ES2683071T3 - Direccionamiento mediado por nucleasas con grandes vectores de direccionamiento - Google Patents
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Abstract
Un método para modificar un locus genómico objetivo en una célula madre embrionaria (ES) de ratón, que comprende: (a) introducción en la célula ES de ratón: (i) una nucleasa de dedo de zinc (ZFN) que provoca un rompimiento de doble cadena en o cerca de el locus genómico objetivo; y (ii) un vector de direccionamiento grande (LTVEC) que comprende un ácido nucleico insertado flanqueado por un brazo de homología secuencia arriba y un brazo de homología secuencia abajo, en el que el ácido nucleico insertado varía de 5 kb a 30 kb de longitud, en el que la suma total de los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo tiene una longitud de al menos 10 kb, en el que los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo están entre 5 kb y 200 kb de longitud, y en el que el LTVEC varía de 50 kb a 300 kb de longitud; y (b) seleccionar una célula ES de ratón dirigida que comprende el ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo, en el que la integración del ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo da como resultado la sustitución de una secuencia de ácido nucleico endógeno en el locus genómico objetivo con el ácido nucleico insertado.
Description
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En una realización, el agente nucleasa es una construcción de expresión que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica una nucleasa, en la que la secuencia de ácido nucleico está operativamente unida a un promotor. En una realización, el promotor es un promotor constitutivamente activo. En una realización, el promotor es un promotor inducible. En una realización, el promotor es activo en la célula procariota. En una realización, el agente nucleasa es un ARNm que codifica una endonucleasa.
En una realización, el agente nucleasa es una nucleasa de dedo de cinc (ZFN). En una realización, cada monómero de la ZFN comprende 3 o más dominios de unión a ADN basados en dedos de cinc, en donde cada dominio de unión a ADN basado en dedos de cinc se une a un subsitio de 3 pb. En una realización, la ZFN es una proteína quimérica que comprende un dominio de unión a ADN basado en dedos de cinc operativamente unido a una nucleasa independiente. En una realización, la endonucleasa independiente es una endonucleasa Fok1. En una realización, el agente nucleasa comprende una primera ZFN y una segunda ZFN, en donde cada una de la primera ZFN y la segunda ZFN está unida operativamente a una nucleasa Fokl, en donde la primera y la segunda ZFN reconocen dos secuencias de ADN objetivo contiguas en cada cadena de la secuencia de ADN objetivo separada por un sitio de escisión de aproximadamente 6 pb a aproximadamente 40 pb, y en el que las nucleasas Fokl se dimerizan y hacen un rompimiento de doble cadena.
En una realización, el agente nucleasa es una nucleasa efectora similar al activador de la transcripción (TALEN). En una realización, cada monómero de TALEN comprende 12-25 repeticiones de TAL, en donde cada repetición de TAL se une a un subsitio de 1 pb. En una realización, el agente nucleasa es una proteína quimérica que comprende un dominio de unión a ADN basado en la repetición de TAL operativamente unido a una nucleasa independiente. En una realización, la nucleasa independiente es una endonucleasa Fok1. En una realización, el agente nucleasa comprende un primer dominio de unión a ADN basado en la repetición de TAL y un segundo dominio de unión a ADN basado en la repetición de TAL, en el que cada uno del primer y segundo dominio de unión a ADN basado en la repetición de TAL está operativamente unido a una nucleasa Fokl, en la que el primer y el segundo dominio de unión de ADN basado en la repetición de TAL reconocen dos secuencias de ADN objetivo contiguas en cada cadena de la secuencia de ADN objetivo separadas por aproximadamente 6 pb a aproximadamente 40 pb del sitio de escisión, y en donde las nucleasas Fokl se dimerizan y producen una ruptura de doble cadena en una secuencia objetivo.
En una realización, cada monómero de la nucleasa reconoce una secuencia objetivo de al menos 9 nucleótidos. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 9 a aproximadamente 12 nucleótidos de longitud. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 12 a aproximadamente 15 nucleótidos de longitud. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 15 a aproximadamente 18 nucleótidos de longitud. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 18 a aproximadamente 21 nucleótidos de longitud.
En una realización, una secuencia objetivo del agente nucleasa está localizada en un intrón. En una realización, la secuencia objetivo está ubicada en un exón. En una realización, la secuencia objetivo está ubicada en un promotor. En una realización, la secuencia objetivo está en una región que no codifica proteínas. En una realización, la región que no codifica proteínas es una región reguladora. En una realización, la secuencia objetivo está ubicada en una región reguladora del promotor. En una realización, la secuencia objetivo está localizada en una región potenciadora.
En una realización, el agente nucleasa es una meganucleasa. En una realización, la meganucleasa reconoce secuencias de ADN de cadena doble de 12 a 40 pares de bases. En una realización, la meganucleasa reconoce una secuencia objetivo perfectamente coincidente en el genoma. En una realización, la meganucleasa es una nucleasa de asentamiento. En una realización, la nucleasa de asentamiento es una familia LAGLIDADG de nucleasa de asentamiento. En una realización, la familia LAGLIDADG de nucleasa de asentamiento se selecciona de I-Scel, I-Crel e I-Dmol.
En una realización, el vector de direccionamiento es un vector de direccionamiento grande (LTVEC).
En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 50 kb a aproximadamente 300 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 50 kb a aproximadamente 75 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 75 kb a aproximadamente 100 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 100 kb a 125 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 125 kb a aproximadamente 150 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 150 kb a aproximadamente 175 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 175 kb a aproximadamente 200 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 200 kb a aproximadamente 225 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 225 kb a aproximadamente 250 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 250 kb a aproximadamente 275 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 275 kb a aproximadamente 300 kb.
En una realización, los brazos de homología del vector de direccionamiento se derivan de una biblioteca de BAC, una biblioteca de cósmidos o una biblioteca de fagos P1. En una realización, los brazos de homología se derivan de un locus genómico del animal no humano que no puede direccionarse usando un método convencional. En una realización, los brazos de homología se derivan de un ADN sintético.
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En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un alelo condicional. En una realización, el alelo condicional es un alelo multifuncional, como se describe en el documento US 2011/0104799. En una realización, el alelo condicional comprende: (a) una secuencia activadora en orientación sentido con respecto a la transcripción de un gen objetivo, y un casete de selección de fármaco en orientación sentido o antisentido; (b) en orientación antisentido una secuencia de nucleótidos de interés (NSI) y un módulo condicional por inversión (COIN, que utiliza un intrón de división de exones y un módulo de tipo trampa génica invertible; véase, por ejemplo, el documento US 2011/0104799,); y (c) unidades recombinables que se recombinan tras la exposición a una primera recombinasa para formar un alelo condicional que (i) carece de la secuencia activadora y la DSC, y (ii) contiene el NSI en orientación sentido y el COIN en orientación antisentido.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un casete de selección. En una realización, el casete de selección comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un marcador de selección, en el que la secuencia de ácido nucleico está operativamente unida a un promotor. En una realización, el promotor es activo en una célula procariota. En una realización, el ácido nucleico es activo en células tanto procariotas como eucariotas. En una realización, el casete de selección está flanqueado con secuencias objetivo de recombinación específicas del sitio. En una realización, el marcador de selección se selecciona de neomicina fosfotransferasa (neor), higromicina B fosfotransferasa (hygr), puromicina-N-acetiltransferasa (puror), blasticidina S desaminasa (bsrr) , xantina / guanina fosforribosil transferasa (gpt), y timidina quinasa del virus del herpes simple (HSV-k), y una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un gen informador unido operativamente a un promotor, en el que el gen informador codifica una proteína informadora seleccionada del grupo que consiste en LacZ, mPlum, mCherry, tdTomato, mStrawberry, J-Red, DsRed , mOrange, mKO, mCitrine, Venus, YPet, proteína fluorescente amarilla mejorada (EYFP), Emerald, proteína fluorescente verde mejorada (EGFP), CyPet, proteína fluorescente cian (CFP), Cerulean, T-Sapphire, luciferasa, fosfatasa alcalina y una combinación de las mismas. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor inducible. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor endógeno. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor exógeno. En una realización, el gen informador se expresa en un tipo de célula específico. En una realización, el gen informador se expresa de una manera específica del tejido. En una realización, el gen informador se expresa en una etapa específica de la etapa de desarrollo.
