JP2020152702A - 核酸吸着材 - Google Patents
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Abstract
Description
特に、核酸は培養液の粘度を上昇させるため、有用物質の分離及び精製の効率を低下させる原因となる。目的物質は、糖タンパク質を含むタンパク質である場合が多いため、タンパク質を除去せずに、核酸を選択的に除去する技術が求められている。
また、特許文献2は、タンパク質溶液から核酸又はエンドトキシンを除去するためにN-アルキル化したキトサンからなる二分子膜を固定化した担体を用いることを開示している。
〔1〕 窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーを備える、核酸吸着材。
〔2〕 窒素原子を含むカチオン性基が、多価アミンに由来する官能基、及び/又は第4級アンモニウム基である、〔1〕に記載の核酸吸着材。
〔3〕 窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーの陰イオン交換容量が0.01〜5meq/dry−gとなるように、セルロースナノファイバーが窒素原子を含むカチオン性基を有する、〔1〕又は〔2〕に記載の核酸吸着材。
〔4〕 セルロースナノファイバーが、1nm〜1000nmの平均繊維径を有する、〔1〕〜〔3〕の何れかに記載の核酸吸着材。
〔5〕 〔1〕〜〔4〕の何れかに記載の核酸吸着材が充填された核酸吸着用カラム。
〔6〕 セルロースナノファイバーに窒素原子を含むカチオン性基を導入する工程を含む、〔1〕〜〔4〕の何れかに記載の核酸吸着材を製造する方法。
〔7〕 〔1〕〜〔4〕の何れかに記載の核酸吸着材と核酸を含有する液体とを接触させる工程を含む、核酸が除去された液体の製造方法。
〔8〕 〔1〕〜〔4〕の何れかに記載の核酸吸着材と、目的物質及び核酸を含有する液体とを接触させる工程を含む、核酸が除去された目的物質を含有する液体の製造方法。
〔9〕 目的物質がタンパク質である、〔8〕に記載の方法。
〔10〕 目的物質が細胞生産物又は微生物生産物である、〔8〕又は〔9〕に記載の方法。
〔11〕 〔1〕〜〔4〕の何れかに記載の核酸吸着材と核酸を含有する液体とを接触させる工程と、核酸吸着材に吸着した核酸を核酸吸着材から離脱させる工程を含む核酸精製方法。
また、核酸は酸性を示すことから、酸性タンパク質との分離が特に難しいが、本発明の核酸吸着材は、酸性タンパク質を吸着しない条件で核酸を強く吸着することができる。
(1)核酸吸着材
本発明の核酸吸着材は、窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーを備える核酸吸着材である。
「セルロースナノファイバー」とは、ナノメートルオーダーの平均繊維径を有する繊維状のセルロースをいう。
平均繊維径は、1nm〜1000nm程度であればよい。また、3nm以上、5nm以上、10nm以上、20nm以上、又は30nm以上で、1000nm以下、500nm以下、300nm以下、200nm以下、150nm以下、100nm以下、90nm以下、80nm以下、70nm以下、60nm以下、又は50nm以下とすることができ、また、これらの組み合わせとすることができる。例えば、3nm〜500nm、5nm〜300nm、又は10nm〜200nmの範囲が挙げられる。
また、セルロースナノファイバーは、繊維径について高い均一性を有することが好ましい。セルロースナノファイバーの繊維径分布の標準偏差は、100nm以下、70nm以下、50nm以下、40nm以下、30nm以下、又は20nm以下が好ましい。
「平均アスペクト比」とは、平均繊維径に対する平均繊維長の比(平均繊維長/平均繊維径)をいう。
誘導体としては、官能基が導入されたセルロース繊維が挙げられる。即ち、本発明において、「セルロース」という用語は、そのような官能基を有するものを包含する。導入し得る官能基については後述する。
また、セルロースナノファイバーは、例えば、セルロースのイオン液体溶液やセルロースの有機溶媒溶液から紡糸することによっても製造できる(特開2015-004151)。
窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーは、本来的に窒素原子を含むカチオン性基を有するものであってもよく、窒素原子を含むカチオン性基をセルロースナノファイバーに導入したものであっても良い。
窒素原子を含むカチオン性基は非環状であってもよく、環状であってもよい。
活性化剤としては、エポキシ基供与体が好ましく、クロロメチルオキシラン(エピクロロヒドリン)がより好ましい。
活性化剤は、1種を単独で、又は2種以上を組み合わせて使用できる。
1価アミンとしては、脂肪族アミン類、特にアルキルアミン(メチルアミン、エチルアミンのような第1級アミン;ジメチルアミン、ジエチルアミンのような第2級アミン;トリメチルアミン、トリエチルアミン、トリプロピルアミン、トリブチルアミン、ジイソプロピルエチルアミンのような第3級アミン);芳香族アミン類(アニリン、トルイジンのような第1級アミンなど);複素環式アミン類(ピロリジン、ピペリジン、モルホリン、イミダゾールのような第2級アミン;ピリジン、2,4,6−トリメチルピリジン(コリジン)、2,6−ルチジン、キノリン、N−メチルモルホリン、N−エチルモルホリンのような第3級アミンなど);アルカノールアミン又はアミノアルコール(モノメタノールアミン、モノエタノールアミン、モノイソプロパノールアミン、2−アミノ−2−メチル−1−プロパノール、2−アミノ−2−メチル−1,3−プロパンジオール、3−アミノ−1,2−プロパンジオール、3−ジメチルアミノ−1,2−プロパンジオール、トリス(ヒドロキシメチルアミノ)メタンのような第1級アミン;ジエタノールアミン、ジイソプロパノールアミン、N−メチルエタノールアミン、N−エチルエタノールアミンのような第2級アミン;トリエタノールアミン、トリイソプロパノールアミン、N−ジメチルアミノエタノール、N−ジエチルアミノエタノールのような第3級アミン)などが挙げられる。
また、ポリエチレンイミン、ポリビニルアミン、ポリアリルアミン、アミノ酸(中でも、リジン、アルギニン、ヒスチジン、オルニチン、トリプトファンのような塩基性アミノ酸)、アミノ酸の重合体(中でも、ポリリジン、ポリアルギニン、ポリヒスチジン、ポリオルニチン、ポリトリプトファンのような塩基性アミノ酸の重合体)、ポリクレアチニンなどのアミノ基を有するポリマーも挙げられる。ポリマーは、直鎖状、分岐状の何れであってもよい。ポリマーの数平均分子量は、例えば、50以上、100以上、又は150以上であってよく、1,000,000以下、100,000以下、10,000以下、5,000以下、2,000以下、又は1,000以下であってよい。ポリマーの数平均分子量としては、例えば、50〜1,000,000、50〜100,000、50〜10,000、50〜5,000、50〜2,000、50〜1,000、100〜1,000,000、100〜100,000、100〜10,000、100〜5,000、100〜2,000、100〜1,000、150〜1,000,000、150〜100,000、150〜10,000、150〜5,000、150〜2,000、150〜1,000が挙げられる。
第4級イミダゾリウム塩としては、1−デシル−3−メチルイミダゾリウム塩、1−メチル−3−オクチルイミダゾリウム塩、1−メチル−ベンゾイミダゾリウム塩(塩酸塩、臭化水素酸塩など)などが挙げられる。
第4級ピリジニウム塩としては、ブチルピリジニウム塩、ドデシルピリジニウム塩(塩酸塩、臭化水素酸塩など)などが挙げられる。
窒素原子を含むカチオン性化合物は、1種を単独で、又は2種以上を組み合わせて使用できる。
2種以上のカチオン性化合物を使用する場合、各カチオン性化合物を導入したセルロースナノファイバーを混合して使用してもよく、或いは、2種以上のカチオン性化合物を導入したセルロースナノファイバーを使用してもよい。
カチオン性を高めるために反応させる化合物は、1種を単独で、又は2種以上を組み合わせて使用できる。
溶媒としては、通常、水を用いればよいが、メタノール、エタノール、2−プロパノール、エチレングリコールモノメチルエーテル(2−メトキシエタノール)のようなアルコール、ジメチルホルムアミド、ジメチルスルホキシドなどの非プロトン性極性溶媒も用いることができる。溶媒は、1種を単独で、又は2種以上を組み合わせて使用できる。
窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーにおける、窒素原子を含むカチオン性基の含有量は、窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーの陰イオン交換容量(Anion Exchange Capacity;AEC)が、例えば0.01meq/dry・g以上、好ましくは0.1meq/dry・g以上、より好ましくは0.4meq/dry・g以上、さらに好ましくは0.9meq/dry・g以上となる量であればよい。この範囲であれば、核酸を十分に吸着することができる。
また、窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーの陰イオン交換容量(AEC)が、例えば5meq/dry・g以下、好ましくは3meq/dry・g以下、より好ましくは1.2 meq/dry・g以下となる量であればよい。この範囲であれば、処理対象試料中に酸性物質(例えば、酸性タンパク質)などのマイナスチャージを有する物質が存在する場合にそのマイナスチャージを有する物質の非特定的吸着を抑えつつ、核酸を効率よく吸着することができる。
本発明の対象となる核酸の種類は限定されず、DNA、RNAが挙げられる。また、プラスミドのように環状核酸であってもよく、直鎖状核酸であってもよい。また、1本鎖、2本鎖、多重鎖の何れの核酸も対象にすることができる。さらに、リン酸化、アデニル化、アジド化、コレステロール化、ヘキシニル化、ビオチン化、チオール化、フルオロ化、ヘキサンジオール化、蛍光色素の結合などの化学修飾を施した核酸も対象にすることができる。核酸のサイズも限定されず、数塩基又は数塩基対程度のオリゴヌクレオチドから、10,000塩基又は10,000塩基対程度のポリヌクレオチドまで対象にすることができる。
また、本発明の核酸吸着材は、カラムに充填して用いることができる。本発明の核酸吸着材が充填されたカラムは、核酸吸着用、核酸除去用、又は核酸精製用のカラムとして用いることができる。
本発明の核酸吸着材と、核酸吸着対象材料とを接触させることにより、核酸吸着対象材料中の核酸が核酸吸着材に吸着する。
核酸を変性させずに核酸吸着材から離脱させるには、核酸を吸着した核酸吸着材を、イオン強度1〜2程度及び/又はpH 9程度の緩衝液と接触させたり、このような緩衝液を通液すればよい。
(1)核酸吸着材の製造
エチレンジアミン(EDA)固定化セルロースナノファイバー
500mLセパラブルフラスコに、20 wet−gの湿潤状態のセルロースナノファイバー(セリッシュろか名人;ダイセルファインケム株式会社製)と、5%(w/w) 水酸化ナトリウム水溶液(5gの水酸化ナトリウム(特級;ナカライテスク製)を95mL水に溶解したもの)を入れ、30℃水浴中で1時間撹拌した。次いで、セパラブルフラスコに160mLのクロロメチルオキシラン(特級;和光純薬工業株式会社製)を加え、さらに30℃水浴中で2時間撹拌した。撹拌速度は一定とした。反応物を濾布(東レシルク, メッシュサイズ 20μm, 東レ株式会社製)上で吸引ろ過し、固形分(ろ過残渣)としてエポキシ活性化セルロースナノファイバーを得た。得られたエポキシ活性化セルロースナノファイバーと、30%(v/v) エチレンジアミン(EDA)水溶液(30mL EDA(和光純薬工業株式会社製)と70mL水の混合液)をセパラブルフラスコに入れ、45℃の水浴中で4時間攪拌した。反応物を東レシルク上で超純水を用いて洗浄液のpHが中性付近になるまで十分に洗浄し、固形分(ろ過残渣)としてEDA固定化セルロースナノファイバーを得た(EDA-CNF-1)。
30%EDA水溶液に代えて30%(w/w)ポリアリルアミン水溶液(平均分子量1,600);ニットーボーメディカル株式会社製)を100mL添加した他は、EDA-CNF-1の製造と同様にしてポリアリルアミン(PAA)固定化セルロースナノファイバー(PAA-CNF)を製造した。
