JPH0216993A - 2’’’―o―デメチルタイロシンの生産方法 - Google Patents
2’’’―o―デメチルタイロシンの生産方法Info
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- JPH0216993A JPH0216993A JP1076383A JP7638389A JPH0216993A JP H0216993 A JPH0216993 A JP H0216993A JP 1076383 A JP1076383 A JP 1076383A JP 7638389 A JP7638389 A JP 7638389A JP H0216993 A JPH0216993 A JP H0216993A
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- streptomyces
- plasmid
- tylosin
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/44—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
- C12P19/60—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin
- C12P19/62—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin the hetero ring having eight or more ring members and only oxygen as ring hetero atoms, e.g. erythromycin, spiramycin, nystatin
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
本発明は2°”°−0−デメチルタイロシンを生産する
ための新規な方法に関するものである。この化合物は、
タイロシン(tylosin)分子のミンノース部分に
おける2°°′−O−メチル基を欠いている点を除いて
はタイロシンと同一である。
ための新規な方法に関するものである。この化合物は、
タイロシン(tylosin)分子のミンノース部分に
おける2°°′−O−メチル基を欠いている点を除いて
はタイロシンと同一である。
本方法は、組換えDNA技術を利用することによって得
られる化合物を開示するものである。突然変異ty+
E遺伝子(デメチルマクロノン−20−メチルトランス
フユラーゼ遺伝子(1) M OMT))を含有する微
生物を、クローンされたtylF遺伝子(マクロノン3
″″−O−メチルトランスフエラーゼ遺伝子(MOMT
))を含有するプラスミドで形質転換することにより、
2”°−Oデメチルタイロシンを生産することかできる
。DMOMT遺伝子(tylE)の突然変異は通常、t
ylF産物、MOMTに由来する3′° −ヒドロキシ
位の意義のあるメチル化を前もって妨げるものであるが
、しかし、MOMT遺伝子(tyl F )を高用量で
投与することを組合わせることにより、2位がメチル化
されていない6−デオキツアロースの3位におけるメチ
ル化が高度の割合て行われる。
られる化合物を開示するものである。突然変異ty+
E遺伝子(デメチルマクロノン−20−メチルトランス
フユラーゼ遺伝子(1) M OMT))を含有する微
生物を、クローンされたtylF遺伝子(マクロノン3
″″−O−メチルトランスフエラーゼ遺伝子(MOMT
))を含有するプラスミドで形質転換することにより、
2”°−Oデメチルタイロシンを生産することかできる
。DMOMT遺伝子(tylE)の突然変異は通常、t
ylF産物、MOMTに由来する3′° −ヒドロキシ
位の意義のあるメチル化を前もって妨げるものであるが
、しかし、MOMT遺伝子(tyl F )を高用量で
投与することを組合わせることにより、2位がメチル化
されていない6−デオキツアロースの3位におけるメチ
ル化が高度の割合て行われる。
2°゛−0−デメチルタイロシンは生物学的に活成経路
内が阻害されている突然変異体の効率的な利用法に関す
るものであり、別の抗生物質を産生ずるストレプトマイ
セス(Streptomyces)種間で、生合成遺伝
子を転移させることに関するものでない。抗生物質産生
微生物で使用できるよう改良されたベクターは、さらに
マルパーチダ(Malpartida)およびホップウ
ッド(D、 A、 Ilopwood)のネイチャー
309:462(1984)に開示されている。しかし
、本発明は、主としてタイロシン生合成経路の突然変異
、およびタイロシン生合成経路の遺伝子をクローニング
することに関連するものである。
内が阻害されている突然変異体の効率的な利用法に関す
るものであり、別の抗生物質を産生ずるストレプトマイ
セス(Streptomyces)種間で、生合成遺伝
子を転移させることに関するものでない。抗生物質産生
微生物で使用できるよう改良されたベクターは、さらに
マルパーチダ(Malpartida)およびホップウ
ッド(D、 A、 Ilopwood)のネイチャー
309:462(1984)に開示されている。しかし
、本発明は、主としてタイロシン生合成経路の突然変異
、およびタイロシン生合成経路の遺伝子をクローニング
することに関連するものである。
最近、抗生物質生合成経路に組換えDNA技術を適用す
ることが、欧州特許公開、EPA 0238323
(1987年9月23日公開、出願番号8730231
8.8)に記載された。この出願には、抗生物質産生微
生物の抗生物質産生能を高めるためのベクターおよびそ
の方法が開示されている。この方法は、抗生物質生合成
経路内で速度制限する酵素まtコは他の遺伝子産物を、
非形質転換微生物と比較して高いレベルで提供すること
何であり、抗菌性のタイロシンと同様の抗菌スペクトル
を有している。
ることが、欧州特許公開、EPA 0238323
(1987年9月23日公開、出願番号8730231
8.8)に記載された。この出願には、抗生物質産生微
生物の抗生物質産生能を高めるためのベクターおよびそ
の方法が開示されている。この方法は、抗生物質生合成
経路内で速度制限する酵素まtコは他の遺伝子産物を、
非形質転換微生物と比較して高いレベルで提供すること
何であり、抗菌性のタイロシンと同様の抗菌スペクトル
を有している。
近年、抗生物質産生微生物の組換えDNA技術における
開発および活用は、主として究極的には新規な抗生物質
を生産するためのクローニングベクターの開発に向けら
れていた。新規な抗生物質を得るための従来の方法は、
ムタ合成(mutasynthesis)であり、抗生
物質生合成が遺伝子学的に阻害されている自体栄養体(
idiotroph)に非天然の側鎖前駆体を与えるこ
とである。もう1つ別の方法は、ハイブリッド生合成で
あって、野生型菌株の生合成経路を表現型において阻害
する酵素インヒビターの存在下に、その受容菌株に非天
然の前駆体を与える生合成である。プロトプラストも使
用されており、これは遺伝子背景物(geneticb
ackgrounds)の相互種間転移(inLers
pecific transrer)を行うのに良好な
方法である。
開発および活用は、主として究極的には新規な抗生物質
を生産するためのクローニングベクターの開発に向けら
れていた。新規な抗生物質を得るための従来の方法は、
ムタ合成(mutasynthesis)であり、抗生
物質生合成が遺伝子学的に阻害されている自体栄養体(
idiotroph)に非天然の側鎖前駆体を与えるこ
とである。もう1つ別の方法は、ハイブリッド生合成で
あって、野生型菌株の生合成経路を表現型において阻害
する酵素インヒビターの存在下に、その受容菌株に非天
然の前駆体を与える生合成である。プロトプラストも使
用されており、これは遺伝子背景物(geneticb
ackgrounds)の相互種間転移(inLers
pecific transrer)を行うのに良好な
方法である。
特定のハイブリッド抗生物質がホップウッドら[Hop
wood、ネイチ+ − (Nature)、 3]4
642(1985)]に議論されているが、本発明は
、タイロシン土台に関連するものである。
wood、ネイチ+ − (Nature)、 3]4
642(1985)]に議論されているが、本発明は
、タイロシン土台に関連するものである。
本発明は、微生物からは相当量で入手できないと従来で
は考えられていた化合物である20−デメチルタイロシ
ンの生産方法に,関するものである。ここに、このよう
な生産法は、タイロシン生合成経路内の特定の突然変異
遺伝子の存在下に2”’−o−デメチルタイロシンを産
生ずる微生物を導く特定の遺伝子のコピーを含有してい
る組換えDNAベクターで突然変異微生物を形質転換す
ることによって、得ることができるものである。
は考えられていた化合物である20−デメチルタイロシ
ンの生産方法に,関するものである。ここに、このよう
な生産法は、タイロシン生合成経路内の特定の突然変異
遺伝子の存在下に2”’−o−デメチルタイロシンを産
生ずる微生物を導く特定の遺伝子のコピーを含有してい
る組換えDNAベクターで突然変異微生物を形質転換す
ることによって、得ることができるものである。
これまで知られていなかった化合物である2°″0−デ
メチルタイロシンは現在、突然変異したストレプトマイ
セス s fradiac)G S 1 6菌株から微量なが
ら発見されている。しかし、本発明は、組換えDNA技
術を利用することによって、2°゛−0−デメチルタイ
ロシンを相当量で生産することができる。本発明は、組
換えDNA技術をさらにストレプトマイセスに適用でき
る点で特に意義がある。既知の天然の抗生物質の2/3
以」二はストレプトマイセスから産生されるので、この
工業的に重要な属に適用できる方法を開発することは特
に要望されているものである。
メチルタイロシンは現在、突然変異したストレプトマイ
セス s fradiac)G S 1 6菌株から微量なが
ら発見されている。しかし、本発明は、組換えDNA技
術を利用することによって、2°゛−0−デメチルタイ
ロシンを相当量で生産することができる。本発明は、組
換えDNA技術をさらにストレプトマイセスに適用でき
る点で特に意義がある。既知の天然の抗生物質の2/3
以」二はストレプトマイセスから産生されるので、この
工業的に重要な属に適用できる方法を開発することは特
に要望されているものである。
本発明の目的に照らし、以下のように用語を定義する。
抗生物質−耐性一付与遺伝子:ある抗生物質に対する耐
性を付与する活性をコードしているDNAセグメント。
性を付与する活性をコードしているDNAセグメント。
組m より N Aクローニングベクター:付加的なり
NAを追加できる、または既に追加されているDNA分
子を含有する、選択でき、かつ自律的に複製できるかま
たは染色体に組み込まれている物質であって、これには
プラスミドおよびファージがあるが、これらに限定され
ない。
NAを追加できる、または既に追加されているDNA分
子を含有する、選択でき、かつ自律的に複製できるかま
たは染色体に組み込まれている物質であって、これには
プラスミドおよびファージがあるが、これらに限定され
ない。
兜ニブラスミドの複製起点(図中で使用)。
制限フラグメント:1つまたはそれ以上の制限酵素の作
用によって生成される線状DNA。
用によって生成される線状DNA。
形質転換体・形質転換された、生存可能な受容プロトプ
ラストなどの受容宿主細胞。
ラストなどの受容宿主細胞。
!に2[ffl : 2”’−0−デメチルタイロシン
およびタイロシンの構造。
およびタイロシンの構造。
纂旦回ニブラスミドpHJL284の制限部位および機
能地図。
能地図。
141Dニブラスミドpxyz1000の制限部位およ
び機能地図。
び機能地図。
本発明は、ストレプトマイセスのタイロシン産生菌株を
培養して2°゛°−O−デメチルタイロシンを生産する
ための方法であって、該産生菌株が、(a)タイロシン
生合成遺伝子tyIEの発現を妨げる1つまたはそれ以
上の突然変異(群)を含有し、(b)タイロシン生合成
遺伝子tytFの発現をコードしているDNAを含む組
換えDNAクローニングベクターで形質転換されており
、 培養条件が細胞の増殖、tylF遺伝子の発現、および
2゛”−O−デメチルタイロシンの産生に好適な条件で
あること、を特徴とする生産方法を提供するものである
。
培養して2°゛°−O−デメチルタイロシンを生産する
ための方法であって、該産生菌株が、(a)タイロシン
生合成遺伝子tyIEの発現を妨げる1つまたはそれ以
上の突然変異(群)を含有し、(b)タイロシン生合成
遺伝子tytFの発現をコードしているDNAを含む組
換えDNAクローニングベクターで形質転換されており
、 培養条件が細胞の増殖、tylF遺伝子の発現、および
2゛”−O−デメチルタイロシンの産生に好適な条件で
あること、を特徴とする生産方法を提供するものである
。
さらに、本発明は、組換えDNAクローニングベクター
、および上記の遺伝子とベクターで形質LT1 ’jz
; 逸:生存可能な受容プロトプラストなどの受容宿主
細胞にDNAを導入して受容細胞の遺伝子型を変化させ
ること。
、および上記の遺伝子とベクターで形質LT1 ’jz
; 逸:生存可能な受容プロトプラストなどの受容宿主
細胞にDNAを導入して受容細胞の遺伝子型を変化させ
ること。
タイロシン生合成遺伝子:1次代謝産物を、これも抗菌
活性を有することができる抗生物質中間体に変換し、次
いで最終産物タイロシンとする工程における酵素反応に
必須の酵素活性をコードしているか、または酵素活性の
発現を調節する産物をコードしているDNAセグメント
。
活性を有することができる抗生物質中間体に変換し、次
いで最終産物タイロシンとする工程における酵素反応に
必須の酵素活性をコードしているか、または酵素活性の
発現を調節する産物をコードしているDNAセグメント
。
阻害性突然変異体:例えば、1つまたはそれ以」二のタ
イロシン生合成遺伝子が欠失するなどの突然変異的な障
害のために、タイロシンを殆ど産生ヒないか、または全
く産生じない微生物。
イロシン生合成遺伝子が欠失するなどの突然変異的な障
害のために、タイロシンを殆ど産生ヒないか、または全
く産生じない微生物。
タイロシン生合成経路叫次代謝産物を抗生物質中間体に
、そしてタイロシンに変換する工程に必須のタイロシン
生合成遺伝子および生化学的反応全体の組。
、そしてタイロシンに変換する工程に必須のタイロシン
生合成遺伝子および生化学的反応全体の組。
以下に、添付した図面の説明をする。
ff1lFI:タイラクトン(tylactone)か
らタイロシンへのタイロシン生合成経路。
らタイロシンへのタイロシン生合成経路。
転換されている2”’−o−デメチルタイロシン産生微
生物、ならびに抗生物質2”゛−0−デメチルタイロシ
ンをも提供するものである。2”0−デメチルタイロシ
ンは、タイロシンと同様の微生物阻害活性スペクトルを
有する抗生物質として有用である。
生物、ならびに抗生物質2”゛−0−デメチルタイロシ
ンをも提供するものである。2”0−デメチルタイロシ
ンは、タイロシンと同様の微生物阻害活性スペクトルを
有する抗生物質として有用である。
本発明は、ストレプトマイセス・フラジアエ(SLre
ptomyces fradiae)G S l 6を
プラスミドpHJL284で形質転換することによって
調製するのが最適である。ストレプトマイセス・フラジ
アエGSI、6は、tylE遺伝子の突然変異のため、
タイロシンを産生ずることのできない阻害性突然変異体
である。ty+E突然変異は、ラクトン環に結合したミ
シノース(mycinose)前駆体(6−ゾオキシー
D−アロース(allose))の2°゛°位における
0−メチル化を妨げるものである。従って、tyIE遺
伝子が無いことにより、2°゛°位はヒドロキシ基を有
している。tylE遺伝子は、酵素、デメチルマクロシ
ン2”’−o−メチルトランスフェラーゼ(DMOMT
)をコードしているので、このty+ E遺伝子は2゛
”−〇−メチル化に関与している。tYI F産物、マ
クロシン3”パ−O−メチルトランスフェラーゼ(MO
MT)による3”“−ヒドロキシ位の有効なメチル化は
、事前の2′ヒドロキシ位のメチル化を必要とするので
、ストレプトマイセス・フラジアエGS 16+i、2
”“0−デメチルタイロシンを微量でしか産生じない。
ptomyces fradiae)G S l 6を
プラスミドpHJL284で形質転換することによって
調製するのが最適である。ストレプトマイセス・フラジ
アエGSI、6は、tylE遺伝子の突然変異のため、
タイロシンを産生ずることのできない阻害性突然変異体
である。ty+E突然変異は、ラクトン環に結合したミ
シノース(mycinose)前駆体(6−ゾオキシー
D−アロース(allose))の2°゛°位における
0−メチル化を妨げるものである。従って、tyIE遺
伝子が無いことにより、2°゛°位はヒドロキシ基を有
している。tylE遺伝子は、酵素、デメチルマクロシ
ン2”’−o−メチルトランスフェラーゼ(DMOMT
)をコードしているので、このty+ E遺伝子は2゛
”−〇−メチル化に関与している。tYI F産物、マ
クロシン3”パ−O−メチルトランスフェラーゼ(MO
MT)による3”“−ヒドロキシ位の有効なメチル化は
、事前の2′ヒドロキシ位のメチル化を必要とするので
、ストレプトマイセス・フラジアエGS 16+i、2
”“0−デメチルタイロシンを微量でしか産生じない。
ストレプトマイセス・フラジアエGS]6は現在一般に
入手可能であり、アメリカン・タイプ・カルチャー・コ
レクション(American Type Cu1tu
re Co11ection) (ATCC,o ツク
ビレ、メリーランド20852)に寄託されており、受
託番号ATCC31664の下に入手可能である。
入手可能であり、アメリカン・タイプ・カルチャー・コ
レクション(American Type Cu1tu
re Co11ection) (ATCC,o ツク
ビレ、メリーランド20852)に寄託されており、受
託番号ATCC31664の下に入手可能である。
本発明の新規な抗生物質を生産するのに有用なベクター
であるプラスミドpHJ+、284は、タイロシン生合
成経路におけるtylF遺伝子を含有している。ty+
F遺伝子は、マクロシン3”゛−Oメチルトランスフェ
ラーゼ(M OM T ) Q−q素’:i:コードし
ている。DMOMT活性が存在せず(従って、2゛°−
〇−位がメチル基でない) 、MOMTが比較的高いレ
ベルで存在する場合、6−ゾオキシアロースの3°”−
o−位が高い割合でメチル化されていることが観察され
る。プラスミドp1、i J L 284は、ブタペス
ト条約の下に寄託(1986年2月18rI)されてお
り、これは、ノーザン・リージオナル・リサーチ・ラボ
ラトリ−(Northern Regional Re
5erch Laboratory (N RRL)、
ベリオ、イリノイス61604)のパーマネント・ス!
・ツタ・カルチャー・コレクションとして寄託されてお
り、その一部を構成しているE、coli K12
HBIOI/pHJL284から入手可能である。こ
れは、受託番号NRRLB18044の下にプラスミド
の保存貯蔵物(ストックリサーバー)として入手できる
。
であるプラスミドpHJ+、284は、タイロシン生合
成経路におけるtylF遺伝子を含有している。ty+
F遺伝子は、マクロシン3”゛−Oメチルトランスフェ
ラーゼ(M OM T ) Q−q素’:i:コードし
ている。DMOMT活性が存在せず(従って、2゛°−
〇−位がメチル基でない) 、MOMTが比較的高いレ
ベルで存在する場合、6−ゾオキシアロースの3°”−
o−位が高い割合でメチル化されていることが観察され
る。プラスミドp1、i J L 284は、ブタペス
ト条約の下に寄託(1986年2月18rI)されてお
り、これは、ノーザン・リージオナル・リサーチ・ラボ
ラトリ−(Northern Regional Re
5erch Laboratory (N RRL)、
ベリオ、イリノイス61604)のパーマネント・ス!
