JP7791815B2 - 蛍光性ベータラクタマーゼ基質および関連する検出方法 - Google Patents
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Description
本発明は、β-ラクタマーゼ型酵素活性の検出のためのプローブに関する。特に、本発明は、触媒活性β-ラクタマーゼの存在を検出するための新規な蛍光性基質およびそのような基質を使用する検出方法に関する。
[背景技術]
β-ラクタム抗生物質は、その構造にβ-ラクタム環を含有する周知のクラスの抗生物質である。しかし、細菌は、抗生物質のβ-ラクタム環の加水分解を促進する酵素であるβラクタマーゼを産生することによって、これらの抗生物質に対する耐性を獲得する傾向があり、これにより、薬剤を無効にすることができる。細菌耐性は、世界的な問題となっている。抗生物質耐性菌の中で、カルバペネム系薬剤に対して耐性を獲得するものは現在治療ができないとされている。実際に病院では、それらを保有する患者がこの感染症で死亡する確率は50%である。
(a)大きなストークスシフトはしばしば130nmを超え、250nmの値に達することができ、これは、検出の感度を最大にする器具選択を可能にする;これは細胞および組織の構成要素による自己蛍光から逃れること/自己蛍光を無視することによる;
(b)固体状態(すべての既知のフルオロフォアの中でまれな特性である)において、輝く蛍光を発光するフルオロフォアを設計する能力。この最後の特性は、拡散によって引き起こされる最小限の希釈で、活性化部位で高強度シグナルを生成することを可能にする;
(c)組織の透明性が最大である、赤色または近赤外線(600~850nm)を発するESIPTフルオロフォアを設計する能力;このようなフルオロフォアを使用するプローブはまた、生きている動物におけるイメージングに特に適している;そして最後に、
(d)ESIPTフルオロフォアのヒドロキシルが含む水素原子を、化学的または生化学的分析対象物に関して特異的な反応性を有する置換基であって、この置換基の開裂が蛍光の出現を引き起こす置換基に置き換えることによって、蛍光を発しない基質を設計する能力。
本発明は第一に、式(I)の化合物に関する。
-Wは-O-または-NR13-であり、R13はC1-C4アルキルまたは水素原子であり;
-R1は、式(I)に存在する-C(O)-WR1結合の切断後に得られるHWR1が、フルオロフォアのクラス、好ましくは励起状態で分子内陽子移動をもたらすフルオロフォアのクラスに属するようなものであり;
-R2、R3およびR4は次のいずれかのように定義される:
○ R2はC1-C4アルキルであり、R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R4はC1-C4アルキルであるか;
○ または、R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R2とR4とが互いに結合され、R2からR4への方向で-(CH2)p-Yq-(CH2)r-鎖を形成し、
● YはO、NR14、N(R14)2 +またはSであり、好ましくはNR14またはN(R14)2 +であり、
● p=0、1、2、3、4または5、
● q=0または1、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6、
● それぞれのR14は独立に、水素原子、C1-C6アルキル、アミノ保護基、または-(L)q-GPを表し、qは0または1に等しく、Lは結合アームであり、GPは親水性基であるか;
○ または、R2はC1-C4アルキルであり、R3とR4とが互いに結合し、それらが結合する炭素原子と共に脂肪族炭素環を形成し;
-R5とR6とは同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子、C1-C4アルキル、またはC5-C10アリールを表し;
-R7は、水素原子、またはC1-C4アルキルおよびC1-C4アルコキシから選択される基であり;
-R8は、水素原子を表し;
-Vは、酸素原子または硫黄原子を表し;
-nは0または1であり;
-Zは-S-、-SO-、または-CR9R10-であり;R9およびR10は同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子またはC1-C4アルキルを表し;
-QはH、カチオンまたはR16であり、ここでR16はC1-C6アルキルであり、任意にアリールまたはO-(CO)-Rで置換され、Rは独立してH、C1-C6アルキルおよびC3-C6シクロアルキルから選択され;
-R11はオルガニル基、オルガニルアミノ基、オルガニルオキシ基、またはオルガニルチオ基であり、
-Xは結合、または
-強力な蛍光を発生させることによる、拡張スペクトラムβ-ラクタマーゼ(ESBL)メンバーの活性、またはカルバペネマーゼの活性に対する迅速な応答;
-酵素変換時における、酵素活性部位でのシグナル保持のユニークな特性が認識された「ELF97アルコール」を含むフルオロフォア、好ましくはESIPTフルオロフォアの放出;及び
-標的酵素活性の非存在下では、大部分または完全に非蛍光性であり、したがって、有利なシグナル対バックグラウンド比を介して検出感度を最大にする。
-分析する試料を化合物(I)と接触するように置くこと
-C(=V)とNR7との間の共有結合を開裂させ、続いて-C(O)-WR1を開裂させて、結合し、HWR1の放出をもたらすことによる蛍光沈殿物の形成を可能にするために、適切な条件を適用すること、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析を試料中のβ-ラクタマーゼの有無との相関。
-R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R11、Z、n、Q、X、およびVは化合物(I)に対して定義されるとおりであり、
-R12は、水素原子またはアミン官能保護基を表す。
