JPH02107190A - 癌胚抗原の構成員の遺伝情報を指定するcDNA類 - Google Patents

癌胚抗原の構成員の遺伝情報を指定するcDNA類

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JPH02107190A
JPH02107190A JP1153923A JP15392389A JPH02107190A JP H02107190 A JPH02107190 A JP H02107190A JP 1153923 A JP1153923 A JP 1153923A JP 15392389 A JP15392389 A JP 15392389A JP H02107190 A JPH02107190 A JP H02107190A
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dna
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nucleic acid
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トマス・アール・バーネツト
James J Elting
ジエイムズ・ジエイ・エルテイング
Michael E Kamarck
マイケル・イー・カマーク
Axel Kretschmer
アクセル・クレチユマー
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は、癌胚抗原(CE A)の抗原族のペプチドの
配列の遺伝情報を指定する(code  for)核酸
配列に関する。
癌胚抗原は、最初に、ゴールド(Go l d)および
フリートマン(Freedman)、ジャーナル・オブ
・イクスペリメンタル・メディシン(J。
Exp、Med、)、121,439−462(196
5)に記載された。CEAはほぼ200゜000の分子
量をもち、50〜60重量%が炭水化物である糖タンパ
ク質として特性付けられる。
CEAは正常のヒト胎児の発育の間に存在するが、正常
の大人の腸管中に非常に低い濃度で存在する。
それはある数の異なる肺癌により産生され、そして分泌
される。
CEAは結腸直腸癌の患者の管理のための臨床的に有用
な腫瘍マーカーである。CEAは感受性イムノアッセイ
法を使用して測定することができる。CEAの外科前の
血清レベルが増加したとき、正常範囲への外科後の血清
CEAの低下は、典型的には、腫瘍の切除が成功したこ
とを示す。外科後のCEAレベルが正常へに戻らないこ
とは、しばしば、腫瘍の切除が不完全であるか、あるい
は追加の腫瘍部位が患者において存在することを示す。
正常レベルへ戻った後、引き続く血清CEAレベルの急
速な上昇は、通常、転移の存在を示す。
正常レベルからの外科後のより遅い上昇は、最もしばし
ば、前に検出されなかった新しい一次腫瘍の存在を示す
と解釈される。こうして、結腸癌の患者の外科後の管理
は、CEAの測定により促進される。
CEAは抗原族のl員である。このため、現在利用可能
な方法によりCEAのイムノアッセイは、CEAがいく
つかの潜在的に反応性の抗原のただ一つであるという事
実によって複雑となる。文献に少なくとも16のCEA
様抗原が記載れてきている。これらのあるものは異なる
研究者らにより記載された同一の抗原であるように思わ
れるので、異なる抗原の実際の数はこの数より多少少な
い。
それにもかかわらず、腫瘍により解放されるCEAのイ
ムノアフセイを潜在的に妨害し得る、交差反応性抗原の
複雑な列が存在する。CEA様抗原の血清レベルは、多
くの癌以外の状態、例えば、炎症性肝臓の病気Jiよび
また喫煙者において増大する。癌患者の状態の管理のた
めのイムノアッセイは、これらの他のCEA様抗原によ
り妨害されないことが重要である。逆に、イムノアフセ
イにより抗原を区別できることが重要である。なぜなら
、異なる腫瘍のタイプはCEAの異なるタイプを侵先的
に発現することができるという可能性があるからである
。そのような場合、異なるタイプのCEAを信頼性をも
って測定できることのより、癌の異なるタイプを診断し
、あるいはより首尾よく処置する手段を提供することが
できる。
rCEA族」の構成員は、いくつかの抗原決定基を共有
する。これらの共通のエピトープは抗原の族の構成員の
区別において有用でなく、そしてそれらを認識する抗体
は腫瘍特異的CEAレベルの測定のためほとんど有用で
はない。
米国特許第3,663,684号は、[癌胚抗原および
ヨウ素を使用する診断法」と題し、RIAにおいて使用
するためのCEAの精製および放射性ヨウ素化に関する
。
米国特許箱3,697,638号は、CEAが抗原の混
合物(この場合において成分AおよびB)であることを
記載している。米国特許箱3.697.638号は、各
成分を分離し、そして放射性ヨウ素化する方法およびそ
れらの特別のRIAにおける使用を述べている。
米国特許箱3,852.415号は、「癌腫抗原の決定
における血漿抽出物の代用物として、ラジオイムノアッ
セイにおいて使用する組成物」と題し、CEA  RI
Aのための希釈剤として血漿の代用物として、EDTA
およびウシ血清アルブミンを含有する緩衝液の使用にに
関する。
米国特許箱3,867.363号は、「癌腫抗原」と題
し、CEAの成分AおよびBの分離、それらの標識付け
およびRIAにおけるそれらの使用に関する。
米国特許箱3.927,193号は、「放射性標識した
抗体の腫瘍の局在化」と題し、体全体の腫瘍の映像にお
ける放射性標識した抗CEA抗体の使用に関する。
米国特許箱3,956.258号は、「癌腫抗原」と題
し、CEA成分成分上びBの分離に関する。
米国特許箱4,086,217号は、「癌腫抗原」と題
し、CEA成分成分上びBの分離に関する。
米国特許箱4,140,753号は、「診断の方法およ
び試薬」と題し、CEA−51と呼ぶCEA異性体の精
製およびRIAにおけるその使用に関する。
米国特許箱4,145,366号は、「癌腫抗原の異性
体」と題し、抗原CEA−3lに関する。
米国特許箱4,180,499号は、「癌腫抗原」と題
し、CEA成分Bを産生する方法を記載している。
米国特許箱4,228,236号は、[癌腫抗原を産生
する方法」と題し、CEAの産生のためのL S −]
、 74 TまたはLS−180の確立された細胞系ま
たはそれらのクローンまたは誘導体に関する。
米国特許箱4.272.504号は、「癌腫抗原のアッ
セイのための抗体吸着した支持体の方法」と題し、CE
Aのラジオイムノアッセイの2つの概念に関する。1つ
は、米国特許箱4.272゜504号はpH5において
65〜85°Cに加熱することにより試料を予備処理し
て、異質タンパク質を沈澱させ、そして排除することに
関する。第2に、それは分析物および標識したCEAト
レーサーを補足する手段として固相の抗体(ビーズまた
は管上)の使用に関する。
米国特許箱4.299,815号は、「癌腫抗原の決定
」と題し、CEA試料を水で希釈し、そしてタンパク質
の沈澱が起こる温度以下の温度に加熱することによって
予備処理することに関する。
次いで、予備処理した試料をRIAlEIA、FIAま
たは化学発光のイムノアッセイを使用してイムノアッセ
イする。
米国特許箱4.349,528号は、「高分子量の癌腫
抗原について特異的なモノクローナルハイブリドーマ抗
体」と題し、180kDのCEAと反応するが、他の分
子量の形態と反応しないモノクローナル抗体に関する。
米国特許箱4,467.031号は、「癌腫抗原のため
の酵素−イムノアッセイ」と題し、CEAのためのサン
ドインチ酵素イムノアッセイに関し、ここで2つの抗C
EAモノクローナル抗体の第1を固相に取り付け、そし
て第2モノクローナル抗体をベルオキシグーゼと接合す
る。
米国特許箱4,489,167号は、[癌の検出の方法
および組成物」と題し、CEAがアルファ酸糖タンパク
質(A G)と抗原決定基を共有し、この糖タンパク質
はヒ]・血清の正常成分である。
ここに記載する方法は、1つの抗体としてACを認識す
る抗体およびCEAを認識するが、AGを認識しない他
の抗体を使用する、固相サンドイッチイムノアッセイに
関する。
米国特許箱4,578,349号は、[癌胚抗[(CE
A)のだめのイムノアッセイ」と題し、CEAイムノア
ッセイにおける希釈剤として高い塩を含有する緩衝液を
使用することに関する。
欧州特許(EP)l 13072−A号は、血液試料を
癌腫抗原についてアッセイすること−シリカゲルと一緒
のインキュベーションによる妨害物質の除去後」と題し
、シリカゲルで予備処理することにより妨害物質を血漿
試料の血清から除去することに関する。
欧州特許(EP)102008−A号は、「癌の診断の
癌腫抗原−電気泳動しないで過塩素酸の抽出物から産生
された」と題し、電気泳動工程を使用しないで、過塩素
酸からCEAを調製する手順に関する。
欧州特許(EP)92223−A号は、[細胞質ゾルま
たは組織中の癌腫抗原の決定−後退の治療の抑制および
早期の認識」と題し、血清または血漿中ではなく、腫瘍
組織それ自体の細胞質ゾル中におけるCEAのイムノア
ッセイに関する。
欧州特許(EP)83103759.6号は、「癌、と
くに乳癌における予測試験として細胞質ゾル−CEA−
測定」と題し、欧州特許(E P)92223−A号に
類似する。
欧州特許(EP)83303759号は、[癌腫抗原に
対して特異的なモノクローナル抗体」と題し、rCEA
特異的」モノクローナル抗体およびイムノアッセイにお
けるそれらの使用に関する。
WO84102983号し;i、「特r4的CEA−族
