JPH022367A - HgiAI制限エンドヌクレアーゼおよびメチラーゼの製造方法 - Google Patents
HgiAI制限エンドヌクレアーゼおよびメチラーゼの製造方法Info
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- JPH022367A JPH022367A JP63317572A JP31757288A JPH022367A JP H022367 A JPH022367 A JP H022367A JP 63317572 A JP63317572 A JP 63317572A JP 31757288 A JP31757288 A JP 31757288A JP H022367 A JPH022367 A JP H022367A
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- restriction endonuclease
- hgia
- gene
- dna
- cloning vector
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases [RNase]; Deoxyribonucleases [DNase]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1003—Transferases (2.) transferring one-carbon groups (2.1)
- C12N9/1007—Methyltransferases (general) (2.1.1.)
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
発明のバックグラウンド
本発明は、制限エンドヌクレアーゼ1liAIおよびそ
の修飾メチラーゼのクローンならびに該クローンからこ
れらの酵素を製造する方法に係る。
の修飾メチラーゼのクローンならびに該クローンからこ
れらの酵素を製造する方法に係る。
制限エンドヌクレアーゼは天然の細菌中にみられる酵素
の一群である。制限エンドヌクレアーぜは、夾雑する他
の細菌成分から精製すると、実験室でDNA分子を切断
して各々相応する正確な断片を形成するのに使用するこ
とができる。この性質の故に、DNA分子はひとつずつ
独自に同定ザることができ、また分画してその構成遺伝
子を単離することができる。制限エンドヌクレアーゼは
現代の遺伝子研究における不可欠の手段であることが立
証されている。これらの酵素は住化学的な「ハザミ」で
あり、これによって遺伝子の工学および解析が達成され
る。
の一群である。制限エンドヌクレアーぜは、夾雑する他
の細菌成分から精製すると、実験室でDNA分子を切断
して各々相応する正確な断片を形成するのに使用するこ
とができる。この性質の故に、DNA分子はひとつずつ
独自に同定ザることができ、また分画してその構成遺伝
子を単離することができる。制限エンドヌクレアーゼは
現代の遺伝子研究における不可欠の手段であることが立
証されている。これらの酵素は住化学的な「ハザミ」で
あり、これによって遺伝子の工学および解析が達成され
る。
制限エンドヌクレアーゼは、DNA分子上の特定のヌク
レオチド配列(いわゆる「認識配列」)を認識してこれ
に結合することによって作用する。
レオチド配列(いわゆる「認識配列」)を認識してこれ
に結合することによって作用する。
これらの酵素はDNA分子に結合すると、その配列の内
部または一端でその分子を開裂する。異なる制限エンド
ヌクレアーゼはそれぞれ異なる認識配列に対して親和力
をもっている。今日までに調べられた幾百秤もの細菌で
白を越える数の異なる制限エンドヌクレアーゼが同定さ
れている。
部または一端でその分子を開裂する。異なる制限エンド
ヌクレアーゼはそれぞれ異なる認識配列に対して親和力
をもっている。今日までに調べられた幾百秤もの細菌で
白を越える数の異なる制限エンドヌクレアーゼが同定さ
れている。
通常細菌は、その種石に、小数の制限Jンドヌフレアー
ゼをもつのみである。これらのエンドヌクレアーゼはそ
れの由来となった細菌に因んで命名される。たとえば、
Haemophilus aegyptiusはHa
el 、HaelIおよびHael[lとよばれる3つ
の異なる制限エンドヌクレアーゼを合成する。これらの
R’t 5F、は、それぞれ(AT )GGCC(AT
)、PuGCGCPyおよびGGCCという配列をn
Rして開裂覆る。一方、大腸菌[5cherichia
coli RY13は1種類の1WiEc。
ゼをもつのみである。これらのエンドヌクレアーゼはそ
れの由来となった細菌に因んで命名される。たとえば、
Haemophilus aegyptiusはHa
el 、HaelIおよびHael[lとよばれる3つ
の異なる制限エンドヌクレアーゼを合成する。これらの
R’t 5F、は、それぞれ(AT )GGCC(AT
)、PuGCGCPyおよびGGCCという配列をn
Rして開裂覆る。一方、大腸菌[5cherichia
coli RY13は1種類の1WiEc。
R1を合成するだけであり、この酵素はGAATTCと
いう配列を認識Vる。
いう配列を認識Vる。
理論に縛られるつもりはないが、自然界で制限エンドヌ
クレアーゼは細菌細胞の繁殖に関して保護的な役割を果
たしていると考えられる。これらの酵素のおかげで、細
菌は、放っておくとこれらの細菌を破壊したりまたはこ
れらに寄生したりするウィルスやプラスミドのような外
来DNA分子による感染に対して抵抗することが可能に
なる。
クレアーゼは細菌細胞の繁殖に関して保護的な役割を果
たしていると考えられる。これらの酵素のおかげで、細
菌は、放っておくとこれらの細菌を破壊したりまたはこ
れらに寄生したりするウィルスやプラスミドのような外
来DNA分子による感染に対して抵抗することが可能に
なる。
I11限エンドヌクレアーゼは、侵入して来るDNA分
子に結合し、認識配列に出会う度毎にそれらのDNA分
子を開裂することによって、細菌に抵抗性を付与する。
子に結合し、認識配列に出会う度毎にそれらのDNA分
子を開裂することによって、細菌に抵抗性を付与する。
こうして生起する破壊の結果、侵入する遺伝子の多くは
無能となり、そのDNAはエキソヌクレアーゼによって
さらに細かく分解されることになる。
無能となり、そのDNAはエキソヌクレアーゼによって
さらに細かく分解されることになる。
細菌の防御系の第二の要素は修飾メチラーゼである。こ
れらの酵素は制限エンドヌクレアーゼと相補的であり、
これによって、細菌が外来の感染性DNAから自身のD
NAを防御し区別できるようにする手段が提供される。
れらの酵素は制限エンドヌクレアーゼと相補的であり、
これによって、細菌が外来の感染性DNAから自身のD
NAを防御し区別できるようにする手段が提供される。
修飾メチラーゼは対応する制限エンドヌクレアーゼと同
じヌクレオブト認識配列を認識してそれに結合するが、
このDNAを破断する代わりに、メチル基を付加するこ
とによってその配列内のヌクレオブトのいずれかを化学
的に修飾する。このメチル化が起こると、その認識配列
に制限エンドヌクレアーゼが結合することはなく、また
、その配列が制限エンドヌクレアーゼに開裂されること