-本明細書で定義される化合物(II)の実施
-式(III)の化合物の実施
〔定義〕
「脂肪族複素環」とは、本発明の文脈において、置換されているかまたは置換されていない飽和環であって、3~20員、好ましくは5~10員、さらに好ましくは5、6、7または8員を含み、O、NまたはSなどの少なくとも1つのヘテロ原子を含むものであると理解される。
「オルガニルオキシ基」とは、任意の有機置換基であると理解され、機能型に関わらず、酸素原子に、前記オルガニル基を化合物に結合するために使用される1つの遊離原子価を有する。
本発明は、式(I)の化合物に関する。
-Wは-O-または-NR13-であり、R13はC1-C4アルキルまたは水素原子であり;
-R1は、式(I)に存在する-C(O)-WR1結合の切断後に得られるHWR1が、フルオロフォアのクラス、好ましくは励起状態で分子内陽子移動をもたらすフルオロフォアのクラスに属するようなものであり;
-R2、R3およびR4は次のいずれかのように定義される:
○ R2はC1-C4アルキルであり、R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R4はC1-C4アルキルであるか;
○ または、R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R2とR4とが互いに結合され、R2からR4への方向で-(CH2)p-Yq-(CH2)r-鎖を形成し、
● YはO、NR14、N(R14)2 +またはSであり、好ましくはNR14またはN(R14)2 +であり、
● p=0、1、2、3、4または5、
● q=0または1、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6、
● それぞれのR14は独立に、水素原子、C1-C6アルキル、アミノ保護基、または-(L)q-GPを表し、qは0または1に等しく、Lは結合アームであり、GPは親水性基であるか;
○ または、R2はC1-C4アルキルであり、R3とR4とが互いに結合し、それらが結合する炭素原子と共に脂肪族炭素環を形成し;
-R5とR6とは同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子、C1-C4アルキル、またはC5-C10アリールを表し;
-R7は、水素原子、またはC1-C4アルキルおよびC1-C4アルコキシから選択される基であり;
-R8は、水素原子を表し;
-Vは、酸素原子または硫黄原子を表し;
-nは0または1であり;
-Zは-S-、-SO-、または-CR9R10-であり;R9およびR10は同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子またはC1-C4アルキルを表し;
-QはH、カチオンまたはR16であり、ここでR16はC1-C6アルキルであり、任意にアリールまたはO-(CO)-Rで置換され、Rは独立してH、C1-C6アルキルおよびC3-C6シクロアルキルから選択され;
-R11はオルガニル基、オルガニルアミノ基、オルガニルオキシ基、またはオルガニルチオ基であり、
-Xは結合、または
-X2は酸素原子であり、X1は-NH2、-OH、-SH、C1-C20アルキル、C5-C24アリール、C2-C6アルケニル、-O-(C1-C20アルキル)、-O-フェニル、-NH-(C1-C20アルキル)、-NH-フェニル、-S-(C1-C20アルキル)、または-S-(C5-C24アリール基)であり、前記アルキル、アリール、アルケニル、およびフェニルの基は任意に置換されているか;
または、X2は窒素原子を表し、CH、O、S、NまたはNHを表すX1に結合され、任意で置換されているC5-C24ヘテロアリールを形成しているか、のいずれかであり;
-
前記基は任意で置換されており;
X3はS、OまたはNRdを表し、Rdは水素原子またはC1-C4アルキル基を表す。
-
○ Tは-NH-C(O)-、-S-、-O-、-NH-、-N(C1-C20アルキル)-または-N(C5-C24アリール)-であり;
○ Reは水素原子または-CNもしくは-COORhなどの電子求引基であり、RhはC1-C4アルキル基を表すか、またはReは-CONRiRjであり、RiおよびRjは、同一であるか、または異なっており、RiおよびRjは水素原子もしくはC1-C4アルキル基を表すか、またはReは-CF3、C2-C6アルケニル、またはヘテロアリールであり、前記ヘテロアリールおよびアルケニルは任意に置換されており;
○ Rfは水素原子、塩素、臭素、ヨウ素またはフッ素原子、-OH、- NH2、-NRkRI、-NHRkまたは-ORkであり、RkおよびRIは、同一であるか、または異なっており、RkおよびRIは、それぞれ独立して、C1-C4アルキル基を表し;
○ または、ReおよびRfは、それぞれ互いに結合して、4または5員を含む炭化水素鎖を形成し、飽和または不飽和であり、置換されているか、または非置換であり、N、SおよびOの中から選択される1つ以上のヘテロ原子によって隔てられていてもよく;
○ Rgは、水素原子、Br、Cl、IまたはF原子であり;
-
○ T’は-NH2、-OH、C5-C24アリール基、C1-C4アルキル基、-SH、-NHR’g、-OR’g、-NR’gRh’、-SR’g、または任意に置換されたC2-C6アルケニル基、またはヘテロアリールであり、R’gおよびRh’は同一であるか、または異なっており、C1-C4アルキル基またはC5-C24アリール基を表し;
○ R’eは水素原子または-CNもしくは-COOR’iなどの電子求引基であり、R’iはC1-C4アルキル基を表すか、またはR’eは-CONR’jR’kであり、R’jおよびR’kは同一であるか、または異なっており、水素原子、もしくはC1-C4アルキル基を表すか、またはR’eは-CF3、もしくは2-オキサゾリル、2-チアゾリル、2-イミダゾリル、2-ベンゾイミダゾリル、4-ピリミジノン-2-イルもしくはキナゾリノン-2-イル基である;
