JP7799272B2 - 変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(cpt)ファミリー蛋白質、ポリイソプレノイドの製造方法、ベクター、形質転換植物、空気入りタイヤの製造方法及びゴム製品の製造方法 - Google Patents
変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(cpt)ファミリー蛋白質、ポリイソプレノイドの製造方法、ベクター、形質転換植物、空気入りタイヤの製造方法及びゴム製品の製造方法Info
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Description
(知見1)野生型のCPTを使用したゴム粒子上でのゴム合成
CPTに変異導入を行わずにそのままゴム粒子に結合させて、ポリイソプレノイドを合成する場合、CPTの種類によっては、ゴム粒子上で高分子のポリイソプレノイドが合成されない場合があることが分かった。特に、もともと膜に結合しない短・中鎖のイソプレノイド合成する酵素を用いた場合はそもそも膜に結合しないという問題点があった。
(知見2)CPTに膜結合を補助するペプチド(又は酵素)を融合させた酵素を使用した膜粒子上でのポリイソプレノイド合成
前記知見1の課題を解決する方法の1つとして、CPTのN末端側又はC末端側に膜結合性を補助するペプチドや酵素(油滴結合蛋白質の膜結合部分やゴム粒子に結合するSRPPなど)と融合する方法も試みた。しかしながら、この方法により、酵素の膜結合性の問題は解決したものの、酵素が正しく膜に埋め込まれない可能性や融合蛋白質が酵素活性に重要とされているNgBRとの相互作用を阻害する可能性が残されていた。
(第1の本開示)
第1の本開示の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質は、ゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列を、ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列と同一に又は類似するように変異した変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質である。これにより、変異前のシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質よりも高分子量のポリイソプレノイドの製造が可能であり、変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質を用いたポリイソプレノイドの製造方法により、変異前のシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質を用いた場合よりも高分子量のポリイソプレノイドの製造が可能となる。
なお、本明細書において、蛋白質のN末端は、ポリペプチド鎖のアミノ末端、蛋白質のC末端は、ポリペプチド鎖のカルボキシ末端を意味する。
前記の通り、本開示者らは、CPTのC末端に着目した。CPTのC末端の重要度は、本来ゴム粒子上に存在しないCPTの方が、ゴム粒子上に存在するCPTよりも大きい。
(1)野生型のHRT1(パラゴムノキ由来のゴム粒子上に存在するCPTファミリー蛋白質(ゴム合成酵素))は、ゴム粒子に結合した状態で、問題なく活性を示した。
(2)N末端欠損HRT1は、ゴム粒子への結合は確認できたものの、酵素活性は確認できなかった。これは、従来の知見と一致する。
(3)C末端変異導入HRT1は、ゴム粒子に結合した状態で、問題なく活性を示した。
以上の通り、ゴム粒子上に存在するCPTファミリー蛋白質(ゴム合成酵素)においては、C末端の構造の重要性は低いことが分かった。
(4)野生型のHbCPT5(パラゴムノキ由来のゴム粒子上に存在しないCPT)は、ゴム粒子に結合させても短鎖イソプレン鎖の合成が中心であった。
(5)N末端HRT1化変異導入HbCPT5(HbCPT5のN末端をHRT1のN末端に置換)では、大きな変化は見られなかった。
(6)C末端HRT1化変異導入HbCPT5(HbCPT5のC末端をHRT1のC末端に置換)では、ゴム粒子に結合させた場合、ゴム鎖長まで生成物鎖長が伸びる割合が増加し、高分子量のポリイソプレノイドの製造量の増大を確認できた。
・C末端HRT1化変異導入AtCPT5(AtCPT5のC末端をHRT1のC末端に置換)とHRBP(パラゴムノキ由来のNgBR)との相互作用試験では、相互作用は確認できなかった。
・CPTのC末端構造は活性中心の近くに存在することが知られている。
よって、これらの知見より、C末端は活性中心の近くに存在するため、その構造(例えば、疎水性度)を変化させることで、活性中心近くまでCPTが膜に深く入り込んでいると推測される。
図1(a)は、ゴム粒子上に存在しないCPTがゴム粒子に結合していない状態で反応する際の概略図である。この場合には、ストッパーの存在により、鎖長制御機構が機能し、所定の分子量のポリイソプレノイドが製造されることとなる。
図1(b)は、ゴム粒子上に存在しないCPTがゴム粒子に結合した状態で反応する際の概略図である。この場合には、ストッパーがわずかにゴム粒子(膜)に埋まるため、ゴム粒子に結合していない状態に比べて、多少高分子量化したポリイソプレノイドが製造されることとなる。
図1(c)は、「ゴム粒子上に存在しないCPTのC末端領域を、ゴム粒子上に存在するCPTのC末端領域に置換した変異CPT」がゴム粒子に結合した状態で反応する際の概略図である。この場合には、変異CPTのC末端が、ゴム粒子(膜)と相互作用するようになるため、CPTがより深くゴム粒子(膜)に入り込み、本来のストッパーが機能しなくなり、生成物が高分子量化することとなる。なお、本開示では、ゴム粒子上に存在しないCPTのC末端領域に更にアミノ酸配列を付加する融合ではなく、ゴム粒子上に存在しないCPTのC末端領域の置換を行っているため、前記機構がより好適に発揮されるものと推測される。
また、ゴム粒子上に存在するCPTには、生成物鎖長を制御するストッパーが存在しないため、ゴム粒子(膜)への結合が多少浅くなったとしても影響は少ないものと推測される。
