JP7711073B2 - 免疫抑制剤として有用な大環状pad4阻害剤 - Google Patents
免疫抑制剤として有用な大環状pad4阻害剤Info
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Description
本願は、2020年2月6日付け出願の米国仮特許出願番号62/970,832の優先権を主張するものであり、その全体を出典明示により本明細書に組み込むものとする。
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩は、PAD4の阻害剤として有用であることが判明した。
いくつかの実施態様において、かかる化合物は、本明細書にて記載される式で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を包含し、ここで各可変基は本明細書に定義され、実施態様にて記載されるとおりである。かかる化合物は、式(I):
Qは、NおよびCHからなる群より選択され;
Aは、炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む、4員ないし15員のヘテロシクリルであり;
A1は、0~3個のR1で置換されるC1-4アルキレンであり;所望により、該C1-4アルキレンの1または複数のメチレン単位は、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)と置き換えられてもよく;
A2は、C3-6カルボシクリル、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルとからなる群より選択され、各々が0~4個のR2で置換され;
A3は、C3-6カルボシクリル、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルとからなる群より選択され、各々が0~4個のR2で置換され;
A4は、C3-8アルキレンおよびC3-8アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-8アルキレンの1または複数のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子と直に結合するものを除き、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)により置き換えられてもよい;
ただし、A2が存在しない場合、A1はA3と直に結合し;A3が存在しない場合、A2はA4と直に結合し;A2とA3が共に存在しない場合、A1はA4と直に結合し、A4の少なくとも2つのメチレン単位は、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)と置き換えられ;
R1は、F、Cl、-ORb、およびC1-3アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R2は、F、Cl、CN、=O、C(=O)NRaRa、およびC1-3アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R3は、F、Cl、Br、-ORb、およびC1-3アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R4は、F、Cl、Br、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R5は、F、Cl、CN、C1-3アルキル、=N-ORb、-(CH2)rORb、-OC(=O)NRaRa、-(CH2)rNRaRa、-NRaC(=NH)C1-3アルキル、-C(=O)ORb、-NRaC(=O)ORb、カルボシクリルイル(0~5個のRcで置換される)、およびヘテロシクリルイル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択されるか;あるいはまた、2個のR5基が一緒になってカルボシクリルまたはヘテロシクリルを形成し;
R6は、各出現で、F、Cl、Br、およびC1-4アルキル、C1-4ハロアルキル、およびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より独立して選択され;
Raは、各出現で、H、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルケニル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルキニル(0~5個のRcで置換される)、-(CH2)r-C3-10カルボシクリル(0~5個のRcで置換される)、および(CH2)r-ヘテロシクリル(0~5個のRcで置換される)からなる群より独立して選択されるか;あるいはRaおよびRaは、その両方が結合する窒素原子と一緒になって、ヘテロ環式環(0~5個のRcで置換される)を形成し;
Rbは、各出現で、H、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルケニル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルキニル(0~5個のRcで置換される)、(CH2)r-C3-10カルボシクリル(0~5個のRcで置換される)、および(CH2)r-ヘテロシクリル(0~5個のRcで置換される)からなる群より独立して選択され;
Rcは、各出現で、F、Cl、Br、CN、=O、OH、OC1-4アルキル、CO2H、C1-6アルキル(0~5個のRdで置換される)、(CH2)r-C3-6シクロアルキル(0~5個のRdで置換される)、(CH2)r-アリール(0~5個のRdで置換される)、(CH2)r-ヘテロシクリル(0~5個のRdで置換される)からなる群より独立して選択され,
Rdは、各出現で、F、Cl、Br、CN、OH、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルキニル、C3-6シクロアルキル、およびフェニルからなる群より独立して選択され;
pは、各出現で、0、1、および2より選択される整数であり;および
rは、各出現で、0、1、2、3、および4より選択される整数である]
で示される構造を有する化合物、またはその医薬的に許容される塩である。
本明細書および添付される特許請求の範囲を通し、所定の化学式または名称は、異性体が存在する場合には、すべての立体異性体および光学異性体ならびにそのラセミ体を包含する。特に断りがなければ、すべてのキラル(エナンチオマーおよびジアステレオマー)およびラセミ形態は本発明の範囲内にある。C=C二重結合、C=N二重結合、環系等の多数の幾何異性体も化合物においても存在することができ、かかるすべての安定した異性体は本発明に含まれる。本発明の化合物のシス-およびトランス-(あるいはE-およびZ-)幾何異性体が記載され、異性体の混合物としてあるいは分離した異性体の形態として単離されてもよい。本発明の化合物は光学活性な形態またはラセミ形態にて単離され得る。光学活性体は、ラセミ体を分割することにより、あるいは光学活性な出発材料より合成することにより、製造されてもよい。本発明の化合物を製造するのに使用されるすべての方法およびその方法の中で製造される中間体は本発明の一部であると考えられる。エナンチオマーまたはジアステレオマーの生成物が製造される場合、それらは従来の方法、例えば、クロマトグラフィーまたは分別結晶により分離されてもよい。その方法の条件に応じて、本発明の最終生成物は、遊離(中性)または塩の形態のいずれかで得られる。これらの最終生成物の遊離および塩の形態の両方が本発明の範囲内にある。所望により、化合物の一の形態はもう一つ別の形態に変換されてもよい。遊離塩基または酸は塩に変換されてもよく;塩は遊離化合物またはもう一つ別の塩に変換されてもよく;本発明の異性体の化合物の混合物は、個々の異性体に分離されてもよい。本発明の化合物、その遊離形態および塩は、水素原子が該分子の他の部分に転位し、該分子の原子間の化学結合がそれに伴って再編成された複数の互変異性体の形態にて存在してもよい。存在する限り、すべての互変異性体の形態が本発明に含まれることを理解すべきである。
「対イオン」なる語は、クロリド、ブロミド、ヒドロキシド、アセテート、およびサルフェートなどの負に帯電した種、あるいはナトリウム(Na+)、カリウム(K+)、アンモニウム(RnNHm +(n=0-4、m=0-4)等などの正に帯電した種を表すのに使用される。
環構造内に点線の環が使用される場合、これはその環構造が飽和、部分飽和または不飽和であってもよいことを示す。
本発明の化合物で窒素原子がある場合(例えば、アミンである場合)には、これらの原子は、酸化剤(例えば、mCPBAおよび/または過酸化水素)で処理することによりN-オキシドに変換され、本発明の他の化合物を得ることができる。かくして、特定される窒素原子はその特定される窒素およびそのN-オキシド(N→O)誘導体の両方に及ぶものと考えられる。
置換基との結合が環の2つの原子を接続する結合を横切って示される場合、その場合にはかかる置換基は該環のいずれの原子に結合してもよい。置換基が、かかる置換基が所定の式の化合物の残基と結合する原子を示すことなく、列挙される場合、その場合にはかかる置換基はそのような置換基にあるいずれの原子を介して結合してもよい。
「医薬的に許容される」なる語は、正常な医学的判断の範囲内において、過度の毒性、刺激、アレルギー反応および/または他の問題または合併症がなく、合理的な利点/危険性の割合を考慮して、ヒトおよび動物の組織と接触して使用するのに適する、それらの化合物、材料、組成物および/または剤形をいうのに本明細書中で利用される。
a)Bundgaard, H.編、Design of Prodrugs, Elsevier(1985)、およびWidder, K.ら編、Methods in Enzymology, 112:309-396, Academic Press(1985);
b)Bundgaard, H.、Chapter 5, 「プロドラッグの設計および用途(Design and Application of Prodrugs)」、Krosgaard-Larsen, P.ら編、A Textbook of Drug Design and Development、pp.113-191, Harwood Academic Publishers(1991);
c)Bundgaard, H.、Adv. Drug Deliv. Rev., 8:1-38(1992);
d)Bundgaard, H.ら、J. Pharm. Sci., 77:285(1988);
e)Kakeya, N.ら、Chem. Pharm. Bull., 32:692(1984);および
f)Rautio, J.編、Prodrugs and Targeted Delivery(Methods and Principles in Medicinal Chemistry), Vol. 47, Wiley-VCH(2011)
を参照のこと。
第1の態様において、本発明は、式(I):
Qは、NおよびCHからなる群より選択され;
Aは、炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む、4員ないし15員のヘテロシクリルであり;
A1は、C1-4アルキレン(0~3個のR1で置換される)であり;所望により、該C1-4アルキレンの1または複数のメチレン単位は、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)と置き換えられてもよく;
A2は、C3-6カルボシクリル、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルとからなる群より選択され、各々が0~4個のR2で置換され;
A3は、C3-6カルボシクリル、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルとからなる群より選択され、各々が0~4個のR2で置換され;
A4は、C3-8アルキレンおよびC3-8アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-8アルキレンの1または複数のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子と直に結合するものを除き、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)により置き換えられてもよい;
ただし、A2が存在しない場合、A1はA3と直に結合し;A3が存在しない場合、A2はA4と直に結合し;A2とA3が共に存在しない場合、A1はA4と直に結合し、A4の少なくとも2つのメチレン単位は、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)と置き換えられ;
R1は、F、Cl、-ORb、およびC1-3アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R2は、F、Cl、CN、=O、C(=O)NRaRa、およびC1-3アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R3は、F、Cl、Br、-ORb、およびC1-3アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R4は、F、Cl、Br、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択され;
R5は、F、Cl、CN、C1-3アルキル、=N-ORb、-(CH2)rORb、-OC(=O)NRaRa、-(CH2)rNRaRa、-NRaC(=NH)C1-3アルキル、-C(=O)ORb、-NRaC(=O)ORb、カルボシクリルイル(0~5個のRcで置換される)、およびヘテロシクリルイル(0~5個のRcで置換される)からなる群より選択されるか;あるいはまた、2個のR5基が一緒になってカルボシクリルまたはヘテロシクリルを形成し;
R6は、各出現で、F、Cl、Br、およびC1-4アルキルからなる群より独立して選択され;
Raは、各出現で、H、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルケニル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルキニル(0~5個のRcで置換される)、-(CH2)r-C3-10カルボシクリル(0~5個のRcで置換される)、および(CH2)r-ヘテロシクリル(0~5個のRcで置換される)からなる群より独立して選択されるか;あるいはRaおよびRaは、その両方が結合する窒素原子と一緒になって、ヘテロ環式環(0~5個のRcで置換される)を形成し;
Rbは、各出現で、H、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルケニル(0~5個のRcで置換される)、C2-6アルキニル(0~5個のRcで置換される)、(CH2)r-C3-10カルボシクリル(0~5個のRcで置換される)、および(CH2)r-ヘテロシクリル(0~5個のRcで置換される)からなる群より独立して選択され;
Rcは、各出現で、F、Cl、Br、CN、=O、OH、OC1-4アルキル、CO2H、C1-6アルキル(0~5個のRdで置換される)、(CH2)r-C3-6シクロアルキル(0~5個のRdで置換される)、(CH2)r-アリール(0~5個のRdで置換される)、(CH2)r-ヘテロシクリル(0~5個のRdで置換される)からなる群より独立して選択され;
Rdは、各出現で、F、Cl、Br、CN、OH、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルキニル、C3-6シクロアルキル、およびフェニルからなる群より独立して選択され;
pは、各出現で、0、1、および2より選択される整数であり;および
rは、各出現で、0、1、2、3、および4より選択される整数である]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A1はC1-4アルキル(0~2個のR1で置換される)であり;所望により、該C1-4アルキレンの1または複数のメチレン単位は、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)と置き換えられてもよく;
