ITMI20121406A1 - Procedimento per la produzione di tiacumicina b - Google Patents

Procedimento per la produzione di tiacumicina b Download PDF

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fermentation
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Guido Trione
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    • C12P19/44Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
    • C12P19/60Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin
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Description

“PROCEDIMENTO PER LA PRODUZIONE DI TIACUMICINA Bâ€
CAMPO DELL’INVENZIONE
La presente invenzione si riferisce a un procedimento migliorato di produzione di Tiacumicina B ed in particolar modo ad un metodo di fermentazione che consente di incrementare la produzione di Tiacumicina B e di prevenirne la sua degradazione nel brodo di coltura.
TECNICA PRECEDENTE
La Tiacumicina B, nota anche come Fidaxomicina, appartiene ad una famiglia di macrolattoni, prodotti da actinomiceti, con una storia complessa.
La Tiacumicina B, infatti, ha la stessa struttura della lipiarmycina che fu isolata e descritta da Lepetit nel 1976 in US3,978,211 come nuovo antibiotico prodotto mediante coltivazione di Actinoplanes deccanensis A/10655 ATCC21983.
Il primo brevetto rivendicava il prodotto lipiarmycina ed un metodo di fermentazione per produrla utilizzando Actinoplanes deccanensis in un terreno nutritivo contenente fonti assimilabili di carbonio, azoto e sali inorganici.
Nel 1986, Abbott Laboratories, depositava un nuovo brevetto US 4,918,174 relativo allo stesso prodotto, che in questo caso era chiamato Tiacumicina B, ottenuto da Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis.
Il ceppo produttore fu depositato all’ARS Patent Collection del Northern Regional Research Center di Peoria, dove gli fu assegnato il numero di accesso NRRL 18085.
Il brevetto rivendicava le Tiacumicine ed un procedimento per produrre Tiacumicine tramite coltivazione di Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis in un terreno nutritivo.
Più recentemente, Optimer Pharmaceutical ha depositato un nuovo brevetto US 7,507,564 che descrive un procedimento migliorato per la produzione di Tiacumicine allo scopo di ottenere una resa superiore a 50 mcg/ml.
Il procedimento descritto da Optimer à ̈ ancora basato sulla fermentazione di Dactylosporangium aurantiacum, ma in un terreno di fermentazione contenente una resina adsorbente in grado di adsorbire la Tiacumicina B.
La Tiacumicina B Ã ̈ un inibitore della RNA polimerasi.
Il grande interesse nei confronti della Tiacumicina B à ̈ dovuto alla sua attività biologica contro il batterio multiresistente (hospital superbug) Clostridium difficile.
Il C. difficile à ̈ un batterio sporigeno anaerobio Gram-positivo che può provocare gravi infezioni intestinali attraverso la produzione di tossine.
La Tiacumicina B à ̈ un antibiotico a spettro ristretto con una buona attività nei confronti dei clostridi e un’attività minima verso la restante microflora intestinale.
La specificità può essere importante per la riduzione del tasso di ricaduta (recidiva) che si osserva con gli antibiotici ad ampio spettro, poiché il mantenimento dell’equilibrio naturale dei batteri intestinali aiuta a fornire resistenza alla ricolonizzazione da parte dei patogeni.
Recentemente à ̈ stato dimostrato che la Tiacumicina B à ̈ efficace contro il Mycobacterium tuberculosis dotato di resistenza multidrug e presenta anche buona attività antitumorale.
DESCRIZIONE DELL’INVENZIONE
La presente invenzione si riferisce ad un procedimento migliorato per la produzione della Tiacumicina B e, particolarmente, all’uso nella fermentazione, di prodotti emulsionanti e/o antischiuma ed opzionalmente oli vegetali.
L’introduzione nel terreno di coltura o nel corso della fermentazione di questi composti, favorisce la produzione di Tiacumicina B e protegge la molecola dal degrado che si verifica naturalmente durante la fermentazione.
Il microorganismo preferibilmente utilizzato à ̈ Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis.
Si osserva frequentemente, nella biosintesi degli antibiotici, un effetto di regolazione feed-back che limita le potenzialità produttive. Allo stesso modo, la bassa resistenza del microrganismo produttore all’antibiotico sintetizzato, può limitare la produttività fermentativa.
Analizzando nello specifico la fermentazione della Tiacumicina B si nota che, con l’aumentare dell’età di fermentazione, una volta raggiunto il picco massimo di produttività, compaiono dei prodotti di degrado e la concentrazione di Tiacumicina B diminuisce in modo proporzionale.
