JP6431478B2 - B型肝炎ウイルスのcccdnaの転写の調節 - Google Patents
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Description
本出願は、2012年6月1日に出願された米国仮特許出願第61/654374号に基づく優先権を主張するものであり、その全内容は参照により本明細書に援用される。
R1は、−(CH2)n−、もしくは、−C(=O)−、
R2は、−C(=O)−、3,5−トリアゾリル、もしくは、−C(Z)N(R4)−、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
R3は、−CH(R5)−、もしくは、R2は、窒素、およびR3は、−CH−であり、R2およびR3が共にピペリジニルを形成し、
R5は、水素、−CH3、もしくは、αアミノ酸R基、
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、もしくは、−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOH、
Xは、=O、H2、=N−NH2、もしくは、=N−NH−C(=O)NH2、
Yは、NHOH、もしくは、−CH2CH3、
Zは、H2、もしくは、O、
R7は、水素、もしくは、アルコキシ、
R8は、アルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
nは、0−2、
mは、0−6、および、
qは、0−3、
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩である。
R1は、−(CH2)−、
および、
R2は、−C(Z)N(R4)−、
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩である。
R1は、−(CH2)n−、もしくは、−C(=O)−、
R2は、−C(=O)−、3,5−トリアゾリル、もしくは、−C(Z)N(R4)−、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
R3は、−CH(R5)−、もしくは、R2は、窒素、およびR3は、−CH−であり、R2およびR3が共にピペリジニルを形成し、
R5は、水素、−CH3、もしくは、αアミノ酸R基、
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、もしくは、−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOH、
Xは、=O、H2、=N−NH2、もしくは、=N−NH−C(=O)NH2、
Yは、NHOH、もしくは、−CH2CH3、
Zは、H2、もしくは、O、
R7は、水素、もしくは、アルコキシ、
R8は、アルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
nは、0−2、
mは、0−6、および、
qは、0−3、
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩である。
R1は、−(CH2)−、
および
R2は、−C(Z)N(R4)−、
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩である。
R1は、−(CH2)n−、もしくは、−C(=O)−、
R2は、−C(=O)−、3,5−トリアゾリル、もしくは、−C(Z)N(R4)−、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
R3は、−CH(R5)−、もしくは、R2は、窒素、およびR3は、−CH−であり、R2およびR3が共にピペリジニルを形成し、
R5は、水素、−CH3、もしくは、αアミノ酸R基、
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、もしくは、−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOH、
Xは、=O、H2、=N−NH2、もしくは、=N−NH−C(=O)NH2、
Yは、NHOH、もしくは、−CH2CH3、
Zは、H2、もしくは、O、
R7は、水素、もしくは、アルコキシ、
R8は、アルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
nは、0−2、
mは、0−6、および、
qは、0−3、
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩である。
R1は、−(CH2)−、
および、
R2は、−C(Z)N(R4)−である
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩である。
R1は、−(CH2)n−、もしくは、−C(=O)−、
R2は、−C(=O)−、もしくは、−C(Z)N(R4)−、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
R3は、−CH(R5)−、
R5は、水素、−CH3、もしくは、αアミノ酸R基、
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、もしくは、−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOH、
Xは、=O、H2、=N−NH2、もしくは、=N−NH−C(=O)NH2、
Yは、NHOH、もしくは、−CH2CH3、
Zは、H2、もしくは、O、
R7は、水素、もしくは、アルコキシ、
R8は、アルキル、もしくは、カルボキシアルキル、
nは、0−2、
mは、0−6、および、
qは、0−3、
または、立体異性体、もしくは、その薬理学的に許容可能な塩。
R1は、−(CH2)−、
および
R2は、−C(Z)N(R4)−である。
(1)病気の予防;例えば、病気、病状もしくは疾患にかかりやすい可能性があるものの、病気の病変もしくは兆候をまだ経験したり示さない個体において、その病気、病状もしくは疾患を予防する。
