JP2010162020A - 新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 - Google Patents
新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2010162020A JP2010162020A JP2009282756A JP2009282756A JP2010162020A JP 2010162020 A JP2010162020 A JP 2010162020A JP 2009282756 A JP2009282756 A JP 2009282756A JP 2009282756 A JP2009282756 A JP 2009282756A JP 2010162020 A JP2010162020 A JP 2010162020A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- hla
- drb1
- sequence
- allele
- amino acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 101150018610 HLA-DRB1 gene Proteins 0.000 title claims abstract description 15
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims abstract description 19
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims abstract description 19
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims abstract description 19
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract description 11
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 3
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 36
- 108010058597 HLA-DR Antigens Proteins 0.000 claims description 15
- 102000006354 HLA-DR Antigens Human genes 0.000 claims description 15
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 11
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 7
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 6
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 5
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 abstract description 28
- 108010039343 HLA-DRB1 Chains Proteins 0.000 abstract description 9
- 102100040485 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1 beta chain Human genes 0.000 abstract description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 abstract description 5
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 abstract description 4
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 abstract description 4
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 abstract description 4
- 239000011324 bead Substances 0.000 abstract description 3
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 abstract description 2
- 101001100327 Homo sapiens RNA-binding protein 45 Proteins 0.000 description 40
- 102100038823 RNA-binding protein 45 Human genes 0.000 description 40
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 24
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 16
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 15
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 10
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 8
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 8
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 8
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 7
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 7
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 6
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 description 2
- 208000009329 Graft vs Host Disease Diseases 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010043391 Thalassaemia beta Diseases 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 2
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 208000024908 graft versus host disease Diseases 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 2
- GVPSCJQLUGIKAM-GUBZILKMSA-N Asp-Arg-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O GVPSCJQLUGIKAM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XIZWKXATMJODQW-KKUMJFAQSA-N Cys-His-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CS)N XIZWKXATMJODQW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 1
- KWUSGAIFNHQCBY-DCAQKATOSA-N Gln-Arg-Arg Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O KWUSGAIFNHQCBY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SNLOOPZHAQDMJG-CIUDSAMLSA-N Gln-Glu-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SNLOOPZHAQDMJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GCYFUZJHAXJKKE-KKUMJFAQSA-N Glu-Arg-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O GCYFUZJHAXJKKE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- DYFJZDDQPNIPAB-NHCYSSNCSA-N Glu-Arg-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DYFJZDDQPNIPAB-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N Glu-Tyr-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N Gly-Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N Gly-Arg-Pro Natural products NCC(=O)NC(CCNC(=N)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N Gly-Glu-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QSVCIFZPGLOZGH-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QSVCIFZPGLOZGH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- VOKCBYNCZVSILJ-KKUMJFAQSA-N