JP7287961B2 - 同時複数平面撮像のためのシステム、装置および方法 - Google Patents

同時複数平面撮像のためのシステム、装置および方法 Download PDF

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関連出願の相互参照
本出願は、「METHOD AND APPARATUS FOR DUAL-PLANE REMOTE FOCUSING IMAGING」と題する、2017年12月12日に出願された米国仮特許出願第62/597,864号、および「METHOD AND APPARATUS FOR DUAL-PLANE REMOTE FOCUSING IMAGING」と題する、2018年11月2日に出願された米国仮特許出願第62/754,722号に対する優先権を主張するものであり、その開示全体は、参照により本明細書に援用される。
本開示は、一般的に同時複数平面撮像のためのシステム、装置、および方法に関連する。より具体的には、本開示は、複数の遠隔フォーカスユニットを用いて迅速な画像取得を可能にするシステム、装置、および方法に関する。
二光子レーザ走査顕微鏡(TPLSM)は、散乱媒体内の構造体の高解像度、高コントラスト画像を提供する。例えば、米国特許公開第2017/0123196号を参照する。例えば、二光子顕微鏡では、米国特許第9,638,909号に記載されるように、撮像体積のZ位置を迅速に調整するために遠隔フォーカスユニットが使用される。しかしながら、二光子顕微鏡での撮像速度はラスタ走査速度によって制限され、それによって十分な時間分解能で逐次的に撮像することができる関心領域の数を制限する。
いくつかの実施形態では、システムは、光信号を生成する光源を含み、光信号は、第一の繰り返し速度で1セットのパルスを含む。システムはまた、光学マルチプレクサ回路を含んで、光学信号を受信し、第二の繰り返し速度で1セットのパルスを含む多重化光信号を生成する。第二の繰り返し速度は、第一の繰り返し速度のn倍数である。第二の繰り返し速度のパルスのセットには、nセットのパルスが含まれ、nセットのパルスの各セットのパルスは、nセットのパルスの互いとは異なる偏光状態を有し、第一の繰り返し速度である。システムはまた多重化光信号を受信し、多重化光信号をn個の励起信号の1セットに分割して、試料を励起するフォーカスユニットを含み、n個の励起信号のセットの各励起信号は、nセットのパルスのうちの1セットのパルスに対応する。システムはまた、対物レンズを含んで、n励起信号のセットを受信し、試料を照射する。対物レンズとフォーカスユニットは、n個の励起信号のセットの互いの励起信号とは異なる試料の焦点面上のn個の励起信号のセットの各励起信号に集合的に焦点を合わせて、n個の励起信号のセットに応じて応答信号を生成する。システムはまた、異なる焦点面からの放射を分離する電子デマルチプレクサ回路を含み、応答信号に基づいてn個の放射信号の1セットを生成し、n個の放射信号のセットの各放射信号は、n個の励起信号のセットのうちの一励起信号に対応する。
いくつかの実施形態では、一方法は、第一の繰り返し速度で1セットのパルスを含む光信号を生成することを含み、第一の繰り返し速度は、第二の繰り返し速度のnの倍数である。第二の繰り返し速度のパルスのセットには、nセットのパルスが含まれ、nセットのパルスの各セットのパルスは、nセットのパルスの互いとは異なる偏光状態を有し、第一の繰り返し速度で動作する。その方法はまた、試料を励起するため光信号をn個の励起信号の1セットに分割することを含み、n個の励起信号のセットの各励起信号は、nセットのパルスのうちの1セットのパルスに対応する。方法はまた、n個の励起信号のセットの互いの励起信号とは異なる試料の焦点面にn個の励起信号のセットの各励起信号に焦点を合わせることを含んで、n個の励起信号のセットに応じて応答信号を生成する。方法はまた、応答信号における異なる焦点面からの放射をn個の放射信号の1セットに分離することを含み、n個の放射信号のセットの各放射信号は、n個の励起信号のセットの一励起信号に対応する。
いくつかの実施形態では、システムは、光信号を生成するためのレーザ源を含み、その光信号は第一の繰り返し速度で1セットのパルスを含む。システムはまた、電気光学変調器および偏光ビームスプリッタを含んで、光信号を受信し、第二の繰り返し速度で1セットのパルスを含む多重化光信号を生成し、そこで第二の繰り返し速度は第一の繰り返し速度の二倍である。第二の繰り返し速度のパルスのセットは、第一の繰り返し速度でパルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットそれぞれを含み、パルスの第一のセットは、パルスの第二のセットとは異なる偏光状態を有する。システムはまた、多重化光信号を受信し、多重化光信号を第一の励起信号および第二の励起信号に分割して試料を励起するフォーカスユニットを含む。第一の励起信号はパルスの第一のセットに対応し、第二の励起信号はパルスの第二のセットに対応する。フォーカスユニットは、フォーカスオプティックの第一のセットと、フォーカスオプティックの第一のセットとは異なる長手方向軸を有するフォーカスオプティックの第二のセットを含む。フォーカスオプティックの第一のセットおよびフォーカスオプティックの第二のセットはそれぞれ、1/4波長板、第二の対物レンズ、およびその対応する励起信号の焦点面の位置を独立して調節するためのフォーカスミラーを含む。システムはまた、第一の励起信号および第二の励起信号を受信し、試料に光学的に結合して試料を照射し、試料から放射を生成する対物レンズを含む。第一の励起信号は、試料の第一の焦点面に焦点を合わせており、第二の励起信号は、第一の焦点面とは異なる試料の第二の焦点面に焦点を合わせている。システムはまた、試料からの放射に基づいて応答信号を生成するように構成された検出器を含む。システムはまた、応答信号を第一の励起信号に対応する第一の放射信号と第二の励起信号に対応する第二の放射信号に分離するスイッチを含む。
当然のことながら、前述の概念および以下でより詳細に考察する追加的概念のすべての組み合わせは(このような概念は相互に矛盾していないという前提で)、本明細書に開示する本発明の主題の一部であると考えられる。特に、本開示の最後に現れる、特許請求の範囲に記載する主題のすべての組み合わせは、本明細書に開示する発明主題の一部であると考えられる。また当然のことながら、参照により組み込まれるあらゆる開示において明示的に用いられる用語には、本明細書に開示する特定の概念と最も一致する意味を与える必要がある。
特許または出願ファイルには、色付きで作成された少なくとも一つの図面が包含されている。色付き図面を伴う本特許または特許出願公開の複製は、要請および必要な料金の支払いに応じて、米国特許商標庁によって提供される。
当業者であれば、図面が主として例示的な目的であること、そして本明細書に記載する本発明の主題の範囲を制限することを意図していないことを理解するだろう。図面は必ずしも一定の比率ではなく、一部の例では、本明細書に開示する本発明の主題の様々な態様は、異なる特徴の理解を容易にするために、図面内で誇張または拡大されて示されうる。図面では、同様の参照文字は概して、同様の特徴(例えば、機能的に類似した、および/または構造的に類似した要素)を意味する。
図1は、一部の実施形態による、複数平面撮像用のシステムを図示する。 図2は、一部の実施形態による、複数平面撮像のための方法を図示する。 図3は、例示的な実施形態による、走査光学の前の二重平面遠隔フォーカスユニットの配置を図示する。 図4は、例示的な実施形態による、走査光学の後の二重平面遠隔フォーカスユニットの配置を図示する。 図5は、例示的な実施形態による、走査光学の二つの独立したセット後の二重平面遠隔フォーカスユニットの配置を図示する。 図6は、一部の実施形態による二重平面遠隔フォーカスユニットを図示する。PBS-偏光ビームスプリッタ、QWP-1/4波長板、Obj-対物レンズ、M-遠隔フォーカスミラー、s-s-偏光、p-p-偏光。 図7A~7Cは、例示的な実施形態による、時間的にインターリーブされたパルス励起の急速な時間的多重化および多重分離のためのシステムの構成要素を図示する。図7Aは、時間的にインターリーブされたフェムト秒レーザパルスを作り出すセットアップを図示する。図7Bは、二重平面遠隔集束アセンブリを図示する。図7Cは、時間的にインターリーブされた光ルミネセンス信号を多重分離するセットアップを図示する。 図8A~8Cは、例示的な実施形態による、スキャンラインまたは画素トリガにより特徴付けられるs-偏光ビームとp-偏光ビームとの間の切り替えに基づいて、比較的遅い時間的多重化および多重分離のためのシステムの構成要素を示す。図8Aは、s偏光ビームとp偏光ビームの間の切り替えのためのセットアップを図示する。図8Bは、二重平面遠隔集束アセンブリを図示する。図8Cは、取得された光ルミネセンス信号を多重分離するスキームを示す。 図9A~9Cは、例示的な実施形態による、両方の焦点面からの情報を含む画像から関心のある特徴部を抽出するために後処理アルゴリズムが使用される時間的符号化の無いシステムの構成要素を示す。図9Aは、s偏光ビーム間とp偏光ビームとの間を切り替えるセットアップを図示する。図9Bは、二重平面遠隔集束アセンブリを図示する。図9Cは、重ねられた画像から数値方法で関数型データを復号するセットアップを図示する。 図10は、一時的に多重化された励起および放射を有する例示的な二重平面多光子撮像システムの例を示す。EOM-電気光学変調器、PPC-パルス プリズム圧縮機、Obj-対物レンズ、RFU-遠隔フォーカスユニット、M-ミラー、QWP-1/4波長板、PR-瞳孔リレー;RFS-共振ガルバノメータスキャナ、GS-ガルバノメータスキャナ、DM-ダイクロイックミラー、PMT-光電子増倍管、BP-バンドパスフィルタ、LP-低パス フィルタ、DAQ-データ収集チャネル。 図11は、時間的にインターリーブされた光ルミネセンス信号をアナログ乗算で復号するための例示的なスキーム/セットアップを示す。 図12は、s偏光ビームおよびp偏光ビームの力を制御するための例示的なセットアップを示す。 図13は、s偏光ビームおよびp偏光ビームの力を制御するための別の例示的なセットアップを図示する。 図14A~14Bは、遠隔フォーカスユニットを有する(図14B)システムおよび有さない(図14A)システムの一部分を示すCAD図である。図14Cは、据え付けられたフォーカスユニットアセンブリの画像である。 同上。 図15A~15Cは、それぞれおよそ50%(図15A)、45%(図15B)、および30%(図15C)の異なるデューティサイクルを有するフェムト秒レーザからの同期シグナルから得られた二つの基準信号を示す。 図16A~16Cは、実施形態による、本明細書に開示されるシステム、装置、および方法で達成可能な異なる走査パラダイムを示す。図16Aは、二重アーム遠隔集束を有する二光子顕微鏡での体積測定撮像を図示する。図16Bは、大容量の同時二重平面撮像を図示したものであり、各撮像平面は独立したZ座標を有するが、同じXY座標を有する。図16Cは、大容量の同時二重平面撮像を図示したもので、各撮像平面は独立したZ座標およびXY座標を有する。 図17A~17Cは、第一(図17A)、第二(図17B)、および同時に信号の多重分離なく両方の撮像チャネル(図17C)において励起を用いて取得されたインビボニューロンの画像の例の画像を図示する。撮像された二重特徴を図示するために、二つのZ平面をXY方向に故意にオフセットした。 図18Aは、160MHzの合計パルス速度でパルス励起から生じる、3nsの寿命および400MHzの検出器帯域幅を有する蛍光信号のシミュレーションされた時間的プロファイルを図示する。図18Bは、時間統合窓幅の関数として、二つの撮像チャネル間の演算クロストーク値を示す。 図18Cは、50%のデューティサイクルでの蛍光信号に対する可変デューティサイクルの関数としての蛍光信号損失を示す。図19Aは、図10のRFスイッチ1050の入力および出力で記録された信号を有する、例示的な多重分離電子機器操作の例を示す。