JP2017106933A5

JP2017106933A5 -

Info

Publication number: JP2017106933A5
Application number: JP2017049533A
Authority: JP
Filing date: 2017-03-15
Publication date: 2018-04-12
Anticipated expiration: 2033-02-15

Claims

標的分子を検出する方法であって、前記方法は、
（ａ）チップを提供することであって、前記チップは、感知電極に隣接して、または、感知電極の近傍に配置された膜の中にナノ細孔を含む、ことと、
（ｂ）前記ナノ細孔を通るように核酸分子を方向付けることであって、前記核酸分子は、レポーター分子に関連付けられており、前記核酸分子は、アドレス領域とプローブ領域とを含み、前記レポーター分子は、前記プローブ領域において前記核酸分子に関連付けられており、前記レポーター分子は、標的分子に結合されている、ことと、
（ｃ）前記ナノ細孔を通るように前記核酸分子が方向付けられている間に前記アドレス領域を配列決定することにより、前記アドレス領域の核酸配列を決定することと、
（ｄ）コンピュータプロセッサの支援により、（ｃ）において決定された前記アドレス領域の核酸配列に基づいて前記標的分子を識別することと
を含む、方法。
（ｂ）における前記プローブ分子は、レポーター分子を前記核酸分子の前記プローブ領域に結合することによって、前記孔の中に保持される、請求項１に記載の方法。
前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度が減少させられるときに、前記核酸分子の最大３つの塩基が識別される、請求項２に記載の方法。
前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度が減少させられるときに、前記核酸分子の最大５つの塩基が識別される、請求項２に記載の方法。
前記レポーター分子が前記ナノ細孔と相互作用すると、前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度が減少させられる、請求項２に記載の方法。
（ｂ）において、前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度が、停止させられるか、または、失速させられる、請求項１に記載の方法。
（ｄ）の前に、前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度が減少させられたか否かを決定することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
（ｄ）において、前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度が減少させられたと決定された場合に、前記標的分子が識別される、請求項１に記載の方法。
（ｄ）において、（ｉ）前記アドレス領域の核酸配列および関連と、（ｉｉ）前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の進行速度との間の相関に基づいて、前記標的分子が識別される、請求項１に記載の方法。
前記ナノ細孔が、個々にアドレス可能である、請求項１に記載の方法。
前記核酸分子が、一本鎖である、請求項１に記載の方法。
前記ナノ細孔の中に前記核酸分子を捕獲することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
前記核酸分子の１つまたは複数の末端部分に形成されているバルキーな構造の支援により、前記核酸分子が前記ナノ細孔の中に捕獲される、請求項１２に記載の方法。
前記核酸分子の１つまたは複数の末端部分に取り付けられているバルキーな構造の支援により、前記核酸分子が前記ナノ細孔の中に捕獲される、請求項１２に記載の方法。
前記ナノ細孔を通る前記核酸分子の流れの方向を逆転させることをさらに含む、請求項１に記載の方法。
前記核酸分子の流れの方向を逆転させると、前記アドレス領域の少なくとも一部を再度配列決定することをさらに含む、請求項１５に記載の方法。
前記レポーター分子が、前記レポーター分子の末端部分に抗体またはアプタマーを含み、前記抗体またはアプタマーは、前記標的分子に関連付けられている、請求項１に記載の方法。
アドレス領域およびプローブ領域が、公知の核酸配列を有する、請求項１に記載の方法。
前記レポーター分子が、前記プローブ領域の核酸配列に相補的な核酸配列を含む、請求項１に記載の方法。
前記核酸分子が、前記のように方向付けられる前に、前記レポーター分子に関連付けられている、請求項１に記載の方法。
（ｂ）の前に、前記核酸分子が、前記ナノ細孔を通って進み、（ｂ）において、前記レポーター分子が、前記ナノ細孔を通って進んだ前記核酸分子に関連付けられている、請求項１に記載の方法。