JP2000510690A - 哺乳類混合リンパ球受容体、ケモカイン受容体(mmlr―ccr) - Google Patents
哺乳類混合リンパ球受容体、ケモカイン受容体(mmlr―ccr)Info
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- C07K14/7158—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons for chemokines
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、新規なケモカイン受容体(MMLR-CCRまたはMPHG-CCR)をコードするポリヌクレオチド(mmlr-ccrまたはmphg-ccr)を提供するものである。本発明は、受容体活性を調節する分子の検出のためのスクーニング方法を提供する。本発明はまた、精製MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの産生のための宿主細胞、アンチセンス分子、診断用分子、及び組換え発現ベクター;MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの抗体、アゴニスト、アンタゴニスト、及びインヒビター;及びこのポリペプチド、その抗体、アンタゴニスト、及びインヒビターに基づく医薬品組成物及び治療方法を提供する。本発明は更に、感染症、炎症、増殖疾患、固形腫瘍、及び循環器病の検出及び治療のための診断用及び治療用組成物を提供する。
Description
【発明の詳細な説明】
哺乳類混合リンパ球受容体、ケモカイン受容体(MMLR-CCR)技術分野
本発明は一般に分子生物学の分野に関するものであり、特に新規な2つのケモ
カイン受容体のヌクレオチド及びアミノ酸配列に関するものである。本発明は更
に、ここに開示する新規なヌクレオチド配列及びアミノ酸配列の、疾患の診断及
び治療における使用に関するものである。背景技術
ケモカインは、一般に約70〜100アミノ酸からなる長さを有し、分子量8〜11k
Dで、1〜100ng/mlの範囲で活性な小型のポリペプチドである。ケモカインは初
めに炎症組織から単離、精製され、その生物活性について特徴づけられた。最近
では、ケモカインは、分子クローニング技術を通して発見されてきており、機能
分析と構造分析の両面から特徴づけられている。
各ケモカインは、主として成熟細胞における初めの2つのシステイン残基の間
隔に基づきシステインモチーフの一次構造及び存在の双方を通して近縁関係を有
する。現在、各種ケモカインは2つのファミリー、即ちC-X-Cケモカイン(α)
及びC-Cケモカイン(β)の何れか一方に割り当てられている。例外は存在する
が、C-X-Cケモカインは、好中球及び繊維芽細胞を活性化し、C-Cケモカイ
ンは単球/マクロファージ、好塩基球、好酸球、T細胞他を含むより多様な標的
細胞のグループに作用する。C-X-Cクラスは、メラノーマ成長刺激活性(MG
SA)、インターロイキン8(IL-8)及び好中活性化ペプチド2(NAP-2)を
含む。C−Cクラスは、RANTES(Regulated on Activation.Normal T Expr
essed and Secreted)、マクロファージ炎症性タンパク質1α及び1β(MIP-
1
α及び-1β)、及び単球走化性タンパク質1(MCP-1)を含む。
MCP-1は、血小板由来成長因子、腫瘍壊死因子α、リポ多糖類、及び酸化型
低密度リポタンパク質を含むメディエーターに応じて、内皮細胞、平滑筋細胞、
及びマクロファージによって産生される強力で特異的な単球アゴニスト及び化学
誘因物質である。MCP-1は、慢性関節リウマチ、肺胞炎、アテローム性動脈硬
化症のような炎症性疾患における組織の単球浸潤、及び動物モデルにおいて腫瘍
の成長の抑制に関与し得る腫瘍のマクロファージ浸潤を媒介することに関与して
いる(Charo(1994)Proc Natl Acad Sci 91:2752-2756)。Charo(先述)は、動
脈壁における単球の浸潤は、アテローム性動脈硬化症の開始における重要なイベ
ントであり、MCP-1、及び他の近縁なタンパク質(MCP-2及びMCP-3:M
CP-1とそれぞれ62%及び73%のアミノ酸の同一性を有する)はヒト骨肉腫
株細胞から精製され、単球に対して特異的な化学誘引性を共有していることを報
告している。
白血球遊走に加えて、C-C及びC-X-Cケモカインの双方は、急性及び慢性
の炎症性疾患、造血の抑制、血管形成及び繊維増殖の調節において主要な関与者
として関与している(Taub et al(1994)Ther Immunol 1:229-246)。マクロファー
ジ炎症性タンパク質1α(MIP-α)は、in vitro及びin vivoでの造血幹細胞の
増殖を抑制することが報告されている(Cook J 1996 Leukoc Biol 59:61-66)。
又Gewirtz等(1995;Blood86:2559-2567)は、3つのC−Cケモカイン、MIP-
1α、MIP-1β及びc10が、好中球活性化ペプチド−2(NAP-2)を等価量投
与した場合、巨核球コロニー形成を特異的に抑制することを報告している。Eave
s等(1993 Proc Natl Acad Sci USA 90:12015-12019)は、慢性骨髄白血病(C
ML)の患者に対して、通常の原始造血細胞の増殖のため、MIP−1αを投与
することを示唆している。
ケモカインは、その標的細胞、即ち免疫細胞の細胞表面上の特定の受容体と相
互作用することにより生物学的効果を発揮する。既知のケモカイン受容体は、結
合の後内部移行する基礎的なタンパク質である、Gタンパク質と結合する。更に
、この受容体は、一連の細胞内及び細胞外ループにより結合される7つの膜貫通
セグメントを含む構造に適合するべく予測されるアミノ酸配列を示す。C-X-C
及びC-Cケモカイン受容体は高度に特異的であり、2つの異なるクラスのケモ
カイン間の結合についての相互の競合は存在しない。この法則の例外は高いアフ
ィニティーをもってC-C及びC-X-Cケモカインの双方に結合する赤血球ケモ
カイン受容体であり、マラリア寄生虫、三日熱マラリア原虫に対する受容体であ
ることが分かってきた。しかし、赤血球ケモカイン受容体を以前に特徴付けられ
た受容体とは区別する特徴が存在する。赤血球ケモカイン受容体は結合の後内部
侵入を防ぐ、Gタンパク質によって調節されない酸性タンパク質である(Horuk
(1994)Trends Pharmacol Sci15:159:165)。
少なくとも2つのC-X-Cケモカイン受容体、IL8A及びIL8Bが、それぞれH
olmes等(1991 Science 253:1278-1280)及びMurphy等(1991;Science 253:1280
-1283)によって報告されてきた。3つのC-C受容体型、MIP-1 α/RANT
ES型(CCR-1)及びMCP-1型(CCR-2)、及びCCR-3(初めにマウス
の好中球に由来)が報告されている(post等(1995)J Immunol 155:5299-305)。
Charo(先述)は、MIP-1α受容体に最も近縁な2つのMCP-1受容体アイソ
フォームのクローニングについて報告している。彼は、MCP-1受容体における
アミノ酸配列、IFFIILLTIDRYLAIVHAVFAL(K/R)ART
VFGVの存在についても報告している。この配列は、第3の膜貫通ドメイン及
び第2の細胞内ループに発生し、ロドプシンにおいてG結合タンパク質と相互作
用することが
知られている。Charo(先述)は、このドメインがC−Cケモカインに対する受
容体に共通なGタンパク質活性化の側面を媒体し得ることを示唆している。
単球/マクロファージ走化性に関係する新規なケモカイン受容体の発見により
、受容体活性の調節因子を識別するための新規なスクリーニング方法の開発の基
礎が得られ、又細胞の異常増殖を伴う炎症、感染症、及び病気に対する診断及び
治療薬の開発の助けとなる。発明の開示
本発明は、ここではMMLR-CCRと表記する、新規なケモカイン受容体に
関するものである。MMLR-CCRをコードするヌクレオチド配列は、二元配
置の混合性リンパ球(MLR)培地の2つから一日に回収された塑性接着単核細
胞から作製されたcDNAライブラリーの配列群のなかから見つけられた。本発明は
また、ここではMPHG-CCRと表記する、新規なケモカイン受容体にも関す
るものである。MPHG-CCRは、塑性接着(2時間培養)単核細胞から作製
されたcDNAライブラリーの配列群のなかから見出された。本発明は、例えば、感
染症、炎症、増殖性疾患、腫瘍形成、及び循環器病のような、通常の白血球の機
能が、通常の白血球生成によって、或いはケモカインアゴニストやアンタゴニス
トによる不適切な活性化によって動揺する疾病状態の研究、診断、及び治療にお
いて、ここに開示する2つのケモカイン受容体のヌクレオチド及びアミノ酸配列
を使用することに関係する。
本発明はまた、(1)適切な培養上清における天然の生物学的リガンド、即ち
ケモカイン、及び(2)受容体/リガンド結合を調節し、シグナル伝達イベント
を調節することによって受容体の活性化を調節する物質、化合物、または合成薬
物を評価し、選別し、同定するために、MMLR-CCR及びMPHG-CCRを
発現する遺伝子組換え宿主細胞や
mmlr-ccr及びmphg-ccrを使用することに関するものである。このような遺伝子組
換え宿主細胞は、例えば受容体/リガンド結合を調節できる有機分子またはペプ
チドライブラリーを選別するために用いることができる。
本発明は、MMLR-CCRが、GenBankにgi:472558として開示されている、
MCP-1 CCR-2ケモカイン受容体、MCP-1RB(Charo前述)と共有するア
ミノ酸相同性と、MPHG-CCRが、Charo(前述)の論文に開示されているC
-Cケモカイン受容体3(g881570)及びMCP-1RA受容体(g472556)と共有す
るアミノ酸相同性に部分的に基づくものである。特に、MMLR-CCRは、ケ
モカイン受容体の第3の膜貫通ドメイン及び第2の細胞内ループにおいて見出さ
れた保存的アミノ酸配列IFFIILLTIDRYLAVVHAVFAL(K/R
)ARTVFGVを含んでいる。前述のケモカイン受容体の第3の膜貫通ドメイ
ン及び第2の細胞内ループは、ロドプシンの対応領域において、Gタンパク質結
合に関与していることが知られており、このドメインが、C-Cケモカインの受
容体に共通なGタンパク質活性化の側面を媒介し得ることを示唆している。Char
o(前出)が報告しているように、MMLR-CCRのGタンパク質結合ドメイン
内である121番目の位置において保存的アミノ酸置換が一箇所あり、イソロイシ
ンがバリンに置き換わっている。
従って、本発明は、単球/マクロファージ浸潤及び走化性及び造血が関係し得
る2つの新規なC-Cケモカイン受容体MMLR-CCR及びMPHG-CCRの
発見に基づくものである。MMLR-CCR及びMPHG-CCR及びそれらをコ
ードするヌクレオチド配列及びオリゴヌクレオチド、ペプチド核酸(PNA)、
その断片や部分やアンチセンス分子は、感染症、炎症、増殖性疾患、腫瘍形成、
及び循環器病が関係するMMLR-CCRの検出や定量、或いはその両方のため
の診断方法の基礎を提供する。上
述の疾病には、慢性関節リウマチ;肺胞炎;アテローム性動脈硬化症;(過剰な
炎症反応により特徴付けられる)慢性肉芽腫症;喘息;重症筋無力症、糖尿病、
及び炎症性腸疾患のような自己免疫疾患;毒素ショック症候群;敗血症性ショッ
ク;(殺菌力の低下により特徴付けられる)チェディアック−東症候群;細胞の
異常増殖を伴う病気;及び固形腫瘍が含まれる。例えば、ここに開示するMML
R-CCRをコードするmmlr-ccrヌクレオチド配列、及びその断片を、このよう
な疾病状態が関係し得るmmlr-ccr核酸の検出のための、バイオプシー用に採取さ
れた細胞や組織や体液のハイブリダイゼーションアッセイにおいて用いることが
できる。
mmlr-ccrまたはmphg-ccrヌクレオチド配列の異常レベル、若しくは生物学的サ
ンプルにおける転写サイズの異常は、受容体が過剰発現されたか、過小発現され
る調節状態の特徴であり得る。MMLR-CCRまたはMPHG-CCRをコード
するヌクレオチド配列は、ケモカイン受容体をコードする遺伝子における欠失、
変異、または染色体転座のような染色体異常を診断的に検出するために用いられ
得るプローブの基礎を提供する。遺伝子発現は、このような疾病状態において、
またはこの受容体をコードする遺伝子の領域に染色体異常が存在し得るときに変
化し得る。
本発明はまた、ヌクレオチド配列のin vitroまたはin vivoでの産生のための
、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRをコードするヌクレオチド配列を含む
遺伝子組換え宿主細胞及び発現ベクターにも部分的に関連する。
更に、本発明は、疾病状態におけるタンパク質の診断的検出及び定量のために
使用され得るケモカイン受容体のアンタゴニストやインヒビターを取出すスクリ
ーニングのため、及び抗体の産生のため、MMLR-CCRまたはMPHG-CC
Rを使用することにも関連するものである。
受容体のレベルまたは活性を調節し得るペプチドまたは小分子は、炎症のよう
な受容体の活性化が関係する疾病状態の治療のための医薬品組成物の基礎となる
。ケモカイン受容体アンチセンス分子を、受容体シグナル伝達を低下させること
が好ましいような状態の場合に、細胞表面の受容体の存在をダウンレギュレート
するのに用いることができる。別形態では、ケモカイン受容体/リガンド相互作
用のアンタゴニストを、受容体活性化を遮断または低下させる、即ち、浸潤/走
化性をもたらすシグナル伝達、及び様々な二次メッセンジャー媒介細胞イベント
を遮断または低下させることが好ましいような疾病や病気において、受容体/リ
ガンド結合を遮断するために用いることができる。更に別形態では、mmlr-ccrま
たはmphg-ccrセンス分子を、受容体の存在をアップレギュレートするために用い
たり、また、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRアゴニストを、走化性及び
他の二次メッセンジャー媒介細胞イベントを増加させることが好ましいような状
態の場合に、受容体の活性化を促進してシグナル伝達イベントを促進するために
用いることができる。このような受容体活性を調節できる分子を、単独で、或い
は他の治療薬と組み合わせて、疾病の治療のために投与することができる。
本発明は、更に、ポジティブコントロールとして用いることができる精製受容
体の一つ、及び抗受容体抗体を含む、細胞及び組織におけるMMLR-CCRま
たはMPHG-CCRの検出のための診断検査法及びキットを提供する。このよ
うな抗体は、タンパク質の発現または欠失体または突然変異体の発現が関与する
任意の疾病状態や病気を検出のための、溶液ベース、膜ベース、組織ベースの技
術において用いることができる。図面の簡単な説明
第1A図〜第1D図は、MMLR-CCRのポリヌクレオチド配列(配列番号
:1)及び予測アミノ酸配列(配列番号:2)を示す。保存配列