本開示の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質は、ゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列を、ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列と同一に又は類似するように変異した変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質である。
なお、本明細書において、C末端領域のアミノ酸配列は、連続するアミノ酸配列である。
ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質としては、ゴム粒子上に存在するCPTファミリー蛋白質であれば特に限定されず、例えば、植物由来のゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であればよい。なかでも、Hevea属又はTaraxacum属(なかでも、Hevea属)に属する植物由来のゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であることが好ましく、Hevea brasiliensis又はTaraxacum koksaghyz(なかでも、Hevea brasiliensis)由来のゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であることがより好ましい。
[1]配列番号1で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[2]配列番号1で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[3]配列番号1で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[1]配列番号2で表される塩基配列からなるDNA
[2]配列番号2で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA
なお、縮重プライマーは、前記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、前記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したcDNAを鋳型にしてRT-PCRを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
ゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質としては、ゴム粒子上に存在しないCPTファミリー蛋白質であれば特に限定されず、例えば、植物由来のゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であればよい。ここで、植物としては、前述の植物と同様の植物である。なかでも、Hevea属又はTaraxacum属(なかでも、Hevea属)に属する植物由来のゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であることが好ましく、Hevea brasiliensis又はTaraxacum koksaghyz(なかでも、Hevea brasiliensis)由来のゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であることがより好ましい。また、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)由来のゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であることも好ましい。
[4]配列番号3で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[5]配列番号3で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[6]配列番号3で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[7]配列番号4で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[8]配列番号4で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[9]配列番号4で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[3]配列番号5で表される塩基配列からなるDNA
[4]配列番号5で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA
なお、縮重プライマーは、前記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、前記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したcDNAを鋳型にしてRT-PCRを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
[5]配列番号6で表される塩基配列からなるDNA
[6]配列番号6で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA
なお、縮重プライマーは、前記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、前記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したcDNAを鋳型にしてRT-PCRを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
前記変異CPTファミリー蛋白質の具体例としては、下記[A-1]が挙げられる。
[A-1]配列番号7で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[A-2]配列番号7で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[A-3]配列番号7で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[B-1]配列番号8で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[B-2]配列番号8で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[B-3]配列番号8で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