A2は、C6アリールおよび炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む、4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A3は、C3-6シクロアルキル、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-7アルキレンの1ないし3個のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子に直に結合するものを除き、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)によって置き換えられてもよく;
R1は、F、Cl、および-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、CN、=O、およびC(=O)NRaRaからなる群より選択され;
R3は、F、Cl、Br、および-OC1-4アルキルからなる群より選択され;
R4は、F、Cl、C1-5アルキル、C1-5ハロアルキルおよびC1-5ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;
Raは、各出現で、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択され;および
Rbは、各出現で、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A2は、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A3は、C3-6シクロアルキル、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-7アルキレンの1または2個のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子に直に結合するものを除き、O、S(O)p、NH、およびN(C1-4アルキル)によって置き換えられてもよく;
R1は、F、Cl、および-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、CN、=O、およびC(=O)NRaRaからなる群より選択され;
R3は、F、Cl、Br、および-OC1-4アルキルからなる群より選択され;
R4は、F、C1-4アルキル、C1-4ハロアルキルおよびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;
Raは、各出現で、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択され;および
Rbは、各出現で、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A2は、C6アリールと、炭素原子、およびN、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子を含む5員または6員のヘテロシクリルとからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-7アルキレンの1または複数のメチレン単位は、O、NH、およびN(C1-4アルキル)と置き換えられてもよく;
R1は、Fおよび-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、CN、=O、およびC(=O)NRaRaからなる群より選択され;および
R4は、C1-3アルキル、C1-3ハロアルキルおよびC1-3ヒドロキシアルキルからなる群より選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-7アルキレンの1または複数のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子に直に結合するものを除き、OおよびNHと置き換えられてもよく;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;
R2は、F、CN、およびC(=O)NH2からなる群より選択され;および
R4は、C1-4ハロアルキルおよびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A4が、C3-7アルキレン、-OC4-7アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択される、
化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A4は、C3-7アルキレン、-OC4-7アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R1は-ORbおよびC1-3アルキルからなる群より選択され;
R2はFおよびCNからなる群より選択され;
R3は-OC1-4アルキルであり;
R4は、C1-3ハロアルキルおよびC1-3ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;および
Rbは、各出現で、HおよびC1-3アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A4がC3-5アルキレンであって;
R3が-OCH3である、
化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A2は
A4は、C3-6アルキレン、-OC3-6アルキレン、およびC3-6アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;および
R2はFおよび=Oからなる群より選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A3は、C3-6シクロアルキルおよび炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;所望により、該C3-7アルキレンの1ないし2個のメチレン単位はO、S(O)p、NH、およびN(C1-4アルキル)によって置き換えられてもよく;
R1は、Fおよび-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、およびCNからなる群より選択され;
R3は、F、Cl、および-OC1-4アルキルからなる群より選択され;
R4は、C1-4アルキル、C1-4ハロアルキルおよびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;
Raは、各出現で、HおよびC1-4アルキルからなる群より独立して選択され;および
Rbは、各出現で、HおよびC1-4アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A3が、シクロプロピル(0~2個のR2で置換される)および
A4が、C3-7アルキレン、-OC4-7アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R2が、FおよびClからなる群より選択され;および
R3が-OCH3である、
化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A2は、C6アリールと、炭素原子およびNから選択される1または2個のヘテロ原子を含む4員ないし6員のヘテロシクリルとを含む群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~3個のR1で置換され;所望により、該C3-7アルキレンの1ないし3個のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子に直に結合するものを除き、OおよびC(=O)と置き換えられてもよく;
R1は、F、Cl、および-OHからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、およびCNからなる群より選択され;および
R3は、F、Cl、および-OC1-4アルキルからなる群より選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A4は、C3-7アルキレン(0~3個のR1で置換される)、-OC4-7アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A2が
A4が、C4-7アルキレンおよびC4-7アルケニレンからなる群より選択され;および
R3が-OCH3である、
化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A1はC1-3アルキレンであり、該C1-3アルキレンの1または2個のメチレン単位が、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)と置き換えられており;
A4は、C3-7アルキレン、-OC4-7アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され;および
R3は、F、Cl、および-OC1-4アルキルからなる群より選択される]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A1はC1-2アルキレンであり;
A4はC3-7アルキレンであって、該C3-7アルキレンの最初の2個のメチレン単位がS(=O)2-NHまたはS(=O)2-N(C1-3アルキル)と置き換えられており;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
QはNおよびCHからなる群より選択され;
A4は、C3-6アルキレン、-OC3-6アルキレン、およびC3-6アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
Qは、NおよびCHからなる群より選択され;
A4は、C3-6アルキレン、-OC3-6アルキレン、およびC3-6アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
Qは、NおよびCHからなる群より選択され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
Qは、NおよびCHからなる群より選択され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
A2が
A4が-C(=O)-C5-6アルキレンであり;および
R3が-OCH3である、
化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
R2が-CH2-シクロプロピルであり;
R3が-OCH3であり;および
R4が
本明細書にて上記に定義され、かつ記載されるように、A1は、1~2個のR1で所望により置換されてもよいC1-4アルキレンである。例えば、いくつかの実施態様において、A1は-CH2-である。いくつかの実施態様において、A1は-CH2CH2-である。いくつかの実施態様において、A1は-CH2CH2CH2-である。所望により、A1のC1-4アルキレンの1または複数のメチレン単位は、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)により置き換えられてもよい。例えば、いくつかの実施態様において、A1は-C(=O)NHCH2CH2CH2-である。特定の実施態様において、A1は、下記の実施例に記載のそれらの官能基より選択される。
いくつかの実施態様において、A4はC3-8アルケニレンである。例えば、いくつかの実施態様において、A4は-CH2=CH2CH2CH2-である。いくつかの実施態様において、A4は-CH2=CH2CH2CH2CH2-である。いくつかの実施態様において、A4は-CH2=CH2CH2CH2CH2CH2-である。
本明細書にて上記に定義され、かつ記載されるように、R2は、F、Cl、CN、=O、C(=O)NRaRa、およびC1-3アルキルより選択される。いくつかの実施態様において、R2はFである。いくつかの実施態様において、R2はClである。いくつかの実施態様において、R2はCNである。いくつかの実施態様において、R2は=Oである。いくつかの実施態様において、R2はC(=O)NH2である。特定の実施態様において、R2は下記の実施例に記載のそれらの官能基より選択される。
本明細書にて上記に定義され、かつ記載されるように、R4はF、Cl、Br、C1-6アルキル(0~5個のRcで置換される)より選択される。特定の実施態様において、R4は1~4個のF、Cl、Br、およびOHで置換されるC1-5アルキルである。
本明細書にて上記に定義され、かつ記載されるように、R6はF、Cl、Br、およびC1-4アルキルである。いくつかの実施態様において、R6は不在である。
いくつかの実施態様において、式(I)の化合物は、下記の実施例より選択される。特定の実施態様において、本発明は、療法において用いるための、上記に、および本明細書に記載のいずれの化合物、あるいはその医薬的に許容される塩または組成物も提供する。いくつかの実施態様において、本発明は、上記に、および本明細書に記載の単離された形態のいずれの化合物も提供する。いくつかの実施態様において、本発明は請求項1~16のいずれか一項に記載の化合物を提供する。
もう一つ別の実施態様によれば、該発明は、本発明の化合物またはその医薬的に許容される誘導体と、医薬的に許容される担体、アジュバント、またはビヒクルとを含む、組成物を提供する。本発明の組成物に配合される化合物の量は、生物学的サンプルまたは患者において、PAD4を明らかに分かるほど阻害するのに効果的であるような量である。特定の実施態様において、本発明の組成物中の化合物の量は、生物学的サンプルまたは患者において、PAD4を目に見える形で阻害するのに効果的であるような量である。特定の実施態様において、本発明の組成物はかかる組成物を必要とする患者に投与するのに処方される。いくつかの実施態様において、本発明の組成物は患者に経口投与するのに処方される。
下部腸管への局所適用は、直腸用坐剤製剤(上記参照)または適切な浣腸製剤にて行われ得る。局所的経皮パッチも使用され得る。
本明細書に記載の化合物および組成物は、一般に、PAD4の阻害に有用である。
本発明において利用される化合物のPAD4の阻害剤としての活性は、インビトロ、インビボまたは細胞株においてアッセイされ得る。インビトロアッセイは、PAD4の阻害を測定するアッセイを包含する。本発明にてPAD4の阻害剤として利用される化合物をアッセイするための詳細な条件は以下の実施例にて記載される。いくつかの実施態様において、提供される化合物はPAD2と比べて選択的にPAD4を阻害する。
本明細書に記載の発明がより完全に理解され得るように、以下の実施例を用いて本発明を説明する。これらの実施例は例示を目的とするに過ぎず、いかなる方法でも本発明を限定するものとして解釈されるべきではないと理解されたい。
後記する実施例に記載されるように、特定の例示として実施態様において、化合物は以下の一般的な操作に従って製造される。一般的な方法は本発明の特定の化合物の合成を示すが、次の一般的方法および当業者に既知の他の方法は、本明細書に記載されるように、すべての化合物、および下位群および種のこれらの各化合物に適用され得ることが理解されよう。
リンカーBがピラゾールまたはイミダゾール中にNHなどの求核性残基を含有する実施例では、一般的な化学スキーム1に示されるように、マクロサイクルを形成しうる。当業者であれば、基Cと二環式管の間にあるリンカーが可変基であり得るところの、同様の合成経路を設計することもできる。
方法1:カラム:ウォーターズ・エックスブリッジ(Waters XBridge)C18、2.1mmx50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+10mM酢酸アンモニウム;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+10mM酢酸アンモニウム;温度:50℃;勾配:3分間にわたって0%B~100%B、次に100%Bで0.75分間保持する;流れ:1mL/分;検出:MSおよびUV(220nm)
((7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H,41H-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(4,1)-ピラゾラシクロノナファン-25-イル)メタノン