抗原、それらに対して特異的な抗体およびそれらの使用
法」と題し、試料中の個々の成分の各々を選択的に測定
するように設計されたイムノアッセイにおける、CEA
−胎便(MA )−およびNAC−特異的エピト−ブに
対するモノクローナル抗体の使用に関する。
以上のCEAアッセイのすべては、選択する完全な抗原
で動物を免疫化することにより、発生したモノクローナ
ル抗体またはポリクローナル抗体を利用する。それらの
いずれも、種々の抗原の独特−次配列の検出のために、
配列特異的抗体をつくという考えを扱っていない。それ
らは、自然産生物の合成ペプチドまたは断片に対する抗
体を産生ずるために、−次アミノ酸配列を使用すること
を包含しない。それらは、CEA族の構成員を区別する
ために一次アミノ酸配列を使用する概念を包含しない。
それらのいずれも、−次配列を決定するために使用する
遺伝子を分離するために、DNAまたはRNAのクロー
ンを使用することを包含しない。
置市において、CEA遺伝子族の構成員を発現する細胞
を発生させるためにDNAまたはRNAクローンを使用
すること、あるいは特定のモノクローナル抗体の発生ま
たはスクリーニングにおいてこれらの細胞を使用するこ
とを包含する教示は存在しない。
定義 核酸の略号 A    アTニン G    グアニン Cシトシン T    チミジン アミノ酸の略号 sp sn hr er lu 1n Pr。
yl la ys at et ie yr he  r p ys  i s ウラシル アスパラギン酸 アスパラギン スレオニン セリン グルタミン酸 グルタミン プロリン グリツツ アラニン システィン バリン メチオニン イソロイシン チロシン フェニルアラニ トリブトファン リジン ヒスチジン Arビ  アルギニン ヌクレオシド − 糖部分(ペントース)、ホスフェー
トおよび窒素の複素環族塩基を含有するDNAまたはR
NAのモノマー単位。この塩基グリコシドの炭素(ペン
トースのビ炭素)を経ては糖部分に結合しており、そし
て塩基と糖との組み合わせはヌクレオシドと呼ばれる。
この塩基はヌクレオチドを特徴づける。4つのDNA塩
基はアデニン(rAJ )、グアニン(「G」)、ント
シン(「C」)、およびチミジン(rTJ )である。
4つのRNA塩基はA、GXCおよびウラシルて「U」
)である。
DNA配列 −隣接するペントースの3′および5′炭
素の間のホスホジエステル結合によりお互いに結合した
、ヌクレオチドの直線の列である。
機能的同等体 −この分野においてよく知られているよ
うに、DNA配列において、あるヌクレオチドは、発現
産生体の配列に影響を及ぼさないで、置換することがで
きる。このペプチドに関すると、この用語は、特定の用
途において機能をもたない1種または2種以上のアミノ
酸が欠失されているか、あるいは他のものにより置換さ
れることができることを意味する。
コドン − mRNAによりアミノ酸をエンコードする
3ヌクレオチド(トリップレット)のDNA配列、翻訳
開始シグナルまたは翻訳停止シグナルをエンコードする
。例えば、ヌクレオチドのトリップレットTTA、TT
G、CTT、CTC。
CTAおよびCTCはアミノ酸のロイシン([LeuJ
)をエンコードし、TAGlTAAおよびTGAは翻訳
停止シグナルであり、そしてATGは翻訳開始シグナル
である。
リーディング7レーム − アミノ酸配列へのmRNA
の翻訳の間のコドンの群。翻訳の間、適切なリーディン
グフレームを維持しなくてはならない。例えば、配列G
CTGGTTGTAAGは3つのRFまたは相で翻訳さ
れることができ、それらの各々は、隣接するするアミノ
酸のアルファーアミノ基とカルボキシ基との間のペプチ
ド結合によりお互いに接続された異なるアミノ酸配列G
CT  GGT  TGT  AAG  −AlaGl
y−Cys−Lys G  CTG  GTT  GTA  AG  −Le
u−Va 1−Va I GCTGG  TTG  TAA  G  −Trp−
Leu−(停止) を与える。
ポリペプチド − 隣接するアミノ酸のアルファアミノ
基おおびカルボキシ基の間のペプチド結合によりお互い
に接続されたアミノ酸の線状の配列。
ゲノム − 細胞またはウィルスの完全なりNへ〇それ
は、なかでも、細胞またはウィルスのポリペプチドの遺
伝情報を指定する構造遺伝子、ならびにそのオペレータ
ー プロモーターおよびリポソームおよび、例えば、シ
ャインーダルガルノ(Sh i ne−Da Iga 
rno)配列を包含する相互作用配列を包含する。
構造遺伝子 −その鋳型またはメツセンジャーRNA 
(rmRNAJ )を通して、特定のポリペプチドに特
徴あるアミノ酸の配列をエンコードするDNA配列。
転写 −構造遺伝子からmRNAを産生ずるプロセス。
翻訳 −mRNAからポリペプチドを産生ずるプロセス
。
発現 −ポリペプチドを産生ずるI;めに構造遺伝子が
なしたプロセス。それは転写と翻訳との組み合わせであ
る。
プラスミド − グラスミドが宿主細胞中で復製するよ
うな完全な「レプリコン」からなる非染色体二本鎖DN
A配列。プラスミドが単細胞の有機体内に配置されたと
き、その有機体の特性は、プラスミドのDNAの結果、
変化または形質転換され得る。例えば、テトラサイクリ
ン耐性(Tetl)のための遺伝子を有するプラスミド
は、前にテトラサイクリンに対して感受性である細胞を
それに対して耐性の細胞に形質転換する。プラスミドに
より形質転換された細胞は「形質転換体」と呼ばれる。
ファージまたなバクテリオファージ − それらの多く
はタンパク質のエンベロープまたはコート(coat)
(rカプシドタンパク質」)中にカプセル化されたDN
A配列から成る。
クローニングベヒクル(vehicle)宿主細胞中で
複製することができるプラスミド、ファージDNAまた
は他のDNA配列、これは、DNAの必須の生物学的機
能、例えば、複製、コートタンパク質の産生またはプラ
スミドまたは結合部位の損失、を付随的に損失しないで
、決定可能な方法でこのようなりNA配列を切断するこ
とができる、1つまたは小さい数の部位によって特徴づ
けられ、そして形質転換された細胞、テトラサイクリン
耐性またはアンピシリン耐性の細胞の同定における使用
に適当なマーカーを含有する。
クローニングベヒクルはしばしばベクターと呼ばれる。
クローニング − 無性生殖により1つの有機体または
DNA配列から誘導される、このような有機体またはD
NA配列の1集団を得るプロセス。
組み換え体DNA分子または雑種DNA生きている細胞
の外側で末端対末端で接合されており、そしである細胞
に感染しかつその中で維持されうる能力を有する、異な
るゲノムからのDNAのセグメントから成る分子。
cDNA発現ベクター −真核細胞中のcDNA配列の
発現を促進するヌクレオチドの配列をまた含有する、原
核細胞のクローニングベヒクル。
これらのヌクレオチドは、真核細胞のプロモータ、別の
きり継ぎ部位およびポリアデニル化シグナルとして機能
する配列を包含する。
形質転換/トランスフェクション − DNAまたはR
NAは、遺伝子の発現を可能とするような方法で、細胞
中に導入される。「感染した」は、ここでは、ウィルス
のベクターによりRNAまたはDNAを宿主中に導入す
ることに関する。
ここで使用する「注入した」は、細胞中へのDNAのミ
クロ注入(小さい注射器を使用する)に関する。
CEA抗原族(CEA遺伝子族) 一部分的cDNA 
 LV−7(CEA−(a))に対して相同性のヌクレ
オチド配列を共有し、そしてこれらの類似性の結果、そ
れらの抗原エピトープのサブセットを共有する、遺伝子
(遺伝子族)およびそれらの産生体(抗原族)の組。C
EA抗原族の例は、CEA (=CEA−(b))、ト
ランスメンブレン(t ransmenbrane)C
EA(TM  CEA)−CEA−(c)および正常交
差反応性抗原(NCA)(=CEA−(d))を包含す
る。
本発明は、TM−2(CEA−(e)) 、TM−3(
CEA−(f)) 、TM−4(CEA(g)) 、K
GCEAlおよびKGCEA2と表示する次のDNA配
列に関し、これらはそれらと交雑可能である塩基配列(
DNAまたはRNA)を有するCEA抗原族のペプチド
の配列の遺伝情報を指定するニ ベト 2; U< I:)+−4 L)L) ・O方 −d、2 ・U 飄 ・Q − 本発明は、また、CEAペプチドまたはそれと交雑可能
な塩基配列の遺伝情報を指定する塩基配列からなる、核
酸、例えば、DNAからなるインサートを有する、複製
可能な組み換え体クローニングベヒクル(「ベクター」
)に関する。
本発明は、また、前述の複製可能な組み換え体クローニ
ングベヒクルまたは前述のcDNAと交雑可能な核酸で
トランスフェクション/形質転換、感染または注入した
細胞に関する。こうして、本発明は、また、クローニン
グベヒクルを使用しないで、遊離核酸を使用して細胞を
トランスフェクションすることに関する。
なおさらに、本発明は、前述のトランスフェクション、
感染または注入した細胞により発現されたポリペプチド
ならびにこのポリペプチドの標識した形態に関し、この
ポリペプチドはCEAとの免疫学的交差反応性を示す。
本発明は、また、アミノ酸配列を有するポリペプチド、
すなわち、合成ペプチド、または前述の複製可能な組み
換え体クローニングベヒクルでトランスフェクション、
注入、感染した細胞の発現産生体、ならびにその標識し
た形態に関する。換言すると、本発明は、全体のアミノ
酸配列に対応するアミノ酸配列を有する合成ペプチド、
または前述の発現産生体の5以上のアミノ酸を有するそ
の一部分に関する。
本発明は、さらに、前述のポリペプチドに対して特異的