IFFIILLTIDRYLAVVHAVFAL(K/R)ARTVFGVは、107
番目の残基から始まっている。
第2A図及び第2B図は、MMLR-CCRとMCP-1受容体(Charo前出)と
のアミノ酸アライメントを示す。この図と第7図に示す配列は、DNASTAR
ソフトウェアのmultisequence alignment program(DNASTAR社、Madison
WI)を用いて作製した。
第3図は、予測アミノ酸配列に基づくMMLR-CCRの疎水性特性の解析結
果を示す。
第4図は、MacDNAsisにより求められたMMLR-CCRの等電点[pI=9.69]を
示す。
第5図は、プローブとして、MMLR-CCRをコードするインサイト社クロ
ーンNo.478861を用いたノーザンブロット分析の結果を示す。
第6A図〜第6C図は、MPHG-CCRのポリヌクレオチド配列(配列番号:
3)及び予測アミノ酸配列(配列番号:4)を示す。
第7A図及び第7B図は、MPHG-CCRとC-Cケモカイン受容体(G188157
0)とのアミノ酸アライメントを示す。
第8図は、予測アミノ酸配列に基づくMMLR-CCRの疎水性特性の解析結
果を示す。
第9図は、MacDNAsisにより求められたMPHG-CCRの等電点を示す。この
結果から、MPHG-CCRの等電点[pI]は、7.63であることがわかる。発明の実施の形態
本発明は、ここではMMLR-CCRと表記する、新規なケモカイン受容体に
関するものである。MMLR-CCRをコードするヌクレオチド配列は、二元配
置の混合性リンパ球(MLR)培地の2つから一日に回収された単核細胞から作
製されたcDNAライブラリーの配列群のなかから
初めに見つけられた。本発明はまた、ここではMPHG-CCRと表記する、新
規なケモカイン受容体にも関するものである。MPHG-CCRは、単核細胞か
ら作製されたcDNAライブラリーの配列群のなかから初めに見出された。本発明は
、例えば、感染症、炎症、増殖性疾患、腫瘍形成、及び循環器病のような、通常
の白血球の機能が、通常の白血球生成によって、或いはケモカインアゴニストや
アンタゴニストによる不適切な活性化によって動揺する疾病状態の研究、診断、
及び治療において、ここに開示する2つのケモカイン受容体のヌクレオチド及び
アミノ酸配列を使用することに関係する。
本発明はまた、(1)適切な培養上清における天然の生物学的リガンド、即ち
ケモカイン、及び(2)受容体/リガンド結合を調節し、シグナル伝達イベント
を調節することによって受容体の活性化を調節する物質、化合物、または合成薬
物を評価し、選別し、同定するために、MMLR-CCR及びMPHG-CCRを
発現する遺伝子組換え宿主細胞やMMLR-CCR及びMPHG-CCRを使用す
ることに関するものである。
本発明は、48時間処理された混合性リンパ球培地の単球、即ち、炎症及び免疫
調節に関連する細胞から作製されたcDNAライブラリーにおける5654個の使用可能
な配列のランダムなサンプルにおけるMMLR-CCRをコードするヌクレオチ
ド配列の存在に部分的に基づくものである。MMLR-CCRのヌクレオチド配
列は、混合性リンパ球反応を受けない単球から作製されたcDNAライブラリーにお
ける7749個の使用可能な配列のランダムなサンプルには存在していない。本発明
はまた、混合性リンパ球反応を受けない単球から作製されたcDNAライブラリーに
おける7749個の使用可能な配列のランダムなサンプルにおけるMPHG-CCR
をコードするヌクレオチド配列の存在に部分的に基づくものである。ここで使用
されるとき、用語「使用可能な配列」とは、ベク
ター、ヌクレオチド反復、コンタミ、及びミトコンドリアDNAを除去した後、
ライブラリーにおけるクローンの総数を意味する。本発明は更に、MMLR-C
CRが既知のMCP-1ケモカイン受容体、MCP-1RB(GenBankアクセス番号g
i:472558)と共有するアミノ酸相同性、及びGタンパク質結合と関連する保存ア
ミノ酸モチーフの損じ亜、及びMPHG-CCRがC-Cケモカイン受容体3及び
MCP-1RAと共有するアミノ酸相同性に部分的に基づくものである。
従って、本発明は、2つの新規なC-Cケモカイン受容体MMLR-CCR及び
MPHG-CCRの同定に基づくものであり、これらは、例えば感染症、炎症、
増殖性疾患、腫瘍形成、及び循環器病のような、通常の白血球形成により、また
はケモカインアゴニストやアンタゴニストによる不適切な活性化により通常の白
血球の機能が動揺する疾病状態に関係し、また、上述の疾病には、慢性関節リウ
マチ;肺胞炎;アテローム性動脈硬化症;(過剰な炎症反応により特徴付けられ
る)慢性肉芽腫症;喘息;重症筋無力症、糖尿病、及び炎症性腸疾患のような自
己免疫疾患;毒素ショック症候群;敗血症性ショック;(殺菌力の低下により特
徴付けられる)チェディアックー東症候群;及び腫瘍形成のような細胞の異常増
殖を伴う病気が含まれる。
本明細書において「核酸配列」なる用語は、オリゴヌクレオチド、ヌクレオチ
ドまたはポリヌクレオチド配列、及びそのフラグメントまたは一部分の配列を意
味し、且つ、一本鎖または二本鎖でありセンス鎖かアンチセンス鎖の何れかを表
すゲノムの若しくは合成のDNAかRNAを意味する。同様に、本明細書におけ
る「アミノ酸配列」とは、ペプチドまたはタンパク質配列、またはその一部分を
意味する。本明細書において、小文字の「mmlr-ccr」または「mphg-ccr」とは核
酸配列を意味し、大文字の「MMLR-CCR」及び「MPHG-CCR」は、タ
ンパク質配列を
意味する。本明細書におけるペプチド核酸配列(PNA)とは、分子を、相補的
なDNAまたはRNAと対応するオリゴヌクレオチドより高いアフィニティ及び
特異性をもってハイブリッド形成可能になる中性の「ペプチド様」バックボーン
を有する情報分子のクラスを意味する(PerSeptive Biosystems 1-800-899-5858
)。
本明細書において、MMLR-CCR及びMPHG-CCRは、ウシ、ヒツジ、
マウス、ブタ、ウマ、好ましくはヒトを含む任意の種の、天然のものか、天然の
、合成の、半合成の、または組換え体何れかの源に由来するMMLR-CCR及
びMPHG-CCRをそれぞれ意味する。
本明細書において、「天然(または自然発生)」とは、天然に見出されるアミ
ノ酸配列を有するMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを意味し、「生物学的
に活性」なる用語は、天然MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの構造的、調
節性の、または生化学的機能を有するMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを
意味する。本明細書において、「免疫学的活性」とは、天然、組換体、または合
成MMLR-CCRまたはMPHG-CCR、またはその任意のオリゴペプチドの
、適当な動物や細胞における特定の免疫応答を誘発し、特定の抗体に結合する能
力として定義される。
本明細書において「誘導体」なる用語は、MMLR-CCRまたはMPHG-C
CRの化学的修飾を意味する。このような修飾の例には、水素からアルキル基、
アシル基、またはアミノ基への置換がある。ケモカイン受容体誘導体は、天然ケ
モカイン受容体の必要不可欠な生物学的特性を保持している。
本明細書において「精製」なる用語は、その天然の環境から取り除かれ、天然
にはそれが結合して存在する少なくとも1つの他の成分から単離または分離され
た核酸配列またはアミノ酸配列を有する分子を意味する。
コーディング配列
ヒトmmlr-ccr(配列番号:1)及びヒトmphg-ccrのヌクレオチド配列は、それ
ぞれ第1A図〜第1D図及び第6A図〜第6C図に示されている。mmlr-ccrの部分的
なコーディング領域は、MMLR細胞から作られたcDNAライブラリー内で、5654
個の使用可能な配列に一個の割合で同定された。mphg-ccrの部分的なコーディン
グ領域は、マクロファージから作られたcDNAライブラリー内で、7749個の使用可
能な配列に一個の割合で同定された。ヒトMCP-1受容体(NCBI GI 4725
58)を、MMLRライブラリー(インサイト社ライブラリーMMLR2LT01)
のcDNAに対して比較するBLAST検索(Basic Local Alignment Search Tool;A
ltschul SF(1993)J Mol Evol 36:290-300;Altschul SF et al(1990)J Mol Biol
215:403-410)により、インサイト社クローンNo.478861(mmlr-ccr)及び442279(mp
hg-ccr)が同定された。mmlr-ccr及びmphg-ccrの5’ヌクレオチド領域を、PC
Rによる延長によって得て、配列決定した。
配列番号:1のヌクレオチド配列は、332個のアミノ酸残基を含むMMLR-C
CRアミノ酸配列(配列番号:2)をコードしている。このアミノ酸配列は、配
列番号:2のなかの107番目から128番目の位置に生ずるIFFIILLTIDR
YLAVVHAVFAL(K/R)ARTVFGVなるドメインを有する。第3図
に示すように、MMLR-CCRは、一連の細胞内及び細胞外ループによって連
結された7つの膜貫通セグメントを含む。配列番号:3のヌクレオチド配列は、
344個のアミノ酸残基を有するMPHG-CCRアミノ酸配列(配列番号:4)を
コードする。
DNA配列決定のための方法は周知であり、例えばDNAポリメラーゼI,Se
quenase(商標)のクラノウフラグメント(US Biochemical
社,Cleveland OH)、Taqポリメラーゼ(Perkin elmer社,Foster City CA)、熱
安定性T7ポリメラーゼ(Amersham社,Chicago IL)、或いはGibco BRL(Gaither
sburg MD)Methods社から市販されているELONGASE増幅システムのよう
な組換えポリメラーゼとプルーフリーディングエキソヌクレアーゼとの組み合わ
せのような酵素を使用する。対象のDNA鋳型にアニールされたオリゴヌクレオ
チドプライマーからDNAを延長する方法は、一本鎖鋳型及び二本鎖鋳型の両方
に対して開発されてきている。連鎖終了反応の生成物は電気泳動を用いて分離さ
れ、それに組み込まれた標識された前駆体を介して検出される。最近の機械化さ
た反応調製、配列決定並びに解析における改善によって、1日当たりの決定でき
る配列数が増えた。好適にはこの処理は、Hamilton MicroLab2200(Hamilton社,R
eno NV)、Peltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Reserch社,Watertown MA)並び
にABI Catalyst800及び377及び373DNAシーケンサ(Perkin Elmer,Norwalk C
N)のような装置を用いて自動化される。
特定のcDNAライブラリの品質は、cDNAのパイロットスケール分析を実行するこ
とにより、さらにはクローン含有ベクター、λ或いはE.coli DNA、ミトコン
ドリア或いは反復DNA、並びに公的データベースに厳密に一致、或いは相同的
に一致するクローンのパーセンテージを調べることにより決定される。
受容体ポリヌクレオチド配列の延長
ポリヌクレオチド配列MMLR-CCRまたはMPHG-CCRは、配列番号:
1または配列番号:3の各ヌクレオチド配列を用いて、プロモータ及び調節エレ
メントのような上流配列を検出するための当業者には周知の様々な方法で延長す
ることができる。Gobinda等(1993;PCR Methods
Applic 2:318-22)は既知の部位に隣接する未知の配列を検索するために汎用プ
ライマーを用いる直接的な方法として「制限部位ポリメラーゼ連鎖反応法(PC
R)」を開示している。ここでは、まずゲノムDNAが、既知の領域に対して特
異的なプライマー及びリンカー配列に対するプライマーの存在下で増幅される。
増幅された配列は、その同じリンカープライマー及び最初のプライマーの内部に
含まれる別の特異的プライマーを用いてPCRの2巡目にかけられる。PCRの
各回の生成物は、適切なRNAポリメラーゼを用いて転写され、逆転写酵素を用
いて配列決定される。
逆PCR法は、既知領域に基づく分岐プライマーを用いて配列を増幅、または
延長するために用いることができる(Triglia等(1988)Nucleic Acids Res 16:
8186)。プライマーは、Oligo4.0(National Biosciences社,Plymouth
MN)或いは別の適切なプログラムを用いて設計され、長さが22〜30ヌクレ
オチドで、50%以上のGC含有率を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配
列にアニールする。この方法ではいくつかの制限酵素を用いて、遺伝子の既知領
域における適切なフラグメントを生成する。次いでこのフラグメントは分子内ラ
イゲーションにより環状にされ、PCR鋳型として使用される。
キャプチャPCR法(Lagerstrom M等(1991)PCR Methods Applic1:111-19)
は、ヒト及び酵母菌人工染色体(YAC)DNA内の既知の配列に隣接するDN
AフラグメントのPCR増幅をするための方法である。またキャプチャPCRで
は、多数の制限酵素の消化及びライゲーションによってPCR前にDNA分子の
未知の部分に、組換えられた二本鎖配列を配置する必要がある。
Parker JD等(1991;Nucleic Acids Res 19:3055-60)は、歩行PCR、すなわ
ち未知の配列の検索ができる標的遺伝子歩行のための方法を
教示している。PromoterFinder(登録商標)、Clontech社(Palo Alto CA)から入手
できる新しいキットでは、PCR、入れ子状(nested)プライマー並びにプロモ
ータファインダライブラリーを用いて、ゲノムDNA内を歩行させる。この過程
は、ライブラリーをスクリ−ニングする必要がなく、イントロン/エクソン接合
部を探し出すのに有用である。
別のPCR方法としては、Guebler等による1995年6月7日出願の米国特
許第08/487,112号「Improved Method for Obtaining Full Length cDN
A Sequences」に開示されたものがあり、この明細書を本明細書と一体に参照され
たい。この方法では、XL−PCR(登録商標)(Perkin elmer社,Foster City
CA)を用いて、ヌクレオチド配列を増幅、並びにまた延長する。
完全長cDNAをスクリーニングするための好適なライブラリーは、サイズ選択さ
れた、より大きなcDNAを含むライブラリーである。またランダムに初回刺激を与
えられた(primed)ライブラリーは、遺伝子の5’及び上流領域を含むより多く
の配列を含むという点で好適である。ランダムに初回刺激を与えられたライブラ
リーは、オリゴd(T)ライブラリーが完全長cDNAを生成しない場合、特に有用
ある。ゲノムライブラリーは、プロモータ結合領域の5’を延長するために有用
である。
