JP2017525754A - 能動的細胞免疫療法のためのサイトカイン組成物を用いたリンパ球の増殖 - Google Patents
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Abstract
Description
少なくとも1つのリンパ球を含む、哺乳動物由来の身体試料(body sample)、特に、組織試料または体液試料を得て、所望により身体試料中の細胞を分離する工程、
インビトロで身体試料を培養して試料中のリンパ球を増殖および/または刺激する工程であって、前記培養がIL−2、IL−15および/またはIL−21の使用を含む、前記工程、
ならびに、所望により培養試料中の臨床的に有用なリンパ球の存在を決定する工程、
を含む、臨床的に有用なリンパ球集団を作製する方法を提供する。
少なくとも1つのリンパ球を含む、哺乳動物由来の身体試料、特に、組織試料または体液試料を得て、所望により身体試料中の細胞を分離する工程、
IL−2、IL−15およびIL−21から選択されるサイトカインのうちの少なくとも2種を使用することを含む、インビトロで身体試料を培養して試料中のリンパ球を増殖および/または刺激する工程、及び
所望により培養試料中の臨床的に有用なリンパ球の存在を決定する工程
を含む、臨床的に有用なリンパ球集団を作製する方法を提供する。
T細胞の総数に対するTregの割合が5%未満、好ましくは3%未満である;
TH細胞の総数に対するTH1細胞の割合が少なくとも50%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%である、
CD8+T細胞の総数に対するCXCR3+T細胞の割合が少なくとも50%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%である、
T細胞の総数に対する4−1BB+T細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも2%、より好ましくは少なくとも2.5%である、
T細胞の総数に対するCD117+T細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも2%、より好ましくは少なくとも2.5%である、
T細胞の総数に対するCD3+CD4−CD8−細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも3%、より好ましくは少なくとも5%である;および
T細胞の総数に対するγδT細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも3%、より好ましくは少なくとも5%である。
哺乳動物におけるがん細胞の退縮をもたらし;
前悪性病変から悪性病変への推移を妨げ;
腫瘍細胞もしくは前悪性細胞の急速な老化をもたらし;
自己抗原陽性細胞の除去をもたらし;
病原体の殺傷、増殖停止もしくは封じ込めをもたらし;
がん幹細胞を妨害し;および/または
がん細胞、もしくは自己抗原を発現する細胞の増殖停止を誘導する。
A)材料および機器
i)機器
24ウェルプレート(ベクトン・ディッキンソン社(BD)、REF353504)
滅菌メス
滅菌ピンセット
Medimachine(組織ホモジネート装置)(BD、カタログ番号340588)
Medicon、50μm、(BD、カタログ番号340591)
Filcons、200μm(BD、カタログ番号340613)
層流フード(クラス2バイオセイフティフード)
低温フリーザー、−80℃
冷蔵庫
遠心機
手袋(ラテックス)
実験用白衣
滅菌遠心管、15mL
ピペットのチップ
ピペットエイド
廃棄物入れ
RPMI1640(ギブコ社、REF 61870−044)
Cellgro(セルジェニクス社(CellGenix)、カタログ番号20801−0100)
プールヒトAB血清(イノベイティブリサーチ社(Innoative Research)、IPLA−SerAB−13458)。
ウシ胎児血清(ギブコ社、REF:26140−079)。
抗CD3抗体(OKT3)、(バイオレジェンド社(BioLegend))、カタログ番号317304)。
ヒトIL−2(プロスペック社(Prospec)、カタログ番号CYT−209−b)。
ヒトIL−15(プロスペック社、カタログ番号cyt−230−b)。
ヒトIL−21(プロスペック社、カタログ番号cyt−408−b)
PEST(抗生物質)
アンホテリシン
アフェレーシスをNY−ESO−1で準備刺激された健常ドナーに対して行った。血液成分の分離後、白血球を含有する産物をその他から隔てた。細胞を、5%プールヒトAB血清、1000U/ml IL−2、10ng/ml IL−15および10ng/ml IL−21を含むCellgro中に懸濁させる。培地はさらに、増殖抗原として10μmol NY−ESO−1ペプチドを含有した。からの細胞の濃度。末梢血由来のリンパ球の増殖は、目的の抗原でパルスされた被照射自己PBMCによる刺激工程を含んでいた。このために、自己PBMCを室温で10mM NY−ESO−1ペプチドで2時間パルスし、次に55Gyで照射した。7日目に、パルスされた被照射自己PBMCをリンパ球培養液に加え、上記で定義された濃度のサイトカインと共に5%ヒトプールAB血清を添加した新鮮な培地中で再懸濁した。10日目に、5%プールヒトAB血清およびサイトカインを添加したCellgroを用いて、細胞を増殖させた。OKT3抗体を、1:10(フィーダー細胞:T細胞の比)の被照射フィーダー細胞(55Gy)、ペプチドおよびサイトカインを加えた上記の同一培地中30ng/mlの濃度で添加した。培養の17〜20日目に、細胞は分析のために回収されるか、または、患者へ移植される。
