JP7531492B2 - 細菌感染症の処置および予防のためのオキソピリド[1,2-a]ピリミジン化合物 - Google Patents
細菌感染症の処置および予防のためのオキソピリド[1,2-a]ピリミジン化合物 Download PDFInfo
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Description
R1が、H;(C1~6アルキル)2アミノC1~6アルキル;C1~6アルコキシ;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキル;C1~6アルキル;C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルC1~6アルキル;モルホリニル;モルホリニルC1~6アルキルまたはピロリジニルC1~6アルキルであり、
R2が、((C1~6アルキル)2アミノ)C1~6アルキルハロピロリジニル;((C1~6アルキル)2アミノ)C1~6アルキルピロリジニル;(C1~6アルキル)2アミノ;(C1~6アルキル)2アミノピロリジニル;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノ;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリル;C3~7シクロアルキル;C3~7シクロアルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;シアノ;ハロC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノ;ハロC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;ハロC1~6アルキルピラゾリル;ハロピロリジニル;ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル;モルホリニル;フェニルピロリジニルまたはピロリジニルであり、
R3が、Hまたはハロゲンであり、
R4が、Hまたはハロゲンであり、
R5が、Hまたはハロゲンであり、
R6が、C1~6アルキルであり、
R7が、カルボキシである、新規な化合物、
またはその薬学的に許容される塩に関する。
「C1~6アルキル」という用語は、1~6個、特に1~4個の炭素原子を含む飽和、直鎖、または分枝鎖のアルキル基、例えばメチル、エチル、プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、tert-ブチルなどを意味する。特定の「C1~6アルキル」基は、メチル、エチル、およびプロピルである。
本発明は、式(I)の化合物であって、
R1が、H;(C1~6アルキル)2アミノC1~6アルキル;C1~6アルコキシ;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキル;C1~6アルキル;C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルC1~6アルキル;モルホリニル;モルホリニルC1~6アルキルまたはピロリジニルC1~6アルキルであり、
R2が、((C1~6アルキル)2アミノ)C1~6アルキルハロピロリジニル;((C1~6アルキル)2アミノ)C1~6アルキルピロリジニル;(C1~6アルキル)2アミノ;(C1~6アルキル)2アミノピロリジニル;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノ;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリル;C3~7シクロアルキル;C3~7シクロアルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;シアノ;ハロC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノ;ハロC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;ハロC1~6アルキルピラゾリル;ハロピロリジニル;ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル;モルホリニル;フェニルピロリジニルまたはピロリジニルであり、
R3が、Hまたはハロゲンであり、
R4が、Hまたはハロゲンであり、
R5が、Hまたはハロゲンであり、
R6が、C1~6アルキルであり、
R7が、カルボキシである、化合物、
またはその薬学的に許容される塩に関する。
R1が、H;ジメチルアミノメチル;メトキシ;メトキシエチル(メチル)アミノメチル;メチル;メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルメチル;モルホリニル;モルホリニルメチルまたはピロリジニルメチルであり、
R2が、(ジメチルアミノ)メチル(ジフルオロ)ピロリジニル;(ジメチルアミノ)メチル(フルオロ)ピロリジニル;ジメチルアミノ)メチルピロリジニル;シアノ;シクロプロピル;シクロプロピル(メチル)アミノメチルピロリジニル;ジフルオロエチル(メチル)アミノメチルピロリジニル;ジフルオロピロリジニル;ジメチルアミノ;ジメチルアミノピロリジニル;ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル;メトキシエチル(メチル)アミノ;メトキシエチル(メチル)アミノメチルピロリジニル;メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリル;モルホリニル;フェニルピロリジニル;ピロリジニル;トリフルオロエチル(メチル)アミノまたはトリフルオロメチルピラゾリルであり、
R3が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R4が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R5が、Hもしくはフルオロであり、
R6が、メチルまたはエチルであり、
R7が、カルボキシである、化合物、
またはその薬学的に許容される塩である。
R1が、Hであり、
R2が、C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルまたは(C1~6アルキル)2アミノであり、
R3が、Hまたはハロゲンであり、
R4が、Hまたはハロゲンであり、
R5が、Hまたはハロゲンであり、
R6が、C1~6アルキルであり、
R7が、カルボキシである、化合物、
またはその薬学的に許容される塩である。
R1が、Hであり、
R2が、メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルまたはジメチルアミノであり、
R3が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R4が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R5が、Hもしくはフルオロであり、
R6が、メチルであり、
R7が、カルボキシである、化合物、
またはその薬学的に許容される塩である。
