JPH01503673A - フェニルアラニンアンモニアリアーゼの製法 - Google Patents

フェニルアラニンアンモニアリアーゼの製法

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は蛋白質フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(以下、PALと略称する )をコードする遺伝物質、より詳細には天然〆状態のPALを]−ドする遺伝子 に通常認められる介在非コ植物、酵母菌、真菌およびストレプトマイシート内に 洪生ずるフェニルアラニンアンモニ・アリアーゼ(PAL : EC4,3゜1 .5)は、し−フェニルアラニンの非酸化的脱アミノ化反応を触媒してtran s−ケイ皮酸にする(Qilbertら。
1985参照)。この酵素はフェニルケトン尿症の治療および診断S−ケイ皮酸 からのL−フェニルアラニン合成に応用される(Yamadaら、 1981) 。植物の場合、この酵素は、フラボノイド生合成に関与し、光照射によって誘導 されるのに対し、ガーキンおよびカラシナの実生植物においては、不活性酵素の 構成プールの活性化の結果としてこの誘導が生じる(Attridgeら、 1 974) 、他の植物種においてハ、光1979)。ガーキン、リンゴ、サツマ イモ及びビンワリのPΔLは特定の不活性化系によっても制御される(Tan、 1980)。
ある種の担子酵母菌においては、フェニルアラニンが炭素、窒素およびエネルギ ーの唯一の供給源として作用し得る。PALはアミノ酸の異化における初期反応 を触媒するため、該酵素はフェニルアラニン代謝の制御に重要な役割(Rhod osporidium toruloides)においては、L−フェニルアラ ニンまたはL−チロシンの存在によってPALが誘導される(Marusich ら、 1981) 、グルコース、およびグルコース存在下のアンモニアがPA L合成を抑制する(Marusichら、 1981)するのに対し、不活性な 前駆体の活性化やPALの分解速度の低下ではなく、むしろ酵素の生体内合成の 結果としてPAL活性が誘発される(QilbertとTu l I y、 1 982) 。グルコースはPAL合成を抑制するが、酵素の安定性には影響を及 ぼさないのに対し、アンモニアはフェニルアラニンの取込みを阻止するため、誘 発物質の排除により酵素合成が抑制される(Gilbertら、 1982)。
異なる生理学的条件下で増殖したR、トルロイデスから単離したmRNAの試験 管内翻訳データから、フェニルアラニン、アンモニアおよびグルコースは機能化 PALmRNAのレベルを調節することによってPAL合成を制御することが示 された(Qilbertら、 1983)。
近年開発された遺伝子工学の手法により、一般的な微生物あるいは工業的規模で 容易に増殖させ得る微生物、特にある種の細菌または酵母菌は変形した遺伝物質 (DNA配列)を有するため、蛋白質等の所要の化合物を生成できるようになっ た。概括的に8うど、化合物をコードするポリヌクレオチド配列の遺伝子から成 るプラスミドを、宿主の遺伝子装置に指令して化合物を合成させる他の遺伝物質 と共に宿主微生物に挿入することによって、この目的が達成される。
最近、PALをコードする遺伝子が8.5kbゲノムのpstl断片としてクロ ーン化された(Qilbcrtら。
1985)。これらの研究から、PALが2.5kbのモノジストロニックi+ RNAから合成されること、および遺伝子がR,トルロイデスゲノム内に単一コ ピーとして存在することが示された。クローン化したPALi伝子を大腸菌(E 、C:01i)(Gilbertら、 1985)およびサツカロミセス・セレ ビサ工Saccharomyccs Ccrevisae(Tul ly、!: ai Ibert、1985) ’に導入してもPAL蛋ら、 1985)およ び酵母菌サッカ・Oミセスーセ1し這ピサエ内(TullyとG11bert、 1985)にR,トルロイデス1由来のクローン化PALを]−ドする遺伝子を 導入する試みが成されて来たが、これらの非相同宿主ではPAL蛋白質が生成さ れなかった。
本発明の目的は、R,l−ルロイデス以外の宿主生物体に導入し得、次いで該ホ ストがPAL蛋白質を産生する遺伝物質を提供することである。以下の説明から 、本発明のその他の目的と利点についても明らかとなろう。
本発明の第1の態様によって、真核微生物由来の対応するイントロン含有構造遺 伝子から誘導したイントロン欠失構造遺伝子を提供し、このときイントロン欠失 遺伝子が原核微生物または真核微生物の内部で産生物を発現し得る。という条件 で、どちらの遺伝子も同一の遺伝子産物をコードする。遺伝子産物は、生産させ ようとする化学的化合物、例えば蛋白質とすることができる。
本発明の第2の好適な態様によって、PALまたはPAL活性を示すポリペプチ ドをコードするイントロン欠失構造遺伝子を提供する。この遺伝子は、真核生物 体のP A L産生株から誘導するのが好ましく、R,トルロイデス株から誘導 するのが最も好ましい。
R,トルロイデスの遺伝子DNAポリヌクレチド配列の一部を第3図に示す。こ の配列を決定するために発明者らが用いた方ン」の標識位置から「終止コドン」 の標識位置まで延びており、数にして6個のイントロンをIV81〜IVS6で 標識している。これらのコドンによりコードしたアミノ酸を各種の制限部位と共 に示している。従って、本発明の第2の態様の遺伝子は、第3図の開始コドンか ら終止コドンまでのコドン配列と同じが、それに関連するか、それから誘導され るが、あるいはそれと相補的なりNA配列から成るのが好ましく、この場合6個 のイントロンIVSI〜IVS6が欠失ており、次のようなポリヌクレオチ配列 を有する。
ATCcSCCCT CCACCA ACCTCG CACTCCCACC:T  CCCACCTCCCCCACAACCCACcrCACG CACノCCA CATCCrCCAG AAG ATCCTC[/CCCCCCCCACCCA ’C,TCCACCCTCCAJ、 CTCCACCCCTACTCCCrCA ACCTC(−CスCaCCTCcrCTC(、CCCcci:、 Acc A AC(、GCAOCCCT cTc ace CTCAAC(、ACAasCA = CACATCCCCTCA A−ACATT CACAAA TCCCTC cac rrc rrc CGCTCCJA CTCTo: ATCAC;CC rCTACC7−CGTCACC; 人Cr GCA TTT cGCGCA  To:G”a cac ACCC(:C人0: CAG CACccc ATC TCCCTCCACAAG GcT CrCCTCCAG CACCACCTC TGCαIT CTT CTC工T TCCTCCTrCCACTCG TTC C■CTCC,4CGCG(T CTCCAG AACTCCCrI’ CCC CTCCaCCrT GTT C父α℃CCCATCACA ATCCCC(T CAACAO: TTCA工CCV (、C5CACTCCαπαcCo: C Tc(TCGTCCTCCACC,CG CTCACCAACTrCCTCAA CCACC父ATCACCCCCATCGTCCCCCTCCCCCCCACC ATCTC’r C−C0TCCα:Cl、LCCTCτCT CCT CrC TCCTACATr GCA ccCGCCATCAcc(、CT CACCC G cACAO:AACCTCCAC(TCCTCCAC(、A(:、 (、G CAACCAG AACATCCTCTACCal:’ C(ACAC(:CC ATCO:CCTCTrCAACCTCCACCCC(TCcCCTCcGCC CG AAGGAA CGr CTC(、CI’ CTCGTCAAC(、CC ACCGcC(TCTCA (、CA TCCATC(、CCACCCTC(1 ,T CTC; CAC(、ACC,u CACATCCTCTCCCTCCT CTCG CACToc:TCACCCC0ATCACC(TCcλA GcG  ATCCTCCcc C,A’、CCCC−CTCc?rにCACCCCTr CCTT CACCACCrCACCCOOCCT CACCCCAce