JP2025166830A - 新規抗トロポニンt抗体 - Google Patents
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Abstract
【課題】ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合する抗体を提供する。
【解決手段】CDRが以下:軽鎖可変ドメイン中の特定のアミノ酸配列を含むCDR1、特定のアミノ酸配列を含むCDR2および特定のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに、重鎖可変ドメイン中の特定のアミノ酸配列を含むCDR1、特定のアミノ酸配列を含むCDR2、および特定のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とする抗体が提供される。
【選択図】図5
【解決手段】CDRが以下:軽鎖可変ドメイン中の特定のアミノ酸配列を含むCDR1、特定のアミノ酸配列を含むCDR2および特定のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに、重鎖可変ドメイン中の特定のアミノ酸配列を含むCDR1、特定のアミノ酸配列を含むCDR2、および特定のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とする抗体が提供される。
【選択図】図5
Description
本発明は、心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する新規モノクローナル抗体であって、CDRが以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とし、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体に関する。
本明細書において、特許出願および製造者のマニュアルを含む多数の文書が引用される。これらの文書の開示は、本発明の特許性に関連すると見なされないが、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。さらに具体的には、参照されるすべての文書は、それぞれ個々の文書が参照により組み込まれると具体的かつ個別に示されたのと同様に参照により組み込まれる。
心筋トロポニンは、心外傷の高感度および特異的なバイオマーカーである。特に心筋トロポニンT(cTnT)は、高度に心臓特異的であり、非心筋または他の組織損傷後に血清中に存在しない。加えてcTnTは、心筋梗塞を診断するために使用される他のものよりさらに持続性で高感度なバイオマーカーであることが示された。したがって一般に心筋トロポニンは、急性心筋虚血を診断するために一般に有用であり、cTnTは特に有用である。
心筋トロポニンTは、心疾患を有する患者において広く使用されるバイオマーカーである。心疾患を有する患者におけるその有用性は、Westermannら、(Nature Reviews/Cardiology,vol 14(2017)473~483によって近年概説された。cTnTの使用は、急性心筋梗塞(AMI)を有することが疑われる患者において十分確立されているが、トロポニン測定は他の急性および非急性の状況においても使用される。AMIを有することが疑われる患者において、早期の意思決定は、迅速な処置およびさらなる診断評価を可能にするために極めて重要である。
トロポニンに対する新規の高感度アッセイは、明確にさらに低い濃度の検出を可能にする。これらのアッセイおよび非常に低いカットオフ濃度を使用して、いくつかの迅速な診断戦略が、急性の心臓の治療における診断を改善したことが報告された。さらに、トロポニンアッセイの非冠状動脈および非急性適用が、例えば心不全、肺塞栓または安定環状動脈疾患を有する患者におけるバイオマーカーとして、見込まれており、個々のリスク層別化を改善する可能性がある。
心筋トロポニンTは、通常、少なくとも1つの抗体がcTnTを捕捉するために使用され、少なくとも第2の(標識化)抗体が試料中のcTnTを検出するために使用されるサンドイッチ型イムノアッセイで測定される。Roche Diagnostics、Germanyによって販売されているcTnTに対する第5世代アッセイの場合も同様である。European Collection of Animal Cell Cultures、GBに寄託された融合細胞クローン7.1 A 12.2-22(ECACC 89060901)によって産生されるモノクローナル抗体12.1A11.11-7は、cTnTに対するアッセイにおける最良の検出抗体としておよそ30年間使用されている。1989年にこの抗体が生成されて以来、cTnTの検出のためのさらに良好なモノクローナル抗体は現れていない。
過去数年間にわたって、種々のトロポニンの測定のためのこれまで以上に高感度のアッセイが、例えばかかるアッセイにおいて使用される検出抗体の標識のための最新の技術に基づいて、開発された。
多数の研究は、トロポニンに対する種々の高感度アッセイを、AMIを有することが疑われる患者のトリアージを改善する可能性および臨床診断の他の分野におけるそれらの有用性の両方について評価した。
最良の高感度トロポニンアッセイでさえ、ある一定の百分率で健康な個体におけるトロポニンを測定できないことが報告された(例えば、上記Westermannら、を参照されたい)。明らかにアッセイ感度が、例えばcTnTの検出において最も重要であり、その目的のための改善は非常に望ましい。
この必要性は、特許請求の範囲において定義される実施形態を提供することによって本発明によって対処される。
抗体とcTnTとの複合体形成に悪影響を与えない一方で、cTnTとかかる変異体抗体との間に形成される複合体の安定性に関して顕著な改善を示す、ある特定の変異が、抗体12.1A11.11-7の相補性決定領域(CDR)に導入され得ることが驚くべきことに見出された。これらの驚くべき特性を介して、優れた感度を有するcTnTに対するアッセイは、実現可能である。
抗体とcTnTとの複合体形成に悪影響を与えない一方で、cTnTとかかる変異体抗体との間に形成される複合体の安定性に関して顕著な改善を示す、ある特定の変異が、抗体12.1A11.11-7の相補性決定領域(CDR)に導入され得ることが驚くべきことに見出された。これらの驚くべき特性を介して、優れた感度を有するcTnTに対するアッセイは、実現可能である。
したがって本発明は、心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する新規モノクローナル抗体であって、CDRが以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とし、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体に関する。
本発明の抗体は、心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する新規モノクロー
ナル抗体であって、CDRが以下:
(a)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに
(b)重鎖可変ドメイン中の
(i)配列番号6のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3、
(ii)配列番号7のCDR1;配列番号8のCDR2および配列番号11のCDR3、(iii)配列番号7のCDR1、配列番号8のCDR2および配列番号13のCDR3、
(iv)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号13のCDR3、(v)配列番号6のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号10のCDR3、
(vi)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号11のCDR3、(vii)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3、
(viii)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号10のCDR3、
(ix)配列番号7のCDR1、配列番号8のCDR2および配列番号12のCDR3、または
(x)配列番号5のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3
から選択される一連のCDR
のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とする新規モノクローナル抗体として記載される場合もある。
ナル抗体であって、CDRが以下:
(a)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに
(b)重鎖可変ドメイン中の
(i)配列番号6のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3、
(ii)配列番号7のCDR1;配列番号8のCDR2および配列番号11のCDR3、(iii)配列番号7のCDR1、配列番号8のCDR2および配列番号13のCDR3、
(iv)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号13のCDR3、(v)配列番号6のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号10のCDR3、
(vi)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号11のCDR3、(vii)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3、
(viii)配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号10のCDR3、
(ix)配列番号7のCDR1、配列番号8のCDR2および配列番号12のCDR3、または
(x)配列番号5のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3
から選択される一連のCDR
のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とする新規モノクローナル抗体として記載される場合もある。
重鎖可変ドメインに含まれるCDRについて上に示される定義(i)から(x)は、本開示による重鎖CDRの選択肢の記載を表す。本定義は、本開示において示される重鎖可変ドメインに関連するすべての種々の実施形態における重鎖可変ドメインを記載および定義するために使用され得る。
抗体の全体構造は、当技術分野において周知であり、ジスルフィド結合によって繋がれた2本の重鎖および2本の軽鎖から構成される。重鎖および軽鎖は、それぞれ1つの定常ドメインおよび1つの可変ドメインからなる。抗原への結合特異性は、抗体を形成する軽鎖および重鎖の可変ドメインによってもたらされる。より具体的には、それらの特異性を決定し、特異的リガンドと接触する抗体の部分は、相補性決定領域(CDR)と称される。CDRは、分子の最も可変性の部分であり、これらの分子の多様性に寄与する。各可変ドメインには3つのCDR領域、CDR1、CDR2およびCDR3があり、4つのフレームワーク領域(FW)に埋め込まれる。本明細書において使用される場合、CDR-HC(またはCDR(HC))は可変重鎖のCDR領域を示し、CDR-LC(またはCDR(LC))は可変軽鎖のCDR領域に関する。同様に、FW-HC(またはFW(HC))は可変重鎖のフレームワーク領域を示し、FW-LC(またはFW(LC))は可変軽鎖のフレームワーク領域に関する。
本発明により使用される場合、用語「含む(comprising)」は、さらなる配列/構成成分が、具体的に述べられる配列および/または構成成分に加えて含まれてよいことを記している。しかし、この用語は、特許請求される主題が述べられる配列および/または構成成分から厳密になることも包含する。
本発明の抗体が述べられるアミノ酸配列より多くを含むこれらの実施形態では、追加的アミノ酸は、N末端もしくはC末端のいずれかまたは両方に存在し得る。追加的配列は、例えば本明細書において下に詳細に考察されるとおり、例えば精製または検出のために導入された配列を含み得る。さらに、個々の配列は、述べられる配列を「含み」、それらは、追加的アミノ酸をN末端もしくはC末端または両方に含み得る。
本発明により、抗体は、配列番号1のヒト心筋トロポニンT(cTnT)に特異的に結合する。本発明の抗体が上に詳述される追加的アミノ酸を含む場合にも、前記抗体が必然的にcTnTに特異的に結合しなければならないことは理解される。
用語「特異的に結合する」(本明細書において「特異的に相互作用する」とも称される)は、本発明により、抗体がcTnTだけに特異的に結合し、異なるタンパク質、具体的には同様の構造の異なるタンパク質、例えばトロポニンI(配列番号33)などと交差反応しないまたは本質的にしないことを意味する。
抗体の特異性を分析するための対応法は、例えばHarlow & Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory PressおよびHarlow & Lane(1999)Using Antibodies:A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory Pressに記載されている。好適な研究の非限定的例は、例えば、結合研究、構造的および/または機能的に密接に関連する分子を用いた遮断および競合研究である。これらの研究は、例えばFACS分析、フローサイトメトリー滴定分析(FACS滴定)、表面プラズモン共鳴(SPR、例えばBIAcore(登録商標)を用いる)、等温滴定熱量測定(ITC)、蛍光滴定または放射標識されたリガンド結合アッセイによるなどの方法によって実行され得る。さらなる方法として、例えばウエスタンブロット、ELISA(競合ELISAを含む)-、RIA-、ECL-、およびIRMA-検査が挙げられる。
本発明の内容では、用語「抗体」は、免疫グロブリン分子全体およびFab、Fab’、F(ab’)2、Fvなどのその抗原結合断片に関する。さらに、用語は、改変および/または変更された抗体分子、ならびに組換え的にまたは合成的に生成された/合成された抗体に関する。用語「抗体」は、二機能性抗体、三機能性抗体、完全ヒト抗体、キメラ抗体および1本鎖Fv(scFv)もしくは抗体融合タンパク質のような抗体構築物も含む。
本明細書において使用される場合、「Fab断片」は、1本の軽鎖ならびに1本の重鎖のCH1および可変領域からなる。Fab分子の重鎖は、別の重鎖分子とジスルフィド結合を形成できない。「Fab’断片」は、1本の軽鎖ならびに、VHドメインおよびCH1ドメインならびにCH1とCH2ドメインとの間の領域も含有する1本の重鎖の一部を、鎖間ジスルフィド結合がF(ab’)2分子を形成するように2つのFab’断片の2本の重鎖の間に形成され得るように含有する。「F(ab’)2断片」は、2本の軽鎖および、CH1とCH2ドメインとの間の定常領域の一部を含有する2本の重鎖を、鎖間ジスルフィド結合が2本の重鎖の間に形成されるように含有する。したがって、F(ab’)2断片は、2本の重鎖の間のジスルフィド結合によって互いに合わさっている2つのFab’断片から構成される。
Fab/c断片は、FcおよびFab決定基の両方を含有し、ここで「Fc」領域は抗体のCH2およびCH3ドメインを含む2つの重鎖断片を含有する。2つの重鎖断片は、2つ以上ジスルフィド結合によって、およびCH3ドメインの疎水性相互作用によって互いに合わさっている。
「Fv領域」は、重鎖および軽鎖の両方由来の可変領域を含むが、定常領域を欠いている。「1本鎖Fv」(「scFv」とも略される)は、本発明の内容では、抗体のVHおよびVLドメインを有する抗体断片であり、ここでこれらのドメインは、単一のポリペプチド鎖中に存在している。一般に、scFvポリペプチドは、scFvが抗原結合のため
の望ましい構造を形成できるようにするポリペプチドリンカーをVHドメインとVLドメインとの間にさらに含む。1本鎖抗体の産生について記載される技術は、例えばPluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies、Rosenburg and Moore eds.Springer-Verlag、N.Y.113(1994)、269~315に記載されている。
の望ましい構造を形成できるようにするポリペプチドリンカーをVHドメインとVLドメインとの間にさらに含む。1本鎖抗体の産生について記載される技術は、例えばPluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies、Rosenburg and Moore eds.Springer-Verlag、N.Y.113(1994)、269~315に記載されている。
本明細書において使用される場合、用語「完全ヒト抗体」は、ヒト免疫グロブリンタンパク質配列のみを含む抗体を指す。それでもなお、完全ヒト抗体は、マウスにおいて、マウス細胞において、もしくはマウス細胞由来の融合細胞において産生された場合はマウス(murine)炭水化物鎖を含む場合がある、またはラットにおいて、ラット細胞において、もしくはラット細胞由来の融合細胞において産生された場合はラット炭水化物鎖を含む場合がある。同様に、完全ヒト抗体は、ハムスターにおいて、ハムスター細胞、例えばCHO細胞などにおいて、またはハムスター細胞由来の融合細胞において産生された場合はハムスター炭水化物鎖を含む場合がある。一方、「マウス抗体」または「マウス(murine)抗体」は、マウス(マウス(murine))免疫グロブリンタンパク質配列のみを含む抗体であり、一方「ラット抗体」または「ウサギ抗体」は、それぞれラットまたはウサギ免疫グロブリン配列のみを含む抗体である。完全ヒト抗体と同様に、かかるマウス(murine)、ラットまたはウサギ抗体は、かかる動物またはかかる動物の細胞において産生される場合に、他の種からの炭水化物鎖を含有する場合がある。例えば抗体は、ハムスター細胞、例えばCHO細胞などにおいて、またはハムスター細胞由来の融合細胞において産生された場合はハムスター炭水化物鎖を含む場合がある。完全ヒト抗体は、例えば、完全ヒト抗体の産生およびスクリーニングを可能にする広く使用されているスクリーニング技術であるファージディスプレイによって産生され得る。同様に、ファージ抗体は、本発明の内容において使用され得る。ファージディスプレイ法は、例えばUS5,403,484、US5,969,108およびUS5,885,793に記載されている。完全ヒト抗体の開発を可能にする別の技術は、マウス融合細胞技術の改変を含む。マウスは、それら自体のマウス遺伝子の代わりにヒト免疫グロブリン遺伝子座を含有するようにトランスジェニックにされる(例えば、US5,877,397を参照されたい)。
用語「キメラ抗体」は、ヒトまたは非ヒト(例えば、マウス、ウマ、ウサギ、イヌ、ウシ、ニワトリ)のいずれかの別の種由来の抗体領域(例えば、定常領域)に融合されたまたはそれとキメラ化された、ヒトまたは非ヒト種の可変領域を含む抗体を指す。
上述のとおり、用語「抗体」は、抗体融合タンパク質などの抗体構築物も包含し、ここで抗体は、具体的なアミノ酸配列によって本明細書において定義されるドメインに加えて、例えば組換え的に産生された構築物の単離および/または調製のための追加的ドメイン(複数可)を含む。
本発明の抗体は、本発明において開示および定義されるCDRを含む組換え抗体、例えば組換えヒト抗体またはヘテロハイブリッド抗体であるように産生され得る。