○ R’fは水素原子、塩素、臭素、ヨウ素、フッ素原子、-OH、-NH2、-NR’IR’m、またはOR’Iであり、R’IおよびR’mは同一であるか、または異なっており、C1-C4アルキル基を表し;
○ またはR’eおよびR’fはそれぞれ互いに結合して、4または5員を含む炭化水素鎖を形成し、飽和または不飽和であり、置換されているか、または非置換であり、N、SおよびOの中から選択される1つ以上のヘテロ原子によって隔てられていてもよく;
-
-X’2は酸素原子であり、X’1は-NH2、-OH、-SH、C1-C20アルキル、C5-C24アリール、C2-C6アルケニル、-O-(C1-C20アルキル)、-O-フェニル、-NH-(C1-C20アルキル)、-NH-フェニル、-S-(C1-C20アルキル)、または-S-(C5-C24アリール基)であり、前記アルキル基、アリール基、アルケニル基、およびフェニル基は、任意に置換されているか;
または、X2は窒素原子を表し、CH、O、S、NまたはNHを表すX1に結合され、任意で置換されているC5-C24ヘテロアリールを形成しているか、のいずれかであり;
-
● YはO、NR14、N(R14)2 +またはSであり、好ましくはNR14またはN(R14)2 +であり、
● p=0、1、2、3、4または5、
● q=0または1、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6、
● それぞれのR14は独立に、水素原子、C1-C6アルキル、アミノ保護基、または-(L)q-GPを表し、qは0または1に等しく、Lは結合アームであり、GPは親水性基である。
● YはNR14またはN(R14)2 +、
● p=2、3、4または5、
● q=1、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6、ならびに
● それぞれのR14は独立に、水素原子、C1-C6アルキル、アミノ保護基、または-(L)q-GPを表し、qは0または1に等しく、Lは結合アームであり、GPは親水性基である、または
R2とR4とが互いに結合され、R2からR4への方向で-(CH2)p-Yq-(CH2)r-鎖を形成し、
● p=2、3、4または5、
● q=0、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6。
-L1およびL’1、同一または異なっており、-O-、-NH-、-N(C1-C6)アルキル)-、-N(フェニル)-、-N(アリール)-、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-OC(O)-O-、-NHC(O)-O-、-OC(O)-NH-、-NHC(O)-NH-、-S-、-SOC-、-N=N-、-NHC(O)-および-CONH-の中から選択される;
-L2は次の2価の基から選択される:(C1-C20)アルキレン、(C1-C20)アルケニレン、(C1-C20)アルキニレン、(C6-C24)アリーレン、(C7-C44)アルキルアリーレン、(C7-C44)アルケニルアリーレン、(C7-C44)アルキニルアリーレン、(C7-C44)アルキルシクロアルキレン、(C7-C44)アルケニルシクロアルキレン、(C7-C44)アルキニルシクロアルキレン、(C7-C44)アルキルヘテロシクロアルキレン、(C7-C44)アルケニルヘテロシクロアルキレン、(C7-C44)アルキニルヘテロシクロアルキレン;前記基はトリアゾール基によって隔てられるか、または終了し、置換されていることまたは非置換であることが可能であり、特に、(C1-C10)アルコキシ、(C1-C10)アルキル、(C6-C10)アリール、アミド、イミド、ホスフィド、ニトリド、(C1-C10)アルケニル、(C1-C10)アルキニル、及び-OHの中から選択される1つ以上の置換基によって、置換されていることまたは非置換であることが可能であり;および
m、m’1及びm2、同一または異なっており、これらは0または1と等しい。
-アミン(第1級、第2級、第3級、または第4級)、アミジン、グアニジン、またはテトラゾールの中から選択されるF1官能基;
-特に、アンモニウム、カルボン酸塩、スルホン酸塩またはリン酸塩の型の基である、F2カチオン性またはアニオン性官能基;
-これらのF1および/またはF2官能基の1つ以上を含む基;
-ポリエチレングリコール;
-グルコース、ガラクトースおよびマンノースのような糖または多糖類;
-ポリリジン、ポリアルギニン、TATペプチドなどのペプチド基、ならびに
-アミノ酸
を挙げる。
-Wは-O-であり;
-R1は、式(I)に存在する-C(O)-OR1結合の切断後に得られるHOR1のようなものである。HOR1はフルオロフォアのクラス、好ましくは励起状態で分子内陽子移動をもたらすフルオロフォアのクラスに属し、-OR1が式(A1)の基に対応するようなものである:
-X2は酸素原子であり、X1は-NH2、-OH、-SH、C1-C20アルキル、C5-C24アリール、C2-C6アルケニル、-O-(C1-C20アルキル)、-O-フェニル、-NH-(C1-C20アルキル)、-NH-フェニル、-S-(C1-C20アルキル)、または-S-(C5-C24アリール基)であり、前記アルキル、アリール、アルケニル、およびフェニルの基は任意に置換されているか;
または、X2は窒素原子を表し、CH、O、S、NまたはNHを表すX1に結合され、任意で置換されているC5-C24ヘテロアリールを形成しているか、のいずれかであり;
-
前記基は任意で置換されており;
X3はS、OまたはNRdを表し、Rdは水素原子またはC1-C4アルキル基を表し;
-R2、R3およびR4は次のように定義される:
R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R2とR4とが互いに結合され、R2からR4への方向で-(CH2)p-Yq-(CH2)r-鎖を形成し、
● YはO、NR14、N(R14)2 +またはSであり、好ましくはNR14またはN(R14)2 +であり、
● p=0、1、2、3、4または5、
