JP7217043B2 - Pcsk9発現を特徴とする癌の治療のための組成物および方法 - Google Patents
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Description
本出願は、2018年6月25日に出願された米国仮特許出願第62/689,288号明細書および2018年11月26日に出願された米国仮特許出願第62/771,293号明細書の優先権を主張し、参照によりその全体を本明細書に組み込む。
本明細書で使用される場合、「治療」、「療法」および/または「治療レジメン」は、患者が呈するか患者が感受性であり得る疾患、障害または生理学的状態に応答して行われる臨床的介入を指す。治療の目的には、症状の緩和または予防、疾患、障害または状態の進行または悪化の遅延または停止、および/または疾患、障害または状態の寛解が含まれる。
本開示は、部分的に、PCSK(プロタンパク質転換酵素サブチリシン/ケキシン9型前駆体)が癌治療の新規の標的であるという本発明者らによる発見に基づいている。PCSK9は、肝細胞および他の細胞型のLDL-R(低密度リポタンパク質受容体)レベルの調節に重要な役割を果たすことが知られている分泌タンパク質である。PCSK9は、LDL-Rに結合し、宿主細胞内でその分解を促進することにより、LDL-Rを負に調節する。これまで、PCSK9遺伝子内の変異は、それらがPCSK9のLDL-R分解機能を増強するか減弱するかに応じて、LDL血中濃度を劇的に増加または低下させ得ることが分かっていた。
いくつかの実施形態では、PCSK9阻害剤は、PCSK9に対する拮抗性抗体を含み得る。抗体は、モノクローナル、ポリクローナル、単一ドメインまたはそれらの断片であり得る。本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」または「MAb」は、実質的に均質な抗体の集団(すなわち、いくつかの自然発生変異は例外である可能性があるが、個々の抗体が互いに同一である場合)由来の抗体を指すことを意味する。MAbは高度に特異的であり、単一の抗原部位に対するものであり、多くの場合、抗原上の単一の決定基に対するものである。抗体はさらにヒト化され得る。本明細書で使用される場合、「ヒト化」抗体は、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖、または非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限の配列を含むそれらの断片(Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2、または抗体の他の抗原結合部分配列など)である非ヒト(例えば、齧歯類)抗体の形態を指すことを意味する。多くのヒト化抗体は、レシピエントの相補性決定領域(CDR)由来の残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)のCDR由来の残基によって置き換えられているヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。
別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、融合タンパク質を含み得る。融合タンパク質またはキメラタンパク質とは、別個のタンパク質を元々コードしていた2つ以上の遺伝子の結合によって作成されたタンパク質を指す。一実施形態では、PCSK9阻害剤は、アネキシンA2融合タンパク質を含み得る。別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、アネキシンA2-Fc融合タンパク質を含み得る。
別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、アドネクチンを含み得る。本明細書で使用される用語「アドネクチン」は、第10のフィブロネクチンIII型ドメインに基づいており、治療に関連する標的に高い親和性および特異性で結合するように設計された治療用タンパク質を指す。好適な例には、限定するものではないが、PCSK9阻害剤BMS-962476(Bristol Myers Squibb)が挙げられる。
