JP2000346847A - 生体由来物質の検出方法および装置 - Google Patents
生体由来物質の検出方法および装置Info
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Landscapes
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
Abstract
(57)【要約】
【課題】 試験片のスポット位置から発せられる信号値
をテンプレートを用いて検出する際に、スポット位置が
異なる試験片を用いても、新たなテンプレートを作成す
ることなく信号値の検出を行う。 【解決手段】 スポット位置の配置が異なる複数種類の
試験片に対応して、複数種類のテンプレートＴをテンプ
レート記憶手段１２に記憶しておく。解析手段１１にお
いて解析を行う際に、使用した試験片のスポット位置に
対応する位置にＲＯＩが配置されたテンプレートＴをテ
ンプレート記憶手段１２から読出して、標識データＳ
１，Ｓ２により表される画像にこのテンプレートＴを設
定し、テンプレートＴのＲＯＩに対応する位置における
信号値を検出して評価を行う。
をテンプレートを用いて検出する際に、スポット位置が
異なる試験片を用いても、新たなテンプレートを作成す
ることなく信号値の検出を行う。 【解決手段】 スポット位置の配置が異なる複数種類の
試験片に対応して、複数種類のテンプレートＴをテンプ
レート記憶手段１２に記憶しておく。解析手段１１にお
いて解析を行う際に、使用した試験片のスポット位置に
対応する位置にＲＯＩが配置されたテンプレートＴをテ
ンプレート記憶手段１２から読出して、標識データＳ
１，Ｓ２により表される画像にこのテンプレートＴを設
定し、テンプレートＴのＲＯＩに対応する位置における
信号値を検出して評価を行う。
Description
【０００１】
【発明の属する技術分野】本発明は、ＤＮＡの解析や免
疫学的解析に用いられる試験片によって生体由来物質を
検出する方法および装置に関するものである。
疫学的解析に用いられる試験片によって生体由来物質を
検出する方法および装置に関するものである。
【０００２】
【従来の技術】近年、遺伝子工学分野における技術が急
速に発展し、１０万個にも及ぶと考えられているヒトゲ
ノムの塩基配列を解読することを１つの目的とするヒト
ゲノムプロジェクトが展開されている。
速に発展し、１０万個にも及ぶと考えられているヒトゲ
ノムの塩基配列を解読することを１つの目的とするヒト
ゲノムプロジェクトが展開されている。
【０００３】一方、抗原抗体反応を利用する酵素免疫測
定法や蛍光抗体法等が診断や研究のために利用され、ま
た各種遺伝子疾患に影響を与えているＤＮＡを探索する
研究も進んでおり、その１つの方法としてアレイ技術が
注目されている。
定法や蛍光抗体法等が診断や研究のために利用され、ま
た各種遺伝子疾患に影響を与えているＤＮＡを探索する
研究も進んでおり、その１つの方法としてアレイ技術が
注目されている。
【０００４】このアレイ技術は、図１に示すような、既
に解読されている互いに異なる既知の多数のｃＤＮＡ
（特異的結合物質の一例）がメンブレンフィルタやスラ
イドガラス等の坦体２上にマトリクス状に高密度に予め
配置されたアレイチップ（ＤＮＡチップと称するものも
あるが、ここでは総称してアレイチップとする）を試験
片１として用いる技術であり、例えば、蛍光色素や放射
性同位体からなる標識物質で標識された健常者Ａの細胞
由来のＤＮＡ（生体由来物質の一例）および上記標識物
質で標識された、遺伝子疾患を有する検体Ｂの細胞由来
のＤＮＡをそれぞれ別個のアレイチップに滴下して、各
検体Ａ，ＢのｃＤＮＡとアレイチップ上のｃＤＮＡとを
ハイブリダイズさせ、後に各アレイチップ上の各ｃＤＮ
Ａに、各標識物質を励起するレーザ光を走査して各ｃＤ
ＮＡ毎に放出される蛍光や放射線を光検出器で検出し、
アレイチップ上における発光位置（スポット位置）に対
応付けられたこの検出結果を表す標識信号を得、各検体
のｃＤＮＡがいずれのｃＤＮＡとハイブリダイズされて
いるかを求め、両検体間において得られる標識信号の比
あるいは差を求めることにより、両検体間においてハイ
ブリダイズされたｃＤＮＡを比較して、上記疾病により
発現した遺伝子または欠損した遺伝子（以下発現の変化
とする）を特定する技術である。この際、標識信号によ
り表される２つの画像をプリント出力あるいはモニタに
出力して、目視により確認することにより発現の変化を
特定することができる。一方、両検体から得られる標識
信号の比は、発現の変化がある位置において得られるも
のほど大きく（あるいは小さく）なることから、各検体
間における標識信号の比が大きい方から（あるいは小さ
い方から）順に例えば５０箇所分のスポット位置におけ
る信号値の比を、その信号が得られた位置と対応付けて
測定結果を表す測定結果表として出力し、この測定結果
表とモニタに表示された画像とに基づいてその信号値が
得られた位置を求め、発現の変化を特定することができ
る。
に解読されている互いに異なる既知の多数のｃＤＮＡ
（特異的結合物質の一例）がメンブレンフィルタやスラ
イドガラス等の坦体２上にマトリクス状に高密度に予め
配置されたアレイチップ（ＤＮＡチップと称するものも
あるが、ここでは総称してアレイチップとする）を試験
片１として用いる技術であり、例えば、蛍光色素や放射
性同位体からなる標識物質で標識された健常者Ａの細胞
由来のＤＮＡ（生体由来物質の一例）および上記標識物
質で標識された、遺伝子疾患を有する検体Ｂの細胞由来
のＤＮＡをそれぞれ別個のアレイチップに滴下して、各
検体Ａ，ＢのｃＤＮＡとアレイチップ上のｃＤＮＡとを
ハイブリダイズさせ、後に各アレイチップ上の各ｃＤＮ
Ａに、各標識物質を励起するレーザ光を走査して各ｃＤ
ＮＡ毎に放出される蛍光や放射線を光検出器で検出し、
アレイチップ上における発光位置（スポット位置）に対
応付けられたこの検出結果を表す標識信号を得、各検体
のｃＤＮＡがいずれのｃＤＮＡとハイブリダイズされて
いるかを求め、両検体間において得られる標識信号の比
あるいは差を求めることにより、両検体間においてハイ
ブリダイズされたｃＤＮＡを比較して、上記疾病により
発現した遺伝子または欠損した遺伝子（以下発現の変化
とする）を特定する技術である。この際、標識信号によ
り表される２つの画像をプリント出力あるいはモニタに
出力して、目視により確認することにより発現の変化を
特定することができる。一方、両検体から得られる標識
信号の比は、発現の変化がある位置において得られるも
のほど大きく（あるいは小さく）なることから、各検体
間における標識信号の比が大きい方から（あるいは小さ
い方から）順に例えば５０箇所分のスポット位置におけ
る信号値の比を、その信号が得られた位置と対応付けて
測定結果を表す測定結果表として出力し、この測定結果
表とモニタに表示された画像とに基づいてその信号値が
得られた位置を求め、発現の変化を特定することができ
る。
【０００５】この際、各スポット位置に対応する信号値
は、標識信号により表される画像に対して、スポット位
置に対応する円形のＲＯＩが配置されたテンプレートを
設定し、このテンプレートのＲＯＩの位置に対応する箇
所における信号値を検出することにより得られるもので
ある。
は、標識信号により表される画像に対して、スポット位
置に対応する円形のＲＯＩが配置されたテンプレートを
設定し、このテンプレートのＲＯＩの位置に対応する箇
所における信号値を検出することにより得られるもので
ある。
【０００６】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、上述し
た試験片におけるスポット位置の配置の仕方は、試験片
の製造メーカーや試験の目的などに応じて種々異なるた
め、特定の製造メーカーや特定の試験に用いられる試験
片にのみ対応するテンプレートしか有していない場合
は、他の試験片を用いると、スポット位置とＲＯＩの位
置とが対応しないことから、信号値の検出を行うことが
