JP7619941B2 - Cd25抗体 - Google Patents

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関連出願の相互参照
この出願は、2018年11月14日に出願された米国仮特許出願第62/767,405号の優先権の利益を主張し、この仮出願の内容は、全体として参照により本明細書に組み入れられている。
CD25タンパク質は、インターロイキン-2(IL-2)受容体のα鎖であり、制御性T細胞および活性化T細胞に存在する膜貫通タンパク質である。正常状態において、制御性T細胞は、CD25を恒常的に発現し、エフェクター細胞の増殖を抑制するように働く。制御性T細胞は、健康状態を維持し、エフェクターT細胞が自己抗原に対して反応しまたは外来抗原へ過剰反応するのを阻害する。正常な防御免疫応答において、エフェクターT細胞は、外来抗原との接触後、増加し、制御性T細胞による阻害に打ち勝つ。しかしながら、増殖性疾患の場合、癌細胞は、制御性T細胞の量を増加させ、それにより癌細胞に対するエフェクターT細胞の産生を制限することにより、健康な免疫応答を不能とする。例えば、癌治療用として免疫系を弱めるために、または自己免疫疾患用として免疫系を上方制御するために、CD25を発現する制御性T細胞の増殖を変化させるためのさらなる分子ツールが必要とされており、そのようなツールが本明細書で提供される。
CD25と特異的に結合する抗体(抗CD25抗体、本明細書では、CD25抗体と、交換可能に呼ばれる)が本明細書で提供される。その抗体は、ヒト、キメラ、またはヒト化であり得る。記載された抗体の使用の方法、およびそれを作製する方法もまた本明細書で提供される。例えば、CD25抗体は、処置を必要としている対象に抗体またはその医薬組成物を投与することを含む、癌の処置に治療的に用いられ得る。本明細書に記載されたCD25抗体を産生する方法もまた提供される。
一態様において、ヒトCD25と結合するモノクローナルCD25抗体であって、以下の特性:
a.前記抗体は、IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)との結合を阻まず、かつ7G7B6が結合するものとは異なるエピトープと結合する;
b.前記抗体は、IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)との結合を阻まないが、IL-2受容体のβ鎖とγ鎖とα鎖(CD25)の三量体形成を阻む;
c.前記抗体は、IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖、β鎖、および/またはγ鎖との結合を阻み、かつダクリズマブまたはバシリキシマブが結合するものとは異なるエピトープと結合する;
d.前記抗体は、7.4のpHにおけるCD25との結合親和性と比較した場合、7.4未満のpHにおいてCD25とのより高い結合親和性を示す;
e.前記抗体は、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、および表5A、もしくは図3A、図3B、および図5に提示された重鎖可変領域(variable heavy chains)のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む;
f.前記抗体は、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、および表5B、もしくは図4A、図4B、および図6に提示された軽鎖可変領域(variable light chains)のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む;
g.前記抗体のVHは、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、表5A、および表6に提示されている、または図3A、図3B、および図5に提示された配列に含有されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列のいずれか1つを含む;
h.前記CD25抗体のVLは、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、表5B、および表7に提示されている、または図4A、図4B、および図6に提示された配列に含有されているCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列のいずれか1つを含む;
i.前記抗体は、表6に提示された組合せのいずれか1つのCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列、ならびに表7に提示された組合せのいずれか1つのCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む、
のうちの少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、または少なくとも6つを有するモノクローナルCD25抗体が本明細書で提供される。
いくつかの実施形態において、抗体のVHは、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、表5A、もしくは表6に提示されている、または図3A、図3B、もしくは図5に提示された配列に含有されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3の組合せのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体のVLは、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、表5B、もしくは表7に提示されている、または図4A、図4B、もしくは図6に提示された配列に含有されているCDRL1、CDRL2、およびCDRL3の組合せのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表6に提示された組合せのいずれか1つのCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表7に提示された組合せのいずれか1つのCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、抗体はヒト抗体である。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化抗体である。いくつかの実施形態において、抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態において、抗体は抗体断片である。いくつかの実施形態において、抗体はまた、カニクイザル(cynomologous monkey)CD25も結合する。
別の態様において、本明細書に記載された抗体または医薬組成物のいずれか1つの治療的有効量を対象に投与することを含む、処置を必要としている対象を処置する方法が本明細書で提供される。いくつかの実施形態において、本明細書に記載された抗体または医薬組成物のいずれか1つの治療的有効量を対象に投与することを含む、対象における制御性T細胞の数を枯渇させる(deplete)方法が本明細書で提供される。いくつかの実施形態において、対象は、癌を患っており、他の実施形態においては、対象は自己免疫関連疾患または障害を患っている。
別の態様において、末梢血単核細胞を含む試料における制御性T細胞の数を枯渇させる方法であって、試料を本明細書に記載された抗体のいずれか1つと接触させることを含む、方法が本明細書で提供される。
関連態様において、本明細書に記載されたいずれか1つまたは複数の抗体、本明細書に記載された抗体のいずれかをコードする核酸配列、前記核酸を含むベクター、本明細書に記載された抗体のいずれかを発現するファージを含む医薬組成物またはキットが、本明細書で提供される。
本明細書(任意の添付の特許請求の範囲、要約、および図面を含む)に記載された上記の特徴の全部、および/またはそのように開示された任意の方法もしくはプロセスの工程の全部は、そのような特徴および/または工程の少なくとも一部がお互いに排他的である組合せを除いて、任意の組合せで組み合わされ得る。
本出願は、添付の図と共に示された以下の説明を参照することにより理解することができる。
図1は、本明細書に記載されたCD25抗体のクラスの1つの所望の特性の例示的な説明である:IL-2受容体のα鎖(CD25)のみを遮断し、IL-2の結合を遮断せず、IL-2により媒介されるシグナル伝達を阻まず、Tregの枯渇をもたらすCD25抗体。データは、Fabクローンに関して収集されるが、本明細書で提供されているように、いくつかの実施形態において、CD25抗体は完全長抗体、すなわち、ヒトIgG1抗体である。
図2は、CD25抗体発見、インビトロ試験、およびインビボ試験についての例示的なワークフローである。
図3Aおよび図3Bは、本開示の例示的なCD25抗体の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列(配列番号61~107、1501及び432~460)を描く。 図3Aおよび図3Bは、本開示の例示的なCD25抗体の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列を描く。
図4Aおよび図4Bは、本開示の例示的なCD25抗体の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列(配列番号703、705、707、709、715、717、722、724、725、727、728、739、742、745、747、749~752、754~756、759、762、765、767、769、776、780、781、783、785、787、789、791、794、797、799、801、803、804、806、809~811、813、815、818、824、827、829、835、841、842、844、846、848、849、851、853、875~880、882、884、886、888、892、897、901~903、905~908、914、917、919~922)を描く。 図4Aおよび図4Bは、本開示の例示的なCD25抗体の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を描く。
図5は、本開示の例示的なCD25抗体のVHアミノ酸配列(配列番号86 8、869、1222、1229~1238、1316~1318及び1327~1335)を描く。
図6は、本開示の例示的なCD25抗体のVLアミノ酸配列(配列番号34 、701、712、735、736、737、775、777、778、795、822、823、825、838、857、859、860、861、864、895及び912)を描く。
図7は、バイオセンサーを用いた交差遮断アッセイを用いる、非IL-2遮断剤の同定を描く。
図8は、バイオセンサーを用いて、IL-2非遮断抗体、7G7B6と競合する本開示のFabを発現するファージを描く。
図9は、pSTAT5レベルが、IL-2用量依存的であり、かつIL-2遮断抗体、ダクリズマブで阻害されることを示す。
図10は、本開示のD5 FabのpSTAT5レベルへの効果を描く。データは、D5 Fabが部分的IL-2遮断剤であることを示している。
図11は、最大IL-2 pSTAT5レベルに対する、異なる濃度におけるD5 FabのpSTAT5レベルへの効果を描く。
図12は、対照[IL-2のみ、ダクリズマブ(Dac)、および7G7B6]と比較した、1ug/mL、2ug/mL、および5ug/mLにおけるいくつかのFabクローン間のpSTAT5レベルの差を描く。
図13A~13Cは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたいくつかのFabクローンについてのKdおよびKoff速度定数の差を描く(図13A)。いくつかの再フォーマット化クローンは、市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブよりも良い親和性およびKoff速度定数を有する(図13B、図13C)。 図13A~13Cは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたいくつかのFabクローンについてのKdおよびKoff速度定数の差を描く(図13A)。いくつかの再フォーマット化クローンは、市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブよりも良い親和性およびKoff速度定数を有する(図13B、図13C)。 図13A~13Cは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたいくつかのFabクローンについてのKdおよびKoff速度定数の差を描く(図13A)。いくつかの再フォーマット化クローンは、市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブよりも良い親和性およびKoff速度定数を有する(図13B、図13C)。
図14A~14Dは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたFabクローンを用いた、IL-2、ならびに市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブに対するエピトープビニング(bining)交差競合アッセイからの代表的なデータを示す。抗体は、異なる交差遮断プロファイルを有した。 図14A~14Dは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたFabクローンを用いた、IL-2、ならびに市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブに対するエピトープビニング(bining)交差競合アッセイからの代表的なデータを示す。抗体は、異なる交差遮断プロファイルを有した。 図14A~14Dは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたFabクローンを用いた、IL-2、ならびに市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブに対するエピトープビニング(bining)交差競合アッセイからの代表的なデータを示す。抗体は、異なる交差遮断プロファイルを有した。 図14A~14Dは、ヒトIgG1抗体へ再フォーマットされたFabクローンを用いた、IL-2、ならびに市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブに対するエピトープビニング(bining)交差競合アッセイからの代表的なデータを示す。抗体は、異なる交差遮断プロファイルを有した。