[C-1]配列番号9で表される塩基配列からなるDNA
[C-2]配列番号9で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA
なお、縮重プライマーは、前記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、前記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したcDNAを鋳型にしてRT-PCRを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
[D-1]配列番号10で表される塩基配列からなるDNA
[D-2]配列番号10で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソプレノイド化合物の鎖長をcis型に延長する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA
なお、縮重プライマーは、前記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、前記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したcDNAを鋳型にしてRT-PCRを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
本開示のポリイソプレノイドの製造方法は、本開示の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質を用いることを特徴とする。
本開示のポリイソプレノイドの製造方法は、本開示の変異CPTファミリー蛋白質を用いる限り特に限定されないが、生体外で、本開示の変異CPTファミリー蛋白質を膜粒子(好ましくはゴム粒子)に結合させる結合工程を含むことが好ましい。生体外で、膜粒子(好ましくはゴム粒子)に変異CPTファミリー蛋白質を結合させることで、膜粒子(好ましくはゴム粒子)中にポリイソプレノイドを合成することができるため、より高分子量のポリイソプレノイドの製造が可能となる。これは、膜粒子(好ましくはゴム粒子)の内部に生成されたポリイソプレノイドが蓄積されることとなるため、膜粒子(好ましくはゴム粒子)に結合しない場合に比べて、より鎖長の長い生成物を生成可能となるためである。
また、ゴム粒子に結合する変異CPTファミリー蛋白質の量は特に限定されない。
すなわち、変異CPTファミリー蛋白質をコードするmRNAを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて(より具体的には、変異CPTファミリー蛋白質をコードするmRNAを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを混合して)蛋白質合成を行うことで、変異CPTファミリー蛋白質の結合したゴム粒子を得ることが好ましい。
前記その他の蛋白質をコードするmRNAとしては、翻訳されてその他の蛋白質を発現することができるものを用いることができる。なお、その他の蛋白質としては、上述したものと同様のものを挙げることができる。
なお、前記特開2005-218357号公報に記載された方法で調製された胚芽抽出物には蛋白質合成反応に必要とされる量のtRNAが含まれているため、当該方法により調製された胚芽抽出物を無細胞蛋白合成溶液に用いる場合には、別途調製したtRNAを追加することは必須要件ではない。すなわち、無細胞蛋白合成溶液には、必要に応じてtRNAを追加すればよい。
また、無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度は、5~50g/Lであることが好ましい。すなわち、無細胞蛋白合成溶液1Lに対してゴム粒子を5~50g共存させることが好ましい。無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が5g/L未満であると、合成された変異CPTファミリー蛋白質が結合したゴム粒子を回収するために、超遠心分離等による分離処理を行った際に、ゴム層が形成されず、合成された変異CPTファミリー蛋白質が結合したゴム粒子を回収することが困難になる場合がある。一方、無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が50g/Lを超えると、ゴム粒子同士が凝集し、合成された変異CPTファミリー蛋白質がうまくゴム粒子に結合できなくなるおそれがある。前記ゴム粒子の濃度としてより好ましくは10~40g/L、更に好ましくは15~35g/L、特に好ましくは15~30g/Lである。
これら界面活性剤は、単独で用いてもよいし、2種以上を併用してもよい。
これらの中でも、ポリオキシアルキレンエーテル系の非イオン性界面活性剤、多価アルコール脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤が好ましい。
前記多価アルコール脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、炭素数2~12の多価アルコールの脂肪酸エステル又はポリオキシアルキレン多価アルコールの脂肪酸エステル等が挙げられる。より具体的には、例えば、ソルビトール脂肪酸エステル、ソルビタン脂肪酸エステル、グリセリン脂肪酸エステル、ポリグリセリン脂肪酸エステル、ペンタエリトリトール脂肪酸エステル等が挙げられる。また、これらのポリアルキレンオキサイド付加物(例えば、ポリオキシアルキレンソルビタン脂肪酸エステル、ポリオキシアルキレングリセリン脂肪酸エステル等)も使用可能である。これらの中でも、ソルビタン脂肪酸エステルが好適に使用される。
前記糖脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、ショ糖、グルコース、マルトース、フルクトース、多糖類の脂肪酸エステル等が挙げられ、これらのポリアルキレンオキサイド付加物も使用可能である。