実施例2の手順は、ドナーがNY−ESO−1によるワクチン接種を受けた患者であったこと以外、実施例1の手順と同じである。
実施例3は、ドナーが、腫瘍により既にTAA NY−ESO−1を発現されていた患者であること以外、実施例1と同じである。
ゾレドロン酸が5μMolの濃度で細胞培養物に添加されたという差異を有する、実施例1に記載されたプロトコルに従って、増殖が実行される。ゾレドロン酸はTCRγδT細胞の増殖を促進することが知られている。図1に示されるように、この実験設定により、頻度および絶対数の両方におけるTCRγδT細胞の強力な増加がもたらされる。図1には、異なる時点における増殖培養物のフローサイトメトリー画像が示される。従って、増殖の1日目に、3.68%の細胞がTCRγδを保有している。2日目に既に僅かな増加がある。際立ったことに、増殖の7日後には、ほぼ50%のT細胞がγδサブセットである。
リンパ球をナルコレプシーを有する患者から得た。増殖抗原としてPRDM2ペプチドを用い、刺激したこと以外は実施例1に記載と同様に、増殖を行った。培養細胞を1日目および18日目にT細胞表現型について試験した。図2は、これらの試料のフローサイトメトリーの結果を示している。結果において、まず、リンパ球が選別され、次いで、CD3+リンパ球が選別される。これらの細胞は次に、CD4およびCD8の存在についてさらに解析される。パネルから、1日目以降、13%のみの細胞がダブルネガティブ状態であることが分かる。過半数の細胞はCD4+である。サイトカイン混合物を用いた18日間の増殖後は、92%の細胞がダブルネガティブ細胞(CD3+CD4−CD8−)T細胞である。
ナルコレプシーを有する2人の異なる患者から得られた血液を用い、再度PRDM2を増殖ペプチドとして用いて、実施例1による増殖プロトコルを実行した。患者につき2つの異なる設定において、DNAseBまたはPRDM2ペプチドを培地中のサイトカイン混合物に添加した。MHC拘束され、PRDM2またはDNAseBを標的とするCD3+CD4−CD8−T細胞および通常のCD8+T細胞を、フローサイトメトリーで選別し、それらが自然に処理および提示されたエピトープを認識するかどうかを試験した。同一患者由来のT細胞をペプチドまたは組換えタンパク質でパルスし、IFN−γ産生を測定した。実験の結果を表1にまとめる。
増殖抗原としてNY−ESO−1の代わりにINO80EおよびUCHL3を使用したことを除いて、実施例1に記載と同様に増殖手順を実行した。18日間の増殖の後、細胞を、フローサイトメトリーによって解析されるINO80EまたはUCHL3で刺激した。フローサイトメトリーの結果を図4および図5に示す。図4Aは、側方散乱および前方散乱によって分離された細胞のシグナルを示している。リンパ球は黒色の楕円で示されるようにゲーティングされる。選別されたリンパ球は次にCD3の存在について再度選別される。CD3+細胞を、CD8およびCD4の存在または非存在による分離によって、さらに解析した。この実験では、41%の細胞がCD8+であり、29.6%がCD4+であり、26.5%がダブルネガティブである。ダブルネガティブおよびCD8+を次に、標的抗原INO80EおよびUCHL3による刺激後のIFN−γ産生について試験した。T細胞がMHCクラス1/ペプチド複合体を用いて客観的に測定されることに留意されたい。図5Aに示される結果によれば、CD8+細胞の1.4%がINO80E刺激後にIFN−γを産生し、ダブルネガティブT細胞の0.56%も刺激後にIFN−γを産生する(図5B参照)。図5に示されるように、同様の結果がUCHL3活性化について得られ、CD8+細胞の0.34%がIFN−γを産生する。また、ダブルネガティブ細胞の0.45%がIFN−γを産生する(図5D参照)。
PBMCをグリア芽腫を有する患者から得て、CMVpp65ペプチドを組み合わせた以外は実施例1に従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて増殖させた。この実験は、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物と組み合わせたCMVpp65ペプチド刺激が高親和性抗原特異的T細胞の強力な増殖をもたらすことを示している(四量体解析)。結果を図7A〜図7Dに示す。APC−CMV bzw. PE−CMVおよび(und)FITC−CMVは、i)同一のMHCクラスI−HLA−0201分子、ii)同一のペプチドを表す。ただし、MHC分子は変異型である。唯一の差異は、MHC分子における変異であり、これにより、異なる親和性を有するT細胞が検出される。CMV四量体は異なる変異がなされている。APC−CMV(中間の親和性、245位における変異;PE−CMV(高親和性)および(und)FITC−CMV(野生型、比較的低親和性)の間。データは、高親和性T細胞受容体が結合することを可能にするのみである変異型四量体が、高親和性T細胞(ならびに低親和性および中間の親和性を有するT細胞)を検出することを示している。高親和性T細胞は、より強力な免疫エフェクター機能を仲介し、腫瘍細胞および/または病原体の除去においてより優れていると考えられる。
PBMCを膵がんを有する患者から得た。実験は実施例1に記載と同様に実行した。図8は、0日目および18日目における増殖の試料のフローサイトメトリー解析を示している。1日目では、NY−ESO−1刺激後のIFN−γ産生はたった1.85であるが、18日目ではこの濃度は9.25へと大幅に増加する(図8Bおよび図8D参照)。従って、NY−ESO−1特異的T細胞の数は増殖中に大幅に増加する。
