JP2000516472A - 組織特異的遺伝子発現を与える自己複製型エピソーム性発現ベクター - Google Patents

組織特異的遺伝子発現を与える自己複製型エピソーム性発現ベクター

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Abstract

(57)【要約】 自己複製、長期間の組織特異的遺伝子発現のための遺伝子座制御領域(LCR)含有エピソーム性発現ベクター、目的の遺伝子の持続性組織特異的発現が記載される。

Description

【発明の詳細な説明】 組織特異的遺伝子発現を与える自己複製型エピソーム性発現ベクター 発明の一般的な分野 本発明は、宿主細胞における目的の遺伝子を発現するための安定な自己複製型 エピソーム性発現ベクターに関する。 発明の背景 宿主細胞における外来遺伝子の発現は、一般に、遺伝子移入ベクターを用いて 遺伝子を宿主細胞中に移入することによって達成される。遺伝子移入ベクターは 、当該分野において入手可能であり、そして例えば、レトロウイルスベクター、 アデノウイルスベクター、およびアデノ随伴ウイルスベクターを含む。多くの移 入ベクターは、完全な遺伝子移入ベクターではないにせよ、少なくとも移入され る遺伝子を、宿主細胞の染色体中に組み込むことによって作動するが、非取込み 移入ベクターは当該分野において公知である。形質移入した遺伝子構築物の安定 な取込みの効率は、一般に非常に不効率である(1:103〜106)。ウイルスベクタ ーベース遺伝子移入を用いることの不利益は、ベクターが収容し得る量の遺伝子 物質が、ウイルスの遺伝子パッケージング限界によって限定されることである。 挿入された遺伝子物質の大きなフラグメントを含む遺伝子移入ベクターは、実用 価値を有するのに十分に高い力価で生成することが困難である。従って、ウイル スベースベクター(例えば、安定な遺伝子移入に悪影響を及ぼすことのない遺伝 子調節エレメント)中にさらなる遺伝子物質を含ませることは困難である。 遺伝子座調節領域(Locus Control Region)(LCR)(Grosveldら、Cell 51:975 -985(1987))(Dominant Activator Sequence、遺伝子座活性化領域(Locus Acti vating Resion)、またはDominant Control Regionとしてもまた公知)は、宿主 細胞の染色体中に組み込まれた連結遺伝子に対して、組織特異的な組込み部位非 依存性コピー数依存性発現を与える。LCRは、元来は、ヒトグロビン遺伝子系に おいて発見され、それは、トランスジェニックマウスの組織中の宿主細胞、ま たはマウス赤白血病(MEL)細胞の染色体中に組み込まれる場合、強い位置効果を 示した(例えば、Magramら、Nature 315:338-340(1985);Townesら、EMBO J.4:1 715-1723(1985);Kolliasら、Cell 46:89-94(1986);Antoniouら、EMBO J.7:377- 384(1988))を参照のこと。位置効果は、LCRがそのような導入遺伝子に直接連結 された場合、克服された(Grosveldら、前出)。他のLCRは、赤血球組織におけ る遺伝子発現を促進するβ-グロビンLCR(βLCR)、およびT細胞における遺伝子 発現を促進するCD2 LCR(例えば、Greavesら、Cell 56:979(1989),欧州特許出 願EP-A-O 668 357)、マクロファージ特異的リゾチームLCR(Boniferら、(1985 ,1990))、およびクラスII MHC LCR(Carsonら、Nucleic Acids Res.21,9:20 65-2072(1993))を含むと同定されている。 本発明の目的は、宿主細胞中に存在する場合、ベクター中に運ばれる目的の遺 伝子の安定かつ組織に制限される発現を与える安定な遺伝子移入系を提供するこ とである。 発明の要旨 本発明は、目的の遺伝子が、特定の組織型の細胞における遺伝子の発現のため に挿入される自己複製型LCR含有エピソーム性発現ベクターを提供する。 従って、本発明は、組織に制限される様式で、宿主細胞における目的の遺伝子 を発現するための自己複製型エピソーム性DNA発現ベクターを含み、そのベクタ ーは以下:(a)組織の特定の型の細胞におけるDNA発現ベクターの複製を指向 し得る複製起点;および(b)LCRまたはその成分であって、それらは、目的の 遺伝子に作動可能に連結され、そして宿主細胞中に存在する場合、組織に制限さ れる様式で遺伝子の発現を指向する、LCRまたはその成分を含む。 本発明に従ったベクターはまた、クローニング部位中に挿入され、そしてLCR に作動可能に連結される目的の遺伝子を含み得る。 用語「遺伝子」は、発現され得る任意のDNA配列を定義するために使用される 。目的の遺伝子は、外来または異種の遺伝子、すなわち宿主細胞のゲノムDNA中 に通常見出されないか、またはその宿主細胞において正常に発現されない遺伝子 であり得る。目的の遺伝子はまた、人工DNA配列であり得る。 目的の遺伝子の組織に制限される発現は、適切なLCRまたはその成分もしくは 部分(それは、目的の遺伝子に対して組織型特異的発現を与える)を用いて、目 的のベクターにおいて媒介される。 本明細書中で使用される「遺伝子座制御領域」(LCR)は、真核生物の宿主細胞 の組織特異的遺伝子座から得られ、そして目的の遺伝子に連結され、そして宿主 細胞の染色体中に組み込まれる場合、目的の遺伝子に対して、組織特異的組込み 部位非依存性(位置非依存性)コピー数依存性発現を与える遺伝子エレメントと して定義される。本発明に従って有用であるLCRは、染色体DNA中に組み込まれる 場合、これらの特徴を有し、そして本発明に従った自己複製型エピソーム性ベク ター中に存在する場合、連結される遺伝子の組織型に制限される発現を与える能 力を保持する。LCRの「成分」は、遺伝子に連結され、そして自己複製型エピソ ーム性ベクター中に組み込まれる場合、組織に制限される遺伝子もまた与えるLC Rの一部をいう。LCRは、それが、天然の染色体状況における1つ以上のDNase I 過感受性部位と関連し、そして本発明に従って有用なLCRの成分はまた、少なく とも1つのDNase I過感受性部位を有するという点で、構造的に同定され得る。 本明細書中において「エンハンサー」は、自己複製型エピソーム性ベクター上 に存在する場合連結される遺伝子の転写のレベルを増加させるが、ベクター上に 存在する場合組織特異的遺伝子発現を与えない遺伝子エレメントとして定義され る。 ベクターが、組織特異的発現を与えるLCRの成分を含み、そして少なくとも1 つのDNase I過感受性部位を含むことは好ましい。ヒトβ-グロビンLCRにおいて 、LCRの好ましい成分は、本質的にHS3からなり;また好ましくは、部位HS2を除 くヒトβ-グロビンLCRであり;また好ましくは、部位HS2なしで、部位HS3および HS4の集まりである。 本発明はまた、組織に制限される様式で、宿主細胞において目的の遺伝子を発 現するための自己複製型エピソーム性DNA発現系を含む1対のベクターを含み、 その1対のベクターは以下を含む:以下を含む第1のベクター:(a)複製起点 ;(b)LCRまたはその成分であって、それらは目的の遺伝子に作動可能に連結 され、そして宿主細胞中に存在する場合、組織に制限される様式で、遺伝子の 発現を指向する、LCRまたはその成分;(c)目的の遺伝子のためのクローニン グ部位;ならびに以下を含む第2のベクター:(d)複製起点;および(e)複 製タンパク質をコードする配列であって、その複製タンパク質は、複製起点の複 製のために必要である、配列。 別の実施態様において、目的の遺伝子およびウイルスの複製遺伝子がいくつか の同じ細胞において発現されるように、第2のベクターはまたLCRを含み得、そ れは、第1のベクター上に存在するものと同じLCRであり得るか、または第1のL CRと同じかもしくは少なくとも重複する組織特異性を特定する異なるLCRであり 得る。 赤血球に制限される遺伝子発現のために、β-グロビン遺伝子座由来のβ-グロ ビンLCRが使用されることは好ましい。本明細書中で使用される「赤血球」は、 赤血球系統の細胞をいう。 T細胞に制限される遺伝子発現のために、CD2遺伝子座由来のCD2 LCR、または エピソーム性状況においてT細胞に制限される遺伝子発現を指向する少なくとも 1つのDNase I過感受性部位を含むLCRの成分が使用されることは好ましい。クラ スII MHC関連細胞に制限される遺伝子発現のために、クラスII MHC LCR、または エピソーム性状況においてMHC関連細胞に制限される遺伝子発現を指向する少な くとも1つのDNase I過感受性部位を含むLCRの成分が使用されることは好ましい 。マクロファージ細胞に制限される遺伝子発現のために、マクロファージ/リゾ チームLCR、またはエピソーム性状況においてマクロファージ細胞に制限される 遺伝子発現を指向する少なくとも1つのDNase I過感受性部位を含むLCRの成分が 使用されることは好ましい。 用語「エピソーム性ベクター」は、直線状または環状であり得、そして通常形 態が二本鎖である核酸ベクターをいう。本発明に従ったベクターは、一般に、1 kb〜1,000kbのサイズ範囲内であり、好ましいサイズ範囲はおよそ5kb〜100kbで ある。 用語「自己複製型」、「安定に維持された」、および「持続性」は、本明細書 中で以下のように定義される。本発明のベクターの自己複製型機能は、ベクター が、ゲノムDNA複製から独立して細胞において安定に維持されること、および細 胞におけるベクターのコピー数における有意な消失なしで、すなわち所定の細胞 分割間の前駆細胞におけるベクター分子の平均約50%より多い消失なしで、3つ 以上の細胞分割間に前駆細胞において持続することを可能にする。この自己複製 型機能は、ウイルスの複製起点を用いること、および特定のウイルス複製開始点 によって媒介される複製のために必要とされる1つ以上のウイルスの複製因子を 提供することによって提供される。複製起点および、必要ならば任意の複製因子 は、種々のウイルス(エプスタインバーウイルス(EBV)、ヒトおよびウシパピロ ーマウイルス、ならびにパポバウイルスBKを含む)から使用され得る。 好ましい実施態様において、ウイルスの複製起点は、EBVのoripであり、そし て複製タンパク質の因子は、トランス作用性EBNA-1タンパク質である。EBNA-1は 、OriPを有する同じエピソーム性発現ベクター上、または細胞中、もしくは宿主 細胞のゲノムDNA中のEBNA-1遺伝子由来の別のベクター上のEBNA-1遺伝子の発現 によって提供され得る。 好ましい実施態様において、ウイルス複製因子をコードする遺伝子は、自己複 製型エピソーム性ベクター上、すわなち目的の遺伝子を有する同じベクター、ま たは1対のベクターの別のベクターのいずれかの上に存在し得、そしてLCRに作動 可能に連結され得る。 本明細書中で使用される「連結される」は、目的の遺伝子および/またはウイ ルス複製因子をコードする遺伝子ならびにLCRが、同じベクター中に含まれ、従 って同じDNA上にシスで存在するシス連結をいい、そして「作動可能に連結され る」は、目的の遺伝子および/またはウイルス複製遺伝子が、LCRを介して組織 に制限される発現に供すシス連結をいう。 必要に応じて、転写ターミネーターは、目的のベクター中、好ましくはLCRま たはその成分間に、および目的の遺伝子のプロモーター、またはベクター上に存 在し得る他のプロモーター由来のこれらの遺伝子の所望されない転写を防ぐため のウイルス複製タンパク質をコードする遺伝子中に導入され得る。