前記アルキルポリグリコシド系の非イオン性界面活性剤としては、グリコシドとしてグルコース、マルトース、フルクトース、ショ糖などが挙げられ、例えば、アルキルグルコシド、アルキルポリグルコシド、ポリオキシアルキレンアルキルグルコシド、ポリオキシアルキレンアルキルポリグルコシドなどが挙げられ、これらの脂肪酸エステル類も挙げられる。また、これらすべてのポリアルキレンオキサイド付加物も使用可能である。
特に、前記の両性イオン界面活性剤が一分子中に+と-の両電荷を有することが好ましく、前記の酸基の酸解離定数(pKa)が、5以下であることが好ましく、4以下であることがより好ましく、3以下であることが更に好ましい。
また、遠心分離処理温度としては、ゴム粒子に結合した変異CPTファミリー蛋白質の蛋白活性を維持するという観点から、0~10℃が好ましく、2~8℃がより好ましく、4℃が特に好ましい。
第1の本開示のゴム製品の製造方法は、前記第1の本開示のポリイソプレノイドの製造方法によりポリイソプレノイドを製造する工程と、得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び前記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法である。
混練工程では、前記ポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る。
生ゴム製品成形工程では、混練工程により得られた混練物から生ゴム製品(タイヤの場合は生タイヤ)を成形する。
生ゴム製品の成形方法としては特に限定されず、生ゴム製品の成形に用いられる方法を適宜適用すればよい。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、混練工程により得られた混練物を、各タイヤ部材の形状に合わせて押し出し加工し、タイヤ成型機上にて通常の方法にて成形し、各タイヤ部材を貼り合わせ、生タイヤ(未加硫タイヤ)を成形すればよい。
加硫工程では、生ゴム製品成形工程により得られた生ゴム製品を加硫することにより、ゴム製品が得られる。
生ゴム製品を加硫する方法としては特に限定されず、生ゴム製品の加硫に用いられる方法を適宜適用すればよい。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、生ゴム製品成形工程により得られた生タイヤ(未加硫タイヤ)を加硫機中で加熱加圧して加硫することにより空気入りタイヤが得られる。
(ベクター)
第2の本開示のベクターは、本開示の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質をコードする遺伝子を含むベクターである。このようなベクターを植物に導入して形質転換を行うことにより、当該ベクターに含まれる、変異CPTファミリー蛋白質をコードする遺伝子が発現し、当該植物において、遺伝子組み換え前と比較して、高分子量のポリイソプレノイドの製造を可能にする。
ここで、本明細書において、遺伝子をプロモーターと機能的に連結させるとは、当該プロモーターの制御を受けるように、当該プロモーターの下流に当該遺伝子配列を連結することを意味する。
Small Rubber Particle Protein(SRPP)は、パラゴムノキ(Hevea brasiliensis)等のゴム産生植物のラテックスに存在するゴム粒子に結合するゴム粒子結合蛋白質のことである。
Hevein2.1(HEV2.1)は、パラゴムノキ(Hevea brasiliensis)等のゴム産生植物の乳管細胞に多く発現している蛋白質のことであり、ゴム粒子の凝集に関与し、抗真菌活性を有するものである。
また、MYC1 transcription factor(MYC1)は、パラゴムノキ(Hevea brasiliensis)等のゴム産生植物のラテックスで多く発現している、ジャスモン酸シグナルに関わる転写因子のことである。ここで、transcription factor(転写因子)とは、遺伝子の転写量を増加若しくは減少(好ましくは増加)させる活性を有する蛋白質を意味する。すなわち、本明細書において、MYC1は、ジャスモン酸シグナルに関わる蛋白質のうち少なくとも1種の蛋白質をコードする遺伝子の転写量を増加若しくは減少(好ましくは増加)させる活性(転写因子活性)を有する蛋白質のことである。
なお更には、第2の本開示のベクターを、前記DNAを導入する方法などにより、微生物、酵母、動物細胞、昆虫細胞等の、生物体、生物体の一部、器官、組織や培養細胞、スフェロプラスト、プロトプラストなどに導入することによって、シス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドを生産することも可能である。
第2の本開示のゴム製品の製造方法は、前記第2の本開示のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物によりポリイソプレノイドを製造する工程、得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び前記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法である。
混練工程では、前記第2の本開示のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る。
なお、前記形質転換植物からのラテックスの採取方法は特に制限されず、通常行われる方法を採用することができるが、例えば、植物の幹を傷つけてにじみ出る乳液を回収したり(タッピング)、根など形質転換植物の一部を切断し、切断した部分からにじみ出る乳液を回収したり、切断した組織を粉砕し、有機溶媒を用いて抽出して採取したりすることができる。
前記採取されたラテックスは、固化工程に供される。固化する方法としては、特に限定されず、エタノール、メタノール、アセトン等のポリイソプレノイドを溶解しない溶媒にラテックスを添加する方法やラテックスに酸を添加する方法等が挙げられる。固化工程を行うことにより、ラテックスからゴム(ポリイソプレノイドの1種)を固形分として回収できる。得られたゴムは、必要に応じて乾燥してから使用すればよい。
生ゴム製品成形工程では、第1の本開示において上述した工程と同様である。
加硫工程は、第1の本開示において上述した工程と同様である。
実施例1:AtCPT5-C末端HRT1型を用いたゴム粒子上のアッセイ