500ml四ツ口フラスコに、15gのセルロース粒子(CellufineGH−25;JNC株式会社製)と、20%(w/w)水酸化カリウム水溶液(42.4gの水酸化カリウム(一級;和光純薬工業株式会社製)を169.6mlの水に溶解させたもの)を入れ、30℃水浴中で1時間撹拌した。次いで、四ツ口フラスコに113mlのクロロメチルオキシラン(特級;和光純薬工業株式会社製)を加え、40℃水浴中で2時間撹拌した。反応物をろ布(TF−301B;通気度 10.2cc/cm2/sec;東レ株式会社製)上で吸引濾過し、固形分(ろ過残渣)としてエポキシ活性化セルロース粒子(Ep−MCC)を得た。
得られたEp−MCCを500ml四ツ口フラスコに入れ、132.4mlの水に分散させた。その後、50%(w/w)ポリエチレンイミン水溶液(25.4mlポリエチレンイミン(平均分子量1800;和光純薬工業株式会社製)と25.4ml水の混合液)を滴下し、50℃の水浴中で2時間撹拌した。反応物をろ布上で吸引濾過し、超純水を用いて洗浄した。得られた固形分(ろ過残渣)を500ml四ツ口フラスコに入れ、水200ml中で室温で1時間撹拌した。ろ布上で吸引濾過して超純水及びメタノールで洗浄を行い、ポリエチレンイミン固定化セルロース粒子(PEI-ビーズ)を得た。
PEI固定化セルロース粒子の製造と同様にして、Ep−MCCを得た。得られたEp−MCCを500ml四ツ口フラスコに入れ、100 mlの水に分散させた。その後、30%(w/w)ポリアリルアミン水溶液(50ml(平均分子量1,600);ニットーボーメディカル社))を滴下し、その後は、PEI固定化セルロース粒子の製造と同様にし、ポリアリルアミン固定化セルロース粒子(PAA-ビーズ)を得た。
EDA-CNF-1、EDA-CNF-2、PAA-CNF、PAA-ビーズ、及びPEI-ビーズを、それぞれ、カラム(0.9cmφ×3.0cm内径、容量1.9mL)に充填し、50μg/mL DNA水溶液(サケ精巣由来、分子量3×105)の50〜2000mLを、流速0.1mL/分で通液しながら、5mLずつ分取して回収した。分取した溶出液に含まれるDNA濃度をDAPIを用いた蛍光測定により定量し、DNA吸着容量は以下の式により算出した。
DNA吸着容量
=カラムに通液したDNAの総量(50(μg/mL)×通液量(mL))−カラムから溶出したDNAの総量(分取した各溶出液のDNA量(溶出液のDNA濃度(μg/mL)×5mL)の合計)
陰イオン交換容量(Anion Exchange Capacity;AEC)は、塩酸を用いた逆滴定法により測定した。手順を以下に示す。
以下の式によりAECを算出した。
AEC(mEq/dry・g)
=(0.1×fHCl×20−0.05×fNaOH×V×20/10)÷W
fHCl : 使用した塩酸のファクター
fNaOH : 使用した水酸化ナトリウムのファクター
V : 滴定量(ml)
W : 粒子の乾燥重量(dry・g)
9,000塩基対のサイズのプラスミド(終濃度:0.01〜100,000ppb)とEDA固定化セルロースナノファイバー(EDA-CNF-3)(終濃度:1%)を試験管中で混合し、25℃300rpmの条件で1.5時間振盪した。その後、混合物をろ紙(ADVANTEC Φ90mm No.131)でろ過して、EDA固定化セルロースナノファイバーを除去した。
フォワードプライマー:(5’−CTCTCGCCGTCGGCGTGCAGTTGCTTCCTC−3’)(配列番号1)
リバースプライマー :(5’−CATGGACGCCCTCCAGGGCACCCGGAAGAC−3’)(配列番号2)
を用いた。PCRの反応条件は、94℃5分、(94℃30秒、55℃30秒、72℃2分)を30サイクル、72℃5分とした。
PCR反応液を1%アガロース電気泳動に供し、色素(Midori Green Direct)により可視化した。結果を図1に示す。図1において、Mは分子量マーカーを示す。
9,000塩基対のサイズのプラスミド(終濃度:10,000ppb)とEDA固定化セルロースナノファイバー(EDA-CNF-3)(終濃度:1%)を試験管中で混合し、25℃300rpmの条件で1.5時間振盪した。その後、混合物をろ紙(ADVANTEC Φ90mm No.131)でろ過して、EDA固定化セルロースナノファイバーを除去した。混合液として、pHを2.0〜11.0に変化させたものを調製した。