PCSK9阻害分子は、RNAiをさらに含み得る。本明細書で使用される場合、「RNAi」は、転写後遺伝子サイレンシング(PTGS)法を含め、当技術分野で公知の遺伝子サイレンシング法のいずれかを含むことを意味する。これらには、限定するものではないが、マイクロRNA(miRNA);低分子干渉(siRNA);低分子ヘアピンRNA(shRNA);プライマリーマイクロRNA(pri-miRNA);非対称干渉RNA(aiRNA);低分子内部セグメント化干渉RNA(sisiRNA);メロデュプレックスRNA(mdRNA);RNA-DNAキメラ二重鎖;トランスキングダムRNA(tkRNA);tRNA-shRNA;タンデムsiRNA(tsiRNA);タンデムヘアピンRNA(thR A);pri-miRNA模倣クラスター(pri-miRNA mimic cluster);および転写遺伝子サイレンシング(TGS)のうちの任意の1つ以上が含まれ得る。一実施形態では、PCSK9阻害剤は、EDF-Aドメイン模倣ペプチドを含み得る。別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、PCSK9に対するRNAi、Alnylam/ALN-PCS02を含み得る。さらに別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、PCSK9に対するRNAi、Alnylam/The Medicines Company/ALN-PCSsc/インクリシランを含み得る。
他の実施形態では、PCSK9阻害剤は、アンチセンスオリゴヌクレオチドを含み得る。例には、Isis Pharmaceuticals/Bristol-Myers Squibb製のPCSK9アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 394814;BMS-PCSK9Rx)が挙げられる同様に、Santaris Pharma製のロック核酸(SPC4061;SPC5011;LNA ASO)は、マウスのPCSK9 mRNAレベルを低下させた。LNA ASOは、ヒトおよびマウスのPCSK9 mRNA(アクセッション番号NM174936およびNM153565)に相補的であり、以下の配列、すなわちGTctgtggaaGCG(大文字はLNA、小文字はDNA)と、ホスホロチオアートヌクレオシド間結合とを有する13ヌクレオチドの長いギャップマーである。Alnylam Pharmaceuticalsは、PCSK9の阻害に関するsiRNA(ALN-PCS)の臨床試験で肯定的な結果を示している。いくつかのPCSK9阻害性オリゴヌクレオチドは、以下のような特許文献に記載されており、本開示の範囲内にある:SANTARIS PHARMA A/S(PCT/EP2007/060703;PCT/EP2009/054499;PCT/EP2010/059257);ISIS PHARMACEUTICAL INC.(PCT/US2007/068404);SIRNA THERAPEUTICS INC.(PCT/US2007/073723);ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC.(PCT/US201 1/058682;PCT/US2010/047726;PCT/US2010/038707;PCT/US2009/032743;PCT/US2007/068655);RXI PHARMACEUTICALS CORP.(PCT/US2010/000019)INTRADIGM CORP.(PCT/US2009/036550);およびNASTECH PHARM CO.(PCT/US2008/055554)。
本発明の別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、PCSK9に対するペプチド系ワクチンであり得る。好ましい実施形態では、ペプチド系ワクチンは、AT04A[Affiris]、またはWIPO特許出願公開番号WO2011/027257に記載されているものなどの他のPCSK9ワクチンであり得る。
本発明の別の実施形態では、PCSK9阻害剤は、低分子阻害剤であり得る。好ましい実施形態では、低分子阻害剤は、SX-PCSK9[Serometrix]、またはWIPO特許出願公開番号WO2014/150395に記載されているものなどの他の低分子PCSK9阻害剤であり得る。上記の説明および図面は例示的なものであり、本発明を開示された正確な形態に限定するものと解釈されるべきではない。関連技術の当業者であれば、上記の開示に照らして多くの修正および変形が可能であることを理解することができる。本開示の完全な理解を提供するために、多数の特定の詳細が説明されている。ただし、特定の例では、説明を曖昧にすることを避けるために、周知のまたは従来の詳細は説明されていない。
