JPH0227987A - N−アセチルグルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼをコードすするcDNA - Google Patents
N−アセチルグルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼをコードすするcDNAInfo
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- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔産業上の利用分野〕
本発明はN−アセチルグルコサミン(β1−4)ガラク
トシルトランスフェラーゼをコードするc DNAに関
する。
トシルトランスフェラーゼをコードするc DNAに関
する。
はとんどの腫瘍マーカーは正常ではみられない特異構造
の糖鎖をもつか、正常では微量であるが腫瘍になると大
壷に産生される糖鎖構造である。
の糖鎖をもつか、正常では微量であるが腫瘍になると大
壷に産生される糖鎖構造である。
その構造を合成していくものは糖転移酵素であり、癌化
による腫瘍マーカーの出現は即ち、糖転移酵素の異常発
現によると考えられる。この蛋白は微量であるが故に精
製が困難であり、物質本体の解析が遅れている。これら
の問題の解決には酵素遺伝子を単離し、癌化との関係を
分子生物学的にアプローチすることが急務である。さら
に単離した遺伝子を発現系ベクターに組み換え、酵素蛋
白の活性標品が大量に得られれば、インビ)口(inv
itro)での糖鎖合成技術の開発の糸口になる。
による腫瘍マーカーの出現は即ち、糖転移酵素の異常発
現によると考えられる。この蛋白は微量であるが故に精
製が困難であり、物質本体の解析が遅れている。これら
の問題の解決には酵素遺伝子を単離し、癌化との関係を
分子生物学的にアプローチすることが急務である。さら
に単離した遺伝子を発現系ベクターに組み換え、酵素蛋
白の活性標品が大量に得られれば、インビ)口(inv
itro)での糖鎖合成技術の開発の糸口になる。
本発明の目的は、糖転移酵素の1つであるN−アセチル
グルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラ
ーゼ(以下β1−4GTと略記する)をコードするcD
NAを提供することにある。
グルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラ
ーゼ(以下β1−4GTと略記する)をコードするcD
NAを提供することにある。
本発明は第1図に示す塩基配列のうち、376番目のT
から始まり、1197番目のAで終わる塩基配列と86
%以上の相同性を有するり、N Aを含むβ1−4GT
をコードするcDNAに関する。
から始まり、1197番目のAで終わる塩基配列と86
%以上の相同性を有するり、N Aを含むβ1−4GT
をコードするcDNAに関する。
本発明のcDNAの具体例としては以下のものがあるが
、これらに限定されない。
、これらに限定されない。
(i)第1図に示す塩基配列のうち、376番目のTか
ら始まり、1197番目の八で終わる塩基配列を有する
マウスβl−4GTをコードするcDNA。
ら始まり、1197番目の八で終わる塩基配列を有する
マウスβl−4GTをコードするcDNA。
(ii)第1図に示す塩基配列のうち、1番目のAから
始まり、1197番目のAで終わる塩基配列を有するマ
ウスβ1−4GTをコードするcDNA。
始まり、1197番目のAで終わる塩基配列を有するマ
ウスβ1−4GTをコードするcDNA。
(iii )第2図に示す塩基配列のうち、373番目
のCから始まり、1194番目のCで終わる塩基配列を
有するヒトβ1−4GTをコードするcDNA。
のCから始まり、1194番目のCで終わる塩基配列を
有するヒトβ1−4GTをコードするcDNA。