図19Bは、PMTおよびプリアンプからの時間分解インパルス応答信号およびインビボGCAmp6f蛍光に対応する信号を示す。図19Cは、高速緑色CFCで染色された花粉粒(PG)試料からの時間分解された平均蛍光信号を示す。垂直グリッド線間の間隔は6.25nsである。 図20Aは、第一のチャネルのみの励起を使用して同時に記録された二つの撮像チャネル内のマウス大脳皮質の平均インビボ画像を示す。図20Bおよび20Cは、時間遅延の関数として二つの撮像チャネルにおける正規化平均放射強度の比較を示す。図20Bのプロファイルは、GCAmp6fで標識化されたニューロンの蛍光信号に対応し、図20Cのプロファイルは、染色されたPGで標識化されたニューロンの蛍光信号に対応する。 図21A~21Dは、平均400倍の、Thorlabsの多光子メソスコープ(「MM」)システムおよび図10の修正二平面システム(「MM2x」)で記録されたGCAmp6f標識化組織片の二光子画像を示す。チャネル1およびチャネル2に記録された画像は、それぞれ70mWおよび82mWの励起出力レベルで記録された。図21A-チャネル1、MMシステム、図21B-チャネル1、MM2xシステム、図21C-チャネル2、MMシステム、図21D-チャネル2、MM2xシステム 図22Aは、異なる励起出力レベルで両方の撮像システム(MM、MM2×)を用いて同じ実験条件で記録された、図21A~21Dの赤い線で概説した細胞本体内の選択された関心領域(ROIs)の平均蛍光信号を示す。 図22Bは、図21Aおよび21Bの画像から計算された平均分散プロットである。 図23A~23Cは、MMおよびMM2xシステムの様々な態様の比較を図示する。図23Aは、二つの撮像チャネルで励起を使用してMMおよびMM2xシステムで記録されたPG試料の画像を示す。画像は、28mWの励起出力で、平均100倍で記録されている。図23Bは、異なる励起出力レベルで図23Aの矢印で示された花粉粒の平均蛍光信号強度のプロットである。図23Cは、MMおよびMM2xシステムのチャネル1の記録されたすべてのPG画像から計算された平均分散プロットである。 図24Aおよび24Bは、チャネル1(図24A)およびチャネル2(図24B)における異なる関心領域における、記録された点分布関数(PSF)の例を示す。図示のPSF画像を、0μmの深さで記録した。 同上。 図25A~25D、26A~26Cは、レーザ励起が第一のチャネル(チャネル1)または第二のチャネル(チャネル2)のいずれかに存在する場合、関数カルシウム信号記録のクロストークを図示し、画像は両方の撮像チャネルに同時に記録される。図25Aは、チャネル1で励起され、チャネル1で検出されるマウス脳組織の平均インビボ画像を図示する。図25Bは、チャネル1で励起され、チャネル2で検出される、10倍された画素強度を有するマウス脳の平均インビボ画像平均を図示する。図25Cは、チャネル2で励起され、チャネル1で検出される、10倍された画素強度を有するマウス脳の平均インビボ画像を図示する。図25Dは、チャネル2で励起され、チャネル2で検出されたマウス脳の平均インビボ画像を図示する。 図26Aは、図27Aおよび27Bの細胞1からのカルシウム信号を示すプロットである。図26Bは、図27Cおよび27Dの細胞2からのカルシウム信号を示すプロットである。図26Cは、図26Aおよび26Bのカルシウム信号トレースの比を示すプロットである。 図27は、それぞれ四つの長手方向(Z)面を有する二つのX、Y領域およびそれぞれ二つの長手方向面を有する四つのX、Y面を有するデータ取得のための二つの例示的な顕微鏡構成を示す。V1-視覚皮質、LM-後内側領域、AM-前内側領域、およびAL-前外側領域。 図28A~28Dは、クロストーク不混合のための例示的なワークフローを示す。具体的には、図28Aは、(第一の)ビーム1がブロックされ、画像が両方のチャネル上で取得されるグラウンドトゥルースクロストークを記録するための実験手法を示し、これにより、一つの区画に対するクリーンな信号を記録し、第二のチャネルへの信号漏出のクリーンな読み取りを記録する。この手順は、ビーム2をブロックして繰り返される。図28Bは、信号(水平軸)を表す平面およびクロストーク測定値(垂直軸)を表す平面のすべての細胞からのカルシウムトレースの2Dヒストグラムを示す。リニアフィットが作成/図示され、その傾斜はクロストークの測定値とみなされる。図28Cは、両方向で測定された一つの実験のすべての対の面に対するリニアフィットを示し、図28Dは、三つの実験にわたる全ての対の面に対するクロストークを特徴付けるリニアフィットを表す。 図29Aおよび29Bは、クロストークの不混合の結果を示す。図29Aは、一部の細胞(矢印を参照)が両方の平面でセグメンテーションアルゴリズムを介して検出される、不混合する(「未修正」の列)前の二つの平面を示す。第二の列(「修正済」)は、クロストークの不混合後の画像を表す。ここでは、細胞は一つの平面にのみ現れ、セグメンテーションアルゴリズムによって検出されない。図29Bは、その元の平面(青色)における細胞に対するカルシウムトレースを示し、クロストーク面(オレンジ)で検出された同一の細胞の活性に対して示されているが、この細胞は不混合後のクロストーク面(緑)で検出されない。 図30Aおよび30Bは、二つの皮質柱のインビボ撮像を示す。顕微鏡は、V1と同様にLMの、それぞれの四つの長手方向面において撮像するように構成される。図30AはV1に対応し、図30BはLMに対応する。 図31A~31Dは、四つの皮質領域のインビボ撮像を図示する。V1、LM、AL、AMの、二つの長手方向面それぞれで撮像するように顕微鏡を構成した。図31Aは、V1に対応し、図31BはALに対応し、図31CはLMに対応し、図31DはAMに対応する。 図32A~32Dは、二つの皮質柱にわたる相関関係を図示する。図32Aは、Vip動物のV1およびLMにおける40個の細胞からのzスコアのニューロン活性を示す。図32Bは、生理学的反応の類似性によって分類されたニューロン活性を示す。図35Cは、第一の10000フレーム(図32Aのzスコアデータの記録の1000秒に対応)の拡大図である。図32Dは、図32Bの分類されたデータの第一の1000秒の拡大図である。 同上。 同上。 同上。
以下には、同時複数平面焦点および撮像のためのシステム、装置および方法に関連するさまざまな概念の詳細な説明、およびその実装の詳細な説明がある。上記に導入され、以下でより詳細に考察された様々な概念が、多数の方法で実装されうることが理解されるべきである。特定の実装および用途の例は、主に当業者が当業者にとって明らかであるその実装および代案を実施するための例示的な目的のために提供される。
以下に説明する図および例示的実装は、本実装の範囲を単一の実施形態に限定することを意味していない。記述された要素または図示された要素の一部またはすべてを交換することによって、その他の実装が可能である。さらに、開示された例示的実装の特定の要素が既知の構成要素を使用して部分的または完全に実装されてもよい場合、一部の例では、本実装の理解に必要なそのような既知の構成要素の一部のみが記述され、かかる既知の構成要素のその他の部分の詳細な説明は、本実装を不明瞭にしないよう省略される。
図1は、複数平面撮像を実装および/または実行できる環境/システム100のブロック図である。いくつかの実施形態では、システム100の態様は、図3~10に関して本明細書に記載されるシステム、装置、および/またはデバイスと構造的ならびに/あるいは機能的に類似しており、かつ/または図2に記述された方法200を実施できる。
システム100は、光源110、マルチプレクサ回路120、フォーカスユニット130、対物レンズ140、およびデマルチプレクサ回路150を含む。いくつかの実施形態では、システム100のすべての構成要素を、例えば、ユーザ用の統合された一体型デバイスとしてシステム100を提示する単一のハウジングなどの共通ケーシングに含めることができる。他の実施形態では、システム100の少なくともいくつかの構成要素は、別々の位置、ハウジング、および/またはデバイス内にあり得る。例えば、一部の実施形態では、光学的接続、電気的および/または電子的相互接続、および/またはこれに類するものを、必要に応じて接続用に用いることができる。
いくつかの実施形態では(図示せず)、システム100は少なくともコントローラおよびメモリを含む。いくつかの実施形態では、システム100はまた、データベースを含むことができるが、一部の実施形態では、データベースおよびメモリは共通のデータストアとすることができる。いくつかの実施形態では、データベースは一つ以上のデータベースを構成する。さらに、その他の実施形態では、少なくとも一つのデータベースは、システム100の外部であり得る。システム100および/またはそれに関連付けられた演算装置は、一つ以上の入力/出力(I/O)インターフェース(図示せず)も含むことができ、ソフトウェアおよび/またはハードウェアに実装される。
メモリおよび/またはデータベースは、独立して、例えば、ランダムアクセスメモリ(RAM)、メモリバッファ、ハードドライブ、データベース、消去可能なプログラム可能な読み出し専用メモリ(EPROM)、電気的消去可能読み出し専用メモリ(EEPROM)、読み出し専用メモリ(ROM)、フラッシュメモリ等であり得る。メモリおよび/またはデータベースは、命令を保存して、コントローラにシステム100に関連付けられたプロセスおよび/または機能を実行させることができる。
コントローラは、システム100に関連付けられた一組の命令またはコードを実行および/または遂行するように構成された任意の適切な処理デバイスとすることができる。コントローラは、例えば、適切にプログラムされたプロセッサ、フィールドプログラマブルゲートアレイ(FPGA)、特定用途向け集積回路(ASIC)、デジタル信号プロセッサ(DSP)、および/またはこれに類するものとすることができる。
システム100は、一つ以上のネットワークを介して他のシステム、装置、および/またはデバイスと電子的に通信することができ、それぞれが、例えば、ローカルエリアネットワーク(LAN)、ワイドエリアネットワーク(WAN)、仮想ネットワーク、通信ネットワーク、ならびに/あるいは有線ネットワークおよび/または無線ネットワークとして実装されるインターネットなどの任意の種類のネットワークでありうる。当技術分野で知られているように、任意のまたはすべての通信をセキュアに(例えば、暗号化)するか、アンセキュアにすることができる。システム100は、パーソナルコンピュータ、サーバ、ワークステーション、タブレット、モバイルデバイス、クラウドコンピューティング環境、これらのプラットフォーム上で実行されるアプリケーションまたはモジュール、および/またはこれに類するものを包含することができる。
いくつかの実施形態では、光源110は、第一の周波数/繰り返し速度で1セットのパルスを含む光信号を生成する。いくつかの実施形態では、光源110は、約300~2000nmの波長で動作するパルスレーザ源であり、中間に全ての値および部分範囲を含む。いくつかの実施形態では、光源110は、約300~1000nmの波長で作動する。いくつかの実施形態では、第一の繰り返し速度は約1MHz~約200MHzであり、中間にすべての値と部分範囲を含む。いくつかの実施形態では、第一の繰り返し速度は最大約80MHzである。いくつかの実施形態では、第一の繰り返し速度は約80MHz~約160MHzであり、中間にすべての値と部分範囲を含む。例示的な実施形態では、システム100は、二光子モードで動作し、光源110は、約40~160MHzの第一の繰り返し速度および約100~150fsのパルス幅を有する約300~1000nmの波長で動作するパルスレーザ源である。別の例示的な実施形態では、システム100は3光子モードで動作し、光源110は、約0.3~5MHzの第一の繰り返し速度および約30~70fsのパルス幅を有する約1000~2000nmの波長で動作するパルスレーザ源である。