L’ambiente di fermentazione non à ̈ favorevole ai composti chimicamente instabili. La variazione del pH, l’accumulo di cataboliti e la presenza di attività enzimatiche nel mezzo acquoso, sono tutte condizioni che concorrono alla degradazione dei composti instabili.
È stato osservato, sorprendentemente, che l’aggiunta di una miscela costituita da un emulsionante e/o un antischiuma ed opzionalmente un olio vegetale permette di evitare l’instaurarsi di fenomeni di inibizione ed, allo stesso tempo, di preservare il prodotto dalla degradazione.
La Tiacumicina B Ã ̈ un prodotto liposolubile che viene rilasciato, durante la fermentazione, nel terreno di coltura.
È stato sorprendentemente osservato, analizzando il brodo di fermentazione con analisi HPLC, che la produzione di Tiacumicina B nel terreno così modificato, continua ad incrementare nel corso della fermentazione fino a 168h senza che compaiano prodotti di degrado in quantità significativa.
Oggetto della presente invenzione à ̈ un procedimento per la produzione di Tiacumicina B comprendente la fermentazione di un microorganismo della specie Dactylosporangium aurantiacum, preferibilmente Dactylosporangium aurantiacum subsp. Hamdenensis, in un brodo di cultura contenente un emulsionante e/o un antischiuma ed opzionalmente un olio vegetale.
Gli emulsionanti sono costituiti da una componente idrofobica ed una idrofilica. Alcuni derivati dell’olio di ricino, etossilati, vengono utilizzati in formulazioni farmaceutiche per applicazioni orali, topiche o parenterali ed in campo cosmetico e per l’alimentazione animale.
Gli emulsionanti consentono di ottenere delle emulsioni stabili “olio in acqua†ed “acqua in olio†.
L’utilizzo di un emulsionante consente di favorire il passaggio di sostanze idrofobiche in acqua formando delle micelle che presentano all’ambiente acquoso la parte idrofilica e legano, al loro interno, la sostanza non idrosolubile.
È stato osservato, sorprendentemente, che la presenza nel terreno di fermentazione di un emulsionante favorisce la produzione di Tiacumicina B permettendo di ottenere produttività 10 volte superiori rispetto a quelle ottenibili con il terreno base.
In particolar modo risulta positivo l’utilizzo di un emulsionante, derivato etossilato dell’olio di ricino, con un bilancio idrofilico/lipofilico di circa 14 (HLB 14) utilizzato in concentrazioni comprese tra 0,5 e 30 g/L.
Analogamente à ̈ stato osservato che la produzione della Tiacumicina B à ̈ favorita, sebbene in maniera più modesta, dall’addizione al terreno di fermentazione di un antischiuma. Gli antischiuma sono anch’essi costituiti da una componente idrofilica ed una idrofobica.
L’utilizzo di un antischiuma del tipo poli-alchil-glicole ed in particolar modo di un alchil-poli-alcossi-etere, permette di raddoppiare la produttività rispetto al terreno base. Preferibilmente l’antischiuma à ̈ addizionato al terreno in concentrazione 0,5÷30 g/L.
L’utilizzo di prodotti emulsionanti in fermentatore à ̈ limitato dalla difficoltà, in condizioni d’areazione ed agitazione del brodo, di controllare l’elevata formazione di schiuma che essi determinano.
È stato sorprendentemente osservato che, se l’emulsionante viene utilizzato in combinazione con prodotti antischiuma o in combinazione con antischiuma ed oli vegetali, non si incorre in problemi di elevata formazione di schiuma e la produzione della Tiacumicina B risulta ulteriormente favorita.
In particolare l’olio vegetale à ̈ scelto nel gruppo costituito da olio di soia, girasole, oliva, arachidi, particolarmente preferito à ̈ l’olio di soia. Preferibilmente l’olio vegetale ha una concentrazione nel brodo di coltura compresa tra 0,5 g/L e 50 g/L.
L’assenza, o per lo meno l’accumulo minimo, di prodotti di degradazione permette di ottenere una maggiore concentrazione di Tiacumicina B nel brodo.
Inoltre, dato che il brodo contiene come prodotto prevalentemente la
Tiacumicina B, il recupero e la purificazione dello stesso dal brodo di
fermentazione diventa più efficiente.