・ツタ・カルチャー・コレクションとして寄託されてお
り、その一部を構成しているE、coli K12
HBIOI/pHJL284から入手可能である。こ
れは、受託番号NRRLB18044の下にプラスミド
の保存貯蔵物(ストックリサーバー)として入手できる
。
本発明をより理解するには、タイロシンがタイロシン産
生微生物内でいかにして生合成されるかを理解しなけれ
ばならない。タイロシンは、3つの糖(ミカロース(m
ycarose)、ミカミノース(mycaminos
e)およびミシノース(mycinose))と結合し
た16員分枝鎖状ラクトン(タイロノライド)から構成
される。そのラクトンは、脂肪酸生合成に関連している
反応経路に類似していると考えられる経路により、プロ
ピオニル−8−補酵素A分子と2つのマロニル−8−補
酵素A分子、4つのメチルマロニル−8−補酵素A分子
およびエチルマロニル−8−補酵素A分子との縮合によ
り、2つのアセテート、5つのプロピオネート、および
ブチレートから誘導される。この反応には、ty+c遺
伝子の産物が必要である。ラクトンの形成、糖の生合成
/結合、および得られた中間化合物のタイロシンへの変
換は遺伝子にコードされた一連の酵素群によって触媒さ
れる。このような酵素群をコードしている遺伝子をクロ
ーニングおよび/または突然変異誘発すれば、この生合
成経路を増幅することができる。
生微生物内でいかにして生合成されるかを理解しなけれ
ばならない。タイロシンは、3つの糖(ミカロース(m
ycarose)、ミカミノース(mycaminos
e)およびミシノース(mycinose))と結合し
た16員分枝鎖状ラクトン(タイロノライド)から構成
される。そのラクトンは、脂肪酸生合成に関連している
反応経路に類似していると考えられる経路により、プロ
ピオニル−8−補酵素A分子と2つのマロニル−8−補
酵素A分子、4つのメチルマロニル−8−補酵素A分子
およびエチルマロニル−8−補酵素A分子との縮合によ
り、2つのアセテート、5つのプロピオネート、および
ブチレートから誘導される。この反応には、ty+c遺
伝子の産物が必要である。ラクトンの形成、糖の生合成
/結合、および得られた中間化合物のタイロシンへの変
換は遺伝子にコードされた一連の酵素群によって触媒さ
れる。このような酵素群をコードしている遺伝子をクロ
ーニングおよび/または突然変異誘発すれば、この生合
成経路を増幅することができる。
分析によると、タイロシンが一連の生合成工程によって
組み立てられていることが分かる。種々の研究によって
、ストレプトマイセス・フラジアエから排出される検出
できる最初の中間体であるタイラクトンは、以下の工程
を包含する好ましい反応順序によってタイロシンに変換
されることが証明されている: (1)ラクトンのC−5ヒドロキシ位へのミカミノース
の付加、(2)C−20メチル基におけるヒドロキシメ
チル基への酸化、(3)C−20ヒドロキ7メチル基に
おけるホルミル基への脱水素、(4> (、−23メチ
ル基におけるヒドロキシメチルMへの酸化、(5)(、
−23ヒドロキシメチル基への6−ゾオキシーD−アロ
ースの付加、(6)ミカミノースのイ°−ヒドロキシ基
へのミカロースの付加、(7)デメチルマクロシン(D
OMM)の2′′−ヒドロキシ位へのメチル基の付加、
および(8)マクロシンの3”’−ヒドロキシ位へのメ
チル基の付加により、タイロシンが産生される。タイラ
クトンがタイロシンに変換される好ましい順序の反応に
必要とされる遺伝子には、tylA、tylF3、ty
lL、 tylMXtyl T、tylH,tylD。
組み立てられていることが分かる。種々の研究によって
、ストレプトマイセス・フラジアエから排出される検出
できる最初の中間体であるタイラクトンは、以下の工程
を包含する好ましい反応順序によってタイロシンに変換
されることが証明されている: (1)ラクトンのC−5ヒドロキシ位へのミカミノース
の付加、(2)C−20メチル基におけるヒドロキシメ
チル基への酸化、(3)C−20ヒドロキ7メチル基に
おけるホルミル基への脱水素、(4> (、−23メチ
ル基におけるヒドロキシメチルMへの酸化、(5)(、
−23ヒドロキシメチル基への6−ゾオキシーD−アロ
ースの付加、(6)ミカミノースのイ°−ヒドロキシ基
へのミカロースの付加、(7)デメチルマクロシン(D
OMM)の2′′−ヒドロキシ位へのメチル基の付加、
および(8)マクロシンの3”’−ヒドロキシ位へのメ
チル基の付加により、タイロシンが産生される。タイラ
クトンがタイロシンに変換される好ましい順序の反応に
必要とされる遺伝子には、tylA、tylF3、ty
lL、 tylMXtyl T、tylH,tylD。
tylJ、 tylKXtylc、 tylE、および
tylFがあるが、これらに限定されない。タイロシン
生合成経路の反応式図を添(=fの第1図に示す。第1
図中の各矢印は、その−ヒに位置する遺伝子名(群)で
指示される生合成遺伝子産物を必要とする変換工程を表
す。
tylFがあるが、これらに限定されない。タイロシン
生合成経路の反応式図を添(=fの第1図に示す。第1
図中の各矢印は、その−ヒに位置する遺伝子名(群)で
指示される生合成遺伝子産物を必要とする変換工程を表
す。
既述のように、本発明の新規な化合物は、LylE遺伝
子に突然変異を含有するタイロシン産生のストレプトマ
イセスを、タイロシン生合成遺伝子tylFを含有する
組換えDNAクローニングベクターで形質転換すること
によって得られる。現在では、例えばty+ Fなどの
抗生物質生合成遺伝子を単離するための方法は種々のも
のが当業界周知である。例えば、以下の実施例1は、す
べての抗生物質産生微生物に一般に適用できる、ストレ
プトマイセス染色体またはプラスミドDNAを単離する
ための好ましい方法である。染色体またはプラスミドD
NAを特定の抗生物質産生微生物から単離した後、調製
したDNAのゲノムライブラリーを、これも当業界周知
である方法によって構築する。例示を目的として、実施
例2では、抗生物質生合成経路の全体をクローニングで
きる可能性を高めるゲノムライブラリーを調製するため
の好えば、ストレプトマイセス・リモサス(rimos
us)およびストレプトマイセス・ハイグロスコピカス
(hygroscopicus)は、タイロシン生合成
経路によって天然でタイロシンを産生ずるその他2つの
微生物である。従って、これら2つの微生物も、本発明
の化合物を得るのに使用することができる。tyIE遺
伝子に突然変異を誘発させれば、これらの微生物は本発
明の目的にとっての宿主として使用することができる。
子に突然変異を含有するタイロシン産生のストレプトマ
イセスを、タイロシン生合成遺伝子tylFを含有する
組換えDNAクローニングベクターで形質転換すること
によって得られる。現在では、例えばty+ Fなどの
抗生物質生合成遺伝子を単離するための方法は種々のも
のが当業界周知である。例えば、以下の実施例1は、す
べての抗生物質産生微生物に一般に適用できる、ストレ
プトマイセス染色体またはプラスミドDNAを単離する
ための好ましい方法である。染色体またはプラスミドD
NAを特定の抗生物質産生微生物から単離した後、調製
したDNAのゲノムライブラリーを、これも当業界周知
である方法によって構築する。例示を目的として、実施
例2では、抗生物質生合成経路の全体をクローニングで
きる可能性を高めるゲノムライブラリーを調製するため
の好えば、ストレプトマイセス・リモサス(rimos
us)およびストレプトマイセス・ハイグロスコピカス
(hygroscopicus)は、タイロシン生合成
経路によって天然でタイロシンを産生ずるその他2つの
微生物である。従って、これら2つの微生物も、本発明
の化合物を得るのに使用することができる。tyIE遺
伝子に突然変異を誘発させれば、これらの微生物は本発
明の目的にとっての宿主として使用することができる。
このように、少なくとも1つのLylE突然変異を含有
するタイロシン産生菌株はいずれも、発現可能なtyl
F遺伝子を含有するクローニングビヒクル(クローニ
ング運搬体)で形質転換することによって2′1−○−
デメチルタイロシンの産生菌に変換することができる。
するタイロシン産生菌株はいずれも、発現可能なtyl
F遺伝子を含有するクローニングビヒクル(クローニ
ング運搬体)で形質転換することによって2′1−○−
デメチルタイロシンの産生菌に変換することができる。
バルブ(Baltz)およびセノ(Seno)(198
1)の突然変異誘発操作法[抗菌剤および化学療法(^
ntimicrobialAgents and Ch
emotherapy)、 20:214−225]に
実質的に従えば、ストレプトマイセスをN−メチルN’
−ニトローN−ニトロソグアニジン(MNNG)で処理
することができる。この突然変異誘発ましい方法を開示
している。ゲノムライブラリーを構築すれば、抗生物質
生合成遺伝子を含有するDNAフラグメントは、多くの
方法によって同定することができる。例えば、ある抗生
物質生合成酵素のアミノ酸配列の少なくとも一部分の知
見に基づいてDNAプローブを構築すればよい。次いで
、このプローブを標準的な方法によってライブラリーと
ハイブリクイズさせれば、その酵素をコードしている遺
伝子を含有するDNAフラグメントを検出することがで
きる。もう1つの方法は、抗生物質の生合成が阻害され
ている突然変異体にクローンしたDNAフラグメントを
導入し、抗生物質産生の回復に関してスクリーニングす
ることである。ライブラリーを調製したベクターによっ
ては、そのDNAで直接、突然変異体を形質転換しても
よく、または標準的な方法によって最初に適当なベクタ
ーにサブクローンしてもよい。
1)の突然変異誘発操作法[抗菌剤および化学療法(^
ntimicrobialAgents and Ch
emotherapy)、 20:214−225]に
実質的に従えば、ストレプトマイセスをN−メチルN’
−ニトローN−ニトロソグアニジン(MNNG)で処理
することができる。この突然変異誘発ましい方法を開示
している。ゲノムライブラリーを構築すれば、抗生物質
生合成遺伝子を含有するDNAフラグメントは、多くの
方法によって同定することができる。例えば、ある抗生
物質生合成酵素のアミノ酸配列の少なくとも一部分の知
見に基づいてDNAプローブを構築すればよい。次いで
、このプローブを標準的な方法によってライブラリーと
ハイブリクイズさせれば、その酵素をコードしている遺
伝子を含有するDNAフラグメントを検出することがで
きる。もう1つの方法は、抗生物質の生合成が阻害され
ている突然変異体にクローンしたDNAフラグメントを
導入し、抗生物質産生の回復に関してスクリーニングす
ることである。ライブラリーを調製したベクターによっ
ては、そのDNAで直接、突然変異体を形質転換しても
よく、または標準的な方法によって最初に適当なベクタ
ーにサブクローンしてもよい。
当業者であれば、本発明の新規な化合物がストレプトマ
イセス・フラジアエでの産生のみに限定されるものでな
いことは理解するものである。例によって、所望のスト
レプトマイセスのtylE阻害性突然変異閑株が菌株さ
れる。
イセス・フラジアエでの産生のみに限定されるものでな
いことは理解するものである。例によって、所望のスト
レプトマイセスのtylE阻害性突然変異閑株が菌株さ
れる。
本発明の目的のために微生物を形質転換するための他の
方法には、例えばプロトプラスト融合、接合およびトラ
ンスダクションなどの遺伝子組換えの伝統的な方法があ
る。これらの方法はいずれも、LyIF遺伝子を突然変
異背景物(mutant background)に導
入するのに使用することができるであろう。
方法には、例えばプロトプラスト融合、接合およびトラ
ンスダクションなどの遺伝子組換えの伝統的な方法があ
る。これらの方法はいずれも、LyIF遺伝子を突然変
異背景物(mutant background)に導
入するのに使用することができるであろう。
さらに、当業者であれば、本発明がプラスミドpHJ
L284または他の特定のベクターの使用に限定されな
いことを理解するものである。ストレプトマイセス・フ
ラジアエ、ストレプトマイセス・リモサス、ストレプト
マイセス・ハイグロスコピカスまたは他のタイロシン産
生微生物内で、複製でき、かつ維持または組込みできる
ベクターは、適当なタイロシン生合成遺伝子を有するよ
う改変することができ、従ってこれは、2”’−0デメ
チルタイロシンを生産するのに使用することができる。
L284または他の特定のベクターの使用に限定されな
いことを理解するものである。ストレプトマイセス・フ
ラジアエ、ストレプトマイセス・リモサス、ストレプト
マイセス・ハイグロスコピカスまたは他のタイロシン産
生微生物内で、複製でき、かつ維持または組込みできる
ベクターは、適当なタイロシン生合成遺伝子を有するよ
う改変することができ、従ってこれは、2”’−0デメ
チルタイロシンを生産するのに使用することができる。
タイロシン生合成遺伝子をライゲートすることのできる
このようなベクターには、プラスミドprJ702、p
rJ903、pfJ922およびplJ941などがあ
るが、これらに限定されない。プラスミドplJ702
は、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクシコンか
ら、受託番号ATCC39155の下に入手することが
できる。プラスミドplJ903、plJ922、およ
びplJ941は、ジョーン・インイ、ス・ストレプト
マイセス・カルチャー・コレクション(John In
nes Streptomyces Cu1ture
Co11ection。
このようなベクターには、プラスミドprJ702、p
rJ903、pfJ922およびplJ941などがあ
るが、これらに限定されない。プラスミドplJ702
は、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクシコンか
ら、受託番号ATCC39155の下に入手することが
できる。プラスミドplJ903、plJ922、およ
びplJ941は、ジョーン・インイ、ス・ストレプト
マイセス・カルチャー・コレクション(John In
nes Streptomyces Cu1ture
Co11ection。
ジョーン・インネス・インスティチュート、コルネイ・
レーン、ノルウィッチ、英国、NR47UH)から、そ
れぞれ受託番号3417.3419、および3338の
下に、入手することができる。プラスミドp HJ L
280 Sp +−I J L 284、p)fJ
L311およびp I−I J L 3 ] 5は例え
ば、tyl Fなどの各種のタイロシン生合成遺伝子を
含有しており、ノーザン・リージオナル・リサーチ・ラ
ボラトリ−(NRRL)[アグリ力ルチュアル・リサー
チ・サービス(^gricultural Re5ea
rch Ser既述のように、ストレプトマイセス・フ
ラジアエG516を、野生型tyl F遺伝子を含有す
るプラスミドpHJL284で形質転換することにより
、2°”−o−デメチルタイロシンが、微量しか産生じ
ない非形質転換G516と比較して際立って多い量で産
生される。DMOMT活性を欠いた比較的高いレベルの
M OM T iQ伝壬子産物、2位にメチル基が存在
しない6−ゾオキシアロースの3位におけるメチル化の
割合を高めることができる。従って、S、フラジアエG
S’16/T)HJL284は、本発明の目的にとって
特に好ましい菌株である。
レーン、ノルウィッチ、英国、NR47UH)から、そ
れぞれ受託番号3417.3419、および3338の
下に、入手することができる。プラスミドp HJ L
280 Sp +−I J L 284、p)fJ
L311およびp I−I J L 3 ] 5は例え
ば、tyl Fなどの各種のタイロシン生合成遺伝子を
含有しており、ノーザン・リージオナル・リサーチ・ラ
ボラトリ−(NRRL)[アグリ力ルチュアル・リサー
チ・サービス(^gricultural Re5ea
rch Ser既述のように、ストレプトマイセス・フ
ラジアエG516を、野生型tyl F遺伝子を含有す
るプラスミドpHJL284で形質転換することにより
、2°”−o−デメチルタイロシンが、微量しか産生じ
ない非形質転換G516と比較して際立って多い量で産
生される。DMOMT活性を欠いた比較的高いレベルの
M OM T iQ伝壬子産物、2位にメチル基が存在
しない6−ゾオキシアロースの3位におけるメチル化の
割合を高めることができる。従って、S、フラジアエG
S’16/T)HJL284は、本発明の目的にとって
特に好ましい菌株である。
プラスミドp HJ L 28 /lは、プロトプラス
ト形質転換によってストレプトマイセス・フラジアエG
516に導入される。プラスミドp I−I J L
284は抗生物質耐性付与遺伝子(S、フラジアエGS
]5が感受性を示すチオストレプトンに対する耐性)を
有しているので、チオストレプトンの存在下にプロトプ
ラストを再生することによって形質転換体を選択するこ
とができる。適当な形質vice)、米国農務省、ペオ
リア、イリノイス、6160 /l ニ、それぞれ受託
番号B−18043、B−1814、B−18046、
およびB−180/I 7の下に寄託されている。これ
らのベクターは、S、フラシアエ中で複製するので、2
0−デメチルタイロシンを生産する本発明の方法にとっ
ては有用なものである。以下の第1表に、本発明の方法
に使用される幾つかのプラスミドを簡単に記載し、例示
する。
ト形質転換によってストレプトマイセス・フラジアエG
516に導入される。プラスミドp I−I J L
284は抗生物質耐性付与遺伝子(S、フラジアエGS
]5が感受性を示すチオストレプトンに対する耐性)を
有しているので、チオストレプトンの存在下にプロトプ
ラストを再生することによって形質転換体を選択するこ
とができる。適当な形質vice)、米国農務省、ペオ
リア、イリノイス、6160 /l ニ、それぞれ受託
番号B−18043、B−1814、B−18046、
およびB−180/I 7の下に寄託されている。これ