できなくなる。この場合、使用する試験片のスポット位
置に対応する位置にＲＯＩが配置された新たなテンプレ
ートを作成すれば信号値の検出を行うことができる。し
かしながら、試験片におけるスポット位置は少ないもの
で５００箇所、多いものでは数万箇所もあり、スポット
位置の配置の仕方も試験片毎に種々異なるため、テンプ
レートを作成する作業が非常に煩わしいものとなる。
た試験片におけるスポット位置の配置の仕方は、試験片
の製造メーカーや試験の目的などに応じて種々異なるた
め、特定の製造メーカーや特定の試験に用いられる試験
片にのみ対応するテンプレートしか有していない場合
は、他の試験片を用いると、スポット位置とＲＯＩの位
置とが対応しないことから、信号値の検出を行うことが
できなくなる。この場合、使用する試験片のスポット位
置に対応する位置にＲＯＩが配置された新たなテンプレ
ートを作成すれば信号値の検出を行うことができる。し
かしながら、試験片におけるスポット位置は少ないもの
で５００箇所、多いものでは数万箇所もあり、スポット
位置の配置の仕方も試験片毎に種々異なるため、テンプ
レートを作成する作業が非常に煩わしいものとなる。
【０００７】本発明は上記事情に鑑みなされたものであ
り、スポット位置の配置が異なる試験片を用いても、ス
ポット位置における信号値の検出を行うことができる生
体由来物質の検出方法および装置を提供することを目的
とするものである。
り、スポット位置の配置が異なる試験片を用いても、ス
ポット位置における信号値の検出を行うことができる生
体由来物質の検出方法および装置を提供することを目的
とするものである。
【０００８】
【課題を解決するための手段】本発明による生体由来物
質の検出方法は、坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するＲＯＩが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ＲＯＩに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する生体由来物質の
検出方法において、複数種類のテンプレートを記憶した
テンプレート記憶手段から、前記試験片に対応する種類
のテンプレートを読出し、該読出されたテンプレートに
基づいて、前記信号値を検出することを特徴とするもの
である。
質の検出方法は、坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するＲＯＩが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ＲＯＩに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する生体由来物質の
検出方法において、複数種類のテンプレートを記憶した
テンプレート記憶手段から、前記試験片に対応する種類
のテンプレートを読出し、該読出されたテンプレートに
基づいて、前記信号値を検出することを特徴とするもの
である。
【０００９】ここで、「ＲＯＩ」は使用する試験片にお
ける特異的結合物質の配置位置に応じて配置されてお
り、「試験片に対応する種類のテンプレートを読出す」
とは、使用する試験片の特異的結合物質の配置位置に対
応してＲＯＩが配置されたテンプレートを読出すことを
いう。
ける特異的結合物質の配置位置に応じて配置されてお
り、「試験片に対応する種類のテンプレートを読出す」
とは、使用する試験片の特異的結合物質の配置位置に対
応してＲＯＩが配置されたテンプレートを読出すことを
いう。
【００１０】また、「テンプレートに基づいて信号値を
検出する」とは、テンプレートを標識信号により表され
る画像上に設定し、この画像のＲＯＩに対応する位置に
おける標識信号の信号値を検出することをいう。
検出する」とは、テンプレートを標識信号により表され
る画像上に設定し、この画像のＲＯＩに対応する位置に
おける標識信号の信号値を検出することをいう。
【００１１】「担体」とは、特異的結合物質を安定に結
合、点着できるものであればよく、例えばメンブレンフ
ィルタやスライドガラス板等である。これらの担体は特
異的結合物質を安定に結合するために、前処理がなされ
ているものであってもよい。
合、点着できるものであればよく、例えばメンブレンフ
ィルタやスライドガラス板等である。これらの担体は特
異的結合物質を安定に結合するために、前処理がなされ
ているものであってもよい。
【００１２】「特異的結合物質」とは、ホルモン類、腫
瘍マーカー、酵素、抗体、抗原、アブザイム、その他の
タンパク、核酸、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ、ＲＮＡ等であっ
て、生体由来物質と特異的に結合可能な物質を意味す
る。「既知の」とは、特異的結合物質によって異なる
が、例えば核酸であればその塩基配列や塩基の長さ等
が、タンパクであればアミノ酸の組成等が分かっている
ことを意味する。ここで、担体の所定の複数位置に配置
される特異的結合物質は、各位置毎に１種類の特異的結
合物質が配置されていることを意味する。
瘍マーカー、酵素、抗体、抗原、アブザイム、その他の
タンパク、核酸、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ、ＲＮＡ等であっ
て、生体由来物質と特異的に結合可能な物質を意味す
る。「既知の」とは、特異的結合物質によって異なる
が、例えば核酸であればその塩基配列や塩基の長さ等
が、タンパクであればアミノ酸の組成等が分かっている
ことを意味する。ここで、担体の所定の複数位置に配置
される特異的結合物質は、各位置毎に１種類の特異的結
合物質が配置されていることを意味する。
【００１３】「生体由来物質」とは、担体上の所定の位
置に配置された既知の特異的結合物質と特異的に結合す
る物質であって、生体から抽出、単離等された物質を意
味するが、生体から直接抽出されたものだけでなく、こ
れらを化学処理、化学修飾等したものも含まれる。例え
ばホルモン類、腫瘍マーカー、酵素、抗体、抗原、アブ
ザイム、その他のタンパク、核酸、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ、
ｍＲＮＡ等の物質である。
置に配置された既知の特異的結合物質と特異的に結合す
る物質であって、生体から抽出、単離等された物質を意
味するが、生体から直接抽出されたものだけでなく、こ
れらを化学処理、化学修飾等したものも含まれる。例え
ばホルモン類、腫瘍マーカー、酵素、抗体、抗原、アブ
ザイム、その他のタンパク、核酸、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ、
ｍＲＮＡ等の物質である。
【００１４】「標識物質」とは、生体由来物質から情報
を得るためにこれらの一部を改変し、あるいはこれらに
直接付加される、目印となる物質を意味する。標識物質
は、標識物質から放出される標識信号が検出でき、かつ
生体由来物質に取り込まれる規則性が予め分かっている
ものであれば特に限定されるものではない。例えばサイ
バーグリーンII、Ｃｙ５、フルオレセインイソチオシア
ネート等の蛍光色素や ３２Ｐ、３３Ｐ等の放射性同位体
を用いることが好ましい。
を得るためにこれらの一部を改変し、あるいはこれらに
直接付加される、目印となる物質を意味する。標識物質
は、標識物質から放出される標識信号が検出でき、かつ
生体由来物質に取り込まれる規則性が予め分かっている
ものであれば特に限定されるものではない。例えばサイ
バーグリーンII、Ｃｙ５、フルオレセインイソチオシア
ネート等の蛍光色素や ３２Ｐ、３３Ｐ等の放射性同位体
を用いることが好ましい。
【００１５】「標識信号」とは、例えば標識物質が蛍光
色素である場合には蛍光、標識物質が放射性同位体であ
る場合には放射線のように、標識物質から放出、あるい
は出力されるものを光検出器あるいは放射線検出器にお