Appare evidente che la presenza di un prodotto prevalentemente puro
nel brodo semplifichi il processo di recupero e permetta di evitare stadi di
purificazione lunghi e dispendiosi.
L’emulsionante e/o l’antischiuma e opzionalmente l’olio vegetale
possono essere presenti nel terreno di coltura. alternativamente l’emulsionante
e l’antischiuma possono essere aggiunti all’inizio della produzione della
Tiacumicina B in un'unica volta o gradualmente durante la fermentazione.
ESEMPIO 1 (comparativo)
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare una beuta (seed flask) contenente 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che fu incubata su un agitatore rotante per 48h a 30°C e 250÷300 rpm.
INGREDIENTE 1 L
Estratto lievito 7,5 g
Destrosio 1 g
Amido solubile 24 g
Peptone di soia 7,5 g
CaCO34 g
pH corretto a 7.3
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 1. terreno vegetativo VPF-1
Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (0,8% di inoculo) in una beuta contenente 30 ml di terreno produttivo PF-1 (tabella 2) che fu incubata su agitatore rotante a 30°C e
250÷300 rpm per 96h raggiungendo una produttività di 50mcg/ml.
INGREDIENTE 1 L
Destrosio 20 g
Amido 20g
Farina di soia 10 g
Estratto lievito 3 g
Olio di soia 1 g
K2HPO4*7H2O 0,05 g
MgSO4*7H2O 0,05 g
KCl 0,03
CaCO33 g
Senza correzione del pH
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 2. terreno produttivo PF-1
ESEMPIO 2
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare una beuta (seed flask) contenente 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che fu incubata su un agitatore rotante per 48h a 30°C e 250÷300
rpm. Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (0,8% di inoculo) in una beuta contenente 30 ml di terreno
produttivo PF-2 (tabella 3) che fu incubata su agitatore rotante a 30°C e
250÷300 rpm per 96h raggiungendo una produttività di 125 mcg/ml.
INGREDIENTE 1 L
Destrosio 20 g
Amido 20g
Farina di soia 10 g
Estratto lievito 3 g
Olio di soia 1 g
K2HPO4*7H2O 0,05 g
MgSO4*7H2O 0,05 g
KCl 0,03
CaCO33 g
antischiuma 5g
Senza correzione del pH
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 3: terreno produttivo PF-2
ESEMPIO 3
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare una beuta (seed flask) contenente 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che fu incubata su un agitatore rotante per 48h a 30°C e 250÷300
rpm. Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (0,8% di inoculo) in una beuta contenente 30 ml di terreno
produttivo PF-3 (tabella 4) che fu incubata su agitatore rotante a 30°C e
250÷300 rpm per 168h raggiungendo una produttività di 470 mcg/ml.
INGREDIENTE 1 L
Destrosio 20 g
Amido 40g
Farina di soia 10 g
Estratto lievito 3 g
Olio di soia 1 g
K2HPO4*7H2O 0,05 g
MgSO4*7H2O 0,05 g
KCl 0,03
CaCO33 g
emulsionante 15g
Senza correzione del pH
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 4: terreno produttivo PF-3
ESEMPIO 4
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare una beuta (seed flask) contenente 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che fu incubata su un agitatore rotante per 48h a 30°C e 250÷300
rpm. Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (0,8% di inoculo) in una beuta contenente 30 ml di terreno
produttivo PF-4 (tabella 5) che fu incubata su agitatore rotante a 30°C e
250÷300 rpm per 168h raggiungendo una produttività di 750mcg/ml.
INGREDIENTE 1 L
Destrosio 20 g
Amido 40g
Farina di soia 10 g
Estratto lievito 3 g
Olio di soia 1 g
K2HPO4*7H2O 0,05 g
MgSO4*7H2O 0,05 g
KCl 0,03
CaCO33 g
antischiuma 5,5g
emulsionante 5,5g
Senza correzione del pH
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 5: terreno produttivo PF-4
ESEMPIO 5
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare una beuta (seed flask) contenente 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che fu incubata su un agitatore rotante per 48h a 30°C e 250÷300
rpm. Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (0,8% di inoculo) in una beuta contenente 30 ml di terreno
produttivo PF-5 (tabella 6) che fu incubata su agitatore rotante a 30°C e
250÷300 rpm per 168h raggiungendo una produttività di 730mcg/ml.