● q=0または1、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6、
● それぞれのR14は独立に、水素原子、C1-C6アルキル、アミノ保護基、または-(L)q-GPを表し、qは0または1に等しく、Lは結合アームであり、GPは親水性基であるか;
-R5とR6とは同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子、C1-C4アルキル、またはC5-C10アリールを表し;
-R7は、水素原子、またはC1-C4アルキルおよびC1-C4アルコキシから選択される基であり;
-R8は、水素原子を表し;
-nは0または1であり;
-Zは-S-、または-CR9R10-であり;R9およびR10は同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子またはC1-C4アルキルを表し;
-QはH、またはカチオンであり、
R11が、C1-C6アルキル、C1-C6ヘテロアルキル、C3-C6シクロアルキル、C1-C6ハロアルキル、C2-C6アルケニル、C2-C6アルキニル、5~10個の環原子を有するヘテロシクリル、5~10個の環原子を有するC5-C10アリール、C7-C16アラルキルから選択され;
前記アルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、ハロアルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリールおよびアラルキルは、独立して、オキソ、ハロゲン、C1-C6アルキル、C1-C6ヘテロアルキル、C3-C6シクロアルキル、C1-C6ハロアルキル、5~10個の環原子を有するヘテロシクリル、C5-C10アリール、5~10個の環原子を有するヘテロアリール、-OH、-NR’’R’’’、-NO2、-CN、および-(CO)-Rから選択される1つ以上の置換基で任意に置換されていてもよく;
それぞれのRは、独立して、H、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシおよび-NR’’R’’’から独立して選択され、
それぞれのR’’およびR’’’はHおよびC1-C6アルキルから独立して選択され、
-Xは結合、または
本発明はまた、式(II)の化合物に関する:
-R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R11、Z、n、Q、XおよびVは化合物(I)に対して定義されるとおりであり、
-R12は、水素原子またはアミン官能保護基を表す。
本発明はまた、以下の工程を含む式(I)の化合物の調製方法に関する:
-化合物(II)の実施;
-式(III)の化合物の実施:
-前記化合物(II)の化合物(III)への付加反応によって化合物(I)を得ること。
この方法は、Xが結合である場合に特に適している。
-次式の化合物(V)の実施:
-次の式(VII)の化合物の実施:
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、V、R11、Q、W、Z、およびnは本発明の文脈上において定義されるとおりであり、LGは脱離基を表し、好ましくはハロゲンおよびトリフルオロメタンスルホナート(トリフラート)から選択される。
-次の式(VII)の化合物の実施:
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、V、R11、Q、W、Z、およびnは本発明の文脈上において定義されるとおりであり、LGは脱離基を表し、好ましくはハロゲンおよびトリフルオロメタンスルホナート(トリフラート)から選択される、各R15はOHを表し、または各R15が互いに結合し、それらが結合するB原子と共に、5~10個の環原子を有する複素環を形成する。互いに結合しているR15基の例には、ピナコール、カテコール、およびメチルイミノジアセテートが含まれる。
-下記式(VII)の化合物の実施
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、V、R11、Q、W、Z、およびnは本発明の文脈上において定義されるとおりであり、LGは脱離基を表し、好ましくはハロゲンおよびトリフルオロメタンスルホナート(トリフラート)から選択され、R15はOHを表し、または各R15が互いに結合し、それらが結合するB原子と共に、5~10個の環原子を有する複素環を形成する。互いに結合しているR15基の例には、ピナコール、カテコール、およびメチルイミノジアセテートが含まれる。
本発明はまた、以下の工程を含む、β-ラクタマーゼをin vitroまたはex vivo検出のための方法に関する:
-分析する試料を化合物(I)に接触するように置くこと、
-C(=V)とNR7との間の共有結合を開裂させ、続いて-C(O)-WR1を開裂させて、結合し、HWR1の放出をもたらすことによる蛍光沈殿物の形成を可能にするために、適切な条件を適用すること、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析を試料中のβ-ラクタマーゼの有無と相関させること。
-分析する試料を化合物(I)に接触するように置くこと、
-C(=V)とNR7との間の共有結合を開裂させ、続いて-C(O)-WR1を開裂させて、結合し、HWR1の放出をもたらすことによる蛍光沈殿物の形成を可能にするために、適切な条件を適用すること、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析を試料中の抗生物質耐性細菌の有無と相関させること。
-分析する試料を化合物(I)に接触するように置くこと、
-C(=V)とNR7との間の共有結合を開裂させ、続いて-C(O)-WR1を開裂させて、結合し、HWR1の放出をもたらすことによる蛍光沈殿物の形成を可能にするために、適切な条件を適用すること、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析を試料中のカルバペネマーゼの有無と相関させること。