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メトキシ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-ピロリジン-1-イル-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-4-(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロール-1-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-(メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(ジメチルアミノ)-6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-(ピロリジン-1-イル)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6-クロロ-4-(ジメチルアミノ)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(ジメチルアミノ)-5,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3-((ジメチルアミノ)メチル)-3-フルオロピロリジン-1-イル)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-(3-(((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3-(((2,2-ジフルオロエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3-((シクロプロピル(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-[4-[(ジメチルアミノ)メチル]-3,3-ジフルオロ-ピロリジン-1-イル]-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5-クロロ-4-(ジメチルアミノ)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-4-(3-フェニルピロリジン-1-イル)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
(S)-7-(4-(2-((ジメチルアミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
(R)-7-(4-(3-(ジメチルアミノ)ピロリジン-1-イル)-6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-(ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸とギ酸の化合物;
7-[8-(エチルアミノ)-6-フルオロ-4-[3-(トリフルオロメチル)ピラゾール-1-イル]-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[8-(エチルアミノ)-6-フルオロ-4-[3-(トリフルオロメチル)ピラゾール-1-イル]-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
8-[8-(エチルアミノ)-6-フルオロ-4-[3-(トリフルオロメチル)ピラゾール-1-イル]-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-4-(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロール-1-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-シアノ-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-[[2-メトキシエチル(メチル)アミノ]メチル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-9-(ピロリジン-1-イルメチル)ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-ピロリジン-1-イル-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-[(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロール-1-イル)メチル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;および
7-[4-シクロプロピル-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;から選択される式(I)の化合物、
またはその薬学的に許容される塩である。
本発明はまた、式(I)の化合物を調製するプロセスであって、式(Ii)
式中、R1~R7は、上記に定義されるとおりである、プロセスに関する。上記のプロセスに従って製造されたときの式(I)の化合物もまた、本発明の目的となる。
別の実施形態は、本発明の化合物と、治療的に不活性な担体、希釈剤または賦形剤とを含有する薬学的組成物または医薬、ならびにこのような組成物および医薬を調製するために本発明の化合物を使用する方法を提供する。一例では、式(I)の化合物が、周囲温度で、適切なpHで、および所望の程度の純度で、生理学的に許容される担体、すなわち、使用される投与量および濃度においてレシピエントに対して非毒性である担体と混合することによって、生薬投与形態に製剤化され得る。製剤のpHは、特定の用途および化合物の濃度に主に依存するが、好ましくは約3~約8の範囲である。一例では、式(I)の化合物は、pH5の酢酸緩衝剤に製剤化される。別の実施形態では、式(I)の化合物は無菌である。化合物は、例えば、固体もしくは非晶質組成物として、凍結乾燥製剤として、または水溶液として保管され得る。
本発明の化合物は、治療有効量の式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩、またはエナンチオマーもしくはジアステレオマーを必要とする対象に投与することにより、ヒトまたは他の動物における細菌感染症の処置および/または予防に有用である。本発明の化合物および方法は、Staphylococcus aureus、Escherichia coli、Klebsiella pneumoniae、Acinetobacter baumanniiおよびPseudomonas aeruginosaを含む病原体に感染したヒト患者に特によく適している。本発明の化合物によっても制御され得る細菌性生物の例には、以下のグラム陽性およびグラム陰性生物が含まれるが、これらに限定されない。Streptococcus pneumoniae、Streptococcus pyogenes、Enterococcus faecalis、Enterococcus faecium、Enterobacter spp.種、Proteus spp.種、Serratia marcescens、Staphylococcus aureus、Coag.Neg.Staphylococci、Haemophilus influenzae、Bacillus anthraces、Mycoplasma pneumoniae、Moraxella catarrhalis、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Legionella pneumophila、Mycobacterium tuberculosis、Helicobacter pylori、Staphylococcus saprophyticus、Staphylococcus epidermidis、Francisella tularensis、Yersinia pestis、Clostridium difficile、Bacteroides spp.種 Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Burkholderia pseudomallei、Burkholderia mallei、Borrelia burgdorferi、Mycobacterium avium complex、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium kansasiiおよびMycobacterium ulcerans。
本明細書で使用される略語は、以下のとおりである:
AcOK 酢酸カリウム
B2Pin2 ビス(ピナコラート)ジボロン
BINAP 2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフタレン
CAMHB Caution-Adjusted Mueller Hinton Broth
CC50 濃度は細胞の50パーセントの死をもたらす
DBU 1,8-ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ-7-エン
DCM ジクロロメタン
DIPEA N,N-ジイソプロピルエチルアミン
EtOAc 酢酸エチル
h 時間
HATU:1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート
HPLC:高速液体クロマトグラフィ
HPLC-UV:紫外線検出器を備えた高速液体クロマトグラフィ
MIC 最小発育阻止濃度
Pd-Ad2nBuPビフェニル
クロロ[(ジ(1-アダマンチル)-N-ブチルホスフィン)-2-(2-アミノビフェニル)]パラジウム(II)
Precat プレ触媒
分取HPLC
分取高速液体クロマトグラフィ
rt 室温
SFC 超臨界流体クロマトグラフィ
SM 出発物質
TLC 薄層クロマトグラフィ
UV 紫外線検出器
中間体および最終化合物を、以下の機器のうちの1つを使用して、フラッシュクロマトグラフィによって精製した:i)Biotage SP1システムおよびQuad 12/25カートリッジモジュール;ii)ISCOコンビフラッシュクロマトグラフィ機器。シリカゲルブランドおよび細孔径:i)KP-SIL 60Å、粒子径:40~60μm;ii)CAS登録番号:シリカゲル:63231-67-4、粒子サイズ:47~60ミクロンのシリカゲル;iii)Qingdao Haiyang Chemical Co.,LtdのZCX、細孔:200-300または300-400。
中間体A1
tert-ブチルN-(3,4-ジクロロ-6-フルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-イル)-N-メチル-カルバメート
メチルアミン溶液(355g、2.866mol、EtOH中25%)を2,4-ジフルオロニトロベンゼン(147g、0.924mol)に0℃で15分間かけて滴下した。添加が完了した後、反応混合物を0℃で2時間撹拌した。溶液をエタノール(500mL)で希釈し、2Lの氷水に注いだ。得られた沈殿物を濾過により収集し、真空中で乾燥して、5-フルオロ-N-メチル-2-ニトロ-アニリン(143g、63%収率)を黄色固体として得た。
乾燥THF(2L)中の水素化ナトリウム(141g、3.5モル、鉱油中60%分散液)の懸濁液に、0℃で、5-フルオロ-N-メチル-2-ニトロアニリン(60g、0.35モル、化合物A1.2)を少しずつ添加した。溶液を0℃で1時間撹拌した後、THF(0.5L)中の二炭酸ジ-tert-ブチル(115g、0.53モル)の溶液を滴下して添加し、反応混合物を15℃でさらに15時間撹拌し続けた。反応混合物を1.6Lの氷水に注ぎ、EtOAc(1.6L)で2回抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空中で濃縮した。粗生成物をシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(石油エーテル中の1~5%EtOAc)によって精製して、tert-ブチルN-(5-フルオロ-2-ニトロ-フェニル)-N-メチル-カルバメート(70g、収率73%)を黄色固体として得た。MS(ESI):293.0([M+Na]+)、171.0([M-C4H8-CO2 +H]+)。
MeOH(1L)中のtert-ブチルN-(5-フルオロ-2-ニトロ-フェニル)-N-メチル-カルバメート(70g、259mmol、化合物A1.3)の溶液に、パラジウム炭素(5g、10重量%負荷)を添加した。この反応混合物をH2雰囲気(50psi)下で16℃で18時間撹拌した。残りのパラジウム触媒を濾過により除去した後、濾液を真空で濃縮して、tert-ブチルN-(2-アミノ-5-フルオロ-フェニル)-N-メチル-カルバメート(60g、収率96%)を白い固体として得た。MS(ESI):263.1([M+Na]+)、185.0([M-C4H8+H]+)、141.0([M-C4H8-CO2+H]+)。
ステップ(d)tert-ブチルN-(3-クロロ-6-フルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-イル)-N-メチル-カルバメート(化合物A1.5)の調製
DCM(200mL)中のtert-ブチルN-(3-クロロ-6-フルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-イル)-N-メチル-カルバメート(4.8g、13.7mmol、化合物A1.5)の溶液に、窒素雰囲気下、0℃で3-クロロ過安息香酸(9.47g、54.9mmol)を添加した。その後、反応混合物を30℃まで加温し、12時間撹拌した。次に、反応混合物を室温へ冷却して戻し、水に注ぎ、亜硫酸ナトリウム溶液(10%、150mL)を1時間撹拌した後、EtOAc(750mL)で3回抽出した。合わせた有機物を重炭酸ナトリウム水溶液(5N、200mL)、ブライン(250mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、真空で濃縮して、tert-ブチルN-(3-クロロ-6-フルオロ-1-オキシド-9H-ピリド[2,3-b]インドール-1-イウム-8-イル)-N-メチル-カルバメートの粗生成物(4.8g、96%収率)を褐色固体として得た。MS(ESI):368.1([{37Cl}M+H]+)、366.1([{35Cl}M+H]+)。
tert-ブチルN-(3,4-ジクロロ-5,6-ジフルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-イル)-N-メチル-カルバメート
DMF(150mL)中のtert-ブチル(3,4-ジクロロ-6-フルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-イル)(メチル)カルバメート(5g、13.02mmol、中間体A1)の撹拌溶液に、1-クロロピロリジン-2,5-ジオン(2.27g、39.06mmol)および4-メチルベンゼンスルホン酸(4.48mg、26.04mmol)を添加した。混合物を、LC-MSが出発物質が完全に消費されたことを示すまで、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を冷却して室温に戻し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(石油エーテル:EtOAc=10:1~1:1)で精製して、3,4,5-トリクロロ-6-フルオロ-N-メチル-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-アミン(3g、71.9%収率)を黄色固体として得た。MS(ESI):319.9(M+H]+)。
DMF(60mL)中の3,4,5-トリクロロ-6-フルオロ-N-メチル-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-アミン(3g、9.416mmol)およびK2CO3(6.5g、47.08mmol)の撹拌溶液に、二炭酸ジ-tert-ブチル(6.2g、28.25mmol)を添加した。混合物を、TLC(石油エーテル:EtOAc=10:1)およびLC-MSが出発物質が完全に消費されたことを示すまで、25℃で12時間撹拌した。反応混合物を真空で濃縮して粗生成物を得て、これをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(石油エーテル:EtOAc=20:1~10:1)によって精製して、tert-ブチルメチル(3,4,5-トリクロロ-6-フルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-8-イル)カルバメート(2.1g;収率53.8%)を黄色固体として得た。MS(ESI):418.0([{35Cl}M+H]+)、317.9{M-56}+H]+)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ ppm 9.75(s、1H)、8.59(s、1H)、7.27~7.30(m、1H)、3.37(s、3H)、1.43(m、9H)。