His-Asn-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)O VOKCBYNCZVSILJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- HHOOEUSPFGPZFP-QWRGUYRKSA-N Phe-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O HHOOEUSPFGPZFP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- RVRRHFPCEOVRKQ-KKUMJFAQSA-N Phe-His-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N RVRRHFPCEOVRKQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- MSSXKZBDKZAHCX-UNQGMJICSA-N Phe-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O MSSXKZBDKZAHCX-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- SRTCFKGBYBZRHA-ACZMJKKPSA-N Ser-Ala-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SRTCFKGBYBZRHA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- VMVNCJDKFOQOHM-GUBZILKMSA-N Ser-Gln-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N VMVNCJDKFOQOHM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N Thr-Ser-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N)O XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- HSVPZJLMPLMPOX-BPNCWPANSA-N Tyr-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HSVPZJLMPLMPOX-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- KLGFILUOTCBNLJ-IHRRRGAJSA-N Tyr-Cys-Arg Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O KLGFILUOTCBNLJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- YMZYSCDRTXEOKD-IHPCNDPISA-N Tyr-Trp-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N YMZYSCDRTXEOKD-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- IVXJODPZRWHCCR-JYJNAYRXSA-N Val-Arg-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N IVXJODPZRWHCCR-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- OVLIFGQSBSNGHY-KKHAAJSZSA-N Val-Asp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O OVLIFGQSBSNGHY-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- WFENBJPLZMPVAX-XVKPBYJWSA-N Val-Gly-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O WFENBJPLZMPVAX-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- UVHFONIHVHLDDQ-IFFSRLJSSA-N Val-Thr-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O UVHFONIHVHLDDQ-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000010322 bone marrow transplantation Methods 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 238000005096 rolling process Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 210000004927 skin cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N valinyl-arginine Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
【課題】ＨＬＡ−ＤＲ抗原のサブタイプのひとつであるＤＲ１４に含まれる新規アリルを提供する。
【解決手段】特定のアミノ酸配列をコードするＨＬＡ−ＤＲＢ１アリル、または特定の塩基配列もしくはその相補配列を有するＨＬＡ−ＤＲＢ１アリル。本発明による新規アリルについて、オリゴヌクレオチドプローブを固相した複数のビーズを用いてＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子の遺伝子型を解析したところ、既知のアリルと全く異なる陽性反応が示された。
【選択図】図１
【解決手段】特定のアミノ酸配列をコードするＨＬＡ−ＤＲＢ１アリル、または特定の塩基配列もしくはその相補配列を有するＨＬＡ−ＤＲＢ１アリル。本発明による新規アリルについて、オリゴヌクレオチドプローブを固相した複数のビーズを用いてＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子の遺伝子型を解析したところ、既知のアリルと全く異なる陽性反応が示された。
【選択図】図１
Description
本発明は、ヒト白血球抗原（Human Leukocyte Antigen、以下「ＨＬＡ」と略すことがある）の新規アリル（allele）に関する。
ＨＬＡのタイピングは移植時の適合性を判定するのみならず、疾患に対する個人の感受性の判定などにおいて重要性が注目されている。
臓器移植を行う場合、臓器の提供者と患者の間でＨＬＡの型がどれだけ一致しているかが移植成功率に大きく影響する。ＨＬＡ型が一致しない場合、拒絶反応のため臓器が患者に生着せず、逆に提供者由来の免疫細胞のためにＧＶＨＤ（移植片対宿主病(Graft-Versus-Host Disease)）が発生し、患者の生命が危険にさらされることになる。また糖尿病など特定の病気の発症率とＨＬＡ型の関連も指摘されている。ＨＬＡのタイピングはこのような医療技術の高度化に従い重要性を増したといえる。
従来のＨＬＡタイピングは抗体を用いて行われる血清学的手法であったが、近年の技術革新によりＨＬＡ分子をコードする遺伝子の配列より型分けを行う、いわゆる遺伝子タイピング法が主流となってきた。骨髄移植において遺伝子型でのマッチングが移植成績と相関することが明らかとなり、ＨＬＡの遺伝子タイピングは医療現場においても重要度を増してきている。
塩基配列を確認する方法としては、シークエンシング反応により配列を決定するサンガー法（例えば、非特許文献１参照）などがあるが、コスト面からＨＬＡの遺伝子タイピングは部分的な配列をプローブやプライマーとして利用し、その反応性から遺伝子配列を推定し、ＨＬＡ型を決める方法が利用されている（例えば、非特許文献２および３参照）。
ＨＬＡ−ＤＲ抗原のサブタイプのひとつであるＤＲ１４に含まれる遺伝子型は２００８年１０月の時点で、９２種類が報告されているが、アリルの存在については充分検討されていないのが現状である。
特許第２５６０１６０号（特許文献１）には、ＤＲＢ１＊１４０１およびＤＲＢ１＊１４０２のような既知のアリルに加えて、新規なアリルとしてＤＲＢ１＊１４０５が開示されている。しかしながら、ここには、ＤＲＢ１＊１４０４やそれに近似する配列は開示されていない。
Santamaria P. et al. HLA class I sequence-based typing. Hum Immunol. 37(1):39-50, 1993.
Bunce M. et al. Phototyping: comprehensive DNA typing for HLA-A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5 & DQB1 by PCR with 144 primer mixes utilizing sequence-specific primers (PCR-SSP). Tissue Antigens. 46(5):355-67, 1995.
Kawai S. et al. Routine low and high resolution typing of the HLA-DRB gene using the PCR-MPH (microtitre plate hybridization) method. Eur J Immunogenet. 23(6):471-86, 1996.
Allele Frequencies [online]、[平成２０年１０月１０日検索]、インターネット <URL: http://www.ebi.ac.uk/imgt/hla/>.