比較例1:AtCPT5を用いたゴム粒子上のアッセイ
実施例1、比較例1において、NgBRファミリー蛋白質と相互作用しないCPTのC末端変異体と通常型との生成物鎖長を比較した。ここで、AtCPT5が、ゴム粒子上に存在しないCPTファミリー蛋白質、HRT1が、ゴム粒子上に存在するCPTファミリー蛋白質に該当する。
比較例2:HbCPT5を用いたゴム粒子上のアッセイ
実施例2、比較例2において、NgBRファミリー蛋白質と相互作用するCPTのC末端変異体と通常型との生成物鎖長を比較した。ここで、HbCPT5が、ゴム粒子上に存在しないCPTファミリー蛋白質、HRT1が、ゴム粒子上に存在するCPTファミリー蛋白質に該当する。
(1)HRT1遺伝子
〔HeveaラテックスからのTotal RNA抽出〕
パラゴムノキのラテックスからホットフェノール法により、Total RNAを抽出した。ラテックス6mLに100mM酢酸ナトリウム緩衝液6mL、10%SDS溶液1mLを添加し、更に65℃で予温しておいた水飽和フェノールを12mL添加した。65℃で5分間インキュベートしたのち、ボルテックスで撹拌し、室温、7000rpmで10分間遠心分離を行った。遠心後、上清を新しいチューブに移し、フェノール:クロロホルム(1:1)溶液12mLを添加し、2分間振盪撹拌した。撹拌後、再度、室温、7000rpmで10分間遠心分離を行った後、上清を新しいチューブに移し、クロロホルム:イソアミルアルコール(24:1)溶液12mLを添加し、2分間振盪撹拌した。撹拌後、再度、室温、7000rpmで10分間遠心分離を行った後、上清を新しいチューブに移し、3M酢酸ナトリウム溶液1.2mLとイソプロパノール13mLを添加し、ボルテックスで撹拌した。Total RNAを沈殿させるために、-20℃で30分間インキュベートした。インキュベート後、4℃、15000rpmで10分間遠心し、上清を取除くことでTotal RNAの沈殿を回収した。回収したTotal RNAは70%エタノールで2度洗浄したのち、RNase freeの水で溶解させた。
回収したTotal RNAをもとに、cDNAを合成した。cDNAの合成はPrimeScript II 1st strand cDNA Synthesis Kit(Takara)の説明書に従って行った。
〔cDNAからHRT1遺伝子の取得〕
作製した1st strand cDNAを鋳型にHRT1遺伝子の取得を行った。PCRはKOD-plus-Neo(TOYOBO)を使用し、説明書に従って行った。PCRは、98℃で10秒、58℃で30秒、68℃で1分を1サイクルとして、35サイクル行った。
HRT1遺伝子の取得は、プライマーとして、
プライマー1:5’- tttggatccgatggaattatacaacggtgagagg-3’
プライマー2:5’- tttgcggccgcttattttaagtattccttatgtttctcc-3’
を使用した。
上述の方法により、HRT1遺伝子が得られた。得られた遺伝子について、その配列を同定し、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定した。
プライマー3:5‘- tttctcgagatggatttgaaacctggagctg -3’
プライマー4:5‘- tttctcgagtcatgtaccataattttgctgcac -3’
を使用した。
上述の方法により、HRBP遺伝子が得られた。得られた遺伝子について、その配列を同定し、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定した(配列番号11、12)。
プライマー5:5‘- tttctcgagatggctgaagacgaagac -3’
プライマー6:5 ‘- tttggatcctcaattctctccataaaac-3’
を使用した。
上述の方法により、REF遺伝子が得られた。得られた遺伝子について、その配列を同定し、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定した(配列番号13、14)。
前記取得したDNA断片にdA付加を行った後、pGEM-T Easy Vector System(Promega)を利用してpGEM-T Easy Vectorに挿入し、pGEM-HRT1、pGEM-HRBP、pGEM-REFを作製した。
前記作製したVectorを用いて大腸菌DH5αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとX-galを含むLB寒天培地上で培養し、青/白スクリーニング法によって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、LB液体培地上で37℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はFast Geneプラスミドミニキット(日本ジェネティクス)を使用した。回収したプラスミドに挿入された遺伝子の塩基配列に変異がないことをシークエンス解析により確認した。
HbCPT5遺伝子はゴムノキゲノムを鋳型としたPCRによって取得した。
〔Hevea葉からのゲノムDNA抽出〕
ゲノムDNAはHevea葉を材料にCetyltrimethylammonium Bromide(CTAB)法により取得した。
PCRはKOD-plus-Neo(TOYOBO)を使用し、説明書に従って行った。PCRは、98℃で10秒、58℃で30秒、68℃で2分を1サイクルとして、35サイクル行った。
HbCPT5遺伝子の取得は、プライマーとして、
プライマー7:5’- GTGCTGGAATTCATGGAAATATTTGAGGCTGG-3’
プライマー8:5’- AAGCTTGTCGACTTAATGGTGATGGTGATGATGAC CGGTACGCAACTGCTTCTTTTTCTTC-3’
を使用した。
上述の方法により、HbCPT5遺伝子が得られた。得られた遺伝子について、その配列を同定し、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定した。
前記取得したPCR断片にdA付加を行った後、pGEM-T Easy Vector System(Promega)を利用してpGEM-T Easy Vectorに挿入し、pGEM-HbCPT5を作製した。