PBMCをグリア芽腫を有する患者から得て、公知のTAAサバイビンを共に用いる以外は実施例1に従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて増殖させた。再度、細胞を、1日目および18日間の培養後にフローサイトメトリーを用いて解析した。解析の前に、増殖された細胞をサバイビンで刺激した。細胞をCD4+T細胞、CD8+T細胞およびダブルネガティブT細胞に分類した。これらのグループにおいて、IL−2、IFN−γおよびTNF−αの濃度を測定した。図9AはCD4+細胞についての結果を示しており、図9Bはダブルネガティブについての結果を示しており、図9CはCD8+細胞についての結果を示している。結果は以下の通りにまとめることができる:時点0(T0)においては、サイトカイン産生によって定義される検出可能なT細胞応答は存在しない。対照的に、18日間の増殖後は、サバイビン特異的T細胞の存在を立証する、サバイビンによる刺激に応答した強力なサイトカイン産生が見られる。これに関して、T細胞応答は通常、サバイビンに対しての誘導が非常に困難であることを留意する必要がある。
PBMCをグリア芽腫を有する患者から得た。増殖は実施例1に記載と同様に実行した。0日目および18日目の試料を、フローサイトメトリーを用いてCD45RAおよびCCR7の存在によって解析した。結果を図10Aおよび図10Bに示す。この実験において、細胞を以下のグループに分類した。CD45RAおよびCCR7についての陽性シグナル(グラフの右上部分)は前駆細胞を表す。CCR7+CD45RA−(右下)はセントラルメモリー細胞である。CCR7−を有するCD45RA陽性シグナル(左上領域)はエフェクター細胞であり、両領域における陰性シグナル(左下領域)は末梢性メモリー細胞である。図10Aおよび図10Bの比較において示されるように、セントラルメモリー細胞の数が、サイトカイン混合物を用いた増殖により、強く増加する(すなわち3.72から21.1に)ことは明らかである。末梢性メモリー細胞の数はわずかに増加し、一方、エフェクター細胞の数は強く減少する。前駆細胞の数は65.4から57.4にほんの僅か減少する。従って、本発明によるサイトカイン混合物を用いた増殖はセントラルメモリーT細胞を富化する。
膵がんを有する患者由来のPBMCを、実施例1に従って、様々な抗原:メソテリンの細胞表面結合部分であるGPI、サバイビンおよびNY−ESO−1をで処理した。結果を以下の表2にまとめる:
グリア芽腫を有する患者由来のPBMCを、抗原(EGRvIII、NY−ESO−1またはサバイビン)のペプチドを用いて、実施例1のプロトコルに従って増殖させた。細胞を、フローサイトメトリーにより解析される同じペプチドで刺激した。結果を表3にまとめる。
PBMCを膵がんを有する患者から得て、実施例1に従って増殖させた。再度、TAAペプチドをGPI、NY−ESO−1およびサバイビンから得た。フローサイトメトリーを用いて、様々なマーカーの存在を検査した。マーカーは、4−1BB、CD25、CD127、CTLA−4、LAG3、PD1およびTIM3である。結果を表4にまとめる。
実験を、それぞれEGVRVIII、NY−ESO−1またはサバイビンを用いて、実施例1のプロトコルに従って行った。結果を表5にまとめる。
PBMCを、膵がんを有する患者およびグリア芽腫を有する患者から得た。実施例1によるプロトコルを用いてリンパ球を増殖させた。リンパ球培養物を種々のマーカーに対するフローサイトメトリーによって解析する。結果を表6に示す。
膵がんを有する患者由来のPBMCを、腫瘍関連抗原NY−ESO−1を用いて、実施例1に従って、増殖させた。得られた細胞を以下の腫瘍関連抗原で4時間刺激した:CMV、EBNA−3a、INO80E、メソテリン、NY−ESO−1、サバイビンおよび(und)UCHL3。フローサイトメトリーを用いて、サイトカイン産生T細胞の割合を測定した。様々なT細胞サブセット(CD8+、CD4+およびダブルネガティブ)についての数字が表7に示される。以下のサイトカインを試験した:IFN−γ、IL−2およびTNF。興味深いことに、NY−ESO−1による刺激だけでなく、増殖プロセスで使用されなかった他の抗原による刺激も、サイトカイン産生T細胞、従って腫瘍反応性T細胞をもたらした。また、ウイルス標的の抗原(CMVおよびEBNA−3a)による刺激も、これらの標的に特異的なT細胞の存在を示す、サイトカインを産生するT細胞をもたらした。
この実施例では、重篤なHPV疾患(HPV33およびHPV56)を患う患者から末梢血を得た。HPV L1ペプチドならびにIL−2、IL−15およびIL−21を含むサイトカイン混合物を用いて刺激を行った。18日間の増殖の後、細胞をL1ペプチドで刺激し、フローサイトメトリーで測定した。この結果を図12に示す。図12D〜図12Fは、それぞれリンパ球CD3+およびCD8+に対するゲーティングを示している。図12A、図12Bおよび図12Cにおいて、長方形は、抗原特異的な脱顆粒/細胞毒性マーカーであるサイトカインCD107aを発現する細胞を示す領域を示している。図12AはL1ペプチドを用いて得られた結果であり、図12Bはポジティブコントロールを用いて得られた結果であり、図12Cはネガティブコントロールとして培地のみを用いて得られた結果である。これから、CD107aを産生する細胞の割合が0.77から2.23に増加している。
グリア芽腫を有する患者由来のPBMCを、NY−ESO−1ペプチドおよびCMVpp65ペプチドで刺激した。グリア芽腫を有する患者由来の末梢血を、2つの設定において刺激性ペプチドがNY−ESO−1またはCMVpp65であった実施例4のプロトコルに従って処理した。再度、18日後に、刺激用の様々な抗原または自己腫瘍細胞を用いてサイトカイン産生アッセイを行った。ペプチドおよびサイトカイン混合物を用いたT細胞の抗原特異的増殖が、刺激性標的を対象としたT細胞の増殖をもたらし、さらにまた、患者自身の自己腫瘍細胞を対象としたT細胞の増殖ももたらすことが分かった。この反応性は、NY−ESO−1およびサイトカインを用いたT細胞の増殖前には存在しなかった。データを表8にまとめる。数字は親T細胞集団内に存在するT細胞の割合を表す。