あるいは、転 写ターミネーターは、LCRの上流および目的の遺伝子またはウイルス複製遺伝子 の下流に導入され得る。 本発明のエピソーム性発現ベクターは、DNA分子を細胞に送達するために使用 される種々の方法のいずれかによって、インビボ、エクスビボ、またはインビト ロで細胞に送達され得る。ベクターはまた、単独、または身体内の細胞への送達 を増強する薬学的組成物の形態で送達され得る。 好ましい実施態様において、本発明のベクターは、遺伝子治療において、身体 内の特定の罹患した組織(腫瘍組織を含む)の細胞中の治療的に有用なタンパク 質を発現するために使用される。 本発明のベクターはまた、インビトロの特定の組織型の細胞中の治療的に有用 なタンパク質を発現するために使用される。 本発明の別の実施態様において、本明細書中に記載のベクターを使用して、外 来または異種の遺伝子が、LCRまたはその成分によって指向され、ベクター中に 組み込まれるような特定の組織型においてのみ発現される、トランスジェニック 動物の型を生成する。ベクターの自己複製機能は、ベクターが、トランスジェニ ック動物の前駆体を通過することを確実にする。そのようなトランスジェニック 動物は、ヒトの臨床的処置前の、組織特異的遺伝子発現の信頼性および効率性を 試験する際に特に有用である。 本発明の別の実施態様において、エピソーム性DNA発現ベクターに含まれ、目 的の遺伝子に作動可能に連結され、そして宿主細胞中に存在する場合、組織に制 限される様式で遺伝子の発現を指向するLCRまたはその成分を同定するための方 法で以下: i.LCRまたはその成分を、LCRが取り込まれた場合に活性である細胞株中に、そ してまた、LCRが取り込まれた場合に不活性である細胞株中に、マーカー遺伝子 に操作可能に連結した候補LCRまたはその成分を含むエピソーム性ベクターをト ランスフェクトすることにより試験する工程;および ii.取り込まれた場合LCRが活性である細胞株においてのみ活性であるLCRまたは それらの成分を同定する工程、 を包含する方法が提供される。 本発明のさらなる特徴および利点は、以下の図面、記載、および請求の範囲に 見い出される。 図面の簡単な説明 図1は、EBVに基づく自己複製型発現ベクターp220.2の模式図である。p220.2 は、8952bpのプラスミドで、これは、EBNA-1、OriPおよびハイグロマイシン耐性 をコードする。これは、143およびHeLa細胞におけるプラスミドとして複製する 。この構築物におけるEBNA-1は、pBR322配列中に配置される未知のプロモーター を除去されている。EBNA-1の上流に挿入されたDNAは、EBNA-1の発現を除去する ようである。bp1-35はpBR322である。bp36-2646は、EBV EBNA-1 107567-110176 のBamHI-PvuIIフラグントである(Baerら、Nature、310:207-211、1984)。BamH I部位は、HindIII部位に連結された平滑末端であった。bp2647-4826は、BstEII 部位に平滑末端連結されたEBV OriP 7333-9516 SphI-SstII部位である(Sugden ら、MCB、5:410-413、1985)。bp4827-5460は、HSV TK調節領域である(McKnigh t,NAR,8:5949-5964,1980)。bp6488-6747は、NaeI部位に毒性のないpBR322へ連 結されたHSV TK PvuIIフラグメントである。この部位は、クローニングにおいて 欠失する。bp5461-6487は、HSV TK配列中のSmaIおよびBgIII部位へ平滑末端連結 されたHPH遺伝子(GritzおよびDavies、Gene,25:179-188,1983)のBamHIフラグ メントである。bp6748-8952は、pBR322の毒性のないベクター(pBR322において1 .1kbが欠失する)である。これは、アンピシリン耐性を与える(LuskyおよびBot chan,Nature 293:79-81,1981)。pUC12からのポリリンカー(SmaI-HaeIIIフラグ メント)は、HSV TK配列中のNarI部位に挿入されている。(/)は、平滑末端連結 を示す。 図2は、レポータ遺伝子構築物を示す: a)5’HpaI部位(815位)からEcoRV部位(1685位)へとプラスミドGSE1758中 のポリA付加部位を過ぎて延びるβグロビン遺伝子(Talbotら、EMBO J.9:2169 -2178,(1990))は、4.1kb EcoRVフラグメントとして取り出され、そしてp220.2 のポリリンカー中の平滑末端SaII部位に挿入される(図1)。このクローンイン グ工程は、多数の余分の制限部位(独特なSaII部位を含む)をβグロビン遺伝子 の5’にもたらす。 図3は、βグロビンLCR過感受性部位構築物を示す。2つ以上の過感受性部位 を含む構築物は、野生型βグロビン遺伝子座の部位の順序に一致するように設計 された。SalIリンカーは、5’末端および3’末端の両方に添加され、これはDNA をp220.2レポーターベクター中のβグロビン遺伝子の上流の独特なSalI部位へと クローニングされることを可能にする(図2)。 図4は、以下を示す: a)βグロビンLCR由来のHS成分の種々の組合せに作動可能に連結されたヒトβグ ロビンレポーター遺伝子を含む自己複製型エピソーム性発現ベクターでトランス フェクトしたK562細胞由来のRNAのSIヌクレアーゼ分析のオートラジオグラム。 レーンβ1(βグロビン遺伝子単独)、レーン2β1および2(βグロビン遺伝 子に作動可能に連結されたHS2)、レーン3β1および2(βグロビン遺伝子に 作動可能に連結されたHS3)、レーン4β1および2(βグロビン遺伝子に作動 可能に連結されたHS4)、レーン4β1および2(βグロビン遺伝子に作動可能 に連結されたSH4)、レーン23β1および2(βグロビン遺伝子に作動可能に連 結されたHS2/HS3の組合せ)、レーン34β1および2(βグロビン遺伝子に作動 可能に連結されたHS3/HS4の組合せ)、レーン24β1および2(βグロビン遺伝 子に作動可能に連結されたHS2/HS4の組合せ)、レーン234β1および2(βグロ ビン遺伝子に作動可能に連結されたHS2/HS3/HS4の組合せ)。レーン+γは、ネ ガティブコントロールとしてのトランスフェクトされていないK562細胞であり、 そしてレーン+βは、ポジティブコントロールとして作用するβグロビン遺伝子 とβLCRとの組合せでトランスフェクトされたMEL細胞をいう。すべてのレーンは 、独立したトランスフェクションである。 b)S1保護フラグメントを含むβグロビン遺伝子の5’領域由来の末端標識され たDNAプローブを模式的に示す。 図5は、本明細書中に記載される構築物を含むK562またはHeLa細胞由来のRNA ブロットのオートラジオグラムを示す。パネルA:レーンMは、pBR322サイズマ ーカーのHlnf1消化物である;レーンPは、ポジティブコントロールとしてのヒ トβグロビン遺伝子で安定にトランスフェクトされたMEL細胞由来のRNAである; レーンβは、ヒトβグロビン遺伝子単独である;レーン2βは、βグロビンLCR H S2の制御下にあるヒトβグロビン遺伝子である;レーン3βは、βグロビンLCR H S3の制御下にあるヒトβグロビン遺伝子である;そして、レーン5βは、βグロ ビンLCR HS2、βグロビンLCR HS3、およびβグロビンLCR HS4の制御下にあるヒ トβグロビン遺伝子である;ならびにレーンNは、ネガティブコントロールとし てのトランスフェクトされていないK562細胞である。パネルBにおいて、レーン は、レーンNがネガティブコントロールとしてトランスフェクトされていないHe La細胞であることを除いてパネルAにおいて示されるのと同一である。 図6は、βグロビンLCR由来のHS成分の種々の組合せに作動可能に連結された ヒトβグロビンレポーター遺伝子を含む自己複製型エピソーム性発現ベクターで トランスフェクトしたK562細胞由来のRNAのSIヌクレアーゼ分析のオートラジオ グラムを示す。レーンMは、マーカーである;レーンβはβグロビン遺伝子単独 である;レーン2βは、βグロビンLCR HS2である;レーン3βは、βグロビンL CR HS3である;レーン4βは、βグロビンLCR HS4である;レーン23βは、β グロビンLCR HS2およびHS3である;レーン34βは、βグロビンLCR HS3およびHS4 である;レーン24βは、βグロビンLCR HS2およびHS4である;レーン234βは、 βグロビンLCR HS2、HS3およびHS4である;レーン234βiは、安定な成分として のβグロビンLCR HS2、HS3およびHS4構築物である;レーンβiは、安定な成分と してのβグロビン遺伝子単独である;レーンNは、ネガティブコントロールとし てのトランスフェクトされていないK562細胞であり;ならびにレーンPは、ポジ ティブコントロールとしてのヒトβグロビン遺伝子で安定にトランスフェクトさ れたトランスフェクトされていないMEL細胞である。すべてのレーンは、独立し たトランスフェクションである。 発明の詳細な説明 本明細書中で参照するすべての参考文献の内容は、参考として援用される。 本発明は、遺伝子座制御領域またはその成分が、目的の遺伝子の組織に限定さ れた発現を特定するための目的の遺伝子を含む、安定な、自己複製型のエピソー ム性ベクターにおいて使用され得るという発見に基づく。 宿主細胞においてLCRを含むエピソーム性ベクターの安定な維持は、宿主細胞 染色体および複製起点因子に非依存性のエピソーム性DNAを開始し、そして複製 するために操作可能である複製起点を使用することにより達成される。本発明に従う有用な複製起点および複製因子 真核生物細胞において異種遺伝子を発現するためのプラスミドベクターは、1 つ以上の真核生物ウイルス(例えば、エプスタインバーウイルス、ヒトパポバウ イルスBK、アデノウイルスに基づくベクター、ならびにウシおよびヒトのパピロ ーマウイルス)のゲノムDNAの一部を使用して作製されてきた。 本発明のエピソーム性ベクターは、複製起点(ori)(これは、自己複製する ようなベクターに必要である)をコードするウイルスゲノムDNAの一部を含み、 従って宿主細胞中において数世代にわたって存続する。さらに、本発明のエピソ ーム性ベクターはまた、複製に必要とされるウイルスタンパク質(すなわち、レ プリケータータンパク質)をコードする1つ以上の遺伝子を含み得る。必要に応 じて、複製開始に役立つレプリケータータンパク質は、本発明の自己複製型エピ ソーム性発現ベクターを含む宿主細胞において別のDNA分子(例えば、別のベク ターまたは宿主ゲノムDNA)上でトランスに発現され得る。 本発明の好ましい自己複製型エピソーム性LCR含有発現ベクターは、ウイルス 配列を含まない。このウイルス配列は、コアまたはキャプシドタンパク質をコー ドするウイルスゲノムDNAの領域(これは、全長ウイルスゲノムDNA分子中に存在 し得る感染性ウイルス粒子またはウイルス発ガン性配列を産生する)のような、 真核生物宿主細胞における長期の安定な維持には必要とされない。 本明細書中において、用語「安定な維持」とは、本発明の自己複製型エピソー ム性発現ベクターの、連続的な選択を行わずに、ベクターのコピー数の有意な消 失(例えば、>50%)なしに、2世代、そして好ましくは5世代以上、非分裂細 胞もしくは分裂細胞の子孫細胞において存続するかまたは維持される能力をいう 。