PCSK9を阻害するために、PCSK9に結合するLDLRのEGFAドメインを模倣するペプチドが開発されている。同様に、EGF-Aペプチド、PCSK9に結合するフィブロネクチン系足場ドメインタンパク質、およびPCSK9変異体(例えば、Pro/Catドメインを有する)の中和が開発されており、これらはいずれもPCSK9活性を阻害することが示されている。いくつかのPCSK9阻害ペプチドは、以下のような特許文献に記載されており、本開示の範囲内にある:SCHERING CORP.(PCT US2009/044883);GENENTECH INC.およびHOFFMANN LA ROCHE(PCT US2012/043315);SQUIBB BRISTOL MYERS CO.(PCT/US201 1/032231;PCT/US2007/015298);ANGELETTI P 1ST RICHERCHE BIO(PCT/EP2011/054646);ならびにAMGEN INC.(PCT/US2009/034775)。
本発明による治療用組成物の投与は、好適な担体、賦形剤、および改善された伝達、送達、忍容性などを提供するために製剤に組み込まれる他の薬剤とともに投与され得る。あらゆる医薬品化学者に公知の処方集、すなわち、Remington’s Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Company,Easton,Pa.に、多数の適切な製剤を見出すことができる。これらの製剤は、例えば、粉末、ペースト、軟膏、ゼリー、ワックス、油、脂質、脂質(カチオン性またはアニオン性)含有小胞(LIPOFECTIN(登録商標)など)、DNA結合体、無水吸収ペースト、水中油および油中水エマルジョン、エマルジョンカーボワックス(様々な分子量のポリエチレングリコール)、半固体ゲル、およびカーボワックスを含有する半固体混合物を含む。例えば、Powell et al.“Compendium of excipients for parenteral formulations” PDA(1998)J Pharm Sci Technol 52:238-311を参照されたい。
本発明のいくつかの方法に従って個体に投与されるPCSK9阻害剤の量は、一般に、治療有効量であり得る。抗体を含むPCSK9阻害剤の場合、治療有効量は、約0.05mg~約600mg、例えば、約0.05mg、約0.1mg、約1.0mg、約1.5mg、約2.0mg、約10mg、約20mg、約30mg、約40mg、約50mg、約60mg、約70mg、約75mg、約80mg、約90mg、約100mg、約110mg、約120mg、約130mg、約140mg、約150mg、約160mg、約170mg、約180mg、約190mg、約200mg、約210mg、約220mg、約230mg、約240mg、約250mg、約260mg、約270mg、約280mg、約290mg、約300mg、約310mg、約320mg、約330mg、約340mg、約350mg、約360mg、約370mg、約380mg、約390mg、約400mg、約410mg、約420mg、約430mg、約440mg、約450mg、約460mg、約470mg、約480mg、約490mg、約500mg、約510mg、約520mg、約530mg、約540mg、約550mg、約560mg、約570mg、約580mg、約590mgまたは約600mgのPCSK9阻害剤であり得る。
本発明の特定の実施形態によれば、定義された時間経過にわたって、PCSK9阻害剤の複数用量を対象に投与してもよい。本発明のこの態様による方法は、対象に複数用量のPCSK9阻害剤を連続投与することを含み得る。本明細書で使用される場合、「連続投与」は、PCSK9阻害剤の各用量が、異なる時点で、例えば、所定の間隔(例えば、時間、日、週または月)によって隔てられた異なる日に、対象に投与されることを意味する。本発明は、PCSK9阻害剤の単一の初期用量、続いてPCSK9阻害剤の1つ以上の二次用量、および場合によりPCSK9阻害剤の1つ以上の三次用量を患者に連続投与することを含み得る方法を含む。