図15A~15Bは、ヒトIgG1へ再フォーマットされたFabの、CD25+ 細胞株SUDHL-1およびHEK IL-2レポーター細胞における特異的な結合(図15A)、ならびにCD25- 細胞株SUDHL-2における無結合(図15B)を描く。 図15A~15Bは、ヒトIgG1へ再フォーマットされたFabの、CD25+ 細胞株SUDHL-1およびHEK IL-2レポーター細胞における特異的な結合(図15A)、ならびにCD25- 細胞株SUDHL-2における無結合(図15B)を描く。 図15A~15Bは、ヒトIgG1へ再フォーマットされたFabの、CD25+ 細胞株SUDHL-1およびHEK IL-2レポーター細胞における特異的な結合(図15A)、ならびにCD25- 細胞株SUDHL-2における無結合(図15B)を描く。
図16A~16Bは、市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブと比較した、ヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンの、CD25+ 細胞株SUDHL-1における代表的な用量応答曲線を示す(図16A)。いくつかのクローンは、IL-2非遮断剤7G7B6よりも良いEC50値を示している(図16B)。 図16A~16Bは、市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブと比較した、ヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンの、CD25+ 細胞株SUDHL-1における代表的な用量応答曲線を示す(図16A)。いくつかのクローンは、IL-2非遮断剤7G7B6よりも良いEC50値を示している(図16B)。
図17は、組換えカニクイザルCD25タンパク質(25nM)と結合する、ヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンの代表的なデータを示す。クローンの大部分は、用量依存的様式(25nMから開始して、3倍希釈)で結合する。
図18A~18Bは、0.1ng/mLにおけるIL-2レベルと比較した、5ug/mlにおけるいくつかのヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンに渡るpSTAT5レベルの差を示す(図18A)。図18Bは、各抗体の5ug/mLを用いた、IL-2用量応答曲線(10ng/mLから開始して、10倍希釈)に関するpSTAT5レベルを示す。いくつかのクローンは、0.1ng/mLにおける市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブよりも良いIL-2遮断剤およびIL-2非遮断剤であることが示された。 図18A~18Bは、0.1ng/mLにおけるIL-2レベルと比較した、5ug/mlにおけるいくつかのヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンに渡るpSTAT5レベルの差を示す(図18A)。図18Bは、各抗体の5ug/mLを用いた、IL-2用量応答曲線(10ng/mLから開始して、10倍希釈)に関するpSTAT5レベルを示す。いくつかのクローンは、0.1ng/mLにおける市販抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブよりも良いIL-2遮断剤およびIL-2非遮断剤であることが示された。
図19A~19Bは、エフェクター細胞としてPBMCおよび標的としてSUHL-1細胞を用いるADCCアッセイにおいて細胞殺害を誘発する、20ug/mLでのヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンの代表的なデータを示す(図19A)。いくつかのクローンは、抗体の10ug/mLから開始して、5倍希釈を用いた場合、7G7B6よりも高いADCCを示した(図19B)。 図19A~19Bは、エフェクター細胞としてPBMCおよび標的としてSUHL-1細胞を用いるADCCアッセイにおいて細胞殺害を誘発する、20ug/mLでのヒトIgG1へ再フォーマットされたFabクローンの代表的なデータを示す(図19A)。いくつかのクローンは、抗体の10ug/mLから開始して、5倍希釈を用いた場合、7G7B6よりも高いADCCを示した(図19B)。
CD25と特異的に結合する抗体が本明細書で提供される。抗体は、ヒト、キメラ、またはヒト化であり得る。記載された抗体を用いる方法およびそれを作製する方法もまた本明細書で提供される。例えば、CD25抗体は、処置を必要としている対象に抗体またはその医薬組成物を投与することを含む、癌を処置するために治療的に用いられ得る。本明細書に記載されたCD25抗体を産生する方法もまた提供される。
定義
本明細書で他に規定がない限り、本明細書で用いられる全ての技術的および科学的用語は、当業者により一般的に理解されているのと同じ意味をもつ。本明細書に記載されたものと類似したまたは等価の任意の方法および材料が、本発明の実践または試験に用いることができ、例示的な方法および材料が記載されている。
本明細書に提供された見出しは、本発明の様々な態様または実施形態の限定ではない。したがって、すぐ下に定義された用語は、総じて、本明細書を参照することにより、より完全に定義される。
数値範囲は、その範囲を定義する数を含む。
本明細書で用いられる場合、抗体という用語は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、非ヒト抗体、キメラ抗体、一価抗体、および抗体の抗原結合断片(例えば、Fab断片、Fab’2断片、またはscFV)を含むが、それらに限定されない。CD25に対する特異性を示す、抗体-薬物コンジュゲート、二特異性抗体、および多特異性抗体もまた本明細書で提供される。非ヒト抗体(例えば、マウス抗体)は、通常の技術を用いて(例えば、マウスCDRを保持しながら、フレームワーク領域において変化を導入することにより)、「ヒト化」され得る。
用語「ポリヌクレオチド」および「核酸」は、本明細書で交換可能に用いられ、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドであり得る、任意の長さのヌクレオチドの重合体型を指す。その用語は、一本鎖、二本鎖、もしくは多重鎖DNAもしくはRNA、ゲノムDNA、cDNA、DNA-RNAハイブリッド、またはプリンおよびピリミジン塩基、もしくは他の天然の、化学的もしくは生化学的修飾型の、非天然の、もしくは誘導体化のヌクレオチド塩基を含む重合体を含むが、それらに限定されない。その用語は、具体的に他に限定または明示がない限り、天然のヌクレオチドの既知の類似体を含有し、かつ類似した結合性質を有し、しかも天然に存在するヌクレオチドと類似した様式で代謝される核酸を包含する。
核酸またはアミノ酸配列が、別の核酸またはアミノ酸配列と、ある特定のパーセント「配列同一性」もしくは「同一性」を有し、またはある特定のパーセント「同一」であると言われる場合、それらの配列がアライメントされている時、その2つの配列を比較した場合、そのパーセンテージの塩基またはアミノ酸が同じであり、かつ同じ相対的位置にある。
用語「個体」、「対象」、および「患者」は、本明細書で交換可能に用いられ、処置または治療が望まれている任意の対象を指す。対象は、哺乳動物対象であり得る。哺乳動物対象には、例えば、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類(例えば、ラット、マウス)、ウサギ目の動物(例えば、ウサギ)、有蹄動物(例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギ、およびその他)などが挙げられる。いくつかの実施形態において、対象はヒトである。いくつかの実施形態において、対象は非ヒト霊長類である。いくつかの実施形態において、対象はコンパニオンアニマル(例えば、ネコ、イヌ)である。
抗体
CD25と特異的に結合する抗体が本明細書で提供される。そのような抗体は、制御性T細胞上に存在する、単独か、または高親和性IL-2受容体を形成する他の分子と会合したかのいずれかでCD25抗原と結合する能力がある。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、CD25と特異的に結合するヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、キメラ抗体、例えば、マウス-ヒトキメラ抗体、例えば、マウス可変ドメインおよびヒト定常領域を含む抗体である。
本開示のCD25抗体は、ヒトIgA、IgD、IgE、IgG、またはIgM抗体のいずれかであり得る。IgA抗体は、IgA1またはIgA2抗体であり得る。IgG抗体は、IgG1、IgG2、IgG2a、IgG2b、IgG3、またはIgG4抗体であり得る。これらの抗体のいずれかの組合せもまた作製され、用いられ得る。いくつかの実施形態において、定常領域は、IgG型、例えば、ヒトIgG型である。いくつかの実施形態において、定常領域は、IgG1型、例えば、ヒトIgG1型である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、1つより多い種との交差反応性を示し、例えば、ヒトCD25と非ヒトCD25の両方と特異的に結合し、例えば、ヒトCD25とカニクイザルCD25の両方と特異的に結合する。
本明細書に提供された抗体のKD(親和定数)は、約10-5nMから約10-14nMまでの範囲である。いくつかの実施形態において、本明細書に提供された抗体のKDは、約10-8nMから約10-12nMまでの範囲である。例示的な実施形態において、CD25抗体のKDは、少なくとも約10-5nM、約10-6nM、約10-7nM、約10-8nM、約10-9nM、約10-10nM、約10-11nM、約10-12nM、約10-13nM、またはさらに約10-14nMである。
本明細書に提供された抗体のKd(解離速度(off-rate)定数)は、約10-21/sから約10-61/sまでの範囲である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、生理的pH(約7.4)と非生理的pHの両方において、CD25抗原に対して同じ親和性(KD)を示す。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、生理的pH(約7.4)と非生理的pHの両方において、CD25抗原に対して同じ解離速度(Kd)を示す。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、生理的pH(約7.4)と非生理的pHにおいて、CD25抗原に対して異なる親和性(異なるKD)を示す。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、生理的pH(約7.4)と非生理的pHにおいて、CD25抗原に対して異なる解離速度定数(異なるKd)を示す。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、生理的pHより低いpHにおいてより、例えば、pHが7.3、7.2、7.1、7.0、6.9、6.8、6.7、6.6、6.5、6.4、6.3、6.2、6.1、またはそれ未満である時より、生理的pH(約7.4)においてCD25抗原に対してより低い親和性(より高いKD)を示す。例示的な実施形態において、抗体は、約7.4のpHにおける親和性と比較して、約6.5のpHにおいてCD25抗原に対するより高い親和性を示す。いくつかの実施形態において、そのような抗体は、酸性環境、低酸素環境、例えば、腫瘍微小環境において活性を保持し、または活性の増強を示すのに有用である。
いくつかの実施形態において、抗体は、非IL-2遮断抗体(blocking antibody)(非IL-2遮断剤(blocker))であり、すなわち、その抗体のCD25との結合は、IL-2リガンドのCD25(IL-2α鎖)との結合を阻まずまたは妨げず、かつIL-2媒介性シグナル伝達、例えば、IL-2/JAK3/STAT-5シグナル伝達経路を通してのシグナル伝達に影響しない。いくつかの実施形態において、抗体は、IL-2リガンドのCD25(IL-2 α鎖)との結合を阻まず、かつ7G7B6抗体が結合する所とは異なるエピトープと結合する。いくつかの実施形態において、抗体は、IL-2リガンドのCD25(IL-2 α鎖)との結合を阻まないが、IL-2受容体のβ鎖とγ鎖とα鎖(CD25)の三量体形成を阻む。
いくつかの実施形態において、抗体は、IL-2遮断抗体(IL-2遮断剤)であり、例えば、その抗体は、IL-2リガンドのその受容体のα鎖、β鎖、および/またはγ鎖との結合を阻みまたは妨げ、かつIL-2媒介性シグナル伝達を減少させまたは阻害する。ある特定の実施形態において、抗体は、IL-2リガンドのCD25との結合を阻みまたは妨げる。いくつかの実施形態において、抗体は、IL-2リガンドのCD25との結合を阻みまたは妨げ、かつダクリズマブかまたはバシリキシマブのいずれかが結合するエピトープとは異なるエピトープと結合する。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、部分的遮断抗体(部分的IL-2遮断剤)であり、IL-2リガンドの、IL-2受容体(CD25)のα鎖、β鎖、および/もしくはγ鎖との結合を完全ではないが、部分的に、阻み、ならびに/または、IL-2媒介性シグナル伝達を、完全ではないが、部分的に減少させる。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、IL-2 α鎖、IL-2 β鎖、およびIL-2 γ鎖のヘテロ三量体形成を阻みまたは妨げる。いくつかの実施形態において、抗体は、IL-2リガンドのCD25との結合を遮断しないが、IL-2 α鎖、IL-2 β鎖、およびIL-2 γ鎖のヘテロ三量体形成を阻みまたは妨げる。ある特定の実施形態において、抗体は、制御性T細胞と選択的に結合する。他の実施形態において、抗体は、Tエフェクター細胞に選択的に結合する。
いくつかの実施形態において、CD25抗体の結合は、制御性T細胞(Treg)の枯渇をもたらすが、エフェクターT細胞(Teff)の増殖を許容する。
いくつかの実施形態において、抗体は、CD25とトランス配向で結合する。他の実施形態において、抗体は、CD25とシス配向で結合する。なおさらなる実施形態において、抗体は、CD25と、シス立体配置またはトランス立体配置のどちらでも結合する能力がある。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、7G7B6(マウスIgG2a Fc受容体を有する抗ヒトCD25;IL-2非遮断剤;BioXcell)のCD25との結合と比較して、CD25に対するより高い結合親和性を示す。
表1A~1L、表2A~2C、表3A~3C、表4A~4B、表5A~5B、表6、および表7、ならびに図3A、図3B、図4A、図4B、図5、および図6は、本明細書に記載されたCD25抗体についての例示的な配列を提供する。示された相補性決定領域(CDR)およびフレームワーク(FR)配列は、抗体アノテーションについてのIMGT協定に基づいていることは留意されたい。しかしながら、当業者は、KabatおよびChothiaなどの抗体アノテーションのための他のアルゴリズム/協定を用いて、提示されたVHおよびVL配列に基づいたCDRおよびフレームワーク配列の他の表現を決定することができる。したがって、本開示のCDRおよびFR配列は、下記の表にアノテーションされた例示的なCDRおよびFR配列に限定されないが、むしろ、可変領域の配列を考慮すれば、CDRは、当業者により理解され、決定されるであろう。