cA c ATCCAA(、TCCCCcCAAACATCCCS AACcTCCT c GAC,CCA人(、CCCCTTT 00丁 c’rcCACCAT C AG CAG CAG (TC,AAG CrCAACCACCACCACGC CATT CTCC(ACACCACCccTACCCCTTG CGCACG TCT CCT CACTGG CTCCGCCCCCrCCTCAcCCAC CTCATT CACcCcCACcCcCTCCTCACCATCCACGo : c(ACACTCCACCACCCACAACCCT CTCATCCAC CTCCACAACAAC; ACT TCCCACCACGGCCCCAAT  TTCCAG(、CT GCCα:T GTCα: AACACCATC以C AAに ACT C(lA: CTCC(4CTCGCICCACATCGCC AAGCTCAACTTCAcGCAGCTCACCCACATG CTCAA CGCCGCCATCAACCCCccc CTCCCCTCC,TGCCTC cCCCCCC,u CACCCCTCCCTCTCCTACCACTCCAA CCCCCTCCACATCCCCαr (、COGCG TACA工TCcC ACTTCGC,t CACCTC(、工AACCCTCTCACCAcc C AT CTCCACCCG CCT cAG ATCGCG AACcxc G CG (TCAACTCCCTr GCCCTCATCTCCαπCI:T C 父ACCACCGAGτCCAACCACGTCCTT TCT CT’CCT CCTCCCCA工CACCrCTACTGCCWT CT: CAAα):  ATCCACTrG CCC(−:CATCGAGTTCGAに TrCAAC AACCAC; TTCccc CCA GCCATC(:TCTCCCTCA TCCACCACCACTTr (、cCTCCCCCATCACCCGCTC C。
AACCTCCGCCACCAc cTc cTc cAG AAc(TG A ACAACACCCTCα工AAGCCCCTCCAC; CAG ACCAA CTCG TACCACCTCCTCCCCCCCTCCCACCACC,CC ’rTCTC(: TI’Cα℃α:CCGCACCGTCαCCACCTC( ’TCTCCTCG AcCTCC; CTCTCCCTCccc ccc C TCAACGCCTCC; AACcrc GCC(、CCα℃αC’FCC( 、CCA″:c TCG CTCACCCGCCAA GTCCCCC,、GA CCTrCTOOTCCGCC−1:、CCTCCACCTCG TCC; C CCC,CCC’rCTCCTACCTCTCG CCG CCCACT■LT CCAACATCTACCAGC;CCATC)JG TCtll; C1−C ACG ATCAACAACGTCCTCCTCAACATCCTCcCT T AC。
遺伝学の分野では周知のように、確定配列と関連するかあるいは確定配列から誘 導されるDNA配列は、同じ蛋白質または前記確定配列によって発現される類似 の活性を有するポリペプチドをコードすることができる。例えば、関連した配列 または誘導された配列は塩基をいくつか欠失したり、付加的な塩基をいくつか包 含したりすることができる。また、遺伝子コードを縮退し、複数のコドンで同一 のアミノ酸をコードすることも周知となっている。従って、関連した配列または 誘導された配列が第3図に挙げたものと異なるコドンを含むこともあるが、それ らが同一のアミノ酸をコードするのが好ましい。以上に挙げた方法の1つまたは それ以上の方法でこのようなコドン配列に関連するか、あるいはそれから誘導さ れた遺伝子が本発明に含まれる遺伝子である。
この配列に関連する遺伝子あるいはそれから誘導された遺伝子は、該配列に対す る類似度から定義する事もできる。類似度はできるだけ高い方が好ましい、理想 は100 %であるが、−股木発明の第1または第2の態様による遺伝子を宿主 生物体に導入出来るようにするためには、遺伝子を組換えDNA分子の中に含ま せるのが一般的な方法である。従って、本発明の第3本発明の第3の態様による プラスミドは、遺伝子を宿主に導入するベクターとして使用し得るものであり、 従ってプラスミドを導入しようとする宿主に違当な遺伝物質を付加的に含ませる こともできる。好適には、この遺伝物質が前記濱伝子に作動的に結合している発 現制御配列、および/または該プラスミドを導入してPAL等の産物の発現が期 待される生物体に対する適当な他の遺伝子からの転写/翻訳信号を含んでも良い 。
本発明の第3の態様によるプラスミドの構造は、ベクターとして使用する相手と なる宿主生物体に応じて変化するが、本発明の第1または第2の態様による遺伝 子を適当な調節信号の下流に配置することによって、現在使用している産生生物 体の何れにおいてもR,トルロイデスPALの発現をIH!できることを利用し て、ベクターを作成することができる。産生生物体としシュードモナス・プチダ (Pseudomanas put+da> 、エルウイニア・クリサンテム( Erwinia chrysanthem)および哺乳類の細胞系がある。
同様に、ブラ、スミド内のPALのCDNAコード領域のすぐ上流にある調節用 DNA配列の性質も適当な特徴的な転写/翻訳信号で構成されることになる。例 えば、S、セレビサエに使用する揚 合、リポソーム結合部位(CCACCTTの配列に準じる)をPAL遺伝子の翻 訳開始点の上流の適当な位置に配置し、 S。
セレビサエ、ボスホグリセラートキナーゼおよび交配因子遺伝子から誘導される ような強力な転写信号をリボゾーム結合部位の5′側に配置することができる。
プラスミド自体が標準レプリコン(2p等)と選択可能なマーカー(Leu2.  Trp 等)を用いても良い。大腸菌に使用する場合も同様に、適当な細菌リ ポソーム結合部位を有するPL、 tac trp 、 racまたはlac  プロモータ並びにCo1E1(DBR322およびpUcプラスミド) 、R3 FIOIOおよび旧の脱走レプリコンで構成される。天然のPALm伝子に存在 するイントロンが、R,トルロイデス以外の生物体内で、PAL発現に対する障 壁として作用するため、本発明を用いると、6@のイントロンの存在により天然 PALm伝子m発子できない広範囲の原核宿主および真核宿主において、PAL を産生ずることができる。
本発明の第4の態様によって、本発明の第3の態様による少なくとも1つの組換 えDNA分子を用いて形質転換された宿主生物体、特に大腸菌、エルウィニア( Erwinia)属、クロストリテアロテルモフイラス(B、 Stearot hermophi Ius)、シュードモナス属の各菌株、桿菌、酔a菌等のそ の他の微生物、その他の真菌、動物または植物の宿主を提供し、好適には原核宿 主を提供する。
本発明はまた、イントロンを欠失した遺伝子の製造方法も提(I) R,t−ル ロイデス株からPALのm R六±を単離する段階と、 N 、A (U)前記mR大士から、それぞれがPALまたはPAL活性を示すポリペプチ ドをコードする遺伝子の一部を含む2つのイントロン欠失相補DNA (cDN A)配列を合成し、2つの遺伝子部分で遺伝子の3′末端と5′末端を含むよう にする段階と、 (III) (It)項に記載の2つのcDNA配列を結合してPALまたはP AL活性を示すポリペプチドをコードするイントロン欠失構成遺伝子を形成する 段階とを含んでいる。
(I[>の段階で使用する方法として、プラスミドに含まれるcDNA配列を形 成するクローン化方法を使用することができる。その場合、適当な制限部位でプ ラスミドを切断することによりプラスミドからcDNA配列を分離した後、2つ の配列を結合して遺伝子を形成する。次に遺伝子を他の遺伝物質と組合せて該遺 伝子を含むプラスミドを形成する。その、後、例えばDUC9のような適当な周 知のプラスミドを適当な部位で切断する。所望により、今度はこのプラスミドか ら遺伝子を順次切除し、さらに他の遺伝物質と組合せてベクターとして使用し得 る他のプラスミドを形成することもできる。当業者に周知の標準的な組換えDN A技術を本発明の方法に用いても良い。
