JP3174355B2 - Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法 - Google Patents

Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法

Info

Publication number
JP3174355B2
JP3174355B2 JP15620291A JP15620291A JP3174355B2 JP 3174355 B2 JP3174355 B2 JP 3174355B2 JP 15620291 A JP15620291 A JP 15620291A JP 15620291 A JP15620291 A JP 15620291A JP 3174355 B2 JP3174355 B2 JP 3174355B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
dna
dta
transformant
amino acid
gene
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
JP15620291A
Other languages
English (en)
Other versions
JPH05168484A (ja
Inventor
昌久 池見
忠志 守川
尚子 佐山
照三 三好
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Denka Co Ltd
Original Assignee
Denki Kagaku Kogyo KK
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Denki Kagaku Kogyo KK filed Critical Denki Kagaku Kogyo KK
Priority to JP15620291A priority Critical patent/JP3174355B2/ja
Publication of JPH05168484A publication Critical patent/JPH05168484A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP3174355B2 publication Critical patent/JP3174355B2/ja
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/52Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、配列表の配列番号1に
示したアミノ酸配列を有し、D−スレオニンアルドラー
ゼ(以下、DTAと略す)活性を有するポリペプチドを
コードするDNA、そのDNAとベクターDNAとより
なる組換え体DNA、その組換え体DNAで形質転換せ
しめられた形質転換体、及び該形質転換体を利用したD
TAの製造法並びにD−スレオニン等のD−β−ヒドロ
キシアミノ酸の製造法に関する。特に本発明は、DTA
のコード領域に対応するDNAを遺伝子組換え操作する
ことにより、安定で且つ発現性に優れた組換え体DNA
を与えると共に、DTA生産性の優れた形質転換体を提
供する。また、こうして得られた形質転換体を利用する
ことにより、バイオインダストリーの分野のみでなく、
広範な応用の可能なDTAを大量に製造することがで
き、さらには特に、医薬、農薬等の合成原料として有用
なD−スレオニンをはじめとしたD−β−ヒドロキシア
ミノ酸を効率よく製造することにも関する。
【0002】
【従来の技術及び発明が解決しようとする課題】D−ア
ミノ酸の研究が進むに従って、D−アミノ酸は抗生物
質、酵素阻害剤、除草剤等の各種医薬、農薬、その他の
各種の生理活性物質の合成原料として有用であることが
明らかにされ、その大量製造法が求められてきた。従来
L−アミノ酸及びD−アミノ酸それぞれの製造は、DL
−アミノ酸から繁雑な方法でもってラセミ体を光学分割
して製造することが一般的であった。
【0003】しかし、そのような方法は、不必要な他方
のアミノ酸をも製造するものであると共にそれを光学分
割しなければならないという著しい不利な点を有してい
た。このような点を解決するものとして、本発明者ら
は、自然界を広く検索した結果D−スレオニンアルドラ
ーゼ(DTA)を見出すと共に(特公昭64−1127
9号)、その酵素を使用すればグリシンとアセトアルデ
ヒドなどのアルデヒド化合物から選択的にD−スレオニ
ンなどのD体のβ−オキシアミノ酸を製造することが出
来ることを見出した(特開昭58−116690号)。
【0004】このようなDTAを使用してD−β−オキ
シアミノ酸を効率よく製造するためには、大量のDTA
を安価に取得することが必要であった。従来この酵素を
大量に効率よく得るために、高生産菌株を土壌などから
得る試みが広範囲になされたり、あるいは既存の生産株
の人工突然変異によって育種改良することがなされてき
たが、満足のいく結果は得られていなかった。
【0005】このような状況のもとで、本発明者らは、
鋭意研究を行ない、その結果微生物よりDTA産生に関
与する遺伝子を遺伝子組換えの手法で大量に得ることを
可能にすると共に、その遺伝子を用いた組換えDNAで
もって形質転換せしめたDTA高生産性の組換え微生物
を取得した。本発明者らは更に研究を進め、前記組換え
手法で得られたDTA産生に関与する遺伝子の塩基配列
の決定を試み、それに成功すると共に、DTA産生に直
接関与する遺伝子部分を特定化した。そして更にこうし
て特定化されたDTA産生に直接関与する遺伝子部分
は、前記の組換えDNAのほんの一部であること、そし
てこのように小断片化された遺伝子はそれ自体でDTA
をコードするものであることを知見するに至った。本発
明者らは更に研究を進めた結果このように小断片化され
たDTAコードDNAは、それを多コピー化することが
容易なこと、遺伝子発現制御配列との組み合わせが比較
的簡単になし得ること、その発現の制御が容易化しうる
こと、さらには高DTA産生形質転換体の育種に使用で
きるなどの優れた利点を有すると共に、そのうちの塩基
配列を公知の手法で置換あるいは欠失あるいは付加する
ことが容易になるなどのことを見出して本発明を完成し
た。
【0006】即ち、本発明は、(1) 配列表の配列番
号1に示したアミノ酸配列を有し、D−スレオニンアル
ドラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするDN
A、(2) 上記(1)のDNAをベクターに組み込ん
でなる組換え体DNA、(3) 上記(2)の組換え体
DNAで形質転換せしめられた形質転換体、(4) 上
記(3)の形質転換体を培養し、次に得られたDTAを
採取することを特徴とするD−スレオニンアルドラーゼ
の製造法、及び(5) 上記(3)の形質転換体あるい
はその処理物を、グリシン及びアルデヒド化合物と反応
せしめ、生成したD−β−ヒドロキシアミノ酸を採取す
ることを特徴とするD−β−ヒドロキシアミノ酸の製造
法に関する。
【0007】本発明は、また、上記(1)のDNAを用
いた高発現性の組換え体DNA並びにその製造法、及び
上記(1)のDNAを用いたDTA高産生形質転換体の
育種法をも提供する。
【0008】以下、本発明を更に詳細に説明する。 (1)DTA合成に関与する遺伝情報を担うDNAの単
離 本発明の配列表の配列番号1に示したアミノ酸配列を有
し、DTA活性を有するポリペプチドをコードするDN
A(以下、単にDTA遺伝子ともいう。)は、D−スレ
オニンアルドラーゼの合成に関与する遺伝情報を担うD
NAから製造することができる。
【0009】このD−スレオニンアルドラーゼの合成に
関与する遺伝情報を担うDNAとしては、例えばキサン
トモナス属細菌から得られたものが挙げられる。このキ
サントモナス属細菌としてはDTA産生キサントモナス
属細菌株であれば特に限定されないが、特に好ましいも
のとしてはキサントモナス・オリゼーIAM1657を
あげることができる。
【0010】また、このDNAは、それが一旦単離取得
されたならば、慣用方法に従ってそのDNA中の塩基配
列の大部分あるいは一部分を利用して、それをプローブ
として用いて、他の生物を検索して、その生物の保有す
る遺伝子のうちに、DTAの合成に関与する遺伝情報を
担うものを見つけ出し、次にそのようにして同定された
遺伝子を遺伝子組換え技術の手法を応用して切り出し
て、それを大量に得、それをこのキサントモナス属細菌
に由来するものと同様に用いることは、当業者であれば
容易に理解し得るところのものである。
【0011】従って、本発明のD−スレオニンアルドラ
ーゼの合成に関与する遺伝情報を担うDNA源として
は、キサントモナス属細菌のみでなく、上記したような
手法の適用できるグラム陰性あるいはグラム陽性細菌で
あってDTAをコードする遺伝子を有するものがあげら
れる。この他にも、DTA遺伝子を有するものであれ
ば、動物、植物、下等生物、高等生物の区別なく利用す
ることが可能である。DTA遺伝子源として好ましい微
生物としてはキサントモナス属、アリスロバクター属、
シュードモナス属あるいは、アルカリゲネス属に属する
ものがあげられる。このようなものの代表的な例として
はキサントモナス・オリゼーIAM1657、アルカリ
ゲネス・ハエカリスIFO12669、シュードモナス
DK−19(微工研菌寄第6200号)及びアリスロバ
クターDK−19(微工研菌寄第6201号)をあげる
ことができる。
【0012】(2)DTAをコードするDNAの塩基配
列の決定 次にキサントモナス属細菌由来のDTA産生に関与する
遺伝子を含むDNAを例にあげて、DTAをコードする
DNAの単離及びその塩基配列の決定法について説明す
る。ここで使用しうるキサントモナス属細菌由来のDT
A産生に関与する遺伝子の供給株としては、具体的には
キサントモナス・オリゼーIAM1657よりクローン
化されたDTA遺伝子を含む約3.5KbのSmaI/
BglII断片を組み込んだプラスミドDNAをもつ形質
転換体大腸菌C600(pDT648)があげられる。
【0013】この株は工業技術院微生物工業技術研究所
に、微工研菌寄第11049号(FERM P−110
49)として寄託されている。上記形質転換体からの組
換え体DNAおよび目的のDTA遺伝子を持つDNA断
片の調製は通常の方法を用いて行うことができる。
【0014】例えば、培地中で増殖させた該形質転換体
を収穫し、細胞壁をリゾチーム処理等の細胞破壊法とし
て知られた方法により壊し、次に核酸画分を分離した
後、密度勾配遠心などの方法により所望の画分に分け
る。こうして得られたプラスミドを含有する画分は、次
に適当な制限酵素で処理することにより、適度な断片に
することができると共にまた選択的に配列表の配列番号
1に示したアミノ酸配列を有し、DTA活性を有するポ
リペプチドをコードするDNA断片とすることができ
る。
【0015】DNAの塩基配列を決定するのに適した程
度まで断片化されたDNAは、次に当該分野でよく知ら
れた方法により処理されてその塩基配列を決定すること
ができる。DNA断片のDNA塩基配列の決定法として
は、Maxam−Gilbert法、ジデオキシ・シー
クエンス法、ジデオキシ・チェイン・ターミネーション
法等があげられる。このような方法の内には、適当な制
限酵素を作用させ、制限酵素地図を作製した上で、必要
な断片をサブクローン化する方法や、ショットガン・ク
ローニング法、PCRにより遺伝子を増幅する方法、核
酸分解酵素によりディリーションする方法などの様々な
手法が含まれていることはもちろんである。
【0016】次に、こうしてDNA塩基配列の決定され
たDNAのうちからDTA活性を有するポリペプチドを
コードしているDNA領域を決定する。このコード領域
決定のためには、先ず大量にDTA活性を有するポリペ
プチドを取得し、そのアミノ酸配列を決定し、そのアミ
ノ酸配列をコードしているDNA領域を探索決定する。
次にこうして決定されたDTA活性を有するポリペプチ
ドをコードするDNA領域を制限酵素で切り出し、再度
これを用いて発現ベクターを構築し、それを適当な宿主
中で発現させ、こうして得られた発現物の活性を検討し
て最終的に確認される。
【0017】上記のようにして構造解析されたDNAか
ら、DTAをコードするDNA以外の領域を除くには、
様々な方法でDTAの合成に不必要な領域を欠失させる
ことによってなすことができる。このような方法として
は、BAL31ヌクレアーゼやエキソヌクレアーゼIII
による欠失法、制限酵素切断サイトを利用した組換え法
などがあげられる。この際、本発明に従えば遺伝子の固
有のプロモーターを他のものに変更したり、部位特異的
変異を導入してプロモーターの強度を変化させること
が、現在の遺伝子操作技術を用いることにより、容易に
行いうる。従って、そのように一部を変更したDNA断
片であっても、DTA活性を示すポリペプチドをコード
するDNAを含むDNA断片であれば、全て本発明に含
まれることは明白である。
【0018】また、本発明のDTA活性を示すポリペプ