(iv)第2図に示す塩基配列のうち、1番目のAから
始まり、1194番目のCで終わる塩基配列を有するヒ
トβl−4GTをコードするc D N A 。
始まり、1194番目のCで終わる塩基配列を有するヒ
トβl−4GTをコードするc D N A 。
以下に本発明のcDNAの製造法について説明する。
(1)マウスβ1−4GTをコードするc DNAマウ
スのβl−4GTをコードするc DNAは以下のよう
にして単離することができる。
スのβl−4GTをコードするc DNAは以下のよう
にして単離することができる。
マウステラトカルチノーマF9細胞は、イ、ンビトロ(
in vitro)で分化誘導可能な腫瘍細胞株であり
、分化段階に応じてβ1−4GTの酵素活性が変化する
ことが知られている。まず第一段階としてβ9細胞株と
cDNAバンクを、ウシβ1−4GT cDNAをプ
ローブとして用いてスクリーニングする。β9 cD
NAバンクはβ9細胞をレチノイン酸にて分化を誘導し
3kb以上のmRNAを抽出精製し、λgtllファー
ジに組み換えて作成できる。ウシβ1−4GTのORF
部分中の5stI−KpnIフラグメントをプローブと
して、50万個のλgtllファージ組み換え体をスク
リーニングすることにより陽性c DNAクローンを得
ることができる。得られたcDNAクローンが全長cD
NAでない場合には、上記で得られた一部に欠失部分の
有するcDNAクローンの5′末端からSmalのフラ
グメントをプローブとして作成し、同じF 9 c D
NAバンクを再スクリーニングすることにより全長cD
NAを単離することができる。全長cDNAの全塩基配
列は常法(例えば53%を用いたM13法)により決定
できる。
in vitro)で分化誘導可能な腫瘍細胞株であり
、分化段階に応じてβ1−4GTの酵素活性が変化する
ことが知られている。まず第一段階としてβ9細胞株と
cDNAバンクを、ウシβ1−4GT cDNAをプ
ローブとして用いてスクリーニングする。β9 cD
NAバンクはβ9細胞をレチノイン酸にて分化を誘導し
3kb以上のmRNAを抽出精製し、λgtllファー
ジに組み換えて作成できる。ウシβ1−4GTのORF
部分中の5stI−KpnIフラグメントをプローブと
して、50万個のλgtllファージ組み換え体をスク
リーニングすることにより陽性c DNAクローンを得
ることができる。得られたcDNAクローンが全長cD
NAでない場合には、上記で得られた一部に欠失部分の
有するcDNAクローンの5′末端からSmalのフラ
グメントをプローブとして作成し、同じF 9 c D
NAバンクを再スクリーニングすることにより全長cD
NAを単離することができる。全長cDNAの全塩基配
列は常法(例えば53%を用いたM13法)により決定
できる。
(2)ヒトβ1−4GTをコードするc DNAウシβ
1−4GT cDNAをプローブとして、ヒト胎盤由
来cDNAバンクをスクリーニングし、得られる25万
個のλgtl1組み換えファージからヒトβ1−4GT
の全長をコードするcDNAを得ることができる。
1−4GT cDNAをプローブとして、ヒト胎盤由
来cDNAバンクをスクリーニングし、得られる25万
個のλgtl1組み換えファージからヒトβ1−4GT
の全長をコードするcDNAを得ることができる。
尚、第1図及び第2図にマウスβl−4GTをコードす
るc DNA及びヒトβ1−4GTをコードするcDN
Aをそれぞれ示す。これらc DNA(マウスβ1−4
GTをコードするc DNAは1〜1197の全長cD
NA、DNAバンクGTをコードするcDNAは1〜1
194の全長cDNA)は、公知の発現系ベクターに組
み換えすることにより、β1−4GTの活性標品を大量
に合成することが可能である。ただし、組み換えによる
β1−4GTの活性標品の合成には上記全長c、 D
N Aの断片cDNAを用いることもできる。例えば、
マウスβ1−4GTをコードするcDNAの場合には、