上記の方法の(I[l)の段階で産生する遺伝子および/またはプラスミドは、 本発明の第2および/または第3の態様によって包含される遺伝子またはプラス ミドのうち何れか1つとするのが好ましく、従って(II)の段階で産生ずるC DNA配列は、その遺伝子またはプラスミドの一部とするのが好ましい。(n) の段階で産生プするCDNA配列および該cDNA配列を含むプラスミドも本発 明の別の態様を成すものである。
従って本発明は、本発明の方法によって産生ずるプラスミド等のDNAポリヌク レチド配列と同じか実質的に同じである、あるいは該DNA配列から誘導される かそれに関連するDNAポリヌクレチド配列も含む。
次に、添付図面を参照しながら本発明について例示的に説明する。
第1図は、PAL遺伝子を載せた遺伝子DNAの配列決定方法を示す略図である 。
第2図は、天然の遺伝子のイントロン配列を欠失したPAL選伝遺伝子せた2つ のプラスミドの製法を示す。
第3図は、ゲノムクローンの完全なヌクレオチド配列、IVS1〜IVS6の標 識を付けた本発明において除去されるイントロン配列・およびPALの対応する アミノ酸配列を示す。
第4図は2つのCDNAプラスミドである1)PALlとpPAL2を結合して 、イントロン欠失遺伝子を含む組換えプラスミドDPAL3を形成する方法を示 す。
第5図および第6図は、重複するcDNAクローンであるpPALlおよびpP AL2のDNAヌクレオチド配列をそれぞれ示す。
第7図はプラスミドpPAL4からのPAL蛋白質の発現を示す。
以下の説明および図面において使用する略称は下記の通りでアラニン Ala  ウラシル U アルギニン Arg チミン T アスパラギン Asn シトシン C アスパラギン酸Asp アデニン △ Asn +ASp Asx グアニン Gグルタミン酸 Glu Gln 十Glu Glx グリシン cry ヒスチジン 旧S イソロイシン Ile ロイシン Leu リジン Lys メチオニン Net フェニルアラン Phe 第1〜6図を参照しながらより詳細に説明する。
第1図において、適当なりローン(C)HG3)から領域2を単離し、T4DN A合成酵素による処理で環状化した後、富波処理によって断片化し、500〜1 ooob pの断片をM 13m p 8に挿入した。制限部位BamH1,B c I Iおよび5allを用いて、領域(1)を各種の特定断片としてM 1 3m p 8およびM13m p 9に挿入した。指示した断片(3)をM 1 3m p8にクローン化することによって、BamHT部位に及ぶDNA配列を 得た。
第2図では、旧deckerl!:Hessing(1983)の方法によりク ローン1 (pPAL 1)を得た。匪により誘導したR、トルロイデス細胞か ら得たmRNA全体をアニールしてオリゴ(dT)を尾部に結合したpUc9に した後、4つの全dNTPの存在下で逆転写酵素を用いて第1鎖のcDNAコピ ーを合成した。
新たに合成した鎖の末尾にターミナルデオキシヌクレオチジルトランスフエラー ゼを用いてオリゴ(dC)をつけた。アルカリ性スク[]−ス勾配による分画後 、cDNA配列を載せた一本鎖ブラスミドDNAをアニールして変性オリゴ(d G)を尾部に結合したpUc9とし、DNAポリメラーゼ(K I enow) を使用すると共に4つの全dNTPを添加して第2鎖を合成した。
GublerとHoffman (1982)の方法を用いてクローン2(pP AL2>を構築した。逆転写酵素とpal mRNAに対してした。RN A  −D N A ハイブリッド内のRNAをRNaseHでニックし、大臆菌のD NAポリメラーゼによってRNAtiをDNAで置換した。このとき、プライマ ーとしてニックされた一重してオリゴ(dG)を尾部に結合したpB R322 とした。
両方の方法を用いて産生したcDNAクローンを大腸菌JM83に形質転換し、 〔α−32p)dATPを標識したpHG3制限第3図では、5つのランダムに 誘導したペプチド断片につき決定したアミノ酸配列を対応する残塁上に線を引い て示している。イントロンをIV81〜6で標示し、6個I全部に共通の配列は 対応する領域に下線を引いて示している。5′の非コード領域の上に引いた破線 はその配列の中でTCに富む領域を示すのに対し、そのすぐ下流側の下線と上線 は反復領域を標示でいる。この配列は第1図の最も左側のBC11部位からCD NAクローンpPAL1の3′末端(第2図)まで延びている。
第4図では、pPALlとpPAL3の環状マツプの一重線がそれぞれpUC9 誘5DNAとpLJc8誘導DNAを表しねしているのに対し、pPAL2の一 重線はpB R322D N Aを表している(pPALlとpPAL2の構築 については第2図参照)。pPAL2の二重線がPALI伝子の転子ントロン欠 失」の5′末端を表すのに対し、pPALlの太い線は遺伝子の3′末端を表し ている。I) A L i転子の5′末端をpPAL2から1.Okb Pst l−Fspl断片として!!@シた後、遺伝子の3′末端を有するpPALlか ら単離した1、25k bのン(TAG)コドンの位置(第3図参照)を矢印で 示している。
PAL遺伝子の挿入方向は、lacプロモータ(lacpo)を有するベクター からの翻訳読み通しが起こらないようにする。
第5図および第6図では、2つのクローンを結合してpPALを形成するために 使用したL呈上1部位を、対応するヌクレオチドに下線を引いて示している。
第7図では、隣接する/aCプロモータからの翻訳読み通しが起こるように、E C0RI−Hind III断片としてpUC9にクローン化したpr’AL3  (第4図)からの完全なPAL遺伝子を含むプラスミドpPAL4を示してい る。
Amersham International P L Cから入手したプラ スミド依存1、、DNA無添加、2.プラスミドpUc9.3.プラスミド1) PAL4゜蛋白質マーカーの分子量をMrとする。
以下の記述においては、下記の一般的手続きを参照するもの本発明により使用す る微生物株とプラスミドは表1に列挙した通りである。
敷基 L−ブロス(トリプトン1%、酵母菌抽出物0.5%、NaC1o、5%)にお いて[、coli株を培養した。2%(W/V)のバクト寒天(Difco)を 添加して培地を固化した。アンピシリン100μQd”を用いてトランスフォー マントの選択、成長を行なった。5−ブロモ−4−クロO−インドイルーβ−D −ガラクトシド(x−Gal)を添加して最終濃度2μd−1にすることによっ て、機能化β−ガラクトシターゼを検出した。
化学物質 〔α32p)dTAPとCDNA合成キットをAmerSham Intern ationalから入手した。アガロース、制限N″#、T4 DNAリガーゼ 、ターミナルデオキシヌクレオデジル転移酵素および17メル一般配列プライマ ーを3ethesda Re5earch 1aboratoriesがら購入 した。タレノウDN酵素合醇素をBoehr ingerMannheimから 、dTテールドpUC9をPL−Biochem i ca l sから購入し た。逆転移酵素はAnolicon Biotechnology Ltdから 購入した。
その他の試薬は全て、Sigma ChemiCaj2 Co。
または、BDHから購入した。
表1 使用した微生物株とベクター rpsL、 thi−1o8od Iacl zH15Messing(198 2)E、C01i JMIOI (lac−poす、5upE、thi Mes sing andFlacl 2m15 traロ 且り立V i e r i  a (1982)プラスミド DuC9Amp’ Vieria andMessing(1982) pBR322^amp TetRBolivar ct al。
EIGH3、Al11l)R(PAL遺伝子クローン) G11bert et  at。
pPALI AmpR(3’末端PAL cDNA 新規プラスミドpPAL3  AllID (PALcDNA 遺伝子全体)新規プラスミドpPAL4 A mD (PAL cDNA 遺伝子全体)新規フラスミトバクテリオア?−ジ H13mp8 Messing andVieria(1982) IIl13u+p9 He5sir+g andVieria(1982) DNA操作 全ての制限W#素とDNA/RNA変性酵素は供給者の推奨する条件下で緩衝液 に入れて使用した。プラスミドの形質転換技術およびDNAのあらゆる操作につ いてはこれまでに記載されている。(Minton et at、、1984) 。