本発明者らは今般、オリゴヌクレオチドプローブを固相した複数のビーズを用いてＨＬＡ−ＤＲＢ１の遺伝子型を解析したところ、既知のアリルと全く異なる陽性反応を示す遺伝子を見出した。本発明はかかる知見に基づくものである。
従って、本発明の目的は、ＨＬＡ−ＤＲ抗原のサブタイプのひとつであるＤＲ１４に含まれる新規アリルおよびそれに基づくタイピング方法を提供することにある。
本発明は、配列番号１記載のアミノ酸配列をコードするＨＬＡ−ＤＲＢ１新規アリルを提供するものであり、また本発明は、配列番号２記載の塩基配列またはその相補配列を有するＨＬＡ−ＤＲＢ１新規アリルを提供するものである。
すなわち、本発明によるＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子は、配列番号１のアミノ酸配列をコードしてなるものであり、また、配列番号２の塩基配列またはその相補配列からなるものである。
また本発明によるタンパク質は、本発明によるＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子でコードされたペプチドを有するものである。
さらに本発明のＨＬＡ−ＤＲ抗原のタイピング方法は、遺伝子型の判定の際に、配列番号１のアミノ酸配列、配列番号２の塩基配列もしくはその相補配列、またはそれらから得られる配列変異情報を用いることを特徴とするものである。
本発明によれば、従来に比べて、ＨＬＡ−ＤＲ抗原のさらに詳細なタイピングが可能となるため、移植時の適合性のより厳密な判定が可能となるのみならず、疾患に対する個人の感受性の判定などにおいてより詳細なデータを得ることが可能となる。したがって本発明は、臓器移植時の適合性判定や、各種疾患に対する感受性判定に極めて有用であると言える。
ＨＬＡ−ＤＲＢ１新規アリルの特定とその用途
本発明によるＨＬＡ−ＤＲＢ１新規アリル（ＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子）は、下記のような実験手順に従って得られたものである。
本発明によるＨＬＡ−ＤＲＢ１新規アリル（ＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子）は、下記のような実験手順に従って得られたものである。
ＤＮＡタイピング法の1つであるＰＣＲ−ＳＳＯＰ（Sequence Specific Oligonucleotide probe）法に基づき、Luminex社のｘＭＡＰ測定技術（http://www.luminexcorp.com/01_xMAPTechnology/index.html）を用いてＨＬＡ遺伝子のタイピングが可能なＷＡＫＦｌｏｗ ＨＬＡタイピング試薬（湧永製薬株式会社製）を用いて、ＨＬＡ−ＤＲ抗原の遺伝子型をタイピングしたところ、血液より抽出したＤＮＡ検体で既知の遺伝子型の反応性が示されなかった。
ＷＡＫＦｌｏｗ ＨＬＡタイピング試薬（湧永製薬株式会社製）で得られた増幅産物を用いて、ダイレクトシークエンシング法（Wong C. et al. Characterization of beta-thalassaemia mutations using directgenomic sequencing of amplified single copy DNA. Nature. 330:384-6, 1987）により、エクソン２の配列を確認した。シークエンス反応は、BigDye Terminator V1.1 Cycle Sequencing Kit（アプライドバイオシステムズ社製）を用い、Applied Biosystems 3130xlジェネティックアナライザ（アプライドバイオシステムズ社製）によりシークエンスデータの取得を行った。エクソン2のそれぞれ上流と下流に設定したプライマーを用いて、センス鎖アンチセンス鎖の両側から配列を確認したところ、ＤＲＢ１＊１５０１の配列とこれまでに報告されていない配列とが検出された。
よって、この検体がＤＲＢ１＊１５０１と未知のアリルとのヘテロ接合である可能性が考えられた。
よって、この検体がＤＲＢ１＊１５０１と未知のアリルとのヘテロ接合である可能性が考えられた。