((7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H,41H-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(4,1)-ピラゾラシクロノナファン-25-イル)メタノン
((7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H,41H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(4,1)-ピラゾラシクロデカファン-25-イル)メタノン
((7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H,41H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(4,1)-ピラゾラシクロデカファン-25-イル)メタノン
((3R,5R)-3-アミノ-5-フルオロピペリジン-1-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H,41H-6-オキサ-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(4,1)-ピラゾラ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン
((3R,5R)-3-アミノ-5-フルオロピペリジン-1-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H,41H-6-オキサ-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(4,1)-ピラゾラ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン
表1
((3R,5R)-3-アミノ-5-フルオロピペリジン-1-イル)(27-メトキシ-11H,21H-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(1,3),5(1,2)-ジベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン
40mLのシンチレーションバイアルにおいて、1H-インドール-2-カルバルデヒド(145mg、0.999ミリモル)および炭酸カリウム(369mg、2.67ミリモル)の無水DMF(3mL)中の撹拌混合物を1-ブロモ-2-(4-ブロモブチル)ベンゼン(260mg、0.890ミリモル)で処理した。該バイアルを密封し、反応物を70℃で5時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチル(25mL)で希釈し、その混濁した溶液を水で1回、10%塩化リチウム溶液で2回、およびブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。真空下で濃縮した。該残渣をセライト上に吸収させ、40gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって0%~50%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物を得た。1H NMR(499MHz、クロロホルム-d) δ 9.91(s,1H)、7.76(dt,J=8.1、0.9Hz,1H)、7.53(dd,J=7.9、1.1Hz,1H)、7.46-7.41(m,2H)、7.29(s,1H)、7.24-7.16(m,3H)、7.06(td,J=7.6、1.9Hz,1H)、4.63(t,J=7.4Hz,2H)、2.78(t,J=7.7Hz,2H)、1.91(dt,J=15.1、7.6Hz,2H)、1.76-1.66(m,2H);LCMS 保持時間=1.17分間、MS ESI m/z=356.2(M+H)(方法3)
40mLのシンチレーションバイアルにおいて、1-(4-(2-ブロモフェニル)ブチル)-1H-インドール-2-カルバルデヒド(235mg、0.660ミリモル)、4,4,4’,4’,5,5,5’,5’-オクタメチル-2,2’-ビ(1,3,2-ジオキサボロラン)(201mg、0.792ミリモル)、酢酸カリウム(129mg、1.319ミリモル)、およびPdCl2(dppf)-ジクロロメタン アダクツ(48.3mg、0.066ミリモル)のジオキサン(4mL)中混合物を、窒素を10分間通気することで、脱気処理に付した。該バイアルを密封し、反応物を85℃で18時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチル(5mL)で希釈し、濾過し、該濾液を真空下で濃縮した。該残渣を40gシリカゲルカラム上のMPLC(16カラム容量にわたって0%~50%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(220mg、0.545ミリモル、収率83%)を得た。1H NMR(400MHz、クロロホルム-d) δ 9.89(s,1H)、7.83-7.71(m,2H)、7.43-7.40(m,2H)、7.37-7.32(m,1H)、7.27(s,1H)、7.22-7.13(m,3H)、4.61(t,J=7.4Hz,2H)、2.99-2.86(m,2H)、1.89(quin,J=7.5Hz,2H)、1.70-1.59(m,2H)、1.31(s,12H);LCMS 保持時間=1.28分間、MS ESI m/z=404.4(M+H)(方法3)
メチル 4-クロロ-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエート(1.79g、7.29ミリモル)およびヒューニッヒ塩基(2.55mL、14.58ミリモル)のDMF(15mL)中の撹拌溶液を(3-ブロモフェニル)メタナミン(2.71g、14.58ミリモル)で処理した。該反応物を室温で60時間撹拌した。LCMSは反応が未だに完了に至っていないことを示した。該混合物を(3-ブロモフェニル)メタナミン(2.71g、14.58ミリモル)で処理し、反応物を50℃で24時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を真空下で濃縮し、残渣を酢酸エチル(200mL)に溶かした。その混濁した溶液を水で1回、10%塩化リチウムで2回、およびブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を220gシリカゲルカラム上のMPLC(12カラム容量にわたって20%~40%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で100mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(2.23g、5.64ミリモル、収率77%)を得た。1H NMR(499MHz、クロロホルム-d) δ 8.56-8.47(m,2H)、7.52(d,J=1.7Hz,1H)、7.47(s,1H)、7.45-7.40(m,1H)、7.26-7.22(m,2H)、4.85(d,J=6.2Hz,2H)、3.92(s,3H)、3.83(s,3H);LCMS 保持時間=1.04分間、MS ESI m/z=395.2(M+H)(方法3)
2ドラムバイアルにおいて、メチル 4-((3-ブロモベンジル)アミノ)-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエート(184mg、0.466ミリモル)、1-(4-(2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル)ブチル)-1H-インドール-2-カルバルデヒド(188mg、0.466ミリモル)、および2Mリン酸三カリウム(0.932mL、1.864ミリモル)のジオキサン(4mL)中の撹拌混合物を、窒素を10分間通気することで、脱気処理に付した。XPhos-Pd G2(35.8mg、0.047ミリモル)を加え、脱気処理をさらに10分間続けた。この時点で、該溶液の体積は約半分に減少した。該バイアルを密封し、反応物を50℃で6時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチルで希釈し、濾過した。濾液を水で2回およびブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を40gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって0%~100%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介したクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(171mg、0.289ミリモル、収率62.0%)を得た。1H NMR(499MHz、クロロホルム-d) δ 9.83(s,1H)、8.54-8.43(m,2H)、7.73(d,J=8.1Hz,1H)、7.48(d,J=1.7Hz,1H)、7.40-7.33(m,2H)、7.30-7.29(m,1H)、7.28-7.21(m,6H)、7.19-7.14(m,3H)、4.89(d,J=5.8Hz,2H)、4.43(t,J=7.3Hz,2H)、3.91(s,3H)、3.82(s,3H)、2.64-2.52(m,2H)、1.67(dt,J=14.9、7.6Hz,2H)、1.51-1.41(m,2H);LCMS 保持時間=1.28分間、MS ESI m/z=592.5(M+H)(方法3)
2ドラムバイアルにおいて、メチル 4-(((2’-(4-(2-ホルミル-1H-インドール-1-イル)ブチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メチル)アミノ)-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエート(122mg、0.206ミリモル)の2:1 EtOH/水(20mL)中の撹拌懸濁液を亜ジチオン酸ナトリウム(264mg、2.062ミリモル)で処理した。反応物を80℃で2時間撹拌した。LCMSによって、5:1の出発材料/生成物が検出された。80℃でさらに2時間撹拌した後、LCMSは同じ割合を検出した。該混合物を室温に冷却し、亜ジチオン酸ナトリウム(134mg、1.048ミリモル)で処理した。該バイアルを密封し、反応物を80℃で2時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。エタノールをいくらか蒸発させ、残りの混合物を酢酸エチル(25mL)中に注いだ。その混濁した溶液を水で3回、ブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を12gシリカゲルカラム上のMPLC(20%酢酸エチル/ヘキサンで30mL/分で溶出する)を介したクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(55mg、0.102ミリモル、収率49.2%)をコハク色の固体として得た。1H NMR(499MHz、クロロホルム-d) δ 8.18(d,J=1.3Hz,1H)、7.68(d,J=7.9Hz,1H)、7.55(d,J=1.2Hz,1H)、7.47(d,J=8.0Hz,1H)、7.40(d,J=8.3Hz,1H)、7.28-7.23(m,2H)、7.19-7.09(m,4H)、7.08-7.02(m,4H)、6.63(s,1H)、6.29(d,J=15.1Hz,1H)、6.06(d,J=15.1Hz,1H)、5.29(dt,J=14.5、4.7Hz,1H)、4.31(ddd,J=14.2、10.1、3.8Hz,1H)、4.17(s,3H)、3.98(s,3H)、2.26(ddd,J=13.3、11.1、6.3Hz,1H)、2.01(ddd,J=13.5、10.3、3.5Hz,1H)、1.36-1.17(m,2H)、0.84-0.71(m,1H);LCMS 保持時間=1.20分間、MS ESI m/z=542.4(M+H)(方法3)
THF(1mL)中の27-メトキシ-11H,21H-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(1,3),5(1,2)-ジベンゼナシクロノナファン-25-カルボン酸(55mg、0.102ミリモル)を0.5M水酸化リチウム(0.406mL、0.203ミリモル)で処理した。反応物を50℃で一夜にわたって撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を1M HClでpH5に調整し、酢酸エチルで3回抽出した。有機相を合わせ、ブラインで1回洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮して表記化合物(46mg、0.087ミリモル、収率86%)を得た。LCMS 保持時間=1.10分間、MS ESI m/z=528.5(M+H)(方法3)
27-メトキシ-11H,21H-2(2,1)-ベンゾ[d]イミダゾラ-1(2,1)-インドラ-4(1,3),5(1,2)-ジベンゼナシクロノナファン-25-カルボン酸(19mg、0.036ミリモル)、tert-ブチル ((3R,5R)-5-フルオロピペリジン-3-イル)カルバメート(8.65mg、0.040ミリモル)、およびトリエチルアミン(0.015mL、0.108ミリモル)の撹拌溶液をBOP(17.52mg、0.040ミリモル)で処理した。反応物を室温となるようにし、4時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物をジオキサン中4M HCl(1mL)で処理し、反応物を室温で1時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を真空下で濃縮した。該粗材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:エックスブリッジ C18、200mmx19mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;勾配:33%Bで0分間保持し、20分間にわたって33-73%Bとし、次に100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSおよびUVシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をDMFで希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(20.9mg、0.033ミリモル、収率92%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6) δ 7.65(d,J=7.6Hz,1H)、7.59(brt,J=8.2Hz,2H)、7.44-7.32(m,3H)、7.24(brt,J=7.8Hz,1H)、7.18-7.02(m,5H)、7.00-6.95(m,2H)、6.48(s,1H)、6.26-6.06(m,2H)、5.23-5.13(m,1H)、5.08-4.90(m,1H)、4.40(brt,J=11.0Hz,1H)、4.14(s,3H)、2.43-2.34(m,1H)、2.32-2.23(m,1H)、1.96-1.71(m,2H)、1.62-1.47(m,1H)、1.42-1.28(m,1H)、1.04-0.87(m,1H)、0.49-0.31(m,1H);MS ESI m/z 628.0(M+H);分析性HPLC保持時間:2.32分間、(方法1)
以下の化合物は、実施例21に記載の操作によって、工程1において1H-インドール-2-カルバルデヒドの代わりに1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドを、および/または1-ブロモ-2-(4-ブロモブチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-2-(3-ブロモプロポキシ)ベンゼンを用い、工程3にて(3-ブロモフェニル)メタナミンの代わりに適切なベンジルアミン誘導体を用いるか、または実施例21、工程7においてtert-ブチル ((3R,5R)-5-フルオロピペリジン-3-イル)カルバメートの代わりにtert-ブチル ((1R,4R,7R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメートを用いることで製造され得る。