-蛍光沈殿物を、蛍光沈殿物の吸収波長で光を生成することができる光源に暴露する工程、および
-得られた沈殿物の蛍光を検出するステップ、を含むことができる。
〔実施例1:化合物15の合成〕
乾燥EtOH(20mL)中のアントラニルアミド(2.000g、11.7mmol、1.0当量)の溶液を、5-クロロサリチルアルデヒド(1.831g、11.7mmol、1.0当量)で処理し、当該混合物を30分間還流する。次に、パラ-トルエンスルホン酸(PTSA)(40mg、0.234mmol、0.02当量)を添加し、還流をさらに1時間続ける。当該反応混合物を室温に下げ、2,3-ジクロロ-5,6-ジシアノ-1,4-ベンゾキノン(DDQ)(2.678g、11.8mmol、1.01当量)で少しずつ処理する。撹拌を一夜続ける。得られた粗懸濁液を濾過し、濾過ケーキをEtOHで2回、およびジエチルエーテルで2回洗浄する。ELF-97(3.41g、11.11mmol、95%)を明るいベージュ色の粉末として得、さらに精製することなく後の工程で使用する。
スペクトルデータは文献値(M. Prost, L. Canaple, J. Samarut, J. Hasserodt. Tagging Live Cells that Express Specific Peptidase Activity with Solid-State Fluorescence. ChemBioChem 2014, 15, 1413-1417)に従う。
トルエン(50mL)中の2-アミノメチルピペリジン(1)(3.0g、26.3mmol、1.0当量)の溶液を無水フタル酸(3.89g、26.3mmol、1.0当量)で少しずつ処理し、続いてトリエチルアミン(550μL、3.95mmol、0.15当量)を滴下する。混合物を、Dean-Stark装置を用いて2時間還流する。混合物を濾過し、濾液を減圧下で乾燥状態まで減らす。生成物2(5.42g、22.2mmol、85%)を淡黄色固体として得、さらに精製することなく次の工程で使用する。
HRMS: ESI: [M+H] + m/z found 245.1290, calc. 245.1290.
iPrOH/H2O 6/1v/v(175ml)中の3(3.582g、12.6mmol、1.0当量)の氷冷溶液を水素化ホウ素ナトリウム(665mg、17.58mmol、5.0当量)で少しずつ処理する。冷却を除去し、混合物を室温で一晩(o/n)撹拌する。次いで、濃HClを用いてpHを1に調整する。得られた混合物を濾過し、濾液を80℃に2時間加熱する。イソプロピルアルコールを減圧下で除去し、得られた水溶液をジエチルエーテルで5回洗浄し、2M NaOH水溶液で塩基性にし、ジエチルエーテルで抽出する。合わせた有機抽出物をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、乾燥状態まで蒸発させ、4を淡黄色油(1.939g、12.6mmol、定量収率)として得る。
13C -NMR (75 MHz, CDCl3): δ (ppm) = 157.34, 134.50, 117.71, 58.62, 56.29, 51.90, 42.31, 28.85, 24.92, 23.58.
(化合物6)
-20℃のH2O/MeOH(20mL、1/1v/v)中の7-アミノセファロスポラン酸(5)(2.000g、7.345mmol、1.0当量)の溶液を、10M NaOH(2mL)で処理し、得られた混合物を-20℃で30分間撹拌する。濃HClでpHを3に調整する。次に、温度を0℃にし、こうして形成された淡黄色沈殿を濾別し、MeOH、アセトン、およびエーテルで洗浄し、次いで乾燥させる。所望のアルコール6がオフホワイトの粉末として得られる(1.451mg、6.302mmol、86%)。
スペクトルデータは、文献値(S. Desgranges, C. C. Ruddle, L. P. Burke, T. M. McFadden, J. E. O’Brien, D. Fitzgerald-Hughes, H. Humphreys, T. P. Smyth, M. Devocelle. β-Lactam-host defence peptide conjugates as antibiotic prodrug candidates targeting resistant bacteria. RSC Advances 2012, 2, 2480)に従う。
スペクトルデータは、文献値(S. Desgranges, C. C. Ruddle, L. P. Burke, T. M. McFadden, J. E. O’Brien, D. Fitzgerald-Hughes, H. Humphreys, T. P. Smyth, M. Devocelle. β-Lactam-host defence peptide conjugates as antibiotic prodrug candidates targeting resistant bacteria. RSC Advances 2012, 2, 2480)に従う。
DCM(50mL)中のアルコール10(1.000g、1.921mmol、1.0当量)の氷冷溶液を、4-ニトロフェニルクロロホルメート(775mg、3.842mmol、2.0当量)、ピリジン(155μL、1.921mmol、1.0当量)および4-ジメチルアミノピリジン(DMAP)(24mg、0.192mmol、0.1当量)で処理する。室温で2時間撹拌した後、水洗し、Na2SO4で乾燥させ、減圧下で濃縮する。粗残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(PE/EtOAc 70/30)により精製して、所望の炭酸塩11を淡黄色固体(685mg、0.999mmol、52%)として得る。
ESI : [M+H] +m/z found 701.2, calc. 701.2.