INGREDIENTE 1 L
Destrosio 20 g
Amido 40g
Farina di soia 10 g
Estratto lievito 3 g
Olio di soia 6,4 g
K2HPO4*7H2O 0,05 g
MgSO4*7H2O 0,05 g
KCl 0,03
CaCO33 g
antischiuma 5,5g
emulsionante 5,5g
Senza correzione del pH
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 6: terreno produttivo PF-5
ESEMPIO 6
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare una beuta (seed flask) contenente 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che fu incubata su un agitatore rotante per 48h a 30°C e 250÷300
rpm. Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (0,8% di inoculo) in una beuta contenente 30 ml di terreno
produttivo PF-1/1 (tabella 7) che fu incubata su agitatore rotante a 30°C e
250÷300 rpm per 72h. A 72h fu aggiunta una soluzione di emulsionante ed
antischiuma in modo da ottenere in terreno produttivo una concentrazione di
11 g/L per entrambi. La fermentazione fu ulteriormente incubata fino a 168h
raggiungendo una produttività di 530 mcg/ml.
INGREDIENTE 1 L
Destrosio 20 g
Amido 40g
Farina di soia 10 g
Estratto lievito 3 g
Olio di soia 1 g
K2HPO4*7H2O 0,05 g
MgSO4*7H2O 0,05 g
KCl 0,03
CaCO33 g
Senza correzione del pH
Sterilizzazione 121C° x 30 min
Tabella 7: terreno produttivo PF-1/1
ESEMPIO 7
Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis AB718C-41
NRRL18085 fu mantenuto a -180°C (WCB). La coltura stock fu usata per
inoculare 6 beute (seed flask) contenenti 40 ml di terreno vegetativo VPF-1
(Tabella 1) che furono incubate su un agitatore rotante per 48h a 30°C e
250÷300 rpm. Al termine dell’incubazione, la coltura vegetativa fu trasferita
asetticamente (1,4% di inoculo) in una fermentatore da 20L contenente 16L di
terreno produttivo PF-5 (tabella 6).
La fermentazione, condotta a 30°C, con areazione 0,75 vvm a
contropressione 0,5 bar ed agitata a 210÷250 rpm, ha portato ad una
produttività di 440 mcg/ml a 120h di fermentazione.

Claims (12)

  1. RIVENDICAZIONI 1. Un procedimento per la produzione di Tiacumicina B comprendente la fermentazione di un microorganismo della specie Dactylosporangium aurantiacum in un brodo di cultura contenente un emulsionante e/o un antischiuma ed opzionalmente un olio vegetale.
  2. 2. Il procedimento secondo la rivendicazione 1 in cui il microorganismo à ̈ Dactylosporangium aurantiacum subsp. hamdenensis.
  3. 3. Il procedimento secondo la rivendicazione 1 o 2 dove l’emulsionante à ̈ un derivato etossilato dell’olio di ricino.
  4. 4. Il procedimento secondo ciascuna delle rivendicazioni da 1 a 3 in cui l’antischiuma à ̈ un polialchilglicole.
  5. 5. Il procedimento secondo la rivendicazione 4 in cui l’antischiuma à ̈ un alchil-poli-alcossi-etere.
  6. 6. Il procedimento secondo ciascuna delle rivendicazioni da 1 a 5 in cui l’olio vegetale à ̈ scelto nel gruppo costituito da olio di soia, girasole, oliva, arachidi.
  7. 7. Il procedimento secondo la rivendicazioni 6 in cui l’olio vegetale à ̈ l’olio di soia.
  8. 8. Il procedimento secondo ciascuna delle rivendicazioni da 1 a 7 in cui l’emulsionante ha una concentrazione nel brodo di coltura compresa tra 0,5 g/L e 30 g/L.
  9. 9. Il procedimento secondo ciascuna delle rivendicazioni da 1 a 8 in cui l’antischiuma ha una concentrazione nel brodo di coltura compresa tra 0,5 g/L e 30 g/L.
  10. 10. Il procedimento ciascuna delle rivendicazioni da 1 a 9 in cui l’olio vegetale ha una concentrazione nel brodo di coltura compresa tra 0,5 g/L e 50 g/L.
  11. 11. Il procedimento secondo ciascuna delle rivendicazioni da 1 a 10 in cui l’emulsionante e/o l’antischiuma e opzionalmente l’olio vegetale sono presenti nel terreno di coltura.
  12. 12. Il procedimento secondo le rivendicazioni 1-10 in cui l’emulsionante e l’antischiuma vengono aggiunti all’inizio della produzione della Tiacumicina B in un’unica volta o gradualmente durante la fermentazione.
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