そこでこれら配列を詳細に調べるため、ＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子のエクソン２領域をグループ特異的プライマーセット（Kotsch. et al., Tissue Antigens 53(5): 486-97, 2002）により増幅し、アリルを単離した。ＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子のイントロン１とイントロン２に設定したＤＲ１５グループ特異的プライマーセット（Kotsch. et al., Tissue Antigens 53(5): 486-97, 2002）、およびＤＲ１４グループ特異的プライマーセット（Kotsch. et al., Tissue Antigens 53(5): 486-97, 2002）を用いて、ＰＣＲ反応によりこの領域を増幅し、得られた増幅産物を３％アガロースゲル電気泳動により分離し、５００ｂｐ付近の断片を取り出して精製を行った。
それぞれのグループ特異的増幅で得られた増幅産物を、BigDye Terminator V1.1 Cycle Sequencing KitおよびApplied Biosystems 3130xlジェネティックアナライザを使用し、ダイレクトシークエンシング法（Wong C. et al. Characterization of beta-thalassaemia mutations using directgenomic sequencing of amplified single copy DNA. Nature. 330:384-6, 1987）により両端のイントロン領域を含むエクソン２領域の配列を確認した。
その結果、ＤＲ１５グループ特異的プライマーセットで得られた増幅物の配列は、ＤＲＢ１＊１５０１と完全に一致し、また、ＤＲ１４グループ特異的プライマーセットで得られた増幅産物の配列は、ＷＡＫＦｌｏｗ ＨＬＡタイピング試薬で得られた増幅産物を用いたダイレクトシークエンシング法で確認された新規配列と一致した。
新規配列を有する遺伝子の塩基配列を既知の配列と比較し、分析を行った結果、図１のようにＤＲＢ１＊１４０３のエクソン２内に３箇所の変異を確認した。具体的には、塩基配列の第１５６〜１５８の塩基に変異が見られた。これらの変異は図２に示す５２番目のアミノ酸がアスパラギン酸からセリンへと置き換わる非同義置換であった。また、５２番目のアミノ酸はＨＬＡ−ＤＲ分子において抗原ペプチドをはさみこむ領域の内側に位置していた。
このことから、このアミノ酸はＨＬＡ−ＤＲ分子に結合するペプチドモチーフにも重要な部位であり、免疫系において重要な役割を果たしている可能性が高いと考えられた。なお、この点は、例えば、文献 Pedro A. Reche & Ellis L. Reinherz, J. Mol. Biol. (2003) 331, pp. 623-641においてこの点が記載されており、具体的には、該文献中に、ＨＬＡ−ＤＲＢ配列が黒三角による位置を特定しつつしめされており（文献の図４）、この場所がＨＬＡ分子の抗原ペプチドとの結合特性や特異性に関係することが明記されている。
したがって、ＤＲＢ１＊１４０３と本発明の変異をもつ遺伝子型（ＤＲＢ１＊１４０３Ｖ）とは、移植医療においては区別する必要があり、移植時の適合性判定などにおいて、ＨＬＡ−ＤＲ抗原のタイピング精度を高める上で、極めて有用かつ重要なものであることが明らかとなった。
したがって、ＤＲＢ１＊１４０３と本発明の変異をもつ遺伝子型（ＤＲＢ１＊１４０３Ｖ）とは、移植医療においては区別する必要があり、移植時の適合性判定などにおいて、ＨＬＡ−ＤＲ抗原のタイピング精度を高める上で、極めて有用かつ重要なものであることが明らかとなった。
以上のようにして、本発明による新規アリル（ＤＲＢ１＊１４０３Ｖ）を特定した。
なお、本発明において見出された新規アリルは、ＷＨＯ命名によれば「ＤＲＢ１＊１４８５」とされ、ＷＨＯにおいて正式に登録されている。このため本明細書においては、新規アリルを、「ＤＲＢ１＊１４０３Ｖ」または「ＤＲＢ１＊１４８５」のいずれかで表示する。
なお、本発明において見出された新規アリルは、ＷＨＯ命名によれば「ＤＲＢ１＊１４８５」とされ、ＷＨＯにおいて正式に登録されている。このため本明細書においては、新規アリルを、「ＤＲＢ１＊１４０３Ｖ」または「ＤＲＢ１＊１４８５」のいずれかで表示する。