な抗体調製物に関する。
本発明の他の面は、次の工程からなる、試験試料中のC
EAまたはその機能的同等体を検出するイムノアッセイ
法に関する: (a)試料を前述の抗体調製物と接触させ、そして (b)試料中のCEAへの結合を決定する。
本発明は、また、次の工程からなる、試験試料中のCE
Aまたは関連する核酸(DNAまたはRNA)の試料を
検出する核酸交雑法に関する=(a)試験試料を核酸か
らなる核酸プローブと接触させ、前記核酸はCEAペプ
チド配列の遺伝情報を指定する塩基配列またはそれと交
雑可能な塩基配列からなり、そして (b)得られる交雑したプローブの形成を決定する。
本発明は、また、次の工程からなる、動物またはヒトの
患者における癌腫抗原またはその機能的同等体の存在を
検出する生体内の方法に関する:(a)前記患者に、本
発明による標識した(例えば、X線により検出可能な放
射線に不透明の物質、放射線したまたはNMRにより検
出可能な常磁性物質で標識した)抗体調製物を導入し、
そして (b)標識を検出することにより、患者中のこのような
抗体調製物の存在を検出する。
他の面において、本発明は、治療の目的で本発明よる抗
体調製物を使用することにに関する。すなわち、抗体調
製物にラジオヌクレオチド、毒素または他の生物学的エ
フェクターを取り付けて複合体を形成し、そして有効量
のこのような複合体を動物またはヒトの患者に、例えば
、注射によりまたは経口的に、導入する。抗体の複合体
は患者中のCEAに結合し、そしてラジオヌクレオチド
、毒素または他の生物学的エフェクターはCEA発現細
胞を破壊するであろう。
親の出願において、次のCEAを記載する:CEA−(
a)   部分的CEA (pcLV7)CEA−(b
)   完全な解読CEA:pc15LV7)(ATC
CNo、67706)CEA−(c)   TM−1(
FL−CEA;pc  19−22)(ATCCNo、
6771cEA−(d)   NCA (pcBT  
20)(ATCCNo、67711) この出願と同時に提出した出願において、次のCEAを
記載する: CEA −(e) (ATCCNo。
CEA−(f) (ATCCNo。
CEA−Cg) A’rCCNo。
77 l Ol 677 l TM−2(pc   E22) TM−3(pc   HT−6 TM−4゜ 67706、67709、6 1および67712はすべて ATCCI:1988年5月25日に受託された。
CEA−(a) 、CEA−(b) 、CEA(c)お
よびCEA−(d)についての配列を下に記載する: 騎 8   Uw N@ L:1 ( L 2.5王1 ψ 暉  1−:)(O Qン 昌C− ()  lj IA lj’1 f″騒j tj>寸 3δ− 05,!♀ V蓼じく ス;彎 むヨ5粗 0   0 Φ 「1 0−くψ −(4。
()l−4の N aく 引上ス 4.5糞 JIJ Q   U t 旧 5クス く− 騒;ゝ 5G″″ くΦト くΦψ 0ン oU611/1 マ <−− IJI+寸 e+    1jll+IV+ マ u < − 3己ろ 昌C≧ 3N j工4 8.1;ゞ OUOIn 外 W  U L I/′I 訃η= jη皐 S、=ηに 3−!た り<〜 5王吊 ut−t。
g w 3 r−η QIJtAL/1 Gl  m  tj  >ψ 0%    t−u  N 1jL−臂 くヒ〜 リ 〉 N <L−rワ ″  ヰ;ヱ くI−1 2g OtJ4Ln r−tj(〜 0   リ α 寸 寸 輪  リ I+ 寸 訃ηg 8.4参 (>Q 5−:     UΦ− 3E+茸   ?、實ミ粗 くく〜  coI−h+〜 O4J  Φ 1 の く−へ 炎:t℃ LZl  L、  − トス己ぢ 62工 5η六   2.?ニア く−臂 Q+1寸 53戎  訃百!虱 ← L−寸 <1−1  寸 訃;咎 ツη禽 55ス 0  1+ Φ ψ 0<−一 〇:1寸 55ち Oaj+3Ll’1 くく円 0・  ljlllM O儒  <1/1  円 <−1 5η六 g、ツ;繋 ((M U P I+′+            1+ t−
N      Pl−Pa t−+      o  
  < >(h5:!二 〇<寸 5王藁 3<努 Φ 〉 n −LLO <  l/l  M N    (J  I−0コ (誹 −ト (x n ut−Ln O愼LJ J: 0) N()−M り罐O U<マ g 、5.!: ML)(マ 5王♀ 訃、c凋 8.5)刈 5王5 g己印 L)  >  Ll’1 3:を号 Lle  の 訃;エ フ、5fη トcD< ψ 0L)l+ − 〇−〇〇の 1)  ← L/II/’1 く−の 訃、2寸 1+−一 〇〉1 ト髄Φ〉1 5、!″ま U<ψ +−# (41(0 以° 騒η3 jよJ tp  >  t。
(LM 渇 I−L a− 昌よS 寸−< +、 ta −七一 く 茹“ヨ LO翻(り 〜く 8″ 昌 。  j シll Q ご 訃 0  ご く ご ・ OC ・ Q コ ・すψ イ・− 5; Uく くト ベし ・ リ し ・Q C ・E4 ψ ・ [−TI−J 5髪 0〉 べ← くト < − づ 0べ ′:?、! すO 〔−IaJ ・E−4← −40J 2″S ← の   の −ト の 明ま田店のン了111r(内′6(こ変更なし)←−1
′+−の−り占(D 明細書の浄ryy (内ζiに変更なし)m(ビ トランスメンブレンCEA、すなわち、TMl (CE
A−(c)) 、TM−2(CEA  (e))、TM
−3(CEA−(f))およびTM−4(CEA−(g
))の概略的関係か第1図に描かれている。
TM−1が第1図に描くように5つの区画、すなわち、
10.12.14.16および18から構成されている
と仮定すると、TM−2はTMlと異なり、100アミ
ノ酸(1,0OAA)区画14は欠失されており、そし
て区画12と16との間のきり継ぎ点20に、驚くべき
ことには、余分のアミノ酸、すなわち、Aspが存在す
る。
TM−3はTM−1と同一であるが、ただし区画18は
きり継ぎ点22において切頭されており、すなわち、7
0アミノ酸の区画は欠失されており、そして下位区画2
4+26から構成された新しい区画が生ずる。しかしな
がら、驚くべきことには、6つの新しいアミノ酸(区画
26)が発生する。
核酸配列の欠失から生成する新規なアミノ酸配列の他の
例は、血小板誘導増殖因子についてである。
TM−4は下位区画24の末端までTM−2と同一であ
る。
下位区画24はTM−1およびTIVI−2の区画18
中に含有されるか、TM−1およびTM−2について第
1図に描かれていない。
あるC E A ′ff−ビト−ブは独特であZ)。こ
れらは、種々のCEA様抗原を免疫学的(二区別するた
めに有用であったエピト−プである。ペプチドのゴビ1
−−ブは抗原の直線のアミノ酸配列および/またはタン
パク質の折り畳みから生成−4る特徴により定められる
。タンパク質の折り畳みについて要求される情報は、−
次アミノ酸配列中に一エンコードされる。〔、だが1で
、抗原の差は、究極的には、異なるC E A分イの一
次構造にJKける差から生、檄4る。こうして、crp
、へ種におけ6CEAタンパク質中に存在する差は、−
次アミノ酸配列を決定することにより決定することがで
きる。これは、最も容易に、CEAについての遺伝fの
各・′7をり〔I−二〉・グおよび配列決定することに
よって達成することができる。どの遺伝子産生体が癌の
診断に最も有用であるかとうかを決定するため、独特プ
ローブを各遺伝子について選択)−1ぞしC各遺伝子の
発現を核酸交雑技術により異なる■・■瘍のタイプにつ
い(決定するJ二とかできる。本発明は、CEA族の異
なる構成員の遺伝情報を指定する潜在的遺伝イを同定し
5、そしてそれらについての理論的−次アミノ酸配列を
lk定するために使用する道具をP)供する。自動化ペ
プチド合成の方法をイ・Jy用1、て、これらの抗原中
の独特配列に対応Jるペプチドを次にa成することかC
きる。これらのペプチドを使用して、これらj′一対す
る抗体を産生する二とができ、こJ′Iは、完全なCF
Aにむいて、免疫化される動物により認識さJするごと
ができ・5でわうっ、1こ1″1.が達成されると、各
1J1.原σ)>:1定のための特別の1′ノ・ノアノ
七・イを発ikさ博(る、rこめに、こFlもの1′7
1ハ;(における差を利用できるという利点か得らJす
る。
広範な種類の宿主7.′りU−−ングベヒクルの徂み合
わせを使用し“C1本発明により調製された本鎖核酸を
クローニングすることかできる。例えば、有用クローニ
ングベヒクルは染色体、次のものから成る:非染色体お
よび合成のDNA配列、例えば、種々の既知のSV40
の誘導体および既知のバクテリアのプラスミド、例えば
、E、c。
11からのプラスミド、例えば、(ol  El、pC
R]、pBR322、pMB89、およびファージのD
NA、例えば、ファージの多くの誘導体、例えば、N 
M 989、および他のD N Aファーン、例えは、
M13およびフィンメンテウス(F i 181、 m
 e n L e Ou S )−本鎖のDNAファー
ジお上びプラスミドおよびファージDNAの組み0才)
セから誘導されたベクター、例えば、ファージDNAP
′Pたは他の発現制御配列を使用するように修飾さ才I
lニブラスミド」]たは酵ff)プラスミド、例えは、
2μグラAq+y:Ft・、はその誘導<4’o有用宿
主は、次のものを包64ることがrさる:・くクチリア
宿主、例えば、ト:、coliの菌株、例え11J′、
E、coli  H13101、E、coli  Xl
776、E、coii  X2282、E、colM 