前記作製したVectorを用いて大腸菌DH5αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとX-galを含むLB寒天培地上で培養し、青/白スクリーニング法によって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、LB液体培地上で37℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はFast Geneプラスミドミニキット(日本ジェネティクス)を使用した。回収したプラスミドに挿入された遺伝子の塩基配列に変異がないことをシークエンス解析により確認した。
AtCPT5 (At5g58780)の完全長cDNAはNational Bio-Resource Projectを通して理化学研究所バイオリソースセンターから提供された(リソース番号:RAFL06-16-E16)。
〔各断片の作製〕
変異体遺伝子作製のための、PCR断片は以下のプライマーを使用したPCRを行うことで作製した。PCRはKOD-plus-Neo(TOYOBO)を使用し、説明書に従って行った。PCRは、98℃で10秒、58℃で30秒、68℃で1分を1サイクルとして、35サイクル行った。
プライマー9:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGTTGTCTATTCTCTCTTCTCTTTTATCT-3’
プライマー10:Rv 5’-GTCGAAGACCAATATCAGGCCAAAGG-3’
プライマー11:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGGAAATATTTGAGGCTGG-3’
プライマー12:Rv 5’-GAAGACCAATCTCCGGCCAC-3’
プライマー13:Fw 5’-CCTTTGGCCTGATATTGGTCTTCGAC-3’
プライマー14:Rv 5’-TACAGGTTTTCCTCGAGTTATTTTAAG-3’
プライマー15:Fw 5’-GTGGCCGGAGATTGGTCTTC-3’
プライマー16:Rv 5’-TACAGGTTTTCCTCGAGTTATTTTAAG-3’
プライマー17:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGTTGTCTATTCTCTCTTCTCTTTTATCT-3’
プライマー18:Rv 5’-TGATTGGCCGAGGCGGCC TTATTTTAAG-3’
プライマー19:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGGAAATATTTGAGGCTGG-3’
プライマー20:Rv 5’-TGATTGGCCGAGGCGGCC TTATTTTAAG-3’
無細胞発現用ベクターpEU-E01-MCS-TEV-His-C1は制限酵素EcoRVとKpnIで処理し、ゲル回収によって精製した。SLiCE反応に用いるSLiCE溶液は、以下のように作成した。
培養した大腸菌DH5α 0.3~0.4gを3% Triton X-100を含む50mM Tris-HCl(pH8.0)1.2mLで穏やかに懸濁し、室温で10分間インキュベートした。インキュベート後、4℃、20000×gの条件下で2分間遠心し、上清を回収した。回収した上清に等量の80%グリセロール溶液を添加し、SLiCE溶液とした。SLiCE溶液は一定量ごとに小分けし、使用するまで-80℃で保管した。
AtCPT5全長
プライマー21:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGTTGTCTATTCTCTCTTCTCTTTTATCT-3’
プライマー22:Rv 5’-TGATTGGCCGAGGCGGCCTCAAACCCGACAGCCAA-3’
プライマー23:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGGAAATATTTGAGGCTGG-3’
プライマー24:Rv 5’-TGATTGGCCGAGGCGGCCTACAACTGCTTCTTTTTCTTC-3’
プライマー25:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGTTGTCTATTCTCTCTTCTCTTTTATCT-3’
プライマー26:Rv 5’-TGATTGGCCGAGGCGGCCTTATTTTAAG-3’
プライマー27:Fw 5’-ACATCACCAAGATATCATGGAAATATTTGAGGCTGG-3’
プライマー28:Rv 5’-TGATTGGCCGAGGCGGCCTTATTTTAAG-3’
前記作製したVectorを用いて大腸菌DH5αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとX-galを含むLB寒天培地上で培養し、コロニーPCRによって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、LB液体培地上で37℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はFast Geneプラスミドミニキット(日本ジェネティクス社製)を使用した。
pGEM-HRBPを制限酵素Xho Iで処理したのち、同様にXho Iで制限酵素処理した無細胞発現用ベクターpEU-E01-MCS-TEV-His-C1に挿入し、pEU-C1-HRBPを作製した。
更に、pGEM-REFを制限酵素Xho IとBam HIで処理したのち、同様にXho IとBam HIで制限酵素処理した無細胞発現用ベクターpEUE01-MCS-TEV-His-C1に挿入し、pEU-C1-REFを作製した。
前記作製したVectorを用いて大腸菌DH5αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとX-galを含むLB寒天培地上で培養し、コロニーPCRによって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、LB液体培地上で37℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はFast Geneプラスミドミニキット(日本ジェネティクス社製)を使用した。
〔ゴム粒子の調製〕