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いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表2A、表2B、および表2Cのいずれか1つに提示された「V-D-J領域」重鎖配列と表3A、表3B、および表3Cのいずれか1つに提示された「V-J領域」軽鎖配列、それらのヒト化バージョン、またはそれらと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体は、与えられた「ID」によりそのように名づけられた特定の抗体クローン由来の重鎖可変領域配列(またはそのヒト化バージョン)、および同じ抗体クローン由来の軽鎖(例えば、同じ「ID」により識別されるクローン由来の軽鎖)可変領域配列(またはそのヒト化バージョン)を含む。したがって、起源の抗体クローンは、表2A~2Cまたは表3A~3Cに示されたIDにより識別することができる。例えば、そのような実施形態において、CD25抗体は、表2Bの行1に提示されている抗体クローン「AHH03760」の重鎖可変領域(またはそのヒト化バージョン)、および表3Bの行3に提示されている抗体クローン「AHH03760」の軽鎖可変領域(またはそのヒト化バージョン)を含む。他の実施形態において、CD25抗体は、与えられた「ID」によりそのように名づけられた特定の抗体クローン由来の重鎖可変領域配列(またはそのヒト化バージョン)、および異なる抗体クローン由来の軽鎖(例えば、同じ「ID」により識別されるクローン由来の軽鎖)可変領域配列(またはそのヒト化バージョン)を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表2A、表2B、および表2Cのいずれか1つに提示されたCDRH1、CDRH2、およびCDRH3、ならびに表3A、表3B、および表3Cのいずれか1つに提示されたCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。そのような実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来のCDRH1、CDRH2、およびCDRH3、ならびに同じ抗体クローン由来のCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。上記で論じられているように、起源の抗体クローンは、表2A~2Cまたは表3A~3Cに示されたIDにより識別することができる。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表4Aに提示された重鎖可変領域、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む。その可変領域は、完全な可変領域を形成し得る連続したHFR1、CDRH1、HFR2、CDRH2、HFR3、CDRH3、HRF4配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含み得る。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表4Bに提示された軽鎖可変領域、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む。その可変領域は、完全な可変領域を形成し得る連続したLFR1、CDRL1、LFR2、CDRL2、LFR3、CDRL3、LRF4配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含み得る。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表4Aに提示されている完全な重鎖可変領域および表4Bに提示されている完全な軽鎖可変領域を含み、その可変領域には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来の重鎖可変領域配列および同じ抗体クローン由来の軽鎖可変領域配列を含み、その可変領域配列には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来の重鎖可変領域配列および異なる抗体クローン由来の軽鎖可変領域配列を含み、その可変領域配列には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。起源の抗体クローンは、表4Aおよび表4Bに示されたIDにより識別することができる。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表4Aに提示されたCDRH1、CDRH2,およびCDRH3、ならびに表4Bに提示されたCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来のCDRH1、CDRH2,およびCDRH3、ならびに同じ抗体クローン由来のCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。他の実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来のCDRH1、CDRH2,およびCDRH3、ならびに異なる抗体クローン由来のCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。上記で論じられているように、起源の抗体クローンは、表4Aおよび表4Bに示されたIDにより識別することができる。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Aに提示された重鎖可変領域を含み、その重鎖可変領域には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。その可変領域は、完全な可変領域を形成し得る連続したHFR1、CDRH1、HFR2、CDRH2、HFR3、CDRH3、HRF4配列を含み得、その配列には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Bに提示された軽鎖可変領域を含み、その軽鎖可変領域には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。その可変領域は、完全な可変領域を形成し得る連続したLFR1、CDRL1、LFR2、CDRL2、LFR3、CDRL3、LRF4配列を含み得、その配列には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Aに提示されている完全な重鎖可変領域および表5Bに提示されている完全な軽鎖可変領域を含み、その可変領域には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来の重鎖可変領域配列および同じ抗体クローン由来の軽鎖可変領域配列を含み、その可変領域配列には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。他の実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来の重鎖可変領域配列および異なる抗体クローン由来の軽鎖可変領域配列を含み、その可変領域配列には、そのヒト化バージョン、およびそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列も挙げられる。起源の抗体クローンは、表5Aおよび表5Bに示されたIDにより識別することができる。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Aに提示されたCDRH1、CDRH2,およびCDRH3、ならびに表5Bに提示されたCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来のCDRH1、CDRH2,およびCDRH3、ならびに同じ抗体クローン由来のCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。他の実施形態において、CD25抗体は、特定の抗体クローン由来のCDRH1、CDRH2,およびCDRH3、ならびに異なる抗体クローン由来のCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む。上記で論じられているように、起源の抗体クローンは、表5Aおよび表5Bに示されたIDにより識別することができる。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、および表5A、もしくは図3A、図3B、および図5に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、さらにヒト化されている、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、および表5A、または図3A、図3B、および図5に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、および表5B、もしくは図4A、図4B、および図6に提示された軽鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体は、通常の技術を用いて、さらにヒト化されている、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、および表5B、または図4A、図4B、および図6に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、および表5A、もしくは図3A、図3B、および図5に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含み、かつCD25抗体は、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、および表5B、もしくは図4A、図4B、および図6に提示された軽鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体のVHは、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、もしくは表5Aに提示されている、または図3A、図3B、もしくは図5に提示された配列に含有されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体のVHは、表6に提示されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体のVLは、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、もしくは表5Bに提示されている、または図4A、図4B、もしくは図6に提示された配列に含有されているCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体のVLは、表7に提示されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体のVHは、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、もしくは表5Aに提示されている、または図3A、図3B、もしくは図5に提示された配列に含有されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含み、かつCD25抗体のVLは、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、もしくは表5Bに提示されている、または図4A、図4B、もしくは図6に提示された配列に含有されているCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、CD25抗体のVHは、表6に提示されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含み、かつCD25抗体のVLは、表7に提示されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、抗体のVHは、表5Aに提示されたCDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体のVLは、表5Bに提示されたCDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体は、表5Aに提示されたCDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列を含むVH、ならびに表5Bに提示されたCDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの実施形態において、抗体は、表1Aおよび表1Bに提示された、D5 CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列、D5 VHおよびD5 VLのアミノ酸配列、または表1Aおよび表1Bに提示されたD5 VHおよびD5 VLのアミノ酸配列のヒト化バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、抗体は、表1Cおよび1Dに提示された、D11 CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列、D11 VHおよびD11 VLのアミノ酸配列、または表1Cおよび1Dに提示されたD11 VHおよびD11 VLのアミノ酸配列のヒト化バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、抗体は、表1Eおよび1Fに提示された、D16 CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列、D16 VHおよびD16 VLのアミノ酸配列、または表1Eおよび1Fに提示されたD16 VHおよびD16 VLのアミノ酸配列のヒト化バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、抗体は、表1Gおよび1Hに提示された、D17 CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列、D17 VHおよびD17 VLのアミノ酸配列、または表1Gおよび1Hに提示されたD17 VHおよびD17 VLのアミノ酸配列のヒト化バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、抗体は、表1Iおよび1Jに提示された、D34 CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列、D34 VHおよびD34 VLのアミノ酸配列、または表1Iおよび1Jに提示されたD34 VHおよびD34 VLのアミノ酸配列のヒト化バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、抗体は、表1Kおよび1Lに提示された、D36 CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列、D36 VHおよびD36 VLのアミノ酸配列、または表1Kおよび1Lに提示されたD36 VHおよびD36 VLのアミノ酸配列のヒト化バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Aに提示された、AH04507、AH04522、AH04526、AH04527、AH04734、AH04750、AH05214、AH05247、AH05249、AH05251、AH05256、AH05257、AH05258、AH05259、AH05268、AH05271、AH05274、AH05280、AH05285、AH05286、AH4501、AH4502、AH4503、AH4505、AH4509、AH4511、AH4518、AH4523、AH4524、AH4525、D11、D17、D34、D36、D5、BP003-T2P1C4、BP003-T2P1D10、BP003-T2P1D7、BP003-T2P1E3、またはBP003-T2P1D1のクローンのいずれか1つのCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Bに提示された、AH04507、AH04522、AH04526、AH04527、AH04734、AH04750、AH05214、AH05247、AH05249、AH05251、AH05256、AH05257、AH05258、AH05259、AH05268、AH05271、AH05274、AH05280、AH05285、AH05286、AH4501、AH4502、AH4503、AH4505、AH4509、AH4511、AH4518、AH4523、AH4524、AH4525、D11、D17、D34、D36、D5、BP003-T2P1C4、BP003-T2P1D10、BP003-T2P1D7、BP003-T2P1E3、またはBP003-T2P1D1のクローンのいずれか1つのCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、表5Aに提示された、AH04507、AH04522、AH04526、AH04527、AH04734、AH04750、AH05214、AH05247、AH05249、AH05251、AH05256、AH05257、AH05258、AH05259、AH05268、AH05271、AH05274、AH05280、AH05285、AH05286、AH4501、AH4502、AH4503、AH4505、AH4509、AH4511、AH4518、AH4523、AH4524、AH4525、D11、D17、D34、D36、D5、BP003-T2P1C4、BP003-T2P1D10、BP003-T2P1D7、BP003-T2P1E3、またはBP003-T2P1D1のクローンのいずれか1つのCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含み、かつCD25抗体は、表5Bに提示された、AH04507、AH04522、AH04526、AH04527、AH04734、AH04750、AH05214、AH05247、AH05249、AH05251、AH05256、AH05257、AH05258、AH05259、AH05268、AH05271、AH05274、AH05280、AH05285、AH05286、AH4501、AH4502、AH4503、AH4505、AH4509、AH4511、AH4518、AH4523、AH4524、AH4525、D11、D17、D34、D36、D5、BP003-T2P1C4、BP003-T2P1D10、BP003-T2P1D7、BP003-T2P1E3、またはBP003-T2P1D1のクローンのいずれか1つのCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH04507のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH04522のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH04526のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH04527のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH04734のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH04750のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05214のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05247のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05249のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05251のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05256のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05257のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05258のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05259のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05268のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05271のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05274のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05280のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05285のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH05286のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4501のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4502のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4503のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4505のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4509のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4511のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4518のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4523のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4524のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、AH4525のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、D11のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、D17のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、D34のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、D36のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、D5のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、BP003-T2P1C4のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、BP003-T2P1D10のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、BP003-T2P1D7のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、BP003-T2P1E3のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、BP003-T2P1D1のCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列(表5Aおよび表5B、それぞれに提示されている)を含む;いくつかの実施形態において、CD25抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、様々な目的のためにコンジュゲートされ、その目的には、治療学および検出/診断学における使用が挙げられるが、それらに限定されない。
本明細書に提供されたCD25抗体のいずれかをコードする核酸配列もまた本明細書で提供される。D5、D11、D16、D17、D34、およびD36 VHおよびVL領域をコードする例示的な核酸配列は、表1A~1Lに提供されている - そのヒト化バージョンを用いることができる。前記抗体をコードする核酸のいずれかを含むベクター、そのようなベクターを含むファージ、およびそのようなベクターを含む宿主細胞もまた本明細書で提供される。
抗体産生および試験
図2は、CD25抗体発見、インビトロ試験、およびインビボ試験についての例示的な非限定的ワークフローであるが、抗体発見および試験にアプローチする代替方法があることを当業者は認識している。
本明細書に記載されたCD25抗体は、CD25完全または部分的免疫原を動物、例えば、マウスまたはウサギへの注射により産生することができる。その動物由来のCD25免疫原(immunoge)陽性B細胞を収集し、それからファージライブラリを作製することができる。いくつかの実施形態において、ファージは、候補CD25抗体のFab断片を発現する。ファージは、例えば連続的に低くなった濃度のCD25抗原に対する、複数ラウンドのスクリーニング(本明細書ではファージパニングと呼ばれる)を受けて、CD25を高親和性で結合する能力があるFab断片が選択され得る。ファージは、CD25抗原をコーティングされたビーズ、または例えば、いくつかの他の基板に対してスクリーニングすることができる。いくつかの実施形態において、スクリーニングは、生理的pH(例えば、約pH7.4)で実行される。他の実施形態において、スクリーニングは、治療関連における使用のために、例えば、低酸素の酸性腫瘍微小環境における使用のために、より低いpHにおいてCD25抗原を結合する能力があるFab断片についてスクリーニングするために、より低いpH、例えば、約6.5のpHで実行される。
本明細書で作製されたCD25抗体は、いくつかのインビトロの、インビボの、エクスビボの、および/または細胞に基づいたアッセイを用いて有効性について試験され得る。
いくつかの実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、制御性T細胞を枯渇させるそれらの能力についてアッセイし、かつさらに、それに基づいて選択することができる。特定の実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、酸性環境、例えば、生理的pHより低いpH、例えば、pH7.3、7.2、7.1、7.0、6.9、6.8、6.7、6.6、6.5、6.4、6.3、6.2、6.1、またはそれ未満において、制御性T細胞を枯渇させるそれらの能力についてアッセイし、かつさらに、それに基づいて選択することができる。
いくつかの実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、IL-2/IL-2受容体経路を通してのシグナル伝達についてアッセイするために、pSTAT5インビトロアッセイに基づいて、アッセイしかつさらに選択することができ、そのシグナル伝達の維持は、その抗体がIL-2遮断抗体ではないことを示している。
いくつかの実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、分子相互作用を特徴づけるためにバイオセンサースクリーニングを用いてアッセイすることができる。
いくつかの実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、既知の機構を有する他の既知のCD25抗体に対する、結合における競合についてアッセイすることができる。
いくつかの実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、エピトープ特異性についてアッセイすることができる。
いくつかの実施形態において、本明細書におけるCD25抗体は、非IL-2遮断剤、IL-2遮断剤、または部分的IL-2遮断剤であるそれらの能力についてアッセイすることができる。
治療的使用
治療的使用、例えば、癌などの増殖性疾患もしくは障害における使用、または自己免疫疾患における使用のためのCD25抗体が本明細書で提供される。
したがって、治療的有効量の治療用CD25抗体を、必要としている対象に投与することを含む、癌を処置する方法が本明細書で提供される。いくつかの実施形態において、癌は原発性癌である。いくつかの実施形態において、癌は、転移性癌である。いくつかの実施形態において、癌は固形腫瘍を含み、他の実施形態においては、癌は液性腫瘍、例えば、血液に基づいた癌を含む。例示的な実施形態において、CD25抗体は非IL-2遮断抗体である。
したがって、治療的有効量の治療用CD25抗体を、必要としている対象に投与することを含む、自己免疫関連疾患または障害を処置する方法が本明細書で提供される。例示的な実施形態において、CD25抗体はIL-2遮断抗体である。
本明細書で用いられる場合、対象は、哺乳動物として分類される任意の動物を指し、それには、ヒト、家庭用および農場用動物、ならびに動物園用、スポーツ用、またはペット動物、例えば、イヌ、ウマ、ウサギ、ウシ、ブタ、ハムスター、アレチネズミ、マウス、フェレット、ラット、ネコなどが挙げられる。対象は雄性または雌性であり得る。
本明細書に提供された治療用CD25抗体のいずれかの投与は、他の既知の薬物/処置(例えば、小分子薬または生物製剤)と併用して、投与され得る。投与は逐次的または同時的であり得る。