376番目のTから1197番目のAまでのcDNAを
用いることによってもβ1−4GTの活性標品を得るこ
とができる。同様にしてヒトβ1−4GTをコードする
c DNAの場合には、373番目のCから1194番
目のCまでのcDNAを用いることによりβ1−4GT
の活性標品を得ることができる。
るc DNA及びヒトβ1−4GTをコードするcDN
Aをそれぞれ示す。これらc DNA(マウスβ1−4
GTをコードするc DNAは1〜1197の全長cD
NA、DNAバンクGTをコードするcDNAは1〜1
194の全長cDNA)は、公知の発現系ベクターに組
み換えすることにより、β1−4GTの活性標品を大量
に合成することが可能である。ただし、組み換えによる
β1−4GTの活性標品の合成には上記全長c、 D
N Aの断片cDNAを用いることもできる。例えば、
マウスβ1−4GTをコードするcDNAの場合には、
376番目のTから1197番目のAまでのcDNAを
用いることによってもβ1−4GTの活性標品を得るこ
とができる。同様にしてヒトβ1−4GTをコードする
c DNAの場合には、373番目のCから1194番
目のCまでのcDNAを用いることによりβ1−4GT
の活性標品を得ることができる。
尚、断片cDNAはプライマー伸長法、Ba131 (
制限酵素)を用いる方法により得ることができる。
制限酵素)を用いる方法により得ることができる。
又、実施例に記載したように、マウスの全長cDNAと
ヒトの全長cDNAは、塩基配列で75%の相同性を有
することから、第1図に示すマウスの1〜1197のc
DNAを塩基配列で75%以上の相同性を有するcDN
Aを前記のような発現系ベクターに組み換えることによ
って、β1−4GTの活性標品を得ることができる。さ
らに、第1図に示すマウスの376〜11g7のcDN
Aと第2図に示すヒトの373〜1194のcDNAと
は、86%の相同性があり、第1図に示すマウスの37
6〜1197のcDNAと80%以上の相同性を有する
cDNAを発現系ベクターに組み換えても、β1−4G
Tの活性標品を得ることができる。
ヒトの全長cDNAは、塩基配列で75%の相同性を有
することから、第1図に示すマウスの1〜1197のc
DNAを塩基配列で75%以上の相同性を有するcDN
Aを前記のような発現系ベクターに組み換えることによ
って、β1−4GTの活性標品を得ることができる。さ
らに、第1図に示すマウスの376〜11g7のcDN
Aと第2図に示すヒトの373〜1194のcDNAと
は、86%の相同性があり、第1図に示すマウスの37
6〜1197のcDNAと80%以上の相同性を有する
cDNAを発現系ベクターに組み換えても、β1−4G
Tの活性標品を得ることができる。
本発明のβ1−4GTをコードするcDNAはβ1−4
GTの活性標品を提供する上で極めて有用であり、β1
−4GTの活性標品を提供することにより糖鎖をインビ
トロで合成することが可能となる。
GTの活性標品を提供する上で極めて有用であり、β1
−4GTの活性標品を提供することにより糖鎖をインビ
トロで合成することが可能となる。
以下本発明を実施例によりさらに説明する。
実施例1
ヒトβ1−40Tをコードする全長cDNAの単離と全
塩基配列及び蛋白−次構造の決定ヒト胎盤より抽出され
たpolyA ”m RN Aよりランダムプライマー
法によりc DNAを0合成し、λgtllファージ組
み込むことにより作成されたcDNAバンクを、ウシβ
1−40TをコードするcDNAをプローブとして、ス
クリーニングした。cDNA内の蛋白コーディング部位
である5stI−KpnIフラグメント(約0.9 k
b)を、”P −d CT Pにてランダムプライマー
法でラベルしプローブとした(第3図)。
塩基配列及び蛋白−次構造の決定ヒト胎盤より抽出され
たpolyA ”m RN Aよりランダムプライマー
法によりc DNAを0合成し、λgtllファージ組
み込むことにより作成されたcDNAバンクを、ウシβ