RCl j−;よびシフトモナス(Pseud。
monas)、バ/ルス・スブチリス(Bacilus
   5ubtilis)、  ノくンルス・ステアロ
テルモフィルス(L(acillus  s(earo
thermophi 1us)および他の1:、。
(: OI i  バ、ルス、酵母および他の菌かび、
動物または植物の宿主、例えば、培養における動物(ヒ
1〜を包含する)または植物の細胞または他LJ)宿主
。もちろん、宿主/ベクタ〜の組み合わ(1のすべてが
l L、、〈効率よいというわけではない。宿主、/り
1=)−ニングベヒクルの特定の選択は、本発明の範囲
を逸脱しないで、記載−傷る原P11を・正しく考慮し
、た後、当業者によりなさI]ることかでさイ〉。
す6.に、特定のクローニングベヒクルの各々内で、種
々の部位4本発明による核酸の挿入のために選択オろ、
−とができ6o これらU)部位は、通常、それらを切
断ずろ′1lll+限エントヌタレアーゼに、より表示
される。Y’ s t !部位はベーターラクタマゼの
遺伝子中に、その夕〉バク質のアミノ酸181および1
B2の遺伝情報を指定するヌクレオチドのトリソゲレッ
トの間に位置する。2一つのHindllエンドヌクレ
アーゼの1つは、アミノ酸101および102の遺伝情
報を指定するトリップレッドと、pBR322中のベー
ターラクタマーゼのアミノ酸45の遺伝情報を指定する
トリップレットにおけるいくつかのTaq部位の1つと
の間に存在する。同様な方法で、このプラスミド中のE
coRr部位およびPvu11部位は解読領域の外側に
存在し、EcoR1部位、それぞれ、テトラサイクリン
およびアンピシリンに抵抗性の遺伝情報を指定する遺伝
子の間に位置する。これらの部位は当業者によりよく認
識されている。もちろん、本発明において有用なりロー
ニングベヒクルは選択したDNA断片の挿入のために制
限エンドヌクレアーゼを必ずしももつ必要はないことを
理解すべきである。その代わり、ベヒクルは別の手段に
より切断および接合することができる。
選択した核酸断片を取り付けて組み換え体積酸分子を形
成するために、ここにおいて選択したベクターまたはク
ローニングベヒクルおよびとくに部位は、次の種々の因
子により決定される二例えば、特定の制限酵素に対して
感受性の部位の数、発現スべきタンパク質の大きさ、宿
主細胞の酵素のタンパク質加水分解の分解に対する所望
のタンパク質の感受性、精製の間に除去困難な宿主細胞
のタンパク質により発現させるべきタンパク質の組み合
わせ、発現の特性、例えば、ベクター配列に関する開始
および停止のコドンの位置、および当業者により認識さ
れる他の因子。ベクターおよび特定の遺伝子についての
挿入部位は、これらの因子のバランスにより決定され、
すべての区画が所定の場合において等しく有効であるわ
けではない。
クローニングベヒクル中に核酸配列を挿入して組み換え
体積酸を形成する方法は、例えば、dAティリング、直
接結合、合成リンカ−、エキソヌクレアーゼおよびポリ
メラーゼ結合修復反応および引き続く結合、または適当
なポリメラーゼおよび適当な一本鎖鋳型を使用する核酸
鎖の伸長および引き続く結合を包含する。
また、クローニングベヒクルの選択した部位に挿入され
たヌクレオチド配列または核酸断片は、実際の構造の一
部ではないヌクレオチドを含むことかできるか、あるい
は所望のタンパク質または成熟タンパク質のための完全
な構造遺伝子の断片のみ含むことができる。
異質遺伝子を含有するクローニングベヒクルまたはベク
ターを使用して、適当な宿主を形質転換して宿主が異質
遺伝子を複製することかできるようにすることができ、
そして異質遺伝子またはその一部分により解読されるタ
ンパク質を発現するようにすることができる。適当な宿
主の選択は、また、この分野において認識されているあ
る数の因子により制御される。これらは、例えば、選択
したベクターとの適合性、雑種によりエンコードされる
タンパク質の毒性、所望のタンパク質の回収の容易さ、
発現の特性、生物安全性およびコストを包含する。これ
らの因子のバランスは、すべての宿主が特定の組み換え
体DNA分子の発現に等しく有効ではないことを理解す
ると、思い当たるであろう。
タンパク質の産生のレベルは、2つの因子により支配さ
れる:細胞内のその遺伝子のコピーの数およびそれらを
使用して遺伝子のコピーが転写および翻訳される効率。
転写および翻訳(これらは−緒になって発現を構成する
)の効率は、次に、通常所望の解読配列の前に位置する
ヌクレオチド配列に依存する。これらのヌクレオチド配
列は、なかでも、RNAポリメラーゼが相互作用して転
写を開始しくプロモーター配列)およびリボツムがmR
NA (転写の産生体)と結合しかつそれと相互作用し
て翻訳を開始する位置を定める。すべてのこのような発
現が等しい効率で配列の機能を制御するわけではない。
こうして、所望のタンパク質のための特異的解読配列を
それらの隣接するヌクレオチド配列から分離し、そして
その代わりにそれらを他の既知の発現制御配列に融合し
て発現のレベルを好適にすることは有利である。これか
達成されると、新しく操作した核酸、例えは、DNA、
断片はマルチコピーまたはバクテリオファージ誘導体中
に挿入して、細胞内の遺伝子のコビ−の数を増加し、こ
れにより発現タンパク質の収率をさらに改良することが
できる。
いくつかの発現制御配列を前述したように使用すること
ができる。これらは、次のものを包含する:E、col
iのラクトースオペロン(「!aC系」)オペレーター
、プロモーターおよびリポソーム結合および相互作用配
列[シャインーダルガルノ(Shine−Dalgar
no)配列ような配列を包含する]、E、coliのト
リプトファンシンセターゼ系(rtrp系」)の対応す
る配列、ファージλの主要なオペレーターおよびプロモ
ーター領域(o t p LiダよびORP ’ R)
 、フィラメンテウス(Filamenteous)−
末鎖DNAファージ、または原核生物または真核生物の
細胞またはそれらのウィルスの遺伝子の発現を制御する
他の配列。したがって、適当な宿主における特定のポリ
ペプチドの産生を改良するために、そのポリペプチドの
遺伝情報を指定する遺伝子を選択し、そしてそれを含有
する組み換え体核酸分子から除去し、そしてその前者の
発現制御配列に密接してまたはそれに対してより適当な
関係でまたは前述の発現制御配列の1つの制御下に、組
み換え体核酸分子中に再挿入することができる。
このような方法はこの分野において知られている。
ここで使用するとき「関係」は、次の多くの因子を包含
する:例えば、組み換え体核酸分子およびその挿入され
た核酸配列の発現増強および促進領域を分離する距離、
挿入された核酸配列またはそのベクター中の他の配列の
転写および翻訳の特性、挿入された核酸配列の特定の配
列およびベクターの他の配列、およびベクターの発現増
強および促進領域の特定の特性。
所望の産生体の細胞の収率をさらに増加することは、細
胞中で利用することができる遺伝子の数の増加に依存す
る。これは、例示の目的で、次のようにして達成される
・鋳型バクテリオファージλ(NM989)中に操作し
た組み換え体核酸分子を挿入することによ−って、最も
簡単にはプラスミドを制限酵素で消化して、直線の分子
を形成し、次いでこれを制限した7アージAクローニン
グ−\ヒクル[例えば、N、E、ムレイ(Murray
)ら、「生体外組み換え体の回収を簡素化するラムドイ
ドファージ」、モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジ
エネティックス(Mo l e c、 Ge n。
Genetic、)、150、pp、53−61(19
77)およびN、E、ムレイ(Murray)ら、「バ
クテリオファージT4かものDNAリガーゼ遺伝子の分
子クローニング」、ジャーナル・オブ・モレキュラー・
バイオロジー(J、Mo1.Biol、)、132、p
p、493−505 (1979)l jイよびDNA
リガーゼどのインキコベーンヨンにより再環化された組
み換え体DNA分子と混合する。次いで、所望の組み換
え体ファージを前のように選択し、モしてE、c。
1iの宿主菌株を溶原化するために使用する。
とくに有用λクローニングベヒクルは、発現遺伝子cl
中に温度感受性突然変異および遺伝子S(その産生体は
宿主細胞の溶菌に必要である)および遺伝子E(その産
生体はウィルスの主要なカプシドタンパク質である)中
に抑制可能な突然変異を含有する。この系を使用すると
、溶原性細胞を32°Cに8いて増殖[7、次いで45
°Cに加熱してファージの切断を誘発する。37°Cに
おいて長く増殖させると、タンパク質は高いレベルで帝
土され、これは細胞内に保持され、これらは通常の方法
でファージ産生体により溶菌されず、そして7アージ遺
伝子のインサー1へはカプセル化されないので、それは
さらに転写のために利用される1)る。次いで、細胞の
人工的溶菌は所望の産生(、ドを高い収率で解放する。
さらに、本発明により調製されるポリペプチドの収率は
、また、異なるコドンをこのf) N A配列のコドン
のあるものまたはすベーCの代わりに使用するすること
(こよ−って改良することがでさ、こ4″Lらの置換さ
れたコドンは置換された=1トンにより遺伝情報を指定
されるものと同一のアミノ酸の遺伝情報を指定すること
を理解すべきである、。
最後に、本発明の組み換え体核酸分子により産生された
ポリペプチドの活性は、本発明の範囲から逸脱しないで
、本発明の核酸配列上t−はボリペプチドを、よく知ら
れた手段により、断片化、修飾または誘導化することに
よって改良することができる。
本発明のポリペプチドは、次のものを包含する:(1)