もない。細菌細胞のDNAはその修飾メチラーゼの活性
のおかげでいつも完全に修飾されており、したがって自
身の内内角制限エンドヌクレアーゼの存在に対して完全
に非感受性となっている。制限エンドヌクレアーゼの認
識と攻撃に対して感受性のあるのは未修飾のDNA、し
たがって外来のものであることが確認できるDNAだけ
である。
じヌクレオブト認識配列を認識してそれに結合するが、
このDNAを破断する代わりに、メチル基を付加するこ
とによってその配列内のヌクレオブトのいずれかを化学
的に修飾する。このメチル化が起こると、その認識配列
に制限エンドヌクレアーゼが結合することはなく、また
、その配列が制限エンドヌクレアーゼに開裂されること
もない。細菌細胞のDNAはその修飾メチラーゼの活性
のおかげでいつも完全に修飾されており、したがって自
身の内内角制限エンドヌクレアーゼの存在に対して完全
に非感受性となっている。制限エンドヌクレアーゼの認
識と攻撃に対して感受性のあるのは未修飾のDNA、し
たがって外来のものであることが確認できるDNAだけ
である。
遺伝子工学技術の出現によって、今では、遺伝子をクロ
ーニングし、その遺伝子がコードしているタンパク質や
酵素を従来の精製技術で入手可能なnより大和に生産す
ることが可能である。制限エンドヌクレアーゼ遺伝子の
クローンを単m1−dる際の鍵は、そのようなりローン
の出現頻度が10−3〜10−4程度に低い場合、複雑
な「ライブラリー」、すなわち「ショットガン」法で得
られるクローンの集団の中で目的と覆るクローンを同定
するための簡単で信頼のおける方法を開発することであ
る。
ーニングし、その遺伝子がコードしているタンパク質や
酵素を従来の精製技術で入手可能なnより大和に生産す
ることが可能である。制限エンドヌクレアーゼ遺伝子の
クローンを単m1−dる際の鍵は、そのようなりローン
の出現頻度が10−3〜10−4程度に低い場合、複雑
な「ライブラリー」、すなわち「ショットガン」法で得
られるクローンの集団の中で目的と覆るクローンを同定
するための簡単で信頼のおける方法を開発することであ
る。
好ましくは、この方法は、目的としない大多数のクロー
ンは破壊されるが珍にある望ましいクローンは生き残れ
るように、選択的なものであるべきである。
ンは破壊されるが珍にある望ましいクローンは生き残れ
るように、選択的なものであるべきである。
■型の制限−修飾系はクローニングされつつあり、その
数は次第に増加している。最初にクローニングされた系
は、制限エンドヌクレアービクローンを同定または選択
する手段としてバタアリオファージによる感染を使用し
た[ HhaT[: Hannet al、 Gen
e、 3: 97−112 (1978) : Ec
oRII :にosykh et al、、Ho1ec
、 gen、 Genct、、 178 : 717
−719(1980); PstI : Walder
et a!、、Proc、 Nat八cへd、 Sc
i、 US^ 78 1503−1507 (1981
)] 、細菌中に制限−修飾系が存在するとm菌はバク
テリオファージによる感染に対して抵抗できるので、ク
ローニングされた制限−修飾遺伝子を担持する細胞は、
原理的に、ファージに暴露されたライブラリーから生え
て来る(生き残る)株として選択的に単離することがで
きる。しかしこの方法は限られた価値しかないことが判
明した。特定的にいうと、クローニングされた制限−修
飾遺伝子は、選択的な生き残りを可能にする程に充分な
ファージ耐性を常に発現するとは限らないことが判明し
たのである。
数は次第に増加している。最初にクローニングされた系
は、制限エンドヌクレアービクローンを同定または選択
する手段としてバタアリオファージによる感染を使用し
た[ HhaT[: Hannet al、 Gen
e、 3: 97−112 (1978) : Ec
oRII :にosykh et al、、Ho1ec
、 gen、 Genct、、 178 : 717
−719(1980); PstI : Walder
et a!、、Proc、 Nat八cへd、 Sc
i、 US^ 78 1503−1507 (1981
)] 、細菌中に制限−修飾系が存在するとm菌はバク
テリオファージによる感染に対して抵抗できるので、ク
ローニングされた制限−修飾遺伝子を担持する細胞は、
原理的に、ファージに暴露されたライブラリーから生え
て来る(生き残る)株として選択的に単離することがで
きる。しかしこの方法は限られた価値しかないことが判
明した。特定的にいうと、クローニングされた制限−修
飾遺伝子は、選択的な生き残りを可能にする程に充分な
ファージ耐性を常に発現するとは限らないことが判明し
たのである。
もうひとつ別のクローニング法では、最初プラスミド由
来とされていた系を旦、延クローニングプラスミド中に
組み込んでいる[EcoRV:Bougucleret
et al、、 Nucleic Ac1d
s Res、、 12:3659−3676(19
84);PaeR7:Gingeras and Br
ooks。
来とされていた系を旦、延クローニングプラスミド中に
組み込んでいる[EcoRV:Bougucleret
et al、、 Nucleic Ac1d
s Res、、 12:3659−3676(19
84);PaeR7:Gingeras and Br
ooks。
Proc、 Natl、 Acad、 Sci、
USA、 80:402−406(1983):
丁heriault and Roy Ge
ne、 19:355−359 (1982)Pv
ul : Blumcnthal at al、
、 J、 Bactcr+。
USA、 80:402−406(1983):
丁heriault and Roy Ge
ne、 19:355−359 (1982)Pv
ul : Blumcnthal at al、
、 J、 Bactcr+。
164・ 501−509 (1985)]。
第三の方法、すなわち多くの系のクローニングに使用さ
れている方法では、本発明音らの特許出願第70707
9号に関連する活性なメチラーゼ遺伝子についで選択す
る[BsuRI : K15s et al、、Nuc
leicAcids Res、 13: 6403
−6421 (1985)]。制限遺伝子と修飾遺伝子
とは近接して結合している傾向があるので、両者の遺伝
子を含イ1するクローンは一方の遺伝子について選択す
るだ【プで1!離できることが多い。しかし、メチル化
活性による選択では常に完全な制限−修飾系が得られる
わけではなく、逆に、メチラーぜ遺伝子のみが得られる
こともある[ [3spR■: Szomolanyi
et al、、Gene、 10:219−225
(1980);3cn工: Janulaitis e
t al、、Gene20:197−204 (198
2):B suRI :にiss and Ba1da
ur。
れている方法では、本発明音らの特許出願第70707
9号に関連する活性なメチラーゼ遺伝子についで選択す
る[BsuRI : K15s et al、、Nuc
leicAcids Res、 13: 6403
−6421 (1985)]。制限遺伝子と修飾遺伝子
とは近接して結合している傾向があるので、両者の遺伝
子を含イ1するクローンは一方の遺伝子について選択す