用語「組換え抗体」として、ヒト免疫グロブリン遺伝子についてトランスジェニックである動物(例えば、マウス)から単離された抗体、宿主細胞にトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現された抗体、組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体または、ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列へのスプライシングを含む任意の他の手段によって調製、発現、作製もしくは単離された抗体、などの組換え手段によって調製、発現、作製または単離されたすべての抗体が挙げられる。組換えヒト抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列由来の可変および定常領域(存在する場合)を有する。しかし、かかる抗体は、in vitro変異導入(または、ヒトIg配列についてのトランスジェニック動物が使用される場合はin vivo体細胞変
異導入)に供されてよく、それにより組換え抗体のVHおよびVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列VHおよびVL配列に由来し、関連する一方で、in vivoでヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然で存在しない配列である。
用語「組換え抗体」として、ヒト免疫グロブリン遺伝子についてトランスジェニックである動物(例えば、マウス)から単離された抗体、宿主細胞にトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現された抗体、組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体または、ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列へのスプライシングを含む任意の他の手段によって調製、発現、作製もしくは単離された抗体、などの組換え手段によって調製、発現、作製または単離されたすべての抗体が挙げられる。組換えヒト抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列由来の可変および定常領域(存在する場合)を有する。しかし、かかる抗体は、in vitro変異導入(または、ヒトIg配列についてのトランスジェニック動物が使用される場合はin vivo体細胞変
異導入)に供されてよく、それにより組換え抗体のVHおよびVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列VHおよびVL配列に由来し、関連する一方で、in vivoでヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然で存在しない配列である。
用語「ヘテロハイブリッド抗体」は、異なる生物に由来する軽鎖および重鎖を有する抗体を指す。例えば、マウス(murine)軽鎖と会合したヒト重鎖を有する抗体は、ヘテロハイブリッド抗体である。ヘテロハイブリッド抗体の例として、キメラおよびヒト化抗体が挙げられる。
本発明による抗体は、軽鎖CDRおよび重鎖CDRの述べられた組合せを含む。CDRが組み込まれるそれぞれの可変ドメインの周囲のフレームワーク配列は、さらなる負担を伴うことなく当業者によって選択され得る。例えば、下にさらに記載されるフレームワーク配列または添付の実施例において使用される具体的なフレームワーク配列は、使用され得る。
本発明によりCDRは、具体的に述べられた配列を含むことができる、または最大1個のアミノ酸置換においてそれから異なっていてよい。そのため、各CDR中の1つのアミノ酸は、異なるアミノ酸によって置き換えられてよい。アミノ酸置換は、1本鎖のまたは1つの抗体のCDRの一部に存在するが、すべてにおいてではないことも包含されることは、理解される。
本発明により用語「置換」は、アミノ酸の別のアミノ酸での置き換えを指す。したがって、アミノ酸の総数は同じままである。ある特定の位置でのアミノ酸の欠失および、異なる位置での1つ(もしくは複数の)アミノ酸(複数可)の導入は、用語「置換」によって明確に包含されない。本発明による置換は、保存的アミノ酸置換または非保存的アミノ酸置換であってよい。用語「保存的アミノ酸置換」は、当技術分野において周知であり、同様の構造的および/または化学的特性を有する異なるアミノ酸を用いたアミノ酸の置き換えを指す。かかる類似性として、例えば、関与する残基の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性および/または両親媒性の性質における類似性が挙げられる。アミノ酸置換は、以下の群の1つのアミノ酸の1つが、同じ群の別のアミノ酸によって置換されている場合に保存的アミノ酸置換である:アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンおよびメチオニンが挙げられる非極性(疎水性)アミノ酸;グリシン、セリン、スレオニン、システイン、アスパラギンおよびグルタミンが挙げられる極性中性アミノ酸;アルギニン、リジンおよびヒスチジンが挙げられる正荷電を有する(塩基性)アミノ酸;ならびにアスパラギン酸およびグルタミン酸が挙げられる負荷電を有する(酸性)アミノ酸。一実施形態では、任意(またはすべて)のCDRにおける置換は、保存的アミノ酸置換である。同様に1つまたは複数のCDRにおいてかかる置換アミノ酸を有する抗体が、必然的に配列番号1のcTnTに特異的に結合する抗体でなければならないことは理解される。
一実施形態では、ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する抗体は、(i)軽鎖可変ドメイン中のCDRが配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3またはCDRあたり最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含み、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中のCDRが配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3を含むことを特徴とする抗体であって、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、C
DR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体である。
DR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体である。
一実施形態では本発明は、ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する抗体であって、CDRが以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含むことを特徴とし、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体を開示する。
さらに本発明は、ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する抗体であって、
式I:
FW(LC)1-CDR(LC)1-FW(LC)2-CDR(LC)2-FW(LC)3-CDR(LC)3-FW(LC)4(式I)
に表されるフレームワーク領域(FW)およびCDRからなる軽鎖可変ドメイン、
ならびに式II:
FW(HC)1-CDR(HC)1-FW(HC)2-CDR(HC)2-FW(HC)3-CDR(HC)3-FW(HC)4(式II)
に表されるFWおよびCDRからなる重鎖可変ドメインを含み、
FWが以下:
軽鎖における
FW(LC)1 配列番号14のアミノ酸配列;
FW(LC)2 配列番号15のアミノ酸配列;
FW(LC)3 配列番号16のアミノ酸配列;
FW(LC)4 配列番号17のアミノ酸配列;
および重鎖における
FW(HC)1 配列番号18のアミノ酸配列;
FW(HC)2 配列番号19のアミノ酸配列;
FW(HC)3 配列番号20のアミノ酸配列;
FW(HC)4 配列番号21のアミノ酸配列;
のアミノ酸配列またはこれらに少なくとも85%同一であるその変種を含み、
CDRが、以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含み、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2
が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする、あるいはCDRあたり最大1個のアミノ酸置換において異なっているこれらのCDRの変種を含む抗体にも関する。
式I:
FW(LC)1-CDR(LC)1-FW(LC)2-CDR(LC)2-FW(LC)3-CDR(LC)3-FW(LC)4(式I)
に表されるフレームワーク領域(FW)およびCDRからなる軽鎖可変ドメイン、
ならびに式II:
FW(HC)1-CDR(HC)1-FW(HC)2-CDR(HC)2-FW(HC)3-CDR(HC)3-FW(HC)4(式II)
に表されるFWおよびCDRからなる重鎖可変ドメインを含み、
FWが以下:
軽鎖における
FW(LC)1 配列番号14のアミノ酸配列;
FW(LC)2 配列番号15のアミノ酸配列;
FW(LC)3 配列番号16のアミノ酸配列;
FW(LC)4 配列番号17のアミノ酸配列;
および重鎖における
FW(HC)1 配列番号18のアミノ酸配列;
FW(HC)2 配列番号19のアミノ酸配列;
FW(HC)3 配列番号20のアミノ酸配列;
FW(HC)4 配列番号21のアミノ酸配列;
のアミノ酸配列またはこれらに少なくとも85%同一であるその変種を含み、
CDRが、以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含み、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2
が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする、あるいはCDRあたり最大1個のアミノ酸置換において異なっているこれらのCDRの変種を含む抗体にも関する。
さらに本発明は、式I:
FW(LC)1-CDR(LC)1-FW(LC)2-CDR(LC)2-FW(LC)3-CDR(LC)3-FW(LC)4(式I)
に表されるフレームワーク領域(FW)およびCDRからなる軽鎖可変ドメイン、
ならびに式II:
FW(HC)1-CDR(HC)1-FW(HC)2-CDR(HC)2-FW(HC)3-CDR(HC)3-FW(HC)4(式II)
に表されるFWおよびCDRからなる重鎖可変ドメインを含む抗cTnT抗体であって、FWが以下:
軽鎖における
FW(LC)1 配列番号14のアミノ酸配列;
FW(LC)2 配列番号15のアミノ酸配列;
FW(LC)3 配列番号16のアミノ酸配列;
FW(LC)4 配列番号17のアミノ酸配列;
および重鎖における
FW(HC)1 配列番号18のアミノ酸配列;
FW(HC)2 配列番号19のアミノ酸配列;
FW(HC)3 配列番号20のアミノ酸配列;
FW(HC)4 配列番号21のアミノ酸配列;
のアミノ酸配列またはこれらに少なくとも85%同一であるその変種を含み、
CDRが、以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含み、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗cTnT抗体を開示する。
FW(LC)1-CDR(LC)1-FW(LC)2-CDR(LC)2-FW(LC)3-CDR(LC)3-FW(LC)4(式I)
に表されるフレームワーク領域(FW)およびCDRからなる軽鎖可変ドメイン、
ならびに式II:
FW(HC)1-CDR(HC)1-FW(HC)2-CDR(HC)2-FW(HC)3-CDR(HC)3-FW(HC)4(式II)
に表されるFWおよびCDRからなる重鎖可変ドメインを含む抗cTnT抗体であって、FWが以下:
軽鎖における
FW(LC)1 配列番号14のアミノ酸配列;
FW(LC)2 配列番号15のアミノ酸配列;
FW(LC)3 配列番号16のアミノ酸配列;
FW(LC)4 配列番号17のアミノ酸配列;
および重鎖における
FW(HC)1 配列番号18のアミノ酸配列;
FW(HC)2 配列番号19のアミノ酸配列;
FW(HC)3 配列番号20のアミノ酸配列;
FW(HC)4 配列番号21のアミノ酸配列;
のアミノ酸配列またはこれらに少なくとも85%同一であるその変種を含み、
CDRが、以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含み、CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗cTnT抗体を開示する。
式Iに示される一次構造は、N末端からC末端への本発明の抗体の軽鎖可変ドメインの構成成分の順序を表す。式IIに示される一次構造は、N末端からC末端への本発明の抗体の重鎖可変ドメインの構成成分の順序を表す。各場合において、フレームワーク領域(FW)1は、それぞれの可変鎖ドメインの最もN末端部分を表し、一方FW4は、それぞれの可変鎖ドメインの最もC末端部分を表す。
上に定義されるとおり、それぞれのFWおよびCDR配列は、列挙したアミノ酸配列を「含む」。一実施形態では、それぞれのFWおよびCDR配列は、前記アミノ酸配列からなる、すなわち本発明の抗トロポニンT抗体の軽鎖可変ドメイン(複数可)および重鎖可
変ドメイン(複数可)は、それぞれ式Iおよび式IIにおいて表されるFWおよびCDRからなり、それぞれのFWおよびCDR配列は、列挙されたアミノ酸配列からなる。
変ドメイン(複数可)は、それぞれ式Iおよび式IIにおいて表されるFWおよびCDRからなり、それぞれのFWおよびCDR配列は、列挙されたアミノ酸配列からなる。
CDRおよびその変種に関して、上に提供される定義および具体的に例示される実施形態を準用する。
フレームワーク領域に関して、ある特定の程度の変動も本明細書において想定される、すなわち個々のFWは、具体的に述べられるアミノ酸配列またはそれに少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含み得る、またはそれからなり得る。好ましくは、同一性は少なくとも90%、より好ましくは少なくとも92.5%、より好ましくは少なくとも95%であり、さらにより好ましくは同一性は、少なくとも99%などの少なくとも98%であり、最も好ましくは同一性は、少なくとも99.5%である。異なるFWについて、実際の配列、ならびに例えばそれぞれのFW配列の長さおよびそれぞれの可変鎖ドメイン内のその位置に依存して、異なる程度の配列同一性が許容可能であり得ることは理解される。
フレームワーク領域に関して、ある特定の程度の変動も本明細書において想定される、すなわち個々のFWは、具体的に述べられるアミノ酸配列またはそれに少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含み得る、またはそれからなり得る。好ましくは、同一性は少なくとも90%、より好ましくは少なくとも92.5%、より好ましくは少なくとも95%であり、さらにより好ましくは同一性は、少なくとも99%などの少なくとも98%であり、最も好ましくは同一性は、少なくとも99.5%である。異なるFWについて、実際の配列、ならびに例えばそれぞれのFW配列の長さおよびそれぞれの可変鎖ドメイン内のその位置に依存して、異なる程度の配列同一性が許容可能であり得ることは理解される。
本発明により、用語「%配列同一性」は、2つ以上のアライメントされたアミノ酸配列の同一アミノ酸のマッチ(「ヒット」)数を、アミノ酸配列の長さ全体(またはその比較される部分全体)を構成するアミノ酸残基数と比較して記載する。同一性パーセントは、同一残基の数を残基の総数で割り、商に100を掛けることによって決定される。言い換えると、アライメントを使用して、同じであるアミノ酸残基の百分率(例えば、85%同一性)は、2つ以上の(サブ)配列が、当技術分野において公知の配列比較アルゴリズムを使用して測定される、比較ウインドウにわたるまたは指定の領域にわたる最大の対応について比較およびアライメントされる場合、または手作業でアライメントされ、目視で検査された場合に、2つ以上の配列またはサブ配列について決定され得る。
当業者は、例えばNCBI BLASTアルゴリズム(Altschul,S.F.ら、[1997]Nucleic Acids Res.25:3389~3402)、CLUSTALWコンピュータープログラム(Tompson,J.D.ら、[1994]Nucleic Acids Res.22:4673~4680)またはFASTA(Pearson,W.R.& Lipman,D.J.[1988]Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85:2444~2448)に基づくものなどのアルゴリズムを使用して、配列間の/内のパーセント配列同一性をどの様に決定するかを公知である。一実施形態では、NCBI BLASTアルゴリズムは、本発明により使用される。アミノ酸配列について、BLASTPプログラムは、ワード長(W)3、および期待値(E)10を初期設定として使用する。BLOSUM62スコアリングマトリクス(Henikoff,S.& Henikoff,J.G.[1992]Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.89:10915~10919)は、配列比較(B)50、期待値(E)10、M=5、N=4および両鎖の比較を使用する。したがってこれらの実施形態では、%配列同一性が示される場合、NCBI BLASTプログラムを用いて決定された少なくとも85%の配列同一性を有するすべてのアミノ酸配列は、前記実施形態の範囲内である。
具体的に述べられたそれぞれのアミノ酸配列と比較した、フレームワーク領域における変動の上に記載の程度は、アミノ酸(複数可)の置換、挿入、付加または欠失によるものであり得る。
用語「置換」は、本明細書において上で定義された。1つより多いアミノ酸が置換される場合、各アミノ酸は独立に別のアミノ酸を用いて置換される、すなわち除去される各アミノ酸について異なるアミノ酸が同じ位置に導入される。
用語「挿入」は、本発明により、1つまたは複数のアミノ酸の具体的に述べられるアミ
ノ酸配列への付加を指し、ここで付加は、ポリペプチドのNまたはC末端への付加ではない。
ノ酸配列への付加を指し、ここで付加は、ポリペプチドのNまたはC末端への付加ではない。
用語「付加」は、本発明により、1つまたは複数のアミノ酸の具体的に述べられるアミノ酸配列へのポリペプチドのNもしくはC末端へのまたは両方への付加を指す。
本発明により使用される場合、用語「欠失」は、具体的に述べられるアミノ酸配列から1つまたは複数のアミノ酸を失うことを指す。
本発明により使用される場合、用語「欠失」は、具体的に述べられるアミノ酸配列から1つまたは複数のアミノ酸を失うことを指す。
一実施形態では、フレームワーク領域のアミノ酸配列における変動は、アミノ酸(複数可)の置換による。本明細書において上で定義されたとおり置換は、保存的アミノ酸置換または非保存的アミノ酸置換であってよい。用語「置換」に関して上に提供された定義および具体的に例示された実施形態を準用する。一実施形態では、フレームワーク領域中の置換は、保存的アミノ酸置換である。
さらなる実施形態では、CDRは、上に列挙した具体的な配列からなり(すなわち、いかなる変動も含まない)、上に列挙したフレームワーク領域(FW)は、上に列挙した具体的な配列内に最大で以下の量のアミノ酸変動を含む:
FW(LC)1 最大3個のアミノ酸変動;
FW(LC)2 最大2個のアミノ酸変動;
FW(LC)3 最大4個のアミノ酸変動;
FW(LC)4 最大1個のアミノ酸変動;および
FW(HC)1 最大3個のアミノ酸変動;
FW(HC)2 最大2個のアミノ酸変動;
FW(HC)3 最大4個のアミノ酸変動;および
FW(HC)4 最大個の1アミノ酸変動。
FW(LC)1 最大3個のアミノ酸変動;