@述の細胞により発現されたポリペプチド、 (2)合成手段により調製されたポリペプチド。
(3)上の(1)または(2)のポリペプチドの断片、
このような断片はアミノ酸の合成によりまたは消化また
は切断により産生される。
本発明による合成ペプチドに関すると、ペプチドの化学
的合成は次の刊行物に記載されている:S、B、H,ケ
ント(Kent)ら、生化学的ポリマーズ(Bioch
emical  Polymers)、ボルドバーブ(
Goldberg)、E、P、およびナカジマ、A、編
、(アカデミツク・ブレス(Academic  Pr
ess)、ニューヨーク)、213−242 (198
0);A、R,ミッチェル(Mitchel +)、S
。
B、H,ケント(Ke n t) 、M、xンゲルハル
ド(Engelhard)およびR,B、メリフィール
ド(Merr i f ie ld)、ジャーナル・オ
ブ・オーガニック・ケミストリー(J、Org。
Chem、)、43.2845−2852 (1987
);J、P、タム(Tam) 、T、−W、つオンゾ(
Wong)、M、リーメン(Riemen)、F、−3
,ジエング(T j o e n g)およびRlB、
メリフィールド(Merr i f ie Id)、テ
トラヘドロン・レターズ(Tetraheclron 
 Letters)、4033 4036(1978)
;s、モジソフ(Mojsov)、A。
R,ミッチェル(Mi tche l I)R,B、メ
リフィールド(Me rr i f ie Id) 、
ジャーナル・オブ・オーガニック・ケミストリー(J。
Org、Chem、) 、45.555−5[30(1
980);J、P、タム(Tam)、R2D、デイマル
チ(DIMarchi)およびR,B、メリフィールド
(Merrif 1eld)、テ]・ラヘドロン・レタ
ーズ(Tetrahedron  I−eeters)
、2851−2854(1981);S、B、H,ケン
ト(K e n t ) 、M 、  リーメン(Ri
 eme n) 、M、し・ドウクス(d o u x
)およびR,B、メリフィールド(Merrifiel
d)、タンパク質配列の分析の方法についての第1■回
国際シンポジウムの会議録(P r o ceedin
g  of  the  IV  Internati
onal  Symposium  onMethod
s  of  Protein  5equence 
 Analysis)、(B r o o khave
n  Press、ニューヨーク州ブルックヘブン、刊
行中、1981゜ メリフィールドの固相手順において、L−アミノ酸の適
当な配列をカルボキシ末端アミノ酸からアミノ末端アミ
ノ酸まで構成する。樹脂のクロロメチル基、ベンズヒド
リルアミン基または他の反応性基への化学的結合を経て
ボリスヂレン(または他の適当な)樹脂へ取り付けられ
た適当なカルボキシ末端アミノ酸を使用して出発して、
アミノ酸を次の手順に従いお互いに付加する。ペプチド
−樹脂を: (a)塩化メチレンで洗浄し、 (b)10分間室温において塩化メチレン中の5%(V
/V)のジイソフロビルエチルアミン(他のヒンダード
塩基)で中和し、 (C)塩化メチレンで洗浄し、 (d)生長するペプチド鎖のモル量の6倍に等しい量の
アミノ酸を半分のモル量のカーポジイミド(シンクロへ
キシルカーポジイミドまたはジイソプロピルカーポジイ
ミド)と0°Cにおいて10分間−緒にすることによっ
て活性化して、アミノ酸対称無水物を形成する。使用す
るアミノ酸は本来N−アルファーtert、−7’チル
オキシカルボニル誘導体どして提供されるべきであり、
側鎖はベンジルエステル(例えは、アスパラギン酸また
はグルタミン酸)、ベンジルエーテル(例えば、セリン
、スレオニン、システィンまたはチロシン)、ベンジル
オキシカルボニル基(例えば、リジン)またはペプチド
の合成において普通に使用されている他の保護基で保護
し、 (e)活性化されたアミノ酸をペプチド−樹脂と2時間
室温において反応させて、生長するペプチド鎖の末端に
新しいアミノ酸を付加し、(f)ペプチド−樹脂を塩化
メチレンで洗浄し、(g)N−アルファ=(tert、
−ブチルオキシカルボニル)基を最も最近付加されたア
ミノ酸から、塩化メチレン中の30〜65%、好ましく
は50%(V / V )のトリフルオロ酢酸と室温に
おいて10〜30分間反応させることにより除去し、 (h)ペプチド−樹脂を塩化メチレンで洗浄し、(i)
要求されるペプチドの配列が構成されるまで、工程(a
)〜(h)を反復する。
次いで、10%V / Vのアニソールまたは他の適当
な(芳香族)スカベンジャーを含有する無水フッ化水素
酸とのにより、ペプチドを樹脂から分離する。引き続い
て、ペプチドをゲル濾過、イオン交換、高圧液体クロマ
トグラフィー、または他の適当な手段により精製するこ
とができる。
ある場合において、化学的合成は同相樹脂を使用しない
で実施することができ、この場合において合成反応は完
全に溶液中で実施される。この反応はこの分野において
同様な反応であり、よく知られており、そして最終産生
体は本質的に同一である。
ポリペプチドの消化は、タンパク質加水分解酵素、こと
にその基質の特異性がアミノ酸の所望の配列にすぐに隣
接する部位においてポリペプチドを切断する酵素を使用
して、達成することができる。
ポリペブチl!の切断は化学的手段により達成すること
ができる。アミノ酸間の特定の結合は、特定の試薬との
反応により切断することができる。
例は次の通りであるニメチオニンを含む結合を臭化シア
ンにより切断し、アスパラギニル−グリシン結合をヒド
ロキシルアミンにより切断する。
本発明は次の利点を有する: (1)TM−] 、TM−2およびTM−3の遺伝情報
を指定する核酸をプローブとして使用して、CE A遺
伝子族の他の構成員を分離することかできる。
(2)TM−1,TM−2およびTM−3の遺伝情報を
指定する核酸をグローブとして使用して、オリゴヌクレ
オチドプローブを誘導して、種々の腫瘍のタイプ中のT
M−1、TM−2、T〜1−3および他のCEA遺伝子
の発現を決定することができる。
(3)TM−1,TM−2、TM−3およびTM−4ヌ
クレオチド配列を使用して、合成タンバタ質の産生のた
めの一次アミノ酸配列を予測することができる。
(4)上の配列から誘導された合成ペプチドを使用して
、配列特異的抗体を産生ずることができる。
(5)CEA抗原族の構成員の各々についてのイムノア
ッセイを、これらの配列特異的抗体および合成ペプチド
を使用して、生成することができる。
(6)CEA族の異なる構成員か癌の異なるタイプのた
めの臨床的に通常なマーカーであるかどうかを決定する
場合、前述のイムノアッセイを癌の異なるタイプについ
ての診断剤として使用することができる。
本発明によるペプチドは、普通の手段により、例えば、
放射性部分(例えば、+250、酵素、色素および蛍光
化合物を使用して標識することかできる。
本発明によるイムノアッセイのだめのいくつかの可能な
立体的配置を使用することができる。これらのイムノア
ッセイにおいて使用することができる読み収り系は多数
であり、そしてこのようなシステムの非制限的例は、蛍
光性および比色酵素系、放射性同位元素の標識および検
出よりよび化学発光の系を包含する。・イムノアッセイ
法の2つの例は、次の通りである: (1)同相(このようなマイクIコタイタープレートま
たはラテックスビーズ)への本発明による抗体調製物(
それから誘導されたFabよたはF(a b) ’ を
包含する)を使用する酵素結合イムノアッセイ(ELi
SA)を、酵素に接合したちの以外のため特異性をもつ
精製した抗体へ収り付ける。この固相抗体を、CEA抗
原族の構成員を含有する試料と接触させる。洗浄後、固
相抗体抗原複合体を、接合した抗ペプチド抗体(または
接合した断片)と接触させる。結合しない接合体を洗浄
除去した後、酵素のための発色性または蛍光性の基質を
添加することによって色または蛍光を発生させる。発生
した色または蛍光の量は、試料中に存在する抗原の量に
比例する。
(2)蛍光で標識したペプチドまたはTM−1゜TM−
2、TIVI−33よびTM−4のための配列の合成ペ
プチドを使用する競合蛍光測定イムノアッセイ。この例
にわいて、細胞により発現された精製したペプチドまた
はその合成ペプチドを蛍光的に標識する。固相に精製し
た抗体を取り付ける。
次いで、蛍光性ペプチドのプローブを加えである、CE
A抗原族の構成員を含有する試料と、この固相を接触さ
せる。結合後、過剰のプローブを洗浄除去し、結合した
プローブの量を定量する。結合した蛍光性プローブの量
は、試料中に存在する抗原の量に逆比例するであろう。
本発明による核酸交雑法において、核酸プローブを標識
、例えば、酵素、蛍光団、放射性同位元素、化学発光化
合物などと接合させる。はとんどの一般の場合において
、プローブを試料と接触させ、そして交雑可能な核酸配
列の存在は、発色性酵素基質の存在下に発色させ、エビ
蛍光(epif 1uorescence)による検出
により、放射性同位元素で標識したプローブのオートラ
ジオグラフィーにより、または化学発光により、検出す
ることができるであろう。交雑可能なRNA配列の検出
は、(I)ドツトプロット法または(2)その場の交雑
法により達成することができる。これらの最後に述べた
2つの技術は、それぞれ、次の文献に記載されている:
D、ギレスピ−(Gillespie)およびJ、ブレ
ラセル(Bresser)、rNaT中のm RN A
の固定化:急速なプロット」、バイオテクニークス(B
 i o techniques)、181−192.