るだ【プで1!離できることが多い。しかし、メチル化
活性による選択では常に完全な制限−修飾系が得られる
わけではなく、逆に、メチラーぜ遺伝子のみが得られる
こともある[ [3spR■: Szomolanyi
et al、、Gene、 10:219−225
(1980);3cn工: Janulaitis e
t al、、Gene20:197−204 (198
2):B suRI :にiss and Ba1da
ur。
Gene、 21:111−119 (1983);お
よびM spI : Walderet al、、J
、Biol、Chem、、258:1235−1241
(1983)] 。
よびM spI : Walderet al、、J
、Biol、Chem、、258:1235−1241
(1983)] 。
制限−修飾遺伝子のクローニングに対する潜在的な障害
は、修飾によって保護されていない宿主中にエンドヌク
レアーゼ遺伝子を導入しようとすることにある。メチラ
ーゼ遺伝子とエンドヌクレアーゼ遺伝子とを一緒に単一
のクローンとして導入すると、エンドヌクレアーゼが宿
主DNAを開裂する償金を得る前にメチラーゼがそのD
NAを修飾して保護するはずである。したがって、場合
によっては、これらの遺伝子は順番(すなわち、最初に
メチラーゼ、次にエンドヌクレアーゼの順)にのみクロ
ーニングが可能となるかもしれない。
は、修飾によって保護されていない宿主中にエンドヌク
レアーゼ遺伝子を導入しようとすることにある。メチラ
ーゼ遺伝子とエンドヌクレアーゼ遺伝子とを一緒に単一
のクローンとして導入すると、エンドヌクレアーゼが宿
主DNAを開裂する償金を得る前にメチラーゼがそのD
NAを修飾して保護するはずである。したがって、場合
によっては、これらの遺伝子は順番(すなわち、最初に
メチラーゼ、次にエンドヌクレアーゼの順)にのみクロ
ーニングが可能となるかもしれない。
制限−修飾系のクローニングに対する別の障害は、E、
(10)Iiの株の中にはシトシンの修飾に対して逆の
反応を示すものがあるという発見にある。
(10)Iiの株の中にはシトシンの修飾に対して逆の
反応を示すものがあるという発見にある。
ずなわら、そのような株は、メチル化シトシンを含有し
ているDNAを破壊する系をもっているのである[Ra
leigh and Wilson、 Proc、 N
a口、Acadsci、 USA、 83: 9070
−9074 (1986)] 、 ;Xれらの株では、
その自身の遺伝子上でも、あるいはその対応するエンド
ヌクレアーぜ遺伝子と共にでも、シトシン特異的メチラ
ーゼ遺伝子を容易にクローニングすることができない。
ているDNAを破壊する系をもっているのである[Ra
leigh and Wilson、 Proc、 N
a口、Acadsci、 USA、 83: 9070
−9074 (1986)] 、 ;Xれらの株では、
その自身の遺伝子上でも、あるいはその対応するエンド
ヌクレアーぜ遺伝子と共にでも、シトシン特異的メチラ
ーゼ遺伝子を容易にクローニングすることができない。
この問題を避けるために、これらの系を欠損り、でいる
旦、 coli変異株(M CrA およびMCrB
’)を使用する必要がある。
旦、 coli変異株(M CrA およびMCrB
’)を使用する必要がある。
精製した制限エンドヌクレアーゼ、および重要性はそれ
より落らるが修飾メチラーゼは、実験室でDNAの特性
決定と再配列をするのに有用な遊具であるから、これら
の醇素を大量に合成する細菌株を組換えDNA技術によ
って得ることは商業的な魅力がある。そのような株が得
られれば、商業的に有用な吊で生産するための手段が提
供されるばかりでなく精製の作業も簡単になると思われ
るので、これらの株は極めて有用なものとなろう。
より落らるが修飾メチラーゼは、実験室でDNAの特性
決定と再配列をするのに有用な遊具であるから、これら
の醇素を大量に合成する細菌株を組換えDNA技術によ
って得ることは商業的な魅力がある。そのような株が得
られれば、商業的に有用な吊で生産するための手段が提
供されるばかりでなく精製の作業も簡単になると思われ
るので、これらの株は極めて有用なものとなろう。
発明の概要
本発明によって、HerpetO3iphOn (l
i(lantelJsに由来するH(JIAI制限エン
ドヌクレアーゼおよび修飾メチラーゼの遺伝子を含有す
るクローン、ならびにこれらの酵素の生産方法が提供さ
れる。より特定すると、本発明は、G(T/A)GC(
丁/A)CというDNA配列を認識して3′末端のCの
直前で開裂する酵素である制限エンドヌクレアーゼH(
11八工を発現するクローンに係る。Brown、 H
cCIellandand Wh已ehead、 G
ene、 9. 49−68 (1980)参照(そ
の開示内容は、ここで引用したことによって本明細書中
に含まれるものとする)。本発明に従って生産されるH
9IA工制限エンドヌクレアーゼは、IIQrpetO
SiDhOn glganteusから%J造された
HaiAI調製物中に見られる夾雑物を含んでいない。
i(lantelJsに由来するH(JIAI制限エン
ドヌクレアーゼおよび修飾メチラーゼの遺伝子を含有す
るクローン、ならびにこれらの酵素の生産方法が提供さ
れる。より特定すると、本発明は、G(T/A)GC(
丁/A)CというDNA配列を認識して3′末端のCの
直前で開裂する酵素である制限エンドヌクレアーゼH(
11八工を発現するクローンに係る。Brown、 H
cCIellandand Wh已ehead、 G
ene、 9. 49−68 (1980)参照(そ
の開示内容は、ここで引用したことによって本明細書中
に含まれるものとする)。本発明に従って生産されるH
9IA工制限エンドヌクレアーゼは、IIQrpetO
SiDhOn glganteusから%J造された
HaiAI調製物中に見られる夾雑物を含んでいない。
この酵素をクローニングする好ましい方法は、1−1
、 (li(JantQtlsに由来するDNAを含
有するライブラリーを形成し、Hg1A■修飾メチラー
ゼをコードしているDNAを含有するクローンを単離し
、これらをスクリーニングして、Hg1AI制限エンド
ヌクレアーゼ遺伝子も共に含有しているクローンを同定
することからなる。
、 (li(JantQtlsに由来するDNAを含
有するライブラリーを形成し、Hg1A■修飾メチラー
ゼをコードしているDNAを含有するクローンを単離し
、これらをスクリーニングして、Hg1AI制限エンド
ヌクレアーゼ遺伝子も共に含有しているクローンを同定
することからなる。
発明の詳細な説明
本発明は、Hgi△■制限および修飾遺伝子のクローン
、ならびにそのようなりローンによって生産される制限
エンドヌクレアーゼHgi△■に係る。
、ならびにそのようなりローンによって生産される制限
エンドヌクレアーゼHgi△■に係る。
これらのHgiAIm伝子は、HgIA■修飾メチラー
ピ遺伝子を含有し発現することに基づいて選択したある
種のクローンが同時に)−1aiAI制限遺伝子も含有
しているという事実を利用する方法によってクローニン
グされる。そのようなりローンのDNAはHatΔ■制
限エンドヌクレアーゼによる消化に低抗性である。この
消化に対する抵抗性によって、HqiA’Iメチラーゼ
および制限エンドヌクレアーゼをコードしているクロー
