JP2000504222A - 遺伝子発現を増大させる植物核スカフォード付着領域 - Google Patents

遺伝子発現を増大させる植物核スカフォード付着領域

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Abstract

(57)【要約】 タバコの遺伝子から単離された核スカフォード付着領域と、細胞中で外来遺伝子の発現が増大している組換え細胞を調製する方法が記載されている。本方法は、5'から3'の方向において、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に位置し、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少なくとも一の構造遺伝子と、該転写開始領域に対して5'側または該構造遺伝子に対して3'側の何れかに位置する本明細書で提供されるヌクレオチド配列のスカフォード付着領域を含んでなるDNA構成物により、植物細胞を形質転換させることを含む。上述の方法を実施するのに使用するDNA構成物やベクターも開示されている。

Description

【発明の詳細な説明】 遺伝子発現を増大させる植物核スカフォード付着領域 本発明は、USDA研究助成金91−37301−6377号および92−373 01−7710号による米国政府の支援を得てなされたものである。したがって 、米国政府は、本発明に一定の権利を所有する。 背景技術 細胞のタンパク性核「マトリックス」または「足場組み(以下、「スカフォー ド」(scaffold)という」は、クロマチン構造を決定する役割を果たしている。 電子顕微鏡では、核DNAは間欠的にこのスカフォードに付着して、一連のルー プを形成することを示している(Zlatanova and Van Holds,J.Cell Sci,103: 889 (1992))。スカフォード付着領域(Scaffold Attachment Region; SAR)は 、ATに富むゲノムのDNA配列で、特異的に核スカフォード成分と結合する。 Boulikas,J.Cell.Biochem.52:14(1993)を参照されたい。これらの配列は、核ス カフォードに付着することにより、クロマチンドメイン各々の境界を定めている と考えられている。転写と複製は核スカフォードにおいて行われると考えられて いる。 SARが導入遺伝子の両側に含まれていると、安定的にトランスフェクトされ た細胞系において発現度が導入遺伝子のコピー数に比例することが証明され、遺 伝子の活性は染色体中の位置とは関係が無いことが示されている。(Bonifer et al.,EMBO J.9: 2843(1990);McKnight et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:6 943(1992); Phi-Van et al.,Mol.Cell.Biol.10:2303(1990))。GUSレポーター 遺伝子の両側に酵母SARを配置すると、植物細胞中で導入遺伝子の発現が増進 し、発現の変化も少なくなることが報告されている。Allen et al.,Plant Cell 5:603(1993)。しかしながら、異なる形質転換体ごとの変化が劇的に減少するこ とはなかったし、多コピーの導入遺伝 子を含む形質転換体で高い発現が見られることはなかった。 発明の概要 上記に鑑み本発明の第一の態様は、配列番号1のヌクレチオド配列を有する単 離DNA分子である。 本発明の他の態様は、転写開始領域と、構造遺伝子と、配列番号1のスカフォ ード付着領域とを含んでなるDNA構成物である。 本発明のさらに他の態様は、前述のDNA構成物を含有する形質転換された植 物細胞と該形質転換された植物細胞を含んでなる組換え植物である。 本発明のさらに他の態様は、外来遺伝子の発現が増大されているトランスジェ ニック植物細胞を調製する方法である。この方法では、植物体を再生可能な植物 細胞を、本発明のDNA構成物で形質転換することを含む。 本発明のさらに他の態様は、外来遺伝子の発現が増進している組換えタバコ植 物細胞を調製する方法である。この方法では、タバコ植物細胞を本発明のDNA 構成物で形質転換することを含む。 本発明のさらに他の態様は、転写開始領域と、構造遺伝子と、配列番号1のス カフォード付着領域とを含んでなるDNA構成物を担持する植物形質転換ベクタ ーである。 図面の簡単な説明 図1は、本発明の1167塩基対からなるタバコSAR(RB 7 SAR)(配列番号 1)と838塩基対からなる酵母SAR(ARS-1)とのSAR配列モチーフを比較する模 式図である。A枠(A)、T枠(T)、ショウジョウバエのトポイソメラーゼII部位(O) 、ARSコンセンサス配列(R)、およびG排除領域(G exclusion regions)(3 0bpからなるATC帯)を黒い縞模様で表している。局所的にATに富む領域(>2 0bp)は斜線の多い枠(AT95%領域)あるいは斜線の少ない枠(AT90〜 95%領域)で示してある。 図2Aは、選択プラスミドpGHNC10の模式図である。図中NPTIIはTn5由来のnpt II であり、ocs Tはオクトピンシンターゼ遺伝子のポリアデニル化部位/ターミネ ーターであり、矢印P1とP2はコピー数の評価に使用したPCRプライマーの位置を 示している。 図2Bは、コントロール発現プラスミドpGHNC12の模式図である。CaMV 35Sは カリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターであり、GUSは大腸菌βグルク ロニダーゼ遺伝子のコード領域であり、nos Tはノパリンシンターゼ(nos)遺伝 子のポリアデニル化部位/ターミネーターであり、矢印P1とP2はコピー数の評価 に使用したPCRプライマーの位置を示している。 図2Cは、(+)SAR発現プラスミドpGHNC11の模式図である。CaMV 35Sはカリフ ラワーモザイクウイルス35Sプロモーターであり、GUSは大腸菌βグルクロニ ダーゼ遺伝子のコード領域であり、nos Tはノパリンシンターゼ(nos)遺伝子の ポリアデニル化部位/ターミネーターであり、Rb7 SARは配列番号1のタバコS ARであり、矢印P1とP2はコピー数の評価に使用したPCRプライマーの位置を示 している。 図3Aは、RB7 SAR(+)プラスミドであるpGHNC11、および、SAR(-)コントロー ルプラスミドであるpGHNC12のGATC部位(垂直線)を示す制限地図である。C aMV 35Sから得られた501塩基対のプローブ断片を制限地図の下に示した。 図3Bは、選択されたRB7 SAR(+)系(左側)およびコントロールプラスミドpG HNC12(右側)のDNAゲルブロットである。DpnI、DpnIIおよびSau3Aの消化産 物を示している。矢印は1kbマーカーから推定した分子量を示している。 図3Cは、選択されたSAR(-)コントロール系のDNAゲルブロットである。Dp n I、DpnIIおよびSau3Aの消化産物を示している。矢印は推定した分子量を示し ている。 図4は、細胞系各々の遺伝子コピー数に対するGUS発現をプロットした図であ る。図中、白色の四角はRB7 SAR(+)形質転換体、黒色の三角はコントロールを 表している。 図5は、遺伝子コピー数に対するNPTタンパク質をプロットした図である。図 中、 白色の四角はRB7 SAR(+)形質転換体、黒色の三角はコントロール系を表してい る。 図6は、図4および図5のデータを総合して再プロットし、導入した遺伝子各 々の発現度を比較した図である。白色の四角は二重RB7 SAR形質転換体、黒色の 三角はコントロール系を表している。 発明の詳細な説明 本発明者らは、安定的に形質転換した細胞系において、タバコから単離したS AR(RB 7 SAR)(配列番号1)を導入遺伝子と併用すると、遺伝子1コピー当たり の平均発現量を100倍以上増大させることを見出した。導入遺伝子のコピー数 が比較的に少ない場合に、このタバコSAR効果が最大となることも見出された。 クロマチン組識のループドメインのモデルから、SARは境界因子として作用 し、凝縮クロマチン構造が拡散しないように限定して、隣接クロマチン中のシス 調節因子の影響を阻止することが予想される。したがって、ゲノムの位置効果に 起因して導入遺伝子の発現が変化するのであるならば、SARによって横側から 挟むことにより遺伝子1コピー当たりの発現を標準化して、形質転換体毎に変化 することを少なくことができるはずである。遺伝子の総発現量は、遺伝子のコピ ー数に比例して変化しなければならない。動物細胞系の実験でも、この予想が支 持されている。Grosveld et al.,Cell 51:975(1987;);Stief et al.Nature 341: 343(1989): Bonifer et al.,EMBO J.9:2843(1990): McKnight et al.,Proc.Natl .Acad.Sci.USA 89:6943(1992); Phi-Van et al.,Mol.Cell.Biol.10:2303(1999). 近年、特に真菌類以上の高等植物系において、一以上の「遺伝子が発現しない (gene silencing)」現象が変化全体の一因となっていることが立証されるように なった。Assaad et al.,Plant Mol.Biol.22:1067(1993); Finnegan and McElro y,Bio/Technology12:883(1994): Flavell,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:3490(199 4).原則として、導入遺伝子の発現に対する位置効果は、ゲノムエンハンサーに 距離が近いことやクロマチン凝縮の程度など挿入部位に初めから存在している特 徴を反映し、一方では、導入 遺伝子自身の相同性依存の相互作用によって遺伝子が発現しなくなり、染色体の 位置によってこれら相互作用の重篤度が左右される。 一つの理論にのみに拘束されるつもりはないが、本発明者らは、コントロール 形質転換体が大きく影響されるような条件下でも、遺伝子が発現しなくなる現象 の重篤度を低下できることが、本発明のSARで見られるように大きなSAR効 果が挙がることに反映されていると提案している。導入遺伝子が複数存在する場 合には、相同性依存による遺伝子が発現しなくなる現象を考えなくてはならない 。コピーを多数挿入する場合に起こる遺伝子が発現しなくなる現象は、真菌類以 上の高等植物でよく知られていたが、最近に至りショウジョウバエでも起こるこ とが報告されるようになった(Dorer and Henikoff,Cell 77:993(1994))。 本明細書では、形質転換体に複数のコピーを挿入することが多く記載されてい る。これは、本明細書で報告するRB7 SAR効果が形質転換のためにアグロ バクテリウムベクターを用いている他の研究機関の報告内容と相違している理由 の一つであるといえよう。四つの報告において、発現のわずかな増加と形質転換 体毎の変化の減少とが報告されている。(Mlynarova et al.,Plant Cell 7:599(1 995);Mlynarova et al.,Plant Cell 6:417(1994); Schoffl et al.,Transgenic Res.2:93(1993); van der Geestet al.,Plant J.6:413(1994)).Breyne et al., Plant Cell 4:463(1992)は、遺伝子の平均発現量が低下したことを報告している 。DNAが媒介する直接的な形質転換では、単一のゲノム部位に多数の導入遺伝 子コピーが組み込まれる複雑な遺伝子座がつくられることがしばしば起こる。単 一の遺伝子座において相同性配列間で相互作用が発生すると、遺伝子が発現しな くなる頻度が上昇すると考えられ、したがって、本明細書の実施例で報告する形 質転換体は、多数コピー現象が希にしか起こらないアグロバクテリウムベクター による形質転換体よりも遺伝子が発現しなくなることに関し、強い影響を受ける と予想され得る。 