JP2017507174A - 抗菌剤 - Google Patents

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Abstract

本発明は、抗菌活性を有する薬剤、その製造、及びヒトを含む動物における細菌感染の治療における使用に関する。薬剤は、構造X−W−L−Vのバンコマイシンタイプの抗生物質の誘導体であり、式中、Xは、水素、アセチル、又は親油性膜挿入要素であり、Wは、塩基性ペプチド又は塩基性アミノ酸であり;Lは連結基であり、且つVは、細菌中のペプチドグリカン生合成を阻害するグリコペプチド部分である。

Description

本発明は、抗菌活性及び改善された生理学的安定性を有する薬剤並びにそれらの製造のための方法及び中間体に関する。本発明は、さらに、人間を含む動物の細菌感染の治療のためのそのような薬剤の使用に関する。
発明の背景
細菌感染により起こる疾患は、人間及び他の哺乳動物においてかなりの罹患率及び死亡率を有する。グラム陽性細菌は、堅い細胞壁に囲まれた典型的な脂質二重層細胞膜を有する。細胞壁は、交互D−及びL−アミノ酸を含むペプチドにより架橋されたN−アセチルグルコサミンとN−アセチルムラミン酸のポリマーであるペプチドグリカンで構成されている。
最も一般的にはバンコマイシンに代表される抗生物質のグリコペプチド基は、細菌の細胞壁の合成の間に、ペプチドグリカンの糖成分とペプチド成分との架橋を阻害することにより、感受性菌中の細胞壁の合成を阻害する。充分な架橋がないと、細胞壁は機械的に脆くなり、細菌は浸透圧の変化を受けると溶解する。バンコマイシンは、架橋前のペプチドグリカン前駆体のペンタペプチド部分のD−アラニル−D−アラニン(D−Ala−D−Ala)末端に高い親和性で結合する。D−Ala−D−Alaジペプチドは、バンコマイシンのペプチド骨格と相補的水素結合を形成する。バンコマイシン−ペプチドグリカン複合体が、トランスペプチダーゼ酵素の作用を物理的に阻止し、それにより、ペプチドグリカンを強化するペプチド架橋の形成を阻害すると考えられる。この活性は、細菌の細胞質中のペプチドグリカン前駆体の蓄積ももたらす。
Figure 2017507174
抗生物質に対する耐性は充分に文献に記載されており、耐性株は人類の健康にとって潜在的な大きい脅威である。リピドIiペプチド構造の変更又は細菌の細胞壁組成の変化など、数種の耐性がバンコマイシンに説明されている。
抗生物質耐性株の出現に対処するために利用されてきた手法には、耐性の生物に対する効力を高めるための既存の抗生物質の修飾、又は細菌の形質膜を透過性にすることにより標的を殺す新たなペプチド抗生物質の発見がある。第一の手法の例は、最近、バンコマイシンなどのグリコペプチドの誘導体を作ることに焦点を置いた。
カップリング剤2−(1−ヒドロキシベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチル−ウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HBTU)を使用するバンコマイシンのカルボキシル末端の官能化は、液相と固相の両方で、短いペプチド配列を取り付けることに成功した(Sundram, U.N. and Griffin, J.H. (1995) General and Efficient Method for the Solution- and Solid-Phase Synthesis of Vancomycin Carboxamide Derivatives J. Org. Chem. 60 1102-1103)。バンコマイシン及び関連抗生物質のアミノ糖及び末端アミン部分も誘導体化された。還元的アルキル化手法において、バンコサミン糖でアルキル化された一連の化合物が作られ、そのいくつかは、バンコマイシン耐性菌株に対して著しく向上した活性を示した(Cooper RDG, Snyder NJ, Zweifel MJ, Staszak MA, Wilkie SC, Nicas TI, Mullen DL, Butler TF, Rodriguez MJ, Huff BE, Thompson RC. Reductive alkylation of glycopeptide antibiotics:synthesis and antibacterial activity. J Antibiot 49 (1996):575-581; and Rodriguez, M. J., N. J. Snyder, M. J. Zweifel, S. C. Wilkie, D. R. Stack, R. D. Cooper, T. I. Nicas, D. L. Mullen, T. F. Butler, and R. C. Thompson. 1998. Novel glycopeptide antibiotics:N-alkylated derivatives active against vancomycin-resistant enterococci J. Antibiot. (Tokyo), 51, 560-569)。
修飾されたグリコペプチド誘導体の1つ、テラバンシンは2009年に臨床使用が認可され、他の2種の誘導体、ダルババンシン及びオリタバンシンは、大規模な臨床試験で試験された(Zhanel GG, Calic D, Schweizer F, Zelenitsky S, Adam H, Lagace-Wiens PR, Rubinstein E, Gin AS, Hoban DJ, Karlowsky JA. New lipoglycopeptides:a comparative review of dalbavancin, oritavancin and telavancin. Drugs. 2010 70:859-886)。別の修飾グリコペプチド、TD−1792は、グリコペプチド抗生物質をセファロスポリンに連結するものである(Blais, J; Stacey R. Lewis, Kevin M. Krause and Bret M. Benton Antistaphylococcal Activity of TD-1792, a Multivalent Glycopeptide-Cephalosporin Antibiotic Antimicrob. Agents Chemother. 2012 56 1584-1587)。
国際公開第A−98/02454号は、可溶性の治療用ポリペプチドが、一般式:
−(L−[W])BX(I)
(式中、各Lは、独立に、柔軟なリンカー基であり、各Wは、独立に、ペプチド膜結合要素であり、nは1以上の整数であり、Xはペプチド又は非ペプチド性の膜結合又は挿入要素である)
の存在物により修飾されているポリペプチド誘導体を記載している。
タイプ(I)の構造は、可溶性ポリペプチドへの付加が、これらのポリペプチドの哺乳動物細胞の細胞外膜への結合を媒介することが見出された、膜相互作用要素のコンビナトリアルアレイを表す。これは、特に、細胞保護剤及び抗炎症剤として作用する補体活性化の制御剤の場合、治療効果をもたらした(例えば、J. Dong, JR Pratt, RA Smith, I. Dodd and SH Sacks, Strategies for targeting complement inhibitors in ischaemia/ reperfusion injury. Mol. Immunol. 36 (1999), pp. 957-963)。
国際公開第02/36612号は、一般構造:
V−L−W−X(II)
(式中、Vは、細菌中のペプチドグリカン生合成を阻害するグリコペプチド部分であり;
Lは、連結基であり;
Wは、ペプチド膜会合要素であり;且つ
Xは、水素又は膜挿入要素である)
を記載している。
国際公開第02/36612号において、連結基Lの広い定義には、「C〜Cの−アルキレン、C〜Cの−O−アルキレン、C〜C−O−の−アルキレン、−O−、−N(H又はC〜Cの低級アルキル)−、−S−、−SO−、−SO、−XH−C(O)−、−C(O)−NH−、−CH=CH−、−C≡C−、−N=N−、−O−C(O)−、及び−C(O)−O−」があるが、その50〜51ページの構造1〜16中の例示は、連結基Lがジスルフィド結合を含む化合物のもののみである。
さらに、国際公開第02/36612号において、Wの広い定義は、リジン又はアルギニンから選択される2〜10個の連続する残基を含む膜結合ペプチドか(膜結合ペプチド自体は、7〜30個のアミノ酸を含む)、膜挿入ペプチドのいずれかとして後に定義される「ペプチド膜会合要素」であるが、その50〜51ページの構造1〜16中の膜結合ペプチドの例示は、それぞれ6個の連続するリジン及び/又はアルギニン残基を含む14、16又は20個のアミノ酸を含む配列番号4〜配列番号8に限定されている。
国際公開第04/022101号は、3個以上の膜結合要素を含み、その少なくとも2個が親油性要素であり、3番目が、一般的に、可溶性薬剤、例えば、タンパク質、抗癌剤、又は抗菌剤と共有結合した塩基性アミノ酸を含むアミノ酸配列である、修飾された治療剤を記載する。抗菌剤はバンコマイシンでよいが、その場合、アミノ酸配列は、典型的には、6〜20個のアミノ酸を含み、リンカー基によりバンコマイシンのN又はC末端に連結して、ジスルフィド結合を含むものをもたらす。
これらの一般構造をベースとする化合物は、様々な生物に対する向上した抗菌活性を示した。
グリコペプチド抗生物質に対する耐性を作り出すグラム陽性細菌の能力を仮定すると、良好な生理学的安定性を有する新たな抗菌剤及び細菌感染を制御する方法が依然として必要とされている。
発明の概要
本発明者らは、ジスルフィド結合を含む、例えば、上記構造IIにあるグリコペプチドと膜結合要素の間の連結を含む従来技術の構造が、生理的条件下で他のチオールとのジスルフィド交換を受け、化合物の分解とその結果の活性低下を起こし得ることを発見した。さらに、従来技術に記載される長いペプチド配列は、商業的な抗生物質に求められる規模での合成が困難であると同時に、生理的条件下でタンパク質分解を受けやすい。
したがって、本発明者らは、上記の式IIに類似の構造を有するが、生理的条件下でより良好な安定性を示すと同時に抗菌活性を保持する化合物を与えるように連結基Lが特に選択されている新規グリコペプチド誘導体の製造に集中した。W基内のさらなる選択は、化合物の合成の容易さの点で、並びにタンパク質分解の可能性の低下の点で利点を与える。
したがって、第一の態様において、本発明は、式(III):
X−W−L−V(III)
(式中、
Xは、WのN−末端に結合した親油性基であり、炭素原子がベースとなっており、且つ以下のパラメーター;
− 存在する場合、任意の芳香環の炭素原子を含む、3〜60個の炭素原子を有すること;
− 直鎖又は分岐鎖であり、且つ後者の場合、1〜6個の分岐点を有すること;
− 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜8個の二重又は三重結合を含むこと;
− S、O、又はNから独立に選択され、酸性置換基中に含まれない最大6個のヘテロ原子を(存在する場合、芳香環における、存在する場合、ヘテロ原子に加えて)任意選択で有すること;
− 1個以上、例えば、2、3、4、5、又は6個の芳香環であって、縮合していてよく、且つそのそれぞれが、存在する場合、N、O、又はSから独立に選択される1、2、又は3個のヘテロ原子を含み得る、1個以上、例えば、2、3、4、5、又は6個の芳香環を任意選択で含むこと;且つ
− ヒドロキシ、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜6個の置換基を任意選択で有すること
を有し;
Wは、Wが、硫黄含有側鎖を有する任意のアミノ酸でなく、又はそれを含まないという条件で、塩基性アミノ酸又は2〜10個のアミノ酸からなる塩基性ペプチドであり;
Lは、式−NH−(CR−Z−(CR−NH−
(式中、
Zは、酸素又は−NH−、−CONH−、−NHCO−、−(OCHCH−、C〜C12アルキル、C〜C12アルケニル、C〜C12アルキニル、C〜C12ヘテロアルキル、C〜C10ヘテロアルケニル、C〜C12シクロアルキル、C〜C12複素環、C〜C18アリール、若しくはC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択される任意選択で置換されている部分であり;且つ
、R、R、及びRは、H、ハロゲン、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C10ヘテロアルケニル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12複素環、任意選択で置換されているC〜C18アリール、任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール、任意選択で置換されているカルボキシ、任意選択で置換されているカルボキサミドからなる群からそれぞれ独立に選択され;且つ
mは、0、1、2、及び3からなる群から選択される整数であり;且つ
nは、0、1、2、及び3からなる群から選択される整数であり;
但し、mとnとの両方が0ではないことを条件とし;且つ
pは、1〜10からなる群から選択される整数である)
の連結基であるか、又は
Lは、式:
Figure 2017507174