サイズがどのくらいかを分析したり、或いは配列決定やPCR処理の産物のヌ
クレオチド配列を確認するための新しい方法はキャピラリー電気泳動法である。
迅速な配列決定のためのシステムは、Perkin elmer社、Beckman Instruments社
(Fullerton CA)並びに他の企業から入手できる。キャピラリー電気泳動法では
、電気泳動分離のための流動性ポリマー、レーザで活性化される4つの異なる蛍
光色素(各ヌクレオチドに対して1つ)を使用し、CCDカメラによる放射線の
波長の検出を
行う。出力/光強度は適切なソフトウエア(例えばPerkin elmer社製のGenotype
r(登録商標)及びSequence Navigator(登録商標))を用いて電気信号に変換
され、サンプルのロードからコンピュータ解析及び電子データ表示までの全過程
がコンピュータ制御される。キャピラリー電気泳動法は特定のサンプルの限定さ
れた量の中に存在するDNAの小片の配列決定に特に適している。この方法によ
り30分間でM13ファージDNAの350bpを再現可能な形で配列決定でき
たことが報告されている(Ruiz-Martinez MC等(1993)Anal Chem 65:2851-8)
。
発現系
本発明に従って、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR、そのポリペプチド
のフラグメント、融合タンパク質或いはその機能的等価物をコードするmmlr-ccr
またはmphg-ccrポリヌクレオチド配列を、適切な宿主細胞内でのMMLR-CC
RまたはMPHG-CCRの発現を誘導する組換えDNA分子を生成するために
用いることができる。遺伝子コードの固有の縮重のために、概ね同一か或いは機
能的に等価なアミノ酸配列をコードする他のDNA配列も、MMLR-CCRま
たはMPHG-CCRのクローン化や発現のために用いることができる。当業者
には理解できるように、非自然発生コドンを有するMMLR-CCRまたはMP
HG-CCRコード化ヌクレオチド配列を生成することは有益であり得る。特定
の原核宿主或いは真核宿主において好適なコドン(Murray E等(1989);Nucleic Ac
ids Res 17:)を、例えば、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR発現率を増大
させたり、或いは自然発生配列から生成された転写産物より長い半減期のような
望ましい特性を有する組換えRNA転写産物を生成したりするように選択するこ
とができる。
また本発明の範囲に含まれるものとして、中程度から最高度の厳密性
の条件の下で、第1A図〜第1D図または第6A図〜第6C図のヌクレオチド配列と
ハイブリッド形成可能なポリヌクレオチド配列がある。ハイブリダイゼーション
条件は、Berger及びKimmel(1987,Guide to Molecular Cloning Techniques,Me
thods in Enzymology,Vol 152,Academic Press,San Diego CA)により教示され
、ここで引用して組み込んでいるように、核酸結合複合体の融点(Tm)に基づ
いており、以下に説明するように、定義された「厳密性」を与える。
「最高度の厳密性」は典型的に約Tm5℃(プローブのTmより5℃下)で発
生し、「高度の厳密性」はTmの約5〜10℃下で発生し、「中程度の現密性」
はTmの約10〜20℃下で発生し、「低度の現密性」はTmの約20〜25℃
下で発生する。当業者には理解できるように、最高度に厳密なハイブリダイゼー
ションは、同一のポリヌクレオチド配列を同定、すなわち検出するために用いる
ことができるが、一方中程度(或いは低度)に厳密なハイブリダイゼーションは
類似の、すなわち近縁なポリヌクレオチド配列を同定、つまり検出するために用
いられる。本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション」は「核酸の鎖が
塩基対合を介して相補鎖と結合する過程」(Coombe J(1994)Dictionary of Bi
otechnology,Stockton Press社,New York)を含む概念である。従って定義によ
り、ハイブリダイゼーションは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術で実行さ
れるような増幅のプロセスを含むものである。このPCR技術についてはDieffe
nbach CW and GS Dveksler(1995,PCR Primer,a Laboratory Manual,Cold Sprin
g Harbor Press社,New york)の論文に記載されており、本明細書と一体に参照
されたい。
本明細書において「欠失」とは、1または2以上のヌクレオチド若しくはアミ
ノ酸残基が欠ける、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における変化として定
義される。
本明細書において「挿入」或いは「付加」とは、天然MMLR-CCRまたは
MPHG-CCRに比べて、結果的に1または2以上のヌクレオチド或いはアミ
ノ酸残基の加わるようなヌクレオチド配列或いはアミノ酸配列の変化を指す。
本明細書において「置換」とは、1または2以上のヌクレオチド或いはアミノ
酸を異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置換することによって生ずる変化を指
す。
本発明において用いられ得る変異MMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリ
ヌクレオチド配列は、異なるヌクレオチド残基の欠失、挿入並びに置換を含み、
結果的に同一の、または機能的に等価のMMLR-CCRまたはMPHG-CCR
ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとなる。そのタンパク質も、サイレ
ント変化を生ずるアミノ酸残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に機能的
に等価な受容体となる。慎重なアミノ酸置換は、受容体の生物学的活性が保持さ
れる限りにおいて、残基の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性並びにまた両親
媒性についての類似性に基づいてなされ得る。例えば負に荷電したアミノ酸には
アスパラギン酸及びグルタミン酸が含まれ、正に荷電したアミノ酸にはリジン及
びアルギニンが含まれ、同じ親水値を持つ帯電しない極性頭基を有するアミノ酸
には、ロイシン、イソロイシン、バリン、グリシン、アラニン、アスパラギン、
グルタミン、セリン、スレオニン、フェニルアラニン並びにチロシンが含まれる
。
本発明の範囲に含まれるものとして、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR
のアレルがある。ここで用いる「アレル」或いは「アレル配列」とは、MMLR
-CCRまたはMPHG-CCRの別形態である。アレルは突然変異、すなわち核
酸配列の変化に起因し、一般に改変mRNA或いはポリペプチドを生成し、その
mRNA或いはポリペプチドの構造或いは機能は変
更される場合もあれば、されない場合もある。遺伝子によっては、アレル形態が
ないもの、1つあるもの、或いは多数存在するものがある。アレルを生じる変異
は一般に、アミノ酸の欠失、付加並びに置換に起因する。このタイプの変化はそ
れぞれ単独で、或いは他の遺伝子の組み合わせで、与えられた配列内一回または
それ以上の回数生じ得る。
本発明のヌクレオチド配列は、限定はしないが遺伝子生成物のクローニング、
プロセッシング並びにまた発現を変化させる変更を含む、様々な目的のMMLR
-CCRまたはMPHG-CCRコード配列の変更のために遺伝子を組換えられ得
る。例えば、変異は、当業者には周知の技術、例えば特定部位突然変異誘発を用
いて導入され、新しい制限部位の挿入、グリコシル化パターンの変更、コドン選
好の変化等をもたらすことができる。
本発明の別の実施例では、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの天然、変
異或いは組換え配列が、異種の配列に結合され、融合タンパク質をコードする配
列となる。例えば、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR活性のインヒビター
を選び出すべくペプチドライブラリをスクリーニングするために、市販の抗体に
より認識される異種のペプチドを発現するキメラケモカイン受容体タンパク質を
コード化することが役立つことがある。融合タンパク質はMMLR-CCRまた
はMPHG-CCR配列と異種のタンパク質配列との間の位置に切断部位を包含
するように組換えることもでき、これによってMMLR-CCRまたはMPHG-
CCRを切断して、異種の部分から分けて精製することが可能となる。
本発明の別の実施例では、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRのコード化
配列は、当業者によく知られた化学的方法を用いて、(Caruthers等(1980)Nuc
Acids Res Symp Ser 7:215-223、Crea,Horn(1980)Nuc Acids Res 9:2331、Ma
tteucci,Caruthers(1980)Tetrahedron Lett
21:719、Chow,Kempe(1981)Nuc Acids Res 9:2807-2817参照)全体的に、或い
は部分的に合成することができる。別法では、MMLR-CCRまたはMPHG-
CCRアミノ酸配列を、全体的に或いは部分的に合成する化学的方法を用いてタ
ンパク質自体を生成することができる。例えばペプチドを固相技術で合成して、
樹脂から切り離し、さらに分離高速液体クロマトグラフィにより精製することが
できる(例えばCreighton(1983)Proteins Structure And Molecular Principl
es,WH Freeman and Co,New York参照)。合成されたペプチドの構成は、アミノ
酸解析或いは配列決定処理により確認することができる(例えばthe Edmandegra
dation procedure;Creighton,上述)。
直接のペプチド合成は、様々な固相技術(Roberge JY等(1995)Science 26
9:202-204)を用いて実行できるが、自動化した合成も、例えば、Applied Biosy
stems 431Aペプチド合成器を用いて、製造者により提供される使用説明書に従っ
て達成される。さらにMMLR-CCRまたはMPHG-CCRのアミノ酸配列、
或いはその任意の部分を、その直接の合成の際に変更したり、また他の細胞内メ
ディエータ或いはその任意の部分に由来する配列と化学的方法を用いて結合して
、変異体ポリペプチドを生成することができる。
形質転換体の同定
標識遺伝子発現の存在/不在は、対象の遺伝子も存在することを示唆するが、
その存在及び発現は確認されるべきである。例えばもしmmlr-ccrまたはmphg-ccr
が標識遺伝子配列内に挿入されるなら、mmlr-ccrまたはmphg-ccrを含む組換え細
胞が標識遺伝子の機能の存在により同定できる。別法では標識遺伝子は、単一プ
ロモータの制御下で受容体配列と直列に配置することができる。誘導または選択
に応じて
の標識遺伝子の発現は、通常さらに受容体の発現をも示す。
この他、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRのコード化配列を含み、さら
にMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを発現する宿主細胞が、当業者には周
知の様々な手順により同定できる。これらの手順は、限定はしないが、DNA-
DNA或いはDNA-RNAハイブリダイゼーション及び、核酸及びタンパク質
の検出並びにまた定量するための膜、溶液或いは破片ベース技術を含むタンパク
質バイオアッセイ或いはイムノアッセイを含む。
mmlr-ccrまたはmphg-ccrポリヌクレオチド配列の存在は、配列番号:1または
配列番号:3に開示されたプローブ、一部分、或いはフラグメントを用いる、D
NA-DNAまたはDNA-RNAハイブリダイゼーションや、増幅により検出す
ることができる。核酸増幅に基づくアッセイでは、配列番号:1または配列番号
:3に基づくオリゴヌクレオチド或いはオリゴマーを使用し、mmlr-ccrまたはmp
hg-ccrのDNA或いはRNAを含む形質転換体を検出する。本明細書において「
オリゴヌクレオチド」或いは「オリゴマー」とは、プローブ或いはアンプリマー
(amplimer)として用いることができる、少なくとも10ヌクレオチド、多い場
合には60ヌクレオチド、好適には15〜30ヌクレオチド、より好適には20
〜25ヌクレオチドの核酸配列を指す。好ましくは、オリゴヌクレオチドは、第
1A図〜第1D図に示すmmlr-ccrまたはmphg-ccrヌクレオチド配列の3’領域に由
来する。
タンパク質に特異的なポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいずれか
を用いて、ケモカイン受容体ポリペプチドの発現を検出し、測定するための種々
のプロトコルが当業者には周知である。このようなプロトコルの例としては、酵
素結合免疫検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)及び蛍光表
示式細胞分取器法(FACS)を含
む。MMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリペプチド上で2つの非干渉なエ
ピトープに対して反応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナル
用イムノアッセイ(two-site,monoclonal-based immunoassay)は好適ではある
が、競合的結合アッセイも用いられる。これらアッセイの並びに他のアッセイは
、Hampton R等(1990,Serologivcal Methods,a Laboratory Manual,APS Pre
ss,St Paul MN)及びMaddox DE等(1983,I Exp Med 158:1211)等に記載されてい
る。
さらに多くの標識及び結合技術は当業者には周知であり、種々の核酸及びアミ
ノ酸検査法において用いることができる。mmlr-ccrまたはmphg-ccrポリヌクレオ
チド配列を検出するための標識されたハイブリダイゼーション或いはPCRプロ
ーブを生成するための手段には、オリゴ標識化、ニックトランスレーション法、
末端標識化或いは標識されたヌクレオチドを用いるPCR増幅などがある。別法
では、mmlr-ccrまたはmphg-ccr配列、或いはその任意の部分が、mRNAプロー
ブの生成のためにベクターにクローン化される。そのようなベクターは当分野で
は周知で市販されており、T7,T3或いはSP6並びに標識されたヌクレオチ