シラスミド DNA分離 [ブリジ溶解(Brij Iysis)Jそれに続<CsCl密度勾配遠心分離 により、アンピシリンを含むL−ブロス培養の19から(:、coliプラスミ ドを精製した(C1ewcll&1−1e l i nsk i 、 1969 年)。小形プラスミド分離選抜のためには1−(o 1mes&Qu i g  l ey(1981)の高速沸騰法を使用した。
゛処理による Jの 配列を決定しようとするDNAをDe i n i ngr (1983)の方 法によりランダムプラント末端断片に断片化した。こうして獲得した断片をM  13m p 8の3ma 1部位にクローン化し、3anger等<1980> に記載のように鋳型DNAを作製した。
ヌクレオチドの配列決定 5anaer et a l (1980)のジデオキシ法によってヌクレオチ ドの配列決定を行なった。S t ad e n (+980)のコンピュータ プログラムを用いて、獲得したデータをコンパイル・して完全な配列とした。
PALmRNAの分離 容易に入手可能なR,toruloides株IFOO559(1986年9月 8日付きでブタベスト条約の規定によりノーウィッチ(英国)のNCYCに寄託 されたN CY 01589)を用いて、先に記載されたように(Gi Ibe rt et al、1985)PAL mRNAを分離シタ。
cDNAのクローニック(合成) ■)ハイデツカ−・メツシング法 使用方法は本質的にHe1decker&Messin。
(1983年)に記載の方法とした。
PALXWR,toru to i des細胞から得たmRNA全部をアニー ルしてオリゴd TテールドpUc9とし、4つの全部のdNTPの存在下で逆 転写酸素を用いて第1鎖のcDNAコピーを合成した。新たに合成した鎖の末尾 に、ターミナルオキシヌクレオチジル転移酵素を用いてオリゴdCを付けた。ア ルカリ性スクロース勾配を用いて分画を行なった後に、cDNA配列を載せた一 本鎖ブラスミドDNAをアニールして変性オリゴdGテールドpucc+とし、 タレノウDNA重合酵素を使用すると共に4つ全部のdNTPを添加して第2鎖 を合成した。
■)ガブラー・ホフマン法 CDNAの第2合成法としてGub l er&Hoffman(1983年) の方法を使用した。逆転写酵素とPALmRNAに1棟 対してキキ的な19マーのプライマー(G A T G A G A G G  G TTGTCGGTC)を用いて第1鎖のcDNAコピーを合成した。RNΔ −DN複合体の中のRNAをRNaSeHを用いて「ニック」し、ニックしたR NAをプライマーとして用いてE。
coli DNA重合酵素によりRNA鎖をDNAで置換した。次に二本鎖DN Aを74 DNA重合酵素の作用によりプラントエンドにし、オリゴdCを末尾 に付けた後アニールしてオリゴdGテールドpB R322とした。
PAL cDN△DNAンの検出 CDNA挿入断片を載せたプラスミドDNAを、F、coliJ N83に形質 転換し、Amp l−ランスフォーマントをPAL特異的DNAについてスクリ ーンした。PALm伝子の転子を叙せた放射標1pHG3DNA小断片を用いた コロニーハイブリッド形成(Qrunste i n&Hogness、197 5)によりこれを実施した。
アミノ酸の配列決定 精製した(Gilbert et al、(1985)の方法による)PAL蛋 白質のペプチド断片を、先行技術に記載の方法(M i nton et al  1984)により分離した。^ppliedBiOSl/StemS%J気相 シークエンサー41〇八を用いた自動気相シークエン性−41〇八ノ酸の配列決 定を行なった。
インビトロ翻訳 イオン非存在下の細菌転写翻訳システムとして、oe VrieS& 2uba y(1967) によって最初に記載されたシステムを変更したのを使用した。
細菌プラスミドに含まれる遺伝子のインビトロ発現に必要な補助溶液とE、co li 5−30抽出物をキットとしてAmersham Internatio nalPLGから購入した。生成した蛋白質を358−メチオニン(Ame r  s h am)で標識し、12%のアクリルアミドゲル(L a emm I  i 、 1970年)上1”5DS−PAGEl、:よッテ分析した。ゲルを 16時間乾燥させた後にオートラジオグラフィーを行なった。
1、PAL遺伝子クローンのヌクレオチド配列決定PAL遺伝子はこれまでに証 明されている通り(Gilbert etal、、1985)、組換えプラスミ ドpHG3を生成するべくpuc8にクローン化された6、7kb BCII断 片の内部でDNAの2.5kbの領域を占める(第1図参照)。遺伝子の大部分 が3kb BamHI断片の上に存在するのに対し、遺伝子の残りの5′末端ハ 0.7kb BamHI−Bc I I断片の上に位置する。従って、3kb断 片を適当なりローン(第1図の断片2)から分離し、ランダムな小断片を音波処 理によって生成(Deininger、1983)してM 13m p 8にク ローニングした。S t ad e n (1980) のコンピュータプログ ラムをするBc l ]−BamHII!Fi片、Bcll−3all断片およ びBamHl−8a I IQ断片(第1図の領域1)ヲM13mp8およびM  13mp9の適当な部位に部位特異的にクローニングすることによって獲得し た。13amH1部位を走査するDNAの配列決定は、第1図のSa l I− XhOI断片(3)をクローニングすることによって達成した。
配列領域の適当なりNA鎖を翻訳した結果、PALをコードし得るオーブンリー ディングフレーム(ORF)が存在しないこ゛とが分かった。しかしこの領域が 確かにPALをコードすることが、翻訳したアミノ酸配列とランダムに誘導した 5つのペプチド断片とを比較することによって確認された。5つのペプチド配列 の全部が翻訳配列の内部に存在していたが、それはいろいろな翻訳リーディング フレームにおいてであった(第2図)。連続したORFが存在しないという事実 は、他の真菌遺伝子と同様に、PALm伝子も転子トロンを含むことを示唆して いるものである。
2、PAL遺伝子を載せたcDNAクローンの分離PΔL介在配列の識別を可能 にするために発明者らはcDNAから遺伝子を再クローニングする方法をとった 。初期実験においてハ、ベクターpUC9と精’!JPALmRNAをもちいて ハイデツカ−・メツシング法(1983)を採用した。pHG3の用してPAL  DNA配列を載せたクローンを識別した。こうして獲得した最大クローンであ るD PA L 1は、PA Ill仏子の3′末端から約1.3 kbを含有 していたく第3図)。遺伝子の5′末端は、ガブラー・ホフマン法(1983)  により作成したC−チルドcDNAをクローニングしてG−テールドpB R 322とし、pPAL2を形成することによって114された。この場合。第1 鎖の合成に使用するプライマーを、先に獲得したC対してイ考的な合成19マー オリゴヌクレオチドとしたく第3図参照)。適当な制限断片をM13mp8とM  13m D 9に部位特異的クローニングすることによって、2つのCDNA クローンのヌクレオチド配列を決定した。
3、PALイントロンの識別 2つのクローンの配列決定により、PALコード配列の中に6つのイントロンが 存在することがv&Hされた。従ってIVS1〜IVS6で標識された6つのD NA領域が完全にpPΔ[1およびCIPAL2の特定領域から無くなっている ことが分かった。6つの欠損領域を調べた結果、全てが3′末端にヌクレオチド CAGを含んでおり、真核遺伝子に普通具られるコンに一致することが判明した 。これらのイントロンのいくつかの5′末端における多数の配列は真核コンセン サス供与体配列(GTA/GAGT)に余り一致しないことが分かった。すなわ ちlVS2.4.5の供与体配列はそれぞれGTGCGT。