11月/12月、1983およびJ、ローレンス(La
wrence)およびR,シンガー(Singer)、
[細胞骨格タンパク質のだめのメツセンジャRNAの細
胞内局在化」、細胞(Cell)、45.407−41
5.1986年5月。読み取り系は、前述のものと同一
であり、例えば、酵素の標識、放射性同位元素などであ
る。
前述したように、本発明は、また、本発明の前述の複合
体の医学における使用に関する。
本発明は、さらに、活性成分として、本発明の複合体を
無菌のおよび/または物理学的に等張の水溶液の形態で
含有する製薬学的組成物を提供する。
非経口的投与のために、活性成分として、本発明の複合
体を含有する溶液および乳濁液は、無菌であり、そして
、適当ならば、血液等張性であるべきである。
活性複合体は、経口的、非経口的(例えば、筋肉内、腹
腔内、または静脈内)、直腸内または局所的に投与され
るであろう。
調製 実施例1a:  RNAの調製 メツセンジャーRNAを、J、ファポラロ(Favol
aro)、R,トレイスマン(Treisman)およ
びR,カメン(kamen)、メソソズ・イン・エンジ
モロジー(Methodsin  Enzymolog
y)、65.718アカデミツク・プレス・インコーポ
レーテンド(Academic  Press、Inc
、)のプロイテイナーゼに抽出法により調製し、次いで
オリゴdTセルロースのクロマトグラフィーにかけてポ
リA+RNA (ポリペプチドに翻訳され得るほとんど
のmRNAを含有する3′−ポリアデニル化真核生物R
NA)を生成した。はぼloopgのポリA+RNAを
得るために、l−ランスフェクション体23.41  
(ATCCNo、CRL9731)のほぼ3X108細
胞[TM−1,TM−2、TM−3およびTM−4発現
する、カマルク(Kamarck)ら、プロシーデイン
ダス・オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サイエン
シス(Proc、Na t 1.Acad、Sc i、
)USA、影↓、5350−5354.1987年8月
]り、後期の指数増殖後、ローラーびんで収穫した。細
胞を、140ミリモルのNaCl、l 。
5ミリモルのMgCl2.10ミリモルのトリスHCI
、p!−18,0,0,5%のNP40.4ミリモルの
ジチオスレイトールおよび20単位の胎盤リボヌクレア
ーゼ阻害因子/ m Qを含有する水冷溶液中で、ホモ
ジナイゼイションにより溶菌した。次いで、ナトリウム
デオキンコレートを02%に加えた。細胞質および核を
ホモジネートを12、ooox−gで20分間遠心する
ことによって分離した。細胞質の分画を等しい体積の0
.2モルのトリス−1−(CI、  pH7,8,25
ミリモルのEDTA、0.3モルのNaCl、2%のド
デ/ル硫酸ナトリウムおよび400μg / m Qの
プロイディナーゼにと混合し、37°Cにおいて1時間
インギュベーションし、次いで等しい体積のフェノール
/クロロホルノ・(1: l/v : v)溶液で1回
抽出した。核酸を分離した水性相のエタノール沈澱によ
り得た。合計のRNAを0.5モルのNaCI、10ミ
リモルのトリス−1(CI 。
pH7,8,0,1%のサルコシル中でオリゴdT(1
2−18)カラムに通過させることによって濃縮した。
洗浄後、結合したRNAを塩化ナトリウムを含有しない
同一溶液で溶離した。
実施例1b:  mRNAの逆転写 lOμgのポリA+RNAを、オリゴdT (12−1
8)およびpdN、ブライマーを使用する逆転写により
プライミングした。looμQの反応を、200単位の
AMV逆転写酵素(LifeScience、Inc、
、米国フロリダ州セン1−ペテルスブルグ)を使用して
、42℃にJりいて4時間実施した。c D N A、
 / m RN Aの雑種のRN A成分を、RNアー
ゼL(、E、coli  ポリメラーゼIJイよびE、
coli  DNAリガーゼで、各々12°Cおよび2
2°Cにおいて1.5時間処理することによって、第2
相補的鎖と置換した。分子の末端をT4  DNAポリ
メラーゼで処理して平滑にした。cDNAをフコ−ノー
ル/クロロホルムで抽出し、そして10ミリモルの1−
リス1−iCI、  pH7,8,1ミリモルのEDT
A (TE)中で調製した「セファデックス(Seph
aclex)G  5J スパン(s p u n)カ
ラムで精製 し l二 。
合成りNAリンカ− 5’  I) CCCG G G      3 ’3
°  GGGCCCTTAA  5″を、過剰のT4D
NAリガーゼを使用1.て平滑末端の才、へ合により、
cDNAの末端に取り付けた。
’rE中の「セファデックス(Sephadex)G 
 5」(中程度)のクロマトグラフィーにより、および
0,8%の低い融点のアガロースクールートの分画によ
り、過剰のリンカ−を除去した。ノザン・プロ/ト分析
に基づいて、CEA関連m RN Aの大きさは3.6
kbであると推定された。したがって、2〜4 k b
 +7) c D N A断片がゲルのスライスから回
収され、そして断片はエタノール沈澱した。
TE中のcDNAの再懸濁後、EcoRI切断ラムダg
う IQアームをCDNAに1:lの推定モル比でイ]
加した。結合を7°CにおいてT4  DNANカリゼ
の存在下に2日間進行させた。結合反応のアリコートを
商業的に入手したパンケージ混合物(Stratoge
neh米国カリフォルニア州サンジエゴ)に添加しす。
5XIO’のファージ粒子が、生体外パッケージおよび
E、co11宿主NM514の感染後、得られた。
実施例1d: 組み換え体ライブラリーのスクリニング 5XIO5のパソケー7′シたラムダ粒子を、E。
coliNM514の菌叢上に配置し、そして複製のパ
ターンを、W、D、ベントン(Bent。
n )およびR,W、デイビス(Dav i s)、サ
イエンス(Science)、196.180182(
+977)に記載されるように、セルロースシー1・上
に持ち」二げた。陽性のファージを、種々のCEA族の
構成員の間に反復するドメインを含有する、32p標識
したLV7  cDNAインサートプローブと交雑させ
た。多数ラウンドのスクリーニングにより、個々のプラ
ークからのファージを増幅し、滴定し、そしてこれらを
使用して、少量の組み換え体ファージDNAを調製した
。
実施例1e:  DNAの操作 T、マニアチス(Maniat is)、E、7リトシ
ユ(Fritsh)およびJ、サムブルンク(Samb
rook)、モレキュラー・クローニング(Molec
ular  Cloning)、実験室のマニュアル(
A  LaboratoryManual)、コールド
・スプリング・ハーバ−(Colcl Spring 
 Harbor)、(1982)に従い、ファージDN
Aを調製した。
DNAのセグメントを低い融点のアガロースゲルから分
離し、そしてブルースクリプト(B I u 5cri
pt)プラスミドベクター(Statagene、米国
カリフォルニア州すンジエゴ)中にサブクローニングた
めに挿入した。DNAの配列決定は、F、サンガー(S
anger)、S、ニノクレン(Nicklen)およ
びA、クールソン(Cou l 5on) 、プロシー
デインダス・オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サ
イエンシズ(Proc、Na L 1.Acad、Sc
 i、)USA。
74.5463−5467 (1977)のジデオキシ
停止法により実施した。pcE22中のcDNAのため
の核酸および翻訳された配列は、上に記載しである(T
M−2(CEA−(e))。
メツセンジャーRNAを、J、ファポラロ(Favol
aro)、R,)レイスマン(Tresman)および
R,カメン(kamen)、メソッズ・イン・エンジモ
ロジ−(Methodsin  Enzymology
)、65.718アカデミツク・プレス・インコーホレ
ーテッド(Academic  Press、Inc、
)のプロイテイナーゼに抽出法により調製し、次いでオ
リゴdTセルロースのクロマトグラフィーにかけてポリ
A+RNA (ポリペプチドに翻訳され得るほとんどの
mRNAを含有する3′−ポリアデニル化真核生物RN
A)を生成した。はぼ100μgのポリA+RNAを得
るために、3XIO’細胞のHT−29腫瘍細胞(AT
CCHT838)を、後期の指数増殖後、ローラーびん
で収穫した。
細胞を、140ミリモルのNaC1,1,5ミリモルの
MgC1,、lOミリモルのトリス−HCl、pH8,
0,0,5%のNP40.4ミリモルのジチオスレイト
ールおよび20単位の胎盤リボヌクレアーゼ阻害因子/
mQを含有する氷冷溶液中で、ホモジナイゼイションに
より溶菌した。次いで、ナトリウムデオキシコレートを
0.2%に加えた。細胞質および核をホモジネートを1
2,000×gで20分間遠心することによって分離し
た。細胞質の分画を等しい体積の0.2モルのトリス−
HCl% pH7,8,25ミリモルのEDTA、0.