En una realización, la integración del ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo introduce una o más modificaciones genéticas como se describe en este documento. En una realización, la modificación genética es una eliminación de una secuencia de ácido nucleico endógeno. En una realización, la modificación genética es una adición de una secuencia de ácido nucleico exógeno en el locus genómico objetivo. En una realización, la modificación genética es un reemplazo de una secuencia de ácido nucleico endógeno con una secuencia de ácido nucleico exógeno en el locus genómico objetivo. En una realización, la secuencia de ácido nucleico exógeno no es una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, la secuencia de ácido nucleico exógeno es una secuencia de ácido nucleico humano. En una realización, la modificación genética es una desactivación, una eliminación, una inserción, un reemplazo ("activación"), una mutación puntual, un intercambio de dominios, un intercambio de exones, un intercambio de intrones, un intercambio de secuencias reguladoras, un intercambio de genes, o una combinación de los mismos.
En una realización, el ácido nucleico insertado es homólogo a una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado es un ácido nucleico humano. En una realización, el ácido nucleico insertado es un fragmento de un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico es un ácido nucleico genómico de ratón, un ácido nucleico genómico humano o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 200 kb como se describió anteriormente.
En una realización, el ácido nucleico insertado es ortólogo a una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado es un ácido nucleico humano. En una realización, el ácido nucleico insertado es un fragmento de un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico es un ácido nucleico genómico de ratón, un ácido nucleico genómico humano o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 200 kb como se describió anteriormente.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en el sistema nervioso, el sistema esquelético, el sistema digestivo, el sistema circulatorio, el sistema muscular, el sistema respiratorio, el sistema cardiovascular, el sistema linfático, el sistema endocrino, el sistema urinario, el sistema reproductivo o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una médula ósea o una célula derivada de médula ósea. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula de bazo. En una realización, el locus genómico comprende una secuencia de ácido nucleico genómico de ratón, una secuencia de ácido nucleico genómico humano, o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula B. En una realización, el ácido nucleico comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula B
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humana es un alelo recesivo. En una realización, el alelo de la enfermedad humana comprende un alelo de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP).
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia reguladora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia promotora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia potenciadora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia de unión a represor transcripcional. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano, en el que la secuencia de ácido nucleico humano comprende una eliminación de una secuencia que no codifica una proteína, pero no comprende una eliminación de una secuencia que codifica una proteína. En una realización, la eliminación de la secuencia que no codifica proteína comprende una eliminación de una secuencia reguladora. En una realización, la eliminación del elemento regulador comprende una eliminación de una secuencia promotora. En una realización, la eliminación del elemento regulador comprende una eliminación de una secuencia potenciadora.
En un aspecto, se proporciona un método para modificar un locus genómico objetivo en una célula madre de embrión de ratón (ES), que comprende: (a) introducir en la célula ES de ratón: (i) una nucleasa de dedo de cinc (ZFN) que realiza un rompimiento de doble cadena en o cerca de un locus genómico objetivo; y (ii) un vector de direccionamiento grande (LTVEC) que comprende un ácido nucleico insertado flanqueado por un brazo de homología secuencia arriba y un brazo de homología secuencia abajo, donde el ácido nucleico insertado varía de 5 kb a 30 kb de longitud, en el que la suma total de los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo tienen una longitud de al menos 10 kb, en los que los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo tienen una longitud de entre 5 kb y 200 kb, y en los que el LTVEC varía de 50 kb a 300 kb de longitud; y (b) seleccionar una célula ES de ratón específica que comprende el ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo, donde la integración del ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo da como resultado el reemplazo de una secuencia de ácido nucleico endógeno en el locus genómico objetivo con el ácido nucleico insertado.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un gen informador unido operativamente a un informador exógeno.
En una realización, la célula ES de ratón es una célula madre pluripotente inducida (iPS). En una realización, la célula pluripotente inducida (iPS) se deriva de un fibroblasto. En una realización, la célula pluripotente es una célula madre hematopoyética (HSC). En una realización, la célula pluripotente es una célula madre neuronal (NSC). En una realización, la célula pluripotente es una célula madre epiblasto. En una realización, la célula pluripotente es una célula progenitora restringida en el desarrollo.
En una realización, la ES de ratón es una célula cancerosa.
En una realización, el locus genómico objetivo se selecciona de un locus FcER1a, un locus TLR4, un locus PRLR, un locus Notch4, un locus Accn2, un locus Adamts5, un locus TRPA1, un locus FoIH1, un locus LRP5, y un locus ERBB4.
En una realización, el locus genómico objetivo comprende una secuencia de ácido nucleico genómico de un ratón.
En una realización, la ZFN se introduce junto con el vector de direccionamiento grande (LTVEC). En una realización, la ZFN se introduce por separado del LTVEC durante un período de tiempo. En una realización, la ZFN se introduce antes de la introducción del LTVEC. En una realización, la ZFN se introduce después de la introducción del LTVEC.
En una realización, el uso combinado del LTVEC con la ZFN da como resultado una eficacia de direccionamiento aumentada en comparación con el uso del LTVEC solo, opcionalmente en donde la eficacia de direccionamiento del LTVEC se incrementa al menos dos veces en comparación con el uso del LTVEC solo. En una realización, cuando el LTVEC se usa junto con la ZFN, la eficacia de direccionamiento del LTVEC se incrementa al menos tres veces en comparación con cuando el LTVEC se usa solo. En una realización, cuando el LTVEC se usa junto con la ZFN, la eficacia de direccionamiento del LTVEC se incrementa al menos cuatro veces en comparación con cuando el LTVEC se usa solo.
En una realización, (I) la ZFN es una construcción de expresión que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica una proteína ZFN, y en la que la secuencia de ácido nucleico está operativamente unida a un promotor activo en la célula; o (II) la ZFN es un ARNm que codifica una proteína ZFN. En una realización, el promotor es un promotor constitutivamente activo. En una realización, el promotor es un promotor inducible. En una realización, el promotor es activo en la célula de mamífero. En una realización, el agente nucleasa es un ARNm que codifica una endonucleasa.
En una realización, cada monómero de ZFN comprende 3 o más dominios de unión a ADN basados en dedos de cinc, en donde cada dominio de unión a ADN basado en dedos de cinc se une a un subsitio de 3 pb. En una realización, la ZFN es una proteína quimérica que comprende un dominio de unión a ADN basado en dedos de cinc operativamente unido a una nucleasa independiente. En una realización, la endonucleasa independiente es una endonucleasa Fok1. En una realización, el agente nucleasa comprende una primera ZFN y una segunda ZFN, en
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donde cada una de la primera ZFN y la segunda ZFN está unida operativamente a una nucleasa Fokl, en donde la primera y la segunda ZFN reconocen dos secuencias de ADN objetivo contiguas en cada cadena de la secuencia de ADN objetivo separada por un sitio de escisión de aproximadamente 6 pb a aproximadamente 40 pb, y en el que las nucleasas Fokl se dimerizan y forman un rompimiento de doble cadena.