膵がんを有する患者由来の末梢血を得て、実施例4のプロトコルに従って処理した。様々な実験設定において、NY−ESO−1またはサバイビンをサイトカイン混合物と共に使用した。さらに、サイトカインの添加無しで、またはIL−7およびIL−2の組み合わせを用いて、同じ実験を行った。18日間の増殖の後、細胞を、NY−ESO−1またはサバイビンペプチド混合物による刺激後のそれらのIFN−γ産生について試験した。結果を図13に示す。図13は、他のサイトカイン組成物またはサイトカイン無しと比較した、IL−2、IL15およびIL−21を用いた増殖後の、IFN−γ産生の強い増加、およびそれによる、抗原特異的リンパ球の濃度の強い増加を示している。
実施例20による実験を、ウイルス抗原EBNA−1、EBNA−3aおよびCMVpp65を用いて繰り返した。結果を図14にまとめる。図14は、他のサイトカイン組成物またはサイトカイン無しと比較した、IL−2、IL15およびIL−21を用いた増殖後の、IFN−γ産生の強い増加、およびそれによる、抗原特異的リンパ球の濃度の強い増加を示している。
PBMC由来のT細胞をIL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物の存在下で培養し、Treg(調節性T細胞)を、フローサイトメトリーを用いてT細胞の増殖の前および後に同定した。結果を図15に示す。図15では、左から右に:T細胞がCD4+T細胞に対するゲーティング、次いで、活性化T細胞上のIL−2受容体の高発現を示すCD25highに対するゲーティングが示される。次に、前記細胞を、Il−2R(高CD125)細胞に対しゲーティングされ、IL−7受容体(CD127)およびFoxp3(細胞内)の発現について試験した。Treg細胞はCD4+CD25high、Foxp3+およびCD127ネガティブと定義される。Tregの数は最初低く(CD4+T細胞中0.07%)、T細胞増殖後はさらに低くなった(0.01%)。データは、IL−2が強いTreg増殖を駆動すると知られていることから、サイトカイン混合物がT細胞増殖においてより優れていることを示しており、また、Treg増殖を阻止する一方で抗腫瘍T細胞を増殖させる、IL−2/IL−15/IL−21の組み合わせの相乗効果も明示している。
T細胞を、NY−ESO−1抗原と共にサイトカイン混合物IL−2/IL−15/IL−21を用いて21日間増殖させた。フローサイトメトリー解析を、増殖前(T0=時点0)および増殖後(TH=回収時(Time of harvest))に実行した。サイトカイン単独で刺激されたT細胞は対照として働く。結果を表9にまとめる。GRexフラスコ内で増殖されたCD8+T細胞におけるVB7.2ファミリーの強い優先的な増殖、ならびにCD8+T細胞(これもGRexフラスコ内で増殖)におけるVB13.2ファミリーの強い優先的な増殖に注目されたい。データは、抗原(NY−ESO−1)の存在が個々のTCR VBファミリーの優先的な増殖を駆動することを示しており、また、抗原(サイトカインのみによるものではない)によって駆動される反応の多様性も示している。集束した、なお多様なTCR VBファミリーが、多様な抗標的T細胞応答を示す。
Tリンパ球をIL−2/IL−15/IL−21およびNY−ESO−1ペプチド混合物を用いて増殖させた。上段パネル:前、下段パネル:サイトカイン/TAA増殖(=T細胞をIL−2/IL−15/IL−21の存在下で培養した)の後。フローサイトメトリー解析をT細胞刺激の前および後に行った。左から右に:i)リンパ球に対するゲーティング、ii)CD3+T細胞に対するゲーティング、iii)CD4/CD8に対するゲーティング。上段右:CD8+活性化T細胞(37%のT細胞)上のPD1発現。サイトカイン/TAAで増殖されたT細胞は、CD4CD8+T細胞上のPD1発現の減少を示す。データは、サイトカイン/ペプチドで増殖されたT細胞が、CD8+T細胞におけるPD1+T細胞の頻度の減少を示すことを示しており、これは、これらの増殖されたT細胞が、より長い寿命を示し、それ故腫瘍細胞に対する優れた有効性を示し得ることを意味する。
HPV33由来のL1タンパク質由来の12の個々のペプチドからなるペプチド混合物を、サイトカイン混合物と共に使用して、HPV+病変を有する患者由来のT細胞を刺激した。21日目に、T細胞を、各々のペプチドを標的とした細胞毒性について試験した。ここでは、自己EBVで形質転換されたB細胞を採取し、ペプチド1〜12でパルスし、次いで、標準的なCr51アッセイを行った。このアッセイは特定の標的を殺傷するT細胞の能力を測定する。結果を図16に示す。
PBMCを腫瘍関連抗原NY−ESO−1の存在下でIL−2/IL−15/IL−21混合物を用いて増殖させた。細胞を増殖前(図18)および増殖後(図19)にフローサイトメトリーで解析した。まず、CD3+T細胞がゲーティングされ、次に、CD3+T細胞がCD4+およびCD8+T細胞に対しゲーティングされる。CD117+細胞を次に、CD8+T細胞(上段)およびCD4+T細胞(下段パネル、左)に対して検出する。中段パネル:前駆物質T細胞を表す、高い集団密度のCD45RA+CCR7+T細胞を有するCD8+およびCD4+T細胞におけるCD45RA/CCR7発現(中段パネル)。右:CD117+T細胞(青色標識)がCD8+T細胞におけるエフェクターT細胞に存在しており;CD117+T細胞はCD4+T細胞サブセットにおける様々なT細胞集団において見つけることができる。データは、T細胞の「幹性(stem−ness)」の存在のマーカーであるCD117発現が様々なT細胞サブセットに存在していることを示している。CD117+T細胞は長期のT細胞記憶の供給源を提供するのに有益である。