いて検出することにより得られる信号のことをいう。
色素である場合には蛍光、標識物質が放射性同位体であ
る場合には放射線のように、標識物質から放出、あるい
は出力されるものを光検出器あるいは放射線検出器にお
いて検出することにより得られる信号のことをいう。
【００１６】「生体由来物質を特異的結合物質に結合」
とは、例えばＤＮＡやＲＮＡ等で見られる相補的なヌク
レオチド配列の間に安定な二重鎖が形成されるような場
合（ハイブリダイゼーション）や、抗原と抗体、ビオチ
ンとアビジン等のように、特定の物質とのみ選択的に反
応する極めて特異性の高い結合を意味する。
とは、例えばＤＮＡやＲＮＡ等で見られる相補的なヌク
レオチド配列の間に安定な二重鎖が形成されるような場
合（ハイブリダイゼーション）や、抗原と抗体、ビオチ
ンとアビジン等のように、特定の物質とのみ選択的に反
応する極めて特異性の高い結合を意味する。
【００１７】なお、本発明による生体由来物質の検出方
法においては、新たなテンプレートを作成し、該新たな
テンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶するこ
とが好ましい。
法においては、新たなテンプレートを作成し、該新たな
テンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶するこ
とが好ましい。
【００１８】本発明による生体由来物質の検出装置は、
坦体上の所定の複数位置に互いに異なる複数の既知の特
異的結合物質が配置された試験片における前記特異的結
合物質に、検体の標識物質で標識された生体由来物質を
結合せしめ、該結合した前記生体由来物質の標識物質か
ら放出される標識信号により表される画像を得、前記試
験片における前記特的結合物質の配置位置に対応するＲ
ＯＩが配置されたテンプレートを前記画像上に設定し、
該画像の前記ＲＯＩに対応する位置における前記標識信
号の信号値を検出する解析手段を備えた生体由来物質の
検出装置において、複数種類のテンプレートを記憶した
テンプレート記憶手段と、該テンプレート記憶手段から
前記試験片に対応する種類のテンプレートを読出す読出
手段とを備え、前記解析手段は、前記読出されたテンプ
レートに基づいて、前記信号値を検出する手段であるこ
とを特徴とするものである。
坦体上の所定の複数位置に互いに異なる複数の既知の特
異的結合物質が配置された試験片における前記特異的結
合物質に、検体の標識物質で標識された生体由来物質を
結合せしめ、該結合した前記生体由来物質の標識物質か
ら放出される標識信号により表される画像を得、前記試
験片における前記特的結合物質の配置位置に対応するＲ
ＯＩが配置されたテンプレートを前記画像上に設定し、
該画像の前記ＲＯＩに対応する位置における前記標識信
号の信号値を検出する解析手段を備えた生体由来物質の
検出装置において、複数種類のテンプレートを記憶した
テンプレート記憶手段と、該テンプレート記憶手段から
前記試験片に対応する種類のテンプレートを読出す読出
手段とを備え、前記解析手段は、前記読出されたテンプ
レートに基づいて、前記信号値を検出する手段であるこ
とを特徴とするものである。
【００１９】なお、本発明による生体由来物質の検出装
置においては、新たなテンプレートを作成し、該新たな
テンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶するテ
ンプレート作成手段をさらに備えることが好ましい。
置においては、新たなテンプレートを作成し、該新たな
テンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶するテ
ンプレート作成手段をさらに備えることが好ましい。
【００２０】
【発明の効果】本発明によれば、複数種類のテンプレー
トを記憶したテンプレート記憶手段から、試験片に対応
する種類のテンプレートを読出して信号値の検出を行う
ようにしたため、使用する可能性のある試験片に対応す
るテンプレートをテンプレート記憶手段に記憶しておけ
ば、どのような試験片を用いても、新たなテンプレート
を作成することなく、標識信号から特的結合物質が配置
された位置における信号値を検出することができる。
トを記憶したテンプレート記憶手段から、試験片に対応
する種類のテンプレートを読出して信号値の検出を行う
ようにしたため、使用する可能性のある試験片に対応す
るテンプレートをテンプレート記憶手段に記憶しておけ
ば、どのような試験片を用いても、新たなテンプレート
を作成することなく、標識信号から特的結合物質が配置
された位置における信号値を検出することができる。
【００２１】また、試験片における特的結合物質の配置
がテンプレート記憶手段に記憶されたテンプレートにな
いものであっても、新たなテンプレートを作成可能とす
ることにより、この試験片からも特異的結合物質が配置
された位置における信号値を検出することができる。こ
の場合、テンプレートを作成する手間がかかるが、新た
に作成したテンプレートをテンプレート記憶手段に記憶
しておけば、これと同一の試験片を使用した場合に直ち
にこの試験片から信号値を検出することができる。
がテンプレート記憶手段に記憶されたテンプレートにな
いものであっても、新たなテンプレートを作成可能とす
ることにより、この試験片からも特異的結合物質が配置
された位置における信号値を検出することができる。こ
の場合、テンプレートを作成する手間がかかるが、新た
に作成したテンプレートをテンプレート記憶手段に記憶
しておけば、これと同一の試験片を使用した場合に直ち
にこの試験片から信号値を検出することができる。
【００２２】
【発明の実施の形態】以下図面を参照して本発明の実施
形態について説明する。
形態について説明する。
【００２３】図１は本発明の実施形態に用いられる試験
片を示す図である。図１に示すように、本実施形態に用
いられる試験片１は、メンブレンフィルタやスライドガ
ラス等の坦体２の所定の複数位置に互いに異なる複数の
既知のｃＤＮＡ（特異的結合物質として）が配置されて
なるものである。なお、坦体２に配置されるｃＤＮＡは
既にその塩基配列が解読されている互いに異なるＤＮＡ
にそれぞれ対応したものであり、坦体２上におけるその
配置位置は予め定められている。また、坦体２に配置さ
れるｃＤＮＡの位置（以下スポット位置とする）は、試
験片１のメーカー毎に異なるものとされている。
片を示す図である。図１に示すように、本実施形態に用
いられる試験片１は、メンブレンフィルタやスライドガ
ラス等の坦体２の所定の複数位置に互いに異なる複数の
既知のｃＤＮＡ（特異的結合物質として）が配置されて
なるものである。なお、坦体２に配置されるｃＤＮＡは
既にその塩基配列が解読されている互いに異なるＤＮＡ
にそれぞれ対応したものであり、坦体２上におけるその
配置位置は予め定められている。また、坦体２に配置さ
れるｃＤＮＡの位置（以下スポット位置とする）は、試
験片１のメーカー毎に異なるものとされている。
【００２４】次に図２を用いて、図１に示した試験片１
の読取装置について説明する。図示の読取装置１００
は、後述する２種類の試験片１，１′の読取装置の一実
施形態であり、上述した多数の既知の互いに異なるｃＤ
ＮＡが配置されている２つの試験片１，１′のそれぞれ
に、互いに異なる２つの検体Ａ，Ｂの蛍光色素で標識さ
れたｃＤＮＡ（生体由来物質として）をハイブリダイズ
させたものを載置して所定の位置に設置する透明な試料
台２０と、蛍光色素を励起するのに適した発光波長のレ
ーザ光Ｌ１を発光するレーザ光源２１と、試験片１，
１′の蛍光色素が励起されて発光した蛍光を光電的に検
出するフォトマルチプライヤ（以下ＰＭＴという）９０
と、レーザ光源２１から出射されたレーザ光Ｌ１を、試
料台２０に載置された試験片１，１′に照射させるとと
もに、この照射により試験片１，１′から出射する蛍光
Ｋ１，Ｋ２をＰＭＴ９０に導光させる光学ヘッド５０
と、光学ヘッド５０を矢印Ｘ方向に等速移動させる主走