En una realización, cada monómero de ZFN reconoce una secuencia objetivo de al menos 9 nucleótidos. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 9 a aproximadamente 12 nucleótidos de longitud. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 12 a aproximadamente 15 nucleótidos de longitud. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 15 a aproximadamente 18 nucleótidos de longitud. En una realización, la secuencia objetivo es de aproximadamente 18 a aproximadamente 21 nucleótidos de longitud.
En una realización, una secuencia de ácido nucleico objetivo de la ZFN está localizada en un intrón, un exón, un promotor, una región que no codifica proteínas, una región reguladora, una región reguladora del promotor o una región potenciadora en el locus genómico objetivo.
La familia LAGLIDADG de nucleasa de asentamiento se selecciona de I-Scel, I-Crel e I-Dmol.
En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 50 kb a aproximadamente 300 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 50 kb a aproximadamente 75 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 75 kb a aproximadamente 100 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 100 kb a 125 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 125 kb a aproximadamente 150 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 150 kb a aproximadamente 175 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 175 kb a aproximadamente 200 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 200 kb a aproximadamente 225 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 225 kb a aproximadamente 250 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 250 kb a aproximadamente 275 kb. En una realización, el LTVEC varía de aproximadamente 275 kb a aproximadamente 300 kb.
En una realización, los brazos de homología del LTVEC se derivan de una biblioteca de BAC, una biblioteca de cósmidos o una biblioteca de fagos P1. En una realización, los brazos de homología se derivan de un locus genómico del animal no humano que no puede direccionarse usando un método convencional. En una realización, los brazos de homología se derivan de un ADN sintético.
En una realización, una suma total del brazo de homología secuencia arriba y el brazo de homología secuencia abajo es de al menos 10 kb. En una realización, el brazo de homología secuencia arriba varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 100 kb. En una realización, el brazo de homología secuencia abajo varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 100 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 10 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 10 kb a aproximadamente 20 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 20 kb a aproximadamente 30 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 30 kb a aproximadamente 40 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 40 kb a aproximadamente 50 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 50 kb a aproximadamente 60 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 60 kb a aproximadamente 70 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 70 kb a aproximadamente 80 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 80 kb a aproximadamente 90 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 90 kb a aproximadamente 100 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 100 kb a aproximadamente 110 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 110 kb a aproximadamente 120 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 120 kb a aproximadamente 130 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 130 kb a aproximadamente 140 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 140 kb a aproximadamente 150 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 150 kb a aproximadamente 160 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 160 kb a aproximadamente 170 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 170 kb a aproximadamente 180 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 180 kb a aproximadamente 190 kb. En una realización, los brazos de homología secuencia arriba y secuencia abajo varían de aproximadamente 190 kb a aproximadamente 200 kb.
En una realización, el vector de direccionamiento comprende un casete de selección. En una realización, el casete de selección comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un marcador de selección, en el que la secuencia de ácido nucleico está operativamente unida a un promotor. En una realización, el promotor es activo en una célula de mamífero. En una realización, el promotor es activo tanto en células procariotas como en células
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eucariotas. En una realización, el marcador de selección se selecciona de neomicina fosfotransferasa (neor), higromicina B fosfotransferasa (hygr), puromicina-N-acetiltransferasa (puror), blasticidina S desaminasa (bsrr) , xantina / guanina fosforribosil transferasa (gpt), y timidina quinasa del virus del herpes simple (HSV-k), y una combinación de los mismos.
En una realización, el ácido nucleico insertado es de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 10 kb. En una realización, el ácido nucleico insertado es de aproximadamente 10 kb a aproximadamente 20 kb. En una realización, el ácido nucleico insertado es de aproximadamente 20 kb a aproximadamente 30 kb.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un ácido nucleico flanqueado con secuencias objetivo de recombinación específicas del sitio. En una realización, el ácido nucleico comprende un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico se deriva de un ratón, un ser humano o una combinación de los mismos. En una realización, las secuencias objetivo de recombinación específicas del sitio se seleccionan del grupo que consiste en loxP, lox511, lox2272, lox66, lox71, loxM2, lox5171, FRT, FRT11, FRT71, attp, att, FRT, rox y una combinación de los mismas.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un alelo condicional. En una realización, el alelo condicional es un alelo multifuncional, como se describe en el documento US 2011/0104799. En una realización, el alelo condicional comprende: (a) una secuencia activadora en orientación sentido con respecto a la transcripción de un gen objetivo, y un casete de selección de fármaco en orientación sentido o antisentido; (b) en orientación antisentido una secuencia de nucleótidos de interés (NSI) y un módulo condicional por inversión (COIN, que utiliza un intrón de división de exones y un módulo de tipo trampa génica invertible; véase, por ejemplo, el documento US 2011/0104799); y (c) unidades recombinables que se recombinan tras la exposición a una primera recombinasa para formar un alelo condicional que (i) carece de la secuencia activadora y la DSC, y (ii) contiene el NSI en orientación sentido y el COIN en orientación antisentido.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un casete de selección. En una realización, el casete de selección comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un marcador de selección, en el que la secuencia de ácido nucleico está operativamente unida a un promotor. En una realización, el promotor es activo en una célula de mamífero. En una realización, el ácido nucleico es activo en una célula eucariota. En una realización, el casete de selección está flanqueado con secuencias objetivo de recombinación específicas del sitio. En una realización, el marcador de selección se selecciona de neomicina fosfotransferasa (neor), higromicina B fosfotransferasa (hygr), puromicina-N-acetiltransferasa (puror), blasticidina S desaminasa (bsrr) , xantina/guanina fosforribosil transferasa (gpt), y timidina quinasa del virus del herpes simple (HSV-k), y una combinación de los mismos.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un gen informador unido operativamente a un promotor, en el que el gen informador codifica una proteína informadora seleccionada del grupo que consiste en LacZ, mPlum, mCherry, tdTomato, mStrawberry, J-Red, DsRed , mOrange, mKO, mCitrine, Venus, YPet, proteína fluorescente amarilla mejorada (EYFP), Emerald, proteína fluorescente verde mejorada (EGFP), CyPet, proteína fluorescente cian (CFP), Cerulean, T-Sapphire, luciferasa, fosfatasa alcalina y una combinación de las mismas. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor inducible. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor endógeno. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor exógeno. En una realización, el gen informador se expresa en un tipo de célula específico. En una realización, el gen informador se expresa de una manera específica de tejido. En una realización, el gen informador se expresa en una forma específica de la etapa de desarrollo.
En una realización, la integración del ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo introduce una o más modificaciones genéticas como se describe en este documento. En una realización, la modificación genética es una eliminación de una secuencia de ácido nucleico endógena. En una realización, la modificación genética es una adición de una secuencia de ácido nucleico exógeno en el locus genómico objetivo. En una realización, la modificación genética es un reemplazo de una secuencia de ácido nucleico endógeno con una secuencia de ácido nucleico exógeno en el locus genómico objetivo. En una realización, la secuencia de ácido nucleico exógeno no es una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, la secuencia de ácido nucleico exógeno es una secuencia de ácido nucleico humano. En una realización, la integración del ácido nucleico insertado en el locus genómico objetivo da como resultado una desactivación, una eliminación, una inserción, un reemplazo ("activación"), una mutación puntual, un intercambio de dominios, un intercambio de exones, un intercambio de intrones, un intercambio de secuencias reguladoras, un intercambio de genes, o una combinación de los mismos.