GTGCGC,GTGC:GCであった。真核遺伝子のイントロンは一般に、介 在非コード領域を精密にスプライシングするのに必要な配列を含むことが証明さ れている。その他の真核インtoruloidesイントロンの中に存在しない 。その代りに、コンセンサスG/ANG/CTGACに一致する配列が存在する (各イントロン内部の関連配列を第3図にF線で示した)。このような配列はR ,toruloidesに特異的なものであり、生物体と密接に関連している。
visae(Tully and G11beert、1985)の何れにおい ても発現しないことが証明されている。E、coliにおいて発現しない理由は 、PALi伝子に転子トロンが存在することによるものである事は間違いない。
また、S、CereViSae はイントロンをスプライスできるのであるが、 PAI−イントロンのヌクレオチド配列とS。
cerev i saeイントロンに見られるヌクレオチド配列との間に相違が あるためこの酵母菌はR,toruloidesPAL遺伝子を発現できない。
4、連続cDNA P’AL遺伝子の誘導CDNAからPAI伝子転子ローニン グする際に用いた方法により、結果的に遺伝子の3′末端を載せたpPALlと 遺伝子の5′末端を載せたpPAL2の2つのクローンが形成された。上記2つ のプラスミドの挿入断片を融合することによって、PA11造遺伝子の全体を載 せた第3プラスミドを構築した。これを達成するために、PALの5′末端を載 せたpPAL2から1.0kb Fspr−Pst[を断片を分離し、それをD PALlから分離した遺伝子の3′末端を載ぜた1、25kb従ってプラスミド pPAL3はPALIIli造遺伝子全体を載せているが、 天然のRotoru lo 1cles染色体遺伝子に見られる6つのイントロ ンはすべて欠落している。
5、PAL蛋白質の合成 pPAL3からの完全にイントロンをもたないPALm伝子m金子断片を、Ia cプロモータに対して両方向にpUCプラスミドを挿入してクローニングし−U 、 pPAL3 (pUc8)と・pPAL4 (pUc9)を得た。pPAL 4では、PAL遺伝子がpUc9からのl acZプロモータと同疎相にあり、 プラスミド特異的インビトロ翻訳系統においてPAI−蛋白質が合成されること が証明されたこれを示したのが第7図である。反対の向きにあるPALJ伝子( 転子AL3)を用いても、PAL蛋白質は生成されない。現在発明者らは3ac charomyces cerevisiaeにおいてPALi伝子を転子する ことを可能にするベクター系統を開発中である。
入rabcusr C,M、+ J、L、^mbrui、c、HO1cV&th t H,P#de【Sen+ 5. 5harma、c、K■獅メB Marusich、w、c、、R,^、jensen+ and L、O,Za mLt、1981. !nduction oETullv; M、+ and  l’1.J、 G11bert、19115.Transformation  of RhQd0S 0r奄р撃kIIIl toruLotdes、 Gene コロ: 2コ5−240゜ぽU −−切り  コ< 1+リ ψす =uI&Iu−(−<I+11+−( ←く 頓−J< ulJ τ< =U +u l+υ zu zu xu <u コク%P+< −13−< &T14  −< JLI J<(< リu gu << =u <u uuシー −一  =と I+じ コリ イロ χロ コリー(J 、J← 給< −u 1jl− −u J< −←LJu −< << IjCJ JLJ 4u Llu −リ e+XJ *U 6−CJ *lp−ズu <u +−c 区1−い< −01 (コリ リ< JLI u= vuくQ 給< <CJ l−< << <υ  工く ψヒいロ −u+JCJ VAJ hU ωU コロ =←とくり+=←  と< Wl−−1−、J< −←−< >(J −< J< ’r、< 、− < コロ −V−ロ コu zu :l口 −U へU く← −0<1−IJ !−IJI−−1< JCj い(−〇 (ヒ>u −u zu up uu  <u <u >u1/lL3 op ロ← ←ロ +tu :)IJ op = a>< wu uu w←−uw+−・ピLJI/、<−< c+q c+u  x< <u +Iu c−u <uJIJ >Ll mu Wu Zω >u  zu zu<+−−!a い< =U い(−〇 −く い(〉ロ uu <<  ト< << uu コリ くベコ口 コロ −U −ロ =U い口 =ρ  コロ−く −← X< X< −← >< <r−WLIuL) −u <IJ  << −1u −1< >u I/1?コロ らロ :tu <υ ←Q ψ Q 切← コロ−(工ω 工ω コリ −← >o −< 440ロ トド ← 鴫 くQ 工く υト エU aU=U *U >U コQ コ< CCU コ υ−く ズLl −1u WI+−< m< −ヒ1−1m l−< (jLl  =L) uu :Ll −IJUU コQ >ロ クロ (Q とく くυば +j −← −Q 洲(−リ コロ −Q<U =U Uロ −< <u L) U <aLLI −IJ l/+Ll シU <U コロ コ←妥ご ミし = ご 巳8 =85口 =むu%J −L) L)IJ (u WJ −υ >V  <−←== べべ 呵Rゴ尺 モロ 層上 dg ;尺 尺etQ4υ V口  Cυ −υ −υ コリ トυtJLJ +IJ )−< αリ −1く 工 ← い< −Jv、s <u −1< <u <tJ :+ト<< UUO<  )u <J IjCJ 工Q −v 0口 20=8 二じ ―どt仁 =實  でご て8 で=0(←g<CJ コIJ L)Lj WIJ Wu :u二( ,1wl−−u −< ctロ =← −← −←<u !:4 <tJ ul J <IJ 11.l−−< JLJgu り0 =ロ コU いυ ロQ ロ U −υζ(Wi−W−−← −(区IJ ItL+ −←ト←−Q−u −リ  :U <U シU −<fLl &JLl >← りQ コヒ e:u el J acLI−u −ト −リ −← −一 −〇 とり=−クト −< Uロ  −υ −U いく トド トベ:+lJ l/IL) :)LJ elJ 1 49 >< 1jLI :=Ll−一 と< wI−wg +4” −u ピυ  −トーu 、:< −u !Ai−e−1−CJIJ (IJ −LJロー  =Q >← コCCu コQ ムυ −U仁U =< −ロ −h :’J − < リく ベト−U υCJtJロ =υ −υ UU <ω 〉Cぽ← tn u コく ←ロ Vω コU ZC,+ イυWu >< −< WH−< g 、−< −一■ト −ペ ロリ エく ニー −U UU <じ=+u >u  t/+u xu wu :lLI CJLI xu=iS 己8−〉 ;ご 二 に 七じ 霜8 =ご>u 筐u :)IJ <u <u り< =U コυ  コQ−Q −υ −H−IJ −ILI −J< <H−← −トuu vr<  wu <u <IJ uu >u JIJ −uuu a+u zu hu  :l< uu tnu op ot−ctCI/I< いく −← −べ −←  トく αQ 区Q<u <u << r:< *ロ +−< 4< LLI  LLJ=u op 1IJu cta −リ ZU =U >υ 2υ−← 区 Q −ヒ −U (← −< <+ JL) I/l<−IJ I−u Ll− 1/l← 〉リ リυ 〉ロ UU <<01J l/ILI =pu <<  go e:u コCJ :lLl a−u工Ll w< LJi−−1u :リ  工Ll =(+、Ji−LA<1−LJ :u −υ <Q ←(←<UU  −U <U垢? −し 二8 =5 Hg 旨83足 主8 手8>L) uu  <U L/11− 工<1−、JIJロ ←← トくuu gu ha 、J (J <u LISLI コu zu a4L)−一 −ロ ωヒ <i−−+ u −(=< =< =す、−< −x< !:< >a <u wu uu  gu +<01J lju <u <IJ elJ Ql−1/l)−el−e :(jlleu −← ” ”’ =L+au+(elJ 71JLIJ −<  <ロ 4u l−< c−リ =’J :U +xi−gu <IJ :l口  −Q コu uu xu :+s−zauuu 、、ju J< 二U Wt −ピU −< uu 、J<h< <IJ IJcj l−< :リ くu 工 u xs uu!? 58 首と z8 乙8 臣8 ゴ? 