5-ブロモピリジン-2-アミン(11.23g、64.9mmol)と2-(エトキシメチレン)マロン酸ジエチル(14g、64.9mmol)との混合物を、110℃で30分間撹拌した。その反応混合物を室温に冷却して戻し、その間に多くの白色固体が形成された。その固体を濾過により収集し、真空下で乾燥させた。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。MS:343.0(Br79[M+H]+)、345.1(Br81[M+H]+)。
2-(((5-ブロモピリジン-2-イル)アミノ)メチレン)マロン酸ジエチル(22.3g、65mmol)およびPPA(65.9g、31.4ml、195mmol、CAS:8017-16-1)を130℃で30分間撹拌した。反応混合物を室温に冷却し、水(100mL)に注ぎ、DCM(100mL)で抽出した。分離された有機層は、無水物上で乾燥した。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得て、これをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(DCM:EtOAc=2:1)によって精製して、エチル7-ブロモ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(6.72g、34.8%収率)を白色固体として得た。MS:297.0([M+H]+)。
1,4-ジオキサン(10mL)中のエチル7-ブロモ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(401mg、1.35mmol)、4,4,4’,4’,5,5,5’,5’-オクタメチル-2,2’-ビ(1,3,2-ジオキサボロラン)(514mg、2.02mmol)、およびAcOK(397mg、4.05mmol)の撹拌溶液に、Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(110mg、135μmol)を室温で添加した。得られた混合物を90℃で6時間撹拌した後、室温に戻した。混合物を濾過し、濾液を真空で濃縮して粗生成物を得て、これをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィにより精製して、(3-エトキシカルボニル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-7-イル)ボロン酸(168mg、収率47.5%)を白色固体として得た。MS:263.1([M+H]+)。
2-[[(5-ブロモ-2-ピリジル)アミノ]メチレン]プロパンジオエートジエチル(化合物B1.2)の合成と同様に、5-ブロモピリジン-2-アミンを5-ブロモ-3-メチルピリジン-2-アミンに置き換えることにより、表題化合物を調製した。MS(ESI):358.9([{81Br}M+H]+)。
エチル7-ブロモ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(化合物B1.3)の合成と同様に、表題化合物は、2-(((5-ブロモピリジン-2-イル)アミノ)メチレン)マロン酸ジエチルを2-(((5-ブロモ-3-メチルピリジン-2-イル)アミノ)メチレン)マロン酸ジエチルで置き換えることにより調製した。MS(ESI):310.9([{81Br}M+H]+)。
ステップ(c)(3-エトキシカルボニル-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-7-イル)ボロン酸(中間体B2)の調製
(3-エトキシカルボニル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-7-イル)ボロン酸(中間体B1)の合成と同様に、表題化合物は、エチル7-ブロモ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレートをエチル7-ブロモ-9-メチル-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレートで置き換えることにより調製した。MS(ESI):277.0([M+H]+)。
(3-エトキシカルボニル-9-メトキシ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-7-イル)ボロン酸
(3-エトキシカルボニル-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-7-イル)ボロン酸
エチル7-ブロモ-9-メチル-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(1g、3.21mmol、化合物B2.3)、NBS(686mg、3.86mmol)、およびBPO(156mg、643μmol)の混合物をCCl4(15ml)中で2時間還流した。その後、混合物を室温に冷却し、DCM(100mL)で希釈し、Na2S2O3水溶液で洗浄した。次に、分離した有機層を無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して、エチル7-ブロモ-9-(ブロモメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレートの粗生成物を得た。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。MS:391.0(Br79[M+H]+)、393.1(Br81[M+H]+)。
エチル7-ブロモ-9-(ブロモメチル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(1.25g、3.2mmol)、モルホリン(558mg、558μl、6.41mmol)およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(828mg、1.12ml、6.41mmol)の混合物をDMF(5mL)中で室温で1時間撹拌した。その後、その混合物をEtOAc(50mL)で希釈し、ブラインで洗浄した。分離した有機層を無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得て、これをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(石油エーテル:EtOAc=1:1)によって精製して、エチル7-ブロモ-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(0.376g、収率29.6%)を得た。MS:396.1(Br79[M+H]+)、398.0(Br81[M+H]+)。
エチル7-ブロモ-9-[[2-メトキシエチル(メチル)アミノ]メチル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート
エチル7-ブロモ-4-オキソ-9-(ピロリジン-1-イルメチル)ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート
エチル9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート
エチル7-ブロモ-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(中間体B5)の合成と同様に、ステップ(b)において、モルホリンをジメチルアミンに置き換えることにより、表題化合物を調製した。MS(ESI):355.9([{81Br}M+H]+)、377.9([{81Br}M+Na]+)。