特定の実施形態によれば、本発明の方法は、本開示の医薬組成物の投与時または投与直前に癌の治療のための抗癌治療レジメンを受けている患者に、PCSK9阻害剤を含む医薬組成物を投与することを含み得る。例えば、以前にPCSK9発現を特徴とする癌(例えば、固形腫瘍または血液由来癌)と診断された患者が、PCSK9阻害剤を含む医薬組成物の投与の前および/または投与と同時に、別の薬剤の安定した治療レジメンを処方され、服用している場合がある。例えば、一実施形態では、PCSK9阻害剤は、少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤、抗癌治療、および/または血管新生因子の阻害剤と同時に投与され得る。他の実施形態では、PCSK9阻害剤は、少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤、抗癌治療、および/または血管新生因子の阻害剤の投与前に投与され得る。さらに他の実施形態では、PCSK9阻害剤は、少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤、抗癌治療、および/または血管新生因子の阻害剤の投与後に投与され得る。
ここで図1および図2を参照すると、PCSK9の阻害は、インビボで腫瘍増殖を有意に減弱することができる。図1で同定された2つのsgRNA配列を組換えレンチウイルスベクターにクローニングし、それぞれB16F10および4T1細胞に感染させるために使用した。ウエスタンブロット分析は、いずれかのsgRNA配列を使用して、B16F10および4T1細胞に対してPCSK9のノックアウトが成功したことを示している。
CRISPR-Cas9技術を使用して、4つの悪性マウス癌細胞株(B16F10、4T1、MC38、CT26)のPCSK9遺伝子をノックアウトした。PCSK9ノックアウトは、腫瘍細胞の形態もしくはインビトロ増殖速度、または軟寒天中で3Dコロニーを形成する能力を変化させなかった。
細胞株および組織培養
B16F10マウス黒色腫細胞、CT26マウス結腸癌、4T1マウス乳癌細胞、MDA-MB-231ヒト乳癌細胞は、Duke University School of MedicineのCell Culture Facilityから購入した。MC38マウス結腸腺癌細胞は、Dr.Takuya Osada(Duke University,School of Medicine)から入手した。B16F10、CT26、4T1、MC38、MDA-MB-231細胞はいずれも、10%ウシ胎児血清(FBS)ならびに100ユニット/mlペニシリンおよび100μg/mlストレプトマイシン抗生物質を含むDMEM(Sigma)中で増殖させた。いずれの細胞株も、ユニバーサルマイコプラズマ(Mycoplasma)検出キット(ATCC)を使用して、マイコプラズマ(mycoplasma)試験に定期的に供した。
レンチウイルスを介したCRISPR/Cas9技術を使用して、PCSK9ノックアウト細胞を作製した。オンラインCRISPR設計ツール(chopchop)を使用して、PCSK9遺伝子を標的とするシングルガイドRNA(sgRNA)配列を設計した。マウスおよびヒトのPCSK9遺伝子を標的とするsgRNA配列を以下の表1に示す。Cas9およびsgRNAを同じベクター内で共発現するBsmB1(Thermal Fisher Scientific)消化プラスミドLentiCRISPRv2(MITのDr.Feng Zhang博士によりAddgene,Cambridge,MAに寄託された)に、sgRNA配列をコードする二本鎖オリゴヌクレオチドをクローニングした。次いで、Zhangラボによって確立されたプロトコルに従って、sgRNAをコードするCRISPRレンチウイルスベクターを作製した。ノックアウト細胞株を作製するために、標的細胞を、sgRNAをコードするCRISPRレンチウイルスに感染させ、10%FBSを含むDMEM中で培養し、7~10日かけてピューロマイシン(B16F10、CT26、MC38、MDA-MB-231では1μg/mlおよび4T1では4μg/ml)中で選択した。ウエスタンブロットによって感染細胞内のPCSK9タンパク質の発現を検出して、ノックダウンを検証した。一般に、実験に使用する前に、PCSK9ノックアウト細胞の混合集団をインビトロで10~12日間増殖させた。
PCSK9欠乏腫瘍細胞が3Dで増殖する能力を測定するために、確立されたプロトコルに従って軟寒天アッセイを行った。6ウェルプレートに、1ウェル当たり10,000細胞の密度で2連で細胞を播種した。3週間の培養後、コロニーを固定し、0.005%クリスタルバイオレットを用いて染色した。次いで、1ウェル当たりのコロニー数を計数した。2つの独立した実験を行った。