En una realización, el ácido nucleico insertado es homólogo a una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico homóloga a la secuencia de ácido nucleico reemplazada en el locus genómico objetivo de la célula ES de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado es un ácido nucleico humano. En una realización, el ácido nucleico insertado es un fragmento de un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico es un ácido nucleico genómico de ratón, un ácido nucleico genómico humano o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 200 kb como se describió anteriormente.
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En una realización, el ácido nucleico insertado es ortólogo a una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico ortóloga a la secuencia de ácido nucleico reemplazada en el locus genómico objetivo de la célula ES de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado es un ácido nucleico humano. En una realización, el ácido nucleico insertado es un fragmento de un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico es un ácido nucleico genómico de ratón, un ácido nucleico genómico humano o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico de una especie diferente.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en el sistema nervioso, el sistema esquelético, el sistema digestivo, el sistema circulatorio, el sistema muscular, el sistema respiratorio, el sistema cardiovascular, el sistema linfático, el sistema endocrino, el sistema urinario, el sistema reproductivo o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una médula ósea o una célula derivada de médula ósea. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula de bazo. En una realización, el locus genómico comprende una secuencia de ácido nucleico genómico de ratón, una secuencia de ácido nucleico genómico humano, o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula B. En una realización, el ácido nucleico comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula B inmadura. En una realización, el ácido nucleico comprende un locus genómico que codifica una proteína expresada en una célula B madura.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico genómico que codifica una secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana.
En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico comprende una secuencia de ácido nucleico de la región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana no reordenada funcionalmente unida a una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina es una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina de ratón o secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina humana, o una combinación de las mismas. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina se selecciona de un CH1, una bisagra, un CH2, un CH3 y una combinación de las mismas. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada comprende un CH1-bisagra-CH2-CH3. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico comprende una secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana reordenada operativamente unida a una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina es una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina de ratón o una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina humana o una combinación de las mismas. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina se selecciona de un CH1, una bisagra, un CH2, un CH3 y una combinación de las mismas. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada comprende CH1-bisagra-CH2-CH3.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico genómico que codifica una secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera de inmunoglobulina humana. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico comprende una secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena ligera λ y/o κ humana no reordenada. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico comprende una secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena ligera λ o κ humana reordenada operablemente unida a una secuencia de ácido nucleico de región constante de cadena ligera de inmunoglobulina humana o de ratón seleccionada de una secuencia de ácido nucleico de región constante de cadena ligera λ y una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena ligera κ. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena ligera λ o κ no reordenada o reordenada se une operativamente a una secuencia de ácido nucleico de región constante de cadena ligera de inmunoglobulina humana o de ratón seleccionada de una secuencia de ácido nucleico de región constante de cadena ligera λ y una secuencia de ácido nucleico de región constante de cadena ligera κ.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano codifica una proteína extracelular. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano codifica un ligando para un receptor. En una realización, el ligando es una citoquina. En una realización, la citoquina es una quimioquina seleccionada de CCL, CXCL, CX3CL y XCL. En una realización, la citoquina es un factor de necrosis tumoral (TNF). En una realización, la citoquina es una interleuquina (IL). En una realización, la interleuquina se selecciona de IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL -11, IL-12, IL-13, IL-14, IL-15, IL-16, IL-17, IL-18, IL-19, IL-20, IL-21, IL-22, IL-23, IL-24, IL-25, IL-26, IL-27, IL-28, IL-29, IL-30, IL-31, IL-32, IL-33, IL-34, IL-35, y IL-36. En una realización, la interleuquina es IL-2. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico humano codifica una proteína citoplasmática. En una realización, la
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secuencia de ácido nucleico genómico humano codifica una proteína de membrana. En una realización, la proteína de membrana es un receptor. En una realización, el receptor es un receptor de citoquina. En una realización, el receptor de citoquina es un receptor de interleuquina. En una realización, el receptor de interleuquina es un receptor alfa de interleuquina 2. En una realización, el receptor de interleuquina es un receptor beta de interleuquina 2. En una realización, el receptor de interleuquina es un receptor gamma de interleuquina 2. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico humano codifica una proteína nuclear. En una realización, la proteína nuclear es un receptor nuclear.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una modificación genética en una secuencia codificante. En una realización, la modificación genética comprende una mutación por eliminación de una secuencia codificante. En una realización, la modificación genética comprende una fusión de dos secuencias codificantes endógenas.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano que codifica una proteína humana mutante. En una realización, la proteína humana mutante se caracteriza por una característica de unión alterada, localización alterada, expresión alterada y/o patrón de expresión alterado. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano comprende al menos un alelo de enfermedad humana. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad neurológica. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad cardiovascular. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad renal. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad muscular. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad de la sangre. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de un gen causante de cáncer. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad del sistema inmune. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo dominante. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo recesivo. En una realización, el alelo de la enfermedad humana comprende un alelo de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP).
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia reguladora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia promotora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia potenciadora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia de unión a represor transcripcional. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano, en el que la secuencia de ácido nucleico humano comprende una eliminación de una secuencia que codifica una proteína, pero no comprende una eliminación de una secuencia que codifica una proteína. En una realización, la eliminación de la secuencia de codificación no proteica comprende una eliminación de una secuencia reguladora. En una realización, la eliminación del elemento regulador comprende una eliminación de una secuencia promotora. En una realización, la eliminación del elemento regulador comprende una eliminación de una secuencia potenciadora. En una realización, la etapa de selección (b) se lleva a cabo mediante una modificación del ensayo de alelos (MOA). En una realización, el método de acuerdo con este aspecto comprende adicionalmente (c) introducir la célula ES de ratón modificada en un embrión en estadio de premórula; y (d) incubar el embrión hasta la etapa de blastocisto, opcionalmente en el que el método comprende producir un ratón F0 a partir del embrión implantado en una madre sustituta; y (e) identificar un ratón que porta el locus genómico genéticamente modificado.
La divulgación se refiere a una célula de mamífero hecha con un método como se describe en la presente memoria. En una realización, la célula de mamífero comprende un ácido nucleico insertado que comprende una o más modificaciones genéticas como se describe en este documento en un locus genómico objetivo.
En una realización, la célula de mamífero es una célula pluripotente. En una realización, la célula pluripotente es una célula madre embrionaria (ES). En una realización, la célula pluripotente es una célula madre pluripotente inducida (iPS). En una realización, la célula pluripotente inducida (iPS) se deriva de un fibroblasto. En una realización, la célula pluripotente inducida (iPS) se deriva de un fibroblasto humano. En una realización, la célula pluripotente es una célula madre hematopoyética (HSC). En una realización, la célula pluripotente es una célula madre neuronal (NSC). En una realización, la célula pluripotente es una célula madre de epiblasto. En una realización, la célula pluripotente es una célula progenitora restringida en el desarrollo.
En una realización, la célula pluripotente es una célula pluripotente de ratón. En una realización, la célula pluripotente es una célula madre embrionaria (ES) de ratón.
En una realización, la célula de mamífero es una célula inmortalizada de ratón o de rata. En una realización, la célula de mamífero es una célula inmortalizada humana. En una realización, la célula de mamífero es un fibroblasto humano. En una realización, la célula de mamífero es una célula cancerosa. En una realización, la célula de mamífero es una célula cancerosa humana.