(式中、c及びdは、0、1、及び2からなる群から選択される整数であり;且つ
点線は、V及びWへの結合点を示す)
の1つから選択され;且つ
Vは、細菌中のペプチドグリカン生合成を阻害するグリコペプチド部分である)
の化合物、又はその薬学的に許容できる塩若しくはプロドラッグを提供する。
本発明は、上記に定義された式(III)の化合物の薬学的に許容できる塩又はプロドラッグも提供する。
さらなる態様において、本発明は、上記に定義された式(III)の化合物及び薬学的に許容できる担体、希釈剤、又は賦形剤を含む組成物を提供する。
別の態様において、本発明は、ヒト又は動物の体の治療の方法に使用するための、上記に定義された式(III)の化合物を提供する。
なおさらなる態様において、本発明は、対象の細菌感染を治療する方法であって、対象に、有効量の上記に定義された式(III)の化合物又は前記化合物を含む組成物を投与することを含む、方法を提供する。
定義
本発明がさらに説明される前に、説明される実施形態は当然変わり得るため、本発明が、説明される特定の実施形態に限定されないことを理解されたい。本発明の範囲は添付される特許請求の範囲によってのみ限定されるため、本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明する目的のみであり、限定的でないものとすることも理解されたい。
値の範囲が提供される場合、文脈上そうでないとする明確な指示がない限り下限の単位の10分の1までの、その範囲の上限と下限との間に挟まれた各値及びその述べられた範囲内の他の述べられた又は挟まれた値が、本発明内に包含されることを理解されたい。これらのより狭い範囲の上限及び下限は、独立に、より狭い範囲に含まれ得るが、述べられた範囲内の具体的に除外された限界を条件として、やはり本発明内に包含される。述べられた範囲が限界の一方又は両方を含む場合、これらの含まれる限界のいずれか又は両方を除外する範囲も本発明に含まれる。
他に定義されない限り、本明細書に使用される全科学技術用語は、本発明が属する技術分野の当業者により通常理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものに類似又は均等なあらゆる方法及び材料も、本発明の実施又は試験に使用できるが、好ましい方法及び材料がここで説明される。本明細書で言及される全刊行物は、引用により本明細書に組み込まれ、刊行物が関連するものとして引用される方法及び/又は材料を開示及び説明する。
本明細書及び添付される特許請求の範囲に使用される通り、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」、及び「その(the)」が、文脈上そうでないとする明確な指示がない限り、複数の指示対象を含むことに留意すべきである。そのため、例えば、「抗菌剤」への言及は複数のそのような薬剤を含み、「前記医薬組成物」への言及は、1種以上の医薬組成物及び当業者に公知であるその均等物を含むなどである。請求項が、任意選択の要素を除外するように立案され得ることもさらに留意される。したがって、この記述は、クレームエレメントの列記に関連した「単に」、「のみ」などの排他的な用語の使用又は「否定による」限定の使用のための先行詞として作用するものとする。
病態又は疾患の「治療すること」又は「治療」は、(1)病態の少なくとも1つの症状を予防すること、すなわち、疾患に曝され得るか、若しくは疾患になりやすい素因を有し得るが、疾患の症状をいまだ経験せず示してもいない哺乳動物に、臨床症状があまり著しく現れないようにすること、(2)疾患を阻害すること、すなわち、疾患若しくはその症状の出現を停止若しくは減少させること、又は(3)疾患を軽減すること、すなわち疾患若しくはその臨床症状の後退を起こすことを含む。
「治療上有効な量」又は「効能のある量」は、疾患の治療のために哺乳動物又は他の対象に投与される場合、別の薬剤との組み合わせで、又は単独で、1つ以上の投与量で、疾患のそのような治療をもたらすのに充分な化合物の量を意味する。「治療上有効な量」は、化合物、疾患及びその重症度、並びに治療すべき対象の年齢、体重などにより変わる。
用語「対象」、「個体」、及び「患者」は、本明細書に記載される医薬的方法、組成物、及び治療を必要とし得るあらゆる哺乳動物又は非哺乳動物の種のメンバー又は複数のメンバーを指すように、本明細書において互換的に使用される。そのため、対象及び患者は、非限定的に、霊長類(ヒトを含む)、イヌ、ネコ、有蹄動物(例えば、ウマ、ウシ、ブタ(swine)(例えば、ブタ(pig)))、鳥類、及び他の対象を含む。ヒト及び商業的に重要な非ヒト哺乳動物(例えば、家畜及び飼育動物)は特に興味深い。
「哺乳動物」は、あらゆる哺乳動物種のメンバー又は複数のメンバーを指し、例としては、イヌ;ネコ;ウマ;ウシ;ヒツジ;齧歯目など、及び霊長類、特にヒトがある。非ヒト動物モデル、特に哺乳動物、例えば、非ヒト霊長類、ネズミ(例えば、マウス、ラット)などを実験的研究に使用できる。
化合物の「薬学的に許容できる塩」は、薬学的に許容でき、親化合物の所望の薬理活性を有する塩を意味する。そのような塩には、(1)塩化水素酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸などの無機酸により形成された酸付加塩;酢酸、プロピオン酸、ヘキサン酸、シクロペンタンプロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、乳酸、マロン酸、コハク酸、リンゴ酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、3−(4−ヒドロキシベンゾイル)安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、1,2−エタンジスルホン酸、2−ヒドロキシエタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、4−クロロベンゼンスルホン酸、2−ナフタレンスルホン酸、4−トルエンスルホン酸、カンファースルホン酸、グルコヘプトン酸、4,4’−メチレンビス−(3−ヒドロキシ−2−エン−1−カルボン酸)、3−フェニルプロピオン酸、トリメチル酢酸、tert−ブチル酢酸、ラウリル硫酸、グルコン酸、グルタミン酸、ヒドロキシナフトエ酸、サリチル酸、ステアリン酸、ムコン酸などの有機酸により形成された酸付加塩;又は(2)親化合物に存在する酸性プロトンが、金属イオン、例えば、アルカリ金属イオン、アルカリ土類イオン、若しくはアルミニウムイオンにより置換された場合;若しくはエタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミン、トロメタミン、N−メチルグルカミンなどの有機塩基と配位結合する場合に形成された塩がある。
「プロドラッグ」は、そのようなプロドラッグが哺乳動物の対象に投与される場合、本明細書に示される式IIIによる活性な親薬物をインビボで放出するあらゆる化合物を意味する。本明細書の式IIIの化合物のプロドラッグは、修飾部分がインビボで切断されて親化合物を放出し得るように、一般式の化合物に存在する官能基を修飾することにより調製される。プロドラッグには、以下に示される一般式の1つ以上にあるヒドロキシ、アミノ、又はスルフヒドリル基が、インビボで切断されてそれぞれ遊離のヒドロキシル、アミノ、又はスルフヒドリル基を再生させ得る任意の基に結合した本明細書に示される式IIIの化合物がある。プロドラッグの例には、以下に示される一般式の1つ以上の化合物中のヒドロキシ官能基の、エステル(例えば、酢酸エステル、ギ酸エステル、及び安息香酸エステル誘導体)、カルバマート(例えば、N,N−ジメチルアミノカルボニル)などがあるが、これらに限定されない。
本発明の化合物又はその構成部分は、1つ以上の不斉中心を有し得る。したがって、そのような化合物は、個別の(R)−若しくは(S)−立体異性体としても、その混合物としても製造され得る。他に示されない限り、本明細書及び請求項中の特定の化合物の記載又は命名は、個別のエナンチオマーと、ラセミであろうと他の状態であろうとその混合物との両方を含むものとする。立体化学の決定及び立体異性体の分離の方法は当技術分野で周知である(例えば、“Advanced Organic Chemistry”, 4th edition J. March, John Wiley and Sons, New York, 1992の第4章の議論参照)。
本明細書で議論される刊行物は、本願の出願日に先立つそれらの開示のためのみに与えられる。本明細書中のいずれの内容も、本発明が、先行発明に基づいてそのような刊行物に先立つ資格がないことの承認として解釈されるものではない。さらに、与えられる刊行日は、独立に確認する必要があり得る実際の刊行日と異なることがある。
グルタチオン存在下のMCC223及びMCC535安定性:この図は、従来技術の化合物、MCC535(式中、Vはバンコマイシンであり、XはnC13COであり、Wは−KKK−であり、Lは(S)−NHCH(COH)CH−SS−(CH−NH−である)と、下記に説明される化合物MCC223の安定性の比較を表す。 MCC174、MCC310、MCC455、MCC520、MCC939、及びMCC4815の薬物動態プロファイル。この図は、静脈内(iv)投与と皮下(sc)投与の両方により試験された(各経路でn=3、2mg/kg iv及び10mg/kg sc)マウス中のいくつかの化合物のインビボ安定性を表す。 MCC174、MCC310、MCC455、MCC520、MCC939、及びMCC4815の薬物動態プロファイル。この図は、静脈内(iv)投与と皮下(sc)投与の両方により試験された(各経路でn=3、2mg/kg iv及び10mg/kg sc)マウス中のいくつかの化合物のインビボ安定性を表す。 マウス大腿部感染モデルにおけるMRSAに対するMCC080、MCC174、MCC310、MCC344、MCC455、及びMCC742の効能。この図は、各大腿部に10cfu(コロニー形成単位)のMRSA(ATCC34400)を注射された免疫不全マウスの各大腿部のlog cfuの低下を表す。
発明の詳細な説明
本発明の化合物は、式(III)のグリコペプチド抗生物質である。化合物は、以下に示される通り良好な抗菌活性並びに先に示された従来技術の式(II)の化合物よりも、グルタチオン存在下でのより良好な安定性及びインビボでのより良好な安定性を示す。
要素X
本発明の化合物において、Xは、WのN−末端に結合した親油性基であり、炭素原子がベースとなっており、且つ以下のパラメーター:
− 存在する場合、脂環式環又は芳香環の原子を含む、3〜60個の原子を有すること;
− 直鎖又は分岐鎖であり、且つ後者の場合、1個以上、例えば、2、3、4、5、又は6個の分岐点を含むこと;
− 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜8、例えば、1、2、3、4、5、6、7、又は8個の二重又は三重結合を含むこと;
− S、O、又はNから独立に選択され、酸性置換基中に含まれない最大6個、例えば、1、2、3、4、5、又は6個のヘテロ原子を(存在する場合、芳香環における、存在する場合、ヘテロ原子に加えて)任意選択で有すること;
− 1個以上、例えば、2、3、4、5、又は6個の芳香環であって、縮合していてよく、且つそのそれぞれが、存在する場合、N、O、又はSから独立に選択される1、2、又は3個のヘテロ原子を含み得る、1個以上、例えば、2、3、4、5、又は6個の芳香環を任意選択で含むこと;且つ
− ヒドロキシ、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから独立に選択される1〜6個(1、2、3、4、5又は6個など)置換基を任意選択で有すること
を有する。
必要な場合、Xは、Wへの結合を可能にする官能基を含み得る。適切な官能基は当技術分野で公知であり、例としては、例えば、活性化されたカルボン酸から誘導されたカルボニル基又はスルホニルクロリドから誘導されたスルホン基がある。
特定の態様において、X基は、WのN−末端を含み、カルボニル基、CH基、又はSO基、最も好ましくはカルボニル基を介してWのN−末端に結合している親油性基である。
一実施形態において、Xは式(IV):
Figure 2017507174

(式中、
各R25及びR26は、以下のパラメーター:
− 存在する場合、任意の脂環式環又は芳香環の炭素原子を含む、3〜30個の炭素原子を有すること;
− 直鎖又は分岐鎖であり、且つ後者の場合、1〜3個の分岐点を含むこと;
− 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜4個の二重又は三重結合を含むこと;
− S、O、又はNから独立に選択される1、2、又は3個のヘテロ原子を(存在する場合、芳香環における、存在する場合、ヘテロ原子に加えて)任意選択で有すること;
− 1個以上、例えば、2又は3個の芳香環であって、縮合していてよく、且つそのそれぞれが、存在する場合、N、O、又はSから独立に選択される1、2、又は3個のヘテロ原子を含むことができる、1個以上、例えば、2又は3個の芳香環を任意選択で含むこと;且つ
− ヒドロキシ、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜3個の置換基を任意選択で有すること
を有する、親油性基であり;
tは、0、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;且つ
uは、0、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;
但し、t又はuの一方が0である場合、t又はuの他方が0でないことを条件とする)
のものである。
置換基がハロである場合、これは、フルオロ、クロロ、ブロモ、又はヨードから選択される。
一実施形態において、存在する場合、脂環式環又は芳香環の炭素原子を含む、3〜30個、好ましくは3〜24個、より好ましくは3〜15個の炭素原子を有するX基がある。そのような基は直鎖又は分岐鎖であり、且つ後者の場合、1個以上、例えば2又は3個の分岐点を含み、飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜4、例えば、1、2、3、又は4個の二重又は三重結合を含む。
一実施形態において、Xは、R27が3〜15個の炭素原子を有する親油性基である式R27CO−のものであり、前記親油性基は:
− 直鎖又は分岐鎖であり、且つ脂環式環又は芳香環であって、基中の炭素原子の総数は任意のそのような環の炭素原子を含む、脂環式環又は芳香環を含むことができ;
− 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜4個の二重又は三重結合を含み;
− O又はNから独立に選択される1又は2個のヘテロ原子を(存在する場合、芳香環における、存在する場合、ヘテロ原子に加えて)任意選択で有し;
− 1又は2個の芳香環であって、そのいずれか若しくは両方が1個の窒素ヘテロ原子を含み得る、1又は2個の芳香環を任意選択で含み;且つ
− ヒドロキシル、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜3個の置換基を任意選択で有する。
一実施形態において、Xは、jが、7、8、9、10、11、12、又は13から選択される式C(2j+1)CO−のアルカン酸であり、典型的なそのような基は、nCCO−(nC15CO−);nCCO−(nC17CO−);nCCO−(nC19CO−);nC10CO−(nC1021CO−);nC11CO−(nC1123CO−)、nC12CO−(nC1225CO−)、及びnC13CO−(nC1327CO−)である。
一実施形態において、Xは、下記から選択される:
nC10CO−;nC13CO−;4−PhO−PhCO−;[(4−PhO−PhCO)Lys(4−PhO−PhCO)−;(nC10CO)Lys(COnC10)−;nC10CO−Gly−;nC11CO−;nC12CO−;(4−PhO−PhCO)−Gly−;nCCO−;nCCO−;nCCo−;(2−Bu−nCCO)−;[(2−Bu−nCCO−)Lys(2−Bu−nCCO)]−;(9Z−9,10−デイヒドロ(deyhdro)−nC13CO)−;CPhCO−;CPhCO−;COPhCO−;(COPhCO−)Lys(COPhCO)−;COPhCO−;COPhCO−;PhOCCO−;[PhOCCO−Lys(PhOCCO)]−;PhCCO−;[PhCCO−Lys(PhCCO)]−;PhCCO−;PhCCO−;PhC11CO−;(4−Ph−PhC1CO)−;[(4−Ph−PhCCO)−Lys(4−Ph−PhCCO)]−;[4−(4−F−PhO)−PhCO]−;{[4−(4−Cl−PhO)−PhCO−Lys[4−(4−F−PhO)−PhCO]}−;[4−(4−Cl−PhCO)−PhCO]−;{[4−(4−Cl−PhO)−PhCO−Lys[4−(4−Cl−PhO)−PhCO]}−;(4−BnO−PhCO)−;[(4−BnO−PhCO)−Lys(4−BnO−PhCO)]−;(nC−pip−4−CO)−;[nCCO−Lys(COnC)]−;[(COPhCO)−Lys(COPhCO)]−;[(PhOCCO)−Lys(PhOCCO)]−;{[4−(4−F−PhO)−PhCO−Lys[4−(4−F−PhO)−PhCO]}−;[PhC11CO−Lys(PhC11CO)]−;nC10CH−;4−PhO−PhCH−;CHPh−SO−;[nC12CO−Lys(nC12−CO)]−;[nC13CO−Lys(nC13−CO)]−;(2−Bu−CCO)−Lys(2−Bu−CCO)−;(nCCH−;nC13CH−;PhCH−;(nC11−Pip−4−CO)−;(nC−Pip−4−CO)−;(1−nC−Pro)−;(nC−Pip−2−CO)−;(4−NH−PhCO)−;(4−MeNH−PhCO)−;(4−nCNH−PhCO)−;(nCCH−);nCCH−;(2−NH−nCCO)−、3,5−MeCO−;3−OH−CCO−;(4−Cl−PhCO)−;cHexCHCO−、及び4−nC−cHexCO−。
要素W
本発明の化合物において、Wは、Wが、硫黄含有側鎖を有する任意のアミノ酸でなく、又はそれを含まないという条件で、塩基性アミノ酸又は2〜10個のアミノ酸からなる塩基性ペプチドである。
そのため、Wは、単一の塩基性アミノ酸でも、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10個のアミノ酸からなる塩基性ペプチドでもあり得る。
特定の実施形態において、Wは、Wが、硫黄含有側鎖を有する任意のアミノ酸でなく、又はそれを含まないという条件で、塩基性アミノ酸又は2〜5個のアミノ酸からなる塩基性ペプチドであり、すなわち、Wは、単一の塩基性アミノ酸でも、2、3、4、又は5個のアミノ酸からなる塩基性ペプチドでもあり得る。
Wは硫黄含有側鎖を有する任意のアミノ酸でなく、又はそれを含まない。そのため、Wは、Met残基もCys残基も全く含まない。
特定の実施形態において、Wは、1、2、又は3個の塩基性アミノ酸からなる。
塩基性ペプチドは、生理的条件下で(例えば、およそpH5〜8)、正味の全体的な正電荷を有する側鎖を含むペプチドである。アミノ酸から形成されるペプチドの正味の全体的な電荷が生理的条件下で正である限り、アミノ酸の正確な性質は本質的でない。これは、少なくとも1個の塩基性残基(例えば、Arg、Lys、Orn、Dab、Dap、His)を含むペプチドとして容易に認識される。ペプチドは、Gly若しくはSer、又は1個以上の酸性残基(例えば、Asp、Glu)などの他のアミノ酸を、そのような酸性残基が追加の塩基性残基により相殺されるのであれば、すなわち、ペプチド中の酸性残基の総数が塩基性残基の総数より少なく、生じたペプチドが生理的条件下で正味の全体的な正電荷を有するように含み得る。
本発明の化合物において、WのN−末端はXに結合し、WのC−末端はLに結合している。
ペプチドは、遺伝子組み換えによっても、合成、例えば、段階的合成によっても調製できる。或いは、ペプチドは、例えば細菌により産生される膜会合ペプチドの場合、天然にペプチドを産生する細胞の培養物から回収できる。
合成手段により製造されるペプチドは、一般に天然のL−アミノ酸(すなわち、遺伝コードによりコードされたもの、いわゆるタンパク質構成アミノ酸)から構成されるが、D−アミノ酸又はラセミのアミノ酸も利用できる。非タンパク質構成アミノ酸は、天然源から単離されるか、又は合成法により調製され、それを使用してもよい。本発明において、W基は、タンパク質構成アミノ酸か非タンパク質構成アミノ酸のいずれかでも、それらの混合物でもよく、又はタンパク質構成アミノ酸か非タンパク質構成アミノ酸のいずれか若しくはそれらの混合物からなることがある。
あらゆる場合に、例えば、インビボ半減期を増大させ、又は安定性を改善するために、側鎖修飾を実施できる。側鎖修飾には、例えば、アルデヒドとの反応とそれに続く水素化ホウ素ナトリウムによる還元による還元的アルキル化、アルキルブロミドの求核置換によるアルキル化、メチルアセトイミダートによるアミジン化、又は無水酢酸によるアシル化によるアミノ基の修飾がある。
アルギニン残基のグアニジン基は、アルキル化によっても、2,3−ブタンジオン又はグリオキサールなどの試薬との複素環縮合生成物の形成によっても修飾できる。トリプトファン残基は、インドール環の酸化又はアルキル化により修飾でき、ヒスチジン残基のイミダゾール環はアルキル化により修飾できる。
他のカルボキシ側鎖は、エステル基、例えば、C1−6アルキルエステルの形態でも、アミドの形態でもブロックできる。
アミノ酸に対する上記の修飾例は網羅的でない。当業者は、必要に応じて、当技術分野で本質的に公知である化学作用を利用してアミノ酸側鎖を修飾できる。
天然源から回収されたペプチドは、非タンパク質構成アミノ酸を含み得るが、それらは、タンパク質構成アミノ酸の翻訳後修飾か、生合成のいずれかにより産生される。
本発明の特定の実施形態において、Wは、式(V):
Figure 2017507174

(式中、
Yは、式−(CR2021−の基であり;
18aは、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール、−C(=NR22)−NR2324、及びOR22からなる群から選択され、
18bは、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択されるか、又は
18a及びR18bは、それらが結合している窒素原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成するか、又は
18a及びR18bの一方が、R20又はR21のいずれか及びそれらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成し;
19は、H及び任意選択で置換されているC〜C12アルキルからなる群から選択され;
20及びR21は、H、ハロゲン、OH、C〜C12アルキル、C〜C18アリール、C〜C12ハロアルキル、C〜C12ヒドロキシアルキル、C〜C12アルキルオキシ、及びC〜C12ハロアルキルオキシからなる群からそれぞれ独立に選択されるか、又は
20及びR21は、それらが結合している炭素と共に、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、又は任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル基を形成するか、又は
20及びR21の一方が、R18aとR18bとの一方及びそれらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成し;
各R22、R23、及びR24は、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から独立に選択されるか、又は
22、R23、及びR24のいずれか2個は、それらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている環式基を形成し;
gは、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;
rは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、及び10からなる群から選択される整数である)
の1個の残基又は2〜10個の連続する残基から、より好ましくは1個の残基又は2〜5個の連続する残基からなる。
特定の実施形態において、式(V)において、Yは、gが先に定義されている通りの(CHである。
特定の実施形態において、Wは、アミノ酸であるか、又は任意選択で置換されているD−若しくはL−リジン、オルニチン、2,4−ジアミノ酪酸、2,3−ジアミノプロピオン酸、及びアルギニンから選択されるアミノ酸を含むか、若しくはそれらからなるペプチドである。
特定の実施形態において、Wは、−Lys−、−Lys−Lys−、−Lys−Lys−Lys−、−Orn−、−Orn−Orn−、−Orn−Orn−Orn−、−Lys−Orn−、−Orn−Lys、−Dab−、−Dab−Dab−、−Lys−Dab−、−Dab−Lys−、−Dab−Orn−、−Orn−Dab−、−Dap−、−Dap−Dap−、−Dap−Lys−、−Lys−Dap、−Dap−Orn、−Orn−Dap、−Dap−Dab−、及び−Dab−Dap−からなる群から選択され、アミノ酸のいずれも−L−配置又は−D−配置であり得る。
反対に示されていない限り、アミノ酸配列は、本明細書において、標準的な表記を利用し、N−末端からC−末端方向に表されていることが理解されるであろう。
連結基L
本発明の化合物において、Lは、式:
−NH−(CR−Z−(CR−NH−
(式中、
Zは、酸素又は−NH−、−CONH−、−NHCO−、−(OCHCH−、C〜C12アルキル、C〜C12アルケニル、C〜C12アルキニル、C〜C12ヘテロアルキル、C〜C10ヘテロアルケニル、C〜C12シクロアルキル、C〜C12複素環、C〜C18アリール、若しくはC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択される任意選択で置換されている部分であり;且つ
、R、R、及びRは、H、ハロゲン、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C10ヘテロアルケニル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12複素環、任意選択で置換されているC〜C18アリール、任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール、任意選択で置換されているカルボキシ、任意選択で置換されているカルボキサミドからなる群からそれぞれ独立に選択され;且つ
mは、0、1、2、及び3からなる群から選択される整数であり;且つ
nは、0、1、2、及び3からなる群から選択される整数であり;
但し、mとnとの両方が0ではなく;且つ
pは、1〜10からなる群から選択される整数である)
の連結基であるか、又は;
Lは、式:
Figure 2017507174