本明細書に記載された治療用CD25抗体のインビボ投与は、静脈内に、腫瘍内に、頭蓋内に、病変内に(例えば、病変内注射、直接的接触拡散)、腔内(腹腔内、胸膜内、子宮内、直腸内)、腹腔内に、筋肉内に、皮下に、局所的に、経口的に、経皮的に、埋入により、吸入により、髄腔内に、脳室内に、または鼻腔内に、実行され得る。例示的な実施形態において、投与経路は静脈内注射による。
治療的有効量の治療用抗体が投与される。治療用抗体の適切な投薬量は、癌の重症度、対象の臨床状態、対象の病歴および処置に対する応答、ならびに主治医の裁量に基づいて決定され得る。
本明細書に提供されたCD25抗体の投薬量は、投与経路に依存して、1日あたり対象の体重1kgにつき約1ng/kgから約1000mg/kg、またはそれ以上まで変動し得る。数日間またはそれ以上に渡る反復投与について、癌の重症度に依存して、処置は、症状の所望の抑制が達成されるまで持続され得る。投薬レジメンは、医師が達成することを望む薬物動態学的減衰のパターンに依存して、有用であり得る。例えば、1週間に1回から21回まで個体に投薬することが本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、投薬頻度は、1日3回、1日2回、1日1回、2日に1回、週1回、2週間に1回、4週間に1回、5週間に1回、6週間に1回、7週間に1回、8週間に1回、9週間に1回、10週間に1回、または月1回、2ヶ月に1回、3ヶ月に1回、またはそれより長い間隔である。治療の過程は、通常の技術およびアッセイによりモニターされ得る。投薬レジメンは、用いられる用量に関わりなく、時間と共に変わり得る。
診断的使用
本明細書に提供されたCD25抗体は、診断および検出のために用いられ得る。適用に依存して、CD25抗体は、インビボまたはインビトロで検出および定量化され得る。
本明細書に提供されたCD25抗体は、様々なイムノアッセイにおける使用のために修正可能である。これらのイムノアッセイには、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、ウェスタンブロット、ラジオイムノアッセイ(RIA)、フローサイトメトリー、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、分光光度法、放射線写真撮影、電気泳動、高速液体クラマトグラフィー(HPLC)、または薄層クロマトグラフィー(TLC)が挙げられるが、それらに限定されない。
本明細書に提供されたCD25抗体は、検出可能な標識、例えば、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、蛍光性、電気的、光学的、または化学的方法により検出可能な標識を含み得る。本開示における有用な標識には、蛍光色素、放射標識、酵素、比色標識、アビジン、またはビオチンが挙げられるが、それらに限定されない。
いくつかの実施形態において、CD25抗体は、核医学装置(SPECT、PET、またはシンチグラフィー)による画像化に有用な同位元素で放射標識される。
医薬組成物
本開示は、治療用CD25抗体を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態において、組成物は無菌である。医薬組成物は、一般的に、薬学的に許容される賦形剤中に有効量の治療用抗体を含む。
キットおよび製造品
本開示はまた、例えば、治療的かまたは診断的かのいずれかの使用のための、本明細書に記載されたCD25抗体のいずれかを含むキットを提供する。いくつかの実施形態において、キットはさらに、二次抗体のいずれか、免疫組織化学分析のための試薬、薬学的に許容される賦形剤、および取扱説明書、ならびにそれらの任意の組合せから選択されるコンポーネントを含有する。いくつかの実施形態において、キットは、本明細書に記載された治療用組成物のいずれか1つまたは複数を、1つまたは複数の薬学的に許容される賦形剤と共に含む。
本出願はまた、本明細書に記載された治療的または診断的組成物またはキットのいずれか1つを含む製造品を提供する。製造品の例には、バイアル(例えば、密封バイアル)が挙げられる。
本明細書に提供された説明は、多数の例示的な構造、方法、パラメータなどを示している。しかしながら、そのような説明は、本開示の範囲への限定として意図されるものではなく、そうではなく、例示的な実施形態の説明として提供されることは、認識されるべきである。
以下の例は、例証を目的として含まれ、本発明の範囲を限定することを意図されない。
実施形態の列挙
実施形態1. ヒトCD25と結合するモノクローナルCD25抗体であって、以下の特性:
a.抗体は、IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)との結合を阻まず、かつ7G7B6が結合するものとは異なるエピトープと結合する;
b.抗体は、IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)との結合を阻まないが、IL-2受容体のβ鎖とγ鎖とα鎖(CD25)の三量体形成を阻む;
c.抗体は、IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)、β鎖、および/またはγ鎖との結合を阻み、かつダクリズマブまたはバシリキシマブが結合するものとは異なるエピトープと結合する;
d.抗体は、7.4のpHにおけるCD25との結合親和性と比較した場合、7.4未満のpHにおいてCD25とのより高い結合親和性を示す;
e.抗体は、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、および表5A、もしくは図3A、図3B、および図5に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む;
f.抗体は、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、および表5B、もしくは図4A、図4B、および図6に提示された軽鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む;
g.抗体のVHは、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、表5A、および表6に提示されている、または図3A、図3B、および図5に提示された配列に含有されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列のいずれか1つを含む;
h.CD25抗体のVLは、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、表5B、および表7に提示されている、または図4A、図4B、および図6に提示された配列に含有されているCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列のいずれか1つを含む;
i.抗体は、表6に提示された組合せのいずれか1つのCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列、ならびに表7に提示された組合せのいずれか1つのCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む。
の少なくとも1つを有する、モノクローナルCD25抗体。
実施形態2. 実施形態1で提供された特性の少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、または少なくとも6つを有する、実施形態1に記載の抗体。
実施形態3. IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)との結合を阻まず、かつ7G7B6が結合するものとは異なるエピトープと結合する、実施形態1に記載の抗体。
実施形態4. IL-2リガンドのIL-2受容体のα鎖(CD25)との結合を阻まないが、IL-2受容体のβ鎖とγ鎖とα鎖(CD25)の三量体形成を阻む、実施形態1に記載の抗体。
実施形態5. IL-2リガンドのIL-2受容体との結合を阻み、かつダクリズマブまたはバシリキシマブが結合するものとは異なるエピトープと結合する、実施形態1に記載の抗体。
実施形態6. 7.4のpHにおけるCD25との結合親和性と比較した場合、7.4未満のpHにおいてCD25とのより高い結合親和性を示す、実施形態1に記載の抗体。
実施形態7. 約6.5のpHにおいてCD25との結合のより高い親和性を示す、実施形態6に記載の抗体。
実施形態8. 表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、および表5A、もしくは図3A、図3B、および図5に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む、実施形態1~7のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態9. 表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、および表5B、もしくは図4A、図4B、および図6に提示された軽鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、もしくは少なくとも95%配列同一性を含むアミノ酸配列を含む、実施形態1~8のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態10. 抗体のVHが、表1A、表1C、表1E、表1G、表1I、表1K、表2A、表2B、表2C、表4A、もしくは表5Aに提示されている、または図3A、図3B、もしくは図5に提示された配列に含有されているCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む、実施形態1~7のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態11. CD25抗体のVLが、表1B、表1D、表1F、表1H、表1J、表1L、表3A、表3B、表3C、表4B、もしくは表5Bに提示されている、または図4A、図4B、もしくは図6に提示された配列に含有されているCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む、実施形態1~7および実施形態10のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態12. CD25抗体が、表6に提示された組合せのいずれか1つのCDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列を含む、実施形態1~10のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態13. CD25抗体が、表7に提示された組合せのいずれか1つのCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む、実施形態1~10のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態14. ヒト抗体である、実施形態1~13のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態15. ヒト化抗体である、実施形態1~13のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態16. キメラ抗体である、実施形態1~13のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態17. マウス可変ドメインおよびヒト定常ドメインを含む、実施形態16に記載の抗体。
実施形態18. 抗体断片である、実施形態1~15のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態19. カニクイザルCD25も結合する、実施形態1~18のいずれか一実施形態に記載の抗体。
実施形態20. 実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つを含む、医薬組成物。
実施形態21. 実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つをコードする核酸配列。
実施形態22. 実施形態21に記載の核酸配列を含むベクター。
実施形態23. 実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つを発現するファージ。
実施形態24. 実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つまたは実施形態20に記載の医薬組成物の治療的有効量を対象に投与することを含む、処置を必要としている対象を処置する方法。
実施形態25. 実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つまたは実施形態20に記載の医薬組成物の治療的有効量を対象に投与することを含む、対象における制御性T細胞の数を枯渇させる方法。
実施形態26. 対象が癌を患っている、実施形態24または25に記載の方法。
実施形態27. 対象が自己免疫関連疾患または障害を患っている、実施形態24または25に記載の方法。
実施形態28. 末梢血単核細胞を含む試料における制御性T細胞の数を枯渇させる方法であって、前記試料を実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つと接触させることを含む、方法。
実施形態29. 実施形態1~19のいずれか一実施形態に記載の抗体のいずれか1つまたは実施形態20に記載の医薬組成物を含むキット。
実施例1
CD25での免疫化
KLHとコンジュゲートされた完全長CD25を、5匹の異なるBalbCマウスへ注射した。全ての注射を、尾静脈を介して行った。免疫化プロトコールは以下の通りであった:
- 0日目:免疫化1
- 14日目:免疫化2
- 28日目:免疫化3
- 35日目:採血
5匹のマウスのうちの4匹からの脾細胞および白血球を用いて、4つのファージライブラリを作製した。ファージライブラリは、抗原結合断片(Fab)を発現するファージを含有した。より具体的には、免疫化動物由来の材料を用いるM13ファージミドライブラリを、以下のように構築した。(i)白血球および脾細胞由来の全RNAを抽出した;(ii)VHおよびVL遺伝子を、特異的なプライマーを用いて増幅した;ならびに(iii)VHおよびVL断片を、GenScriptのM13ファージミドベクターへ2段階クローニングにより挿入した。ライブラリサイズ>2×10;挿入率は>90%であり、インフレーム率は>80%であった。ライブラリは、>95%の固有配列を有する、高度な多様性のライブラリであった。
実施例2
CD25結合についてのファージパニング
Fab含有ファージライブラリのファージパニングの3ラウンドを、ELISAに基づいたアッセイを用いて実行した。ファージを、CD25でコーティングされたビーズに対してスクリーニングした。各ラウンドを、減少する濃度のCD25を用いて実行した。個々のファージクローンは、大腸菌(E. Coli)TG1細胞(LB/カルベニシリン上にプレーティングされた)において発現した。単一コロニーを、0.4ml 2YTブロス中、37℃で30分間、培養し、その後、M13 K07ヘルパーファージに、37℃で3時間、感染させた。その後、50μg/mlカルベニシリンおよび10μg/mlカナマイシンを、その培養物へ加え、その後、それを25℃で一晩、増殖させた。次の日、ファージをその培養物から採取した。