25-((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-カルボニル)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,1)-ピロリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-45-オン・TFA(異性体1および異性体2)
表記化合物は、実施例21、工程3に記載される条件を用い、1H-インドール-2-カルバルデヒドの代わりに4-(アミノメチル)ピロリジン-2-オンを用いて製造された。LCMS 保持時間=0.72分間、MS ESI m/z=324.2(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21、工程1に記載される条件を用い、(3-ブロモフェニル)メタナミンの代わりに1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドを用いて製造された。LCMS 保持時間=1.13分間、MS ESI m/z=357.1(M+H)(方法3)
2ドラムバイアルにおいて、メチル 3-メトキシ-5-ニトロ-4-(((5-オキソピロリジン-3-イル)メチル)アミノ)ベンゾエート(100mg、0.311ミリモル)および1-(4-(2-ブロモフェニル)ブチル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドの2:1 EtOH/水(5mL)中の撹拌懸濁液を亜ジチオン酸ナトリウム(119mg、0.932ミリモル)で処理した。反応物を80℃で6時間撹拌した。LCMSは反応が未だに完了に至っていないことを示した。該混合物を室温となるようにし、亜ジチオン酸ナトリウム(119mg、0.932ミリモル)で処理した。反応物を80℃で18時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。エタノールの大部分をロータリーエバポレーターで蒸発させ、残りの混合物を酢酸エチルで3回抽出した。有機相を合わせ、ブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を24gシリカゲルカラム上のMPLC(1%~10%のメタノール/ジクロロメタンで40mL/分で溶出する(生成物は7%メタノールにて溶出する))を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮してメチル 2-(1-(4-(2-ブロモフェニル)ブチル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-1-((5-オキソピロリジン-3-イル)メチル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(150mg、0.238ミリモル、収率77%)を無色の固体として得た。LCMS 保持時間=0.95分間、MS ESI m/z=630.3(M+H)(方法3)
メチル2-(1-(4-(2-ブロモフェニル)ブチル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-1-((5-オキソピロリジン-3-イル)メチル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(117mg、0.186ミリモル)、キサントホス(32.2mg、0.056ミリモル)、Pd2(dba)3(16.99mg、0.019ミリモル)、および炭酸セシウム(91mg、0.278ミリモル)のジオキサン(5mL)中の撹拌混合物を、窒素を10分間通気することで、脱気処理に付した。該バイアルを密封し、反応物を110℃で18時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を濾過し、該濾液を真空下で濃縮した。該残渣を24gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって1%~7%のメタノール/ジクロロメタンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(80mg、0.146ミリモル、収率78%)を得た。LCMS 保持時間=0.89分間、MS ESI m/z=550.3(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21、工程6に記載の条件を用いて、メチル 27-メトキシ-45-オキソ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,1)-ピロリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボキシレートより製造された。LCMS 保持時間=0.78分間、MS ESI m/z=536.3(M+H)(方法3)
27-メトキシ-45-オキソ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,1)-ピロリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボン酸(78mg、0.146ミリモル)、tert-ブチル ((7R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(34.1mg、0.161ミリモル)、およびトリエチルアミン(0.061mL、0.438ミリモル)の撹拌溶液をBOP(71.0mg、0.161ミリモル)で処理した。反応物を室温となるようにし、4時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。反応混合物を24gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって1%~20%の[メタノール中7Mアンモニア]/ジクロロメタンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮した。該残渣を酢酸エチルに溶かし、該溶液を10%塩化リチウムで2回、ブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣をISCO GOLD40gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって2%~10%のメタノール中7Mアンモニア/ジクロロメタンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(77mg、0.105ミリモル、収率72.3%)をジアステレオマーの混合物として得た。LCMS 保持時間=0.87分間、MS ESI m/z=730.5(M+H)(方法3)。異性体を下記に示される条件を用いてSFCで分割させ、37mgの異性体1(最初の溶出液)を得た。LCMS 保持時間=0.87分間、MS ESI m/z=730.5(M+H)(方法3);および35mgの異性体2(次の溶出液)を得た。LCMS 保持時間=0.87分間、MS ESI m/z=730.5(M+H)(方法3)
装置:ベルガー(Berger)SFC
カラム:AD 25x3cm ID、5mm
温度:40C
流速:85mL/分
移動相:60/40 CO2/IPA
検出器波長:215nm
注入容量:1000μL
サンプル調製:70mgのサンプルを2mLのIPA/1mlのMeOHに溶かす
tert-ブチル ((7R)-2-(27-メトキシ-45-オキソ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,1)-ピロリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボニル)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(異性体1)(37mg、0.051ミリモル)のジクロロメタン(1mL)中の撹拌溶液をTFA(1mL)で処理した。該反応物を室温で1時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物をジクロロメタンから3xに濃縮し、残りのTFAを除去し、残りの材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:エックスブリッジ C18、200mmx19mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;勾配:11%Bで0分間保持し、20分間にわたって11-51%Bとし、次に100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSおよびUVシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をエチレンジクロリドおよびメタノールの1:1混合液で希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(23.4mg、0.031ミリモル、収率62.1%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)(回転異性体) δ 8.46(brd,J=4.9Hz,0.3H)、8.32(d,J=3.4Hz,0.7H)、8.13(brd,J=7.6Hz,0.3H)、8.06(brd,J=7.5Hz,0.7H)、7.66-7.55(m,0.3H)、7.51-7.41(m,0.7H)、7.27(s,1H)、7.18-6.98(m,6H)、5.33-4.71(m,3.7H)、4.55(brs,0.3H)、4.24(brs,0.5H)、4.06(brs,2.5H)、3.87-3.61(m,1H)、3.54(brs,3H)、3.35-3.15(m,2H)、2.79-2.67(m,1H)、2.39-2.23(m,1H)、2.14-1.66(m,6H)、1.55-1.41(m,1H)、1.27-1.08(m,1H)、0.60-0.42(m,1H);MS ESI m/z 630.0(M+H);分析性HPLC保持時間:1.52分間、(方法1)
tert-ブチル ((7R)-2-(27-メトキシ-45-オキソ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,1)-ピロリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボニル)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(異性体2)(37mg、0.051ミリモル)のジクロロメタン(1mL)中の撹拌溶液をTFA(1mL)で処理した。該反応物を室温で1時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物をジクロロメタンから3xに濃縮し、残りのTFAを除去し、残りの材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:エックスブリッジ C18、200mmx19mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;勾配:11%Bで0分間保持し、20分間にわたって11-51%Bとし、ついで100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSおよびUVシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をエチレンジクロリドおよびメタノール(EDM)の1:1混合液で希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(26.0mg、0.035ミリモル、収率69%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)(回転異性体) δ 8.46(brs,0.2H)、8.32(brd,J=3.7Hz,0.8H)、8.14(brd,J=7.9Hz,0.2H)、8.07(brd,J=7.9Hz,0.8H)、7.65-7.55(m,0.4H)、7.51-7.41(m,0.6H)、7.31-7.26(m,1H)、7.20-6.99(m,7H)、5.31-4.86(m,4H)、4.61-4.52(m,0.4H)、4.34-4.18(m,0.6H)、4.06(brs,3H)、3.63-3.56(m,1H)、3.47-3.13(m,3H)、2.86-2.59(m,2H)、2.49-2.22(m,2H)、2.09-1.61(m,8H)、1.55-1.13(m,3H)、0.67-0.36(m,1H);MS ESI m/z 630.2(M+H);分析性HPLC保持時間:1.44分間(方法1)
((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((シス)-6,7-ジヒドロキシ-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3),5(1,2)-ジベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン(異性体1)
表記化合物は、実施例21、工程1に記載の条件を用いて、1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドおよび4-ブロモ-1-ブテンより製造された。LCMS 保持時間=0.86分間、MS ESI m/z=201.1(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21、工程3に記載される条件を用い、(3-ブロモフェニル)メタナミンの代わりに(5-ブロモピリジン-3-イル)メタナミンを用いて製造された。LCMS 保持時間=0.91分間、MS ESI m/z=396.1(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例DG17、工程3に記載の条件を用いて、メチル 4-(((5-ブロモピリジン-3-イル)メチル)アミノ)-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエートおよび1-(ブタ-3-エン-1-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドより製造された。LCMS 保持時間=1.07分間、MS ESI m/z=546.3(M+H)(方法3)
2ドラムバイアルにおいて、メチル 1-((5-ブロモピリジン-3-イル)メチル)-2-(1-(ブタ-3-エン-1-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(189mg、0.346ミリモル)、(2-ビニルフェニル)ボロン酸(77mg、0.519ミリモル)、および2Mリン酸三カリウム(0.692mL、1.384ミリモル)のジオキサン(4mL)中の撹拌混合物を、窒素を10分間通気することで、脱気処理に付した。XPhos-Pd G2(26.6mg、0.035ミリモル)を加え、脱気処理をさらに10分間続けた。この時点で、該溶液の体積は約半分に減少した。該バイアルを密封し、反応物を50℃で6時間、そして室温で14時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈して濾過し、濾液を水で3回、ブラインで1回洗浄した。水相を合わせ、酢酸エチルで1回抽出し、有機相を合わせ、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を40gシリカゲルカラム上のMPLC(10カラム容量にわたって20%~100%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付し、所望の生成物を溶出させた。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(170mg、0.298ミリモル、収率86%)を得た。LCMS 保持時間=0.97分間、MS ESI m/z=570.3(M+H)(方法3)