(式中、c及びdは、0、1、及び2からなる群から選択される整数であり;且つ
点線は、V及びWへの結合点を示す)
の1つから選択される。
Lが式−NH−(CR−Z−(CR−NH−のものである場合、アミンの一方がアミド結合を介してWのC−末端カルボキシルに結合し、Vへの結合は、アミド結合を介して、グリコペプチド遊離カルボキシル基へのものである。
Lが、上記に表された式の1つから選択される場合、特定の化合物は、環アミンがW基に結合し、環外アミン基がV基に結合するものである。
特定の態様において、−L−は、式−NH−(CH−Z−(CH−NH−のものであり、式中、Z、m、及びnは、先に定義されている通りである。
−L−が、式−NH−(CH−Z−(CH−NH−のものである場合、特定の化合物は、Zが、C〜C12アルキル、NH、O、C〜C12複素環、C〜C18アリール、又はC〜C12シクロアルキル、より好ましくは、C〜Cアルキル、NH、O、フェニル、又はシクロヘキシルからなる群から選択されるものである。
この態様において、特定の基−L−は、式−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−O−(CH−NH−、−NH−(CH−O−(CH−NH−、−NH−(1,4−Ph)−CH−NH−、−NH−(1,3−Ph)−CH−NH−、−NH−(1,4−cHex)−CH−NH−、又は−NH−CH−(1,4−cHex)−CH−NH−である。
或いは、−L−は、式−NH−CH(R)−Z−(CH−NH−のものであり、式中:
が、−(CO)OH、−(CO)OMe、−(CO)NH、−(CO)NHNH、−(CO)NHMe、−(CO)NHEt、−(CO)N(Me)、−(CO)NHBn、若しくは−(CO)R、又は任意選択で置換されているC〜C12複素環、若しくは任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール部分であり;且つ
が、任意選択で置換されているC〜C12複素環又は任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール部分であり;且つ
Z及びnが先に定義されている通りである。
この態様において、特定の化合物は、−L−が式−NH−CH(R)−(CH−NH−のものである化合物であり、式中:
qが、0、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;且つ
が、−(CO)OH、−(CO)OMe、−(CO)NH、−(CO)NHNH、−(CO)NHMe、−(CO)NHEt、−(CO)N(Me)、−(CO)NHBn、若しくは−(CO)R、又は任意選択で置換されているC〜C12複素環、若しくは任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール部分である。
−L−が式−NH−CH(R)−(CH−NH−のものである場合、特定の化合物は、qが、2、3又は4からなる群から選択される整数から選択され、且つ/又はRが、−CO(OH)、−CO(NH)、及び−CO(NHMe)からなる群から選択されるものである。
本発明の特定の化合物は、−L−が下記から選択されるものである:
(R)−又は(S)−NHCH(COOH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHMe)(CHNHCOCHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(COOH)(CHNHCOCHNH−;
(R)−又は(S)−NHCHCO−NH(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONH)−CH−(1,3−トリアゾール)−(CH−NH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHMe)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(COOMe)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHMe)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHMe)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(COOH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(COOH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCHCO−NH(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHnC14)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHEt)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONHBn)(CHNH−;
−NH(CHNH−;
−NH(CHNH−;
−NH(CHNH−;
−NH(CHNH−;
−NH(CHNH−;
−NH(CHNH(CHNH−;
−NH(CHO(CHNH−;
−NH(CHO(CHO(CHNH−;
−NHCH(1,3−Ph)CHNH−;
−NHCH(1,4−Ph)CHNH−;
−NH(1,4−cHex)NH−;
−NHCH(1,4−cHex)CHNH−;
−1−ピペリジン−4−CHNH−;
−1−ピペリジン−2−CHNH−;及び
−1−ピペリジン−2−NH−。
より詳細には、−L−は下記から選択される:
(R)−又は(S)−NHCH(CONHMe)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(COOH)(CHNH−;
−NH(CHNH−;及び
−NH(CHNH−。
要素V
本発明の化合物において、Vは、細菌中のペプチドグリカン合成を阻害するグリコペプチド部分である。
ペプチドグリカンの最初の2段階は、細菌細胞の内部で起こる。段階1は、N−アセチルムラミン酸系脂質と、連結したペンタペプチドとの集合を含むが、ペプチドは、L−アラニン−γ−D−グルタミン酸−m−Xaa−D−アラニン−D−アラニンであり、式中、Xaaは通常D−アミノ−ピメリン酸であるが、いくつかの種では(例えば、スタフィロコッカス・アウレウス(Staph aureus))L−リジンである。γ−D−グルタミン酸残基は、α酸基のアミド化により修飾され得る。
第二段階では、脂質はN−アセチルグルコサミンにより延長される。この脂質は、その後に細胞膜を越えて輸送される。
第三段階は、細菌膜の外部表面で起こるが、トランスグリコラーゼ(transglycolase)による、脂質に連結したGlcNAc−MurNAC−二糖の重合及びトランスペプチダーゼによるペプチド側鎖の架橋を含む。
この生合成経路の阻害剤のクラスの最もよく知られた化合物はバンコマイシンであり、上記で議論された通り、細菌細胞壁ペプチドグリカン前駆体のペンタペプチドのD−Ala−D−Alaジペプチド末端に結合し、それによりそのペプチドグリカンへのさらなる処理を防ぐことにより、ペプチドグリカン生合成を阻害することが知られている。
バンコマイシンの誘導体も、ペプチドグリカンの生合成を阻害することにより作用する。バンコサミン糖でアルキル化された一連の化合物は、さらなる糖により誘導体化された類似化合物と共に、バンコマイシン耐性菌に対して活性を有することが示された(Cooper, R.D.G. et al. 1996、前掲;Rodriguez, M.J. et al., 1998、前掲;及びGe, M., Chen, Z., Onishi, H. R., Kohler, J., Silver, L. L., Kerns, R., Fukuzawa, S., Thompson, C., and Kahne, D.(1999) Vancomycin derivatives that inhibit peptidoglycan biosynthesis without binding D-Ala-D-Ala, Science 284, 507-511)。
一般論として、当業者は、細菌中のペプチドグリカン生合成を阻害するグリコペプチドをよく知っており、本発明に使用するのに好適なグリコペプチドを選択できる。そのようなグリコペプチドは、典型的には、1000〜3000Daの分子量のものであり、Lys−D−Ala−D−Alaペプチド、Lys−D−Ala−D−乳酸デプシペプチドなど、リピドII又は細菌のペプチドグリカン構造の個別成分及び脂質GlcNAc−MurNAC−ペンタペプチドの成分と相互作用することが可能であり、バンコマイシン感受性参考株(例えば、参考株S.アウレウス(S.aureus)NCTC(National Collection of Type Cultures)6571、S.アウレウス(S.aureus)ATCC 25923(NCTC 12981)、S.アウレウス(S.aureus)ATCC 29213(NCTC 12973)、ストレプトコッカス・ニューモニエ(Streptococcus pneumoniae)ATCC 49619(NCTC 12977)、及びエンテロコッカス・フェカリス(Enterococcus faecalis)ATCC 29212(NCTC 12697)のいずれか1つから選択される)に対して、4μg/ml以下のMICで活性である。MIC試験の認められている標準的な方法には寒天希釈法又は液体希釈法があり、どちらの方法も、参照標準文献Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M07-A9(Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically;Approved Standard - Ninth Edition)に収録され、J. Antimicrob. Chemother.(2001) 48(suppl 1):5-16に発表されている。
本明細書の特定の実施形態において、要素Vは、バンコマイシンの誘導体である。要素又は部分Vとして企図される特定のバンコマイシン誘導体には、開示が引用により本明細書に組み込まれる国際公開第96/30401号及び国際公開第98/00153号に開示されるグリコペペプチド(glycopepeptides)に基づく化合物及びその塩がある。
特定の実施形態において、Vは、バンコマイシン、バンコマイシンアグリコン、バンコマイシンデスバンコサミン、デスメチルバンコマイシン、クロロエレモマイシン、テイコプラナイン(teicoplanain)−A−2、リストセチンA、エレモマイシン、バルヒマイシン、アクチノイジンA、コンプレスタチン、クロロペプチン1、キスタマイシンA、アボパルシン、テラバンシン、A40926、及びオリタバンシン、並びに一級アミンがR17により任意選択で置換されているそのいずれかから選択され、R17は、水素、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C10ヘテロアルケニル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択される有機側鎖部分である。
より詳細な実施形態において、Vは、バンコマイシン、バンコマイシンアグリコン、デスバンコサミンバンコマイシン、又はテラバンシンから選択される。最も詳細には、Vはバンコマイシンである。
本発明において、式(III)の化合物のX−W−L−成分は、L基とグリコペプチド遊離カルボキシル基との間のアミド連結により結合している。
本発明の一態様において、X−W−L−Vは式(VI):
Figure 2017507174