チドをコードするDNAを含むDNA断片としては、D
TA活性を示すポリペプチドをコードするDNAに加え
て、その遺伝子を生体内で発現させるのに重要な役割を
担う制御領域、例えば、遺伝子の転写プロモーター、リ
ボソーム結合部位、転写のターミネーターなどをコード
するDNAをも含んだものがあげられる。
【0019】本発明に従えば、一旦そのDTA活性を有
するポリペプチドをコードするDNAの塩基配列が明ら
かにされることにより、その機能を損なわない範囲でそ
の塩基の置換あるいは欠失を当該分野においてよく知ら
れた方法を適用して容易に行なうことができる。例え
ば、相当するアミノ酸をコードする遺伝暗号の縮重を利
用したもの、生物の遺伝暗号の利用率を考慮した変換あ
るいはDTAの機能に悪影響を及ぼさないようなアミノ
酸配列の変換のための塩基の置換、付加または欠失処理
などがあげられる。更にまた、このような改変のうちに
は、DTAの活性中心のみを保存し、その他の部分を大
幅に変化させるようにそのDNAの配列及び長さをかえ
ることも含まれる。したがって、本発明のD−スレオニ
ンアルドラーゼをコードするDNAとしては、以上のよ
うな改変を施したものすべてが含まれることは当業者で
あれば容易に理解し得るところのものである。
【0020】以上のような事情に鑑み、本発明のD−ス
レオニンアルドラーゼをコードするDNAは、本発明の
思想を実質的に利用して得られ、本発明のDNAと実質
的に同一の機能を有するものすべてを含有するものであ
る。
【0021】(3)DTA遺伝子を持つ組換え体DNA
の作製 DTAの合成に関与する遺伝情報を担うDNAを含む断
片から、適当な手段を施してDNA合成に不必要な領域
を欠失させたDNAは、それを適当なベクターDNAに
再び組み込むことにより、宿主細胞に再び導入すること
が出来る。本発明の上記DTAをコードするDNAを宿
主細胞に導入し、そしてそれをその導入された宿主細胞
内で発現させるために用いられるベクターDNAとして
は、適当な宿主細胞内で、DTA遺伝子を発現できるも
のであれば特に制限なく使用し得る。
【0022】このようなベクターDNAとしては、上記
DTAをコードするDNAを組み込むことの出来るもの
であり、組換えたベクターDNAで宿主細胞を形質転換
できるものであり、そして得られた形質転換体の細胞内
で導入されたDTAをコードするDNAの発現ができる
ものであれば特に限定されず、如何なるものも使用する
ことが出来る。このようなベクターDNAとしては、宿
主細胞中で自律複製可能であり、さらに組換え宿主細胞
のみを選別できるような適当な選択マーカーなどが付与
されたものがあげられる。さらにまた、このようなベク
ターDNAは公知のベクターDNA等から当業者が容易
に製造し得るようなものであってもよい。
【0023】このようなベクターDNAとしては、例え
ばプラスミドベクター、ファージベクター、コスミドベ
クターから選ばれたものがあげられる。また、このよう
なベクターDNAは他の宿主株との間で遺伝子交換が可
能なシャトルベクターであってもよいし、ランナウェイ
ベクターやスリーパーベクターなど遺伝子産物の発現効
率を向上せしめるために特別に工夫されたものであって
もよい。さらに、このようなベクターDNAは、lac
UV5プロモーター、trpプロモーター、tacプロ
モーター、lppプロモーター、tufBプロモータ
ー、recAプロモーター、PL プロモーター等の制御
因子を適宜付与されたものであってもよい。このような
形質発現などに係わる因子等を導入するためには、遺伝
子組換え技術の分野でよく知られた方法を適宜選択して
適用することにより行うことができる。
【0024】ここで使用することのできるベクターDN
Aの代表的なものは、宿主細胞によっても異なるが、p
BR328(Murooka,et al.,J.Ba
cteriol.,169(7),4406(198
7))、pRK2013などのヘルパープラスミドと共
に用いられるpRK290(G.Ditta,et a
l.,Proc.Natl.Acad.Sci.,US
77(12)、7347−7351(1980))
などがあげられる。
【0025】上記ベクターDNAに、上記DTAをコー
ドするDNAを組み込むには、まず、上記ベクターDN
Aに適当な制限酵素を作用させ、得られたベクターDN
A断片を、上記DTAをコードするDNA断片とを混合
し、これにDNAリガーゼを作用させることによりなし
うる。この際、必要に応じ当該分野で知られたリンカー
付与、ブラントエンド化等の処理を加えることもでき
る。このようにして得られた組換え体DNAは次に適当
な宿主細胞の中に導入される。
【0026】(4)複数のDTA遺伝子を持つ組換え体
DNAの作製 同一のプラスミド上に複数のDTA遺伝子、すなわち上
記DTAをコードするDNAを組み込めば、より良好な
結果が得られる。複数のDTA遺伝子を組み込む際のそ
の様式は、固有のプロモーターを持つDTA遺伝子が複
数個導入されていてもよいし、複数のDTA遺伝子がポ
リシストロニックに転写されるオペロンとして導入され
ていてもよいし、またこれらの組み合わせであってもよ
い。
【0027】固有のプロモーターを持つDTA遺伝子を
導入する方法では、導入可能な任意の位置にランダムに
導入してもよいし、一群のクラスターとして導入しても
よい。その際、遺伝子を導入する順序や遺伝子の方向性
は特に問題とはならない。また、DTA遺伝子をオペロ
ンとして導入する方法では、プロモーターからの転写方
向に対してDTA遺伝子をタンデムに配置することが望
ましい。いずれの方法においてもDTA遺伝子を効率よ
く発現させるために重要な役割を担う制御領域、例えば
遺伝子の転写プロモーター、リボソーム結合部位、転写
のターミネーターなどをコードするDNAが適当な位置
に配置されていることが必要であることは言うまでもな
い。
【0028】導入する遺伝子の数に特に制限はなく、組
換え体DNA及びそれを含む形質転換体の安定性を損な
わない範囲であればよい。組換え体DNAを作製する場
合、このための技術としては制限酵素による切断、リガ
ーゼによる連結、化学合成DNAの利用、ヌクレアーゼ
による欠失、部位特異的変異による塩基置換など、通常
の遺伝子操作で用いられる技術を適宜選択して適用する
ことにより行なうことができるが、この際に、プロモー
ターの変更やその他のDTA遺伝子を発現させるための
塩基配列の改変を行ってもよい。このようにして得られ
た組換え体DNAは次に適当な宿主細胞の中に導入され
る。
【0029】(5)組換え体DNAの宿主細胞への導入 上記のようにして作製した組換え体DNAを導入するた