ンを選択的に単111tするための手段が得られる。
ピ遺伝子を含有し発現することに基づいて選択したある
種のクローンが同時に)−1aiAI制限遺伝子も含有
しているという事実を利用する方法によってクローニン
グされる。そのようなりローンのDNAはHatΔ■制
限エンドヌクレアーゼによる消化に低抗性である。この
消化に対する抵抗性によって、HqiA’Iメチラーゼ
および制限エンドヌクレアーゼをコードしているクロー
ンを選択的に単111tするための手段が得られる。
HQiAI制限遺伝子およびメチラーゼ遺伝子をクロー
ニングして発現さゼるための本発明の好ましい方法を第
1図に示すが、これには以下のステップが含まれる。
ニングして発現さゼるための本発明の好ましい方法を第
1図に示すが、これには以下のステップが含まれる。
(1) 1lerpetosiphon giga
nteusのDNAを精製する。n、 gigant
eusは Brown at al、、 5upra
に記載されている。この細菌のサンプルはThe八m
へrican Type CIJItUre Co
11ectionから ATCC53756として入手
可能である。
nteusのDNAを精製する。n、 gigant
eusは Brown at al、、 5upra
に記載されている。この細菌のサンプルはThe八m
へrican Type CIJItUre Co
11ectionから ATCC53756として入手
可能である。
(2) このDNAをBQIIIのような制限エンド
ヌクレアー1で部分消化する。
ヌクレアー1で部分消化する。
(3) 消化したDNAを、1個以上のHglAl部
位を含有するpU C19(^TCC37254)のよ
うなり[1−ニングベクターに連結する。連結したDN
AをEscherichia coli R81株(
八TCC31343)のような適当な宿主に形質転換す
る。
位を含有するpU C19(^TCC37254)のよ
うなり[1−ニングベクターに連結する。連結したDN
AをEscherichia coli R81株(
八TCC31343)のような適当な宿主に形質転換す
る。
(4) 形質転換した混合物を、形質転換細胞を選択
するためのアンピシリンのような抗生物質を含有する培
地(Amp plates)に接種する。培養後形質転
換体]ロニーをひとつに集めてセルライブラリーとする
。
するためのアンピシリンのような抗生物質を含有する培
地(Amp plates)に接種する。培養後形質転
換体]ロニーをひとつに集めてセルライブラリーとする
。
(5) このセルライブラリーから組換えプラスミド
全部をそっくり精製してプラスミドライブラリーを作成
する。
全部をそっくり精製してプラスミドライブラリーを作成
する。
(6) このプラスミドライブラリーを、H3gig
anteusから調製したHg1AI制限エンドヌクレ
アーゼで完全に消化する。Hg1A■消化により、メチ
ラーゼを含有しない未修飾クローンが特異的に破壊され
、)−1oiΔ■メチラーゼクローンの相対頻度が増大
する。
anteusから調製したHg1AI制限エンドヌクレ
アーゼで完全に消化する。Hg1A■消化により、メチ
ラーゼを含有しない未修飾クローンが特異的に破壊され
、)−1oiΔ■メチラーゼクローンの相対頻度が増大
する。
(7) 消化したプラスミドライブラリーをFcol
i RRIのような適当な宿主に形質転換し、選択培地
に接種して形質転換体を回収する。これらのコロニーを
採取し、そのDNAをl−(giAI峰飾遺伝子の存在
について分析する。ゴなわら、コロニーが11持するプ
ラスミドを精製し、l−1oiAI制限エンドヌクレア
ーゼと共にインキュベートして消化に対して抵抗性か否
かを決定する。また、細胞の全DNA(染色体およびプ
ラスミド)も精製し、HgiAI制限エンドヌクレアー
ゼと共にインキュベ−1・する。HQ1Δ■修篩遺伝子
を担持するり[1−ンのDNAは充分に修飾されている
はずであり。
i RRIのような適当な宿主に形質転換し、選択培地
に接種して形質転換体を回収する。これらのコロニーを
採取し、そのDNAをl−(giAI峰飾遺伝子の存在
について分析する。ゴなわら、コロニーが11持するプ
ラスミドを精製し、l−1oiAI制限エンドヌクレア
ーゼと共にインキュベートして消化に対して抵抗性か否
かを決定する。また、細胞の全DNA(染色体およびプ
ラスミド)も精製し、HgiAI制限エンドヌクレアー
ゼと共にインキュベ−1・する。HQ1Δ■修篩遺伝子
を担持するり[1−ンのDNAは充分に修飾されている
はずであり。
プラスミドONΔと全DNAは両方とも消化に対して実
質的に抵抗性であるはずである。
質的に抵抗性であるはずである。
(8) ステップ(7)で同定されたHqiAIメチ
ラーゼクローンの細胞抽出物を調製し、この抽出物のl
−1oiAI制限エンドヌクレアーゼ活牲を検定するこ
とによって、Hg1Δ■制限エンドヌクレアーゼを担持
するクローンを同定する。
ラーゼクローンの細胞抽出物を調製し、この抽出物のl
−1oiAI制限エンドヌクレアーゼ活牲を検定するこ
とによって、Hg1Δ■制限エンドヌクレアーゼを担持
するクローンを同定する。
(9) H(liAI制限および修飾遺伝子を担持し
ているクローンを醗′M槽内のアンピシリン含有富化培
地中で増殖させることによって、1liAI制限エンド
ヌクレアーゼを生産することができる。
ているクローンを醗′M槽内のアンピシリン含有富化培
地中で増殖させることによって、1liAI制限エンド
ヌクレアーゼを生産することができる。
細胞を遠心して集め、音波処理で破砕すると、HOiA
丁制限エンドヌクレアーゼ活性を含有する粗細胞抽出物
が生成する。
丁制限エンドヌクレアーゼ活性を含有する粗細胞抽出物
が生成する。
(10) HUiA I制限エンドヌクレアーゼ活性
を含りする粗細胞抽出物を、アフィニティーク[]71
へグラフィーやイオン交換クロマトグラフィーのように
標準的なタンパク質精製技術によって精製する。
を含りする粗細胞抽出物を、アフィニティーク[]71
へグラフィーやイオン交換クロマトグラフィーのように
標準的なタンパク質精製技術によって精製する。
十に概略を記載した手順は本発明の好ましい実施態様で
あるが、上記の手順を業界で公知の技術によって変える
ことができるということは当業者には明らかであろう。
あるが、上記の手順を業界で公知の技術によって変える
ことができるということは当業者には明らかであろう。
以下に現状で好ましい具体例を挙げて本発明を例示する
が、これらの実施例は単なる例示であって特許請求の範
囲で指摘されない限り本発明がこれらの実施例に限定さ
れることはないものと考えられたい。
が、これらの実施例は単なる例示であって特許請求の範
囲で指摘されない限り本発明がこれらの実施例に限定さ
れることはないものと考えられたい。
実施例
HaiAI制限エンドヌクレアーゼ遺伝子のクローニン
グ (1) DNAの精製: 凍結した1lerpetosiphon gigan
tcus (八TCC53756)のall胞10g
を氷上で1時間W1.?!Iシた後20dの25%スク
ロース、 50mHTris pHa、o中に再懸濁さ
せた。10dの0.25HEDT八pへ 8.0および
6dの10ny / dリゾチーム(0,25H丁ri
