JP7642002B2 - データ生成装置、データ生成方法及びプログラム - Google Patents
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Description
図1は、病理画像に異常が存在するか否かを判定する画像処理システム1の一例を示す図である。データ生成装置10は、データ生成装置10に入力された病理画像を用いて、診断装置20が備える学習モデルを学習させるための学習用データ(教師データ)を生成する装置である。診断装置20は、データ生成装置10で生成された学習用データを用いて学習した学習済モデルを用いて、病理画像に異常が存在するか否かの判定を行う装置である。データ生成装置10及び診断装置20は、無線又は有線の通信ネットワークNを介してお互いに通信することができる。
図2は、データ生成装置10のハードウェア構成例を示す図である。データ生成装置10は、CPU(Central Processing Unit)、GPU(Graphical processing unit)等のプロセッサ11、メモリ、HDD(Hard Disk Drive)及び/又はSSD(Solid State Drive)等の記憶装置12、有線又は無線通信を行う通信IF(Interface)13、入力操作を受け付ける入力デバイス14、及び情報の出力を行う出力デバイス15を有する。入力デバイス14は、例えば、キーボード、タッチパネル、マウス及び/又はマイク等である。出力デバイス15は、例えば、ディスプレイ、タッチパネル及び/又はスピーカ等である。
図3は、データ生成装置10の機能ブロック構成例を示す図である。データ生成装置10は、記憶部100と、表示制御部101と、入力部102と、生成部103と、画像処理部104とを含む。記憶部100は、データ生成装置10が備える記憶装置12を用いて実現することができる。また、表示制御部101と、入力部102と、生成部103と、画像処理部104とは、データ生成装置10のプロセッサ11が、記憶装置12に記憶されたプログラムを実行することにより実現することができる。また、当該プログラムは、記憶媒体に格納することができる。当該プログラムを格納した記憶媒体は、コンピュータ読み取り可能な非一時的な記憶媒体(Non-transitory computer readable medium)であってもよい。非一時的な記憶媒体は特に限定されないが、例えば、USBメモリ又はCD-ROM等の記憶媒体であってもよい。
図4は、データ生成装置10が行う処理手順の一例を示すフローチャートである。まず、入力部102は、ユーザから、学習用データの生成に用いる病理画像の入力を受け付け、入力された病理画像を病理画像DBに格納する(S10)。病理画像は、異常かどうかの判断を付けやすくするため、染色されることが通常行われる。染色方法としては、ヘマトキシリン・エオジン染色、PAS染色、メイ・ギムザ染色、アルシアンブルー染色、パパニコロウ染色、アザン染色、エラスチカ・ワンギーソン染色、エラスチカ・マッソン染色などが例として挙げられる。なお、ユーザは、複数の病理画像を入力する場合、病理の種別が同一である病理画像を入力する。以下の説明では、ユーザにより複数の病理画像が入力されたものとする。
以上説明した実施形態によれば、データ生成装置10は、画像を複数の部分画像に分割して表示し、部分画像ごとに、ユーザからラベルの入力を受け付けるようにした。これにより、画像に関する学習用データを、より簡易に生成することが可能になる。
Claims (8)
- 病理画像と、前記病理画像を複数に分割することで生成される複数の部分病理画像の境界線とを重ねて画面に表示させる表示制御部と、
前記複数の部分病理画像の各々に付与される、病理に関するラベルの入力を受け付ける入力部と、
前記複数の部分病理画像の各々と、前記複数の部分病理画像の各々に付与された病理に関するラベルとを対応づけることで、学習モデルを学習させるための学習用データを生成する生成部と、
を有し、
前記入力部は、前記複数の部分病理画像の各々を一意に識別する部分病理画像IDと、前記複数の部分病理画像の各々に付与された病理に関するラベルとを対応づけてラベルデータベースに格納し、