めの宿主細胞としては、上で得られた組換えベクターで
もって形質転換されて、DTA遺伝子を発現させること
ができるようなものであれば、特に制限なく使用するこ
とが出来る。このような宿主細胞としては、本発明の目
的に沿ってDTA遺伝子の発現を達成し得る限り、グラ
ム陰性菌あるいはグラム陽性菌の区別なく、さらには、
下等細胞あるいは高等細胞の区別なく、動物由来細胞で
あろうと植物由来細胞であろうと使用できる。
【0030】ここで使用することのできる宿主細胞とし
ては、本発明のDTAをコードするDNAの発現が達成
され得るものがあげられ、このような宿主細胞として
は、大腸菌、キサントモナス属細菌、アセトバクター属
細菌、シュードモナス属細菌、グルコノバクター属細
菌、アゾトバクター属細菌、リゾビウム属細菌、アルカ
リゲネス属細菌、クレブシエラ属細菌、サルモネラ属細
菌及びセラチア属細菌から選ばれたものがあげられる。
【0031】ここで使用することの好ましい宿主細胞と
しては、例えば大腸菌及びキサントモナス属細菌があげ
られる。上記組換え体DNAを用いて上記宿主細胞を形
質転換などをするにあたっては、DNA組換技術におい
て広く知られた方法を適用して行うことができる。この
ような方法としては、宿主細胞をコンピテント(com
petent)状態にして形質転換用緩衝液中で組換え
体DNAと混合するとか、ヘルパー・プラスミドを用い
て接合伝達により移入するなどの方法があげられる。
【0032】(6)形質転換体によるDTAの製造 本発明により得られたDTA産生形質転換体は、それを
栄養培地中で培養せしめられ、次に得られた培養物をそ
のままDTA含有物として、あるいは培養物中からDT
Aを単離して、D−スレオニンあるいはその誘導体の合
成に用いることが出来る。DTA産生形質転換体は、適
当な栄養培地中で培養することにより、それを大量に得
ることができる。培養に用いられる培地は微生物の生育
に必要な炭素源、窒素源、無機物質等を含む通常の培地
である。更に、ビタミン、アミノ酸等の有機微量栄養素
を添加すると望ましい結果が得られる場合が多い。培養
は、好気的条件下でpH4〜10、温度20〜60℃の
任意の範囲に制御して1〜10日間培養を行えばよい。
形質転換体を用いる場合、使用する菌株に応じてアンピ
シリン、クロラムフェニコール等の抗生物質を培養液に
添加してもよい。
【0033】大量に培養して得たDTA産生形質転換体
の細胞あるいはその培養液よりのDTAの単離精製にあ
たっては、特公昭64−11279号に記載の方法と類
似の方法が使用できるほか、その産生量が非常に高いこ
とからより簡便な方法が利用できる。このような方法を
行うには、まず、生物体を機械的方法、酵素処理方法、
自己溶解法、超音波処理法などの方法によって破壊し、
粗抽出液を得、ついでこれを硫酸アンモニウム、リン酸
ナトリウムなどの塩析剤あるいはアセトン又はエタノー
ルなどの溶媒による蛋白質沈澱法、電気泳動法、ゲル濾
過法あるいは分子ふるいクロマトグラフィー法、限外濾
過法、逆相クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグ
ラフィー法、イオン交換クロマトグラフィー法、アフィ
ニティクロマトグラフィー法、吸着クロマトグラフィー
法、などの方法を単独あるいは適宜組み合わせて用いて
適用することにより行うことが出来る。
【0034】(7)D−β−オキシアミノ酸の製造 こうして得られた組換えDTAは特開昭58−1166
90号に記載されたようにしてグリシンとアセトアルデ
ヒドなどのアルデヒド化合物からD−スレオニンなどの
D体のβ−オキシアミノ酸を製造する際に、従来自然界
に見出されている非組換え微生物のDTAと同様にして
用いることができるが、本発明によれば大量かつ高純度
でそのDTAを製造しうるものであることから、こうし
て得られたDTAを用いることにより目的D−スレオニ
ン類を製造する方法としては大変に優れている。
【0035】また、従来自然界に見出されているDTA
生産性微生物では、L−アロスレオニンアルドラーゼを
も同時に産生しているために、グリシンとアルデヒド類
からD−β−オキシアミノ酸類を製造しようとする場
合、L−アロ−β−オキシアミノ酸の副生を避けるため
にL−アロスレオニンアルドラーゼを分離するか、選択
的に不活性化させることが必要であった。本発明に従っ
て組換えにより得られた微生物では、DTAのみを大量
に製造することが出来るので、D−スレオニン類を製造
する際に、宿主の産生するL−アロスレオニンアルドラ
ーゼ活性を除去するという繁雑な操作を大巾に省くこと
が出来る。
【0036】この方法で用いられるアルデヒド化合物と
しては一般式R−CHO(式中Rは水素原子、置換又は
非置換の脂肪族基、脂環式基、芳香族基、又複素環式基
を表わす)で示されるアルデヒド化合物があげられる。
本方法で使用される酵素は、酵素活性を発揮し得る形態
であればよく、必ずしも単離されたものに限定されな
い。また該酵素は、半精製品でもよく粗抽出液、さらに
は培養物、生物体、凍結乾燥生物体、アセトン乾燥生物
体、あるいはそれら生物体の磨砕物等であってもよい。
さらにそれは、酵素自体あるいは生物体のまま公知の手
段で固定化されて用いられてもよい。
【0037】また、反応温度は10〜70℃、好ましく
は20〜50℃である。反応時のpHは6〜9.5、好
ましくは7〜8に維持する。本反応はバッチ方式で行っ
てもよく、連続方式で行っもよい。更に、本反応は任意
の時間だけ反応を行わせることによってなしうるが、好
適には1〜50時間、より好ましくは5〜30時間反応
を行うのがよい。反応終了後は、適宜濃縮、遠心分離、
濾過などの処理を施して懸濁物等を除去してから、イオ
ン交換樹脂処理、晶析等で精製し、必要に応じ活性炭な
どで脱色処理することにより、目的D−β−ヒドロキシ
アミノ酸を得ることが出来る。
【0038】本方法で使用される酵素は、天然のDTA
のペプチド配列と一致するもののみに限定されず、遺伝
子変換及び遺伝子組換えの手法で得られるDTA活性を
示すものすべてを言うものと解すべきである。従って、
本方法で使用できる組換えDTAは、天然のDTAのペ
プチド配列中のアミノ酸の欠失したもの、あるいはその
ペプチド配列中のアミノ酸が他のアミノ酸で置き換えら
れたものをも包含する。
【0039】本発明に従って、配列表の配列番号1に示
したアミノ酸配列を有し、DTA活性を有するポリペプ
チドをコードするDNAを用いて、それをベクターに組
み込んで得られた組換え体DNAは、それを宿主に導入
して形質転換体を得ても、その形質転換体の生育が親の