本発明は、植物(すなわち、維管束植物)を含む諸種生物の細胞を形質転換さ せる のに用いることができる。本明細書において用いる、植物とは、裸子植物と被子 植物(すなわち、単子葉植物と双子葉植物)の両方を含む。本発明による形質転 換を用いて、安定的に形質転換した細胞中で導入遺伝子の発現度を増進させるこ とができる。 本明細書において用いる「機能上関連している」なる語は、単一のDNA分子 上で相関連するDNA配列の機能が相互に影響しあうことを意味する。したがっ て、転写開始領域が構造遺伝子の発現に影響することができる場合(すなわち、 構造遺伝子が、転写開始領域の転写制御下にある場合)、転写開始領域は構造遺 伝子と機能上関連していることとなる。転写開始領域は構造遺伝子の「上流」に あり、反対に、構造遺伝子は転写開始領域の「下流」にあると言われている。 本発明のDNA構成物、すなわち「発現カセット」は、5'から3'転写方向に 、第一のスカフォード付着領域と、転写開始領域と、該転写開始領域と機能上関 連している構造遺伝子と、RNAポリメラーゼの停止シグナルを含む停止配列と 、ポリアデニル化のためのポリアデニル化シグナル(例えば、nosターミネータ ー)と、第二のスカフォード付着領域とを含んでいることが好ましい。これらの 領域はすべて、形質転換される細胞内で機能できるものでなければならない。停 止領域は、転写開始領域やプロモーター領域と同じ遺伝子から得てもよいし、ま た別の遺伝子から得てもよい。前述した本発明のDNA構成物は、転写開始領域 と機能上関連している構造遺伝子を一個含む場合もあるし、また一以上の構造遺 伝子を含む場合もある。本発明の特定のDNA構成物は、5'から3'転写方向に 、第一のスカフォード付着領域と、転写開始領域と、該転写開始領域と機能上関 連している第一の構造遺伝子と、該転写開始領域と機能上関連している第二の構 造遺伝子と、RNA仏ポリメラーゼの停止シグナルを含む停止配列と、ポリアデニ ル化のためのポリアデニル化シグナル(例えば、nosターミネーター)と、第二 のスカフォード付着領域とを含んでいる。 本発明の実施に用いられるスカフォード付着領域(すなわち、「SAR」)は 、本明細書で提供される配列番号1(RB7 SAR)のヌクレオチド配列を有する。R B7 SA Rは天然に存在するものから単離することができるし、また化学的に合成するこ ともできる。 SARは、方向に無関係に作用することが知られている。Poljak et al.,Nucl eic Aclds Res.22:4386(1994).本発明の遺伝子構成物は、単一方向に直接反復 (ダイレクトリピート)して(→→)、または反対方向に直接反復して(←←) 、あるいは二つ間接反復のうちいずれか(→←または←→)に、方向付けられて いるRB7 SARを含有していてもよい。 転写開始領域はRNAポリメラーゼ結合部位を含んでいることが好ましいが、形 質転換すべき宿主生物由来のものであってもよいし、また転写開始領域が宿主中 で機能できる他の供給源から得てもよい。他の供給源としては、ノパリン(nopal ine)、(オクトピン(octapine)、マンノピン(mannopine)を生合成するための転 写開始領域、または他のオピン(opine)の転写開始領域などのアグロバクテリ ウムT−DNA遺伝子、植物由来の転写開始領域、ウイルス(宿主に特異性を持 つウイルスを含む)由来の転写開始領域、あるいは部分的または全て合成した転 写開始領域が挙げられる。転写開始領域および転写終了領域は公知である。例え ば、dGreve,J.Mol.Appl.Genet.1,499-511(1983); Salomon et al.,EMBO J.3,141 -146(1984); Garfinkel et al.,Cell 27,143-153(1983); およびBarker et al., Plant Mol.Biol.2,235-350(1983)を参照されたい。 転写開始領域には、RNAポリメラーゼ結合部位の他に、例えば化学的または物 理的抑制や誘導を調節(例えば、代謝産物や光の調節)したり、細胞の分化(植 物の葉、根、種子などと関連する)によって調節することにより、転写を調節す る領域を含んでいてもよい。したがって、転写開始領域またはこの領域の調節部 分は、このように調節される遺伝子のうちの適当なものから得ることができる。 例えば、1,5−リブローズビスリン酸カルボキシラーゼ遺伝子を光で誘導して 、転写開始に使用することができる。ストレス、温度、損傷、病原菌の効果など によって誘導される他の遺伝子 も知られている。 構造遺伝子は、タンパク質、ポリペプチドまたはその部分をコードしているD NAセグメントからなり、恐らくはリボゾーム結合部位および/または翻訳開始 コドンを含むが、転写開始領域は欠けている遺伝子の部分である。この語は、形 質転換された細胞内で天然に見出される、導入された構造遺伝子のコピーにも適 用する。構造遺伝子は、ヘテロ構造遺伝子といわれる場合には、この遺伝子が導 入される細胞内で通常見出されない、あるいは機能上関連している転写開始領域 と一緒には通常見出されないタンパク質をコードしていてもよい。植物類におい て発現するために、本発明の転写開始領域と機能上関連している遺伝子は、染色 体遺伝子、cDNA、合成遺伝子、あるいはそれらの組み合せから得ることがで きる。どのような構造遺伝子でも使用可能である。植物細胞を形質転換させる場 合、構造遺伝子は、グリホスフェート耐性など所望の特色を与える酵素、昆虫耐 性を与えるバチルス・チュリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)のタンパク 質などのタンパク質(またはその断片)、またはウイルス耐性を与える植物ウイ ルスタンパク質またはその断片をコードしていてもよい。 発現カセットは、少なくとも一の複製システムを持つDNA構成物中に備えら れていてもよい。便宜上、Co1E1,pSC101,pACYC184などの大腸菌(Escherichia c oli)中で機能する複製システムを持つのが普通である。こうすることにより、 各々の操作を終えた後、各段階において、それによって得た構成物をクローニン グし、配列を決定し、操作の正確性を測定することができる。大腸菌の複製シス テムに加え、またはその代わりに、例えば、P−1不和合性プラスミドの複製シ ステムなどの、広域宿主に対する複製システムを用いてもよい。複製システムの 他に、一以上の宿主に有用なマーカーを少なくとも一個存在させるか、あるいは 宿主毎に異なるマーカーを存在させることが多い、すなわち、あるマーカーは原 核宿主において選択に用いられ、またあるマーカーは真核細胞宿主、特に植物宿 主において選択に用いられる。マーカーは、抗生物質、毒素、重金属などの殺生 物剤に対する防護の役割を果たしたり、また、例 えば、栄養要求株宿主に原栄養性の性質を付与することにより相補性を与えたり 、新規化合物の生成により可視の表現型を提供したりする。本発明で用いる遺伝 子の代表例としては、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ(NPTII)、ハ イグロマイシンホスホトランスフェラーゼ(HPT)、クロラムフェニコールア セチルトランスフェラーゼ(CAT)、ニトリラーゼおよびゲンタマイシン耐性 遺伝子が挙げられる。植物宿主の選択では、好適なマーカーの例としてはインジ ゴ色を与えるβグルクロニダーゼ、可視光を与えるルシフェラーゼ、カナマイシ ン耐性またはG418耐性を与えるNPTII、ハイグロマイシン耐性を与えるH PTおよびグリホサート耐性を与える突然変異aroA遺伝子を挙げることができる が、これらの例に限定されることはない。 適当な複製システムを制限酵素で分割して、特定の構成物または断片を有効部 位に挿入することにより、各種構成物、発現カセット、マーカーなどを含む各種 断片を順次導入する。DNA構成物はライゲーションしてクローニングした後、 単離してさらに操作するのに用いることができる。これら技術はすべて文献に十 分な例示がなされており、Sambrook et al.,Molecular Cloning: A Laboratory Manual,(2nd Ed.1989)(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY )に詳細な例示を見出すことができる。 本発明のDNA構成物により植物組識を形質転換するために用いることができ るベクターの例としては、非アグロバクテリウムベクター、特に衝撃ベクター(b allistic vector)並びにDNAが媒介する形質転換に好適なベクターを挙げるこ とができる。 細胞の衝撃による形質転換に好適である本発明のDNA構成物を担持する微粒 子は、本発明により細胞を形質転換する場合にも有用である。微粒子を細胞中に 打ち込んで、形質転換した細胞を作る。形質転換細胞が植物細胞である場合、当 業者に公知の技術により形質転換した細胞から植物体を再生することができる。 好適な衝撃による細胞形質転換法およびその装置のいずれを用いても本発明を実 施することができる。典型的な装置と方法は、Stomp et al.,に付与された米国 特許第5,122,466号およびSanford a nd Wolfに付与された米国特許第4,945,050号(本明細書で引用するすべての米国 特許の開示は、引用することによりその全文を本明細書の一部をなすものとする )に開示されている。衝撃による形質転換法を用いる場合、発現カセットは形質 転換される細胞中で複製可能なプラスミド中に組み入れる。このシステムで使用 するのに好適な微粒子の例としては、1〜5μmの金球体が挙げられる。沈殿な どの好適技術によりDNA構成物を微粒子上に付着させる。 当業者に公知であ るアグロバクテリウム・ツュメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)を媒 介して形質転換する方法は、本発明のDNA構成物により植物組識を形質転換す るのに用いることができる。 植物細胞プロトプラストをDNAが媒介して形質転換することにより、植物が 本発明のDNA構成物より形質転換され、また、その後当業者に公知の方法によ り形質転換したプロトプラストから植物体を再生することもできる。 その後、器官形成または胚形成によるクローン増殖が可能な植物組識は何れも 、本発明のベクターで形質転換することができる。本明細書に言う「器官形成」 とは分裂組識中心から苗条(shoot)と根が順次に発育してゆく過程を指す。また 本明細書に言う「胚形成」とは、体細胞あるいは配偶子の何れかから、苗条と根 が定められた通りに一緒に(順次行うのでなく)発生してゆく過程を指す。選択 される特定の組識は、形質転換する特定種に有効且つ至適なクローン増殖システ ムによって変更ことができる。典型的な組識標的としては、葉、花粉、胚、子葉 、胚軸、大胞子、カルス組識、存在する分裂組識(例えば、頂点分裂組識、腋芽 や根端分裂組識、)および誘導された分裂組識(例えば、子葉分裂組識や胚軸分 裂組識)が挙げられる。 本発明の植物は、各種の形態をとることができる。本発明の植物は、形質転換 細胞と形質転換をしていない細胞とのキメラや、また、クローン化した形質転換 体(例えば、細胞すべてが形質転換されて、発現カセットを含有している)であ ってもよい。さらにまた、形質転換した移植片と形質転換をしていない組識(例 えば、柑橘種の形質転換していない接ぎ穂に接ぎ木された形質転換した根の台木 )を含む植物であって もよい。形質転換した植物は、クローン増殖や古典的な交配技術によって増殖さ せることができる。例えば、第一世代(T1)の形質転換植物を自家受精させて 、ホモ接合体の第二世代(T2)の形質転換植物を作り、古典的交配技術により T2植物をさらに増殖させる。選択可能な優性マーカー(npt IIなど)を発現カ セットと連結させて、交配を助けることもできる。 本発明の実施に使用できる植物の例としては、タバコ(Nicotiana tabacum) 、セイヨウアブラナ(Brassica napus)、ジャガイモ(Solanum tubersum)、大 豆(glycinemax)、ピーナッツ(Arachis hypogaea)、綿(Gossypium hirsutum )、ジャガイモ(Ipomoea batatus)、キャッサバ(Mahihot esculenta)、コー ヒー(Cofea spp.)