らのベクターは、S、フラシアエ中で複製するので、2
0−デメチルタイロシンを生産する本発明の方法にとっ
ては有用なものである。以下の第1表に、本発明の方法
に使用される幾つかのプラスミドを簡単に記載し、例示
する。
第1表
タイロシン生合成遺伝子を含有するプラスミドE、 c
ol i KI2 C,F 、 J 、
B−180441113101/pHJ!、284 E、 col i KI2 L、 M
B−1804511131,01/pHJL3+
1 E、coliK12 D、E、F、H,J
B−1804311B+01./1)llJL280 E、coli KI2 D、 E、 F、 H
,J B−18047JMI09/pHJL3
15 1986年2月18日 1986年2月18日 1986年2月18日 1986年2月工8日 転換体を同定した後、チオストレプトンを存在させて繁
殖しざえすればプラスミドが維持される。
ol i KI2 C,F 、 J 、
B−180441113101/pHJ!、284 E、 col i KI2 L、 M
B−1804511131,01/pHJL3+
1 E、coliK12 D、E、F、H,J
B−1804311B+01./1)llJL280 E、coli KI2 D、 E、 F、 H
,J B−18047JMI09/pHJL3
15 1986年2月18日 1986年2月18日 1986年2月18日 1986年2月工8日 転換体を同定した後、チオストレプトンを存在させて繁
殖しざえすればプラスミドが維持される。
2°”−o〜デメチルタイロンンを産生させるため、米
国特許第4.4+9,447号に既に記載されているデ
ミジノシルタイロシンの発酵条件下で、得られた形質転
換体を増殖させる。デミジノシルタイロシンに関して米
国特許第4,419,447号が記載しているように、
得られた発酵ブロスを濾過し、抽出する。さらに、実施
例11に記載のように、2′″−0−デメチルタイロシ
ンと前駆体2”’−0−デメチルマクロシン(macr
ocin)との混合物である抽出した物質を精製し、純
粋な2′°°〜O−デメチルタイロシンを得る。形質転
換、培養および発酵操作の詳細は、さらに以下の実施例
に記載する。
国特許第4.4+9,447号に既に記載されているデ
ミジノシルタイロシンの発酵条件下で、得られた形質転
換体を増殖させる。デミジノシルタイロシンに関して米
国特許第4,419,447号が記載しているように、
得られた発酵ブロスを濾過し、抽出する。さらに、実施
例11に記載のように、2′″−0−デメチルタイロシ
ンと前駆体2”’−0−デメチルマクロシン(macr
ocin)との混合物である抽出した物質を精製し、純
粋な2′°°〜O−デメチルタイロシンを得る。形質転
換、培養および発酵操作の詳細は、さらに以下の実施例
に記載する。
2°゛′−O−デメチルタイロシンは実質的にタイロシ
ンと同等の活性スペクトラムを示す。従って、2”’−
o−デメチルタイロシンは、グラム陽性およびグラム−
陰性菌、ならびに特定の植物病原体微生物などの各種の
微生物の増殖に対する阻害作用を有している。タイロシ
ンに関する詳細な抗菌活性は、米国特許第3,178,
341号に開示されている。2”’−0−デメチルタイ
ロシンが阻害作用を示す主要な微生物は、グラム−陽性
菌である。タイロシン同様、2°′°−0−デメチルタ
イロシンは動物に対しては十分許容されるものであり、
経口および非経口的投与の両縁路で有効である。
ンと同等の活性スペクトラムを示す。従って、2”’−
o−デメチルタイロシンは、グラム陽性およびグラム−
陰性菌、ならびに特定の植物病原体微生物などの各種の
微生物の増殖に対する阻害作用を有している。タイロシ
ンに関する詳細な抗菌活性は、米国特許第3,178,
341号に開示されている。2”’−0−デメチルタイ
ロシンが阻害作用を示す主要な微生物は、グラム−陽性
菌である。タイロシン同様、2°′°−0−デメチルタ
イロシンは動物に対しては十分許容されるものであり、
経口および非経口的投与の両縁路で有効である。
本発明をさらに説明するため、以下に実施例を挙げるが
、これらは本発明の範囲を限定するものではない。
、これらは本発明の範囲を限定するものではない。
衷旌甜よ
トリブチカーゼ大豆ブロス(TSB”)10肩Cニ単一
コロニーを接種し、この溶液を3回ホモジナイズ(ho
mogenizing) してコロニーを崩壊させて、
ブロス10RQ中にてストレプトマイセス・フラジアエ
を30°Cで増殖させた。培養物1031ρを48時間
増殖させ、次いでホモジナイズし、これy、New Y
ork 11514)]の220%v/v)溶液約50
1Qを加え、穏やかに混合した後、得られた細胞溶解し
た細胞を55℃で30分間インキュベートした。5M
NaCl2250xQを溶解した細胞溶液中に穏やかに
混合した後、懸濁液を5orvall遠心管(〜40顧
/管)に移し、水上に2時間放置した。得られた溶液を
S orvall S S 340−ターおよび遠心機
によって15.00 Orpmで20分間遠心分離した
。得られた上清をまとめ(〜7001の、イソプロピル
アルコール0.64容量を加え、穏やかに混合した。こ
の溶液をS orvall遠心ボトルに移し、S or
vall G S A o−夕−および遠心機によって
l01OOOrpI++で遠心分離し、沈澱物を採取し
た。得られた沈澱物を風乾し、次いでTEに穏やかに再
懸濁して最終容量100110゜とした。
コロニーを接種し、この溶液を3回ホモジナイズ(ho
mogenizing) してコロニーを崩壊させて、
ブロス10RQ中にてストレプトマイセス・フラジアエ
を30°Cで増殖させた。培養物1031ρを48時間
増殖させ、次いでホモジナイズし、これy、New Y
ork 11514)]の220%v/v)溶液約50
1Qを加え、穏やかに混合した後、得られた細胞溶解し
た細胞を55℃で30分間インキュベートした。5M
NaCl2250xQを溶解した細胞溶液中に穏やかに
混合した後、懸濁液を5orvall遠心管(〜40顧
/管)に移し、水上に2時間放置した。得られた溶液を
S orvall S S 340−ターおよび遠心機
によって15.00 Orpmで20分間遠心分離した
。得られた上清をまとめ(〜7001の、イソプロピル
アルコール0.64容量を加え、穏やかに混合した。こ
の溶液をS orvall遠心ボトルに移し、S or
vall G S A o−夕−および遠心機によって
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た。得られた沈澱物を風乾し、次いでTEに穏やかに再
懸濁して最終容量100110゜とした。
RNAa8eA (シグマ(Sigma)、SL、 L
ouis、 Miss。
ouis、 Miss。
uri)約5.OxgをTE(10mM トリス−H
CQ pH8,O/1.0mM EDTA)lxfi中
に懸濁し、2分間沸騰させ、ブロテイナーゼに5.Ox
を使用し、最終濃度04%までグリシンを加えたTSB
50ON&を含有するフラスコに接種した。この培養物
を30’Cで48時間増殖させ、RC−5ツルパル(S
orvall)およびGSAローターを使用して5or
vall遠心ボトル中で、10,000 rpm、15
分間遠心分離に付し、菌糸体を採取した。湿潤した菌糸
が約50g調製された。
CQ pH8,O/1.0mM EDTA)lxfi中
に懸濁し、2分間沸騰させ、ブロテイナーゼに5.Ox
を使用し、最終濃度04%までグリシンを加えたTSB
50ON&を含有するフラスコに接種した。この培養物
を30’Cで48時間増殖させ、RC−5ツルパル(S
orvall)およびGSAローターを使用して5or
vall遠心ボトル中で、10,000 rpm、15
分間遠心分離に付し、菌糸体を採取した。湿潤した菌糸
が約50g調製された。
細胞ペレットをトリス−ショ糖(10mlVIトリスー
1−ICf! pH8,0/]、OmM EDTA/2
5%シヨ糖)500xCに再懸濁した。次ぎに、得られ
た懸濁液に0.25M EDTA (pH8,0)およ
びリゾチーム溶液[トリス−ショ糖溶液中、]Oxg/
i(! リゾチーム(カルビオケム((:albioc
hem))] 250 *σを加えた。この混合物を室
温で15分間インキュベートし、次いでプロテイナーゼ
K(ベックマン)50igを加え、得られた懸濁液をさ
らに30分間インキュベートした。ドデシル硫酸ナトリ
ウム[特級品、ガラード・ンユレジンガー・ケミカル(
Gallard−Schlesinger Chemi
cal Mfg、Corp、、 584 Mineol
a Place、Ilew York Citgと共に
上記のD N A jff、A濁液に加え、次いでこの
混合物を4°Cで15時間インキュベートした。次ぎに
、等B1の緩衝液飽和フェノールをこの混合物に加え、
遠心分離(5,OOOrpm、GSAo−夕、10分間
)によって層を分離した。水層を250mり容量のメス
シリンダー中にデカントし、3M酢酸ナトリウム(pH
8,0)を添加して0゜3M酢酸ナトリウムに調節した
。この溶液を水」二に置き、これら2つの液体が混合し
ないように冷エタノール2容量を穏やかに加えた。マー
ミュー (Marmar)ら[+961. J、 Mo
1. Biol、 3:208−218]によって開発
された操作法を使用し、DNAとエタノールとの界面に
ガラスロッドを穏やかに渦巻かせて高分子mのDNA種
を採取した。このようにして採取したDNAを70%エ
タノールで1回洗浄し、風乾した後、最終濃度1.4r
ig/x(lで(O]MNa(4を加えた)TE51f
fに再懸濁した。
1−ICf! pH8,0/]、OmM EDTA/2
5%シヨ糖)500xCに再懸濁した。次ぎに、得られ
た懸濁液に0.25M EDTA (pH8,0)およ
びリゾチーム溶液[トリス−ショ糖溶液中、]Oxg/
i(! リゾチーム(カルビオケム((:albioc
hem))] 250 *σを加えた。この混合物を室
温で15分間インキュベートし、次いでプロテイナーゼ
K(ベックマン)50igを加え、得られた懸濁液をさ
らに30分間インキュベートした。ドデシル硫酸ナトリ
ウム[特級品、ガラード・ンユレジンガー・ケミカル(
Gallard−Schlesinger Chemi
cal Mfg、Corp、、 584 Mineol
a Place、Ilew York Citgと共に
上記のD N A jff、A濁液に加え、次いでこの
混合物を4°Cで15時間インキュベートした。次ぎに
、等B1の緩衝液飽和フェノールをこの混合物に加え、
遠心分離(5,OOOrpm、GSAo−夕、10分間
)によって層を分離した。水層を250mり容量のメス
シリンダー中にデカントし、3M酢酸ナトリウム(pH
8,0)を添加して0゜3M酢酸ナトリウムに調節した
。この溶液を水」二に置き、これら2つの液体が混合し
ないように冷エタノール2容量を穏やかに加えた。マー
ミュー (Marmar)ら[+961. J、 Mo
1. Biol、 3:208−218]によって開発
された操作法を使用し、DNAとエタノールとの界面に
ガラスロッドを穏やかに渦巻かせて高分子mのDNA種
を採取した。このようにして採取したDNAを70%エ
タノールで1回洗浄し、風乾した後、最終濃度1.4r
ig/x(lで(O]MNa(4を加えた)TE51f
fに再懸濁した。
a) トリブチカーゼ大豆ブロスは、ボルチモア・バ
イオロジカル・ラボラトリーズ[Baltimore
Bi。
イオロジカル・ラボラトリーズ[Baltimore
Bi。
logical Laboratories、P、O,
Box 243.コノキーズビレ、メリーランド210
3]]、またはデイフコ・ラボラトリーズ[Difco
Laboratories、デトロイトミシガン]か
ら入手される。
Box 243.コノキーズビレ、メリーランド210
3]]、またはデイフコ・ラボラトリーズ[Difco
Laboratories、デトロイトミシガン]か
ら入手される。
実施例2
大腸菌(E、coli) K I 2 C60C600
RK (ATCC33525)の−晩培養物を、マルト
ース(20%マルトースから0.2%マルト−ス)およ
びMgSO4(1M MgSO4から10mM)を加え
たTブロス(バタトートリブトン10g、酵母エキス5
g、NaC45gに蒸留水を加えて1リツトルとする(
pH7,0))IOJIρ中で37°Cにて増殖させた
。このような添加ブロスをTMMと命名スる。シャロン
4のファージストック、(ATCC40432)、標準
的なE、coli K ] 2 ラムダ(λ)クロー
ニングベクターを連続して希釈し、個々のファージ希釈
物0.1xf!を、TMM中で増殖させたE、coli
培養物のl/10希釈物0,1mρに加えた。次いで、
これらの培養物を37°Cで20分間インキユヘートし
た。TMトップ寒天(TM top agar) (]
OmM MgS O,および0.7%寒天を加えた′
Fブロス)3zf!を加えた後、培養物を、I OmM
MgSO4を加えたT寒天(Tブロス+1.5%寒天
)上にプレートシ、37°Cで16−24時間インキュ
ベートした。〜20,000pfu(プラーク形成ユニ
ット)を含有する平板を選携し、ラムダ緩衝液(トリス
−HCσ635g1 トリス−塩基1.I 8g、Mg
5O,・7H。
RK (ATCC33525)の−晩培養物を、マルト
ース(20%マルトースから0.2%マルト−ス)およ
びMgSO4(1M MgSO4から10mM)を加え
たTブロス(バタトートリブトン10g、酵母エキス5
g、NaC45gに蒸留水を加えて1リツトルとする(
pH7,0))IOJIρ中で37°Cにて増殖させた
。このような添加ブロスをTMMと命名スる。シャロン
4のファージストック、(ATCC40432)、標準
的なE、coli K ] 2 ラムダ(λ)クロー
ニングベクターを連続して希釈し、個々のファージ希釈
物0.1xf!を、TMM中で増殖させたE、coli
培養物のl/10希釈物0,1mρに加えた。次いで、
これらの培養物を37°Cで20分間インキユヘートし
た。TMトップ寒天(TM top agar) (]
OmM MgS O,および0.7%寒天を加えた′
Fブロス)3zf!を加えた後、培養物を、I OmM
MgSO4を加えたT寒天(Tブロス+1.5%寒天
)上にプレートシ、37°Cで16−24時間インキュ
ベートした。〜20,000pfu(プラーク形成ユニ
ット)を含有する平板を選携し、ラムダ緩衝液(トリス
−HCσ635g1 トリス−塩基1.I 8g、Mg
5O,・7H。
0 2.46g、NaC& 5.84gに蒸留水を1リ
ツトルになるまで加える・>5M(lを注いだ。得られ
た平板を50+0.容ff1sorvall管に削り入
れ、CJ−TCI!30.1!ρを添加した後、その管
を4,000 rpmで10分間遠心した。得られた上
清を新鮮な管中に採り、CHCa2O5πaを加えた。
ツトルになるまで加える・>5M(lを注いだ。得られ
た平板を50+0.容ff1sorvall管に削り入
れ、CJ−TCI!30.1!ρを添加した後、その管
を4,000 rpmで10分間遠心した。得られた上
清を新鮮な管中に採り、CHCa2O5πaを加えた。
適当な力価を得るには、3−5細胞溶解物を調製すれば
よいことに注意すべきである。
よいことに注意すべきである。
B、ファージ細胞溶Iの調製
1’:、coli K I 2 C600Rx MK(
ATCC33525)の培養物20xQを7MMブロス
中、327〜 7°Cで一晩増殖させた。この培養物をlQ″pruの
シャロン4 (実施例2Aの平板細胞溶解物から入手し
、常法によって力価測定した)と混合し、振盪させずに
30℃で10分間インキュベートシた。
ATCC33525)の培養物20xQを7MMブロス
中、327〜 7°Cで一晩増殖させた。この培養物をlQ″pruの
シャロン4 (実施例2Aの平板細胞溶解物から入手し
、常法によって力価測定した)と混合し、振盪させずに
30℃で10分間インキュベートシた。
インキュベートした混合物を半分に分け、その各々を、
最終濃度10mM Mg5O,でMg5O,を加えたT
ブロス500RQを入れた1リツトル容量フラスコに加
え、37℃で振盪させて細胞溶解した(約3−8時間)
。
最終濃度10mM Mg5O,でMg5O,を加えたT
ブロス500RQを入れた1リツトル容量フラスコに加
え、37℃で振盪させて細胞溶解した(約3−8時間)
。
細胞溶解した後、DNAasel (50mM ト
リス−)(CρpH8,0中、10gg/xρ)[ウォ
ーンングトン・ダイアグノスティックQorthing
tonDiagnostic)、フリーボールド、ニュ
ーシャーシー07728から入手]を各フラスコ毎に終
濃度1μg/x(lで加え、それらのフラスコを15分
間振盪させた。次イテ、NaCQ 7.9 g’/ 1
001gを各フラスコに加え、振盪して溶液とした。
リス−)(CρpH8,0中、10gg/xρ)[ウォ
ーンングトン・ダイアグノスティックQorthing
tonDiagnostic)、フリーボールド、ニュ
ーシャーシー07728から入手]を各フラスコ毎に終
濃度1μg/x(lで加え、それらのフラスコを15分
間振盪させた。次イテ、NaCQ 7.9 g’/ 1
001gを各フラスコに加え、振盪して溶液とした。
クロロホルム0.23!ρを各フラスコに加えた後、そ
の内容物をSor’vall遠心ボトルに移し、GSA
ローター、4 、 OOOrpmで10分間回転させた
。
の内容物をSor’vall遠心ボトルに移し、GSA
ローター、4 、 OOOrpmで10分間回転させた
。
=28
」1清をまとめた後、ポリエチレングリコール6000
[シグマから入手]を終濃度100g/リツ!・ルで加
え、振盪させて溶液とし、氷上に1時間放置した。
[シグマから入手]を終濃度100g/リツ!・ルで加
え、振盪させて溶液とし、氷上に1時間放置した。
この溶液の部分量を5orvallボトルに移し、GS
Sクローター6,0OOrpL11で10分間遠心して
沈澱物を採取した。すべてのベレットを全1115雇の