(2)病気の抑制;例えば、病気、病状もしくは疾患による病変もしくは兆候を経験したり示している個体において、病気、病状または疾患を抑制する(すなわち、病変および/または兆候の発症の進行を阻止することを含む)。
(3)病気の改善;例えば、病気、病状もしくは疾患による病変もしくは兆候を経験したり示している個体において、病気、病状または疾患を改善する(すなわち、病変および/または兆候を阻止することを含む)。
HBV cccDNAの調節
DHBV cccDNAは、LMHで誘導されたdstet5細胞中で効率的に生産され、転写的に活性を有する。HBVを生産するほとんどの細胞株は、宿主染色体に統合されたHBVの導入遺伝子からHBVの遺伝子産物を生産しており、したがってcccDNAは主なウイルス産物の源ではない。これはcccDNAを標的とする薬のスクリーニングを困難にする。ウイルス性遺伝子産物がcccDNAに依存する細胞株が生産された。テトラサイクリン(tet)で制御されたHBV/DHBVで、この目的のために、ヒトHep G2およびチキン肝癌(LMH)に安定な細胞株を樹立した。図1で示されているように、tetの非存在下およびウイルスの逆転写を防止するためのホスカルネット(PFA)の2mMの存在下での培養の後に、DHBVのRNAが蓄積し、しかしDHBVの複製はヌクレオカプシドを含むpgRNA含有ヌクレオカプシドの段階で静止される(レーン0)。tetを媒体に戻して導入遺伝子の転写をブロックし、PFAを除去してpgRNA含有カプシド中のウイルスDNA合成を続行すると、ウイルス性のRNAの急激な低下があり(1日目および2日目)、3日目以降にcccDNAが生産された場合高レベルに最後の上昇がある。
ウイルスの転写がcccDNA依存的方法(図1、2B)で生産される系および条件で、本願発明者らの社内の小さな化合物のライブラリーから得られた化合物を含む、おおよそ100の化合物がスクリーニングされ、それらは本願発明者らの天然の生産物コレクション(Natural Products collection)に示している。選択された化合物は、細胞のエピジェネティック修飾酵素の阻害剤を含み、HDAC、HAT、サーチュイン、ヒストンメチルトランスフェラーゼ、ヒストンデメチラーゼ、およびDNAメチルトランスフェラーゼを含む。表1で示された4つの化合物を含む多数の化合物は、cccDNAに由来するDHBVのpgRNAの量を著しく減らした。すべてはHDACのクラスI阻害活性を有している。
HepDE19の細胞を6ウェルプレートに播種し、コンフルエントになるまでテトラサイクリンの存在下で培養する。Tetを培地から除去し、pgRNAの転写、DNAの合成およびcccDNAの形成を生じさせる。Tetを培地に加え、導入遺伝子の転写を遮断する。3日後、異なるウェルの細胞をそれぞれ多様な濃度(すなわち0.1から10.0uM)の「試験」化合物(表1の4つの「ヒット」および〜20の類似体)で2日間処置するか、または処置をしないで静置する。細胞内のHBVのcccDNA、ウイルス性RNAおよび核のDNAを上述のように、および知られた手順でサザン/ノーザンブロットハイブリダイゼーションアッセイによって定量する。細胞内の全長のHBeAgの前駆体および分泌HBeAgをそれぞれウェスタンブロットおよびELISAアッセイで定量する。すべてのHBVの発現はこれらの細胞では主としてHBVの導入遺伝子からのものであるからであることから、HepG2.2.15細胞をコントロールとして使用する。cccDNAの転写を阻害することが示されているインターフェロンアルファ、およびcccDNA形成を阻害する(我々のスクリーニング、Guo 2012から)二置換スルホンアミド(DSS)CCC−0975は、陽性薬品コントロールとして含まれるであろう。いくつかの実験で、培地から「試験」薬品の除去の後、多様な時間(日数)、培養は維持し、薬品により誘導されたあらゆるHBV cccDNAの抑制の耐久性を決定する。cccDNAの転写に対する試験化合物の選択性を決定するために、アルファ1アンチトリプシン、アルブミンを包含するがこれらに限定されない細胞遺伝子のパネルの発現に対する試験化合物の効果もまた定量RT−PCRまたはノーザンブロットハイブリダイゼーションによって測定する。化合物の細胞毒性は並行する培養物のMTTアッセイによって決定する。
ウッドチャック肝炎ウイルス(WHV)はHBVに対する治療を評価することに役立つモデルである。したがって、リード化合物がWHVに対して活性的であるかどうかを知ることは、計画を立てるのに有益である。一次ウッドチャック肝細胞の培養物(PWHC)は、WHVを含む肝細胞の50−90%がWHVを有する条件下で、慢性的に感染したウッドチャックから得られた少区分の生検より得られた、コラゲナーゼ処理組織を播種することによって調製されるものであって、培養物(90%またはそれ以上)は肝細胞であり、少なくとも2か月は培養物で維持することができ、これは以前に行われたとおりである(Fletcher SP,et al.2012。Transcriptomic analysis of the woodchuck model of chronic hapatitis B.Hepatology:In pressを参照)。播種の7日以内に、培養物を試験化合物の非存在下または存在下でインキュベートし、培地内(WHVビリオン関連DNA;WHs)および細胞内(WHV DNA、WHV RNA転写物)のWHV遺伝子産物の量は、以前に使用され開示されたもの(Guo、H.、et al.2010.Production and function of the cytoplasmic deproteinized relaxed circular DNA of hepadnaviruses.JVirol84:387−396;Guo、et al.2011.Alkylated porphyrins have broad antiviral activity against hepadnaviruses、flaviviruses、filoviruses、and arenaviruses.Antimicrob Agents Chemother 55:478−486)と同様な方法を使って決定する。
一次的なスクリーニングで同定されたそれぞれの化合物は、HDACの阻害活性(例えば、表1を参照)を有するという性質を共有する。おそらくHDACの阻害は、これらの化合物のHBVに対する抗ウイルス性の作用のメカニズムの一部、または中心のいずれかである。化合物のメカニズムを正確に知ることは必要ではないが、この情報は修飾化合物の選択または設計、ならびに潜在的な生体内毒性の予想および低減、ならびに臨床研究の設計に役立つであろう。また多くのHDACの結晶構造が入手可能であるため、将来的な薬品の設計が補助され得る。まとめると、研究においてならびに人々において、HDACの阻害剤の増大する経験は、現在の臨床の設計および将来の計画に方向性を提供し得るものである。
HBV cccDNAの制御に関与する特定のHDACアイソザイムを同定したので、HBV cccDNAを制御するアイソザイムの阻害に対して最大の選択性を有する化合物を同定することは有益である。このことは最大の選択性のある化合物の発展を可能にし、ならびにHBV cccDNAの制御に関与していないHDACアイソザイムを不必要に阻害することからもたらされるオフターゲット効果を回避するのに役立つ。上記表1に表示している4つの化合物のそれ、すなわちアピシジンは最高の選択指数を有しており、ならびにまた最も狭いHDACの阻害プロフィール(HDACクラスIに選択的)を有するものである。したがって、広範なHDAC阻害剤を避けること、およびHBV cccDNAを抑制するのに十分な特定のHDACサブアイソザイムに注目することによって、より高い選択性を達成することが可能である。
序論および原理 生体内実験は高価であり、倫理的に制限されるものである。動物で実験する前に、生体内での性能を可能な範囲で予測する、潜在的な毒性および他の細胞−血清相互作用的な性質について、化合物を最初に特性評価することは賢明である。これらの研究はこの分野では標準になっている。細胞複製に対する毒性も、毒性に関して化合物をランキングするのに良い方法であることが見出されている。最後に、生体内での作業に移る前に、異なる配合組成もまた通常必要である。なぜなら、組織培養セッティングに使用する溶媒が常に生体内での投与と適合性のあるものとは限らないからである。これらは以下のとおり使用されている。通例のADMETに加えて、現在認可されている抗ウイルス治療の存在下で、HBV生産細胞で特性評価が行われている、生体外での「ADMET」における革新が提案されている。
生体外での有利特性を有するリード化合物をスケールアップし、生体内での毒性、薬物動態(PK)および有効性を試験する。
生体外での有効性を実証し、生体内での働きのために投薬することの安全性および理論的根拠を決定した後、リード化合物が慢性HBVの検証動物モデルにおいてウイルスのレベルを制御できるかどうかを知ることは重要である。これは、cccDNAを標的とする小分子薬が動物において試験されているであろう最初の機会を表す。安全で、選択的で、かつcccDNA標的化剤とする一致した結果が重要である。有効なエンドポイントは、ウイルス血症、抗原血症における、肝臓内(intra-liver)cccDNAおよびcccDNAの抑制の指標となる複製型の総量と同様の、急速でかつ協調的な減少を含む。これらの標的は、用いられた動物モデル、および試験された処置の長さを必要とする。
本発明の化合物は後述する一般的な方法および手順を使用する、容易に手に入る出発物質から製造することができる。典型的または適切なプロセスの条件(例えば、反応の温度、時間、反応物のモル比、溶媒、圧力など)が挙げられ、他のプロセスの条件も特に明記しない限りは使用することができる。最適な反応の条件は特定の反応物または用いられる溶媒により異なるかもしれないが、このような条件は当業者の日常的な最適化手順によって決定することができる。
アピシジンは誘導化され、最近の類似体1および2
Claims (12)
- B型肝炎ウイルスの共有結合閉環状DNA(cccDNA)の転写の抑制における使用のための、クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤を含む組成物。
- B型肝炎を処置するための、請求項1に記載の組成物。
- クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤が、トリコスタチンA、スベロイルビスヒドロキサム酸、4−(ジメチルアミノ)−N−[7−(ヒドロキシアミノ)−7−オキソヘプチル]ベンズアミド、アピシジン、
、または式:
式中、
R1は、−(CH2)n−であり;
R2は、3,5−トリアゾリルまたは−C(Z)N(R4)−であり;
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R5は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、または−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOHであり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3であり;
Zは、H2またはOであり;
R8は、アルキルまたはカルボキシアルキルであり;
nは、0〜2から選択される整数であり;
mは、0〜6から選択される整数であり;
qは、0〜3から選択される整数である、
で示される化合物、
またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩である、請求項1または2に記載の組成物。 - クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤が、アピシジン、
、または式
式中、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R5は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3である、
で示される化合物、
またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩である、請求項1または2に記載の組成物。 - クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤が、式(I):
式中、
R1は、−(CH2)n−または−C(=O)−であり;
R 2 およびR 3 は、次のように選択され:(a)R 2 が3,5−トリアゾリルまたは−C(Z)N(R 4 )−であり、R 3 が−CH(R 5 )−であるか、または(b)R 2 が窒素であり、R 3 が−CH−であり、R 2 およびR 3 が共にピペリジニルを形成する;
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R 5 は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、または−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOHであり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3であり;
Zは、H2またはOであり;
R7は、水素またはアルコキシであり;
R8は、アルキルまたはカルボキシアルキルであり;
nは、0〜2から選択される整数であり;
mは、0〜6から選択される整数であり;
qは、0〜3から選択される整数である、
で示される化合物
またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩である、請求項1または2に記載の組成物。 - B型肝炎ウイルスを調節する更なる剤の治療有効量を更に含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物。
- 生体外系においてB型肝炎ウイルスの共有結合閉環状DNAを抑制する方法であって、クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤を、B型肝炎ウイルスに接触させることを含む、前記方法。
- 前記クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤は、トリコスタチンA、スベロイルビスヒドロキサム酸、4−(ジメチルアミノ)−N−[7−(ヒドロキシアミノ)−7−オキソヘプチル]ベンズアミド、アピシジン、または式:
式中、
R1は、−(CH2)n−であり;
R2は、3,5−トリアゾリル、または−C(Z)N(R4)−であり;
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R5は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、または−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOHであり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3であり;
Zは、H2またはOであり;
R8は、アルキルまたはカルボキシアルキルであり;
nは、0〜2から選択される整数であり;
mは、0〜6から選択される整数であり;
qは、0〜3から選択される整数である、
で示される化合物、
またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩である、請求項7に記載の方法。 - 前記クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤は、アピシジン、
、または式
式中、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R5は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3である、
で示される化合物、
またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩である、請求項7に記載の方法。 - 前記クラスIヒストン脱アセチル化酵素活性の阻害剤は、式(I):
式中、
R1は、−(CH2)n−または−C(=O)−であり;
R 2 およびR 3 は、次のように選択され:(a)R 2 が3,5−トリアゾリルまたは−C(Z)N(R 4 )−であり、R 3 が−CH(R 5 )−であるか、または(b)R 2 が窒素であり、R 3 が−CH−であり、R 2 およびR 3 が共にピペリジニルを形成する;
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R 5 は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
R6は、−(CH2)mC(X)Y、−(CH2)2CH3、または−(CH2)q−フェニル−(CH2)mC(=O)NHOHであり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3であり;
Zは、H2またはOであり;
R7は、水素またはアルコキシであり;
R8は、アルキルまたはカルボキシアルキルであり;
nは、0〜2から選択される整数であり;
mは、0〜6から選択される整数であり;
qは、0〜3から選択される整数である、
で示される化合物、
またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩である、請求項7に記載の方法。 - B型肝炎ウイルスを調節する更なる剤をB型肝炎ウイルスに接触させることを更に含む、請求項7〜10のいずれか一項に記載の方法。
- 式(ii)
式中、
R4は、水素、アルキル、アリール、アラルキル、ジアルキルアミノアルキル、またはカルボキシアルキルであり;
R5は、水素、−CH3、またはαアミノ酸の側鎖基であり;
Xは、=O、H2、=N−NH2、または=N−NH−C(=O)NH2であり;
Yは、NHOHまたは−CH2CH3である、
で示される化合物、またはその立体異性体もしくは薬学的に許容可能なその塩。
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