(式中、
X、W、及びLは先に定義されている通りであり;
は、水素、炭水化物、又はアミノ炭水化物であり;
は、水素、OH、又は−O−マンノースであり;
は、−NH、−NHCH、又は−N(CHであり;
10は、−CHCH(CH、[p−OH,m−Cl]フェニル、p−ラムノース−フェニル、[p−ラムノース−ガラクトース]フェニル、[p−ガラクトース−ガラクトース]フェニル、[p−CHO−ラムノース]フェニルであるか、又は[p−OH,m−(O−{m−OH,m−R11}−フェニル)]フェニルを介してR11に結合して環式環系を形成し;
11は、−CH−(CO)NH、ベンジル、[p−OH]フェニル、[p−OH,m−Cl]フェニル;[p−OH,m−Cl]フェニルであるか、又は[m−OH,m−(O−{o−OH、m−R10}フェニル)]−フェニルを介してR10に結合して環式環系を形成し;
12は、水素、又はマンノースであり;
13は、水素、OH、又はCHNHCHPOであり;
14は、水素、ベータ−D−グルコピラノース、ベータ−D−グルコサミン、2−O−(アルファ−L−バンコサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、2−O−(アルファ−L−4−エピ−バンコサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、(アルファ−アクチノサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、(アルファ−リストサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、若しくは(アルファ−アコサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース;又は前記グルコサミン若しくはグルコピラノース基のいずれか1つであって、その一級アミンでR17により任意選択で置換されている前記グルコサミン若しくはグルコピラノース基のいずれか1つであり、R17は、先に定義されている通りであり;且つ
15及びR16は、独立に、水素又はクロロである)
のものである。
特定の態様では、式(VI)の化合物において、Rは、H、4−エピ−バンコサミニル、アクチノサミニル、又はリストサミニルである。
本発明の化合物の特定の群は、上記式(III)の化合物であって、式中:
Xが式R27CO−のものであり、式中、R27が3〜15個の炭素原子を有する親油性基であり、前記親油性基が:
− 直鎖又は分岐鎖であり、且つ脂環式環又は芳香環であって、基中の炭素原子の総数は任意のそのような環の炭素原子を含む、脂環式環又は芳香環を含むことができ;
− 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜4個の二重又は三重結合を含み;
− O又はNから独立に選択される1又は2個のヘテロ原子を(存在する場合、芳香環における、存在する場合、ヘテロ原子に加えて)任意選択で有し;
− 1又は2個の芳香環であって、そのいずれか若しくは両方が1個の窒素ヘテロ原子を含み得る、1又は2個の芳香環を任意選択で含み;且つ
− ヒドロキシル、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜3個の置換基を任意選択で有し;
Wが、アミノ酸であるか、又は任意選択で置換されているD−若しくはL−リジン、オルニチン、2,4−ジアミノ酪酸、2,3−ジアミノプロピオン酸、及びアルギニンから選択される2〜5個のタンパク質構成若しくは非タンパク質構成アミノ酸からなるペプチドであり;
Lが式−NH−(CH−Z−(CH−NH−のものであり;式中、Z、m、及びnが、先に定義されている通りであり;且つ
Vが、バンコマイシン、バンコマイシンアグリコン、バンコマイシンデスバンコサミン、デスメチルバンコマイシン、クロロエレモマイシン、テイコプラナイン−A−2、リストセチンA、エレモマイシン、バルヒマイシン、アクチノイジンA、コンプレスタチン、クロロペプチン1、キスタマイシンA、アボパルシン、テラバンシン、A40926、及びオリタバンシン、並びに一級アミンでR17により任意選択で置換されているそのいずれか1つから選択され、R17は、水素、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C10ヘテロアルケニル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択される有機側鎖部分である、化合物である。
本発明の化合物の別の特定の群は、上記式(III)の化合物であって、式中:
Xが、式C(2j+1)CO−のアルカン酸であり、式中、jは、7、8、9、10、11、12、又は13から選択され;
Wが、塩基性アミノ酸又は2若しくは3個のアミノ酸残基からなる塩基性ペプチドであり、Wとしての又はW内の各アミノ酸は、L−リジン、D−リジン、オルニチン、2,4−ジアミノ酪酸、及び2,3−ジアミノプロピオン酸からなる群から選択され;
Lが、
(R)−又は(S)−NHCH(CONHMe)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(CONH)(CHNH−;
(R)−又は(S)−NHCH(COOH)(CHNH−;
−NH(CHNH−;又は
−NH(CHNH−;
からなる群から選択され;且つ
Vが、バンコマイシン、バンコマイシンアグリコン、バンコマイシンデスバンコサミン、及びデスメチルバンコマイシンからなる群から選択される、化合物である。
特定の化合物は、以下の表2に表される化合物の任意の1つ以上であり得る。
本発明の化合物において、任意選択の置換基が言及される。置換基が存在する場合、それぞれは、ハロゲン(例えば、塩素、フッ素、臭素又はヨウ素)、=O、=S、−CN、−NO、−CF、−OCF、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロアルキル、ハロアルケニル、ハロアルキニル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、アリールアルキル、シクロアルキルアルケニル、ヘテロシクロアルキルアルケニル、アリールアルケニル、ヘテロアリールアルケニル、シクロアルキルヘテロアルキル、ヘテロシクロアルキルヘテロアルキル、アリールヘテロアルキル、ヘテロアリールヘテロアルキル、ヒドロキシ、ヒドロキシアルキル、アルキルオキシ、アルキルオキシアルキル、アルキルオキシシクロアルキル、アルキルオキシヘテロシクロアルキル、アルキルオキシアリール、アルキルオキシヘテロアリール、アルキルオキシカルボニル、アルキルアミノカルボニル、アルケニルオキシ、アルキニルオキシ、シクロアルキルオキシ、シクロアルケニルオキシ、ヘテロシクロアルキルオキシ、ヘテロシクロアルケニルオキシ、アリールオキシ、フェノキシ、ベンジルオキシ、ヘテロアリールオキシ、アリールアルキルオキシ、アミノ、アルキルアミノ、アシルアミノ、アミノアルキル、アリールアミノ、スルホニルアミノ、スルフィニルアミノ、スルホニル、アルキルスルホニル、アリールスルホニル、アミノスルホニル、スルフィニル、アルキルスルフィニル、アリールスルフィニル、アミノスルフィニルアミノアルキル、−C(=O)OH、−C(=O)Ra、C(=O)ORa、C(=O)NR、C(=NOH)R、C(=NR)NR、NR、NRC(=O)R、NRC(=O)OR、NRC(=O)NR、NRC(=NR)NR、NRSO、−SRa、SONRaRb、−OR、OC(=O)NR、OC(=O)R、及びアシルからなる群から独立に選択され、
、R、R、及びRは、H、C〜C12アルキル、C〜C12ハロアルキル、C〜C12アルケニル、C〜C12アルキニル、C〜C10ヘテロアルキル、C〜C12シクロアルキル、C〜C12シクロアルケニル、C〜C12ヘテロシクロアルキル、C〜C12ヘテロシクロアルケニル、C〜C18アリール、C〜C18ヘテロアリール、及びアシルからなる群からそれぞれ独立に選択されるか、又はR、R、R、及びRのいずれか2個以上が、それらが結合している原子と共に、3〜12個の環原子を有する複素環式環系を形成する。
本発明において、基がC〜C12アルキルである場合、これは、例えば、メチル、エチル、イソプロピル、tert−ブチル、ヘプチル、イソ−プロピル、n−オクチル、ドデシル、オクタデシル、アミル、2−エチルヘキシルなどを含む、飽和の直鎖又は分岐鎖の炭化水素基又は鎖である。
本発明において、基がC〜C12アルケニルである場合、これは、エテニル、プロペニル、ブテニル、1−メチル−2−ブテニル、オクテニルなど、1個以上の炭素−炭素二重結合を有する不飽和の直鎖又は分岐鎖の炭化水素基である。
本発明において、基がC〜C12アルキニルである場合、これは、エチニル、1−プロピニル、1−ブチニル、ヘプチニル、オクチニルなど、1個以上の炭素−炭素三重結合を有する不飽和の直鎖又は分岐鎖の炭化水素基である。
本発明において、基がハロアルキル、ハロアルケニル、又はハロアルキニル基である場合、これは、1〜3回、フッ素、塩素、臭素、又はヨウ素などのハロゲン原子により置換された、先に定義されたアルキル基、アルケニル基、又はアルキニル基であり得る。2個以上のハロゲン原子が存在する場合、これらは同じでも異なっていてもよい。
本発明において、基がC〜C10ヘテロアルキルである場合、これは、メトキシエチル、エトキシエチル、N−エチルプロピルアミンなど、1個以上、特に1〜3個の炭素原子が、N、S、及びOから選択されるヘテロ原子に置き換えられた、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がC〜C10ヘテロアルケニルである場合、これは、メトキシエテニル、エトキシエテニル、N−エチルプロペニルアミンなど、1個以上、特に1〜3個の炭素原子が、N、S、及びOから選択されるヘテロ原子に置き換えられた、先に定義されたアルケニル基である。
本発明において、基がC〜C12シクロアルキルである場合、これは、シロプロピル(cylopropyl)、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルなど、閉環炭化水素基である。
本発明において、基がC〜C12シクロアルケニルである場合、これは、シクロプロペニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニルなど、少なくとも1個の炭素−炭素二重結合を有する閉環炭化水素環である。
本発明において、基がC〜C12複素環である場合、これは、詳細には、ピペリジニル、モルホリノ、テトラヒドロピラニル、テトラヒドロフラニルなど、1個以上、特に1〜3個の環炭素原子が、N、S、及びOから選択されるヘテロ原子に置き換えられた、先に定義されたシクロアルキル基である。本願において、用語ヘテロシクロアルキルと複素環は互換的に使用できる。
本発明において、基がC〜C12ヘテロシクロアルケニルである場合、これは、1,2,3,4−テトラヒドロピリジニル、1,2−ジヒドロピリジニル、2−ピリリニル(pyrrilinyl)、2−イミダゾリニル、2−ピラゾリニルなど、1個以上、特に1〜3個の環炭素原子が、N、S、及びOから選択されるヘテロ原子に置き換えられた、先に定義されたシクロアルケニル基である。
本発明において、基がC〜C18アリールである場合、これは、フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インダニルなど、1又は2個の芳香環を有する、単環、二環、又は三環式炭素環系である。
本発明において、基がC〜C18ヘテロアリールである場合、これは、チエニル、フリル、ピロリル、ピロリジニル、イミダゾリル、イソオキサゾリル、トリアゾリル、チアジアゾリル、オキサジアゾリル、テトラゾリル、チアトリアゾリル、オキサトリアゾリル、ピリジル、ピリミジル、ピラジニル、ピリダジニル、オキサジニル、トリアジニル、チアジアジニルテトラゾロ、1,5−[b]ピリダジニル、及びプリニル、並びにベンゾ縮合誘導体、例えば、ベンゾオキサゾリル、ベンズチアゾリル(benzthiazolyl)、ベンゾイミダゾリル、及びインドリルなど、1個以上の環炭素原子が、1個以上、特に1〜3個のN、S、及びOから選択されるヘテロ原子により置き換えられた、先に定義されたアリール基である。
本発明において、基がシクロアルキルアルキル基である場合、これは、n−ブチルシクロヘキシルなど、少なくとも1個のシクロアルキル基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がヘテロシクロアルキルアルキル基である場合、これは、n−ブチルピペリジニルなど、少なくとも1個のヘテロシクロアルキル基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がヘテロアリールアルキル基である場合、これは、4−ピリジルブチルなど、少なくとも1個のヘテロアリール基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がアリールアルキル基である場合、これは、4−フェニルブチルなど、少なくとも1個のアリール基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がシクロアルキルアルケニル基である場合、これは、4−シクロヘキシル−2−ブテニルなど、少なくとも1個のシクロアルキル基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルケニル基である。
本発明において、基がヘテロシクロアルキルアルケニル基である場合、これは、4−フラニル−2−ブテニルなど、少なくとも1個のヘテロシクロアルキル基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルケニル基である。
本発明において、基がアリールアルケニル基である場合、これは、4−フェニル−2−ブテニルなど、少なくとも1個のアリール基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルケニル基である。
本発明において、基がヘテロアリールアルケニル基である場合、これは、4−ピリジル−2−ブテニルなど、少なくとも1個のヘテロアリール基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルケニル基である。
本発明において、基がシクロアルキルヘテロアルキル基である場合、これは、2−シクロヘキシル−2−エトキシエチルなど、少なくとも1個のシクロアルキル基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたヘテロアルキル基である。
本発明において、基がヘテロシクロアルキルヘテロアルキル基である場合、これは、2−ピペリジン−2−エトキシエチルなど、少なくとも1個のヘテロシクロアルキル基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたヘテロアルキル基である。
本発明において、基がアリールヘテロアルキル基である場合、これは、2−フェニル−2−エトキシエチルなど、少なくとも1個のアリール基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたヘテロアルキル基である。
本発明において、基がヘテロアリールヘテロアルキル基である場合、これは、2−ピリジル−2−エトキシエチルなど、少なくとも1個のヘテロアリール基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたヘテロアルキル基である。
本発明において、基がヒドロキシアルキルである場合、これは、4−ヒドロキシペンチルなど、少なくとも1個のヒドロキシル基により置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がアルキルオキシである場合、これは、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシなど、先に定義されたアルキル基により置換された酸素である。
本発明において、基がアルキルオキシアルキルである場合、これは、4−メトキシペンチルなど、少なくとも1個のアルキルオキシ基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がアルキルオキシシクロアルキルである場合、これは、4−メトキシ−シクロヘキシルなど、少なくとも1個のアルキルオキシ基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたシクロアルキル基である。
本発明において、基がアルキルオキシヘテロシクロアルキルである場合、これは、3−メトキシピペリジニルなど、少なくとも1個のアルキルオキシ基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたヘテロシクロアルキル基である。
本発明において、基がアルコキシアリールである場合、これは、4−メトキシフェニルなど、少なくとも1個のアルキルオキシ基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたアリール基である。
本発明において、基がアルコキシヘテロアリールである場合、これは、4−メトキシピリジニルなど、少なくとも1個のアルキルオキシ基(先に定義されている通り)により置換された、先に定義されたヘテロアリール基である。
本発明において、基がアルコキシカルボニルである場合、これは、メトキシカルボニルなど、先に定義されたアルコキシ基により置換されたカルボニル基である。
本発明において、基がアルキルアミノカルボニルである場合、これは、N−ブチルカルボキサミドなど、アルキルアミノ基により置換されたカルボニル基である。
本発明において、基がアルケニルオキシである場合、これは、ブタ−2−エニルオキシなど、先に定義されたアルケニル基により置換された酸素である。
本発明において、基がアルキニルオキシである場合、これは、ブタ−2−イニルオキシなど、先に定義されたアルキニル基により置換された酸素である。
本発明において、基がシクロアルキルオキシである場合、これは、シクロヘキシルオキシなど、先に定義されたシクロアルキル基により置換された酸素である。
本発明において、基がシクロアルケニルオキシである場合、これは、シクロヘキサ−3−エニルオキシなど、先に定義されたシクロアルケニル基により置換された酸素である。
本発明において、基がヘテロシクロアルキルオキシである場合、これは、3−ピペリジニルオキシなど、先に定義されたヘテロシクロアルキル基により置換された酸素である。
本発明において、基がヘテロシクロアルケニルオキシである場合、これは、4,5−デヒドロ−3−ピペリジニルオキシなど、先に定義されたヘテロシクロアルケニイル(heterocycloalkenyyl)基により置換された酸素である。
本発明において、基がアリールオキシである場合、これは、フェニルオキシなど、先に定義されたアリール基により置換された酸素である。
本発明において、基がヘテロアリールオキシである場合、これは、3−ピリジニルオキシなど、先に定義されたヘテロアリール基により置換された酸素である。
本発明において、基がアリールアルキルオキシである場合、これは、4−フェニルブトキシなど、先に定義されたアリールアルキル基により置換された酸素である。
本発明において、基がアルキルアミノである場合、これは、4−ブチルアミノなど、先に定義されたアルキル基により置換されたアミンである。
本発明において、基がアシルアミノである場合、これは、アセトアミドなど、先に定義されたアシル基により置換されたアミンである。
本発明において、基がアミノアルキルである場合、これは、4−アミノブチルなど、アミンにより置換された、先に定義されたアルキル基である。
本発明において、基がアリールアミノである場合、これは、フェニルアミノなど、先に定義されたアリール基により置換されたアミンである。
本発明において、基がアルキルスルホニルである場合、これは、ブチルスルホニルなど、先に定義されたアルキル基により置換されたスルホニル基である。
本発明において、基がアリールスルホニルである場合、これは、フェニルスルホニルなど、先に定義されたアリール基により置換されたスルホニル基である。
本発明において、基がアルキルスルフィニルである場合、これは、ブチルスルフィニルなど、先に定義されたアルキル基により置換されたスルフィニル基である。
本発明において、基がアリールスルフィニルである場合、これは、フェニルスルフィニルなど、先に定義されたアリール基により置換されたスルホニル基である。
本発明において、基がアミノスルフィニルアミノアルキルである場合、これは、アミノスルフィニルアミノプロピルなど、アミン上でアミノスルフィニル基により置換されたアミノアルキル基である。
本発明において、基がアシルである場合、これは、ホルミル、アセチル、プロピオニル、ベンゾイルなど、RがCOに単結合で結合しているアルキル又は芳香族基を表す、式RCO−の基である。
薬物の投与
本発明のさらなる態様は、式(III)の化合物及び薬学的に許容できる担体を含む医薬組成物である。
製剤は、任意選択で、他の治療成分又は希釈剤を含む。担体又は複数の担体は、製剤の他の成分と適合性があり、その受容者にとって有害でない意味で「許容でき」なくてはならない。
非経口又は筋肉内投与に好適な製剤には、酸化防止剤、緩衝剤、及び製剤を意図される受容者の血液と等張にする溶質を含み得る水性又は非水性滅菌注射液;並びに懸濁化剤及び増粘剤を含み得る水性及び非水性滅菌懸濁剤がある。製剤は、単位用量又は多用量容器、例えば、密封されたアンプル及びバイアルに呈することができ、使用直前に注射のための滅菌液体担体、例えば水を加えるのみでよい凍結乾燥(freeze-dried)(凍結乾燥された(lyophilized))状態で保存できる。注射液及び懸濁剤は、滅菌散剤、顆粒剤、及び錠剤から即席に調製できる。
先に詳細に言及された成分に加え、製剤が、対象とする製剤の種類と関連する分野で従来使用される他の薬剤を含み得ることを理解されたい。可能な製剤のうち、滅菌されたパイロジェン除去水溶液及び非水溶液が好ましい。
或いは、組成物は、例えば、軟膏剤、クリーム剤、ローション剤、眼軟膏剤、点眼剤、点耳剤、洗口液、含浸包帯及び縫合糸、並びにエアゾール剤の形態で局所適用のために製剤でき、例えば、保存剤、薬物の浸透を助ける溶媒、及び軟化薬を含む適切な従来の添加剤を、軟膏剤及びクリーム剤中に含み得る。そのような局所製剤は、適合性のある従来の担体、例えば、ローション剤用のクリーム又は軟膏基剤、及びエタノール又はオレイルアルコールも含み得る。そのような担体は、製剤の約1重量%〜約98重量%を構成し得る。より一般的には、それらは、製剤の約80重量%までを構成する。
或いは、組成物は、投与用の吸入経路(例えば、鼻腔内、肺内など)のために製造され得る。そのような手段には、エアゾール懸濁液の吸入又は本発明の化合物の吹送がある。本発明の化合物の鼻腔内粘膜、気管、及び細気管支への送達に好適なネブライザー装置、定量吸入器などは、当技術分野で周知であるため、ここでは詳細に説明されない。本発明の化合物を含む微粉化された組成物の吸い込まれ得る乾燥粒子を含む固体粒状組成物は、標準的な技法により調製できる。固体粒状組成物は、任意選択で、エアゾールの形成を促進するのに役立つ分散剤を含むことができる。好適な分散剤はラクトースであり、1対1の重量比など任意の好適な比率で化合物とブレンドできる。有効成分は、懸濁又は溶液製剤として送達でき、液化噴射剤、例えば、ジクロロフロウロメタン(dichloroflouromethane)、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、及びこれらの混合物などのクロロフルオロカーボン化合物の使用を含み得る。エアゾール製剤は、さらに、1種以上の共溶媒、例えば、エタノール、乳化剤、及びオレイン酸又はソルビタントリオレアートなどの他の製剤界面活性剤、酸化防止剤、並びに好適な着香料を含み得る。
或いは、組成物は、経口投与用に製剤され得る。経口投与は、錠剤、ロゼンジ剤、水性又は油性懸濁剤、分散性散剤又は顆粒剤、乳剤、ハード又はソフトカプセル、又はシロップ剤、又はエリキシル剤として製剤された本発明の化合物を含む医薬組成物を使用して達成され得る。そのような経口組成物は、薬学的に優れており且つ心地よい調製物を与えるために、1種以上の甘味剤、着香料、着色剤、又は保存剤を含み得る。錠剤は、被覆されていても被覆されていなくてもよいが、有効成分を、非毒性の薬学的に許容できる賦形剤、例えば、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、ラクトース、リン酸カルシウム又はリン酸ナトリウムなどの不活性な希釈剤、造粒又は崩壊剤、例えばコーンスターチ又はアルギン酸;スターチ、ゼラチン又はアラビアゴムなどの結合剤;及び滑沢剤、例えばステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、又はタルクと混合して含むように製剤され得る。コーティングが使用される場合、コーティングは、消化管中での崩壊及び吸収を遅らせ、それにより長期間にわたり持続した作用を与える。
製剤が水性懸濁剤である場合、そのようなものは、好適な賦形剤との混合物中の活性薬剤を含み得る。そのような賦形剤は、必要に応じて、懸濁化剤(例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロプロピルメチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン、トラガカントゴム、及びアラビアゴム);分散化剤若しくは湿潤剤;保存剤;着色剤、及び/又は着香料であり得る。
本発明の組成物は、注射により投与して、留置器具の挿入直前に関連する細菌に対する全身作用を達成することができる。治療は、手術後に、器具の体内時間の間に続き得る。さらに、組成物を使用して、手術技法の周術期の保護(cover)を広げて、細菌による創傷感染を防ぐこともできる。
整形外科医の多くは、人工関節を有する患者が、菌血症をもたらし得る歯科治療前に、抗生物質の予防投与について考慮されるべきであると考える。遅発性深部感染は、人工関節の喪失を招くことがある重篤な合併症であり、相当な罹患率及び死亡率を伴う。したがって、この状況において、予防的な抗生物質の代りとしてペプチド又はペプチド/薬物コンジュゲートの使用を拡張することが可能である。
細菌感染は、埋め込み材料及び留置器具の臨床使用に伴う主な合併症の1つを起こす。とりわけ、ブドウ球菌は、医療器具関連感染にしばしば関連してきた(Dankert et al 1986, CRC Rev Biocompatability 2, 219-301)。感染は定着すると、事実上、治療不可能であり、インプラント不全を起こす。ブドウ球菌のインプラントへの付着を除去しようとする試みは、補綴材料の表面の修飾によるタンパク質の付着の妨げ;例えば、PTFEなどの「付着しない」材料による被覆、又は表面への抗生物質の結合を含んできた(Kamal et al., 1991, J. Amer. Med. Assoc. 265, 2364-2368)。さらに、非ステロイド性抗炎症薬を使用して、ブドウ球菌の医療用ポリマーへの付着を防ぐ提案もあった(Farber and Wolff 1992, J. Infect. Dis. 166:861-865)。
ヒト患者への投与のために、活性薬剤の1日用量レベルが、0.01〜50mg/kg、典型的には1mg/kg付近であることが期待される。医師は、いずれにしても、個々の患者に最適な実際の用量を決定し、特定の患者の年齢、体重、及び応答により変わり得る。上記の用量は、平均的な症例を例示するものである。当然のことながら、より高い用量又はより低い用量が有利となる個別の場合があり得、そのようなものは本発明の範囲内である。
上述の療法に加え、本発明の組成物は、創傷組織中に曝露されているマトリックスタンパク質、特にフィブロネクチンへの細菌の付着を防ぐ創傷治療剤として、及び抗生物質の予防投与に替わるものとして、又はそれと組み合わせた歯科治療における予防的な使用のため一般的に使用できる。
或いは、本発明の組成物は、挿入直前に留置器具を浸すためにも使用できる。活性薬剤は、好ましくは、創傷又は留置器具を浸すために0.1μg/ml〜10mg/mlの濃度で存在する。
本発明の組成物は、以下の生物により起こる細菌感染の治療に使用できるが、それに限定されない:マイコバクテリウム属菌(Mycobacterium sp.);エンテロコッカス属菌(Enterococcus sp.);スタフィロコッカス属菌(Staphylococcus sp.);ストレプトコッカス属菌(Streptococcus sp.);ボレリア属菌(Borrelia sp.);クロストリジウム属菌(Clostridium sp.);アクチノマイセス属菌(Actinomyces sp.);及びニューモコッカス属菌(Pneumococcus sp.)。
本発明のさらなる態様において、式(III)の化合物を、医薬として、又は動物若しくはヒトの体の治療の方法において、及びとりわけ先に列記された生物により起こる細菌感染の治療のために使用できる。式(III)の化合物を、細菌感染、特に先に列記された生物により起こるものの治療のための医薬品の製造にも使用できる。
化合物の合成
本発明の化合物を合成できる経路は当技術分野で周知である。一般的に、化合物は、保護された要素Wを要素Lにカップリングし、次いでそれに要素Xを取り付けることにより合成できる。最後に、X−W−LをVとカップリングして、保護基を除く。生じた化合物を、例えば、L基において修飾して、さらなる化合物を得ることができる。代替合成経路において、LをVにカッププリングし、XをWにカップリングし、最終工程として、X−WをL−Vにカップリングする。
本発明の実施形態を、ここで例として詳細に説明する。
実施例1.Lys−OH、Lys−OMe、又はLys−NHMeリンカーを有する化合物に至る一般的な合成経路:液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
Figure 2017507174
スキームA i)Fmoc−L−Lys(ivDde)−OH、DIC、HOBt、DMAP、DMF ii)DMF中20%ピペリジン iii)Fmoc−Lys(Mtt)−OH、HBTU、DIPEA、DMF iv)RCOOH、HBTU、DIPEA、DMF、又はRSOCl、DIEA v)MeOH、DIPEA、DMF、50℃、一晩 vi)MeNH、DIPEA、THF、一晩 vii)DMF中2%HNNH.HO、1時間 viii)バンコマイシン.HCl、HBTU、DIPEA、DMSO、DMF、一晩 ix)DCM中2%TFA、5%EtSiH、30分 x)LiOH、ジオキサン/HO(1:1)、室温、一晩。
i)Fmoc−L−Lys(ivDde)−OHのHypogel HMBA樹脂へのローディング:
Hypogel HMBA樹脂(1.0g、ローディング0.81mmol/g、0.81mmol)を、乾燥DMF(×3)で洗浄した。Fmoc−L−Lys(ivDde)−OH(2.33g、MW 574.7、4.05mmol、5当量)の乾燥DMF溶液(10ml)に、ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt、547mg、MW 135、4.05mmol、5当量)を加え、それに続いて1,3−ジイソプロピルジイミド(DIC)(627μl、d 0.815、MW 126.2、4.05mmol、5当量)を、次いで4−ジメチルアミノピリジン(DMAP、30mg、MW 122.17、0.3当量)を加えた。生じた溶液を樹脂に加え、樹脂を室温で一晩振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。樹脂をアセチル残基でキャップするために、樹脂を、グローブボックス中で、乾燥DMF(×3)及びDIPEA(848μl)で洗浄し、次いで無水酢酸(307μl、d 1.08、MW 102.09)を加え、1時間振とうし、次いで液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
ii)Fmoc脱保護:
樹脂(1.45g、0.56mmol/g)を、20%ピペリジンのDMF溶液(14.5ml)により処理し、室温で1時間振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
iii)Fmoc−L−Lys(Mtt)−OHとのペプチドカップリング:
樹脂(1.27g、0.64mmol/g)を、DMF(×3)で洗浄した。Fmoc−L−Lys(Mtt)−OH(995mg、MW 624.8、1.59mmol、2.0当量)のDMF(9.5ml)溶液に、HBTUのDMF溶液(3.2ml、0.5M、1.59mmol)を加え、それに続いてDIPEA(1107μl、d 0.742、MW 129.25、6.35mmol、7.8当量)を加えた。溶液を10分間静置し、次いで洗浄した樹脂に加えた。樹脂を、室温で3時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
iv−a)種々の酸とのペプチドカップリング:
樹脂(100mg、0.043mmol)をDMF(×3)で洗浄した。酸のDMF溶液(1ml)に、HBTUのDMF溶液(0.2ml、0.5M)、DIPEA(34.9μl、d 0.742、MW 129.25、最終濃度0.5M)を加えた。溶液を10分間静置し、次いでDMFで洗浄した樹脂に加えた。樹脂を室温で一晩振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
iv−b)スルホンアミドの形成:
樹脂(100mg、0.43mmol/g)をDMF(×3)で洗浄した。樹脂に、DMF(2ml)中のドデカンスルホニルクロリド(17.3mg、MW 268.84、1.5当量)、DIPEA(8.9μl、d 0.742、MW 129.25、1.2当量)を加え、室温で一晩振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
iv−c)Fmoc−L−Lys(Fmoc)−OHとのペプチドカップリング:
樹脂(1.89g、0.43mmol/g)をDMF(×3)で洗浄した。Fmoc−L−Lys(Fmoc)−OH(1400mg、MW 624.8、1.59mmol、2.9当量)のDMF(14.2ml)溶液に、HBTUのDMF溶液(4.73ml、0.5M、2.37mmol、2.9当量)を加え、それに続いてDIPEA(1650□l、d 0.742、MW 129.25、6.35mmol、11.7当量)を加えた。溶液を10分間静置し、次いで洗浄した樹脂に加えた。樹脂を、室温で3時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄し、真空中で乾燥させた。次いで、Fmoc基を、手順(ii)に従って除去し、遊離アミンを、手順(iv−a)を利用して誘導体化した。
v)メチルエステルを与える樹脂からのペプチドの切断:
樹脂を、無水メタノール(2.5ml/樹脂100mg)、無水DMF(2.5ml/樹脂100mg)、及び無水DIPEA(0.5ml/樹脂100mg)により処理し、50℃の油浴中で一晩加熱した。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)及びMeOH(×3)で洗浄し、溶媒を減圧下で除去した。
vi)メチルアミドを与える樹脂からのペプチドの切断:
樹脂を、THF(×3)で、次いでDIPEA(×2)で洗浄し、次いで、THF中のメチルアミン2M、2ml/樹脂100mg)により処理し、室温で一晩振とうした。減圧を利用して樹脂から液体を排出し、次いで、THF(×2)、DCM(×2)、及びACN(×2)で洗浄した。Nガスを利用して溶媒を発散させ、試料をLCMSにより品質管理のために分析した。
vii)ivDde保護基の脱保護:
ペプチド(40mg)を、2%抱水ヒドラジンのDMF溶液(2.0ml)に溶解させた。生じた溶液を室温で30分間撹拌し、溶媒を減圧下で除去した。いくつかの試料をLCMSにより品質管理のために分析した。
viii)バンコマイシンとの液相カップリング:
ペプチド7(50μmol)の乾燥DMF(0.86ml)溶液を、バンコマイシン塩酸塩(89mg、FW 1485.71、59.9μmol、1.2当量)の乾燥DMF(0.86ml)溶液により処理した。この溶液に、HBTUの乾燥DMF溶液(120μl、0.5M、60μmol)、1.2当量)を加え、それに続いてDIPEA(36μl、d 0.742、FW 129.25、0.207μmol、4.1当量)を加えた。生じた溶液を室温で一晩撹拌した。試料をLCMSにより分析し、カップリングの完了を確実にして、必要な場合追加のカップリング試薬を加えた。溶媒を真空中で除去した。
ix)4−メチルトリチル基脱保護:
バンコマイシン結合化合物(50mg)を、2%TFAと5%TESのDCM溶液(2ml)により処理し、30分間静置した。溶媒を減圧下で除去し、試料をLCMSにより分析して、完全な脱保護を確実にした。必要な場合、プロセスを繰り返した。最終化合物をHO/ACN(1:1、1.0ml)に溶解させ、0.45μmシリンジフィルターに通して濾過し、LCMSにより分析した。
x)メチルエステルの切断:
C−末端にカルボン酸を有する化合物を得るために、化合物をジオキサン/水(1:1)及びLiOHの水溶液(10当量)0.1ml、0.5M、50μmol)により処理し、室温で一晩撹拌した。試料を凍結乾燥し、HO/ACN(1:1、1.0ml)に溶解させ、0.45μmシリンジフィルターに通して濾過し、LCMSにより分析した。
HPLCによる最終精製:粗生成物を水/アセトニトリル(体積で1:1)に溶解させ、濾過し、0.1%TFAを含む水/アセトニトリルの勾配溶離を利用して分取HPLCにより精製した(Agilent Zorbax SB-Phenyl、9.4×250mm、5μm粒径、流量5mL分−1、15分かけてHO+0.1%TFA中0〜100%CH3CN+0.1%TFA(酸誘導体)又はAgilent Zorbax SB-C18、9.4×100mm、5μm粒径、流量5mL分−1、30分かけてHO+0.1%TFA中0〜100%CH3CN+0.1%TFA(アミド誘導体))。ELSDにより95%超の純度であるとLCMSにより分析されたフラクションをポーリング(polled)し、凍結乾燥した(分析HPLCは、Agilent Eclipse XDB-Phenyl、4.6×150mm、5μm粒径、流量0.5mL分−1、13分かけてHO+0.05%FA中0〜100%CH3CN+0.05%FAに関して以下に与えられる)。
化合物の正体は、高分解能質量分析法(HRMS)及びMS−MS分析を利用して確認した。
実施例2.MCC000310の合成:液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
実施例1に記載した標準的な手順を、MCC000310の合成に適用した。
Figure 2017507174
スキーム1試薬及び条件:a)Fmoc−L−Lys(ivDde)−OH、DIC、HOBt、DMAP、DMF、室温、16時間;b)無水酢酸、DIPEA、DMF、室温、16時間;c)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、Fmoc−Lys(Mtt)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温、3時間;d)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、Fmoc−Lys(Mtt)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温、3時間。
Figure 2017507174