陽性クローンを以下のようにシーケンシングした。陽性ヒットクローンを一晩、培養し、プラスミドDNAを、Qiagen plasmid miniprepキットを用いて調製した。精製されたプラスミドを、サンガーシーケンシングのために、GenewizおよびELIM Biopharmaceuticalsへ提出した。VH配列は、シーケンシングプライマー(ACGCCTGCGAAGTCACCCAT(配列番号1497))または(AGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCAC(配列番号1498))を用いて得られた。VL配列は、シーケンシングプライマー(AGCGGATAACAATTTCACACAGGA(配列番号1499))または(CGGATAACAATTTCACACAG(配列番号1500))を用いて得られた。
図3A、図3B、図4A、および図4B、ならびに表2A、表2B、表3A、および表3Bは、第2ラウンドのパニング後に選択されたFabのVHおよびVL配列を示す。
図5および図6、ならびに表2Cおよび3Cは、第3ラウンドのパニング後に選択されたFabのVHおよびVL配列を示す。
表4A、表4B、表5A、および表5Bは、類似したパニングプロトコール後の追加のクローンを示す。
さらなるpHに基づいたファージパニングを実行した。
実施例3
pH 6.5におけるCD25結合についてのファージパニング
より低いpH範囲においてCD25を結合するFab候補について選択するために、例えば低酸素の酸性腫瘍微小環境において、結合することができる結合剤について選択するために、さらなるファージパニングを実行した。
標準ファージディスプレイプロトコール(Barbas et al., 2001)を用いて、4つのマウスHuCD25免疫化ファージライブラリ(7807、7808、7809、7810)を、TG1においてエレクトロポレーションにより形質転換し、ファージをCM13の添加により増殖させた。ファージを分泌するTG1培養物を、氷上での1時間のインキュベーション後、PEG/NaClでPEG沈殿させた。
ファージライブラリ(7807、7808、7809、7810)を、標準プロトコールを用いる特定のpH選択に用いた。生理的pHにおいて高親和性で結合する抗体を除去するために、まず、PBST pH7.4中10ug/ml完全長CD25(400nM)でコーティングされたELISAプレート上での1時間の吸収によるpH7.4における3×1011個のpfuファージ(3×10個の1000倍表示)の対抗選択により、サブトラクティブパニングを実行した。生じたファージ上清を収集し、pHを、PBSTを用いてpH6.5に調整した。次のファージパニング選択を、pH6.5において実行した。
パニング選択物を、1時間のインキュベーション後、CD25抗原を含まない25マイクロリットルのストレプトアビジンダイナビーズを用いて、予め清浄化した。その後、ファージを、新しい、予めブロッキングされたEppendorf LoBindチューブへ加えた。ビオチン化完全長CD25抗原を、100nM濃度において1時間、加えた。その後、試料を、25マイクロリットルのストレプトアビジンビーズと、室温で1時間、インキュベートした。試料をペレット化し、PBSTと共に磁石/磁気ビーズを用いて、7~9回、洗浄した。残留ファージを除去するために、チューブを2回、交換した。
ファージを溶出するために、800マイクロリットルのグリシン、pH2.2をビーズに加え、10分間だけ、インキュベートした。その後、それらを、高いpHのTris 9.0で中和した。溶出されたファージを、新鮮に増殖した(OD600 約0.5)1ml TG1に加え、20~30分間、インキュベートした。分画の対数希釈系列(Fractional log dilution series)をプレート上にプレーティングし、その残りを、25ml 2×YT(2×酵母トリプトンブロス)へ移した。これらの工程を、さらに2回、合計3パニングラウンド、繰り返し、その後、ペリプラスム抽出物のファージELISAおよびOctetスクリーニングを行った。
シーケンシング
陽性ヒットクローンを、一晩、培養し、プラスミドDNAを、Qiagen plasmid miniprepキットを用いて調製した。精製されたプラスミドを、サンガーシーケンシングのために、GenewizおよびELIM Biopharmaceuticalsへ提出した。VH配列は、シーケンシングプライマー(ACGCCTGCGAAGTCACCCAT(配列番号1497))または(AGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCAC(配列番号1498))を用いて得られた。VL配列は、シーケンシングプライマー(AGCGGATAACAATTTCACACAGGA(配列番号1499))または(CGGATAACAATTTCACACAG(配列番号1500))を用いて得られた。VHおよびVL V-D-J配置、核酸アライメント、およびアミノ酸アライメントを、IMGT High V-Questにより同定した。
選択されたFabクローンD5、D11、D16、D17、D34、およびD36についての配列は、表1A~1Lに提示されている。
実施例4
ファージELISAプロトコールおよびバイオセンサー/Octetスクリーニング
ELISA/抽出物調製
CD25のFabファージとの結合を評価するためのファージELISA、およびFab Octetスクリーニングのためのペリプラスム抽出物調製を、本質的には記載されているように行い、改変を付記した(Schwimmer et al., 2013)。
CD25抗原を、PBS、pH7.4中に希釈した。コーティングされ得る96ウェルプレートの各ウェルについて1ugのCD25を含有する50マイクロリットルの抗原溶液を作製した。50マイクロリットルの抗原溶液をELISAプレートウェルに加え、4℃で一晩、インキュベートした。インキュベーション後、ウェルをPBSで2回、洗浄し、ウェルを、200マイクロリットルの1×PBST 2.0%BSAを加えることによりブロッキングし、25℃で2時間、インキュベートした。ファージを、1×PBST 1.0%BSA、pH6.5中、2倍希釈した。50マイクロリットルを加え、室温で5分間、インキュベートした。ブロッキング溶液を、ウェルから振るい落とし、50ulの希釈ファージ調製物を各ウェルに加え、室温で1時間、インキュベートした。ELISAプレートウェルを、200マイクロリットルのPBST pH6.5で3~5回、洗浄した。HRPコンジュゲート型抗M13抗体(Abcam, ab50370)を、1×PBST 1.0% BSA pH6.5で1:5000希釈した。希釈された二次抗体コンジュゲートの50マイクロリットルを、各ウェルに加え、室温で1時間、インキュベートした。ELISAプレートウェルを、200マイクロリットルのPBST pH6.5で3~5回、洗浄した。ECL Lumo基質(例えば、Supersignal ELISA Pico化学発光基質)を、記載されているように、1:1混合物に調製した。50マイクロリットルの基質溶液を各ウェルに加え、読み取り前に、室温で50~60分間、インキュベートした。
0.1mlの一晩培養物(96ウェルプレート中の1ml培養物または14ml falconチューブ中の4ml培養物)に関して、コロニーを0.03~4ml 2×YT 0.2%グルコース中に接種した。それらを、OD600 約0.5~1.0まで37℃で1.5~2時間、250~700rpmにおいてインキュベートした。培養物を、50~400ul IPTG 0.025~0.1Mで誘導した。場合によっては、250rpmで振盪しながら、温度を30℃へ下げた。その後、それらを一晩、インキュベートした。次の日、培養物を、3400rcfで10~15分間、ペレット化することにより採取した。上清を捨てた。
培養物を、1×Haltプロテアーゼ阻害剤を含む50~75ul PPBバッファー(30mM Tris-HCl、pH8.0、1mM EDTA、20%スクロース)で再懸濁し、ロッキングプラットフォーム上において、室温で15分間、または4℃で10分間、インキュベートした。培養物を、1×Haltプロテアーゼ阻害剤を含む150~225ulの冷たいddH20で再懸濁し、ロッキングプラットフォーム上において、室温で1時間、または4℃で1~2時間、インキュベートした。溶解物懸濁液を、15000rcf、4℃で10~15分間、回転させた。上清を収集し、希釈した。
Fab発現および精製プロトコール
プレート中0.03~0.5ml 一晩培養物または50mL培養物に関して、単一の大腸菌コロニーを、50 2×YT 0.2%グルコース中に接種し、増殖した。培養物を、250~700rpm、37℃で1.5時間、インキュベートした。培養物を、50ulの25mM~1M IPTGで誘導した。温度を30℃へ、rpmを150へ下げた。インキュベーションを一晩、行った。50ml培養物またはプレートを、3400rcfで15分間、ペレット化することにより採取した。上清を捨てた。50mL培養物からの細胞ペレットを、-80℃フリーザーに1時間、置き、一方、プレート中で増殖した培養物に、EDTAフリーの1×Haltプロテアーゼ阻害剤(Thermo Fisher Scientific)と共に75uLのPPBを加え、ボルテックスした。プレートを、1000rpm、4℃で10分間、振盪した。EDTAフリーの1×Haltプロテアーゼ阻害剤(Thermo Fisher Scientific)と共に225uLの容量の冷水を各ウェルに加えた。試料を混合し、最大速度、すなわち、1000rpmで、4℃、1~2時間、振盪した。プレートを3500rpm、4℃で10分間、回転させた。上清(PPE)を、新しいプレートへ移し、-20℃で保存した。50ml培養物からの細胞ペレットを、フリーザーから取り出し、5ml PBS、10mMイミダゾールを、2.5mg/ml リゾチームおよびEDTAフリーの1×Haltプロテアーゼ阻害剤(Thermo Fisher Scientific)と共に加えた。ペレットが完全に解凍/混合したらすぐに、これらを室温で30分間、インキュベートした。溶解物を、3400rcfで15分間、遠心分離した。上清を取り出し、ペレットを捨てた。500ul Ni-NTA樹脂を加え(予洗およびペレット化)、またはNi-NTAスピンカラムをFab精製に用いた。清浄化された溶解物を30分間~1時間、インキュベートした。これを1500rcfで回転させた。これらを、1ml PBS、10mMイミダゾールで5回、洗浄した。各回転後、バッファーを捨てた。1ml PBS、200mMイミダゾールを加え、混合し、30分間、インキュベートし、1500rcfで15分間、回転させた。溶出されたタンパク質を、タンパク質濃度を決定した後、4℃または20℃で保存した。Zebaカラムを、脱塩/バッファー交換に用いた。
FabのOctet/バイオセンサースクリーニング
未加工の上清におけるOctet Koff速度定数スクリーニングについて、50ulの溶解物を、384ウェルPall ForteBio Octetプレートに用いた。データを、Octet RED 384(MD ForteBio)において収集した。簡単に述べれば、ヒトCD25を、AR2Gチップに連結した(1ug/ml)。データ収集について、ベースラインを、pH6.5におけるPBST 1%BSAバッファー中、60秒間、評価した。その後、pH6.5に調整された50ul 溶解物へチップを移動させ、会合を、300秒間、測定した。最後に、チップを、pH6.5におけるPBST 1%BSAバッファーへ移動させた。その後、チップを、200mM Tris-グリシン、pH2.5で再生し、PBST、1% BSA、pH6.5で中和した。データ分析に関して、参照サブトラクションについて、二重参照(チップ上のCD25なし、およびブランク参照ウェル)を、Octet HT 11.0ソフトウェアにおいて実施した。
選択されたFabが、IL-2のCD25との結合を遮断するかどうかを決定するために、バイオセンサーアッセイを実行した。
ヒトIgG1抗体のOctet/バイオセンサースクリーニング
選択された40個のFabのサブセットを、ヒトIgG1(本明細書ではヒトIgG1抗体と呼ばれている)を含有するように再フォーマットし、データをこれらから収集した。再フォーマットのために選択されたFabは、表5A(重鎖)および表5B(軽鎖)に示されている。異なる再フォーマット化IgG1抗体のKoff速度定数および親和性を、ForteBio(登録商標)Octet RED384(商標)バイオレイヤー干渉法(bio-layer interferometry)装置において評価した。精製された抗体を、アミン反応性バイオセンサー(Fortebio(登録商標)AR2G)上に共有結合性に固定化し、過剰な反応性エステルをエタノールアミンでブロッキングした。その後、ベースラインとして、センサーをランニングバッファー中へ漬け、300nM完全長CD25を含有するウェルへ移し、その後、ランニングバッファー中へ戻した。CD25の会合およびその後の解離を、二連で記録した。ランニングバッファーのみの会合(センサードリフトについて照合するために)、およびヒトND血清由来の固定化IgGを有する追加のセンサー(非特異的IgG結合について照合するために)を、対照として実行した。観察された結合速度(on rate)および解離速度を、1:1結合フィットモデルを用いてフィッティングし、平衡結合定数(KD)を計算した。
再フォーマット化ヒトIgG1抗体のエピトープビニング(epitope binning)を、古典的サンドイッチ形式で実施される交差競合アッセイを用いて行い、そのアッセイは、ベースラインを収集し、試料抗体をバイオセンサー上に固定化し、抗原を捕獲し、その後、競合分析物とインキュベートすることを含む。競合分析物は、それの結合エピトープが、固定化された抗体のそれと重複しない場合のみ、捕獲されたCD25を結合することができる。精製された抗体は、アミン反応性バイオセンサー(Fortebio(登録商標)AR2G)上に共有結合性に固定化され、過剰な反応性エステルをエタノールアミンでブロッキングした。センサーを、ベースラインとしてランニングバッファー中へ漬け、その後、完全長CD25へ漬けた。その後、センサーを、競合分析物(IL-2、7G7B6、バシリキシマブ、ダクリズマブ)を含有するウェル、または参照としてのランニングバッファーを含有するウェルへ移した。センサーは、必要な場合、0.1Mグリシン pH2.0、10秒間の3サイクルに、その後、ランニングバッファーに10秒間、それらを曝すことにより、再生された。
結果
図7は、分子レベルでの交差遮断アッセイを用いる、非IL-2遮断剤およびIL-2遮断剤(Fab)の同定を描く。CD25をバイオセンサーチップ上にコーティングし、示されたFabと接触させた。その後、IL2を加えた。シグナル伝達の増加は、そのFabとIL2が、CD25上に異なる結合部位を有することを示す。
表8は、試験されたFabクローンが、生理的pHおよび酸性pHにおいて類似した結合動態を示したことを示している。
Figure 0007619941000105