臣8 z8+<  <a <u pu l/lヒ +< >U ←<1 uuq園111% 、、PAL 補正書の写しく翻訳文)提出内(特許法第184条の8)平成元年3月8日 特許庁長官 古 1)文 毅 殿 1、特許出願の表示 PCT/GB 871006282、発明の名称 フェニ ルアラニンアンモニアリアーゼの製法3、特許出願人 住 所 イギリス国、ロンドン・Jヌ・ダブリュ・ 9・ 5・イー・キュー、 コリンディル・アヴ工ニュ・61 名 称 ザ・パブリック・ヘルス・ラボラタリイ・サーヴイス・ボード4、代  理 人 東京都新宿区新宿1丁目1番14号 山田ビル5、補正書の提出年月日  1988年8月10日6、添附肉類の目録 請求の範囲 1) 具眼微生物由来の対応するイントロン含有構造遺伝子から誘導したイント ロン欠失構造遺伝子であって、前記イントロン欠失遺伝子が原核または具眼微生 物内でフェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)またはPAL活性を示す ポリペプチドを発現できることを条件として、どちらの這d(龜−の産生物をコ ードしていることを特徴とする遺伝子。
2) 具眼微生物のPAL産生株のイントロン含有遺伝子から誘導することを特 徴とする請求項1に記載の遺伝子。
3) 前記微生物がRotoruloidesであることを特徴とする請求項2 に記載の遺伝子。
4) 前記遺伝子がPALまたはPAL活性を示すポリペプチドを発現する条件 で、下記に列挙したポリヌクレオチド配列:ATG Ol:G CCT CCA  cCA’ ACCTCCCACTCG CAG CCT C(、CACCTI l& CCCACAACCCAG CTCACCCACにTCCACATCCT CCAG AAG 人TCCTCCCCGCCCCGACCCACTCCACG  CTCQ’tA CTcCACC;(:4 TACTCCCTCAACCrC CCA CACic l:Tc TCG CCCCCG ACG AAG 0c cACCCCT (TCCCCGTCAAIII; (、ACAil;CCAC CAG 八TCCGCTCA AACATr CACA人A TCに (:TC CACTrCTTG CCCTCtll;CAA CTCTCCATCACCC ;TCTACCcc(TCACCACT C(IA TrT CCCCCA T CX::CCA CACACCccc 八CCCAG CACCCCATCTC C,CrCCAG AAG CCT CTCCTCCA(1; CACCAG  C’rCT(15Gf:T CrT CTCCCT TCG TCG TTCC ACTC’CTTCCGCCC;CCTC(TC(TCCTCCAG CCG  CTC’ ACCAACTrCCTCAACCACCCOATOACCCCCA TCGTCCCCCTCCGC(、(A ACC! ATCTCT ccc 〒 cc ccc ahc CTCTCT CCT CTCTCCTACATT G CA CCG、’CCC八TCACCC(7CACCCCCACAGC:AAG  CTCCAC(TCGTCCACCA; GCC−AAC(、AC; AAC ATCCTCTACGCCCCCCAG CCCATCGCG CTCTrCA ACCrC(:ACCCC(7C(ITc CTC(C:CCCCAAGCAA  CCT CTCCCT CTCC,TCAACCDNA配列: CCCGTC TCA CCA TCCATCIl$CTCACG CCCATCACG GT CCAA (1;CC; ATCG’rCGCCCACGCCCGCTCG T rCCACCCCTry! CTT CACCACG’rCACG CGCCC T CACCCG ACに CAG ATCCAAにTCGCG GCA AA CATCCC;CAACCTCCTCGAG GCA ACCCCCTrT G CT (ITcCACCAT CACCAGcAG (TCAACGTCAAG 、 GACCAC0Gに(14ATT、CTCCCCCAG CACCGC’T ACCCCTTCCGCkCG TCT CCT CACT(C; CTCC, (、CCCG CTCGTCACCGACCTCATr CACGCCCACC CCCTCCTCACC八TCCACccc cccCACTCCACG AC CC/VCAACCCT CTCATCCACCTCCAG 八人CAACAC T 、TCGCACCACGCC(、GCAAT TrCCAに CCT CC CGCT GTG CCCAACACCATCCAGA八G へACT CGC CTCGCG CTCGCCCAG ATCCGCAACCTCAACTTCA cCCAGCTCACCCACATC(TTCAAC! CCCC(A ATC AACCGC(、GCCTCCCCTCCτCCCTCGCC: GCCCAA  GACCCCTCCCTCTCCTACCACT(1;CAへc ccc c rc cへCへTC(1;CCGOT CCG CCG TACACCTCC;  (、AG TTG CCA CACCTCCCC八ACCCTGTG AC( : ACG CAT CTCCACCCCGCr CAG ATC; CCG  AACCAG CCG 、CrC八人CTCCCTT C;CG CTCATC TCG GCT CCT CCCACG ACCGAG TCCAACCACQ TCCTT TCT CTCCTCCTCGCCACICCACCTCTACT CCGTT CTCCAA GCCATC(1;ACTrCCCCC,CG A TCCACTTC(1;AG TrCAACAACCAG TTCGGCCCA  CCCATCCrc! TCCCTCATC(lac CACCAC! Tr T CGCTCCCCCATCACCCCCTCGΔ八CへCTCC(、CCA CCACCTCCrC(1;ACAAG CrC; AACAAG AcCCT C(、CCAAGCGCCTCCAG CACACCAACTCC: TACG AC(ITc にTCCCCCC;CTCG CACCACccCTTCTCC TrCにCCCCCCGCACC(ITc! (TCGkG CTCCTCTC G TCG ACGTCCCTCTCCCTCCCCGCCCTCAACCCC TOOAACGTCCCCCCCGCCCへCTC(”、GCCATCTCG  CTCACCC(、CCAA (ITc CCCCAG ACCTrCTCG  TCCCCCGCG TCC; 八CCTCCTCG CCCGCG CTCT Cfll; TAC、CTCTCG CCG CCCACT CへGATCCT CTACGCCTTCGTCC(、CGAG CAG CTT CにCGTCA ACGCCCGCCC;CCTCAAG ATCCTCGCT TAGと同一の 構造または該配列と70%もしくはそれ以上の相同性を有する構造であることを 特徴とする遺伝子。
5) 請求項1〜3の何れか1項に記載の遺伝子を含むことを特徴とする組換え DNA分子。
6) 請求項4に記載の遺伝子を含むことを特徴とする組換えDNA分子。
7) 前記組換えDNA分子がプラスミドであることを特徴とする請求項6に記 載の分子。
8) 前記プラスミドがベクターであり、遺伝子に作動的に結合した発現制御l 配列、および/またはE、 coli K12゜の細胞系由来のPALまたはP AL活性を示すポリペプチドに対する適当な転写/翻訳信号を含むことを特徴と する請求項7に記載のプラスミド。
9) 前記プラスミドが遺伝子の翻訳開始点の上流側のリポソーム結合部位を含 み、並びにS、 cerevisaeホスホグリセラードキナーゼ遺伝子および 交配因子遺伝子から誘導した転写信号をリポソーム結合部位の5°に配置するこ とを特徴とする請求項8に記載のプラスミド。
10) 請求項4に記載の遺伝子を、pUc9のIac Zプロモータを有する 相内の遺伝子と共にプラスミドPUc9に挿入して成ることを特徴とする組換え DNA分子。
