JP6810023B2 - 構造的に多様な複合脂質を分析するための方法、組成物およびキット - Google Patents
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Description
本出願は2014年7月30日出願の米国仮特許出願第62/031,099号の利益を主張し、その開示内容全体を参照により援用する。
本開示の一実施形態において、対象サンプル中の1または2以上の対応する脂質クラスに存在する脂質分子種の組成を表す内部標準として使用するための1または2以上の脂質分子混合物の合成方法であって、アシル基を少なくとも1つ有する脂質クラスについて、同位体標識された少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を、脂質骨格上の単一位置にアシル化反応を介して付着させるステップ;アシル基を少なくとも1つ有する脂質クラスについて、少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を、同位体標識された脂質骨格上の単一位置にアシル化反応を介して付着させるステップ;および、脂肪酸を少なくとも2つ有する脂質クラスについて、1つの同位体標識された脂肪酸を脂質骨格上の第1の位置にアシル化反応を介して付着させ、かつ、少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を脂質骨格上の別位置にアシル化反応を介して付着させるステップ;のうちの1または2以上を含み、少なくとも2種類の脂肪酸の混合物は、対象サンプル中の対応する脂質クラスに存在する脂肪酸を表し、混合物中の各脂肪酸は、対象サンプル中の対応する脂質クラスに存在する脂質分子種中の脂肪酸の存在比率を表す比率で存在する、方法が提供される。対応する脂質クラスは、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、1−モノアシルグリセロール、リン脂質、ホスファチジルコリン、o−ホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミン、p−ホスファチジルエタノールアミン、コレステリルエステル、リゾホスファチジルコリン、リゾホスファチジルエタノールアミン、リゾホスファチジルセリン、リゾホスファチジルイノシトール、リゾホスファチジルグリセロール、リゾホスファチジン酸、リゾCDP−ジアシルグリセロール、CDP−ジアシルグリセロール、スフィンゴミエリン、カルジオリピン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジン酸、セラミド、ラクトシルセラミド、グルコシルセラミド、フィトセラミド、6−ヒドロキシセラミド、セレブロシド、ガングリオシド、ワックスエステル、および、ワックスジエステルの1または2以上を含み得る。1または2以上の脂質分子混合物のそれぞれにおける1または2以上の脂肪酸混合物は、表1、表2、表3、表4、表5、表6または表7に記載の1または2以上の脂質分子種混合物を含み得る。1または2以上の脂質分子混合物のそれぞれにおける1または2以上の脂肪酸混合物は、表1、表2、表3、表4、表5、表6または表7に記載の1または2以上の脂質分子種混合物からなり得る。
本開示の一実施形態において、対象サンプル中の1または2以上の対応する脂質クラスに存在する脂質分子種の組成を表す1または2以上の脂質分子混合物を含む、内部標準として使用するための組成物であって、各脂質分子混合物は、脂質骨格上の単一位置に少なくとも2種類の同位体標識された脂肪酸の混合物を有する脂質骨格であって、アシル基を少なくとも1つ有する脂質クラスのための脂質骨格;脂質骨格上の単一位置に少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を有する同位体標識された脂質骨格であって、アシル基を少なくとも1つ有する脂質クラスのための脂質骨格;および、脂質骨格上の第1の位置に単一の同位体標識された脂肪酸を有し、かつ脂質骨格上の別位置に少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を有する脂質骨格であって、脂肪酸を少なくとも2つ有する脂質クラスのための脂質骨格;のうちの1または2以上を含み、少なくとも2種類の脂肪酸の混合物は、対象サンプル中の対応する脂質クラスに存在する脂肪酸を表し、混合物中の各脂肪酸は、対象サンプル中の対応する脂質クラスに存在する脂質分子種中の脂肪酸の存在比率を表す比率で存在する、組成物が提供される。脂質クラスは、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、1−モノアシルグリセロール、リン脂質、ホスファチジルコリン、o−ホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミン、p−ホスファチジルエタノールアミン、コレステリルエステル、リゾホスファチジルコリン、リゾホスファチジルエタノールアミン、リゾホスファチジルセリン、リゾホスファチジルイノシトール、リゾホスファチジルグリセロール、リゾホスファチジン酸、リゾCDP−ジアシルグリセロール、CDP−ジアシルグリセロール、スフィンゴミエリン、カルジオリピン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジン酸、セラミド、ラクトシルセラミド、グルコシルセラミド、フィトセラミド、6−ヒドロキシセラミド、セレブロシド、ガングリオシド、ワックスエステル、および、ワックスジエステルの1または2以上を含み得る。