査手段６０と、レーザ光源２１、光学ヘッド５０および
ＰＭＴ９０を一体的に矢印Ｙ方向（矢印Ｘ方向に直行す
る方向）に移動させる副走査手段７０と、ＰＭＴ９０に
より検出された検出信号を対数増幅する増幅器９１と、
この増幅された検出信号をＡ／Ｄ変換して標識データＳ
１，Ｓ２を得るＡ／Ｄ変換器９２と、試験片１，１′間
において、互いに対応するスポット位置における標識デ
ータＳ１，Ｓ２を比較して比較結果を算出する解析装置
９３と、レーザ光Ｌ１を出射させる制御を行うコントロ
ールユニット９５とを備えた構成である。なお、標識デ
ータＳ１，Ｓ２は試験片１，１′における検体Ａ，Ｂが
ハイブリダイズされた各スポット位置において得られる
信号値の全体を総称するものである。
の読取装置について説明する。図示の読取装置１００
は、後述する２種類の試験片１，１′の読取装置の一実
施形態であり、上述した多数の既知の互いに異なるｃＤ
ＮＡが配置されている２つの試験片１，１′のそれぞれ
に、互いに異なる２つの検体Ａ，Ｂの蛍光色素で標識さ
れたｃＤＮＡ（生体由来物質として）をハイブリダイズ
させたものを載置して所定の位置に設置する透明な試料
台２０と、蛍光色素を励起するのに適した発光波長のレ
ーザ光Ｌ１を発光するレーザ光源２１と、試験片１，
１′の蛍光色素が励起されて発光した蛍光を光電的に検
出するフォトマルチプライヤ（以下ＰＭＴという）９０
と、レーザ光源２１から出射されたレーザ光Ｌ１を、試
料台２０に載置された試験片１，１′に照射させるとと
もに、この照射により試験片１，１′から出射する蛍光
Ｋ１，Ｋ２をＰＭＴ９０に導光させる光学ヘッド５０
と、光学ヘッド５０を矢印Ｘ方向に等速移動させる主走
査手段６０と、レーザ光源２１、光学ヘッド５０および
ＰＭＴ９０を一体的に矢印Ｙ方向（矢印Ｘ方向に直行す
る方向）に移動させる副走査手段７０と、ＰＭＴ９０に
より検出された検出信号を対数増幅する増幅器９１と、
この増幅された検出信号をＡ／Ｄ変換して標識データＳ
１，Ｓ２を得るＡ／Ｄ変換器９２と、試験片１，１′間
において、互いに対応するスポット位置における標識デ
ータＳ１，Ｓ２を比較して比較結果を算出する解析装置
９３と、レーザ光Ｌ１を出射させる制御を行うコントロ
ールユニット９５とを備えた構成である。なお、標識デ
ータＳ１，Ｓ２は試験片１，１′における検体Ａ，Ｂが
ハイブリダイズされた各スポット位置において得られる
信号値の全体を総称するものである。
【００２５】検体Ａは健常者であり、検体Ｂは所定の遺
伝子疾病を有する者である。各試験片１，１′には上述
したように、多数の既知の互いに異なるｃＤＮＡが所定
スポット位置に配置されており、さらにこの試験片１，
１′に上記各検体Ａ，Ｂの細胞由来の各ｃＤＮＡがピペ
ット等でスポットされ、試験片１，１′上の多数のｃＤ
ＮＡのうち、各検体Ａ，Ｂの各ｃＤＮＡに対応する（相
補的な）ｃＤＮＡはこれらのｃＤＮＡとハイブリダイズ
されている。そして所定の溶液で、いずれかの検体のｃ
ＤＮＡとハイブリダイズされたｃＤＮＡを残して、いず
れの検体のｃＤＮＡともハイブリダイズされていないｃ
ＤＮＡは洗浄されている。
伝子疾病を有する者である。各試験片１，１′には上述
したように、多数の既知の互いに異なるｃＤＮＡが所定
スポット位置に配置されており、さらにこの試験片１，
１′に上記各検体Ａ，Ｂの細胞由来の各ｃＤＮＡがピペ
ット等でスポットされ、試験片１，１′上の多数のｃＤ
ＮＡのうち、各検体Ａ，Ｂの各ｃＤＮＡに対応する（相
補的な）ｃＤＮＡはこれらのｃＤＮＡとハイブリダイズ
されている。そして所定の溶液で、いずれかの検体のｃ
ＤＮＡとハイブリダイズされたｃＤＮＡを残して、いず
れの検体のｃＤＮＡともハイブリダイズされていないｃ
ＤＮＡは洗浄されている。
【００２６】ここで、レーザ光源２１は例えば波長633n
mのレーザ光Ｌ１を出射するHe−Neレーザ、波長532nmの
レーザ光Ｌ１を出射するＳＨＧレーザ、波長473nmのレ
ーザ光Ｌ１を出射するＳＨＧレーザを用いることができ
る。波長633nmのレーザ光Ｌ１は、例えばＣｙ５という
蛍光色素を励起するのに適し、波長532nmのレーザ光Ｌ
１は、例えばＣｙ３という蛍光色素を励起するのに適
し、波長473nmのレーザ光Ｌ１は、例えばFloresceinと
いう蛍光色素を励起するのに適している。
mのレーザ光Ｌ１を出射するHe−Neレーザ、波長532nmの
レーザ光Ｌ１を出射するＳＨＧレーザ、波長473nmのレ
ーザ光Ｌ１を出射するＳＨＧレーザを用いることができ
る。波長633nmのレーザ光Ｌ１は、例えばＣｙ５という
蛍光色素を励起するのに適し、波長532nmのレーザ光Ｌ
１は、例えばＣｙ３という蛍光色素を励起するのに適
し、波長473nmのレーザ光Ｌ１は、例えばFloresceinと
いう蛍光色素を励起するのに適している。
【００２７】次に本実施形態の読取装置１００の動作に
ついて説明する。
ついて説明する。
【００２８】試料台２０上に、検体Ａの蛍光色素で標識
されたｃＤＮＡがハイブリダイズされた試験片１が載置
され、コントロールユニット９５はレーザ光Ｌ１を出射
させるようにレーザ光源２１を制御し、これにより、レ
ーザ光源２１からレーザ光Ｌ１が出射される。レーザ光
源２１から出射されたレーザ光Ｌ１は矢印Ｘ方向に進
む。光学ヘッド５０の平面ミラー５１に入射したレーザ
光Ｌ１は図示上方に反射され、孔開きミラー５２の小孔
５２ａを通過してレンズ５３に入射し、レンズ５３を通
って試料台２０上に載置された試験片１の微小領域を照
射する。このとき光学ヘッド５０は、主走査手段６０に
より高速にかつ等速度で矢印Ｘ方向に移動させられてお
り、レーザ光Ｌ１は試験片１を矢印Ｘ方向に主走査する
ため、この主走査中に、レーザ光Ｌ１が照射された微小
領域に存在するｃＤＮＡに対しては、照射されたレーザ
光Ｌ１により蛍光色素が励起されて蛍光Ｋ１を発光す
る。
されたｃＤＮＡがハイブリダイズされた試験片１が載置
され、コントロールユニット９５はレーザ光Ｌ１を出射
させるようにレーザ光源２１を制御し、これにより、レ
ーザ光源２１からレーザ光Ｌ１が出射される。レーザ光
源２１から出射されたレーザ光Ｌ１は矢印Ｘ方向に進
む。光学ヘッド５０の平面ミラー５１に入射したレーザ
光Ｌ１は図示上方に反射され、孔開きミラー５２の小孔
５２ａを通過してレンズ５３に入射し、レンズ５３を通
って試料台２０上に載置された試験片１の微小領域を照
射する。このとき光学ヘッド５０は、主走査手段６０に
より高速にかつ等速度で矢印Ｘ方向に移動させられてお
り、レーザ光Ｌ１は試験片１を矢印Ｘ方向に主走査する
ため、この主走査中に、レーザ光Ｌ１が照射された微小
領域に存在するｃＤＮＡに対しては、照射されたレーザ
光Ｌ１により蛍光色素が励起されて蛍光Ｋ１を発光す
る。
【００２９】レーザ光Ｌ１で発光した蛍光Ｋ１は試験片
１の下面から広がって出射し、出射した蛍光Ｋ１は、光
学ヘッド５０のレンズ５３により図示下方のビームとさ
れ、同じく光学ヘッド５０の孔開きミラー５２に入射す
る。蛍光Ｋ１は孔開きミラー５２の反射面で反射され、
矢印Ｘ方向に沿った方向に進行する。矢印Ｘ方向に進行
した蛍光Ｋ１はＰＭＴ９０に入射する。ＰＭＴ９０に入
射した蛍光Ｋ１は、それぞれＰＭＴ９０により増幅され
て光電検出され、対応する電気信号として読み取られ、
対数増幅器９１により増幅され、Ａ／Ｄ変換器９２によ
りデジタル信号化される。
１の下面から広がって出射し、出射した蛍光Ｋ１は、光
学ヘッド５０のレンズ５３により図示下方のビームとさ
れ、同じく光学ヘッド５０の孔開きミラー５２に入射す
る。蛍光Ｋ１は孔開きミラー５２の反射面で反射され、
矢印Ｘ方向に沿った方向に進行する。矢印Ｘ方向に進行
した蛍光Ｋ１はＰＭＴ９０に入射する。ＰＭＴ９０に入
射した蛍光Ｋ１は、それぞれＰＭＴ９０により増幅され
て光電検出され、対応する電気信号として読み取られ、
対数増幅器９１により増幅され、Ａ／Ｄ変換器９２によ
りデジタル信号化される。
【００３０】このようにして１主走査による読取りが終
了すると、光学ヘッド５０は主走査手段６０により元の