ゴム粒子は、5段階の遠心分離によってパラゴムノキのラテックス(Heveaラテックス)から調製した。Heveaラテックス900mLに、20mMのジチオスレイトール(DTT)を含む1M Tris緩衝液(pH7.5)100mLを添加し、ラテックス溶液を調製した。得られたラテックス溶液を、1000×g、2000×g、8000×g、20000×g、50000×gの異なる遠心速度で段階的に遠心分離した。遠心分離はいずれも4℃、45分で行った。50000×gでの遠心分離で残ったゴム粒子層に、3-[(3-コラミドプロピル)ジメチルアミノ]-プロパンスルホン酸(CHAPS)を終濃度0.1~2.0×CMC(臨界ミセル濃度CMCの0.1~2.0倍)になるように加え、ゴム粒子を洗浄した。洗浄処理後、洗浄されたゴム粒子を超遠心分離(40000×g、4℃、45分)によって回収し、等量の2mMのジチオスレイトール(DTT)を含む100M Tris緩衝液(pH7.5)に再懸濁した。
無細胞蛋白合成は、WEPRO7240H Expression kit((株)セルフリーサイエンス製)を使用して行った。前記〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕で獲得したベクターを鋳型に、WEPRO7240H Expression kitのプロトコルに従って、mRNAの転写反応を行った。
転写反応後、得られたmRNAはエタノール沈殿により精製した。
透析カップ(MWCO 12000)(Bio-Teck社製)中に、以下の量をそれぞれ添加した。WEPRO7240H Expression kitのプロトコルに従って全量60μLで反応溶液を調整した。反応溶液にゴム粒子を1~2mg添加した。更に、PP容器No.2(マルエム容器)にSUB-AMIX 650μLを添加した。
透析カップをPP容器No.2にはめ、26℃で蛋白合成反応を開始した。反応開始から2度のmRNAの追加と透析外液(SUB-AMIX)の交換を行った。反応は24時間行った。
透析カップの溶液を新しい1.5μLチューブに移し、反応後のゴム粒子を超遠心分離(40000×g、4℃、45分)によって回収し、等量の2mMのジチオスレイトール(DTT)を含む100M Tris緩衝液(pH7.5)に再懸濁した。
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を以下の方法により測定した。
まず、50mM Tris-HCl(pH7.5)、2mM DTT、5mM MgCl2、15μM ジメチルアリル二リン酸(DMAPP)、100μM 1-14Cイソペンテニル二リン酸([1-14C]IPP)(比活性:5Ci/mol)、10μL ゴム粒子溶液を混合した反応溶液(Total 100μL)を調製し、30℃で16時間反応させた。
反応後、飽和NaClを200μL加え、1mLのジエチルエーテルでイソペンテノールなどを抽出した。次に、水相のポリプレニル二リン酸を1mLの食塩水飽和BuOHで抽出し、その後更に、水相の超長鎖ポリイソプレノイド(ゴム)を1mLのトルエン/ヘキサン(1:1)で抽出し、放射活性を計測した。各層の放射活性は液体シンチレーションカウンターで14Cのカウントを計測した。放射活性(dpm)が高いほど、超長鎖ポリイソプレノイド(ゴム)が多く生産されており、ゴム合成活性が高いことを示す。
前記合成した超長鎖ポリイソプレノイド(ゴム)の分子量分布を下記の条件でRadio HPLCにより測定した。結果を図2に示す。
HPLCシステム:GILSON社製
カラム:TOSOH社製のTSKguardcolumn MP(XL)、TSKgel Multipore HXL-M(2本)
カラム温度:40℃
溶媒:Merck社製のTHF
流速:1ml/分
UV検出:215nm
RI検出:Ramona Star(Raytest GmbH)
〔比較例1と実施例1〕
結果を図2、3に示した。図2、3より、比較例1では短・中鎖イソプレン鎖合成活性が高かった一方、実施例2では短・中鎖イソプレン鎖合成が約0.01倍に減少していた。一見すると、長鎖イソプレン鎖合成活性は変わらないように見えるが、GPCによる分子量分布を確認したところ、生成物の分子量が高分子化していることが分かった。
結果を図4に示した。図4より、比較例2では短・中鎖イソプレン鎖合成活性が高かった一方、実施例2では短・中鎖イソプレン鎖合成が約0.37倍に減少しており、代わりに長鎖イソプレン鎖合成活性が約3.1倍に増加していた。このことからHbCPT5においてもC末端をHRT1型にすることで生成物の鎖長の分子量を高分子化していることが分かった。
配列番号1:パラゴムノキ由来のHRT1のアミノ酸配列
配列番号2:パラゴムノキ由来のHRT1をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号3:シロイヌナズナ由来のAtCPT5のアミノ酸配列
配列番号4:パラゴムノキ由来のHbCPT5のアミノ酸配列
配列番号5:シロイヌナズナ由来のAtCPT5をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号6:パラゴムノキ由来のHbCPT5をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号7:AtCPT5-C末端HRT1のアミノ酸配列
配列番号8:HbCPT5-C末端HRT1のアミノ酸配列
配列番号9:AtCPT5-C末端HRT1をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号10:HbCPT5-C末端HRT1をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号11:パラゴムノキ由来のHRBPをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号12:パラゴムノキ由来のHRBPのアミノ酸配列
配列番号13:パラゴムノキ由来のREFをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号14:パラゴムノキ由来のREFのアミノ酸配列
配列番号15:プライマー1
配列番号16:プライマー2
配列番号17:プライマー3
配列番号18:プライマー4
配列番号19:プライマー5
配列番号20:プライマー6
配列番号21:プライマー7
配列番号22:プライマー8
配列番号23:プライマー9
配列番号24:プライマー10