1,4-ジオキサン(20mL)中のエチル7-ブロモ-9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(900mg、2.5mmol)、B2Pin2(1.3g、5mmol)、およびAcOK(0.48mL、7.6mmol)をN2で5回脱気した後、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(116.3mg、0.13mmol)およびXPhos(121.1mg、0.25mmol)をN2下で、その混合物に添加した。反応溶液を再びN2で5回脱気し、100℃で12時間撹拌した。混合物を冷却して室温に戻し、真空で濃縮して残留物を得て、それをDCM(500mL)で希釈して、濾過した。濾液を真空で濃縮して粗生成物を得て、これを分取HPLC(0.5% TFA)によって精製して、エチル9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート(1g、収率82.3%))を褐色固体として得た。MS(ESI):320.1([M+H]+)。1H NMR(MeOH-d4 400MHz):δ 9.494~9.497(m、1H)、9.057~9.066(m、1H)、8.446(s、1H)、4.720~4.740(m、2H)、4.381~4.434(m、2H)、3.066~3.079(m、6H)、1.264~1.272(m、15H)。
エチル7-ブロモ-9-[(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[3,4-b]ピロール-1-イル)メチル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボキシレート
MeOH(10mL)および水(2mL)中の1-tert-ブチル3-メチル3-フルオロピロリジン-1,3-ジカルボキシレート(3.5g、14.1mmol)の溶液に、水酸化ナトリウム(1.7g、42.4mmol)を添加して、得られた反応混合物を20℃で12時間撹拌した。その混合物をDCM(100mL)で希釈し、HCl水溶液(2M)でpH=3に調整し、次にDCM(100mL)で抽出した。有機層を無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して、1-(tert-ブトキシカルボニル)-3-フルオロピロリジン-3-カルボン酸の粗生成物(3.2g、収率96.9%)を白色固体として得た。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
1-(tert-ブトキシカルボニル)-3-フルオロピロリジン-3-カルボン酸(2.9g、12.4mmol)、HATU(6.1g、16.1mmol)、塩酸ジメチルアミン(5.1g、62.1mmol)、および6.5mL、37.3mmol)をDIPEA(THF(10mL)中で20℃で4時間撹拌した。LC-MSが出発物質が消費されたことを示した後、混合物をDCM(100mL)で希釈し、水(50mL)に注ぎ、DCM(100mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して、tert-ブチル3-(ジメチルカルバモイル)-3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(1.9g)の粗生成物を無色の油として得た。MS(ESI):205.1([M+H-t-Bu]+)。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
THF(8mL)中のtert-ブチル3-(ジメチルカルバモイル)-3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(1.8g、6.9mmol)の溶液に、0℃でボラン-メチルスルフィド複合体(8mL、80mmol)を添加して、得られた反応混合物を20℃まで加温し、12時間撹拌した。次に、その混合物を冷MeOH(100mL)に注ぎ、さらに1時間撹拌した後、それを真空で濃縮して、tert-ブチル3-((ジメチルアミノ)メチル)-3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(1.2g)の粗生成物を無色の油として得た。MS(ESI):247.1([M+H]+)、191.0([M+H-t-Bu]+)。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
HCl/EtOAc(10mL、40mmol、4M)中のtert-ブチル3-((ジメチルアミノ)メチル)-3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(1.2g、4.8mmol)の溶液を20℃で2時間撹拌し、LC-MSが出発物質が消費されたことを示した後、混合溶液を真空で濃縮して粗生成物を得て、これをMeOH/EtOAc(v:v=1:10、10mL)中で再結晶化して、1-(3-3-フルオロピロリジン-3-イル)-N、N-ジメチルメタンアミン塩酸塩(910mg、収率85.2%)を白色固体として得た。MS(ESI):147.1([M+H]+)。
EtOH(40mL)中のtert-ブチル3-ホルミルピロリジン-1-カルボキシレート(2g、22.5mmol)および2-メトキシ-N-メチルエタンアミン(2g、10.1mmol)の溶液に、Ti(OiPr)4(4g、14.1mmol)をN2下で添加した。混合物を15℃で12時間撹拌した後、NaBH4(1.6g、42.3mmol)を混合物に添加して、15℃でさらに12時間撹拌した。次に、反応混合物を水(250mL)に注ぎ、濾過した。濾液をEtOAc(100mL)で3回抽出した。合わせた有機物をブライン(100mL)で3回洗浄し、無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得て、これをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(DCM:MeOH=20:1~10:1)で精製して、tert-ブチル3-(((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.5g、収率92.6%)を淡黄色の油として得た。1 H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ ppm 3.373~3.402(t、2H)、3.342(s、2H)、3.277~3.315(m、1H)、3.268(s、3H)、3.228(s、1H)、2.499(s、1H)、2.458~2.483(s、1H)、2.261~2.276(m、2H)、2.177(s、3H)、1.840~1.867(m、1H)、1.476~1.496(m、1H)、1.240(s、9H)。
HCl/ジオキサン(25mL)中のtert-ブチル3-(((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.5g、9.178mmol)の溶液を、15℃で1時間撹拌した。その後、反応混合物を真空で濃縮して、2-メトキシ-N-メチル-N-(ピロリジン-3-イルメチル)エタンアミン二塩酸塩(1.5g)の粗生成物を濃黄色の油として得た。MS(ESI):173.1([M+H]+)。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
CH3NH2/THF(25mL)中のtert-ブチル3-ホルミルピロリジン-1-カルボキシレート(4g、20.08mmol)の溶液に、Pd(OH)2(1.4g、10.04mmol)を添加し、得られた混合物をH2雰囲気(50psi)下で25℃で5時間撹拌した。TLC後(DCM:MeOH=10:1)が出発物質が消費されたことを示した後、反応混合物を濾過し、濾液を真空で濃縮して、tert-ブチル3-((メチルアミノ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレートの粗生成物(3.8g、収率88.4%)黄色油として得た。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