スキーム2試薬及び条件:a)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、Fmoc−Lys(Fmoc)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温、16時間;b)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、4−フェノキシ安息香酸、HBTU、DIPEA、DMF、室温、16時間。
Figure 2017507174
スキーム3試薬及び条件:a)THF中2MのNHMe、室温、16時間;b)DMF中2%ヒドラジン、室温、1時間;c)バンコマイシン.HCl、HBTU、DIPEA、DMF、室温、16時間;d)DCM中2%TFA、5%TES、室温、3×1時間。
実施例3.MCC000635の合成:液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
MCC000635の調製のために、実施例2からの共通な中間体トリペプチド4を、標準的な条件下でFmoc−L−Lys(Mtt)−OHにより処理して、ペプチド10を与えた。ペプチド10をミリスチン酸により処理すると、アルキルテールペプチド11を与え、それを次のバンコマイシンとの液相カップリングのために樹脂から切断した。
Figure 2017507174
スキーム4試薬及び条件:a)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、Fmoc−Lys(Mtt)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温、16時間;b)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、ミリスチン酸、HBTU、DIPEA、DMF、室温、16時間。
Figure 2017507174
スキーム5試薬及び条件:a)MeOH、DMF、DIPEA、50℃、16時間;b)DMF中2%ヒドラジン、室温、1時間;c)バンコマイシン.HCl、HBTU、DIPEA、DMF、室温、16時間;d)DCM中2%TFA、5%TES、室温、2×1時間。
実施例4.MCC000223の合成:MCC000635の転化
精製されたメチルエステルMCC000635(20mg)を、ジオキサン:HO(50:50)中で、過剰のLiOH(10当量)により処理し(スキーム6)、反応の進行を、LCMSを利用してモニターした。エステルは、希薄条件中で、5℃で24時間の期間をかけて手際よく加水分解され、MCC000223を与えた。HPLC精製により、MCC223が良好な収率で生じた(10mg)。
Figure 2017507174
スキーム6試薬及び条件:a)LiOH、ジオキサン:HO(50:50)。
実施例5.MCC000223の合成:固相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
MCC223を調製する固相経路は、HMPB樹脂(スキーム6)を利用した。酸感受性樹脂は、最終工程として使うのに魅力的であり、同時にMtt基を除去し、最終生成物を樹脂から切断する。Alloc保護基を、ivDde基の代りに使用する。固相経路は、MCC223を、8工程で、11%というかなりの全体収率(純度95%超)でHPLC精製の後に与えた。
Figure 2017507174
スキーム7試薬及び条件:a)Fmoc−L−Lys(Alloc)−OH、DIC、HOBt、DMAP、DMF、室温、16時間;すすぎ、次いで、無水酢酸、DIPEA、DMF、室温、1時間;b)DMF中20%ピペリジン、室温、30分、すすぎ、次いでFmoc−Lys(Mtt)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温、3サイクルで1時間;c)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、すすぎ、次いでミリスチン酸、HBTU、DIPEA、DMF、室温、1時間;d)Pd(PPh、フェニルシラン、DCM、20時間;e)バンコマイシン、HBTU、DIPEA、DMF、18時間;f)DCM中2%TFA 5%TES、30分間。
実施例6.MCC000455の合成:液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成による、Lys−NHリンカーを有する化合物の生成
Figure 2017507174
スキーム8試薬及び条件:a)DMF中20%ピペリジン、室温、30分、すすぎ、次いで、Fmoc−L−Lys(Boc)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温;b)DMF中20%ピペリジン、室温、30分、すすぎ、次いで、Fmoc−Lys(ivDde)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温;c)DMF中20%ピペリジン、室温、2×30分、すすぎ、次いで、ウンデカン酸、HBTU、DIPEA、DMF、室温、1時間;d)20% TFA、5% TES、DCM;e)バンコマイシン、PyBOP/HBTU、DIPEA、DMF/DMSO;f)DCM中2%ヒドラジン。
Rink Amide AM樹脂のFmoc脱保護:
Rink Amide AM樹脂(ローディング0.94mmol/g、300mg)を、DMF中20%ピペリジン(6.0ml)により処理し、室温で30分間振とうして、Fmoc保護基を除去した。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Rink Amide AM樹脂のFmoc−L−Lys(Boc)−OHによるローディング:
Fmoc−L−Lys(Boc)−OH(703mg)をDMF(3.0ml、0.5M)に溶解させた。HBTUのDMF溶液(3.0ml、0.5M)を加え、それに続いてDIPEA(523μl)を加えた。溶液を室温で10分間静置し、次いで、先にDMFで3回洗浄した樹脂に加えた。次いで、樹脂を室温で1時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Fmoc脱保護:
樹脂をDMF中20%ピペリジン(6.0ml)により処理し、室温で30分間振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Fmoc−L−Lys(ivDde)−OHとのペプチドカップリング:
Fmoc−L−Lys(ivDde)−OH(423mg)のDMF溶液(4..5ml、0.167M)を調製した。これに、HBTUのDMF溶液(1.5ml、0.5M)を加え、それに続いてDIPEA(261μl)を加えた。溶液を室温で10分間静置し、次いで、先にDMFで3回洗浄した樹脂に加えた。次いで、樹脂を室温で2時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。この工程を繰り返した。
Fmoc脱保護及びFmoc−L−Lys(ivDde)−OHとのカップリング工程を繰り返し、それに続いて別のFmoc脱保護を行った。
ウンデカン酸とのカップリング:
ウンデカン酸(279mg)のDMF(3.0ml)溶液を、HBTUのDMF溶液(3.0ml、0.5M)及びDIPEA(523μl)と混合した。溶液を室温で10分間静置し、次いで、先にDMFで3回洗浄した樹脂に加えた。樹脂を室温で1時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。樹脂を真空中で乾燥させた。5mgの樹脂を切断して、反応の程度を確認した。樹脂を1.0mlアセトニトリルに溶解させ、0.45μmシリンジフィルターに通して濾過し、LCMSにより分析した。LCMS分析:RT 9.088分、ELSDにより80%、(M+H)+ 982.5、(M+2+)2+ 491.9、(M+3H)3+ 328.3。
Rink Amide AM樹脂の切断及びBoc脱保護:
20%TFA、5%トリエチルシランのDCM溶液(6.0ml)を調製し、樹脂(300mg)に30分間加えた。樹脂を濾過により除去し、DCM(×3)及びアセトニトリル(×3)で洗浄した。溶媒を真空中で除去した。樹脂を、1:1のACN/HOに溶解させ、凍結乾燥した。
バンコマイシンとの液相カップリング:
グローブボックス中で、ペプチド(40mg、40.7μmol)を乾燥DMF(0.7ml、58.1mM)に溶解させた。乾燥DMSO(0.7ml、69.7mM)中のバンコマイシン.HCl(72mg、FW1485.71、48.8μmol、1.2当量)を、溶解するまで加熱し、溶液は透明であった。溶液を室温に冷却し、ペプチドに加えた。HBTU(95mg、FW 379.3)の乾燥DMF溶液(0.5ml、0.5M)の98μlの溶液と、それに続いてDIPEA(29μl、4.1当量)を加え、一晩撹拌した。LCMS分析:Rt 7.189分、ELSDにより25%、(M+2H)2+ 1207.4、(M+3H)3+ 805.3、(M+4H)4+ 604.4。
ivDde脱保護:
バンコマイシン誘導体を、1:1のDMF/DMSO中の2%ヒドラジン一水和物1.0mlにより処理し、室温で一晩撹拌した。0.8mlの1:1のACN/HOに20μlの溶液を溶解させ、30分後、2時間後、及び一晩の後LCMSにより分析することにより、反応の程度を確認した。LCMS分析:所望の生成物Rt 5.388分、ELSDにより50%、(M+2H)2+ 1000、(M+3H)3+ 667.8、(M+4H)4+ 501;1つのivDdeのみ除去されたものRt 6.376分、ELSDにより20%、(M+2H)2+ 1103、(M+3H)3+ 736.5、(M+4H)4+ 552.6。次いで、溶媒を、高真空下35℃で一晩除去した。
最終生成物の精製:
粗生成物を水/ACNに溶解させ、島津分取HPLCにより精製した。精製された生成物を凍結乾燥すると、白色粉末、19mgを与え、切断したペプチドの量に基づいて19%であった。
実施例7.非分岐ジアミンリンカーを有する化合物を製造する一般的手順:液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
Figure 2017507174
スキーム9試薬及び条件:i)Fmoc−L−Lys(Mtt)−OH、DIC、HOBt、DMAP、DCM、DMF;ii)DMF中20%ピペリジン、室温、30分;iii)Fmoc−L−Lys(Mtt)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温;iv)RCOOH、HBTU、DIPEA、DMF又はRSOCl、DIEA;v)NH(CHNH、DIPEA、DMF、50℃;vi)バンコマイシン、HBTU、DIPEA、DMF/DMSO;vii)2% TFA、5% TES、DCM。
Hypogel HMBA樹脂からの1,3−ジアミノプロパン及び1,2−ジアミノエタン媒介切断の一般的手順:
1,3−ジアミノプロパン又は1,2−ジアミノエタンのDMF溶液(2.0M、樹脂100mgあたり2.0ml)を、ガラスバイアル中で樹脂に加えた。バイアルを固く締め、50℃で一晩加熱した。樹脂及び溶液を固相反応管に移した。濾液を回収し、樹脂を、DMF(×3)、メタノール(×3)、及びアセトニトリル(×3)で洗浄した。洗液を濾液と合わせ、溶媒を減圧下で除去すると、粗製のリポペプチドを、C末端アミノ−アルキルアミドとして与えた。粗製のリポペプチドを、さらに精製せずに、バンコマイシンとの液相カップリング反応に使用した。
実施例8.MCC000344の合成:液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
Figure 2017507174
Fmoc−L−Lys(Mtt)−OHのHypogel HMBA樹脂へのローディング:
1.5gのHMBA Hypogel樹脂(ローディング:0.81mmol/g)をDMF(3×)で洗浄した。Fmoc−L−Lys(Mtt)−OH(3.8g、MW 624.8g/mol、5当量)の溶液を、15mLのDMF中に調製した。ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)(0.82g、MW 135、5当量)、N,N−ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)(941μL、MW 126.2g/mol、5当量)、及び4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)(44.5mg、MW 122.17)を、アミノ酸溶液に加えた。溶液を、事前洗浄した樹脂に加え、一晩室温で振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(3×)、MeOH(3×)、及びDCM(3×)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
Fmoc保護基の脱保護:
250mgの樹脂を、DMF(3×)で事前洗浄し、2.5mLのDMF中20%ピペリジン(樹脂100mgあたり1.0mL)により処理し、室温で1時間振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(3×)、MeOH(3×)、及びDCM(3×)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
樹脂に結合したペプチドへのアミノ酸カップリング:
Fmoc−L−Lys(Mtt)−OH(1539mg、MW 624.8g/mol、2当量)の14.75mLのDMF中の溶液を調製した。HBTUの乾燥DMF溶液(0.5M、4.92mL)及びDIPEA(1713μL、MW 129.25)を、アミノ酸溶液に加えた。溶液を室温で10分間静置し、次いで、事前洗浄した樹脂に加え、一晩室温で振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(3×)、MeOH(3×)、及びDCM(3×)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
Fmoc保護基の脱保護:
250mgの樹脂を、DMF(3×)により事前洗浄し、2.5mLのDMF中20%ピペリジン(樹脂100mgあたり1.0mL)により処理し、室温で1時間振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(3×)、MeOH(3×)、及びDCM(3×)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
樹脂に結合したペプチドへの挿入要素のカップリング:
ウンデカン酸(105mg、MW 186.29g/mol 5.1当量)の1.13mLのDMF中の溶液及びHBTUの乾燥DMF中の溶液(1.13mL、0.5M、5.1当量)を調製した。HBTU溶液をウンデカン酸溶液に加え、それに続いてDIPEA(196μL、MW 129.25g/mol、d 0.742、10.2当量)を加えた。溶液を室温で10分間静置し、次いで事前洗浄した樹脂(225mg)に加え、室温で一晩振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(3×)、MeOH(3×)、及びDCM(3×)で洗浄し、真空中で乾燥させた。
1,3−ジアミノプロパンを使用する樹脂切断:
25mgの樹脂を、0.75mLの1,3−ジアミノプロパン及び0.15mLのDIPEAにより処理した。反応混合物を、一晩室温で撹拌したままにした。切断されたペプチドを、DCM(3×)、MeOH(3×)、及びACN(3×)を使用した樹脂洗液と共に回収した。溶媒を蒸発させ、真空中で乾燥させた。
ペプチドとバンコマイシンの液相カップリング:
バンコマイシン.HClの溶液(195.76mg、MW 1485.7g/mol、0.125M、1.2当量)を、1.05mLの乾燥DMSO中に調製した。バンコマイシンを完全に溶解させるには、穏やかな加熱が必要である。観察された色はピンクから薄茶色に変化した。乾燥DMF中のHBTU(0.26mL、MW 379.3g/mol、0.5M 1.2当量)をバンコマイシン溶液に加え、それに続いてDIPEA(78.42μL、MW 129.25g/mol、4.1当量)を加えた。溶液をペプチドに加え、室温で一晩撹拌したままにした。バンコマイシン誘導体を、高真空下で蒸発乾固させた。
Mtt保護基の脱保護
2%TFA、5%トリエチルシランの乾燥DCM溶液20mLを、バンコマイシン誘導体(200mg)に加えた。溶液を室温で30分間撹拌したままにした。溶媒を蒸発させ、真空中で乾燥させ、最終生成物MCC000344を分取HPLCにより精製した。
実施例9.トリアゾールリンカーを有する化合物の合成:MCC000453を製造する、液相グリコペプチドカップリングを含む固相合成
Figure 2017507174
スキーム10試薬及び条件:i)DMF中20%ピペリジン、室温;ii)Fmoc−L−プロパルギルグリシン−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温;iii)Fmoc−L−Lys(Boc)−OH、HBTU、DIPEA、DMF、室温;iv)ウンデカン酸、HBTU、DIPEA、DMF、室温;v)20%TFA、5%TES、DCM;vi)CuSO、NaAsc、DMF、HO。
Rink Amide AM樹脂のFmoc脱保護:
Rink Amide AM樹脂(ローディング0.81mmol/g、300mg)を、DMF中20%ピペリジン(6.0ml)により処理し、室温で30分間振とうし、Fmoc保護基を除去した。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Fmoc−L−プロパルギルグリシンによるRink Amide AM樹脂のローディング:
Fmoc−L−プロパルギルグリシンをDMF(4.5ml、0.5M)に溶解させた。HBTUのDMF溶液(1.5ml、0.5M)を加え、それに続いてDIPEA(0.5M最終濃度)を加えた。溶液を室温で10分間静置し、次いで先にDMFで3回洗浄した樹脂に加えた。次いで、樹脂を室温で一晩振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Fmoc脱保護:
樹脂を、DMF中20%ピペリジン(6.0ml)により処理し、室温で30分間振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Fmoc−L−Lys(Boc)−OHとのペプチドカップリング:
Fmoc−L−Lys(Boc)−OH(703mg)のDMF溶液(3.0ml、0.5M)を調製した。これに、HBTUのDMF溶液(3.0ml、0.5M)を加え、それに続いてDIPEA(523μl)を加えた。溶液を室温で10分間静置し、次いで先にDMFで3回洗浄した樹脂に加えた。次いで、樹脂を室温で1時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
Fmoc脱保護:
樹脂をDMF中20%ピペリジン(6.0ml)により処理し、室温で30分間振とうした。樹脂から液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。
ウンデカン酸とのカップリング:
ウンデカン酸(279mg)のDMF(3.0ml)溶液を、HBTUのDMF溶液(3.0ml、0.5M)及びDIPEA(523μl)と混合した。溶液を室温で10分間静置し、次いで、先にDMFで3回洗浄した樹脂に加えた。樹脂を室温で1時間振とうし、液体を排出し、DMF(×3)、MeOH(×3)、及びDCM(×3)で洗浄した。樹脂を真空中で乾燥させた。
Rink Amide AM樹脂の切断及びBoc脱保護:
20%TFA、5%トリエチルシランのDCM溶液(0.5ml)を調製し、樹脂に加え、30分間静置した。樹脂を、濾過により除き、DCM(×3)及びアセトニトリル(×3)で洗浄した。溶媒を真空中で除去した。残渣を、1:1のACN/HOに溶解させ、凍結乾燥した。1mgの試料を1.0mlのアセトニトリルに溶解させ、0.45μmシリンジフィルターに通して濾過し、LCMSにより分析した:−Rt 6.38分、ELSDにより90%、(M+H)+ 537.3、(M+2H)2+ 269.2。
アジドアルキルアミンバンコマイシンの調製:
バンコマイシンアジド誘導体の液相カップリング(「クリック」反応):
バンコマイシン−アジドアナログ(1.5mg、1μmol)をHOに溶解させた。この溶液に、CuSO.5HO(0.5mg、2μmol)及びアスコルビン酸ナトリウム(1mg、5μmol)を加えた。生じた溶液を、ペプチド(0.5mg、1μmol)のDMF(250μl)溶液に加え、次いで、マイクロ波中で80℃で10分間加熱した。0.125mlの溶液を、0.375mlの1:1 ACN/HOと混合し、0.45μmシリンジフィルターに通して濾過し、LCMSにより分析した:Rt 5.522分、ELSDにより70%、(M+2H)2+ 1034.3、(M+3H)3+ 690、(M+4H)4+ 517.7。粗生成物を水/ACNに溶解させ、島津分取HPLを利用して、凍結乾燥により精製すると、白色粉末、1.3mgが生じ、切断したペプチドの量に基づき16%であった。LCMS:Rt 5.57 95%(ELSD)[M+2H]2+ 1033.8、[M+3H]3+ 690.2、[M+4H]4+ 517.8。
実施例10.合成した化合物のまとめ
化合物を、上述の経路又はその変形体の1つ以上により合成した。合成の分野の通常の技量を有する化学者は、使用される試薬の変更により(アミド結合形成のための代りのカップリング試薬の取り換えなど)、又は保護基の装着、種類、及び除去の順序を変えることにより、又は成分が組み立てられる順序を変えることにより、述べられた手順を変更しても、所望の生成物が製造されることを認識するであろう。
Figure 2017507174
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抗菌活性の決定
化合物の抗菌活性を、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)(MRSA ATCC 43300、GISA NRS17、VISA NRS1、MRSA臨床分離株、ダプトマイシン耐性臨床分離株)、ストレプトコッカス・ニューモニエ(Streptococcus pneumoniae)(MDR ATCC 700677)、エンテロコッカス・フェカリス(Enterococcus faecalis)(VanA臨床分離株)、及びエンテロコッカス・フェシウム(Enterococcus faecium)(MDR Van A ATCC 51559)を含むいくつかの細菌株に対して実施した。
全化合物を、1mM濃度のストック溶液から160ug/ml水溶液に調製した。
MICアッセイ:
化合物を、標準的な抗生物質と共に、96ウェルノンバインディングサーフェイスプレート(NBS, Corning)のウェルにわたって連続的に2倍希釈した。標準は64μg/ml〜0.03μg/mlであり、化合物は8μg/ml〜0.003μg/mlであり、最終体積はウェルあたり50μLであった。グラム陽性細菌を、ミュラー(Muller)ヒントンブロス(MHB)(Bacto laboratories、カタログ番号211443)中で、37℃で一晩培養した。次いで、各培養物の試料を新しいMHBブロスで40倍に希釈し、37℃で2〜3時間インキュベートした。生じた対数中期培養物を、5×10e5 CFU/mLの最終濃度に希釈し、次いで、50μLを、化合物含有96ウェルプレートの各ウェルに加えた。全プレートを覆い、37℃で24時間インキュベートした。MICは、目に見える増殖を全く示さない最低濃度であった。
MBCアッセイ:
最小殺菌濃度(MBC)を決定するために、MIC値を決定した後に、30μlのレサズリン(0.01%)を、96ウェルプレートの各ウェルに加えた。次いで、化合物を37℃でさらに18〜24時間インキュベートした。青く発色したウェルは死んだ微生物を示し、ピンクの発色のあるウェルは生きている微生物を示す。MBC値は、青い発色のウェルの最低濃度により決定した。
検出及び分析:
MICを24時間のインキュベーションで目視で決定し、MICを、インキュベーション後に増殖が全く見られない最低濃度と定義した。MICとMBCの両方を、目視検査のみで決定した。
生物学的結果のまとめ
上記で測定された抗菌活性を、3つの代表的な細菌株に対して以下の表にまとめる。
Figure 2017507174
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ヒト血漿中の化合物の安定性
ヒト血漿安定性アッセイを、Di, L.;Kerns, E. H.;Hong, Y.;Chen, H. Development and application of high throughput plasma stability assay for drug discovery(International Journal of Pharmaceutics 2005, 297, 110-119、改変あり)に記載の方法に従って実施した。
簡単に言うと、試験化合物(20μM)を1mMストック溶液から調製した。ヒト血漿試料(200μl)を、使用前に、160μlのリン酸緩衝食塩水(PBS、pH 7.4)で50%v/vの濃度に希釈した。次いで、溶液をボルテックスにかけ、37℃の振とう器に置き、10分間穏やかに振とうした。次いで、40μlの試験化合物を血漿試料に加え、ボルテックスにかけた。反応時間t=0時間で、50μlの試料を直ちにエッペンドルフチューブに移し、150μlの冷アセトニトリルでクエンチした。残りの血漿溶液をインキュベートし、37℃で振とうした。他の試料を、0、1、3、6、及び24時間の時点で回収し、そのために50μlのアリコートを除き、150μlの冷アセトニトリルでクエンチした。全試料を4℃の冷蔵庫に10分間置き、次いで3000rpmで15分間遠心分離した。上清(100μl)をLCMS分析用のガラスバイアルインサートに移した。0時間の時点での試料に対する、各個別の時点で残っている試験化合物のパーセンテージを報告した。
プロトコル:
化学薬品:DMSO、アセトニトリル、及びリン酸緩衝食塩水(PBS pH 7.4、等張性)。
血漿:ヒト血漿(貯蔵された正常なヒト血漿ヘパリン抗凝固剤50mL(IPLA−2 N−04ロットIR09−1001、元々はInnovative Research製であり、BioCoreにより輸入された)。
消耗品:エッペンドルフチューブ(ユーカトロピン及びバンコマイシン)、低結合エッペンドルフチューブ(化合物用)、及びAgilentガラスHPLCバイアル及びインサート。
装置:37℃振とう器、ボルテクサー、遠心分離機、及びLC−MS。
ストック溶液:
全化合物は100%の水中(20μMに等しい400μLアッセイ体積中の40μL)
ユーカトロピン:100%DMSO中300μg/mL(23μMに等しい400μLアッセイ体積中の10μL)。
血漿安定性アッセイ手順
緩衝液のみの対照試料の調製:
化合物:40μLのバンコマイシン誘導体溶液を、それぞれエッペンドルフチューブ中の160μLのPBS(pH7.4)に加えた。600μLの冷アセトニトリルを加え、チューブをボルテックスにかけ、LC−MS分析用のガラスバイアルに移した。
50%血漿とPBS緩衝液の時間0、1、3、6、及び24時間での血漿安定性プロトコル:
ユーカトロピン:200μLの血漿と190μLの緩衝剤をボルテックスにかけ、37℃で10分間振とうした。次いで、10μLのユーカトロピン溶液を加え、チューブをボルテックスにかけた。50μLのアリコートを直ちにエッペンドルフチューブに移し、150μLの冷アセトニトリルを加え、チューブを4℃の冷蔵庫に10分間移した。次いで、残りの血漿溶液をインキュベーターに移し、37℃で振とうした。チューブを冷蔵庫から取り出し、3000rpmで15分間遠心分離し、100μLの上清をLC−MS分析用のガラスバイアルインサートに移した。50μLのアリコートを、上記の通り、1、2、3、6、及び24時間で処理し、5μLを、分析のためにトリプル四重極MSシステムに注入した。
バンコマイシン誘導体:200μLの血漿と160μLの緩衝剤をボルテックスにかけ、37℃で10分間振とうした。次いで、40μLの化合物を加え、試料を上記の通り処理した。
Figure 2017507174
グルタチオン存在下での化合物の安定性
生理学的濃度のグルタチオンの存在下での化合物の安定性を以下のプロトコルに従って評価した:20μLの1mMの試験化合物のストック溶液を、プラスチックHPLCインサート中の180μLのグルタチオン(還元型)PBS溶液に加え、溶液に、100μMの化合物及び5mMか0.5mMのいずれかのグルタチオンの最終濃度を与えた。試料をHPLCサンプリングラックに置き、1時間に1回の間隔で10時間までサンプリングした。注入の直前に試料を調製するように注意を払った。次いで、化合物の減少に関して、UV面積を時間に対してプロットした。0時間での総バンコマイシン誘導体に対して、パーセンテージをプロットした。結果を図1に示す。
マウス中の化合物の薬物動態プロファイル
インビボ実験アッセイ:体重が25〜35gの7〜9週齢の雄のCD1マウス(SLAC Laboratory Animal Co. Ltd., Shanghai, China)を、試験に使用する前におよそ3日間順化させた。動物を、National Research CouncilのGuide for the Care and Use of Laboratory Amimalsに従って、順化及びインライフ試験の間群飼する。温度及び相対湿度を毎日モニターしながら、動物室の環境を制御する(目標条件:温度18〜26℃、相対湿度30〜70%、12時間人工光及び12時間暗がり)。製剤投与の前およそ16時間、動物に餌を与えず、次いで投薬の4時間後にCertified Rodent Diet(カタログ番号M−01F、Shanghai SLAC Laboratory Animal Co. Ltd.)に自由にアクセスさせた。水を、動物に自由に与える前に、オートクレーブにかける。化合物の製剤を、投薬日の朝に調製した。IV群の製剤を、動物に投薬する前に、0.22μmのフィルターで濾過した。用量製剤調製の後に、二連の50μLアリコートを、用量確認のために各用量製剤から除いた。
試験した各化合物に関して、3匹のマウスには、2mg/kgの投与量(遊離塩基濃度に基づく)を与え、投与体積2ml/kgで、1mg/mLの脱イオン水中に製剤された試験物品を使用して、施設のSOPに従い尾静脈により各動物に投与して静脈内に(IV)投薬した。追加の3匹のマウスには、10mg/kgの投与量を与え、5ml/kgの投与体積で、2mg/mLの脱イオン水中に製剤された試験物品を使用して、施設のSOPに従い各動物の背中に皮下ボーラスにより各動物に投与して皮下に(SC)投薬した。
全動物を、最後の試験時点で安楽死させた(100%COを、動物ボックスに導入した)。
試料回収:血漿試料を、各用量投与の後、以下の目標時間で回収した:
IVサンプリング時点(投薬後の時間):0、0.083、0.25、0.5、1、2、4、8、24。
SCサンプリング時点(投薬後の時間):0、0.25、0.5、1、2、4、8、24。
最初のいくつかの時点では、およそ30μLの血液を、顎下腺又は伏在静脈を介して得た。最後の時点では、マウスが麻酔にかかっている間に(100%COを動物ボックスに導入)、心臓穿刺により試料を得た。全血液試料を、2μLのK2−EDTA(0.5M)を抗凝固剤として含む予冷したプラスチックマイクロ遠心チューブに移し、遠心分離まで濡れた氷上に置いた。収集した血液試料を、回収の30分以内に、7,000rpm、4℃で約10分間遠心分離した。遠心分離後、血漿を、あらかじめラベルを貼り予冷した別のポリプロピレンマイクロ遠心チューブに移し、次いで、ドライアイス上で急速冷凍し、LC/MSMS分析まで−70±10℃で保存した。
試料分析:
投薬製剤確認:製剤のアリコートを、二連で各用量製剤の中心の位置で収集した。LC−UV法を、6つの較正標準からなる較正曲線により開発した。用量製剤試料中の試験化合物の濃度を、LC−UV法により決定した。分析単位の受入基準:6つの較正標準のうち少なくとも5つが、正常値の20%以内でなくてはならない。
血漿試料:試験に使用した動物血漿中の試験物品の定量的な決定のためのLC−MS/MS法を、内部標準により決定した。マウス血漿中の化合物のベンチトップ安定性を、中QCの濃度で、三連で、0、2時間に、室温で決定した。安定性を、T2/T0試料の平均ピーク面積比を利用して決定した。平均ピーク面積比が80%〜120%以内である場合、血漿中の試験物品は、室温で2時間安定であると考えられる。標準曲線は、3ng/mL以下の目標LLOQで、LC−MS/MS法の8つの非ゼロ較正標準からなる。1セットのQC試料は、3つの濃度レベル(低、中、及び高)からなる。試料分析を、1セットの較正標準及び2セットのQC試料と同時に、LC−MS/MS法を利用して実施した。血漿バイオ分析単位の受入基準:最低で6つの較正標準が、その公称濃度の±20%以内に逆算され;且つ6つのQC試料のうち最低4つが、その公称濃度の±20%以内に逆算される。分析物干渉:単一のブランクマトリックス中の平均計算濃度がLLOQの0.5倍以下でなくてはならない。キャリーオーバー:最高標準注入の直後の単一のブランクマトリックス中の平均計算キャリーオーバー濃度はLLOQ以下でなくてはならない。
データ分析:個別の動物の血漿濃度対時間データを、WinNonLinノンコンパートメントモデル(Phoenix WinNonlin 6.2.1, Pharsight, Mountain View, CA)により分析した。薬物動態パラメーターC0、T1/2、CL、Vdss、Cmax、Tmax、AUC0−last、AUC0−inf、%F、MRT0−last、MRT0−inf、及び血漿濃度対時間プロファイルのグラフを誘導し、図2に表す。
ネズミ大腿部感染モデルにおける化合物の効能
概要:成体(8週齢)の雌のCD1マウスを、感染の4日前及び1日前の2回のシクロホスファミドの注射により、好中球減少にさせた。10cfu MRSA(Strain ATCC 43300)の接種物を、全マウスの左右両方の大腿部に筋肉内注射した。感染開始の2時間後に、食塩水、バンコマイシン、又は本発明の化合物を、腰部に皮下注射した。さらに2時間後、50μLの血液試料を、尾部の出血から得て、抗生物質化合物の存在に関して分析した。感染後24時間で、マウスを安楽死させ、追加の血液試料を化合物分析のために回収した。次いで、大腿部を取り除き、秤量し、一定体積の食塩水中でホモジナイズした。ホモジネート溶液を濾過し、希釈し、寒天プレートの上に播種し、それを一晩37℃でインキュベートした。コロニー数を利用して、大腿部ホモジネート中のcfu、cfu/大腿部、及びcfu/大腿部のgに到達した。
化合物調製:シクロホスファミド一水和物(Sigma)を滅菌食塩水に溶解させて30mg/mLの濃度にした。同様に、バンコマイシン(Sigma)及びMCC化合物も滅菌食塩水に溶解させて、それぞれ60mg/mL及び18.5mg/mLの最終濃度にした。全化合物を低結合エッペンドルフチューブ中に調製し、使用まで−20℃に保った。
インビボ実験アッセイ:8週齢の雌の非近交系CD1マウス(UQBR−AIBN)を、実験感染の4日前(150mg/kg)及び1日前(100mg/kg)の2回のシクロホスファミド腹腔内注射により好中球減少にした。MRSAを使用する感染モデルを、食塩水中の対数増殖早期細菌MRSA懸濁液(およそ2×10cfu/mL)50μLの両大腿部筋肉への筋肉内注射により確立した。2時間後、バンコマイシン(200mg/kg)又は本発明の化合物(25mg/kg)の単回投与を、皮下注射により肩甲骨間に(首の後ろの領域)投与した。未処置の動物には、同体積の食塩水(Baxter)を与えた。マウスを、投薬の間及びその後に、正常な挙動(すなわち、身づくろい、食べること、飲むこと、睡眠、及び警戒)の徴候に関してモニターした。食塩水/抗生物質処置の2時間後、0.05mLの血液を、尾の切断により収集した。MRSA感染の24時間後、マウスを安楽死させ、血液を、図1に概説した通り、心臓から心臓穿刺により(食塩水群)又は尾の切断により(バンコマイシン及びMCC化合物処置群)収集した。各マウスで、脚を尻と膝で切ることにより両大腿部を無菌で収集し、10mlの冷滅菌食塩水に入れて、各大腿部の個々の重量を記録した。
注射用MRSA溶液の調製:MRSA二次培養細菌分離株(ATCC43300)を、−80℃の保管庫から取り出し、一晩(O/N)の増殖のために新たに寒天プレート上に播種した。一晩培養調製物から、単一のコロニーを10〜12mLのミュラーヒントンブロス(MHB)に希釈し、37℃で一晩にインキュベートした。100μLの一晩二次培養物を10mLのMHBに加えることにより対数期の二次培養物を得て、さらに2〜3時間インキュベートした。最後に、細菌懸濁液のOD600値を決定し、ミリリットルあたりのコロニー形成単位(cfu/mL)を外挿した。細菌細胞懸濁液の食塩水への完全な希釈液を、洗浄(3220xg 10分間)により得て、食塩水中のOD600を決定した。次いで、2×106cfu/mL溶液(50μL中105cfu/大腿部)を得るために、懸濁液を、それに応じて希釈した。
注射したMRSA溶液の定量化:MRSA注射液に存在する実際のcfu/mLと、OD600読み取り値に基づき推定されたcfu/mLを相関させることができるように、MSRA注射液からの標準的なプレートカウントを実施した。そのため、10μLの注射用MRSA懸濁剤を、10〜1000倍に希釈し、各希釈液を寒天プレートに播種し、37℃で24時間インキュベートした。2×106cfu/mLで推定された溶液から、18cfu/10μLが1:1000希釈で見いだされ、実際の注射用MRSA溶液に1.8×106cfu/mLの最終濃度を与えた。
血清試料調製:血液試料を、食塩水/バンコマイシン/MCC処置の2時間後(尾の切断)及び22時間後(心臓穿刺又は尾の切断)に、リチウム−ヘパリンMicrovette(登録商標)(Sardest)を使用して、又はヘパリンコートされたシリンジを使用して採取した。全試料を4℃に保ち、10000xgで15分間で沈降させた。血清を回収し、使用まで−80℃に保った。
大腿部ホモジネート及びCFU決定:大腿部を、200mMプローブを使用するPolytron MR2500E(全てKinematica)を利用して20000rpmで15秒間ホモジナイズした。ホモジネート溶液を、100μmのポアサイズのフィルター(BD)を使用して濾過し、1mlの濾液溶液を氷上に置き、段階希釈を手早く実施し(1:10及び1:100)、適切な普通寒天プレート(Bactolaboratories)上に播種し、37℃で一晩インキュベートした。翌日コロニーをカウントし、cfu/大腿部及びcfu/大腿部のグラムを、プレートカウント及び希釈係数に基づいて計算した。
代表的な結果を、以下の表6にまとめた結果と共に図3に示す。
Figure 2017507174
Figure 2017507174
ネズミの肺感染生存モデル(S.ニューモニエ(S. pneumoniae))における化合物の効能
体重が22±2gである10匹の雄の特定病原体不在ICRマウスの群を使用した。20μLのBHIに懸濁させたLD90〜100の投与量(2.96×10CFU/マウス)のストレプトコッカス・ニューモニエ(Streptococcus pneumoniae)(ATCC 6301)の気管内接種により、急性肺炎を誘発させた。ビヒクル(10ml/kg)、バンコマイシン、及び25mg/kgの試験物質を、感染2時間後にそれぞれ皮下に投与した。死亡率を、接種後10日間毎日記録した。ビヒクル対照群に対する50パーセント以上の(≧50%)生存率の増加は、有意な抗感染活性を示す。結果を図4に表す。