1または2以上の脂質分子混合物のそれぞれにおける1または2以上の脂肪酸混合物は、表1、表2、表3、表4、表5、表6または表7に記載の1または2以上の脂質分子種混合物を含み得る。1または2以上の脂質分子混合物のそれぞれにおける1または2以上の脂肪酸混合物は、表1、表2、表3、表4、表5、表6または表7に記載の1または2以上の脂質分子種混合物からなり得る。
本開示の一実施形態において、対象サンプル中に存在する脂質分子を検出または定量する方法であって、i)対象サンプル中の1または2以上の対応する脂質クラスに存在する脂質分子種の組成を表す1または2以上の脂質分子混合物を有する既知量の組成物を対象サンプルに添加するステップであって、該組成物は、a)脂質骨格上の単一位置に少なくとも2種類の同位体標識された脂肪酸の混合物を有する脂質骨格であって、アシル基を少なくとも1つ有する脂質クラスのための脂質骨格;b)脂質骨格上の単一位置に少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を有する同位体標識された脂質骨格であって、アシル基を少なくとも1つ有する脂質クラスのための脂質骨格;および、c)脂質骨格上の第1の位置に単一の同位体標識された脂肪酸を有し、かつ脂質骨格上の別位置に少なくとも2種類の脂肪酸の混合物を有する脂質骨格であって、脂肪酸を少なくとも2つ有する脂質クラスのための脂質骨格;のうちの1または2以上を含み、少なくとも2種類の脂肪酸の混合物は、対象サンプル中の対応する脂質クラスに存在する脂肪酸を表し、混合物中の各脂肪酸は、対象サンプル中の対応する脂質クラスに存在する脂質分子種中の脂肪酸の存在比率を表す比率で存在する、ステップ;および、ii)脂質分子種の組成を表す1または2以上の脂質分子混合物を有する組成物を内部標準として使用して、対象サンプル中の1または2以上の対応する脂質クラスのそれぞれに存在する脂質分子種を検出または定量するステップ、を含む方法が提供される。
一般的に、本開示のキットは、1または2以上の内部標準と、対象サンプル中の脂質を検出および/または定量するために内部標準を使用するための指示書とを含む。キットは、1または2以上の対照サンプルおよびサンプル収集レセプタクルを更に含み得る。キット中の各内部標準組成物は、1または2以上の脂質クラスの様々な組み合わせで一緒にパッケージ化され得るか、あるいは、それぞれ別個のバイアルまたは容器内にパッケージ化され得る。キットは、調製・使用のための指示を記載したラベルおよび/または添付文書、試料収集用レセプタクル、輸送用容器、および/または、出荷用封筒を含み得る。別個に梱包される更なるキットのコンポーネントには、対象サンプル中の脂質を検出および/または定量するためのバッファーおよび他の試薬が含まれ得る。
脂質代謝物含有量または脂質分子含有量のアッセイは、体液サンプル(例えば、血液、血漿、尿、脳脊髄液(CSF))、組織サンプル、細胞サンプル、皮膚サンプル、溶液、複合混合物、in vitro培養細胞、および、細胞培地などの任意のサンプルタイプについて実施され得る。いくつかの実施形態において、脂質分子の量は、脂質の複合混合物、血液、血漿、血清、単離リポタンパク質分画、唾液、尿、リンパ液、および、脳脊髄液からなる群から選択される1または2以上のサンプルから決定される。いくつかの実施形態において、アッセイは、全血液、血漿、血清または単離リポタンパク質分画について行われ得る。またいくつかの実施形態において、1または2以上のサンプルは血漿または血清である。
実施例1:内部標準混合物の合成組成物
広範な脂質クラス(例えば、リン脂質)毎に単一の内部標準のみを通常使用する従来のリピドミクス戦略とは対照的に、本発明では、脂肪酸の混合物(脂質クラス毎に最大10個の脂肪酸)を含む内部標準を合成した。内部標準混合物(IS混合物)中の脂肪酸は、分析対象のサンプルタイプに存在する脂質クラスに見出される化学構造(脂質分子種)の多様性を表すように選択した。表1に示す各脂肪酸の濃度は各脂質クラスについて測定したものであり、脂質クラス内の残りの全ての脂肪酸は最も近い内部標準アナログに割り当て、また、その測定値を割り当てた。各脂質クラスについての総濃度は、その脂質クラスについての全ての分子種の値(測定値および割り当て値)を足すことにより計算した。
リン酸グリセロール頭部基から出発して、重水素標識パルミテート(16:0)をsn−1位にアシル化し、そして不飽和脂肪酸混合物をsn−2位にアシル化することにより、ホスファチジルコリン、o−ホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミンおよびp−ホスファチジルエタノールアミンについて例示のリン脂質内部標準を合成した。リン脂質、ホスファチジルコリンおよびホスファチジルエタノールアミンの標識戦略を図1に示す。