s pH8,0中)を加えた。この懸濁液を2時間氷上
に保った後、24−の 1%Triton X−100
,50mHTris OH8,0,67mHEDTAお
よび5dの10%SDSを加えて溶菌ざした。得られた
溶液を、(前もって0.58 Tris、 pH8,0
で平衡化した)フェノール70dおよびクロロホルム6
0−で抽出した。(Hられた乳濁液を110Kr1)で
30分遠心して相を分離した。粘稠なト相を新しいびん
に移してもう一度71ノールおよびクロロホルムで抽出
した。得られた乳濁液を再度遠心した後、その上相をD
NA緩衝液(10mHTris pH8,0,1mHE
DT^)に対しこの緩衝液を四回交換1ノで透析した。
グ (1) DNAの精製: 凍結した1lerpetosiphon gigan
tcus (八TCC53756)のall胞10g
を氷上で1時間W1.?!Iシた後20dの25%スク
ロース、 50mHTris pHa、o中に再懸濁さ
せた。10dの0.25HEDT八pへ 8.0および
6dの10ny / dリゾチーム(0,25H丁ri
s pH8,0中)を加えた。この懸濁液を2時間氷上
に保った後、24−の 1%Triton X−100
,50mHTris OH8,0,67mHEDTAお
よび5dの10%SDSを加えて溶菌ざした。得られた
溶液を、(前もって0.58 Tris、 pH8,0
で平衡化した)フェノール70dおよびクロロホルム6
0−で抽出した。(Hられた乳濁液を110Kr1)で
30分遠心して相を分離した。粘稠なト相を新しいびん
に移してもう一度71ノールおよびクロロホルムで抽出
した。得られた乳濁液を再度遠心した後、その上相をD
NA緩衝液(10mHTris pH8,0,1mHE
DT^)に対しこの緩衝液を四回交換1ノで透析した。
次に、透析した溶液を最終濃度200埒/戴のRNas
eにより37℃で1時間消化した後、5HNaCρを最
N濃度0.4Hまで加え、かつ055倍容量のイソプロ
ピルアルコールを添加してDNAを沈澱させた。沈澱し
たDNAをガラス捧に巻き付けて取り出し、風乾した後
DNA緩衝液に溶解させて4℃で貯蔵した。
eにより37℃で1時間消化した後、5HNaCρを最
N濃度0.4Hまで加え、かつ055倍容量のイソプロ
ピルアルコールを添加してDNAを沈澱させた。沈澱し
たDNAをガラス捧に巻き付けて取り出し、風乾した後
DNA緩衝液に溶解させて4℃で貯蔵した。
(2) DNAの消化:
If、 g+ganteusのD N A 3ONを、
300成の制限エンドヌクレアーゼ消化用M!ti液(
10mHTris Dl17.5.10m)l HaC
l、、 、 10mHメルカ71〜エタノール。
300成の制限エンドヌクレアーゼ消化用M!ti液(
10mHTris Dl17.5.10m)l HaC
l、、 、 10mHメルカ71〜エタノール。
150mHNaC!! )中に希釈した。得られた溶液
を100成ずつ3つに分けた。最初のものにはBglI
[制限エンドヌクレアーゼを5 unit加え、2番目
のものには2.5 unit、 3番目のものには1U
nit加えた。得られた溶液を1時間37℃にインキュ
ベートした後、10分間72℃に加熱して消化を停止さ
せた。
を100成ずつ3つに分けた。最初のものにはBglI
[制限エンドヌクレアーゼを5 unit加え、2番目
のものには2.5 unit、 3番目のものには1U
nit加えた。得られた溶液を1時間37℃にインキュ
ベートした後、10分間72℃に加熱して消化を停止さ
せた。
3つの溶液を一緒にした。
(3) 連結および形質転換:
13alllで部分消化したIf、 giganteu
s DNA3埒(30度)を、Ba1nHIで開裂し
脱リン酸化した1lUc19(ATCC37254)
1.5埒(8IIi)と混合した。iox連結用II
液(500n+HTris pH7,5,100mHH
(+(J2. +OOmHDTT、 5mHATP)を
10ρ力口え、さらに滅菌蒸溜水を52成加えて容積を
100庫とした。
s DNA3埒(30度)を、Ba1nHIで開裂し
脱リン酸化した1lUc19(ATCC37254)
1.5埒(8IIi)と混合した。iox連結用II
液(500n+HTris pH7,5,100mHH
(+(J2. +OOmHDTT、 5mHATP)を
10ρ力口え、さらに滅菌蒸溜水を52成加えて容積を
100庫とした。
T4 DNΔリガーゼを4成加え、得られた溶液を4時
間17℃にインキュベートした。この溶液をクロロホル
ム10I11で抽出して滅菌した後、15秒間軽く遠心
(vcrocentrHugation)して清澄化し
た。
間17℃にインキュベートした。この溶液をクロロホル
ム10I11で抽出して滅菌した後、15秒間軽く遠心
(vcrocentrHugation)して清澄化し
た。
連結溶液80dを1戒のSSC/Caa!2(50mH
NaC15mHクエンMNa 、 67mHCaC
12)と混合し、氷冷した旦 col i RRl
(ATCC31343)コンピテント細胞を21n1
加えた。得られた溶液を5分間42°Cにインキュベー
トした後、8dの 1uria−ブロス(L−−bro
th)を添加して37℃で4時間インキュベーションを
続行した。
NaC15mHクエンMNa 、 67mHCaC
12)と混合し、氷冷した旦 col i RRl
(ATCC31343)コンピテント細胞を21n1
加えた。得られた溶液を5分間42°Cにインキュベー
トした後、8dの 1uria−ブロス(L−−bro
th)を添加して37℃で4時間インキュベーションを
続行した。
(4) セルライブラリー二
形質転換した培養液を穏やかに遠心した後、上清を捨て
、細胞を11dの1−brothに再懸濁させた。再懸
濁した細胞のうち200dを、アンピシリンを100i
/d含有するLuria−寒天(L−agar)プレー
ト上に接種した。このプレートを一晩37℃にインキュ
ベートした。プレートの表面上に生えてきた形質転換細
胞をまとめて回収するために、各プレート1.: 2.
5dの10mHTris pH7,5,10mHHc+
(lj!2を満たし、コロニーを全部掻ぎ集め、得られ
た懸濁液を1本のチューブ内にプールした。
、細胞を11dの1−brothに再懸濁させた。再懸
濁した細胞のうち200dを、アンピシリンを100i
/d含有するLuria−寒天(L−agar)プレー
ト上に接種した。このプレートを一晩37℃にインキュ
ベートした。プレートの表面上に生えてきた形質転換細
胞をまとめて回収するために、各プレート1.: 2.
5dの10mHTris pH7,5,10mHHc+
(lj!2を満たし、コロニーを全部掻ぎ集め、得られ
た懸濁液を1本のチューブ内にプールした。
(5) プラスミドライブラリー二
2.5dのセルライブラリーを、アンピシリンを+00
IJ9/d含有する L−broth 5007中に接
種した。
IJ9/d含有する L−broth 5007中に接
種した。
37℃で一晩振盪培養した模、4にrpmで5分遠心し
た。ト清を捨て、細胞ベレットを101+li!の25
%スクロース、 50mHTrys pH8,0k1.
i温テ再懸濁すt! タ。
た。ト清を捨て、細胞ベレットを101+li!の25
%スクロース、 50mHTrys pH8,0k1.