FW(LC)2 最大2個のアミノ酸変動;
FW(LC)3 最大4個のアミノ酸変動;
FW(LC)4 最大1個のアミノ酸変動;および
FW(HC)1 最大3個のアミノ酸変動;
FW(HC)2 最大2個のアミノ酸変動;
FW(HC)3 最大4個のアミノ酸変動;および
FW(HC)4 最大個の1アミノ酸変動。
さらなる実施形態では、FWにおけるアミノ酸変動は、置換である。
さらなる実施形態では、軽鎖または重鎖可変ドメインフレームワーク領域に存在する変動の総量は、例えば最大8個のアミノ酸置換など、例えば最大6個のアミノ酸置換、最大4個のアミノ酸置換など、例えば最大3個のアミノ酸置換、最大2個のアミノ酸置換などの最大9個のアミノ酸置換である。さらなる実施形態では、軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域1から4を合わせた中に、または重鎖可変ドメインのフレームワーク領域1から4を合わせた中に1個だけのアミノ酸置換がある。
さらなる実施形態では、軽鎖または重鎖可変ドメインフレームワーク領域に存在する変動の総量は、例えば最大8個のアミノ酸置換など、例えば最大6個のアミノ酸置換、最大4個のアミノ酸置換など、例えば最大3個のアミノ酸置換、最大2個のアミノ酸置換などの最大9個のアミノ酸置換である。さらなる実施形態では、軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域1から4を合わせた中に、または重鎖可変ドメインのフレームワーク領域1から4を合わせた中に1個だけのアミノ酸置換がある。
FWとして本明細書に定義される式Iおよび式IIの一部が、可変鎖領域のフレームまたはスキャホールドの一部を形成するアミノ酸配列であることから、前記配列内、特に保存的アミノ酸置換の形態での置換は、多くの場合、抗cTnT抗体の結合能力に影響を与えない。これは、これらのアミノ酸が典型的にはcTnTへの結合に直接関与しないこと、および好適な代替的アミノ酸へのそれらの置換がタンパク質の三次元構造およびフォールディングへの変化が生じないように設計され得るためである。一方、かかる置換は、ある種の宿主における発現の改善または例えば追加的ジスルフィド架橋の導入によるタンパク質の安定性についてなど多数の有益な効果をもたらし得る。
抗体の「結合親和性」は、以下の式:
Kd=kd/ka
式中:
Kd=解離平衡定数[M]
kd=解離速度定数[s-1]
ka=結合速度定数[M-1s-1]
に従って標的抗原上のエピトープと抗体の結合部位との間の相互作用の強度を測定する。
Kd=kd/ka
式中:
Kd=解離平衡定数[M]
kd=解離速度定数[s-1]
ka=結合速度定数[M-1s-1]
に従って標的抗原上のエピトープと抗体の結合部位との間の相互作用の強度を測定する。
抗体の結合親和性についてのさらなる関連パラメーターは、以下のとおりである:
t/2=解離複合体(dissociation complex)半減期=ln2/kd/60[分]
Rmax=分析物の最大応答[RU]
MR:モル比=分析物の最大応答(Rmax)比
一実施形態では、本明細書において上に開示されるcTnTに対するモノクローナル抗体は、37℃で10分間以上のt/2-dissを有してcTnTに結合する。
t/2=解離複合体(dissociation complex)半減期=ln2/kd/60[分]
Rmax=分析物の最大応答[RU]
MR:モル比=分析物の最大応答(Rmax)比
一実施形態では、本明細書において上に開示されるcTnTに対するモノクローナル抗体は、37℃で10分間以上のt/2-dissを有してcTnTに結合する。
本発明は、
(i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択される重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有する抗体にさらに関する。
(i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択される重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有する抗体にさらに関する。
同様に本発明において開示されるのは、
(i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列の重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
CDRが以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含み、
CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、
ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とし、
ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有する抗体である。
(i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列の重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
CDRが以下:(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3のアミノ酸配列を含み、
CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、
ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とし、
ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有する抗体である。
一実施形態では本開示は、
(i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメイン
を含む抗体に関する。
(i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメイン
を含む抗体に関する。
本発明の抗cTnT抗体に関して本明細書で上に提供されるすべての定義および具体的
例示的実施形態、特に多様性の言及される程度および種類を準用する。
本発明により、cTnTへの改善された結合特性(より良好なKD値)を有し、それにより以前のアッセイと比較して優れた感度を有してcTnTの検出を可能にする新規抗cTnT抗体が提供される。
例示的実施形態、特に多様性の言及される程度および種類を準用する。
本発明により、cTnTへの改善された結合特性(より良好なKD値)を有し、それにより以前のアッセイと比較して優れた感度を有してcTnTの検出を可能にする新規抗cTnT抗体が提供される。
用語「KD」は、平衡解離定数(平衡結合定数の逆数)を指し、当技術分野において示される定義に従って本明細書において使用される。KD値を決定するための手段および方法は、下に簡潔に示され、示される実施例において詳細に記載される。
抗体、例えば抗cTnT抗体の結合特性は、Biacore技術が同義になる表面プラズモン共鳴分光法などのリアルタイムバイオセンサーに基づく分子相互作用測定を介して最も良好に決定される。実験の詳細は、実施例5に示され、動態学的データは、表3に示される。例えば、表3における組合せ「12」として表示される抗体は、cTnTへの改善された結合特性、すなわち、1.18E+061/Msの結合定数(ka);3.7E-04の解離定数(kd)(約31分間の解離についての半減時間、それにより3.2E-10Mの全体的親和性定数(KD)に置き換えられる)を有する。
本発明において開示され、特許請求される変異抗体は、驚くべきことに抗体とcTnTとの複合体形成に悪影響を与えず、全ての変異抗体のKaは親抗体についてと同じ範囲内である。他方で、良好なKD値に置き換えられるcTnTとの間に形成された複合体の安定性に関する顕著な改善が達成され得る。
一実施形態では、本明細書において上に開示される本発明によるモノクローナル抗体は、37℃で10分間以上のt/2-dissを有してcTnTに結合する。
一般に、低いKD値は、当技術分野において周知のとおり、より高いまたは改善された親和性に対応する。一実施形態では、変異体抗cTnT抗体は、5.8E-10MのKDを有する親抗体のKDに等しいまたはより低い結合親和性を有する。
一般に、低いKD値は、当技術分野において周知のとおり、より高いまたは改善された親和性に対応する。一実施形態では、変異体抗cTnT抗体は、5.8E-10MのKDを有する親抗体のKDに等しいまたはより低い結合親和性を有する。
改変軽鎖および重鎖領域について上に述べられた配列は、添付の実施例において使用されたアミノ酸配列である。
本発明は、本明細書において上に定義される本発明の抗体のいずれか1つの軽鎖可変領域をコードする核酸分子にさらに関する。この核酸分子は、本明細書において本発明の第1の核酸分子と称される。さらに本発明は、本明細書において上に定義される本発明の抗体のいずれか1つの重鎖可変領域をコードする核酸分子にも関する。この核酸分子は、本明細書において本発明の第2の核酸分子と称される。
本発明は、本明細書において上に定義される本発明の抗体のいずれか1つの軽鎖可変領域をコードする核酸分子にさらに関する。この核酸分子は、本明細書において本発明の第1の核酸分子と称される。さらに本発明は、本明細書において上に定義される本発明の抗体のいずれか1つの重鎖可変領域をコードする核酸分子にも関する。この核酸分子は、本明細書において本発明の第2の核酸分子と称される。
本発明により、用語「核酸分子」は、本明細書において核酸配列またはポリヌクレオチドとも称され、cDNAまたはゲノムDNAなどのDNAを含む。
本発明の核酸分子は、例えば標準的化学合成方法および/もしくは組換え法によって合成され得る、または例えば化学合成と組換え法を組み合わせることによって半合成的に産生され得る。コード配列の転写制御エレメントへの、および/または他のアミノ酸コード配列へのライゲーションは、制限消化、ライゲーションおよび分子クローニングなどの確立された方法を使用して実行され得る。
本発明の核酸分子は、例えば標準的化学合成方法および/もしくは組換え法によって合成され得る、または例えば化学合成と組換え法を組み合わせることによって半合成的に産生され得る。コード配列の転写制御エレメントへの、および/または他のアミノ酸コード配列へのライゲーションは、制限消化、ライゲーションおよび分子クローニングなどの確立された方法を使用して実行され得る。
本発明により、本発明の第1の核酸分子は:
(i)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3を含む;
(ii)本明細書において上に定義される式Iのアミノ酸配列からなる;または
(iii)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
軽鎖可変領域をコードする。
(i)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3を含む;
(ii)本明細書において上に定義される式Iのアミノ酸配列からなる;または
(iii)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
軽鎖可変領域をコードする。
同様に、本発明の第2の核酸分子は、
(i)配列番号6のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(ii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号8のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号11のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(iii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号8のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号13のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(iv)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号13のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(v)配列番号6のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号10のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(vi)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号11のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(vii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(viii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号10のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;(ix)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号8のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(x)配列番号5のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(xi)本明細書において上に定義される式IIのアミノ酸配列からなる;
(xii)配列番号23のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;
(xiii)配列番号24のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;または
(xiv)配列番号25のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
(xv)配列番号26のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;
(xvi)配列番号27のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;または
(xvii)配列番号28のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
(xviii)配列番号29のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;
(xix)配列番号30のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;または
(xx)配列番号31のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
(xxi)配列番号32のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
重鎖可変領域をコードする。
(i)配列番号6のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(ii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号8のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号11のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(iii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号8のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号13のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(iv)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号13のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(v)配列番号6のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号10のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(vi)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号11のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(vii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(viii)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号10のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;(ix)配列番号7のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号8のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(x)配列番号5のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR1、配列番号9のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR2、および配列番号12のアミノ酸配列もしくは最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むCDR3を含む;
(xi)本明細書において上に定義される式IIのアミノ酸配列からなる;
(xii)配列番号23のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;
(xiii)配列番号24のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;または
(xiv)配列番号25のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
(xv)配列番号26のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;
(xvi)配列番号27のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;または
(xvii)配列番号28のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
(xviii)配列番号29のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;
(xix)配列番号30のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる;または
(xx)配列番号31のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
(xxi)配列番号32のアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる
重鎖可変領域をコードする。