11) 請求項4に記載の組換えり、 N A分子を用いて形質転換したE、c oliであることを特徴とする宿主微生物。
12) イントロンを欠失した遺伝子の製造方法であって、(I ) R、to ruloides株からPALのmRNAを単離する段階と、 (I[)前記mRNAから、それぞれがPALまたはPAL活性を示すポリペプ チドをコードする遺伝子の一部を含む2つのイントロン欠失CDNA配列を合成 し、2つの遺伝子部分が遺伝子の3゛末端と5°末端とを含むようにする段階と 、(■)2つの前記CDNA配列を結合して、PALまたはPAL活性を示すポ リペプチドをコードするイントロン欠失構造遺伝子を形成する段階とを含んで成 ることを特徴とする方法。
13)’PALまたはI)AL活性を示すポリベブブードをコードするイントロ ン欠失遺伝子の一部であり、前記遺伝子の3°末端まとするポリヌクレオチド配 列。
14) 下記の配列: ^TGCX2Gα:T CCAOCA ACCTCCCACTCGCAGα:T  CCCA(X: T■CCCACAACCCAG (TCAC(: CAG  CrC(、kCATCCrCQlkCAACATCCTC+5 CAG CCG ^CC(ACTC(:、 AC(: CTCCAA C’rCCAC(、(A  TACTCc CTCAACCT’CG(A ffc(TC(TCTC(: G CCCCG ACGAACG(A ACG CCT (ITc CGC(TCA AG CACACCGACCA(: ATOCCCTCA AAG ATr C ACAAA TCG (TCQAG TrCTrG C圓TCCCAA CTC TCCATG AC;CCTCTACGGC(TCACG ACT GCA T rT GCCGCA TCCCCA CACACCC(X: A(ICGACC AC! ATCTCG CTCCAC)JG α7 (’rCCTCCAG C ACCAG CTCTGCCに’r (Tr CTCCCT TCG TCG  TrCCACTCG TrCCGCCTCCGCCOCG(T CTCCAG  AACTCCCTr CCCCTCCAC(TT (TT C(4C℃CCCA TCACA ATCCcc(TCAACACcTTG ACCCGCCGCCA CTCG CCr GrCCTX: CTC(TOC:’rCCTC(IAc  (ACCTCACCAACTrCCTCAACCACC(CATC^CCCCC ATC(TCCtA CTcCGcG(A Ace ATCTCr QC(1;  TCG (5CACCTCTCT CCT C’rCTCCTACATr ( :CA GCC,GCCATCAGCCCT CACCCCCAc ACGAA C(TG CACGTCGTCCACCAG (5AACGAG AACATC Cr’CTACCCICC(X:CAcccc^TOccG CTCTrCAA CCTCcACσ:C(TC(TCCTCC(A CCG AAGcAA cG rCTCcGrCTCGTOAAOG(A ACCGCI:、 g TCA C CA TCG ATC(5^CCCTCC(T CrG CACCAC(AA  CACATCCTCTCG CE αTC(: (Jl; TCIII;(2) ACC(、CCATCACCGTCcAA CCCATに c′rCCCV C ACCCCG(A TCG TTCCACCCCTrCCTT CACCAC( 7CACG CCCCCT CACCCCACに CACATCCAA(TCc cG C,Gk AACATCCccAAC; CTCCTCCAG (、(A  ACA C(A TTT GCr (TCCACCAT CAG GAに C AG (XCAACCTCAAG CACCACCAG G(A ATT CT CCにCCGCA 11.Ac C(、CTAG CCCTrCi CCCAC G +と同一のポリヌクレオチド配列、または該配列と70%もしくはそれ以上 の相同性を有するポリヌクレオチド配列を含むことを特徴とする請求項13に記 載の配列。
15) 下記の配列: TCT OCT CACT(1;G CTCCccα℃口℃(TCA(:CGA CCTCATr CACにccCACn (T(! CTcACC^’rcc八 GαEへ1;ccMc ACT ccc cTc ccc arc ccc C ACATCccc AAG crc AAC’rrc ACG CACCTCA CCにACATCCrC人ACGOCGGCATG AA(! CCO(:GC CT(! CCCTCCTGCCTCGCG CCCCAA CACCCCT( I: CTCTCCTACCACTl:4 AACGGCCTC(:、kCAT CGCC(1;(T Gl:CccG TACA閃TCG CAG m (:C A CACCTCCCCAACCCrTCに cccATCTCG CTCAC CCGcCAA GrCCOOCACACCTrCEに TCCl双CCCTC に ACCTCG TCG CCCGCG CTCTCC,TACCTCTCG  CCG CGCACT CGCATCCTCTACにCCTrC! CTCC GcGAG GAG (TT CにC(TCAACCCCCGCCGC(:、G k CAC(TCTrCCTCGCCAA(: CAA にAG (:TCAc GATCCC;C’TCCAAC(TCと同一のポリヌクレオチド配列、または 該配列と70%もしくはそれ以上の相同性を有するポリヌクレオチド配列を含む ことを特徴とする請求項14に記載の配列。
16)請求項13に記載のポリヌクレオチド配列を含むことを特徴とする組換え DNA分子。
17) 請求項14または15に記載のポリヌクレオチド配列を含むことを特徴 とする組換えDNA分子。
18) ポリヌクレオチド配列がpB R322またはpUc9と結合している ことを特徴とする請求項11に記載の組換えDNA分子。
国際調査報告 1M1e”j116”al Al−11−11@、 PCT/ G−1,87/  0Oo28 −国際調青報告

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1)真核微生物由来の対応するイントロン含有構造遺伝子から誘導したイントロ ン欠失構造遺伝子であって、前記イントロン欠失遺伝子が原核または真核微生物 内で産生物を発現できることを条件として、どちらの遺伝子も同一の産生物をコ ードしていることを特徴とする遺伝子。 2)前記遺伝子がフェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)またはPAL 活性を示すポリペプチドであることを特徴とする請求項1に記載の遺伝子。 3)前記遺伝子が真核微生物のPAL産生株のイントロン含有遺伝子であること を特徴とする請求項2に記載の遺伝子4)微生物がR.toruloidesで あることを特徴とする請求項3に記載の遺伝子。 5)前記遺伝子がPALまたはPAL活性を示すポリペプチドをコードする下記 のポリヌクレオチド配列:【配列があります】 と同一の構造、または該配列と関連する構造、または該配列から誘導した構造、 または該配列と相補的な構造を有することを特徴とする遺伝子。 6)前記遺伝子がPALまたはPAL活性を示すポリペプチドをコードすること を条件として、前記遺伝子がいくつかの塩基を欠くか、またはいくつかの塩基を 余分に含むか、または列挙したコドンのいくつかを他のコドンと置換することを 特徴とする請求項5に記載の遺伝子。 7)請求項1〜4の何れかに記載の遺伝子を含むことを特徴とする組換えDNA 分子。 8)請求項5または6に記載の遺伝子を含むことを特徴とする組換えDNA分子 。 9)前記組換えDNA分子がプラスミドであることを特徴とする請求項8に記載 の分子。 10)前記プラスミドがペクターであり、遺伝子に作働的に結合した発現制御配 列、および/またはE.coli k12.Bacillus subtili s、Saccharomyces cerevisae、Preudomona sPutida、Erwinia chrysanthemiまたは哺乳類の細 胞系由来のPALまたはPAL活性を示すポリペプチドに対する適当な転写/翻 訳信号を含むことを特徴とする請求項9に記載のプラスミド。 