最も好ましいベクターは、10〜15世代またはそれを越える細胞世代にわたって 維持される。対照的に、宿主細胞中のプラスミドの「一過性」または「短期の」 維持は、ベクターが、安定な様式で宿主細胞中で複製し、そして分離することが できないことをいう;すなわち、このベクターは、1または2世代後に消失する か、あるいは連続する世代間で>51%のコピー数消失を経験する。 本発明のいくつかの代表的な自己複製型LCR含有エピソーム性ベクターは、さ らに以下に記載される。自己複製機能は、1つ以上の哺乳動物配列(例えば、Wo hlgemuthらにより記載される、1996、Gene Therapy 3:503;Vosら、1995,Jour.Ce ll.Biol.追補21A、433;およびSunら、1994、Nature Genetics 8:33に記載され るような)により、必要に応じて核保持のために必要とされ得る1つ以上の配列 と組み合わせて別に提供され得る。自己複製機能を提供するための哺乳動物配列 、特にヒト配列の使用の利点は、毒性特性または発ガン性特性を有し得る余分な 活性化因子を必要としないことである。本発明は、いかなる複製起点にもエピソ ーム性ベクターにも限定されないが、エピソーム性ベクターにおけるLCRの組織 限定制御の組合せを包含することが当業者には理解される。 1.本発明に従う有用なエプスタインバーウイルスに基づく自己複製型エピソー ム性発現ベクター。 エプスタインバーウイルス(EBV)由来の潜在性起源oriPは、Yatesら、Proc.N atl,Acad.Sci.USA 81:3806-3810(1984);Yatesら、Nature 313:812-815(1985); Krysanら、Mol.Cell.Biol.9:1026-1033(1989);Jamesら、Gene 86:233-239(1990 )、PetersonおよびLegerski,Gene 107:279-284(1991);ならびにPanら、Som.Cel l Molec.Genet.18:163-177(1992)に記載されている。本発明に従う有用なEBVに 基づくエピソーム性ベクターは、EBVの2.61kbフラグメントに含まれるEBVのoriP 領域(図1を参照のこと)およびEBVの2.18kbフラグメントに含まれるEBNA-1遺 伝子(図1を参照のこと)を含む。EBVのoriPおよびEBNA-1遺伝子を有するベク ターの1つは、図1に示される。図1に示されるベクターはまた、培養物におい て安定にトランスフェクトされた真核生物細胞の選択のための抗生物質耐性遺伝 子、目的の遺伝子の挿入のためのポリリンカークローニング部位、および細菌性 宿主細胞中のベクターDNAの産生のためのpBR322の一部を含む。 oriPを含むベクターのエピソーム性複製をトランスに支持するために唯一必要 とされるウイルス性遺伝子産物であるEBNA-1タンパク質は、oriPを含む同一のエ ピソーム性発現ベクター上に提供され得る(例えば、Jamesら、前出;Peterson およびLegerski、前出;Panら、前出を参照のこと)。トランスでのウイルスプ ラスミドの複製を支持するために必要とされることが知られているEBNA-1のよう な任意のタンパク質に関して、この遺伝子はまた、本発明のエピソーム性発現ベ クターを含む宿主細胞中の別のDNA分子(例えば、異なるDNAベクターまたは宿主 ゲノムDNA)上で発現され得ることが理解される。 2.本発明に従う有用なパピローマウイルスに基づく、自己複製型、エピソー ム性、発現ベクター。 本発明のエピソーム性発現ベクターはまた、ウイルスのパピローマファミリー (これは、ウシパピローマウイルス(BPV)およびヒトパピローマウイルス(HPV) を含むがこれらに限定されない)の複製機能に基づき得る。BPVおよびHPVは、哺 乳動物細胞中で安定に維持されるプラスミドとして存続する。BPVおよびHPVによ りコードされるトランスに作用する因子(すなわちE1およびE2)はまた、最小の 複製起点を解する多くの細胞型における複製を媒介するために必要とされそして 充分であるものとして同定されている(Ustavら、EMBO J.10.449-457(1991);U stavら、EMBO J.10:4231-4329,(1991);Ustavら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:8 98-902(1993))。 本発明に従う有用なエピソーム性ベクターは、Piirsooら、EMBO J.,15:1(1996 )およびWO 94/12629に記載されるBPV-Iベクター系である。Piirsooらに記載され るBPV-Iベクター系は、BPV-1複製起点(最小の起点エレメントおよび染色体外の 維持エレメント)を有するプラスミド、および必要に応じてE1遺伝子およびE1遺 伝子を含む。BPV-1 E1およびE2遺伝子は、BPVエピソーム性ベクターの安定な維 持に必要とされる。これらの因子は、プラスミドが細胞周期の状態には非依存的 に細胞あたり30コピー数までの安定なコピー数に複製されることを確実にする。 従って、遺伝子構築物は分裂細胞および非分裂細胞の両方で安定に存続する。こ れは、造血幹細胞およびより複雑な(committed)前駆細胞のような細胞におけ る遺伝子構築物の維持を可能にする。 BPV複製起点は60塩基対(bp)DNAフラグメント内の上流調節領域の3'末端(ヌ クレオチド(nt)7914〜7927)に位置付けられている。これはE1複製因子および E2複製因子の結合部位を含む。HPVの最少複製起点はまた、HPVのURRフラグメン ト(nt 7022〜7927)に特徴付けられ、そして位置付けられる(例えば、Chiang ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:5799-5803(1992)を参照のこと)。 本明細書中で用いられる「E1」とは、BPVサブタイプ1のヌクレオチド(nt)8 49〜2663によって、もしくはHPVのサブタイプ11のnt 832〜2779によってコード されるタンパク質、他のパピローマウイルスの等価なE1タンパク質、またはパピ ローマウイルスE1タンパク質の機能的なフラグメントもしくは変異体(すなわち 、E1の複製特性を有するE1のフラグメントもしくは変異体)を意味する。 本明細書中で用いられる「E2」とは、BPVサブタイプ1のnt 2594〜3837によっ て、もしくはHPVサブタイプ11のnt 2723〜3823によってコードされるタンパク質 、他のパピローマウイルスの等価なE2タンパク質またはパピローマウイルスE2タ ンパク質の機能的なフラグメントもしくは変異体(すなわち、E2の複製特性を有 するフラグメントもしくは変異体)を意味する。 「ミニ染色体維持エレメント」(MME)とは、パピローマウイルス複製に必須 なウイルスタンパク質またはヒトタンパク質が結合するパピローマウイルスゲノ ムの染色体外維持エレメントを意味する。この領域は、Piirsooら(前出)によ って記載されるように宿主細胞中でパピローマウイルスMOの安定なエピソーム性 維持に必須である。好ましくは、MMEは、転写アクチベーターE2の複数の結合部 位を含む配列である。BPV中のMMEは、最少の約6つの連続的なE2結合部位を含み 、そして約10の連続的なE2結合部位で最適な安定な維持を与える上流調節領域内 に位置するBPVの領域として本明細書中で定義される。E2結合部位9は、以下で 記載されるように、この部位についての好ましい配列であり、ここで連続部位は 、約4〜10ヌクレオチド、最適には6ヌクレオチドのスペーサーによって分離さ れる。E1およびE2は、さらにWO 94/12629およびPiirsooら(前出)に記載される ように、プラスミドにシスまたはトランスのいずれかで提供され得る。 「E2結合部位」とは、E2タンパク質が結合するパピローマウイルス二本鎖DNA の最少の配列を意味する。E2結合部位は、配列5’ACCGTTGCCGGT 3'を含み得、こ れはBPV-1 URRの高親和性E2結合部位9である;あるいは、E2結合部位は結合部 位9の置換を含み得、この置換はURR内に見出され、そして一般的なE2結合配列5 ’ACCN6GGT 3'内に含まれる。1つ以上の転写アクチベーターE2結合部位は、ほ とんどのパピローマウイルスにおいて、BPVおよびHPVにおいてのように上流調節 領域に位置付けられる。 本発明による、さらに有用なベクターは、(WO 94/12629に記載される)BPV遺 伝子地図上の6959〜7945/1〜470の間のBPVの領域を含み得る。この領域は複製起 点、目的の遺伝子に作動可能に連結される第1のプロモーター、E1遺伝子の転写 を駆動する第2のプロモーターに作動可能に連結されるBPV E1遺伝子;およびE2 遺伝子の転写を駆動する第3のプロモーターと作動可能に連結されるBPV E2遺伝 子を含む。 BPV由来のE1およびE2は、BPV起点または多くのHPVサブタイプの起点を含むベ クターを複製する(Chiangら(前出))。HPV由来のE1およびE2は、BPV起点およ び多くのHPVサブタイプの起点を介してベクターを複製する(Chiangら(前出) )。本発明の全てのベクターについて、本発明のBPVベースのエピソーム性発現 ベクターは、宿主細胞の2〜5以上の分裂の間持続する。 3.本発明の有用なパポーバウイルスベース、自己複製、エピソーム性発現ベ クター。 本発明のベクターはまた、ヒトパポーバウイルスBKゲノムDNA分子から得られ 得る。例えば、BKウイルスゲノムは制限酵素EcoRIおよびBamHIで消化され得、ベ クターに安定な維持を与え得るBKウイルス複製起点配列を含む5キロベース(kb )を生成し得る(例えば、De BenedettiおよびRhoads、Nucleic Acids Res.19: 1925(1991)を参照のこと。これはBKウイルスの3.2kbフラグメントであり得る(Co operおよびMiron、Human Gene Therapy 4:557(1993))。 4.複製起点因子発現の調節。 上記のように、本発明のベクターは、宿主細胞中のベクターの安定な維持のた めに必要なトランス作用ウイルス複製因子をコードする1つ以上の遺伝子を含み 得る。 調節エレメント(例えば、プロモーター、エンハンサー、LCR(これらはレプ リケーター遺伝子の発現を駆動する))は、同一であってもよいし異っていても よく、そして例えば、B細胞で表れる腫瘍に対して(B細胞に対して免疫グロブ リン重鎖プロモーター/エンハンサーおよび血球発現についてはIg重鎖プロモー ターまたはIg軽鎖プロモーター)、または特定されない細胞型で存在する腫瘍に 対してLCRと同一または重複した組織特異性を提供し得、そしてさらに遍在性に 発現する遺伝子由来(例えば、ホスフォグリセロールキナーゼ、IE-CMV、RSV-LT R、またはDHFR遺伝子由来)のプロモーターを含み得る。エピソーム性ベクター の複製起点に関してレプリケーター遺伝子の配置は、ウイルスゲノムのこれらの 配列の天然の配向を模倣してもよいし、種々の他の配向を想定し得、それらの選 択は当業者に明らかである。 EBVベースのエピソーム性ベクターにおいて、複製因子をコードするウイルス 遺伝子の転写は相対的に弱いプロモーターの制御下に置かれることがしばしば好 ましい。