いくつかの実施形態では、マルチプレクサ回路120(「光マルチプレクサ回路」とも呼ばれる)は、光源から光信号を受信し、第二の繰り返し速度で1セットのパルスを含む多重化光信号を生成する。いくつかの実施形態では、第二の繰り返し速度は、第一の繰り返し速度のn倍数(例えば、第一の繰り返し速度の2倍、3倍、5倍、および/またはこれに類するもの)である。第二の繰り返し速度のパルスには、パルスのnセットが含まれ、パルスの各セットは、パルスの互いのセットとは異なる偏光状態を有し、第一の繰り返し速度である。いくつかの実施形態では、n=2である。いくつかの実施形態では、nは、試料中の標的発蛍光団の蛍光の寿命、第一の繰り返し速度、および/またはこれに類するものなどの要因に基づいて変化する場合がある。一例として、試料の蛍光寿命が約3nsで第一の繰り返し速度が80MHzである実験では、n=2、すなわち、二つのチャネルを使用できる。別の例として、試料の蛍光寿命が約3nsで第一の繰り返し速度が40MHzである実験では、n=4、すなわち、四つのチャネルを用いることができ、一部の実施形態では、パルスの各セットは約50%のデューティサイクルを有する。例えば、光信号は80MHz(第一の繰り返し速度)でのパルストレインを含むことができ、多重化光信号は、光信号からのパルスの2セットの生成による160MHzの第二の繰り返し速度(すなわち、二倍)を有することができ、それぞれ80MHzであるが、他方に対して遅延し、一方はs偏光状態を有し、他方はp偏光状態を有する。
いくつかの実施形態では、マルチプレクサ回路120は、ナイフエッジミラーを含むミラーなど、ビーム操作のための他の反射素子を含みうる。いくつかの実施形態では、および本明細書でより詳細に説明されるように、マルチプレクサ回路120は、一つ以上のビーム変調器を含んで、nセットのパルスの生成に影響を及ぼしうる。いくつかの実施形態では、ビーム変調器は、電気光学変調器を含む。いくつかの実施形態では、マルチプレクサ回路120は、一つ以上のビームスプリッタを含んで、多重化光信号を生成するためnセットのパルスの組み換えに影響を与えうる。いくつかの実施形態では、ビームスプリッタは、偏光ビームスプリッタを含む。いくつかの実施形態では、マルチプレクサ回路は、例えば、光ファイバーなどの遅延線を含んで、nセットのパルスの間で引き起こされた時間遅延を制御する。いくつかの実施形態では、時間遅延/分離は、nセットのパルスのそれぞれに関連付けられたデューティサイクルに基づくか、またはそれに基づいて選択できる。追加的または代替的に、一部の実施形態では、時間遅延/分離は、n個の励起信号に応じる試料からの蛍光放射に関連付けられた減衰時間に基づくか、またはそれに基づいて選択できる。
いくつかの実施形態では、フォーカスユニット130は、多重化光信号を受信して、試料105を励起するためそれをn個の励起信号に分割する。n個の励起信号はそれぞれ、nセットのパルスのうちの1セットのパルスに対応する。いくつかの実施形態では、n個の励起信号はそれぞれ、本明細書でより詳細に説明するように、対物レンズを介して試料の異なる焦点面に焦点を合わせることができる。別の方法として、フォーカスユニット130は、n個の励起信号のそれぞれの焦点深さを同じになるように(例えば、より強い励起信号が必要な深さでの撮像の場合)、または異なるように調節できる。いくつかの実施形態では、フォーカスユニット130は、n個の励起信号それぞれに対して1セットのフォーカスオプティックである、nセットのフォーカスオプティックを含む。いくつかの実施形態では、フォーカスオプティックの各セットは、その対応する励起信号の焦点面を調節するために移動できる可動ミラーを含みうる。
いくつかの実施形態では、フォーカスオプティックの各セットは、フォーカスオプティックの他のセットの長手方向軸とは異なる長手方向軸を有する。いくつかの実施形態では、フォーカスユニット130は、偏光ビームスプリッタなどのビームスプリッタを含んで、n個の励起信号をフォーカスオプティックのそれぞれのセットの長手方向軸に沿って分割することができる。いくつかの実施形態では、フォーカスオプティックの各セットは、本明細書でより詳細に説明するように、1/4波長板を含んで、同じ偏光ビームスプリッタを使用して同じ光学経路に沿った組み換えを可能にするために、その対応する励起信号を位相シフトすることもできる。いくつかの実施形態では、フォーカスオプティックの各セットは対物レンズを含むことができる(それぞれが「第二の対物レンズ」と呼ばれる場合もある)。
フォーカスユニット130は、「遠隔フォーカスユニット」と呼ばれることがあり、フォーカスオプティックの各セットも、フォーカスユニット/遠隔フォーカスユニットと呼ばれることがある。
いくつかの実施形態では、システム100はさらに、マルチプレクサ回路120とフォーカスユニット130との間に、XY走査ユニット(例えば、ガルバノメータスキャナ)などの走査ユニットを含み得る。この方法では、n個の励起信号はそれぞれ、それぞれの焦点面でスキャンされうる。
いくつかの実施形態では、システム100は、光学経路およびフォーカスユニット130の前に、ビームスプリッタをさらに含んで、nセットのパルスを分離/分割することができる。n = 2を例として使用して、ビームスプリッタは、パルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットを分離することができる。このような実施形態では、システム100は、ビームスプリッタとフォーカスユニット130との間の光学経路に第一の走査ユニットをさらに含んで、パルスの第一のセットを受信し、試料105内のそれぞれの画像平面内のパルスの第一のセットを走査することができる。システム100はまた、ビームスプリッタとフォーカスユニット130との間の光学経路に第二の走査ユニットを含んで、パルスの第二のセットを受信し、試料内のそれぞれの焦点平面内のパルスの第二のセットを走査することができる。この方法では、試料内の異なる深さ/Z軸値だけでなく、異なるXYパラメータを有する焦点平面も同様に可能である。
いくつかの実施形態では、対物レンズ140(「第一の対物レンズ」とも呼ばれる場合がある)は、フォーカスユニットからn個の励起信号を受信し、試料150を照射する。この方法では、対物レンズおよびフォーカスユニットは、試料105の異なる焦点面上のn個の励起信号のそれぞれに集合的に焦点を合わせる。試料は、n個の励起信号に応じて応答信号(例えば、蛍光、燐光、および/またはこれに類するもの)を生成できる。多重化された光信号/励起信号と同様に、応答信号は、試料105からの複数の応答/放射の多重化表現でもよい。
いくつかの実施形態では、システム100は、フォーカスユニット130と対物レンズ140との間に、XY走査ユニット(例えば、ガルバノメータスキャナ)などの走査ユニットをさらに含みうる。この方法では、n個の励起信号はそれぞれ、それぞれの焦点面でスキャンされうる。
いくつかの実施形態では、光電子増倍管(PMT)またはカメラなどの光検出器は、応答信号を受信する。いくつかの実施形態では、システムは、デマルチプレクサ回路150(「電子デマルチプレクサ回路」とも呼ばれる場合がある)を含んで、応答信号から一つ以上の放射信号を分離する。いくつかの実施形態では、デマルチプレクサ回路150は、応答信号に基づいてn個の放射信号を生成し、デマルチプレクサ回路によって生成された各放射信号は、n個の励起信号のうちの一つに対応し、その励起信号に対する試料応答を反映する。いくつかの実施形態では、応答信号および/またはデマルチプレクサ回路150によって受信される応答信号の表示は、アナログ信号であり、デマルチプレクサ回路150は、n個のアナログ放射信号に応答信号を分離するため、アナログスイッチなどの任意の適切な回路であってもよい。いくつかの実施形態では、デマルチプレクサ回路150によって受信された応答信号の表示は、PMT検出器に結合されたデジタルアナログコンバータ(DAC)などからのデジタル信号である。いくつかの実施形態では、応答信号は画像であり、デマルチプレクサ回路は一つ以上の画像処理技術を実行して、n個の放射信号としてn個の発光画像を生成する。いくつかの実施形態では、デマルチプレクサ回路150は、例えば、無線周波数回路などの高速スイッチング回路を含んで、n個の放射信号を生成する。いくつかの実施形態では、デマルチプレクサ回路150は、光源110から受信した一つ以上の基準/タイミング信号に基づくn個の放射信号を生成する。
図2は、一部の実施形態による、複数平面撮像のための方法を図示する。一部の実施形態では、方法200の一部またはすべての態様は、例えば、図1、図3~10に示されるシステムおよび/またはその構成要素など、本明細書で説明したシステム、装置、および/またはデバイスのうちの一つ以上によって実装されうる。
方法200は、210で、(例えば、図1のマルチプレクサユニット120を介して)第一の周波数/繰り返し速度の1セットのパルスを含む光信号を生成することを含む。第一の繰り返し速度(例えば、160MHz)は、第二の繰り返し速度(例えば、80MHz)のn倍数である。第二の繰り返し速度のパルスのセットには、nセットのパルスが含まれ、nセットのパルスはそれぞれ、異なる偏光状態を有し、第一の繰り返し速度で動作する。しかし、いくつかの実施形態では、nセットのパルスの二つ以上の偏光状態は同じでありうる。いくつかの実施形態では、nセットのパルスは、2セットのパルスを含み、生成することにはさらに、s偏光パルスの第一のセットとp偏光パルスの第二のセットとして2セットのパルスを生成することが含まれる。
方法200はまた、220で、多重化光信号をn個の励起信号の1セットに分割して、試料を励起することを含む。n個の励起信号はそれぞれ、nセットのパルスのうちの1セットに対応する。
方法200はまた、230で、n個の励起信号のセットの互いの励起信号とは異なる試料の焦点面にn個の励起信号のセットの各励起信号の焦点を合わせることを含み、それにより、n個の励起信号のセットに応じて応答信号を生成する。いくつかの実施形態では、方法200は、(例えば、フォーカスユニット130の可動ミラーを介して)各励起信号の焦点面の位置を独立して調整することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法200は、試料内のそれぞれの焦点面内のn個の励起信号のセットの各励起信号を走査することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法200はさらに、試料内のそれぞれの焦点面内のnセットのパルスの各セットのパルスをさらに含む。いくつかの実施形態ではnセットのパルスは、パルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットを含み、方法200は、パルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットを分割することをさらに含む。このような実施形態では、方法200はさらに、試料内のそれぞれの焦点面内のパルスの第一のセットを走査すること、および試料内のそれぞれの焦点面内のパルスの第二のセットを走査することを含む。いくつかの実施形態では、方法200は、検出器を介して応答信号を受信することをさらに含む。
方法200はまた、240で、n個の放射信号のセットの各放射信号がn個の励起信号のセットのうちの一励起信号に対応する、n個の放射信号の1セットに応答信号を分離することを含む。いくつかの実施形態では、240で分離することは、応答信号をn個の放射信号のセットに分離することおよび/または1セットの基準信号に基づいて、n個の放射信号のセットを生成することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、システムは、光学信号を生成するためのレーザ源を含み、その光信号は第一の繰り返し速度で1セットのパルスを含む。システムはまた、電気光学変調器および偏光ビームスプリッタを含んで、光信号を受信し、第二の繰り返し速度で1セットのパルスを含む多重化光信号を生成する。第二の繰り返し速度は、第一の繰り返し速度の二倍であり、第二の繰り返し速度のパルスのセットは、第一の繰り返し速度でそれぞれパルスの第一のセットおよびパルスのセットを含む。パルスの第二のセットは、パルスの第二のセットとは異なる偏光状態を有する。