11)前記分子が遺伝子の翻訳開始点の上流側のリポソーム結合部位を含み、並 びにS.cerevisaeホスホグリセラートキナーゼ遺伝子および交配因子 遺伝子から誘導した転写信号をリポソーム結合部位の5′に配置することを特徴 とする請求項10に記載の分子。 12)請求項5に記載の遺伝子を、pUC9のIacZプロモータを有する相内 の遺伝子と共にプラスミドpUC9に挿入して成ることを特徴とする組換えDN A分子。 13)請求項8に記載の組換えDNA分子を用いて形質変換することを特徴とす る宿主微生物。 14)イントロンを欠失した遺伝子の製造方法であって、(I)R.torul oides株からPALのmRNAを単離する段階と、 (II)前記mRNAから、それぞれがPALまたはPAL活性を示すポリペプ チドをコードする遺伝子の一部を含む2つのイントロン欠失cDNA配列を合成 し、2つの遺伝子部分が遺伝子の3′末端と5′末端とを含むようにする段階と 、(III)2つの前記cDNA配列を結合して、PALまたはPAL活性を示 すポリペプチドをコードするイントロン欠失構造遺伝子を形成する段階とを含ん で成ることを特徴とする方法。 15)PALまたはPAL活性を示すポリペプチドをコードするイントロン欠失 遺伝子の一部であり、前記遺伝子の3′末端または5′末端を含むことを特徴と するポリヌクレオチド配列。 16)下記のポリヌクレオチド配列: 【配列があります】 と同じ、または該配列と関連する、または該配列から誘導したポリヌクレオチド 配列を含むことを特徴とする請求項15に記載の配列。 17)下記のポリヌクレオチド配列: 【配列があります】 と同じ、または該配列に関連する、又は該配列から誘導したポリヌクレオチド配 列を含むことを特徴とする請求項15にに記載の配列。 18)いくつかの塩基を欠くか、または他の塩基を含むかまたは列挙したコドン のいくつかを他のコドンと置換することを特徴とする請求項16又は17に記載 のポリヌクレオチド配列。 19)請求項15に記載のポリヌクレオチド配列を含むことを特徴とする組換え DNA分子。 20)請求項16または17に記載のポリヌクレオチド配列を含むことを特徴と する組換えDNA分子。 21)ポリヌクレオチド配列がpBR322またはpUC9と結合していること を特徴とする請求項20に記載の組換えDNA分子。
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Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4946790A (en) * 1987-02-06 1990-08-07 Mitsui Toatsu Chemicals, Inc. Recombinant plasmid for the expression of L-phenylalanine ammonia-lyase and transformed strain carrying same
CA1319630C (en) * 1987-02-19 1993-06-29 Satori Sone Method of regulating expression of a foreign gene by controlling the sugar concentration in a medium and a process of producing a foreign gene product thereby
US5139935A (en) * 1987-02-19 1992-08-18 Mitsui Toatsu Chemicals, Incorporated Method of regulating expression of a foreign gene by controlling the sugar concentration in a medium and a process of producing a foreign product thereby
US5043277A (en) * 1987-02-19 1991-08-27 Mitsui Toatsu Chemicals, Incorporated Method of regulating expression of a foreign gene by controlling culture temperature and a process of producing a foreign gene product thereby
US5981239A (en) * 1997-09-24 1999-11-09 Great Lakes Chemical Corp. Synthesis of optically active phenylalanine analogs using Rhodotorula graminis
US6368837B1 (en) 1999-08-06 2002-04-09 E. I. Du Pont Nemours And Company Bioproduction of para-hydroxycinnamic acid
US6521748B2 (en) 1999-08-06 2003-02-18 E. I. Du Pont De Nemours And Company Polynucleotide encoding a mutant Rhodotorula glutinis tyrosine ammonia lyase polypeptide
US6355468B1 (en) * 2000-07-24 2002-03-12 Pcbu Services, Inc., Phenylalanine ammonia lyase polypeptide and polynucleotide sequences and methods of obtaining and using same
US6967097B2 (en) 2000-07-24 2005-11-22 Pcbu Services, Inc. Phenylalainine ammonia lyase polypeptide and polynucleotide sequences and methods of obtaining and using same
US6951751B2 (en) 2002-05-23 2005-10-04 E. I. Du Pont De Nemours And Company DNA and amino acid sequences of a tyrosine-inducible tyrosine ammonia lyase enzyme from the yeast Trichosporon cutaneum
US9150884B2 (en) 2011-03-08 2015-10-06 Arizona Board Of Regents, A Body Corporate Of The State Of Arizona, Acting For And On Behalf Of Arizona State University Microbial conversion of glucose to styrene and its derivatives
US11613768B2 (en) 2017-07-25 2023-03-28 Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University Microbial production of 2-phenylethanol from renewable substrates

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
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Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS60149387A (ja) * 1983-08-31 1985-08-06 アルコ リミティド セロビオヒドロラーゼiをコードする遺伝子

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