ラムダ緩衝液に再懸濁し、クロロホルム15峠を加えた
501容量S orval l管に移し、旋回した後、
4 、00 Orpmで10分間遠心した。
Sクローター6,0OOrpL11で10分間遠心して
沈澱物を採取した。すべてのベレットを全1115雇の
ラムダ緩衝液に再懸濁し、クロロホルム15峠を加えた
501容量S orval l管に移し、旋回した後、
4 、00 Orpmで10分間遠心した。
」二部の水層を採取した後、塩化セシウム(0゜8 ]
4 g/好)を加え、屈折率1.3809に調節した
。この溶液をベックマン超遠心管に移し、平衡化するま
で回転させた(50.OOOrpm、18時間)。ファ
ージバンドを注射器(針とシリンジ)で抜き取り、ラム
ダ緩衝液2リツトルに対して4−8時間透析した。だい
たいのDNA濃度を測定した後、等容量の緩衝液飽和(
50mMl!スー1−ICρpH8,0)フェノール[
特級、ベセスダ・リサーチ・ラボラトリ−(Bethe
sda Research Laboratory、
B RL)、ガイザースブルク、メリーランド208
77から入手]を加え、穏やかに混合してラムダDNA
を抽出した。5orvall遠心機で遠心して層を分離
し、水層を取り出し、等量のエーテルと混合した。遠心
によって層を再び分離し、エーテル層を取り出して廃棄
した。エーテル抽出工程を繰り返し、3M酢酸ナトリウ
ム(pH8,0)を添加して0.3M酢酸ナトリウムと
し、λDNA溶液を調製した。冷エタノール2容量を加
えてDNAを沈澱させ、〜20℃で一晩保存した。遠心
分離(15,00Orpm、15分間、5orvall
管)してDNAを採取し、70%エタノールで1回洗浄
し、風乾した。このDNAベレットを終濃度〜400μ
g/肩θでTE500μQに再懸濁した。
4 g/好)を加え、屈折率1.3809に調節した
。この溶液をベックマン超遠心管に移し、平衡化するま
で回転させた(50.OOOrpm、18時間)。ファ
ージバンドを注射器(針とシリンジ)で抜き取り、ラム
ダ緩衝液2リツトルに対して4−8時間透析した。だい
たいのDNA濃度を測定した後、等容量の緩衝液飽和(
50mMl!スー1−ICρpH8,0)フェノール[
特級、ベセスダ・リサーチ・ラボラトリ−(Bethe
sda Research Laboratory、
B RL)、ガイザースブルク、メリーランド208
77から入手]を加え、穏やかに混合してラムダDNA
を抽出した。5orvall遠心機で遠心して層を分離
し、水層を取り出し、等量のエーテルと混合した。遠心
によって層を再び分離し、エーテル層を取り出して廃棄
した。エーテル抽出工程を繰り返し、3M酢酸ナトリウ
ム(pH8,0)を添加して0.3M酢酸ナトリウムと
し、λDNA溶液を調製した。冷エタノール2容量を加
えてDNAを沈澱させ、〜20℃で一晩保存した。遠心
分離(15,00Orpm、15分間、5orvall
管)してDNAを採取し、70%エタノールで1回洗浄
し、風乾した。このDNAベレットを終濃度〜400μ
g/肩θでTE500μQに再懸濁した。
C,シャロン4EcoRIアームの調製シャロン4の左
および右の両アームを得るために、シャロン4DNA
(100μg)250tt(!、10XEcoRI緩衝
液(]0000mMリスHCQ pH7,5,500m
M NaCQおよび5000 rpm、5°C115時
間)に付し、UV光でバンドを視覚化し、4つの観察で
きるバンドを注射器で抜き取った。臭化エチジウムをn
−ブタノールで抽出し、得られたDNAをアガロースゲ
ル電気泳動(AGE)によって調査した。シャロン4の
左および右のアームである2つのバンドを等モルで混合
し、半分で希釈し、エタノール2容量を加えて沈澱させ
、−20°Cで一晩保存した。沈澱したDNAをHB4
0−ターで遠心(Sorvall管、12、00 Or
pm、30分)して採取し、次いでシャロン4アームD
NAをTEに再懸濁して終濃度0゜174μg/μりと
した。
および右の両アームを得るために、シャロン4DNA
(100μg)250tt(!、10XEcoRI緩衝
液(]0000mMリスHCQ pH7,5,500m
M NaCQおよび5000 rpm、5°C115時
間)に付し、UV光でバンドを視覚化し、4つの観察で
きるバンドを注射器で抜き取った。臭化エチジウムをn
−ブタノールで抽出し、得られたDNAをアガロースゲ
ル電気泳動(AGE)によって調査した。シャロン4の
左および右のアームである2つのバンドを等モルで混合
し、半分で希釈し、エタノール2容量を加えて沈澱させ
、−20°Cで一晩保存した。沈澱したDNAをHB4
0−ターで遠心(Sorvall管、12、00 Or
pm、30分)して採取し、次いでシャロン4アームD
NAをTEに再懸濁して終濃度0゜174μg/μりと
した。
実施例3
実施例1と実質的に同様に、ストレプトマイセス・フラ
ジアエの培養物をその条件下で増殖させ、DNAを調製
した。
ジアエの培養物をその条件下で増殖させ、DNAを調製
した。
mM MgCQ、’) 3011 Qll Jig /
杼ウシ血清アルブミン(USA)30μσ、および蒸
留水10μQをEcoRI酵素[New Englan
d Biolabs、 Inc、、 32Tozer
Road、 1leverly、 MA 01915]
] Q μQ(l Q O単位)によって37℃で
2時間消化した。さらにEcoRI酵素10μρを追加
し、もう1時間イン牛ユベー1−した。温度を70°C
に10分間上昇させて反応を停止させた。等量の緩衝液
飽和フェノールを混合し、微小管内の遠心によって層を
分離した。前述の実施例に記載のように、水層を取り出
し、エーテルで2回抽出した。
杼ウシ血清アルブミン(USA)30μσ、および蒸
留水10μQをEcoRI酵素[New Englan
d Biolabs、 Inc、、 32Tozer
Road、 1leverly、 MA 01915]
] Q μQ(l Q O単位)によって37℃で
2時間消化した。さらにEcoRI酵素10μρを追加
し、もう1時間イン牛ユベー1−した。温度を70°C
に10分間上昇させて反応を停止させた。等量の緩衝液
飽和フェノールを混合し、微小管内の遠心によって層を
分離した。前述の実施例に記載のように、水層を取り出
し、エーテルで2回抽出した。
得られたDNA懸濁液を半分に分け、マニアチス(Ma
niaLis)らのモレキュラー・クローニング(Mo
1ecular Cloning、Co1d Spri
ng l1arbor Laborat。
niaLis)らのモレキュラー・クローニング(Mo
1ecular Cloning、Co1d Spri
ng l1arbor Laborat。
ry、Co1d Spring l1arbor、ニュ
ーヨーク、 +982)の記載に実質的に従い、2μg
/μQ臭化エチジウムを入れた+ 0−40%(w/い
ショ糖勾配(1MNaCQ、20mM )リス−HC
CpH8,O1および5mMEDTA中)を加えた2つ
の5W40管に加えた。ベックマンSW40ローター(
25,0臭化エチジウムを除き、かつ10%W/Vおよ
び/IO%w/vショ糖溶液の代わりにそれぞれ5%W
/Vおよび20%w/vショ糖溶液を使用する以外は、
実施例2Cに実質的に従って調製した5−20%W/V
ショ糖勾配を入れた4つの5W40ベックマンポリアロ
マ−管の上部に、上記Aで得られたDNAQ濁液約]、
、5xf2を重層した。これらの勾配は、ベックマン超
遠心機中のベックマン5W40を使用した30.OOO
rpm、17時間に付した。
ーヨーク、 +982)の記載に実質的に従い、2μg
/μQ臭化エチジウムを入れた+ 0−40%(w/い
ショ糖勾配(1MNaCQ、20mM )リス−HC
CpH8,O1および5mMEDTA中)を加えた2つ
の5W40管に加えた。ベックマンSW40ローター(
25,0臭化エチジウムを除き、かつ10%W/Vおよ
び/IO%w/vショ糖溶液の代わりにそれぞれ5%W
/Vおよび20%w/vショ糖溶液を使用する以外は、
実施例2Cに実質的に従って調製した5−20%W/V
ショ糖勾配を入れた4つの5W40ベックマンポリアロ
マ−管の上部に、上記Aで得られたDNAQ濁液約]、
、5xf2を重層した。これらの勾配は、ベックマン超
遠心機中のベックマン5W40を使用した30.OOO
rpm、17時間に付した。
6管の底に穴をあけ、滴を捕集し、各々の管からフラク
シヨン1.5Jlρを採取した。これらのフラクション
をAGE (アガロースゲル電気泳動)によって調査し
、高分子慣フラクンヨン(> 50 kb)を集め、常
法によって沈澱させた。得られたDNA沈澱物をTE5
00μgに再懸濁し、終濃度14μg / tt f!
とした。
シヨン1.5Jlρを採取した。これらのフラクション
をAGE (アガロースゲル電気泳動)によって調査し
、高分子慣フラクンヨン(> 50 kb)を集め、常
法によって沈澱させた。得られたDNA沈澱物をTE5
00μgに再懸濁し、終濃度14μg / tt f!
とした。
C,ストレプトマイセス・フラジアエ挿入体り凡人の調
製 前の実施例で得られたDNA約0.5jl12に3M酢
酸すトリウムを加え、O、、3M酢酸ナトリウムに調節
し、冷エタノール2容■によって沈澱させ、−20°C
で一晩保存した。得られた沈澱物を遠心によって採取し
、エタノールで洗浄し、終濃度0.46μg/μσでT
EI、(3mgに再懸濁し、4°Cで16時間保存した
。Haelll制限酵素てDNAを消化するため、3つ
の反応物を用意し、そしてAlul制限酵素でDNAを
消化するため、3つの反応物を用意した。
製 前の実施例で得られたDNA約0.5jl12に3M酢
酸すトリウムを加え、O、、3M酢酸ナトリウムに調節
し、冷エタノール2容■によって沈澱させ、−20°C
で一晩保存した。得られた沈澱物を遠心によって採取し
、エタノールで洗浄し、終濃度0.46μg/μσでT
EI、(3mgに再懸濁し、4°Cで16時間保存した
。Haelll制限酵素てDNAを消化するため、3つ
の反応物を用意し、そしてAlul制限酵素でDNAを
消化するため、3つの反応物を用意した。
上、 HaeI[I制限酵素消化
1XHaenl緩衝液中に、懸濁したDNA約5401
1(1,I OX Haelll緩衝液(500mMN
aCQ、60mM MgC(!t、60mM β−メル
カプトエタノール)250μQ、水1700μQ、およ
びHaem酵素(7単位/μσ、BRL)1/10希釈
液8.9μρを含有させ、Haell1反応混合物を用
意した。この単一のHaell1反応混合物から、各々
〜800μQを含有する3つの反応物を調製し、37℃
で20分間、40分間、および60分間インキュベート
し、次いで水上に放置した。AGEによって消化の程度
をモニターした。反応物の各3つの反応を行った。次い
で、これらの反応物を採取し、沈澱させた。
1(1,I OX Haelll緩衝液(500mMN
aCQ、60mM MgC(!t、60mM β−メル
カプトエタノール)250μQ、水1700μQ、およ
びHaem酵素(7単位/μσ、BRL)1/10希釈
液8.9μρを含有させ、Haell1反応混合物を用
意した。この単一のHaell1反応混合物から、各々
〜800μQを含有する3つの反応物を調製し、37℃
で20分間、40分間、および60分間インキュベート
し、次いで水上に放置した。AGEによって消化の程度
をモニターした。反応物の各3つの反応を行った。次い
で、これらの反応物を採取し、沈澱させた。
2つのDNA消化物をHB40−ターの遠心(12、O
OOrpm、12分間)によって別々ニ捕集した。得ら
れた沈澱物を70%エタノールで1回洗浄した。最後に
、この沈澱物をTE200μaに別々に再懸濁した。懸
濁液を採取し、TEを加えて最終審11600μρとし
た。この採取したDNA約200 tt(lをそれぞれ
、3つの5−20%W/Vショ糖勾配置311に加えた
。これら3つの勾配液を5M40ベツクマンローター中
、30,00Q rpm、5℃に17時間かけた。勾配
管の底に穴をあけ、滴を捕集して各管毎に各々〜0.4
畦含有する約30個のフラクションを捕集した。各フラ
クションをAGEで分析し、1O−25kbの大きさの
DNAに対応するフラクションを採取し、常法によって
沈澱させた。得られた沈澱物をTE800μQに再懸濁
して濃度0.065μg/μaとした。
OOrpm、12分間)によって別々ニ捕集した。得ら
れた沈澱物を70%エタノールで1回洗浄した。最後に
、この沈澱物をTE200μaに別々に再懸濁した。懸
濁液を採取し、TEを加えて最終審11600μρとし
た。この採取したDNA約200 tt(lをそれぞれ
、3つの5−20%W/Vショ糖勾配置311に加えた
。これら3つの勾配液を5M40ベツクマンローター中
、30,00Q rpm、5℃に17時間かけた。勾配
管の底に穴をあけ、滴を捕集して各管毎に各々〜0.4
畦含有する約30個のフラクションを捕集した。各フラ
クションをAGEで分析し、1O−25kbの大きさの
DNAに対応するフラクションを採取し、常法によって
沈澱させた。得られた沈澱物をTE800μQに再懸濁
して濃度0.065μg/μaとした。
3、ストレプトマイセス・フラジアよりNAの々に、I
−1l−1a制限酵素の1/10希釈液2μρを加え、
37°Cのインキュベートを30分間続けた。
−1l−1a制限酵素の1/10希釈液2μρを加え、
37°Cのインキュベートを30分間続けた。
得られた反応物を再び氷上に置き、八〇Eによって消化
程度をモニターした。この酵素2μaの添加を繰り返し
、最終的な消化の程度をAGEで確認した。3つの反応
物を一緒にし、3M酢酸すトリウムを添加して0.3M
酢酸ナトリウムとし、エタノール2容量で洗浄し、−2
0°Cで一晩放置することで沈澱させた。
程度をモニターした。この酵素2μaの添加を繰り返し
、最終的な消化の程度をAGEで確認した。3つの反応
物を一緒にし、3M酢酸すトリウムを添加して0.3M
酢酸ナトリウムとし、エタノール2容量で洗浄し、−2
0°Cで一晩放置することで沈澱させた。
2、Alul制限酵素消化
Haelff反応酵素および緩衝液の代わりに、Alu
l(61’位/μρBRL)の1/10希釈液10μρ
、蒸留水〜1700μρ、および]QXA]ul緩衝液
(500mM トリス−HCQ pH8,0,50m
M MgC(lx、500mM NaCQ、および10
mM ジチオ1・レイト−ル)を使用する以外は、Ha
elIl消化の操作法と同一の操作法を使用してAIu
l消化を行った。AluJ酵素とのインキュベート期間
を1回だけ付加的に設けることが必要である以外は、H
ael消化の反応操作に実質的に従い、メチル化 5XEcoRIメチラーゼ緩衝液(500mMトリス−
HCo、pH8,0,12,5mM ジチオトレイト−
ル、25mM EDTA、2yg/xQ B5A1およ
び5.5μMS−アデノシルーメチオニン)約200μ
e1およびEcoRIメチラーゼ(10単位/μg、B
RL)10μeを、上記のようにして調製したDNA−
800μQに加え、次いで37°Cで2時間インキュベ
ートした。このDNAを緩衝液飽和フェノールで2回抽
出し、得られたフェノール層をTEで再度抽出した。得
られた水層を採取し、エーテルで2回抽出し、次いで酢
酸すトリウム、次ぎに2容量のエタノールを用いて沈澱
させ、−20’Cで2時間インキュベートした。沈澱物
を遠心(12,OOOrpm、15分間)によって集め
、得られたDNAを70%エタノールで1回洗浄し、風
乾した後、TE75μσに再懸濁した。これは、メチル
化されたAlul −Hae■部分消化S、フラジアよ
りNA約44μgを含有していた。
l(61’位/μρBRL)の1/10希釈液10μρ
、蒸留水〜1700μρ、および]QXA]ul緩衝液
(500mM トリス−HCQ pH8,0,50m
M MgC(lx、500mM NaCQ、および10
mM ジチオ1・レイト−ル)を使用する以外は、Ha
elIl消化の操作法と同一の操作法を使用してAIu
l消化を行った。AluJ酵素とのインキュベート期間
を1回だけ付加的に設けることが必要である以外は、H
ael消化の反応操作に実質的に従い、メチル化 5XEcoRIメチラーゼ緩衝液(500mMトリス−
HCo、pH8,0,12,5mM ジチオトレイト−
ル、25mM EDTA、2yg/xQ B5A1およ
び5.5μMS−アデノシルーメチオニン)約200μ
e1およびEcoRIメチラーゼ(10単位/μg、B
RL)10μeを、上記のようにして調製したDNA−
800μQに加え、次いで37°Cで2時間インキュベ
ートした。このDNAを緩衝液飽和フェノールで2回抽
出し、得られたフェノール層をTEで再度抽出した。得
られた水層を採取し、エーテルで2回抽出し、次いで酢
酸すトリウム、次ぎに2容量のエタノールを用いて沈澱
させ、−20’Cで2時間インキュベートした。沈澱物
を遠心(12,OOOrpm、15分間)によって集め
、得られたDNAを70%エタノールで1回洗浄し、風
乾した後、TE75μσに再懸濁した。これは、メチル
化されたAlul −Hae■部分消化S、フラジアよ
りNA約44μgを含有していた。
46 リンカ−付加
TE中、100μg/屑qのEcoRIリンカ−(pG
G AΔTTCC,コラボレイティブ・リサーチ
I nc、(Col 1aborative Re
5earch、Inc、、 128スプリング・スト
リート、レキシングトン、MA02173)から入手)
約40μQを65°Cで3分間インキュベートした後、
氷」二で冷却した。
G AΔTTCC,コラボレイティブ・リサーチ
I nc、(Col 1aborative Re
5earch、Inc、、 128スプリング・スト
リート、レキシングトン、MA02173)から入手)
約40μQを65°Cで3分間インキュベートした後、
氷」二で冷却した。
メチル化したストレプトマイセス・フラジアよりNA約
2μg、 リンカ−DNA40μt! 、5Xリガー
ゼ/キナーゼ緩衝液(250mM トリスHCQ p
H7,8,25%グリセロール、25mMジチオトレイ
トール、および50mM MgCρ、)40μρ、0.