図8は、ファージが、IL-2非遮断抗体、7G7B6と競合する、本開示のFabを発現することを描く。バイオセンサーチップを、抗体7G7B6でコーティングし、最初にCD25と、その後、示されたFab、または既知のIL2遮断抗体であるバシリキシマブと接触させた。7G7B6がCD25と結合している時、クローンD11、D34、およびD36は結合しない。クローンD5、D16、およびD17は結合するが、すぐに外れ、可能な交差遮断機能を示している。
図13A~13Cは、再フォーマット化ヒトIgG1抗体クローンに関するKoff速度定数および親和性についての動態解析を示す(図13A)。抗体のKD値は、4.4E-10から8.4E-09までの範囲であり、Koff値は、6.4E-05から1.9E-03までであった。いくつかの抗体は、市販の抗体7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブ(それぞれ、Kd値 2.6E-09、4.5E-10、4.7E-10、およびそれぞれ、2.3E-04、1.1E-04、1.9E-04のKoff速度定数)よりも高い親和性(図13B)およびKoff値(図13C)を有した。クローンBP003-T2P1D7、AH0580、AH05268、D36、D11、AH05259、BF003-T2P1D1、およびD34は、この解析において、7G7B6よりも良いKd値を有し、クローンD17、AH04526、AH04750、AH05285、AH05256、およびAH04527は、この解析において、ダクリズマブおよびバシリキシマブよりも良いKd値を有する(図13B)。クローンAH05256、AH04527、AH04526、AH05251、AH05285、AH05259、D17、AH04750は、この解析において、7G7B6よりも良いKoff速度定数を有する(図13C)。
図14A~14D:市販の抗ヒトCD25抗体、7G7B6、ダクリズマブ、およびバシリキシマブ、加えてIL-2と重複するエピトープとの、再フォーマット化ヒトIgG1 Fabの結合を評価するためにエピトープビニングを実行した。クローンの遮断プロファイルは以下である:(図14A)7G7B6より遮断されるが、IL-2にもダクリズマブにもバシリキシマブにも遮断されない;(図14B)IL-2、ダクリズマブ、バシリキシマブにより遮断されるが、7G7B6により遮断されない;(図14C)7G7B6およびダクリズマブにより遮断されるが、バシリキシマブにより遮断されない;(図14D)IL-2、ダクリズマブ、およびバシリキシマブにより遮断される。これらの遮断プロファイルは、抗体の異なるエピトープとの異なるアプローチ角度からの結合を示している。
機能性エピトープの追加のエピトープマッピングが、アラニン突然変異誘発により実施される。この方法は、それが、競合アッセイにより定義される構造的エピトープよりむしろ、機能性エピトープにおいて作動するため、抗体をビニングするための直交法として用いられる。様々なペアの表面アクセス可能残基が、突然変異誘発のために選択される。これらのアッセイに用いるために選択されたアラニン突然変異が全体的または局所的な安定性に影響しないことを確認するために計算モデル化が用いられる。
実施例5
結合アッセイ
ヒトIgG抗体のCD25特異的結合についての細胞結合アッセイ
細胞上のCD25との抗体結合および特異性を確証するために、3つの細胞株SUDHL-1およびSUDHL-2(ヒト大型びまん性組織球性リンパ腫細胞株、ATCC)、ならびにHEK IL-2レポーター細胞(Invivogen)を用いて、CD25結合について試験した。SUDHL-1およびHEK IL-2レポーター細胞株はCD25+であるが、SUDHL-2はCD25- 細胞である。各細胞株について、100,000個の細胞を、96ウェル丸底プレートの細胞バッファー(PBS+2%HI FBS)においてプレーティングし、遠心分離した。1~10ug/mLの抗体濃度を用いて、各抗体の結合を試験した。細胞を、100uLの抗体/ウェル中に再懸濁し、氷上で20分間、インキュベートした。インキュベーション後、細胞を、300xg、室温で5分間、遠心分離し、氷冷の細胞バッファーで再懸濁および洗浄した。その後、細胞を、AF647にコンジュゲートされた抗ヒトFc二次抗体(Biolegend)で染色し、暗闇中、氷上で20分間、インキュベートした。細胞を遠心分離し、洗浄し、DAPIを含む冷たい細胞バッファー中で洗浄および再懸濁し、フローサイトメトリー(Cytoflex、Becton Dickinson)を用いて分析した。DAPI+ 細胞を分析から除外した。平均蛍光強度を、中央値を用いて計算した(FlowJo、TreeStar)。
ヒトIgG1クローンの組換えCD25カニクイザル結合
組換えカニクイザル(cyno)CD25との結合について試験するために、マイクロタイタープレートを、50mM炭酸ナトリウム、pH9.6中1ug/ml Cyno CD25の80ulで、4℃で、一晩、コーティングした。次の日、ウェルから前記タンパク質を除去し、200ul PBS/0.1%BSA/0.05%tween20でブロッキングした。プレートを、室温で1時間、インキュベートした。ヒトIgG1再フォーマット化Fabクローン(ヒトIgG1抗体)を25nMから開始し、PBTバッファー中に3倍の段階希釈し、RTで1時間のインキュベーションのためにプレートへ加えた。その後、プレートを洗浄し、その後、1:2500希釈のHRPコンジュゲート型抗Fab抗体を加えた。プレートをPBS/tween20で5~10回、洗浄して、非特異的結合剤を除去した。TMBペルオキシダーゼ基質およびペルオキシダーゼ溶液を加え、発色させるのに必要とされる時間の間、インキュベートし、その終了時に80uLのELISA停止溶液を加えた。その後、OD測定値を、プレートリーダー(SpectraMax iD3プレートリーダー、Molecular Devices)を用いて450nMにおいて取得した。
図15A~15Bは、全ての抗体クローン(10ug/mL)の、CD25+ 細胞株、SUDHL-1細胞とHEK細胞の両方との特異的結合、およびCD25- SUDHL-2細胞株における結合なしの確証を示す。追加として、抗体の大部分が、対照の、7G7B6、ダクリズマブ、バシリキシマブと同じ様に、結合した。
図16A~16Bは、SUDHL-1 CD25+ 細胞株における、10ug/mLから開始して、5倍の段階希釈で結合したクローンの用量応答曲線を示す(図16A)。クローンの大部分は、用量依存的様式で結合し、市販の7G7B6よりも良いEC50値を有した(図16B、表9)(クローン名は、本開示の上記表に提示された名前が参照される)。表9におけるいくつかのクローンは、7G7B6よりも良いEC50値を有する。
Figure 0007619941000106
Figure 0007619941000107


図17は、組換えcyno CD25と結合したいくつかのクローンの用量応答曲線を示す。ダクリズマブおよびバシリキシマブを陽性対照として用いた。
実施例6
一次細胞を用いたpSTAT5アッセイ
高度に精製されたヒト制御性T細胞におけるFabクローンの生物活性をスクリーニングするためのpSTAT5アッセイ
IL-2/JAK3/STAT-5シグナル伝達経路は、Tregの生存および増殖に関与する。この経路は、Tregの抑制活性に必須である因子、転写因子Foxp3の発現を惹起し、かつ維持する。IL-2がIL-2Rと結合した時、JAKタンパク質は活性化される;それらは、IL-2受容体の細胞質側領域と結合しているチロシンキナーゼである。これは、特定のチロシン残基上でトランスリン酸化を惹起し、STATタンパク質が動員され、かつリン酸化されるためのドッキング部位を生じる。その後、二量体化およびリン酸化されたSTATが、核へ転位置して、特異的なDNA配列を結合し、TregにおけるFoxp3およびCD25などのいくつかの標的遺伝子の転写を制御する。
この実施例において、一次ヒト制御性T細胞上のCD25と結合した時の、選択されたFabの機能性を評価した。このアッセイは、pSTAT5レベルに基づいて、どれが、IL-2遮断剤、非遮断剤、および部分的遮断剤であるか、加えて、効力の決定を可能にした。アッセイに用いられる対照は、既知のIL-2遮断剤(ダクリズマブ)およびIL-2非遮断剤(7G7B6)を含む。まず、新鮮なPBMC細胞を、白血球除去システムチャンバー(leukocyte reduction system chambers)(Stanford Blood Center)から単離した。等量の細胞バッファー(PBS+2%HI FBS)を、各血液試料へ加え、50mL SepMateコニカルチューブの内部に充填されたFicoll Paque(Stem Cell Technologies)に加え、SepMateチューブを用いるPBMC単離のための標準プロトコールに従った。PBMCからヒト制御性T細胞を単離するために、EasySepヒトCD4+CD127low CD25+ 制御性T細胞単離キット(Stem Cell Technologies)および制御性ヒトCD4+CD25+ T細胞キット(Dynabeads)を用いた。それぞれの単離キットプロトコールを、細胞の磁気に基づいた単離に用いた。Treg単離を、抗ヒトCD4、CD25、CD127抗体での細胞の染色、および細胞内Foxp3染色(BD Biosciences)により確認した。pSTAT5アッセイについて、100,000個のTregを、96ウェル丸底プレート中にプレーティングし、遠心分離した。1~5ug/mLの抗体濃度を用いた。Tregを、50uLの抗体/ウェル中に再懸濁し、37℃インキュベーター内で15分間、インキュベートした。次に、IL-2についての希釈物を、細胞培地中100ng/mL濃度から開始して10倍希釈で調製した。IL-2希釈物をウェルに50uL/ウェルで、37℃インキュベーター内で10分間、加えた。インキュベーション後、プレートを室温、300xgで5分間、遠心分離し、100uL/ウェルの室温固定化バッファー(BD Biosciences)中、室温で15分間、再懸濁した。細胞を遠沈し、冷たい細胞バッファー(PBS+2%HI FBS)中に再懸濁した。その後、細胞を、100uL/ウェルの氷冷透過処理バッファー(BD Biosciences)中に再懸濁し、氷上で15分間、インキュベートした。細胞を、細胞バッファーで洗浄し、フローサイトメトリー(Cytoflex、Becton Dickinson)を用いる分析のために50uLの調製pSTAT5抗体中に再懸濁した。
HEK IL-2レポーター細胞を用いた、抗体クローンの生物活性をスクリーニングするためのpSTAT5アッセイ
この実施例において、クローンを、HEK IL-2レポーター細胞株(Invivogen)を用いて試験した。この細胞株は、IL-2の結合によるJAK-STAT経路の活性化をモニターするためにInvivogenにより作製された。完全活性ヒトIL-2シグナル伝達経路を得るために、そのレポーター細胞株は、HEK293細胞にヒトIL-2Rα、IL-2Rβ、およびIL-2Rγ遺伝子、ならびにJAK3およびSTAT5遺伝子を安定的にトランスフェクションすることにより作製された。このアッセイは、pSTAT5レベルに基づいて、IL-2の存在下での抗体および競合物質の添加による、IL-2遮断剤、非遮断剤、部分的遮断剤のIL-2生理機能および特徴づけを評価するためのハイスループット方法を提供する。アッセイに用いられる対照は、既知のIL-2遮断剤(ダクリズマブおよびバシリキシマブ)およびIL-2非遮断剤(7G7B6)を含む。pSTAT5アッセイについて、100,000個の細胞を、96ウェル丸底プレート中にプレーティングし、遠心分離した。1~5ug/mLの抗体濃度を用いた。HEK細胞を、50uLの抗体/ウェル中に再懸濁し、37℃インキュベーター内で15分間、インキュベートした。次に、IL-2についての希釈物を、細胞培地中10ng/mL濃度から開始して10倍希釈で調製した。IL-2希釈物をウェルに50uL/ウェルで、37℃インキュベーター内で10分間、加えた。インキュベーション後、プレートを室温、300xgで5分間、遠心分離し、100uL/ウェルの室温固定化バッファー(BD Biosciences)中、室温で15分間、再懸濁した。細胞を遠沈し、冷たい細胞バッファー(PBS+2%HI FBS)中に再懸濁した。その後、細胞を、100uL/ウェルの氷冷透過処理バッファー(BD Biosciences)中に再懸濁し、氷上で15分間、インキュベートした。細胞を、細胞バッファーで洗浄し、フローサイトメトリー(Cytoflex、Becton Dickinson)を用いる分析のために50uLの調製pSTAT5抗体中に再懸濁した。パーセントpSTAT5+ 細胞を、親集団に基づいて定量化し、値を、10ng/mL濃度におけるIL-2に対して標準化した。
結果
図9は、pSTAT5シグナルがIL-2用量依存的であり、ダクリズマブ(IL-2遮断剤)で阻害されることを示している。pSTAT5レベルは、IL-2の用量と相関し、高いIL-2用量がpSTAT5レベルを増加させ、一方、より低いレベルのIL-2はより低いレベルのpSTAT5を生じた。加えて、抗ヒトIL-2抗体のIL-2遮断剤である、ダクリズマブが2ug/mLの一定濃度で加えられた時、それは、JAK-STAT5シグナル伝達経路を阻害して、より低いpSTAT5レベルを生じた。
図10および図11は、pSTAT5アッセイにおけるD5 Fabの試験を示す。図10におけるデータは、pSTAT5アッセイが、ダクリズマブおよびIL-2のみと比較した、1ug/mL、2ug/mL、および5ug/mLにおけるD5 Fab活性の差を区別できたことを示している。D5の異なる濃度において、pSTAT5のレベルにおける用量依存的減少があり、D5が、1ug/mLの最低濃度においてさえも、IL-2のIL-2Rとの結合を部分的に遮断していることを示唆した。データは、生MFIレベル(平均蛍光強度)により表され、かつIL-2の最高用量(100ng/mL)により生じた最大pSTAT5レベルに対してpSTAT5レベルを比較することにより、表されている(図11)。
図12は、1つのドナーからの予備的Fabスクリーニングデータを示す。1つのドナーからのこのアッセイは、対照(IL-2のみ、ダクリズマブ(Dac、IL-2遮断剤)、および7G7B6(非IL-2遮断剤))と比較した、1ug/mL、2ug/mL、および5ug/mLにおけるいくつかのFabクローン間のpSTAT5レベルの差を示す。7G7B6よりも良いIL-2非遮断剤であるように思われるクローンもあれば、ダクリズマブよりも良いIL-2遮断剤であるクローンもある。完全なIL-2非遮断剤は、IL-2と類似したpSTAT5レベルを有することが予想され、かつ濃度依存的であることは予想されない。データは、生MFIレベル(平均蛍光強度)により表され、かつ7G7B6により生じた最大pSTAT5レベルに対してpSTAT5レベルを比較することにより、表されている。加えて、データは、FabクローンのIC50効力値の差を観察するために用いることができる(表10)。
Figure 0007619941000108

次のアッセイは、ダクリズマブおよび7G7B6のFab型、加えてその同じFabクローンの複数のドナーへの試験を含む。さらに、pSTAT5アッセイが、生理的pHにおけるクローン活性に対して腫瘍微小環境のpHも利用するために、より低いpHレベル(pH6.4~6.7)において実施される。