1−40TをコードするcDNAをプローブとして、ス
クリーニングした。cDNA内の蛋白コーディング部位
である5stI−KpnIフラグメント(約0.9 k
b)を、”P −d CT Pにてランダムプライマー
法でラベルしプローブとした(第3図)。
c DNAバンク(λgtllファージバンク)の25
0.0OOPFUを宿主菌B、Co11 Y1088に
37℃、15分間吸着させ、軟寒天(0,7%Agar
) L B培地に懸濁した。これを10CIX14C1
1の角型シャーレのLB培地1.0枚に均等にまいた。
0.0OOPFUを宿主菌B、Co11 Y1088に
37℃、15分間吸着させ、軟寒天(0,7%Agar
) L B培地に懸濁した。これを10CIX14C1
1の角型シャーレのLB培地1.0枚に均等にまいた。
37℃、8時間培養してファージプラークを出現させた
。
。
1MNaC1液にあらかじめ浸しさらに風乾しておいた
ニトロセルロースフィルター(以下NcF)9X13C
1lを、ファージプラーク平板にかぶせ30秒放置する
ことによりファージをNCFにうつしとった。さらに同
じ平板に2枚目のNCFを1分間放置しファージをうつ
しとった。このようにスクリーニングはすべてデュプリ
ケートして行われた。
ニトロセルロースフィルター(以下NcF)9X13C
1lを、ファージプラーク平板にかぶせ30秒放置する
ことによりファージをNCFにうつしとった。さらに同
じ平板に2枚目のNCFを1分間放置しファージをうつ
しとった。このようにスクリーニングはすべてデュプリ
ケートして行われた。
NCFをさらに0.5 M NaH,1,5M Na
C1液にて5分間アルカリ処理を施こし、0.5M T
ris−HC1pfl?、5、■、5M NaC1液
にて中和した。風乾後、80℃にてベーキングし、プレ
ハイブリダイゼーションをバッファー組成、ホルムアミ
ド50%、SD31%、デンハルト(口enhardt
)液0.1%、デキストランサルフエイト5%、ポリA
0.05%を使用して、42℃で一昼夜行った。
C1液にて5分間アルカリ処理を施こし、0.5M T
ris−HC1pfl?、5、■、5M NaC1液
にて中和した。風乾後、80℃にてベーキングし、プレ
ハイブリダイゼーションをバッファー組成、ホルムアミ
ド50%、SD31%、デンハルト(口enhardt
)液0.1%、デキストランサルフエイト5%、ポリA
0.05%を使用して、42℃で一昼夜行った。
cDNAプローブの調整;pUc19ベクターにサブク
ローンした後、プラスミドとしてCsC1密度勾配によ
り超遠心機にて精製した。制限酵素で切断後、0.7%
低融点アガロースにて電気泳動分離し、目的のバンドを
切り出しプローブ用DNAとして精製した。約50nH
のプローブDNAをマルチランダムプライマーキット法
(アマ−ジャム社製)をもちいて32pにて標識した。
ローンした後、プラスミドとしてCsC1密度勾配によ
り超遠心機にて精製した。制限酵素で切断後、0.7%
低融点アガロースにて電気泳動分離し、目的のバンドを
切り出しプローブ用DNAとして精製した。約50nH
のプローブDNAをマルチランダムプライマーキット法
(アマ−ジャム社製)をもちいて32pにて標識した。
上記プレハイブリダイゼーション用バッファーと同じ組
成の液にて標識プローブを稀釈してハイブリダイゼーシ
ョンを42℃で一昼夜行った。最終的に55℃、0、2
X 5SPEのストリンゼンシーにてNCFを洗浄後
、オートラジオグラフィーを行い、陽性のクローンを拾
った。2次、3次、4次スクリーニングとファージ数を
順にl/10数に減らしていき、4次スクリーニングで
完全に単一クローンとした。
成の液にて標識プローブを稀釈してハイブリダイゼーシ
ョンを42℃で一昼夜行った。最終的に55℃、0、2
X 5SPEのストリンゼンシーにてNCFを洗浄後
、オートラジオグラフィーを行い、陽性のクローンを拾
った。2次、3次、4次スクリーニングとファージ数を