Claims (24)

  1. 式(III):
    X−W−L−V (III)
    [式中、
    Xは、WのN−末端に結合した親油性基であり、炭素原子がベースとなっており、且つ以下のパラメーターを有し;
    − 3〜60個の炭素原子であって、任意の脂環式環又は芳香環が存在する場合にはそれらの炭素原子を含めて3〜60個の炭素原子を有すること;
    − 直鎖又は分岐鎖であって、且つ後者の場合、1〜3個の分岐点を含むこと;
    − 飽和又は不飽和であって、後者の場合、1〜8個の二重又は三重結合を含むこと;
    − 任意選択的に、(ヘテロ原子が存在する場合であって、これらに加えて、芳香環が存在する場合には当該芳香環中に)酸性置換基中に含まれない最大6個のヘテロ原子であって、S、O、又はNから独立して選択されるヘテロ原子を有すること;
    − 任意選択的に、1個以上の芳香環であって、縮合していてよく、且つそのそれぞれが、存在する場合、N、O、又はSから独立に選択される1、2、又は3個のヘテロ原子を含み得る、1個以上の芳香環を含むこと;且つ
    − 任意選択的に、ヒドロキシ、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜6個の置換基を有すること;
    Wは、塩基性アミノ酸又は2〜10個のアミノ酸からなる塩基性ペプチドであって、但し、Wは、硫黄含有側鎖を有する任意のアミノ酸でなく、又はそれを含まず;
    Lは、式−NH−(CR−Z−(CR−NH−
    (式中、
    Zは、酸素又は−NH−、−CONH−、−NHCO−、−(OCHCH−、C〜C12アルキル、C〜C12アルケニル、C〜C12アルキニル、C〜C12ヘテロアルキル、C〜C10ヘテロアルケニル、C〜C12シクロアルキル、C〜C12複素環、C〜C18アリール、若しくはC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択される任意選択で置換されている部分であり;且つ
    、R、R、及びRは、H、ハロゲン、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C10ヘテロアルケニル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12複素環、任意選択で置換されているC〜C18アリール、任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール、任意選択で置換されているカルボキシ、任意選択で置換されているカルボキサミドからなる群からそれぞれ独立に選択され;且つ
    mは、0、1、2、及び3からなる群から選択される整数であり;且つ
    nは、0、1、2、及び3からなる群から選択される整数であり;
    但し、mとnとの両方が0ではなく;且つ
    pは、1〜10からなる群から選択される整数である)
    の連結基であるか、あるいは
    Lは、式:
    Figure 2017507174