本発明は、本発明の第1の核酸分子、すなわち本明細書において上に定義される本発明の抗体のいずれか1つの軽鎖可変領域をコードする核酸分子を含むベクターにさらに関する。本発明は、本発明の第2の核酸分子、すなわち本明細書において上に定義される本発明の抗体のいずれか1つの重鎖可変領域をコードする核酸分子を含むベクターにさらに関する。かかるベクターは、本明細書において「本発明の個別のベクター(複数可)」とも称される。
多数の好適なベクターが分子生物学の当業者に公知であり、その選択は所望の機能に依存する。ベクターの非限定的例として、プラスミド、コスミド、ウイルス、バクテリオファージおよび例えば遺伝子工学において慣用されている他のベクターが挙げられる。当業者に周知である方法は、種々のプラスミドおよびベクターを構築するために使用できる;例えば、Sambrookら、(同上)およびAusubel、Current Protocols in Molecular Biology、Green Publishing Associates and Wiley Interscience、N.Y.(1989)、(1994)に記載される技術を参照されたい。
一実施形態では、ベクターは発現ベクターである。本発明による発現ベクターは、宿主において本発明の核酸分子の複製および発現を方向付けることができ、それにより、選択された宿主においてそれによりコードされた本発明の抗トロポニンT抗体の可変鎖ドメインの発現をもたらす。さらなる実施形態では、ベクター(複数可)は、本発明の前記可変鎖ドメインだけでなく、本発明の前記可変鎖ドメインを含む全長IgG抗体も発現されることを確実にするためのさらなる配列を含む。
発現ベクターは、例えば、クローニングベクター、バイナリーベクターまたはインテグレーティングベクターであり得る。発現は、核酸分子の、例えば翻訳可能なmRNAへの転写を含む。一実施形態では、ベクターは、モノクローナルウサギ抗体の重鎖および/または軽鎖の一過的組換え発現のための真核生物発現プラスミドである。かかるベクターは、抗体発現のためだけでなく、例えば真核細胞、例えばHEK293もしくはその誘導体またはCHO細胞の一過性トランスフェクションによる抗体産物のために特に開発された。
ベクターの非限定的例として、pQE-12、pUCシリーズ、pBluescript(Stratagene)、発現ベクターのpETシリーズ(Novagen)もしくはpCRTOPO(Invitrogen)、lambda gt11、pJOE、pB
BR1-MCSシリーズ、pJB861、pBSMuL、pBC2、pUCPKS、pTACT1、pTRE、pCAL-n-EK、pESP-1、pOP13CAT、E-027 pCAG Kosak-Cherry(L45a)ベクターシステム、pREP(Invitrogen)、pCEP4(Invitrogen)、pMC1neo(Stratagene)、pXT1(Stratagene)、pSG5(Stratagene)、EBO-pSV2neo、pBPV-1、pdBPVMMTneo、pRSVgpt、pRSVneo、pSV2-dhfr、pIZD35、Okayama-Berg cDNA発現ベクターpcDV1(Pharmacia)、pRc/CMV、pcDNA1、pcDNA3(Invitrogen)、pcDNA3.1、pSPORT1(GIBCO BRL)、pGEMHE(Promega)、pLXIN、pSIR(Clontech)、pIRES-EGFP(Clontech)、pEAK-10(Edge Biosystems)pTriEx-Hygro(Novagen)およびpCINeo(Promega)が挙げられる。Pichia pastorisに対する好適なプラスミドベクターの非限定的例は、例えばプラスミドpAO815、pPIC9KおよびpPIC3.5K(すべてInvitrogen)を含む。Xenopus胚、ゼブラフィッシュ胚ならびに多種多様な哺乳動物および鳥類細胞においてタンパク質を発現するために好適な別のベクターは、多目的発現ベクターpCS2+である。
BR1-MCSシリーズ、pJB861、pBSMuL、pBC2、pUCPKS、pTACT1、pTRE、pCAL-n-EK、pESP-1、pOP13CAT、E-027 pCAG Kosak-Cherry(L45a)ベクターシステム、pREP(Invitrogen)、pCEP4(Invitrogen)、pMC1neo(Stratagene)、pXT1(Stratagene)、pSG5(Stratagene)、EBO-pSV2neo、pBPV-1、pdBPVMMTneo、pRSVgpt、pRSVneo、pSV2-dhfr、pIZD35、Okayama-Berg cDNA発現ベクターpcDV1(Pharmacia)、pRc/CMV、pcDNA1、pcDNA3(Invitrogen)、pcDNA3.1、pSPORT1(GIBCO BRL)、pGEMHE(Promega)、pLXIN、pSIR(Clontech)、pIRES-EGFP(Clontech)、pEAK-10(Edge Biosystems)pTriEx-Hygro(Novagen)およびpCINeo(Promega)が挙げられる。Pichia pastorisに対する好適なプラスミドベクターの非限定的例は、例えばプラスミドpAO815、pPIC9KおよびpPIC3.5K(すべてInvitrogen)を含む。Xenopus胚、ゼブラフィッシュ胚ならびに多種多様な哺乳動物および鳥類細胞においてタンパク質を発現するために好適な別のベクターは、多目的発現ベクターpCS2+である。
一般に、ベクターは、1つまたは複数の複製開始点(ori)およびクローニングまたは発現のための遺伝系、宿主における選択のための1つまたは複数のマーカー、例えば、抗菌薬耐性ならびに1つまたは複数の発現カセットを含有することができる。加えて、ベクターに含まれるコード配列は、転写制御エレメントおよび/または他のアミノ酸コード配列に、確立された方法を使用してライゲートされてよい。かかる制御配列は、当業者に周知であり、限定されることなく、転写の開始を確実にする制御配列、内部リボソーム侵入部位(IRES)(Owens,G.C.ら、[2001]Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.98:1471~1476)ならびに任意選択で転写の終了および転写物の安定化を確実にする制御エレメントを含む。転写の開始を確実にするかかる制御エレメントの非限定的例は、プロモーター、翻訳開始コドン、エンハンサー、インスレーターおよび/または転写終結を確実にする制御エレメントを含み、これらは本発明の核酸分子の下流に含まれるものである。さらなる例として、Kozak配列ならびにRNAスプライシングのためのドナーおよびアクセプター部位が隣接する介在配列、分泌シグナルをコードするヌクレオチド配列または、使用される発現系に応じて、細胞性コンパートメントへまたは培養培地へ発現されたタンパク質を方向付けることができるシグナル配列が挙げられる。ベクターは、正しいタンパク質フォールディングを促進するための1つまたは複数のシャペロンをコードする追加的な発現可能なポリヌクレオチドも含有する場合がある。
好適な複製開始点の追加的例として、例えば全長ColE1、切断型ColEI、SV40ウイルス性およびM13複製開始点が挙げられる一方で、好適なプロモーターの追加的例として、限定されることなく、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、SV40プロモーター、RSVプロモーター(ラウス肉腫(Rous sarcome)ウイルス)、lacZプロモーター、テトラサイクリンプロモーター/オペレーター(tetp/o)、ニワトリβ-アクチンプロモーター、CAG-プロモーター(ニワトリβ-アクチンプロモーターとサイトメガロウイルス最初期エンハンサーとの組合せ)、gai10プロモーター、ヒト伸長因子1α-プロモーター、AOX1プロモーター、GAL1プロモーターCaM-キナーゼプロモーター、lac、trpもしくはtacプロモーター、T7もしくはT5プロモーター、lacUV5プロモーター、Autographa californica多核多角体ウイルス(multiple nuclear polyhedrosis virus)(AcMNP
V)多角体プロモーターまたは哺乳動物および他の動物細胞におけるグロビンイントロンが挙げられる。エンハンサーの一例は、例えばSV40エンハンサーである。転写終結を
確実にする制御エレメントについての非限定的な追加的例として、SV40-ポリA部位、tk-ポリA部位、rho-非依存性lppターミネーターまたはAcMNPV多角体ポリアデニル化シグナルが挙げられる。選択可能マーカーのさらなる非限定的例として、メトトレキサートへの耐性を付与するdhfr(Reiss、Plant Physiol.(Life Sci.Adv.)13(1994)、143~149)、アミノグリコシド ネオマイシン、カナマイシンおよびパロマイシン(paromycin)に対する耐性を
付与するnpt (Herrera-Estrella、EMBO J.2(1983)、987~995)ならびに、ハイグロマイシンへの耐性を付与するhygro(Marsh、Gene 32(1984)、481~485)が挙げられる。追加的な選択可能遺伝子は、記載されており、すなわちtrpB、細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用できるようにする;hisD、細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノール(histinol)を利用できるようにする(Hartman、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85(1988)、8047);マンノース-6-リン酸イソメラーゼ、細胞がマンノースを利用できるようにする(WO94/20627)、およびODC(オルニチンデカルボキシラーゼ)、オルニチンデカルボキシラーゼ阻害剤、2-(ジフルオロメチル)-DL-オルニチン、DFMOに対する耐性を付与する(McConlogue、1987、In:Current Communications in Molecular Biology、Cold Spring Harbor Laboratory ed.)またはAspergillus terreus由来のデアミナーゼ、ブラストサイジンSに対する耐性を付与する(Tamura、Biosci.Biotechnol.Biochem.59(1995)、2336~2338)。
V)多角体プロモーターまたは哺乳動物および他の動物細胞におけるグロビンイントロンが挙げられる。エンハンサーの一例は、例えばSV40エンハンサーである。転写終結を
確実にする制御エレメントについての非限定的な追加的例として、SV40-ポリA部位、tk-ポリA部位、rho-非依存性lppターミネーターまたはAcMNPV多角体ポリアデニル化シグナルが挙げられる。選択可能マーカーのさらなる非限定的例として、メトトレキサートへの耐性を付与するdhfr(Reiss、Plant Physiol.(Life Sci.Adv.)13(1994)、143~149)、アミノグリコシド ネオマイシン、カナマイシンおよびパロマイシン(paromycin)に対する耐性を
付与するnpt (Herrera-Estrella、EMBO J.2(1983)、987~995)ならびに、ハイグロマイシンへの耐性を付与するhygro(Marsh、Gene 32(1984)、481~485)が挙げられる。追加的な選択可能遺伝子は、記載されており、すなわちtrpB、細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用できるようにする;hisD、細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノール(histinol)を利用できるようにする(Hartman、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85(1988)、8047);マンノース-6-リン酸イソメラーゼ、細胞がマンノースを利用できるようにする(WO94/20627)、およびODC(オルニチンデカルボキシラーゼ)、オルニチンデカルボキシラーゼ阻害剤、2-(ジフルオロメチル)-DL-オルニチン、DFMOに対する耐性を付与する(McConlogue、1987、In:Current Communications in Molecular Biology、Cold Spring Harbor Laboratory ed.)またはAspergillus terreus由来のデアミナーゼ、ブラストサイジンSに対する耐性を付与する(Tamura、Biosci.Biotechnol.Biochem.59(1995)、2336~2338)。
さらなる実施形態では、ベクターは、イントロンAを含む5‘CMVプロモーターおよび3‘BGHポリアデニル化配列からなる発現カセットを含有する真核生物発現プラスミドである。発現カセットに加えて、プラスミドは、pUC18由来複製開始点および、E.coliにプラスミド増幅のためのアンピリシン耐性を付与するベータラクタマーゼ遺伝子を含有できる。抗体の分泌のために、真核生物リーダー配列は、抗体遺伝子の5’にクローニングされてよい。
好適な細菌性発現宿主は、例えばJM83、W3110、KS272、TG1、K12、BL21(BL21(DE3)、BL21(DE3)PlysS、BL21(DE3)RIL、BL21(DE3)PRAREなど)またはRosetta由来の株を含む。ベクター改変、PCR増幅およびライゲーション技術について、Sambrook & Russel[2001](Cold Spring Harbor Laboratory、NY)を参照されたい。
本発明の核酸分子および/またはベクターは、例えば化学に基づく方法(ポリエチレンイミン、リン酸カルシウム、リポソーム、DEAEデキストラン、ヌクレオフェクション)、非化学的方法(電気穿孔法、ソノポレーション、光学トランスフェクション(optical transfection)、遺伝子電気泳動転写、水力学的送達(hydrodynamic delivery)また
は細胞を本発明の核酸分子に接触させることで自然に生じる形質転換)、粒子に基づく方法(遺伝子銃、マグネトフェクション、インペールフェクション(impalefection))フ
ァージベクターに基づく方法およびウイルスでの方法による細胞への導入のために設計されてよい。例えば、レトロウイルス、ワクチニアウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、セムリキ森林ウイルスまたはウシパピローマウイルスなどのウイルス由来の発現ベクターは、標的細胞集団への核酸分子の送達のために使用され得る。加えて、バキュロウイルス系も本発明の核酸分子のための真核生物発現系においてベクターとして使用され得る。一実施形態では、本発明の核酸分子および/またはベクターは、リン酸カルシウムによる化学的にコンピテントなE.coliの形質転換のためおよび/またはポリエチレンイミンもしくはリポフェクタミントランスフェクションによるHEK293および
CHOの一過性トランスフェクションのために設計される。
は細胞を本発明の核酸分子に接触させることで自然に生じる形質転換)、粒子に基づく方法(遺伝子銃、マグネトフェクション、インペールフェクション(impalefection))フ
ァージベクターに基づく方法およびウイルスでの方法による細胞への導入のために設計されてよい。例えば、レトロウイルス、ワクチニアウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、セムリキ森林ウイルスまたはウシパピローマウイルスなどのウイルス由来の発現ベクターは、標的細胞集団への核酸分子の送達のために使用され得る。加えて、バキュロウイルス系も本発明の核酸分子のための真核生物発現系においてベクターとして使用され得る。一実施形態では、本発明の核酸分子および/またはベクターは、リン酸カルシウムによる化学的にコンピテントなE.coliの形質転換のためおよび/またはポリエチレンイミンもしくはリポフェクタミントランスフェクションによるHEK293および
CHOの一過性トランスフェクションのために設計される。
本発明は:
(i)本明細書において上に定義される選択肢(i)による軽鎖可変ドメインおよび本明細書において上に定義される選択肢(i)による重鎖可変ドメインをコードする核酸分子;
(ii)本明細書において上に定義される選択肢(ii)による軽鎖可変ドメインおよび本明細書において上に定義される選択肢(ii)による重鎖可変ドメインをコードする核酸分子;または
(iii)本明細書において上に定義される選択肢(iii)による軽鎖可変ドメインおよび本明細書において上に定義される選択肢(iii)による重鎖可変ドメインをコードする核酸分子
を含むベクターにさらに関する。
(i)本明細書において上に定義される選択肢(i)による軽鎖可変ドメインおよび本明細書において上に定義される選択肢(i)による重鎖可変ドメインをコードする核酸分子;
(ii)本明細書において上に定義される選択肢(ii)による軽鎖可変ドメインおよび本明細書において上に定義される選択肢(ii)による重鎖可変ドメインをコードする核酸分子;または
(iii)本明細書において上に定義される選択肢(iii)による軽鎖可変ドメインおよび本明細書において上に定義される選択肢(iii)による重鎖可変ドメインをコードする核酸分子
を含むベクターにさらに関する。
一実施形態では、ベクターは発現ベクターである。
本発明のベクター、具体的にはベクターの種類または制御配列に関して、本明細書において上で提供されるすべての定義および具体的に例示される実施形態を準用する。この第2の種類のベクターは、少なくとも2つの核酸分子、すなわち1つは軽鎖可変ドメインをコードし1つは重鎖可変ドメインをコードする2つの核酸分子を含むベクターに関する。上の組合せから明らかであるとおり、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとは、本発明の機能性抗cTnT抗体の発現が可能であるようにベクターにおいて組み合わされる。この第2の種類のベクターは、本明細書において「本発明の組合せベクター」とも称される。
本発明のベクター、具体的にはベクターの種類または制御配列に関して、本明細書において上で提供されるすべての定義および具体的に例示される実施形態を準用する。この第2の種類のベクターは、少なくとも2つの核酸分子、すなわち1つは軽鎖可変ドメインをコードし1つは重鎖可変ドメインをコードする2つの核酸分子を含むベクターに関する。上の組合せから明らかであるとおり、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとは、本発明の機能性抗cTnT抗体の発現が可能であるようにベクターにおいて組み合わされる。この第2の種類のベクターは、本明細書において「本発明の組合せベクター」とも称される。
本発明は:
(i)本発明の組合せベクター;または
(ii)本発明の第1の核酸分子、すなわち本発明による軽鎖可変領域をコードする核酸分子を含む本発明の個別のベクターおよび本発明の第2の核酸分子、すなわち本発明の重鎖可変領域をコードする核酸分子を含む本発明の個別のベクターであって、これら2つのベクターが上の選択肢(i)から(iii)に定義される合致する軽鎖および重鎖可変領域をコードする核酸分子を含むベクター
を含む宿主細胞または非ヒト宿主にさらに関する。
(i)本発明の組合せベクター;または
(ii)本発明の第1の核酸分子、すなわち本発明による軽鎖可変領域をコードする核酸分子を含む本発明の個別のベクターおよび本発明の第2の核酸分子、すなわち本発明の重鎖可変領域をコードする核酸分子を含む本発明の個別のベクターであって、これら2つのベクターが上の選択肢(i)から(iii)に定義される合致する軽鎖および重鎖可変領域をコードする核酸分子を含むベクター
を含む宿主細胞または非ヒト宿主にさらに関する。