前記生成部は、前記ラベルデータベースから、前記部分病理画像IDと病理に関するラベルとを取得し、病理画像データベースに格納されている病理画像から、部分画像IDに対応する部分病理画像の画像データを抽出し、抽出した部分病理画像の画像データと、部分病理画像IDに対応する病理に関するラベルとを組み合わせることで、学習用データを生成する、
データ生成装置。 - 前記病理画像は、複数の病理画像を含み、
前記入力部は、前記複数の病理画像に対応する画像種別に関する情報の入力を受け付け、
前記入力部に入力された前記画像種別に応じて定められた変更方法に従って、前記複数の病理画像の色に関する画素値を変更する変更部、を更に有する、
請求項1に記載のデータ生成装置。 - 前記変更方法には、前記複数の病理画像における各画素のRGB値を標準化した値に変更する方法、及び、前記複数の病理画像における各画素のRGB値をランダムに変更する方法が含まれる、
請求項2に記載のデータ生成装置。 - 前記表示制御部は、前記複数の部分病理画像の各々に付与する病理に関するラベルの目標値である病理に関するラベルごとの比率を示す情報と、前記複数の部分病理画像に対して付与された病理に関するラベルごとの比率の実績値を示す情報との両方を表示させる、
請求項1~3のいずれか一項に記載のデータ生成装置。 - 前記入力部は、前記複数の部分病理画像のうち、所定条件を満たす部分病理画像については、病理に関するラベルの入力を受け付けないようにし、
前記生成部は、前記複数の部分病理画像のうち、病理に関するラベルの入力が受け付けられなかった部分病理画像については、前記学習用データに含めないようにする、
請求項1~4のいずれか一項に記載のデータ生成装置。 - 前記複数の部分病理画像は、前記病理画像内における基準となる点から所定距離ずらした点を基準に、前記病理画像を右左方向及び上下方向に所定間隔で分割することで生成される病理画像であり、
前記入力部は、前記所定距離の指定を受け付ける、
請求項1~5のいずれか一項に記載のデータ生成装置。 - データ生成装置が実行するデータ生成方法であって、
病理画像と、前記病理画像を複数に分割することで生成される複数の部分病理画像の境界線とを重ねて画面に表示させるステップと、
前記複数の部分病理画像の各々に付与される、病理に関するラベルの入力を受け付けるステップと、
前記複数の部分病理画像の各々と、前記複数の部分病理画像の各々に付与された病理に関するラベルとを対応づけることで、学習モデルを学習させるための学習用データを生成するステップと、
を含み、
前記入力を受け付けるステップは、前記複数の部分病理画像の各々を一意に識別する部分病理画像IDと、前記複数の部分病理画像の各々に付与された病理に関するラベルとを対応づけてラベルデータベースに格納し、
前記生成するステップは、前記ラベルデータベースから、前記部分病理画像IDと病理に関するラベルとを取得し、病理画像データベースに格納されている病理画像から、部分画像IDに対応する部分病理画像の画像データを抽出し、抽出した部分病理画像の画像データと、部分病理画像IDに対応する病理に関するラベルとを組み合わせることで、学習用データを生成する、
データ生成方法。 - コンピュータに、
病理画像と、前記病理画像を複数に分割することで生成される複数の部分病理画像の境界線とを重ねて画面に表示させるステップと、
前記複数の部分病理画像の各々に付与される、病理に関するラベルの入力を受け付けるステップと、
前記複数の部分病理画像の各々と、前記複数の部分病理画像の各々に付与された病理に関するラベルとを対応づけることで、学習モデルを学習させるための学習用データを生成するステップと、
を実行させ、
前記入力を受け付けるステップは、前記複数の部分病理画像の各々を一意に識別する部分病理画像IDと、前記複数の部分病理画像の各々に付与された病理に関するラベルとを対応づけてラベルデータベースに格納し、
前記生成するステップは、前記ラベルデータベースから、前記部分病理画像IDと病理に関するラベルとを取得し、病理画像データベースに格納されている病理画像から、部分画像IDに対応する部分病理画像の画像データを抽出し、抽出した部分病理画像の画像データと、部分病理画像IDに対応する病理に関するラベルとを組み合わせることで、学習用データを生成する、
プログラム。
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