、ココナッツ(Cocos nucifera)、パイナップル(Ananas co mosus)、ミカン類(Citrus spp)、ココア(Theobroma cacao)、茶(Camellia si nensis)、バナナ(Musa spp.)、アボカド(Persea americana)、イチジク(F icus casica)、グァバ(Psidium quajava)、マンゴー(Mangifera indica)、 オリーブ(Olea europaea)、パパイヤ(Carica papaya)、カシュー(Anacardi um occidentale)、マカデミア(Macadamia integrifolia)、アーモンド(Prun us amygdalus)、テンサイ(Beta vulgaris)、トウモロコシ(Zeamays)、小麦 、燕麦、ライ麦、大麦、米、野菜類、鑑賞植物類が挙げられるが、これらのみに 限定されない。野菜類の例としては、トマト(Lycopersicon esculentum)、レ タス(例えば、Lactuea sativa)、サヤインゲン(Phaseolus vulgaris)、ライ マメ(Phaseolus limensis)、エンドウマメ(Pisum spp.)、およびキュウリ( C.sativus)、カンタロープ(C.cantalupensis)やマスクメロン(C.melo)などの Cucumis属のものが挙げられる。鑑賞植物としては、ツツジ(Rhododendron spp. )、アジサイ(Macrophylla hydrangea)、ハイビスカス(Hibiscu rosasanensi s)、バラ(Rosa spp.)、チューリップ(Tulipa spp.)、ラッパスイセン(Nar cissus spp.)、ペチュニア(Petuniahybrida)、カーネーション(dianthus ca ryophyllus)、ポインセチア(Euphorbia pulcherima)および菊が挙げられる。 本発明を実施するのに用いられる裸子植物としては、 テーダマツ(Pinus taeda)、エリオットマツ(Pinus elliotii)、ポンデローサ マツ(Pinus ponderosa)、コントルタマツ(Pinus contorta)およびモンテレー マツ(Pinus radiata)などのマツ類、ベイマツ(Pseudotsuga menziesii)、ベ イツガ(tsuga canadensis)、ベイトウヒ(Picea glauca)、アカスギ(Sequoi a sempelvirens)、ヨーロッパモミ(Abies amabilis)、バルサモミ(Abies bals amea)などのモミ、およびベイスギ(Thujaplicata)やアラスカヒノキ(Chamae cyparis nootkatensis)などのヒマラヤスギを含む針葉樹が挙げられる。 次に掲げる実施例は本発明を説明するために開示したものであって、したがっ て、本発明を限定するように解釈してはならない。 例1方法 1.プラスミド構成物 pRB7-6(Hall et al.,Proc.Natl.Acad.Scl.USA 88:9320(1991))由来のクレノ ウで満たした平滑末端を持つ1.1kbのClaI/ScaI SAR断片(配列番号1)を用いて 、GUSレポータープラスミドを調製した。ClaI/ScaI SAR断片を、pBluescript II SK+(Stratagene)においてクレノウで満たした平滑末端を有するXbaI部位に挿 入して、プラスミドpGHNC1を得た。同様にして、1.1kbのClaI/ScaI SAR断片(配 列番号1)をpBluescript II SK+(Stratagene)において、クレノウで満たした 平滑末端を有するXhoI部位に挿入して、プラスミドpGHNC4を得た。さらに、pGHN C4由来の1.1kbのApaI/HindIII断片を、pGHNC1のApaI/HindIII部位に挿入して、p GHNC5を得た。35Sプロモーター/GUSリーデイングフレーム/Nosターミネー ターを含有するpBI221(Clonetech)由来の2.8kbのHindIII/EcoRI断片を、pGHNC5 またはpBluescnpt II SK+のHindIII/EcoRI部位に挿入して、それぞれpGHNC11( +SAR)とpGHNC12(−SAR)を得た。 pUNK1(Herrera-Estrella et al.,IN: Gelvin et al.,(Eds.),Plant Molecular Biology Manual,Kluwer Academic Publishers,Dordrecht,The Netherlands,pp. 1-22(1988)) 由来のnosプロモーター/NPTリーディングフレーム/Ocsターミネーターを含有 するHindIII/EcoRI断片を、pBluescript IIのSK+のHindIII/EcoR I 部位中にラ イゲーションして、選択プラスミド(pGHNC10)が作成された。2.微小発射物による形質転換 ワシントン州立大学のG.Anから、タバコ細胞系NT-1の恵贈を受けた。懸濁培養 物は、100mg/Lのイノシトール、1mg/LのチアミンHCl、180mg/LのKH2PO4、30g/L のスクロース、および2mg/Lの2、4-ジクロロフェノキシ酢酸を添加してあるムラ シゲ・スクーグ(Murashige and Skoog)塩(GIBCO Laboratories,Grand Island, NY)を含有する培地で増殖された。pHを5.7に調整してからオートクレーブで処理 した。毎週一回、500ml容量の三角フラスコ中で新鮮な培地100mlに3mlの播種材 料を添加することにより、細胞を継代培養した。フラスコは、光度47μmol m-2s ec-1、27℃の条件下で、125rpmの回転シェーカー中に置かれた。初期対数増殖期 である4日目の細胞を、微小発射物による衝撃(microprojectile bombardment) により形質転換した。50mlのアリコートを遠心分離し、ペレットを濃度が0.1g/m lとなるように新鮮な培地に再懸濁した。60mmペトリ皿の培地を0.8%の寒天で予 め凝固させておいて、この培養基上に無菌レンズ紙(lens paper)を敷き、この 上に0.5mlのアリコートを単層となるよう塗布した。塗布した細胞は、衝撃前3時 間23℃で保持した。微小発射物による衝撃は、通常の1,500psiの破裂円盤バルブ (rupture disk valve)を備えたDupont PDS−1000粒子加速器を用い、サンプル を発射器から5.5cmの距離において行った。 細胞はバッチ単位で、「発現」プラスミドと「選択」プラスミドとの混合物を 用いて共形質転換した。CaMV 35Sプロモーター(Benfey and Cua,Science 244:1 74(1989))により発現されたβ−グルクロニダーゼ(GUS)遺伝子を発現の測定に用 い、一方ノパリンシンターゼプロモーター(Depicker et al.,1982)により発 現されたネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子(nptII)を、安定して外 来DNAを組み入れている細胞の選択に用いた。プラスミドはすべて、大腸菌DH 5α株で増幅され、Quiage n plasmid maxiprep kit(Quiagen,Inc.Chatsworth,CA)を用いて単離した。共形 質転換混合物は、GUSレポータープラスミドとntpII選択プラスミドとを、モ ル比4:1で含有していた。したがって、500ngの各SAR形質転換混合物は、432n gのpGHNC11と68 ngのpGHNC10からなり、一方、コントロール混合物は314ngのpGH NC12と68 ngのpGHNC10を含有していた。(5μLのTE緩衝液中の)各DNA調製 物を、50μLのCaCl2(2.5M)および20μLのスペルミジン(0.1M)と混合して、1.0 μmの金の微小発射物上に沈殿させた。 衝撃後、ペトリ皿をパラフィルムで密閉し、一定の光を当てながら27℃で24時 間インキュベートした。その後、レンズ紙を用いて細胞を、1ml当たり100μgの カナマイシンを添加している培地を入れた新鮮なプレートに移した。約3週間以 内にカナマイシン耐性をもつ単離した微小カルスが出現し始めたので、この微小 カルスをカナマイシン培地を含む新鮮なプレートに移した。このプレート上で1 週間増殖した後、1ml当たり50μgのカナマイシンを添加した1mlのブロス を播種して、各カルスの懸濁培養を始めた。カルス確立後は、1ml当たり50μ gのカナマイシンを添加した5mlのブロスと3%(v/v)の播種材料との混液を 用いて、毎週、懸濁培養物を移した。3.遺伝子コピー数分析 前述の説明の通りに(Allen et al.,Plant Cell 5:603(1993))DNAを単離 した。定量的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法により、すべての細胞系についてGUS 遺伝子およびnptII遺伝子のコピー数を評価し、代表的な細胞系についてこの評 価をゲノムサザン法により確認した。GUS遺伝子のコピー数分析についてのPCR法 では、CaMV 35Sプロモーターに位置するプライマー(5'-TCAAGATGCC TCTGCCGACA- 3')(配列番号2)とGUS遺伝子の翻訳領域に位置するプライマー(5'-TCACGGGTTG G GGTTTCTAC-3')(配列番号3)を用い、nptII遺伝子のコピー数分析についてのPCR 法によるにおいては、nosプロモーター(5'-GGAACTGACA GAACCGCAAC-3')(配列番 号4)に位置するプライマーとnptII遺伝子の翻訳領域に位置するプライマー(5'- GGACAGGTCG GTCTTGACAA-3')(配列番号5) を用いた。メーカーの指示に従って、Ampli wax beads(Perkin Elmer)を使用す るホットスタートPCR法を用いた。下部混合物(25μL)には、0.8mMのdNTPs、 6mMのMgCl2、0.4mMづつの各オリゴヌクレオチドプライマー、50mMのKCl、10mM のTris-HCl(pH8.8)を含有していた。上部混合物(75μL)は、50 mMのKCl、10mM のTris-HCl(pH8.8)、2.5UのTaqポリメラーゼおよび100ngのゲノムDNAを10μl のTEに溶解した溶液を含有していた。サイクルは各々、94℃で2分、50℃で 2.5分および72℃で3分であった。72℃で7分行う最終伸長ステップ後に反応 を完了させた。 GUSのコピー数分析およびnptIIのコピー数分析のいずれにおいても、PCRはサ イクル18回に限定して、基質の消耗を避け、増幅産物はブロッテイングおよび32 Pで標識したDNAプローブとのハイブリダイゼーションを行って視覚化した。 タバコDNA(Arumuganathan and Earle,1991)1C(5pg)当量当たりGUS遺伝 子1〜150個が導入されるように、野生型NT−1ゲノムDNAにpGHNC11(+SAR) から得たDNAを連続希釈して、再構築標準品を調製した。標準品と未検試料の 両方について同時にPCR反応を行った。同様にして、pGHNC10のDNAの連続希釈を 行い、1C当たりnptII遺伝子1〜40個が導入されるように、野生型NT−1ゲノムD NAにpGHNC10から得たDNAを連続希釈して、nptII復元標準品を調製した。ハ イブリダイゼーションシグナルを、Ambis radioanalytiical scanner(Ambis,San Diego,CA)で定量化し、コピー数の最終評価を直線回帰分析によって計算した。4.DNAゲルブロット分析 Murray et al.,Plant Mol.Biol.Rep.10:173(1992)の説明に従ってサザン法を 実施した。アガロースゲルを0.5mg/mlのエチジウムブロミドで染色して、写真を 撮影した。