DMF(5mL)中の1,1-ジフルオロ-2-ヨードエタン(2.7g、14.02mmol)およびtert-ブチル3-((メチルアミノ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2g、9.35mmol)の溶液へ、K2CO3(2.6g、18.70mmol)を添加して、得られた反応混合物を60℃で12時間撹拌した。その反応物を室温に冷却した後、混合溶液をEtOAc(100mL)で3回抽出した。合わせた有機物をブライン(100mL)で3回洗浄し、無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得て、これをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(石油エーテル:EtOAc=10:1~3:1)で精製して、tert-ブチル3-(((2,2-ジフルオロエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.3g、収率53.5%)を淡黄色の油として得た。
HCl/ジオキサン溶液(25mL、4M)中のtert-ブチル3-(((2,2-ジフルオロエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.3g、8.264mmol)の混合物を15℃で1時間撹拌した。その後、反応混合物を真空で濃縮して、2,2-ジフルオロ-N-メチル-N-(ピロリジン-3-イルメチル)エタンアミン二塩酸塩(1.5g)の粗生成物を濃黄色の油として得た。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。1HNMR(400MHz、DMSO-d6)δ:5.613~5.880(t、1H)、3.045~3.078(m、2H)、2.860~2.869(m、2H)、2.734~2.745(s、3H)、2.692(s、1H)、2.298(s、3H)、2.136(s、1H)、1.605~1.630(m、1H)、1.046~1.100(m、1H)。
CHCl3(100mL)中の3,3,3-トリフルオロプロパン酸エチル(10g、64.1mmol)の溶液に、Et3N(7.8g、76.9mmol)、およびTMSOTf(17.4g、76.9mmol)を滴下して添加した。添加後、混合物を室温で1.5時間撹拌した。次に、反応物を氷浴で冷却し、DCM中のTiCl4の溶液を添加した(9.61mL、1M)。得られた反応混合物を室温まで加温し、水(100mL)を添加して氷浴下で反応をクエンチする前に1時間撹拌した。次に、分離した有機層を無水物上で乾燥させた。MgSO4を濾過し、真空で濃縮して、3,3-ジフルオロアクリレートエチルの粗生成物を得た。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
CHCl3(20mL)中のN-(メトキシメチル)-1-フェニル-N-(トリメチルシリルメチル)メタンアミン(5.0g、36.8mmol)の溶液に、エチル3,3-ジフルオロアクリレート(1.3g、55.1mmol)およびTFA(0.5mL)を氷浴中で添加した。得られた反応混合物を氷浴中で1時間撹拌した後、室温まで加温した。さらに2時間撹拌した。反応をクエンチするためにNaHCO3の飽和水溶液を添加し、混合物を水(50mL)に注ぎ、EtOAc(50mL)で抽出した。有機層を水で洗浄した。CaCl2溶液(100mL、1N)を2回、ブライン(100mL)、無水物上で乾燥させた。Na2SO4、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルフラッシュクロマトグラフィ(石油エーテル:EtOAc=40:1~20:1)で精製して、エチル1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-カルボキシレート(10.9g、収率74.7%)を油として得た。MS(ESI):270.1([M+H]+)。
THF(20mL)中のエチル1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-カルボキシレート(4g、14.9mmol)およびLiAlH4(5.6g、148.6mmol)の溶液を25℃で2時間撹拌した。その後、反応をNaOH水溶液でクエンチして、濾過した。濾液を水に注ぎ、EtOAcで抽出した。分離した有機層をCaCl2水溶液(50mL、1N)で2回、ブライン(50mL)で洗浄し、無水物上で乾燥させた。Na2SO4を濾過し、真空で濃縮して、(1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)メタノール(3.1g)の粗生成物を黄色の油として得た。MS(ESI):228.1([M+H]+)。
DCM(10mL)中の(1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)メタノール(1g、4.4mmol)の溶液に、TosCl(1.3g、6.6mmol)、Et3N(1.3g、13.2mmol)、およびDMAP(0.16g、1.32mmol)を0℃で添加した。得られた反応混合物を0℃で2時間撹拌した後、真空で濃縮した。粗生成物を分取HPLC(添加剤として0.1% TFA)によって精製して、(1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)メチル4-メチルベンゼンスルホネート(1.2g、収率70.6%)を無色の油として得た。MS(ESI):382.0(M+H)+。
THF(10mL)中の(1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)メチル4-メチルベンゼンスルホネート(1.2g、3.15mmol)の溶液に、ジメチルアミン(30mL、THF中2M)を添加し、得られた混合物を60℃で2時間撹拌した。次に、その混合物を真空で濃縮して粗生成物を得て、これを分取HPLC(水中の0.5% TFA)によって精製して、1-(1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)-N、Nジメチルメタンアミン(0.65g、収率81.2%)を無色の油として得た。MS(ESI):255.1(M+H)+。
脱気し、H2で数回パージした後、1-(1-ベンジル-4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)-N、N-ジメチルメタンアミン(0.65g、2.56mmol)とPd(OH)2(0.36g、0.26mmol)との溶液を、H2(50psi)下で60℃で12時間撹拌した。その後、反応物を室温に冷却し、セライトを通して濾過した。濾過ケーキをMeOH(30mL)で4回洗浄し、合わせた有機物を真空で濃縮して、1-(4,4-ジフルオロピロリジン-3-イル)-N、N-ジメチルメタンアミン(0.79g)の粗生成物を無色の油として得た。MS(ESI):165.1(M+H)+。それをさらに精製することなく、次のステップで直接使用した。
DCM(3mL)中の7-(8-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)-4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸(0.057g、101μmol)の撹拌溶液に、TFA(3g、2mL、26.3mmol)を室温で添加した。得られた反応混合物を室温で2時間撹拌した後、真空濃縮した。残留物を分取HPLCにより精製して、7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸(2.6mg、収率5.5%)を黄色固体として得た。1H NMR(MeOH-d4、400MHz)δ 9.1-9.2(m、1H)、9.0-9.1(m、1H)、8.12(s、2H)、7.9-8.0(m、1H)、6.5-6.6(m、1H)、2.9-2.9(m、3H)、2.8-2.9(m、6H)。MS(ESI):465.3([M+H]+)。
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸
7-[4-シクロプロピル-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸
実施例4
50%成長阻害濃度(IC50)測定アッセイ:
E.coli(BW25113、Coli Genetic Stock Center、#7636から入手)およびK.pneumoniae(ATCC10031)に対する化合物のin vitro抗菌活性は、以下の手順に従って決定された。
最小発育阻害濃度プロトコル(MIC)アッセイ:
E.coli(ATCC25922)の増殖を阻害する化合物のin vitroでの効力は、MIC(最小発育阻止濃度)アッセイによって評価された。サンプルは10mM DMSOストック溶液から調製した。マスタープレート(Greiner、カタログ番号:651201)でDMSOで2倍段階希釈した後、サンプルの各アリコート20μLに180μLの無菌蒸留水を添加した。次に、10μLの希釈化合物を新しいアッセイプレート(Costar、3599)に移した。
凍結乾燥溶解度アッセイ(LYSA):
本発明の化合物の溶解度は、LYSAアッセイによって評価された。サンプルは、30μLの純粋なDMSOで希釈した10mM DMSOストック溶液(20μL)から2回ずつ調製した。遠心真空蒸発器でDMSOを蒸発させた後、残留物を0.05Mリン酸緩衝液(150μL、pH6.5)に溶解し、1時間撹拌し、2時間振盪した。一晩後、マイクロタイタフィルタプレートを使用して溶液を濾過した。次に、濾液およびその1/10希釈液を、HPLC-UVで分析した。さらに、10mMストック溶液から4点較正曲線を作成し、化合物の溶解度測定に使用した。結果は、μg/mLで示し、表5に要約した。本発明の特定の化合物は、GP-6と比較してはるかに改善された溶解度で、LYSA>10μg/mLを有することが見出された。
細胞傷害性アッセイ
本発明の化合物の細胞毒性は、HepG2アッセイによって評価された。HepG2細胞(ATCC HB-8065(商標))を96ウェルプレートに播種し(ウェル当たり1.2×104細胞)、化合物で3日間処理し、CellTiter-Blue(登録商標)Cell Viability Assay(Promega、カタログ番号G8082)を使用して、化合物処理後3日目に細胞生存率を測定した。20μLのセルタイタブルーバッファを細胞の各ウェルに添加し、37℃で3時間インキュベートし、プレートリーダー(Molecular Device SpectraMax M2)で蛍光値を測定した。各化合物のCC50値は、4つのパラメーターロジスティック方程式を使用してGraphPad Prismでプロットされる。細胞毒性の結果を表6に示す。
Claims (16)
- 式(I)の化合物であって、
式中、
R1が、H;(C1~6アルキル)2アミノC1~6アルキル;C1~6アルコキシ;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキル;C1~6アルキル;C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルC1~6アルキル;モルホリニル;モルホリニルC1~6アルキルまたはピロリジニルC1~6アルキルであり、
R2が、((C1~6アルキル)2アミノ)C1~6アルキルハロピロリジニル;((C1~6アルキル)2アミノ)C1~6アルキルピロリジニル;(C1~6アルキル)2アミノ;(C1~6アルキル)2アミノピロリジニル;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノ;C1~6アルコキシC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリル;C3~7シクロアルキル;C3~7シクロアルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;シアノ;ハロC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノ;ハロC1~6アルキル(C1~6アルキル)アミノC1~6アルキルピロリジニル;ハロC1~6アルキルピラゾリル;ハロピロリジニル;ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル;モルホリニル;フェニルピロリジニル、もしくはピロリジニルであり、
R3が、Hもしくはハロゲンであり、
R4が、Hもしくはハロゲンであり、
R5が、Hもしくはハロゲンであり、
R6が、C1~6アルキルであり、
R7が、カルボキシである、化合物、
またはその薬学的に許容される塩。 - R1が、H;ジメチルアミノメチル;メトキシ;メトキシエチル(メチル)アミノメチル;メチル;メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルメチル;モルホリニル;モルホリニルメチル、もしくはピロリジニルメチルであり、
R2が、(ジメチルアミノ)メチル(ジフルオロ)ピロリジニル;(ジメチルアミノ)メチル(フルオロ)ピロリジニル;ジメチルアミノ)メチルピロリジニル;シアノ;シクロプロピル;シクロプロピル(メチル)アミノメチルピロリジニル;ジフルオロエチル(メチル)アミノメチルピロリジニル;ジフルオロピロリジニル;ジメチルアミノ;ジメチルアミノピロリジニル;ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル;メトキシエチル(メチル)アミノ;メトキシエチル(メチル)アミノメチルピロリジニル;メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリル;モルホリニル;フェニルピロリジニル;ピロリジニル;トリフルオロエチル(メチル)アミノ、もしくはトリフルオロメチルピラゾリルであり、
R3が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R4が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R5が、Hもしくはフルオロであり、
R6が、メチルもしくはエチルであり、
R7が、カルボキシである、請求項1の化合物、
またはその薬学的に許容される塩。 - R1が、Hである、請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
- R2が、C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルもしくは(C1~6アルキル)2アミノである、請求項1もしくは3に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
- R2が、メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルもしくはジメチルアミノである、請求項4に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
- R1が、Hであり、
R2が、C1~6アルキル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルもしくは(C1~6アルキル)2アミノであり、
R3が、Hもしくはハロゲンであり、
R4が、Hもしくはハロゲンであり、
R5が、Hもしくはハロゲンであり、
R6が、C1~6アルキルであり、
R7が、カルボキシである、請求項1に記載の化合物、
またはその薬学的に許容される塩。 - R1が、Hであり、
R2が、メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロリルもしくはジメチルアミノであり、
R3が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R4が、H、クロロ、もしくはフルオロであり、
R5が、Hもしくはフルオロであり、
R6が、メチルであり、
R7が、カルボキシである、請求項6に記載の化合物、