図18A~18Bは、10ng/mlから開始して10倍の段階希釈のIL-2濃度で、HEK IL-2レポーター細胞株においてpSTAT5を測定することによる、再フォーマット化ヒトIgG1クローン(5ug/mL)のIL-2遮断剤、非遮断剤、および部分的遮断剤としての機能特徴づけを示す。0.1ng/mL(生理的レベルにより近い)のIL-2濃度において、AH04503、AH04750などのクローンは、ダクリズマブまたはバシリキシマブのどちらよりも良いIL-2遮断剤であり、一方、クローンAH05280およびAH02571は、5ug/mLにおける7G7B6よりも良いIL-2非遮断剤であり得る(A)。クローンAH05251、AH05257は、IL-2部分的遮断剤の例である(図18A)。IL-2用量応答曲線は、IL-2非遮断剤であるクローンを、IL-2遮断剤であるクローンから明らかに描き出し、それぞれ、7G7B6と共に左へシフトする曲線、ならびにダクリズマブおよびバシリキシマブと共に右へシフトする曲線を有する(図18B)。
継続するpSTAT5研究は、一次Tregおよび複数のドナーを用いてこれらの抗体クローンを試験するために行われ得る。
実施例7
抗体依存性細胞傷害性(ADCC)
機能細胞殺害アッセイADCCおよびADCP
Treg枯渇についての機構の一つは、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)を通してである。これは、標的細胞上の特定の抗原と結合した抗体への免疫/エフェクター細胞の認識によりトリガーされる、細胞死を通常、引き起こす、細胞媒介性免疫防御機構である。ADCCを誘発するために、ヒトFcサブクラスを有する抗体、IgG1が、以下の3つのFc受容体と結合する能力を有するそれのエフェクター機能について、一般的に選択される:NK細胞、単球、および顆粒球などの免疫細胞上に発現している、FcγRI(CD64)、FCγRII(CD32)、およびFcγRIIIA(CD16)。NK細胞は主に、FcγRIIIAを発現し、ADCCにおける主要なエフェクター細胞であると考えられる。
この実施例において、ADCCを、乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)細胞傷害性プレートに基づいた比色アッセイ(Thermo Fisher)を用いて定量化した。このアッセイにおいて、LDHの放出は、細胞殺害の量と比例する。乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)は、全ての細胞に存在する細胞質内酵素であり、原形質膜が損傷した時に放出される。培地中の細胞外LDHは、LDHが乳酸塩のピルビン酸塩への変換を、NAD+NADHへの還元を介して触媒する、共役酵素反応により定量化される。ジアホラーゼの添加により、NADHは、テトラゾリウム塩(INT)へ還元されて、490nmにおいて測定することができるホルマザン生成物を形成する。アッセイについての対照は、ヒトRajiリンパ腫細胞株におけるリツキシマブ(抗CD20抗体)およびSUDHL-1細胞におけるダクリズマブの使用を含む(どちらの抗体もADCCを誘導することが知られている)。追加の対照には以下が挙げられる:陰性対照として、非グリコシル化ヒトIgG1、および陽性対照として、非フコシル化ヒトIgG1。第1の最初のスクリーニングとして、再フォーマット化クローンを、ADCCアッセイにおいて、1つの濃度(10ug/mL)で、単一のドナー由来のPBMCを用いて、試験した。ヒトPBMC(ASTARTE Biologics)を、前日に解凍し、X-VIVO 15または20培地(Lonza)を用いて、5%CO2インキュベーター内、37℃で一晩、培養した。実験の当日、PBMCおよびSUDHL-1標的細胞を、カウントし、X-VIVO 15(Lonza、フェノールレッド)無血清培地中に再懸濁した。抗体希釈物を、10ug/mlから開始して5倍の段階希釈により調製した。その後、標的細胞を、96ウェル白色平底不透明プレート(CORNING 参照#3917)において96ウェル50μL/ウェルでプレーティングし、10μL/ウェルの抗体希釈物を、標的細胞へ加え、37℃、5%CO2インキュベーター内で30分間、インキュベートした。インキュベーション後、PBMCを標的細胞へ加えた(50μL/ウェル)。自発性および最大LDH放出計算のための対照標的細胞について、50μL/ウェルのアッセイ培地(X-VIVO15、フェノールレッドなし)を加えた。共インキュベーション(ADCC誘導)を、37℃、5%CO2インキュベーター内で4時間、プレートをインキュベートすることにより行い、その共インキュベーションが完了する45分前に、Max LDH放出を計算するために、10%Triton X100溶液(PBS中)をウェルに加えた(10μL/ウェル、11×希釈比)。インキュベーション後、50μL/ウェルの反応基質を、96ウェルプレート(透明平底)にプレーティングし、その後、アッセイプレートの上清の50μL/ウェルを反応基質へ移した。プレートを、暗闇中、RTで30分間、発色させた。インキュベーション後、50μL/ウェルの停止溶液を加え、490nmおよび680nmにおける吸光度を、プレートリーダー(SpectraMax iD3プレートリーダー、Molecular Devices)を用いることにより測定した。
追加として、機能抗体依存性細胞食作用(ADCP)アッセイもまた、マクロファージの、抗体結合によるTreg細胞を貪食する活性を試験するために実施する。これは、Treg枯渇についての追加の作用機構であり得る。マクロファージ上のFc受容体FCγRIIa(CD32b)は、ADCPについての優位な誘導因子(dominant inducer)であると考えられる。このアッセイにおいて、一次Tregが、エフェクター細胞としてのヒト単球由来マクロファージと共に標的細胞として用いられる。CD14マイクロビーズ(Miltenyi Biotec)を用いる単球単離のため、ならびに制御性ヒトCD4+CD25+ T細胞キット(Dynabeads)およびヒトTreg細胞分化キット(R&D Systems)を用いるTregのために、PBMCが白血球除去システムチャンバー(Stanford Blood Center)から単離される。単球は、培地中のヒト血清またはM-CSFと共に5~7日間、培養される。5~7日目において、マクロファージは、10:1のエフェクター:標的比で、事前標識されたTreg(固定可能な生死判別色素で標識される(Invitrogen))と共に、抗CD25抗体および対照を添加して、2~4時間、共培養され、固定化バッファー(BD Bioscienes)で固定化される。標識Tregからマクロファージを同定するために、マクロファージはCD14に関して染色され、フローサイトメトリーを用いて、CD14+として定義される食作用性集団およびTreg標識+ 集団について分析される。抗CD25抗体は、ADCPもまた誘導することが予想される。
結果
図19A~19Bは、全ての再フォーマット化クローンの機能性ADCC活性を示す。第1のスクリーニングにおいて、クローンはCD25+ 細胞と結合し、ADCCが誘導され、細胞殺害は、18.2%から26.7%までの溶解の範囲であった(Raji細胞殺害は、参照として用いられている;図19A)。これらの所見を検証するために、選択クローンについての用量応答曲線に関して、アッセイを繰り返した。結果は、ベースライン溶解に対して2倍から6倍までのADCC活性の範囲を示し、%バックグラウンド溶解に対する倍数変化により測定された場合、クローンAH04511、AH05274、D11、D34、D36が、最も強力なADCCを誘発し、かつ7G7B6抗体より高い効力を有した。
次の研究は、機能性ADCC殺害アッセイのためにエフェクターとしてPBMCおよびNK細胞の追加のドナーを含む。
実施例8
CD25抗体の機能特徴づけ
インビトロでの特徴づけ
次のインビトロでの特徴づけは、Treg細胞の非存在下および存在下における、CD25抗体のTエフェクター細胞応答への影響を評価するためのT細胞活性化およびTreg抑制研究を含む。活性化についての読み取りは、細胞内グランザイムB、増殖、およびサイトカイン放出(例えば、IL-2、IFNγ、TNF-α)を含む。具体的には、健康なドナーおよび特定の抗原応答(例えば、ヒトサイトメガロウイルスまたはインフルエンザ抗原)を有するドナー由来のヒト一次通常T細胞(T conv細胞)を、細胞増殖色素(例えば、ThermoFisher)で標識し、様々な濃度のCD25抗体および対照抗体(1~10ug/mL)で処理し、その後、CD3/CD28ビーズを用いて活性化し、Tregと共にまたはTregなしで、37℃、5%CO2で48~72時間のインキュベーションとして、インキュベートする。T細胞活性化を評価するために、上清を、サイトカイン分析のために収集し、固定可能な生死判別色素(例えば、Thermofisher)および表面抗ヒトT細胞マーカー:CD3、CD4、CD8、CD45RA、CD25で細胞を染色し、その後、細胞内グランザイムBおよびFoxp3の染色のために固定化および透過処理を行う。細胞を、グランザイムB陽性細胞および増殖性細胞についてフローサイトメトリーを用いて分析する。
インビボでの特徴づけ
マウス異種移植腫瘍モデルを用いた、CD25抗体のインビボ活性。これらの実験は、ADCCおよび/またはADCPによるCD25+ 腫瘍枯渇に基づいて、CD25抗体の違いを区別するのに役立つ。候補抗体を、マウスIgG2aアイソタイプ抗体として産生し、免疫不全RAG-/- ノックアウトマウス(機能性NK細胞およびAPC細胞を有するが、成熟Bリンパ球もTリンパ球ももたない)において用いる。動物に、CD25+ ヒト細胞株(例えば、SUDHL-1、CD25+ 未分化大細胞リンパ腫)を皮下に移植する。抗体間の違いを認識するために、様々なサイズの腫瘍(触知可能、100~500mm3)が用いられ得る。動物を、異なる用量のCD25抗体(例えば、1~10mg/kg、週3回または1日1回)で処置し、体重およびTGIの変化についてモニターする。
ヒト化マウスでのマウス異種移植腫瘍モデルにおける薬物有効性およびMOA研究
Treg枯渇、およびTエフェクター細胞活性の増加と共に腫瘍内Teff/Treg比の増加による腫瘍成長阻害についてより効果的な抗体を、有効性および作用機構を確立するために、様々なヒト腫瘍モデル(例えば、肝臓癌、乳癌、黒色腫、胃癌、NSCLC、および結腸癌)において試験する。いくつかの研究は、トリプルネガティブ乳癌細胞株MDA-MB-231、胃細胞株、黒色腫細胞株A375、および肝臓癌細胞株Huh-7、加えて、十分特徴づけられており、かつ浸潤したTregと腫瘍成長の間の相関が示されており、ならびに/またはヒトPBMCおよび/もしくはCD34+ 細胞を移植されたヒト化マウスにおいてPD-1抗体組合せで処置されているヒトPDXモデルを用いることを含み得る。これらのモデルにおいて、腫瘍を皮下に移植し、腫瘍が触知可能から100~500mm3までのサイズ範囲に達したならば、様々な用量のCD25抗体および投薬スケジュール(例えば、1~10mg/kg、週3回または1日1回)で処置する。動物の健康スコアリング、体重、腫瘍成長、加えて、血液および腫瘍の免疫表現型検査を、腫瘍および免疫細胞組成および腫瘍浸潤細胞、ならびにサイトカイン分泌を特徴づけるために、フローサイトメトリー、Meso Scale Discovery多重プレート、および組織診断を用いて、実施する。
ヒト化マウスでのマウス異種移植腫瘍モデルにおける併用研究。いったんリード候補および適応症が、有効性およびMOA研究に基づいて確立されたならば、本発明者らは、免疫活性化のために免疫原性および他の経路の活性化を増加させるための幅広い種類の作用物質(例えば、化学療法、チェックポイント阻害剤、TLRアゴニスト、ワクチン)を用いる併用研究を実施する。併用実験は、有効性およびMOA研究に用いられた類似した腫瘍モデルにおいて行われる。

本明細書に引用された全ての特許、特許出願、刊行物、文書、Webリンク、および品物は、全体として参照により本明細書に組み入れられている。

Claims (9)

  1. ヒトCD25と結合するモノクローナルCD25抗体であって、以下の表に提示された(1)~(278)のいずれか1つの組合せである、CDRH1、CDRH2、およびCDRH3のアミノ酸配列ならびにCDRL1、CDRL2、およびCDRL3のアミノ酸配列を含む、前記モノクローナルCD25抗体。












  2. 配列番号2、17、32、38、44、60~107、431~460、868、869、1222、1230、1231、1232、1233、1234、1235、1236、1238、1237、1299、1316、1318、1327、1328、1329、1330、1331、1332、1333、1334、および1335に提示された重鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも90%配列同一性を含むアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含み、かつ、配列番号10、25、34、40、50、59、701、703、705、707、709、712、715、717、722、724、725、727、728、735、736、737、739、742、745、747、749、750、751、752、754、755、756、759、762、765、767、769、775、776、777、778、780、781、783、785、787、789、791、794、795、797、799、801、803、804、806、809、810、811、813、815、818、822、823、824、825、827、829、835、838、841、842、844、846、848、849、851、853、857、859、860、861、864、875、876、877、878、879、880、882、884、886、888、892、895、897、901、902、903、905、906、907、908、912、914、917、919、920、921、および922に提示された軽鎖可変領域のいずれか1つのアミノ酸配列、そのヒト化バージョン、またはそれと少なくとも90%配列同一性を含むアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む;
    請求項1に記載のモノクローナルCD25抗体。
  3. ヒト抗体である;
    ヒト化抗体である;
    キメラ抗体である;
    マウス可変ドメインおよびヒト定常ドメインを含む;
    抗体断片である;または
    カニクイザルCD25も結合する;
    請求項1または2に記載のモノクローナルCD25抗体。
  4. 請求項1~のいずれか一項に記載のモノクローナルCD25抗体を含む、医薬組成物。
  5. 請求項1~のいずれか一項に記載のモノクローナルCD25抗体をコードする核酸。
  6. 請求項に記載の核酸を含むベクター。
  7. 請求項1~のいずれか一項に記載のモノクローナルCD25抗体を発現するファージ。
  8. 癌、自己免疫疾患、自己免疫障害を処置するため、または制御性T細胞を枯渇させるための、請求項1~のいずれか一項に記載のモノクローナルCD25抗体を含む組成物。
  9. 請求項1~のいずれか一項に記載のモノクローナルCD25抗体または請求項に記載の医薬組成物を含むキット。

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