例えば、EBNA-1をコードする遺伝子の発現は、多くの細胞にとって毒性 であり得、そして/または遺伝子がCMVプロモーター(周知の相対的に強い真核 生物プロモーター)を使用して発現される場合ベクター配列において望ましくな い再配列を生じ得る。対照的に、相対的に弱い真核生物プロモーター配列を使用 するEBNA-1遺伝子の発現は、EBNA-1が宿主細胞中で所望のレベル(すなわち、培 養物中の細胞に非毒性であるレベル)のベクター複製を維持するように機能する ことを可能にする。本発明のベクターに有用なこのような相対的に弱いプロモー ター配列は、細菌性プラスミドpBR322の配列の一部およびチミジンキナーゼ(tk )プロモーターに見出される。 パピローマウイルスベースのベクターにおけるE1発現およびE2発現について好 ましいプロモーターは、チミジンキナーゼプロモーター、SV40初期プロモーター 、CMVプロモーター、およびSRαプロモーターを含む。 5 ベクターDNAの生産 本発明の別の実施態様において、ベクターが作製される。これは本発明よる使 用のために十分なDNAを生成するために本発明のベクターを含む細胞を培養する 工程を包含する。このような生産は下等真核生物細胞(例えば、酵母もしくは昆 虫)または原核生物細胞(例えば、細菌細胞(例えば、E.coliまたはSalmonell a)で行われることが特に好ましい。従って、本発明の、ベクターは酵母、昆虫 の複製起点、もしくは細菌性起点(例えば、pBR322複製起点)、ならびにベクタ ーを含む細胞の選別のための選択マーカーをコードする1つ以上の遺伝子(例え ば、 カナマイシン耐性をコードする遺伝子)、および/またはLacZのようなマーカー 遺伝子をさらに含むことが好ましい。本発明の有用な組織特異的遺伝子発現を提供するためのLCR、およびそれらの成 本発明は、安定な自己複製エピソーム性ベクターとベクターに含まれる遺伝子 の組織型制限発現のための遺伝子座調節領域またはそれらの成分との組み合わせ を意図する。 いずれか1つの理論に縛られることなく、ゲノムDNA状況において、LCRは特異 的な組織型の細胞におけるクロマチンの通常はきつく巻き付けられた構造の開口 を促進し、それによって組織特異的様式で開口クロマチンの領域の遺伝子の転写 を可能にすると考えられている。 さらに、LCRは、それらが結合された遺伝子の上流に位置していようと下流に 位置していようと、そして遺伝子についての配向に係わらず組織制限遺伝子発現 を与え得る。本発明によるエピソーム性ベクターに有用なLCRは、結合された遺 伝子に関して上流もしくは下流または任意の配向で配置され得る。 本発明の前には、染色体状況ではなくエピソーム性状況において存在する場合 LCRが組織制限遺伝子発現を与え得るか否か知られていなかった。さらに、ベク ターの一過性トランスフェクションにおいて、LCR成分は、LCR成分が古典的なエ ンハンサーエレメントを含まなければ、発現を増大させないと理解されていた( Tuanら、1989、Proc.Nat.Aca.Sci 86:2544)。 自己複製において、本明細書中で記載されるエピソーム性発現ベクター、LCR 、またはそれらの成分はベクター上に存在する選択された遺伝子に作動可能に連 結され、その結果遺伝子発現は、LCRまたはその成分が機能することが公知であ る特定の組織型の細胞においてのみ生じる。機構によって制限されることは望ま ないが、本明細書中で記載される自己複製ベクターは、LCRまたはその成分がLCR またはその成分が連結される配列を開口し、そして/または、次いで、配列の転 写を促進し得る宿主細胞の天然のクロマチンの高次構造と類似の高次構造で安定 に維持されるようである。 一般に、LCRもしくは成分またはその成分の組み合わせのいずれが、外来遺伝 子の組織特異的発現を媒介するために使用され得るかどうかが、レポーター遺伝 子に作動可能に連結されたLCRまたはその成分を含む自己複製エピソーム性ベク ターを使用して容易にアッセイされる。組織特異的様式でのレポーター遺伝子の 発現は、標準的な方法を使用して、そしてLCRが特異的である組織型の細胞にお けるレポーター遺伝子発現と異なる組織型の細胞におけるレポーター遺伝子発現 とを比較することによってアッセイされ得る。種々のレポーター遺伝子およびレ ポーター遺伝子を含むベクターが市販されている。これは、プロモーター機能お よび/またはエンハンサー機能を試験するために使用され得る。当該分野で使用 される標準的なレポーター遺伝子は、β-ガラクトシダーゼをコードするlacZ遺 伝子、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼをコードするCAT遺伝 子、ルシフェラーゼ遺伝子系、およびアルカリホファターゼをコードする遺伝子 を含む(例えば、Jamesら、(前出);PetersonおよびLegerski、(前出);Pan ら、(前出)を参照のこと)。 例えば、β-グロビンLCRは、β-グロビン遺伝子座の胎児グロビン遺伝子の上 流に位置するDNaseI高感度部位(すなわち、HS1、HS2、HS3、およびHS4)を含む DNAフラグメントである、十分に規定されている部分を含む;このような部位お よびそれらの検出は、Tuanら、前出、1985)に記載される。HS2、HS3、およびHS 4成分の組み合わせが本発明によるエピソーム性ベクターにおいて使用される場 合、HS2を含むLCR成分の組み合わせは赤血球細胞において外来遺伝子の組織特異 的発現を与えないことを発見した;同様に、HS2とHS3の組み合わせは組織特異的 発現を与えないことを発見した。しかし、H3成分単独は、以下の実施例において 示されるように結合された遺伝子の組織特的発現を与えるに効果的であること; しかし、エンハンサーであることが公知であるHS2成分は、唯一のLCR成分として エピソーム性ベクター上に存在する場合この活性を有しないこともまた発見した 。エピソーム性β-グロビンLCRにおけるHS2の非存在は組織特異的遺伝子発現を 生じることが本発明によって意図される。 本発明の有用なさらなるLCRは、T細胞における遺伝子発現を促進するCD2 LCR (例えば、Greavesら(前出)を参照のこと)、マクロファージ特異的リゾチー ムLCR(Boniferら(前出))、およびクラスII MHC LCR(Carsonら(前出))を 含むが、これらに限定されない。 当業者は、エピソーム上に存在する場合、組織特異的遺伝子発現を与えるβ- グロビンLCR成分、および他のこのようなLCRまたはそれらの成分を見出すための 方法を同定する本開示の利点、ならびに当該分野で利用可能な技術を使用して、 エピソーム性ベクター上に存在する場合組織特異的遺伝子発現を与えるさらなる LCRまたはそれらの成分を同定し得る。 本発明に従って(すなわち、エピソームの状況において)有用であるLCRの成 分を同定するために、当業者は、候補LCR成分およびマーカー遺伝子を含むエピ ソーム性ベクターを、LCRが活性である(すなわち、ゲノムへ組み込まれた場合 、活性である(特定の細胞株))細胞株へ、そしてまたLCRが不活性である(す なわち、ゲノムへ組み込まれた場合、不活性である(非特定の細胞株))ことが 知られる細胞株へ、各LCRまたはその成分(すなわち、LCRのDNase I高感受性部 位)を個々にトランスフェクトすることによって試験し得る。安定なエピソーム について選択した後に、LCR成分が、非特定の細胞株において活性である場合( すなわち、LCR成分が(βグロビンLCRのHS2のように)組織特異的でないことを 示す場合)、LCR成分は、本発明による有用な候補LCR成分としては除外される。 非特定の細胞株において活性でないが、特定の細胞株において活性であるLCR成 分は、安定なエピソームの状況において組織特異性を与える点で本発明に従って 有用である。次いで、本発明に従って有用であると示されるLCR成分は、潜在的 に増強されたレベルの組織特異的発現を与えるために組み合わされ、そしてとも に使用され得る。 必要に応じて、1つ以上の転写ターミネーターはまた、本発明のベクターに組 み込まれて、その発現が特定のLCRまたはその成分の排他的な制御下におかれた 遺伝子を介して進行し得る(すなわち、転写読み通し(readthough))ベクター内 の他の既知のプロモーター配列もしくは潜在的プロモーター配列からの望ましく ない転写を妨げ得る。そのような有用な転写ターミネーターの一例はβグロビン ターミネーターであるが、他の真核生物転写ターミネーターもまた、本明細書中 に記載のベクターにおいて使用され得る。好ましくは、転写ターミネーターは、 LCRまたはその成分と、LCRが作動可能に連結される遺伝子のプロモーターとの間 に配置される。目的の非相同遺伝子または外来遺伝子の選択 本発明のベクターは、特定の組織タイプの細胞における非相同遺伝子または外 来遺伝子の発現において特に有用である。 エピソーム性ベクターに組み込まれ得る治療的核酸配列の例としては、以下が 挙げられる。治療的に有用な核酸配列としては、レセプター、酵素、リガンド、 調節因子、および構造タンパク質をコードする配列が挙げられる。治療的な核酸 配列としてはまた、核タンパク質、細胞質タンパク質、ミトコンドリアタンパク 質、分泌タンパク質、原形質膜会合タンパク質、血清タンパク質、ウイルス抗原 、細菌抗原、原生動物抗原、および寄生生物抗原をコードする配列が挙げられる 。本発明に従って有用な核酸配列としてはまた、タンパク質、リポタンパク質、 糖タンパク質、リンタンパク質、および核酸(例えば、RNAまたはアンチセンス 核酸)をコードする配列が挙げられる。本発明のエピソーム性ベクターを用いて 発現され得るタンパク質またはポリペプチドとしては、ホルモン、成長因子、酵 素、凝固因子、アポリポタンパク質、レセプター、薬物、オンコジーン、腫瘍抗 原、腫瘍サプレッサー、ウイルス抗原、寄生生物抗原、および細菌抗原が挙げら れる。これらの化合物の特定の例としては、プロインスリン、成長ホルモン、ア ンドロゲンレセプター、インスリン様成長因子I、インスリン様成長因子II、イ ンスリン様成長因子結合タンパク質、上皮細胞成長因子、TGF-α、TGF-β、PDGF 、血管形成因子(酸性線維芽細胞成長因子、塩基性線維芽細胞成長因子、および アンジオゲニン)、マトリックスタンパク質(IV型コラーゲン、VII型コラーゲ ン、ラミニン)フェニルアラニン水酸化酵素、チロシン水酸化酵素、オンコジー ン(ras、fos、myc、erb、src、sis、jun)、E6またはE7形質転換配列、p53タンパ ク質、Rb遺伝子産物、サイトカインレセプター、Il-1、IL-6、IL-8、ウイルスキ ャプシドタンパク質、および免疫学的応答を誘導するために使用され得るウイル ス、細菌、寄生生物由来のタンパク質、ならびに体内で有用な有意性のある他の タンパク質が挙げられる。取り込まれ得る遺伝子は、取り込まれるべきタンパク 質およびポリペプチドをコードする核酸配列の有効性によって限定されるのみで ある。 当業者は、より多くのタンパク質およびポリペプチドが、同定されるにつれて、 それらがエピソーム性ベクターに組み込まれ得、そして動物またはヒトの組織に おいて発現され得ることを容易に認識する。 本発明のベクターはまた、例えば、遺伝子産物の用量を増大させるために宿主 細胞(すなわち、ネイティブな遺伝子または相同遺伝子)において既に発現され ている遺伝子を発現するために使用され得る。しかし、相同遺伝子の発現が、細 胞内でのその過剰発現によって、LCR、またはその成分による制御に供され得な い調節を解除された発現を生じ得ることに留意すべきである。