システムはまた、多重化光信号を受信し、多重化光信号を第一の励起信号および第二の励起信号に分割して試料を励起するフォーカスユニットを含む。第二の励起信号はパルスの第二のセットに対応し、第二の励起信号はパルスの第二のセットに対応する。フォーカスユニットは、フォーカスオプティックの第一のセットと、フォーカスオプティックの第一のセットとは異なる長手方向軸を有するフォーカスオプティックの第二のセットを含む。フォーカスオプティックの第一のセットおよびフォーカスオプティックの第二のセットはそれぞれ、1/4波長版、第二の対物レンズ、およびその対応する励起信号の焦点面の位置を独立して調節するためのミラーを含む。フォーカスオプティックの第一のセットおよびフォーカスオプティックの第二のセットはそれぞれ、第一の励起信号および第二の励起信号を受信し、試料を照射するために光学的に結合され、試料からの放射を生成する対物レンズをさらに含む。第一の励起信号は、試料の第一の焦点面に焦点を合わせており、第二の励起信号は、第一の焦点面とは異なる試料の第二の焦点面に焦点を合わせている。システムはまた、試料からの放射に基づいて応答信号を生成するように構成された検出器を含む。システムはまた、応答信号を第一の励起信号に対応する第一の放射信号と第二の励起信号に対応する第二の放射信号に分離するための無線周波数スイッチを含む。
簡略化のために、2セットのフォーカスオプティックを有するフォーカスユニット(「二重平面遠隔フォーカス」と呼ばれる場合もある)に関して説明するが、三つ以上のセットのフォーカスオプティックを有するシステムは、本明細書に開示された実施形態の範囲内であることが理解される。同様の名称および/または参照される構成要素(例えば、図3の光源110およびレーザ源/光源310)は、別段の記載がない限り、構造的および/または機能的に類似していてもよいことも理解される。
いくつかの実施形態では、システムは、一つ以上のスキャン組立品/ユニットを含むことができる。スキャン組立品(例えば、XYスキャナ)に対するフォーカスユニットの位置に基づいて、異なる構成が可能である。図3は、レーザ光源310およびマルチプレクサ回路320を含む例示的なシステム300を示す。ビームコンディショニング/マルチプレクサ回路320は、レーザ特性を修正するためのレーザ出力制御構成要素324およびパルス成形ユニット326を含みうる。ビームコンディショニングユニット320はまた、遅延線を含むことができ、ビームコンディショニングユニット320の出力は、本明細書に記載の多重化光信号である。システム300はまた、顕微鏡本体/ケーシング内に、多重化光信号を受信し、二つの励起信号を生成する二重平面遠隔フォーカスユニット330を含む。XYスキャナ335は、二つの励起信号を受信し、それぞれの励起信号をX、Y方向のそれぞれの焦点面内で走査する。対物レンズ340は、二つの励起信号を試料(図示せず)に印加して、検出器345は試料からの応答信号を捕捉する。
図4は、図3のものと類似しうるレーザ410および多重化ユニット420を有する別の例示的なシステム400を図示する。ここで、XYスキャナ435は多重化光信号を受信し、二重平面遠隔フォーカスユニット430はXYスキャナ435の下流にある。
図5は、図3のものと類似しうるレーザ510および多重化ユニット520を有する別の例示的なシステム500を図示する。ビームスプリッタ533(例えば、偏光ビームスプリッタ)は、パルスの第一および第二のセットを分離し、これはそれぞれのXYスキャナ535a、535bに送信される。ビームコンバイナ537(例えば、別の偏光ビームスプリッタ)は、2セットのパルスを組み合わせ、これは次に二つの励起信号を生成するため二重平面遠隔フォーカスユニットに送信される。
図6は、例示的な二重平面遠隔フォーカスユニット630の詳細を図示する。多重化光信号には、偏光ビームスプリッタ642によって分割されるパルスのs偏光セットおよびp偏光セットが含まれ、パルスのsセットをフォーカスオプティック660aの第一のセットに送信させ、偏光オプティックのpセットをフォーカスオプティック660bの第二のセットに反射し、これにより(図示するように)同一オプティックをオプティック660aのセットに含めることができる。オプティック660aのセットに関して説明すると、オプティック660a、660bのセットはそれぞれ、1/4波長板642、対物レンズ644(「遠隔対物レンズ」とも呼ばれる場合がある)、および可動ミラー646を含みうる。1/4波長板は、パルスの入ってくるセットの偏光、ならびにパルスの出ていくセットをそれぞれ90°まで変更することができ、その結果、ビームスプリッタ642に戻るパルスのセットは180°まで回転する。この方法で、オプティック660aのセットは、パルスの入射のsセットからパルスのpセットを生成し、オプティック660bのセットは、パルスの入射のpセットからパルスのsセットを生成する。これにより、図6に図示するように、共通の光経路に沿って、オプティック660a、660bのセットの偏光ビームスプリッタ642によって受信されたパルスのセットの組み換えが可能になる。いくつかの実施形態では、可動ミラー646の位置は、パルスの対応するセットの焦点面のZ位置、または深さに影響を与えるように独立して調整されうる。いくつかの実施形態では、可動ミラー646は、フォーカスミラー(「遠隔フォーカスミラー」とも呼ばれる場合もある)であってもよい。
図7A~7Cは、80MHzでフェムト秒パルストレインを生成するパルスレーザ光源(図示せず)と仮定して、システム100のさまざまな構成要素の例示的なセットアップを示す。図7Aは、時間的にインターリーブされたフェムト秒パルスとして多重化光信号を生成するためのマルチプレクサ回路720を図示する。パルストレインは、パルスのs偏光セットおよびp偏光セットを生成する電気光学変調器724に印加される。パルスのpセットは、偏光ビームスプリッタ726を介してパルスのsセットを組み換える前に6.25nsの時間遅延を誘発する遅延線(例えば、光ファイバー)を介して送信され、160MHzで多重化光信号を生成する。
図7Bは、図6に図示するユニット630と類似しうる二重平面遠隔フォーカスユニット730への図7Aの多重化光信号の印加を図示したものである。図7B~7Cに示すように、フォーカスユニット730によって生成される二つの励起信号は、試料(図示せず)における深さz1に焦点を合わせたs偏光励起信号、試料内のz1と異なる深さz2に焦点を合わせたp偏光励起信号を含む。図7Cはまた、光電子増倍管755を介した試料からの応答信号の収集を図示する。応答信号は、分離可能ではなく、かつ/またはその他の方法でPMT755を介して区別できる、二つの励起信号によって時間的にインターリーブする応答を含む。ここでアナログ多重分離ユニット(例えば、スイッチング回路)として図示されるデマルチプレクサ回路750は、インターリーブされた応答を二つの放射信号に分離する。図7Cの例示的な実施形態では、データ取得ボード(DAQ)756は、複数のXY値にわたって放射信号を収集して、それぞれ焦点面/位置z1、z2の個々の信号758a、758bを生成する。いくつかの実施形態では(図示せず)、信号758a、758bは、焦点面/位置z1、z2に対応する画像を生成する基礎とすることができる。簡潔に述べると、画像をラスタスキャン方式で生成することができ、また横方向スキャナのタイミングを使用して、所与の画素に対応する試料においてスキャナがX-Y位置を通過した時間にわたって積分された検出器からの強度値を所与の画素に割り当てることができる。
図8A~8Cは、システム100の様々な構成要素の他の例示的なセットアップを図示する。図8Aは、多重化光信号が入力レーザ信号と同じ繰り返し速度を有するような、多重化光信号生成を図示する。具体的には、図7Aに示すとおり、単一sパルスおよびpパルスをインターリーブする代わりに、sパルスおよびpパルスの群を交互にインターリーブし、pパルスをsパルスよりも低い出力に調整する。図8Bは、図7Bと類似した方法での二つの励起信号の生成を図示する。図8Cは、その後増幅器ユニット856を介して増幅される、PMT 855を介した応答信号の収集を図示する。DAQ857および画像処理ユニット850(例えば、プロセッサで実行される)は、増幅された応答信号を集合的に分析して、図8Aに示す時間符号化に基づいて、対応する画像858a、858bをそれぞれ生成するために、それぞれz1、z2位置で画素データを分離する。たとえば、DAQ857は、ピクセルクロックのタイミングに基づいて画素をデインターリーブすることによって、画素データを二つに分解できる。
図9A~9Cは、例えば、カルシウム撮像を介したニューロン活性の推定など、機能的分析の目的で、システム100の様々な構成要素の他の例示的なセットアップを図示したものである。図9Aは、多重化光信号が入力レーザ信号と同じ繰り返し速度を有するように、かつsパルスおよびpパルスが多重化光信号内に重ねられるように、多重化光信号生成を図示する。言い換えれば、偏光ビームスプリッタ926による組み換えに伴いパルスのsセットとpセットとの間の時間符号化/遅延はない。図9Bは、図7Bと類似した方法での二つの励起信号の生成を図示する。応答信号は、二つの放射信号の間の時間的な分離を含まないため、図9Cは、DAC957およびデータ処理ユニット950を使用して関数型データ958a、958bを時間的に分離できることを示す。非限定的な例として、データ処理ユニット950は、独立した構成要素分析、ソースデミキシング、および/または同種のものなどであるが、それに限定されない一つ以上の計算手法を用いて、異なる焦点面から関数型データ958a、958bへの信号を分離することができる。
図10は、一部の実施形態による、例示的なシステム1000を示す。いくつかの実施形態では、図10は、本明細書に詳述されるように、二重平面遠隔フォーカスユニット1030および時間ドメイン多重化/多重分離能力を有する修正多光子メソスコープ(Thorlabs)システムを図示する。システム1000は、80MHzでのTi:サファイアレーザの動作としてここに図示されるレーザ源1010を含む。システム1000はまた、二つのEOM1011、1013を直列に備えるデマルチプレクサユニット1020を含む。直列に配置された二つのEOMは、焦点面/撮像面の両方で完全な出力入力制御を達成でき、利用可能なレーザ出力のより効率的な使用を可能にすることができる。第一のEOM1011は、総出力入力を制御するが、第二のEOM1013は、偏光ビームスプリッタ1014の前に入ってくるレーザビームの偏光を回転させて、二つのビーム間の出力スリッティング比を制御する。多重化ユニットはまた、直交偏光ビームの経路/遅延線1015を含んで、6.25nsの時間遅延を与える。
一連の超短波パルスからなる入ってくるビーム/光信号を、PBS1014で二つの直交偏光ビームに分割し、6.25nsだけ他方に対して一方を遅らせ、これらのビームをPBS1916と組み換えることによって、励起パルストレインの時間符号化を効果的に生成する。ビームは、最初に直交偏光ビームを分離し、独立して位置付けられたミラーM1およびM2を有する二つの遠隔フォーカスユニットにそれらを向ける二重平面遠隔フォーカスユニット1030に向けられる。次に遠隔フォーカスユニット1030はビームを再び組み換え、それらをXY走査オプティックGS1、GS2、GS3に向ける。この構成では、焦点面/撮像面は、軸方向に独立して配置されるが、横方向に結合されたままである。PMT1045(例えば、H11706-40、Hamamatsu)信号は、400MHzアンプ1046(例えば、HCA-400M-5K-C、FEMTO)で増幅され、カスタム多重分離回路1050に向けられる。図示したように、一部の実施形態では、回路1050は、無線周波数(RF)スイッチ(例えば、CMD196C3、カスタムMMIC)に基づくことができる。システム1000はまた、ビーム位置決めオプティック1032、1034、1036を含む。