メチル2-(1-(ブタ-3-エン-1-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-1-((5-(2-ビニルフェニル)ピリジン-3-イル)メチル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(170mg、0.298ミリモル)のジクロロエタン(50mL)中の撹拌溶液を、窒素を15分間にわたって激しく通気することで脱気処理に付した。該混合物をジクロロ[1,3-ビス(2,4,6-トリメチルフェニル)-2-イミダゾリジニリデン][[5-[(ジメチルアミノ)スルホニル]-2-(1-メチルエトキシ-O)フェニル]メチレン-C]ルテニウム(II)(10.95mg、0.015ミリモル)で処理し、さらに5分間脱気処理に付した(その体積は今では約4.5mLであった)。該混合物を50℃に加熱し、窒素雰囲気下で18時間にわたって撹拌した。LCMSは反応が完了していないことを示した。該混合物をジクロロ[1,3-ビス(2,4,6-トリメチルフェニル)-2-イミダゾリジニリデン][[5-[(ジメチルアミノ)スルホニル]-2-(1-メチルエトキシ-O)フェニル]メチレン-C]ルテニウム(II)(10.95mg、0.015ミリモル)で処理し、さらに5分間脱気処理に付した。反応物を50℃で6時間撹拌した。LCMSは反応が完了していないことを示した。該混合物をジクロロ[1,3-ビス(2,4,6-トリメチルフェニル)-2-イミダゾリジニリデン][[5-[(ジメチルアミノ)スルホニル]-2-(1-メチルエトキシ-O)フェニル]メチレン-C]ルテニウム(II)(10.95mg、0.015ミリモル)で処理し、さらに5分間脱気処理に付した。反応物をを50℃で6時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。触媒を濾過で取り出し、ジクロロメタンでリンスし、濾液およびリンス液を合わせ、真空下で濃縮した。該残渣を24gシリカゲルカラム上のMPLC(24カラム容量にわたって1%~10%のメタノール/ジクロロメタンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して、表記化合物(92mg、0.170ミリモル、収率56.9%)を得た。LCMS 保持時間=0.91分間、MS ESI m/z=542.3(M+H)(方法3)
メチル (Z)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,5)-ピリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-6-エン-2 -カルボキシレート(90mg、0.166ミリモル)の1:1 THF/アセトン(2mL)中の撹拌懸濁液を0℃に冷却し、4-メチルモルホリン N-オキシド(38.9mg、0.332ミリモル)およびオスミウム テトロキシド(t-BuOH中2.5%)(0.021mL、1.662マイクロモル)の水(1mL)中溶液で処理した。反応物を室温となるようにし、6時間撹拌した。LCMSは、ほとんどが出発材料で、微量の生成物の存在を示した。有機溶媒を蒸発させ、残渣をTHF(3mL)で処理した(均一な溶液を観察した)。該混合物をオスミウムテトロキシド(t-BuOH中2.5%)(0.021mL、1.662マイクロモル)で処理し、反応物を室温で3日間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を真空下で濃縮し、残渣をイソプロパノールから2倍に濃縮し、残りの水を除去した。該残渣をセライトに吸着させ、24gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって0.5%~10%のメタノール/ジクロロメタンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(43mg、0.075ミリモル、収率45.0%)を得た。LCMS 保持時間=0.74分間、MS ESI m/z=576.3(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21、工程6を用いて、メチル (シス)-6,7-ジヒドロキシ-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,5)-ピリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボキシレートより製造され得る。LCMS 保持時間=0.67分間、MS ESI m/z=562.4(M+H)(方法3)
(シス)-6,7-ジヒドロキシ-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,5)-ピリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボン酸(41.0mg、0.073ミリモル)、tert-ブチル ((1R,4R,7R)-1,4-ジメチル-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート、およびトリエチルアミン(0.031mL、0.219ミリモル)の撹拌溶液をHATU(36.1mg、0.095ミリモル)で処理した。反応物を室温となるようにし、4時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。反応混合物を12gシリカゲルカラム上のMPLC(25カラム容量にわたって3%~20%のメタノール/ジクロロメタンの勾配で30mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。異性体を次の条件を用いてSFCで分割した:
装置:SFC 150
カラム:YMC SB 25x3cm ID、5μm
温度:40℃
流速:100mL/分
移動相:65/35 CO2/EtOH
検出器波長:220nm
注入容量:1mL
サンプル調製:44mgのサンプルをMeOHに溶かした
21-((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-カルボニル)-19-メトキシ-7,8,16,17-テトラヒドロ-6H-ベンゾ[b]ベンゾ[4,5]イミダゾ[1,2-h]ピリド[3’,2’:4,5]ピロロ[2,1-j][1]オキサ[4,8,11]トリアザシクロテトラデシン-15(14H)-オン
表記化合物は、実施例21、工程1に記載の条件を用いて、1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドおよび1-(3-ブロモプロポキシ)-2-ニトロベンゼンより製造され得る。LCMS 保持時間=0.94分間、MS ESI m/z=326.2(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21、工程3に記載の条件を用いて、メチル 4-クロロ-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエートおよびtert-ブチル 3-アミノプロパノエート・塩酸塩より製造され得る。LCMS 保持時間=1.03分間、MS ESI m/z=355.2(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例37、工程3に記載の条件を用いて、メチル 4-((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロピル)アミノ)-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエートおよび1-(3-(2-ニトロフェノキシ)プロピル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドより製造され得る。LCMS 保持時間=1.06分間、MS ESI m/z=630.4(M+H)(方法3)
メチル 1-(3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロピル)-7-メトキシ-2-(1-(3-(2-ニトロフェノキシ)プロピル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(103mg、0.164ミリモル)および炭素上10%パラジウム(30mg、0.028ミリモル)の混合物を真空/窒素下で3x脱気処理に付した。反応物をパール(Parr)振盪器で4時間にわたって30psiで水素添加し、その時点で完了していると判断された。該混合物を真空/窒素下で3x脱気処理に付し、次に触媒を濾過で除去し、酢酸エチルおよびジクロロメタンで濯いだ。濾液とリンス液を合わせ、真空下で濃縮して表記化合物(98mg、0.163ミリモル、収率100%)を得、それを次の工程に直ちに用いた。LCMS 保持時間=0.89分間、MS ESI m/z=600.3(M+H)(方法3)
メチル 2-(1-(3-(2-アミノフェノキシ)プロピル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-1-(3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロピル)-7-メトキシ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(98mg、0.163ミリモル)のジクロロメタン(3mL)中の撹拌溶液をジオキサン中4M HCl(2mL)で処理した。該反応物を室温で18時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。 該混合物をジクロロメタンから3xに濃縮し、表記化合物を得、それを次の工程にて直ちに用いた。LCMS 保持時間=0.71分間、MS ESI m/z=544.2(M+H)(方法3)
3-(2-(1-(3-(2-アミノフェノキシ)プロピル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-5-(メトキシカルボニル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-1-イル)プロパン酸・3HCl(106mg、0.163ミリモル)およびトリエチルアミン(0.227mL、1.630ミリモル)のDMF(2mL)中の撹拌溶液をHATU(74.4mg、0.196ミリモル)で処理し、反応物を室温で3時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチル(30mL)中に注ぎ、該溶液を10%塩化リチウムで3回、ブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣をISCO GOLD24gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって20%~100%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(50mg、0.095ミリモル、収率58.4%)を得た。LCMS 保持時間=0.80分間、MS ESI m/z=526.2(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21、工程6および7に記載の条件を用いて、メチル 19-メトキシ-15-オキソ-7,8,14,15,16,17-ヘキサヒドロ-6H-ベンゾ[b]ベンゾ[4,5]イミダゾ[1,2-h]ピリド[3’,2’:4,5]ピロロ[2,1-j][1]オキサ[4,8,11]トリアザシクロテトラデシン-21-カルボキシレートおよびtert-ブチル ((1R,4R,7R)-1,4-ジメチル-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメートより製造され得る。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)(回転異性体) δ 9.35-9.16(m,1H)、8.36(brs,1H)、8.08(brd,J=7.6Hz,1H)、7.60(brd,J=4.6Hz,0.4H)、7.49-7.40(m,0.6H)、7.21-7.12(m,2H)、7.11-7.00(m,2H)、6.95-6.82(m,3H)、5.51-5.38(m,1H)、5.05(brdd,J=5.2、2.7Hz,1H)、4.97-4.82(m,2H)、4.55(brd,J=5.5Hz,0.4H)、4.35-4.20(m,0.6H)、3.95-3.80(m,1.4H)、3.70-3.60(m,0.6H)、3.57-3.50(m,0.4H)、3.22(brd,J=11.3Hz,0.6H)、3.00-2.76(m,2H)、2.70-2.64(m,0.6H)、2.30-2.13(m,1H)、2.10-1.75(m,5H)、1.72-1.57(m,1H);MS ESI m/z 606.3(M+H);分析性HPLC保持時間:1.37分間、(方法1)
((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロデカファン-5-エン-25-イル)メタノン
100mLのRBFに、ヘキサ-5-エン-1-オール(2g、19.97ミリモル)、トリエチルアミン(5.57ml、39.9ミリモル)および4-メチルベンゼンスルホニルクロリド(5.71g、30.0ミリモル)/DCM(39.9ml)を加えた。該混合物をDMAP(0.244g、1.997ミリモル)で処理した。該反応物を、KMnO4のステインで反応が完了していると決定されるまで、室温で撹拌した。該混合物を蒸発乾固させ、40gシリカカラムにロードし、MPLCに付し、0%~10%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(5.078g、収率100%)を得た。LCMS Tr=0.99分間、MS ESI m/z=255.2(M+H)(方法3)
20mLのバイアルに、1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒド(200mg、1.368ミリモル)、K2CO3(567mg、4.11ミリモル)/DMF(4562μl)を加えた。該溶液を室温で30分間撹拌した。混合物を撹拌し、ヘキサ-5-エン-1-イル 4-メチルベンゼンスルホネート(383mg、1.505ミリモル)で処理し、該溶液を、LCMSによって完了となるまで、80℃に加熱した。反応物を酢酸エチルにて希釈し、LiCl(10%)で3回、水で1回およびブラインで1回洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。該混合物をMPLCに付し、15%~25%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(150mg、収率48%)を得た。1H NMR(499MHz、DMSO-d6) δ 10.13-9.78(m,1H)、8.74-8.42(m,1H)、8.42-8.07(m,1H)、7.62-7.37(m,1H)、7.37-7.08(m,1H)、5.86-5.57(m,1H)、5.12-4.78(m,2H)、4.78-4.39(m,2H)、2.17-1.87(m,2H)、1.87-1.52(m,2H)、1.52-1.21(m,2H);LCMS Tr=0.97分間、MS ESI m/z=229.2(M+H)(方法3)
40mLのバイアルに、メチル 4-クロロ-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエート(2g、8.14ミリモル)、ヒューニッヒ塩基(2.84mL、16.29ミリモル)および(3-ブロモフェニル)メタナミン(3.03g、16.29ミリモル)/DMF(15mL)を加えた。該混合物を50℃で一夜加熱した。該混合物を酢酸エチルにて希釈し、LiCl 10%で2回、水で1回、およびブラインで1回洗浄した。該混合物をMPLCに付し、20%~30%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(2.783g、収率86%)を得た。LCMS Tr=1.04分間、MS ESI m/z=395.2(M+H)(方法3)