この実施例は、機能試験および免疫療法のための膵がん由来のTILを培養するための手順を説明する。
患者から得られた腫瘍組織を滅菌容器に入れた。前記組織を、滅菌メスを用いて1〜2mm3の小片に切り分けた。組織片を24ウェルプレートのウェルに1ウェル当たり1小片で入れた。10%ヒトAB血清を含有するCellgroを用いて細胞培地を調製した。この培地の中に、IL−2、IL−15およびIL−21を、IL−2については1000u/ml、IL−15およびIL−21のそれぞれについては10ng/mlの最終濃度となるように、添加する。さらに、PESTおよびアンホテリシンを培地に添加した。1mlの培地を各ウェルに添加し、細胞培養物を37℃で4日間インキュベートした。並行して、健常ドナー由来のPBMCを10%ヒトAB血清を含有するCellgro中で培養した。PBMCの濃度を測定し、106/mlの濃度に調整した。次に、PBMCを55Gyで18分間照射した。照射後、OKT3を10ng/mlの最終濃度となるように添加した。この培養物をOKT3含有フィーダー細胞と称する。TIL培養の10日目に、100μlのOKT3含有フィーダー細胞培養物を24ウェルプレートの各ウェルに添加する。従って、各ウェル内の培養物は、最終濃度10ng/mlのOKT3および総数106個のフィーダー細胞を含有する。TIL:フィーダー細胞の比は約1:10である。
膵臓腫瘍組織を術後に直接得て、滅菌容器に入れた。腫瘍組織を、滅菌メスを用いて1〜2mm3の小片に切り分けた。各組織片を24ウェルプレートのウェルに移す。10%ウシ胎児血清を含有する1mlのRPMI1640培地を各ウェルに添加する。7日目および14日目に培地を交換した。これは培地が除去され、同じ種類の新鮮な培地に置き換えられたことを意味する。腫瘍細胞が超高密度に達した際、培養物を6ウェルプレートに移した。
リンパ球濃度が非常に低いときにフィーダー細胞が添加された場合、フィーダー細胞の添加によって腫瘍浸潤リンパ球の良好な増殖がもたらされないことが分かった。図20Aは、1週間のインキュベーションのリンパ球培養物を示している。いくつかのリンパ球は検出可能であるが、リンパ球濃度は増殖基準線未満である。図20Bおよび図20Cは、2週間のインキュベーション後の同じリンパ球培養物を示している。ここで、検出することができるリンパ球の数が、この増殖基準線を越えて増加した。フィーダー細胞はこの工程で添加され得る。図1D、EおよびEは、フィーダー細胞の添加から4日後、1週間後および2週間後の培養物を示している。前記図では、図Dの画像から図Fの画像へと、リンパ球の数が大幅に増加していることが見て取れる。図Fでは、リンパ球が集まって培養物中の腫瘍細胞を攻撃していることが見て取れる。
腫瘍組織を16人のグリア芽腫患者から得た。TILを、実施例1のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、前記組織から増殖させた。
増殖された細胞を、CD3、CD4およびCD8を標的とする抗体を用いて、それらのCD4/CD8表現型についてフローサイトメトリー分析で解析した。
増殖された細胞を、それらの特定の表現型(前駆T細胞(CD45RA+CCR7+)、セントラルメモリーT細胞(CD45RA−CCR7+)、末梢性メモリーT細胞(CD45RA−CCR7−)、または分化型エフェクターT細胞(CD45RA+CCR7−))、ならびに、基本表現型CD8+、CD4+およびダブルネガティブT細胞における活性化/枯渇マーカーの発現について、フローサイトメトリー分析で解析した。TIL集団のフローサイトメトリー分析に使用した抗体を表11にまとめる。
腫瘍組織を17人の膵がん患者から得た。表12は、患者の年齢、性別、試料および組織診断の種類をまとめている。
増殖された細胞を、CD3、CD4およびCD8を標的とする抗体を用いて、それらのCD4/CD8表現型についてフローサイトメトリー分析で解析した。結果を表13にまとめる。
腫瘍組織を17人の膵がん患者から得た。TILを、実施例28のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、前記組織から増殖させた。PCRに基づくアプローチを用いて、TCR長を測定した。TCRファミリーの「通常の」イメージは、T細胞受容体の長さのガウス分布である。単一のピークは個々のTCRファミリーにおける単クローン性を示唆している。図25に示されるデータは、自己腫瘍標的に対し焦点を置かれていることを示唆して、TIL組成物が単クローン性または多クローン性であることを示しており、サイトカイン混合物は、集束したTCRレパートリーの増殖を助ける。
腫瘍組織をグリア芽腫患者から得た。TILを、実施例1のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。増殖されたリンパ球を腫瘍関連抗原、すなわちEGRvrIII、NY−ESO−1またはサバイビンに由来するペプチドで刺激し、サイトカインIFNγおよびTNFαのうちのいずれか1つを産生する細胞の割合を測定した。
腫瘍組織を膵がん患者から得た。
腫瘍組織をグリア芽腫患者から得た。TILを、実施例27のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。増殖されたリンパ球を自己腫瘍細胞で刺激した。結果を図28Aに示す。図28Bはフローサイトメトリー解析の画像を示している。結果により、増殖されたT細胞が自己腫瘍細胞を認識することが確認される。従って、サイトカイン混合物は、自己腫瘍細胞、従って患者自身の変異に反応性の、グリア芽腫由来のT細胞を増殖させる。