いくつかの実施形態では時間的多重分離には、時間がかかるレーザ動作周波数との同期を必要とすることがある。ここでは、フェムト秒レーザ同期信号出力からRFスイッチ制御に対する相補的なRF信号を導き出すために、80MHz帯域パスフィルタ1018およびコンパレータ1019(例えば、LTC6957-HMS3、アナログデバイス)が用いられる。これらの制御/基準信号は、約5Vのピーク間振幅および約-1.0Vの共通モードでの相補的な方形波信号である。多重分離後に、高帯域幅信号は50MHzのローパスフィルタ1054a、1054b(ミニ回路)を通過し、デジタイザ入力DAQ1、DAQ2(例えば、NI FlexRIO、National Instruments)に向けられる。Vidrioによってカスタマイズされた制御ソフトウェア(ScanImage、Vidrio LLC)は、二重平面遠隔フォーカスユニット1030およびEOM1011、1014の両方に対する完全制御を提供し、二つの撮像面での走査に適応できる。
図11は、アナログ乗算を使用して時間的にインターリーブされた光ルミネセンス信号(応答信号内の)を復号するための例示的な実施形態を図示する。この例ではフェムト秒レーザである光源1110からの同期信号は、RF帯域パスフィルタ1118およびコンパレータ1119に印加され、二つの方形波基準信号を生成する。検出器/PMT1145からの検出された信号は、RFスプリッタ1150を使用して分割される。RFスプリッタ1150からの二つの信号は、RF乗算器1152a、1152bそれぞれを介して基準信号で乗算され、続いてDAQ1157a、1157bそれぞれを介してデジタル化される。
図12~13は、パルスのsセットおよびpセットの制御のための例示的な手法に関する追加的詳細を含む。図12は、図10と類似したセットアップ/手法を図示したものであり、第一のEOM1222は総出力入力を制御し、一方で第二のEOM1224はパルスのsセットとpセットとの間の出力分割比を制御する。図13は、パルスの各セットの出力がインラインで調節され、ビームスプリッタ1322によって後分割されるセットアップ/手法を図示する。第一のEOM1324は、パルスのsセットの出力レベルを制御し、第二のEOM1326はパルスのpセットの出力レベルを制御する。
図14A~14Cは、既存のシステムへの取り外し可能な付属品として、本明細書に記述した二重平面遠隔フォーカスユニットなどのフォーカスユニット上に追加する例示的な手法を示す。図14Aは、第二の遠隔フォーカスユニットなしの元のシステムのCADモデルを図示し、図14Bは、図14Aのシステムに追加された二つの遠隔フォーカスユニットを含む付属品のCADモデルを示す。図14Cは、既存のシステムのブレッドボードに取り付けられた例示的な二重平面遠隔フォーカスアドオンモジュール写真である。こうした実施形態では、二重平面遠隔フォーカスモジュールは、既存の構成要素を修正する必要なしに、既存のシステムに取り付け、かつ取り外すことができる付属品として設計されうる。二重平面遠隔フォーカスモジュール追加の一つのこうした例は、以下のように、光学系を取り付けられたブレッドボード用とすることができる。第一に、既存のねじ穴を使用して、ツーピース連結板をブレッドボード上に取り付けることができる。次に、高速/急速移動ステージ、取付けブラケット、および二次遠隔フォーカスユニットがこのプレート上に取り付けられる(図2b)。一部の機械的制約と仮定すると、ビームスプリッタ(立方体)の後の二次的なs偏光ビームは、第二の遠隔フォーカスユニットの方のブレッドボードに直交する方向に(第一の遠隔フォーカスユニットおよび第二の遠隔フォーカスユニットを図10のフォーカスユニット1030に図示された方法と同様の方法で互いに対して位置付けて)向けることができる。いくつかの実施形態では、この機械的設計は、ブレッドボードのXYZおよび傾斜調整を制限することなく、多光子メソスコープ(Thorlabs、Inc.)のエンクロージャの内側に収まる。
本明細書に開示されるように、一部の実施形態では、一つ以上の基準信号は、反応信号の時間復号で使用するための光源(例えば、パルスレーザ源)から導き出されうる。図15A~15Cは、異なるデューティサイクルを有するフェムト秒レーザシグナルから得られたいくつかの例示的な基準信号を示す。図15Aの基準信号のデューティサイクルは約50%である。図15Bの基準信号のデューティサイクルは約45%である。図15Cの基準信号のデューティサイクルは約30%である。
さまざまな走査技術を説明すると、図16A~16Cは、本明細書に開示された実施形態毎に可能な例示的な走査パラダイムを示す。図16Aは、本明細書に記載される二重平面遠隔フォーカスユニットを用いた、二光子顕微鏡での体積測定イメージを図示する。二つの励起信号(s偏光およびp偏光)はそれぞれ、異なる平面に焦点を合わせることができ、次いで両方とも他の平面に移動することができる。図16Bは、大容量の同時二重平面撮像を図示したものであり、各撮像面は独立したZ位置/焦点面位置を有するが、XYの位置決めの範囲を維持する。図16Cは、大容量の同時二重平面撮像を図示したもので、各撮像面は独立したZおよびXYの位置決めの範囲を有する。
図17A~17Cは、図10のシステムで取得されたニューロンインビボの画像であり、図17Aは第一のチャネルからの画像であり、図17Bは第二のチャネルからの画像であり、図17Cは両方の撮像チャネルからの組み合わされた画像である。撮像された二重特徴を図示するために、二つのZ平面をXY 方向に故意にオフセットした。
実施例1
二光子レーザ走査顕微鏡(TPLSM)は、カルシウム信号のインビボ機能記録用標準ツールになっている。非常に大きな視野を有する新規のメゾスコピック撮像システムの進歩により、機能的撮像および分析にほぼ100倍大きい容量へのアクセスが与えられ、複数の皮質領域にわたるインビボ脳機能の研究および情報交換のための新たなフロンティアが開かれた。フレームレートの制限により、研究者は撮像領域のサイズ、横方向移動の回数(ROI)、およびROI内の軸方向平面数の間のバランスを見つける必要があり、その結果、各平面を満足のいく時間的分解能で撮像できる。より速いTPLSM撮像方法は、脳光生理学的研究の範囲をさらに拡大するために非常に望ましい。この要望に対処するために、近年、様々な方法が導入されてきた。これらの手法はそれぞれ、解像度、有用な信号振幅、および許容されるレーザ出力入力間の異なる形態のトレードオフを利用して、解像度の減少、ノイズに対する信号の低下(SNR)、および撮像深度の低減を犠牲にしてより高い撮像スループットを達成する。例えば、ベッセルビームを用いた撮像は、被写界深度を拡大するため横方向解像度を維持し、軸方向の解像度を故意に犠牲にし、ベッセルビームの長さにほぼ比例したレーザ出力の増加を要求して、従来のTPLSMと同様の信号振幅を有する個別の細胞から蛍光信号を記録する。レーザ出力の入力の増大により、特にインビボ深部の撮像のとき、より高い背景蛍光が生じ、かつ、出力調整と組み合わせて光散乱によって生じる信号減衰を補正するとき、有意に小さな深さで生物学的に許容可能な出力レベル閾値に達する。
複数の励起ビームおよび単一の検出器を用いた同時複数サイト記録を可能にするより速いカルシウム撮像スループット多重化技術を実現するための成長する必要性に対処することが、浮かび上がる。ただし、これらの方法は、原則実証の証明として考慮することができ、ニューロサイエンスで使用する準備が整う前にさらなる開発が必要である。理想的には、TPLSMシステムは、複数の皮質領域、異常補正機構および最適化された収集効率から情報を記録する大きな視野を有し、効率的な二光子励起および蛍光信号検出、光学的にアクセス可能な体積内で撮像平面を移動するため高速走査ならびに高速な横方向および軸方向位置決め機構を確実にする必要がある。Sofroniewらによって開発され、Thorlabによって商品化された多光子メソスコープ(MM)は、現在これらの要件を満足する唯一の商業システムである。システムは、遠隔フォーカスの原理を利用して、誤差補正された二光子撮像を達成する。
本明細書では、既存のものに同一の第二の撮像チャネルを追加することによって、その撮像スループットを効果的に倍にするMMシステムに対する修正が開示される。追加された励起経路は、撮像面の軸方向位置付けに責任を有する独自の遠隔フォーカスユニットを利用し、横方向の位置決めをする光力学を元のビームと共有する。時間分割多重化(TDM)の原理を利用して、励起レーザパルストレインを時間遅延で符号化し、検出器へのそれらの到着時間に基づいて各チャネルから時間的にインターリーブされた蛍光信号を復号する。この結果、軸方向に独立して位置付けられた二つの焦点面からの同時撮像が達成された。
図10は、使用されるシステム1000を図示する。図14A~14Cは、元のMMシステムのブレッドボードに取り付けられたアドオン式モジュールを示す。
元のMMおよび修正された二重平面多光子メソスコープ(MM2x)の詳細な評価および比較は、両方のシステムの動的範囲および雑音レベル、撮像チャネル間のクロストーク、異なる深度での撮像体積の異なる領域内の点広がり関数を測定することによって実施された。元のMMシステムを特徴付けるために、多重分離電子機器は信号検出経路から取り外され、電流増幅器およびローパスRFフィルタのみが配置されている。
160MHzのパルス速度を組み合わせた時間的にインターリーブされた励起パルスは、異なる位置から生じる対応する一連のインターリーブされた蛍光信号を作り出す。単一レーザパルスからの蛍光信号を含む時間ウィンドウの幅は、6.25nsに等しい。したがって、これらの信号を分類するため、多重分離電子機器は十分に高い帯域幅を有するべきである。高い帯域幅要件が必要である一方、正常な時間的多重分離は使用中の染料の蛍光寿命にも依存する。緑色蛍光タンパク質に基づくカルシウムインジケータの蛍光寿命τは、2.7~3.2nsである。この寿命は、蛍光信号を次の時間ウィンドウに延長させるのに十分に長く、それにより、撮像チャネル間の著しいクロストークを生成する。
予想されるクロストーク値を評価するために、PMTおよび増幅器の測定器応答に関連する約400MHzおよび約500MHzの帯域幅を有する二つのガウスプロファイルの畳み込みおよび蛍光寿命によって定義される指数関数系崩壊信号によって蛍光信号を表現する数値モデルが作成された(図18A)。最初と次の時間ウィンドウ間のクロストークは、これらの時間間隔で統合された信号の最小比として特徴付けられた。クロストークの減少は、時間窓幅、すなわちそのデューティサイクルを減少させることによって達成することができる。図18Bは、デューティサイクルの関数としての異なる蛍光寿命の演算クロストーク値を示す。例えば、τ=3nsおよび50%デューティサイクルの場合、推定クロストーク値は、約16%に等しい。デューティサイクルを減少することで、図18Cに示すように、有用な蛍光信号の一部を失うことを犠牲にして、クロストークが減少する。顕著なクロストークの減少は、デューティサイクル値が40~50%で発生する。図18Cは、6.25nsの窓内の統合信号に対する信号損失を示し、この時間間隔を超えて延長する信号による追加的な10~16%の損失を考慮しない。
図19Aは、多重分離電子機器の動作を示す。ここでは、0~1Vのステップおよび100nsの持続時間を有する入力方形波形が、レーザ同期信号から得られる制御信号によって二つのDAQチャネル間で切り替わる。図19Aにおける信号の10~90%の上昇/下落時間は約0.6nsである。両方の信号は、12.5nsの期間、および約39%のデューティサイクルを有する。出力信号の振幅は、1.6±0.2dBだけ減衰され、これは、製造者が明記した挿入損失と一致する。単一の光子検出イベントに対応する平均PMT信号、およびGCAmp6f標識化細胞および花粉粒(PG)の測定された時間分解蛍光信号の例が、図19B、19Cに示されている。図19Bにおけるインパルス応答トレースは、プリアンプの帯域幅によって定義される約2.5nsのFWHMを有する主ピーク、ならびにPMTプリアンプ接続内のブロードバンドパルスの反射に起因するより小さいサイドローブを示す。測定された時間分解蛍光信号は、図18Aのシミュレーションされたトレースよりもわずかに広がっており、これは回路のインパルス応答の増加した幅、測定中の電子ジッタによって引き起こされる場合があり、3ns GCaMP6fの蛍光寿命よりも長い。PG試料(図19C)の時間分解蛍光測定値は、鉛被ケーブルの長さを45cmから5cmに低減する前に記録され、トレースは反射によって引き起こされるより顕著な二次ピークを示し、主ピークから約5nsほどオフセットする。