この試験で行われた動物実験はいずれも、Duke University Institutional Animal Use and Care Committeeによって承認された。C57BL/6J、Balb/cマウスおよびOT-1トランスジェニックマウス(C57BL/6バックグラウンド)は、Jackson Laboratory(Bar Harbor,ME)から購入した。NOD CRISPR PrkdcIl2rGamma(NCG)三重免疫不全マウスは、Charles River Laboratory(Wilmington,MA)から購入した。腫瘍細胞を注射する前に、年齢を一致させた6~8週齢のマウスの脇腹を剃毛した。次いで、剃毛した脇腹に、1.0x105のCRISPR/Cas9改変対照または標的遺伝子ノックアウト腫瘍細胞とともに、腫瘍細胞を皮下注射した。
マウスにおける免疫エフェクター細胞(immune effector cell)の特定のサブセットの役割を評価するために、それぞれ-3、0、3および8日目に、BioXcellから購入した150μgの抗CD4(GK1.5)、100μgの抗CD8β(53-5.8)および200μgの抗NK1.1(PK136)をi.p.注射することにより、CD4+T細胞、CD8+T細胞およびNK細胞を枯渇させた。対照として、等量のIgGアイソタイプ抗体(BioXcell)を注射した。
EGFPまたはtdTomatoを安定に発現するB16F10細胞を、それぞれPCSK9標的(表1のsgRNA1、sgRNA2)または対照レンチウイルスベクターに感染させ、1μg/mlピューロマイシンを用いて10日かけて選択した。続いて、約5x104のPCSK9ノックアウト細胞(EGFP発現)と5x104の対照細胞(tdTomato発現)とを混合し、C57BL/6J雌マウスに皮下接種した。接種後12~14日に腫瘍を切除した。次いで、それらを細かく切り刻み、DNase I(50μg/ml、Sigma)およびコラゲナーゼP(2mg/ml、Sigma)中で37oCで20分間インキュベートした。解離した腫瘍細胞を70μm細胞ストレーナー(BD)に通した。腫瘍細胞を洗浄し、2%FBSを含む氷冷PBSに再懸濁した。BD Cantoフローサイトメトリーシステム(Flow Cytometry Shared Facility、Duke University School of Medicine)を使用して、GFPとtdTomato腫瘍細胞との比を分析した。
インビボ実験では、PCSK9欠乏(FGP発現)または対照ベクター(tdTomato発現)B16F10細胞をマウスに別個に接種し、10~12日後に腫瘍を採取した。次いで、腫瘍細胞を上記のように分解および処理し、抗H-2Kb/H-2Db抗体(28-8-6、BioLegend)を使用してフローサイトメトリー分析に供した。
B16F10細胞をPCSK9標的または対照レンチウイルスベクターに感染させ、1μg/mlピューロマイシンを用いて10日かけて選択した。次いで、C57BL/6Jマウスに、約1x105のPCSK9ノックアウトまたは対照細胞を皮下接種した。接種後12日目に腫瘍を収集し、重量を測定し、機械的に細かく切り刻み、DNase I(50μg/ml、Sigma)およびコラゲナーゼP(2μg/ml、Sigma)中で20分間37°Cでインキュベートした。解離した細胞を70μm細胞ストレーナー(BD)に通した。次いで、濾過した細胞を抗CD16/32抗体(BioLegend)を用いてブロックし、指定された表面抗体を用いて氷上で20分間染色した。Live/Dead Fixable Aqua色素(Thermo Fisher Scientific)を使用して、死細胞を除外した。製造業者の指示(Thermo Fisher Scientific)に従って、固定および透過処理後に細胞内抗体を加えた。抗マウス蛍光色素コンジュゲート抗体を表2に示す。BD Cantoフローサイトメトリーシステムを使用して、染色された細胞を分析した。
上記のように腫瘍細胞を接種し、接種後10日目にゲノムDNA抽出のためにそれらを収集した。DNeasy Blood&Tissueキット(Qiagen)を使用してゲノムDNAを抽出し、マウスTCRB CDR3サーベイ配列決定のためにAdaptive Biotechnologiesに提出した。PCR反応のインプットとして約2.6μgの初期DNAを使用した。Adaptive Biotechnologieオンライン分析プラットフォームを使用してデータを分析した。