本発明による新規アリルＤＲＢ１＊１４０３Ｖについて、これと配列が近似すると予想されるＤＲＢ１＊１４０５等との間でアミノ酸配列を比較したところ（図３）、ＤＲＢ１＊１４０５との間では、配列中６個所のアミノ酸が相違していることを確認している。具体的には、ＤＲＢ１＊１４０５における変異として特徴的である１１番目のアミノ酸については、本発明によるアリルＤＲＢ１＊１４０３Ｖでは変異が見られない一方で、本発明によるＤＲＢ１＊１４０３Ｖにおいて特徴的な５２番目のアミノ酸の変異については、ＤＲＢ１＊１４０５では変異は見られない。上記のようにこの５２番目のアミノ酸の変異は、抗原ペプチドとの結合に重要であることから、この点で、ＤＲＢ１＊１４０３ＶとＤＲＢ１＊１４０５とは大きく異なっていると言える。
よって、本発明によるＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子は、前記したように、配列番号１のアミノ酸配列をコードしてなるものである。好ましくは、本発明による本発明によるＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子は、配列番号２の塩基配列またはその相補配列からなるものである。ここで相補配列は慣用の方法により得ることができる。
タイピング方法
上記のように新規アリルの存在とその変異部位が明らかになったため、それら情報に基づいて、そのようなアリルを検出することができるＨＬＡ−ＤＲ抗原タイピング用ＤＮＡプローブを設計し、得ることができる。具体的には、配列番号１に示すアミノ酸配列とその変異部位（５２番目のアミノ酸（配列番号１および図２））に関する情報や、配列番号２のエキソン２の塩基配列と変異部位（１５６〜１５８番目の塩基）に関する情報、さらには必要により公知のＨＬＡ−ＤＲＢ１抗原の情報に従って、当業者であれば慣用の方法に従って、本発明によるプローブを容易に設計し、得ることができる。例えば、配列番号２の塩基配列のＤＮＡ断片にはハイブリダイズするが、ＤＲＢ１＊１４０３のＤＮＡ断片にはハイブリダイズしないものを選択することでも目的のプローブが得ることができる。ここでプローブの設計、合成等の手法については、例えば、"Molecular Cloning"，3rd Edition，Cold Spring Harbor Laboratory Press(New York)等を参考にすることができる。
上記のように新規アリルの存在とその変異部位が明らかになったため、それら情報に基づいて、そのようなアリルを検出することができるＨＬＡ−ＤＲ抗原タイピング用ＤＮＡプローブを設計し、得ることができる。具体的には、配列番号１に示すアミノ酸配列とその変異部位（５２番目のアミノ酸（配列番号１および図２））に関する情報や、配列番号２のエキソン２の塩基配列と変異部位（１５６〜１５８番目の塩基）に関する情報、さらには必要により公知のＨＬＡ−ＤＲＢ１抗原の情報に従って、当業者であれば慣用の方法に従って、本発明によるプローブを容易に設計し、得ることができる。例えば、配列番号２の塩基配列のＤＮＡ断片にはハイブリダイズするが、ＤＲＢ１＊１４０３のＤＮＡ断片にはハイブリダイズしないものを選択することでも目的のプローブが得ることができる。ここでプローブの設計、合成等の手法については、例えば、"Molecular Cloning"，3rd Edition，Cold Spring Harbor Laboratory Press(New York)等を参考にすることができる。
従って、本発明においては、例えば、配列番号１のアミノ酸配列の一部であって、配列番号１の５２番目のアミノ酸を含むアミノ酸配列の部分領域をコードしてなる塩基配列に相補的な配列を有する、ＨＬＡ−ＤＲ抗原タイピング用ＤＮＡプローブが提供されうる。
また本発明の別の態様によれば、配列番号２の塩基配列の一部であって、配列番号２の１５６〜１５８番目の塩基を含む領域に相補的な配列を有する、ＨＬＡ−ＤＲ抗原タイピング用ＤＮＡプローブが提供されうる。
また本発明の別の態様によれば、配列番号２の塩基配列の一部であって、配列番号２の１５６〜１５８番目の塩基を含む領域に相補的な配列を有する、ＨＬＡ−ＤＲ抗原タイピング用ＤＮＡプローブが提供されうる。