66M AT P40itQ 、およびT4 DNA
リガーゼ(1単位/μρ、ベーリンガー・マンハイム・
バイオケミカルズ(Boehringcr−Man口h
eim Biochemicals)) 12 tt
Qを含有するライゲート反応物を室温で12時間インキ
ュベー1・した。
2μg、 リンカ−DNA40μt! 、5Xリガー
ゼ/キナーゼ緩衝液(250mM トリスHCQ p
H7,8,25%グリセロール、25mMジチオトレイ
トール、および50mM MgCρ、)40μρ、0.
66M AT P40itQ 、およびT4 DNA
リガーゼ(1単位/μρ、ベーリンガー・マンハイム・
バイオケミカルズ(Boehringcr−Man口h
eim Biochemicals)) 12 tt
Qを含有するライゲート反応物を室温で12時間インキ
ュベー1・した。
5分間温度を65°Cに上昇させ、この反応を停止させ
、次いで4°Cで一晩保存した。保存したライゲート反
応物約+90μQを10XEcoRI緩酵素(1O単位
/μσ、BRL)20μ夕と混合し、37°Cで5時間
インキュベートした。0.25MEDT八(pt+8.
0)20μQを添加した後、温度を65°Cに5分間上
昇させて反応を停止させ、次いで水」二で冷却した。こ
の反応物を5−30%w/vショ糖勾配に重層し、SW
40ローターに付した(18時間、30.OOOrpm
、5°C)。管の底に穴をあけ、5滴のフラクションを
36個採取した。これらフラクションをAGEによって
調査し、1O−19kbの大きさのフラクションを集め
、酢酸ナトリウムおよびエタノールで沈澱させ、20’
Cで一晩保存した。5orvall HB4 ローター
(12,OOOrpm、15分間)で遠心して沈澱した
DNAを採取し、70%エタノールで1回洗浄して風乾
し、T E 4.00μQに再懸濁した。この懸濁液は
、濃度0.022μg/μσで、Ec。
、次いで4°Cで一晩保存した。保存したライゲート反
応物約+90μQを10XEcoRI緩酵素(1O単位
/μσ、BRL)20μ夕と混合し、37°Cで5時間
インキュベートした。0.25MEDT八(pt+8.
0)20μQを添加した後、温度を65°Cに5分間上
昇させて反応を停止させ、次いで水」二で冷却した。こ
の反応物を5−30%w/vショ糖勾配に重層し、SW
40ローターに付した(18時間、30.OOOrpm
、5°C)。管の底に穴をあけ、5滴のフラクションを
36個採取した。これらフラクションをAGEによって
調査し、1O−19kbの大きさのフラクションを集め
、酢酸ナトリウムおよびエタノールで沈澱させ、20’
Cで一晩保存した。5orvall HB4 ローター
(12,OOOrpm、15分間)で遠心して沈澱した
DNAを採取し、70%エタノールで1回洗浄して風乾
し、T E 4.00μQに再懸濁した。この懸濁液は
、濃度0.022μg/μσで、Ec。
RI結合S、フラジアよりNAを含有していた。
39〜
火旌圓A
ファージライブラリーの生産
実施例3(C)で調製したストレプトマイセス・フラジ
アよりNA約2μgを、実施1’Al2CでJ+u2し
たシャロン4アーム17.2μ(lc〜3μg)と混合
し、次いで3M酢酸ナトリウム(終濃度03M酢酸ナト
リウム)および2容量のエタノールを加えてDNAを沈
澱させた。この混合物を70℃で15分間インキュベー
トした。ブリンクマン(B rinkman)微小管中
で10分間遠心してDNAベレットを捕集し、70%エ
タノールで洗浄して風乾した。次いで、得られたペレッ
トを以下のライゲート反応混合物16μeに再懸濁した
;ライゲート反応混合物−5xキナ一ゼ/リガーゼ緩衝
液4μg、0.66M ATP (pH7,4)4μQ
1蒸留水11μg、およびT4 DNAリガーゼ1μ
C0このライゲート反応物を9°Cで72時間インキュ
ベートした。
アよりNA約2μgを、実施1’Al2CでJ+u2し
たシャロン4アーム17.2μ(lc〜3μg)と混合
し、次いで3M酢酸ナトリウム(終濃度03M酢酸ナト
リウム)および2容量のエタノールを加えてDNAを沈
澱させた。この混合物を70℃で15分間インキュベー
トした。ブリンクマン(B rinkman)微小管中
で10分間遠心してDNAベレットを捕集し、70%エ
タノールで洗浄して風乾した。次いで、得られたペレッ
トを以下のライゲート反応混合物16μeに再懸濁した
;ライゲート反応混合物−5xキナ一ゼ/リガーゼ緩衝
液4μg、0.66M ATP (pH7,4)4μQ
1蒸留水11μg、およびT4 DNAリガーゼ1μ
C0このライゲート反応物を9°Cで72時間インキュ
ベートした。
ベセスダ・リサーチ・ラボラトリ−・パッケージング抄
本(Bethesda Re5earch Labor
atory packaging extract)を
使用し、その手引書に実質的に従い、」1記のライゲー
ト物を常法によりパッケージングした。バイオチック・
パッケージングキットなどの他の同様のインビトロパッ
ケージングミックスも本発明に使用するために入手可能
である。
本(Bethesda Re5earch Labor
atory packaging extract)を
使用し、その手引書に実質的に従い、」1記のライゲー
ト物を常法によりパッケージングした。バイオチック・
パッケージングキットなどの他の同様のインビトロパッ
ケージングミックスも本発明に使用するために入手可能
である。
このパッケージング混合物をCsCI2ブロック勾配」
二に重層し、5W50ベツクマンローターにかけた(2
時間、30. OOOrpm、 5°C)。塩化セシウ
ム勾配は、CsCσ0.5xρ当たりの密度を1.7.
1.5および1.3にする以外は、マニアチス(198
2)らの教示に従って調製した。管の底に穴をあけ、1
0滴のフラクションを捕集し、それぞれ13RL ミニ
透析ユニットでラムダ緩衝液に対して透析した。E、c
oli K12 C6C600Rxの代わりに、E、
coli K12 294 (ATCC314/16
)のTMM中、37℃、1624時間培養物10酎を使
用し、実施例2Aに記載のようにフラクションの力価を
測定し、組換え体に関して調査した。10mM Mg5
O,および40μg/iσ5−ブロモー4−クロロ−3
−インドリル−β−D−ガラクトンダーゼを加えたT′
fi!天平板(X−ガル、BRLから入手)上に現れる
非−青色プラークの発現性によって、組換え体の同定を
行った。種々のフラクンヨンを採取し、組換えファージ
のライブラリーを得た。各平板上に少なくとも4,00
0個の組換えプラークがあるE、coli K12 2
94のライブラリーの平板溶解物を調製することで、第
1次細胞溶解物の増幅を行った。これらの平板溶解物か
ら、実施例2の教示に従い、大規模に、ファージ溶解お
よびDNA調製を行った。得られたDNAを濃度0.2
3μg / tt (lでTEI肩Qに再懸濁した。
二に重層し、5W50ベツクマンローターにかけた(2
時間、30. OOOrpm、 5°C)。塩化セシウ
ム勾配は、CsCσ0.5xρ当たりの密度を1.7.
1.5および1.3にする以外は、マニアチス(198
2)らの教示に従って調製した。管の底に穴をあけ、1
0滴のフラクションを捕集し、それぞれ13RL ミニ
透析ユニットでラムダ緩衝液に対して透析した。E、c
oli K12 C6C600Rxの代わりに、E、
coli K12 294 (ATCC314/16
)のTMM中、37℃、1624時間培養物10酎を使
用し、実施例2Aに記載のようにフラクションの力価を
測定し、組換え体に関して調査した。10mM Mg5
O,および40μg/iσ5−ブロモー4−クロロ−3
−インドリル−β−D−ガラクトンダーゼを加えたT′
fi!天平板(X−ガル、BRLから入手)上に現れる
非−青色プラークの発現性によって、組換え体の同定を
行った。種々のフラクンヨンを採取し、組換えファージ
のライブラリーを得た。各平板上に少なくとも4,00
0個の組換えプラークがあるE、coli K12 2
94のライブラリーの平板溶解物を調製することで、第
1次細胞溶解物の増幅を行った。これらの平板溶解物か
ら、実施例2の教示に従い、大規模に、ファージ溶解お
よびDNA調製を行った。得られたDNAを濃度0.2
3μg / tt (lでTEI肩Qに再懸濁した。
実施例5
増幅したファージ細胞溶解物を、実施例2Aに記載のよ
うにE、coli K12 29/Iににプレートし、
平板毎に約5,000プラークとした総量約20,00
0プラークを得た。ベントンら[Ben=43 用し、ホスホトリエステル法によってオリゴヌクレオチ
ドを調製する。このシステムは自動であるので、ユーザ
ーは所望のDNA配列を決定するだけでよく、次いでそ
の装置の取り扱い説明書に従う。得られたオリゴヌクレ
オチドは、15%アクリルアミドおよび7.0M尿素の
ゲル電気泳動法によって精製する。合成されるオリゴヌ
クレオチドは末端が[γ−32P]ΔTPで標識されて
おり、ポリヌクレオチドキナーゼで処理されている[こ
れは、マニアチス、フリチノシュ、およびサンプルツク
のモレキュラー・クローニンク:研究マニュアル(コー
ルド・スプリング・ハーバ−・ラボラトリ−、コールド
・スプリング・ハーバ−1N。
うにE、coli K12 29/Iににプレートし、
平板毎に約5,000プラークとした総量約20,00
0プラークを得た。ベントンら[Ben=43 用し、ホスホトリエステル法によってオリゴヌクレオチ
ドを調製する。このシステムは自動であるので、ユーザ
ーは所望のDNA配列を決定するだけでよく、次いでそ
の装置の取り扱い説明書に従う。得られたオリゴヌクレ
オチドは、15%アクリルアミドおよび7.0M尿素の
ゲル電気泳動法によって精製する。合成されるオリゴヌ
クレオチドは末端が[γ−32P]ΔTPで標識されて
おり、ポリヌクレオチドキナーゼで処理されている[こ
れは、マニアチス、フリチノシュ、およびサンプルツク
のモレキュラー・クローニンク:研究マニュアル(コー
ルド・スプリング・ハーバ−・ラボラトリ−、コールド
・スプリング・ハーバ−1N。
Y、、19g2)に記載されている]。モレキュラー・
クローニング・マニュアル(324−321)に詳細に
記載されているように、得られた放射活性プローブを」
1記のフィルターとハイブリダイズした。
クローニング・マニュアル(324−321)に詳細に
記載されているように、得られた放射活性プローブを」
1記のフィルターとハイブリダイズした。
実施例2Δに記載のように、このプローブとハイブリダ
イズするプラーク内のファージを高い力ton and
Davis、サイエンス(Science)、 19
6:180(1977)]に記載の方法(これは、モレ
キュラー・クローニング(マニアチス、フリチノシュ、
サンプルツク)、コールド・スプリング・ハーバ−・ラ
ボラトリ−132C1−32]頁の研究マニュアルに詳
細に記載されている)によって、これらのプラークを二
l・ロセルロースフィルターに移シた。
イズするプラーク内のファージを高い力ton and
Davis、サイエンス(Science)、 19
6:180(1977)]に記載の方法(これは、モレ
キュラー・クローニング(マニアチス、フリチノシュ、
サンプルツク)、コールド・スプリング・ハーバ−・ラ
ボラトリ−132C1−32]頁の研究マニュアルに詳
細に記載されている)によって、これらのプラークを二
l・ロセルロースフィルターに移シた。
ライブラリー内のtylF遺伝子を検出するため、ty
lF遺伝子産物、MOMTの最初の36個のアミノ酸を
コードしている遺伝子の既知のDNA配列部分[フィソ
ンユマン(Fishman)らのプロシーディング・オ
ブ・す/ヨナル・アカデミ−・オブ・サイエンスU S
A (Proc、 Natl、 Acad、 Sci
、 USA)、 84 :8248、1987]に基づ
いて放射活性オリゴヌクレオチドプローブを構築した。
lF遺伝子産物、MOMTの最初の36個のアミノ酸を
コードしている遺伝子の既知のDNA配列部分[フィソ
ンユマン(Fishman)らのプロシーディング・オ
ブ・す/ヨナル・アカデミ−・オブ・サイエンスU S
A (Proc、 Natl、 Acad、 Sci
、 USA)、 84 :8248、1987]に基づ
いて放射活性オリゴヌクレオチドプローブを構築した。
このDNAプローブ(最善の結果を得るためには、長さ
が少なくとも44個ヌクレオチド長あるべきである)を
作成する方法は、当業界周知である。簡単に言えば、S
AMI自動1) N A 音成機[バイオサーチ(Bi
osearch)、サン・ラフアール、CA]または同
様の装置を使価にまで増殖させ、実施例2Bに記載のよ
うにファージDNAを調製した。
が少なくとも44個ヌクレオチド長あるべきである)を
作成する方法は、当業界周知である。簡単に言えば、S
AMI自動1) N A 音成機[バイオサーチ(Bi
osearch)、サン・ラフアール、CA]または同
様の装置を使価にまで増殖させ、実施例2Bに記載のよ
うにファージDNAを調製した。
実施例6
鼾巨
通常の微生物学的手法に従って、E、coli K 1
2 C600RK M K−/ p HJ L 210
(N RRLB−15824)の単一の細菌コロニー
を、水溶11121リットル当たり25μg/+lIf
!のアンピシリンを含有するバクト(Bacto) l
−リプトン10g、バクト酵母エキス5g、およびNa
Cf!10g(p+−17,5)を含有するLB培地に
接種した。
2 C600RK M K−/ p HJ L 210
(N RRLB−15824)の単一の細菌コロニー
を、水溶11121リットル当たり25μg/+lIf
!のアンピシリンを含有するバクト(Bacto) l
−リプトン10g、バクト酵母エキス5g、およびNa
Cf!10g(p+−17,5)を含有するLB培地に
接種した。
この培養物を37℃で] 6−2 /1時ff、’5イ
ンキュベートシた。翌朝、l mM M g S O4
,0,2%グルコース、0.3−0.4%CAΔ(カザ
ミノ酸、デイ7 ’:j (1)ifco乃、2 tt
g/*Q B 1 (チア ミラ−HCQ、シグマ)
、および添加物を加えたM9培地(ミラーら、1979
、分子遺伝学の実験(Iixper imenis i
n Mo1ecular Genetics)、コール
ド・スブリング・バーバー・ラボラトリ−、コールド・
スプリング・ハーバ−ニューヨーク)50011ρに」
1記培養物5RQを接種した。(gられた培養物を激し
く振盪させなから37°Cて16〜2/1時間インキュ
ベートシ、その培養物の試料を希釈度1/10から11
50で」1記の添加M9培地に接種し、激しく振盪させ
ながら37℃で2時間半から3時間インキュベートした
。その培養物の濁度をブルーフイルターで測定すると、
約30C)−400KlettUi位であった。クロラ
ムフェニコール(150−175μg/xのを培養物に
加え、激しく撹拌しながら16−24時間インキュベー
トを続けた。
ンキュベートシた。翌朝、l mM M g S O4
,0,2%グルコース、0.3−0.4%CAΔ(カザ
ミノ酸、デイ7 ’:j (1)ifco乃、2 tt
g/*Q B 1 (チア ミラ−HCQ、シグマ)
、および添加物を加えたM9培地(ミラーら、1979
、分子遺伝学の実験(Iixper imenis i
n Mo1ecular Genetics)、コール
ド・スブリング・バーバー・ラボラトリ−、コールド・
スプリング・ハーバ−ニューヨーク)50011ρに」
1記培養物5RQを接種した。(gられた培養物を激し
く振盪させなから37°Cて16〜2/1時間インキュ
ベートシ、その培養物の試料を希釈度1/10から11
50で」1記の添加M9培地に接種し、激しく振盪させ
ながら37℃で2時間半から3時間インキュベートした
。その培養物の濁度をブルーフイルターで測定すると、
約30C)−400KlettUi位であった。クロラ
ムフェニコール(150−175μg/xのを培養物に
加え、激しく撹拌しながら16−24時間インキュベー
トを続けた。
遠心(7500rpm、5分間、4°C)によって細菌
細胞を収穫し、次いでS V(0,15M NaCQ、
O,IM NaEDTA、p H8,0)200xQで
2回洗浄した。得られたペレットを10d/g湿潤重量
のTS溶液(25%ショ糖、50mM トリス、p H
8)に再懸濁し、氷上に置いた。この懸濁物に、リゾチ
ーム溶液(50mM)リス−I]C0,pH7,8中、
5ttg/RQ ) 2yQ/g湿潤重量を加え、氷」
1に5分間放置して冷却した。次いで、0.25 M
E D T A (+) H8、O) 4好/g湿潤重
h1を加え、さらに5分間冷却した。細胞溶解溶液(0
,4%デオキンコール酸塩、1%B rij58.50
mM1・リスおよび0.0625M EDTA、pH8
)]6好/g湿潤重量を添加し、混合物を37°Cで1
5−30分間インキュベートした。S orvalls
S 340−ターの遠心(21゜000 rpm、+
5−30分間、4°C)によって細胞残骸(dcbri
s)を除去した。」1清を採取し、3M酢酸すトリウム
(pH8)0.1容量およびイソプロピルアルコール0
.64容量をその上清に加えた。得られた溶液を遠心(
10,OOOrpm、10分間、4°C) L、得られ
たペレットをTE (]QmMMトリス、]mM ED
TA pH8)1112に再懸濁した。常法に従い、
塩化セシウム(CsCのを使用した、プロピジウム・ニ
ョウ化物(propidium diiodide)を
含有する平衡密度勾配遠心法によって、プラスミドDN
Aを精製した。
細胞を収穫し、次いでS V(0,15M NaCQ、
O,IM NaEDTA、p H8,0)200xQで
2回洗浄した。得られたペレットを10d/g湿潤重量
のTS溶液(25%ショ糖、50mM トリス、p H
8)に再懸濁し、氷上に置いた。この懸濁物に、リゾチ
ーム溶液(50mM)リス−I]C0,pH7,8中、
5ttg/RQ ) 2yQ/g湿潤重量を加え、氷」
1に5分間放置して冷却した。次いで、0.25 M
E D T A (+) H8、O) 4好/g湿潤重
h1を加え、さらに5分間冷却した。細胞溶解溶液(0
,4%デオキンコール酸塩、1%B rij58.50
mM1・リスおよび0.0625M EDTA、pH8
)]6好/g湿潤重量を添加し、混合物を37°Cで1
5−30分間インキュベートした。S orvalls
S 340−ターの遠心(21゜000 rpm、+
5−30分間、4°C)によって細胞残骸(dcbri
s)を除去した。」1清を採取し、3M酢酸すトリウム
(pH8)0.1容量およびイソプロピルアルコール0
.64容量をその上清に加えた。得られた溶液を遠心(
10,OOOrpm、10分間、4°C) L、得られ
たペレットをTE (]QmMMトリス、]mM ED