ドのような適切なRNAポリメラーゼの付加により、in vitroでのRNAプロー
ブ合成のために用いることができる。
Pharmacia Biotech社(Piscataway NJ)、Promega社(Madison WI)並びにUS Bioc
hemical社(Cleveland OH)のようないくつかの企業がこれらの手順に対する商
用のキット及びプロトコルを提供する。適切なリポーター分子、すなわち標識に
は、放射性核種、酵素、蛍光性、化学ルミネセンス或いは色素性因子及び基質、
補助因子、インヒビター、磁気粒子或いはそれに類似のものが含まれる。そのよ
うな標識の使用を教示する特許には、米国特許第3,817,837号、第3,850,752号、
第
3,939,350号、第3,996,345号、第4,277,437号、第4,275,149号並びに第4,336,24
1号がある。また、組換え免疫グロブリンが米国特許第4,816,567号に示されてお
り、本明細書とともに参照されたい。
受容体の精製
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRヌクレオチド配列で形質転換された宿
主細胞は、細胞培地からコード化タンパク質を発現及び回収するために適切な条
件下で培養される。組換え細胞により生成されるタンパク質は、用いられる配列
並びにまたベクターに応じて、細胞内に分泌、つまり含有されるようにすること
ができる。mmlr-ccrまたはmphg-ccrを含む発現ベクターは、原核細胞か、真核細
胞の細胞膜を通してのMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを分泌を誘導する
シグナル配列を含むように設計される。他の組換え構成物では、mmlr-ccrまたは
mphg-ccrを、可溶性タンパク質の精製を容易にするポリペプチドドメインをコー
ドするヌクレオチド配列に結合することができる(Kroll DJ等(1993)DNA Cell
Biol 12:441-53、融合タンパク質を含むベクターに関する上記論議も参照され
たい)。
またMMLR-CCRまたはMPHG-CCRは、タンパク質精製を容易にする
ために加えられた1または2以上の付加的なポリペプチドドメインを備えた組換
えタンパク質として発現される。そのような精製を容易にするドメインには、限
定はしないが、固定化金属上での精製を可能にするヒスチジントリプトファンモ
ジュールのような金属キレートペプチド(Porath J(1992)Protain Expr Purif
3:263-281)、固定化免疫グロブリン上での精製を可能にするプロテインAドメ
イン、並びにFLAGS延長/アフィニティ精製システムにおいて用いられるド
メイン(Immunex社、Seattle WA)が含まれる。精製ドメイン及びMMLR-
CCRまたはMPHG-CCR間の第XA因子或いはエンテロキナーゼのような
切断可能なリンカー配列を含めるのは精製を容易にするのに役立つ。
受容体及び受容体を含む遺伝子組換え宿主細胞の使用
MMLR-CCRのアミノ酸配列(配列番号:2)は第1A図〜第1D図に示
されている。MCP-1 CCRケモカイン受容体、即ちGタンパク質結合に関与
することが知られている第3の膜貫通ドメインにおけるMCP-1RB(Charo前
述)に対するその相同性、及びマクロファージ、48時間混合性リンパ球反応cD
NAライブラリーにおけるその存在、及び通常マクロファージMMLR-CCRに
おける不存在に基づいて、MMLR-CCRが、白血球の機能の発揮に関与する
ケモカイン受容体であるように思われる。MPHG-CCRのアミノ酸配列(配
列番号:4)は第6A図〜第6C図に示されている。C-Cケモカイン受容体3
及びMCP-1RAへの相同性、及びマクロファージライブラリーにおけるその存
在に基づき、MPHG-CCRは、白血球の機能の発揮に関与するケモカイン受
容体であるように思われる。
従って、本発明は、MMLR-CCR及びMPHG-CCRアミノ酸配列、及び
その受容体を発現する遺伝子組換え宿主細胞を提供し、適切な細胞調整において
天然リガンド、即ちケモカインを評価し、選別し、且つ同定する。本発明のケモ
カイン受容体及びその受容体を発現する遺伝子組換え宿主細胞を、受容体/リガ
ンド結合を調整し、受容体活性化及びシグナル伝達イベントを調節する物質、化
合物、または合成薬物を同定するためにも用いることができる。例えば、このよ
うな遺伝子組換え宿主細胞を、MMLR-CCR活性を調節できるペプチドライ
ブラリーまたは有機分子を選別するために用いることができる。
本発明のある実施例では、MMLR-CCR、MPHG-CCR、またはそれ
らの変異体、及び/またはMMLR-CCR、MPHG-CCR、またはそれらの
変異体を発現する株細胞を、抗体、ペプチド、または単球/マクロファージ浸潤
及び透過性のモジュレータとして作用する、組み合わせ化学により作製された有
機または無機分子のような他の分子を選別し、免疫用途を調節する治療薬を同定
するために用いることができる。受容体の活性を中和できる抗受容体抗体を、例
えば炎症性疾患の場合において受容体活性化を抑制するために用いることができ
る。合成化合物、天然産物、及び他の潜在的に生物学的活性の物質の源を、当業
者には日常的と考えられる様々な方法でスクリーニングすることができる。例え
ば、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの細胞外ドメインをコードするヌク
レオチド配列を、株細胞において発現させ、その株細胞を、MMLR-CCRA
またはMPHG-CCR活性のモジュレータ、即ちアゴニストかアンタゴニスト
の何れかをスクリーニングするために用いることができる。この1実施例では、
MMLR-CCR変異体や、121番目の位置の残基がバリンの代わりにイソロ
イシンを含むものとなっている。
テスト分子がケモカイン受容体活性またはリガンド結合に干渉する能力は、単
球走化性の測定により決定することができる(Falk et al 1980 JImmunol Metho
ds 33:239)。ケモカイン受容体の活性を、例えばCa++流動(Grynkievicz et
al(1985)J Biol Chem 260:3440 and McColl et al(1993)J Immunol 150:4550-
4555)及び脱顆粒及びレスピラトリーバースト応答(Zachariae et al 1990 J.E
xp.Med.171:2177-82)及び接着分子発現及びサイトカイン産生の調節(Jiang et
al 1992 J Immunol 148:2432-8)のような他の反応を測定することによってもモ
ニタできる。
抗体
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリペプチドに対する抗体の生成のた
めに、当分野においてよく知られる手順が用いられる。このような抗体には、限
定はしないが、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、一本鎖
、Fabフラグメント並びにFab発現ライブラリにより生成されるフラグメン
トが含まれる。中和抗体、すなわちMMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリ
ペプチドの生物活性を抑制する抗体は、、特に診断及び治療に好適である。
抗体を生成するために、ヤギ、ウサギ、ラット、マウス等を含む種々の宿主は
、免疫学的特性を保持するMMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリペプチド
或いはその任意の部分、フラグメント或いはオリゴペプチドを注入することによ
り免疫することができる。宿主種に応じて、種々のアジュバントが免疫学的反応
を促進するために用いられる。そのようなアジュバントには、限定はしないが、
フロイントアジュバント、水酸化アルミニウムのような無機質ゲルアジュバント
、リゾレシチンのような表面活性物質アジュバント、プルロニックポリオルアジ
ュバント、ポリアニオンアジュバント、ペプチドアジュバント、油性乳剤アジュ
バント、キーホールリンペットヘモシニアンアジュバント並びにジニトロフェノ
ールアジュバントが含まれる。BCG(カルメット‐ゲラン杆菌)及びコリネバ
クテリウムパルヴムは潜在的に有用なヒトアジュバントである。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRに対するモノクローナル抗体は、培地
中の連続株細胞による抗体分子の産生を行うための任意の技術を用いて調製され
る。これらは、限定はしないが、Koehler及びMilstein(1975,Nature 256:495-49
7)に当初掲載されたハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術(Kosb
or等(1983)Immunol Today 4:72、Cote等(1983)Proc Natl Acad Sci 80:2026-2
030)及びEBV−ハイブリ
ドーマ技術(Cote等(1985)Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R L
iss lnc,pp77-96)を含む。さらに、適切な抗原特異性並びに生物活性を有する
分子を得るための「キメラ抗体」の生成、即ちヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺
伝子のスプライシングのために開発された技術が用いられる(Morrison等(1984)P
roc Natl Acad Sci 81:6851-6855)、Neuberger等(1984)Nature 312:604-608、
Takeda等(1985)Nature314:452-454)。別法では、一本鎖抗体の生成のために
記載された技術(米国特許第4,946,778号)が、特異的一本鎖抗体を生成するた
めに適用される。
また抗体は、リンパ球集団におけるin vivo生成を誘導することにより、或い
はOrlandi等(1989,Proc Natl Acad Sci 86:3833-3837)並びにWinter G及びMi
lstein C(1991,Nature 349:293-299)に開示されているような組換え免疫グロ
ブリンライブラリー或いは高度に特異的な結合試薬のパネルをスクリーニングす
ることによっても生成することができる。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRに対する特異結合部位を含む抗体フラ
グメントも生成することができる。例えばこのようなフラグメントには、限定は
しないが、抗体分子のペプシン消化により生成することができるF(ab’)2
フラグメント及びF(ab’)2フラグメントのジスルフィド架橋を減らすこと
により生成することができるFabフラグメントが含まれる。別法では、所望の
特異性を有するモノクローナルFabフラグメントを迅速に、しかも容易に同定
できるように、Fab発現ライブラリーが構築される(Huse WD等(1989)Scien
ce 256:1275-1281)。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCR特異的抗体は、MMLR-CCRまた
はMPHG-CCRポリペプチドの発現が関連する状態及び疾患の診断のため
に有用である。確立された特異性を有するポリクローナル抗体或いはモノクロー
ナル抗体のいずれかを用いる競合的結合アッセイ或いは免疫放射定量測定法のた
めの種々のプロトコルが当分野ではよく知られている。そのようなイムノアッセ
イでは、一般に、ケモカイン受容体とその特異的抗体(或いは類似の受容体結合
分子)との間の複合体の形成、並びに複合体形成の測定が行われる。特異的MM
LR-CCRまたはMPHG-CCRタンパク質上の2つの非干渉性エピトープに
対して反応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナル用イムノア
ッセイが好適ではあるが、競合結合アッセイも用いられる。これらの検査法はMa
ddox DE等(1983,J Exp Med 158:1211)に記載されている。
受容体特異的抗体を用いる診断アッセイ
抗MMLR-CCRまたはMPHG-CCR抗体は、例えば、感染症、炎症、腫
瘍形成、細胞の異常増殖、及び循環器病のような受容体活性化を伴う病気の診断
のために役立つ。ケモカイン受容体に対する診断アッセイは、ヒトの体液、細胞
、組織或いはそのような組織の切片または抽出物において、MMLR-CCRま
たはMPHG-CCRを検出するための抗体或いは標識を利用する方法を含む。
本発明のポリペプチド及び抗体は、修飾の有無に拘わらず用いることができる。
多くの場合、ポリペプチド及び抗体は、共有結合、或いは非共有結合かのいずれ
かでそれらをリポーター分子と結合することにより標識される。非常に多くのリ
ポーター分子が周知となっている。
それぞれのタンパク質に対して特異的なポリクローナル抗体或いはモノクロー
ナル抗体を用いて、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリペプチドを測定
するための種々のプロトコルが当分野では周知である。その例として、酵素結合
免疫測定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ
(RIA)並びに蛍光表示式細胞分取器法(FACS)がある。MMLR-CC
RまたはMPHG-CCRポリペプチド上の2つの非干渉性エピトープに対して
反応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナル用イムノアッセイ
が好適であるが、競合的結合アッセイも用いられる。これらのアッセイは、他に
もあるが、Maddox DE等(1983,I ExpMed 158:1211)に記載されている。
疾病の診断の基礎を提供するために、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR
発現についての通常値、すなわち標準値が確立されなければならない。これは複
合体形成のために適切な条件下で、ヒト或いは動物どちらでもよいが、正常の被
験者から得られる体液或いは細胞抽出物と、MMLR-CCRまたはMPHG-C
CRに対する抗体とを結合することにより得ることができ、これは当分野ではよ
く知られた技術である。標準的な複合体形成量は、一連のポジティブコントロー
ルの希釈系列とそれを比較することにより定量され、抗体の既知の量が既知の濃
度の精製MMLR-CCRまたはMPHG-CCRと結合される。その後正常サン
プルから得られた標準値を、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRが関係する
障害或いは疾患により潜在的に影響を受けた被験者からのサンプルから得られた
値と比較する。標準値と被験値との偏差によって疾患状態の存在を確認できる。
薬物スクリーニング
MMLR-CCRまたはMPHG-CCR、その免疫原性フラグメント或いはそ