バイアルに、メチル 4-((3-ブロモベンジル)アミノ)-3-メトキシ-5-ニトロベンゾエート(1402mg、3.55ミリモル)および1-(ヘキサ-5-エン-1-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒド(810mg、3.55ミリモル)/エタノール/H2O(2:1)(35.5ml)を加えた。該混合物を1分間音波処理に付した。室温で15分間混合した後、亜ジチオン酸ナトリウム(1544mg、8.87ミリモル)を加え、反応物を80℃で一夜加熱した。エタノールを真空下で蒸発させた。該混合物を酢酸エチルにて希釈し、水で2回、ブラインで1回洗浄し、その後で硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。生成物をMPLCに付し、20%~30%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。
所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(409mg、収率20.1%)を得た。LCMS Tr=1.17分間、MS ESI m/z=575.4(M+H)(方法3)
20mLのバイアルに、メチル 1-(3-ブロモベンジル)-2-(1-(ヘキサ-5-エン-1-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(378mg、0.659ミリモル)、リン酸三カリウム・n水和物の粉末(1.483mL、2.97ミリモル)を、つづいて4,4,5,5-テトラメチル-2-ビニル-1,3,2-ジオキサボロラン(0.224mL、1.318ミリモル)/DMF(13.182mL)を加えた。該混合物を窒素で5分間パージし、その後でPdCl2(dppf)(48.2mg、0.066ミリモル)を加え、さらに5分間パージした。反応物に栓をし、80℃で撹拌した。1時間混合した後、反応を止めた。該混合物を酢酸エチルで希釈し、PTFE膜を通して濾過した。有機層をLiCl(10%)で2回、水で2回、ブラインで1回洗浄し、その後で硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発乾固させた。粗製物をMPLCに付し、0%~20%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(265.8mg、収率77%)を得た。1H NMR(499MHz、DMSO-d6) δ 8.48-8.31(m,1H)、8.15-8.06(m,1H)、8.06-7.98(m,1H)、7.51-7.40(m,1H)、7.40-7.27(m,1H)、7.27-7.14(m,2H)、7.04-6.89(m,2H)、6.86-6.71(m,1H)、6.66-6.43(m,1H)、5.93-5.80(m,2H)、5.68-5.55(m,1H)、5.55-5.41(m,1H)、5.22-5.05(m,1H)、4.88-4.69(m,2H)、4.58-4.38(m,2H)、4.12-3.98(m,2H)、3.94(s,3H)、3.91(s,3H)、1.99(s,3H)、1.90-1.67(m,2H)、1.48-1.28(m,2H)、1.15-1.04(m,2H);LCMS Tr=1.15分間、MS ESI m/z=521.4(M+H)(方法3)
サイドアームに還流冷却器および温度計を装着した100mLのRBFに、メチル 2-(1-(ヘキサ-5-エン-1-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-イル)-7-メトキシ-1-(3-ビニルベンジル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-5-カルボキシレート(19mg、0.036ミリモル)/DCE(10mL)を加えた。該溶液を10分間にわたって脱気処理に付し、その後でグラブス触媒(登録商標)のZ-Selective(2.320mg、3.65マイクロモル)を添加し、つづいて窒素下にて50℃で撹拌した。1時間後、さらに6mgのグラブス触媒(登録商標)Z-Selectiveを加え、温度を70℃に上げた。該混合物を真空下で蒸発させ、生成物をMPLCに付し、20%~40%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(15.2mg、収率85%)を得た。1H NMR(499MHz、クロロホルム-d) δ 8.54-8.33(m,1H)、8.30-8.12(m,1H)、8.09-7.81(m,1H)、7.52-7.39(m,1H)、7.39-7.31(m,1H)、7.31-7.20(m,1H)、7.20-7.05(m,1H)、7.04-6.86(m,2H)、6.76(s,1H)、6.29-6.07(m,2H、J=11.6 Hz)、6.01-5.76(m,1H)、5.73-5.55(m,1H、J=11.6 Hz)、5.31-5.13(m,1H)、5.13-4.84(m,1H)、4.10-4.01(m,3H)、4.01-3.87(m,3H)、2.44-2.19(m,1H)、2.01-1.86(m,1H)、1.86-1.74(m,1H)、1.70(brs,3H)、1.59-1.39(m,1H)、1.19-1.01(m,1H)、0.97-0.75(m,1H);LCMS Tr=1.15分間、MS ESI m/z=493.5(M+H)(方法3)
20mLのバイアルに、メチル (Z)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロデカファン-5-エン-25-カルボキシレート(52mg、0.106ミリモル)/MeOH/THF 2:1(1056μl)を加えた。混合物を撹拌し、NaOH(1M)(158μl、0.158ミリモル)で処理し、該バイアルを密封し、50℃で1時間撹拌した。さらに1mLのTHFを加え、基質を可溶化させた。終了後に、そのpHを5に調整し、つづいてEtOAc(5mL)で7回抽出した。有機層を合わせ、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。表記化合物を粗混合物(57mg、収率113%)として単離し、次の工程にてさらに精製することなく用いた。LCMS Tr=1.06分間、MS ESI m/z=479.3(M+H)(方法3)
(Z)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロデカファン-5-エン-25-カルボン酸(28mg、0.059ミリモル)、tert-ブチル ((1R,4R,7R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(13.66mg、0.064ミリモル)およびトリエチルアミン(0.024mL、0.176ミリモル)のジクロロメタン(1.5mL)中の撹拌溶液を(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート(28.5mg、0.064ミリモル)で処理した。該溶液を室温で一夜撹拌した。LCMSで生成物の塊を確認した後、該溶液をHCl(4N)(0.293mL、1.170ミリモル)で処理し、さらに2時間撹拌した。該混合物を真空下で濃縮した。該粗材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:エックスブリッジ C18、200mmx19mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;勾配:22%Bで0分間保持し、20分間にわたって22-62%Bとし、ついで100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSおよびUVシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をDMFで希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(21.5mg、収率63.5%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)(回転異性体) δ 8.56-8.29(m,1H)、8.26-7.92(m,1H)、7.61-7.47(m,0.5H)、7.46-7.36(m,1H)、7.33(s,1H)、7.31-7.22(m,1H)、7.21-7.08(m,1H)、7.00-6.90(m,1H)、6.89-6.83(m,1H)、6.64-6.48(m,0.5H)、6.24-6.04(m,2H)、5.95-5.74(m,1H)、5.65-5.47(m,1H)、5.31-4.93(m,1H)、4.90-4.63(m,1H)、4.55-4.33(m,0.4H)、4.20-4.06(m,0.5H)、4.02-3.91(m,2H)、3.91-3.88(m,1H)、2.48-2.42(m,6H)、2.34-2.09(m,1H)、2.04-1.90(m,1H)、1.89-1.85(m,1H)、1.84(brd,J=6.3Hz,1H)、1.74-1.50(m,2H)、1.48-1.24(m,2H)、0.86-0.57(m,1H);LCMS Tr=1.71分間、MS ESI m/z=573.1(M+H)(方法2)
((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)(27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロデカファン-25-イル)メタノン.
100mLのRBFに、実施例41、工程5の生成物、炭素上パラジウム5%スタンダード(5.19mg、2.436マイクロモル)を加えた。MeOH(3045μl)を窒素流下で乾燥試薬に加えた。該容器に、水素バルーンおよび窒素/真空ラインを支持する、3方向24/40バルブを装着した。そのシステムに窒素/真空のサイクルを、つづいて水素/真空のサイクルを3回フラッシュさせた。該システムを水素で飽和させ、LCMSによって完了となるまで、その溶液を室温で3時間撹拌した。該混合物をPTFEフィルターを通して濾過し、つづいて真空下で蒸発させた。表記化合物を単離し(15mg、収率100%)、次の工程にてさらに精製することなく用いた。LCMS Tr=1.14分間、MS ESI m/z=495.4(M+H)(方法3)
20mLのバイアルに、実施例42、工程1の生成物(12mg、0.024ミリモル)/MeOH/THF 2:1(970μl)を加えた。該混合物をLiOH(48.5μl、0.024ミリモル)で処理し、該バイアルを50℃で1時間撹拌した。pH を5に調整し、つづいて酢酸エチル(5mL)で7回抽出した。有機層を合わせ、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。表記化合物を粗混合物として単離し、次の工程にてさらに精製することなく用いた。LCMS Tr=0.98分間、MS ESI m/z=481.3(M+H)(方法3)
27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロデカファン-25-カルボン酸(13mg、0.027ミリモル)、tert-ブチル ((1R,4R,7R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(6.32mg、0.030ミリモル)およびトリエチルアミン(0.011mL、0.081ミリモル)のジクロロメタン(1.5mL)中の撹拌溶液を(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート(13.16mg、0.030ミリモル)で処理した。該溶液を室温で一夜撹拌した。LCMSによって完了と判断された後、該溶液をHCl(4N)(0.135mL、0.541ミリモル)で処理した。該混合物を1時間撹拌した。該混合物を真空下で濃縮した。該粗材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:エックスブリッジ C18、200mmx19mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;勾配:23%Bで0分間保持し、20分間にわたって23-63%Bとし、次に100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をDMFで希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(10mg、収率64%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)(回転異性体) δ 8.55-8.20(m,1H)、8.17-7.91(m,1H)、7.51(brd,J=8.9Hz,1H)、7.44-7.35(m,0.6H)、7.27-7.19(m,1H)、7.19-7.12(m,1H)、7.14-7.01(m,1H)、7.00-6.91(m,0.6H)、6.90-6.83(m,0.7H)、6.36-6.22(m,0.7H)、6.20-6.04(m,1H)、6.03-5.90(m,0.7H)、4.93-4.64(m,2H)、4.61-4.37(m,0.5H)、4.30-4.12(m,0.5H)、4.10-4.01(m,2H)、3.98-3.90(m,0.4H)、3.60-3.29(m,2H)、3.20-2.98(m,1H)、2.94(s,0.3H)、2.69-2.57(m,1H)、2.10-1.76(m,4H)、1.73-1.52(m,1H)、1.49-1.09(m,4H)、1.06-0.89(m,1H)、0.87-0.61(m,2H)、0.46(brd,J=11.9Hz,2H);LCMS Tr=1.71分間、MS ESI m/z=574.9(M+H)(方法2)
((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((53R,54R)-27-メトキシ-51-メチル-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-5(3,4)-ピロリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン
バイアル中にて、LDA/THF(193μl、0.386ミリモル)を実施例41、工程5の生成物(38mg、0.077ミリモル)およびトリメチルアミン-n-オキシド(10.43mg、0.139ミリモル)のTHF(4286μl)中溶液に0℃で添加した。さらに等量のトリメチルアミン-n-オキシド(10.43mg、0.139ミリモル)を加え、反応の完了を促進させた。LCMSによって完了していると判断されると、反応物を50%塩化アンモニウムでクエンチさせ、酢酸エチルで抽出した。表記化合物を粗混合物として単離し(59mg、収率139%)、次の工程にてさらに精製することなく用いた。LCMS Tr=0.77分間、MS ESI m/z=550.3(M+H)(方法3)
4mLのバイアルに、メチル (53R,54R)-27-メトキシ-51-メチル-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-5(3,4)-ピロリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボキシレート(59mg、0.107ミリモル)および水酸化リチウム・一水和物(5.40mg、0.129ミリモル)/THF/H2O 50:50(1073μl)を加えた。反応物を17時間撹拌し、その後でさらなるLiOH 0.5M(322μl、0.161ミリモル)を添加した。終了した後、そのpHを7に調整し、酢酸エチルで6回抽出し、その後で硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。表記化合物を粗混合物として単離し(46mg、収率80%)、次の工程にてさらに精製することなく用いた。LCMS Tr=1.32分間、MS ESI m/z=536.3(M+H)(方法3)