順にl/10数に減らしていき、4次スクリーニングで
完全に単一クローンとした。
λgtllファージのミニプレプ法:Y1088宿主菌
を前夜よりYT培地にておこしておく。菌液1−に、フ
ァージをM、0,1. 0.03〜0.2の範囲で加え
、37℃20分吸着させた後、YT培地を15−加えて
37℃で13〜14時間振とう培養した。
を前夜よりYT培地にておこしておく。菌液1−に、フ
ァージをM、0,1. 0.03〜0.2の範囲で加え
、37℃20分吸着させた後、YT培地を15−加えて
37℃で13〜14時間振とう培養した。
遠心(3000rpm15分)後、上清をとりDE52
を等量論え30分間回転板にて混合する。遠心(300
0rpm15分)、上清を取った。5MNaCβを17
8容量、冷インプロパツールを27/40容徽加えて混
合し、−20℃で2時間放置した。4℃にて遠心(30
0Grpm15分)後、上清を揄て沈渣のファージを1
mlの70%エタノールに懸濁した後、エッペンドルフ
チューブにうつす。遠心(6000rpm 5分)後、
上清を檜で、沈渣を乾燥し400μl1TEバツフアー
に懸濁する。この後は、フェノール処理2回、フェノー
ル/クロロホルム処理を行いエタノール沈殿によりファ
ージDNAを精製した。
を等量論え30分間回転板にて混合する。遠心(300
0rpm15分)、上清を取った。5MNaCβを17
8容量、冷インプロパツールを27/40容徽加えて混
合し、−20℃で2時間放置した。4℃にて遠心(30
0Grpm15分)後、上清を揄て沈渣のファージを1
mlの70%エタノールに懸濁した後、エッペンドルフ
チューブにうつす。遠心(6000rpm 5分)後、
上清を檜で、沈渣を乾燥し400μl1TEバツフアー
に懸濁する。この後は、フェノール処理2回、フェノー
ル/クロロホルム処理を行いエタノール沈殿によりファ
ージDNAを精製した。
ファージDNAをECoRIで切断後、電気泳動にかけ
挿入された。cDNAの結果を得た。さらにS ac
I %K pn I、SmaIなどの制限酵素を組みあ
わせてこの時点で大まかな制限酵素地図を作成した。こ
の電気泳動ゲルをナイロンフィルターにブロッティング
し、ウシcDNAを各部分とノ\イブリダイズすること
により、18個の各りC−ンの位置関係を確認した。そ
れぞれのクローンを天童培養によりDNAをm製し、E
coRiで切断した後、このEcoRI断片をpUC1
9ベクターにすべてサブクローンした。
挿入された。cDNAの結果を得た。さらにS ac
I %K pn I、SmaIなどの制限酵素を組みあ
わせてこの時点で大まかな制限酵素地図を作成した。こ
の電気泳動ゲルをナイロンフィルターにブロッティング
し、ウシcDNAを各部分とノ\イブリダイズすること
により、18個の各りC−ンの位置関係を確認した。そ
れぞれのクローンを天童培養によりDNAをm製し、E
coRiで切断した後、このEcoRI断片をpUC1
9ベクターにすべてサブクローンした。
λgillファージよりpUc19プラスミドへのサブ
クローニング;大景精製したファージDNAをEcoR
Iで切断後、LMPアガロース電気泳動にて分離し切り
出し精製した。pUc19プラスミドをEC0RIで切
断、cDNAのEcoRIフラグメントとpUcL9の
DNA量をモル数で合わせ、20μ!容量にて10単位
の74 ’DNAリガーゼの存在下に16℃−昼夜保
温した。前夜より宿主菌HBIOIをおこしておき、使
用2時間前にLB培地にて20倍稀釈し振とう培養する
。
クローニング;大景精製したファージDNAをEcoR
Iで切断後、LMPアガロース電気泳動にて分離し切り
出し精製した。pUc19プラスミドをEC0RIで切
断、cDNAのEcoRIフラグメントとpUcL9の
DNA量をモル数で合わせ、20μ!容量にて10単位
の74 ’DNAリガーゼの存在下に16℃−昼夜保
温した。前夜より宿主菌HBIOIをおこしておき、使