宿主細胞は、任意の原核または真核細胞であってよい。用語「原核生物」は、本発明のタンパク質の発現のためにDNAまたはDNAもしくはRNA分子を用いて形質転換、形質導入またはトランスフェクトされ得るすべての細菌を含むことが意図される。原核生物宿主は、例えばE.coli、S.typhimurium、Serratia marcescens、Corynebacterium(glutamicum)、Pseudomonas(fluorescens)、Lactobacillus、Streptomyces、SalmonellaおよびBacillus subtilisなどのグラム陰性およびグラム陽性細菌を含み得る。
用語「真核生物」は、酵母、高等植物、昆虫および哺乳動物細胞を含むことが意図される。典型的な哺乳動物宿主細胞として、Hela、HEK293、H9、Per.C6およびJurkat細胞、マウスNIH3T3、NS/0、SP2/0およびC127細胞、COS細胞、例えばCOS1またはCOS7、CV1、ウズラQC1-3細胞、マウスL細胞、マウス肉腫細胞、Bowesメラノーマ細胞ならびにチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞が挙げられる。本発明による例示的な哺乳動物宿主細胞は、CHO細胞である。他の好適な真核生物宿主細胞として、限定されることなく、例えばDT40細胞などのニワトリ細胞、またはSaccharomyces cerevisiae、Pi
chia pastoris、Schizosaccharomyces pombeおよびKluyveromyces lactisなどの酵母が挙げられる。発現のために好適な昆虫細胞は、例えばDrosophila S2、Drosophila Kc、Spodoptera Sf9およびSf21またはTrichoplusia Hi5細胞である。好適なゼブラフィッシュ細胞株として、限定されることなく、ZFL、SJDまたはZF4が挙げられる。
chia pastoris、Schizosaccharomyces pombeおよびKluyveromyces lactisなどの酵母が挙げられる。発現のために好適な昆虫細胞は、例えばDrosophila S2、Drosophila Kc、Spodoptera Sf9およびSf21またはTrichoplusia Hi5細胞である。好適なゼブラフィッシュ細胞株として、限定されることなく、ZFL、SJDまたはZF4が挙げられる。
記載されるベクター(複数可)は、宿主のゲノムにインテグレートされ得るか、または染色体外に維持され得るか、のいずれかである。ベクターが適切な宿主に組み込まれると、宿主は核酸分子の高レベル発現のために好適な条件下に維持され、所望により、本発明の抗体の回収および精製が続き得る。上に記載の宿主細胞のために適切な培養培地および条件は、当技術分野において公知である。
一実施形態では、述べられる宿主は、ヒト細胞またはヒト細胞株などの哺乳動物細胞である。さらなる実施形態では、本発明のベクター(複数可)を用いて形質転換される宿主細胞は、HEK293またはCHOである。またさらなる実施形態では、本発明のベクター(複数可)を用いて形質転換される宿主細胞は、CHOである。これらの宿主細胞ならびに好適な培地および細胞培養条件は、当技術分野において記載されている、例えばBaldi L.ら、Biotechnol Prog.2005 Jan-Feb;21(1):148~53、Girard P.ら、Cytotechnology 2002
Jan;38(1-3):15~21およびStettler M.ら、Biotechnol.Prog.2007 Nov-Dec;23(6):1340~6を参照されたい。
Jan;38(1-3):15~21およびStettler M.ら、Biotechnol.Prog.2007 Nov-Dec;23(6):1340~6を参照されたい。
本発明による用語「を含むベクター」に関して、本発明の抗cTnT抗体を産生するために宿主細胞に必要および/または十分であるさらなる核酸配列が、ベクター中に存在することは理解される。かかるさらなる核酸配列は、例えば、軽鎖の残部をコードする核酸配列および重鎖の残部をコードする核酸配列である。
本発明による宿主細胞または非ヒト宿主は、本明細書において上に定義される軽鎖および重鎖可変領域の両方をコードする1つのベクターを含むか、または一方のベクターが本発明による軽鎖可変領域をコードする核酸分子を保有し、第2のベクターが本発明による合致する重鎖可変領域をコードする核酸分子を保有する2つの別々のベクターを含む。したがって、第1のベクターが本明細書において上の選択肢(i)による軽鎖可変領域をコードする核酸分子を保有する場合、それにより第2のベクターは同様に上の選択肢(i)による重鎖可変領域をコードする核酸分子を保有する。同じことを選択肢(ii)および(iii)に準用する。
したがって、各場合において、本明細書において上に記載される結合能力からなる本発明の抗cTnT抗体の産生を確実にするために、1つの抗体分子内に存在することが必要であるこれらの核酸分子の発現は、互いに関連付けられている。
本実施形態による宿主細胞は、例えば、多量の本発明の抗cTnT抗体を産生するために使用され得る。前記宿主細胞は、上に記載のベクター(複数可)を宿主に導入することによって産生される。宿主中の前記ベクター(複数可)の存在は、次に本発明の抗cTnT抗体の上に記載の軽鎖可変ドメインおよび重鎖可変ドメインをコードする核酸分子の発現を媒介する。本明細書において上に記載のとおり、本発明のベクター(複数可)は、全長IgG抗体の発現を可能にする配列をさらに含むことができ、それにより宿主細胞による全長IgG抗体の産生をもたらし、ここで前記抗体は、本発明による可変軽鎖および/または重鎖ドメインの存在によって特徴付けられる。
本発明は、配列番号1のcTnTに特異的に結合する抗体の産生のための方法にさらに関し、方法は本発明の宿主細胞を好適な条件下で培養するステップおよび産生された抗体を単離するステップを含む。
本実施形態により、本発明の宿主中に存在するベクター(複数可)は、発現ベクター(複数可)、または宿主細胞のゲノムへの本発明の核酸分子(複数可)の、その発現が確実である様式での安定なインテグレーションを媒介するベクター(複数可)のいずれかである。本発明の抗cTnT抗体の軽鎖および重鎖ドメインそれぞれをコードする核酸分子が、抗体の発現が確実であるように良好に導入されている宿主細胞の選択のための手段および方法は、当技術分野において周知であり、記載されている(Browne,S.M.&
Al-Rubeai,M.[2007]Trends Biotechnol.25:425~432;Matasci,Mら、[2008]Drug Discov.Today:Technol.5:e37-e42;Wurm,F.M.[2004]Nat.Biotechnol.22:1393~1398)。
Al-Rubeai,M.[2007]Trends Biotechnol.25:425~432;Matasci,Mら、[2008]Drug Discov.Today:Technol.5:e37-e42;Wurm,F.M.[2004]Nat.Biotechnol.22:1393~1398)。
原核または真核生物宿主細胞を培養するための好適な条件は、当業者に周知である。例えば細菌、例えばE.coliなどの細菌は、Luria Bertani(LB)培地中、通気下、典型的には4から約37℃の温度で培養され得る。発現産物の収量および溶解度を増加させるために、培地は、緩衝されてよく、または両者を増強もしくは促進することが公知である好適な添加物を補充されてよい。誘導性プロモーターが宿主細胞に存在するベクター(複数可)中の本発明の核酸分子を調節する場合、ポリペプチドの発現は、例えばアンヒドロテトラサイクリンなどの適切な誘導剤の添加によって誘導され得る。好適な発現プロトコールおよび戦略は、当技術分野において記載されており(例えば、Dyson,M.R.ら、(2004).BMC Biotechnol.4、32~49においておよびBaldi,L.ら、(2007).Biotechnol.Lett.29、677~684において)、必要に応じて、特定の宿主細胞が必要とすることおよび発現されるタンパク質の必要要件に適合され得る。
細胞型およびその具体的な必要要件に依存して、哺乳動物細胞培養は、例えば10%(v/v)FCS、2mM L-グルタミンおよび100U/mlペニシリン/ストレプトマイシンを含有するRPMI、Williams’EまたはDMEM培地において実行されてよい。細胞は、DT40ニワトリ細胞では例えば37℃または41℃、5%CO2、水飽和雰囲気中に保たれてよい。
昆虫細胞培養のために好適な培地は、例えばTNM+10%FCS、SF900またはHyClone SFX-Insect培地である。昆虫細胞は、通常付着培養または懸濁培養として27℃で増殖させる。
真核細胞または脊椎動物細胞のための好適な発現プロトコールは、当業者に周知であり、例えばSambrook,J & Russel,D.W.[2001](Cold Spring Harbor Laboratory、NY)から検索され得る。
一実施形態では、方法は、例えばCHOまたはHEK293細胞などの哺乳動物細胞を使用して実行される。さらなる実施形態では、方法は、CHO細胞を使用して実行される。
組換え産生手順において使用される宿主に依存して、発現される抗体は、グリコシル化されている場合とされていない場合がある。一実施形態では、プラスミドまたはウイルスは、本発明の抗体のコード配列ならびにそれに遺伝子的に融合されたN末端FLAGタグ
および/またはC末端Hisタグを含有して使用される。さらなる実施形態では、前記FLAG-タグの長さは、例えば正確に8アミノ酸などの約4から8アミノ酸である。上に記載されるベクターは、当業者に一般に公知の任意の技術を使用して宿主を形質転換またはトランスフェクトするために使用され得る。さらに、融合し、作動可能に連結した遺伝子を調製するため、ならびにそれらを例えば哺乳動物細胞および細菌において発現するための方法は、当技術分野において周知である(Sambrook、同上)。
および/またはC末端Hisタグを含有して使用される。さらなる実施形態では、前記FLAG-タグの長さは、例えば正確に8アミノ酸などの約4から8アミノ酸である。上に記載されるベクターは、当業者に一般に公知の任意の技術を使用して宿主を形質転換またはトランスフェクトするために使用され得る。さらに、融合し、作動可能に連結した遺伝子を調製するため、ならびにそれらを例えば哺乳動物細胞および細菌において発現するための方法は、当技術分野において周知である(Sambrook、同上)。
形質転換された宿主は、バイオリアクターにおいて増殖させることができ、当技術分野において公知の技術によって最適な細胞増殖を達成するように培養され得る。次に本発明の抗体は、増殖培地から単離され得る。例えば、本発明の微生物によって発現された抗体の単離および精製は、例えば、親和性クロマトグラフィー(例えば、StrepタグIIもしくはHis6タグなどの融合タグを使用する)、ゲルろ過(サイズ排除クロマトグラフィー)、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)、逆相HPLCまたは免疫沈降などの任意の従来の手段によってでよい。これらの方法は、当技術分野において周知であり、例えばSambrook,J & Russel,D.W.[2001](Cold Spring Harbor Laboratory、NY)に一般に記載されている。
本発明により、用語「産生された抗体を単離すること」が本発明の抗cTnT抗体の単離を指すことは理解される。
本発明は、
(i)本発明の抗体、
(ii)本発明の核酸分子、
(iii)本発明のベクター、
(iv)本発明の宿主細胞、および/または
(v)本発明の方法によって産生された抗体
のうちの少なくとも1つを含む組成物にさらに関する。
本発明は、
(i)本発明の抗体、
(ii)本発明の核酸分子、
(iii)本発明のベクター、
(iv)本発明の宿主細胞、および/または
(v)本発明の方法によって産生された抗体
のうちの少なくとも1つを含む組成物にさらに関する。
本発明により使用される場合、用語「組成物」は、述べられた化合物のうちの少なくとも1つを含む組成物に関する。それは、任意選択で、本発明の化合物の特徴を変更でき、それによりそれらの機能を、例えば、安定化、モジュレートおよび/または増強するさらなる分子を含み得る。組成物は、固体または液体形態であってよく、とりわけ粉末(複数可)、錠剤(複数可)または溶液(複数可)の形態であってよい。
組成物の構成成分は、1つまたは複数の容器、例えば、密封されたアンプルもしくはバイアルに、水溶液としてまたは再構成のための凍結乾燥製剤として包装されてよい。凍結乾燥製剤の例として、10mlバイアルは5mlの1%(w/v)または10%(w/v)水溶液を用いて充填され、得られた混合物は凍結乾燥される。使用のための溶液は、例えば、治療使用のための注射用水または別の望ましい溶媒、例えば、診断目的のための緩衝液、のいずれかを使用して凍結乾燥化合物(複数可)を再構成することによって調製される。保存剤および、例えば、抗菌剤、抗酸化剤、キレート剤および不活性ガスなどの他の添加剤も存在してよい。
組成物の種々の構成成分は、使用のための説明書を含むキットとして包装されてよい。
一実施形態では、本発明の組成物は、当技術分野において周知のin vitroまたはex vivo法、例えばイムノアッセイなどの方法を当業者が実行できるようにする組成物である。
一実施形態では、本発明の組成物は、当技術分野において周知のin vitroまたはex vivo法、例えばイムノアッセイなどの方法を当業者が実行できるようにする組成物である。
本発明の抗体を利用できるイムノアッセイの例は、直接または間接フォーマットいずれ
かでのイムノアッセイである。かかるイムノアッセイの例は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、酵素イムノアッセイ(EIA)、放射免疫アッセイ(RIA)または発光、蛍光、化学発光または電気化学発光の検出に基づくイムノアッセイである。
かでのイムノアッセイである。かかるイムノアッセイの例は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、酵素イムノアッセイ(EIA)、放射免疫アッセイ(RIA)または発光、蛍光、化学発光または電気化学発光の検出に基づくイムノアッセイである。
心筋トロポニンT(cTnT)は、例えば、US6,333,397およびUS6,376,206においてそれぞれ開示されるサンドイッチイムノアッセイによって最も良好に検出され、cTnTの測定のためのアッセイの本質的にすべての続く世代において確認される。第5世代cTnT-アッセイ、Roche Diagnostics、Germanyによって販売されているcTnT(hs-cTnT)のための高感度アッセイでは、いまだサンドイッチイムノアッセイ原理が使用されている。このアッセイは、5ng/mlの検出下限値(LOD)を有してcTnTを検出できることから、高感度アッセイである。この良好なLODは、使用されるアッセイプロトコールに応じてそれぞれ9または18分間の全体として非常に短いインキュベーション時間にもかかわらず達成される。このアッセイでは、サンドイッチは、ビオチン化捕捉抗体およびルテニル化(ruthenylated)検出抗体を含んで形成される。この複合体は、ストレプトアビジンコート磁気ビーズに結合し、未結合材料は洗浄除去される。当業者に明らかであるとおり、Kdが顕著でない場合、いくらかの解離が生じ、LODの低減に直接転換されるシグナルの低減をもたらすことから、非常に重要である。
当業者に明らかであるとおり、cTnTの検出のための方法において本発明による抗体を使用することは有利である。
一実施形態では、本開示は:a)試料を本開示による抗cTnT抗体と、抗cTnT抗体/cTnT複合体の形成のために十分な時間および条件下で接触させるステップ;ならびにb)抗cTnT抗体/cTnT複合体を測定するステップであって、その複合体の量が試料中のcTnTの濃度を示す、ステップを含む、試料中のcTnTを検出する方法に関する。例えば「抗cTnT抗体/cTnT複合体」における用語「/」は、非共有結合性複合体が、一方の抗cTnT抗体と他方のcTnTとの間に形成されていることを示すために使用される。
一実施形態では、本開示は:a)試料を本開示による抗cTnT抗体と、抗cTnT抗体/cTnT複合体の形成のために十分な時間および条件下で接触させるステップ;ならびにb)抗cTnT抗体/cTnT複合体を測定するステップであって、その複合体の量が試料中のcTnTの濃度を示す、ステップを含む、試料中のcTnTを検出する方法に関する。例えば「抗cTnT抗体/cTnT複合体」における用語「/」は、非共有結合性複合体が、一方の抗cTnT抗体と他方のcTnTとの間に形成されていることを示すために使用される。
一実施形態では本発明は:a)試料をcTnTに対する第1の抗体およびcTnTに対する第2の抗体と、第1の抗cTnT抗体/cTnT/第2の抗cTnT抗体複合体の形成のために十分な時間および条件下で接触させるステップであって、第2の抗体が検出可能に標識化されている、ステップ;ならびにb)(a)において形成された複合体を測定するステップであって、複合体の量が試料中のcTnTの濃度を示し、第1のまたは第2の抗体が本発明による抗体である、ステップを含む、試料中のcTnTを検出する方法に関する。
当業者に明らかであるとおり、試料は、第1のおよび第2の抗体と任意の望ましい順序で、すなわち最初に第1の抗体、第2の抗体;第1の抗体より先に第2の抗体または同時に、第1の抗cTnT抗体/cTnT/第2の抗cTnT抗体複合体を形成するために十分な時間および条件下で接触されてよい。
当業者が容易に理解するとおり、特異的抗cTnT抗体とcTnT抗原/分析物とのいずれかの間の複合体(=抗cTnT抗体/cTnT複合体)の形成、またはcTnTに対する第1の抗体、cTnT(分析物)および第2の抗cTnT抗体複合体を含む二次のもしくはサンドイッチ複合体(=第1の抗cTnT抗体/cTnT/第2の抗cTnT抗体複合体)の形成のために、適切であるまたは十分である時間および条件を確立することは、日常的な実験に過ぎない。
抗cTnT抗体/cTnT複合体の検出は、任意の適切な手段によって実施され得る。
当業者は、かかる手段/方法を完全に熟知している。
用語「試料」または「目的の試料」または「検査試料」は、本明細書において互換的に用いられる。試料は、in vitro試料であり、in vitroで分析され、身体に戻されない。試料の例として、これだけに限らないが血液、血清、血漿、滑膜液、尿、唾液およびリンパ液などの液体試料または、組織抽出物、軟骨、骨、滑膜および結合組織などの固形試料が挙げられる。一実施形態では試料は、血液、血清、血漿、滑膜液および尿から選択される。一実施形態では試料は、血液、血清および血漿から選択される。一実施形態では試料は、血清または血漿である。
当業者は、かかる手段/方法を完全に熟知している。
用語「試料」または「目的の試料」または「検査試料」は、本明細書において互換的に用いられる。試料は、in vitro試料であり、in vitroで分析され、身体に戻されない。試料の例として、これだけに限らないが血液、血清、血漿、滑膜液、尿、唾液およびリンパ液などの液体試料または、組織抽出物、軟骨、骨、滑膜および結合組織などの固形試料が挙げられる。一実施形態では試料は、血液、血清、血漿、滑膜液および尿から選択される。一実施形態では試料は、血液、血清および血漿から選択される。一実施形態では試料は、血清または血漿である。
本明細書において使用される場合、用語「参照試料」は、目的の試料と実質的に同一の様式で分析され、その情報が目的の試料のものと比較される試料を指す。それにより参照試料は、目的の試料から得られた情報の評価を可能にする基準を提供する。参照試料は、健康なまたは正常な組織、器官または個体由来であってよく、それにより、組織、器官または個体の健康な状況の基準を提供する。正常な参照試料の状況と目的の試料の状況との間の差異は、疾患発症のリスクまたはかかる疾患もしくは障害の存在もしくはさらなる進行を示し得る。参照試料は、異常なまたは病的な組織、器官または個体由来であってよく、それにより組織、器官または個体の病的な状況の基準を提供する。異常な参照試料の状況と目的の試料の状況との間の差異は、疾患発症のリスクが低いことまたはかかる疾患または障害が存在しないこと、もしくはそれらが改善していることを示し得る。