i温テ再懸濁すt! タ。
0.258 EDTA、 pH8,0を5d、および
10IIt9/威リゾチーム(O325)4 Tris
、 pH8,0中)を31n1.加えた。
10IIt9/威リゾチーム(O325)4 Tris
、 pH8,0中)を31n1.加えた。
得られた溶液を氷上に1時間放置した曵、12m1の1
%Triton X−100,50mHTrys pt
l 8.0.67mHEDTAを添加し、この懸濁液に
穏やかに渦を巻かせて細胞の溶菌を誘導した。
%Triton X−100,50mHTrys pt
l 8.0.67mHEDTAを添加し、この懸濁液に
穏やかに渦を巻かせて細胞の溶菌を誘導した。
溶菌した混合物を5Mのチューブに移して17Kppm
、 4℃で45分間遠心した。ピペットで上清を取り
出した。固体のcscpを2o、og秤間して50m1
のプラスチック製ネジブタ付きチューブに入れ、このデ
ユープ中に上清22.09をピペットで入れて混合した
。5η/dのエチジウムプロミド(10mHTris
ptl 8.0. 100mHNaC1,1mHEDT
A中)を i、。
、 4℃で45分間遠心した。ピペットで上清を取り
出した。固体のcscpを2o、og秤間して50m1
のプラスチック製ネジブタ付きチューブに入れ、このデ
ユープ中に上清22.09をピペットで入れて混合した
。5η/dのエチジウムプロミド(10mHTris
ptl 8.0. 100mHNaC1,1mHEDT
A中)を i、。
d加えた。この溶液を、5/81nx3 inの遠心管
2本に移し、Beckman T i 70ロ一ター中
44KrDm。
2本に移し、Beckman T i 70ロ一ター中
44KrDm。
17℃で42時間回転させた。プラスミドを集めるため
に、これらのチューブを聞き、紫外光を照射して2木の
ケイ光バンドの下側の方を注DI !で集めた。各チュ
ーブから得た下側のバンドを合わせ、等8最の、水で飽
和した水冷n−ブタノールで四回抽出することによって
エチジウムプロミドを除去した。
に、これらのチューブを聞き、紫外光を照射して2木の
ケイ光バンドの下側の方を注DI !で集めた。各チュ
ーブから得た下側のバンドを合わせ、等8最の、水で飽
和した水冷n−ブタノールで四回抽出することによって
エチジウムプロミドを除去した。
抽出された溶液をDNA緩衝液を四回交換しながらこの
緩衝液に対して透析した後、2倍容最のイソプロパツー
ルと最終濃度が0.4Hとなるのに充分な58 Ha(
Jを添加して核酸を沈澱させた。得られた溶液を一晩−
20℃で保存した模15Krom、O℃で15分遠心し
た。上清を捨て、ペレットを15分間風乾した後、50
0屑の10mHTris pH7,5,1mHEDTA
に溶かして一20℃で貯蔵した。プラスミドDNAの濃
度は約150埒/dであった。
緩衝液に対して透析した後、2倍容最のイソプロパツー
ルと最終濃度が0.4Hとなるのに充分な58 Ha(
Jを添加して核酸を沈澱させた。得られた溶液を一晩−
20℃で保存した模15Krom、O℃で15分遠心し
た。上清を捨て、ペレットを15分間風乾した後、50
0屑の10mHTris pH7,5,1mHEDTA
に溶かして一20℃で貯蔵した。プラスミドDNAの濃
度は約150埒/dであった。
(6) プラスミドライブラリーの消化:4.5乃(
30m )のプラスミドライブラリーを150屑の制限
エンドヌクレアーゼ消化用緩衝液(トー記第2項)に希
釈した。36 unitの1liAI制限エンドヌクレ
アーゼを加え、チューブを1時間37℃にインキュベー
トした後、12分間72℃に加熱して反応を停止させた
。
30m )のプラスミドライブラリーを150屑の制限
エンドヌクレアーゼ消化用緩衝液(トー記第2項)に希
釈した。36 unitの1liAI制限エンドヌクレ
アーゼを加え、チューブを1時間37℃にインキュベー
トした後、12分間72℃に加熱して反応を停止させた
。
(7) 形質転換:
12.5成(0,3埒)の消化したライブラリーを10
0屑のSSC/CaC1!2(上記第3項)および20
0成の水冷したコンビテンt−E、 coli RR
Iと混合した。
0屑のSSC/CaC1!2(上記第3項)および20
0成の水冷したコンビテンt−E、 coli RR
Iと混合した。
得られた混合物を3分間42℃に暖めた後、7ンビシリ
ンを100A9/d含有する1−agarプレートに接
種した。このプレートを一晩37℃にインキュベートし
た。1−HJiAI消化によって、未消化のプラスミド
による形質転換の場合と比較して、形質転換体の数は1
/103に減少した。このH(liAI消化で生き残っ
たもののうちから14個のコロニーを採り、それぞれ、
10rdのアンピシリン含有1−broth中に(3種
してミニカルチャー(小培養物)を:!!製し、アンピ
シリンを含有するL −agarプレート上に画線して
マスターストックを調製した。
ンを100A9/d含有する1−agarプレートに接
種した。このプレートを一晩37℃にインキュベートし
た。1−HJiAI消化によって、未消化のプラスミド
による形質転換の場合と比較して、形質転換体の数は1
/103に減少した。このH(liAI消化で生き残っ
たもののうちから14個のコロニーを採り、それぞれ、
10rdのアンピシリン含有1−broth中に(3種
してミニカルチャー(小培養物)を:!!製し、アンピ
シリンを含有するL −agarプレート上に画線して
マスターストックを調製した。
(8) 生き残った個体の解析:
上記第7項で得られた14個の生き残りのコロニーを1
0戒になるまで増殖させ、これらが担持するプラスミド
を、Birnboin and Doly、 Nuc
leicAcids Res、、 7 : 1513
(1979)の方法を応用した以下のm1niprep
精製法によって調製した。
0戒になるまで増殖させ、これらが担持するプラスミド
を、Birnboin and Doly、 Nuc
leicAcids Res、、 7 : 1513
(1979)の方法を応用した以下のm1niprep
精製法によって調製した。
m1niprep法:
各培養物を8Krpmで5分間遠心し、上清を捨てて1
qられた細胞ペレットを、1η/dリゾチームを含有す
る1、Odの25mHTris 10mH[DTA
501118グルコース、 pH8,0中に再懸濁さ
せた。室温に10分間装いた少、各チューブに2.Od
の0.2HNa0t11χSO3を加え、チューブを振
i!AI、て細胞を溶解し、次いで水土に置いた。溶液
が透明になってから各々3M酢酸ナトリウムH)114
.8)を1.5rd、ずつ加えて振盪した。生じた沈澱
を15Krom、 4℃で10分間遠心して沈ませた。
qられた細胞ペレットを、1η/dリゾチームを含有す
る1、Odの25mHTris 10mH[DTA
501118グルコース、 pH8,0中に再懸濁さ
せた。室温に10分間装いた少、各チューブに2.Od
の0.2HNa0t11χSO3を加え、チューブを振
i!AI、て細胞を溶解し、次いで水土に置いた。溶液
が透明になってから各々3M酢酸ナトリウムH)114
.8)を1.5rd、ずつ加えて振盪した。生じた沈澱
を15Krom、 4℃で10分間遠心して沈ませた。
得られた上清を各々、イソプロパツールを31Rp、含
有する遠心管に流し入れて混合した。室温で10分経っ
た後遠心管を15にppmで10分間遠心して沈殿した
核酸をペレット化した。
有する遠心管に流し入れて混合した。室温で10分経っ
た後遠心管を15にppmで10分間遠心して沈殿した
核酸をペレット化した。
上清を捨て、ペレットを室温で30分風乾した。
乾燥シタ後ヘレッ1−を850IJ1の10m)l T
rlS、 1mHEDTA、 pH8,0に再懸濁させ
た。5HNaci!を75成ずつ加え、得られた溶液を
、575成のイソプロパツールを含有するcpDenc
lorrチューブに移し、室温で10分かけて再度沈澱
させた。次に、チューブをmicroruge中で45
秒間回転し、上清を捨ててペレットを風乾した。このペ
レットを、次いで、RNaSQを1100p/rfdl
含有する500屑の10mHTrislmHEDTA、
pH8,0に溶解し、1時間37℃にイン=1:ユベ
ートしてRNAを消化した。50/I11の5HNaC
1、次いで350[のイソプロパツールを添加してDN
Aをもう一度沈澱させた。室温で10分後、45秒間遠
心してDNAを沈ませ、−F清を捨て、得られたペレッ
を150成の10mHTris、 In+HEDTA、
pH8,0に再溶解した。次いで、プラスミドm1n
iprcD (小調製物)をHOiΔ王とE(10)R
Iで消化して解析した。
rlS、 1mHEDTA、 pH8,0に再懸濁させ
た。5HNaci!を75成ずつ加え、得られた溶液を
、575成のイソプロパツールを含有するcpDenc
lorrチューブに移し、室温で10分かけて再度沈澱
させた。次に、チューブをmicroruge中で45
秒間回転し、上清を捨ててペレットを風乾した。このペ
レットを、次いで、RNaSQを1100p/rfdl
含有する500屑の10mHTrislmHEDTA、
pH8,0に溶解し、1時間37℃にイン=1:ユベ
ートしてRNAを消化した。50/I11の5HNaC