腫瘍組織をグリア芽腫患者から得た。TILを、実施例27のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。増殖されたリンパ球を自己腫瘍細胞で刺激した。TILをまずCD3+T細胞に対しゲーティングし、次にCD4+およびCD8+T細胞に対しゲーティングした。個々のVβファミリーの頻度を、TCR VB抗体パネルを用いて検査した。このTCRパネルはヒトTCRレパートリーの約75%を網羅しており、そのため、全てのTCR Vβファミリーが十分に捕捉されない可能性がある。TCR Vβファミリー分布は、10%を超え得るTCR VB2を除いて、各ファミリーにおいて約2〜6%である。表14は、グリア芽腫を有する患者由来のTILにおけるVβ−2ファミリーの優先的な増殖を示している。
腫瘍組織を膵がん患者から得た。TILを、実施例28のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。
腫瘍組織をグリア芽腫患者から得た。TILを、実施例28のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。自己腫瘍細胞を実施例29のプロトコルに従って作製した。自己腫瘍細胞を放射能標識し、増殖されたTILと一緒に4時間培養する。腫瘍細胞の殺傷によって、後に測定される放射能の放出が引き起こされる。前記方法の原理を図21に示す。腫瘍細胞に対するTILの比に依存した細胞毒性効果が確認される結果が図31に示される。データは、サイトカイン混合物が自己腫瘍細胞に対して強い細胞毒性を有するTILを増殖させることを示している。
並行した実験において、自己腫瘍細胞を、IL−15、IL−21およびIL−2のサイトカイン混合物を用いてグリア芽腫から増殖されたTILと一緒に、3日間インキュベートした。インキュベーションの後、IFNγ産生(pg/mL)をELISAで測定した。CD4+またはCD8+細胞が腫瘍反応に関与しているかどうかを確認するために、CD8+T細胞に影響を与えるMHCクラスI抗原反応(W6/32)を阻止する抗体、または、CD4+T細胞に影響を与えるHLA−DR(MHCクラスII反応)を阻止する抗体を使用した。結果を表16にまとめる。
腫瘍組織を膵がん患者から得た。TILを、実施例28のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。自己腫瘍細胞を実施例29のプロトコルに従って作製した。自己腫瘍細胞を放射能標識し、増殖されたTILと一緒に4時間培養する。腫瘍細胞の殺傷によって、後に測定される放射能の放出が引き起こされる。前記方法の原理を図7に示す。比較のために、および対照として、自己(メラノーマ)TIL系を使用した。細胞毒性効果が確認される結果を図33に示す。データは、サイトカイン混合物が膵がんを有する患者由来のTILも増殖させることを示している。これらのTILは、TCR使用に基づいて、高度にフォーカスされており、自己腫瘍に対して細胞傷害反応を含む特異的な反応性を示す。
腫瘍組織をグリア芽腫患者から得た。TILを、実施例27のプロトコルに従って、IL−2、IL−15およびIL−21のサイトカイン混合物を用いて、腫瘍組織から増殖させた。T細胞の機能およびホーミングを定義したマーカー発現について、細胞をフローサイトメトリーで解析した。
15の重複ペプチドとしてのTAAをTILと一緒に3日間インキュベートし、IFNγ産生(pg/mL)をELISAで測定した。さらに、抗原反応を、CD8+T細胞に影響を与えるMHCクラスI抗原反応(W6/32)を阻止する抗体、または、CD4+T細胞に影響を与えるHLA−DR(MHCクラスII反応、L243)を阻止する抗体によって阻止した。各試料におけるIFNγ産生(pg/mL)を表18に示す。抗MHCクラスI(CD8+T細胞を阻止)または抗MHCクラスII(CD4+を阻止)T細胞による阻止によって示される、抗原特異的であるTILにおけるIFNγ産生。結果から、TILが、膵がんを有する患者由来の、通常共有されるがん抗原、特に、NY−ESO−1またはメソテリンに対して、IFNγを産生することが確認される。
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Claims (44)
- インターロイキン2(IL−2)、インターロイキン15(IL−15)およびインターロイキン21(IL−21)から選択される少なくとも2種類のサイトカインを含む、リンパ球を増殖させるための組成物。
- 2種または3種のサイトカインを含む、請求項1に記載の組成物。
- 液状である、特に細胞培地である、請求項1または請求項2に記載の組成物。
- 前記液体組成物中のIL−2の濃度が10U/ml〜6000U/mlの範囲内、好ましくは500U/ml〜2000U/mlの範囲内、より好ましくは800U/ml〜1200U/mlの範囲内である、請求項3に記載の組成物。
- IL−15の濃度が、0.1ng/ml〜100ng/mlの範囲内、好ましくは2ng/ml〜50ng/mlの範囲内、より好ましくは5ng/ml〜20ng/mlの範囲内である、請求項3または請求項4に記載の組成物。
- IL−21の濃度が0.1ng/ml〜100ng/mlの範囲内、好ましくは2ng/ml〜50ng/mlの範囲内、より好ましくは5ng/ml〜20ng/mlの範囲内である、請求項3〜請求項5のいずれか一項に記載の組成物。
- 少なくとも1つのリンパ球を含む、哺乳動物由来の身体試料、特には組織試料または体液試料を得て、所望により前記身体試料中の細胞を分離する工程、
IL−2、IL−15および/またはIL−21を使用してインビトロで前記身体試料を培養して前記試料中のリンパ球を増殖および/または刺激する工程、及び
所望により培養試料中の臨床的に有用なリンパ球の存在を決定する工程