位置まで戻され、一方その間に、副走査手段７０がレー
ザ光源２１、光学ヘッド５０およびＰＭＴ９０を一体的
に矢印Ｙ方向に副走査させる。そして、以上の主走査と
副走査とを繰り返すことにより、試験片１の全面に亘っ
てレーザ光Ｌ１が照射され、試験片１の各スポット位置
に対応した蛍光Ｋ１がデジタル信号化され標識データＳ
１として取得され、解析装置９３に入力される。
了すると、光学ヘッド５０は主走査手段６０により元の
位置まで戻され、一方その間に、副走査手段７０がレー
ザ光源２１、光学ヘッド５０およびＰＭＴ９０を一体的
に矢印Ｙ方向に副走査させる。そして、以上の主走査と
副走査とを繰り返すことにより、試験片１の全面に亘っ
てレーザ光Ｌ１が照射され、試験片１の各スポット位置
に対応した蛍光Ｋ１がデジタル信号化され標識データＳ
１として取得され、解析装置９３に入力される。
【００３１】主走査、副走査を終え試験片１から標識デ
ータＳ１が取得されると、光学ヘッド５０は最初の位置
まで戻され、次に検体Ｂの蛍光色素で標識されたｃＤＮ
Ａがハイブリダイズされた試験片１′が試料台２０上に
載置され、試験片１と同様に読取りが行われて標識デー
タＳ２が取得され、解析装置９３に入力される。
ータＳ１が取得されると、光学ヘッド５０は最初の位置
まで戻され、次に検体Ｂの蛍光色素で標識されたｃＤＮ
Ａがハイブリダイズされた試験片１′が試料台２０上に
載置され、試験片１と同様に読取りが行われて標識デー
タＳ２が取得され、解析装置９３に入力される。
【００３２】図３は解析装置９３の構成を示す概略ブロ
ック図である。図３に示すように解析装置９３は、標識
データＳ１，Ｓ２を読み込む読込手段１０と、標識デー
タＳ１，Ｓ２を解析して測定結果表Ｈを出力する解析手
段１１と、解析手段１１において解析を行う際に必要と
なるテンプレートＴを、使用する試験片１，１′の種類
に応じて複数記憶したテンプレート記憶手段１２と、後
述するようにテンプレートＴによりアドレスが対応付け
られた標識データＳ１，Ｓ２を格納する画像格納手段１
３と、測定結果表Ｈを格納する測定結果格納手段１４
と、測定結果表Ｈおよび画像を表示するモニタ１５と、
種々の入力を行うキーボードおよびマウスからなる入力
手段１６と、後述するように選択された測定結果に対応
するスポット位置の画像を画像データＳ４，Ｓ５として
画像格納手段１３から読出す読出手段１７とを備える。
ック図である。図３に示すように解析装置９３は、標識
データＳ１，Ｓ２を読み込む読込手段１０と、標識デー
タＳ１，Ｓ２を解析して測定結果表Ｈを出力する解析手
段１１と、解析手段１１において解析を行う際に必要と
なるテンプレートＴを、使用する試験片１，１′の種類
に応じて複数記憶したテンプレート記憶手段１２と、後
述するようにテンプレートＴによりアドレスが対応付け
られた標識データＳ１，Ｓ２を格納する画像格納手段１
３と、測定結果表Ｈを格納する測定結果格納手段１４
と、測定結果表Ｈおよび画像を表示するモニタ１５と、
種々の入力を行うキーボードおよびマウスからなる入力
手段１６と、後述するように選択された測定結果に対応
するスポット位置の画像を画像データＳ４，Ｓ５として
画像格納手段１３から読出す読出手段１７とを備える。
【００３３】テンプレート記憶手段１２には、試験片
１，１′のスポット位置に対応する複数の円形のＲＯＩ
を有するテンプレートＴが複数記憶されている。すなわ
ち、試験片１，１′におけるスポット位置の配置は試験
片１，１′の製造メーカーや試験の目的などに応じて種
々異なるものであり、使用される試験片１，１′の種類
に応じて例えば図４から図６に示すように複数のテンプ
レートＴがテンプレート記憶手段１２に記憶されてい
る。なお、図４から図６に示すテンプレートＴにおいて
円形部分がスポット位置に対応するＲＯＩとなってい
る。
１，１′のスポット位置に対応する複数の円形のＲＯＩ
を有するテンプレートＴが複数記憶されている。すなわ
ち、試験片１，１′におけるスポット位置の配置は試験
片１，１′の製造メーカーや試験の目的などに応じて種
々異なるものであり、使用される試験片１，１′の種類
に応じて例えば図４から図６に示すように複数のテンプ
レートＴがテンプレート記憶手段１２に記憶されてい
る。なお、図４から図６に示すテンプレートＴにおいて
円形部分がスポット位置に対応するＲＯＩとなってい
る。
【００３４】また、テンプレートＴの各ＲＯＩにはアド
レス番号が付与されている。例えば図４に示すテンプレ
ートにおいては、テンプレートＴがField１〜６の６つ
のフィールドに分割されており、各フィールドにおいて
４×４のＲＯＩブロックが１６×２４個存在する。この
ＲＯＩブロックにはＸＹ両方向においてそれぞれａ〜
ｐ、１〜２４のアドレス番号が付与されており、このＲ
ＯＩブロックの位置は各フィールドにおいて例えばａ−
１として表すことができる。さらに、ＲＯＩブロックに
は８種類のｃＤＮＡが１組ずつ配置されており、同一の
ｃＤＮＡが配置されたスポット位置には同一のパターン
番号が付与されている。したがって、例えばＲＯＩブロ
ックにおけるパターン番号が「２」であった場合、図４
に示すテンプレートにおいては、ＲＯＩは例えば「Fiel
d１，ａ−１，２」をアドレス番号としてその位置を特
定することができる。
レス番号が付与されている。例えば図４に示すテンプレ
ートにおいては、テンプレートＴがField１〜６の６つ
のフィールドに分割されており、各フィールドにおいて
４×４のＲＯＩブロックが１６×２４個存在する。この
ＲＯＩブロックにはＸＹ両方向においてそれぞれａ〜
ｐ、１〜２４のアドレス番号が付与されており、このＲ
ＯＩブロックの位置は各フィールドにおいて例えばａ−
１として表すことができる。さらに、ＲＯＩブロックに
は８種類のｃＤＮＡが１組ずつ配置されており、同一の
ｃＤＮＡが配置されたスポット位置には同一のパターン
番号が付与されている。したがって、例えばＲＯＩブロ
ックにおけるパターン番号が「２」であった場合、図４
に示すテンプレートにおいては、ＲＯＩは例えば「Fiel
d１，ａ−１，２」をアドレス番号としてその位置を特
定することができる。
【００３５】また、図５に示すテンプレートは、Field
１，２の２つのフィールドに分割されており、各フィー
ルドがさらにＡ〜Ｈの８つの領域に分割されている。各
領域においては１２×３０個のＲＯＩが存在する。この
ＲＯＩにはＸＹ両方向においてそれぞれａ〜ｌ、１〜３
０のアドレス番号が付与されており、図５に示すテンプ
レートにおいて、ＲＯＩは例えば「Field１，Ｂ，ａ−
１」をアドレス番号としてその位置を特定することがで
きる。
１，２の２つのフィールドに分割されており、各フィー
ルドがさらにＡ〜Ｈの８つの領域に分割されている。各
領域においては１２×３０個のＲＯＩが存在する。この
ＲＯＩにはＸＹ両方向においてそれぞれａ〜ｌ、１〜３
０のアドレス番号が付与されており、図５に示すテンプ
レートにおいて、ＲＯＩは例えば「Field１，Ｂ，ａ−
１」をアドレス番号としてその位置を特定することがで
きる。
【００３６】さらに、図６に示すテンプレートは、Ａ〜
Ｆの６つの領域に分割されており、各領域においては２
×１４個のＲＯＩブロックがＸ方向に７組存在する。Ｒ
ＯＩブロックにおいてはＹ方向にａ〜ｍのアドレス番号
が付与されており、ＲＯＩブロックはＸ方向に１〜７の
アドレス番号が付与されている。なお、図６に示すテン
プレートにおいては、ＲＯＩブロックの番号が同一の場
合はそこは同一のｃＤＮＡが配置されてなるものであ
る。したがって、図６に示すテンプレートにおいて、Ｒ
ＯＩは例えば「Ａ，１−ａ」をアドレス番号としてその
位置を特定することができる。
Ｆの６つの領域に分割されており、各領域においては２
×１４個のＲＯＩブロックがＸ方向に７組存在する。Ｒ
ＯＩブロックにおいてはＹ方向にａ〜ｍのアドレス番号
が付与されており、ＲＯＩブロックはＸ方向に１〜７の
アドレス番号が付与されている。なお、図６に示すテン
プレートにおいては、ＲＯＩブロックの番号が同一の場