En una realización, el locus genómico objetivo se selecciona a partir de un locus FcER1a, un locus TLR4, un locus PRLR, un locus Notch4, un locus Accn2, un locus ADAMTS5, un locus TRPA1, un locus FoIH1, un locus de LRP5, y un locus ERBB4.
En una realización, el locus genómico objetivo comprende una o más modificaciones genéticas como se describe en
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este documento. En una realización, la modificación genética es una eliminación de una secuencia de ácido nucleico endógena. En una realización, la modificación genética es una adición de una secuencia de ácido nucleico exógeno en el locus genómico objetivo. En una realización, la modificación genética es un reemplazo de una secuencia de ácido nucleico endógeno con una secuencia de ácido nucleico exógeno en el locus genómico objetivo. En una realización, la secuencia de ácido nucleico exógeno no es una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, la secuencia de ácido nucleico exógeno es una secuencia de ácido nucleico humano. En una realización, el locus genómico objetivo comprende una modificación seleccionada de una desactivación, una eliminación, una inserción, un reemplazo ("activación"), una mutación puntual, un intercambio de dominios, un intercambio de exones, un intercambio de intrones, un intercambio de secuencias reguladoras, un intercambio de genes, o una combinación de los mismos.
En una realización, el locus genómico objetivo comprende un ácido nucleico insertado que es homólogo a una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado es un ácido nucleico humano. En una realización, el ácido nucleico insertado es un fragmento de un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico es un ácido nucleico genómico de ratón, un ácido nucleico genómico humano o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 200 kb como se describió anteriormente.
En una realización, el locus genómico objetivo comprende un ácido nucleico insertado que es ortólogo a una secuencia de ácido nucleico de ratón. En una realización, el ácido nucleico insertado es un ácido nucleico humano. En una realización, el ácido nucleico insertado es un fragmento de un ácido nucleico genómico. En una realización, el ácido nucleico genómico es un ácido nucleico genómico de ratón, un ácido nucleico genómico humano o una combinación de los mismos. En una realización, el ácido nucleico insertado varía de aproximadamente 5 kb a aproximadamente 200 kb como se describió anteriormente.
En una realización, el locus genómico objetivo comprende un alelo condicional. En una realización, el alelo condicional es un alelo multifuncional, como se describe en el documento US 2011/0104799. En una realización, el alelo condicional comprende: (a) una secuencia activadora en orientación sentido con respecto a la transcripción de un gen objetivo, y un casete de selección de fármaco en orientación sentido o antisentido; (b) en orientación antisentido una secuencia de nucleótidos de interés (NSI) y un módulo condicional por inversión (COIN, que utiliza un intrón de división de exones y un módulo de tipo trampa génica invertible; véase, por ejemplo, el documento US 2011/0104799,); y (c) unidades recombinables que se recombinan tras la exposición a una primera recombinasa para formar un alelo condicional que (i) carece de la secuencia activadora y la DSC, y (ii) contiene el NSI en orientación sentido y el COIN en orientación antisentido.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende un gen informador unido operativamente a un promotor, en el que el gen informador codifica una proteína informadora seleccionada del grupo que consiste de LacZ, mPlum, mCherry, tdTomato, mStrawberry, J-Red, DsRed , mOrange, mKO, mCitrine, Venus, YPet, proteína fluorescente amarilla (EYFP), Emerald, proteína fluorescente verde potenciada (EGFP), CyPet, proteína fluorescente cian (CFP), Cerulean, T-Sapphire, luciferasa, fosfatasa alcalina, y una combinación de las mismas. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor inducible. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor endógeno. En una realización, el gen informador se expresa bajo el control de un promotor exógeno. En una realización, el gen informador se expresa en un tipo de célula específico. En una realización, el gen informador se expresa de una manera específica del tejido. En una realización, el gen informador se expresa en una forma específica de la etapa de desarrollo.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano que codifica una proteína expresada en el sistema nervioso, el sistema esquelético, el sistema digestivo, el sistema circulatorio, el sistema muscular, el sistema respiratorio, el sistema cardiovascular, el sistema linfático, el sistema endocrino, el sistema urinario, el sistema reproductivo o una combinación de los mismos. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano codifica una proteína expresada en una médula ósea o una célula derivada de médula ósea. En una realización, el genoma de la célula ES de ratón comprende un locus genómico humano que codifica una proteína expresada en una célula de bazo. En una realización, el ácido nucleico humano codifica una proteína expresada en una célula B. En una realización, el ácido nucleico humano codifica una proteína expresada en una célula B inmadura. En una realización, el ácido nucleico humano codifica una proteína expresada en una célula B madura.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano que codifica una secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano comprende una secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana no reordenada. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región variable de cadena pesada de inmunoglobulina no reordenada está operativamente unida a una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina de ratón, a una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina humana. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina se selecciona de un CH1, una bisagra, un CH2, un CH3 y una combinación de las mismos. En una realización, la secuencia de ácido nucleico
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de la región constante de cadena pesada comprende una CH1-bisagra-CH2-CH3. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano comprende una secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana reordenada. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región variable de cadena pesada de inmunoglobulina humana está unida operativamente a una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina de ratón, a una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina humana. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada de inmunoglobulina se selecciona de un CH1, una bisagra, un CH2, un CH3 y una combinación de las mismas. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena pesada comprende una CH1-bisagra-CH2-CH3.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano que codifica una secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera de inmunoglobulina humana. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano comprende una secuencia de ácido nucleico de región variable de cadena ligera λ y/o κ humana no reordenada. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano comprende una secuencia de ácido nucleico de la región variable de cadena ligera λ y/o κ humana reordenada. En una realización, la secuencia de ácido nucleico de la región variable de cadena ligera λ y/o κ no reordenada está unida operativamente a una secuencia de ácido nucleico de región constante de cadena ligera de inmunoglobulina humana o de ratón seleccionada de una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena ligera λ y una secuencia de ácido nucleico de la región constante de cadena ligera κ.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano codifica una proteína extracelular. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano codifica un ligando para un receptor. En una realización, el ligando es una citoquina. En una realización, la citoquina es una quimioquina seleccionada de CCL, CXCL, CX3CL y XCL. En una realización, la citoquina es un factor de necrosis tumoral (TNF). En una realización, la citoquina es una interleuquina (IL). En una realización, la interleuquina se selecciona de IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-14, IL-15, IL-16, IL-17, IL-18, IL-19, IL-20, IL-21, IL-22, IL-23, IL-24, IL-25, IL-26, IL-27, IL-28, IL-29, IL-30, IL-31, IL-32, IL-33, IL-34, IL-35, y IL-36. En una realización, la interleuquina es IL-2. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico humano codifica una proteína citoplasmática. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico humano codifica una proteína de membrana. En una realización, la proteína de membrana es un receptor. En una realización, el receptor es un receptor de citoquina. En una realización, el receptor de citoquina es un receptor de interleuquina. En una realización, el receptor de interleuquina es un receptor alfa de interleuquina 2. En una realización, el receptor de interleuquina es un receptor beta de interleuquina 2. En una realización, el receptor de interleuquina es un receptor gamma de interleuquina 2. En una realización, la secuencia de ácido nucleico genómico humano codifica una proteína nuclear. En una realización, la proteína nuclear es un receptor nuclear.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una modificación genética en una secuencia codificante. En una realización, la modificación genética comprende una mutación por eliminación de una secuencia codificante. En una realización, la modificación genética comprende una fusión de dos secuencias codificantes endógenas.