TA pH8)1112に再懸濁した。常法に従い、
塩化セシウム(CsCのを使用した、プロピジウム・ニ
ョウ化物(propidium diiodide)を
含有する平衡密度勾配遠心法によって、プラスミドDN
Aを精製した。
実施例7
プラスミドpl−IJL210(実施例6で調製)約1
0μQ(〜11μg)を、10XEcoR[緩衝液5μ
C,B5A3μQ1蒸留水25μg、およびEcoRI
制限酵素(10単位/μρ、NEB)5μQに加え、3
7°Cで2時間イン牛ユベートシた。温度を70℃に1
0分間上昇させて反応を停止させた。3M酢酸ナトリウ
ム(pH8,0)6μgおよび冷エタノール120μQ
を加えてDNAを沈澱させた。−70’Cで15分間イ
ンキュベートした後、ブリンクマン(Brinkman
)微小管中で10分間遠心してDNAを採取した。得ら
れたDNAペレットを70%エタノールで1回洗浄し、
風乾した後、蒸留水80μaに再懸濁した。この懸濁液
に5XCIAP緩衝液(500mM)リスHCQ pH
7,5,250mM NaCQおよび5QmMM)(C
ρ、)を加えた。DNAを脱リン酸化するため、製造ス
ペックに従い、ウシ腸内アルカリホスファターゼ(■級
)[4単位/μg、ベーリンガー・マンハイム]の1/
10希釈液3μQを加え、得られた反応物をまず37°
Cで30分間、次いで70°Cでさらに30分間インキ
ュベートした。
0μQ(〜11μg)を、10XEcoR[緩衝液5μ
C,B5A3μQ1蒸留水25μg、およびEcoRI
制限酵素(10単位/μρ、NEB)5μQに加え、3
7°Cで2時間イン牛ユベートシた。温度を70℃に1
0分間上昇させて反応を停止させた。3M酢酸ナトリウ
ム(pH8,0)6μgおよび冷エタノール120μQ
を加えてDNAを沈澱させた。−70’Cで15分間イ
ンキュベートした後、ブリンクマン(Brinkman
)微小管中で10分間遠心してDNAを採取した。得ら
れたDNAペレットを70%エタノールで1回洗浄し、
風乾した後、蒸留水80μaに再懸濁した。この懸濁液
に5XCIAP緩衝液(500mM)リスHCQ pH
7,5,250mM NaCQおよび5QmMM)(C
ρ、)を加えた。DNAを脱リン酸化するため、製造ス
ペックに従い、ウシ腸内アルカリホスファターゼ(■級
)[4単位/μg、ベーリンガー・マンハイム]の1/
10希釈液3μQを加え、得られた反応物をまず37°
Cで30分間、次いで70°Cでさらに30分間インキ
ュベートした。
B、ストレプトマイセス・フラジアよりNA挿入体の副
刃 各バタテリオファージ(実施例2で調製)から得たDN
A I 0tt(! (〜2μg)を、l0XEc。
刃 各バタテリオファージ(実施例2で調製)から得たDN
A I 0tt(! (〜2μg)を、l0XEc。
R1緩衝液2μQ、B5A2μρ、水5μCおよびEc
oR1酵素(10単位/μQ、NEB)と共に37°C
で3時間インキュベートした。温度を70°Cに10分
間」1昇させて反応を停止させた。
oR1酵素(10単位/μQ、NEB)と共に37°C
で3時間インキュベートした。温度を70°Cに10分
間」1昇させて反応を停止させた。
C,ライゲーション
脱リン酸化し、EcoRI消化したpHJL210 D
NΔ約10μρをEcoRI消化バタ消化バクテリオ
ファージDNA20μC得られた混合物に、3M酢酸ナ
トリウム3μgおよび冷100%工タノール82μQを
加えて沈澱させた。ドライアイス上で一70℃に冷却し
て10分間インキュベートした後、遠心して沈澱物を捕
集し、70%エタノールで1回洗浄し、風乾した。得ら
れたベレットを蒸留水23μσに再%濁し、この溶液に
、066M ATP8μσ、5Xキナ一ゼ/ワガーゼ緩
衝液8μgおよびリガーゼ(ベーリンガー・マンハイム
)Iμeを加え、得られたライゲーンヨン液を15℃で
20時間インキュベートした。蒸留水〜48μC15X
キナーゼ/リガーゼ緩衝液16μQ、0.66M AT
P 16μりおよびリガーゼ1μCを添加することによ
って、このライゲーンヨン液を希釈し、環状化を促進さ
せた。得られた溶液を15°Cで72時間イン牛ユベー
トシ、次いで温度を10分間70℃に上昇させて反応を
停止させた。容管に3M酢酸すトリウム12μQおよび
冷エタノール300μσを加えてDNAを沈澱させた。
NΔ約10μρをEcoRI消化バタ消化バクテリオ
ファージDNA20μC得られた混合物に、3M酢酸ナ
トリウム3μgおよび冷100%工タノール82μQを
加えて沈澱させた。ドライアイス上で一70℃に冷却し
て10分間インキュベートした後、遠心して沈澱物を捕
集し、70%エタノールで1回洗浄し、風乾した。得ら
れたベレットを蒸留水23μσに再%濁し、この溶液に
、066M ATP8μσ、5Xキナ一ゼ/ワガーゼ緩
衝液8μgおよびリガーゼ(ベーリンガー・マンハイム
)Iμeを加え、得られたライゲーンヨン液を15℃で
20時間インキュベートした。蒸留水〜48μC15X
キナーゼ/リガーゼ緩衝液16μQ、0.66M AT
P 16μりおよびリガーゼ1μCを添加することによ
って、このライゲーンヨン液を希釈し、環状化を促進さ
せた。得られた溶液を15°Cで72時間イン牛ユベー
トシ、次いで温度を10分間70℃に上昇させて反応を
停止させた。容管に3M酢酸すトリウム12μQおよび
冷エタノール300μσを加えてDNAを沈澱させた。
これらの管をドライアイス上で10分間インキュベート
した後、ブリンクマン微小管中にDNAを採取し、70
%エタノールで1回洗浄し、風乾し、最後にTE30μ
ρに再懸濁した。
した後、ブリンクマン微小管中にDNAを採取し、70
%エタノールで1回洗浄し、風乾し、最後にTE30μ
ρに再懸濁した。
実施例8
プラスミドp HJ L 284の単離(実施例7の変
法) Δ、 E、coli K 12 HB 101/
pHJ L2り聯甥芥 E、coli K12 HBIOI/pHJL28
4の凍結乾燥品は、受託番号NRRL B−18044
の下にN RRLから入手可能である。この凍結乾燥さ
れた細胞を、50μg/xQ、アンピシリンを含有する
し一寒天平板(1リツトル当たりバタトトリプトン]O
g、バクト酵母エキス5g、NaC010g1グルフー
ス2g、および寒天15gを含有するし寒天)」二に画
線培養し、E、coli K 12 tTB 101/
pl(J L284の単一のコロニー単12% 体を得
た。このようなコロニーの1つをL B培地(LB培地
は寒天を除いたし寒天である)]0Oxf!に接種し、
実施例6に記載のようにプラスミドDNAを調製した。
法) Δ、 E、coli K 12 HB 101/
pHJ L2り聯甥芥 E、coli K12 HBIOI/pHJL28
4の凍結乾燥品は、受託番号NRRL B−18044
の下にN RRLから入手可能である。この凍結乾燥さ
れた細胞を、50μg/xQ、アンピシリンを含有する
し一寒天平板(1リツトル当たりバタトトリプトン]O
g、バクト酵母エキス5g、NaC010g1グルフー
ス2g、および寒天15gを含有するし寒天)」二に画
線培養し、E、coli K 12 tTB 101/
pl(J L284の単一のコロニー単12% 体を得
た。このようなコロニーの1つをL B培地(LB培地
は寒天を除いたし寒天である)]0Oxf!に接種し、
実施例6に記載のようにプラスミドDNAを調製した。
実施例9
プラスミドpHJL401 [NRRL B−18
217から、実施例6に記載のように単離し、調製する
]約2μgを、ニュー・イングランド・バイオラドから
入手した16μ/μ(!EcoRI制限酵素1μQを加
えた総容量25μgのEcoRI緩衝液[50mM N
aC(!、100mM トリス−HCQ pH7,5
,50mM MgCQ、、100μg/酎ウシ血清アル
ブミン]に懸濁した。この反応物を37°Cで4時間イ
ンキュベートし、次いで70°Cに10分間加熱して反
応を停止させた。無水エタノール2.5容量および3M
酢酸ナトリウム0.1容量を加えて制限分断されたDN
Aを沈澱させ、−70’Cで15分間維持した。遠心に
より沈澱物を採取し、二ニー・イングランド・バイオラ
ドから入手した8単位/μQのBamHI酵素2μQを
加えたBamHI制限酵素緩衝液(150mM NaC
l2,6mM )リス−HCQpH7,9,6=52 mM M g CQ t、100μg/zQウシ血清ア
ルブミン)25μρ中に懸濁した。この反応物を37°
Cで4時間インキュベートし、次いで70°Cに10分
間加熱して反応を停止させた。制限分断されたDNAを
使用前O℃に維持した。
217から、実施例6に記載のように単離し、調製する
]約2μgを、ニュー・イングランド・バイオラドから
入手した16μ/μ(!EcoRI制限酵素1μQを加
えた総容量25μgのEcoRI緩衝液[50mM N
aC(!、100mM トリス−HCQ pH7,5
,50mM MgCQ、、100μg/酎ウシ血清アル
ブミン]に懸濁した。この反応物を37°Cで4時間イ
ンキュベートし、次いで70°Cに10分間加熱して反
応を停止させた。無水エタノール2.5容量および3M
酢酸ナトリウム0.1容量を加えて制限分断されたDN
Aを沈澱させ、−70’Cで15分間維持した。遠心に
より沈澱物を採取し、二ニー・イングランド・バイオラ
ドから入手した8単位/μQのBamHI酵素2μQを
加えたBamHI制限酵素緩衝液(150mM NaC
l2,6mM )リス−HCQpH7,9,6=52 mM M g CQ t、100μg/zQウシ血清ア
ルブミン)25μρ中に懸濁した。この反応物を37°
Cで4時間インキュベートし、次いで70°Cに10分
間加熱して反応を停止させた。制限分断されたDNAを
使用前O℃に維持した。
B、pHJL284のE coRI /B amHI消
化実施例8の教示に実質的に従って調製したpHJL2
84DNA約5μgを、容量25μρでなく50μQで
反応を行うこと以外は実施例9Aに従い、制限酵素Ec
oRrおよびBamHTで消化した。得られたフラグメ
ントを、アガロースゲル電気泳動によって分離し、ty
l Fおよびtyl J遺伝子を含有する〜2.3kb
フラグメントを常法により単離した。単離したフラグメ
ントを0°Cで保存した。
化実施例8の教示に実質的に従って調製したpHJL2
84DNA約5μgを、容量25μρでなく50μQで
反応を行うこと以外は実施例9Aに従い、制限酵素Ec
oRrおよびBamHTで消化した。得られたフラグメ
ントを、アガロースゲル電気泳動によって分離し、ty
l Fおよびtyl J遺伝子を含有する〜2.3kb
フラグメントを常法により単離した。単離したフラグメ
ントを0°Cで保存した。
EcoR1/ B amHI消化p HJ L 401
、および〜2.3kb EcoRI/BamHTフラグ
メントを一緒に混合し、01容量の3M酢酸ナトリウム
および2.5容量の無水エタノールを加えて沈澱させた
。得られた沈澱物をリガーゼ−キナーゼ緩衝液(025
M トリス−T−TCQI)r−I7.8.50 mM
M g CQ t、25mM ジチオトレイトールお
よび25%グリセロール)50μQに溶解した。
、および〜2.3kb EcoRI/BamHTフラグ
メントを一緒に混合し、01容量の3M酢酸ナトリウム
および2.5容量の無水エタノールを加えて沈澱させた
。得られた沈澱物をリガーゼ−キナーゼ緩衝液(025
M トリス−T−TCQI)r−I7.8.50 mM
M g CQ t、25mM ジチオトレイトールお
よび25%グリセロール)50μQに溶解した。
0.66M ATP12μρ、およびT/IDNΔリガ
ーゼ2μQを加え、得られた溶液を15°Cで18時間
インキュベートした。
ーゼ2μQを加え、得られた溶液を15°Cで18時間
インキュベートした。
D、G516の形質転換
700Cで10分間インキュベートしてライゲーション
反応を停止させ、0.1容量の3M酢酸ナトリウムおよ
び2.5容量の無水エタノールを加えてDNAを沈澱さ
せ、−70°Cに15分間維持した。所望のプラスミド
pXYZ1000を含む沈澱物をTE20μQに溶解し
、その1011gを使用し、実施例10に記載の操作法
に従ってG516を形質転換した。2”’−o−デメチ
ルタイロシンの産生に関してチオストレプトン耐性の形
出されたDNA挿入体を有するプラスミド)を精製した
後、それぞれ約5μgをGS]6に形質転換する。
反応を停止させ、0.1容量の3M酢酸ナトリウムおよ
び2.5容量の無水エタノールを加えてDNAを沈澱さ
せ、−70°Cに15分間維持した。所望のプラスミド
pXYZ1000を含む沈澱物をTE20μQに溶解し
、その1011gを使用し、実施例10に記載の操作法
に従ってG516を形質転換した。2”’−o−デメチ
ルタイロシンの産生に関してチオストレプトン耐性の形
出されたDNA挿入体を有するプラスミド)を精製した
後、それぞれ約5μgをGS]6に形質転換する。
ストレプトマイセス・フラジアエG5l6(ATCC3
]664)の培養物を、トリブチカーゼ大豆ブロス(T
SB)20110.に接種し、水浴インキュベーター中
、29℃、26 Orpmで1624時間インキュベー
トした。ホモジナイズ管[トーツス・サイエンティフィ
ック(Thomas 5cientific)、スエデ
スボロ、NJ]およびT−ライン研究スターラー(T
−L ine 1aboratory 5tirrer
)を使用し、この培養物をホモジナイズした後、音波処
理細胞粉砕機(Sonirier Ce1l Disr
upL。
]664)の培養物を、トリブチカーゼ大豆ブロス(T
SB)20110.に接種し、水浴インキュベーター中
、29℃、26 Orpmで1624時間インキュベー
トした。ホモジナイズ管[トーツス・サイエンティフィ
ック(Thomas 5cientific)、スエデ
スボロ、NJ]およびT−ライン研究スターラー(T
−L ine 1aboratory 5tirrer
)を使用し、この培養物をホモジナイズした後、音波処
理細胞粉砕機(Sonirier Ce1l Disr
upL。
r) [ヘッド・システムズ・ウルトラソニックス、1
nc(Head Systems Ultrasoni
cS、 Inc、 )]を使用して76ワツトで7秒間
分断した。ホモジナイズし、分断した培養物4x1!を
、0.3%w/vグリシンを含有するTSB (BBL
)20MQに接種し、29°Cで16−24時間再びイ
ンキュベートした。
nc(Head Systems Ultrasoni
cS、 Inc、 )]を使用して76ワツトで7秒間
分断した。ホモジナイズし、分断した培養物4x1!を
、0.3%w/vグリシンを含有するTSB (BBL
)20MQに接種し、29°Cで16−24時間再びイ
ンキュベートした。
次いで、得られた培養物をホモジナイズし、」二記質転
換体をスクリーニングし、これらのコロニから得られた
プラスミドDNAを分析して正しいプラスミド構造物を
確認した。プラスミドpXY21000のマツプを添付
の第4図に示す。
換体をスクリーニングし、これらのコロニから得られた
プラスミドDNAを分析して正しいプラスミド構造物を
確認した。プラスミドpXY21000のマツプを添付
の第4図に示す。
実施例10
実施例7で構築したプラスミドDNAは、G516を直
接、形質転換することができるが、さらに効率の良い方
法として、まずプラスミドDNAを増幅し、E、col
i内にその構造物を確認する方法がある。次いで、大量
の所望のプラスミドをEcoliから精製すればよく、
これを使用してストレプトマイセス・フラジアエ菌株を
形質転換することができる。形質転換によってプラスミ
ドDNAをE、coliに導入し、制限酵素分析によっ
てそのプラスミドを同定し、E、coliから大量のプ
ラスミドを精製する方法は、当業界周知である。適切な
プラスミド(すなわち、オリゴヌクレオチドプローブと
のハイブリダイゼーションによって検のように01度培
養した。この3度目の培養が終了した後、培養物をホモ
ジナイズして採取し、次いでP培地で2回洗浄した。P
培地基体は、K、3040 、25 gおよびM g
CQ t・6H,02,03gにショ糖103gを加え
、次いで脱イオン水を最終審fft700mgになるま
で加えて調製した。
接、形質転換することができるが、さらに効率の良い方
法として、まずプラスミドDNAを増幅し、E、col
i内にその構造物を確認する方法がある。次いで、大量
の所望のプラスミドをEcoliから精製すればよく、
これを使用してストレプトマイセス・フラジアエ菌株を
形質転換することができる。形質転換によってプラスミ
ドDNAをE、coliに導入し、制限酵素分析によっ
てそのプラスミドを同定し、E、coliから大量のプ
ラスミドを精製する方法は、当業界周知である。適切な
プラスミド(すなわち、オリゴヌクレオチドプローブと
のハイブリダイゼーションによって検のように01度培
養した。この3度目の培養が終了した後、培養物をホモ
ジナイズして採取し、次いでP培地で2回洗浄した。P
培地基体は、K、3040 、25 gおよびM g
CQ t・6H,02,03gにショ糖103gを加え
、次いで脱イオン水を最終審fft700mgになるま
で加えて調製した。
次いで、この混合物を滅菌し、溶液7 、OHQの各々
+、=に++tpo、0.05g/脱イオン水100祿
、CaCQv 2.78 g/脱イオン水100jlf
f、および0.25M TES(2−([)リス−(ヒ
ドロキンメチル)メチルコアミノ)エタンスルホン酸)
(p H7、2)約10酎をそれぞれ加え、所望のP培
地を調製した。
+、=に++tpo、0.05g/脱イオン水100祿
、CaCQv 2.78 g/脱イオン水100jlf
f、および0.25M TES(2−([)リス−(ヒ
ドロキンメチル)メチルコアミノ)エタンスルホン酸)
(p H7、2)約10酎をそれぞれ加え、所望のP培
地を調製した。
得られた細胞ペレットを、lxg/xQ リゾチーム(
カルバイオケム(Calbiochem)、う・ジヨウ
、CΔ92037)を含有するP培地151Qに再懸濁
し、次いで室温で約1時間および1.5時間インキュベ
ートし、プロトプラストを形成させた。
カルバイオケム(Calbiochem)、う・ジヨウ
、CΔ92037)を含有するP培地151Qに再懸濁
し、次いで室温で約1時間および1.5時間インキュベ
ートし、プロトプラストを形成させた。
このプロトプラストを遠心して穏やかに採取し、P培地
で2回洗浄し、P培地2蛙に再懸濁し、使用するまで水
上でインキュベートした。プラスミドpHJL284D
NA約5μgを、P培地中、1gg/m(lの硫酸ヘパ
リン(シグマ)約50μQに加え、水上で約10分間イ
ンキュベートした。
で2回洗浄し、P培地2蛙に再懸濁し、使用するまで水
上でインキュベートした。プラスミドpHJL284D