OT-1 C57BL/6マウスの脾臓から、マウスH-2Kbに結合したSIINFEKLペプチドを特異的に認識するTCRをコードする導入遺伝子を発現するOT-1 CD8+T細胞を採取した。マウス組換えIL2の存在下で、5x106細胞/mlのOT-1 SIINFEKLパルスマウス脾細胞を5~7日間インビトロでインキュベートすることにより、活性化されたOT-1 T細胞を作製した。要約すると、OT-1マウスの脾臓を採取し、無菌技術を使用してホモジナイズした。放出された細胞をペレット化し、3ml ACK緩衝液(0.15M NH4Cl、1mM KHCO3および0.1mM EDTA)に2分間再懸濁して、室温で赤血球を溶解した。次いで、脾細胞をペレット化し、洗浄し、0.75μg/ml SIINFEKLペプチド(GenScript)を含有する完全増殖培地(10%ウシ胎児血清[Corning]、1Xペニシリン-ストレプトマイシン[Thermo Fisher Scientific]、1Xピルビン酸ナトリウム[Thermo Fisher Scientific]および1X 2-メルカプトエタノール[Thermo Fisher Scientific]を含むRPMI1640[Sigma-Aldrich])中に5x106細胞/mlで再懸濁し、95%空気/5%CO2加湿環境で37oCでインキュベートした。3および5日目に、新鮮な完全増殖培地とともに、マウス組換えIL2(Thermo Fisher Scientific)を30ユニット/mlで加えた。7日目に、アッセイのために細胞を回収した。APC/Fire750標識抗マウスCD8およびAPC標識抗マウスTCRVβ5.1/5.2抗体(BioLegend)を使用したフローサイトメトリー分析によって特異性を決定した。
細胞をPBSで洗浄した後、プロテアーゼ阻害剤を添加したRIPA緩衝液中に溶解した。SDS-PAGEにより等量のタンパク質を分離し、PVDFメンブレンに転写した。特異的な抗体、続いてHRPとコンジュゲートした二次抗体を用いてタンパク質をプローブした。ECLを使用してHRPシグナルを発現させた。Image J(NIH)を使用して、目的のタンパク質の定量を分析した。
リソソームおよび膜内のMHC-Iの分布を検討するために、5x107のH2-K1-Flag形質導入PCSK9過剰発現またはノックアウトB16F10細胞を使用して、リソソームおよび膜画分を単離した。リソソームの単離には、製造業者の指示に従って(Lysosome Enrichmentキット、Thermo Scientific)、密度勾配超遠心分離法を使用した。膜分離緩衝液A(50mM Tris-HCl、pH7.5、450mM NaCl、1.5mM MgCl2、0.2mM EDTA、0.1mM EGTA、1mM DTT)および緩衝液B(緩衝液A+1%NP40、0.1%SDS)を使用して、膜画分を分離した。マウス抗Flag抗体を使用したウエスタンブロットによって、リソソームおよび膜画分内のMHC-I発現を検出した。それぞれリソソームおよび膜のマーカーとして、マウス抗LAMP2(Porteintech)およびウサギ抗パンカドヘリン(Novus Biologicals)を使用した。
1ng/mlでマウス組換えIFNγと12時間インキュベーションすることによって、B16F10 Ctrl-Td(TdTomato蛍光タンパク質を発現)、B16F10 PCSK9KO-Td、B16F10 Ctrl-OVA-Td(ニワトリ卵白アルブミン遺伝子を発現)およびB16F10 PCSK9 KO-OVATd細胞を最初に刺激した。次いで、マウス組換えIL2(30ユニット/ml)を含むOT-1 T細胞完全増殖培地中で、1:1の比でOT-1 T細胞とともに、またはOT-1 T細胞を用いず、刺激された腫瘍細胞を24時間培養した。続いて、TdTomato発現腫瘍細胞を計数するために、Zeiss Axio Observer.Z1蛍光顕微鏡イメージングステーションによってTdTomato蛍光および明視野画像(各ウェルについて3つの視野)を捕捉し、ZENイメージングソフトウェア(Carl Zeiss Microscopy GmbH)およびImageJ 1.52h(NIH)によって分析した。二元配置分散分析とHolm-Sidakの多重比較検定とを使用して、統計的有意性を検討した。GraphPad Prism 6.0ソフトウェア(GraphPad Software)を使用して結果をプロットした。