1、次いで350[のイソプロパツールを添加してDN
Aをもう一度沈澱させた。室温で10分後、45秒間遠
心してDNAを沈ませ、−F清を捨て、得られたペレッ
を150成の10mHTris、 In+HEDTA、
pH8,0に再溶解した。次いで、プラスミドm1n
iprcD (小調製物)をHOiΔ王とE(10)R
Iで消化して解析した。
(9)l−1oiAIメチラーぜ遺伝子クローン:解析
した14個のプラスミドのうち10個が、HIIJAI
浦化に対して感受性でありさまざまな構造をイイしてい
ることが判明した。これらのプラスミドはにせものであ
るので捨てた。残りの4個のプラスミドは、HgiΔ工
消化に対して抵抗性であり、5.4Kbと1.5Kbの
2個のB(llI[断片を担持していることが判明した
(第2図)。これらのプラスミドは同一であるように思
われた。これらのうちのひとつpにし1708H111
−14は、Hg1AI修飾メチラーピを]−ドしている
ばかりでなく、H(11AI制限エンドヌクレアーゼも
コードしていることがボされた。
した14個のプラスミドのうち10個が、HIIJAI
浦化に対して感受性でありさまざまな構造をイイしてい
ることが判明した。これらのプラスミドはにせものであ
るので捨てた。残りの4個のプラスミドは、HgiΔ工
消化に対して抵抗性であり、5.4Kbと1.5Kbの
2個のB(llI[断片を担持していることが判明した
(第2図)。これらのプラスミドは同一であるように思
われた。これらのうちのひとつpにし1708H111
−14は、Hg1AI修飾メチラーピを]−ドしている
ばかりでなく、H(11AI制限エンドヌクレアーゼも
コードしていることがボされた。
no)HgiA I制限遺伝子クローン:1)KL17
011H111−14は、このプラスミドを担持してい
るE、 coli RRIの抽出物を検定することに
より、lli△■制限エンドヌクレアーゼをコードして
いて発現することが判明した。
011H111−14は、このプラスミドを担持してい
るE、 coli RRIの抽出物を検定することに
より、lli△■制限エンドヌクレアーゼをコードして
いて発現することが判明した。
エンドヌクレアーゼアッセイ:
1)KL170ItH111−14を担持しているE、
coli RRIの培養物100dを、100μy/
m1.アンピシリンを含有するL−broth中30℃
中足0℃殖させた。培養物を4にrpmで5分間遠心し
、得られた細胞ペレットを3dの10mHKPO4pH
7,5,10mHメルメルトエタノール、 0.1mH
E[]TA中に再懸濁させた。同じ緩衝液中に10/r
tg/ dのリゾチームを含有する液を0.3戒加え、
得られた懸濁液を1時間氷上に放置した。この懸濁液1
.0戒を、10秒ずつ三回穏やかに音波処理して細胞を
破砕した。音波処理した抽出物を5分間軽く遠心して細
胞の破片を除去し、上清のエンドヌクレアーゼ活性を以
下のようにして検定した。
coli RRIの培養物100dを、100μy/
m1.アンピシリンを含有するL−broth中30℃
中足0℃殖させた。培養物を4にrpmで5分間遠心し
、得られた細胞ペレットを3dの10mHKPO4pH
7,5,10mHメルメルトエタノール、 0.1mH
E[]TA中に再懸濁させた。同じ緩衝液中に10/r
tg/ dのリゾチームを含有する液を0.3戒加え、
得られた懸濁液を1時間氷上に放置した。この懸濁液1
.0戒を、10秒ずつ三回穏やかに音波処理して細胞を
破砕した。音波処理した抽出物を5分間軽く遠心して細
胞の破片を除去し、上清のエンドヌクレアーゼ活性を以
下のようにして検定した。
精製したλフ?−ジD N A30m (43麿)を、
600成の制限エンドヌクレアーゼ消化用緩衝液(十記
第2項)中に希釈した。この溶液を5本のチューブに、
最初の1本は150成、残りの4本は+oo llI!
ずつ分注した。最初のチューブに抽出物75成を入れて
DNA1埒当たり抽出物1成とした。次に、最初のチュ
ーブから5011I!を取り出して第二のデユープに移
して0.39fl/埒とした。続は又ブユーブ3.4.
5にも順次50IJ1ずつ移して、チューブ3(01成
/p3> ’+ 4 (0,03IIi/埒)および5
(0,01/n/49>とした。これらのチューブを
1時間37℃にインキュベートシた後、各チューブのサ
ンプル20成をゲル電気泳動によって分析した。
600成の制限エンドヌクレアーゼ消化用緩衝液(十記
第2項)中に希釈した。この溶液を5本のチューブに、
最初の1本は150成、残りの4本は+oo llI!
ずつ分注した。最初のチューブに抽出物75成を入れて
DNA1埒当たり抽出物1成とした。次に、最初のチュ
ーブから5011I!を取り出して第二のデユープに移
して0.39fl/埒とした。続は又ブユーブ3.4.
5にも順次50IJ1ずつ移して、チューブ3(01成
/p3> ’+ 4 (0,03IIi/埒)および5
(0,01/n/49>とした。これらのチューブを
1時間37℃にインキュベートシた後、各チューブのサ
ンプル20成をゲル電気泳動によって分析した。
これらの抽出物は、1dに付き約1000 unitの
1」giAI制限エンドヌクレアーゼを含有しているこ
とが判明した。これは、細胞1g当たり約104uni
tに相当する。
1」giAI制限エンドヌクレアーゼを含有しているこ
とが判明した。これは、細胞1g当たり約104uni
tに相当する。
pにL170RH111−14を担持するE、 col
i RRlは、Hg1AI制限エンドヌクレアーゼを精
製する際の好ましい宿主として使用することができる。
i RRlは、Hg1AI制限エンドヌクレアーゼを精
製する際の好ましい宿主として使用することができる。
この株を、醗酵槽のアンピシリン含有L −broth
中30℃中足0℃まで増殖させた後、遠心して細胞を集
め、直ぐに破砕して抽出物を調製してもよいし、使用片
まで一70℃で凍結保存してもよい。
中30℃中足0℃まで増殖させた後、遠心して細胞を集
め、直ぐに破砕して抽出物を調製してもよいし、使用片
まで一70℃で凍結保存してもよい。
第1図は、f−(oiAI制限エンドヌクレアーゼをク
ローニングして生産する方法の概略をボす。 第2図は、HaiAIυ1限エンドヌクレアーゼおよび
修飾メチラーゼをコードしているト1゜gigante
us D N Aの6.7Kb 81Jlff ?ルチ
フラグメント(大所片)の制限地図であり、この断片を
pHc19(八TCC37254)のBamHI部位に
クローニングしてpにL170RH111−14を創作
した。 第3図は、F)KL170RH111−14を担持する
Ecoli R11t(ATCC31343)の細胞抽
出物中のHaiAI制限エンドヌクレアーゼ活性を小す
アガロースゲルの写真である。 K11obase pairs FIG、2
ローニングして生産する方法の概略をボす。 第2図は、HaiAIυ1限エンドヌクレアーゼおよび
修飾メチラーゼをコードしているト1゜gigante
us D N Aの6.7Kb 81Jlff ?ルチ
フラグメント(大所片)の制限地図であり、この断片を
pHc19(八TCC37254)のBamHI部位に
クローニングしてpにL170RH111−14を創作
した。 第3図は、F)KL170RH111−14を担持する
Ecoli R11t(ATCC31343)の細胞抽
出物中のHaiAI制限エンドヌクレアーゼ活性を小す
アガロースゲルの写真である。 K11obase pairs FIG、2
Claims (13)
- (1)HgiA I 制限エンドヌクレアーゼ遺伝子を含
むクローニングベクター。 - (2)請求項1に記載のクローニングベクターを含有す
る形質転換された宿主。 - (3)HgiA I 遺伝子が、¥Herpetosip
hongigante−¥¥us¥ATCC53756
から切り出されたものである、請求項1に記載のクロー
ニングベクター。 - (4)HgiA I 修飾遺伝子を含むクローニングベク
ター。 - (5)請求項4に記載のクローニングベクターを含有す
る形質転換された宿主。 - (6)(a)¥Herpotosiphongigan
teus¥に由来するDNAからライブラリーを形成し
、 (6)HgiA I 修飾遺伝子を含有するクローンを単
離し、 (c)修飾遺伝子を含有するクローンをスクリーニング
し、 (d)HgiA I 制限エンドヌクレアーゼ遺伝子を同
時に含有しているクローンを単離する ことからなる、HgiA I 制限エンドヌクレアーゼ遺
伝子のクローニング方法。 - (7)前記ライブラリーを、 (a)¥Herpetosiphongiganteu
s¥ATCC53756に由来するDNAを精製するス
テップ、 (b)精製したDNAを消化してDNA断片を形成する
ステップ、 (c)この断片をクローニングベクターに連結するステ
ップ、 (d)ステップ(c)のクローニングベクターで宿主細
胞を形質転換してセルライブラリーを形成するステップ
、 (e)このセルライブラリーから組換えベクターを精製
してプラスミドライブラリーを形成するステップ によつて形成する、請求項6に記載の方法。 - (8)クローニングベクターがpUC19である、請求
項7に記載の方法。 - (9)宿主細胞が¥E.coli¥のmcrB^−およ