宿主の生育に比べて劣ることが少ないばかりでなく、そ
の導入された組換え体DNAも安定に保持され、欠失あ
るいは脱落により活性を失なうというような欠点がな
い。さらにまた、配列表の配列番号1に示したアミノ酸
配列を有し、DTA活性を有するポリペプチドをコード
するDNAは、それが小型のものであることから、その
取り扱いが容易なばかりでなく、ベクター中に複数個組
み込んだり、あるいは強力な発現活性を有する制御配列
と組み合わせることが可能となった。
【0040】本発明に従って得られた形質転換体は、優
れた生育性を示すと共に高いDTA生産性を示すことが
でき、更に安定にDTA生産性を保持するために有用で
ある。また、本発明に従えば、大量のDTA生産が可能
であり、またその生産されたDTAの単離精製も容易と
なり、高純度のDTA製品が得られる。こうして得られ
たDTAを利用することにより、優れたD−スレオニン
をはじめとするD−β−ヒドロキシアミノ酸の製造法が
提供される。
【0041】
【実施例】
実施例1 DTA遺伝子の塩基配列の決定 組換え体DNAの調製は、以下説明するようにBirn
boim&Dolyの方法(T.Maniatis,e
t al.,Molecular Cloning,9
0)に従って行った。DTA遺伝子を保持する組換え体
プラスミドDNAを持つ形質転換体DK−EC600
(pDT648)(微工研菌寄第11049号)を10
0μg/mlのアンピシリンを含む400mlのLB培地で
一晩培養した。培養液から菌体を集菌し、4mg/mlのリ
ゾチームを含む4mlのグルコース溶液(50mMグルコ
ース,5mMトリス,10mMEDTA;pH8.0)
に懸濁して室温で反応させた。8mlのアルカリSDS溶
液(0.2N NaOH,1%SDS)および6mlの酢
酸カリウム溶液(5M酢酸カリウム;pH4.8)を順
次添加して穏やかに混和してから氷水中に5分間置い
た。15,000rpm で20分間遠心して沈澱を除去し
た後、10.8mlのイソプロピルアルコールを添加して
氷中に10分間静置し、次に15,000rpm で20分
間遠心して上澄みを除去した。80%エタノール水溶液
を添加して再度遠心した後、減圧下で乾燥した。
【0042】TE緩衝液10mlを加えて沈澱ペレットを
静かに溶解してから10mg/mlエチジウム・ブロマイド
1mlを添加し、これに10.5gの塩化セシウムを加え
て静かに溶解した。この溶液を12,000rpm で5分
間遠心して沈澱を除去した後、分離用超遠心機(ロータ
ーRPV45T)を用いて45,000rpm で16〜2
0時間遠心分離した。紫外線照射下で閉環状DNAを含
む画分1mlを注射器で抜取り、NaCl飽和イソプロピ
ルアルコールで少なくとも5回処理してエチジウム・ブ
ロマイドを抽出除去した。
【0043】TE緩衝液2ml、エタノール6mlを順次加
え、−20℃で10分間冷却後、15,000rpm で2
0分間遠心し、析出・沈澱させた。80%エタノール水
溶液で洗浄後減圧下に乾燥して400μリットルのTE
緩衝液に溶解した。pDT648からDTA遺伝子を含
む約3.5KbのSmaI/BglII断片を含むDNA
断片を調製し、エチジウム・ブロマイドを含む1%アガ
ロース・ゲル電気泳動で分離した。目的のDNA断片を
含むゲルを紫外線照射下で切り出し、常法に従い、ゲル
内部からDNA断片を抽出・回収した。
【0044】3.5KbのSmaI/BglII断片の一
部を制限酵素で除去したDNA断片を用いて組換え体D
NAを作製した。これを導入して得た形質転換体のDT
A活性を調べたところ、SmaI/EcoT22Iの約
2.5Kb上にDTA遺伝子が局在していることが見い
出された。そこで、代表的な4塩基認識の制限酵素を用
いて詳細な制限酵素切断地図を作製した。そのうちの代
表的な制限酵素切断地図を図1に示す。SmaI/Ec
oT22I DNA断片を図1に示した制限酵素で切断
し、M13ファージを用いたジデオキシ法により塩基配
列を決定した。この配列を配列表の配列番号1に示す。
決定した塩基配列は2053塩基対からなり、下記する
ようにしてDTA遺伝子の全領域が含まれていることが
確認された。
【0045】塩基配列中には、755番目のATGから
はじまり、1892番目のTGAで終わる1137塩基
対のDTAに対応するオープンリーディングフレームが
存在する。DTAのN末端アミノ酸を決定するために、
精製酵素のN末端アミノ酸配列を次のようにして決定し
た。DTA遺伝子を含む形質転換体DK−XC3311
(pDT648)(微工研菌寄第10979号)の培養
菌体を超音波破砕後、1mM塩化マンガン、0.01m
MPLPを含む10mM HEPES緩衝液(pH5.
5)中55℃で30分間熱処理した。遠心後上澄をDE
AEイオン交換クロマトグラフィーおよびゲル・パーミ
エーションクロマトグラフィーにより、SDSポリアク
リルアミド電気泳動で単一バンドを与えるまで精製し
た。DTA活性画分を分取し、逆相カラムクロマトグラ
フィーで単一ピークを与えることを確認した後、プロテ
ィン・シーケンサー(Applied Biosyst
ems477A)によりN末端の12個のアミノ酸残基
の配列を決定した。
【0046】このアミノ酸配列は、オープン・リーディ
ング・フレームから推定されたDTAのアミノ酸配列中
のN末端付近に見い出され、塩基配列上767番目から
コードされる12残基のアミノ酸配列と完全に一致し
た。これにより、DTAは塩基配列上767番目から1
891番目までにコードされ、Valではじまる、37
5個のアミノ酸残基からなる分子量39,300のタン
パク質であると推定されるが、その分子量はSDS P
AGEにより決定された分子量42,000と良好な一
致を示した。
【0047】実施例2 組換え体DNAの作製 塩基配列上640番目のAluIサイトから1911番
目のSalIサイトまでの約1270残基のDNA断片
をファージベクターM13mp18のSmaIサイトと
SalIサイトの間に組み換えた。常法に従って調製し
た組換え体DNAを制限酵素PstIで切断して平滑末
端化後BamHIリンカー存在下でT4DNA Lig
aseにより連結し、次にそれでもってJM109を形
質転換した。常法にしたがって選抜した形質転換体から
調製した組換え体DNAを制限酵素KpnIで切断して
平滑末端化後BglIIリンカー存在下で閉環し、次にこ
うして得られたベクターでJM109を再度形質転換し
た。この形質転換体から得られた組換え体DNAを制限
酵素BgmHIとBglIIで切断し、エチジウム・ブロ
マイドを含む1%アガロース・ゲル電気泳動で分離し、