用語、指標の「上昇した」または「増加した」レベルは、試料中のかかる指標のレベルが参照または参照試料におけるかかる指標のレベルと比較して高いことを指す。例えば、所与の疾患を罹患していない個体の同じ液体試料より高い量で、前記疾患を罹患している1個の個体の液体試料において検出可能であるタンパク質は、上昇したレベルを有する。
ある特定の実施形態では、サンドイッチは、cTnTに対する第1の抗体、cTnT(分析物)およびcTnTに対する第2の抗体を含んで形成され、ここで第2の抗体は検出可能に標識化されている。
多数の標識(色素とも称される)は、利用可能であり、一般に以下のカテゴリーに分類することができ、それらすべてを合わせておよびそれらそれぞれが本開示による実施形態を表す:
(a)蛍光色素
蛍光色素は、例えば、Briggsら、”Synthesis of Functionalized Fluorescent Dyes and Their Coupling to Amines and Amino Acids,” J.Chem.Soc.、Perkin-Trans.1(1997)1051~1058)によって記載されている。
(a)蛍光色素
蛍光色素は、例えば、Briggsら、”Synthesis of Functionalized Fluorescent Dyes and Their Coupling to Amines and Amino Acids,” J.Chem.Soc.、Perkin-Trans.1(1997)1051~1058)によって記載されている。
蛍光標識またはフルオロフォアとして、希土類キレート(ユーロピウムキレート)、FITC、5-カルボキシフルオレセイン、6-カルボキシフルオレセインを含むフルオレセイン型標識;TAMRAを含むローダミン型標識;ダンシル;リサミン;シアニン;フィコエリトリン;テキサスレッド;およびこれらの類似体が挙げられる。蛍光標識は、本明細書に開示される技術を使用して標的分子中に含まれるアルデヒド基にコンジュゲートされてよい。蛍光色素および蛍光標識試薬として、Invitrogen/Molecular Probes(Eugene、Oregon、USA)およびPierce Biotechnology,Inc.(Rockford、Ill.)から商業的に入手できるものが挙げられる。
(b)発光色素
発光色素または標識は、化学発光および電気化学発光色素にさらに細分類され得る。
化学発光(chemiluminogenic)標識のさまざまなクラスとして、ルミノール、アクリジニウム化合物、セレンテラジンおよび類似物、ジオキセタン、ペルオキシオキサリック酸(peroxyoxalic acid)およびそれらの誘導体に基づく系が挙げられる。免疫診断手順の
ために主にアクリジニウムに基づく標識が使用される(詳細な概説は、Dodeigne
C.ら、Talanta 51(2000)415~439に示されている)。
発光色素または標識は、化学発光および電気化学発光色素にさらに細分類され得る。
化学発光(chemiluminogenic)標識のさまざまなクラスとして、ルミノール、アクリジニウム化合物、セレンテラジンおよび類似物、ジオキセタン、ペルオキシオキサリック酸(peroxyoxalic acid)およびそれらの誘導体に基づく系が挙げられる。免疫診断手順の
ために主にアクリジニウムに基づく標識が使用される(詳細な概説は、Dodeigne
C.ら、Talanta 51(2000)415~439に示されている)。
電気化学発光標識として使用される主な関連標識は、それぞれルテニウムおよびイリジウムに基づく電気化学発光複合体である。電気化学発光(Electrochemiluminescense)(ECL)は、高感度および選択的な方法として分析的応用において非常に有用であることが証明されている。それは、化学発光分析(バックグラウンド光学シグナルの非存在)の分析的有利点と、印加する電極電位による反応調節の容易さとを組み合わせている。一般に、ルテニウム複合体、特に、液相または液体固相界面においてTPA(トリプロピルアミン)を用いて再生される[Ru(Bpy)3]2+(約620nmで光子を放出する)は、ECL標識として使用される。近年、イリジウムに基づくECL標識も記載されている(WO2012107419(A1))。
(c)放射性標識は、3H、11C、14C、18F、32P、35S、64Cu、68Gn、86Y、89Zr、99TC、111In、123I、124I、125I、131I、133Xe、177Lu、211Atまたは131Biなどの放射性同位元素(放射性核種)を利用する。
(d)画像化および治療目的のための標識として好適な金属キレート複合体は、当技術分野において周知である(US2010/0111856;US5,342,606;US5,428,155;US5,316,757;US5,480,990;US5,462,725;US5,428,139;US5,385,893;US5,739,294;US5,750,660;US5,834,456;Hnatowichら、J.Immunol.Methods 65(1983)147~157;Mearesら、Anal.Biochem.142(1984)68~78;Mirzadehら、Bioconjugate Chem.1(1990)59~65;Mearesら、J.Cancer(1990)、Suppl.10:21~26;Izardら、Bioconjugate Chem.3(1992)346~350;Nikulaら、Nucl.Med.Biol.22(1995)387~90;Cameraら、Nucl.Med.Biol.20(1993)955~62;Kukisら、J.Nucl.Med.39(1998)2105~2110;Verelら、J.Nucl.Med.44(2003)1663~1670;Cameraら、J.Nucl.Med.21(1994)640~646;Rueggら、Cancer Res.50(1990)4221~4226;Verelら、J.Nucl.Med.44(2003)1663~1670;Leeら、Cancer Res.61(2001)4474~4482;Mitchellら、J.Nucl.Med.44(2003)1105~1112;Kobayashiら、Bioconjugate Chem.10(1999)103~111;Miedererら、J.Nucl.Med.45(2004)129~137;DeNardoら、Clinical Cancer Research 4(1998)2483~90;Blendら、Cancer Biotherapy & Radiopharmaceuticals 18(2003)355~363;Nikulaら、J.Nucl.Med.40(1999)166~76;Kobayashiら、J.Nucl.Med.39(1998)829~36;Mardirossianら、Nucl.Med.Biol.20(1993)65~74;Roselliら、Cancer Biotherapy & Radiopharmaceuticals、14(1999)209~20)。
一実施形態では、サンドイッチは、cTnTに対する第1の抗体、cTnT(分析物)およびcTnTに対する第2の抗体を含んで形成され、ここで第2の抗体は検出可能に標識化されており、第1の抗cTnT抗体は、固相に結合できるまたは固相に結合されている。
一実施形態では、本発明において開示される抗cTnT抗体は、cTnTを測定するためのイムノアッセイにおいて使用される。一実施形態では、本明細書において上に開示される抗cTnT抗体は、サンドイッチ型イムノアッセイにおいて使用される。一実施形態では、本発明において開示される抗cTnT抗体は、検出抗体として使用される。一実施形態では、本明細書において開示される抗cTnT抗体は、発光色素、特に化学発光色素または電気化学発光色素を用いて検出可能に標識化される。
これらおよび他の実施形態は、本発明の記載および実施例によって開示され、包含される。本発明により使用される方法、使用および化合物のいずれか1つに関するさらなる文献は、公立図書館およびデータベースから例えば電子デバイスを使用して検索され得る。例えば、インターネット上で利用できる公開データベース「Medline」は、例えばncbi.nlm.nih.gov/PubMed/medline.html.でWorld Wide Webにおいて利用できる。ncbi.nlm.nih.gov/、fmi.ch/biology/research_tools.html、tigr.org/、またはinfobiogen.fr/などのWorld Wide Webにおいて利用できるさらなるデータベースおよびアドレスは、当業者に公知であり、lycos.comでWorld Wide Webにおけるアドレスを使用して得ることもできる。
他に定義されない限り、本明細書で用いるすべての技術的および科学的用語は、本発明が属する分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。矛盾する場合、定義を含めて特許明細書が優先される。
本明細書で提供されるすべてのアミノ酸配列は、当技術分野において習慣的に行われているとおり最もN末端側の残基から始めて最もC末端側の残基で終わるように表されており(N→C)、本発明を通じてアミノ酸を同定するために使用される1文字または3文字コード略号は、アミノ酸について一般に使用されるものに対応する。
本明細書において、特に特許請求の範囲において特徴付けられる実施形態に関して、従属請求項において言及される各実施形態は、前記従属請求項が従属する各請求項(独立または従属)の各実施形態と組み合わされることが意図される。例えば、3つの選択肢A、BおよびCを列挙する独立請求項1、3つの選択肢D、EおよびFを列挙する従属請求項2ならびに請求項1および2に従属し、3つの選択肢G、HおよびIを列挙するする請求項3の場合、他を具体的に言及する場合を除いて、明細書が、組合せA、D、G;A、D、H;A、D、I;A、E、G;A、E、H;A、E、I;A、F、G;A、F、H;A、F、I;B、D、G;B、D、H;B、D、I;B、E、G;B、E、H;B、E、I;B、F、G;B、F、H;B、F、I;C、D、G;C、D、H;C、D、I;C、E、G;C、E、H;C、E、I;C、F、G;C、F、H;C、F、Iに対応する実施形態を明白に開示することは理解される。
同様に、独立および/または従属請求項が選択肢を列挙しない場合に、従属請求項が複数の先行する請求項を遡って参照する場合、それによって網羅される主題の任意の組合せが明確に開示されると考えられることは、理解される。例えば、独立請求項1、請求項1を遡って参照する従属請求項2ならびに請求項2および1の両方を遡って参照する従属請
求項3の場合、請求項3および1の主題の組合せは、請求項3、2および1の主題の組合せであるとして明確かつ明白に開示されることになる。請求項1から3のいずれか一項を参照するさらなる従属請求項4が存在する場合、請求項4および1、請求項4、2および1、請求項4、3および1ならびに請求項4、3、2および1の主題の組合せが明確かつ明白に開示される。
求項3の場合、請求項3および1の主題の組合せは、請求項3、2および1の主題の組合せであるとして明確かつ明白に開示されることになる。請求項1から3のいずれか一項を参照するさらなる従属請求項4が存在する場合、請求項4および1、請求項4、2および1、請求項4、3および1ならびに請求項4、3、2および1の主題の組合せが明確かつ明白に開示される。
上記検討事項は、すべての添付される特許請求の範囲に準用する。非限定的例を示すために、請求項13、12および1(i)の組合せは、請求項の構造の観点から明確かつ明白に予測される。同じことが例えば請求項13、11および4(ii)などの組合せに適用される。
ある特定の本発明の態様は、添付の図の方法によっても例示される。
以下の実施例は、本発明を例示する:
実施例1
材料および一般的方法
組換えDNA技術
Sambrook,J.ら、Molecular Cloning:A laboratory manual;Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、New York、1989に記載のとおり標準的方法をDNAを操作するために使用した。分子生物学的試薬を製造者の説明書に従って使用した。
材料および一般的方法
組換えDNA技術
Sambrook,J.ら、Molecular Cloning:A laboratory manual;Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、New York、1989に記載のとおり標準的方法をDNAを操作するために使用した。分子生物学的試薬を製造者の説明書に従って使用した。
DNA配列決定
DNA配列をMicrosynth AG(Balgach、Switzerland)で実施した二重鎖配列決定によって決定した。
DNA配列をMicrosynth AG(Balgach、Switzerland)で実施した二重鎖配列決定によって決定した。
DNAおよびタンパク質配列分析ならびに配列データ管理
Vector NT1 Advance suite version 11.5.0を配列作成、マッピング、分析、アノテーションおよび例示のために使用した。
Vector NT1 Advance suite version 11.5.0を配列作成、マッピング、分析、アノテーションおよび例示のために使用した。
タンパク質化学および標識化技術
標準的タンパク質化学および標識化技術は、例えばHermanson,G.“Bioconjugate Techniques”3rd Edition(2013)Academic Pressに示されている。
標準的タンパク質化学および標識化技術は、例えばHermanson,G.“Bioconjugate Techniques”3rd Edition(2013)Academic Pressに示されている。
バイオインフォマティクス
バイオインフォマティクス法は、例えばKeith J.M.(ed.)“Bioinformatics” Vol.IおよびVol.II、Methods in Molecular Biology Vol.1525およびVol.1526(2017)Springerにおいて、ならびにMartin,A.C.R.& Allen,J.“Bioinformatics Tools for Analysis of Antibodies”in:Dubel S.& Reichert J.M.(eds.)“Handbook of Therapeutic Antibodies”Wiley-VCH(2014)に示されている。
バイオインフォマティクス法は、例えばKeith J.M.(ed.)“Bioinformatics” Vol.IおよびVol.II、Methods in Molecular Biology Vol.1525およびVol.1526(2017)Springerにおいて、ならびにMartin,A.C.R.& Allen,J.“Bioinformatics Tools for Analysis of Antibodies”in:Dubel S.& Reichert J.M.(eds.)“Handbook of Therapeutic Antibodies”Wiley-VCH(2014)に示されている。
電気化学発光イムノアッセイ
イムノアッセイおよび関連法は、例えばWild D.(ed.)“The Immunoassay Handbook”4th Edition(2013)Elsevierに示されている。電気化学発光標識としてのルテニウム複合体は、例えばStaffilani M.ら、Inorg.Chem.42(2003)7789~7798に示されている。典型的には、電気化学発光(ECL)に基づくイムノアッセイの実施のため
にElecsys 2010 analyzerまたは後継システム、例えばRoche
analyzer(Roche Diagnostics GmbH、Mannheim Germany)E170、cobas e 601 module、cobas e 602 module、cobas e 801 moduleおよびcobas e 411などを使用し、ならびにこれらの分析器のために設計されたRoche Elecsys assaysを、他に示さない限り標準的条件下でそれぞれ使用した。
イムノアッセイおよび関連法は、例えばWild D.(ed.)“The Immunoassay Handbook”4th Edition(2013)Elsevierに示されている。電気化学発光標識としてのルテニウム複合体は、例えばStaffilani M.ら、Inorg.Chem.42(2003)7789~7798に示されている。典型的には、電気化学発光(ECL)に基づくイムノアッセイの実施のため
にElecsys 2010 analyzerまたは後継システム、例えばRoche
analyzer(Roche Diagnostics GmbH、Mannheim Germany)E170、cobas e 601 module、cobas e 602 module、cobas e 801 moduleおよびcobas e 411などを使用し、ならびにこれらの分析器のために設計されたRoche Elecsys assaysを、他に示さない限り標準的条件下でそれぞれ使用した。
実施例2
ライブラリー構築
親抗体可変重鎖は、マウス(murine)由来(配列番号34)である。変異HCCDRを含むライブラリーを、それぞれHCCDR1、HCCDR2および/またはHCCDR3における単一アミノ酸無作為化を目的として構築物した。第1のステップでは、4つの異なる親抗体フレームワーク領域の1つをそれぞれコードする4つのDNA断片を生成した。フレームワーク領域1、3および4を施設内でポリメラーゼ連鎖反応によって得た、フレームワーク領域2を表す短い断片2(42bp)は、Metabion international AGに発注した(図1A参照)。断片をゲル精製し、定量した。これらのDNA断片の内の1つの100ngをPCR反応混合物に加える4つそれぞれにおけるポリヌクレオチド鋳型として使用した。CDR領域を親CDRと同じ数のコドンを含むポリヌクレオチドライブラリーの使用によって加え、前記ライブラリーのメンバーは、HCCDRそれぞれにおけるそれぞれの各コドン位置について1つのNNKコドンを有するライブラリーメンバーを含むように設計した。CDRライブラリー中のポリヌクレオチドは、それぞれのCDRに隣接するフレームワーク領域にハイブリダイズできる配列を付加的に含んだ。末端プライマーをネステッドPCR増幅のために使用した。それにより(図1B参照)、部分的に重複した配列を含む4個のDNA断片を生成した。重複PCRを、FW1配列の3’末端およびFW4配列の5’末端にハイブリダイズする末端プライマーを用いて、4個の断片を直鎖状DNAライブラリー構築物に接続するために実施した(図1C参照)。典型的PCR反応物は、MgSO4、200μM dNTP mix、0.5μMフォワードプライマーおよびリバースプライマー、250ng DNA鋳型、5単位Pwo DNAポリメラーゼを含む10μl 10×PCR緩衝液を含有する100μl反応混合物にPCRグレード水を用いて満たした。典型的PCRは、最初に94℃、5分間の鋳型変性から開始し、30サイクル(94℃ 2分間、60℃ 45秒間、72℃ 1分間)を使用し、72℃、5分間の最終伸長ステップを含んだ。プライマー、鋳型および断片配列を表1に列挙する。ライブラリー断片は、無細胞系における良好な転写および翻訳のために必要なすべての制御配列を含有した。当業者は、当技術分野の現行の方法に従って、かかるライブラリーを生成できる、例えばHanes,J.& Pluckthun,A.(1997)、“In vitro selection and evolution of functional proteins by using ribosome display”、Proc Natl Acad Sci U.S.A.94、4937~42を参照されたい。それにより250ngの、3個のHC CDRを含むDNAライブラリーを生成し、約5・1011に対応するライブラリーメンバーをin vitro提示アプローチのために使用した。