(53R,54R)-27-メトキシ-51-メチル-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-5(3,4)-ピロリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロノナファン-25-カルボン酸(46mg、0.043ミリモル)、tert-ブチル ((1R,4R,7R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(10.03mg、0.047ミリモル)およびヒューニッヒ塩基(37.5μl、0.215ミリモル)のジクロロメタン(2.1mL)中の撹拌溶液を((1H-ベンゾ[d][1,2,3]トリアゾール-1-イル) オキシ) トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート(V)(20.89mg、0.047ミリモル)で処理した。該溶液を室温で一夜撹拌した。LCMSによって生成物を確認した後、該溶液を塩化水素(4N)(215μl、0.859ミリモル)で処理した。該溶液を2時間撹拌し、その後で真空下で蒸発させた。該粗材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:アジレント・ボーナス(Agilent Bonus)RP C18 2.6μM、200mmx21.2mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+酢酸アンモニウム;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+酢酸アンモニウム;勾配:0%Bで4分間保持し、20分間にわたって0-100%Bとし、次に100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をDMFで希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(3.6mg、収率13%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6) δ 8.63-7.91(m,3H)、7.41(brs,7H)、6.78-5.69(m,2H)、5.31(brs,1H)、4.91-4.41(m,2H)、4.28-2.63(m,11H)、2.38-1.58(m,5H)、1.54-0.55(m,8H)、0.08(brs,3H)
LCMS Tr=1.13分間、MS ESI m/z=629.9(M+H)(方法2)
((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)((51S,52R)-53,53-ジフルオロ-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナ-5(1,2)-シクロプロパナシクロノナファン-25-イル)メタノン
2.5mLのマイクロ波バイアルに、実施例41、工程5の生成物(105mg、0.213ミリモル)およびヨウ化ナトリウム(32.0mg、0.213ミリモル)を加え、該バイアルをエバキュエートさせ、N2で3回埋め戻した。該バイアルに、アセトニトリル(2132μl)を、次にトリメチル(トリフルオロメチル)シラン(315μl、2.132ミリモル)を添加した。バイアルを、バイオタージ(Biotage)Initatior Plus MWを高吸光度(低出力)で用いて80℃に加熱した。さらに5当量のヨウ化ナトリウムおよび2.5当量のトリメチル(トリフルオロメチル)シランを該バイアルに添加した。LCMSで出発材料のわずか15%が観察されるようになるまで、0.3mLのTMSCF3の添加が(蒸発が原因で)15分毎に必要であった。反応物を2滴の水でクエンチさせ、セライトを通して濾過し、酢酸エチルで洗浄した。該混合物を蒸発乾固させ、アセトニトリルを取り除き、酢酸エチルに再び溶かし、50%水/ブライン溶液で抽出し、残りのいずれのヨウ化ナトリウムも除去した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。生成物をMPLCに付し、20%~30%酢酸エチル/ヘキサンの勾配を用いて精製した。所望の生成物を含有するフラクションを集め、真空下で濃縮して表記化合物(72.4mg、収率62.4%)を得た。LCMS Tr=1.05分間、MS ESI m/z=543.3(M+H)(方法3)
20mLのバイアルに、メチル (51R,52R)-53,53-ジフルオロ-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナ-5(1,2)-シクロプロパナシクロノナファン-25-カルボキシレート(51mg、0.094ミリモル)/MeOH/THF 2:1(940μl)を添加した。該混合物を撹拌し、NaOH(1M)(141μl、0.141ミリモル)で処理し、該バイアルを密封して、50℃で1時間、つづいて室温で一夜撹拌した。そのpHを6に調整し、水層を酢酸エチル(5mL)で7回抽出し、つづいて該有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥させ、蒸発乾固させた。表記化合物を粗混合物として単離し(56mg、収率113%)、次の工程にてさらに精製することなく用いた。LCMS Tr=1.04分間、MS ESI m/z=529.3(M+H)(方法3)
(51R,52R)-53,53-ジフルオロ-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナ-5(1,2)-シクロプロパナシクロノナファン-25-カルボン酸(28mg、0.053ミリモル)、tert-ブチル ((1R,4R,7R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-7-イル)カルバメート(12.37mg、0.058ミリモル)およびトリエチルアミン(0.022mL、0.159ミリモル)のDCM(1.5mL)中の撹拌溶液を、((1H-ベンゾ[d][1,2,3]トリアゾール-1-イル)オキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート(V)(25.8mg、0.058ミリモル)で処理した。該溶液を室温で一夜撹拌した。LCMSで生成物が確認された後、該溶液をHCl(4N)(0.265mL、1.059ミリモル)で処理した。該溶液を2時間撹拌し、その後で真空下で蒸発させた。該粗材料を分取性LC/MSを介して次の条件:カラム:エックスブリッジ C18、200mmx19mm、5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;移動相B:95:5 アセトニトリル:水+0.05%トリフルオロ酢酸;勾配:22%Bで0分間保持し、20分間にわたって22-62%Bとし、次に100%Bで0分間保持する;流速:20mL/分;カラム温度:25℃を用いて精製した。フラクションの収集はMSおよびUVシグナルによって始められた。所望の生成物を含有するフラクションを合わせ、遠心蒸発を介して乾燥させた。次に精製した材料をDMFで希釈し、Si-ピリジンで処理し、最低でも2時間振盪させた。得られた混合物を濾過し、遠心蒸発を介して乾燥させ、表記化合物(20.5mg、収率52.1%)を得た。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)(回転異性体) δ 8.54-7.94(m,2H)、7.77-6.83(m,8H)、6.67-5.82(m,3H)、5.07-4.44(m,2H)、4.16(brs,2H)、3.99(brs,1H)、3.39-3.07(m,1H)、2.82(brs,1H)、2.41(s,1H)、1.91(s,9H)、0.82-0.03(m,3H)(メトキシ メチル(3)プロトンは水のピークの下にある);LCMS Tr=1.71分間、MS ESI m/z=623.3(M+H)(方法2)
((3R,5R)-3-アミノ-5-フルオロピペリジン-1-イル)((Z)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(1,3)-ベンゼナシクロデカファン-5-エン-25-イル)メタノン
((3R,5R)-3-アミノ-5-フルオロピペリジン-1-イル)(16-(2-ヒドロキシプロパン-2-イル)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,5)-ピリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン
6-クロロ-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルボン酸(1.06g、5.39ミリモル)、N,O-ジメチルヒドロキシルアミン・塩酸(0.631g、6.47ミリモル)、HOBt・水和物(1.239g、8.09ミリモル)、およびトリエチルアミン(3.76mL、27.0ミリモル)のジクロロメタン(10mL)中の撹拌溶液をEDC(1.550g、8.09ミリモル)で処理した。該反応物を室温で18時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチル(100mL)で希釈し、水で2回、ブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を80gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって20%~50%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で60mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(0.73g、3.05ミリモル、収率56.5%)を無色の固体として得た。LCMS 保持時間=1.17分間、MS ESI m/z=240.1(M+H)(方法3)
6-クロロ-N-メトキシ-N-メチル-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルボキシアミド(680mg、2.84ミリモル)、トリブチル (1-エトキシビニル)スタンナン(2.368mL、7.09ミリモル)、およびキサントホス(328mg、0.567ミリモル)のジオキサン(10mL)中の撹拌溶液を、窒素を10分間通気することで、脱気処理に付した。該混合物をPd2(dba)3(260mg、0.284ミリモル)で処理し、さらに5分間脱気処理に付した。該バイアルを密封し、反応物を110℃で18時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。固体を濾過で除去し、THFで濯ぎ、次に濾液およびリンス液を合わせ、1M HCl(5mL)で処理した。該混合物を室温で2時間撹拌し、その時点でLCMSは中間体のビニルエーテルが所望のケトンに完全に変換したことを示した。有機溶媒を蒸発させ、残りの水性混合物を飽和炭酸水素ナトリウムで処理した。10分間撹拌した後、該混合物を酢酸エチルで3回抽出した。有機相を合わせ、ブラインで洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を80gシリカゲルカラム上のMPLC(20カラム容量にわたって10%~100%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で60mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(500mg、2.022ミリモル、収率71.3%)をコハク色の固体として得た。LCMS 保持時間=0.72分間、MS ESI m/z=248.2(M+H)(方法3)
6-アセチル-N-メトキシ-N-メチル-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルボキシアミド(500mg、2.022ミリモル)、Boc-無水物(704μl、3.03ミリモル)、およびトリエチルアミン(564μl、4.04ミリモル)のTHF中の撹拌溶液をDMAP(247mg、2.022ミリモル)で処理した。該反応物を室温で4時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチルで希釈し、その混濁した溶液を水で3回、ブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣を40gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって0%~70%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(640mg、1.842ミリモル、収率91%)を得た。LCMS 保持時間=0.83分間、MS ESI m/z=348.1(M+H)(方法3)
乾燥フラスコにおいて、tert-ブチル 6-アセチル-2-(メトキシ(メチル)カルバモイル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-1-カルボキシレート(600mg、1.727ミリモル)の無水THF(10mL)中の撹拌溶液を-78℃に冷却し、塩化メチルマグネシウム(エーテル中3M)(0.691mL、2.073ミリモル)を滴下して処理した。反応物を-78℃で2時間撹拌し、次に半飽和塩化アンモニウムでクエンチさせた。該混合物を室温となるようにした。混濁した混合物を酢酸エチルで3回抽出し、次に有機相を合わせ、ブラインで洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣をISCO GOLD40gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって15%~35%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮してtert-ブチル 6-(2-ヒドロキシプロパン-2-イル)-2-(メトキシ(メチル)カルバモイル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-1-カルボキシレート(287mg、0.790ミリモル、収率45.7%)をわずかにアンバー色の固体として得た。LCMS 保持時間=0.74分間、MS ESI m/z=364.2(M+H)(方法3)。tert-ブチル 6-(2-ヒドロキシプロパン-2-イル)-2-(メトキシ(メチル)カルバモイル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-1-カルボキシレート(387mg、1.065ミリモル)のジクロロメタン(5mL)中の撹拌溶液をTFA(2mL)で処理した。該反応物を室温で1時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を真空下で濃縮し、残渣を酢酸エチルと飽和炭酸ナトリウムの間に分配した。10分間撹拌した後、層を分離し、有機相を飽和炭酸ナトリウムで2回洗浄した。水相を合わせ、酢酸エチルで2回抽出し、次に有機相を合わせ、ブラインで洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮して表記化合物(259mg、0.984ミリモル、収率92%)を得た。LCMS 保持時間=0.62分間、MS ESI m/z=264.2(M+H)(方法3)
40mLのシンチレーションバイアルにおいて、6-(2-ヒドロキシプロパン-2-イル)-N-メトキシ-N-メチル-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルボキシアミド(259mg、0.984ミリモル)および炭酸カリウム(408mg、2.95ミリモル)の無水DMF(3mL)中の撹拌混合物を、4-(2-ブロモフェニル)ブチル 4-メチルベンゼンスルホネート(377mg、0.984ミリモル)で処理した。該バイアルを密封し、反応物をを70℃で48時間撹拌し、その時点でLCMSによって反応が完了していると判断された。該混合物を酢酸エチル(25mL)で希釈し、その混濁した溶液を水で1回、10%塩化リチウム溶液で2回、およびブラインで1回洗浄し、次に硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。該残渣をセライト上に吸着させ、40gシリカゲルカラム上のMPLC(15カラム容量にわたって0%~100%の酢酸エチル/ヘキサンの勾配で40mL/分で溶出する)を介するクロマトグラフィーに付した。所望の生成物を含有するフラクションをプールし、真空下で濃縮して表記化合物(400mg、0.843ミリモル、収率86%)を得た。LCMS 保持時間=1.04分間、MS ESI m/z=474.1(M+H)(方法3)