    (式中、c及びdは、0、1、及び2からなる群から選択される整数であり;且つ
    点線は、V及びWへの結合点を示す)
    の1つから選択され;且つ
    Vは、細菌中のペプチドグリカン生合成を阻害するグリコペプチド部分である]
    の抗菌性化合物、又はその薬学的に許容できる塩若しくはプロドラッグ。
  2. Xが式R27CO−のものであり、式中、R27が3〜15個の炭素原子を有する親油性基であり、前記親油性基が:
    − 直鎖又は分岐鎖であり、且つ脂環式環又は芳香環であって、前記基中の炭素原子の総数が任意の前記環の炭素原子を含む、脂環式環又は芳香環を含むことができ;
    − 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜4個の二重又は三重結合を含み;
    − 任意選択的に、(ヘテロ原子が存在する場合であって、これらに加えて、芳香環が存在する場合には当該芳香環中に)1又は2個のヘテロ原子であって、O又はNから独立に選択されるヘテロ原子を有し;
    − 任意選択に、1又は2個の芳香環であって、そのいずれか若しくは両方が1個の窒素ヘテロ原子を含み得る、芳香環を含み;且つ
    − 任意選択的に、ヒドロキシル、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜3個の置換基を有する、請求項1に記載の化合物。
  3. Xが、式(IV):
    Figure 2017507174