ゲルの頂部1/3を0.25NのHClで10分間処理した。その後、ゲルを15分 間、150 mM 3mMのNaOH、3mMのEDTA中で2回インキュベートし、さらに15分間、15 0 mM のNaPO4中で2回インキュベートして、25mM ピロ亜リン酸ナトリウムを用い るサザン法(Sambrook et al.,Molecular Cloning: A Laboratory Manual,(2nd Ed.1989)Cold Spri ng Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY)により、Greenscreen Plus(New England Nuclear)にブロットした。2%のSDS、0.5%のBSA、1mMのEDTA、1 mMの1,10−フェナントロリン中でインキュベートしてブロッキングし、100 mMのNaPO4(pH7.8)、20mMのピロ亜リン酸ナトリウム、5mMのEDTA、1 mM 1、10 −フェナントロリン、0.1% SDS、10% デクストラン硫酸、500μg/mlのヘパリ ン硫酸、50μg/mlの酵母DNA、50μg/mlの鰊精子でハイブリダイゼーションを 行った。United StatesBiochemical Co.のRandom Prime DNA Labeling kitに よりプローブを調製した。洗浄条件は、室温下にて2XSSC、0.5%のSDSで5 分間2回、室温下にて2XSSC、0.1%のSDSで15分間1回、室温下にて0.1XS SC、0.5%のSDSで15分間2回、および37℃にて0.1XSSC、0.5%のSDSで30分 間2回であった。5.NPTII分析およびGUS分析 NPTIIタンパク質分析を行うため、細胞を液体窒素中で粉砕して、100μlのTrisC l(0.15M,pH7.8)に懸濁した。混合物を遠心分離し、上澄み液を使ってメーカー の指示に従ってNPTIIエライザキット(5'->3')によるエライザ分析を行った。 GUS蛍光強度分析を行うため、NPTIIとDNA抽出の際に説明したと同様にして 凍結細胞を液体窒素中で粉砕した。このようにして得た粉末を、50mMのNaPO4(pH 7.8)、10mMのβ−メルカプトエタノール、10mMのNa2EDTA、0.1%(w/v)のラウリ ルサーコシンナトリウム(sodium lauryl sarcosine)、および0.1%(w/v)のトリ トンX−100を含有する600μlのGUS抽出緩衝液に再懸濁して、2回10秒間の超音波 破砕した。抽出液は、不溶のポリビニルポリピロリドンで処理して澄明化し、遠 心分離した。GUS活性は、メチルウンベリフェロングルクロニド(MUG)を基質と して、Jefferson,Plant Mol.Biol.Rep.5:387(1987); Jefferson et al.,EMBO J. 6:3901(1987)が説明している蛍光強度分析法により測定した。総タンパク質は、 BioRadタンパク質分析キット(BioRad Laboratories,Melville,N.Y.)を用いて 測定したが、nmols 4−メチルウンベリフェロン(4-MU)として報告されているG USの特異的活性のため、反応初速度か らmin-1mgタンパク質-1が形成された。6.一過性発現 Hall et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:9320(1991)と同様の方法により、培 養開始後4日目のNT−1懸濁培養物からエレクトロポレーション用プロトプラスト を調製した。100mlの培養物を遠心分離(300×g、2分間)して細胞を採取し、10 0mlのマンニトール(0.4M)中で2回洗い、0.4Mのマンニトール、20mMのMES(pH5.5) 、1%nのセルラーゼ(Onozuka RS)および0.1%のペクチダーゼY23(Onozuka)を 含有する、等量のプロトプラスト形成溶液中に再懸濁した。その後懸濁液を150r pmで振とうしながら、25℃で30〜60分間インキュベートした。このようにして得 たプロトプラストを、GH3.7ローターを備えたBeckman GPR遠心分離器により300 ×gで5分間遠心分離することによって、プロトプラスト緩衝液で2回洗った。こ の混液を0.4Mのマンニトールで希釈して、プロトプラストの濃度をml当たり4×1 06とした。このようにして得た懸濁液に等量の2×エレクトロポレーション緩衝 液を添加希釈して、プロトプラストの最終濃度を1ml当たり2×106とした。2×エ レクトロポレーション緩衝液には、273mMのNaCl、5.36mMのKcl、2.94mMのKH2PO4 、0.4Mのマンニトール(pH 5.6)を含有していた。 エレクトロポレーションの都度、80μgの切断された大腸菌担体DNAと被検 体である20μgのプラスミドDNAの混合物を使用した。1mlのプロトプラストを エレクトロポレーションキュベット(BRL)に添加し、DNAとTE緩衝液との100 μLの混液と混合してから、氷上に5分間放置した。250V、1180μFでBRL Cell Po ratorによりエレクトロポレーションを実施した。処理後直ちにキュベットを15 分間氷上に置いた。その後、エレクトロポレーションされたプロトプラストのア リコート(400μl)を、0.4Mのマンニトールを添加した4mlの培地を入れた60mm ペトリ皿に移した。各種の時間でインキュベートした後、4℃で5分間300×gの遠 心分離によりプロトプラストを採取した。ペレット各々を600μlのGUS抽出緩衝 液中に再懸濁して、GUS活性を上述した蛍光法で分析した。7.植物核スカフォードの単離と結合分析 前述した説明と同様にして、NT−1細胞の核および核スカフォードを単離した( Hallet al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:9320(1991);Hall and Spiker,IN: Gelv in et al.,(Eds.),Plant Molecular Biology Manual,Kluwer Academic Punlidhr td,Dordrecht,pp.1-12(1994)。このようにして得た核輪状脂質(halos)を、70m MのNaCl、20mMのトリス(pH8.0)、20mMのKcl、0.1%のジギトニン、1%のチオジ グリコール、50mMのスペルミン、0.5mM PMSFと2μg ml-1アプロチニンが添加さ れている125mMのスペルミジン(Hall et al.,1991; Hall and Spiker 1994)を含 有する消化/結合緩衝液(D/BB、pH6.5)で2回洗った。その後、輪状脂質を 、10mMのMgCl2を含む同一の緩衝液で洗った。さらに、0.5mMのPMSF、2μg ml-1 のアプロチニン、10mMのフェナントロリンおよび10mMのMgCl2を含有するD/BB中 で輪状脂質を4×106ml-1まで希釈し、500単位ml-1の各種制限酵素(New England Biolabs)を37℃で1時間消化した。さらに、新鮮な酵素を添加し、もう1時間イン キュベートを続行した。各約8×105に相当するスカフォードを含有するスカフォ ードのアリコート(100μl)を2600×gで遠心分離し、上澄み液を捨て、0.5mMのPM SF、2μg ml-1のアプロチニンおよび10mMのMgCl2を含有するD/BB中にスカフォ ードペレットを再懸濁した。 結合分析を行うため、末端を33Pで標識してある断片を予め制限酵素(New Engl and Biolabs)で消化しておいて、その4μmoleを適当な競合DNAと共にスカフ ォードアリコート100μlに添加し、しばしば混合しながら37℃で1時間インキュ ベートした。スカフォードアリコートを2600×gで遠心分離して、ペレット(ス カフォードと結合したDNA断片を含有する)と非結合断片を含有する上澄み液 とを分離した。ペレット部分は10mMのMgCl2を添加してある200μlのD/BBで洗浄 して、0.5mg ml-1のプロテイナーゼKを添加した0.5%のSDSを含有する100μlのTE 緩衝液(100%に相当)中に再懸濁し、室温で一晩インキュベートした。ペレット 部分と上澄み液部分各々の等量(普通20%)を、1%アガロースゲルをTAE緩衝液 に溶解した溶液(Sambrook et al.,1989) 中で分離した。ゲルは7%トリクロロ酢酸で20分間処理し、濾紙上で乾燥した後 、X線フィルムに暴露した。 例2 SAR のモチーフとスカフォードの予想結合活性 SARの配列は非常に変わり易いが、これまでに酵母と動物の配列を比較する ことによって大まかな輪郭のSARコンセンサス要素やモチーフが数個同定された( Dickinson et al.,Cell 70:631(1992); Gasser and Laemmli,EMBO J.5:511(1986 ); Mielk et al.,Biochem.29:7475(1990))。図1は、1186塩基対のタバコRB7 SAR (配列番号1)および838塩基対の酵母SAR配列(ARS-1,Allen et al.,Plant Cell 5:603(1993))中におけるこれらモチーフの一部の分布を示している。 図1において、A枠(A)は、コンセンサス配列AATAAAYAAA(Yはピリミジンである )と、8/10かそれ以上の一致と評価された。T枠(T)は、コンセンサス配列TTWTWT TWTT(WはAまたはTである)と、9/10かそれ以上の一致と評価された。ショウジ ョウバエのトポイソメラーゼII部位(O)は、コンセンサス配列GTNWAYATTNATNNGと 、13/15かそれ以上の一致と評価された。ARSコンセンサス配列(WTTTATATTTW)は 、(R)で表されている。G排除領域(30塩基対のATC帯)は黒い縞模様で表されてい る。局所的にATに富む領域(>20bp)は斜線の多い枠(AT95%領域)と斜線の少な い枠(AT90〜95%)で示してある。 酵母SARはA枠とT枠を数個含有している。その上に、ARS共通要素1個、G排除 領域または30bpからなるATC帯を2個、およびAT90%を含有する20bp帯1個を有し ている。植物SAR(配列番号1)は、はるかに高い密度のAおよびT枠のモチーフ 、AT富に富む帯、およびG排除領域ならびにショウジョウバエのトポイソメラー ゼIIのコンセンサス配列に相同性を持つ要素3個を含有している。無作為にクロ ーニングした植物SARの総合研究(データ未発表)では、これらのモチーフの どれをとっても、in vitro分析において結合活性と密接な相関関係があることは 、示されていない。しかしながら、結合活性は、SAR関連モチーフの全数や全般 密度と弱い相関関係しかない。この 分析と図1のデータから、配列番号1のSARは、酵母SAR(ARS−1)よりも遥かに強 くスカフォード調製物と結びつくことが予想される。 例3 スカフォードの結合活性 RB7 SAR(配列番号1)は一貫して、タバコRB 7 SAR(配列番号1)の結合活性がA RS−1 SARのそれに匹敵することを示した。非特異的な競合体(nonspecific comp etitor)として制限酵素処理された植物ゲノムDNAを存在させながら、被検体 であるSAR配列を含有し末端に標識を付けた制限断片を、タバコ核スカフォード 調製物と混合した。プラスミドpGA−1は、酵母SAR(ARS−1)とTRP1を含有して いて、EcoRlとHindIIIによって消化された。プラスミドpB7−6は、配列番号1 のRB7タバコSARを含有していて、SpeIとXhoIによって消化された。結合条 件下でタバコ核スカフォード調製物と共にインキュベートした後、遠心分離によ り結合と未結合のDNA断片を分離し、DNAを精製してからゲル分析を行った 。 プラスミドpGA−1を用いる反応の度に、ペレットと上澄み液の同一%(20%) づつをとり、さらに同一%の未分画プローブのアリコートをとって、これらをア ガロースゲル上に互いに隣接するレーンに泳動して、オートラジオグラフ法によ り視覚化した(結果は示さず)。また、%を1/10に下げて(2%)、ペレットと上澄 み液画分をゲルにロードして、同一の方法を実施した。