JP7687635B2 - Copd指標値の測定方法 - Google Patents
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Description
被検者から採取された生体試料を分析することで得られたデータに基づき、前記生体試料に含まれる複数種の代謝物のうち、慢性閉塞性肺疾患関連疾患に関連する代謝物の量をCOPD指標値として測定する方法であり、
前記COPD指標値が、24種の代謝物であるグルタル酸、αケトイソカプロン酸、ホスホグリセロール、ヒドロキシ酪酸、アラビノース、アセト酢酸、オルニチン、ヒドロキシプロリン、ノルバリン、イソクエン酸、エリスリトール、ミオイノシトール、トレイトール、2-アミノアジピン酸、キヌレニン、フコース、フェニルアラニン、アラビトール、キシロース、シスチン、チロシン、尿酸、マンノース、ベータ・アラニンから選ばれる少なくとも1種の代謝物の量であることを特徴とする。
本発明者は、多数の被検者から採取した血液試料をクロマトグラフ質量分析装置を用いて分析し、該血液試料に含まれる多数の代謝物の量を網羅的に測定した結果を包括的に解析することにより、上述した24種の代謝物がCOPD発症に大きく関連することを見出した。このような解析手法はメタボロミクスといわれており、この手法を用いることにより、COPDに関連する複合的な病態の変化を包括的にとらえることができる。
上記10種の代謝物は、135種の代謝物の測定値について、COPD関連群と正常群の2群間でt検定を行ったところ、COPD関連群と正常群との間に有意な差が認められたものである。従って、上記10種の代謝物の量をCOPD指標値として測定し、該COPD指標値と所定の閾値との比較により、COPD関連疾患の有無を診断することができる。所定の閾値は、多数の被検者について、前記10種の代謝物の生体試料中に含まれる量を測定したときの平均値や中央値等とすることができる。
上記5種の代謝物は、従属変数としてCOPD関連疾患の有無に加えて、調整因子として年齢、性別、喫煙歴を投入したモデルについて135種の代謝物の測定値のロジスティック回帰分析を行ったところ、P値が0.05よりも小さく、COPD発症の有無との間に高い相関関係が見られた代謝物である。従って、これら5種の代謝物の測定値をCOPD指標値として測定し、これと所定の閾値との比較により、COPD発症の有無を診断することができる。
上記10種の代謝物は、従属変数としてCOPD関連疾患の有無において、135種の代謝物の測定値についてROC解析し、そのAUC値を求めたところ、その値が大きかった代謝物である。従って、これら10種の代謝物の測定値をそれぞれCOPD指標値として測定し、これと所定の閾値との比較により、COPD発症の有無を診断することができ、しかも、誤診断を少なくすることができる。
上記10種の代謝物は、従属変数としてCOPD関連疾患の有無、調整因子として年齢、性別、喫煙歴を投入したモデルについて135種の代謝物の測定値についてC統計量を求めたところ、その値が大きかった代謝物である。従って、これら10種の代謝物の測定値をそれぞれCOPD指標値として測定し、これと所定の閾値との比較により、COPD発症の有無を診断することができ、しかも、誤診断を少なくすることができる。
研究倫理委員会の承認のもと、2015年10月から2016年9月までの1年間に聖路加国際病院附属クリニック予防医療センターを訪れた人間ドック受診者(約4万5000人)の中から約1万人の受診者をランダムにサンプリングし、そのうち本実験への不参加を表明した者、測定データが欠損している者、及び除外基準を満たす者を除外した残りの6610人の対象者を被検者とした。なお、除外基準は、喫煙を開始してから20年が経過した頃から発症し始めるという先行研究の知見から、人間ドックの受診時に40歳以下であることとした。
なお、臨床検査では、気管支拡張剤投与後のスパイロメータを用いた呼吸機能検査による1秒率の値が70%未満の患者をCOPDであると判定しているが、本実験では気管支拡張剤投与を行っていない。従って、上記COPD関連群には、実際にCOPDを発症している被検者だけでなくCOPD関連疾患がある被検者が含まれる。
(1)前処理
6610人の被検者から採取された血液を、所定時間放置した後、遠心分離し、上澄み(血清)を採取した。採取した血清は分析までの間、-80℃で保管した。なお、被検者から血液を採取してから血清を冷凍するまでの時間は血清中の代謝物の測定値に影響を及ぼす。そこで、今回は、血液を採取してから冷凍するまでの時間が5~8時間であった被検者が全体の約半数を占めるように、当該被検者を選定した。
-80℃で保存されていた血清を25℃、5分で解凍した。解凍後の血清を、10,000×g, 4℃, 1minで遠心分離した後、氷上静置し、これに、第1混合液(メタノール/水/クロロホルム、2.5:1:1)250μLに、内部標準溶液(2‐イソプロピルリンゴ酸:0.1mg/mL)6μLを添加し、ボルテックスミキサーを用いて混合して第2混合液を得た。