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano que codifica una proteína humana mutante. En una realización, la proteína humana mutante se caracteriza por una característica de unión alterada, localización alterada, expresión alterada y/o patrón de expresión alterado. En una realización, la secuencia de ácido nucleico humano comprende al menos un alelo de enfermedad humana. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad neurológica. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad cardiovascular. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad renal. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad muscular. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad de la sangre. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de un gen causante de cáncer. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo de una enfermedad del sistema inmune. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo dominante. En una realización, el alelo de la enfermedad humana es un alelo recesivo. En una realización, el alelo de la enfermedad humana comprende un alelo de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP).
En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia reguladora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia promotora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia potenciadora. En una realización, la secuencia reguladora es una secuencia de unión a represor transcripcional. En una realización, el ácido nucleico insertado comprende una secuencia de ácido nucleico humano, en el que la secuencia de ácido nucleico humano comprende una eliminación de una secuencia que no codifica una proteína, pero no comprende una eliminación de una secuencia que codifica una proteína. En una realización, la eliminación de la secuencia que no codifica proteína comprende una eliminación de una secuencia reguladora. En una realización, la eliminación del elemento regulador comprende una eliminación de una secuencia promotora. En una realización, la eliminación del elemento regulador comprende una eliminación de una secuencia potenciadora.
La divulgación se refiere a un método para fabricar un animal no humano que comprende en su línea germinal una o
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| PL3360964T3 (pl) | 2012-12-06 | 2020-03-31 | Sigma-Aldrich Co. Llc | Modyfikacja i regulacja genomu oparta na crispr |
| MX384291B (es) | 2013-02-20 | 2025-03-14 | Regeneron Pharma | Modificación genética de ratas. |
| DK3456831T3 (da) | 2013-04-16 | 2021-09-06 | Regeneron Pharma | Målrettet modifikation af rottegenom |
| EP3988649B1 (en) * | 2013-09-18 | 2024-11-27 | Kymab Limited | Methods, cells and organisms |
| KR101566498B1 (ko) * | 2013-11-13 | 2015-11-06 | 건국대학교 산학협력단 | 인터루킨 2 수용체 감마 유전자 적중벡터, 그 벡터가 도입된 면역세포 결핍 형질전환 미니 복제돼지 생산과 그 제조방법 및 활용 |
| US10787684B2 (en) * | 2013-11-19 | 2020-09-29 | President And Fellows Of Harvard College | Large gene excision and insertion |
| EP3080279B1 (en) | 2013-12-11 | 2018-09-26 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for the targeted modification of a genome |
| KR102170502B1 (ko) * | 2013-12-11 | 2020-10-28 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 게놈의 표적화된 변형을 위한 방법 및 조성물 |
| HRP20200529T1 (hr) | 2014-06-06 | 2020-09-04 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Postupci i pripravci za modificiranje ciljnog lokusa |
| SI3161128T1 (sl) | 2014-06-26 | 2019-02-28 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Postopki in sestavki za ciljano genetsko spremembo in postopki uporabe |
| BR112017007770A2 (pt) | 2014-10-15 | 2018-01-16 | Regeneron Pharma | cultura in vitro, população de hipscs, método para modificar um locus-alvo genômico, e, hipsc. |
| KR102531016B1 (ko) | 2014-11-21 | 2023-05-10 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 쌍 형성된 가이드 rna를 사용하는 표적화된 유전자 변형을 위한 방법 및 조성물 |
| ES2947714T3 (es) * | 2014-12-19 | 2023-08-17 | Regeneron Pharma | Métodos y composiciones para la modificación genética dirigida a través de múltiples direccionamientos en un solo paso |
| AU2016233250C1 (en) | 2015-03-16 | 2022-08-18 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animal exhibiting diminished upper and lower motor neuron function and sensory perception |
| AU2016270587B2 (en) | 2015-05-29 | 2020-12-24 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals having a disruption in a C9ORF72 locus |
| CN109862785B (zh) | 2016-09-30 | 2022-09-06 | 瑞泽恩制药公司 | C9orf72基因座中具有六核苷酸重复扩增的非人类动物 |
| ES2996886T3 (en) | 2017-06-27 | 2025-02-13 | Regeneron Pharma | Rodents comprising a humanized asgr1 locus |
| CN110891420B (zh) | 2017-07-31 | 2022-06-03 | 瑞泽恩制药公司 | Cas转基因小鼠胚胎干细胞和小鼠及其应用 |
| KR20200033259A (ko) | 2017-07-31 | 2020-03-27 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 생체내에서 CRISPR/Cas-매개된 파괴 또는 삭제 및 외인성 도너 핵산과의 CRISPR/Cas-유도된 재조합을 평가하기 위한 방법 및 조성물 |
| EP3585161A1 (en) | 2017-07-31 | 2020-01-01 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Assessment of crispr/cas-induced recombination with an exogenous donor nucleic acid in vivo |
| US20190098879A1 (en) | 2017-09-29 | 2019-04-04 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-Human Animals Comprising A Humanized TTR Locus And Methods Of Use |
| JP7097440B2 (ja) | 2017-11-10 | 2022-07-07 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | Slc30a8変異を含む非ヒト動物および使用方法 |
| JP7361031B2 (ja) | 2017-11-30 | 2023-10-13 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | ヒト化trkb遺伝子座を含む非ヒト動物 |
| EP3592140A1 (en) | 2018-03-19 | 2020-01-15 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Transcription modulation in animals using crispr/cas systems |
| JP7222075B2 (ja) | 2018-09-13 | 2023-02-14 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | C3糸球体症のモデルとしての補体因子h遺伝子ノックアウトラット |
| KR102925054B1 (ko) | 2018-12-20 | 2026-02-10 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 뉴클레아제-매개 반복부 팽창 |
| KR102661779B1 (ko) | 2019-04-04 | 2024-04-30 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 인간화 응고 인자 12 좌위를 포함하는 비-인간 동물 |
| US11891618B2 (en) | 2019-06-04 | 2024-02-06 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Mouse comprising a humanized TTR locus with a beta-slip mutation and methods of use |
| MX2021015122A (es) | 2019-06-07 | 2022-04-06 | Regeneron Pharma | Animales no humanos que comprenden un locus de albumina humanizado. |
| RU2722933C1 (ru) * | 2019-06-11 | 2020-06-05 | Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования Сколковский институт науки и технологий | Средство разрезания днк на основе cas9 белка из бактерии demequina sediminicola |
| WO2021108363A1 (en) | 2019-11-25 | 2021-06-03 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Crispr/cas-mediated upregulation of humanized ttr allele |
| WO2021154791A1 (en) | 2020-01-28 | 2021-08-05 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals comprising a humanized pnpla3 locus and methods of use |
| EP4099821A1 (en) | 2020-02-07 | 2022-12-14 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | <smallcaps/>? ? ?klkb1? ? ? ? ?non-human animals comprising a humanizedlocus and methods of use |
| US20230102342A1 (en) | 2020-03-23 | 2023-03-30 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals comprising a humanized ttr locus comprising a v30m mutation and methods of use |
| WO2021263146A2 (en) | 2020-06-26 | 2021-12-30 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals comprising a humanized ace2 locus |