BSA(Bovine serum albumin;ウシ血清アルブミン)とDNA(サケ精巣由来、分子量3×105)との混合液(BSA 1mg/ml、DNA 50μg/mL)4mLとEDA固定化セルロースナノファイバー(EDA-CNF-2)0.2 wet-gを混合し、25℃の下、200rpmで2時間撹拌した。混合液のイオン強度は、リン酸緩衝液濃度を調整することで、0.05又は0.2とした。また、混合液のpHを5〜9に変化させたものを調製した。混合物をろ紙(ADVANTEC Φ90mm No.131)でろ過して、EDA固定化セルロースナノファイバーを除去した。
また、ろ液に含まれるBSAをBCAキットを用いたUV−Vis測定により定量し、EDA固定化セルロースナノファイバーを用いない場合のBSA量を基準値として、EDA固定化セルロースナノファイバーへの吸着率(%)を算出した。
イオン強度0.2の場合、pH5〜9の全範囲で、EDA固定化セルロースナノファイバーはDNAを完全に吸着し、BSAを全く吸着しなかった。
一方、イオン強度0.05の場合、EDA固定化セルロースナノファイバーは、pH5〜9の全範囲でDNAを完全に吸着したが、pH6〜7外の範囲でBSAも吸着した。EDA固定化セルロースナノファイバーは、pH6〜7の範囲で核酸を選択的に吸着した。
EDA固定化セルロースナノファイバー(EDA-CNF-2)をカラム(0.9cmφ×3.0cm内径、容量1.9mL)に充填し、BSAとDNA(サケ精巣由来、分子量3×105)との混合液 60mL(BSA 1000μg/mL、DNA50μg/mL)をアプライした。BSAとDNAの混合液は、PBSを用いてpH=7.0、イオン強度0.2に調製した。
まず、PBSを用いてpH=7.0、イオン強度0.2に調製した溶出液を通液した。次いで、トリスバッファーを用いてpH=9、イオン強度0.2から2へのグラジエントを設けた溶出液を通液した。流速は0.1mL/分とした。溶離液中のDNAは、DAPIを用いた励起波長340nm、蛍光は波長430nmでの蛍光測定により検出し、BSAは、BCA(ビシンコニン酸)を用いた560nmでのUV-Visにより検出した。
DNAとBSAの混液をアプライした後、ほとんどBSAは吸着せず、pH=7.0、イオン強度0.2の溶出液の通液により、BSAの99%以上が溶出した。この間、プラスミドは99%以上が吸着したままであった。また、pH=9、イオン強度0.2から2へのグラジエントを設けた溶出液の通液によりプラスミドの80%以上が溶出した。
まず、PBSを用いてpH=7.0、イオン強度0.4に調製した溶出液を通液した。次いで、トリスバッファーを用いてpH=9、イオン強度0.2から2へのグラジエントを設けた溶出液を通液した。流速は0.1mL/分とした。
Claims (11)
- 窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーを備える、核酸吸着材。
- 窒素原子を含むカチオン性基が、多価アミンに由来する官能基、及び/又は第4級アンモニウム基である、請求項1に記載の核酸吸着材。
- 窒素原子を含むカチオン性基を有するセルロースナノファイバーの陰イオン交換容量が0.01〜5meq/dry−gとなるように、セルロースナノファイバーが窒素原子を含むカチオン性基を有する、請求項1又は2に記載の核酸吸着材。
- セルロースナノファイバーが、1nm〜1000nmの平均繊維径を有する、請求項1〜3の何れかに記載の核酸吸着材。
- 請求項1〜4の何れかに記載の核酸吸着材が充填された核酸吸着用カラム。
- セルロースナノファイバーに窒素原子を含むカチオン性基を導入する工程を含む、請求項1〜4の何れかに記載の核酸吸着材を製造する方法。
- 請求項1〜4の何れかに記載の核酸吸着材と核酸を含有する液体とを接触させる工程を含む、核酸が除去された液体の製造方法。
- 請求項1〜4の何れかに記載の核酸吸着材と、目的物質及び核酸を含有する液体とを接触させる工程を含む、核酸が除去された目的物質を含有する液体の製造方法。
- 目的物質がタンパク質である、請求項8に記載の方法。
- 目的物質が細胞生産物又は微生物生産物である、請求項8又は9に記載の方法。
- 請求項1〜4の何れかに記載の核酸吸着材と核酸を含有する液体とを接触させる工程と、核酸吸着材に吸着した核酸を核酸吸着材から離脱させる工程を含む核酸精製方法。
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