約1.2Kbの目的のDNA断片を含むゲルを紫外線照
射下で切り出した。常法に従い、ゲル内部からDNA断
片を抽出・回収した。
【0048】プラスミド・ベクターpBR328を制限
酵素BamHIで切断し、CIP(フォスファターゼ
(ベーリンガーマンハイム社製))による脱リン酸化
後、上で調製した1.2KbのBamHI/BglII断
片と混合してT4DNA Ligaseで連結した。こ
うして得られたベクターで大腸菌C600のコンピテン
トセルを形質転換し、この形質転換体から得られた組換
え体DNAの構造を制限酵素で切断後のDNAの電気泳
動パターンにより確認した。このプラスミドをpDT6
51と命名した。
【0049】実施例3 複数個の遺伝子を組み込んだ組換え体DNA 上で得た形質転換体からプラスミドpDT651を調製
した。pDT651をBamHIで切断、CIPによる
脱リン酸化後、上で作製したDTA遺伝子を含む約1.
2KbのBamHI/BglII断片を混合後、T4DN
A Ligaseで連結して大腸菌C600のコンピテ
ントセルに形質転換した。
【0050】得られた組換え体DNAの構造を、制限酵
素で切断後のDNAの電気泳動パターンにより解析し、
2番目に導入されたDTA遺伝子が最初に導入されたD
TA遺伝子と同一方向にタンデムに挿入されたものを選
択し、pDT652と命名した。以下、同様の組換え操
作を繰り返し、DTA遺伝子が3個または4個同一方向
にタンデムに挿入された組換え体DNAを作製し、それ
ぞれpDT653、pDT654と命名した。
【0051】実施例4 DTA生産菌の育種 以下、上で作製した組換え体DNAをキサントモナス属
細菌に移入してDTA産生株を育種した例を具体的に示
す。宿主菌、キサントモナス・シトリーIFO3311
を50mlのLB培地に接種し、37℃で2時間45分培
養した。集菌後直ちに10mlのコンピテント調製用緩衝
液(50mM CaCl2 、10mM RbCl2
0.1M MOPS;pH6.5)に懸濁し、氷中30
分間静置した。遠心によって上澄みを除去後2.5mlの
同一緩衝液に再懸濁し、氷中で30分間以上静置した。
【0052】10μgのpDT651〜654をそれぞ
れ個別に含む微量遠心チューブに100μリットルの形
質転換緩衝液(10%ポリエチレングリコール(分子量
1000)、1mM EDTA、1mM MOPS;p
H7.2)、200μリットルのコンピテント・セルを
採取し、混合後氷中に30分間静置した。37℃の水浴
で2分間加温した後、0.8mlのLB培地を添加し、3
7℃で1時間培養した。50μg/mlのクロラムフェニ
コールを含むLB寒天培地に0.1mlずつ培養液を塗布
し、一昼夜37℃で培養した。こうしてpDT651,
pDT652,pDT653及びpDT654の各ベク
ターをそれぞれ保有する形質転換体を得た。
【0053】得られたクロラムフェニコール耐性株が目
的のプラスミドを保持していることを確認し、このうち
それぞれ1株をDTA活性測定に供した。形質転換体を
50μg/mlのクロラムフェニコールを含むLB培地1
00mlに接種し、37℃で一晩培養した。集菌後、活性
測定用緩衝液(0.01mM PLP、5mM MnC
2 ・4H2 O、0.01M トリス;pH7.0)で
洗浄し凍結乾燥した。凍結乾燥菌体40mgを同緩衝液1
mlに懸濁し、さらに0.0078%になるまで希釈し
た。あらかじめ保温しておいた基質溶液(50mMD−
スレオニン、2mM MnCl2 ・4H2 O、0.01
mM PLP、0.2M トリス;pH7.0)0.2
mlを加えた。
【0054】30℃で2時間反応させた後、0.4mlの
1N塩酸を加え反応を停止させた。遠心後上澄み液を
0.22μのメンブランフィルターで濾過した。各プラ
スミドDNAを持つキサントモナス・シトリーIFO3
311の形質転換体のDTA活性を、宿主及び遺伝子供
与体と比較して表1に示す。
【0055】
【表1】
【0056】実施例5 DTA高生産によるD−スレオニンの製造 上で育種したDTA高生産性の形質転換体を50μg/
mlのクロラムフェニコールを含むLB培地500mlに接
種し、37℃で一晩培養した。集菌後、0.9%食塩水
を加えて洗浄し凍結乾燥した。
【0057】アセトアルデヒド50mM、グリシン50
mM、0.1mM PLPおよび10mMメルトカプト
エタノールを含むpH8.0の0.1Mトリス塩酸緩衝
液500mlよりなる基質溶液に上記乾燥菌体1gを加え
30℃で20時間反応させた。反応終了後、DNA供与
体であるキサントモナス・オリゼーIAM1657およ
び形質転換体DK−XC3311(pDT648)と比
較して、溶液中のD−スレオニンを定量したところ表2
に示す結果を得た。
【0058】
【表2】
【0059】反応液をH+ 型のDowex50W×8を
500ml充填したカラムに通液し、水洗後0.2Nアン
モニアで溶離してスレオニン区分からグリシン区分を分
離した。スレオニン区分を濃縮後活性炭で脱色し、脱色
液にエタノールを添加して結晶を得た。この結晶につい
てNMR、赤外線吸収スペクトル、元素分析、及び比旋
光度を測定して、この結晶がD−スレオニンであること
を確認した。また、ストレプトコッカス・ハエカリスI
FO3181を用いたバイオ・アッセイ法により、反応
液中にはL−体がまったく含まれていないことを確認し
た。
【0060】
【発明の効果】微生物より単離したDTA産生遺伝子を
含むDNAの塩基配列を解析することにより、DTA産
生に必要で、ベクターに組み込むための遺伝子断片を大
幅に小型化するとともに、複数個の遺伝子のベクターへ
の導入を可能にした。これにより、形質転換体の生育及
び導入した組換え体DNAの安定性を向上せしめるとと
もにDTAの生産性をも大幅に改善せしめることができ
た。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】DTA遺伝子を有するSmal−EcoT22
1断片の制限酵素地図の代表例を示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI C12R 1:64) (C12P 13/08 C12R 1:64) (72)発明者 三好 照三 東京都町田市旭町3丁目5番1号 電気 化学工業株式会社総合研究所内 (56)参考文献 特開 平3−139283(JP,A) (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12N 15/09 ZNA BIOSIS(DIALOG) GenBank/EMBL/DDBJ(G ENETYX) MEDLINE(STN)