ベクター送達 本明細書中に記載の自己複製型LCR(またはその成分)含有エピソーム発現ベ クターの送達のための多数の技術が公知であり、そして本発明に従って有用であ る。その技術には、核酸縮合剤、電気穿孔法、石綿との複合体化、ポリブレン、 DEAEセルロース、デキストラン、リポソーム、リポポリアミン、ポリオルニチン 、粒子ボンバードメント、および直接の微量注入の使用が含まれる(Kucherlapat iおよびSkoultchi,Crit.Rev.Biochem.16:349-379(1984);Keownら,Methods En zymol.185:527(1990)によって総説される)。 本発明のベクターは、ウイルスまたは非ウイルス手段の送達を介して、宿主細 胞に非特異的か、または特異的に(すなわち、宿主細胞の指定されたサブセット に)送達され得る。ウイルス起源の好ましい送達方法には、ウイルスパッケージ ングシグナル(例えば、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、およびパポーバウ イルスのパッケージングシグナル)が本発明のベクターに対するトランスフェク ションレシピエントとしてその中に操作されたウイルス粒子産生パッケージング 細胞株が含まれる。好ましい非ウイルスベース遺伝子送達手段および方法がまた 、本発明において使用され得、そして、核酸縮合ペプチド、リポソーム内へのカ プセル化、そしてエクスビボでの細胞のトランスフェクション、それに続くトラ ンスフェクト細胞の再移植または投与を含み得る。 ウイルス外被タンパク質のアミノ酸配列由来の種々のペプチドが、ポリリジン DNA複合体と同時投与された場合に遺伝子導入において使用され、(Plankら,J. Biol.Chem.269:12918-12924(1994));Trubetskoyら,Bioconjugate Chem.3: 323-327(1992);WO 91/17773;WO 92/19287;およびMackら,Am.J.Med.Sci.307:1 38-143(1994))、このことは陽イオン脂質とのポリリジン結合体の同時縮合は、 遺伝子導入効率における改善を導き得ることを示唆する。PCT公開番号WO 95/026 98は、陽イオン脂質遺伝子導入の効率の増大を試みるためのウイルス成分の使用 を開示する。 本発明において有用な核酸縮合剤としては、スペルミン、スペルミン誘導体、 ヒストン、陽イオン性ペプチド、およびポリリジンが挙げられる。スペルミン誘 導体は、スペルミンの類似体および誘導体をいい、そして国際公開番号WO 93/18 759(1993年9月30日公開)に示される化合物を含む。 ジスルフィド結合を使用して、送達ビヒクルのペプチド成分が連結されている (Cottenら,Meth.Enzymol.217:618-644(1992));Trubetskoyら(前出)もまた参 照のこと)。 DNA構築物を細胞へ送達するための送達ビヒクルは当該分野で公知であり、そ して、例えば、WuおよびWu,J.Biol.Chem.263:14621(1988);Wilsonら,J.Biol. Chem.267:963-967(1992);ならびに米国特許番号5,166,320号に記載のように、 細胞表面レセプターに特異的であるDNA/ポリカチオン複合体を含む。 本発明に従うベクターの送達は、核酸縮合ペプチドを使用して意図される。核 酸構築物の縮合、それゆえ核酸の細胞への送達に特に有用である核酸縮合ペプチ ドは、以下の一般式のアミノ酸配列を含む、 NH2-A-(X1X2Y1Y2)nX3X4-(Z1Z2Z3Z4)-(X5X6Y3Y4)mX7X8BCOOH ここで、X1-8のそれぞれは、独立して側鎖に正に荷電した基を有するアミノ酸で あり;ここで、Y1-4のそれぞれは、独立してαヘリックス形成を促進する天然に 存在するアミノ酸であり;ここで、Z1-4のそれぞれは、独立して安定化されたタ ーン構造を形成するに高い傾向を有する少なくとも3つのアミノ酸を有する天然 に存在するアミノ酸であり;ここで、Aはアミノ末端セリン残基またはトレオニ ン残基であり;ここで、Bは任意のアミノ酸であり;そして、ここでn=2〜4お よびm=2である。 他のペプチドは、X1-8のそれぞれが、独立してリジン、アルギニン、2,4-ジア ミノ-酪酸、またはオルニチンであり;ここで、Y1-4のそれぞれが、独立してグ ル タミン酸、アラニン、ロイシン、メチオニン、グルタミン、トリプトファン、ま たはヒスチジンであり;ここで、Z1-4のそれぞれが、独立してアスパラギン、グ リシン、プロリン、セリン、およびアスパラギン酸であり;ここで、Bはアラニ ン、グルタミン酸、またはシステインのいずれか1つであるものである。 エクスビボまたはインビボのいずれかで核酸の細胞への送達に関与する本発明 のこの実施態様において有用なペプチドが、1つ以上の内在性セリン残基、トレ オニン残基、またはシステイン残基を、好ましくは選択されたリガンドに結合す るように曝露され、従ってαヘリックスの正に荷電した(核酸起源の)表面では ない配列中の位置において含み得ることを本発明に従って意図される。ペプチド 内での選択された反応性アミノ酸残基のこの配置は、核酸に接触するペプチドの 表面に接触しないように配向されて、選択および規定された安定性を有する結合 によって他の機能的ペプチドとこのペプチドとの結合を可能にする、。システイ ンは、チオール側鎖を介して、他の反応性チオール基(ジスルフィドを介して) 、アルキル化官能基(チオエステル結合を形成するため)、または他のチオール 反応性基(例えば、マレイミド誘導体)を含む化合物への特異的結合を可能にす る。 この一般配列内にあるペプチドは、以下を含む。 従って、核酸の送達に有用な核酸縮合ペプチドは、以下:1)ヘリックス形成 アミノ酸、2)核酸の主溝に接触する繰り返し三次元構造、3)定量のための適 切な発色団、および4)補助的機能的ドメインを形成するリガンドの領域特異的 結合のための多数の「ハンドル」(すなわち、反応部位)、を含み得る。 核酸縮合ペプチドはまた、核酸を縮合する能力を有する配列として本明細書中 で同定されたH1の部分(以下の配列I、IIもしくはIII)または他のヒトヒストン 由来の配列(以下の配列IV)を含み得る。それゆえ、核酸縮合ペプチドは、全配 列長が17残基より上である以下の3つのコンセンサス配列の直線的組合せを含み 得る: 配列I:-K-K-X-P-K-K-Y-Z-B-P-A-J- ここで:Kはリジンであり、Pはプロリンであり;Aはアラニンであり;Xはセリン 、 トレオニン、またはプロリンであり;Yはアラニンまたはバリンであり;Zはアラ ニン、トレオニン、またはプロリンであり;Bはリジン、アラニン、トレオニン 、またはバリンであり;そしてJはアラニンまたはバリンである。 配列II:-X-K-S-P-A-K-A-K-A- ここで:Xはアラニンまたはバリンであり;Kはリジンであり;Sはセリンであり ;Pはプロリンであり;そして、Aはアラニンである。 配列III:-X-Y-V-K-P-K-A-A-K-Z-K-B- ここで:Xはリジンまたはアルギニンであり;Yはアラニンまたはトレオニンであ り;Zはプロリン、アラニン、またはセリンであり;Bはリジン、トレオニン、ま たはバリンであり;Kはリジンであり;Pはプロリンであり;Aはアラニンである 。 配列IV -A-B-C-D-E-F-G-H-I-J-K- ここで:Aは好ましくはリジンまたはトレオニンであり;Bは好ましくはグリシン またはグルタミンであり;Cは好ましくはグリシンであるが、アスパラギン酸、 グルタミン酸、またはセリンでもあり得;Dは好ましくはグリシンであるが、リ ジン、バリン、グルタミン、またはトレオニンでもあり得;Eは好ましくはリジ ンまたはアラニンであり;Fは好ましくはアラニンまたはリジンであり;Gは好ま しくはアルギニンであるが、バリンまたはイソロイシンでもあり得る;Hは好ま しくはアラニンであるが、トレオニン、ヒスチジン、またはプロリンでもあり得 る;Iは好ましくはリジン、アルギニン、またはグルタミンである;Jはアラニン またはアルギニンである;そして、Kは好ましくはリジンまたはグルタミンであ る。好ましいコンセンサス配列は: -K-G-G-G-K-A-R-A-K-A-K- である。 そのようなペプチドの1つはNBC1であり、以下のような構造を示す: NH2-[SV40 NLS]-[配列I]-[配II]-[配列III]-[SV40 NLS]-[配列I]-C-COOH、ここ で-C-はシステインであり;ここでSV40 NLSは 配列 Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val-Gln;および、配列 である。 本発明の他のこのような核酸縮合ペプチドは、以下の一般配列に含まれるアミ ノ酸配列を有する: NH2-X-(Y)n-C-COOH,ここでXは存在しないかまたはセリンもしくはトレオニン のいずれかであり;Yは、上記に定義されたように、配列I、II、またはIIIのい ずれかであり;nは2〜6であり;そしてCはシステインである。 他のこのようなペプチドは、以下の構造および配列を有する:NBC2は、構造: NH2-[配列III]-[SV40 NLS1]-[配列I]-C-COOH(ここで、-C-はシステインである) を有する。 NBC8は、構造:NH2-[配列I]-[配列I]-C-COOH(ここで、-C-はシステインである )を有する。 NBC9は、構造:NH2-[配列I]-[配列I]-[配列I]-C-COOH(ここで、-C-はシステイ ンである)を有する。 NBC10は、構造:NH2-[配列I]-[配列I]-[配列I]-[配列I]-C-COOH(ここで、-C- はシステインである)を有する;これらのアミノ酸配列は、以下の通りである: 上記のように、低い多分散指標(polydispersion index;PDI)を有する核酸縮 合ペプチドは、本発明に従う核酸の細胞への送達に有用である。このようなペプ チドのPDIは、エレクトロスプレー質量分析法によるそのペプチドの分析から算 出され得る。この方法は、各成分の正確な質量を0.001%以内で与える。本発明 において有用なペプチド調製物のPDI値は、1.0〜1.100の範囲内である。本発明 において特に有用であるペプチド調製物は、1.01未満のPDIを有し、そして1.001 未満のPDIさえ有する。 第1の核酸縮合ペプチドは、8〜24個の正に荷電したアミノ酸側鎖を含み得る ;例えば、正に荷電したアミノ酸側鎖の数は、12〜18の範囲であり得る。 特定の哺乳動物細胞タイプを標的化し得る合成ウイルス様粒子における正電荷 /負電荷の比は、その核酸中の1リン酸残基あたり0.5〜3の範囲内である;した がって、この比はまた、0.8〜1.2の範囲内であり得る。 標的化する細胞タイプに関して限定されない合成ウイルス様粒子における正電 荷/負電荷の比は、その核酸中の1リン酸残基あたり0.5〜5の範囲内であり、し たがってまた1.2〜2の範囲内であり得る。 官能基が、本発明に従うベクターの送達に有用なペプチドに結合され得る。こ れらの官能基には、特定の細胞タイプを標的化するリガンド(例えば、モノクロ ーナル抗体、インスリン、トランスフェリン、アシアロ糖タンパク質、または糖 )が含まれ得る。したがって、リガンドは、非特異的様式で、または細胞タイプ に関して限定される特異的様式で細胞を標的化し得る。 官能基はまた、脂質(例えば、パルミトイル、オレイル、またはステアロイル) ;中性親水性ポリマー(例えば、ポリエリレングリコール(PEG)、またはポリビニ ルピロリジン(PVP));融合性(fusogenic)ペプチド(例えば、インフルエンザウイ ルスのHAペプチド);またはリコンビナーゼもしくはインテグラーゼを含み得る 。官能基はまた、核局在化配列(NLS)のような細胞内輸送タンパク質を含み得る 。 送達に特に好ましい(すなわち、第2の官能基が、核酸縮合ペプチドと直接結 合した第1の官能基に共有結合される)実施態様において、第1の官能基は、脂 質またはPEGのような中性親水性ポリマーの1つを含み得、そして第2の官能基 は、細胞表面レセプターを標的化するリガンドを含み得る。例えば、第1の官能 基が脂質を含む場合、第2の官能基は、細胞レセプターを標的化するリガンドを 含み得る。第1の官能基がPEGを含む場合、第2の官能基は、細胞レセプターを 標的化するリガンドを含み得る。リガンドは、例えば、糖部分、またはその細胞 レセプターが細胞タイプに限定されるリガンドの1つであり得、したがって、標 的細胞集団は、細胞タイプに関して限定されなくてもよいし、または限定されて もよい。あるいは、第1の官能基が脂質を含む場合、第2の官能基はPEGを含み 得る。 上記の核酸縮合ペプチド/ベクターDNA組成物を、以下の通りに調製し得る。組 成物を、核酸およびペプチド調製物が、等容量の同じ緩衝液(通常、0.15M〜1.0M NaCl;25mM HEPES,pH7.4)中に調製されるように処方する。縮合ペプチド調製物 を、0.1容量/分の速度で添加される間、核酸は振盪またはボルテックスする。複 合体を、標的細胞への添加の前または被験体への投与の前に、少なくとも30分間 室温で放置し、そして4℃で保存し得る。この粒子を遠心分離し、凝集物質を除 去する。 細胞標的化のための上記のDNA/ポリカチオン複合体に加えて、核酸を含有する 細胞標的化リポソームを調製する方法は、先行技術において公知である。リポソ ームは、細胞膜を形成する脂質と類似の様式で配置した脂質から構成される中空 の球状小胞である。これらは、水溶性化合物を捕捉するための内部水性空間を有 し、そしてサイズが、直径0.05ミクロン〜数ミクロンの範囲である。いくつかの 研究により、リポソームは核酸を細胞に送達し得ること、およびその核酸は生物 学的に活性のままであることが示されている。 例えば、本来研究ツールとして設計されたリポソーム送達ビヒクル(Lipofecti n)は、インタクトなmRNA分子を細胞に送達し、対応するタンパク質の産生を生じ ることが示された。 リポソームはいくつかの利点を提供する:これらは、組成が非毒性および生分 解性であり;これらは長い循環半減期を示し;そして組織への標的化のために、 認識分子がその表面に容易に付着され得る。最後に、リポソームベースの薬剤( 液体懸濁物または凍結乾燥物としてのいずれか)の費用効率の高い製造は、受容 可能な薬物送達系としてのこの技術の実行可能性を示している。標的化リポソー ムの例は、免疫リポソームである。リポソームは、例えば、リポソーム表面上へ のタンパク質(例えば、免疫グロブリン)の吸着;リポソーム膜の形成(例えば、 超音波処理、界面活性剤透析または逆相エバポレーションによる)の間のそのリ ポソーム膜へのネイティブなタンパク質の組込み;リポソーム膜中に組み込まれ た反応性化合物へのタンパク質の(直接またはスペーサー基を介する)共有結合; リポソーム形成の間の、または予め形成したリポソームとのインキュベーション による、改変タンパク質の非共有性疎水性結合;および間接的な結合(リポソー ムへのポリマーを介した免疫グロブリンタンパク質の共有結合を含む)によって 調製される(Torchilin,V.P.CRC Critical Reviews in Therapeutic Drug Carr ier Systems,2(1)を参照のこと)。核酸−リガンド複合体とレセプターとの結合 は、レセプター媒介エンドサイトーシスによるその核酸の取り込みを容易にする 。 アデノウイルスキャプシド(これは、エンドソームを自然に崩壊させ、それに より細胞質中に物質を放出させる)に結合させた核酸−リガンド複合体は、細胞 内リソゾームによるこの複合体の分解を回避するために使用され得る(例えば、C urielら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:8850(1991);Cristianoら、Proc.Natl.Ac ad.Sci.USA 90:2122-2126(1993)を参照のこと)。レセプター媒介核酸取り込みは 、インビトロまたはインビボのいずれかで細胞へ核酸を導入するために使用され 得、そしてさらに、核酸が、目的の標的細胞に選択的に発現するレセプターに結 合するリガンドの使用により、特定の細胞タイプに選択的に標的化され得るか、 または標的細胞タイプに関して非選択性であり得るというさらなる特徴を有する 。 送達ビヒクルの種々の成分の正確な化学量論比は、初期の免疫応答の大きさ、 送達の効率、および細胞への特異的標的化の程度を制御するために変更され得る 。 細胞への非特異的送達の場合、細胞表面レセプターを標的化する非特異的リガ ンドが使用され得る;特異的送達の場合、特定のサブセットの細胞を標的化する リガンドが使用され得る。例えば、可溶性DNA/ポリリジン複合体が作成され得る (Liら、Biochem.J.12:1763(1973))。アシアロ糖タンパク質を付されたポリリジ ン複合体は、インビトロでDNAを肝細胞に標的化するために使用されている(Wuお よびWu、J.Biol.Chem.262:4429(1987);米国特許第5,166,320号)。ラクトシル 化ポリリジン(Midouxら、Nucleic Acids Res.21:871-878(1993))およびガラク トシル化ヒストン(Chenら、Human Gene Therapy 5:429-435(1994))は、プラスミ ドDNAを、レクチンレセプターを有する細胞に標的化するために使用され、ポリ リジンに結合したインスリン(Rosenkrantzら、Exp.Cell Res.199:323-329(1992 ))は、プラスミドDNAを、インスリンレセプターを有する細胞に標的化するため に使用されている。モノクローナル抗体は、DNAを特定の細胞タイプに標的化す るために使用されている(Machyら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:8027-8031(1988 );Trubetskovら、前出、ならびにWO 91/17773およびW0 92/19287)。 好ましい実施態様において、リガンドは、本発明のベクターを特定タイプの組 織の細胞に標的化するための送達ビヒクルに含まれる。好ましくは、リガンドは 、特定タイプの組織の細胞表面に発現するエピトープに特異的である。特定のガ ン組織について、好ましいリガンドには、抗体またはそのフラグメント、例えば 、結腸ガンに発現するCanAgのCA242ドメインを認識するモノクローナル抗体C242 (Lindholmら、Int.Arch.Allergy Appl.Immunol.71:171-181(1983)およびLarson ら、Int.J.Cancer 42:877-882(1983));乳ガン細胞により発現される多形性上皮 ムチン(PEM)を認識するモノクローナル抗体SM3(Burchellら、Cancer Research 4 7:5476-5482(1983))、およびヒトグリア腫瘍の上皮成長因子レセプターに見出さ れるが、正常組織には見出されない新規エピトープを認識するモノクローナル抗 体(Moscatelloら、Cancer Res.55:5536-5539(1995))が含まれる。さらに、成長 因子もまた、肺瘍を標的化するために使用され得る。例えば、上皮成長因子(EGF )レセプターは、肺ガン細胞に過剰発現し、したがってEGFは、送達ビヒクルを肺 ガンに標的化するためのリガンドとして使用され得る(Cristianoら、Cancer Gen e Therapy 3:4-10(1996))。 さらに、特定の可溶性巨大分子が、特定の腫瘍タイプの受動的腫瘍標的化のた めに使用され得る。多くの固形脛瘍は、巨大分子に対して高透過性である血管系 を有する。この理由は明確には理解されていないが、結果は、このような腫瘍は 循環する巨大分子を選択的に蓄積し得るということである。亢進した透過性およ び保持の効果(EPR効果)は、SMANCS(スチレン/マレイン酸−無水物−ネオカルチ ノスタチン;現在、日本において、肝ガンの処置に正規に臨床的に使用されてい る)の作用機構を構成すると考えられる。抗ガン活性について研究中である別の クラスの結合体は、N-(2-ヒドロキシプロピル)メタクリルアミドコポリマー−ア ントラサイクリン結合体である(Seymour,L.、CritiCal Reviews in Therapeuti c Drug Carrier Systems 9(2):135-187(1992))。したがって、スチレン/マレイ ン酸−無水物を含むポリマーまたはN-(2-ヒドロキシプロピル)メタクリルアミド コポリマーは、本発明の送達ビヒクルを標的化するためのリガンドとして使用さ れ得る。薬学的組成物および治療的使用 本発明の薬学的組成物は、疾患を処置するためか、または特定組織の細胞に有 利なタンパク質もしくは機能を提供するための治療について、本発明の自己複製 型エピソーム性ベクターまたは送達組成物を、所望であれば、薬学的に受容可能 なキャリアまたは希釈剤と混合して含み得る。 本発明の自己複製型エピソーム性LCR含有ベクターまたは本発明のベクターを 含む組成物もしくは送達ビヒクルは、筋肉内、静脈内、エアロゾル、経口(錠剤 または丸剤形態)、局所的、全身的、眼、坐剤として、腹腔内および/または鞘内 を含む経路を介して、ならびに腫瘍塊へのベクターDNAもしくは送達ビヒクルの 直接注入により投与され得る。 正確な投薬療法は、もちろん、個々の患者に関して個々の医師によって決定さ れる必要があり、これは、目的の遺伝子により発現されるタンパク質の正確な性 質、および処置のために標的化される組織のタイプによって制御される。 投薬はまた、疾患適応および投与経路に依存する。有利なことに、本発明のベ クターは、特定組織の細胞においてのみ、すなわち、LCRまたはその成分が機能 的である組織の宿主細胞においてのみ、選択された遺伝子の長期間発現を提供す るように設計される。したがって、このような宿主細胞において、処置の持続時 間は、一般に、継続的であるか、または細胞が死滅するまでである。用量の数は 、疾患および臨床試験からの効力データに依存する。 本発明に従う効果的な遺伝子治療のために送達されるベクターDNAの量は、体 重1kgあたり約50ng〜1000μgの間のベクターDNAの範囲であり、そして好まし くは、体重1kgあたり約1〜100μgの間のベクターDNAの範囲である。 インビボでの細胞取り込みのためにエピソーム性ベクターを哺乳動物に投与す ることは、本発明によれば好ましいが、本明細書に記載されたベクターは、エク スビボアプローチを利用して投与され得る。このアプローチにより、細胞は、動 物から取り出され、特定のLCRもしくはその成分の制御下に選択された遺伝子を 含むエピソーム性ベクターで形質導入され、次いで動物に再移植される。例えば 、肝臓は、エクスビボアプローチにより、動物から肝細胞を取り出し、選択され たタンパク質をコードする遺伝子もしくは治療的核酸を含むエピソーム性ベクタ ーでその肝細胞をインビトロで形質導入し、そして形質導入した肝細胞を動物に 再 移植する(例えば、Chowdhuryら、Science 254:1802-1805,1991によりウサギに ついて、またはWilson、Hum.Gene Ther.3:179-222,1992によりヒトにおいて記 載されたように)ことによって利用され得る。このような方法はまた、本発明の 発現ベクターを循環系もしくはリンパ系における種々の細胞集団(例えば、赤血 球、T細胞、およびB細胞)に送達するために有効であり得る。組織特異性の試験または遺伝子療法の有効性のためのトランスジェニック動物 本発明の別の実施態様では、本発明の自己複製型エピソーム性LCR含有ベクタ ーを用いる組織特異性および/または遺伝子療法の有効性を決定するための哺乳 動物モデルが提供される。この哺乳動物モデルは、その細胞が本発明のベクター を含むトランスジェニック動物を包含する。トランスジェニックマウス(Gordon ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:7380(1980); Harbersら、Nature 293:54 0(1981);Wagnerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:5016(1981);およびWagne rら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:6376(1981)、ヒツジ、ブタ、ニワトリ(Ha mmerら、Nature 315:680(1985)を参照のこと)などを作成する方法は、当該技術 分野で周知であり、そして本発明による使用に考慮される。このような動物は、 ヒトにおける臨床試験の前の試験を可能にする。 例えば、トランスジェニック動物は、腫瘍または腫瘍が発生する性向を有し得 る。Stewartら、Int.J.Cancer 53:1023(1993)は、T細胞腫瘍を有するトラン スジェニックマウスを記載している。Teitzら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90 :2910(1993)は、横紋筋肉腫およびインスリン産生性膵臓ランゲルハンス島肺瘍 を有するトランスジェニックマウスを記載している。腫瘍細胞においてのみ発現 されるべき選択された遺伝子を含むエピソーム性ベクターは、これらの腫瘍を保 持する任意のマウスから卵子中に導入され、LCR、またはその成分が、選択され た遺伝子の発現を腫瘍細胞に厳密に制限するか否かを決定し、そしてまた、この ような腫瘍細胞中の選択された遺伝子を発現する結果を測定するための動物モデ ルを作成し得る。 本発明の自己複製型のLCR含有エピソーム性ベクターを含むトランスジェニッ ク動物はまた、組織特異的様式で目的のタンパク質の長期間産生のために用いら れ得る;例えば、βグロビンLCRまたはHS3と4との組合せまたはHS3単独を用い るトランスジェニック動物の赤血球細胞におけるヒトグロビンの産生、あるいは LCRマクロファージ/リゾチームLCRを用いるトランスジェニック動物のミルク中 の目的のタンパク質の産生。 以下の実施例は例示により提供され、そして本発明をいかなる様式においても 制限する意図はない。本発明のいくつかの代表的な構築物の調製、試験および分 析を以下に詳細に記載する。当業者は、異なるエピソーム性ベクター、異なるLC R、またはその成分、および異なる目的の遺伝子を用いて、本発明の他のベクタ ーの調製および試験のために、これらの手順を適合し得る。 実施例1 試験遺伝子構築物およびベクター系の調製1.EBVベクター 本発明による有用な1つのEBVを基礎にするベクターはp220.2ベクターである( 図1)。このp220.2ベクターは、(i)EBV由来のOriPおよびEBNA-1遺伝子、(ii)安 定なトランスフェクトされた真核生物組織培養細胞の選択のためのハイグロマイ シン耐性遺伝子、(iii)試験遺伝子のためのポリリンカークローニング部位およ び(iv)真核生物細胞中のEBNA-1遺伝子の発現を駆動する弱い真核生物プロモータ ー配列を含むpBR322ベクター骨格を含む。2.レポーター遺伝子 LCR活性を評価するために用いられるレポーター遺伝子(図2)は、ヒトβグロ ビン:815塩基対(bp)5'および1685 bp 3'フランキング配列を有する4.1 kb Hpal -EcoRVフラグメント;(Fritschら、Cell 19:959-972(1980);Lawnら、Cell 19:9 59-972(1980))に由来した。 このレポーター遺伝子を、平滑末端連結により、p220.2の特有のポリリンカー HindIII部位中に別にクローン化した(図2)。3.βグロビンLCR試験構築物 3つのβグロビンLCR成分は、DNase1過感受性部位HS2、HS3およびHS4である( Collisら、EMBO J.9:223-240(1990))。これら成分は、1.5−2kbフラグメン トとして、個々に、または2つまたは3つの部位の組合せ(以下を参照)で、p220 .2のSalI部位中に、βグロビンまたはγH2Kレポーター遺伝子の上流にクローン 化した(図3)。 実施例2 組織培養細胞の安定なトランスフェクションの分析 EBVを基礎にするベクターは、霊長類細胞またはヒト細胞における自己複製型 エピソームとして最も安定である。従って、βグロビンLCR試験遺伝子構築物の 安定なトランスフェクションは、ヒト骨髄性白血病細胞株K562(LozzioおよびLoz zio、Blood 45:321-334(1975))中で実施した。この細胞株は、胚(ε)および胎児 (γ)パターンのグロビン遺伝子発現(Andersonら、Int.J.Cancer 23:143-147(1 979))を示し、そして先にβグロビンLCR機能を評価するために首尾良く用いられ ている(Blom van Assendelftら、Cell 56.969-977(1989))。1.トランスフェクション方法 K562細胞(107)を、Antoniou、1991に記載されるように、960μF、および300V に設定したBio Rad Gene Pulser(BioRad、Hercules、CA)を用い、50μgのスー パーコイル試験構築物DNAを用いたエレクトロポレーションによりトランスフェ クトした。各エレクトロポレーションしたサンプルを、安定なトランスフェクト された細胞の2つの独立のプールを生成するために、2つの75cm2組織培養フラ スコに等分した。ハイグロマイシンB(250μg/ml)を、エレクトロポレーション の24時間後に添加し、そしてその後この濃度で維持した。非トランスフェクト細 胞の細胞死は、7−10日後(約10の細胞分裂に相当)に明らかであり、そしてト ランスフェクト細胞のコンフルエントフラスコがその7日後に得られた。2.トランスフェクト細胞からのRNAおよびDNA調製 (i)総RNAを、3M LiClおよび6M尿素(AuffreyおよびRougeon、Eur.J.Biochem. 107:303-314(1980))の存在下の選択的沈殿により調製した。 (ii)総ゲノムDNAは、単離された核から調製した。細胞(〜2×107)を、RSB(10mM Tris-HCl pH7.5,10mM NaCl,3mM MgCl2)プラス0.1%NP40中で破壊した後、遠 心分離により核をペレット化した。次いで、核を、TNE(150mM Tris-HCl,pH7. 5,100mM NaCl,5mM EDTA)、1%SDSおよび50μg/mlプロテイナーゼK中に再懸 濁することにより溶解し、そして55℃で一晩インキュベートした。次いで、等容 量のフェノール/クロロホルム(1:1)で1回抽出し、そして0.7容量のイソプロ パノールを用いて水相からDNAを沈殿させた。得られるDNA沈殿物を、溶液から巻 き取り、70%エタノール中で1回洗浄し、そして200μl(7)TE(10mM Tris-Cl.0. 1mM EDTA,pH8.0)中に溶解した。3.試験遺伝子の発現の分析 トランスフェクトされた遺伝子の発現は、βグロビン(Antoniouら、(1988))ま たはγH2K遺伝子の5'領域からの末端標識DNAプローブを用いるSI-ヌクレアーゼ 保護アッセイ(Antoniouら、Human Genetic Disease Analysis.A Practical App roach(第2版)(1993))により評価した。これらのプローブは、正確な野生型のキ ャップ部位からの開始により生じたこれらの転写物のみを検出する(図4および 図5、下のパネル)。内部標準として、すべてのサンプルは、遺伝子の3'末端か らのプローブを用いて内因性γグロビンmRNAについて同時にアッセイした(図4 、下のパネル)。4.トランスフェクトされたDNAのエピソームの状態とコピー数の評価 (a)エピソームの状態 単離された核からの総DNA(10μg)をPvulおよびDpnI(6単位)で一晩消化し、 そして0.6%アガロースゲル上の電気泳動により分離し、そしてMagnacharge Plu sナイロントランスファーメンブレン上にサザンブロットした。DpnI消化は、残 りの細菌由来プラスミドDNAが破壊されることを確実にする。次いで、このブロ ットを、ニックトランスレーションにより32Pで標識されたp220.2ベクターでプ ローブした。エピソームの形態にあるトランスフェクトされたDNAは、試験構築 物のサイズに依存して、12−17.5kbの線状分子として現れる。 (b)エピソームコピー数 同量のDNAを、EcoRIおよびDpnIで消化し、そして上記のようにサザンブロット した。このブロットを、βグロビン遺伝子のイントロンIIにまたがる920bpのBam HI-EcoRIフラグメントでプローブした。これにより、3コピーの内因性βグロビ ン遺伝子からの5.5kbフラグメントおよびトランスフェクトされた構築物からの 7.2−12.7kbフラグメントを検出した。 実施例3 1.βグロビンレポート遺伝子構築物の発現分析 図4(上のパネル)は、トランスフェクトされた遺伝子構築物の発現に対する、 S1ヌクレアーゼ保護アッセイによるRNAの分析からのオートラジオグラムを示す 。部位は、EBVを基礎にする自己複製型エピソーム性発現ベクターp220.2中のβ グロビン遺伝子に連結され、そしてK562細胞中に安定にトランスフェクトされた 。総RNAを、プローブの混合物を用いるS1ヌクレアーゼ保護アッセイにより分析 し、移入遺伝子からのβグロビン5'mRNAおよび内部対照として作用する内因的に 発現したγグロビンmRNA(3'γ)の両方を同時に検出した。図4中の結果の定量化 は、Phosphorimager(Molecular Dynamics)によるもので、そして表1に要約する 。 この実験では、βグロビン遺伝子単独ではほとんどまたはまったく発現が見ら れなかった(自己複製型エピソーム性ベクターではLCR成分は存在しない)(レーン β1)。HS2またはHS4のいずれかを含むベクターは、少ない程度のみ発現が改良 された(レーン2βおよび4β)。対照的に、HS3(レーン3β)単独を含むベクタ ーは、HS2またはHS4単独のいずれかを含むベクターより10倍より多い発現レベル を与えた。HS3を含むベクターを用いて得た発現のレベルは、HS2/HS3の組合せを 含むベクター(レーン23β)またはHS3/HS4の組合せを含むベクター(レーン34β) で得られた発現レベルに匹敵した。HS2/HS4ベクター(レーン24β)は、2部位構 築物の最も弱い転写活性を与えた。最も高い転写レベルは、すべての3つのβグ ロビンLCRエレメント(HS2、3、4)の組合せを含むベクターを用いて得られた(レ ーン234β)。