用2時間前にLB培地にて20倍稀釈し振とう培養する
。
その後、遠心3.00 Orpm 15分にて菌をおと
し上清を172量の50mM冷CaC1xといれかえる
。さらに遠心後、上清を1720量の50 mlJ C
aC12に懸濁する。この菌液0.3 Wd2を前述の
DNA液に加え混合後40分間氷上に放置し、42℃
2分間急速に熱を加える。この菌液をLB平板(50μ
g/mlアンピシリン、X−gal 200 D g/
ml、IPTG100μg / dを含む)上にコンラ
ージ棒にて均等にひろげ、−昼夜37℃で培養、出現し
てくるコロニーのうち白色コロニーをひろった。確かに
cDNAを挿入されたか否かを確認のために、標識cD
NAをもちいてコロニーハイブリダイゼーションをも行
った。
し上清を172量の50mM冷CaC1xといれかえる
。さらに遠心後、上清を1720量の50 mlJ C
aC12に懸濁する。この菌液0.3 Wd2を前述の
DNA液に加え混合後40分間氷上に放置し、42℃
2分間急速に熱を加える。この菌液をLB平板(50μ
g/mlアンピシリン、X−gal 200 D g/
ml、IPTG100μg / dを含む)上にコンラ
ージ棒にて均等にひろげ、−昼夜37℃で培養、出現し
てくるコロニーのうち白色コロニーをひろった。確かに
cDNAを挿入されたか否かを確認のために、標識cD
NAをもちいてコロニーハイブリダイゼーションをも行
った。
pUc19にサブクローンされたcDNAを大量に得る
ために、各プラスミドクローンをもつ菌をそれぞれ11
のLB−アンピシリン培養液にて一昼夜培養し、アルカ
リ法にてプラスミドを精製した。各種制限酵素にて切断
し制限酵素地図を作成した(第4図)。この結果よりM
13ファージに組み換えるプロトコールを検討し塩基配
列のシーフェンスを行った。
ために、各プラスミドクローンをもつ菌をそれぞれ11
のLB−アンピシリン培養液にて一昼夜培養し、アルカ
リ法にてプラスミドを精製した。各種制限酵素にて切断
し制限酵素地図を作成した(第4図)。この結果よりM
13ファージに組み換えるプロトコールを検討し塩基配
列のシーフェンスを行った。
M13ファージジデオキシ法による全塩基配列シークエ
ンス;M13ファージのmp18及びmp19をもちい
た。各RF DNAを組み換えるべき制限酵素部位で
切断した。pUc19に組み込まれたcDNAを目的の
制限酵素部位で切断した。両者をモル比を合わせて混合
し、T4リガーゼにて16℃−昼夜、結合反応を行った
。前述の様に、宿主菌JMIOIにトランスフェクショ
ンし、ソフトアガー及び指示菌JMI 01と混合し、
LB平板(X−ガル、IPTGを含む)上に均一にひろ
げ、37℃−昼夜培養した。
ンス;M13ファージのmp18及びmp19をもちい
た。各RF DNAを組み換えるべき制限酵素部位で
切断した。pUc19に組み込まれたcDNAを目的の
制限酵素部位で切断した。両者をモル比を合わせて混合
し、T4リガーゼにて16℃−昼夜、結合反応を行った
。前述の様に、宿主菌JMIOIにトランスフェクショ
ンし、ソフトアガー及び指示菌JMI 01と混合し、
LB平板(X−ガル、IPTGを含む)上に均一にひろ
げ、37℃−昼夜培養した。
YT培養液5r111に白プラークをひろいあげ、宿主
菌JMI 01を加え8時間振とう培養した。遠心(3
000rpm、i5分)後、上清をとり65℃、15分
の熱処理を加えた。この5μlをフィルターにとり、M
13ファージに目的のcDNAが挿入されているかどう
か確かめるために、標識cDNAにてハイブリダイズを
行った。その結果陽性に出たM13ファージの上清のみ
をシーフェンスにもちいた。
菌JMI 01を加え8時間振とう培養した。遠心(3
000rpm、i5分)後、上清をとり65℃、15分
の熱処理を加えた。この5μlをフィルターにとり、M
13ファージに目的のcDNAが挿入されているかどう
か確かめるために、標識cDNAにてハイブリダイズを