次に、上記第3混合液を、25℃、5分間、16,000×gで遠心し、その上清180μLを新しいチューブに回収した。これを、室温、60分間、スピードメモリを「7」に設定して遠心エバポレーターで濃縮した。
濃縮した第3混合液の上清(濃縮液)を-80℃、30分で凍結した後、これをオーバーナイトで乾燥したものをサンプルとした。得られたサンプルは分析までデシケーターで保存した。
デシケーターで保存されていたサンプルに、メトキシアミン溶液(20mg/mL /ピリジンで溶解)80μLを添加した後、これを37℃、30分間、1,200 rpmで振盪した。続いて、N-メチル-N-トリメチルシリルトリフルオロアセトアミド40μLを添加し、37℃、30分間、1,200 rpmで振盪した後、25℃、5分間、16,000×gで遠心分離し、その上清50μLをガラスバイアルに入れ、このバイアルをGCMSのオートサンプラーにセットした。
(1)カラム:DB-5((5%-フェニル)-メチルポリシロキサン、無極性)、長さ30m、内径0.25mm、膜厚1.00μm
(2)カラムオーブン温度:80℃
(3)インジェクション温度:280℃
(4)インジェクションモード:スプリット
(5)ヘリウムガス流量:39cm/sec
(6)カラム温度:0-2.5min;80℃、2.5-18.5min;80-280℃に上昇、18.5-23.0min;280℃
(7)MSイオン源温度:200℃
(8)インターフェイス温度:250℃
(9)検出器電圧:0.2kV
(10)質量範囲:m/z 85-500
<代謝物の測定>
試料のマススペクトルからピークを網羅的に検出し、それらのピーク情報(質量電荷比及び信号強度)をMSライブラリに格納されている多数の代謝物に特異的な物質の質量電荷比と比較することで、代謝物を同定し、135種類の代謝物の測定値(以下、MSデータという。)を求めた。
MSデータを取得した被検者について、統計解析に必要な臨床情報、検査データを、聖路加国際病院の研究倫理委員会の承諾のもと、聖路加国際大学情報システムセンターから入手し、臨床情報、検査データとMSデータの突合わせを行った。被検者の臨床情報及び検査データは全て被検者を表す管理番号で管理されており、データの突き合わせの際に、被検者が特定されないようにした。
以上の結果から、上記10種の代謝物の測定値はCOPD指標値として有用であり、いずれも測定値と所定の閾値とを比較し該閾値よりも大きいときはCOPD関連疾患であると診断することができる。
すなわち、COPDの診断方法は、被検者から採取された生体試料を分析装置で分析すること、前記分析装置で得られたデータから、24種の代謝物であるグルタル酸、αケトイソカプロン酸、ホスホグリセロール、ヒドロキシ酪酸、アラビノース、アセト酢酸、オルニチン、ヒドロキシプロリン、ノルバリン、イソクエン酸、エリスリトール、ミオイノシトール、トレイトール、2-アミノアジピン酸、キヌレニン、フコース、フェニルアラニン、アラビトール、キシロース、シスチン、チロシン、尿酸、マンノース、ベータ・アラニンから選ばれる少なくとも1種の代謝物の量であるCOPD指標値を求めること、前記COPD指標値を所定の閾値と比較した結果に基づき、前記被検者におけるCOPDの有無を診断すること、を含む。
被検者において被検者から採取された生体試料をクロマトグラフ質量分析装置で分析すること、
前記クロマトグラフ質量分析装置で得られたデータから、24種の代謝物であるグルタル酸、αケトイソカプロン酸、ホスホグリセロール、ヒドロキシ酪酸、アラビノース、アセト酢酸、オルニチン、ヒドロキシプロリン、ノルバリン、イソクエン酸、エリスリトール、ミオイノシトール、トレイトール、2-アミノアジピン酸、キヌレニン、フコース、フェニルアラニン、アラビトール、キシロース、シスチン、チロシン、尿酸、マンノース、ベータ・アラニンから選ばれる少なくとも1種の代謝物の量であるCOPD指標値を求めること、前記COPD指標値を所定の閾値と比較した結果に基づき、前記被検者におけるCOPDの有無を診断すること、を含む。
Claims (2)
- 被検者から採取された生体試料に含まれる慢性閉塞性肺疾患関連疾患の有無と関連する代謝物の量をCOPD指標値として測定するステップと、
前記被検者とは異なる、COPD関連群に属する喫煙者と正常群に属する喫煙者とCOPD関連群に属する非喫煙者と正常群に属する非喫煙者のそれぞれから採取された生体試料に含まれる、前記COPD指標値である代謝物の量を測定するステップと、
前記COPD関連群に属する喫煙者と正常群に属する喫煙者とCOPD関連群に属する非喫煙者と正常群に属する非喫煙者のそれぞれから採取された生体試料に含まれる、前記COPD指標値である代謝物の量に基づいて、閾値を設定するステップと、
前記COPD指標値と前記閾値を比較するステップと
を含み、
前記生体試料が血液試料であり、
前記COPD指標値がチロシンの量である、COPD指標値の測定方法。 - 請求項1に記載のCOPD指標値の測定方法において、
前記COPD指標値が、生体試料をクロマトグラフMS分析することによって得られたデータに基づき測定されたチロシンの量である、COPD指標値の測定方法。
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