のオリゴペプチドは、種々の任意の薬物スクリーニング技術において治療用化合
物のスクリーニングのために用いることができる。そのような試験において用い
られるフラグメントは、溶液、固体支持体への付着、細胞表面への付着、或いは
細胞内への定着において制限はない。MMLR-CCRまたはMPHG-CCRと
試験される薬剤との間の触媒活性ま
たは結合複合体形成の消滅が測定される。従って、本発明は、MMLR-CCR
、MPHG-CCRまたはそれらのフラグメントに対して特異的結合親和性を有
するものを複数の化合物のなかからスクリーニングする方法であって、複数の化
合物を準備する過程と;本発明のケモカイン受容体またはそのフラグメントと、
複数の化合物のそれぞれとを、適切な条件の下で結合できるだけの十分な時間を
掛けて結合させる過程と;ケモカイン受容体またはそのフラグメントと、複数の
化合物のそれぞれとの結合を検出し、もってケモカイン受容体に特異的に結合す
る化合物を同定する過程とを有することを特徴とする方法を提供する。このよう
なアッセイでは、複数の化合物は、当業者に周知の組み合わせ化学技術により生
成される。本発明の或る実施例では、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRオ
リゴペプチドが、細胞外結合ドメインから得られる。
薬物スクリーニングのための別の方法は、MMLR-CCRまたはMPHG-C
CRポリペプチドへの安定的な結合親和性を有する化合物の高スループットスク
リーニングを提供するものであり、1984年9月13日公告の欧州特許出願第84/035
64号(Guysen)に詳細に記載されており、本明細書に一体に引用されている。概
要としては、多数の別々の小ペプチド試験用化合物をプラスチックピン或いはい
くつかの他の表面のような、固体マトリックス上で合成する。ポリペプチド試験
化合物をMMLR-CCRまたはMPHG-CCRフラグメントと反応させ、洗浄
する。次いで結合した本発明のMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを当分野
で周知の方法により検出する。また精製MMLR-CCRまたはMPHG-CCR
を前述の薬物スクリーニング技術において使用するために、プレート上に直接コ
ーティングすることもできる。別法では、ペプチドを捕捉し、固形支持体上にペ
プチドを固定するために非中和抗体を用いる。
また本発明は、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRに結合し得る中和抗
体が、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRとの結合について特に試験化合物
と競合する競合的薬物スクリーニングアッセイの使用も意図している。このよう
にして、抗体を用いて1または2以上の抗原性決定基をMMLR-CCRまたは
MPHG-CCRと共通に有する任意のペプチドの存在を検出することができる
。
受容体ポリヌクレオチドの使用
mmlr-ccrまたはmphg-ccrポリヌクレオチド、或いはその一部が診断並びにまた
治療目的で用いられる。診断目的の場合、本発明のmmlr-ccrまたはmphg-ccrポリ
ヌクレオチド配列は、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR活性が関係する状
態や疾病、例えば、感染症、炎症、腫瘍形成、増殖性疾患、及び循環器病におけ
る遺伝子発現を検出し、かつ定量するために用いられる。治療目的の場合、MM
LR-CCRまたはMPHG-CCRアンチセンス分子を、細胞表面の受容体の存
在をダウンレギュレートすることが望ましい病状の患者に投与し、MMLR-C
CRまたはMPHG-CCRの活性を抑制する。別法として、治療目的で、MM
LR-CCRまたはMPHG-CCRのセンスポリヌクレオチド配列を、シグナル
伝達イベントの促進が望ましい病気の患者に投与する。
本発明の範囲には、オリゴヌクレオチド配列、アンチセンスRNA及びDNA
分子、PNA及びリボザイムが含まれており、これらはMMLR-CCRまたは
MPHG-CCRのmRNAを不安定化したり、mmlr-ccrまたはmphg-ccrの翻訳
を抑制するように機能する。
本発明の別の側面は、MMLR-CCRまたはまたは近縁な分子、例えばアレ
ルをコードする、ゲノム配列を含むポリヌクレオチド配列を検出できるハイブリ
ダイゼーションプローブ或いはPCRプローブを提供する。そして、そのプロー
ブの特異性、すなわち非常に高い保存領域またはド
メイン、保存的な領域またはドメイン、若しくは非保存領域またはドメインの何
れに由来するのかということや、ハイブリダイゼーション或いは増幅の(高度の
、中程度の或いは低度の)厳密性によって、そのプローブが天然mmlr-ccrのみを
同定するものであるか、或いは近縁な配列も同定するものであるかが決まってく
る。近縁な核酸配列の検出のためのプローブは、既知のケモカイン受容体の保存
的、または高度に保存的な領域、例えばGタンパク質結合ドメインから選択され
る。同一の核酸配列の検出のため、または最高度の厳密性が要求される、例えば
診断試験のような場合には、核酸プローブは、mmlr-ccrポリヌクレオチドの非保
存的ヌクレオチド領域または一義的な領域から選択される。本明細書において、
「非保存的ヌクレオチド領域」とは、ここに開示するmmlr-ccr及びmphg-ccrに独
特で、近縁なケモカイン受容体には発生しないヌクレオチド領域を意味する。
受容体ポリヌクレオチドの診断のための使用
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRコード化ポリヌクレオチド配列を、受
容体活性化が関係する疾病、例えば感染症、炎症、腫瘍形成、及び循環器病の診
断に用いる。例えば、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRをコードするポリ
ヌクレオチド配列を、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの異常発現を検出
するための生検用に採取された組織や体液の、ハイブリダイゼーションアッセイ
或いはPCRアッセイにおいて用いることができる。そのような定性的及び定量
的方法の形態は、サザンブロット法或いはノーザンブロット法、ドットブロット
法或いは他の膜用技術、PCR技術、浸漬法、ピン或いはチップ技術及びELI
SA技術を含む。これらの技術は全て、当分野ではよく知られており、実際に市
販されている多くの診断キットの基礎となっている。
このようなアッセイは、特定の治療行為の有効性を評価するために修正され、
動物実験、臨床試験、或いは個々の患者の治療をモニタする際に用いることがで
きる。疾患を診断するための基礎を与えるために、MMLR-CCRまたはMP
HG-CCR発現に対する正常な或いは標準的なプロフィールが確立されなけれ
ばならない。これは、正常な被験者、すなわち動物或いはヒトから得られる体液
或いは細胞抽出物を、ハイブリダイゼーション或いは増幅に適切な条件下で、M
MLR-CCRまたはMPHG-CCR、或いはその一部と結合することにより達
成される。標準的なハイブリダイゼーションの定量は、正常被験者に対して得ら
れる値と、既知の精製MMLR-CCRまたはMPHG-CCR量が用いられる同
一の実験におけるポジティブコントロール希釈系列で得られる値とを比較するこ
とにより定量することができる。正常なサンプルから得られた標準値は、MML
R-CCRまたはMPHG-CCR発現に関連する障害或いは疾患により潜在的に
影響を受けている被験者からのサンプルから得られる値と比較される。標準値と
被験者値との偏差から疾患状態の存在が確立される。疾患が確立された場合は、
現存する治療用薬剤が投与され、治療プロファイル或いは数値が生成される。最
終的にアッセイは、その数値が正常、すなわち標準パターンに進むか、或いは戻
るかを評価するために規則的に繰り返される。治療プロファイルは治療の有効性
を示すために用いられ、数日間或いは数ヶ月の期間に渡って継続される。
米国特許第4,683,195、4,800,195並びに4,965,188号に記載のあるようなPC
R法により、mmlr-ccrまたはmphg-ccr配列に基づくオリゴヌクレオチドのための
追加の使用法が提供される。このようなオリゴマーは一般には化学的に合成され
るが、酵素を用いて発生させたり、或いは組換えソースから生成することもでき
る。一般にオリゴマーは、通常特定の遺伝子或いは状態を同定するために最適な
条件下で用いられる2
つのヌクレオチド配列、即ちセンス方向(5’→3’)のヌクレオチド及びアン
チセンス方向(3’←5’)のヌクレオチドからなる。同一の2つのオリゴマー
、入れ子状のオリゴマーの組、或いはオリゴマーの縮重プールでさえ、近縁なD
NAまたはRNA配列の検出や定量のためのより低い厳密性の条件下であっても
用いることができる。
さらに特定の分子の発現を定量するための方法には、放射性標識(radiolabel
ing)(Melby PC等1993 J Immunol Methods 159:235-44)或いはビオチン標識(Du
plaa C等1993 Anal Biochem 229-36)ヌクレオチドの利用、制御核酸の同時増
幅(coamplification)の利用、並びに実験結果を補完して書かれた標準的なグ
ラフ曲線の利用が含まれる。多数のサンプルの定量は、ELISA形式のアッセ
イを実行することにより迅速に行うことができ、対象のオリゴマーが様々な希釈
溶液中に現れ、分光光度分析或いは比色分析反応により迅速に定量することがで
きる。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRポリヌクレオチドの治療のための使用
MMLR-CCRまたはMMLR-CCRアンチセンス分子は、受容体の存在を
ダウンレギュレートし、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR活性を抑制する
ことが望ましいような、受容体活性化が関係する様々な異常状態、例えば、感染
症、炎症、細胞の異常増殖、腫瘍形成、及び例えばアテローム性動脈硬化症のよ
うな循環器病の治療のための基礎となり得る。別形態では、MMLR-CCRま
たはMPHG-CCRをコードするポリヌクレオチド配列が、受容体をアップレ
ギュレートし、免疫応答を促進することが望ましいような、種々の異常状態の治
療における遺伝子治療の基礎となり得る。
レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペス或いはワクシニアウイル
スに由来する発現ベクター、或いは細菌性プラスミドに由来する発現ベクターは
、標的の器官、組織、または細胞群へのヌクレオチド配列の送達のために用いら
れる。当業者によく知られた方法は、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRを
発現する組換えベクターを構築するために用いることができる。例えばManiatis
等(上記)及びAusubel等(上記)に記載された技術を参照されたい。別形態と
して、組換えMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを、リポソームに入れて標
的細胞に送達させることができる。
完全長cDNA配列、並びにまたその調節エレメントを含むポリヌクレオチドによ
り、研究者は遺伝子機能のセンス調節(Youssoufian H及びHF Lodish 1993 Mol
Cell Biol 13:98-104)、或いはアンチセンス調節(Eguchi等(1991)Annu Rev
Biochem 60:631-652)の調査用のツールとしてMMLR-CCRまたはMPHG-
CCRを用いることができる。ゲノムDNAから得られたcDNAまたは調節配列か
らデザインされたオリゴヌクレオチドを、発現を抑制するためにin vitroまたは
in vivoで用いることができる。このような技術は、現在当分野ではよく知られ
ており、センス或いはアンチセンスオリゴヌクレオチド、或いはより大きなフラ
グメントを、コーディング領域或いは制御領域に沿った様々な位置から設計する
ことができる。
更に、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR活性を抑制することが望ましい
ような状態において、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR断片を高レベルで
発現する発現ベクターを細胞または組織にトランスフェクトすることにより、M
MLR-CCRまたはMPHG-CCR発現を調節することができる。このような
作製物は、翻訳不可能なセンス或いはアンチセンス配列とともに細胞から溢れ出
し得る。DNAへの組み込みがない場合ですら、このようなベクターは、全ての
複製物が内在性ヌクレアーゼにより分解
されるばで、RNA分子を転写し続ける。このような過渡的発現は、非複製ベク
ター(Mettler I,personal communication)でも1ヶ月以上、適当な複製エレメ
ントがベクター系の一部である場合には更に長い期間継続し得る。
mmlr-ccrまたはmphg-ccr遺伝子のの制御領域、例えばプロモータ、エンハンサ
或いはイントロンに対するアンチセンス分子、DNA、RNAまたはPNAを設
計することにより遺伝子発現を修飾することができる。転写開始部位、例えばリ
ーダ配列の+10〜−10領域の間に由来するオリゴヌクレオチドが好適である
。またアンチセンス分子は、転写産物がリボソームへの結合するのを防止するこ
とにより、mRNAの翻訳を阻止するように設計される。同様に、抑制は、「三
重らせん」塩基対合としても知られる、Hogeboom塩基対合方法論を用いて達成す
ることができる。三重らせん対合は、二重らせんがポリメラーゼ、転写因子、或
いは調節分子を結合するために十分に開放する機能を抑制する。三重らせんDN
Aを用いた最近の治療法は、Gee JEら(Huber BE and BI Carr(1994)Molecular
and Immunologic Approaches,Futura Publishing Co,Mt Kisco NY)により
再検討されている。
リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素性RNA分子で
ある。リボザイム作用の機構は、相補的標的RNAへのリボザイム分子の配列特
異的ハイブリダイゼーションが行われ、その後エンドヌクレアーゼによる切断(
endonucleolytic cleavage)がなされる。発明の範囲内には、mmlr-ccrまたはmp
hg-ccrのエンドヌクレアーゼによる切断を、特異的に及び効果的に引き起こす工
学的に処理されたハンマーヘッド状モチーフ(hammerhead motif)リボザイム分
子も含まれている。
任意の潜在的なRNA標的内の特異的なリボザイム切断部位の最初の
同定は、配列GUA、GUU並びにGUCが後続するリボザイム切断部位に対す
る標的分子を走査することにより行われる。一度同定されると、切断部位を含む