行った。その結果陽性に出たM13ファージの上清のみ
をシーフェンスにもちいた。
上清1rn1に15%ポリエチレンゲルコール2.5M
NaCβ液を250μl加え混合後、氷上に30分放
置し、遠心(15,00Orpm、 15分)する。
NaCβ液を250μl加え混合後、氷上に30分放
置し、遠心(15,00Orpm、 15分)する。
上清を先細のパスツールピペットにて完全に吸い出し、
沈渣のファージを風乾させる。フェノール処理、フェノ
ール/クロロホルム処理、クロロホルム処理後、エタノ
ール沈澱を2回行う。乾燥後に10μlのTEバッファ
ーにとかし、ssDNAとして4℃に保存した。
沈渣のファージを風乾させる。フェノール処理、フェノ
ール/クロロホルム処理、クロロホルム処理後、エタノ
ール沈澱を2回行う。乾燥後に10μlのTEバッファ
ーにとかし、ssDNAとして4℃に保存した。
ssD N A 4 u 1 、LO4JJ 1 、ブ
ライ7−(0,5pmol) 1 μl 、T Mバッ
フy (0,1M)リスHClpH75,0,1M
MgCl 2> 1μlを混和し、70℃、10分加
熱し、少くとも30分以上かけてゆっくりと室温にもど
す。遠心して壁面についている水滴を底におとす。2μ
m(20μCi)の[”S〕−d ATPを加えポルテ
ックス後遠心し、氷上に置く。この間に、A、G、C,
1’、それぞれの混合物を4μmずつ分注しておく。最
初のサンプルに1 unit/μlのクレノーフラッグ
メント(Klenowfragment) 1 、!j
1を加えて軽く遠心後に、2.5〜3.0μβをA、
G、C,T混合物のそれぞれに加え軽く遠心で混合して
反応を開始する。室温で20分間放置後、チエイス溶液
(chase 5olution)1μβを加え軽く遠
心し、さらに室温で20分間放置する。スピードバック
(Spaad vac)を用いて完全に乾燥させる。5
μlのストップ溶液 (Stopsolution)を
加えボーテックス (Vortex)にてよく溶かす。
ライ7−(0,5pmol) 1 μl 、T Mバッ
フy (0,1M)リスHClpH75,0,1M
MgCl 2> 1μlを混和し、70℃、10分加
熱し、少くとも30分以上かけてゆっくりと室温にもど
す。遠心して壁面についている水滴を底におとす。2μ
m(20μCi)の[”S〕−d ATPを加えポルテ
ックス後遠心し、氷上に置く。この間に、A、G、C,
1’、それぞれの混合物を4μmずつ分注しておく。最
初のサンプルに1 unit/μlのクレノーフラッグ
メント(Klenowfragment) 1 、!j
1を加えて軽く遠心後に、2.5〜3.0μβをA、
G、C,T混合物のそれぞれに加え軽く遠心で混合して
反応を開始する。室温で20分間放置後、チエイス溶液
(chase 5olution)1μβを加え軽く遠
心し、さらに室温で20分間放置する。スピードバック
(Spaad vac)を用いて完全に乾燥させる。5
μlのストップ溶液 (Stopsolution)を
加えボーテックス (Vortex)にてよく溶かす。
90℃で2〜3分加熱後、素早く2.5μlをgelに
アプライし電気泳動する。
アプライし電気泳動する。
シークエンスミ気泳動;以下の様に試薬を調整した。(
1)40%アクリルアミドストック溶液;190gアク
リルアミド、10gビスアクリルアミドにdd LOを
加え500dにする。(2)高塩ゲル溶液;50g尿素
、10 gサッカロース、15−40%アクリルアミド
ストック溶液、25rnl 10xTBE、BPB粉末
を少々、以上にdd’ )+20を加え、100rnl
にした後に、フィルター(0,45um)を通し、4℃
に保存、(3)低温ゲル溶液;250g尿素、75rn
140%アクリルアミドストック溶液、25mj!10
xTBE、以上にdd 020を加え、500−にした
後に、フィルター(0,45μm)を通し4℃で保存。
1)40%アクリルアミドストック溶液;190gアク