| KR20230152124A (ko) | 2021-03-05 | 2023-11-02 | 더 보드 어브 트러스티스 어브 더 리랜드 스탠포드 주니어 유니버시티 | 생체내 dna 조립 및 분석 |
| IL312505A (en) | 2021-11-04 | 2024-07-01 | Regeneron Pharma | Non-human animals comprising a modified cacng1 locus |
| KR20240117571A (ko) | 2021-12-08 | 2024-08-01 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 돌연변이 마이오실린 질환 모델 및 이의 용도 |
| US20250049006A1 (en) | 2021-12-20 | 2025-02-13 | C/O Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals comprising humanized ace2 and tmprss loci |
| WO2023150798A1 (en) | 2022-02-07 | 2023-08-10 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for defining optimal treatment timeframes in lysosomal disease |
| AU2023218391A1 (en) | 2022-02-11 | 2024-07-11 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for screening 4r tau targeting agents |
| IL317261A (en) | 2022-07-29 | 2025-01-01 | Regeneron Pharma | Non-human animals containing a modified transferrin receptor locus |
| JP2025525745A (ja) | 2022-08-05 | 2025-08-07 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | Tdp-43の凝集耐性バリアント |
| EP4593590A1 (en) | 2022-09-29 | 2025-08-06 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Correction of hepatosteatosis in humanized liver animals through restoration of il6/il6r/gp130 signaling in human hepatocytes |
| AU2024214456A1 (en) | 2023-02-01 | 2025-07-03 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Animals comprising a modified klhdc7b locus |
| WO2024189098A1 (en) | 2023-03-13 | 2024-09-19 | Iomx Therapeutics Ag | Platform technology for the identification of modulators of immune effector cell function |
| WO2025122754A1 (en) | 2023-12-07 | 2025-06-12 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Gaa knockout non-human animals |
| WO2025250495A1 (en) | 2024-05-28 | 2025-12-04 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Acceleration of human hepatocyte engraftment in humanized liver animals by supplementing paracrine ligands or agonists that activate human liver regeneration signals |
Family Cites Families (95)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5830729A (en) | 1996-04-18 | 1998-11-03 | Institut Pasteur | I Sce I-induced gene replacement and gene conversion in embryonic stem cells |
| AU737155B2 (en) | 1997-03-14 | 2001-08-09 | Biogen Idec Inc. | Method for integrating genes at specific sites in mammalian cells via homologous recombination and vectors for accomplishing the same |
| US5830698A (en) * | 1997-03-14 | 1998-11-03 | Idec Pharmaceuticals Corporation | Method for integrating genes at specific sites in mammalian cells via homologous recombination and vectors for accomplishing the same |
| WO2000039316A1 (en) | 1998-12-31 | 2000-07-06 | The J. David Gladstone Institutes | Transgenic rodents and rodent cell lines expressing hiv co-receptors |
| CA2361191A1 (en) | 1999-02-03 | 2000-08-10 | The Children's Medical Center Corporation | Gene repair involving the induction of double-stranded dna cleavage at a chromosomal target site |
| AU776576B2 (en) * | 1999-12-06 | 2004-09-16 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods of using randomized libraries of zinc finger proteins for the identification of gene function |
| US7105348B2 (en) | 2000-10-31 | 2006-09-12 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods of modifying eukaryotic cells |
| US20050144655A1 (en) | 2000-10-31 | 2005-06-30 | Economides Aris N. | Methods of modifying eukaryotic cells |
| US6596541B2 (en) | 2000-10-31 | 2003-07-22 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods of modifying eukaryotic cells |
| US6586251B2 (en) | 2000-10-31 | 2003-07-01 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods of modifying eukaryotic cells |
| WO2003087341A2 (en) | 2002-01-23 | 2003-10-23 | The University Of Utah Research Foundation | Targeted chromosomal mutagenesis using zinc finger nucleases |
| WO2003080809A2 (en) | 2002-03-21 | 2003-10-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for using zinc finger endonucleases to enhance homologous recombination |
| EP2806025B1 (en) | 2002-09-05 | 2019-04-03 | California Institute of Technology | Use of zinc finger nucleases to stimulate gene targeting |
| US20030175968A1 (en) | 2002-10-30 | 2003-09-18 | Golic Kent G. | Gene targeting method |
| EP1587545A2 (en) * | 2003-01-13 | 2005-10-26 | Mahendra S. Rao | Persistent expression of candidate molecule in proliferating stem and progenitor cells for delivery of therapeutic products |
| US7888121B2 (en) | 2003-08-08 | 2011-02-15 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for targeted cleavage and recombination |
| US8409861B2 (en) | 2003-08-08 | 2013-04-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted deletion of cellular DNA sequences |
| AU2004263865B2 (en) * | 2003-08-08 | 2007-05-17 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for targeted cleavage and recombination |
| AU2005287278B2 (en) | 2004-09-16 | 2011-08-04 | Sangamo Biosciences, Inc. | Compositions and methods for protein production |
| ES2463476T3 (es) | 2004-10-19 | 2014-05-28 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Método para generar un ratón homocigótico para una modificación genética |
| FR2879622B1 (fr) | 2004-12-17 | 2008-02-01 | Agronomique Inst Nat Rech | Procede in vitro de production d'ovocytes ou d'oeufs presentant une modification genomique ciblee |
| US10022457B2 (en) | 2005-08-05 | 2018-07-17 | Gholam A. Peyman | Methods to regulate polarization and enhance function of cells |
| GB0615327D0 (en) | 2006-03-30 | 2006-09-13 | Univ Edinburgh | Culture medium containing kinase inhibitors and uses thereof |
| AU2007235496B2 (en) | 2006-03-31 | 2013-11-21 | E. R. Squibb & Sons, L.L.C. | Transgenic animals expressing chimeric antibodies for use in preparing human antibodies |
| US7771967B2 (en) | 2006-12-22 | 2010-08-10 | The J. David Gladstone Institutes | Nucleic acid encoding apolipoprotein E-I3 |
| US10155038B2 (en) | 2007-02-02 | 2018-12-18 | Yale University | Cells prepared by transient transfection and methods of use thereof |
| DE602008003684D1 (de) | 2007-04-26 | 2011-01-05 | Sangamo Biosciences Inc | Gezielte integration in die ppp1r12c-position |
| PL2602323T3 (pl) | 2007-06-01 | 2018-06-29 | Open Monoclonal Technology, Inc. | Kompozycje i sposoby hamowania endogennych genów immunoglobin i wytwarzania transgenicznych ludzkich przeciwciał typu idiotypowego |
| SG191561A1 (en) | 2008-08-22 | 2013-07-31 | Sangamo Biosciences Inc | Methods and compositions for targeted single-stranded cleavage and targeted integration |
| US20100076057A1 (en) | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Northwestern University | TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA |
| EP2180058A1 (en) | 2008-10-23 | 2010-04-28 | Cellectis | Meganuclease recombination system |
| EP2352369B1 (en) | 2008-12-04 | 2017-04-26 | Sangamo BioSciences, Inc. | Genome editing in rats using zinc-finger nucleases |
| US20110239315A1 (en) | 2009-01-12 | 2011-09-29 | Ulla Bonas | Modular dna-binding domains and methods of use |
| WO2010124200A2 (en) | 2009-04-23 | 2010-10-28 | Transposagen Biopharmaceuticals, Inc. | Genetically modified rat models for cancer |
| US8772008B2 (en) | 2009-05-18 | 2014-07-08 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for increasing nuclease activity |