ライブラリー構築
親抗体可変重鎖は、マウス(murine)由来(配列番号34)である。変異HCCDRを含むライブラリーを、それぞれHCCDR1、HCCDR2および/またはHCCDR3における単一アミノ酸無作為化を目的として構築物した。第1のステップでは、4つの異なる親抗体フレームワーク領域の1つをそれぞれコードする4つのDNA断片を生成した。フレームワーク領域1、3および4を施設内でポリメラーゼ連鎖反応によって得た、フレームワーク領域2を表す短い断片2(42bp)は、Metabion international AGに発注した(図1A参照)。断片をゲル精製し、定量した。これらのDNA断片の内の1つの100ngをPCR反応混合物に加える4つそれぞれにおけるポリヌクレオチド鋳型として使用した。CDR領域を親CDRと同じ数のコドンを含むポリヌクレオチドライブラリーの使用によって加え、前記ライブラリーのメンバーは、HCCDRそれぞれにおけるそれぞれの各コドン位置について1つのNNKコドンを有するライブラリーメンバーを含むように設計した。CDRライブラリー中のポリヌクレオチドは、それぞれのCDRに隣接するフレームワーク領域にハイブリダイズできる配列を付加的に含んだ。末端プライマーをネステッドPCR増幅のために使用した。それにより(図1B参照)、部分的に重複した配列を含む4個のDNA断片を生成した。重複PCRを、FW1配列の3’末端およびFW4配列の5’末端にハイブリダイズする末端プライマーを用いて、4個の断片を直鎖状DNAライブラリー構築物に接続するために実施した(図1C参照)。典型的PCR反応物は、MgSO4、200μM dNTP mix、0.5μMフォワードプライマーおよびリバースプライマー、250ng DNA鋳型、5単位Pwo DNAポリメラーゼを含む10μl 10×PCR緩衝液を含有する100μl反応混合物にPCRグレード水を用いて満たした。典型的PCRは、最初に94℃、5分間の鋳型変性から開始し、30サイクル(94℃ 2分間、60℃ 45秒間、72℃ 1分間)を使用し、72℃、5分間の最終伸長ステップを含んだ。プライマー、鋳型および断片配列を表1に列挙する。ライブラリー断片は、無細胞系における良好な転写および翻訳のために必要なすべての制御配列を含有した。当業者は、当技術分野の現行の方法に従って、かかるライブラリーを生成できる、例えばHanes,J.& Pluckthun,A.(1997)、“In vitro selection and evolution of functional proteins by using ribosome display”、Proc Natl Acad Sci U.S.A.94、4937~42を参照されたい。それにより250ngの、3個のHC CDRを含むDNAライブラリーを生成し、約5・1011に対応するライブラリーメンバーをin vitro提示アプローチのために使用した。
実施例3
in vitro提示
Fab提示のための緩衝液を調製し、4℃で転倒回転させながら一晩インキュベートした。洗浄緩衝液、WB、(60mM Tris;pH7.5、AcOHを用いて調整、180mM NaCl、60mM酢酸マグネシウム、5%Blocker BSA、33mM KCl、200μg t-RNA、0.05% Tween20);ビーズ洗浄緩衝液BWB(100mM PBS、0.1% Tween20);停止緩衝液SB(50mM Tris pH7.5、AcOHを用いて調整、150mM NaCl、50mM酢酸マグネシウム、5%Blocker BSA(Pierce)、33mMKCl、0.5%Tween20、8.2mM酸化型グルタチオン);溶出緩衝液(55mM Tris pH7.5、AcOHを用いて調整、165mM NaCl、22mM EDTA、1mg BSA、5000U rRNA(5000U)、50μg tRNA)。
in vitro提示
Fab提示のための緩衝液を調製し、4℃で転倒回転させながら一晩インキュベートした。洗浄緩衝液、WB、(60mM Tris;pH7.5、AcOHを用いて調整、180mM NaCl、60mM酢酸マグネシウム、5%Blocker BSA、33mM KCl、200μg t-RNA、0.05% Tween20);ビーズ洗浄緩衝液BWB(100mM PBS、0.1% Tween20);停止緩衝液SB(50mM Tris pH7.5、AcOHを用いて調整、150mM NaCl、50mM酢酸マグネシウム、5%Blocker BSA(Pierce)、33mMKCl、0.5%Tween20、8.2mM酸化型グルタチオン);溶出緩衝液(55mM Tris pH7.5、AcOHを用いて調整、165mM NaCl、22mM EDTA、1mg BSA、5000U rRNA(5000U)、50μg tRNA)。
必要量の磁気ビーズ(ストレプトアビジンコートビーズ)を10μLの初期懸濁物あた
り100μL洗浄緩衝液(WB)を用い、4℃、一晩、転倒回転させてブロックした。標的/バックグラウンド試料あたり25μLのビーズをプレパニングステップのために、および20μLをパニングのために使用した。ビーズ保存緩衝液のアジ化ナトリウムを除去するために、ビーズをビーズ洗浄緩衝液(BWB)を用いて4回、およびWBを用いて3回洗浄した。これらのステップは、ビーズを回収するために2分間磁場を適用し、続いて上清を廃棄することによって実施した。最後の洗浄ステップ後、ビーズをその最初の体積のWB中に再懸濁した。
り100μL洗浄緩衝液(WB)を用い、4℃、一晩、転倒回転させてブロックした。標的/バックグラウンド試料あたり25μLのビーズをプレパニングステップのために、および20μLをパニングのために使用した。ビーズ保存緩衝液のアジ化ナトリウムを除去するために、ビーズをビーズ洗浄緩衝液(BWB)を用いて4回、およびWBを用いて3回洗浄した。これらのステップは、ビーズを回収するために2分間磁場を適用し、続いて上清を廃棄することによって実施した。最後の洗浄ステップ後、ビーズをその最初の体積のWB中に再懸濁した。
PUREfrex(商標)DS 2.0を製造者の説明書に従って使用して、in vitro転写および翻訳を実施した。標的(T)のために1個およびバックグラウンド(BG)のために1個の1.5mL反応チューブを準備した。
発現鋳型(LC)および提示鋳型(HC)のDNA投入量は、2:1分子比を適用した。提示および発現鋳型をコードするDNAの量は、すべてのFab提示サイクルにおいて一定に保った。in vitro転写/翻訳反応混合物を37℃、1時間インキュベートした。インキュベーション後、反応を100μLの停止緩衝液を加えることによって停止させ、続いて14000rpm、15分間、1℃での遠心分離ステップを行った。他に言及しない限り、続くステップは、4℃で実施した。停止された翻訳混合物の上清を、調製したビーズ懸濁物に加え、30分間、ロッキングプラットホームでインキュベートした。その後、懸濁物を三元複合体が残存している上清から非特異的結合分子を有するビーズを分離するために13000rpm、1℃、10分間で遠心分離した。プレパニングした上清(300μL)を、WBを用いて予めブロックした新たな2mL反応チューブに移し、さらなる使用まで氷上に保った。標的(組換えビオチン化cTnT)を300μLプレパニングした上清に10nMから50nMの範囲の最終濃度で加えた。ビオチン化cTnT濃度を選択圧を上昇させるためにすべてのサイクルにおいて減少させた。懸濁物を30分間、ロッキングプラットホーム上でインキュベートした。溶液パニングステップは、ビオチン化cTnTと三元複合体との間の特異的結合を可能にした。標的cTnTに結合した三元複合体を20分間インキュベーションステップにおいてストレプトアビジンビーズを用いて捕捉した。選択圧のさらなる増加は、2つの方法:抗原濃度を2nMに減少させること、または非ビオチン化競合物を使用することによってのいずれかでサイクルIIIにおいて達成した。後者ではパニングステップは、低いビオチン化cTnT濃度および過剰な競合物cTnTを一晩用いて実行した。
洗浄ステップは、磁場において結合した標的三元複合体を有するビーズを捕捉するステップに続く上清の除去を含む。ビーズを500μL氷冷WBを用いて洗浄した。選択圧を洗浄ステップの持続時間を5分間から1時間に延長することによって次の提示サイクルにおいて増加させた。最終洗浄ステップを新たにブロックした2mL反応チューブにビーズを移すために使用した。続いてビーズを磁場を用いて捕捉し、上清を除去した。続く溶出ステップをEDTAを含有する100μLの1×EBを加え、振とうしながら10分間インキュベートすることによって実施した。mRNAを三元複合体から遊離させた。その後溶出混合物を14000rpm、10分間、1℃で遠心分離した。RNeasy MinElute cleanup kit(Qiagen)を、濃縮したRNAを単離および精製するために製造者の説明書に従って使用した。RNAを16μL RNase不含有水を用いて溶出した。選択ステップ由来のすべての残存DNAを消化するために、Ambion DNA-free(商標)キットを製造者の説明書に従って使用した。残存DNAは、続くPCR反応において増幅され得ない。DNase不活性化後、懸濁物を2分間、13000rpm、室温で遠心分離した。上清(50μL)を氷上の新たな1.5mL反応チューブに移した。精製RNAは、逆転写(RT)のために直ちに使用した。すべての残存上清は-20℃で保存した。
溶出したmRNAをcDNAに逆転写した。2つの反応物を、パニングステップにおける標的を含有する試料Tについて準備した。2つのさらなる反応物を試料BGおよび水を含有する陰性対照のために調製した。試料の数に応じて、マスター混合物を調製し、プレミックスを氷上で0.2mL反応チューブに分注した。各反応物に12μLの溶出RNAおよび0.5μLの逆転写酵素を入れた。陰性対照をRNAの代わりに12μLのRNase不含有水を用いて実行した。逆転写を45分間、65℃、PCRサーモサイクラーで実施した。続いてcDNA試料を5分間、氷上でインキュベートし、続くステップで増幅した。残りの試料は、-20℃で保存した。2つのPCR反応を実行した:第1のPCR「RTでのPCR」は、プライマーFrtおよびRrtを用いて選択プールのcDNAを増幅するために実施した。プライマーF1AおよびR1Aを使用する第2のPCR「RT-PCRでのPCR」をin vitro転写/翻訳のための調節エレメントを再度付着させるために適用した。両方の反応をPwo DNAポリメラーゼを用いて実施した。
選択プールの十分なDNA濃度をもたらすために、4つの反応物を試料TおよびBGのそれぞれについて準備した。
追加的に4つの対照試料を準備した。最初の2つの試料は、試料TのmRNA単離後のDNA消化物由来およびBGであり、残っている可能性があるDNAを増幅するPCRによって検証した。3番目および4番目は、RTの陰性対照およびPCRグレード水を使用する「RTでのPCR」での陰性対照であった。
追加的に4つの対照試料を準備した。最初の2つの試料は、試料TのmRNA単離後のDNA消化物由来およびBGであり、残っている可能性があるDNAを増幅するPCRによって検証した。3番目および4番目は、RTの陰性対照およびPCRグレード水を使用する「RTでのPCR」での陰性対照であった。
TのPCR産生物を調製用1%アガロースゲルからQIAquickゲル抽出キットを用いて精製し、続いて定量し、「RT-PCRでのPCR」のための鋳型として使用した。選択プールの3つの反応物およびDNA鋳型の代わりにPCRグレード水を用いた1つの陰性対照を調製した。各反応物について、250ngの予め精製した「RTでのPCR」を使用した。PCR産生物を1%調製用アガロースゲルからQIAquickゲル抽出キットを用いて精製し、続く適切な発現系へのサブクローニングのためにさらに改変した。
実施例4
濃縮結合剤のペリプラスマチック発現
濃縮Fab結合剤を単離するために、マウス(murine)可変HCを、FabのヒトCH1ドメイン、マウス(murine)VLドメインおよびヒトCLドメインを含有するphoATIR3-9bi Fab TN-T M7chim発現ベクターにクローニングした(図2を参照されたい)。各選択プールは、発現ベクターへのクローニングを可能にするためのリーダー配列Tir9中に位置するBsiWI制限部位を伴う形で準備した。
濃縮結合剤のペリプラスマチック発現
濃縮Fab結合剤を単離するために、マウス(murine)可変HCを、FabのヒトCH1ドメイン、マウス(murine)VLドメインおよびヒトCLドメインを含有するphoATIR3-9bi Fab TN-T M7chim発現ベクターにクローニングした(図2を参照されたい)。各選択プールは、発現ベクターへのクローニングを可能にするためのリーダー配列Tir9中に位置するBsiWI制限部位を伴う形で準備した。
第2の制限部位KpnIは、HCの可変領域の末端にあり、それにより付着させる必要はない。したがってPCRは、BsiWI制限部位を含有するフォワードプライマー5’GCTACAAACGCGTACGCTATGGAAGTGCAGCTGCAGCAGAGCG-3’(配列番号95)、およびリバースプライマーRrt 5’-GGAAAGCCTCTGAGGACCAGCACGGATGCCCTGTGC-3’(配列番号88)を使用して実施した。ペリプラスマチック発現を96ウエルディープウエルブロック(DWB)で実施した。前培養(「マスター」)DWBをIntegra VIAFlo96を使用してウエルあたり1mLのLB(100μg/mLアンピシリン)を用いて満たし、予めサブクローニングおよび形質転換を実行した単離したクローンを接種した。選択プールあたり約300個のコロニーを取った。陰性対照として1ウエルを接種せずに残し;別のウエルを陽性対照としてXL1 blue形質転換TnT M-7(野生型)Fab発現ベクターを接種した。DWBを空気透過性膜を用いて封をし、オービタルシェーカーインキュベーター(750rpm)で一晩、30℃でインキュベートした。続いて、マスターDWBの各ウエルから50μLをSimmons,L.C.、Reilly,D.
、Klimowski,L.、Raju,T.S.、Meng,G.、Sims,P.、Hong,K.、Shields,R.L.、Damico,L.A.、Rancatore,P.& Yansura,D.G.(2002)“Expression of full-length immunoglobulins in Escherichia coli:rapid and efficient production of aglycosylated antibodies”、J Immunol Methods 263、133~47によって記載されたとおり1ウエルあたり1150mL C.R.A.P培地(100μg/mLアンピシリン)を用いて調製された新たな「発現」DWBに移した。DWBを空気透過性膜を用いて封をし、オービタルシェーカーインキュベーターで30℃でインキュベートした。Fab発現の誘導は、リン酸制限C.R.A.P培地を用いるphoAプロモーターに基づく。24時間後、Fab発現を有する細胞を4000rpm、10分間の遠心分離によって採取し、さらなる使用まで-20℃で保存した。
、Klimowski,L.、Raju,T.S.、Meng,G.、Sims,P.、Hong,K.、Shields,R.L.、Damico,L.A.、Rancatore,P.& Yansura,D.G.(2002)“Expression of full-length immunoglobulins in Escherichia coli:rapid and efficient production of aglycosylated antibodies”、J Immunol Methods 263、133~47によって記載されたとおり1ウエルあたり1150mL C.R.A.P培地(100μg/mLアンピシリン)を用いて調製された新たな「発現」DWBに移した。DWBを空気透過性膜を用いて封をし、オービタルシェーカーインキュベーターで30℃でインキュベートした。Fab発現の誘導は、リン酸制限C.R.A.P培地を用いるphoAプロモーターに基づく。24時間後、Fab発現を有する細胞を4000rpm、10分間の遠心分離によって採取し、さらなる使用まで-20℃で保存した。
前培養マスターDWBを950μLの40%グリセロールを加え、-80℃で保存する「グリセロールストック」のために使用した。細胞沈殿を50μL B-PERII Bacterial Protein Extraction Reagent(Thermo Fisher Scientific)中に、封をしたDWBを5分間強くボルテックスし、追加的に10分間、室温で振とうすることによって再懸濁した。細胞可溶化物を950μL Tris緩衝液(20mM Tris pH7.5、150mM NaCl)に希釈し、遠心分離(10分間、4000rpm)の前に10分間インキュベートした。粗細胞抽出物を含有する発現ブロックをSPR動態学的調査でのさらなる使用まで4℃に保った。
実施例5
ELISAスクリーニング
詳細なBiacore解析のための最良の変異体Fab結合剤を明らかにするために事前に酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)を実行した。ELISA設定を図3に示す。ビオチン化組換え心筋トロポニンT(100nM)をストレプトアビジン-MTP96ウエルプレートに1時間、RTでオービタルシェーカーで振とうすることによって捕捉した。抗原トロポニンTを100μL IP緩衝液(PBS pH7.3、1%BSA)に希釈した。続いてウエルをマイクロプレート洗浄器BioTek ELx405 Selectを使用して300μL 1×洗浄緩衝液(150mM NaCl、0.05%Tween20、0.2%Bronidox)を用いて3回洗浄した。洗浄後、変異抗cTnT Fab結合剤を含有する粗細胞抽出物をIP緩衝液に1:2に希釈し、トロポニンT捕捉ウエルに移した。再びウエルを300μL 1×洗浄緩衝液を用いて3回洗浄した。ヤギで産生させた抗ヒトIgG(Fab特異的)-ペルオキシダーゼ標識抗体(検出抗体)を1:40000希釈(IP緩衝液中)でトロポニンT結合変異Fab断片を検出するために使用した。未結合検出抗体を除去するために再びウエルを300μL 1×洗浄緩衝液を用いて3回洗浄した。マイクロプレートを1ウエルあたり100μL ABTSを用いて30分間、RTでインキュベートした。光学密度を405nmに設定したマイクロプレートリーダーBioTek Power wave XSを用いて測定した。親抗cTnT抗体の野生型Fabを陽性対照として使用した。最初のヒットを同定し、その粗細胞抽出物を動態学的分析に供した。
ELISAスクリーニング
詳細なBiacore解析のための最良の変異体Fab結合剤を明らかにするために事前に酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)を実行した。ELISA設定を図3に示す。ビオチン化組換え心筋トロポニンT(100nM)をストレプトアビジン-MTP96ウエルプレートに1時間、RTでオービタルシェーカーで振とうすることによって捕捉した。抗原トロポニンTを100μL IP緩衝液(PBS pH7.3、1%BSA)に希釈した。続いてウエルをマイクロプレート洗浄器BioTek ELx405 Selectを使用して300μL 1×洗浄緩衝液(150mM NaCl、0.05%Tween20、0.2%Bronidox)を用いて3回洗浄した。洗浄後、変異抗cTnT Fab結合剤を含有する粗細胞抽出物をIP緩衝液に1:2に希釈し、トロポニンT捕捉ウエルに移した。再びウエルを300μL 1×洗浄緩衝液を用いて3回洗浄した。ヤギで産生させた抗ヒトIgG(Fab特異的)-ペルオキシダーゼ標識抗体(検出抗体)を1:40000希釈(IP緩衝液中)でトロポニンT結合変異Fab断片を検出するために使用した。未結合検出抗体を除去するために再びウエルを300μL 1×洗浄緩衝液を用いて3回洗浄した。マイクロプレートを1ウエルあたり100μL ABTSを用いて30分間、RTでインキュベートした。光学密度を405nmに設定したマイクロプレートリーダーBioTek Power wave XSを用いて測定した。親抗cTnT抗体の野生型Fabを陽性対照として使用した。最初のヒットを同定し、その粗細胞抽出物を動態学的分析に供した。