Claims (11)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列表の配列番号1に示したアミノ酸配
    列を有し、D−スレオニンアルドラーゼ活性を有するポ
    リペプチドをコードするDNA。
  2. 【請求項2】 配列表の配列番号1に示した塩基配列
    らなる請求項1記載のDNA。
  3. 【請求項3】 配列表の配列番号1に示したアミノ酸配
    列を有し、D−スレオニンアルドラーゼ活性を有するポ
    リペプチドをコードするDNAをベクターに組み込んで
    なる組換え体DNA。
  4. 【請求項4】 配列表の配列番号1に示した塩基配列
    らなるDNAをベクターに組み込んでなる組換えDNA
    である請求項3記載の組換え体DNA。
  5. 【請求項5】 配列表の配列番号1に示したアミノ酸配
    列を有し、D−スレオニンアルドラーゼ活性を有するポ
    リペプチドをコードするDNAあるいは配列表の配列番
    号1に示した塩基配列からなるDNAを複数個ベクター
    に組み込んでなる請求項3記載の組換え体DNA。
  6. 【請求項6】 配列表の配列番号1に示したアミノ酸配
    列を有し、D−スレオニンアルドラーゼ活性を有するポ
    リペプチドをコードするDNAをベクターに組み込んで
    なる組換え体DNAで形質転換せしめられた形質転換
    体。
  7. 【請求項7】 請求項4または5のいずれかに記載の組
    換え体DNAで形質転換せしめられた形質転換体である
    請求項6記載の形質転換体。
  8. 【請求項8】 配列表の配列番号1に示したアミノ酸配
    列を有し、D−スレオニンアルドラーゼ活性を有するポ
    リペプチドをコードするDNAをベクターに組み込んで
    なる組換え体DNAで形質転換せしめられた形質転換体
    を培養し、次に得られたD−スレオニンアルドラーゼを
    採取することを特徴とするD−スレオニンアルドラーゼ
    の製造法。
  9. 【請求項9】 該形質転換体が請求項7記載のものであ
    る請求項8記載の製造法。
  10. 【請求項10】 配列表の配列番号1に示したアミノ酸
    配列を有し、D−スレオニンアルドラーゼ活性を有する
    ポリペプチドをコードするDNAをベクターに組み込ん
    でなる組換え体DNAで形質転換せしめられた形質転換
    体あるいはその形質転換体処理物を、グリシン及びアル
    デヒド化合物と反応せしめ、生成したD−β−ヒドロキ
    シアミノ酸を採取することを特徴とするD−β−ヒドロ
    キシアミノ酸の製造法。
  11. 【請求項11】 該形質転換体が請求項7記載のもので
    ある請求項10記載の製造法。
JP15620291A 1991-05-31 1991-05-31 Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法 Expired - Fee Related JP3174355B2 (ja)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP15620291A JP3174355B2 (ja) 1991-05-31 1991-05-31 Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP15620291A JP3174355B2 (ja) 1991-05-31 1991-05-31 Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JPH05168484A JPH05168484A (ja) 1993-07-02
JP3174355B2 true JP3174355B2 (ja) 2001-06-11