本発明において得られたプローブは必要に応じて、慣用の標識物質（例えば、放射性同位体、蛍光色素、発色色素、発酵色素等）により、慣用の方法に従って標識されていてもよい。
本発明の別の態様によれば、本発明において得られたプローブを含むタイピング用試薬が提供される。該試薬には、ＨＬＡ−ＤＲの他の型を検出可能なプローブや、検体中のＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子を増幅可能なプライマー等を含むものであることができる。
本発明の別の態様によれば、前記したように、ＨＬＡ−ＤＲ抗原のタイピング方法であって、遺伝子型の判定の際に、配列番号１のアミノ酸配列、配列番号２の塩基配列もしくはその相補配列、またはそれらから得られる配列変異情報を用いることを特徴とする方法が提供される。
ここで、「得られる配列変異情報」とは、図１および２にも示されているように既知のアリル（ＤＲＢ１＊１４０３）と本件新規アリル（ＤＲＢ１＊１４０３Ｖ）とを塩基配列またはアミノ酸配列を比較することにより得られる配列上の変異情報である。具体的には、例えば、アミノ酸配列の場合であれば、前記したような、ＤＲＢ１＊１４０３のアミノ酸配列上、５２番目のアミノ酸がアスパラギン酸からセリンへと置き換わっている場合であり、塩基配列であれば、１５６〜１５８番目の塩基のＤＲＢ１＊１４０３の場合に対する変異である。
本発明によるＨＬＡ−ＤＲ抗原のタイピング法には、例えば、被験者のＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子が新規アリルを有するか否かを検出する工程が含まれる。このとき検出は、例えば、ＰＣＲ−ＳＳＯ法、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ(制限酵素断片長多型)法、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ(単鎖高次構造多型)法(Orita,M. et al., Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A., 86, 2766-2770(1989)等)、ＡＳＯ(allele specific oligonucleotid)ハイブリダイゼーション法、リバースＰＣＲ−ＳＳＯ法、Ｌｕｍｉｎｅｘ法（Luminex社）、ＰＣＲ−ＭＰＨ法（Polymerase Chain Reaction-based Microtiter Plate Hybridization）（湧永製薬株式会社）、ＴａｑＭａｎ−ＰＣＲ法、Ｉｎｖａｄｅｒ法、ＲＣＡ(rolling cycle amplification)法、ＤＮＡチップ又はマイクロアレイを用いた方法、プライマー伸長法、サザンブロットハイブリダイゼーション法等、慣用の方法を利用して、タイピングを実施することができる。この場合、必要により、ＰＣＲ法などの核酸増幅法により核酸試料を予め増幅させた後、上述の方法を適宜適用してもよい。
タイピング法の具体例を挙げると、被験者のゲノムＤＮＡから調製した核酸試料を、本発明によるプローブとを反応させた後、特異的なハイブリッド形成を検出することによって、被験者のＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子が新規アリルを有するか否かを検出することができる。このとき、使用される核酸試料は、典型的には、被験者の血液、皮膚細胞、粘膜細胞、毛髪等から抽出したゲノムＤＮＡから慣用の方法に従って調製し得ることができる。また、ここでＨＬＡタイピング法には、上記のＰＣＲ−ＳＳＯ法、Ｌｕｍｉｎｅｘ法などが適宜利用することができる。例えば、ＰＣＲ−ＳＳＯ法では、ＰＣＲで増幅させた核酸試料を膜やマイクロプレートなどの支持体に結合させた後、この支持体を適当なハイブリダイゼーション条件下で標識化プローブと反応させる。非特異的結合成分を洗浄除去した後、標識量を指標として支持体に結合したプローブを検出することができる。Ｌｕｍｉｎｅｘ法ではＰＣＲの増幅産物と、蛍光ビーズに固相化したオリゴヌクレオチドプローブとのハイブリダイゼーションを蛍光により検出することができる。
〔配列表〕
SEQUENCE LISTING
<110> Wakunaga Pharmaceutical Co., Ltd.