表記化合物は、実施例21を用いて、1-(4-(2-ブロモフェニル)ブチル)-6-(2-ヒドロキシプロパン-2-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-2-カルバルデヒドより製造され得る。1H NMR(500MHz、クロロホルム-d) δ 8.83(dd,J=7.5、1.9Hz,1H)、8.38(t,J=2.1Hz,1H)、7.99(d,J=8.2Hz,1H)、7.50(d,J=5.4Hz,1H)、7.28-7.23(m,1H)、7.22-7.17(m,2H)、7.15(d,J=7.5Hz,1H)、7.08(ddd,J=7.5、3.4、1.2Hz,1H)、7.07-7.03(m,1H)、7.03-7.00(m,1H)、6.99(s,1H)、6.25(d,J=15.0Hz,1H)、6.08(d,J=15.0Hz,1H)、5.29(brd,J=6.0Hz,1H)、5.16-4.65(m,4H)、4.18(s,3H)、3.37(brs,1H)、3.28-3.10(m,1H)、2.88-2.51(m,1H)、2.47-2.33(m,2H)、1.93-1.83(m,1H)、1.80-1.68(m,1H)、1.61(s,6H)、1.59-1.45(m,3H)、1.20-1.05(m,1H)、0.81-0.62(m,1H);LCMS 保持時間=0.73分間、MS ESI m/z=688.3(M+H)(方法3)
((1R,4R,7R)-7-アミノ-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)(16-(2-ヒドロキシプロパン-2-イル)-27-メトキシ-11H,21H-1,2(2,1)-ジピロロ[2,3-b]ピリジナ-4(3,5)-ピリジナ-5(1,2)-ベンゼナシクロノナファン-25-イル)メタノン
LCMS 保持時間=0.69分間、MS ESI m/z=682.4(M+H)(方法3)
本発明の化合物をPAD4の阻害剤として以下に記載のアッセイプロトコルを用いてアッセイした。
化合物を100%DMSOに可溶化させ、化合物の濃度を10mMとした。化合物のストック溶液を室温で貯蔵した。一連の希釈液をDMSO中にて調製し、20μLの混合容量で8回混合した。該アッセイにおける化合物の最終の最高濃度は50μMである。最終のアッセイ条件は次のとおり:
反応容量:26μl
アッセイ緩衝液:25mM Hepes、pH7.5、5mM NaCl、1mM DTT、0.2mg/ml BSA、0.01%CHAPS、50μMカルシウム、および5μM TPEN
最終濃度:5nM hPAD4酵素、250μM BAEE、および0.5%DMSO
総インキュベーション時間:37℃で30分間の化合物および酵素のプレインキュベーションに、37℃で90分間の酵素/基質反応に、および30分間のフェニルグリオキサールとの反応に付す
停止溶液:40μlのACN中5%TCA
であった。
表4. PAD4活性
Claims (21)
- 式(II):
[式中:
Qは、NおよびCHからなる群より選択され;
は
からなる群より選択され;
A1はC1-4アルキル(0~2個のR1で置換される)であり;該C1-4アルキレンの1または複数のメチレン単位は、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)で置き換えられてもよく;
A2は、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A3は、C3-6シクロアルキル、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
ただし、A 2 およびA 3 の両方が(A 2 ) 0 および(A 3 ) 0 であることはなく;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;該C3-7アルキレンの1ないし3個のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子に直に結合するものを除き、O、S(O)p、NH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)で置き換えられてもよく;
R1は、F、Cl、および-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、CN、=O、およびC(=O)NRaRaからなる群より選択され;
R3は、F、Cl、Br、および-OC1-4アルキルからなる群より選択され;
R4は、F、Cl、C1-5アルキル、C1-5ハロアルキルおよびC1-5ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;
Raは、それぞれ、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択され;
Rbは、それぞれ、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択され;および
pは、それぞれ、0、1、および2より選択される整数である]
で示される化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(III):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A2は、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A3は、C3-6シクロアルキル、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;該C3-7アルキレンの1または複数のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子と直に結合するものを除き、O、S(O)p、NH、およびN(C1-4アルキル)で置き換えられてもよく;
R1は、F、Cl、および-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、CN、=O、およびC(=O)NRaRaからなる群より選択され;
R3は、F、Cl、Br、および-OC1-4アルキルからなる群より選択され;
R4は、F、C1-4アルキル、C1-4ハロアルキルおよびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;
Raは、それぞれ、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択され;および
Rbは、それぞれ、HおよびC1-5アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される、請求項1に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(IV):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A2は、C6アリール、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む5員または6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;該C3-7アルキレンの1または複数のメチレン単位は、O、NH、およびN(C1-4アルキル)で置き換えられてもよく;
R1は、Fおよび-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、CN、=O、およびC(=O)NRaRaからなる群より選択され;および
R4は、C1-3アルキル、C1-3ハロアルキルおよびC1-3ヒドロキシアルキルからなる群より選択される]
で示される、請求項2に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(V):
[式中:
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;該C3-7アルキレンの1または複数のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子と直に結合するものを除き、O、およびNHで置き換えられてもよく;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;
R2は、F、CN、およびC(=O)NH2からなる群より選択され;および
R4は、C1-4ハロアルキルおよびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より選択される]
で示される、請求項3に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - A4が、C3-7アルキレン、-OC 3-6 アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択される、請求項4に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。
- 式(VI):
[式中:
A4は、C3-7アルキレン、-OC 3-6 アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R1は-ORbおよびC1-3アルキルからなる群より選択され;
R2はFおよびCNからなる群より選択され;
R3は-OC1-4アルキルであり;
R4はC1-3ハロアルキルおよびC1-3ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;および
Rbは、それぞれ、HおよびC1-3アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される、請求項3に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 -
が
であり;
A4がC3-5アルキレンであって;
R3が-OCH3である、請求項6に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(VII):
[式中:
A2は
からなる群より選択され;
A4は、C3-6アルキレン、-OC3-6アルキレン、およびC3-6アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;および
R2は、Fおよび=Oからなる群より選択される]
で示される、請求項3に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(VIII):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A3は、C3-6シクロアルキル、および炭素原子と、N、OおよびS(O)pから選択される1~4個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;該C3-7アルキレンの1または2個のメチレン単位は、O、S(O)p、NH、およびN(C1-4アルキル)で置き換えられてもよく;
R1は、Fおよび-ORbからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、およびCNからなる群より選択され;
R3は、F、Cl、および-OC1-4アルキルからなる群より選択され;
R4は、C1-4アルキル、C1-4ハロアルキルおよびC1-4ヒドロキシアルキルからなる群より選択され;
Raは、それぞれ、HおよびC1-4アルキルからなる群より独立して選択され;および
Rbは、それぞれ、HおよびC1-4アルキルからなる群より独立して選択される]
で示される、請求項2に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - A3が、シクロプロピル(0~2個のR2で置換される)および
からなる群より選択され;
A4が、C3-7アルキレン、-OC 3-6 アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~5個のR1で置換され;
R2が、FおよびClからなる群より選択され;および
R3が-OCH3である、
請求項9に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(IX):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A2は、C6アリール、および炭素原子と、Nより選択される1~2個のヘテロ原子とを含む4員ないし6員のヘテロシクリルからなる群より選択され、各々が0~2個のR2で置換され;
A4は、C3-7アルキレンおよびC3-7アルケニレンからなる群より選択され、各々が0~3個のR1で置換され;該C3-7アルキレンの1~3個のメチレン単位は、インドールまたはピロロピリジン部分の窒素原子と直に結合するものを除き、O、およびC(=O)で置き換えられてもよく;
R1は、F、Cl、および-OHからなる群より選択され;
R2は、F、Cl、およびCNからなる群より選択され;および
R3は、F、Cl、および-OC1-4アルキルからなる群より選択される]
で示される、請求項1に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(X):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A4は、C3-7アルキレン(0~3個のR1で置換される)、-OC 3-6 アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され;
R1は、Fおよび-OHからなる群より選択され;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される、請求項11に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - A2が
であり;
A4が、C4-7アルキレンおよびC4-7アルケニレンからなる群より選択され;および
R3が-OCH3である、
請求項11に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(XI):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A1はC1-3アルキレンであって、該C1-3アルキレンの1または2個のメチレン単位はNH、N(C1-4アルキル)、およびC(=O)で置き換えられており;
A4は、C3-7アルキレン、-OC 3-6 アルキレン、およびC3-7アルケニレンからなる群より選択され;および
R3は、F、Cl、および-OC1-4アルキルからなる群より選択される]
で示される、請求項1に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 式(XII):
[式中:
は
からなる群より選択され;
A1はC1-2アルキレンであり;
A4はC3-7アルキレンであり、該C3-7アルキレンの最初の2個のメチレン単位がS(=O)2-NHまたはS(=O)2-N(C1-3アルキル)で置き換えられており;および
R3は-OC1-4アルキルである]
で示される、請求項1に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩。 - 請求項1~15のいずれか1項に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩、および医薬的に許容される担体、補助剤または賦形剤を含む、医薬的に許容される組成物。
- さらなる治療剤と組み合わせた、請求項16に記載の組成物。
- PAD4を阻害するための、請求項1~15のいずれか1項に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩を含む、医薬組成物。
- 急性リンパ性白血病、強直性脊椎炎、がん、慢性リンパ性白血病、大腸炎、狼瘡、関節リウマチ、多発性硬化症、および潰瘍性大腸炎からなる群より選択されるPAD4介在性疾患、障害または症状を治療するための、請求項1~15のいずれか1項に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩を含む、医薬組成物。
- PAD4介在性疾患、障害または症状が、関節リウマチ、潰瘍性大腸炎、およびがんから選択される、請求項19に記載の医薬組成物。
- 治療に用いるための請求項1~15のいずれか1項に記載の化合物、またはその医薬的に許容される塩を含む、医薬組成物。
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