またはその薬学的に許容される塩。 - 7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メトキシ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-ピロリジン-1-イル-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-4-(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロール-1-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-(メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(ジメチルアミノ)-6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-モルホリノ-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-(ピロリジン-1-イル)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-9-((ジメチルアミノ)メチル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6-クロロ-4-(ジメチルアミノ)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(ジメチルアミノ)-5,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3-((ジメチルアミノ)メチル)-3-フルオロピロリジン-1-イル)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-(3-(((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3-(((2,2-ジフルオロエチル)(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3-((シクロプロピル(メチル)アミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-[4-[(ジメチルアミノ)メチル]-3,3-ジフルオロ-ピロリジン-1-イル]-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5-クロロ-4-(ジメチルアミノ)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-4-(3-フェニルピロリジン-1-イル)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
(S)-7-(4-(2-((ジメチルアミノ)メチル)ピロリジン-1-イル)-6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
(R)-7-(4-(3-(ジメチルアミノ)ピロリジン-1-イル)-6,7-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(5,6-ジフルオロ-4-(ヘキサヒドロピラジノ[2,1-c][1,4]オキサジン-8(1H)-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸とギ酸の化合物;
7-[8-(エチルアミノ)-6-フルオロ-4-[3-(トリフルオロメチル)ピラゾール-1-イル]-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[8-(エチルアミノ)-6-フルオロ-4-[3-(トリフルオロメチル)ピラゾール-1-イル]-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
8-[8-(エチルアミノ)-6-フルオロ-4-[3-(トリフルオロメチル)ピラゾール-1-イル]-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-モルホリノ-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-4-(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロール-1-イル)-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-シアノ-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-[[2-メトキシエチル(メチル)アミノ]メチル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-4-オキソ-9-(ピロリジン-1-イルメチル)ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-4-ピロリジン-1-イル-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-(モルホリノメチル)-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-(4-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)-6-フルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル)-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
7-[4-(ジメチルアミノ)-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-[(5-メチル-2,3,3a,4,6,6a-ヘキサヒドロピロロ[2,3-c]ピロール-1-イル)メチル]-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;および
7-[4-シクロプロピル-5,6-ジフルオロ-8-(メチルアミノ)-9H-ピリド[2,3-b]インドール-3-イル]-9-メチル-4-オキソ-ピリド[1,2-a]ピリミジン-3-カルボン酸;
から選択される化合物、またはその薬学的に許容される塩。 - 式(Ii)、
の化合物の酸との反応を含み、式中、R1~R7が、請求項1~7のいずれか一項のように定義され、前記酸が、トリフルオロ酢酸である、請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物の調製のためのプロセス。 - 請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を含む薬学的組成物。
- 請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩と、治療的に不活性な担体と、を含む、薬学的組成物。
- DNAジャイレースまたはトポイソメラーゼIV阻害剤としての使用のための、請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を含む薬学的組成物。
- DNAジャイレースおよびトポイソメラーゼIV阻害剤としての使用のための、請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を含む薬学的組成物。
- 細菌感染症の処置または予防のための、請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を含む薬学的組成物。
- 細菌感染症の処置または予防のための医薬の調製のための、請求項1~8のいずれか一項に記載の化合物の使用。
- 非ヒト哺乳動物における細菌感染症の処置または予防のための方法であって、有効量の請求項1~8のいずれか一項で定義される化合物またはその薬学的に許容される塩を投与することを含む、方法。
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