合はそこは同一のｃＤＮＡが配置されてなるものであ
る。したがって、図６に示すテンプレートにおいて、Ｒ
ＯＩは例えば「Ａ，１−ａ」をアドレス番号としてその
位置を特定することができる。
【００３７】次いで、解析装置９３の動作について説明
する。まず、使用した試験片１，１′の種類を入力手段
１６から解析手段１１に入力すると、解析手段１１にお
いて、試験片１，１′のスポット位置に対応するＲＯＩ
が配置されたテンプレートＴをテンプレート記憶手段１
２から読出し、標識データＳ１，Ｓ２により表される画
像上にテンプレートＴをそれぞれ配置する。なお、本実
施形態においては図４に示すテンプレートに対応する試
験片１，１′を使用したものとして説明するが、図５あ
るいは図６に示すテンプレートに対応する試験片を用い
た場合は、この試験片に対応するテンプレートＴがテン
プレート記憶手段１２から読出される。そして、テンプ
レートＴにおける円形のＲＯＩが画像上のスポット位置
に適合するようにテンプレートＴの位置を調節するフィ
ッティングを行う。すなわち、試験片１，１′において
はスポット位置に対応するようにスポットが行われる
が、スポット毎に若干の位置ずれが生じることがある。
したがって、各スポット位置における測定を正確に行う
ためにＲＯＩをスポット位置に合わせる操作を行う。具
体的にはテンプレートＴを回転、左右上下方向へ移動、
拡大縮小することにより、ＲＯＩの位置とスポット位置
とを合わせる。このフィッティングは自動で行ってもよ
いが、標識データＳ１，Ｓ２およびテンプレートＴをモ
ニタ１５に表示し、入力手段１６のマウスを操作して手
動で行ってもよい。なお、このフィッティングの前に、
標識データＳ１，Ｓ２をモニタ１５に表示し、検体Ａ，
Ｂを試験片１，１′にスポットした際のスポットのぼ
け、にじみ、蛍光の発光量が大きいこと、上述したよう
に所定の溶液で洗浄した際に残存する検体のむら等に起
因する、各スポット位置の信号値に異常を有する異常箇
所を除去することが好ましい。そしてこのフィッティン
グにより、各スポット位置にはテンプレートのアドレス
番号に対応するアドレス番号が付与されることとなる。
また、標識データＳ１，Ｓ２により表される画像におい
ては、各画素の位置を座標値として表すことができるた
め、アドレス番号とアドレス番号の中心位置を表す画像
上の座標値との対応付けがなされ、この対応付け結果を
表す対応付け情報が標識データＳ１，Ｓ２に付与され
る。
する。まず、使用した試験片１，１′の種類を入力手段
１６から解析手段１１に入力すると、解析手段１１にお
いて、試験片１，１′のスポット位置に対応するＲＯＩ
が配置されたテンプレートＴをテンプレート記憶手段１
２から読出し、標識データＳ１，Ｓ２により表される画
像上にテンプレートＴをそれぞれ配置する。なお、本実
施形態においては図４に示すテンプレートに対応する試
験片１，１′を使用したものとして説明するが、図５あ
るいは図６に示すテンプレートに対応する試験片を用い
た場合は、この試験片に対応するテンプレートＴがテン
プレート記憶手段１２から読出される。そして、テンプ
レートＴにおける円形のＲＯＩが画像上のスポット位置
に適合するようにテンプレートＴの位置を調節するフィ
ッティングを行う。すなわち、試験片１，１′において
はスポット位置に対応するようにスポットが行われる
が、スポット毎に若干の位置ずれが生じることがある。
したがって、各スポット位置における測定を正確に行う
ためにＲＯＩをスポット位置に合わせる操作を行う。具
体的にはテンプレートＴを回転、左右上下方向へ移動、
拡大縮小することにより、ＲＯＩの位置とスポット位置
とを合わせる。このフィッティングは自動で行ってもよ
いが、標識データＳ１，Ｓ２およびテンプレートＴをモ
ニタ１５に表示し、入力手段１６のマウスを操作して手
動で行ってもよい。なお、このフィッティングの前に、
標識データＳ１，Ｓ２をモニタ１５に表示し、検体Ａ，
Ｂを試験片１，１′にスポットした際のスポットのぼ
け、にじみ、蛍光の発光量が大きいこと、上述したよう
に所定の溶液で洗浄した際に残存する検体のむら等に起
因する、各スポット位置の信号値に異常を有する異常箇
所を除去することが好ましい。そしてこのフィッティン
グにより、各スポット位置にはテンプレートのアドレス
番号に対応するアドレス番号が付与されることとなる。
また、標識データＳ１，Ｓ２により表される画像におい
ては、各画素の位置を座標値として表すことができるた
め、アドレス番号とアドレス番号の中心位置を表す画像
上の座標値との対応付けがなされ、この対応付け結果を
表す対応付け情報が標識データＳ１，Ｓ２に付与され
る。
【００３８】そしてこのようにフィッティングが行われ
ると、入力手段１６からの指示により各スポット位置に
おける濃度の測定が行われる。具体的には、ＲＯＩによ
り囲まれる領域の信号値を積算し、この積算した信号値
をそのスポット位置における濃度値として検出する。こ
の際、背景の濃度値すなわち試験片１，１′の坦体２の
濃度値を検出された濃度値から除去することが好まし
い。そして、標識データＳ１，Ｓ２に設定された全ての
ＲＯＩにおいて濃度値が検出されると、標識データＳ
１，Ｓ２間において互いに対応するスポット位置におい
て得られた濃度値の比を求める。ここで、標識データＳ
１の特定スポット位置において得られる濃度値をＮ１、
標識データＳ２においてこの特定スポット位置に対応す
るスポット位置において得られる濃度値をＮ２とする
と、この比はＮ２／Ｎ１として求められる。そして、こ
の比が大きい順に例えば５０箇所分のスポット位置のア
ドレス番号と比の値とを対応付けた測定結果表Ｈを作成
し、これを測定結果格納手段１４に格納する。また、標
識データＳ１，Ｓ２は上記対応付け情報が付与されて画
像格納手段１３に格納される。
ると、入力手段１６からの指示により各スポット位置に
おける濃度の測定が行われる。具体的には、ＲＯＩによ
り囲まれる領域の信号値を積算し、この積算した信号値
をそのスポット位置における濃度値として検出する。こ
の際、背景の濃度値すなわち試験片１，１′の坦体２の
濃度値を検出された濃度値から除去することが好まし
い。そして、標識データＳ１，Ｓ２に設定された全ての
ＲＯＩにおいて濃度値が検出されると、標識データＳ
１，Ｓ２間において互いに対応するスポット位置におい
て得られた濃度値の比を求める。ここで、標識データＳ
１の特定スポット位置において得られる濃度値をＮ１、
標識データＳ２においてこの特定スポット位置に対応す
るスポット位置において得られる濃度値をＮ２とする
と、この比はＮ２／Ｎ１として求められる。そして、こ
の比が大きい順に例えば５０箇所分のスポット位置のア
ドレス番号と比の値とを対応付けた測定結果表Ｈを作成
し、これを測定結果格納手段１４に格納する。また、標
識データＳ１，Ｓ２は上記対応付け情報が付与されて画
像格納手段１３に格納される。
【００３９】次いで、入力手段１６から測定結果表Ｈお
よび標識データＳ１，Ｓ２を表示する指示がなされる
と、測定結果格納手段１４から測定結果表Ｈが、画像格
納手段１３から標識データＳ１，Ｓ２が読出されてモニ
タ１５に表示される。図７は測定結果表Ｈおよび標識デ
ータＳ１，Ｓ２の表示状態を示す図である。図７に示す
ようにモニタ１５のウィンドウ４０には測定結果表Ｈの
うち上位７つまでのリストが表示され、スクロールバー
４０Ａを操作することにより全てのリストをウィンドウ
４０に表示することができる。なお、測定結果表Ｈに
は、そのリストの番号（Ｎｏ．）、フィールド番号（Fi
eld）、ＸＹ両方向のアドレス番号（Ｘ，Ｙ）、パター
ン番号（Pattern）、求められた比（Ratio）および判断
（Judge）の各項目が設けられている。なお、Judgeの項
目は空欄となっており、ここにオペレータの評価を入力
するものである。また、ウィンドウ４１，４２には、測
定結果表Ｈにおいて選択されたリストに対応するスポッ
ト位置の画像Ｇ１，Ｇ２が表示される。なお、図７にお
いてはＮｏ．３のリストが選択され、このリストにおけ