3モルのNaCl、2%のドデシル硫酸ナトリウムおよ
び400μg / m aのプロイテイナーゼにと混合
し、37°Cにおいて1時間インキュベーションし、次
いで等しい体積のフェノール/クロロホルム(1: l
/V : V)溶液で1回抽出した。核酸を分離した水
性相のエタノール沈澱により得た。合計のRNAを0.
5モルのNaC1,10ミ リ モルの ト リ ス 
−HCI  、  pH7゜8.0.1%のサルコシル
中でオリゴdT(1218)カラムに通過させることに
よって濃縮した。洗浄後、結合したRNAを塩化ナトリ
ウムを含有しない同一溶液で溶離した。
実施例2b:  mRNAの逆転写 1011 gのJ−IT−29ポリA+RNAを、オリ
ゴdT(12−18)およびpdN6プライマーを使用
する逆転写によりプライミングした。100μQの反応
を、200単位のAMV逆転写酵素(Life  5c
ience、Inc、、米国70リダ州セントペテルス
ブルグ)を使用して、42°Cにおいて4時間実施した
。c D N A / m RNAの雑種のRNA成分
を、RNアーゼH,E、coli  ポリメラーゼIお
よびE、coli  DNAリガーゼで、各々12°C
および22°Cにおいて1.5時間処理することによっ
て、第2相補的鎖と置換した。分子の末端をT4DNA
ポリメラーゼで処理して平滑1こした。cDNAをフェ
ノール/クロロホルムで抽出し、そしてlOミリモルの
トリス−HCl、pH7,8,1ミリモルのE丁)TA
(TE)中で調製しf−rセファデックス(Sepha
dex)G−5」スパン(3p 111t )カラムで
精製した。
合成1) N Aリンカ 5″ pCCCGGG      3’3’  GGG
CCCTTAA  5’を、過剰のT Zi  11)
 N Aリガーゼを使用して平滑末端の結合により、C
D N Aの末端に取り付けた。
TE中の「セファデックス(Sephadex)G−5
J  (中程度)のクロマI・グラフィーにより、Jイ
よび0.8%の低い融点のアカロースクール上の分画に
より、過剰のりンカーを除去した。HT2S]のポリA
 −1−RN Aのノザン・プロット分析に基づいて、
CEA関連mRNAの大きさは2.2kbであると推定
された。したがって、2〜3kbのcDNA断片がゲル
のスライスから回収され、そして断片はエタノール沈澱
した。TE中のcDNAの再懸濁後、EcoRI切断ラ
ムダgうt 10アームをcDNAl:l:lの推定モ
ル比で付加しtユ。結合を7°CにおいてT4  DN
Aリガーゼの存在下に2日間進行させた。結合反応のア
リコートを商業的に人手したパッケージ混合物(Str
atogene、米国カリフォルニア州すンジエゴ)に
添加した。5×lOt′の7ア一ジ粒子が、生体外パン
ケージHよびE、coli宿主NM514の感染後、得
られた。
実施例2d:mみ換え体ライブラリーのスクリニンゲ 5XIO5のパックー−ジしたラムダ粒子を、Ecol
iNM514の菌叢上に配置し、イして複製のパターン
を、W、D、ベントン(Bent。
n)およびR7〜V、デイビス(Davis)、ザイエ
ンス(science)、+96.180182(19
77)に記載されるJ:うに、セルローメン−1−十に
持ち−Fげた。陽性のファージを、種々のCEA族の構
成員の間に反復するドメインを含打する、32p標識し
たLV7  cDNADNAリガ−ゼ1−ブと交雑させ
た。多数ラウンドのス〈ノリーユング(こより、個々の
プラークからのファージを増幅し、滴定し、そしてこれ
らを使用し、て、少r1の組み換え体〕了−ジDNAを
調製した。
実施例2e:  I)N、Aの操作 ]゛、、マニアチスaniat is)、E、フッI−
シュ(Fritsh)お4にびT4 リームプルyり(
Sambronk)、モレキュラー−クロユング(Mo
lecular  Cloning)、実験室のマニユ
アル(A  LaboratoryManuaり、コー
ルド・スプリング・)\バー(Cold  Sprin
g  Harbor)、(1982)に従い、ファー・
二フL) N Aを調製t、 t−。
DNAのセグメントを低い融点のアガロースゲルから分
離し、そしてブルースクリプト(B l u 5cri
pt)プラスミドベクター(Statagene、米国
カリフォルニア州すンジエゴ)中にサブクローニングな
y)に挿入した。DNAの配列決定は、F、ザンガー(
Sange r)、S、二・リクレン(Nicklen
)およびA、クールソ〉((コoulson)、フロン
〜デインダス・才ブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・
サイエンらズ(Proc、Na t 1.、Acad、
Sc i、)IJSA。
74.5463−5467 (1977)の・、゛fオ
キシ停止法により実施した。H”l”−6巾のc D 
NAのための核酸および翻訳さね!−配列は、その解読
領域の5′末端において完結口ず、HT −Gイン倶−
トのヌクレオチド配列は、CEA−(c)およびCEA
−(e)の遺伝情報を指定するcDト4・λクローンの
核酸配列にそれが関連するこ、ヒを水田、 i(′F−
f3イ〉・ザー +−の核酸配列は、これらのクローン
どCEA −(c)  cDNAのヌクレオチド位a 
1463〜1515および1676〜242gにおいて
のみ叉なる。この結果から理解されるように、pcHT
6インサートはCEA(【)のための部分的解読配列で
あり、そしてC,EA−(f)の推定される核酸および
翻訳された配列は上に記載しである(Trvl−3(C
EA(f))。
メツセンジャーRNAを、J、ファポラロ(Favo 
l a ro) 、R,トレイスマン(Treisma
n)およびR,カメン(k a m e n ) 、メ
ソッズ・イン・エン・ジモロジー(Methodsin
  Enzymology)、65.718アカデミツ
ク・プレス・インコーホレーテッド(Academic
  Press、Inc、)のプロイテイナーゼに抽出
法により調製し、次いでオリゴdTセルロースのクロマ
トグラフィーにかけてポリA+RNA (ポリペプチド
に翻訳され得るほとんどのm RN Aを含有する3′
−ポリアデニル化真核生物RNA)を生成した。はぼ1
00μgのポリA+RNAを得るために、3X10’細
胞の組み換え体23.411またはHT −29腫瘍細
胞系(ATCCHTB38)を、後期の指数増殖後、ロ
ーラーびんで収穫した。細胞を、140ミリモルのNa
C:1.1.5ミリモルのMgCl2.10ミリモルの
トリス−HCl、p H8,0,0゜5%のNP40.