標的遺伝予の領域に対応する15〜20個のリボヌクレオチドの間の短いRNA
配列は、そのオリゴヌクレオチドの機能を停止させる2次構造の特徴について評
価される。また候補の標的の適切性の評価は、リボヌクレアーゼ保護アッセイを
用いて相補的なオリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成に対する接触性を試験
することにより行われる。
本発明のアンチセンスRNA及びDNA分子及びリボザイムは、RNA分子を
合成するのための当分野で周知の方法により調製することができる。これらの技
術には、固相ホスホラミダイト(phosphoramidite)化学合成のような化学的合
成オリゴヌクレオチドの技術が含まれる。別法では、RNA分子を、MMLR-
CCRまたはMPHG-CCRをコードするDNA配列のin vivo及びin vitro転
写により生成することができる。このようなDNA配列は、T7或いはSP6の
ような適切なRNAポリメラーゼプロモータを有する多種のベクターに組み込ま
れる。別法では、構造的に或いは誘導的にアンチセンスRNAを合成するアンチ
センスcDNA構成物が、株細胞、細胞或いは組織内に導入される。
DNA分子は細胞内安定性を高め及び半減期を長くするために修飾することが
できる。実行可能な修飾には、限定はしないが、その分子の5’並びにまた3’
末端のフランキング配列の付加、或いは分子のバックボーン内にホスホジエステ
ラーゼ連鎖ではなくホスホロチオネート(phosphorothioate)或いは2’−O−
メチルを使用することを含む。
細胞或いは組織内にベクターを導入するための方法には、以下に議論される方
法が含まれる。これらの形質転換またはトランスフェクション方法のいくつかは
、ex vivo治療法に対しても適切なものである。
更に、ここに開示するmmlr-ccrまたはmphg-ccrのヌクレオチド配列は、新技術
、即ち、限定はしないが、それがトリプレット遺伝暗号及び特異的塩基対合相互
作用のような特性を含む、現在周知のヌクレオチド配列の特性に依存する技術で
あれば、まだ開発されていない分子生物学的技術においても用いることができる
。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRに近縁なポリヌクレオチド配列の検出及
びマッピング
mmlr-ccrまたはmphg-ccr核酸配列は、天然ゲノム配列のマッピングのためのハ
イブリダイゼーションプローブを生成するために用いることができる。この配列
は、よく知られる技術を用いて、特定の染色体或いはその染色体の特定領域に対
してマッピングすることができる。このような技術には、拡散させた染色体(ch
romosomal spreads)に対するin situハイブリダイゼーション(Verma等(1988
)Human Chromosomes:A Manual of Basic Technique,Pergamon Press,New York
)、フローソート(flow-sorted)染色体調製法、或いは酵母菌人工染色体(Y
ACs)、細菌性人工染色体(BACs)、細菌性P1構造体或いはPrice CM(
1993;Blood Rev 7:127-34)及びTrask BJ(1991;Trends Ganet 7:149-54)に概
要が示されている単染色体cDNAライブラリのような人工染色体構造が含まれる。
染色体調製物のin situハイブリダイゼーション及び確定された染色体マーカ
ーを用いる連鎖解析のような物理的地図作成技術は、遺伝子地図を延長する際に
大変重要である。ヒトゲノムのSTSに基づく地図の最近の例は、Whitehead-MI
T Center for genomic Reserch(Hudson TJら(1995)Science 270:1945-1954)か
ら最近出版されている。多くの場合、特定のヒト染色体の数或いは腕が知られて
いなくても、マウスのよ
うな別の哺乳動物種の染色体上の遺伝子の配置から、関連する標識を明らかにす
ることができる。新しい配列は、染色体の腕、或いはその一部への物理的マッピ
ングにより割当てることができる。これは位置クローニング或いは他の遺伝子発
見技術を用いて疾患遺伝子を調査する研究者に貴重な情報を提供する。ひとたび
毛細血管拡張性運動失調(AT)のような疾患或いは症候群が、特定のゲノム領
域、例えばAT〜11q22-23への遺伝子連鎖により粗く局所化されれば、その領域
にマッピングされる任意の配列は、さらなる研究のための関連する遺伝子、或い
は調節遺伝子を表すことができる(Gatti等(1988)Nature 336:577-580)。本
発明のヌクレオチド配列は、正常者、保菌者或いは感染した個体間の転座、逆位
等による染色体位置の違いを検出するために用いることもできる。
医薬品組成物
本発明は、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRのヌクレオチド、タンパク
質、抗体、アンタゴニスト、インヒビターを、単独で、或いは安定化化合物のよ
うな少なくとも1つの他の薬剤とともに含んでいる医薬品組成物に関するもので
ある。この医薬品組成物は、任意の無菌の生体適合性担体に含めて投与されるが
、このような担体には、限定はしないが、生理食塩水、緩衝食塩水、ブドウ糖或
いは水が含まれる。これらの分子は、患者に対して、単体で、或いは他の薬品や
ホルモンと結合して、医薬品添加物或いは製薬学的に許容される担体と混合され
る他の薬品組成物に入れて投与され得る。本発明の一実施例では、製薬学的に許
容される担体とは、製薬学的に不活性なものである。医薬品組成物の投与
医薬品組成物は経口投与、或いは非経口投与される。非経口投与の方法には、
局所的投与、動脈内(腫瘍への直接の)投与、筋肉内投与、皮下投与、髄内投与
、くも膜下内投与、脳室内投与、静脈内投与、腹腔内投与或いは鼻腔内投与を含
む。活性成分に加えて、これらの薬品組成物は、薬学的に用いられ得る調合物内
への活性化合物の処理を容易にする賦形剤及び補助剤を含む適切な製薬学的に許
容される担体を含み得る。調合或いは投与に関する技術の詳細は、“Remington'
s Pharmaceutical Sciences(Mack Publishing Co,Easton PA)”の最新版にお
いて見出すことができる。
経口投与用の薬品組成物は、当分野でよく知られる製薬学的に許容される担体
を用いて適切な剤形に製剤される。このような担体により、薬品組成物は、治療
を受ける患者による摂取のための、錠剤、丸剤、カプセル剤、液体剤、ゲル剤、
シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤或いは類似の剤形として処方される。
経口投与するための製薬調製は、活性化合物と固形の賦形剤とを組み合わせる
ことによって得ることができるが、所望に応じて、必要なら適切な補助剤を添加
した後、得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を処理して、錠剤或いは糖衣剤
核を得ることができる。適切な賦形剤は、ラクトース、サクロース、マンニトー
ル或いはソルビトールを含む砂糖のような糖質或いはタンパク質充填剤、とうも
ろこし、小麦、米、じゃがいも等からのでんぷん、メチルセルロース、ヒドロキ
シプロピルメチルセルロース或いはカルボキシルメチルセルロースナトリウムの
ようなセルロース、アラビアゴム或いはトラガカントのようなゴム、並びにゼラ
チン或いはコラーゲンのようなタンパク質である。必要ならば、クロスリンクし
たポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸ナトリウムのようなアルギン酸或い
はアルギン酸ナトリウムのようなその塩のような、崩
壊剤或いは可溶化剤が加えられる。
糖衣剤核は、濃縮砂糖溶液のような適切な錠皮を与えられるが、溶液はアラビ
アゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル剤、ポリエチレングリ
コール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び適切な有機溶剤或いは溶剤混
合物が含み得る。錠剤の識別のため、すなわち活性化合物の量、すなわち投与量
を特徴付けるために染料或いは色素が錠剤或いは糖衣錠皮に加えられてもよい。
経口投与可能な製剤は、ゼラチンからなるプッシュフィットカプセル及びゼラ
チンからなる柔らかい、密封されたカプセル、並びにグリセロール或いはソルビ
トールのような錠皮を含む。プッシュフィットカプセルは、ラクトース或いはで
んぷんのような充填剤或いは結合剤、タルク或いはステアリン酸マグネシウムの
ような潤滑剤、並びに付加的には安定剤と混合された活性処方組成物を含み得る
。柔らかいカプセルでは、活性化合物は、安定剤があるなしにかかわらず、脂肪
油、液体パラフィン、液体ポリエチレングリコールのような適切な液体に溶解或
いは懸濁される。
非経口投与用の剤形は、水溶性の活性化合物の水溶液を含む。注射用として、
本発明の薬品組成物を水溶液、好適にはハンクの溶液、リンガー溶液或いは生理
緩衝食塩水のような生理学的に適合性の緩衝液に入れて製剤することができる。
水性の注入懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール
或いはデキストランのような懸濁剤の粘性を増加する物質が含み得る。更に、活
性成分の懸濁液は、適切な油性注入懸濁剤として調製される。適切な親油性の溶
媒或いは媒介物は、胡麻油のような脂肪油や、オレイン酸エチル、トリグリセリ
ド或いはリポソームのような合成脂肪酸エステルを含む。また懸濁剤は、所望に
応じて、それにより溶解度を増加し、非常に濃縮された溶液の調製が
できるようになる適切な安定剤或いは薬剤を含んでもよい。
局所的投与または経鼻投与用には、浸透される特定の障壁に対して適切な浸透
剤を配合する。このような浸透剤は、従来より周知である。製造と保管
本発明の薬品組成物は周知の方法、例えば従来の混合処理、溶解処理、顆粒化
処理、糖衣形成処理、研和処理、乳化処理、カプセル化処理、封入処理或いは凍
結乾燥処理により製造される。
この医薬品組成物は塩類として提供されることもあり、限定はしないが、塩酸
、硫酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、コハク酸等を含む、多くの酸とともに
形成することができる。塩は、対応する遊離塩基形態である水性或いはプロトニ
ック溶剤において、より可溶性が高くなる傾向がある。他の場合には、好適な製
剤は、1mM〜50mMのヒスチジン、0.1%〜2%のショ糖、使用前に緩衝剤と結
合させたpH範囲4.5〜5.5にある2%〜7%のマンニトールにおける凍結乾燥粉末
である。
製薬学的に許容される担体内に製剤された本発明の化合物を含む組成物は、調
製された後、適切な容器内に入れられて、さらに提示した疾病状態の治療のため
にラベル付けされる。MMLR-CCRまたはMPHG-CCRの投与の場合、こ
のようなラベルには、投与の量、頻度、方法が表示される。治療上効果的な投与量
本発明において使用するために適切な医薬品組成物は、活性成分を所望の目的
を達成するに効果的な量だけ含む組成物である。効果的な投与量の決定は、当業
者の能力の範囲内で行うことができる。
任意の化合物の場合、治療的に有効な投与量は、初めに、新生物細胞、
或いは通常マウス、ウサギ、イヌ、ブタのような動物モデルの何れかの細胞培地
のアッセイから推定される。次いで、このような情報を用いて、ヒトにおいて効
果的な投与量や投与経路を決定することができる。
治療的に有効な投与量とは、症状や疾病を寛解するタンパク質、その抗体、ア
ンタゴニスト、またはインヒビターの量である。そのような化合物の毒性及び治
療有効性は、例えばLD50(個体群の50%の致死投与量)及びED50(個体群の
50%において治療的に効果のある投与量)を決定するための、細胞培地或いは実
験動物における標準的な製薬学的手順により決定することができる。毒性と治療
有効性との間の投与量比は治療指数であり、比LD50/ED50として表すことが
できる。大きな治療指数を示す医薬品組成物が好ましい。これらの細胞培地のア
ッセイ及び付加的な動物研究から得られるデータは、ヒトへの使用に対する投与
量の範囲を決める際に用いることができる。そのような化合物の投与量は、毒性
がほとんど或いは全くなく、ED50を達成する循環濃度の範囲内にあることが望
ましい。投与量は、用いられる剤形、患者の感受性並びに投与経路に応じてこの
範囲内で変化する。
正確な投与量は治療されるべき患者を考慮して個々の医師により選択される。
投与量及び投薬量は、十分なレベルの活性部分を与え、かつ所定の効果を維持す
るために調整される。考慮すべき付加的な要因は、疾患状態の重症度、または患
者の年齢、体重並びに性別、食事、投与の時間及び頻度、併用する薬剤、反応感
受性、並びに治療への耐性/反応を含む。長期的に作用する薬品組成物は3〜4
日毎に、1週間毎に、或いは半減期及び特定の処方のクリアランス速度に応じて
2週間に1度、投与してもよい。
通常の投与量は0.1〜100,000μgの範囲にあって、全投与量は最大約1gであ
り、投与経路に応じて変化する。特定の投与量或いは供給の方
法に関するガイダンスは、文献において見出すことができる。米国特許第4,657,
760号、第5,206,344号或いは第5,225,212号を参照されたい。当業者は、ヌクレ
オチドに対しては、タンパク質やそのインヒビター用の剤形とは異なる剤形を採
用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの送達は、細胞
、病状、位置等によって決まってくる。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRのアンタゴニストまたはアゴニストを
、それぞれ、ケモカイン受容体活性を抑制か、促進することが望ましい病気の患
者に、適切な剤形で送達することが企図されている。
以下に本発明の実施例を示す。但し、以下の実施例は単なる例示であって、本
発明をこの実施例に限定しようとするものではない。
産業上の応用
1 MMLR-CCRライブラリーの構築及びcDNAクローンの単離
例として、MMLR2DT01 cDNAライブラリーの構築について説明する。MP
HGNOT03ライブラリーは類似した方法を用いて作製した。
このライブラリーのために使用した通常の末梢血液マクロファージは、2人の
24歳の白人男性から得た。このライブラリーは、フィコール/ハイパク精製軟
膜(Ficoll/Hypaque purified buffy coats)から得られた同種間で刺激された
ヒトマクロファージ集団の混合物を表す。2つの異なるドナー(HLAアレル型
ではない)からの細胞を、1×106/mlの密度でインキュベートし、DME
含有10%ヒト血清のなかで48時間培養した。
インキュベーションの後、マクロファージは大半がペトリ皿のプラスチックの
表面に付着し、大抵の他の細胞型B及びTリンパ球は溶液の中に残っていた。D