免疫蛍光分析では、マウスから得られた腫瘍を10%中性緩衝ホルマリン中で固定し、パラフィンに包埋し、薄片にした後、切片上に封入した。次いで、表2に記載されているマウスCD45またはCD8aに対する抗体を使用して、標準的な手順に従って染色した。
表3に記載されている配列を有するPCRプライマーを使用して、mycタグ付きマウスPCSK9の2.2kb断片と、flagタグ付きH2Kdの0.7kb断片とを得た。次いで、製造業者の指示(New England Biolabs)に従って、ギブソンアセンブリのキットを使用して、GFP-Neoレンチウイルスベクターに、PCSK9-mycおよびH2Kd-Flag断片をコードするDNA断片をクローニングした。遺伝子をコードするレンチウイルスベクターを作製し、次いでB16F10細胞を感染させるために使用した。その後の分析の前に、G418を用いて5日かけて細胞を選択した。
10cmペトリ皿で培養した細胞を氷冷PBSで2回洗浄し、プロテアーゼ阻害剤(Sigma-Aldrich)を添加した500μlのIP溶解緩衝液(150nM NaCl、50mM Tris、0.1%NP-40)を用いて、氷上で直接溶解した。細胞溶解物を1.7mlチューブに移し、4oCで15分間エンドツーエンド回転(end-to-end rotated)させた。Bio-Radタンパク質アッセイによって溶解物中のタンパク質濃度を測定した。HAタグ付きPCSK9タンパク質のIPについては、ローテーター上で500μlの細胞溶解物を5μlの抗HA抗体(Santa Cruz Biotechnology)と4oCで一晩インキュベートした。次いで、c-HA抗体を含む溶解物を20μlのプロテインA/Gアガロースビーズ(Santa Cruz Biotechnology)と4oCで2時間コンジュゲートさせた。IP溶解緩衝液で3回洗浄した後、SDS-PAGEおよびウエスタン分析のために、プルダウン複合体(pull-down complex)を2X SDSローディング緩衝液中で煮沸した。
CRISPR/Cas9ベクター対照またはPCSK9ノックアウトB16F10腫瘍細胞から全RNAを抽出し、RNA-seq分析に供した。Duke University Sequencing and Genomic Technologies CoreによってRNA-seqを行った。Kapa Stranded mRNA-seqライブラリー調製キットを使用して、配列決定ライブラリーを作製した。Illumina Hiseq 4000装置を使用して、50bpの単一末端読取り長により、ライブラリーを配列決定した。
MHC-Iタンパク質のリソソーム分解のPCSK9の影響を決定するために、20μg/mlシクロヘキシミド(CHX、Sigma)を用いて、ベクター対照またはPCSK9ノックアウトMDA-MB-231細胞を処理して、タンパク質生合成を1、4、8、18、24時間阻害した。リソソーム阻害のために、20nMバフィロマイシン(Baf A1、Sigma)を用いて、MDA-MB-231細胞を1、2、4、8、24時間処理した。次いで、細胞を回収し、抗HLA-ABC抗体(Proteintech)を使用したウエスタンブロットによりMHCクラスIタンパク質を検出した。
GraphPad Prism 6ソフトウェアを使用して統計分析を行い、0.05未満のp値によって統計的有意性を決定した。腫瘍増殖遅延実験の多重比較には、二元配置分散分析を使用した。マウスの生存分析には、ログランク(Mantel-Cox)検定を使用した。他の実験では、独立スチューデントのt検定を使用して、2つの群間の比較を行った。Gene Expression across Normal and Tumor tissueデータベース(GENT)を使用して、示された患者コホートにおけるPCSK9とCD8Aとの間の関係を分析した。TCGAデータベースからPCSK9遺伝子発現および患者生存率に関するデータを取得し、ログランク検定を使用してその関係を評価し、p<0.05の値が統計的に有意であると解釈した。