びhsdR^−株である、請求項7に記載の方法。 - (10)プラスミドライブラリーをHgiA I で消化
して消化プールを形成し、この消化プールを宿主細胞中
に形質転換し、修飾遺伝子を含有するクローンを選択す
ることによつて、HgiA I 修飾遺伝子を含有するク
ローンを単離する、請求項7に記載の方法。 - (11)(a)¥Herpetosiphongiga
nteus¥に由来するDNAを精製し、 (b)精製したDNAを適当な制限エンドヌクレアーゼ
で消化してDNA断片を形成し、(c)この断片をクロ
ーニングベクターに連結してDNA混合物を形成し、 (d)ステップ(c)のDNA混合物で宿主細胞を形質
転換してライブラリーを形成し、(e)HgiA I 修
飾メチラーゼ遺伝子を含有するクローンを単離し、 (f)HgiA I 修飾メチラーゼ遺伝子を含有するク
ローンをスクリーニングし、HgiA I 制限エンドヌ
クレアーゼ遺伝子を同時に含有しているクローンを単離
し、 (g)ステップ(f)のクローンを含有する宿主細胞を
培養し、 (h)この培養物からHgiA I 制限エンドヌクレア
ーゼを回収する ことからなる、HgiA I 制限エンドヌクレアーゼの
製造方法。 - (12)クローニングベクターがプラスミドまたはウィ
ルスのDNA分子である、請求項11に記載の方法。 - (13)プラスミドがpUC19である、請求項12に
記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US07/134,001 US4987074A (en) | 1987-12-17 | 1987-12-17 | Method for producing the HgiAI restriction endonuclease and methylase |
| US134,001 | 1987-12-17 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH022367A true JPH022367A (ja) | 1990-01-08 |
Family
ID=22461309
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP63317572A Pending JPH022367A (ja) | 1987-12-17 | 1988-12-15 | HgiAI制限エンドヌクレアーゼおよびメチラーゼの製造方法 |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US4987074A (ja) |
| EP (1) | EP0321271B1 (ja) |
| JP (1) | JPH022367A (ja) |
| AT (1) | ATE103329T1 (ja) |
| DE (1) | DE3888648T2 (ja) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPH0849285A (ja) * | 1994-08-04 | 1996-02-20 | Takashi Matsushima | 側溝用ダクト |
| JPH08165670A (ja) * | 1994-12-14 | 1996-06-25 | Asahi Concrete Works Co Ltd | ケーブル共同溝 |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5491060A (en) * | 1989-05-01 | 1996-02-13 | The University Of Maryland | Mutant strain of E. coli for detection of methyltransferase clones |
| US5298404A (en) * | 1989-10-13 | 1994-03-29 | New England Biolabs, Inc. | Method for producing the Hpa I restriction endonuclease and methylase |
| US5202248A (en) * | 1990-11-02 | 1993-04-13 | New England Biolabs, Inc. | Method for cloning and producing the nco i restriction endonuclease and methylase |
| US5192676A (en) * | 1991-02-05 | 1993-03-09 | New England Biolabs, Inc. | Type ii restriction endonuclease, asci, obtainable from arthrobacter species and a process for producing the same |
| US5200337A (en) * | 1991-10-25 | 1993-04-06 | New England Biolabs, Inc. | Type ii restriction endonuclease, apo i, obtainable from arthrobacter protophormiae and a process for producing the same |
| WO2008076922A1 (en) * | 2006-12-15 | 2008-06-26 | Ceres, Inc. | Modulation of plant protein levels |
| EP2548953A1 (en) | 2005-08-04 | 2013-01-23 | New England Biolabs, Inc. | Novel restriction endonucleases, DNA encoding these endonucleases and methods for identifying new endonucleases with the same or varied specificity |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| IN166864B (ja) * | 1985-03-01 | 1990-07-28 | New England Biolabs Inc | |
| ATE113653T1 (de) * | 1986-06-06 | 1994-11-15 | New England Biolabs Inc | Verfahren zur klonierung eines restriktionsmodifizierungssystems. |
-
1987
- 1987-12-17 US US07/134,001 patent/US4987074A/en not_active Expired - Lifetime
-
1988
- 1988-12-15 JP JP63317572A patent/JPH022367A/ja active Pending
- 1988-12-16 AT AT88311923T patent/ATE103329T1/de not_active IP Right Cessation
- 1988-12-16 DE DE3888648T patent/DE3888648T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1988-12-16 EP EP88311923A patent/EP0321271B1/en not_active Expired - Lifetime
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPH0849285A (ja) * | 1994-08-04 | 1996-02-20 | Takashi Matsushima | 側溝用ダクト |
| JPH08165670A (ja) * | 1994-12-14 | 1996-06-25 | Asahi Concrete Works Co Ltd | ケーブル共同溝 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0321271B1 (en) | 1994-03-23 |
| EP0321271A2 (en) | 1989-06-21 |
| DE3888648D1 (de) | 1994-04-28 |
| ATE103329T1 (de) | 1994-04-15 |
| DE3888648T2 (de) | 1994-09-29 |
| US4987074A (en) | 1991-01-22 |
| EP0321271A3 (en) | 1990-03-21 |
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| ENDONUCLEASE | Barsomian et al.[45] Date of Patent: Mar. 12, 1991 | |
| ENDONUCLEASE | Chen et al. |