メタノール:ジクロロメタン抽出手順を使用して脂質をサンプルから抽出した。ジクロロメタン:メタノール(50:50)中の内部標準を抽出液に添加し、その後、一連の遠心・沈殿層回収工程を行った。1つに合わせた沈殿層のアリコートを窒素下で濃縮し、次いで10mM酢酸アンモニウムジクロロメタン:メタノール(50:50)0.25mLで戻した。インフュージョンMSを使用した分析のために、抽出物をインサートに移し、バイアルに入れた。インフュージョンMS分析を、Sciex SelexIonおよび500 QTRAPを組み合わせたnano PEEk tubingを用いたShimazdu LCで行った。サンプルはポジティブ・モードエレクトロスプレーおよびネガティブ・モードエレクトロスプレーの両方で分析した。5500 QTRAPスキャンをMRMモードで行ったところ、内部標準を含めて合計+1100MRMであった。
内部標準混合物の定量性能を評価するために、表1に示す内部標準の混合物を使用して、15個のヒト血清サンプル中の脂質分子種を測定した(トリプリケートで実施)。標識内部標準混合物下で血清サンプルから脂質を抽出し、上述の方法で脂質抽出物を分析した。トリプリケートサンプル中の1100個の測定脂質分子種のそれぞれの平均濃度を、内部標準混合物を使用して計算し、また、分析CVを計算して精度を求めた。15個のトリプリケートサンプルの平均濃度およびCV値を1100個の測定脂質分子種全てに対してプロットした。CV(%)と脂質分子種濃度との関係を示す散布図を図12に図示する。CVは最高濃度域における脂質分子種では低かったが、非常に低濃度(例えば、0.001μM)における所定の脂質分子種では10%と高かった。
((計算値−TrueMass値)/TrueMass値)×100
Claims (9)
- 異なる脂肪酸残基を含むコレステリルエステル(CE)の、同位体標識された内部標準組成物であって、
前記異なる脂肪酸残基は、16:0、16:1n7、18:1n9、18:2n6、20:3n6、20:4n6、20:5n3、および22:6n3を含む、内部標準組成物。 - 2以上の脂質クラスからの脂質分子種を含む、同位体標識された内部標準組成物であって、
前記脂質分子種のそれぞれは、
脂質骨格、1または2以上の脂肪酸残基、および、1または2以上の同位体標識を含み、
前記脂質分子種のそれぞれについて、
a)前記脂質骨格が1または2以上の同位体標識を含むか;または
b)前記1または2以上の脂肪酸残基が同位体標識を含み、
前記脂質分子種の前記2以上の脂質クラスは、
(i)異なる脂肪酸残基を含むコレステリルエステルであって、当該脂質分子種の脂質骨格に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、16:1n7、18:1n9、18:2n6、20:3n6、20:4n6、20:5n3、および22:6n3を含む、コレステリルエステルと、
(ii)下記(a)〜(e)のうちの1つ以上と、を含む、内部標準組成物:
(a)異なる脂肪酸残基を含むホスファチジルコリンまたはエーテル結合型ホスファチジルコリンであって、パルミテート(16:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:1n7、18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:3n6、20:4n6、20:5n3、22:4n6、22:5n3、および22:6n3を含む、ホスファチジルコリンまたはエーテル結合型ホスファチジルコリン;
(b)異なる脂肪酸残基を含むホスファチジルエタノールアミンまたはプラズマローゲン型ホスファチジルエタノールアミンであって、ステアレート(18:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:3n6、20:4n6、20:5n3、22:5n3、および22:6n3を含む、ホスファチジルエタノールアミンまたはプラズマローゲン型ホスファチジルエタノールアミン;
(c)異なる脂肪酸残基を含むスフィンゴミエリンであって、当該脂質分子種の脂質骨格に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、24:0、18:1n9、および24:1n9を含む、スフィンゴミエリン;
(d)異なる脂肪酸残基を含むジアシルグリセロールであって、脂質骨格は未標識であり、同位体標識パルミテート(16:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、18:0、18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:4n6、20:5n3、および22:6n3を含む、ジアシルグリセロール;および
(e)異なる脂肪酸残基を含むトリアシルグリセロールであって、脂質骨格は未標識であり、同位体標識パルミテート(16:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、18:0、18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:3n6、20:4n6、および22:6n3を含む、トリアシルグリセロール。 - 同位体標識が2H、13Cまたは15Nを含む、請求項1または2に記載の内部標準組成物。