NA約5μgを、P培地中、1gg/m(lの硫酸ヘパ
リン(シグマ)約50μQに加え、水上で約10分間イ
ンキュベートした。
非常に少ない量(約5−100ナノグラム(ng))の
プラスミドDNAは、E 、 col iから直接使用
せずに、最初にS、フラジアユ中で複製させれば、スト
レプトマイセス・フラジアエ菌株を形質転mするのに使
用することがてきる。ストレプトマイセスプラスミド 当業界周知であり、ホップウ・ノド(llopwood
)ら[ストレプトマイセスの遺伝子増幅(Geneti
c Manipulation of StrepLo
myees)、 I 9 8 5、研究’?−tアル(
John Innes Foundation, No
rwich, England)]にも記載されている
。DNA/ヘパリン溶液ヲまず、プロトプラスト約20
0μ夕に加え、次いでP培地中、55%PEG100O
(シグマ)から構成される溶液約0.9jl(をDN
A/プロトプラス1−混合物に加え、得られた混合物を
室温で穏やかに混合した。
プラスミドDNAは、E 、 col iから直接使用
せずに、最初にS、フラジアユ中で複製させれば、スト
レプトマイセス・フラジアエ菌株を形質転mするのに使
用することがてきる。ストレプトマイセスプラスミド 当業界周知であり、ホップウ・ノド(llopwood
)ら[ストレプトマイセスの遺伝子増幅(Geneti
c Manipulation of StrepLo
myees)、 I 9 8 5、研究’?−tアル(
John Innes Foundation, No
rwich, England)]にも記載されている
。DNA/ヘパリン溶液ヲまず、プロトプラスト約20
0μ夕に加え、次いでP培地中、55%PEG100O
(シグマ)から構成される溶液約0.9jl(をDN
A/プロトプラス1−混合物に加え、得られた混合物を
室温で穏やかに混合した。
この混合物を軟質R2寒天重層部(soft R2 a
gar overlays)4 aρを使用し、R2平
板の各種の標本に上記の混合物をプレートした。R2平
板は、R2培地30ffρを含有しており、37℃で約
4日間乾燥されたものであった。R2培地は、水700
RQに、シヨ糖103g,に2So40.25g1微量
元素溶液2tiQ 、 MgCL・6H.01012g
1グルコース10.0g.、I−−アスパラギン2.O
g,カザミノ酸0.1g、および寒天22gを加え、次
いで得られた溶液を滅菌し、最後に、以下の溶11kを
各々加えて調製する: KH,Po.005g/脱イオ
ン水1 0 0yiQ, CaC1!=2. 2 2
g/脱イオン水100fIQ、および0.25M TE
S(pH7.2)、この最終溶液のpHをNaOT−1
で7 2に調節する。微量元素溶液は、1リツトル当た
りZnCQx4 0ffg,FeCQs’ 6Hto
20Qxg,CuCQt・2H,O I Oxg,
MnCe2・4HzO ] ORg,NaaB+C)
+” 1 0H20 ] 0311gおよび( N
u 4)IIMO?0 24・4H!010肩gを含有
している。軟質R2寒天重層部は、ショ糖515 g,
MgCQt” 6HtO 5.0 6 gS CaC
Qt ] 。
gar overlays)4 aρを使用し、R2平
板の各種の標本に上記の混合物をプレートした。R2平
板は、R2培地30ffρを含有しており、37℃で約
4日間乾燥されたものであった。R2培地は、水700
RQに、シヨ糖103g,に2So40.25g1微量
元素溶液2tiQ 、 MgCL・6H.01012g
1グルコース10.0g.、I−−アスパラギン2.O
g,カザミノ酸0.1g、および寒天22gを加え、次
いで得られた溶液を滅菌し、最後に、以下の溶11kを
各々加えて調製する: KH,Po.005g/脱イオ
ン水1 0 0yiQ, CaC1!=2. 2 2
g/脱イオン水100fIQ、および0.25M TE
S(pH7.2)、この最終溶液のpHをNaOT−1
で7 2に調節する。微量元素溶液は、1リツトル当た
りZnCQx4 0ffg,FeCQs’ 6Hto
20Qxg,CuCQt・2H,O I Oxg,
MnCe2・4HzO ] ORg,NaaB+C)
+” 1 0H20 ] 0311gおよび( N
u 4)IIMO?0 24・4H!010肩gを含有
している。軟質R2寒天重層部は、ショ糖515 g,
MgCQt” 6HtO 5.0 6 gS CaC
Qt ] 。
111g0.25M TES (pH7.2)50x
Q、および寒天2.05gを十分mの脱イオン水に加え
、終審fft500x(!とすることによって調製する
。この混合物を蒸し、寒天を溶融し、管(各々4+のに
分配し、使用するまでオートクレーブ処理した。形質転
換されたプロトプラストをプレートした後、得られた平
板を29℃で24時間インキュベートし、次いでジメチ
ルスルホキシド中、50gg/xO.チオストレプトン
(E.R.スクイブ(Squibb)、プリンストン、
NJO8540)25μQを含有する軟質R2寒天4R
(lをそのプロトプラスト上に散布した。29°Cにお
ける平板のインキュベートを、再生が完了するまで、通
常は約7−14日間続け、所望のストレプトマイセス・
フラジアエGS 1 5/pHJL284形質転換体を
選択した。培地に20gg/xQチオストレプトンを加
えてプラスミドを維持する以外は、米国特許第4,41
9,447号に記載の発酵条件にて、そのS.フラジア
エGS 16/pl(JL284閑株を培養した。バル
ゾ(Baltz)およびセノ(Seno)[Antim
icrobial^gents and Chemot
herapy,20:214−225,1981]、な
らびにケネディ− (Kennedy, J。
Q、および寒天2.05gを十分mの脱イオン水に加え
、終審fft500x(!とすることによって調製する
。この混合物を蒸し、寒天を溶融し、管(各々4+のに
分配し、使用するまでオートクレーブ処理した。形質転
換されたプロトプラストをプレートした後、得られた平
板を29℃で24時間インキュベートし、次いでジメチ
ルスルホキシド中、50gg/xO.チオストレプトン
(E.R.スクイブ(Squibb)、プリンストン、
NJO8540)25μQを含有する軟質R2寒天4R
(lをそのプロトプラスト上に散布した。29°Cにお
ける平板のインキュベートを、再生が完了するまで、通
常は約7−14日間続け、所望のストレプトマイセス・
フラジアエGS 1 5/pHJL284形質転換体を
選択した。培地に20gg/xQチオストレプトンを加
えてプラスミドを維持する以外は、米国特許第4,41
9,447号に記載の発酵条件にて、そのS.フラジア
エGS 16/pl(JL284閑株を培養した。バル
ゾ(Baltz)およびセノ(Seno)[Antim
icrobial^gents and Chemot
herapy,20:214−225,1981]、な
らびにケネディ− (Kennedy, J。
It) [ Journal or Chemothe
rapy, 281 :288−292. 1983]
の教示に実質的に従い、2”’ー0ーデメチルタイロシ
ン産生を常法により検定し、測定した。
rapy, 281 :288−292. 1983]
の教示に実質的に従い、2”’ー0ーデメチルタイロシ
ン産生を常法により検定し、測定した。
実施例11
Δ.2 −0−デメチルタイロシンの構造確認2゛“
−〇ーデメチルタイロシンは、95%酢酸エチルと5%
ジエチルアミンとの溶液で展開させるシリカゲルプレー
トの薄層クロマトグラフィーではRf値約0.42−0
.52である。このRf値は、tylF遺伝子がクロー
ンされていないストレプトマイセス・フラジアエGS]
6から産生される2”’−0−デメチルマクロシンのR
f値(0.06)よりも非常に高い値である。また、2
°′°−0−デメチルタイロシンは、高速液体クロマト
グラフィー(HPLC)[ゾルボックス(Zorbox
)C8/l)N(523)カラム、移動層:23%アセ
トニトリル、19%テトラヒドロフラン、および58%
イオン対溶液(ベン−タン−スルホン酸1.45g、氷
酢酸581112、水5800Rの]のシステムにおけ
る保持時間(約690秒)によっても同定することがで
きる。このシステムは非勾配溶離(isocratic
)であり、30℃で行う。20−デメチルタイロシンは
吸収280nmで検出される。この/ステムにおける2
”’−o−デメチルマクロシンの保持時間は約480秒
である。
−〇ーデメチルタイロシンは、95%酢酸エチルと5%
ジエチルアミンとの溶液で展開させるシリカゲルプレー
トの薄層クロマトグラフィーではRf値約0.42−0
.52である。このRf値は、tylF遺伝子がクロー
ンされていないストレプトマイセス・フラジアエGS]
6から産生される2”’−0−デメチルマクロシンのR
f値(0.06)よりも非常に高い値である。また、2
°′°−0−デメチルタイロシンは、高速液体クロマト
グラフィー(HPLC)[ゾルボックス(Zorbox
)C8/l)N(523)カラム、移動層:23%アセ
トニトリル、19%テトラヒドロフラン、および58%
イオン対溶液(ベン−タン−スルホン酸1.45g、氷
酢酸581112、水5800Rの]のシステムにおけ
る保持時間(約690秒)によっても同定することがで
きる。このシステムは非勾配溶離(isocratic
)であり、30℃で行う。20−デメチルタイロシンは
吸収280nmで検出される。この/ステムにおける2
”’−o−デメチルマクロシンの保持時間は約480秒
である。
生成物は融点124−128°Cである。その他の物理
的性質は、キヨ/マ(Kiyoshima)ら[ジャー
ナル・オブ・アンチバイオチフス(J、 Antibi
otics)XL 1+23(1987)]に記載され
ている。
的性質は、キヨ/マ(Kiyoshima)ら[ジャー
ナル・オブ・アンチバイオチフス(J、 Antibi
otics)XL 1+23(1987)]に記載され
ている。
B9発酵ブロスからの2°゛°−O−デメチルタイロシ
ンの調製 ストレプトマイセス・フラジアエG516(1)HJL
284)の7日間発酵培養物を濾過して菌糸体および培
地固形物を除去した。Mi&のpHを9.0−9.5に
調節し、マクロライド成分を酢酸エチル中に抽出させ、
次いでp H4、0の水でさらに抽出した。このpHを
9.0にし、マクロラストレブトマイセス・フラジアエ
のLyIE突然ストレプトマイセス・フラジアエ(例え
ば八TCC19609)のタイロンン産生菌株の保存標
本をTSB20jI0.に接種し、30’Cで2448
時間好気的に増殖させ、十分に繁殖させた。
ンの調製 ストレプトマイセス・フラジアエG516(1)HJL
284)の7日間発酵培養物を濾過して菌糸体および培
地固形物を除去した。Mi&のpHを9.0−9.5に
調節し、マクロライド成分を酢酸エチル中に抽出させ、
次いでp H4、0の水でさらに抽出した。このpHを
9.0にし、マクロラストレブトマイセス・フラジアエ
のLyIE突然ストレプトマイセス・フラジアエ(例え
ば八TCC19609)のタイロンン産生菌株の保存標
本をTSB20jI0.に接種し、30’Cで2448
時間好気的に増殖させ、十分に繁殖させた。
得られた培養物をホモジナイズし、音波処理(実施例1
9参照)し、その5籾をTSB45jlCに接種した。
9参照)し、その5籾をTSB45jlCに接種した。
培養物を16−24時間好気的に増殖させ、再度分断し
、5WQ部分量を、幾つかの複製のフラスコ中でTSB
45ff(に接種した。この培養物を2.5−3時間好
気的に37℃で増殖させ、水酸化ナトリウムでそのpH
を8.5に調節シ、次イで25μg/+ρクロラムフェ
ニコールおよび異なる量のN−メチル−N−ニトロN−
ニトロソグアニジン(MNNG)を加え、MNNGの終
濃度を100.200または300μg/xρとした。
、5WQ部分量を、幾つかの複製のフラスコ中でTSB
45ff(に接種した。この培養物を2.5−3時間好
気的に37℃で増殖させ、水酸化ナトリウムでそのpH
を8.5に調節シ、次イで25μg/+ρクロラムフェ
ニコールおよび異なる量のN−メチル−N−ニトロN−
ニトロソグアニジン(MNNG)を加え、MNNGの終
濃度を100.200または300μg/xρとした。
得られた培養物を20分間増殖させ、試料を取り出し、
生存性について試験し、残った細胞を遠心によってペレ
ット化し、新鮮なイド成分を塩化メチレン中に抽出させ
た。溶媒を留去し、得られた固形残渣をアミルアセテー
トに溶解し、濃度約50g/9とした。この溶液を等量
の飽和ホウ酸ナトリウム(9,0)と共に撹拌した。ア
ミルアセテート分画を回収し、マクロライド成分をp
H4、Q−4、5の水に抽出させた。
生存性について試験し、残った細胞を遠心によってペレ
ット化し、新鮮なイド成分を塩化メチレン中に抽出させ
た。溶媒を留去し、得られた固形残渣をアミルアセテー
トに溶解し、濃度約50g/9とした。この溶液を等量
の飽和ホウ酸ナトリウム(9,0)と共に撹拌した。ア
ミルアセテート分画を回収し、マクロライド成分をp
H4、Q−4、5の水に抽出させた。
このpHを9.0に調節し、活性物質を塩化メチレン中
に再抽出さた。この塩化メチレンを留去し、得られた残
渣を酢酸エチルに溶解した。シリカゲルの調製用薄層ク
ロマトグラフィー(展開溶媒:95%酢酸エチルおよび
5%ジエチルアミン)によって、2”’−o−デメチル
タイロシンを他のマクロライド成分から分離した。2゛
゛−O−デメチルタイロシンは、混合物中に存在するマ
クロライド成分の中では最も高いRf値(〜0.420
52)を示した。得られた純粋な2°′°−0デメチル
タイロシンを、標準品として使用するため、酢酸エチル
に溶解し、1ag/mQの濃度とした。
に再抽出さた。この塩化メチレンを留去し、得られた残
渣を酢酸エチルに溶解した。シリカゲルの調製用薄層ク
ロマトグラフィー(展開溶媒:95%酢酸エチルおよび
5%ジエチルアミン)によって、2”’−o−デメチル
タイロシンを他のマクロライド成分から分離した。2゛
゛−O−デメチルタイロシンは、混合物中に存在するマ
クロライド成分の中では最も高いRf値(〜0.420
52)を示した。得られた純粋な2°′°−0デメチル
タイロシンを、標準品として使用するため、酢酸エチル
に溶解し、1ag/mQの濃度とした。
実施例12
’Fsnに再懸濁した。これらの培養物を37°Cで1
6=2/1時間増殖させた。インキュベートの後に適度
に十分な増殖を示す培養物をホモジナイズし、音波処理
し、TSBに希釈し、プレートしてASIJ79地」二
に孤立し、突然変異誘発されたコロニーを得た+ASl
培地−酵母エキスIg/ff。
6=2/1時間増殖させた。インキュベートの後に適度
に十分な増殖を示す培養物をホモジナイズし、音波処理
し、TSBに希釈し、プレートしてASIJ79地」二
に孤立し、突然変異誘発されたコロニーを得た+ASl
培地−酵母エキスIg/ff。
I7−アラニン0.2g/(!、L−アルギニン0.2
g/ρ、I、−アスパラギン0.5 g/(1、可溶性
澱粉5 g/Q、塩化ナトリウム2.5 g/(!、
Na、SO,IOg/ρ、肉汁寒天(meer aga
r) 20 g / 12、p+−17,5、前滅菌。
g/ρ、I、−アスパラギン0.5 g/(1、可溶性
澱粉5 g/Q、塩化ナトリウム2.5 g/(!、
Na、SO,IOg/ρ、肉汁寒天(meer aga
r) 20 g / 12、p+−17,5、前滅菌。
得られた平板を29−300Cで7−14日間インキュ
ベートシ、コロニーを増殖させた。個々のコロニーを小
フラスコまたはボトル中の既知のタイロシン発酵培地[
ボルフおよびセノ(Baltz 、and 5eno)
、AnLimicrobial Agents and
Chrmotharapy、 20:214−225
.1981] 7−10xQに接種した。もう1つのA
SI平板上に各コロニーを同時に複製バッチした。発酵
培養物を好気的に29°Cで7日間増殖させ、従来知ら
れているように(llaltz and 5eno、
1181) 、薄層り07トゲラフイーによってマクロ
ライド成分の存在に関し、個々の発酵ブロスを分析した
。2“゛−Oデメチルタイロシンは、既知の2“°°−
〇−デメチルタイロシン試料(実施例11)との同時ク
ロマトグラフィーによってまず同定することができる。
ベートシ、コロニーを増殖させた。個々のコロニーを小
フラスコまたはボトル中の既知のタイロシン発酵培地[
ボルフおよびセノ(Baltz 、and 5eno)
、AnLimicrobial Agents and
Chrmotharapy、 20:214−225
.1981] 7−10xQに接種した。もう1つのA
SI平板上に各コロニーを同時に複製バッチした。発酵
培養物を好気的に29°Cで7日間増殖させ、従来知ら
れているように(llaltz and 5eno、
1181) 、薄層り07トゲラフイーによってマクロ
ライド成分の存在に関し、個々の発酵ブロスを分析した
。2“゛−Oデメチルタイロシンは、既知の2“°°−
〇−デメチルタイロシン試料(実施例11)との同時ク
ロマトグラフィーによってまず同定することができる。
次いで、この化合物を産生ずる突然変異体(tyl E
)を保存し、2′°“−〇−デメチルタイロシンの生
産に使用する。
)を保存し、2′°“−〇−デメチルタイロシンの生
産に使用する。
実施例13
ストレプトマイセス・フラジアよりA2の突然変異体の
構築 実質的に実施例12の教示に従い、ストレプトマイセス
・フラジアエを突然変異させて、バルブおよび七ノ(A
ntimicrobial Agents and C
hemothcrapy、 20:214−225(1
981))の方法に実質的に従い、得られたty+E突
然変異を含有する微生物を常法により選択した。得られ
た菌株をS リモサス BA2と命名するが、これは本
発明の目的に叶う宿主として有用である。
構築 実質的に実施例12の教示に従い、ストレプトマイセス
・フラジアエを突然変異させて、バルブおよび七ノ(A
ntimicrobial Agents and C
hemothcrapy、 20:214−225(1
981))の方法に実質的に従い、得られたty+E突
然変異を含有する微生物を常法により選択した。得られ
た菌株をS リモサス BA2と命名するが、これは本
発明の目的に叶う宿主として有用である。
実施例14
絶倒12に記載のように、ストレプトマイセス・ハイグ
ロスコピカスのタイロシン生合成経路における突然変異
体を入手する操作を行った。tyl E生合成遺伝子に
関連した突然変異は常法により確認でき、バルブおよび
セス(Antimicrobial Agents a
nd Che+notherapy、 20:214−