撮像チャネル間のクロストークは、単一チャネルの励起を使用して試験試料からの信号を記録し、両方のチャネルの放射信号を記録することによって測定された。蛍光クロストーク値は、マウス脳のインビボ画像、および染色された花粉粒(PG)(Carolina)の試料(図20A~20C参照)を用いて、時間遅延の関数として評価もされた。特に、PG試料は、GCAmp6fと比較してはるかに短い蛍光寿命を示した。図20Aは、第一のチャネル内に存在する励起と共に記録された両方のチャネルにおけるマウス大脳皮質のインビボ画像を示し、平均1000倍である。異なる時間遅延で記録されたマウスおよびPGの画像内の選択された領域の平均信号に対応する正規化された蛍光強度プロファイルが、図20B、20Cにそれぞれ示される。撮像チャネル間のクロストーク値は異なり、脳組織およびPG画像ではそれぞれ約7%および1%のレベルで表される。
二つの撮像システムの間の定量的な類似性を示す例が、図21A~21Dに示されている。GcaMP6f標識化脳組織切片の二光子画像を、チャネル1またはチャネル2のいずれかの励起経路を使用して、MMおよびMM2xで記録した。絶対強度値は、元のMMと比較して多重化システムで記録された画像でわずかに弱められている。平均強度値は、異なる励起強度で取得された400画像の他、図21A~21Dに示される選択されたROI内の平均強度から計算された。結果は、図22A、22Bに示されている。対応する画像から計算された平均分散プロットを図22Bに示す。両方の撮像システムでほぼ同じ雑音レベルが観察された。
GCaMP6fは高励起強度で光退色するため、この発蛍光団を使用して二つの撮像システムの全ての動的範囲を評価し比較することは、困難でありうる。この目的のため、より明るくより光安定性のある蛍光試料が使用された。それらの画像が異なる励起出力レベルで記録された時、同様の実験のセットがPGを使用して実施された。取得された画像の一例を図23Aに示す。図23Bは、選択されたPGの入力出力に基づく蛍光強度依存性を示す。4000カウント未満の強度レベルでのMMおよびMM2xからの信号の定量的な類似性が観察された。MM2における蛍光信号は、このレベルより上の飽和の明瞭な兆候を示す。したがって、MM2xの動的範囲は、MMと比較して50%低くなる。これらの画像から計算された対応する平均分散プロットは、図23Cに示され、チャネル1からのデータを提示する。信号飽和限界より低い両方の撮像システムの雑音関係に対してほぼ同一の信号が観察された。
ポイント拡散機能(PSF)測定は、0~500μmの異なる撮像深度およびシステムの視野の異なる領域の水性ゲルマトリックス内の固定された200nm蛍光ビーズのzスタックを取得することによって、撮像体積全体で実施された。300μmの深さで記録された二つの撮像チャネルからのPSFの例は、を図24A、24Bに示される。グレーの円の内側の点の位置は、PSFが測定された視野の位置を示す。偽色画像は、体積測定PSFの単一平面(XY、XZ、YZ)への突起を示す。ラインプロットは、対応する突起部の断面を示す。測定されたPSF値の完全なリストは、表1に提供される。両方の撮像チャネルに全体的にほぼ同一のPSF値が観察された。
表1.撮像体積にわたるMM2xシステムのポイント拡散機能特性
Figure 0007287961000001
二光子時間分割多重化方法が年数前に実証されているものの、この方法は商業的計測器のレベルに進展していない。今日まで、わずかな二光子撮像コミュニティの研究グループのみが、この方法を独自の実験セットアップで実施した。特に、100MHzを超える時間的にインターリーブされた高帯域幅のPMT信号の多重分離は、技術的に困難である。この撮像技術を可能にするために解決すべき問題は二つある。第一は、撮像チャネルへの信号の正しい割り当てに重要なレーザ繰り返し速度を有する検出電子回路の同期である。レーザパルス速度は共振経路長に依存するため、例えば、周囲温度の変化によって任意の経路長さ変化はパルスレート周波数を変える。これにより、任意の形状の時系列信号の周期シーケンスが、主要周波数を中心とする個別の周波数セットによって表されることを思い出させる。従って、80MHzを中心とした適切なRFフィルタを使用して主要周波数構成要素を絶縁することが可能であり、結果得られる正弦波を方形波形、またはRFコンパレータ回路を使用して相補的方形波形に変換することが可能である(図10)。
第二および最も困難な問題は、多重分離である。インビボカルシウム信号に対応するPMT出力での電気信号は、個々の光子検出イベントから生じる絶縁された高帯域幅スパイクから高光子流束からの信号の著しく高く長いバーストに及ぶ、大きなダイバーシティを示す。全体的に、デジタル化された信号の動的範囲は、4桁より多くにわたる。検出感度、検出帯域幅、および動的範囲の観点から、多重分離電子機器のための結果的な要件を満たすことは困難である。発行済みのレポートはそれぞれ独自の多重分離方法を説明する。同一の実験条件で測定した従来的なTPLSMとの詳細な比較は通常、提供されなかったため、撮像システムの性能がどの程度多重分離電子機器によって影響を受けるかは不明確なままであった。初期の多重分離スキームは、同じアナログ乗算器ADL5391(アナログデバイス)を利用したカスタム回路に基づいた。この手法は多重分離(データは非表示)を達成したが、この解決策は、追加の増幅段階の存在および高振幅低帯域幅信号によって引き起こされる著しい背景変化により、暗雑音が5倍以上増加した。図10の多重分離回路は、製造者が明記した1.8nsのスイッチング時間を有する高速RFスイッチに基づく。0~-5Vの制御電圧を印加することを推奨しているが、正電圧に向かってスイッチ操作を制御する相補的な80MHz方形RF信号をわずかに変化させることによって、もっと速いスイッチ力を達成することが可能でありうる。図19Aに示されるように、信号統合窓のデューティサイクルが低減された制御信号の段階的変化に続く約1nsの遅れ時間が観察された。
検出電子機器の帯域幅および蛍光染料の時間的プロファイルは、平均された信号の幅に影響し、それは現在の窓内にどれだけ適合するか、かつそれが次の時間窓にどの程度漏れるかに影響する。例えば、図19A~19C、20A~20Cは、PG試料のクロストークが、それぞれの蛍光寿命の違いにより試料のGCaMP6f標識化試料より著しく小さいことを示す。興味深いことに、GCaMP6fに対する約8%の測定されたクロストーク値は、図18における数値分析による予測よりも顕著に小さい。検出システム(図19B)のインパルス応答は、次の時間窓内に延びる蛍光信号の振幅を減少させる可能性が高い小さなアンダーシュートを有することに留意されたい。
一つの有用なパラメータは、多重化撮像システムで失われた有用な信号の一部分である。染料の検出電子機器および蛍光寿命の帯域幅は、蛍光信号の時間的な幅に影響し、測定間隔内に適合する量、および次の時間窓への漏れの量に影響を与える。本明細書に開示されるTDM システムは、一部の実施形態では、より短い蛍光寿命を有する試料を好んで、クロストークの低減および有用な信号の損失を低減する。図23A~23Bに示したMMおよびMM2xで撮像されたPG試料からの蛍光信号の蛍光信号の一対一の比較は、信号飽和効果が発生する前の特定の制限内ではあるが、両方のシステムの性能がほぼ同一であることを示す。図21A~21Dおよび図22A~22BにおけるGCaMP6f標識化試料からの蛍光信号の同様の比較は、それぞれ修正システムでの信号振幅の最大24%減少を示す。このような信号損失は、平均GCaMP6f蛍光信号が、図19A、19Bに示す通り、4.9nsの時間間隔に適合しないため予測される。図19A、19Bからのデータを使用して、合計GcaMP6f蛍光信号の約17%が時間窓の外側に表示され、約5%が次のところに表示されることが推定される。これらの推定は、図26A~26Cにおける実験的に観察されたクロストーク値と十分に一致する。図22Aの蛍光信号の直接的な比較は、24%の信号損失を示した。その一部は、システムの増幅因子(またはシステム変換利得)のみを変更し、検出された光子の数に影響を与えない、多重分離電子機器の挿入損失に起因する可能性がある。
MMおよびMM2xシステムに対応する図22D、23Cにおける平均分散プロットは、信号飽和効果が発生する前に密接に一致して表示され、両方の撮像システムで同一の雑音レベルを示唆する。両方の撮像チャネルのMMおよびMM2xで記録されたGCaMP6f標識化画像から計算された平均分散プロットの線形勾配は、70±2カウントに等しく、これは平均値の±3%以内である。
8000カウントの近くに表示されるMMでの信号飽和(約213)(図21A)は、限定された±1Vの入力電圧範囲を有する14ビットDAQ電子機器によって引き起こされる。信号基準レベルは現在0Vに設定されていることに留意されたい。したがって、DAQ入力で表示される信号は、記録された信号で非直線性を避けるために、1Vより低い振幅を有する必要がある。所与のPMT利得設定における増幅されたPMT信号のピーク電圧は、常に1Vを超え、低パスフィルタの使用は、DAQデジタル化窓およびデジタル化速度に対する信号の一致に必須である。多重分離回路が定位置にある場合、信号飽和は約4000カウントで発生し、これは検出ダイナミック範囲の50%の減少に対応する。試験実験では、RFスイッチが通過信号を徐々に減衰し、それらの振幅を±2Vに制限することが観察された。これらの電圧レベルは、プリアンプとスイッチの両方の動作制限の近くまたはそれより上に表示される。スイッチ動作は正の信号極性および負の信号極性で同一であるため、DCオフセットをプリアンプ出力に導入し、新しい基準に対して信号を測定することによって、動的範囲を延長することが可能である。
実施例2
最近、直径約5mmの超大型視野内でのカルシウム撮像が可能な多光子メソスコープ(MM)を開発および商品化した。二光子顕微鏡で走査速度が限定されるため、わずかな選択された関心領域のみが適切なフレームレートでの画像でありうる。一過性カルシウム信号を記録するために8~10Hzの満足のいく時間分解能を達成するために、研究者は、光学的にアクセス可能な撮像容量内の撮像領域のサイズと関心領域の数との間のバランスを見つける必要がある。図10は、その撮像を全体的に効果的に倍にするMMシステムの修正を図示する。時間分割多重化および遠隔フォーカスの方法を使用して、軸方向に独立して位置付けられた二つの焦点面からの同時画像取得を可能にする。
図25A~25D、26A~26Cは、機能的カルシウム信号記録のクロストークを図示する。具体的には、図25A、25Bおよび図25C、25Dは、試料を第一または第二のチャネルのみで励起すると同時に、約200および300μmの深さで同時に記録されたマウス脳組織の二つのチャネルからの動き補正および平均化された対の画像を示す。したがって、画像の各セットは、関心面内のセルからの蛍光信号を示し、クロストークの存在によって、同じ細胞のゴースト画像が表示される。図21A~21Dのゴースト画像内の画素強度は、10倍される。カルシウム信号を選択した細胞から抽出して、両方の撮像チャネルにおけるそれらの相対強度を示した(図26A、26B)。図26Cは、図26A、26Bで測定されたカルシウム信号の比として計算されたクロストーク値を示す。図26Cのトレースから計算された平均クロストーク値は、それぞれ、チャネル1からチャネル2に対して(5.6±0.7)・10-2およびチャネル2からチャネル1に対して(7.0±1.1)・10-2である。蛍光の確率的な性質により、クロストーク値の変動が、フレームからフレームへと発生する。