同一量の画分で比較する と、全シグナルのうち大部分が上澄み液画分中で観察されたが、低い程度ではあ るが20%画分を使ったゲルで酵母SARによる結合を見分けることが出来た(結果 は示さず)。より感度の高い分析では、酵母断片は結合するが、TRP1とベクター 断片は結合しないことが明らかであって、SAR DNAと単離されたスカフォード との関連が特異性を有することが確認された(結果は示さず)。 配列番号1のRB7 タバコSARを含有するプラスミドpB7−6 Sca/Claについても 同様のオートラジオグラフィーゲルを調製した。上述の酵母SARを使って得た結 果とは対 照的に、遥かに大きな部分のタバコRB7 SAR プローブがスカフォード画分と関連 した(結果は示さず)。 既知のSAR以外の要素が、発現分析で用いた構成物がスカフォードと結合す るのに貢献しているかも知れない可能性を検討した。上記の説明と同様のスカフ ォード結合分析を、CaMV 35S プロモーターと、GUS遺伝子と、コントロールプラ スミドpGHNC12のnos ポリアデニル化シグナルとを含む断片を分離するように設 計された制限消化産物を用いて実施した。これらの結合分析では、ゲルのレーン にペレット画分由来の材料を過大にロードした場合であっても、一律に否定的な 結果となった(結果は示さず)。 これらの結果は、RB7 SAR(配列番号1)の結合活性は酵母 SAR(ARS−1)よりも 高いことを示している。 例4 RB7 SAR は平均発限度を増大させる 前報の研究(Allen et al.,Plant Cell 5:603(1993))では、GUSレポーター遺伝 子の両側を2コピーのイーストSARエレメント(ARS−1)で挟むと、安定した形 質転換細胞系において平均GUS発現を12倍増大させることが証明された。本例に おいて、Allen et al.,1993と同様に、構成物により、RB7 SAR(配列番号1)を用 いて同一の細胞系を形質転換させた。共形質転換プロトコルを使用して、分析可 能マーカーと選択可能マーカーとが物理的に結合するのを防止した(Allen et al .,1993)。使用した構成物は図2A、2Bおよび2Cに示す。被検体である適当なレポー タープラスミドと選択プラスミドとを混合し、混合物を微小発射物と共に沈殿さ せ、前報の説明(Allen et al.,1993)と同様にしてタバコ懸濁培養細胞を入れた プレートに衝撃を与えて、形質転換を行った。カナマイシン耐性(Kmr)微小カル スを選択して、例1の説明と同様にしてカルスによる各々独立の懸濁培養細胞系 を作成した。もとの微小カルスから得たセグメントを組識化学的に染色したとこ ろ、SARプラスミドで形質転換した細胞系は遥かに 染色性が高いことが証明された(結果は示さず)。毎週植え継ぎを行って3週間 増殖した後、懸濁細胞を採取した。各細胞系からDNAを抽出して、サザン法分 析と定量PCR分析を行い、さらにこの細胞集団の一部を使用して例1の説明と同様 にして抽出可能GUS活性とNPTタンパク質濃度を測定した。導入遺伝子のコピー数 評価と発現データを表1および2に示す。 表1および2はまた、KMr系についてGUS酵素活性として測定した、GUS遺伝子の 平均発現度も示している。コントロールGUS活性は平均8nmol 4-MU min-lmg タン パク質-1で、アグロバクテリウムベクター中で同様の構成物で形質転換したタバ コ組識で通常得られている1〜54 nmol 4-MU min-1mg タンパク質-1の範囲に十分 入っている(Frischet al.,PlantJ.7:503(1995);Hobbs et al.,Plant Mol.Biol.2 1:17(1993);Jefferson et al.,EMBO J.6:3901(1987))。Rb7 SARがレポータ ー遺伝子の両側に含まれた場合、GUS活性はSARを欠いているコントロール構 成物の平均約60倍高かった。この発現に対する効果は、前報で報告されている酵 母SARの効果の約5倍高かった(Allen et al.,1993)。 表1および2は、また、GUS遺伝子とntpII遺伝子の平均コピー数を比較している 。これらのデータは定量PCR法によって得たものである(Allen et al.,1993)。 上記各々の場合、例1で説明したように、プロモーターおよびコード領域の配 列に対応するプライマーによって増幅を行った。増幅されたバンドにハイブリダ イゼーションされた放射活性をカウントして適当なPCR産物を計算し、遺伝子の コピー数は、実験の都度平行して得られた標準曲線によりシグナルを比較して推 計した。SARによって両側を挟まれた構成物によって形質転換した細胞系では 、コントロール構成物で形質転換した細胞系と比較して、35S::GUS遺伝子の平均 コピー数が約2倍減少していた。この結果は、酵母SARを用いた前報の研究結果 に類似している(Allen et al.,1993)。SAR含有細胞系においてGUS遺伝子のコピ ー数が少なかったのは、遺伝子コピー1個当たりの発現におけるRB 7 SARの平均 効果が、60倍増大した発現全体に対す る効果よりも大きいことを意味する。表1および2に示す通り、RB 7 SAR構成物 で形質転換した細胞系の遺伝子のコピー1個当たりのGUS酵素活性は、SARを 欠く同じ構成物で形質転換した細胞系より平均約140倍高い。 GUSならびにNPTIIの遺伝子コピー数、および、選択プラスミドとコントロールプ ラスミド(-SAR)との共形質転換から得られた各トランスジェニックタバコ系の発 現度 a=サンプルは、PCR分析によりGUSおよびNptIIの遺伝子コピー数に ついて分析された(例1)。 b=サンプルは、蛍光定量法によりGUSの特異性活性について分析された(例 1)。 c=エライザ法によりGUSおよび遺伝子コピー数に用いたのと同じサンプルが NtpIIタンパク質について分析された(例1)。 d=測定せず。 バラツキ係数=標準偏差/平均GUSならびにNPTIIの遺伝子コピー数、および、選択プラスミドとコントロールプ ラスミド+SARとの共形質転換から得られた各トランスジェニックタバコ系の発現 度 a=サンプルは、PCR分析によりGUSおよびNptIIの遺伝子コピー数に ついて分析された(例1)。 b=サンプルは、蛍光定量法によりGUSの特異性活性について分析された(例 1)。 c=エライザ法によりGUSおよび遺伝子コピー数に用いたのと同じサンプルが NtpIIタンパク質について分析された(例1)。 d=測定せず。 バラツキ係数=標準偏差/平均 例5 一過性発現 染色体の取り込みに依存する効果と一般的な転写エンハンサー活性とを区別す るため、SAR構成物は一過性発現システムにおいて検討された。この種の分析 は転写エンハンサーの研究に広く利用されている。一過的にトランスフェクトさ れたDNAは、ヌクレオソーム中では不完全にしか組識化されず(Archer et al. ,Science 255:1573(1992); Weintraub Cell 42:705(1995))、発現細胞の極く少 数しか安定的に形質転換されないという事実から、一過性の発現は大部分染色体 の取り込みとは無関係に起こることが示唆される(Christou,PlantJ.2:275(1992) ; Daveyetal.,Plant Mol.Biol.13:273(1989); Paszkowski et al.,EMBO J.3:271 7(1984);およびSauland Potrykus,Develop.Genet.11:176(1990))。植物SARプ ラスミド(pGHNC11)をNT−1プロトプラスト中にエレクトロポレーションして20 時間後GUS分析を行った。この時SARを欠いているコントロールプラスミド でトランスフェクトしたものと比較して、GUS遺伝子発現が2.7nmol -min-1-m g protein-1から7.27nmol -min-1-mg protein-1へと、約3倍の増進が観察された 。これは例5で報告されているように、安定的に形質転換した細胞系では発現全 体が約60倍、遺伝子1コピー当たりの発現が 約140倍増大したのと、著しい対照をなしている。したがって、安定的に形質転 換した細胞系におけるRB7エレメントの効果は、一過性転写分析における効果の2 0〜50倍であった。これらの結果はRB7エレメントが単に転写エンハンサーとして のみ作用しているばかりではないことを示唆している。 例6 取り込みパターン 直接的な遺伝子転移法(Direct gene transfer procedure)は、複雑な取り込み パターンとなることがある(Christou PlantJ.2:275(1992); Koziel et al.,Bio /Technology11:194(1993); Miittlesten Scheid et al.,Mo.l.Gen.Genet.228:1 04(1991); Paszkowski et al.,EMBO J.3:2717(1984); Tomes et al.,Plant Mol. Biol.14:261(1990);Wan and Lemaux,Plant Physiol.104:37(1994))。したがって 、コントロール発現プラスミド(pGHNC12)またはRB7 SAR(+)発現プラスミド(pGHN C)のいずれかで形質転換した複数の細胞系を、35S::GUS::nosカセットの片側を 切断するEcoRIとHindIIIで単離したゲノムDNAを消化して、DNAゲルブロッ ト解析を行った(例1による)。 ゲノムDNA(10μg)は、HindIII/EcoRIで消化し、0.85%アガロースゲル上で 分画した。DNAはナイロン膜にブロットし、例1の説明と同様にしてプローブ した。10μgのHindII/EcoRIを含むゲルレーンは、SAR(+)またはSAR(-)コントロ ールプラスミドで形質転換された各細胞系から得られたゲノムDNAを消化した 。コピー数復元ゲルレーンは、2.8kbの35S::GUS::nos Tの1C等量当たり40コ ピー、20コピー、10コピー、5コピー、1コピーおよび0コピーを添加してある、 形質転換しない(コントロール)10μgのゲノムDNAが含有されている。こ のコピー数復元ゲル層もプローブした。 35Sプロモーターの配列でプローブしたところ、親プラスミドの消化物が2.8kb のバンド一本を形成していた(データは開示しない)。ゲノムDNA中へ組み込 み後で、複雑なハイブリダイゼーションパターンが観察され、組み込み過程中に 広範な再構成が行われたことを示していた。コントロール構成物の組み込みパタ ーンは平均して、 SARプラスミドに対するものよりも若干複雑であった。しかしながら、この差違 はSARの細胞系がコピー数が少ないことの反映であるかもしれない。コピー数が 似たようなものである場合には、SAR細胞系とコントロール細胞系の取り込みパ ターンにはっきりした相違はなかった。 ほどんとの形質転換体に、35S::GUS遺伝子を含有する無傷の2.8kb断片が観察 され、ほどんとの細胞系には若干の再構成しない遺伝子コピーが含まれているこ とを示していた。しかしながら、回収した細胞系の約20〜30%には、無傷の35S: :GUS遺伝子を示す2.8kbバンドが欠けていた。一般に、このバンドはコピー数全 体が少ない細胞系にはなく、また一個のコピー復元標準品と同等以上のコピー数 を持つバンドはほどんと無い。一般に発現度が非常に低い。これらの細胞系のほ どんとは、プロモーター領域で再構成が起こっていて、このために活性が低下し たのか、あるいは失活してしまったとかんがえられる。例外はSAR系37(37−11 )で、PCR分析によると8コピーと評価され、またサザン法では複数のコピーを持 つ高分子バンドが数個存在することを示していた。この細胞系はまた、GUS発現 が高く(表2)、この場合再構成が遺伝子の機能に劇的な影響を与えないことを 示していた。 制限酵素で処理していないDNAサンプルのゲルブロットについてもプローブ を行った(データは示さず)。各種のコピー数と発現度を代表できるようにサン プルを選択した。