JP2017520257A - 成長促進のためのビフィドバクテリウム・ブレーベcbt br3菌株及びこれを含む成長促進用機能性食品組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
1−1.菌株の選抜
ヒトの糞便1gを滅菌嫌気水に連続希釈(serial dilution)した後、各希釈液1mlをMan−Rogosa−Sharpe(MRS. BD. USA)固体培地に注ぎ、嫌気条件で3日間培養した。生成されたコロニーをMRSにBCP(Bromocresol purple、 0.17g/L)が添加された乳酸菌選択培地(BL固体培地)に移した後、同じ条件で3日間培養した。BCP指示薬は乳酸菌が乳酸を形成して周辺のpHが低くなると、紫色から黄色に変化する。コロニーの周辺の色が黄色に変化したコロニーを選択した後、生化学的、分子生物学的同定を行い、その後、菌株の機能性及び安定性が最も優れる菌株1種を最終選抜した。
1)APIキットを用いた生化学的同定
選抜された菌株の糖利用性を調べるために、API 50 CHL Carbohydrate Test Kit(bioMerieux Co., France)を用いた。10 mlのMRS(Man−Rogosa−Sharpe) 液体培地で37℃で17時間培養した後、1mlの培養液を回収してCHL溶液で2回洗浄した。続いて、遠心分離(MICRO−17、Hanil、KR)によって菌体を集めて9mlのCHL溶液に再懸濁させた。150μlの菌株懸濁液をAPI 50 CHLキットの各ウェルに入れた後、オートクレーブしたパラフィン油をウェル内の菌株懸濁液上に分注した。37℃で3日間培養した後、各々の糖利用性を比較した。49種の炭素源に対して微生物増殖による色の変化可否を観察して各炭素源の利用可否を観察し、最終同定の結果は、同定用プログラムAPI webを利用して解釈し、その結果を下記表1及び表2に示した。
分離した菌株からゲノムDNAを抽出し、16s rRNA塩基配列を分析した。糞便から分離した菌株の純粋培養液1mlでAccuprepゲノム抽出キット(Bioneer、Korea)を用いてゲノムDNAを抽出した。抽出したDNAを鋳型として16s rRNA領域をプライマーF(5’−AAGGAGGTGATCCAGCC−3’)3とプライマーR(5’−AAGGAGGTGATCCAGCC−3’)3を用いてPCR(MyCycler、BIO−RAD、USA)を行った。
RAPD分析は、糞便から分離した菌株からゲノムDNAを抽出し、分離したDNAを鋳型として(GTG)5(5’−GTGGTGGTGGTGGTG −3’) プライマーを用いて、PCR−RAPD (MyCycler、BIO−RAD、USA)を行った。最終の産物であるPCR産物は、EtBr (ethidium bromide)に染色した後、G:BOX (SYNGENE、UK)で観察した。RAPDの結果から分離した菌株は、図2に図示されたように、ビフィドバクテリウム・ブレーベT (ATCC 15700)と異なるバンドパターンを示していることが確認できた。従って、上記結果から、糞便から分離した菌株は、ビフィドバクテリウム・ブレーベT (ATCC 15700)と異なる新規な菌株であることを確認した。図2におけるレーン1は、ビフィドバクテリウム・ブレーベT(ATCC 15700)の結果であり、レーン2は、ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(KCTC 12201BP)の結果を示す。
MRS brothで純粋培養したビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3とビフィドバクテリウム・ブレーベT(ATCC 15700)のO.D.を測定した後、2%Low Melting Agaroseを用いて、最終にO.D600=4に合わせてプラグ(plug)を作製した。作製されたプラグを1mlリゾチーム緩衝液(2mg/ml Lysozyme (Sigma)、0.05% N−lauorylsarcosine (Sigma))に入れて、4 mg/ml Lysostaphin(sigma) 10μlを加えた後、37℃で一晩反応させた。プラグを慎重に取り外してNDS緩衝液(1ml 1M Tris−HCl(pH=8.0)、10 ml100% SDS、89 ml0.5M EDTA(pH=8.5)4mlに入れて、50℃で一晩反応させた。以降、軽く振とうしながら、50mM EDTA(pH 8.5) 10mlでプラグを6回洗浄した後、処理しようとする酵素緩衝液400μlにプラグを慎重に移し、常温で30分放置する。プラグを新たな酵素緩衝液400μlに移した後、制限酵素(20U)を入れて、37℃で一晩反応させた。このとき、制限酵素はNotIを使用した。電気泳動はCHEFシステム(BIO−RAD、USA)を用いて、0.5X TBEで5.3cm/V、1s〜15sパルスタイム、20時間実施した。
本発明によるビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3の特性は次の通りである。
1)抗生剤の耐性実験
分離したビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(KCTC 12201BP)の安全性を検証するために、抗生剤の耐性を分析した。抗生剤の耐性実験は、European Food Safety Authority (EFSA)で推薦するmicro−dilution方法を用いて行い、実験に用いられた抗生剤は10種であって、アンピシリン(AMP)、バンコマイシン(VAN)、ゲンタマイシン(GEN)、カナマイシン(KAN)、ストレプトマイシン(STM)、エリトロマイシン(ERM)、シナシッド(Q/D)、クリンダマイシン(CLM)、テトラサイクリン(TET)及びクロラムフェニコール(CP)である。
ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3の腸定着性の測定は、ビフィドバクテリウム・ブレーベT (ATCC 15700)を対照群として人の大腸上皮細胞に由来するHT−29細胞株で実施した。HT−29細胞株に各菌株を1時間処理した後、グラム染色と生菌の数を測定することによって、菌株の腸定着能を比較し、下記表5に示した。
溶血性テスト(Hemolysis test)は、ビフィズス菌が人体内で溶血性毒性がないことを確認するためのものであって、赤血球の破壊または分解する現象である溶血性可否を検査した。Baumgartner等の方法によって、試験菌株を5%馬血液が補充されたMRS培地で成長させ、嫌気性の条件下で37℃で48時間インキュベーションした。菌体の周りに透明環の生成可否で溶血性を判断した。本発明の菌株の溶血性可否を検査した結果、図4を通じて確認されるように、ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株は、馬の血液に対して溶血性がないため、人体に無害であることが確認された。
本発明のビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株に対する安全性を検証するために、実験動物を対象に急性毒性実験を実施した。6週齢の雌雄Sprague−Dawley (SD)系マウスに本発明の凍結乾燥された菌株を1.0×1011cfu/kgで経口投与した。対照群には0.85%塩水を胃内に投与した。全ての実験動物に対する臨床症状は、試料投与の1日から剖検日まで1日1回ずつ14日間観察した。観察結果は、下記表5に示した。
ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(KCTC 12201BP)菌株のゲノムシーケンシングは、PacBio RS II System (DNA Link、Republic of Korea)を用いて行った。ゲノムに対して、10 kbのライブラリーを作り、C2−P4 chemistryを有するSMRTcellのうち一つを用いて、ゲノムシーケンシングを実施した。ゲノムシーケンシングによって337,655,282 bpの長い配列が収得された。SMRTpipe HGAPによりDe novo組立を実施し、SMRTpipe AHAによってスキャフォールディングとギャップフィリングを行った。構造遺伝子の予測は、Glimmer3とし、遺伝子annotationはPfam、Uniref100、KEGG、COG及びGenBank NRデータベースに対してBLASTPによって得た結果を用いて、AutoFACT (Koski et al. 2005)によって行った。Transfer RNA及びリボソームRNAは、各々tRNAscan−SE (Lowe and Eddy 1997) 及びRNAmmer (Lagesen et al. 2007)を用いて行った。Clusters of Orthologous Groups (COGs) categoryによる遺伝子の機能的分類は、e−value cutoffを1e−2未満としてRPS−BLASTを用いて行った(Mavromatis et al. 2009)。
本発明のビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株のゲノムの遺伝子コンテンツ分析の結果、母乳オリゴ糖代謝に関する遺伝子中、α−マンノシダーゼ、β−マンノシダーゼ、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ、エンド−α−N−アセチルガラクトサミニダーゼ、シアリダーゼ、α−フコシダーゼをコード化する遺伝子を含むことが確認された。これによって、本発明の菌株が人の酵素によって消化されない母乳オリゴ糖を消化させて供給することができるということが分かる。
遺伝子分析の結果、本発明のビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株は、ビタミン、特にビタミンB群の生合成のための全ての遺伝子を有することが確認された。本発明のビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株のゲノムには、2種類のビタミンを合成することができる遺伝子が存在する。コリスミ酸から葉酸(B2)を合成し、L−アスパラギン酸塩からニコチン酸(B3)を合成する遺伝子を有することが確認された。
PAIs (Pathogenicity islands) 及びREIs(Antimicrobial resistance islands)に対する分析は、PAIデータベース(Yoon et al. 2007; Yoon et al. 2015)のPAI finderを用いて行った。分析の結果、本発明のビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株のゲノムには、PAI (Pathogenicity islands) 及びPAI−類似領域は存在しないことが確認された。
以下の実施例で、本発明の菌株の特性と成長促進用効能を立証する。全ての実施例の実験結果は、平均(mean)±標準偏差(SD)で表し、実験結果の統計処理は、GraphPad PrismTM 6.0を用いて、実験群間の平均の差は、one−way ANOVAで有意性を確認した後、Tukey’s multiple range testを用いて事後検証した。.
ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株(KCTC 12201BP)をBLブロス(BD Diagnostics、Sparks、MD)で24時間37℃で培養し、リン酸塩バッファー溶液(PBS、10mMリン酸ナトリウム、130mM塩化ナトリウム、pH7.4)に1011CFU/mlで希釈して超音波処理した後、上澄み液を遠心分離し、0.45μmポアサイズのフィルタでろ過し、凍結乾燥した後、−20℃に生体内実験前まで保管した。
動物実験は、Institutional Animal Care and Use Committee(IACUC)のAnimal use and Care Protocolを遵守して行った。実験動物は、Saeronbio Inc.(Uiwang、Korea)で雄のSD実験用マウス6週齢を(グループ当たり10匹、雌5匹、雄5匹)購入し、24時間の適応期間を有した後、17日間の飼育が行われ、飼育環境は24±2℃、湿度55±15%でlight cycleが12時間維持された。基礎食餌のために17日間麦成分の飼料(barley feed、A04、UAR、Vilemoisson−sur−Orge、France)を摂取するようにし、飲用水は自由に摂取したり、ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(107 CFU/head/day)を飲用水に混ぜて摂取するようにした。
本発明のビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3菌株の成長促進の効能を観察するために、麦成分の飼料を17日間食べさせて基礎食餌を誘導し、実験を始めた後17日まで毎日体重と摂取した飲用水及び飼料の量を測定した。体重の増加は、実験日の体重から実験開始日の体重を引いて計算した。飲用水と飼料は、ケージ別に測定した後、匹当たり計算して17日までの総量を計算した。体重増加の効率は、総摂取した飼料の量から増加した体重を割って計算した。
Claims (6)
- 成長促進のための韓国生命工学研究院遺伝子銀行(Korean Collection for Type Culture; KCTC)に受託番号KCTC 12201BPとして国際寄託されたビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(Bifidobacterium breve CBT BR3)ビフィズス菌。
- 前記ビフィズス菌は、母乳オリゴ糖を分解する遺伝子を有しており、前記遺伝子は、α−マンノシダーゼ、β−マンノシダーゼ、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ、エンド−α−N−アセチルガラクトサミニダーゼ、シアリダーゼ、及びα−フコシダーゼをコード化する遺伝子を含むことを特徴とする請求項1に記載のビフィズス菌。
- 前記ビフィズス菌は、ニコチン酸(B3)、及び葉酸(B9)の生合成遺伝子を含むことを特徴とする請求項1に記載のビフィズス菌。
- 請求項1によるビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(Bifidobacterium breve CBT BR3)(KCTC 12201BP)の菌株を含む成長促進用機能性食品組成物。
- 前記食品組成物は、ビフィドバクテリウム・ブレーベCBT BR3(受託番号:KCTC 12201BP)菌株の生菌または乾燥菌を108乃至1012cfu/g含むことを特徴とする請求項4に記載の成長促進用機能性食品組成物。
- 前記食品組成物が、ビフィドバクテリウム・ロンガムインファンティスCBT BT1(Bifidobacterium longum subsp. infantis CBT BT1)(KCTC 11859BP)、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥムCBT BF3(KCTC 12199BP)、及びビフィドバクテリウム・ロンガムCBT BG7(KCTC 12200BP)で構成される群から選択される一つ以上の他のプレバイオティク (prebiotic)をさらに含むことを特徴とする請求項4に記載の成長促進用機能性食品組成物。
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| JP2017521071A (ja) * | 2015-05-21 | 2017-08-03 | セル バイオテック カンパニー リミテッド | 成長促進のためのビフィドバクテリウム・ロンガムcbt bg7菌株及びこれを含む成長促進用機能性食品組成物 |
Non-Patent Citations (5)
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|---|---|---|---|---|
| JP2017521071A (ja) * | 2015-05-21 | 2017-08-03 | セル バイオテック カンパニー リミテッド | 成長促進のためのビフィドバクテリウム・ロンガムcbt bg7菌株及びこれを含む成長促進用機能性食品組成物 |
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