Family

ID=15622603

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP15620291A Expired - Fee Related JP3174355B2 (ja) 1991-05-31 1991-05-31 Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JP3174355B2 (ja)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE05793824T1 (de) 2004-10-13 2008-02-07 Mitsui Chemicals, Inc. Für ein neuartiges enzymmit d-serin-synthaseaktivität codierende dna, verfahren zur herstellung dessenzyms und verfahren zur herstellung von d-serin unter verwendung davon

Also Published As

Publication number Publication date
JPH05168484A (ja) 1993-07-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR960014703B1 (ko) 세팔로스포린 아세틸히드롤라아제 유전자 및 이 유전자에 의해 코딩된 단백질
Perona et al. Overproduction and purification of Escherichia coli tRNAGln2 and its use in crystallization of the glutaminyl-tRNA synthetase-tRNAGln complex
US4520016A (en) Bacteriolytic proteins
KR100312456B1 (ko) 슈도모나스 플루오레슨스 유래의 외래단백질 분비촉진유전자
JPH01502638A (ja) グラム陽性及びグラム陰性菌に対する活性を有するポリペプチド類
JPH0787788B2 (ja) イソペニシリンn合成酵素をコ−ドしているdna化合物および組換えdna発現ベクタ−
JP3408737B2 (ja) ニトリルヒドラターゼの活性化に関与するタンパク質及びそれをコードする遺伝子
EP0497103B1 (en) Gene encoding asymmetrically active esterase
US5314819A (en) Protein having nitrile hydratase activity obtained from rhizobium, gene encoding the same, and a method for producing amides from nitriles via a transformant containing the gene
AU761093B2 (en) Construction of production strains for producing substituted phenols by specifically inactivating genes of the eugenol and ferulic acid catabolism
JPH05168484A (ja) Dta遺伝子の塩基配列及びその利用法
JP2923654B2 (ja) Dta遺伝子及びその利用法
CN111662903B (zh) 对数期特异性启动子及其应用
CN114181288A (zh) 制备l-缬氨酸的方法及其所用的基因与该基因编码的蛋白质
RU2140453C1 (ru) Рекомбинантная плазмидная днк p ua bc22, кодирующая модифицированный активатор плазминогена урокиназного типа, нетранслируемый днк-элемент - искусственная межгенная последовательность мгп14 и штамм бактерий escherichia coli - продуцент модифицированного активатора плазминогена урокиназного типа
JP3151893B2 (ja) エステル不斉加水分解酵素遺伝子
RU2415940C1 (ru) ПЛАЗМИДНЫЙ ВЕКТОР pE-Lc-LTP, ШТАММ БАКТЕРИИ Escherichia coli ДЛЯ ЭКСПРЕССИИ ЛИПИД-ТРАНСПОРТИРУЮЩИХ БЕЛКОВ ЧЕЧЕВИЦЫ Lens culinaris И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ УКАЗАННЫХ БЕЛКОВ
JPH0731480A (ja) L−グルタミルtRNAレダクターゼをコードするDNA断片
RU2144082C1 (ru) Рекомбинантная плазмида, кодирующая гибридный белок-предшественник инсулина человека (варианты), штамм бактерий e.coli - продуцент гибридного белка-предшественника инсулина человека (варианты) и способ получения инсулина человека
KR101081012B1 (ko) 클로로히드린 및 하이드록시카르복실산 에스테르 부제가수분해 효소 유전자
WO2009054754A1 (en) PHINS21 RECOMBINANT PLASMID FOR ENCODING HYBRID PROTEIN WITH HUMAN PROINSULIN, AN Escherichia coli JM109/pHINS21 BACTERIA STRAIN AS A PRODUCER OF HYBRID PROTEIN WITH HUMAN PROINSULIN AND A HUMAN PROINSULIN PRODUCING METHOD
JPH0928380A (ja) ニトリラーゼ遺伝子発現に関わる調節因子およびその遺伝子
Jiang et al. The expression of proUK in Escherichia coli: the vgb promoter replaces IPTG and coexpression of argU compensates for rare codons in a hypoxic induction model
WO1999020763A1 (en) D-sorbitol dehydrogenase, genes thereof and use of the same
JP3491695B2 (ja) N−アシルノイラミン酸アルドラーゼの製造法

Legal Events

Date Code Title Description
S531 Written request for registration of change of domicile

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313531

R350 Written notification of registration of transfer

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20080330

Year of fee payment: 7

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20090330

Year of fee payment: 8

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20100330

Year of fee payment: 9

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees