JP6783655B2 - (r)−レチクリンおよびその前駆体を製造するための組成物および方法 - Google Patents
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Description
本特許協力条約出願は、米国特許法第119(e)項に基づいて、2013年12月04日に出願された米国の仮特許出願第61/911,759号明細書および2014年9月15日に出願された米国仮特許出願第62/050,399号明細書の利益を主張するものであり、これらは両方とも、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
(a)ベンジルイソキノリン誘導体を準備するステップと、
(b)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体へのベンジルイソキノリン誘導体の変換を可能にする条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体に変換することができる酵素混合物とベンジルイソキノリン誘導体を接触させるステップと
を含む方法の少なくとも1つの実施形態を提供する。
(a)ベンジルイソキノリン誘導体を準備するステップと、
(b)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体へのベンジルイソキノリン誘導体の変換を可能にする条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体に変換することができる酵素混合物とベンジルイソキノリン誘導体を接触させるステップと
を含み、
ベンジルイソキノリン誘導体は、化学式(I):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有し;かつ(R)−レチクリン前駆体は、化学式(II):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有するが、化学式(II)は(R)−レチクリンを除外する方法の少なくとも1つの実施形態を提供する。
で示される。
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有する酸化ベンジルイソキノリン誘導体を形成させることができる第1のポリペプチドと、酸化ベンジルイソキノリン誘導体(IV)を還元して、(R)−レチクリンまたは化学式(II):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
(ただし、化学式(II)は(R)−レチクリンを除外する)を有する(R)−レチクリン前駆体を形成させることができる第2のポリペプチドとを含む。
(a)作動可能に連結される成分として、
(i)CYP450およびAKRからなる群から選択されるポリペプチドの1つまたは複数をコードする1つまたは複数の核酸配列と、
(ii)宿主細胞における発現を制御することができる1つまたは複数の核酸配列と
を含むキメラ核酸配列を準備するステップと、
(b)キメラ核酸配列を宿主細胞に導入し、宿主細胞を増殖させて、CYP450およびAKRからなる群から選択されるポリペプチドを産生させるステップと、
(c)CYP450およびAKRからなる群から選択されるポリペプチドを宿主細胞から回収するステップと
を含む方法を提供する。
(a)作動可能に連結される成分として、
(i)CYP450ポリペプチドをコードする第1の核酸配列と、
(ii)AKRポリペプチドをコードする第2の核酸配列と、
(iii)宿主細胞における発現を制御することができる1つまたは複数の核酸配列と
を含むキメラ核酸配列を準備するステップと、
(b)キメラ核酸配列を宿主細胞に導入し、宿主細胞を増殖させて、CYP450およびAKRを産生させ、かつ(R)−レチクリンまたは化学式(II)を有する(R)−レチクリン前駆体を産生させるステップと、
(c)(R)−レチクリンまたは化学式(II)を有する(R)−レチクリン前駆体を回収するステップと
を含む方法を提供する。
(a)作動可能に連結される成分として、CYP450ポリペプチドをコードする第1の核酸配列と、細胞におけるこの第1の核酸配列の発現を制御する第1の核酸配列とを含む第1のキメラ核酸配列を準備するステップと、
(b)作動可能に連結される成分として、AKRポリペプチドをコードする第2の核酸配列と、細胞におけるこの第2の核酸配列の発現を制御する第2の核酸配列とを含む第2のキメラ核酸配列を準備するステップと、
(c)第1および第2のキメラ核酸配列を宿主細胞に導入し、宿主細胞を増殖させて、CYP450およびAKRを産生させ、かつ(R)−レチクリンまたは化学式(II)を有する(R)−レチクリン前駆体を産生させるステップと、
(d)(R)−レチクリンまたは化学式(II)を有する(R)−レチクリン前駆体を回収するステップと
を含む方法を提供する。
(a)AKRおよび/またはCYP450をコードする核酸配列を含むと推測される試料を準備するステップと、
(b)AKRおよび/またはCYP450をコードするヌクレオチド配列の存在について試料を分析するステップと
を含む方法を提供する。
(a)AKRおよび/またはCYP450を天然に発現する細胞を準備するステップと、
(b)細胞を突然変異誘発させるステップと、
(c)細胞を増殖させて複数の細胞を得るステップと、
(d)この複数の細胞が、レベル調節されたAKRおよび/またはCYP450を含む細胞を含むか否かを判定するステップと
を含む方法を提供する。
(a)AKRおよび/またはCYP450を発現する細胞を準備するステップと、
(b)細胞におけるAKRおよび/またはCYP450の発現をサイレンシングするステップと
を含む方法を提供する。
(a)ベンジルイソキノリン誘導体を準備するステップと、
(b)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体へのベンジルイソキノリン誘導体の変換を可能にする条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体に変換することができる酵素混合物とベンジルイソキノリン誘導体を接触させるステップと
を含む方法の少なくとも1つの実施形態を提供する。
(a)ベンジルイソキノリン誘導体を準備するステップと、
(b)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体へのベンジルイソキノリン誘導体の変換を可能にする条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体に変換することができる酵素混合物とベンジルイソキノリン誘導体を接触させるステップと
を含み、
ベンジルイソキノリン誘導体は、化学式(I):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有し;かつR−レチクリン前駆体は、化学式:
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有する方法の少なくとも1つの実施形態を提供する。
「ベンジルイソキノリン誘導体」という用語は、化学式(VII):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ独立にまたは同時に、水素原子、ヒドロキシル基、アルキル基(例えば、C1〜C10−アルキル)またはアルコキシ基(例えば、C1〜C10−アルコキシ)であり、R5は水素原子またはアルキル基(例えば、C1〜C10−アルキル)を表す]を有する化合物を指す。
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ独立にまたは同時に、水素原子、ヒドロキシル基、アルキル基(例えば、C1〜C10−アルキル)またはアルコキシ基(例えば、C1〜C10−アルコキシ)であり、R5は、水素原子またはアルキル基(例えば、C1〜C10−アルキル)を表す]を有する化合物を指すが、化学式(VIII)は(R)−レチクリンを除外する、すなわち、本明細書で使用する(R)−レチクリン前駆体という用語から具体的に除外されるのは、R1がメトキシ基、R2がヒドロキシル基、R3がヒドロキシル基、R4がメトキシ基、R5がメチル基である化合物である。
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ独立にまたは同時に、水素原子、ヒドロキシル基、アルキル基(例えば、C1〜C10−アルキル)またはアルコキシ基(例えばC1〜C10−アルコキシ)であり、R5は、水素原子またはアルキル基(例えば、C1〜C10−アルキル)を表す]を有する化合物を指す。
(R)−レチクリンおよび(R)−レチクリン前駆体の合成
本開示は、少なくとも1つの態様において、(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を製造する少なくとも1つの実施形態であって、
(a)ベンジルイソキノリン誘導体を準備するステップと、
(b)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体へのベンジルイソキノリン誘導体の変換を可能にする条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体に変換することができる酵素混合物とベンジルイソキノリン誘導体を接触させるステップと
を含み、
ベンジルイソキノリン誘導体は、化学式(I):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有し;また(R)−レチクリン前駆体は、化学式(II):
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;
R5は、水素原子またはメチル基を表す]
を有するが、化学式(II)は(R)−レチクリンを除外する実施形態を提供する。
(a)(S)−レチクリンを準備するステップと、
(b)(S)−レチクリンの(R)−レチクリンへの変換を可能にする条件下で、(S)−レチクリンを(R)−レチクリンに変換することができる酵素混合物と(S)−レチクリンを接触させるステップと
を含む方法を提供する。
[式中、好ましい実施形態では、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;R5は、好ましい実施形態では、水素原子またはメチル基を表す]を有する酸化ベンジルイソキノリン誘導体を形成させることができる第1のポリペプチドと、化学式(IV)を有する酸化ベンジルイソキノリン誘導体を還元して、(R)−レチクリンまたは化学式(II)[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基を表し;R5は、水素原子またはメチル基を表す](ただし、化学式(II)は(R)−レチクリンを除外する)を有する(R)−レチクリン誘導体を形成させる第2のポリペプチドとを含む。
(a)(R)−レチクリンを準備するステップと、
(b)(R)−レチクリンの1,2−デヒドロレチクリンへの変換を可能にする条件下で、(R)−レチクリンを1,2−デヒドロレチクリンに変換することができるAKRポリペプチドと(R)−レチクリンを接触させるステップと
を含む方法を提供する。前述の反応を行なうために使用することができるAKRポリペプチドには、配列番号59〜配列番号115;配列番号327;配列番号329;配列番号330;および配列番号340に示す任意のポリペプチドが含まれる。この変換を可能にする反応条件には、反応混合物における、酸化剤、好ましくはNAD+またはNADP+の存在が含まれる。上記のように、反応のためのpHは、最適化することができる。前述の反応の可逆性についてさらに図2に示す。
本開示の特定の態様によれば、in vitro反応条件下でベンジルイソキノリン誘導体の酵素触媒化学変換を可能にする反応条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を、触媒量の酵素CYP450およびAKRと接触させる。そのようなin vitro反応条件下で、開始反応成分は多かれ少なかれ純粋な形態で準備され、必要な化学反応が実質的に進行することを可能にする条件下で混合される。開始ベンジルイソキノリン誘導体の実質的に純粋な形態を購入することができる。(S)−レチクリンは、例えば、実質的に純粋な化合物として(例えば、Santa Cruz Biotechnology Inc.から)購入することも、前駆化合物から化学的に合成することも、パパヴェル・ソムニフェルム(Papaver somniferum)および所望のそのような化合物を含む植物のケシ科(Papaveraceae)、クスノキ科(Lauraceae)、バンレイシ科(Annonaceae)、トウダイグサ科(Euphorbiaceae)、またはクワ科(Moraceae)の他のメンバーを含む天然供給源から単離することも可能である。適切なケシ科(Papaveraceae)メンバーとしては、以下に限定されるものではないが、ケシ(Papaver)属、キケマン(Corydalis)属;クサノオウ(Chelidonium)属;およびロメリア(Romeria)属に属する種が挙げられる。そのような種は、(S)−レチクリンを作ることができる可能性があり、そのような種としては、以下の限定されるものではないが、種チェリドニウム・マジョス(Chelidonium majus);コリダリス・ブルボサ(Corydalis bulbosa);コリダリス・カヴァ(Corydalis cava);コリダリス・オコテニス(Corydalis ochotenis);コリダリス・オフィオカルパ(Corydalis ophiocarpa);コリダリス・プラティカルパ(Corydalis platycarpa);コリダリス・ツベロサ(Corydalis tuberosa);パパヴェル・アルメニアクム(Papaver armeniacum);パパヴェル・ブラクテアツム(Papaver Bracteatum);パパヴェル・シリンドリクム(Papaver cylindricum);パパヴェル・デカイスネイ(Papaver decaisnei);パパヴェル・フガクス(Papaver fugax);パパヴェル・オレオフィルム(Papaver oreophyllum);パパヴェル・オリエンタレ(Papaver orientale);パパヴェル・パエオニフォリウム(Papaver paeonifolium);パパヴェル・ペルシクム(Papaver persicum);パパヴェル・シュードオリエンタレ(Papaver pseudo−orientale);パパヴェル・ロエアス(Papaver rhoeas);パパヴェル・ロパロテセ(Papaver rhopalothece);パパヴェル・セティゲルム(Papaver setigerum);パパヴェル・ソムニフェルム(Papaver somniferum);パパヴェル・タウリコルム(Papaver tauricolum);パパヴェル・トリニアエフォリウム(Papaver triniaefolium);およびロメリア・カリカ(Romeria carica)から選択される植物種が挙げられる。(S)−レチクリンの化学合成は、例えば、S.Teitel and A.Bross,Journal of Heterocyclic Chemistry 5,825−829,1968に記載されるような標準的方法を使用して行うことができる。
(a)作動可能に連結される成分として、
(i)CYP450およびAKRからなる群から選択されるポリペプチドの1つまたは複数をコードする1つまたは両方の核酸配列と、
(ii)宿主細胞における発現を制御することができる1つまたは複数の核酸配列と
を含むキメラ核酸配列を準備するステップと、
(b)キメラ核酸配列を宿主細胞に導入し、宿主細胞を増殖させて、CYP450およびAKRからなる群から選択されるポリペプチドを産生させるステップと、
(c)CYP450およびAKRからなる群から選択されるポリペプチドを宿主細胞から回収するステップと
を含む方法を提供する。
本開示の特定の態様によれば、in vivo反応条件下でベンジルイソキノリン誘導体の酵素触媒化学変換を可能にする反応条件下で、ベンジルイソキノリン誘導体を、触媒量の酵素CYP450およびAKRの1つまたは複数と接触させる。そのようなin vivo反応条件下で、生細胞は、(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を産生するように改変される。特定の実施形態では、生細胞は、細菌細胞および真菌細胞を含む微生物である。他の実施形態では、生細胞は、植物および植物細胞培養物を含む多細胞生物である。
(a)作動可能に連結される成分として、
(i)CYP450ポリペプチドをコードする第1の核酸配列と、
(ii)AKRポリペプチドをコードする第2の核酸配列と、
(iii)宿主細胞における発現を制御することができる1つまたは複数の核酸配列と
を含むキメラ核酸配列を準備するステップと、
(b)キメラ核酸配列を宿主細胞に導入し、宿主細胞を増殖させて、CYP450およびAKRを産生させ、かつ(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を産生させるステップと、
(c)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を回収するステップと
を含む方法を提供する。
(b)作動可能に連結される成分として、CYP450ポリペプチドをコードする第1の核酸配列と、細胞におけるこの第1の核酸配列の発現を制御する第1の核酸配列とを含む第1のキメラ核酸配列を準備するステップと、
(c)作動可能に連結される成分として、AKRポリペプチドをコードする第2の核酸配列と、細胞におけるこの第2の核酸配列の発現を制御する第2の核酸配列とを含む第2のキメラ核酸配列を準備するステップと、
(c)第1および第2のキメラ核酸配列を宿主細胞に導入し、宿主細胞を増殖させて、CYP450およびAKRを産生させ、かつ(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を産生させるステップと、
(d)(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を回収するステップと
を含む方法を提供する。
(i)宿主細胞における発現を制御することができる核酸配列と、
(ii)CYP450をコードする核酸配列と
を含む組換え発現ベクターであって、宿主細胞における発現に適している発現ベクターを含む。
(i)宿主細胞における発現を制御することができる核酸配列と、
(ii)AKRをコードする核酸配列と
を含む組換え発現ベクターであって、宿主細胞における発現に適している発現ベクターを含む。
(i)宿主細胞における発現を制御することができる核酸配列と、
(ii)CYP450およびAKRをコードする核酸配列と
を含む組換え発現ベクターであって、宿主細胞における発現に適している発現ベクターを含む。「宿主細胞における発現に適している」という用語は、組換え発現ベクターが宿主細胞における発現を達成するのに必要な遺伝エレメントに連結された本開示のキメラ核酸配列を含むことを意味する。この点に関して発現ベクターに含むことができる遺伝エレメントとしては、転写終結領域、マーカー遺伝子をコードする1つまたは複数の核酸配列、1つまたは複数の複製起点等が挙げられる。好ましい実施形態では、発現ベクターはさらに、宿主細胞ゲノムにおける、ベクターまたはその一部の組込みに必要な遺伝エレメント、例えば、植物宿主細胞が使用される場合、植物の核ゲノムへの組込みを促進する、T−DNAの左側および右側境界配列を含む。
本開示に従って得られる(R)−レチクリンは、薬剤、治療剤、または医薬品として使用するために製剤化することができる。したがって、本開示はさらに、本開示の方法に従って調製された(R)−レチクリンを含む医薬組成物を含む。本開示による(R)−レチクリンを含む医薬製剤は、好ましくはさらに、ビヒクル、賦形剤、希釈剤、および補助物質、例えば、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝物質等を含む。これらのビヒクル、賦形剤、および補助物質は、一般に、過度の毒性を示すことなく投与することができる薬剤である。薬学的に許容される賦形剤としては、以下に限定されるものではないが、水、生理食塩水、ポリエチレングリコール、ヒアルロン酸、グリセリン、およびエタノールなどの液体が挙げられる。薬学的に許容される塩として、例えば、塩酸塩、リン酸塩、硫酸塩等の鉱酸塩;および酢酸塩、プロピオン酸塩、安息香酸塩等の有機酸塩もその中に含めることができる。安定剤として有用である薬学的に許容される賦形剤を製剤が含有することも、要求されるものではないが、好ましい。ペプチドに対する安定剤としても作用する適切な担体の例としては、限定されるものではないが、医薬品グレードのデキストロース、スクロース、ラクトース、ソルビトール、イノシトール、デキストラン等が挙げられる。他の適切な担体としては、これも限定されるものではないが、デンプン、セルロース、リン酸ナトリウムまたはカルシウム、クエン酸、グリシン、ポリエチレングリコール(PEG)、およびそれらの組合せが挙げられる。医薬組成物は、経口および静脈内投与、ならびに所望される他の投与経路のために製剤化することができる。投薬は多様であり得るものであり、ルーチン的な実験を使用して最適化することができる。(R)−レチクリンを含む医薬組成物は、脱毛症または筋肉緊張を処置するために使用することができる。
さらなる態様では、AKRおよび/またはCYP450をコードする核酸配列は、試料中の遺伝子の有無を検出するために使用することができる。したがって、本開示の一実施形態では、AKRおよび/またはCYP450をコードする核酸配列の有無を検出する方法であって、
(a)AKRおよび/またはCYP450をコードする核酸配列を含むと推測される試料を準備するステップと、
(b)AKRおよび/またはCYP450をコードするヌクレオチド配列の存在について試料を分析するステップと
を含む方法を提供する。
(a)細胞を準備するステップと、
(b)細胞からゲノムDNAを抽出するステップと、
(c)AKRおよび/またはCYP450をコードする核酸配列の存在についてゲノムDNAを分析するステップと
を含む方法を提供する。
(a)AKRおよび/またはCYP450を天然に発現する細胞を準備するステップと、
(b)細胞を突然変異誘発させるステップと、
(c)細胞を増殖させて複数の細胞を得るステップと、
(d)この複数の細胞が、レベル調節されたAKRおよび/またはCYP450を含む細胞を含むか否かを判定するステップと
を含む方法を提供する。
(e)レベル調節されたAKRおよび/またはCYP450を含む細胞を選択し、かつ複数の細胞を得るためにそのような細胞を増殖させるステップ。
(a)AKRおよび/またはCYP450を天然に発現する結実植物を準備するステップと、
(b)植物の種子を突然変異誘発して、突然変異誘発された種子を得るステップと、
(c)突然変異誘発された種子を生育して、次世代種子の実を結ばせることができる次世代突然変異誘発された植物にするステップと、
(d)次世代種子または突然変異誘発された植物の別の部分を得るステップと、次世代植物または次世代種子がAKRおよび/またはCYP450の調節された発現を示す場合、分析するステップと
を含む方法を提供する。
i.突然変異型植物からDNAを抽出するステップと、
ii.AKRおよび/またはCYP450をコードする核酸配列を含むDNAの一部を増幅して、増幅した突然変異型DNAを得るステップと、
iii.野生型植物からDNAを抽出するステップと、
iv.増幅した突然変異型DNAと野生型植物由来のDNAを混合してヘテロ二本鎖ポリヌクレオチドを形成させるステップと、
v.ミスマッチしたヘテロ二本鎖ポリヌクレオチドの領域に制限することができる一本鎖制限ヌクレアーゼとヘテロ二本鎖ポリヌクレオチドとをインキュベートするステップと、
vi.ヘテロ二本鎖ポリヌクレオチドにおけるミスマッチの部位を決定するステップと
を含む。
(a)AKRおよび/またはCYP450を発現する細胞を準備するステップと、
(b)細胞におけるAKRおよび/またはCYP450の発現をサイレンシングするステップと
を含む方法を含む。
(a)AKRおよび/またはCYP450を発現する植物を準備するステップと、
(b)ウイルス誘導遺伝子サイレンシングを使用して、植物におけるAKRおよび/またはCYP450の発現を低減するステップと
を含む方法を含む。
この実施例では、CYP450およびAKRの部分で構成される、パパヴェル・ソムニフェルム(Papaver somniferum)の融合ポリペプチド(配列番号323)の形態の酵素混合物を使用する、(S)−レチクリンの(R)−レチクリンへのin vitro変換が示される。
この実施例では、パパヴェル・ロエアス(Papaver rhoeas)のCYP450(配列番号325)を使用する、酵母における(S)−レチクリンの1,2−デヒドロレチクリンへのin vitro変換が示される。下記のように、pESC−leu2d::PsCPR/PrDRSを保持するサッカロミセス・セレビシア(Saccharomyces cerevisiae)株YPH499を増殖させ、ミクロソームを精製した。手短に言えば、2%グルコースを添加した、ロイシン不含合成完全(SC)培地中で、この酵母株を30℃で16時間、250rpmで増殖させた。この培養物の1ミリリットルを、1.8%ガラクトース、0.2%グルコース、および1%ラフィノースを添加した、ロイシン不含SC培地50mLに加え、30℃で72時間、250rpmで増殖させた。次いで、培養物を4,000gで5分間遠心分離し、TEK緩衝液(50mM Tris−HCl pH8、1mM EDTA、100mM KCl)5mLで洗浄した。次いで、ペレットを、TESB緩衝液(50mM Tris−HCl pH8、1mM EDTA、0.6Mソルビトール)1mLに再懸濁し、0.5mmのガラスビーズを等量加えた。チューブを10℃で4分間、手で振盪した。ビーズをTESBで洗浄し、洗浄液を集め、14,000gで10分間遠心分離した。次いで、上清を125,000gで1時間超遠心分離し、上清を廃棄した。次いで、ミクロソームを50mM HEPES pH7.5に再懸濁した。
この実施例では、パパヴェル・ロエアス(Papaver rhoeas)のAKR(配列番号327)を使用する、酵母における1,2−デヒドロレチクリンの(R)−レチクリンへのin vitro変換が示される。
この実施例では、CYP450およびAKRの部分で構成される、パパヴェル・ソムニフェルム(Papaver somniferum)の融合ポリペプチド(配列番号323)の形態の酵素混合物を使用する、酵母における(S)−N−メチルコクラウリンの(R)−N−メチルコクラウリンへのin vitro変換が示される。
この実施例では、ウイルス誘導遺伝子サイレンシング(VIGS)を使用する、AKRおよび/またはCYP450をコードする遺伝子のサイレンシングが示される。
この実施例では、還元剤NADHまたはNADPHの存在下でAKRポリペプチドにより触媒される1,2−デヒドロレチクリンの(R)−レチクリンへの変換が示される。この実施例ではさらに、酸化剤NAD+またはNADP+の存在下での前述の反応の可逆性が示される。
この実施例では、還元剤存在下および酸化剤存在下の両方におけるAKRポリペプチドのpH依存性が示される。
この実施例ではさらに、ウイルス誘導遺伝子サイレンシング(VIGS)を使用する、AKRおよび/またはCYP450をコードする遺伝子のサイレンシングを示す。
Claims (16)
- (R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を調製するための方法であって、
(a)宿主細胞に、
(i)作動可能に連結される成分として、配列番号325と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むシトクロムP450(CYP450)ポリペプチドをコードする第1の核酸配列と、細胞における第1の核酸配列の発現を制御する第2の核酸配列とを含む第1のキメラ核酸配列と、
(ii)作動可能に連結される成分として、配列番号327または配列番号329と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むアルド・ケト還元酵素(AKR)ポリペプチドをコードする第3の核酸配列と、細胞における前記第3の核酸配列の発現を制御する第4の核酸配列とを含む第2のキメラ核酸配列と、
を導入するステップと、
(b)前記宿主細胞を増殖させて(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を産生させるステップと、
を含むことを特徴とする方法。 - 請求項1に記載の方法において、前記CYP450ポリペプチドが、配列番号325のアミノ酸配列を含み、前記AKRポリペプチドが、配列番号327または配列番号329のアミノ酸配列を含むことを特徴とする方法。
- (R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を調製するための方法であって、
(a)作動可能に連結される成分として、
(i)シトクロムP450(CYP450)ポリペプチドをコードする第1の核酸配列と、
(ii)アルド・ケト還元酵素(AKR)ポリペプチドをコードする第2の核酸配列と、
(iii)宿主細胞における発現を制御することができる1つまたは複数の核酸配列と
を含むキメラ核酸配列を導入するステップと、
(b)前記宿主細胞を増殖させて、(R)−レチクリンまたは(R)−レチクリン前駆体を産生させるステップと
を含み、前記(R)−レチクリン前駆体が、化学式:
[式中、R1、R2、R3、およびR4はそれぞれ、水素原子、ヒドロキシル基、またはメトキシ基であり;
R5は、水素原子またはメチル基である]
を有するが、(R)−レチクリンが前記式から除外されており、
前記第1の核酸配列が、配列番号325と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードし、かつ、前記第2の核酸配列が、配列番号327または配列番号329と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、または、
前記キメラ核酸配列が、配列番号323と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む融合ポリペプチドをコードすることを特徴とする方法。 - 請求項3に記載の方法において、前記第1の核酸配列が、配列番号325のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードし、かつ、前記第2の核酸配列が、配列番号327または配列番号329のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、または、前記キメラ核酸配列が、配列番号323のアミノ酸配列を含む融合ポリペプチドをコードすることを特徴とする方法。
- 請求項3または4に記載の方法において、前記第1および第2の核酸配列が、CYP450ポリペプチドおよびAKRポリペプチドを含む融合ポリペプチドを産生させるために作動可能に連結されており、前記融合ポリペプチドが配列番号323のアミノ酸配列を含むことを特徴とする方法。
- 請求項1乃至5の何れか1項に記載の方法において、前記方法が、(R)−レチクリンを産生することを特徴とする方法。
- シトクロムP450(CYP450)ポリペプチドおよびアルド・ケト還元酵素(AKR)ポリペプチドを含む単離された組成物であって、
前記CYP450ポリペプチドが、配列番号325と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ、
前記AKRポリペプチドが、配列番号327または配列番号329と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、
または、
前記CYP450ポリペプチドおよび前記AKRポリペプチドが、配列番号323と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む融合ポリペプチドを形成することを特徴とする組成物。 - 請求項7に記載の組成物において、前記CYP450ポリペプチドが、配列番号325のアミノ酸配列を含み、かつ、前記AKRポリペプチドが、配列番号327または配列番号329のアミノ酸配列を含む、または、前記融合ポリペプチドが、配列番号323のアミノ酸配列を含むことを特徴とする組成物。
- 請求項7または8に記載の組成物において、前記融合ポリペプチドが、配列番号323のアミノ酸配列を含むことを特徴とする組成物。
- 作動可能に連結される成分として、
(a)宿主細胞における発現を制御することができる核酸配列と、
(b)(i)配列番号325と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むシトクロムP450(CYP450)ポリペプチド、および、配列番号327または配列番号329と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むアルド・ケト還元酵素(AKR)ポリペプチド、または、
(ii)配列番号323と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む融合ポリペプチドと、
をコードする核酸配列とを含む組換え発現ベクターであって、前記発現ベクターが、宿主細胞における発現に適していることを特徴とする組換え発現ベクター。 - 請求項10に記載のベクターにおいて、前記CYP450ポリペプチドが、配列番号325のアミノ酸配列を含み、かつ、前記AKRポリペプチドが、配列番号327または配列番号329のアミノ酸配列を含む、または、前記融合ポリペプチドが、配列番号323のアミノ酸配列を含むことを特徴とするベクター。
- 植物の外で(R)−レチクリンを製造する方法であって、
最適な条件下で、(S)−レチクリンを(R)−レチクリンに変換することができる1つまたは複数の酵素と(S)−レチクリンを接触させるステップと
を含み、
前記1つまたは複数の酵素が、
(a)配列番号325のアミノ酸配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むシトクロムP450(CYP450)ポリペプチド、および、配列番号327または配列番号329と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むアルド・ケト還元酵素(AKR)である、または、
(b)CYP450およびAKRポリペプチドを含み、かつ配列番号323と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を有する融合ポリペプチドであることを特徴とする方法。 - 請求項12に記載の方法において、前記CYP450ポリペプチドが配列番号325のアミノ酸配列を含み、かつ、前記AKRポリペプチドが、配列番号327または配列番号329のアミノ酸配列を含む、または前記融合ポリペプチドが、配列番号323のアミノ酸配列を含むことを特徴とする方法。
- a)(S)−レチクリンを1,2−デヒドロレチクリンへと酸化することができる第1のポリペプチド;および/または
b)1,2−デヒドロレチクリンを(R)−レチクリンへと還元することができる第2のポリペプチド
を発現するキメラ核酸を含む微生物であって、
前記第1のポリペプチドが配列番号325と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ、前記第2のポリペプチドが配列番号327または配列番号329と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、または、
前記第1および第2のポリペプチドが、配列番号323と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む融合ポリペプチドを形成することを特徴とする微生物。 - 請求項14に記載の微生物において、前記第1のポリペプチドが配列番号325のアミノ酸配列を含み、かつ、前記第2のポリペプチドが配列番号327または配列番号329のアミノ酸配列を含む、または、前記融合ポリペプチドが配列番号323のアミノ酸配列を含むことを特徴とする微生物。
- 請求項14または15に記載の微生物において、前記微生物が酵母であることを特徴とする微生物。
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