細胞系から各種のコピー数と発現度を代表できる未消化のDN A(5μg)を取り、0.6%アガロースゲル上で分画し、501bpのCaMV35Sプローブ で分析した。高分子染色体DNAの位置は、エチジウムブロミド染色により測定 した。未消化プラスミド(pGHNC11とpGNHC12)の位置を測定した。形質転換してい ない5μgのゲノムDNA中で、1C当たり30コピー、10コピー、3コピー、1コピー のCaMV 35S::GUS::nos Tを添加してあるゲル層もプローブした。 これら各々の場合、すべての検出可能のGUS配列は高分子染色体DNAと共に 移動していて、形質転換の際に使用されたプラスミドと大きさが似ている染色体 外エレメ ント上にGUS配列が保持されている可能性が否定された。コピー数全体が少ない あるいは多い系についても同様の結果を得た。 Chen et al.,PlantJ.5:429(1994)は、直接的なDNA転移を受けた小麦細胞系 の導入遺伝子がN−6−メチルアデニンを含有している場合が多いことを報告して 、小麦細胞の形質転換と同時に、マイコプラズマ様生物などの内部寄生植物(end ophyte)の形質転換も起こる可能性があることを指摘した。この可能性を排除す るため、メチル化分析を行った。 細胞系から、GUS遺伝子コピー数と発現度が多様となるような高分子DNAを 選択調製し、アイソシゾマーであるDpnI、DpnII、またはSau3Aにより消化した。 DpnIはN−6−アデニンメチル化を必要とする。DpnIIはアデニンメチル化で阻害 される。Sau3AはN−6−アデニンメチル化による影響は受けないが、シトシンメ チル化によって阻害される。図3はSAR(+)プラスミドであるpGHNC11、および、SA R(-)コントロールプラスミドであるpGHNC12のGATC部位(垂直線)を示す制限地 図である。CaMV 35Sプロモーター由来の501塩基対プローブは、制限地図の下に 示してある。図3Bは選択されたSAR(+)系のDNAゲルブロットで、DpnI、Dpn IIおよびSau3Aの消化産物を示している。分子量は1kbマーカー(BRL)から推定 した(矢印)。Damメチラーゼ(+)大腸菌株から産生したプラスミドpGHNC12の コントロール消化産物は、図の右側に示してある。図3Cは選択されたSAR(−) コントロール系のDNAゲルブロットで、DpnI、DpnIIおよびSau3Aの消化産物を 示している。分子量は矢印によって図の左側に示してある。 活性のためにN−6−アデニンメチル化を必要とするDpnIは、導入遺伝子DNA を切断しないが、形質転換に用いられた大腸菌プラスミドDNAの同一配列を完 全に消化する。DpnIIはアデニンメチル化で阻害される点でDpn I とは異なるア イソシゾマーであり、プラスミドDNAは切断しないが、すべての被検細胞系の 導入遺伝子配列を分割する。もう一つのGATC分割アイソシゾマーであるSau3Aは 、プラスミドDN Aを完全に消化するが、導入遺伝子DNAに対しては部分的な活性しか示さない 。この酵素はGATC標的配列のC残基においてシトシンメチル化によって阻害され る。植物DNAにおいて、シトシンメチル化は植物DNA中のCGおよびCXG部位 に優先的に起こるが(Gruenbaum et al.,Nature 292:860(1981))、しかしながら シトシン類の一部は非対称な位置でメチル化する場合もある(Meyer et al.,Embo J.13:2084(1994))。したがって、Sau3Aは導入遺伝子のDNAを完全には分割で きなかったのは、導入遺伝子のGATC部位の一部にシトシンメチル化が存在するこ とに一致する。これらのデータを総合すると、形質転換した細胞系で導入遺伝子 が複製される過程において、アデニンメチル化が消失して、植物特異性のパター ンでシトシンメチル化が確立することが分かる。 例7コピー数と発現度 例1の説明と同様にして、形質転換の8週間後、複数の導入遺伝子細胞系を用 い、nmols 4−MUに作られたmin-1mg protein-1としてのGUSの特異的活性を蛍光 定量法で、遺伝子コピー数をPCR法でそれぞれ測定した。 図4では、各細胞系のGUS発現と遺伝子コピー数をプロットされている。(白 四角はRB7 SAR(+)形質転換細胞、黒三角はコントロール系である)。RB7 SARは 導入遺伝子数が少ない(細胞1個当たり約20コピー以下)細胞系で最大の効果を 挙げ、コピー数が多い系ではSARとコントロール構成物共に発現が低下していた 。植物SARに対する刺激の程度は全般に非常に大きかったのであるが、コピー数 に対する関係は、前報で報告された酵母由来の効果の低いSARを用いた実験結果 とまったくよく似ていた(Allen et al.,Plant Cell 5:603(1993))。酵母SAR構成 物の場合、20〜30個もの導入遺伝子コピーを持つ形質転換細胞で発現が増大した 。本例においては、コピー数が約20個以下の場合にRB7 SARの効果が最もはっき りと認められた。 SAR構成物のコピー数が少ない三つの細胞系(11−12、11−13および11−13) もG US発現の程度が低かったが、これは明らかにコピー数が少ないと発現度が高くな る(表2)という一般論に反する。これらの細胞系は無傷の2.8kbの35S::GUS::no s T バンドを欠いている系であるので、再構成した導入遺伝子配列しか含有し ていなかったかも知れない。しかしながら、これらのデータは分析データ全体に はあまり影響しない。2.8kbのバンドを欠いているSAR系およびコントロール系の データを除くと、平均GUS活性はSAR構成物含有系では574nmols 4−MU min-1mg p rotein-1で、コントロール系では10.4 nmols 4−MU min-1mg protein-1で、55 倍の差があった。データ全体の対応値は499および8.2 nmols 4−MU min-1mg pro tein-1で、61倍の差であった。 例8 選択遺伝子の発現に対する共形質転換の効果 本データにおいては、配列番号1のRb7 SARは、導入遺伝子の存在数が少ない 場合に発現を大幅に増大させ、導入遺伝子の存在数が大きいとSAR構成物とコン トロール構成物両方の発現が低い値となる。これらのデータは、本SARは転写 を遮断する作用がなかったこと、および/または染色体位置効果以外のものに由 来する変化が入遺伝子の発現に強く影響したことを示している。 SAR含有レポータープラスミドと共に形質転換したことが、選択プラスミド においてNPTII遺伝子の発現を増進させたか、否かを判定するため、同じ細胞懸 濁液から抽出液を取り、この抽出液中のNPT タンパク質濃度をエライザ分析によ り測定した。表2に示す通り、SAR含有ベクターと共に形質転換しても、すべての 細胞系の平均NPTタンパク質量には何らの効果もなかった(1.1倍)。GUS分析に 用いた導入遺伝子細胞系について、NPTIIタンパク質(pg/μg総タンパク質)は エライザ法で測定し、遺伝子コピー数はPCR法で測定した(図4参照)。図5はNPTタ ンパク質をコピー数に対してプロットした図(SAR(+)形質転換細胞は白四角 、コントロール系は黒三角)であり、NPTIIの発現がSAR構成物との共形質転換の 影響を受けないことを示している。 NTPIIタンパク質の濃度は個々の形質転換体で、約100pg/μg細胞性タンパク質ま で非常に広範囲に変化する。図4と5のGUSおよびNPTII発現データをプロットし直 して導入遺伝子各々の発現度を比較した(図6)。白四角は二重SAR形質転換体を 表し、黒三角はコントロール系を表している。GUS活性をNPTタンパク質濃度に対 してプロットすると、NPTIIとGUSとは弱い相関関係しかないことが分かった。SA R系のほどんと全てのNPT値は、コントロール系の変化の範囲内に収まっていた。 これらの結果は、共形質転換は組み込みが同一の遺伝子座に起こることが多い が(Christou and Swain,Theor.Appl.Genet.79:337(1990); Christou et al.,Pro c.Natl.Acad.Sci.USA 86:7500(1989); McCabe et al.,Bio/Technology 6:923(1 988); Christou,PlantJ.2:275(1992); Saul and Potrykus,Develop.Genet.11:17 6(1990))、共形質転換したプラスミド上の遺伝子はかなり独立して発現している ことを示している。レポーターおよび選択プラスミドが密集した配列で組み込ま れれば、GUSレポーター構成物上のSARが、NPTII遺伝子発現を刺激することもで きたことであろう。このような効果が発生しなかったことは、これら二つのプラ ッスミドは通常は密集したパターンで組み込まれることはなく、また同一の染色 体部位ではプラスミド配列により、SARが他の遺伝子に影響することを阻止さ れていること意味している。 例9 形質転換したタバコの再生 懸濁細胞の形質転換実験(例1)に使用したものと同じRB7 SAR 構成物を用い 、微小発射物の衝撃(例1を参照されたい)によりタバコ(Nicotiana tabacum) を形質転換させた後、形質転換した植物を再生した。 二重RB7 SAR 形質転換(SAR+)から約50の植物を回収し、コントロール形質 転換から約30の植物を回収した。一次形質転換体(成熟T0植物)をGUS組識化学 染色により分析し、35S GUS 導入遺伝子についてPCR分析した。一次形質転換体 の予備データは次のことを示している。 (a)SAR+プラスミドにより形質転換すると、形質転換体数が増加する。 (b)SAR+一次形質転換体とコントロール一次形質転換体は、共に、35S−GUS 遺伝子を含有するが(定量PCR分析により測定)、GUS発現を行わない(即ち、一 次形質転換体が遺伝子を発現しない)同一数の植物が含まれている。 (c)GUS染色に対し陽性である形質転換体数に差違があるようには見えない。 2種の形質転換体のGUS発現の大きさの絶対的な差に対して効果があるか、否かを 判定するため、GUS活性の測定が進行中である。GUSの染色パターンを比較すると 、SARで形質転換された植物は、葉片(leaf punches)中で多様な発現をすること が少ないことが示唆される。 実験形質転換体を野生型タバコ(Petite havana)親株と戻し交配させた。初期 データは、SARを持たない導入遺伝子を含有するBC1植物は、SARを含有する形質 転換体由来のBC1植物より5倍多い確率で遺伝子を発現しなくなることを示してい る(データは示さない)。これらの結果から、SARは将来の世代の発現を安定 化するようになることを示唆している。 例10Agrobacterium tumefaciens が媒介するセイヨウアブラナ(Brassica napus)の形 質転換 Agrobacterium tumefaciendが媒介する形質転換によってセイヨウアブラナ(c anola)を形質転換した。Agrobacterium tumefaciendのZ707S株とLBA4404株を使 用した。表3に示すように、2つの構造遺伝子(Ubl/Hpt遺伝子および35S/GUS遺 伝子)を含み、かつ2つのRB7 SARで両側を挟むか、あるいはSARを持ってい ない構成物により、アグロバクテリウムの二つの株各々を形質転換した。また、 これらから植物体を再生した。表3に、形質転換および再生の過程で得たデータ 、並びにT0植物から得たGUS発現データを要約して掲げる。 形質転換効率に対する効果 アグロバクテリウムのZ707S株は、通常、LBA4404株よりも効率的にセイヨウア ブ ラナを形質転換させることができる(表3のSARを含まないコントロールプラ スミドの結果を参照。Z707S株とLBA4404株によるハイグロマイシン耐性カルスの 形成数は42:2である)。SARが導入遺伝子の両側を挟む場合、ハイグロマイシ ン耐性カルスの数に対して、Z707S株による効果はない(SARがないZ707S株コ ントロールは42個、SAR+Z707Sは41個)。しかしながら、効率の悪いLBA4404株は ,SARが存在すると顕著に多くのヒグロマイシン耐性カルスを生成する(2個 対15個)。これらの結果から、SARはこれまでアグロバクテリウムによる形質 転換に無反応であった作物植物を、アグロバクテリウムに媒介させて形質転換す るのに好ましい効果があることを示している。 レポーター遺伝子の発現に対する効果0SAR+セイヨウアブラナは、平均でSARのないコントロールアブラナ より33倍多くのGUS発現を行った。SAR+アブラナの最も高いGUS発現度 は、SARがないアブラナの最も高いGUS発現度の27倍であった。これらのア ブラナをサザン法ブロッテングにより分析すると、遺伝子コピー数が高いことが 分かる。アグロバクテリウムは通常遺伝子のコピー数が少ないので、これは驚く べきことである。 SAR+構成物、SARなしの構成物共にコピー数が多かったので、この効果 がSARに起因するとは考えられない。 このデータは次のことを示している。 (a)SARによる効果は、アグロバクテリウム形質転換に影響を受けやすい 。 (b)SARによる効果は、再生された導入遺伝子植物にも存在する。 (c)SARは、二つ遺伝子(この場合、Hpt選択可能マーカー遺伝子とGUSレ ポーター遺伝子)の両側を挟んでいると効果を発揮する。 (d)RB7 SARは、タバコ以外の植物種で作用する。 上記の実施例は本発明を説明するためのものであって、本発明を限定するもの と解釈してはならない。本発明は後述の請求項によって範囲が定められており、 請求項の 同等物は本発明の一部とする。 表3 セイヨウアブラナの形質転換とGUS発現
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,S Z,UG),UA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD ,RU,TJ,TM),AL,AM,AT,AT,AU ,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH, CN,CU,CZ,CZ,DE,DE,DK,DK,E E,EE,ES,FI,FI,GB,GE,HU,IL ,IS,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LC, LK,LR,LS,LT,LU,LV,MD,MG,M K,MN,MW,MX,NO,NZ,PL,PT,RO ,RU,SD,SE,SG,SI,SK,SK,TJ, TM,TR,TT,UA,UG,US,UZ,VN (72)発明者 ホール,ジェラルド,ジュニア アメリカ合衆国、53716 ウィスコンシン、 マディソン、イースト・ブックアイ・ロー ド 5649 (72)発明者 スパイカー,スティーヴン アメリカ合衆国、27608 ノース・キャロ ライナ、ローリー、カンタベリー・ロード 1322 (72)発明者 アレン,ジョージ・シー アメリカ合衆国、27608 ノース・キャロ ライナ、ローリー、カーティア・ドライヴ 2719

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.配列番号1のヌクレオチド配列を有する単離DNA分子。 2.5'から3'の方向において、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に位 置し、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少なくとも一の構造遺伝子と 、該転写開始領域に対して5'側または該構造遺伝子に対して3'側の何れかに位 置する配列番号1のスカフォード付着領域とを含んでなるDNA構成物。 3.5'から3'の方向において、配列番号1の第一のスカフォード付着領域と 、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に位置し、かつ、該転写開始領域と機 能上関連している少なくとも一の構造遺伝子と、配列番号1の第二のスカフォー ド付着領域とを含んでなる請求項2に記載のDNA構成物。 4.植物形質転換ベクターに担持されている請求項2に記載のDNA構成物。 5.アグロバクテリウム・ツュメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens) の植物形質転換ベクターに担持されている請求項2に記載のDNA構成物。 6.請求項2に記載のDNA構成物を含有する植物細胞。 7.請求項2に記載のDNA構成物を含有する双子葉植物細胞。 8.請求項2に記載のDNA構成物を含有する単子葉植物細胞。 9.請求項2に記載のDNA構成物を含有する裸子植物細胞。 10.5'から3'の方向において、植物細胞中で機能する転写開始領域と、該 転写開始領域の下流に位置し、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少な くとも一の構造遺伝子と、該転写開始領域に対して5'側または該構造遺伝子に 対して3'側の何れかに位置する配列番号1のスカフォード付着領域とを含んで なるヘテロDNA構成物を含有する形質転換植物細胞を含む組換え植物。 11.構成物が5'から3'の方向において、配列番号1の第一のスカフォード 付着領域と、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に位置し、かつ、該転写開 始領域と 機能上関連している少なくとも一の構造遺伝子と、配列番号1の第二のスカフォ ード付着領域とを含んでなる請求項10に記載の組換え植物。 12.上記構成物が、上記構造遺伝子の下流に位置し、かつ、上記構造遺伝子 と機能上関連している終結配列をさらに含み、該終結配列が上記第二のスカフォ ード付着領域に対して5'側に位置している請求項11に記載の組換え植物。 13.植物が単子葉植物である請求項10に記載の組換え植物。 14.植物が双子葉植物である請求項10に記載の組換え植物。 15.植物がタバコ、ジャガイモ、大豆、ピーナッツ、綿、セイヨウアブラナ および野菜類からなる群から選ばれる双子葉植物である請求項10に記載の組換 え植物。 16.植物が裸子葉植物である請求項10に記載の組換え植物。 17.植物体を再生可能な植物細胞を準備するステップと、 5'から3'の方向において、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に位置し 、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少なくとも一の構造遺伝子と、該 転写開始領域に対して5'側または該構造遺伝子に対して3'側の何れかに位置す る配列番号1のスカフォード付着領域とを含んでなるDNA構成物により、該植 物細胞を形質転換させるステップと を含む、細胞中で外来遺伝子の発現が増大しているトランスジェニック植物細胞 を調製する方法。 18.構成物が、5'から3'の方向において、配列番号1の第一のスカフォー ド付着領域と、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に位置し、かつ、該転写 開始領域と機能上関連する少なくとも一の構造遺伝子と、配列番号1の第二のス カフォード付着領域とを含んでなる請求項17に記載の方法。 19.上記形質転換のステップが、上記の発現カセットを担持する微粒子を上 記植物細胞に打ち込むことによって実施される請求項17に記載の方法。 20.上記形質転換ステップが、アグロバクテリウム・ツュメファシエンス(A grob acterium tumefaciens)による形質転換によって実施される請求項17に記載の 方法。 21.上記植物細胞が、植物体を再生可能な植物組識中に存在する請求項17 に記載の方法。 22.上記形質転換された植物細胞から苗条を再生させるステップをさらに含 む請求項17に記載の方法。 23.上記の形質転換された植物細胞から根を再生させるステップをさらに含 む請求項17に記載の方法。 24.上記の形質転換された植物細胞から植物体を再生させるステップをさら に含む請求項17に記載の方法。 25.上記の植物細胞が単子葉植物細胞である請求項17に記載の方法。 26.上記の植物細胞が双子葉植物細胞である請求項17に記載の方法。 27.上記の植物細胞が裸子植物細胞である請求項17に記載の方法。 28.植物体を再生可能なタバコ植物細胞を準備するステップと、 5'から3'の方向において、植物細胞中で機能する転写開始領域と、該転写開始 領域の下流に位置し、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少なくとも一 の構造遺伝子と、該転写開始領域に対して5'側または該構造遺伝子に対して3' 側の何れかに位置する配列番号1のスカフォード付着領域とを含んでなるDNA 構成物により該タバコ植物細胞を形質転換させるステップと を含む、細胞中で外来遺伝子の発現が増大している組換えタバコ植物細胞を調製 する方法。 29.5'から3'の方向において、転写開始領域と、該転写開始領域の下流に 位置し、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少なくとも一の構造遺伝子 と、該転写開始領域に対して5'側または該構造遺伝子に対して3'側の何れかに 位置する配列番号1のスカフォード付着領域とを含んでなり、植物形質転換ベク ターにより担持されているDNA構成物。 30.5'から3'の方向において、植物細胞中で機能する転写開始領域と、該 転写開始領域の下流に位置し、かつ、該転写開始領域と機能上関連している少な くとも一の構造遺伝子と、該転写開始領域に対して5'または該構造遺伝子に対 しては3'の何れかに位置する配列番号1のスカフォード付着領域とを含んでな るヘテロDNA構成物を含有する形質転換されたタバコ植物細胞を含む組換えタ バコ植物。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2005529610A (ja) * 2002-06-14 2005-10-06 クロマジェニックス ビー.ブイ. 複数のタンパク質の同時生産のための方法;そこで使用するためのベクター及び細胞

Families Citing this family (41)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6239328B1 (en) 1992-10-05 2001-05-29 North Carolina State University Method for reducing expression variability of transgenes in plant cells
AR012202A1 (es) * 1997-03-28 2000-09-27 Mycogen Plant Science Inc Metodo mejorado para la transformacion de celulas vegetales, celula vegetal transformada, celula transgenica y metodo para aumentar el numero detransformantes de numeros de copias bajo en un proceso de transformacion vegetal
JP2002502261A (ja) * 1997-06-03 2002-01-22 ノース・キャロライナ・ステイト・ユニヴァーシティ 植物細胞における導入遺伝子の発現の変動性を減少させる方法
US6245974B1 (en) 1997-08-06 2001-06-12 North Carolina State University Matrix attachment regions
AU3476399A (en) * 1998-07-31 2000-02-21 Mycogen Plant Science, Inc. Improved plant transformation process by scaffold attachment regions (sar)
US6177612B1 (en) 1998-07-31 2001-01-23 Her Majesty The Queen In Right Of Canada, As Represented By The Department Of Agriculture And Agri-Food Canada Matrix attachment regions
AU762382B2 (en) * 1998-09-29 2003-06-26 Pioneer Hi-Bred International, Inc. MAR/SAR elements flanking RSYN7-driven construct
AU1833100A (en) * 1998-12-01 2000-06-19 Dow Agrosciences Llc Artificial matrix attachment region for increasing expression of genes introduced in plant cells
DE19857654A1 (de) 1998-12-14 2000-06-15 Max Planck Gesellschaft Beeinflussung des Blühverhaltens von Pflanzen durch Expression Saccharose-spaltender Proteine
AU5484500A (en) * 1999-06-14 2001-01-02 North Carolina State University Method for obtaining low copy transgenes by direct dna transformation
US7126041B1 (en) 1999-12-10 2006-10-24 North Carolina State Unversity High efficiency gene targeting in plants
KR100408844B1 (ko) 2000-07-29 2003-12-06 한국산업기술평가원 동물세포 발현벡터
DK1395669T3 (da) * 2001-01-26 2009-11-16 Selexis Sa Matriks bindingsregioner og fremgangsmåder til anvendelse af disse
ATE466941T1 (de) 2001-07-04 2010-05-15 Chromagenics Bv Dns-sequenzen mit anti-repressor-aktivität
CA2427190A1 (en) * 2002-04-30 2003-10-30 Alberta Research Council Inc. Production of recombinant epidermal growth factor in plants
AU2003243059A1 (en) * 2002-06-14 2003-12-31 Chromagenics B.V. Use of repression blocking sequences in methods for enhancing gene expression
US20040016014A1 (en) * 2002-07-17 2004-01-22 Nguyen Thanh-Tuyen T. High efficiency germline transformation system
US20040016015A1 (en) * 2002-07-17 2004-01-22 Nguyen Thanh-Tuyen T. High efficiency germline transformation system
EP1573058B1 (en) * 2002-12-18 2011-09-14 ChromaGenics B.V. A method for improving protein production
ATE354645T1 (de) * 2002-12-20 2007-03-15 Chromagenics Bv Mittel und methoden zur produktion eines proteins durch chromatin-öffner, die chromatin zugänglicher für transkriptionsfaktoren machen können
CN100480261C (zh) * 2003-02-26 2009-04-22 中国科学院上海生命科学研究院 核基质蛋白结合序列及其应用
EA200600449A1 (ru) * 2003-08-19 2006-08-25 ТВЕНТИ СЕКОНД СЕНЧУРИ ЛИМИТИД, эЛэЛСи Табачное изделие (варианты), способ его изготовления (варианты), трансгенное растение табака, способы повышения содержания никотина, редуцирующих сахаров и уровня биосинтеза алкалоидов в растении и способ изготовления восстановленного табака
WO2005040377A2 (en) 2003-10-24 2005-05-06 Selexis S.A. High efficiency gene transfer and expression in mammalian cells by a multiple transfection procedure of matrix attachment region sequences
US20060172382A1 (en) * 2004-11-08 2006-08-03 Chromagenics B.V. Selection of host cells expressing protein at high levels
US8039230B2 (en) * 2004-11-08 2011-10-18 Chromagenics B.V. Selection of host cells expressing protein at high levels
US20060195935A1 (en) 2004-11-08 2006-08-31 Chromagenics B.V. Selection of host cells expressing protein at high levels
US8999667B2 (en) * 2004-11-08 2015-04-07 Chromagenics B.V. Selection of host cells expressing protein at high levels
EP1809750B1 (en) * 2004-11-08 2012-03-21 ChromaGenics B.V. Selection of host cells expressing protein at high levels
JP2009514547A (ja) 2005-11-04 2009-04-09 ダウ・アグロサイエンス・エル・エル・シー 組み換え植物懸濁培養物を使用するワクチンマスター細胞系統の調製
SI2049663T1 (sl) 2006-08-11 2015-12-31 Dow Agrosciences Llc Homologna rekombinacija, posredovana z nukleazo s cinkovim prstom
KR101520507B1 (ko) 2006-12-14 2015-05-29 다우 아그로사이언시즈 엘엘씨 최적화된 비-정규 아연 손가락 단백질
US7888069B2 (en) * 2006-12-22 2011-02-15 Dow Agrosciences Llc Plant-made west nile virus (WNV) vaccines, vectors and plant codon optimized sequences
EP2238253B1 (en) 2007-11-27 2012-09-12 Medicago Inc. Recombinant influenza virus-like particles (vlps) produced in transgenic plants expressing hemagglutinin
PH12012500565B1 (en) * 2009-09-22 2018-01-12 Medicago Inc Method of preparing plant-derived proteins
RU2568056C2 (ru) 2009-10-22 2015-11-10 ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи Конструируемые белки с цинковыми пальцами, направленные на гены растений, вовлеченные в биосинтез жирных кислот
NZ600546A (en) 2010-01-22 2014-08-29 Dow Agrosciences Llc Excision of transgenes in genetically modified organisms
WO2012033794A2 (en) * 2010-09-08 2012-03-15 Dow Agrosciences Llc Aad-12 event 1606 and related transgenic soybean lines
CA2820706C (en) 2010-12-03 2018-05-22 Ms Technologies, Llc Optimized expression of glyphosate resistance encoding nucleic acid molecules in plant cells
AU2013205606B2 (en) 2012-02-01 2015-05-21 Corteva Agriscience Llc Synthetic Brassica-derived chloroplast transit peptides
TW201538518A (zh) 2014-02-28 2015-10-16 Dow Agrosciences Llc 藉由嵌合基因調控元件所賦予之根部特異性表現
EP3782465B1 (en) 2019-08-23 2023-08-30 Universität Potsdam Transgenic zebrafish model for stroke

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5459252A (en) * 1991-01-31 1995-10-17 North Carolina State University Root specific gene promoter
AU673859B2 (en) * 1992-10-05 1996-11-28 North Carolina State University Method for increasing expression and reducing expression variability of foreign genes in plant cells

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2005529610A (ja) * 2002-06-14 2005-10-06 クロマジェニックス ビー.ブイ. 複数のタンパク質の同時生産のための方法;そこで使用するためのベクター及び細胞
JP2010004886A (ja) * 2002-06-14 2010-01-14 Chromagenics Bv 複数のタンパク質の同時生産のための方法;そこで使用するためのベクター及び細胞
JP2010011859A (ja) * 2002-06-14 2010-01-21 Chromagenics Bv 複数のタンパク質の同時生産のための方法;そこで使用するためのベクター及び細胞

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