を含む、臨床的に有用なリンパ球集団を作製する方法。 - 前記臨床的に有用なリンパ球が、腫瘍反応性リンパ球、病原体反応性リンパ球および自己免疫反応性リンパ球から選択され、好ましくは腫瘍反応性リンパ球から選択される、請求項7に記載の方法。
- 前記身体試料が、末梢血、臍帯血、骨髄、リンパ節 肝臓、胸水、胸郭、腹腔、滑液、腹膜、腹膜後隙、胸腺、および腫瘍からなる群より選択される、請求項7または請求項8に記載の方法。
- 前記身体試料が末梢血から選択される、請求項9に記載の方法。
- 前記哺乳動物、特にヒトが、腫瘍疾患に罹患している哺乳動物、腫瘍疾患を発症するリスクを有する哺乳動物、感染症に罹患している哺乳動物、感染症を発症するリスクを有する哺乳動物、自己免疫疾患に罹患している哺乳動物、自己免疫疾患を発症するリスクを有する哺乳動物から選択される、請求項7〜請求項10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記インビトロ培養工程が、リンパ球が検出可能になるまでIL−2、IL−15およびIL−21を含む培地中でインキュベーションすることを含む第一増殖工程を含む、請求項7〜請求項11のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第一増殖工程のインキュベーションの時間が、6時間〜180日間の範囲内、好ましくは4〜10日間の範囲内、より好ましくは6〜8日間の範囲内、最も好ましくは約7日間である、請求項12に記載の方法。
- 前記インビトロ培養が、IL−2、IL−15およびIL−21に加えてフィーダー細胞および/またはCD3に対する抗体を含む培地中でインキュベーションすることを含む第二増殖工程を含む、請求項12または請求項13に記載の方法。
- フィーダー細胞:リンパ球の比が、1:1〜1:100の範囲内、好ましくは1:2〜1:50の範囲内、より好ましくは1:5〜1:20の範囲内、最も好ましくは約1:10である、請求項14に記載の方法。
- 前記第一増殖工程が細胞培養にIL−2、IL−15およびIL−21を同時点で添加することを含む、請求項12〜請求項15のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第一増殖工程が細胞培養にIL−2、IL−15およびIL−21のうちの少なくとも1つを異なる時点で別々に添加することを含む、請求項12〜請求項15のいずれか一項に記載の方法。
- 最初にIL−21が添加され、特にIL−15が次に添加され、その後IL−2が添加される、請求項17に記載の方法。
- 最初にIL−15が添加され、特にIL−21が次に添加され、その後IL−2が添加される、請求項17に記載の方法。
- 前記臨床的に有用なリンパ球集団が単クローン性、少クローン性または多クローン性のいずれかである、請求項7〜請求項19のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第一増殖工程の培地および/または前記第二増殖工程の培地が、少なくとも1つの増殖抗原を含む、請求項12〜請求項20のいずれか一項に記載の方法。
- 増殖抗原がTAAの断片、特に、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、または配列番号14のアミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列の少なくとも8個の連続アミノ酸を含むペプチドである、請求項21に記載の方法。
- 前記インビトロ培養工程が、リフォーカス細胞を含む培地中でのインキュベーションを含むリフォーカス工程をさらに含む、請求項12〜請求項22のいずれか一項に記載の方法。
- リフォーカス工程の時間が、1〜6日間の範囲内、好ましくは1〜3日間である、請求項23に記載の方法。
- リフォーカス細胞:リンパ球の比が、1:1〜1:100の範囲内、好ましくは1:5〜1:10の範囲内である、請求項23または請求項24に記載の方法。
- 前記培養工程が、プロモーター化合物を添加して特定のリンパ球亜群、特にガンマ−デルタT細胞(γδ−T細胞)、の増殖を促進させることを含む、請求項7〜請求項25のいずれか一項に記載の方法。
- 増殖した細胞培養物から前記臨床的に有用なリンパ球集団を単離することをさらに含む、請求項7〜請求項26のいずれか一項に記載の方法。
- 前記臨床的に有用なリンパ球の存在を検査する工程が評価用抗原を使用することを含む、請求項7〜請求項27のいずれか一項に記載の方法。
- 評価用抗原が、培養された試料と同じ哺乳動物由来の細胞(自己細胞)、特に腫瘍細胞、少なくとも部分的に遺伝的に一致している同種細胞、特に腫瘍細胞、及び導入遺伝子として臨床的に有用な抗原を発現する細胞から選択される形で培養試料に提示される、請求項28に記載の方法。
- 前記臨床的に応答性のリンパ球の存在の検査が、リンパ球を少なくとも1つの臨床的に有用な抗原と接触させ、サイトカイン産生(特にINFγ産生)、細胞増殖、細胞毒性、シグナル伝達および/または細胞内リン酸化のいずれか1つにおける変化を決定することを含む、請求項28または請求項29に記載の方法。
- 身体試料が哺乳動物から入手される、請求項7〜請求項30のいずれか一項に記載の方法に従って、臨床的に有用なリンパ球集団を得るかまたは作製する工程;および
臨床的に有用なリンパ球集団を前記哺乳動物に投与する工程
を含む、前記哺乳動物における感染症、腫瘍疾患、または自己免疫疾患を治療または予防するための免疫療法。 - 腫瘍疾患がグリア芽腫および膵がんから選択される、請求項31に記載の免疫療法。
- 臨床的に有用なリンパ球集団が、
前記哺乳動物におけるがん細胞の退縮をもたらし;
前悪性病変から悪性病変への推移を妨げ;
腫瘍細胞もしくは前悪性細胞の急速な老化をもたらし;
自己抗原陽性細胞の除去をもたらし;
病原体の殺傷、増殖停止もしくは封じ込めをもたらし;