| EP2456876A2 (en) | 2009-07-24 | 2012-05-30 | Transposagen Biopharmaceuticals, Inc. | Genetically modified rat models for cytokine-cytokine signaling pathways |
| US8586526B2 (en) | 2010-05-17 | 2013-11-19 | Sangamo Biosciences, Inc. | DNA-binding proteins and uses thereof |
| EP2493288B1 (en) * | 2009-10-28 | 2015-02-18 | Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Homologous recombination in the oocyte |
| CA2779858C (en) | 2009-10-29 | 2019-10-29 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Multifunctional alleles |
| WO2011053957A2 (en) | 2009-11-02 | 2011-05-05 | Gen9, Inc. | Compositions and methods for the regulation of multiple genes of interest in a cell |
| EP2508595B1 (en) | 2009-12-01 | 2016-11-23 | National Cancer Center | Method for constructing chimeric rat using rat embryonic stem cells |
| WO2011072246A2 (en) | 2009-12-10 | 2011-06-16 | Regents Of The University Of Minnesota | Tal effector-mediated dna modification |
| CN102791865B (zh) | 2009-12-21 | 2015-07-01 | 凯津公司 | 用于转染原生质体的改进技术 |
| PH12012501467B1 (en) | 2010-01-22 | 2018-07-04 | Corteva Agriscience Llc | Excision of transgenes in genetically modified organisms |
| EP2660318A1 (en) * | 2010-02-09 | 2013-11-06 | Sangamo BioSciences, Inc. | Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules |
| GB201009732D0 (en) * | 2010-06-10 | 2010-07-21 | Gene Bridges Gmbh | Direct cloning |
| MY191870A (en) | 2010-06-11 | 2022-07-18 | Regeneron Pharma | Production of fertile xy female animals from xy es cells |
| AU2011281062B2 (en) * | 2010-07-21 | 2015-01-22 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for modification of a HLA locus |
| WO2012018726A1 (en) * | 2010-08-02 | 2012-02-09 | Cellectis Sa | Method for increasing double-strand break-induced gene targeting |
| WO2012129198A1 (en) | 2011-03-23 | 2012-09-27 | Transposagen Biopharmaceuticals, Inc. | Genetically modified rat models for obesity and diabetes |
| WO2012168307A2 (en) | 2011-06-07 | 2012-12-13 | Helmholtz Zentrum München - Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Improved recombination efficiency by inhibition of nhej dna repair |
| CN107858333B (zh) | 2011-10-28 | 2022-05-27 | 瑞泽恩制药公司 | T细胞受体基因修饰小鼠 |
| US9637739B2 (en) | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
| WO2013141680A1 (en) | 2012-03-20 | 2013-09-26 | Vilnius University | RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX |
| SG11201406547YA (en) | 2012-04-25 | 2014-11-27 | Regeneron Pharma | Nuclease-mediated targeting with large targeting vectors |
| AU2013259647B2 (en) | 2012-05-07 | 2018-11-08 | Corteva Agriscience Llc | Methods and compositions for nuclease-mediated targeted integration of transgenes |
| AU2013266968B2 (en) | 2012-05-25 | 2017-06-29 | Emmanuelle CHARPENTIER | Methods and compositions for RNA-directed target DNA modification and for RNA-directed modulation of transcription |
| CN104540382A (zh) | 2012-06-12 | 2015-04-22 | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 | 用于产生条件性敲除等位基因的方法和组合物 |
| AU2013293270B2 (en) | 2012-07-25 | 2018-08-16 | Massachusetts Institute Of Technology | Inducible DNA binding proteins and genome perturbation tools and applications thereof |
| AU2013335451C1 (en) | 2012-10-23 | 2024-07-04 | Toolgen Incorporated | Composition for cleaving a target DNA comprising a guide RNA specific for the target DNA and Cas protein-encoding nucleic acid or Cas protein, and use thereof |
| PL3360964T3 (pl) | 2012-12-06 | 2020-03-31 | Sigma-Aldrich Co. Llc | Modyfikacja i regulacja genomu oparta na crispr |
| WO2014093479A1 (en) | 2012-12-11 | 2014-06-19 | Montana State University | Crispr (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) rna-guided control of gene regulation |
| EP2840140B2 (en) | 2012-12-12 | 2023-02-22 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-Cas based method for mutation of prokaryotic cells |
| EP2931899A1 (en) | 2012-12-12 | 2015-10-21 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof |
| US20140310830A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-10-16 | Feng Zhang | CRISPR-Cas Nickase Systems, Methods And Compositions For Sequence Manipulation in Eukaryotes |
| CN113355357B (zh) | 2012-12-12 | 2024-12-03 | 布罗德研究所有限公司 | 对用于序列操纵的改进的系统、方法和酶组合物进行的工程化和优化 |
| WO2014093709A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
| IL239344B2 (en) | 2012-12-12 | 2024-06-01 | Broad Inst Inc | Systems engineering, methods and optimal guiding components for sequence manipulation |
| US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
| EP3031921B1 (en) | 2012-12-12 | 2025-03-12 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation and therapeutic applications |
| US20140186843A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
| WO2014093655A2 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation with functional domains |
| DK2931891T3 (da) | 2012-12-17 | 2019-08-19 | Harvard College | Rna-styret modificering af menneskelige genomer |
| ES2953523T3 (es) | 2012-12-27 | 2023-11-14 | Keygene Nv | Método para inducir una translocación dirigida en una planta |
| WO2014127287A1 (en) | 2013-02-14 | 2014-08-21 | Massachusetts Institute Of Technology | Method for in vivo tergated mutagenesis |
| MX384291B (es) | 2013-02-20 | 2025-03-14 | Regeneron Pharma | Modificación genética de ratas. |
| US10227610B2 (en) | 2013-02-25 | 2019-03-12 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for enhancing nuclease-mediated gene disruption |
| EP2922393B2 (en) | 2013-02-27 | 2022-12-28 | Helmholtz Zentrum München - Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Gene editing in the oocyte by cas9 nucleases |
| WO2014143381A1 (en) | 2013-03-09 | 2014-09-18 | Agilent Technologies, Inc. | Methods of in vivo engineering of large sequences using multiple crispr/cas selections of recombineering events |
| RU2662932C2 (ru) | 2013-03-14 | 2018-07-31 | Карибо Биосайенсиз, Инк. | Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты |
| US20140273230A1 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | Sigma-Aldrich Co., Llc | Crispr-based genome modification and regulation |
| US9234213B2 (en) | 2013-03-15 | 2016-01-12 | System Biosciences, Llc | Compositions and methods directed to CRISPR/Cas genomic engineering systems |
| US20140349400A1 (en) | 2013-03-15 | 2014-11-27 | Massachusetts Institute Of Technology | Programmable Modification of DNA |
| US9937207B2 (en) | 2013-03-21 | 2018-04-10 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Targeted disruption of T cell receptor genes using talens |
| EP4286517A3 (en) | 2013-04-04 | 2024-03-13 | President and Fellows of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
| DK3456831T3 (da) | 2013-04-16 | 2021-09-06 | Regeneron Pharma | Målrettet modifikation af rottegenom |
| US20160186208A1 (en) | 2013-04-16 | 2016-06-30 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Methods of Mutating, Modifying or Modulating Nucleic Acid in a Cell or Nonhuman Mammal |
| US20160040155A1 (en) | 2013-04-16 | 2016-02-11 | University Of Washington Through Its Center For Commercialization | Activating an alternative pathway for homology-directed repair to stimulate targeted gene correction and genome engineering |
| EP2796558A1 (en) | 2013-04-23 | 2014-10-29 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Improved gene targeting and nucleic acid carrier molecule, in particular for use in plants |
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