乾燥DCM(1.5mL)中の溶液12(39mg、0.056mmol、1.0当量)に、1,3-ジメチルバルビツール酸(DMBA)(43mg、0.278mmol、5.0当量)を添加し、得られた混合物をアルゴンフラックスを用いて脱気した後、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)Pd(PPh3)4(1mg、0.0006mmol、0.01当量)で処理する。反応の完了後(典型的には約4時間)、当該反応混合物を乾燥状態まで蒸発させ、シリカゲルクロマトグラフィー(DCM/MeOH、99/1v/v)により精製して、所望の第2級アミン13を黄色油として得る(15mg、0.023mmol、41%)。
乾燥DCM(1mL)中のELF-97(7mg、0.023mmol、1.0当量)の氷冷懸濁液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)(20μL、0.113mmol、5.0当量)を、アルゴン雰囲気で滴下し、続いて乾燥DCM(1mL)中のトリホスゲン(20mg、0.068mmol、3.0当量)の溶液を添加する。混合物を0℃で1時間撹拌し、室温で一晩撹拌する。翌朝、揮発性物質を液体-窒素トラップに捕捉しながら、減圧下で乾燥状態まで減らす。後者の含有物は、その後のエタノール性ヒドロキシドナトリウムの添加によって破壊される)。得られたELF-97のクロロギ酸塩(固体残渣)を、さらに精製することなく、次の工程で使用する。
〔実施例2:化合物15の蛍光の検出〕
化合物15の蛍光をβ-ラクタマーゼの有無で評価した。試験は、マイクロウェルプレート(75μM、37℃、10U.mL-1)中でのインキュベーション/化学反応によって行った。蛍光をプレート蛍光光度計によって経時的に測定した。得られた結果を図1に示す。
アルコール27(3.3g、15.5mmol、1当量)を無水DCM(30mL)に溶解し、p-ニトロフェニルクロロホルメート(1.05当量、3.29g)を添加した。フラスコを氷浴中に置き、ピリジン(2.5当量、38.75mmol、3.2mL)を滴下した。その後、室温で16時間撹拌した後、ジエチルエーテルで希釈し、セライトでろ過し、Et2Oでリンスした。溶媒を減圧下で留去し、当該粗混合物をシリカゲルフラッシュクロマトグラフィー(溶離剤EP/CHCl3 1:0~0:1)に供し、活性炭-ボロン酸塩28(5.56g、14.7mmol、95%)を無色油として得た。
純粋な30(0.47mmol、376mg)をフラスコに入れ、工業グレードのTHF(15mL)に溶解し、氷浴中に置いた。次に、TBAFの溶液(1MのTHF溶液、1.02当量、479μL)を滴下し、反応物を室温で16時間撹拌した。フラスコを氷浴中に置き、飽和NaHCO3水溶液(10ml)を滴下した。31をEt2Oで抽出し、水分、ブラインで洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。シリカゲル上でのフラッシュクロマトグラフィー(DCM/Et2O 0:1~1:0)による粗混合物の精製は、純粋な31を無色のガラス状固体(294mg、0.46mmol、95%)をもたらした。(M+H+ 31=644.3)。
Claims (17)
- 式(I)の化合物:
ここで:
-Wは-O-または-NR13-であり、R13はC1-C4アルキルまたは水素原子であり;
-R1は、フルオレセイン、クマリン、シアニン、フェノキサジンおよびアクリジノンからなる群より選択され;または
WR1は式(A1)に記載の芳香族基-OR1であり:
ここで:
-X2は酸素原子であり、X1は-NH2、-OH、-SH、C1-C20アルキル、C 6 -C24アリール、C2-C6アルケニル、-O-(C1-C20アルキル)、-O-フェニル、-NH-(C1-C20アルキル)、-NH-フェニル、-S-(C1-C20アルキル)、または-S-(C 6 -C24アリール基)であり、前記アルキル、アリール、アルケニル、およびフェニルの基は任意に置換されているか;
または、X2は窒素原子を表し、CH、O、S、NまたはNHを表すX1に結合され、任意で置換されているC5-C24ヘテロアリールを形成しているか、のいずれかであり;
-
は任意で置換されたフェニル基、任意で置換されたナフチル基、または
の中から選択され
前記基は任意で置換されており;
X3はS、OまたはNRdを表し、Rdは水素原子またはC1-C4アルキル基を表し;
-R2、R3およびR4は次のいずれかのように定義される:
○ R2はC1-C4アルキルであり、R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R4はC1-C4アルキルであるか;
○ または、R3はC1-C4アルキルまたは水素原子であり、R2とR4とが互いに結合され、R2からR4への方向で-(CH2)p-Yq-(CH2)r-鎖を形成し、
● YはO、NR14、N(R14)2 +またはSであり、
● p=0、1、2、3、4または5、
● q=0または1、
● r=0、1、2、3、4または5、
● p+q+r=3、4、5、または6、
● それぞれのR14は、水素原子を表し;
○ または、R2はC1-C4アルキルであり、R3とR4とが互いに結合し、それらが結合する炭素原子と共に脂肪族炭素環を形成し;