実施例6
SPRに基づく機能解析
詳細な動態学的調査を37℃で、GE Healthcare T200装置で実施した。Biacore CM-5シリーズSセンサーを装置にマウントし、製造者の説明書に従ってプレコンディショニングした。システム緩衝液は、HBS-ET(10mM H
EPES(pH7.4)、150mM NaCl、1mM EDTA、0.05%(w/v)Tween(登録商標)20)であった。試料緩衝液は、1mg/ml CMD(カルボキシメチルデキストラン、Fluka)を補充したシステム緩衝液であった。一実施形態では、抗ヒト抗体捕捉システムは、CM5バイオセンサー上に確立した。GAHF(ab’)2、(ヤギ抗ヒトF(ab’)2)(コード番号:109-005-097、ロット番号13.12.2005、Jackson Immuno Research)を製造者の説明書に従ってNHS/EDC化学を使用して固定化した。10mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.0)中の30μg/ml GAHF(ab’)2をフローセル1、2、3および4に予備濃縮し、10.000RU GAHF(ab’)2で固定化した。次にセンサーを1MエタノールアミンpH8.5を用いて飽和させた。
SPRに基づく機能解析
詳細な動態学的調査を37℃で、GE Healthcare T200装置で実施した。Biacore CM-5シリーズSセンサーを装置にマウントし、製造者の説明書に従ってプレコンディショニングした。システム緩衝液は、HBS-ET(10mM H
EPES(pH7.4)、150mM NaCl、1mM EDTA、0.05%(w/v)Tween(登録商標)20)であった。試料緩衝液は、1mg/ml CMD(カルボキシメチルデキストラン、Fluka)を補充したシステム緩衝液であった。一実施形態では、抗ヒト抗体捕捉システムは、CM5バイオセンサー上に確立した。GAHF(ab’)2、(ヤギ抗ヒトF(ab’)2)(コード番号:109-005-097、ロット番号13.12.2005、Jackson Immuno Research)を製造者の説明書に従ってNHS/EDC化学を使用して固定化した。10mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.0)中の30μg/ml GAHF(ab’)2をフローセル1、2、3および4に予備濃縮し、10.000RU GAHF(ab’)2で固定化した。次にセンサーを1MエタノールアミンpH8.5を用いて飽和させた。
記載のとおりキメラ抗TnT抗体断片をE.coli細胞においてペリプラスマチックに発現させ、公知の方法によって溶解させた(技術的詳細について:Andersen,D.C.& Reilly,D.E.(2004);Production technologies for monoclonal antibodies and their fragments.Curr Opin Biotechnol 15,456~62を参照されたい)。可溶化物を試料緩衝液に1:20に希釈した。Fab断片をそれらのヒト化フレームワーク領域を介して発現可溶化物から流速10μl/分、1分間でバイオセンサー上に捕捉し、10倍濃縮HBS-EP緩衝液を用いる30μl/分、2分間の洗浄ステップが続いた。応答単位(RU)でのFab断片捕捉レベル(CL)をモニターした。組換えヒトTnT(Roche、37kDa)を試料緩衝液中90nMに希釈し、濃度シリーズをTnT濃度0nM、30nM、11nM、3.3nM、1.1nM、0nM、3.3nMで作製した。分析物濃度シリーズは、結合フェーズ80μl/分、3分間であり、解離フェーズを3分間モニターした。
分析物結合フェーズの最後、レポートポイントで、応答単位(RU)での「結合遅延(binding late)」(BL)をモニターした。各サイクルの動態学的速度決定後、捕捉システムを15秒間の10mMグリシンpH1.5の注射に続く2回の1分間の10mMグリシンpH1.7の注射、20μl/分によって再生した。
cTnT分析物の動態学的パラメーターka[1/Ms]、kd[1/s]、t1/2
diss[分]、KD[M]および結合化学量論(モル比)(詳細について:Schraeml,M.& Biehl,M.(2012);Kinetic screening in the antibody development process.Methods Mol Biol 901、171~81を参照されたい)を各Fab断片変異体についてBiaevaluationソフトウェア(GE healthcare)を用いて製造者の説明書に従って決定した。動態学的パラメーターは、CDR変異部位に相関し、その抗原複合体安定性(t1/2 diss)に従って表3に列挙する。
diss[分]、KD[M]および結合化学量論(モル比)(詳細について:Schraeml,M.& Biehl,M.(2012);Kinetic screening in the antibody development process.Methods Mol Biol 901、171~81を参照されたい)を各Fab断片変異体についてBiaevaluationソフトウェア(GE healthcare)を用いて製造者の説明書に従って決定した。動態学的パラメーターは、CDR変異部位に相関し、その抗原複合体安定性(t1/2 diss)に従って表3に列挙する。
動態学的パラメーターは、対応するCDRにおいて同定された変異に相関した。このスクリーニングにおいて得られた変異体は、すべて1つより多いアミノ酸置換を含有した。次いで、スクリーニングにおいて同定された単一の置換およびすべての置換の種々の組合せ/変動を含む変異体Fab-断片を作製および検査した。検査したすべての変異/組合せを表2に列挙する。
すべての上の変異体をSPRによって分析し、それらの抗原複合体安定性(t1/2 diss)に従って順位付けした(表3を参照されたい)。
抗体組合せ12に含まれる個々の置換、すなわち番号9、17および19に含まれる変異(表3を参照されたい)を別々に分析した場合、3個の変異部位に、この変異抗体の親和性、複合体安定性およびECLアッセイ性能を改善する相乗効果があることが明らかになる。これは、それらに含まれる変異の相乗効果も実証する。
実施例7
HEK細胞におけるキメラ抗体の発現
キメラヒト/マウス抗体を標準的手順により得た。対応するベクターおよびクローニング工程は、Norderhaugら、J Immunol Methods.1997 May 12;204(1):77~87に記載されている。
HEK細胞におけるキメラ抗体の発現
キメラヒト/マウス抗体を標準的手順により得た。対応するベクターおよびクローニング工程は、Norderhaugら、J Immunol Methods.1997 May 12;204(1):77~87に記載されている。
SPRによって選択した数個のFab断片から、全長マウス(murine)/ヒトキメラ抗体、すなわちヒトIgG CH1、CH2およびCH3ドメインを有する抗体を構築し、産生した。重鎖および軽鎖をコードするcDNAを融合細胞クローン7.1 A 12.2-22(ECACC 89060901)からRT-PCRによって得て、別々のベクターにヒトサイトメガロウイルス(CMV)最初期エンハンサー/プロモーター領域の下流にクローニングし、BGHポリアデニル化シグナルが続いた。
懸濁適合ヒト胚性腎臓FreeStyle 293-F細胞株(Thermo Fisher Scientific)を抗体の一過的遺伝子発現(TGE)のために使用した
:生細胞およそ2×10E6個/mlで、製造者の指針に従ってPEIpro(Polyplus-transfection SA、Strasbourg)トランスフェクション試薬によって複合体化された等量の両方の発現プラスミド(細胞培養物1Lあたり合計0.7mg)を細胞にトランスフェクトした。トランスフェクションの3時間後、バルプロ酸、HDAC阻害物質を発現をブーストするために加えた(最終濃度:4mM)。毎日、培養物に6%(v/v)のダイズペプトン加水分解物ベースのフィード(hydrolysate-based feed)を補充した。トランスフェクションの7日後、培養上清を遠心分離によって回収し、抗体をそれから標準的手順により精製した。
:生細胞およそ2×10E6個/mlで、製造者の指針に従ってPEIpro(Polyplus-transfection SA、Strasbourg)トランスフェクション試薬によって複合体化された等量の両方の発現プラスミド(細胞培養物1Lあたり合計0.7mg)を細胞にトランスフェクトした。トランスフェクションの3時間後、バルプロ酸、HDAC阻害物質を発現をブーストするために加えた(最終濃度:4mM)。毎日、培養物に6%(v/v)のダイズペプトン加水分解物ベースのフィード(hydrolysate-based feed)を補充した。トランスフェクションの7日後、培養上清を遠心分離によって回収し、抗体をそれから標準的手順により精製した。
実施例8
ECL測定
実施例7により産生した抗体をサンドイッチイムノアッセイで検査した(図4を参照されたい)。IgGルテニウムコンジュゲートを生成し、親抗cTnT抗体の性能を変異抗cTnT抗体と比較するために、純正Roche Elecsysアッセイ、カタログ番号05092744190 (Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)に含まれる元の標準的ルテニル化コンジュゲートの代わりにおよび比較のために使用した。変異mAbsを異なる標識化化学量論でルテニウムにコンジュゲートした。一実施形態では、ルテニウム標識化モル比は、1:10 抗体IgG:標識であった。抗cTnT抗体変種由来のルテニウムコンジュゲートをElecsys
R2試薬に希釈し、測定をブランク対照を用いて、トロポニンT hsアッセイプロトコールを使用してCobas E170 Module(Diluent Universal、Id.11732277122、Diluent Multi Assay、Id.03609987170、Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)で、トロポニンT hsアッセイ仕様書を使用してトロポニンT hs CalSetからのCal1およびCal2(Id.05092752190、Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)で実施した。結果を図5に示す。組合せ番号11および12にそれぞれ存在する変異を含む抗体は、親(非変異)抗体と比較してシグナルノイズ比の改善を示す。
ECL測定
実施例7により産生した抗体をサンドイッチイムノアッセイで検査した(図4を参照されたい)。IgGルテニウムコンジュゲートを生成し、親抗cTnT抗体の性能を変異抗cTnT抗体と比較するために、純正Roche Elecsysアッセイ、カタログ番号05092744190 (Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)に含まれる元の標準的ルテニル化コンジュゲートの代わりにおよび比較のために使用した。変異mAbsを異なる標識化化学量論でルテニウムにコンジュゲートした。一実施形態では、ルテニウム標識化モル比は、1:10 抗体IgG:標識であった。抗cTnT抗体変種由来のルテニウムコンジュゲートをElecsys
R2試薬に希釈し、測定をブランク対照を用いて、トロポニンT hsアッセイプロトコールを使用してCobas E170 Module(Diluent Universal、Id.11732277122、Diluent Multi Assay、Id.03609987170、Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)で、トロポニンT hsアッセイ仕様書を使用してトロポニンT hs CalSetからのCal1およびCal2(Id.05092752190、Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)で実施した。結果を図5に示す。組合せ番号11および12にそれぞれ存在する変異を含む抗体は、親(非変異)抗体と比較してシグナルノイズ比の改善を示す。
Claims (15)
- ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する抗体であって、CDRが以下:
(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに
(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3
のアミノ酸配列または最大1個のアミノ酸置換において異なっているその変種を含むことを特徴とし、
CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、
ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体。 - 軽鎖可変ドメインが配列番号2のアミノ酸配列のCDR1、配列番号3のアミノ酸配列のCDR2、および配列番号4のアミノ酸配列のCDR3、またはCDRあたり最大1個のアミノ酸置換において異なっているこれらのCDRの1つまたは複数の変種を含み、重鎖可変ドメインが請求項1における(ii)において示されたCDR1、CDR2およびCDR3の組合せを含み、個々のCDRが請求項1の(ii)において示された配列からなる、請求項1に記載の抗体。
- ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する抗体であって、CDRが以下(i)軽鎖可変ドメイン中の配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR3、ならびに
(ii)重鎖可変ドメイン中の配列番号5;配列番号6の;または配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号8の;または配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR2、および配列番号10の;配列番号11の;配列番号12の;または配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR3
のアミノ酸配列を含むことを特徴とし、
CDRのうちの少なくとも2個が、配列番号6もしくは配列番号7のCDR1、配列番号9のCDR2および配列番号12のCDR3から選択される、またはCDR1が配列番号7のものであり、CDR2が配列番号8のものであり、CDR3が配列番号11のものもしくは配列番号13のものであり、
ただし、配列番号6のCDR1が存在する場合、a)CDR3は配列番号11でも配列番号13でもない、またはb)本抗体内のCDR2およびCDR3は同時にそれぞれ配列番号8および配列番号12のものではないことを条件とする抗体。 - ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)に特異的に結合する抗体であって、
式I:
FW(LC)1-CDR(LC)1-FW(LC)2-CDR(LC)2-FW(LC)3-CDR(LC)3-FW(LC)4(式I)
に表されるフレームワーク領域(FW)およびCDRからなる軽鎖可変ドメイン、
ならびに式II:
FW(HC)1-CDR(HC)1-FW(HC)2-CDR(HC)2-FW(HC)
3-CDR(HC)3-FW(HC)4(式II)
に表されるFWおよびCDRからなる重鎖可変ドメインを含み、
FWが以下:
軽鎖における
FW(LC)1 配列番号14のアミノ酸配列;
FW(LC)2 配列番号15のアミノ酸配列;
FW(LC)3 配列番号16のアミノ酸配列;
FW(LC)4 配列番号17のアミノ酸配列;
および重鎖における
FW(HC)1 配列番号18のアミノ酸配列;
FW(HC)2 配列番号19のアミノ酸配列;
FW(HC)3 配列番号20のアミノ酸配列;
FW(HC)4 配列番号21のアミノ酸配列;
のアミノ酸配列またはこれらに少なくとも85%同一であるその変種を含み、CDRが請求項1に定義される配列、または最大1個のアミノ酸置換において異なっているこれらの変種を含む、抗体。 - 式I:
FW(LC)1-CDR(LC)1-FW(LC)2-CDR(LC)2-FW(LC)3-CDR(LC)3-FW(LC)4(式I)
に表されるフレームワーク領域(FW)およびCDRからなる軽鎖可変ドメイン、
ならびに式II:
FW(HC)1-CDR(HC)1-FW(HC)2-CDR(HC)2-FW(HC)3-CDR(HC)3-FW(HC)4(式II)
に表されるFWおよびCDRからなる重鎖可変ドメインを含み、
CDRが請求項3において定義される配列を含み、FWが以下:
軽鎖における
FW(LC)1 配列番号14のアミノ酸配列;
FW(LC)2 配列番号15のアミノ酸配列;
FW(LC)3 配列番号16のアミノ酸配列;
FW(LC)4 配列番号17のアミノ酸配列;
重鎖における
FW(HC)1 配列番号18のアミノ酸配列;
FW(HC)2 配列番号19のアミノ酸配列;
FW(HC)3 配列番号20のアミノ酸配列;
FW(HC)4 配列番号21のアミノ酸配列;
のアミノ酸配列またはこれらに少なくとも85%同一であるその変種を含む、請求項3に記載の抗体。 - 37℃で10分間以上のt/2-dissを有する、請求項1から5のいずれかに記載の抗体。
- (i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択される重鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有
する抗体。 - (i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列の重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
CDRが請求項1において定義されるとおりであり、
抗体がヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有する、抗体。 - (i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメインと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、ならびに
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列の重鎖可変ドメイン
を含む抗体であって、
CDRが請求項1において定義されるとおりであり、
抗体が、ヒト心筋トロポニンTに特異的に結合し、37℃で10分間以上のt/2-dissを有する、抗体。 - (i)配列番号22のアミノ酸配列からなる軽鎖可変ドメイン、および
(ii)配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27;配列番号28;配列番号29;配列番号30;配列番号31;および配列番号32のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列からなる重鎖可変ドメイン
を含む抗体。 - 請求項1から10のいずれか一項に記載の軽鎖可変領域をコードする核酸分子。
- 請求項1から10のいずれか一項に記載の重鎖可変領域をコードする核酸分子。
- 請求項11に記載のおよび/または請求項12に記載の核酸分子
を含むベクター。 - (i)請求項1から10のいずれか一項に記載の抗体
(ii)請求項11もしくは12に記載の核酸分子、および/または
(iii)請求項13に記載のベクター、
のうちの少なくとも1つを含む組成物。 - 請求項1から10のいずれか一項に記載の抗体のヒト心筋トロポニンTへの結合を検出するステップを含む、ヒト心筋トロポニンT(配列番号1)を決定する方法。
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