るスポット位置であるField２、ｎ−１３の位置におけ
るＲＯＩブロックに対応するスポットブロックの画像が
ウィンドウ４１，４２に表示された状態を示している。
よび標識データＳ１，Ｓ２を表示する指示がなされる
と、測定結果格納手段１４から測定結果表Ｈが、画像格
納手段１３から標識データＳ１，Ｓ２が読出されてモニ
タ１５に表示される。図７は測定結果表Ｈおよび標識デ
ータＳ１，Ｓ２の表示状態を示す図である。図７に示す
ようにモニタ１５のウィンドウ４０には測定結果表Ｈの
うち上位７つまでのリストが表示され、スクロールバー
４０Ａを操作することにより全てのリストをウィンドウ
４０に表示することができる。なお、測定結果表Ｈに
は、そのリストの番号（Ｎｏ．）、フィールド番号（Fi
eld）、ＸＹ両方向のアドレス番号（Ｘ，Ｙ）、パター
ン番号（Pattern）、求められた比（Ratio）および判断
（Judge）の各項目が設けられている。なお、Judgeの項
目は空欄となっており、ここにオペレータの評価を入力
するものである。また、ウィンドウ４１，４２には、測
定結果表Ｈにおいて選択されたリストに対応するスポッ
ト位置の画像Ｇ１，Ｇ２が表示される。なお、図７にお
いてはＮｏ．３のリストが選択され、このリストにおけ
るスポット位置であるField２、ｎ−１３の位置におけ
るＲＯＩブロックに対応するスポットブロックの画像が
ウィンドウ４１，４２に表示された状態を示している。
【００４０】オペレータはこのように表示された測定結
果表Ｈおよび画像Ｇ１，Ｇ２を観察し、その評価を測定
結果表ＨのJudgeの欄に入力する。なお、この評価とし
ては測定結果と画像の状態とから目的の遺伝子が発現し
ていることを表す「Ｇｏｏｄ」、目的の遺伝子が発現し
ていないことを表す「ＮＧ」および判断が付かないこと
を表す「？」の文字を入力手段１６から入力することに
より行う。ここで、評価の入力は例えばキーボードの
「Ｇ」を押下すると「Ｇｏｏｄ」と入力され、「Ｎ」を
押下すると「ＮＧ」と入力されるようにすることが好ま
しい。そして、順次リストを選択することにより、画像
Ｇ１，Ｇ２と測定結果表Ｈとを参照して評価を行う。
果表Ｈおよび画像Ｇ１，Ｇ２を観察し、その評価を測定
結果表ＨのJudgeの欄に入力する。なお、この評価とし
ては測定結果と画像の状態とから目的の遺伝子が発現し
ていることを表す「Ｇｏｏｄ」、目的の遺伝子が発現し
ていないことを表す「ＮＧ」および判断が付かないこと
を表す「？」の文字を入力手段１６から入力することに
より行う。ここで、評価の入力は例えばキーボードの
「Ｇ」を押下すると「Ｇｏｏｄ」と入力され、「Ｎ」を
押下すると「ＮＧ」と入力されるようにすることが好ま
しい。そして、順次リストを選択することにより、画像
Ｇ１，Ｇ２と測定結果表Ｈとを参照して評価を行う。
【００４１】このように、本実施形態によれば、複数種
類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手段１２
から、使用した試験片１，１′のスポット位置に対応す
るＲＯＩが配置されたテンプレートＴを読出すようにし
たため、使用する可能性のある試験片に対応する複数種
類のテンプレートをテンプレート記憶手段１２に記憶し
ておけば、どのような試験片を用いても、テンプレート
Ｔを新たに作成することなく、標識データＳ１，Ｓ２か
らスポット位置における濃度値を検出することができ
る。
類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手段１２
から、使用した試験片１，１′のスポット位置に対応す
るＲＯＩが配置されたテンプレートＴを読出すようにし
たため、使用する可能性のある試験片に対応する複数種
類のテンプレートをテンプレート記憶手段１２に記憶し
ておけば、どのような試験片を用いても、テンプレート
Ｔを新たに作成することなく、標識データＳ１，Ｓ２か
らスポット位置における濃度値を検出することができ
る。
【００４２】なお、上記実施形態においては、使用した
試験片１，１′のスポット位置に対応するＲＯＩが配置
されたテンプレートがテンプレート記憶手段１２に記憶
されていない場合がある。このため、テンプレート記憶
手段１２に新たなテンプレートを作成するためのテンプ
レート作成手段を設け、試験片１，１′のスポット位置
に応じてＲＯＩを配置した新たなテンプレートを作成す
るようにしてもよい。この場合、スポット位置の属性と
して、マトリクス状にスポットを配置した１レイヤーあ
るいは図４に示すように４×４のスポットブロックを複
数配置した２レイヤー等のレイヤー数、スポット数、ス
ポットブロック数、アドレスの表現方法、Field数、Fie
ld内のスポット数、図６に示すようにペアとなるスポッ
トの有無、ペアスポットの番号、スポットが信号値検出
用であるか、位置決め用であるか、スポットがなされな
いものであるかなどのスポット毎の測定属性など、種々
のものがあり、この属性が試験片の製造メーカーによっ
て異なるものである。したがって、テンプレート作成手
段は、これらの属性を考慮してテンプレートを作成可能
なものとすることが好ましい。
試験片１，１′のスポット位置に対応するＲＯＩが配置
されたテンプレートがテンプレート記憶手段１２に記憶
されていない場合がある。このため、テンプレート記憶
手段１２に新たなテンプレートを作成するためのテンプ
レート作成手段を設け、試験片１，１′のスポット位置
に応じてＲＯＩを配置した新たなテンプレートを作成す
るようにしてもよい。この場合、スポット位置の属性と
して、マトリクス状にスポットを配置した１レイヤーあ
るいは図４に示すように４×４のスポットブロックを複
数配置した２レイヤー等のレイヤー数、スポット数、ス
ポットブロック数、アドレスの表現方法、Field数、Fie
ld内のスポット数、図６に示すようにペアとなるスポッ
トの有無、ペアスポットの番号、スポットが信号値検出
用であるか、位置決め用であるか、スポットがなされな
いものであるかなどのスポット毎の測定属性など、種々
のものがあり、この属性が試験片の製造メーカーによっ
て異なるものである。したがって、テンプレート作成手
段は、これらの属性を考慮してテンプレートを作成可能
なものとすることが好ましい。
【００４３】また、上記実施形態においては、特異的結
合物質としてｃＤＮＡを、生体由来物質として細胞から
抽出したｃＤＮＡを用いて説明したが、本発明はこれに
限定されるものではない。
合物質としてｃＤＮＡを、生体由来物質として細胞から
抽出したｃＤＮＡを用いて説明したが、本発明はこれに
限定されるものではない。
【００４４】さらに、上記実施形態においては、解析装
置９３において標識データＳ１，Ｓ２の比を求めている
が、標識データＳ１，Ｓ２の差を求め、この差が大きい
順に５０箇所分のスポット位置と差の値とを対応付けた
測定結果表Ｈを作成してもよい。
置９３において標識データＳ１，Ｓ２の比を求めている
が、標識データＳ１，Ｓ２の差を求め、この差が大きい
順に５０箇所分のスポット位置と差の値とを対応付けた
測定結果表Ｈを作成してもよい。
【００４５】さらにまた、上記実施形態においては、２
つの試験片１，１′を用いて解析を行っているが、多数
の既知の互いに異なるｃＤＮＡが２組配置された１つの
試験片を用いて２種類の検体Ａ，Ｂについて解析を行う
ようにしてもよい。
つの試験片１，１′を用いて解析を行っているが、多数
の既知の互いに異なるｃＤＮＡが２組配置された１つの
試験片を用いて２種類の検体Ａ，Ｂについて解析を行う
ようにしてもよい。
【００４６】また、上記実施形態においては、２種類の
検体Ａ，Ｂについて解析を行っているが、３種類以上の
検体についても上記と同様に試験片１，１′の読取り、
解析および測定結果表Ｈと画像との表示を行うことが可
能である。
検体Ａ，Ｂについて解析を行っているが、３種類以上の
検体についても上記と同様に試験片１，１′の読取り、
解析および測定結果表Ｈと画像との表示を行うことが可
能である。