4ミリモルのジチオスレイトールおよび20単位の胎盤
リボヌクレアーゼ阻害因子/mQを含有する水冷溶液中
で、ホモジナイゼイションにより溶菌した。次いで、ナ
トリウムデオキンコレートを0.2%に加えた。細胞質
および核をホモジネートを12,000Xgで20分間
遠心することによって分離した。細胞質の分画を等しい
体積の0.2モルのトリス−HCl、p■17.8.2
5ミリモルのEDTA、0.3モルのNaC1,2%の
ドデシル硫酸ナトリウムおよび400μg/mQのグロ
イテイナーゼにと混合し、37°Cにおいて1時間イン
キュベーションし、次いで等しい体積のフェノール/ク
ロロホルム(1:l/v:v)溶液で1回抽出した。核
酸を分離した水性相のエタノール沈澱により得た。
合計のRNAをQ、5モルのNaCl、10ミリモルの
トリス−HCl、pH7,8、O,1%のサルコシル中
でオリゴdT (12−18)カラムに通過させること
によって濃縮した。洗浄後、結合したRNAを塩化ナト
リウムを含有しない同一溶液で溶離した。
実施例3b:  mRNAの逆転写 10μgの23.411またはHT −29ポリA十R
NAを、オリゴdT(12−18)およびpdNsプラ
イマーを使用する逆転写によりブライミングした。10
0μQの反応を、200単位のAMV逆転写酵素(Li
fe  5cience。
Inc、、米国フロリダ州セントペテルスブルグ)を使
用して、42°Cにおいて4時間実施した。CD N 
A / m RN Aの雑種のRNA成分を、RNアー
ゼHSE、coli  ポリメラーゼIおよびE。
coli  DNAリガーゼで、各々12°Cおよび2
2°Cにおいて1,5時間処理することによって、第2
相補的鎖と置換した。分子の末端をT4  DNAポリ
メラーゼで処理して平滑にした。cDNAを7エノール
/クロロホルムで抽出し、そしてlOミリモルのトリス
−MC1% pH7,8,1ミリモルのEDTA (T
E)中で調製した「セファデックス(Sephadex
)G−5Jスパン(Spun)カラムで精製しtこ。
実施例3c:  CEA−(g)のクローニング合成り
NAリンカ− 5’  pCCCGGG      3’3”  GG
GCCCTTAA  5’を、過剰のT4  DNAリ
ガーゼを使用して平滑末端の結合により、cDNAの末
端に取り付けた。
TE中の[セファデックス(Sephadex)G−5
J  (中程度)のクロマトグラフィーにより、および
0.8%の低い融点のアガロースゲル上の分画により、
過剰のリンカ−を除去した。23゜411またはHT 
−29のポリA+RNAのノザン・プロット分析に基づ
いて、CEA関連mRNAの大きさは1.7kbである
と推定された。したがって、l〜2kbのcDNA断片
がゲルのスライスから回収され、そして断片はエタノー
ル沈澱した。TE中のc DNAの再懸濁後、EcoR
■切断ラムダgtloアームをcDNAll:l:lの
推定モル比で付加した。結合を7°CにおいてT4 D
NAリガーゼの存在下に2日間進行させた。
結合反応のアリコートを商業的に入手したパンケシ混合
物(Stratogene1米国カリフォルニア州サン
ジエゴ)に添加しす。5X]06の7ア一ジ粒子が、生
体外パッケージおよびE、co1i宿主NM514の感
染後、得られた。
実施例3d: 組み換え体ライブラリーのスクリユング 5X105〜lXl0’のパッケージしlニラムタ゛粒
子を、E、co l iNM514の菌叢上に配置し、
そして複製のパターンを、W、D、ベントン(Bent
on)およびR,W、デイビス(Dav i s) 、
サイエンス(Science)、196.180−18
2 (1977)に記載されるように、セルロースシー
1・上に持ち上げた。陽性のファージを、種々のCEA
族の構成員の間に反復するドメインを含有する、32p
標識したLV7cDNAインサートプローブと交雑させ
た。この選択法により、多数ラウンドのスクリーニング
後、陽性のファージかえられる。個々のプラークからの
ファージを増幅し、滴定し、そしてこれらを使用して、
少量の組み換え体ファージDNAを調製し Iこ 。
実施例3e:  DNAの操作 T、マニアチス(Maniatis)、E、フリトシュ
(Fritsh)およびJ、サムプルツク(Sambr
ook)、モレキュラー・クローニング(Molecu
lar  Cloning)、実験室のマニュアル(A
  LaboratoryManual)、コールド・
スプリング・ハーバ−(Cold  Spring  
l1arbor)、(1982)に従い、ファージDN
Aを調製した。
DNAのセグメントを低い融点のアガロースゲルから分
離し、そしてブルースクリプト(B l u 5cri
pt)プラスミドベクター(Statage II e
 %米国カリフォルニア州ザンジェゴ)中にザブクロー
ニングために挿入した。DNAの配列決定は、F、ザン
ガー(Sange r) 、S、ニックレン・(Nic
klen)およびA、クールソン(Cou l 5on
)、プロンーデインダス・才ブ・ナンヨカル・アカデミ
−・オブ・サイエン/ス(Proc、Na t 1.A
cad、Sc i、)USA。
74.5/163−5467 (1977)のジブすキ
ン停止法により実施した。CEA−(g)の遺伝情報を
指定するヌクレオチドおよび翻訳された配列は、上に記
載しである(TM−4(CEA(g))。
癌腫抗原[LV7またはCEA−(a)]の−部分の遺
伝情報を指定するc D N Aのセグメントを、ラン
ダムブライミングにより放射線標識し、そしてバクテリ
オファージのベクターλgtll(C1ontech 
 Laboratories。
Inc、、米国カリフォルニア州バロアルト)中のKG
−1細胞から調製した商業的cDNAライブラリーのフ
ィルターのレプリカ上で、相同性配列を検出するために
使用した。交雑は68°Cにおいて2XSSSPE (
IXssPE−0,15モルのNaCl、0.01モル
のリン酸ナトリウムおよび1ミリモルのEDTA、水酸
化カリウム7)、5×デンハル[・溶液およびl OO
μgの変性サケ精子D N A / m Q中で実施し
、そして交雑後0゜2XSCC1(1,259不のドデ
シル硫酸ナトリウム中で洗浄した。
陽性のファージを取り上げ、均質に再スクリユングし、
そしてDNAの産生のため増幅した。
cDNAのインサー1−をファージDNAからEcoR
Iで切除し、そしてプラスミドベクターpr+Iues
cript  KSのEcoR[部位中にスクリーニン
グした。二本鎖DNA上のDNAの配列決定は、ザンガ
ー(Sanger)ら、5upra、の方法により実施
した。KG−1cDNAからの2つの異なるインサート
の配列を、下に示す: こt)明tmWおよび特許請求の範囲は例示を目的とし
、そして限定を目的とセーす、そして種々の変更および
変化は本発明の精神および範囲を逸脱しないで可能であ
ることが明らかであろう。
本発明の主な特徴およびfル様は、次の通りである。
l、ペプチドの配列の遺伝情報を指定する塩基配列から
なり、群の核酸は次の5つの配列の群から選択されるD
NAであるか、あるいはこのような5つの配列のいずれ
かと交雑可能であるか、あるいはこのような5つの配列
のいずれかにより遺伝情報を指定されるペプチドの配列
と実質的に同一であるペプチドの配列の遺伝情報を指定
する核酸で、す)ることを特徴とする特許 く← で; U< ()C→ ・Q +)。
(つr→ °′5! ・Q 方 ・ Q − 8〜 O〉 ←−→ べH 〇− ロQ で2 Uく くト り    o    o    o    ロ    
CI     CI    IN     のつ   
 uo     IN     O)     ?  
   0    u)    O()5   の   
r+   さ   の   山   小   −−2、
上記第1項記載のDNA配列(1)であることを特徴と
する、タンパク質CEA−(e)の遺伝情報を指定する
塩基配列からなる核酸。
3、上記第1項記載のDNA配列(2)であることを特
徴とする、タンパク質CEA−(r)の遺伝情報を指定
する塩基配列からなる核酸。
4、上記第1項記載のDNA配列(3)であることを特
徴とする、タンパク質CEA−(g)の遺伝情報を指定
する塩基配列からなる核酸。
5、上記第1項記載のDNA配列(4)であることを特
徴とする、タンパク質KGCEAIの遺伝情報を指定す
る塩基配列からなる核酸。
6、上記第1項記載のDNA配列(5)であることを特
徴とする、タンパク質KGCEA2の遺伝情報を指定す
る塩基配列からなる核酸。
7、上記第1〜6項のいずれかに記載の核酸からなるイ
ンサートを有する複製可能な組み換え体クローニングベ
ヒクル。
8、上記第7項記載の組み換え体クローニングベヒクル
でトランスフェクション、感染または注入された細胞。
9、上記第1〜6項のいずれかに記載の核酸により遺伝
情報を指定されるアミノ酸配列を有することを特徴とす
るタンパク質、あるいは5以上のアミノ酸を有するその
ポリペプチドまたはペプチド断片。
10、上記第9項記載のタンパク質、ポリペプチドまた
はペプチドに対する抗体。
【図面の簡単な説明】
第1図は、トランスメンブレンCEAを概略的に表す。 特許出願人 モレキュラー・ダイアグノステイックス・
インコーポ、レーテッド FIG、1

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、ペプチドの配列の遺伝情報を指定する塩基配列から
    なり、群の核酸は次の5つの配列の群から選択されるD
    NAであるか、あるいはこのような5つの配列のいずれ
    かと交雑可能であるか、あるいはこのような5つの配列
    により遺伝情報を指定されるペプチドの配列と実質的に
    同一であるペプチドの配列の遺伝情報を指定する核酸で
    あることを特徴とする核酸: 【遺伝子配列があります】
JP1153923A 1988-06-16 1989-06-16 癌胚抗原の構成員の遺伝情報を指定するcDNA類 Pending JPH02107190A (ja)

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