-R5とR6とは同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子、C1-C4アルキル、またはC 6 -C10アリールを表し;
-R7は、水素原子、またはC1-C4アルキルおよびC1-C4アルコキシから選択される基であり;
-R8は、水素原子を表し;
-Vは、酸素原子または硫黄原子を表し;
-nは0または1であり;
-Zは-S-、-SO-、または-CR9R10-であり;R9およびR10は同一であるか、または異なっており、それぞれ独立して、水素原子またはC1-C4アルキルを表し;
-QはH、カチオンまたはR16であり、ここでR16はC1-C6アルキルであり、任意にアリールまたはO-(CO)-Rで置換され、Rは独立してH、C1-C6アルキルおよびC3-C6シクロアルキルから選択され;
-R11は、
から選択され、
-Xは結合、または
から選択される基を表す。 - 式(Ia)である、請求項1に記載の化合物(I):
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R11、Q、W、XおよびVは、請求項1に定義されるとおりである。 - 式(Ib)である、請求項1に記載の化合物(I):
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、Q、W、XおよびVは、請求項1に定義されるとおりである。 - -OR1はアリールオキシ種であり、以下の構造(A2)、(A3)または(A4)の1つに対応する、請求項1に記載の化合物(I):
-
ここで、
○ Tは-NH-C(O)-、-S-、-O-、-NH-、-N(C1-C20アルキル)-または-N(C 6 -C24アリール)-であり;
○ Reは水素原子または-CNもしくは-COORhからなる群から選択される基であり、RhはC1-C4アルキル基を表すか、またはReは-CONRiRjであり、RiおよびRjは、同一であるか、または異なっており、RiおよびRjは水素原子もしくはC1-C4アルキル基を表すか、またはReは-CF3、C2-C6アルケニル、またはヘテロアリールであり、前記ヘテロアリールおよびアルケニルは任意に置換されており;
○ Rfは水素原子、塩素、臭素、ヨウ素またはフッ素原子、-OH、- NH2、-NRkRI、-NHRkまたは-ORkであり、RkおよびRIは、同一であるか、または異なっており、RkおよびRIは、それぞれ独立して、C1-C4アルキル基を表し;
○ または、ReおよびRfは、それぞれ互いに結合して、4または5員を含む炭化水素鎖を形成し、飽和または不飽和であり、置換されているか、または非置換であり、N、SおよびOの中から選択される1つ以上のヘテロ原子によって隔てられていてもよく;
-
ここで、
○ T’は-NH2、-OH、C 6 -C24アリール基、C1-C4アルキル基、-SH、-NHR’g、-OR’g、-NR’gRh’、-SR’g、または任意に置換されたC2-C6アルケニル基、またはヘテロアリールであり、R’gおよびRh’は同一であるか、または異なっており、C1-C4アルキル基またはC 6 -C24アリール基を表し;
○ R’eは水素原子または-CNもしくは-COOR’iからなる群から選択される基であり、R’iはC1-C4アルキル基を表すか、またはR’eは-CONR’jR’kであり、R’jおよびR’kは、同一であるか、または異なっており、水素原子、もしくはC1-C4アルキル基を表すか、またはR’eは-CF3、もしくは2-オキサゾリル、2-チアゾリル、2-イミダゾリル、2-ベンゾイミダゾリル、4-ピリミジノン-2-イルもしくはキナゾリノン-2-イル基である;
○ R’fは水素原子、塩素、臭素、ヨウ素、フッ素原子、-OH、-NH2、-NR’IR’m、またはOR’Iであり、R’IおよびR’mは、同一であるか、または異なっており、C1-C4アルキル基を表し;
○ またはR’eおよびR’fはそれぞれ互いに結合して、4または5員を含む炭化水素鎖を形成し、飽和または不飽和であり、置換されているか、または非置換であり、N、SおよびOの中から選択される1つ以上のヘテロ原子によって隔てられていてもよく;
-
ここで、
-X’2は酸素原子であり、X’1は-NH2、-OH、-SH、C1-C20アルキル、C 6 -C24アリール、C2-C6アルケニル、-O-(C1-C20アルキル)、-O-フェニル、-NH-(C1-C20アルキル)、-NH-フェニル、-S-(C1-C20アルキル)、または-S-(C 6 -C24アリール基)であり、前記アルキル基、アリール基、アルケニル基、およびフェニル基は、任意に置換されているか;
または、X’ 2は窒素原子を表し、CH、O、S、NまたはNHを表すX’ 1に結合され、任意で置換されているC5-C24ヘテロアリールを形成しているか、のいずれかであり;
-
は、任意で置換されているC 6 -C10アリールまたはC5-C10ヘテロアリールを表す。 - 式(Ic)である、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物(I):
ここで、R1、R11、Z、Q、Xおよびnは請求項1~4のいずれか1項に定義されるとおりであり、Yは-CH2-、-NR14-、または-N(R14)2 +-を表し、それぞれのR14は、水素原子を表す。 - 式(Id)である、請求項1~5のいずれか1項に記載の化合物(I):