<120> New HLA-DRB1 genes and their use
<130> 181434SQ
<160> 2
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 96
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(96)
<223> DRB1*1485
<400> 1
Arg Phe Leu Glu Tyr Ser Thr Ser Glu Cys His Phe Phe Asn Gly Thr
1 5 10 15
Glu Arg Val Arg Phe Leu Glu Arg Tyr Phe His Asn Gln Glu Glu Asn
20 25 30
Val Arg Phe Asp Ser Asp Val Gly Glu Tyr Arg Ala Val Thr Glu Leu
35 40 45
Gly Arg Pro Ser Ala Glu Tyr Trp Asn Ser Gln Lys Asp Leu Leu Glu
50 55 60
Asp Arg Arg Ala Leu Val Asp Thr Tyr Cys Arg His Asn Tyr Gly Val
65 70 75 80
Gly Glu Ser Phe Thr Val Gln Arg Arg Gly Glu Arg Gly Ala Gly Arg
85 90 95
<210> 2
<211> 270
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(270)
<223> DRB1*1485
<400> 2
cacgtttctt ggagtactct acgtctgagt gtcatttctt caatgggacg gagcgggtgc 60
ggttcctgga gagatacttc cataaccagg aggagaacgt gcgcttcgac agcgacgtgg 120
gggagtaccg ggcggtgacg gagctggggc ggcctgatgc cgagtactgg aacagccaga 180
aggacctcct ggaagacagg cgggccctgg tggacaccta ctgcagacac aactacgggg 240
ttggtgagag cttcacagtg cagcggcgag 270
〔配列表〕
SEQUENCE LISTING
<110> Wakunaga Pharmaceutical Co., Ltd.
<120> New HLA-DRB1 genes and their use
<130> 181434SQ
<160> 2
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 96
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(96)
<223> DRB1*1485
<400> 1
Arg Phe Leu Glu Tyr Ser Thr Ser Glu Cys His Phe Phe Asn Gly Thr
1 5 10 15
Glu Arg Val Arg Phe Leu Glu Arg Tyr Phe His Asn Gln Glu Glu Asn
20 25 30
Val Arg Phe Asp Ser Asp Val Gly Glu Tyr Arg Ala Val Thr Glu Leu
35 40 45
Gly Arg Pro Ser Ala Glu Tyr Trp Asn Ser Gln Lys Asp Leu Leu Glu
50 55 60
Asp Arg Arg Ala Leu Val Asp Thr Tyr Cys Arg His Asn Tyr Gly Val
65 70 75 80
Gly Glu Ser Phe Thr Val Gln Arg Arg Gly Glu Arg Gly Ala Gly Arg
85 90 95
<210> 2
<211> 270
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(270)
<223> DRB1*1485
<400> 2
cacgtttctt ggagtactct acgtctgagt gtcatttctt caatgggacg gagcgggtgc 60
ggttcctgga gagatacttc cataaccagg aggagaacgt gcgcttcgac agcgacgtgg 120
gggagtaccg ggcggtgacg gagctggggc ggcctgatgc cgagtactgg aacagccaga 180
aggacctcct ggaagacagg cgggccctgg tggacaccta ctgcagacac aactacgggg 240
ttggtgagag cttcacagtg cagcggcgag 270
Claims (4)
- 配列番号１のアミノ酸配列をコードしてなる、ＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子。
- 配列番号２の塩基配列またはその相補配列からなる、ＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子。
- 請求項１または２に記載のＨＬＡ−ＤＲＢ１遺伝子でコードされたペプチドを有する、タンパク質。
- 遺伝子型の判定の際に、配列番号１のアミノ酸配列、配列番号２の塩基配列もしくはその相補配列、またはそれらから得られる配列変異情報を用いることを特徴とする、ＨＬＡ−ＤＲ抗原のタイピング方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2009282756A JP2010162020A (ja) | 2008-12-15 | 2009-12-14 | 新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 |
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2008318526 | 2008-12-15 | ||
| JP2009282756A JP2010162020A (ja) | 2008-12-15 | 2009-12-14 | 新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2010162020A true JP2010162020A (ja) | 2010-07-29 |
Family
ID=42578743
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2009282756A Pending JP2010162020A (ja) | 2008-12-15 | 2009-12-14 | 新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP2010162020A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2012008145A1 (ja) | 2010-07-16 | 2012-01-19 | 三井・デュポンポリケミカル株式会社 | 充填方法、液体小袋包装体の製造方法、および液体小袋包装体 |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5468611A (en) * | 1990-06-27 | 1995-11-21 | The Blood Center Research Foundation, Inc. | Method for HLA typing |