このレベルは、HS3単独またはHS2/HS3およびS3/HS4 2部位構築物 の少なくとも約2倍の大きさであった。 この実験を繰り返し、そしてその結果を図6に示す。この繰り返された実験の 結果は、βグロビン遺伝子単独ではK562細胞中で発現し得ないことを再び示した (レーンβ)。βLCR HS2(レーン2β)またはHS3(レーンβ3)のいずれかの添加は 、匹敵する程度まで発現の有意な増加を与えた。HS4(レーンβ4)は、βグロビ ン遺伝子単独の発現を超えて発現を改変しなかった。2つのβLCR HS部位の組み 合 わせ(レーン23β、34βおよび24β)はすべて、HS部位単独のいずれの発現をも超 える増加した発現を示した。3つのHS部位のすべての組み合わせ(レーン234β) は、前に見られるように最高レベルの発現を与えた。図6中の結果は、図4中に 示される結果を本質的に確認し、そしてHS2単独を用いた発現を示す。 表1:K562細胞中の自己複製型EBVを基礎にするエピソーム性ベクター中のβLCR の制御下のヒトβグロビンの発現。 この表は、Molecular Dynamics phosphorimagerを用いる自己複製型のEBVを基 礎にするベクターp220.2(図3)中の、ヒトβグロビン遺伝子単独(β-1)または βLCRのDNaseI過感受性(HS)部位の異なる組み合わせの制御下のいずれかで安定 にトランスフェクトされたK562細胞からのRNAの、図4中に示されるS1ヌクレア ーゼ保護アッセイの定量化を示す。 実施例4 EBVを基礎にする自己複製型エピソーム性ベクターp220.2(図2および3を参照 のこと)中の、単独(β)またはβLCR HS2(2β)、HS3(3β)およびHS2、3および4 (5β)の制御下のいずれかのヒトβグロビン遺伝子を、エレクトロポレーション により(本文を参照のこと)、K562(パネルA)およびHeLa(パネルB)細胞中に安定 にトランスフェクトした。スーパーコイルプラスミドDNA(50μg)を、2×107細 胞と混合し、そしてBio Rad Gene Pulser setを用い、300Vで960μFのシングル パルスエレクトロポレーションにかけて送達した。安定にトランスフェクトした 細胞を250μgのハイグロマイシンで選択した。総RNAを、生成され、そして末端 標識されたDNAプローブを用いるS1ヌクレアーゼ保護アッセイにより移入遺伝子 発現について分析された安定にトランスフェクトされたプールから抽出した。ト ランスフェクトされた遺伝子からのβグロビンmRNAは、図4に示されるように同 じ5'プローブ(5'β)を用いて検出した。207ヌクレオチド(5'γ)の保護されたフ ラグメントを与える5'エクソンIIプローブを用いたγグロビンmRNAの検出は、K 562細胞中で内部対照として作用した。構成的にかつ遍在して発現されたhnRNPA2 に対するmRNAは、HeLa細胞由来サンプル中の内部対照としてプローブされた(122 ヌクレオチドS1保護フラグメントA2を与える)。結果を図5に示す。 この結果は、HS3単独を保持するエピソーム性ベクターが組織特異的に、すな わちK562細胞では発現するが、HeLa細胞中では発現しないことを示し、その一方 、HS2単独を保持するか、またはHS2、3および4を保持するエピソーム性ベクター は、K562およびHeLa細胞の両方で発現するので、組織特異的に発現しないことを 示す。従って、エピソーム性ベクター中のHS2の存在は、目的の遺伝子の発現を もたらすが、組織特異的様式ではなく、その一方、HS3単独の存在(すなわちHS2 の非存在下)は、目的の遺伝子の組織特異的様式発現をもたらす。従って、HS2の ような古典的エンハンサーは(そのコア内のNF-E2/AP-1ダイマー結合部位に局在 化される)、(Tuanら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:2554-2558(1989);Neyら 、Genes Dev.4:993-1006(1990a);およびNeyら、Nuc.Acids Res.18:6011-6017 (1990b))、組織特異性を規定するLCRまたはLCR成分から、前者が本発明による組 織 特異的転写を与える能力がないことにより区別可能である。
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Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.組織に制限される様式で、宿主細胞中の目的の遺伝子を発現するための自己 複製型エピソーム性DNA発現ベクターであって、該ベクターは以下: (a)自己複製型の複製起点;および (b)LCRまたはその成分であって、それは、目的の遺伝子に作動可能に連結さ れ、そして宿主細胞中に存在する場合、組織に制限される様式で該遺伝子の発現 を指向する、LCRまたはその成分、 を含む、ベクター。 2.LCRまたはその成分に作動可能に連結された目的の遺伝子をさらに含む、請 求項1に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 3.前記LCRの成分が、本質的にHS3からなるβ-グロビンLCRの成分である、請求 項2に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 4.前記LCRまたはその成分が、部位HS2を除く前記β-グロビンLCRまたはその成 分である、請求項2に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター 5.前記LCRの成分が、本質的にHS3およびHS4からなるβ-グロビンLCRの成分で ある、請求項2に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 6.前記複製起点がウイルスの複製起点である、請求項1〜5のいずれか1項に 記載の自己複製型エピソーム性DNAベクター。 7.前記ウイルスの複製起点がエプスタインバーウイルス由来の複製起点である 、請求項6に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 8.宿主細胞において該発現ベクターの複製のために必要とされる複製因子をコ ードする配列をさらに含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載の自己複製型エ ピソーム性DNA発現ベクター。 9.前記複製因子をコードする前記配列が、エプスタインバーウイルスのEBNA-1 をコードする配列、パピローマウイルスのE1をコードする配列、およびパピロー マウイルスのE2をコードする配列からなる群より選択される、請求項8に記載の 自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 10.前記発現ベクターで安定にトランスフェクトされた培養物中の細胞を選択 するための抗生物質耐性遺伝子をさらに含む、請求項1〜9のいずれか1項に記 載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 11.前記LCRと目的の遺伝子との間に置かれ、それらの間の転写を妨げるよう に作用する真核生物の転写終結配列をさらに含む、請求項1〜10のいずれか1 項に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベクター。 12.組織に制限される様式で、宿主細胞において目的の遺伝子を発現するため の自己複製型エピソーム性DNA発現系を含む、1対のベクターであって、該1つ のベクターは以下: i.(a)複製起点; (b)LCRまたはその成分であって、それは、目的の遺伝子に作動可能に連 結され、そして宿主細胞中に存在する場合、組織に制限される様式で、該遺伝子 の発現を指向する、LCRまたはその成分;および (c)目的の遺伝子のためのクローニング部位; を含む第1のベクター;ならびに ii.(a)複製起点;および (b)複製タンパク質をコードする配列であって、該複製タンパク質は、 該複製起点の複製のために必要とされる、配列; を含む第2のベクター、 を含む、1対のベクター。 13.LCRまたはその成分に作動可能に連結される目的の遺伝子をさらに含む、 請求項12に記載の1対のベクター。 14.前記LCRの成分が、本質的にHS3からなる前記β-グロビンLCRの成分である 、請求項12または請求項13に記載の1対のベクター。 15.前記LCRまたはその成分が、部位HS2を除く前記β-グロビンLCRまたはその 成分である、請求項12または請求項13に記載の1対のベクター。 16.前記LCRの成分が、本質的にHS3およびHS4からなるβ-グロビンLCRの成分 である、請求項12または請求項13に記載の1対のベクター。 17.前記複製起点がウイルスの複製起点である、請求項12〜16のいずれか 1項に記載の1対のベクター。 18.前記ウイルスの複製起点がエプスタインバーウイルス由来である、請求項 17に記載の1対のベクター。 19.前記複製因子をコードする前記配列が、エプスタインバーウイルスのEBNA -1をコードする配列、パピローマウイルスのE1をコードする配列、およびパピロ ーマウイルスのE2をコードする配列からなる群より選択される、請求項12〜1 6のいずれか1項に記載の1対のベクター。 20.前記各第1のベクターおよび第2のベクターが、該発現ベクターで安定に トランスフェクトされた培養物中の細胞を選択するための抗生物質耐性遺伝子を 個々にさらに含む、請求項12〜19のいずれか1項に記載の1対のベクター。 21.前記第1のベクターが、前記LCRと、目的の遺伝子のためのクローニング 部位との間に置かれる真核生物転写終結配列をさらに含む、請求項12〜20の いずれか1項に記載の1対のベクター。 22.特定の組織型の細胞における目的の遺伝子を発現するための方法であって 、請求項1〜11のいずれか1項に記載の自己複製型エピソーム性DNA発現ベク ター、または請求項12〜21のいずれか1項に記載の1対のベクターを、哺乳 動物に投与する工程を包含する、方法。 23.培養物における宿主細胞中の目的の遺伝子の持続性組織特異的発現を得る 方法であって、請求項1〜11のいずれか1項に記載のベクター、または請求項 12〜21のいずれか1項に記載の1対のベクターでトランスフェクト宿主細胞 を培養する工程を包含する、方法。 24.請求項1〜11のいずれか1項に記載の発現ベクター、または請求項12 〜21のいずれか1項に記載の1対のベクターを含む細胞を含む、トランスジェ ニック動物。 25.エピソーム性DNA発現ベクター中に含まれ、目的の遺伝子に作動可能に連 結され、そして宿主細胞中に存在する場合、組織に限定される様式で該遺伝子の 発現を指向するLCRまたはその成分を同定するための方法であって、以下: i.該LCRが組み込まれる場合活性である細胞株中、また該LCRが組み込まれる場 合不活性である細胞株中に、マーカー遺伝子に作動可能に連結される候補LC Rまたはその成分を含むエピソーム性ベクターをトランスフェクトすること によって、該LCRまたはその成分を試験する工程;および ii.該LCRが組み込まれる場合活性である細胞株において活性のみである該LCR またはその成分を同定する工程、 を包含する、方法。
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