ここで、R1、R11、XおよびQは前記請求項1から5のいずれか1項に定義されるとおりであり、Yは請求項5に定義されるとおりである。 - 式(Ie)である、請求項1~6のいずれか1項に記載の化合物(I):
ここで、R1、R9、R10、R11、XおよびQは請求項1~5のいずれか1項に定義されるとおりであり、Yは請求項5に定義されるとおりである。 - 以下の工程を含む、β-ラクタマーゼをin vitroまたはex vivoで検出するための方法:
-分析する試料を請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物(I)に接触するように置くこと、
-C(=V)とNR7との間の共有結合を開裂させ、続いて-C(O)-WR1を開裂させて、結合し、HWR1の放出をもたらすことによる蛍光沈殿物の形成を可能にするために、適切な条件を適用すること、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析を試料中のβ-ラクタマーゼの有無と相関させる。 - 以下の工程を含む、抗生物質耐性菌をin vitroまたはex vivoで検出するための方法:
-分析する試料を請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物(I)に接触するように置くこと、
-C(=V)とNR7との間の共有結合を開裂させ、続いて-C(O)-WR1を開裂させて、結合し、HWR1の放出をもたらすことによる蛍光沈殿物の形成を可能にするために、適切な条件を適用すること、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析、
-蛍光沈殿物の定量的分析または定性的分析を試料中の抗生物質耐性細菌の有無と相関させる。 - 請求項1~7に記載の化合物を含む、β-ラクタマーゼを検出するためのキット。
- 請求項1~7に記載の化合物を含む、β-ラクタマーゼを検出するための装置。
- ヒトにおけるβ-ラクタマーゼのin vivo検出のための、請求項1~7のいずれか1項に記載の化合物(I)。
- 式(II)の化合物:
ここで:
-R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R11、Z、n、Q、XおよびVは請求項1から7のいずれか1項に定義されるとおりであり、
-R12は、水素原子またはtert-ブトキシカルボニル基、フルオロフェニルメトキシカルボニル基、アリールオキシカルボニル基、および2,2,2-トリクロロエトキシカルボニル基からなる群から選択される基を表す。 - 以下の工程を含む、請求項1~7に記載の式(I)の化合物の調製方法:
-R12は水素原子を表す、請求項13に記載の化合物(II)を、式(III)の化合物と反応させること
ここで、R1は請求項1から7のいずれか1項に定義されるとおりであり、Mは、ハロゲン原子、イミダゾリル基、トリアゾリル基、およびパラ-ニトロフェノキシから選択される基を表す:
-前記化合物(II)の化合物(III)への付加反応によって化合物(I)を得ること。 - Xは
であり、以下の工程を含む、請求項1~7に記載の式(I)の化合物の調製方法:
-次の式の化合物(VII):
を式(VIII)の化合物と反応させること
-および、前記化合物(VII)と化合物(VIII)との反応によって化合物(I)を得ること、
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、V、R11、Q、W、Z、およびnは請求項1~7のいずれか1項に定義されるとおりであり、LGは、ハロゲンおよびトリフルオロメタンスルホナートから選択される基を表す。 - Xは
であり、以下の工程を含む、請求項1~7に記載の式(I)の化合物の調製方法:
-次の式の化合物(VII):
を式(IX)の化合物の実施と反応させること
-および、前記化合物(VII)と化合物(IX)との反応によって化合物(I)を得ること、
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、V、R11、Q、W、Z、およびnは請求項1~7のいずれか1項に定義されるとおりであり、LGは、ハロゲンおよびトリフルオロメタンスルホナート(トリフラート)から選択される基を表し、R15はOHを表し、または各R15が互いに結合し、それらが結合するB原子と共に、5~10個の環原子を有する複素環を形成する。 - Xは
であり、以下の工程を含む、請求項1~7に記載の式(I)の化合物の調製方法:
-次の式の化合物(VII):
を式(X)の化合物と反応させること
-前記化合物(VII)と化合物(X)とを反応させて化合物(I)を得ること、
ここで、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、V、R11、Q、W、Z
、およびnは請求項1~10のいずれか1項に定義されるとおりであり、LGは、ハロゲンおよびトリフルオロメタンスルホナート(トリフラート)から選択される基を表し、R15はOHを表し、または各R15が互いに結合し、それらが結合するB原子と共に、5~10個の環原子を有する複素環を形成する。
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