実施例3
幾つかの標準的な皮質回路モデルは、感覚処理の一つの可能な基本単位として二つの完全な皮質柱間の相互作用を提案する。特に、二つの接続された皮質柱にわたるボトムアップ回路とトップダウン回路の動的相互作用は、感覚情報がどのように処理されるかにおいて重要な役割を果たす。二光子レーザ走査顕微鏡(2P-LSM)により、神経活動の蛍光カルシウムインジケータを使用して、哺乳類脳における神経活性の記録が可能になる。最近の2P-LSMの前進は、撮像フィールド視野(FoV)を約0.4×0.4mmから5×5mmに増大し、この大きなFoV内の複数の関心領域(RoIs)の無作為の位置決めを支持する。さらに、二つの相互接続された皮質柱にわたるニューロン活性の流れを同時に記録することは、皮質層の対の小さな部分集合に限定されている。図10に、同時に記録されたRoIsの数を延ばし、最大約11Hzのフレームレートで二つの皮質柱の複数の層の撮像を達成する、二光子ランダムアクセスメソコピー(2P-RAM)を二重平面遠隔フォーカスと組み合わせる先進的顕微鏡システムを提示する。PMTおよび多重分離は、カスタム電子機器を使用する。マウスの一次視覚皮質(V1)および異なる皮質層に位置する画像平面を有するその他の高い視覚領域(VA)内に位置する二つの皮質柱でのインビボ撮像が、本明細書において示される。図27は、最適なフレームレートを可能にする二つの可能性のある撮像シナリオ、すなわち、二つの横方向領域(V1およびLM)内の4つの軸方向に分離された平面の撮像および四つの横方向位置(V1、LM、AM、AL)内の二つの軸方向に分離された平面の撮像を示す。
図28A~28Dは、クロストークの不混合のための例示的なワークフローを示す。具体的には、両方のチャネル上のデータを取得しながら、単一のビームで走査することによってグラウンドトゥルースデータを測定した。信号対クロストークの2Dヒストグラムをプロットし、リニアフィットを計算した(図28B参照)。フィットの傾斜は、走査された平面から非走査平面(クロストーク)への信号の漏出量の割合を示す。混合マトリクスは、二つの傾斜およびそれらの捕捉物から構成され、クロストークからの信号を分離するために混合データに加えられた。
図29A、29Bは、クロストークデミキシングの結果を示す。図29Aの矢印は、誤ったチャネルに漏出した細胞からの信号を示す。デミキシングの前および後の撮像データが本明細書に示され、デミキシング後に漏れが消滅することを示す。図29Bは、信号面(青色)、クロストーク面(オレンジ)およびデミキシング後のクロストーク面(緑色)のカルシウムトレースを示す。
図30A、30Bは、二つの皮質柱のインビボ撮像を図示する。Slc17a7;Ai93マウスの75μm、175μm、275μm、および375μmの深さでV1(図30A)およびLM(図30B)中で11Hzで8平面の同時撮像。FoVは400x400μmであり、Al Brain Observatory datasetsの標準サイズに合致して実行された。LUTは、異なる深さでコントラストを最適化するために調整した。フレームは、8倍で時間平均される。
図31A~31Dは、四つの皮質領域のインビボ撮像を図示する。Vip-IRES-Cre;Ai148マウスは、75μm、190μmの二つの深さでV1(図31A)、Lm(図31B)、AL(図31C)、およびAM(図31D)中の視覚皮質で撮像された。フレームレートは11Hz、FOV 400×400μmである。各フレームのLUTは、コントラストを最適化するために調整される。
図32A~32Dは、二つの皮質柱にわたる相関関係を図示する。Vip-IRES-Cre;Ai148マウスは、75μm、175μm、275μm、および325μmの四つの深さでV1およびLMの視覚皮質で撮像された。約1200の細胞を記録し、分析した(V1で400、LMで200)。多くの細胞は、単一平面記録と類似した相関関係を示す。
二重ビーム二光子メソスコープシステムは、二つの皮質柱での同時結像を可能にする。本明細書では、2軸位置で4つの視覚領域におけるVipおよびSlcのマウス、および4軸位置の二つの視覚領域での撮像が本明細書で実証されている。性能は、元のおよび二重平面2P-RAMのシステム利得の観点から比較された。クロストークは、10%未満であることが示されているGCaMP6標識化組織についても評価された。システムは、動作装置と統合され、活動中のニューラル活動追跡を可能にする。
以下の参照はそれぞれ、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
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本明細書において様々な発明の実施形態を記載し、例示してきたが、当業者は、本明細書に記載の機能を実施し、ならびに/または結果および一つ以上の利点を得るための、様々な他の手段および/または構造を容易に想定し、かかる変形および/または変更の各々は、本明細書に記載の発明に関する実施形態の範囲内であるとみなされる。より一般的には、当業者は、本明細書に記載するすべてのパラメータ、寸法、材料、および構成が例示を意味し、実際のパラメータ、寸法、材料、および/または構成が、本発明の教示が使用される特定の一つまたは複数の用途に依存することを容易に理解するだろう。当業者は、本明細書に記載する特定の発明に関する実施形態の多くの同等物を認識し、またはただ通常の実験を用いて確認することができる。したがって、前述の実施形態は、例としてのみ提示され、添付した特許請求の範囲およびその同等物の範囲内であり、発明の実施形態が、具体的に記載し請求する以外の形でも実践されうることを理解されたい。本開示の発明に関する実施形態は、本明細書に記載する個々の特徴、システム、物品、材料、キット、および/または方法を対象とする。加えて、二つ以上のこのような特徴、システム、物品、材料、キット、および/または方法の任意の組み合わせは、このような特徴、システム、物品、材料、キット、および/または方法が相互に矛盾しない場合、本開示の本発明の範囲内に含まれる。
上に記載した実施形態は、多数の手段のいずれかで実施できる。例えば、本明細書に開示される実施形態は、ハードウェア、ソフトウェア、またはそれらの組み合わせを使用して実装されてもよい。ソフトウェアに実装される場合、ソフトウェアコードは、単一のコンピュータに提供されるか、複数のコンピュータ間に分散するかにかかわらず、任意の適切なプロセッサまたはプロセッサの集合で実行され得る。
さらに、コンピュータが、ラック搭載型コンピュータ、デスクトップ型コンピュータ、ラップトップ型コンピュータ、またはタブレット型コンピュータなど、多数の形態のいずれかで具現化されうることは理解されるべきである。加えて、コンピュータは、概してコンピュータとみなされるデバイスではなく、パーソナルデジタルアシスタント(PDA)、スマートフォン、またはいかなる他の適切な携帯型もしくは固定電子デバイスを含む、適切な処理能力を有するデバイスの中に埋め込まれてもよい。
また、コンピュータは一つ以上の入力および出力デバイスを有しうる。これらのデバイスは、とりわけ、ユーザインターフェースを提示するために使用できる。ユーザインターフェースを提供するために使用できる出力デバイスの例には、プリンタまたは出力の視覚的表現のためのディスプレイ画面、およびスピーカーまたは出力の可聴表現のための他の音声発生デバイスが挙げられる。ユーザインターフェースに使用できる入力デバイスの例には、キーボード、ならびにマウス、タッチパッド、およびデジタイザタブレットなどのポインティングデバイスが含まれる。別の例として、コンピュータは、音声認識によってまたは他の可聴フォーマットで、入力情報を受信してもよい。
このようなコンピュータは、ローカルエリアネットワーク、またはエンタープライズネットワークなどの広域ネットワーク、およびインテリジェントネットワーク(IN)またはインターネットを含む、任意の適切な形態の一つ以上のネットワークによって相互接続されてもよい。このようなネットワークは、任意の適切な技術に基づいてもよく、任意の適切なプロトコルに従って動作してもよく、無線ネットワーク、有線ネットワーク、または光ファイバーネットワークを含んでもよい。
本明細書に概説する様々な方法またはプロセスは、様々なオペレーティングシステムまたはプラットフォームのうちのいずれか一つを用いる、一つ以上のプロセッサ上で実行可能なソフトウェアとしてコード化されてもよい。加えて、このようなソフトウェアは、多数の適切なプログラミング言語および/またはプログラミングもしくはスクリプトツールのいずれかを使用して記述されてもよく、またフレームワークもしくは仮想マシン上で実行される、実行可能なマシン語コードまたは中間コードとしてコンパイルされてもよい。
また、様々な発明の概念が、一つ以上の方法として具現化されてもよく、その例を提供してきた。方法の一部として行われる行為は、任意の適切な手段で順序付けられうる。したがって、行為が例示するものとは異なる順序で行われる実施形態を構築してもよく、それは、例示的実施形態に連続する行為として示す場合であっても、一部の行為を同時に行うことを含みうる。
本明細書で言及するすべての出版物、特許出願、特許、および他の参考文献は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。
本明細書で定義および使用するすべての定義は、辞書定義、参照により組み込まれる文書の定義、および/または定義された用語の通常の意味を統制するものと理解されるべきである。
本明細書および特許請求の範囲で使用する場合、不定冠詞「a」および「an」は、明確にそうでないと示されない限り、「少なくとも一つ」を意味すると理解されるべきである。
本明細書および特許請求の範囲で使用する場合、「および/または」という語句は、結合された要素の「いずれかまたは両方」を意味し、すなわち、一部の場合には接続的に存在し、他の場合には離接的に存在する要素を意味すると理解されるべきである。「および/または」で挙げられる複数の要素は、同じ形式、すなわち、結合される要素のうちの「一つ以上」と解釈されるべきである。他の要素は、具体的に識別される要素に関連するかまたは関連しないかにかかわらず、「および/または」節によって具体的に識別される要素以外に、随意に存在してもよい。したがって、非限定的な例として、「Aおよび/またはB」への言及は、「備える」などの制限のない語法と連動して使われるときに、一実施形態においては、Aのみ(任意選択的にB以外の要素を含む)、別の実施形態では、Bのみ(任意選択的にA以外の要素を含む)、さらに別の実施形態では、AとBと両方(任意選択的に他の要素を含む)などを指すことができる。
本明細書および特許請求の範囲において使用する場合、「または」は、上で定義した「および/または」と同じ意味を有すると理解されるべきである。例えば、リスト内の項目を分離するとき、「または」または「および/または」は包括的なもの、すなわち、複数の要素または要素のリスト、および随意にリストに無い追加の項目のうちの少なくとも一つを含むが、二つ以上も含むと解釈されるものとする。それとは反対であると明確に指示した用語のみ、例えば、「のうちの一つのみ」もしくは「のうちの正確に一つ」、または特許請求の範囲において使用するときの「から成る」は、多数の要素またはリストの要素のうちの正確に一つの要素の包含を指す。概して、本明細書で使用する場合、「または」という用語は、「いずれか」、「のうちの一つ」、「のうちの一つのみ」、または「のうちの正確に一つ」など、排他性の用語が先行するときには、排他的な選択肢(すなわち「両方ともでなくどちらか一方」)を示すとのみ解釈されるものとする。「から基本的に成る」は、特許請求の範囲で使用する場合、特許法の分野において使用される通常の意味を有するものとする。