225(1981))の方法に従い、選択することがで
きる。得られた菌株をS。
ロスコピカスのタイロシン生合成経路における突然変異
体を入手する操作を行った。tyl E生合成遺伝子に
関連した突然変異は常法により確認でき、バルブおよび
セス(Antimicrobial Agents a
nd Che+notherapy、 20:214−
225(1981))の方法に従い、選択することがで
きる。得られた菌株をS。
リモサスBA3と命名する。
実施例16
ストレプトマイセス・フラジアエGS]6およびプラス
ミドp HJ L 284の代わりにストレプトマイセ
ス・リモサス BA3およびプラスミドpXYZ100
0の培養物を使用する以外は、実施例10に記載の方法
に実質的に従い、ストレブ)マイ1− IJモサス B
A3/pXYZ 1000を構築した。2”’−0−デ
メチルタイロシンの産生は、常法により検定でき、また
ボルフおよびセス、^ntimicrobial Ag
ents and ChemotherapyスI・レ
ブトマイセス・リモサスB A 3 突然変異体省構藩 ストレプトマイセス・フラジアエの代わりにストレプト
マイセス・リモサス(ATCC]0970)を使用する
以外は、実質的に実施例12に記載のように、ストレプ
トマイセス・リモサスのタイロシン生合成経路における
突然変異体を入手する操作を行った。tylE生合成遺
伝子に関連した突然変異は常法により確認でき、バルブ
および七ノ(Antimicrobial Agent
s and Chemotherapy、 20:21
4−225(1980)の方法に従い、選択することが
できる。得られた菌株をS リモサスBA3と命名する
が、これは本発明の目的に叶う宿主として有用である。
ミドp HJ L 284の代わりにストレプトマイセ
ス・リモサス BA3およびプラスミドpXYZ100
0の培養物を使用する以外は、実施例10に記載の方法
に実質的に従い、ストレブ)マイ1− IJモサス B
A3/pXYZ 1000を構築した。2”’−0−デ
メチルタイロシンの産生は、常法により検定でき、また
ボルフおよびセス、^ntimicrobial Ag
ents and ChemotherapyスI・レ
ブトマイセス・リモサスB A 3 突然変異体省構藩 ストレプトマイセス・フラジアエの代わりにストレプト
マイセス・リモサス(ATCC]0970)を使用する
以外は、実質的に実施例12に記載のように、ストレプ
トマイセス・リモサスのタイロシン生合成経路における
突然変異体を入手する操作を行った。tylE生合成遺
伝子に関連した突然変異は常法により確認でき、バルブ
および七ノ(Antimicrobial Agent
s and Chemotherapy、 20:21
4−225(1980)の方法に従い、選択することが
できる。得られた菌株をS リモサスBA3と命名する
が、これは本発明の目的に叶う宿主として有用である。
実施例15
ストレプトマイセス・フラジアエの代わりにストレプト
マイセス・ハイグロスコピカス(ATC(,10976
)を使用する以外は、実質的に実20:214−225
、およびケネディ−(Kennedy)、 Journ
al of Chemotherapy 281:28
8−292(1983)に記載の教示に実質的に従い、
測定できる。この化合物ハ、既知の2”’−0−デメヱ
ルタイロシン試料(実施例11)との同時クロマトグラ
フィーによってまず同定される。
マイセス・ハイグロスコピカス(ATC(,10976
)を使用する以外は、実質的に実20:214−225
、およびケネディ−(Kennedy)、 Journ
al of Chemotherapy 281:28
8−292(1983)に記載の教示に実質的に従い、
測定できる。この化合物ハ、既知の2”’−0−デメヱ
ルタイロシン試料(実施例11)との同時クロマトグラ
フィーによってまず同定される。
実施例17
ストレプトマイセス・フラジアエG5l6およびプラス
ミドp)(JL284の代わりにストレプトマイセス・
ハイグロスコピカス BA4およびプラスミドpxYz
1000の培養物を使用する以外は、実施例10に記載
の方法に実質的に従い、ストレプトマイセス・ハイグロ
スコピカス BA4/pXYZ 1000を構築した。
ミドp)(JL284の代わりにストレプトマイセス・
ハイグロスコピカス BA4およびプラスミドpxYz
1000の培養物を使用する以外は、実施例10に記載
の方法に実質的に従い、ストレプトマイセス・ハイグロ
スコピカス BA4/pXYZ 1000を構築した。
ボルフおよびセス、^nLim1crobial^ge
nts and Chemotherapy 20:2
+4−225、およびケネデ4 +、 Journal
of Chem。
nts and Chemotherapy 20:2
+4−225、およびケネデ4 +、 Journal
of Chem。
therapy 2B1:288−292 (198:
()に記載の教示に実質的に従い、2””O−デメチル
タイロシンの産生は、常法により検定、測定できる。こ
の化合物は、既知の2”’−0−デメチルタイロシン試
料(実施例11)との同時クロマトグラフィーによって
まず同定される。
()に記載の教示に実質的に従い、2””O−デメチル
タイロシンの産生は、常法により検定、測定できる。こ
の化合物は、既知の2”’−0−デメチルタイロシン試
料(実施例11)との同時クロマトグラフィーによって
まず同定される。
実施例18
ストレプトマイセス・フラジアエG515およびプラス
ミドpHJ L28/lの代わりにストレプトマイセス
・フラジアエ BA2およびプラスミドpxyz ]
000の培養物を使用する以外は、実施例10に記載の
方法に実質的に従い、ストレプトマイセス・フラジアエ
BA2/pXYZ]OOOを構築した。ボルフおよび
七ノ、AnLimicr。
ミドpHJ L28/lの代わりにストレプトマイセス
・フラジアエ BA2およびプラスミドpxyz ]
000の培養物を使用する以外は、実施例10に記載の
方法に実質的に従い、ストレプトマイセス・フラジアエ
BA2/pXYZ]OOOを構築した。ボルフおよび
七ノ、AnLimicr。
bia1人gents and Chemothera
py 20:2+4−225、およびケネディー、 J
ournal of Chemotherapy 28
1:288−292(1983)に記載の教示に実質的
に従い、2“−〇−デメチルタイロシンの産生は、常法
により検定、測定できる。この化合物は、既知の20−
デメチルタイロシン試料(実施例11)理して分断した
。次いで、この培養物の接種物をチオストレプトン不含
のTSBに3回連続して継代した。各継代の後に、培養
物を分断し、体積10%のレベルで接種した。最後の継
代の後、培養物を分断し、チオストレプトンを25μg
/xQで含有するASI寒天培地(組成に関しては実施
例12を参照)上にプレートした。チオストレプトン耐
性コロニーを取り出し、TSB上で増殖させた。完全に
増殖した時に、培養物を分断し、チオストレプトン含有
培地上における平板効率(plating effic
iency)を測定した。この効率が1.00の値であ
るか、またはこの付近である場合には、pHJL284
プラスミドはゲノムに組み込まれている。その理由はこ
の自立的なプラスミドは抗生物質選択の無い増殖期では
不安定であり、消失するからである。平板効率が1.0
0よりも小さい場合は、別のチオストレプトン耐性コロ
ニーを取り出し、選択無しの増殖を繰り返し、再度、チ
オストレプトンに対する平板効率を評価する。平板効率
が1.00、またはその付近に達するまでとの同時クロ
マトグラフィーによってまず同定される。
py 20:2+4−225、およびケネディー、 J
ournal of Chemotherapy 28
1:288−292(1983)に記載の教示に実質的
に従い、2“−〇−デメチルタイロシンの産生は、常法
により検定、測定できる。この化合物は、既知の20−
デメチルタイロシン試料(実施例11)理して分断した
。次いで、この培養物の接種物をチオストレプトン不含
のTSBに3回連続して継代した。各継代の後に、培養
物を分断し、体積10%のレベルで接種した。最後の継
代の後、培養物を分断し、チオストレプトンを25μg
/xQで含有するASI寒天培地(組成に関しては実施
例12を参照)上にプレートした。チオストレプトン耐
性コロニーを取り出し、TSB上で増殖させた。完全に
増殖した時に、培養物を分断し、チオストレプトン含有
培地上における平板効率(plating effic
iency)を測定した。この効率が1.00の値であ
るか、またはこの付近である場合には、pHJL284
プラスミドはゲノムに組み込まれている。その理由はこ
の自立的なプラスミドは抗生物質選択の無い増殖期では
不安定であり、消失するからである。平板効率が1.0
0よりも小さい場合は、別のチオストレプトン耐性コロ
ニーを取り出し、選択無しの増殖を繰り返し、再度、チ
オストレプトンに対する平板効率を評価する。平板効率
が1.00、またはその付近に達するまでとの同時クロ
マトグラフィーによってまず同定される。
実施例19
み
実施例10に記載のように、G516をpHJL284
で形質転換し、チオストレプトン耐性形質転換体を選択
した。pHJL284の存在が確認された形質転換体を
選択し、チオストレプトン(2011g/ui2)を加
えたTSBに接種した。得られた培養物を30’Cで振
盪し、完全に増殖させた(約48時間)。この培養物を
ガラスホモジナイザー[トーツス・サイエンティフィツ
ク(Thomas 5cientific)、スウェデ
スボラ、ニューシャーシー]でホモジナイズし、超音波
振動機(ultras。
で形質転換し、チオストレプトン耐性形質転換体を選択
した。pHJL284の存在が確認された形質転換体を
選択し、チオストレプトン(2011g/ui2)を加
えたTSBに接種した。得られた培養物を30’Cで振
盪し、完全に増殖させた(約48時間)。この培養物を
ガラスホモジナイザー[トーツス・サイエンティフィツ
ク(Thomas 5cientific)、スウェデ
スボラ、ニューシャーシー]でホモジナイズし、超音波
振動機(ultras。
nic vibration) [ヒート・ンステムズ
・ウルトラソニノクス、 I nc、 (Heat S
ystems Ultrasonics、 Inc、
)、ICC肩口ローブ76ワツト、7秒]で処(このこ
とは、pHJL284を含有する培養物がゲノムに組み
込まれていることを示す)、この操作を繰り返す。次い
で、得られた培養物を使用し、実施例10に記載の方法
で2゛°”−O−デメチルタイロシンを生産する。
・ウルトラソニノクス、 I nc、 (Heat S
ystems Ultrasonics、 Inc、
)、ICC肩口ローブ76ワツト、7秒]で処(このこ
とは、pHJL284を含有する培養物がゲノムに組み
込まれていることを示す)、この操作を繰り返す。次い
で、得られた培養物を使用し、実施例10に記載の方法
で2゛°”−O−デメチルタイロシンを生産する。
第1図は、タイラクトンからタイロシンまでのタイロシ
ン生合成経路を示す経路図であり、第2図は、タイロシ
ンおよび2°゛−〇−デメチルタし/ イロシンの構造式を示す図であり、第2図は、プラスミ
ドpHJL284(26,94kb)の制限部位および
機能地図の模式図であり、第4図は、プラスミドpXY
Zlo00(8,1kb)の制限部位および機能地図の
模式図である。 特許出願人 イーライ・リリー・アンド・カンパニー化
理 人 弁理士 前出 葆 (外1名)FIG、3 EcoRI FIG、4 coRI 7ト危にン市」巨=:=L’+’ (ブjJ:′SO:、) 補正の内容 平成 1年 7月1011 74頁10行、 「第2図」を「第3図」 に訂正する。 1、事件の表示 平成 1年 特許願 第076383号 以 上 2、発明の名称 一〇 デメチルタイロシンの生産力 3、補正をする者 事件との関係
ン生合成経路を示す経路図であり、第2図は、タイロシ
ンおよび2°゛−〇−デメチルタし/ イロシンの構造式を示す図であり、第2図は、プラスミ
ドpHJL284(26,94kb)の制限部位および
機能地図の模式図であり、第4図は、プラスミドpXY
Zlo00(8,1kb)の制限部位および機能地図の
模式図である。 特許出願人 イーライ・リリー・アンド・カンパニー化
理 人 弁理士 前出 葆 (外1名)FIG、3 EcoRI FIG、4 coRI 7ト危にン市」巨=:=L’+’ (ブjJ:′SO:、) 補正の内容 平成 1年 7月1011 74頁10行、 「第2図」を「第3図」 に訂正する。 1、事件の表示 平成 1年 特許願 第076383号 以 上 2、発明の名称 一〇 デメチルタイロシンの生産力 3、補正をする者 事件との関係
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、ストレプトマイセスのタイロジン産生菌株を培養し
て2’’’−O−デメチルタイロシンを生産するための
方法であって、該産生菌株が、(a)タイロジン生合成
遺伝子tylEの発現を妨げる1つまたはそれ以上の突
然変異(群)を含有し、(b)タイロジン生合成遺伝子
tylFの発現をコードしているDNAを含む組換えD
NAクローニングベクターで形質転換されており、 培養条件が細胞の増殖、tylF遺伝子の発現、および
2’’’−O−デメチルタイロシンの産生に好適な条件
であることを特徴とする生産方法。 2、組換えDNAクローニングベクターが培養中自律的
に複製するベクターとして維持される請求項1に記載の
方法。 3、組換えDNAクローニングベクターがプラスミドで
ある請求項2に記載の方法。 4、プラスミドがプラスミドpHJL284、またはp
XYZ1000である請求項3に記載の方法。 5、組換えDNAクローニングベクターが培養中微生物
のゲノムDNAに組み込まれた配列として維持される請
求項1に記載の方法。 6、形質転換用ベクターのtylF DNAが培養中微
生物のゲノムDNAに組み込まれることによって維持さ
れる請求項1に記載の方法。 7、培養する菌株がストレプトマイセス・フラジアエ、
ストレプトマイセス・リモサス、またはストレプトマイ
セス・ハイグロスコピカスである請求項1から6までの
いずれかに記載の方法。 8、培養する菌株がストレプトマイセス・フラジアエG
516である請求項7に記載の方法。 9、DNAクローニングベクターがpHJL284であ
る請求項8に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US173860 | 1988-03-28 | ||
| US07/173,860 US5063155A (en) | 1988-03-28 | 1988-03-28 | Method for producing 2"'-o-demethyltylosin |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH0216993A true JPH0216993A (ja) | 1990-01-19 |
Family
ID=22633827
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP1076383A Pending JPH0216993A (ja) | 1988-03-28 | 1989-03-27 | 2’’’―o―デメチルタイロシンの生産方法 |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5063155A (ja) |
| EP (1) | EP0335573A3 (ja) |
| JP (1) | JPH0216993A (ja) |
| DK (1) | DK142989A (ja) |
| IL (1) | IL89712A0 (ja) |
Families Citing this family (31)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6500960B1 (en) | 1995-07-06 | 2002-12-31 | Stanford University (Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University) | Method to produce novel polyketides |
| US6558942B1 (en) | 1994-05-06 | 2003-05-06 | The Leland Stanford Junior University | Combinatorial polyketide libraries produced using a modular PKS gene cluster as scaffold |
| US6066721A (en) * | 1995-07-06 | 2000-05-23 | Stanford University | Method to produce novel polyketides |
| US5622866A (en) * | 1994-06-23 | 1997-04-22 | Merck & Co., Inc. | Expression cassettes useful in construction of integrative and replicative expression vectors for Streptomyces |
| IL122859A0 (en) * | 1995-07-06 | 1998-08-16 | Univ Leland Stanford Junior | Cell-free synthesis of polyketides |
| EP0870053A4 (en) | 1995-12-19 | 2002-09-11 | Univ Minnesota | METABOLIC METHOD FOR PRODUCING POLYHYDROXYALKANOATE MONOMER SYNTHASES |
| CA2197524A1 (en) * | 1996-02-22 | 1997-08-22 | Bradley Stuart Dehoff | Polyketide synthase genes |
| US6117659A (en) * | 1997-04-30 | 2000-09-12 | Kosan Biosciences, Inc. | Recombinant narbonolide polyketide synthase |
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