- 5%CE16:0
5%CE16:1n7
20%CE18:1n9
50%CE18:2n6
5%CE20:3n6
5%CE20:4n6
5%CE20:5n3
5%CE22:6n3
を含む、請求項1に記載の内部標準組成物。 - 異なる脂肪酸残基を含むコレステリルエステル(CE)の、同位体標識された内部標準組成物の合成方法であって、
異なる脂肪酸残基を、1または2以上の同位体標識を有するコレステロール頭部基にアシル化反応を介して付着させるステップを含み、
前記異なる脂肪酸残基は、16:0、16:1n7、18:1n9、18:2n6、20:3n6、20:4n6、20:5n3、および22:6n3を含む、方法。 - 2以上の脂質クラスからの脂質分子種を含む同位体標識された内部標準組成物の合成方法であって、前記脂質分子種のそれぞれは、脂質骨格、1または2以上の脂肪酸残基、および、1または2以上の同位体標識を含み、前記脂質分子種のそれぞれについて、
前記1または2以上の脂肪酸残基を、前記脂質骨格上の単一位置にアシル化反応を介して付着させるステップであって、前記1または2以上の脂肪酸残基が同位体標識されているステップ;および
前記1または2以上の脂肪酸残基を、前記脂質骨格上の単一位置にアシル化反応を介して付着させるステップであって、前記脂質骨格が同位体標識されているステップ;のうちの1以上を含み、
前記脂質分子種の前記2以上の脂質クラスは、
(i)異なる脂肪酸残基を含むコレステリルエステルであって、当該脂質分子種の脂質骨格に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、16:1n7、18:1n9、18:2n6、20:3n6、20:4n6、20:5n3、および22:6n3を含む、コレステリルエステルと、
(ii)下記(a)〜(e)のうちの1つ以上と、を含む、内部標準組成物の合成方法:
(a)異なる脂肪酸残基を含むホスファチジルコリンまたはエーテル結合型ホスファチジルコリンであって、パルミテート(16:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:1n7、18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:3n6、20:4n6、20:5n3、22:4n6、22:5n3、および22:6n3を含む、ホスファチジルコリンまたはエーテル結合型ホスファチジルコリン;
(b)異なる脂肪酸残基を含むホスファチジルエタノールアミンまたはプラズマローゲン型ホスファチジルエタノールアミンであって、ステアレート(18:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:3n6、20:4n6、20:5n3、22:5n3、および22:6n3を含む、ホスファチジルエタノールアミンまたはプラズマローゲン型ホスファチジルエタノールアミン;
(c)異なる脂肪酸残基を含むスフィンゴミエリンであって、当該脂質分子種の脂質骨格に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、24:0、18:1n9、および24:1n9を含む、スフィンゴミエリン;
(d)異なる脂肪酸残基を含むジアシルグリセロールであって、脂質骨格は未標識であり、同位体標識パルミテート(16:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、18:0、18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:4n6、20:5n3、および22:6n3を含む、ジアシルグリセロール;および
(e)異なる脂肪酸残基を含むトリアシルグリセロールであって、脂質骨格は未標識であり、同位体標識パルミテート(16:0)残基が当該脂質分子種の脂質骨格に第1の位置において結合し、かつ、脂質骨格の別位置に結合する前記異なる脂肪酸残基は16:0、18:0、18:1n9、18:2n6、18:3n3、20:3n6、20:4n6、および22:6n3を含む、トリアシルグリセロール。 - 前記内部標準組成物は、
5%CE16:0
5%CE16:1n7
20%CE18:1n9
50%CE18:2n6
5%CE20:3n6
5%CE20:4n6
5%CE20:5n3
5%CE22:6n3
を含む、請求項5に記載の方法。 - (i)請求項1または2に記載の内部標準組成物の1または2以上と;、
(ii)対象サンプル中に存在する脂質分子種を検出または定量するために、請求項1に記載の前記コレステリルエステルおよび/または請求項2に記載の前記脂質分子種を内部標準として使用するための指示と、を含むキット。 - 前記脂質分子種の少なくとも1つは、1または2以上の同位体標識を有する脂質骨格を含み、前記脂質分子種の少なくとも1つは、1または2以上の同位体標識を有する脂肪酸残基を含む、請求項2に記載の内部標準組成物。
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