MEをウェルからデカントし、そのウェルをリン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄
した。PBS/1mM EDTAの中でペトリ皿を静か
に剥がすことにより、マクロファージはプラスチックの表面から放出された。即
座にマクロファージをグラニジウムイソチオシアネート含有緩衝液の中に溶解し
た。
この可溶化液を、pH8.0のフェノールとクロロホルムの混合物で2度抽出
し、L8-70M Ultracentrifuge(Beckman Instruments)においてBeckman SW28
rotorを用いて塩化セシウムクッションと共に遠心分離した。RNAを0.3M
核酸ナトリウム及び2.5容量のエタノールを用いて沈殿させ、水に再懸濁して
、37℃で15分間かけてDNase処理をした。全RNAをQiagen 0ligotex kit(Q
IAGEN Inc,Chatsworth CA)を用いて単離した。T及びBリンパ球のコンタミもあ
る程度存在することに注意しなければならない。
このポリA+RNAをSuperScript Plasmid System for cDNA Synthesis and P
lasmid Cloning(catalogue#18248-013;Gibco BRL,Gaithersburg MD)において、
推奨プロトコルに従って使用した。cDNAをSepharose CL4Bカラム(catalog#2
75105,Pharmacia)上で分画化し、これらの400bpを越えるcDNAをpSport I
にリゲートした。このプラスミドを化学的にコンピテントなDH5宿主細胞(Gib
co BRL)にトランスフォームした。
プラスミドDNAは細胞から放出され、Miniprep Kit(Catalogue#77468;Adva
nced GeneticT 0echnologies Corporation,Gaithersburg MD)を用いて精製した
。このキットは960回の精製用の試薬を備え、96穴ブロックから成る。以下
の変更点を除いて、推奨プロトコルを用いた。(1)96個のウェルには、25
mg/Lのカルベニシン及び0.4%のグリスロールを有する無菌のTerrific B
toth(Catalogue#22711,Gibco/BRL,Gaithersburg MD)の1mlのみをそれぞれ充
填した。(2)その穴に接種がなされ、次いで60μlの溶解緩衝液に溶解した
後黴菌
を24時間培養した。(3)Beckman GS-6Rを用いて@2900rpmで5分
間の遠心分離を行った後、ブロックの内容物を一次フィルタプレートに加えた。
(4)ポリスバッファにイソプロパノールを添加するオプションの工程は定例的
には実施しなかった。プロトコルの最終ステップの終了後、サンプルを貯蔵のた
めBeckman96穴ブロックに移送した。
プラスミドDNAを精製するための別の方法では、MAGIC MINIPREPSTMDNA Pur
ification System(Catalogue#A7100,Promega,Madison WI)またはQIAwellTM-8 P
lasmid,QIAwell PLUS DNA、QIAwell ULTRA DNA Purification Systems及び(QIAG
EN Chatsworth CA)を使用する。
cDNAの配列決定は、4つのPeltier Thermal Cyclers(PTC200from MJ Research
,Watertown MA)及びApplied Biosystems 377または373 DNA Sequencing Systems
(Perkin Elmer)を組み合わせてHamilton Micro Lab 2200(Hamilton,Reno NV)を
用いるSanger F及びAR Coulson(1975;J Mol Biol 94:441f)の方法より行い、読
み枠を決定した。
2 cDNAクローン及びその推定タンパク質の相同性検索
各cDNAを、BLAST検索(Basic Local Alignment Search Tool(Altschul
SF(1993)J Mol Evol36:290-300:Altschul,SF等(1990)J Mol Biol215:403-10))
を用いて、GenBankの配列と比較した。この方法で、ヒトMCP-1RB受容体(
NCBI GI472558)Charo(前出)と不完全に一致するインサイト社クロー
ンNo.478861、及びC-Cケモカイン受容体3及びMCP-IRA(Charo前出)と
不完全に一致するインサイト社クローンNo.442279を同定した。
BLASTを用いて局部的な配列アライメントを検索した。BLASTは
ヌクレオチド及びアミノ酸配列の両方のアライメントを生成して配列類似性を求
める。そのアライメントの局所性のために、BLASTは厳密な一致を求める際
に、すなわちホモログを求める際に特に有効である。BLASTは間隙を含まな
い一致を求めるのに役立つ。BLASTアルゴリズム出力の基本的な単位は、Hi
gh-scoring Segment Pair(HSP)である。
HSPは2つの配列フラグメントからなり、両フラグメントは任意ではあるが
、そのアライメントが局所的に最大となっている等しい長さものであり、そのア
ライメントスコアはユーザにより設定された閾値すなわちカットオフスコアを満
足、即ち、カットオフスコアを超えている。BLASTアプローチは問い合わせ
配列とデータベース配列との間のHSPを見つけ出すものであり、見出された任
意の一致の統計的有意性を評価し、そのユーザが設定した有意性の閾値を満足す
る一致のみを報告するものである。パラメータEはデータベース配列一致を知ら
せるための統計的に有意な閾値を確定するパラメータである。Eは全データベー
ス検索の情況においてHSP(或いはHSPの組)の発生の機会の期待される頻
度の上側の境界として解釈される。その一致がEを満足する任意のデータベース
配列がプログラム出力において報告される。
3 cDNAクローンの読み枠の決定
MMLR2DT01ライブラリーから得られた個々のcDNAクローンの読み枠を、
ポリヌクレオチド配列の開始コドン(ATG、GTG等)及び停止コドン(TG
A、TAA、TAG)を解析することにより得た。典型的には、1つのフレーム
はcDNA配列のすべての主要な部分を通じて継続し、他の2つの未決定のフレーム
は多数の停止コドンを含む傾向がある。
読み枠を決定するためのアルゴリズムとして、各推定上のコドントリプ
レットの個々のヌクレオチド塩基の発生を解析するアルゴリズムが開発されてき
た(例えばFickett,J.W.(1982)Nucleic Acids Research 10:5303)。コーディ
ングDNAでは、あるトリプレットの周期現象内に含まれるあるヌクレオチドが
優勢、例えば第3のコドン位置においてピリミジンが有意に優勢である傾向があ
る。このようなアルゴリズムは幅広く市販のソフトウェアに組み込まれており、
任意のDNAストレッチのコーディング可能性(及びフレーム)を決定するのに
用いられる。このアルゴリズムから得られた情報を開始/停止コドン情報と組み
合わせて、ライブラリー内の個々のクローンの適当な読み枠を高い確実性をもっ
て決定し、適当な発現媒介物との正しい読み枠のアライメントが得られる。
4 調節エレメント回復までのmmlr-ccrまたはmphg-ccrの延長
完全長mmlr-ccrまたはmphg-ccrの核酸配列を、ゲノムライブラリから完全長配
列を得るためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計するために用いる。一方の
プライマーはアンチセンス方向(XLR)の延長を開始するために合成され、他
方のプライマーはセンス方向(XLF)に配列を延長するために合成される。こ
れらのプライマーにより、周知のmmlr-ccrまたはmphg-ccr配列を「外側に」延長
し、対象の制御領域の新しい未知のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを生成
できるようになった。初期プライマーは、Oligo4.0(National Biosciences社、
Plymouth MN)、或いは他の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌク
レオチドで50%以上のGC含有率を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配
列にアニールするように設計することができる。結果的にヘアピン構造及びプラ
イマー−プライマー二量体化を生じる任意のヌクレオチドのストレッチの延長は
避けられる。
5’上流配列を延長し、増幅するためにヒトゲノムライブラリを用いる。必要
なら、既知領域をさらに延長するためにプライマーの第2の組をデザインする。
XL-PCRキット(Perkin Elmer社)のための指示に従って、酵素と反応混合
物とを完全に混合することにより、高い忠実度の増幅が得られる。40pmolの各プ
ライマと、推奨された濃度のキットの他の全ての成分とから増幅を開始する場合
、PCRはPeltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Reserch社、Watertown MA)を
用いて、以下のパラメータで実行される。
ステップ1 94℃で1分間(初期変性)
ステップ2 65℃で1分間
ステップ3 68℃で6分間
ステップ4 94℃で15秒間
ステップ5 65℃で1分間
ステップ6 68℃で7分間
ステップ7 ステップ4〜6をさらに15サイクル反復
ステップ8 94℃で15秒間
ステップ9 65℃で1分間
ステップ10 68℃で7分15秒間
ステップ11 ステップ8〜10を12サイクル反復
ステップ12 72℃で8分間
ステップ13 4℃(その温度を保持)
反応混合物の5〜10μlのアリコットを、低濃度(約0.6〜0.8%)ア
ガロースミニゲルにおける電気泳動で解析して、反応物が配列を延長することに
成功したか否かを決定する。最も大きな生成物或いはバンドを選択して、ゲルか
ら切り出した。さらなる精製には、QIAQuick(登録商標)(QIAGEN社)の
ような市販のゲル抽出法を用いる。DNA
回収の後、クレノウ酵素を用いて一本鎖ヌクレオチドの延び出しを切り取り、再
結合及びクローニングを容易にする平滑末端を作った。
エタノール沈殿の後、生成物を13μlのリゲーション緩衝液内に再溶解し、
1μlのT4−DNAリガーゼ(15単位)及び1μlのT4ポリヌクレオチド
キナーゼを加えて、その混合物を、室温で2〜3時間、或いは16℃で一昼夜イ
ンキュベートする。コンピテントなE.coli細胞(40μlの適切な溶媒内
にある)を、3μlのリゲーション混合物を用いて形質転換し、80μlのSO
C培地(Sembrook J等、上記)で培養する。37℃で1時間のインキュベーシ
ョンの後、全ての形質転換混合物を、2xCarbを含むLuria Bertani(LB
)寒天上にのせる。後日、いくつかのコロニーを各プレートから無作為に選択し
、適切な市販の無菌の96穴マイクロタイタープレートの個々のウェル内に入れ
られた150μlの液状LB/2xCarb培地で培養する。さらに後日、5μ
lの各オーバーナイト培養物を非無菌96穴プレート内に移し、水で1:10に
希釈した後、各5μlのサンプルをPCRアレイ内に移す。
PCR増幅の場合、rTthDNAポリメラーゼの4単位を含む18μlの濃
縮PCR反応混合物(3.3x)、ベクタープライマー、並びに延長反応に用い
られる遺伝子特異的プライマーの一方或いは両方を各ウェルに加える。増幅は以
下の条件に従って行う。
ステップ1 94℃で60秒間
ステップ2 94℃で20秒間
ステップ3 55℃で30秒間
ステップ4 72℃で90秒間
ステップ5 ステップ2〜4をさらに29サイクル反復
ステップ6 72℃で180秒間
ステップ7 4℃(そのまま保持)
PCR反応物のアリコットを、分子量マーカーと共にアガロースゲル上で移動
させる。PCR生成物のサイズを元の部分的なcDNAと比較して、適切なクローン
を選択し、プラスミドに結合して、配列決定を行う。
5 ハイブリダイゼーションプローブのラベリング
配列番号:1及び配列番号:3の核酸配列に由来するハイブリダイゼーション
プローブは、cDNA、mRNA並びにゲノムDNAをスクリーニングするために用
いられる。約20の塩基対からなるオリゴヌクレオチドのラベリングについて特
に記すが、大きなcDNAフラグメントの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴヌ
クレオチドを、50pmolの各オリゴマーと、250mCiの[γ‐32P]アデ
ノシン三リン酸(Amersham社,Chicago IL)及びT4ポリヌクレオチドキナーゼ
(DuPont NEN(商標)、Boston MA)とを組み合わせて用いてラベルする。標識
付けられたオリゴヌクレオチドを、SephadexG-25超精細樹脂カラム(Pharmacia
社)を用いて精製する。それぞれ毎分107カウントを含む各部分を、以下のエ
ンドヌクレアーゼ(AseI,BglII,EcoRI,PstI,Xba1或いはPvuII;DuPont NEN(商
標))の1つを用いて消化されるヒトゲノムDNAの典型的な膜ハイブリダイゼ
ーション解析において用いる。
各消化物からのDNAを、0.7%アガロースゲル上で分画化して、ナイロン
膜(Nytran Plus,Schleicher&Schuell,Durham NH)に移す。ハイブリダイゼーシ
ョンは40℃で16時間かけて行う。非特異的シグナルを取り除くために、ブロ
ットは、0.1xクエン酸ナトリウム食塩水及び0.5%ドデシル硫酸ナトリウ
ムまで段階的に厳密性が増す条件
下で、室温にて順次洗浄される。XOMAT AR(登録商標)フィルム(Kodak,Ro
chester NY)を、数時間かけてPhosphoimager cassette(Molecular Dynamics,Sun
nyvale CA)においてブロツトに露光された後、ハイブリダイゼーションパターン
が視覚的に比較される。
6 アンチセンス分子
MMLR-CCRまたはMPHG-CCR配列或いはその任意の一部は、内生M
MLR-CCRまたはMPHG-CCRのin vivoまたはin vitro発現を抑制する
ために用いることができる。約20塩基対からなるアンチセンスオリゴヌクレオ
チドの使用について特に記すが、大きなcDNAフラグメントの場合でも概ね同じ手
順を用いることができる。MMLR-CCRまたはMPHG-CCRのコード化配
列に基づくオリゴヌクレオチドを用いて、内生MMLR-CCRまたはMPHG-
CCRの発現を抑制することができる。Oligo 4.0を用いて、相補的なオリゴヌ
クレオチドを保存的な5'配列からデザインし、プロモータが上流の非翻訳配列を
結合するのを防ぐことにより転写を抑止したり、或いは、リボゾームがmRNA
に結合するのを防止することによりMMLR-CCRまたはMPHG-CCR転写
物の翻訳を抑止するために用いることができる。
7 MMLR-CCRまたはMPHG-CCR特異的抗体の産生
ポリクローナル抗体の産生のために、MMLR-CCRまたはMPHG-CCR
の予測アミノ酸配列をDNASTARソフトウエア(DNASTAR社)を用い
て解析して免疫抗原性の高い領域を決定し、対応するオリゴペプチドを合成して
、ウサギで抗体を産生するために用いる。C末端付近の、或いは隣接する親水性
領域内のエピトープのような、適切なエピトープを選択するための解析は、Ausu
bel FM等(上記)の論文に記載されてい
る。通常、約15残基の長さを有するオリゴペプチドを、fmoc-chemistryを用い
るABIペプチドシンセサイザーModel 431A(Perkin Elmer,Norwalk,CN)を
用いて合成し、M−マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエス
テル(MBS:Ausubel FM等、上記)を用いた反応によりキーホールリンペット
ヘモシニアン(KLH、Sigma)に結合する。フロイントの完全アジュバントに
おけるオリゴペプチド−KLH複合体を用いてウサギを免疫する。得られた抗血
清の抗ペプチド活性を検査するには、例えばペプチドをプラスチックに結合し、
1%BSAを用いてブロックし、ウサギ抗血清と反応させて洗浄し、さらに放射
性ヨウ素標識されたヤギ抗ウサギIgGを用いて反応させる。
8 特異的抗体を用いるMMLR-CCRまたはMPHG-CCRの精製
内生MMLR-CCRまたはMPHG-CCRや組換えMMLR-CCRまたは
MPHG-CCRは、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRに対する特異的な
抗体を用いるイムノアフィニティークロマトグラフィにより精製することができ
る。イムノアフィニティーカラムは、CnBr活性化Sepharose(Pharmacia Bio
tech社)のような活性化クロマトグラフ樹脂とMMLR-CCRまたはMPHG-
CCR抗体とを共有結合させることにより構成される。結合後、その樹脂を製造
者の指示に従って、ブロックし洗浄する。
MMLR-CCRまたはMPHG-CCRを含む培地をイムノアフィニティーカ
ラムに通し、そのカラムをMMLR-CCRまたはMPHG-CCRを優先的に吸
収できる条件下(例えば界面活性剤の存在下での高イオン強度緩衝剤)で洗浄す
る。このカラムを、抗体/MMLR-CCRまたはMPHG-CCR結合を切るよ
うな条件下(例えばpH2〜3の緩衝剤、或いは高濃度の尿素またはチオシアン
酸塩イオンのようなカオトロピックイオ
ン)で溶離させ、MMLR-CCRまたはMPHG-CCRを回収する。
9 MMLR-CCRまたはMPHG-CCRと相互作用する分子の同定
MMLR-CCRまたはMPHG-CCR、或いはその生物学的に活性なフラグ
メントを、125Iボルトンハンター試薬を用いて標識する(Bolton,AE及びHunter
,WM(1973)Biochem J 133:529)。96穴プレートのウェル内に前に入れておい
た候補分子を、標識したMMLR-CCRまたはMPHG-CCRとともに培養し
、洗浄し、標識したMMLR-CCRまたはMPHG-CCR複合体を有する任意
のウェルをアッセイする。異なる濃度のMMLR-CCRまたはMPHG-CCR
を用いて得られるデータを用いて、候補分子とMMLR-CCRまたはMPHG-
CCRとの会合の数、アフィニティー並びに会合度の値を計算する。
10 ノーザン分析
MMLR-CCRをコードする、インサイト社クローンNo.478861からの0.6kb
SalI/NotIフラグメントを用いてClontech Labsから得られた種々の組織のノーザ
ン分析を、0.2X SSC/0.1%SDS洗浄を用いて行った。この分析の結果、第
5図に示す16の組織、通常の心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓
、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、大腸、及び白血球の全てにおいて4.
0kbの主要な転写物が存在することがわかった。第5図に示すように、転写物は
、肺、脾臓、胸腺、卵巣、小腸、末梢血の白血球の調製物において最も豊富に存
在していた。2.5kbのより小さい転写物は、胎盤にみられた。
上記のすべての刊行物及び特許明細書は、本明細書と一体に参照されたい。本
発明の記載した方法及びシステムの種々の変更例及び変形例は、
本発明の範囲及び精神から逸脱しないことは当業者には明らかであろう。本発明
は特に好適な実施例に関連して記載されているが、本発明の請求の範囲は、その
ような特定の実施例に不当に制限されるべきではないことを理解されたい。実際
には、本発明を実施するために記載された方法の種々の変更例は、分子生物学或
いは関連する分野の当業者には明らかなように、以下の請求項の範囲内に含まれ
るものである。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
C12P 21/02 G01N 33/53 D
G01N 33/53 33/566
33/566 C12N 5/00 B
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L
U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF
,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,
SN,TD,TG),AP(GH,KE,LS,MW,S
D,SZ,UG),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ
,MD,RU,TJ,TM),AT,AU,BR,CA
,CH,CN,DE,DK,ES,FI,GB,IL,
JP,KR,MX,NO,NZ,RU,SE,SG,U
S
(72)発明者 コールマン、ロジャー
アメリカ合衆国カリフォルニア州94041・
マウンテンビュー・#2・マリポーザ
260
(72)発明者 ワイルド、クレイグ・ジー
アメリカ合衆国カリフォルニア州94087・
サニーベイル・マンダリンドライブ 1239
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.配列番号:2の配列を含むポリペプチドをコードする核酸を含む精製ポリヌ クレオチド。 2.前記核酸配列が、配列番号:1の配列を含むることを特徴とする請求項1に 記載の精製ポリヌクレオチド。 3.前記ポリペプチドが、121番目の残基にイソロイシンを有することを特徴 とする請求項1に記載の精製ポリヌクレオチド。 4.請求項2のポリヌクレオチドまたはその一部に相補的な配列を含むアンチセ ンス分子。 5.請求項1のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。 6.請求項5の発現ベクターで形質転換された宿主細胞。 7.請求項1のポリヌクレオチドまたはそのフラグメントを含むmmlr-ccrポリヌ クレオチド配列の検出のための診断用組成物。 8.配列番号:2のアミノ酸配列を含む精製ポリペプチド。 9.121番目の残基にイソロイシンを有することを特徴とする請求項8に記載 の精製ポリペプチド。 10.請求項8のポリペプチドに対して特異的な抗体。 11.配列番号:2のアミノ酸配列を有するMMLR-CCRポリペプチドの生 成方法であって、 a)前記ポリペプチドの発現に適した条件の下で請求項6の宿主細胞を培養す る過程と、 b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペプチドを回収する過程とを含むことを 特徴とする配列番号:2のアミノ酸配列を有するMMLR-CCRポリペプチド の生成方法。 12.複数の化合物のなかから請求項8のポリペプチドに対して特異的な結合親 和性を有するものを選別するためのスクリーニング方法であっ て、 a)複数の化合物を準備する過程と、 b)請求項8のポリペプチドと、前記複数の化合物のそれぞれとを、適切な条 件の下で結合できるだけの十分な時間をかけて結合させる過程と、 c)請求項8のポリペプチドと前記複数の化合物のそれぞれとの結合を検出し 、請求項8の前記ポリペプチドに特異的に結合する化合物を同定する過程とを含 むことを特徴とするスクリ−ニング方法。 13.請求項10の抗体を含むポMMLR-CCRリペプチド配列の同定のため の診断用組成物。 14.細胞内でのMMLR-CCRの発現を抑制する方法であって、 請求項4のアンチセンス分子を前記細胞に効果的な量だけ投与する過程を含む 細胞内でのMMLR-CCRの発現を抑制する方法。 15.前記細胞がin vivoであることを特徴とする請求項14に記載の方法。 16.配列番号:4の配列を有するポリペプチドをコードする核酸配列を含む精 製ポリヌクレオチド。 17.前記ポリヌクレオチド配列が、配列番号:2の配列を含むことを特徴とす る請求項16に記載のポリヌクレオチド。 18.請求項16に記載のポリヌクレオチドまたはその一部分に相補的な配列を 含むアンチセンス分子。 19.請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。 20.請求項19の発現ベクターで形質転換された宿主細胞。 21.請求項16のポリヌクレオチド、またはそのフラグメントを含むmphg-ccr ポリヌクレオチド配列の検出のための診断用組成物。 22.配列番号:4のアミノ酸配列を含む精製ポリペプチド。 23.請求項22のポリペプチドに対して特異的な抗体。 24.配列番号:4のアミノ酸配列を有するMPHG-CCRポリペプチドの生 成方法であって、 a)前記ポリペプチドの発現に適切な条件の下で、請求項20の宿主細胞を培 養する過程と、 b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペプチドを回収する過程とを含むことを 特徴とする配列番号:4のアミノ酸配列を有するMPHG-CCRポリペプチド の生成方法。 25.複数の化合物のなかから請求項22のポリペプチドに対して特異的な結合 親和性を有するものを選別するためのスクリーニング方法であって、 a)複数の化合物を準備する過程と、 b)請求項22のポリペプチドと、前記複数の化合物のそれぞれとを、適切な 条件の下で結合できるだけの十分な時間をかけて結合させる過程と、 c)請求項22のポリペプチドと前記複数の化合物のそれぞれとの結合を検出 し、請求項22の前記ポリペプチドに特異的に結合する化合物を同定する過程と を含むことを特徴とするスクリーニング方法。 26.請求項23の抗体を含むMPHG-CCRポリペプチド配列の同定のため の診断用組成物。 27.細胞内でのMPHG-CCRの発現を抑制する方法であって、 請求項18のアンチセンス分子を前記細胞に効果的な量だけ投与する過程を含 む細胞内でのMPHG-CCRの発現を抑制する方法。 28.前記細胞がin vivoであることを特徴とする請求項27に記載の方法。
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| EP1199360A3 (en) * | 1996-03-01 | 2002-05-02 | Euroscreen S.A. | Active and inactive CC-chemokine receptors and nucleic acid molecules encoding said receptor |
| EP0859787B1 (en) * | 1996-07-22 | 2001-10-10 | Smithkline Beecham Corporation | G-protein coupled receptor hnfds78 |
| US6528625B1 (en) | 1996-10-28 | 2003-03-04 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Anti-CCR5 antibodies and kits comprising same |
| CA2235420A1 (en) * | 1998-06-17 | 1999-12-17 | Paolo Renzi | Antisense oligonucleotides for treating or preventing atopic diseases and neoplastic cell proliferation |
| DE19842363A1 (de) * | 1998-09-16 | 2000-03-30 | Forssmann Wolf Georg | Verwendung von Chemokinen zur Stammzellmobilisation und von Chemokin-Antagonisten zur Vermeidung von Tumormetastasierung |
| US7175988B2 (en) | 2001-02-09 | 2007-02-13 | Human Genome Sciences, Inc. | Human G-protein Chemokine Receptor (CCR5) HDGNR10 |
| US7393934B2 (en) | 2001-12-21 | 2008-07-01 | Human Genome Sciences, Inc. | Human G-protein chemokine receptor (CCR5) HDGNR10 |
| WO2005105841A2 (en) | 2004-03-12 | 2005-11-10 | Human Genome Sciences, Inc. | Human g-protein chemokine receptor (ccr5) hdgnr10 |
| NZ554723A (en) | 2004-10-29 | 2009-12-24 | Topigen Pharmaceuticals Inc | Antisense oligonucleotides against CCR3 chemokine receptor |
| WO2007055636A1 (en) * | 2005-11-08 | 2007-05-18 | Astrazeneca Ab | Single nucleotide polymorphisms in the ckrx gene associated with respiratory disease |
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| US6265184B1 (en) * | 1995-12-20 | 2001-07-24 | Icos Corporation | Polynucleotides encoding chemokine receptor 88C |
| EP1199360A3 (en) * | 1996-03-01 | 2002-05-02 | Euroscreen S.A. | Active and inactive CC-chemokine receptors and nucleic acid molecules encoding said receptor |
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