    (式中、
    各R25及びR26が、以下のパラメーター:
    − 3〜30個の炭素原子であって、任意の脂環式環又は芳香環が存在する場合にはそれらの炭素原子を含めて3〜30個の炭素原子を有すること;
    − 直鎖又は分岐鎖であり、且つ後者の場合、1〜3個の分岐点を含むこと;
    − 飽和又は不飽和であり、後者の場合、1〜4個の二重又は三重結合を含むこと;
    − 任意選択的に、(ヘテロ原子が存在する場合であって、これらに加えて、芳香環が存在する場合には当該芳香環中に)1、2、又は3個のヘテロ原子であって、O、S、又はNから独立に選択されるヘテロ原子を有すること;
    − 任意選択的に1個以上、例えば、2又は3個の芳香環であって、縮合していてよく、且つそのそれぞれが、存在する場合、N、O、又はSから独立に選択される1、2、又は3個のヘテロ原子を含むことができる、芳香環を含むこと;且つ
    − 任意選択的に、ヒドロキシ、アミノ、メチル、メチルアミノ、及びハロから選択される1〜3個の置換基を有すること
    を有する、炭素原子に基づく親油性鎖であり;
    tが、0、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;且つ
    uが、0、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;
    但し、t又はuの一方が0である場合、t又はuの他方は0ではない)
    のものである、請求項1に記載の化合物。
  4. −L−が式−NH−(CH−Z−(CH−NH−のものであり;式中、Z、m、及びnが請求項1に定義されている通りである、請求項1〜3のいずれか一項に記載の化合物。
  5. Zが、C〜C12アルキル、NH、O、C〜C12複素環、C〜C18アリール、及びC〜C12シクロアルキルからなる群から選択される、請求項4に記載の化合物。
  6. −L−が、式−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−NH−(CH−NH−、−NH−(CH−O−(CH−NH−、−NH−(CH−O−(CH−NH−、−NH−(1,4−Ph)−CH−NH−、−NH−(1,3−Ph)−CH−NH−、−NH−(1,4−cHex)−CH−NH−、又は−NH−CH−(1,4−cHex)−CH−NH−のものである、請求項1〜5のいずれか一項に記載の化合物。
  7. −L−が、式−NH−CH(R)−Z−(CH−NH−のものであり、式中:
    が、−(CO)OH、−(CO)OMe、−(CO)NH、−(CO)NHNH、−(CO)NHMe、−(CO)NHEt、−(CO)N(Me)、−(CO)NHBn、若しくは−(CO)R、又は任意選択で置換されているC〜C12複素環、若しくは任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール部分であり;且つ
    が、任意選択で置換されているC〜C12複素環又は任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール部分であり;且つ
    Z及びnが、請求項1に定義されている通りである、請求項1に記載の化合物。
  8. −L−が式−NH−CH(R)−(CH−NH−のものであり、式中:
    qが、0、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;且つ
    が、−(CO)OH、−(CO)OMe、−(CO)NH、−(CO)NHNH、−(CO)NHMe、−(CO)NHEt、−(CO)N(Me)、−(CO)NHBn、若しくは−(CO)R、又は任意選択で置換されているC〜C12複素環、若しくは任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール部分である、請求項1又は7に記載の化合物。
  9. Vが、バンコマイシン、バンコマイシンアグリコン、バンコマイシンデスバンコサミン、デスメチルバンコマイシン、クロロエレモマイシン、テイコプラナイン−A−2、リストセチンA、エレモマイシン、バルヒマイシン、アクチノイジンA、コンプレスタチン、クロロペプチン1、キスタマイシンA、アボパルシン、テラバンシン、A40926、及びオリタバンシン、並びに一級アミンでR17により任意選択で置換されているそのいずれか1つから選択され、R17は、水素、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C10ヘテロアルケニル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択される有機側鎖部分である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の化合物。
  10. X−W−L−が、グリコペプチド遊離カルボキシル基へのアミド連結によりVに結合している、請求項9に記載の化合物。
  11. X−W−L−Vが、式(VI):
    Figure 2017507174

    (式中、
    X、W、及びLは、請求項1に定義されている通りであり;
    は、水素、炭水化物、又は4−エピ−バンコサミニル、アクチノサミニル、若しくはリストサミニルを含むがこれらに限定されないアミノ炭水化物であり;
    は、水素、OH、又は−O−マンノースであり;
    は、−NH、−NHCH、又は−N(CHであり;
    10は、−CHCH(CH、[p−OH,m−Cl]フェニル、p−ラムノース−フェニル、[p−ラムノース−ガラクトース]フェニル、[p−ガラクトース−ガラクトース]フェニル、[p−CHO−ラムノース]フェニルであるか、又は[p−OH,m−(O−{m−OH,m−R11}フェニル)]フェニルを介してR11に結合して環式環系を形成し;
    11は、−CH−(CO)NH、ベンジル、[p−OH]フェニル、[p−OH,m−Cl]フェニル;[p−OH,m−Cl]フェニルであるか、又は[m−OH,m−(O−{o−OH,m−R10}フェニル)]−フェニルを介してR10に結合して環式環系を形成し;
    12は、水素、又はマンノースであり;
    13は、水素、OH、又はCHNHCHPOであり;
    14は、水素、ベータ−D−グルコピラノース、ベータ−D−グルコサミン、2−O−(アルファ−L−バンコサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、2−O−(アルファ−L−4−エピ−バンコサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、(アルファ−アクチノサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、(アルファ−リストサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース、若しくは(アルファ−アコサミニル)−ベータ−D−グルコピラノース;又は前記グルコサミン若しくはグルコピラノース基のいずれか1つであって、その一級アミンでR17により任意選択で置換されている前記グルコサミン若しくはグルコピラノース基のいずれか1つであり、R17は、請求項9に定義されている通りであり;且つ
    15及びR16は、独立に、水素又はクロロである)
    のものである、請求項1〜8のいずれか一項に記載の化合物。
  12. Wが、塩基性アミノ酸又は2〜5個のアミノ酸を含む塩基性ペプチドであり、但し、Wは硫黄含有側鎖を有する任意のアミノ酸でなく、又はそれを含まない、請求項1〜11のいずれか一項に記載の化合物。
  13. Wが、式(V):
    Figure 2017507174

    (式中、
    Yは、式−(CR2021−の基であり;
    18aは、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール、−C(=NR22)−NR2324、及びOR22からなる群から選択され、
    18bは、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択されるか、又は
    18a及びR18bは、それらが結合している窒素原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成するか、又は
    18a及びR18bの一方が、R20又はR21のいずれか及びそれらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成し;
    19は、H及び任意選択で置換されているC〜C12アルキルからなる群から選択され;
    20及びR21は、H、ハロゲン、OH、C〜C12アルキル、C〜C18アリール、C〜C12ハロアルキル、C〜C12ヒドロキシアルキル、C〜C12アルキルオキシ、及びC〜C12ハロアルキルオキシからなる群からそれぞれ独立に選択されるか、又は
    20及びR21は、それらが結合している炭素と共に、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、又は任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル基を形成するか、又は
    20及びR21の一方が、R18aとR18bとの一方及びそれらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成し;
    各R22、R23、及びR24は、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から独立に選択されるか、又は
    22、R23、及びR24のいずれか2個が、それらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている環式基を形成し;
    gは、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;
    rは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、及び10からなる群から選択される整数である)
    の1個の残基又は2〜10個の連続する残基からなる、請求項12に記載の化合物。
  14. Yが(CHである、請求項13に記載の化合物。
  15. Wが、式(V):
    Figure 2017507174

    (式中、
    Yは式−(CR2021−の基であり;
    18aは、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリール、−C(=NR22)−NR2324、及びOR22からなる群から選択され、
    18bは、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12アルケニル、任意選択で置換されているC〜C12アルキニル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から選択されるか、又は
    18a及びR18bは、それらが結合している窒素原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成するか、又は
    18a及びR18bの一方が、R20又はR21のいずれか及びそれらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成し;
    19は、H及び任意選択で置換されているC〜C12アルキルからなる群から選択され;
    20及びR21は、H、ハロゲン、OH、C〜C12アルキル、C〜C18アリール、C〜C12ハロアルキル、C〜C12ヒドロキシアルキル、C〜C12アルキルオキシ、及びC〜C12ハロアルキルオキシからなる群からそれぞれ独立に選択されるか、又は
    20及びR21は、それらが結合する炭素と共に、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、又は任意選択で置換されているC〜C12ヘテロシクロアルキル基を形成するか、又は
    20及びR21の一方が、R18aとR18bとの一方及びそれらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている複素環部分を形成し;
    各R22、R23、及びR24は、H、任意選択で置換されているC〜C12アルキル、任意選択で置換されているC〜C12ヘテロアルキル、任意選択で置換されているC〜C12シクロアルキル、任意選択で置換されているC〜C18アリール、及び任意選択で置換されているC〜C18ヘテロアリールからなる群から独立に選択されるか、又は
    22、R23、及びR24のいずれか2個が、それらが結合している原子と共に、任意選択で置換されている環式基を形成し;
    gは、1、2、3、4、及び5からなる群から選択される整数であり;
    rは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、及び10からなる群から選択される整数である)
    の1個の残基又は2〜5個の連続する残基からなる、請求項12に記載の化合物。
  16. Yが(CHである、請求項15に記載の化合物。
  17. 前記残基又は連続する残基が、任意選択で置換されているD−若しくはL−リジン、オルニチン、2,4−ジアミノ酪酸、2,3−ジアミノプロピオン酸、及びアルギニンから選択される、請求項12〜16のいずれか一項に記載の化合物。
  18. Wが、−Lys−、−Lys−Lys−、−Lys−Lys−Lys−、−Orn−、−Orn−Orn−、−Orn−Orn−Orn−、−Lys−Orn−、−Orn−Lys、−Dab−、−Dab−Dab−、−Lys−Dab−、−Dab−Lys−、−Dab−Orn−、−Orn−Dab−、−Dap−、−Dap−Dap−、−Dap−Lys−、−Lys−Dap、−Dap−Orn、−Orn−Dap、−Dap−Dab−、及び−Dab−Dap−からなる群から選択され、前記アミノ酸のいずれも−L−配置又は−D−配置であり得る、請求項1〜17のいずれか一項に記載の化合物。
  19. 各任意選択の置換基が、ハロゲン、=O、=S、−CN、−NO、−CF、−OCF、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロアルキル、ハロアルケニル、ハロアルキニル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、アリールアルキル、シクロアルキルアルケニル、ヘテロシクロアルキルアルケニル、アリールアルケニル、ヘテロアリールアルケニル、シクロアルキルヘテロアルキル、ヘテロシクロアルキルヘテロアルキル、アリールヘテロアルキル、ヘテロアリールヘテロアルキル、ヒドロキシ、ヒドロキシアルキル、アルキルオキシ、アルキルオキシアルキル、アルキルオキシシクロアルキル、アルキルオキシヘテロシクロアルキル、アルキルオキシアリール、アルキルオキシヘテロアリール、アルキルオキシカルボニル、アルキルアミノカルボニル、アルケニルオキシ、アルキニルオキシ、シクロアルキルオキシ、シクロアルケニルオキシ、ヘテロシクロアルキルオキシ、ヘテロシクロアルケニルオキシ、アリールオキシ、フェノキシ、ベンジルオキシ、ヘテロアリールオキシ、アリールアルキルオキシ、アミノ、アルキルアミノ、アシルアミノ、アミノアルキル、アリールアミノ、スルホニルアミノ、スルフィニルアミノ、スルホニル、アルキルスルホニル、アリールスルホニル、アミノスルホニル、スルフィニル、アルキルスルフィニル、アリールスルフィニル、アミノスルフィニルアミノアルキル、−C(=O)OH、−C(=O)Ra、C(=O)OR、C(=O)NR、C(=NOH)R、C(=NR)NR、NR、NRC(=O)R、NRC(=O)OR、NRC(=O)NR、NRC(=NR)NR、NRSO、−SRa、SONRaRb、−OR、OC(=O)NR、OC(=O)R、及びアシルからなる群から独立に選択され、
    、R、R、及びRは、H、C〜C12アルキル、C〜C12ハロアルキル、C〜C12アルケニル、C〜C12アルキニル、C〜C10ヘテロアルキル、C〜C12シクロアルキル、C〜C12シクロアルケニル、C〜C12ヘテロシクロアルキル、C〜C12ヘテロシクロアルケニル、C〜C18アリール、C〜C18ヘテロアリール、及びアシルからなる群からそれぞれ独立に選択されるか、又はR、R、R、及びRのいずれか2個以上が、それらが結合している原子と共に、3〜12個の環原子を有する複素環式環系を形成する、請求項1〜18のいずれか一項に記載の化合物。
  20. 表1に開示される化合物から選択される、請求項1に記載の化合物。
  21. 請求項1〜20のいずれか一項に記載の任意の化合物の薬学的に許容できる塩。
  22. 請求項1〜20のいずれか一項に記載の化合物及び薬学的に許容できる担体、希釈剤、又は賦形剤を含む組成物。
  23. ヒト又は動物の体の治療の方法に使用するための、請求項1〜20のいずれか一項に記載の化合物又は請求項22に記載の組成物。
  24. 対象の細菌感染を治療する方法であって、対象に、有効量の請求項1〜20のいずれか一項に記載の抗菌剤又は有効量の請求項22に記載の組成物を投与することを含む、方法。
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Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11174288B2 (en) 2016-12-06 2021-11-16 Northeastern University Heparin-binding cationic peptide self-assembling peptide amphiphiles useful against drug-resistant bacteria
CN110312518A (zh) * 2016-12-09 2019-10-08 昆士兰大学 糖蛋白抗生物素构建体
WO2018102890A1 (en) * 2016-12-09 2018-06-14 The University Of Queensland Visualization constructs
IL270685B (en) * 2017-05-22 2022-09-01 Insmed Inc Cleavable derivatives of lipoglycopeptide and their uses
CN108060207B (zh) * 2017-12-29 2021-10-15 河南科技大学 一种基于微量天然化合物的最小杀菌浓度测定方法
CN109946398B (zh) * 2019-03-28 2022-05-24 丽珠集团新北江制药股份有限公司 一种检测达巴万星及其杂质的方法
CN116515102B (zh) * 2022-01-21 2025-04-18 苏州万维生命科学技术有限公司 星型β-抗菌糖肽、其制备方法及应用

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001501601A (ja) * 1996-09-12 2001-02-06 メルク エンド カンパニー インコーポレーテッド 前立腺ガンの治療において有用な共役体
JP2002503708A (ja) * 1998-02-23 2002-02-05 シンソーブ・バイオテック・インコーポレーテッド 抗生物質と毒素結合性オリゴ糖組成物を用いた細菌性赤痢の治療のための組成物と方法
WO2004022101A1 (en) * 2002-09-05 2004-03-18 Adprotech Limited Modified therapeutic agents
JP2004513132A (ja) * 2000-11-03 2004-04-30 ケンブリッジ・ユニバーシティ・テクニカル・サービシーズ・リミテッド 糖ペプチド及びペプチド性膜関連成分のコンジュゲートを含んでなる抗菌薬
JP2009529530A (ja) * 2006-03-09 2009-08-20 インフラザイム・ファーマシューティカルズ・リミテッド 新規の抗生物質組成物
JP2012506419A (ja) * 2008-10-23 2012-03-15 ステバ、バイオテック、ナムローゼ、フェンノートシャップ Rgd含有ペプチド模倣体及びその使用

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5840684A (en) 1994-01-28 1998-11-24 Eli Lilly And Company Glycopeptide antibiotic derivatives
GB9614871D0 (en) 1996-07-15 1996-09-04 Smithkline Beecham Plc Compounds
US6017511A (en) 1997-05-30 2000-01-25 Resolution Pharmaceuticals Inc. Glycopeptide-chelator conjugates
JP4381531B2 (ja) * 1999-12-08 2009-12-09 塩野義製薬株式会社 グリコペプチド誘導体
AU2001259298A1 (en) 2000-05-02 2001-11-12 Advanced Medicine, Inc. Polyacid glycopeptide derivatives
WO2002005837A1 (en) 2000-07-17 2002-01-24 Intrabiotics Pharmaceuticals, Inc. Antimicrobial sulfonamide derivatives of lipopeptide antibiotics
WO2004044222A2 (en) 2002-11-12 2004-05-27 Enzon Pharmaceuticals, Inc. Polymeric prodrugs of vancomycin
WO2007047608A2 (en) 2005-10-14 2007-04-26 Epix Pharmaceuticals, Inc. Fibrin targeted therapeutics
WO2011019839A2 (en) 2009-08-12 2011-02-17 The Medicines Company Glycopeptide and lipoglycopeptide antibiotics with improved solubility

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001501601A (ja) * 1996-09-12 2001-02-06 メルク エンド カンパニー インコーポレーテッド 前立腺ガンの治療において有用な共役体
JP2002503708A (ja) * 1998-02-23 2002-02-05 シンソーブ・バイオテック・インコーポレーテッド 抗生物質と毒素結合性オリゴ糖組成物を用いた細菌性赤痢の治療のための組成物と方法
JP2004513132A (ja) * 2000-11-03 2004-04-30 ケンブリッジ・ユニバーシティ・テクニカル・サービシーズ・リミテッド 糖ペプチド及びペプチド性膜関連成分のコンジュゲートを含んでなる抗菌薬
WO2004022101A1 (en) * 2002-09-05 2004-03-18 Adprotech Limited Modified therapeutic agents
JP2009529530A (ja) * 2006-03-09 2009-08-20 インフラザイム・ファーマシューティカルズ・リミテッド 新規の抗生物質組成物
JP2012506419A (ja) * 2008-10-23 2012-03-15 ステバ、バイオテック、ナムローゼ、フェンノートシャップ Rgd含有ペプチド模倣体及びその使用

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