がん幹細胞を妨害し;且つ/又は
がん細胞、もしくは自己抗原を発現する細胞の増殖停止を誘導する、請求項31または請求項32に記載の免疫療法。 - 医学的処置における使用のための、特に、感染症、自己免疫疾患または腫瘍疾患を治療または予防するための、請求項1〜請求項6のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記使用が、請求項7〜請求項31のいずれか一項に記載の方法を用いて臨床的に有用なリンパ球集団を作製することを含む、請求項34に記載の使用のための組成物。
- IL−2、IL−15、およびIL−21を含み、さらに、TCRを刺激する成分(特にOKT3)、共刺激分子、フィーダー細胞および少なくとも1つの臨床的に有用な抗原の配列を含むペプチドのうち少なくとも1つを含んでもよい、免疫療法、特に腫瘍疾患の治療、で使用するためのキット。
- B細胞、NK細胞およびT細胞から選択され、前記T細胞がヘルパーT細胞(TH細胞またはCD4+−T細胞)、特にTH1細胞、細胞傷害性T細胞(TC細胞またはCD8+−T細胞)、特にCD8+CXCR3+T細胞、メモリーT細胞、特にセントラルメモリーT細胞(TCM細胞)、幹メモリーT細胞(TSCM)または末梢性メモリー細胞(TPM細胞)、ガンマ−デルタT細胞(γδ−T細胞)、NK−T細胞、粘膜関連インバリアントT細胞(MAIT)、ダブルネガティブT細胞(CD3+CD4−CD8−T細胞)から選択される、請求項7〜請求項30のいずれか一項に記載の方法によって得られる臨床的に有用なリンパ球。
- 組織、特に腫瘍もしくは感染組織もしくは炎症組織、への進入を促進する分子(例えばCXCR3)を発現するリンパ球;および
長期メモリー(特にCD117およびc−kit)、抗原特異的免疫応答の活性化、特に4−1BB、溶解性免疫細胞応答、特にCD107a、のいずれかのマーカーが豊富であるリンパ球
から選択される、請求項36または請求項37に記載の臨床的に有用なリンパ球。 - T細胞前駆体、TCMおよび/またはTPMを含む、医薬用途に有用なリンパ球の組み合わせの形成を促進する分子およびサイトカインを発現し、
臨床的に有用なリンパ球の増殖を促進する分子およびサイトカインを発現し、
IFNγ、TNFα、IL−2、IL−17およびそれらの任意の組み合わせから選択されるサイトカインを産生し、
CD3+CD4−CD8−T細胞である、
請求項7〜請求項30のいずれか一項に記載の方法によって得られるリンパ球。 - 請求項7〜請求項30のいずれか一項に記載の方法によって得られる、臨床的に有用なリンパ球集団。
- 臨床的に有用なリンパ球集団を含む、請求項7〜請求項30のいずれか一項に記載の方法によって得られるリンパ球集団。
- 以下の特徴のうちの一つまたは複数によって特徴付けられる請求項41に記載のリンパ球集団:
T細胞の総数に対してのTregの割合が5%未満、好ましくは3%未満である;
TH細胞の総数に対してのTH1細胞の割合が少なくとも50%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%である、
CD8+T細胞の総数に対してのCXCR3+T細胞の割合が少なくとも50%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%である、
T細胞の総数に対しての4−1BB+T細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも2%、より好ましくは少なくとも2.5%である、
T細胞の総数に対してのCD117+T細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも2%、より好ましくは少なくとも2.5%である、
T細胞の総数に対してのCD3+CD4−CD8−細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも3%、より好ましくは少なくとも5%である;および
T細胞の総数に対してのγδT細胞の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも3%、より好ましくは少なくとも5%である。 - 以下の特徴のうちの一つまたは複数によって特徴付けられる請求項41または請求項42に記載のリンパ球集団:
T細胞の総数に対しての前駆T細胞(CD45RA+CCR7+)の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも2%、より好ましくは少なくとも3%である;
T細胞の総数に対してのセントラルメモリーT細胞(CD45RA−CCR7+)の割合が少なくとも2%、好ましくは少なくとも5%、より好ましくは少なくとも10%である;
T細胞の総数に対しての末梢性メモリーT細胞(CD45RA−CCR7−)の割合が少なくとも2%、好ましくは少なくとも5%、より好ましくは少なくとも10%である;および
T細胞の総数に対してのエフェクターT細胞(CD45RA+CCR7−)の割合が少なくとも1%、好ましくは少なくとも3% より好ましくは少なくとも5%である。 - 以下の特徴のうちの一つまたは複数によって特徴付けられる、請求項41〜請求項43のいずれか一項に記載のリンパ球集団:
多量体可溶性MHC−ペプチド複合体または細胞内サイトカイン産生によって決定される、T細胞の総数に対する臨床的に有用なT細胞の割合が、少なくとも0.1%である;
抗原刺激後の細胞内サイトカイン産生の値が、抗原刺激無しの場合の標準偏差の少なくとも2倍である;および
抗原刺激後のCD107a誘導の値が、抗原刺激無しの場合の標準偏差の少なくとも2倍である。
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