| JP2560160B2 (ja) * | 1990-08-20 | 1996-12-04 | 社団法人北里研究所 | 新規なｄｎａ塩基配列およびその用途 |
| JP4381424B2 (ja) * | 2006-02-03 | 2009-12-09 | 湧永製薬株式会社 | Ｈｌａ新規遺伝子 |
-
2009
- 2009-12-14 JP JP2009282756A patent/JP2010162020A/ja active Pending
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5468611A (en) * | 1990-06-27 | 1995-11-21 | The Blood Center Research Foundation, Inc. | Method for HLA typing |
| US6194147B1 (en) * | 1990-06-27 | 2001-02-27 | The Blood Center Research Foundation, Inc. | Method for HLA typing |
| JP2560160B2 (ja) * | 1990-08-20 | 1996-12-04 | 社団法人北里研究所 | 新規なｄｎａ塩基配列およびその用途 |
| JP4381424B2 (ja) * | 2006-02-03 | 2009-12-09 | 湧永製薬株式会社 | Ｈｌａ新規遺伝子 |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| JPN6014007867; Ｙｅ， Ｓ． ｅｔ ａｌ．: Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ：ＤＱ６４３３９０ ［ｇｉ：１０９１３９８３１］， Ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ： Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＨＣ ｃｌａｓｓ ＩＩ ａｎｔｉｇｅｎ （ＨＬＡ-ＤＲＢ１） ｇｅｎｅ， ＨＬ , 20060620, ＮＣＢＩ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ * |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2012008145A1 (ja) | 2010-07-16 | 2012-01-19 | 三井・デュポンポリケミカル株式会社 | 充填方法、液体小袋包装体の製造方法、および液体小袋包装体 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Shindo et al. | HLA-DRB1 typing of Vogt-Koyanagi-Harada's disease by PCR-RFLP and the strong association with DRB1* 0405 and DRB1* 0410. | |
| JP3093265B2 (ja) | 遺伝子ファミリーのメンバーのヌクレオチドシーケンスを比較して遺伝子型を決定する方法とそのためのキット | |
| AU2012285223B2 (en) | Method and kit for DNA typing of HLA gene | |
| Gao et al. | Diversity of MICA and linkage disequilibrium with HLA-B in two North American populations | |
| IL194900A (en) | HLA allele gene associated with drug antagonism and methods for detecting it | |
| JP2014217332A (ja) | Ｈｌａ遺伝子のマルチプレックスｄｎａタイピング方法及びキット | |
| Collins et al. | High resolution molecular phototyping of MICA and MICB alleles using sequence specific primers | |
| WO2011030159A1 (en) | Method using hla epitope determination | |
| Lin et al. | Further molecular diversity in the HLA‐B15 group | |
| KR101754076B1 (ko) | 리얼타임 ｐｃｒ을 이용한 ｈｌａ-ｄｒｂ１ 및 ｈｌａ-ｄｒｂ３/４/５ 유전자형 분석 방법 및 키트 | |
| WO2017135396A1 (ja) | Ｐｃｒを用いないキャプチャー法によるｈｌａ遺伝子タイピング用プローブセット及びそれを用いたタイピング方法 | |
| CN113481198B (zh) | 主要组织相容性复合体单核苷酸多态性 | |
| ES2445709T3 (es) | Método para la identificación por técnicas moleculares de variantes genéticas que no codifican antígeno D (D-) y codifican antígeno C alterado (C+W) | |
| TW201300528A (zh) | Ｈｌａ－ｄｑｂ１基因分型的方法及其相關引子 | |
| CN109234282B (zh) | BRCA1基因g.43063754T＞G突变体及其引物 | |
| Middleton | HLA typing from serology to sequencing era | |
| JP2010162020A (ja) | 新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 | |
| Liacini et al. | Full genomic sequence of the HLA‐DPA1* 02: 46 allele identified by next generation sequencing. | |
| CN111304211B (zh) | Rhd-t268a突变体及其检测 | |
| JP4381424B2 (ja) | Ｈｌａ新規遺伝子 | |
| JP2011050377A (ja) | 新規ｈｌａ−ｄｒｂ１遺伝子およびその用途 | |
| Loginova et al. | Characterization of two new human leukocyte antigen alleles: HLA‐A* 02: 982 and HLA‐C* 04: 441. | |
| JP4889258B2 (ja) | ウシ白血病発症に対する抵抗性の判定方法 | |
| Quan et al. | Full‐length sequence of the novel HLA‐C* 03: 566 allele by next‐generation sequencing in a Chinese individual. | |
| Zhu et al. | The novel HLA‐A* 24: 520 allele was identified in a Chinese individual. |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20120803 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20140225 |
|
| A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20140704 |