配列番号25:プライマー11
配列番号26:プライマー12
配列番号27:プライマー13
配列番号28:プライマー14
配列番号29:プライマー15
配列番号30:プライマー16
配列番号31:プライマー17
配列番号32:プライマー18
配列番号33:プライマー19
配列番号34:プライマー20
配列番号35:プライマー21
配列番号36:プライマー22
配列番号37:プライマー23
配列番号38:プライマー24
配列番号39:プライマー25
配列番号40:プライマー26
配列番号41:プライマー27
配列番号42:プライマー28
Claims (14)
- ゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列を、ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列と同一に又は類似するアミノ酸配列に変異し、
ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列と類似するアミノ酸配列は、ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列と、90%以上の配列同一性を有し、ゴム粒子上に存在可能なアミノ酸配列であり、
前記ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質が、パラゴムノキ、ロシアタンポポ又はグアユール由来のゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質であり、
前記ゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列が、該蛋白質のC末端から上流50アミノ酸であるC末端を含むアミノ酸配列であり、
ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域が、該蛋白質のC末端から上流50アミノ酸である変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質。 - ゴム粒子上に存在しないシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列を、ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質のC末端領域のアミノ酸配列と同一の又は類似するアミノ酸配列に置換した請求項1記載の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質。
- 前記ゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質が、パラゴムノキ又はロシアタンポポ由来のゴム粒子上に存在するシス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質である請求項1又は2記載の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質。
- 請求項1~3のいずれかに記載の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質を用いることを特徴とするポリイソプレノイドの製造方法。
- 生体外で、請求項1~3のいずれかに記載の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質を膜粒子に結合させる結合工程を含む請求項4記載のポリイソプレノイドの製造方法。
- 請求項4又は5に記載のポリイソプレノイドの製造方法によりポリイソプレノイドを製造する工程と、得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び前記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法。
- 請求項4又は5に記載のポリイソプレノイドの製造方法によりポリイソプレノイドを製造する工程と、得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び前記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法。
- 請求項1~3のいずれかに記載の変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質をコードする遺伝子を含むベクター。
- 植物での蛋白質発現に用いられるプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結された変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質をコードする遺伝子を含む請求項8記載のベクター。
- 乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結された変異シス型プレニルトランスフェラーゼ(CPT)ファミリー蛋白質をコードする遺伝子を含む請求項8記載のベクター。
- 請求項8~10のいずれかに記載のベクターが導入された形質転換植物。
- 請求項8~10のいずれかに記載のベクターを植物に導入することにより、該植物においてポリイソプレノイドを製造する方法。
- 請求項8~10のいずれかに記載のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物によりポリイソプレノイドを製造する工程、得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び前記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法。
- 請求項8~10のいずれかに記載のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物によりポリイソプレノイドを製造する工程、得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び前記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法。
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