【００４７】また、上記実施形態においては、標識物質
として蛍光色素を用いたが、放射性同位体を用いること
も可能である。
として蛍光色素を用いたが、放射性同位体を用いること
も可能である。
【図１】本実施形態に用いられる試験片を示す図
【図２】本実施形態に用いられる読取装置の構成を示す
図
図
【図３】解析装置の構成を示す概略ブロック図
【図４】テンプレートを示す図（その１）
【図５】テンプレートを示す図（その２）
【図６】テンプレートを示す図（その３）
【図７】測定結果表および画像の表示状態を示す図
１，１′ 試験片 ２ 坦体 １０ 読込手段 １１ 解析手段 １２ テンプレート記憶手段 １３ 画像格納手段 １４ 測定結果格納手段 １５ モニタ １６ 入力手段 １７ 読出手段 ９３ 解析装置 １００ 読取装置
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ｇ０１Ｎ 33/53 Ｇ０１Ｎ 33/53 Ｍ Ｄ 33/543 ５０１ 33/543 ５０１Ｄ ５２１ ５２１ 35/00 35/00 Ａ 35/02 35/02 Ｆ // Ｃ１２Ｎ 15/09 Ｃ１２Ｎ 15/00 Ａ
Claims (4)
- 【請求項１】 坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するＲＯＩが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ＲＯＩに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する生体由来物質の
検出方法において、 複数種類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手
段から、前記試験片に対応する種類のテンプレートを読
出し、 該読出されたテンプレートに基づいて、前記信号値を検
出することを特徴とする生体由来物質の検出方法。 - 【請求項２】 新たなテンプレートを作成し、該新た
なテンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶する
ことを特徴とする請求項１記載の生体由来物質の検出方
法。 - 【請求項３】 坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するＲＯＩが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ＲＯＩに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する解析手段を備え
た生体由来物質の検出装置において、 複数種類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手
段と、 該テンプレート記憶手段から前記試験片に対応する種類
のテンプレートを読出す読出手段とを備え、 前記解析手段は、前記読出されたテンプレートに基づい
て、前記信号値を検出する手段であることを特徴とする
生体由来物質の検出装置。 - 【請求項４】 新たなテンプレートを作成し、該新た
なテンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶する
テンプレート作成手段をさらに備えたことを特徴とする
請求項３記載の生体由来物質の検出装置。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2000091713A JP2000346847A (ja) | 1999-03-30 | 2000-03-29 | 生体由来物質の検出方法および装置 |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP11-89357 | 1999-03-30 | ||
| JP8935799 | 1999-03-30 | ||
| JP2000091713A JP2000346847A (ja) | 1999-03-30 | 2000-03-29 | 生体由来物質の検出方法および装置 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2000346847A true JP2000346847A (ja) | 2000-12-15 |
Family
ID=26430779
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2000091713A Pending JP2000346847A (ja) | 1999-03-30 | 2000-03-29 | 生体由来物質の検出方法および装置 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP2000346847A (ja) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2005527829A (ja) * | 2002-05-24 | 2005-09-15 | ニンブルゲン システムズ インコーポレイテッド | 単一マイクロアレイ上で多数の試料のハイブリダイゼーション反応を行うマイクロアレイ及びその方法 |
| JP2007064927A (ja) * | 2005-09-02 | 2007-03-15 | Nipro Corp | 定性反応用試験片 |
-
2000
- 2000-03-29 JP JP2000091713A patent/JP2000346847A/ja active Pending
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2005527829A (ja) * | 2002-05-24 | 2005-09-15 | ニンブルゲン システムズ インコーポレイテッド | 単一マイクロアレイ上で多数の試料のハイブリダイゼーション反応を行うマイクロアレイ及びその方法 |
| JP2007064927A (ja) * | 2005-09-02 | 2007-03-15 | Nipro Corp | 定性反応用試験片 |
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Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
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Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20050912 |
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| A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A712 Effective date: 20061201 |
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| A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20070829 |
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| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080408 |
|
| A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080521 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080916 |
|
| A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20090526 |