ここで図4A~図4Hを参照すると、同系マウス宿主にPCSK9欠乏細胞を接種すると、腫瘍を形成するそれらの能力は有意に減弱された(図4A、図4C、図4E、図4G)。さらに、試験した4つのマウス腫瘍系統いずれでも、PCSK9ノックアウト群では、腫瘍細胞接種後60日まで宿主マウスに腫瘍が認められない長期生存マウスが存在した。対照的に、マウスにベクター対照形質導入腫瘍細胞を注射した群では、腫瘍増殖のために全マウスを最終的に殺処分しなければならなかった(図4B、図4D、図4F、図4H)。蛍光タンパク質を使用することにより、PCSK9欠乏細胞の優先的な増殖抑制をインビボでさらに確認した。PCSK9ノックアウト細胞がほぼ完全に失われたのに対して、対照細胞が腫瘍塊に多数残っていたことは明らかである。約1x105のベクター対照およびPCSK9ノックアウトマウス腫瘍細胞を同系マウスに皮下接種し、腫瘍形成を観察した。腫瘍サイズおよび無腫瘍生存率をともにモニタリングした。「TF」は、それらの特定の実験が示された数の無腫瘍マウスをもたらしたことを示す。
Claims (10)
- PCSK9阻害剤と、少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤とを含む、癌を治療するための医薬組成物であって、
前記PCSK9阻害剤は、PCSK9に対する拮抗性抗体を含み、
前記少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体を含む、医薬組成物。 - 少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて癌を治療するためのPCSK9阻害剤を含む医薬組成物であって、
前記PCSK9阻害剤は、PCSK9に対する拮抗性抗体を含み、
前記少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体を含む、医薬組成物。 - PCSK9阻害剤と組み合わせて癌を治療するための少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤を含む医薬組成物であって、
前記PCSK9阻害剤は、PCSK9に対する拮抗性抗体を含み、
前記少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体を含む、医薬組成物。 - 前記PCSK9阻害剤が、前記少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤の投与前、投与後または同時に投与される、請求項1~3の何れか1項に記載の医薬組成物。
- 前記少なくとも1つの免疫チェックポイント阻害剤が、更に、抗PDL1抗体、抗CTLA4抗体、抗LAG3抗体、抗TIM3抗体、抗TIGIT抗体およびそれらの組合せからなる群から選択される抗体を含む、請求項1~4の何れか1項に記載の医薬組成物。
- 前記PCSK9に対する拮抗性抗体が、レパーサ(登録商標)(Amgen 145およびエボロクマブとしても知られている)、プラルエント(登録商標)(REGN 727[Regeneron]およびSAR236553[Sanofi]としても知られている)、LY3015014(フロボシマブ[Lilly]としても知られている)、RN316(ボコシズマブ[Pfizer]としても知られている)、1D05-IgG2[Merck]、1B20[Merck]、RG7652[Roche/Genentech]、LGT209[Novartis]、またはMEDI-4166[Astrazeneca]である、請求項1~5の何れか1項に記載の医薬組成物。
- 前記PCSK9阻害剤が二重特異性抗体を含み、前記二重特異性抗体の一方のアームがPCSK9に対して拮抗的であり、他方のアームが少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質に対して拮抗的である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記PCSK9阻害剤が二重特異性抗体を含み、前記二重特異性抗体の一方のアームがPCSK9に対して拮抗的であり、他方のアームが免疫刺激標的に対して作動的である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記免疫刺激標的が、1BB、OX40およびICOSからなる群から選択される、請求項8に記載の医薬組成物。
- 前記PCSK9に対する拮抗性抗体が、レパーサ(登録商標)(Amgen 145およびエボロクマブとしても知られている)、またはプラルエント(登録商標)(REGN 727[Regeneron]としても知られている)である、請求項6
に記載の医薬組成物。
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