本明細書および特許請求の範囲で使用される場合、一つ以上の要素のリストに関連する「少なくとも一つ」という語句は、要素のリストの中の要素のいずれか一つ以上から選択される、少なくとも一つの要素を意味するが、要素のリスト内で具体的に列挙したありとあらゆる要素のうちの、少なくとも一つを必ずしも含むわけではなく、要素のリストのいかなる要素の組み合せも除外するものではない、と理解されるべきである。この定義はまた、「少なくとも一つ」という語句が指す、要素のリスト内で具体的に識別される以外の要素が、具体的に識別される要素に関連するかまたは関連しないかにかかわらず、任意に存在しうることを許容する。したがって、非限定的な例として、「AおよびBのうち少なくとも一つ」(または、等価的に、「AまたはBのうちの少なくとも一つ」、もしくは、等価的に「Aおよび/またはBのうちの少なくとも一つ」)は、一実施形態においては、Bは存在せず、任意選択的に二つ以上のAを含む、少なくとも一つのA(任意選択的にB以外の要素を含む)、別の実施形態においては、Aは存在せず、任意選択的に二つ以上のBを含む、少なくとも一つのB(任意選択的にA以外の要素を含む)、また別の実施形態においては、任意選択的に二つ以上のAを含む、少なくとも一つのA、および任意選択的に二つ以上のBを含む、少なくとも一つのB(任意選択的に他の要素を含む)などを指すことができる。
特許請求の範囲、ならびに上記の明細書で、すべての移行句、例えば、「備える(comprising)」、「含む(including)」、「有する(carrying)」、「有する(having)」、「包含する(containing)」、「伴う(involving)」、「保つ(holding)」、「から構成される(composed of)」、および類似のものは制限がないと理解され、すなわち、含むがそれに限定はされないということを意味する。「から成る(consisting of)」および「から基本的に成る(consisting essentially of)」という移行句のみが、米国特許局の特許審査手続便覧、セクション2111.03に記載されている、それぞれ閉鎖的または半閉鎖的な移行句であるものとする。

Claims (24)

  1. 光信号を生成する光源であって、前記光信号が1セットのパルスを第一の繰り返し速度で含む、光源と、
    前記光信号を受信し、第二の繰り返し速度で1セットのパルスを含む多重化光信号を生成する光マルチプレクサ回路であって、前記第二の繰り返し速度が前記第一の繰り返し速度のn倍数であり、前記第二の繰り返し速度のパルスの前記セットが、nセットのパルスを含み、前記nセットのパルスの各セットのパルスが、前記nセットのパルスの互いとは異なる偏光状態を有し、前記第一の繰り返し速度である、光マルチプレクサ回路と、
    前記多重化光信号を受信し、前記多重化光信号をn個の励起信号の1セットに分割して試料を励起するフォーカスユニットであって、n個の励起信号の前記セットの各励起信号が前記nセットのパルスのうちの1セットのパルスに対応する、フォーカスユニットと、
    n個の励起信号の前記セットを受信し、前記試料を照射する対物レンズであって、前記対物レンズおよび前記フォーカスユニットが、n個の励起信号の前記セットの互いの励起信号とは異なる前記試料の焦点面上のn個の励起信号の前記セットの各励起信号に集合的に焦点を合わせて、n個の励起信号の前記セットに応じて応答信号を生成する、対物レンズと、
    前記異なる焦点面からの放射を多重分離し、前記応答信号に基づいてn個の放射信号の1セットを生成する電子デマルチプレクサ回路であって、n個放射信号の前記セットの各放射信号が、n個の励起信号の前記セットのうちの一励起信号に対応する、電子デマルチプレクサ回路と、を備えるシステム。
  2. 前記対物レンズが、第一の対物レンズであり、前記フォーカスユニットが、nセットのフォーカスオプティックを含み、フォーカスオプティックの各セットが、フォーカスオプティックの他のセットの長手方向軸とは異なる長手方向軸を有し、n個の励起信号の前記セットのうちの一励起信号の焦点を設定し、フォーカスオプティックの各セットが、
    1/4波長板と、
    第二の対物レンズと、
    前記対応する励起信号の前記焦点面の位置を独立して調節するフォーカスミラーと、を含む、請求項1に記載のシステム。
  3. 式中、n=2であって、パルスの各セットが、約50%のデューティサイクルを有する、請求項2に記載のシステム。
  4. 式中、n=2であって、前記マルチプレクサ回路が、電気光学変調器および1セットの偏光ビームスプリッタを含んで、前記光信号を受信し、s偏光パルスの第一のセットおよびp偏光パルスの第二のセットとして2セットのパルスを生成する、請求項1に記載のシステム。
  5. 前記光源が、約700nm~約1000nmの波長で動作するレーザ源であり、前記第一の繰り返し速度が最大約80MHzである、請求項1に記載のシステム。
  6. 前記試料内のそれぞれの焦点面内のn個の励起信号の前記セットの各励起信号を走査するため、前記フォーカスユニットと前記対物レンズとの間の光経路に走査ユニットをさらに備える、請求項1に記載のシステム。
  7. 前記試料内のそれぞれの焦点面内の前記nセットのパルスの各セットのパルスを走査するため、前記マルチプレクサ回路と前記フォーカスユニットとの間の光経路に走査ユニットをさらに備える、請求項1に記載のシステム。
  8. 前記nセットのパルスが、パルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットを含み、
    パルスの前記第一のセットとパルスの前記第二のセットを分割するように構成されたビームスプリッタと、
    前記試料内のそれぞれの画像面内のパルスの前記第一のセットを受信し、パルスの前記第一のセットを走査する、前記ビームスプリッタと前記フォーカスユニットとの間の光経路内の第一の走査ユニットと、
    前記試料内のそのそれぞれの焦点面内のパルスの前記第二のセットを受信し、パルスの前記第二のセットを走査する、前記ビームスプリッタと前記フォーカスユニットとの間の前記光経路内の第二の走査ユニットと、をさらに備える、請求項1に記載のシステム。
  9. 前記応答信号を受信するために、前記デマルチプレクサ回路に通信可能に結合された検出器をさらに備える、請求項1に記載のシステム。
  10. 前記マルチプレクサユニットが、前記nセットのパルスの間に時間分離を導入する遅延線を含む、請求項9に記載のシステム。
  11. 前記時間分離が、a)前記nセットのパルスの各セットのパルスに関連付けられたデューティサイクル、およびb)n個の励起信号のセットに応答して、前記試料からの蛍光放射に関連付けられた減衰時間に基づく、請求項10に記載のシステム。
  12. 前記デマルチプレクサ回路が、前記光源からの1セットの基準信号に基づいて前記応答信号をn個の放射信号の前記セットに分離する、請求項9に記載のシステム。
  13. 前記デマルチプレクサ回路が、前記光源からの1セットの基準信号に基づいてn個の放射信号の前記セットを生成する前記検出器に通信可能に結合されたスイッチを含む、請求項9に記載のシステム。
  14. 第一の繰り返し速度で1セットのパルスを含む光信号を生成することであって、前記第一の繰り返し速度が、第二の繰り返し速度のn倍数であり、前記第二の繰り返し速度のパルスの前記セットが、nセットのパルスを含み、前記nセットのパルスの各セットのパルスは、前記nセットのパルスの互いとは異なる偏光状態を有し、前記第一の繰り返し速度で動作する、光信号を生成することと、
    試料を励起するため前記光信号をn個の励起信号の1セットに分割することであって、n個の励起信号の前記セットの各励起信号が、前記nセットのパルスのうちの1セットのパルスに対応する、分割することと、
    n個の励起信号の前記セットの互いの励起信号とは異なる前記試料の焦点面にn個の励起信号の前記セットの各励起信号の焦点を合わせて、n個の励起信号の前記セットに応じて応答信号を生成することと、
    前記応答信号において、前記異なる焦点面からの放射をn個の励起信号の1セットへ分離することとであって、n個の放射信号の前記セットの各放射信号が、n個の励起信号の前記セットの励起信号に対応する、分離することと、を含む方法。
  15. 各励起信号の前記焦点面の位置を独立して調節することをさらに含む、請求項14に記載の方法。
  16. 前記nセットのパルスが、2セットのパルスを含み、前記生成することが、s偏光パルスの第一のセットとp偏光パルスの第二のセットとして前記2セットのパルスを生成することを含む、請求項15に記載の方法。
  17. 前記試料内のそれぞれの焦点面内のn個の励起信号の前記セットの各励起信号を走査することをさらに含む、請求項14に記載の方法。
  18. 前記試料内のそれぞれの焦点面内の前記nセットのパルスの各セットのパルスを走査することをさらに含む、請求項14に記載の方法。
  19. 前記nセットのパルスが、パルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットを含み、
    パルスの前記第一のセットとパルスの前記第二のセットを分割することと、
    前記試料内のそれぞれの焦点面内のパルスの前記第一のセットを走査することと、
    前記試料内のそれぞれの焦点面内のパルスの前記第二のセットを走査することと、をさらに含む、請求項14に記載の方法。
  20. 検出器を介して、前記応答信号を受信することをさらに含む、請求項14に記載の方法。
  21. 前記分離することが、前記応答信号を1セットの基準信号に基づいてn個の放射信号の前記セットに分離することをさらに含む、請求項20に記載の方法。
  22. 前記分離することが、1セットの基準信号に基づいてn個の放射信号の前記セットを生成することをさらに含む、請求項20に記載の方法。
  23. 光信号を生成するレーザ源であって、前記光信号が第一の繰り返し速度で1セットのパルスを含む、レーザ源と、
    前記光信号を受信し、第二の繰り返し速度で1セットのパルスを含む多重化光信号を生成する電気光学変調器および偏光ビームスプリッタであって、前記第二の繰り返し速度が前記第一の繰り返し速度の二倍であり、前記第二の繰り返し速度のパルスの前記セットが、それぞれ前記第一の繰り返し速度のパルスの第一のセットおよびパルスの第二のセットを含み、パルスの前記第一のセットが、パルスの前記第二のセットとは異なる偏光状態を有する、電気光学変調器および偏光ビームスプリッタと、
    前記多重化光信号を受信し、前記多重化光信号を第一の励起信号および第二の励起信号に分割して、試料を励起するフォーカスユニットであって、前記第一の励起信号が、パルスの前記第一のセットに対応し、前記第二の励起信号が、パルスの前記第二のセットに対応し、前記フォーカスユニットがフォーカスオプティックの第一のセットおよびフォーカスオプティックの前記第一のセットとは異なる長手方向軸を有するフォーカスオプティックの第二のセットを含み、フォーカスオプティックの前記第一のセットおよびフォーカスオプティックの前記第二のセットがそれぞれ、
    1/4波長板と、
    第二の対物レンズと、
    その対応する励起信号の焦点面の位置を独立して調節するフォーカスミラーと、を含む、フォーカスユニットと、
    前記第一の励起信号および第二の励起信号を受信し、前記試料に光学的に結合して前記試料を照射し、前記試料からの放射を生成する対物レンズであって、前記第一の励起信号が、前記試料の第一の焦点面に焦点を合わせ、前記第二の励起信号が、前記第一の焦点面とは異なる前記試料の第二の焦点面に焦点を合わせる、対物レンズと、
    前記試料からの前記放射に基づいて応答信号を生成するように構成された検出器と、
    前記応答信号を前記第一の励起信号に対応する第一の放射信号と前記第二の励起信号に対応する第二の放射信号に分離するスイッチと、を備えるシステム。
  24. nが2~5の整数である、請求項1に記載のシステム。
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