リルアミド、10gビスアクリルアミドにdd LOを
加え500dにする。(2)高塩ゲル溶液;50g尿素
、10 gサッカロース、15−40%アクリルアミド
ストック溶液、25rnl 10xTBE、BPB粉末
を少々、以上にdd’ )+20を加え、100rnl
にした後に、フィルター(0,45um)を通し、4℃
に保存、(3)低温ゲル溶液;250g尿素、75rn
140%アクリルアミドストック溶液、25mj!10
xTBE、以上にdd 020を加え、500−にした
後に、フィルター(0,45μm)を通し4℃で保存。
gel 5ize350 X 425 X厚さ0.4
mm (I B I社製装置)のgelを作製した。(
1) 65−の低温ゲル溶液に120μβの25%過硫
酸アンモニウムと70μITEMEDを加える。 (2
) 15 rd高温ゲル溶液に16μm25%過硫酸ア
ンモニウムと20μITEMEDを加える。まず12〜
13FR1の(1)を25dのピペットで吸い上げ、続
いてω)を同量吸い上げる。45℃に傾けたプレートの
端より静かに流し込む。さらに残りの(1]をプレート
の中央より流し込み、プレートをねかせコームを差し込
み、ゲル化するのを待つ。コームをぬき、前述のサンプ
ルをのせ電気泳動を74Wで行った。泳動後、5%メタ
ノール75%酢酸溶液に20〜30分間浸して尿素を除
く。ゲルを3MMペーパーにうつしとりラップをかけて
80℃で乾燥させた後、コダック社製XAR−5フィル
ムに感光させた。
mm (I B I社製装置)のgelを作製した。(
1) 65−の低温ゲル溶液に120μβの25%過硫
酸アンモニウムと70μITEMEDを加える。 (2
) 15 rd高温ゲル溶液に16μm25%過硫酸ア
ンモニウムと20μITEMEDを加える。まず12〜
13FR1の(1)を25dのピペットで吸い上げ、続
いてω)を同量吸い上げる。45℃に傾けたプレートの
端より静かに流し込む。さらに残りの(1]をプレート
の中央より流し込み、プレートをねかせコームを差し込
み、ゲル化するのを待つ。コームをぬき、前述のサンプ
ルをのせ電気泳動を74Wで行った。泳動後、5%メタ
ノール75%酢酸溶液に20〜30分間浸して尿素を除
く。ゲルを3MMペーパーにうつしとりラップをかけて
80℃で乾燥させた後、コダック社製XAR−5フィル
ムに感光させた。
以上の方法を用いて、ヒトβ1−4GT cDNAの
全塩基配列を決定した(第2図)。
全塩基配列を決定した(第2図)。
実施例2
造の決定
ウシβl−4GT cDNAクローンの5stI−K
pn IフラグメントがF 9 c DNAバンクの
スクリーニングにプローブとして用いられた。方法につ
いては実施例1のヒトc DNAバンクのスクリーニン
グとまったく同様である。
pn IフラグメントがF 9 c DNAバンクの
スクリーニングにプローブとして用いられた。方法につ
いては実施例1のヒトc DNAバンクのスクリーニン
グとまったく同様である。
最初のスクリーニングで、5GT個のファージ数から3
個の陽性クローンを得た。前述の如く制限酵素地図を作
成した。このうち、2個は同じ地図を示し、長さもほと
んど同じであった(λmGT−10と命名)が、1個p
mG T −2は一部異なる地図を示した。前者のうち
最も長いクローンでも全長をコードしていないことが判
明したので、5′末端のEcoRI −SmaIフラグ
メントを切り出し精製し、同じF9 cDNAバンク
を再スクリーニングした。5GT個のファージのうち、
4個の陽性クローンを得た後、型通り制限酵素地図の作
成、及び全長cDNAであるヒトβ1−4 GTc D
N Aの各部分とハイブリダイズを行い、全長をコー
ドすると思われるcDNAクローン(λmGT−5)の
塩基配列決定を行った(第1図)。
個の陽性クローンを得た。前述の如く制限酵素地図を作
成した。このうち、2個は同じ地図を示し、長さもほと
んど同じであった(λmGT−10と命名)が、1個p
mG T −2は一部異なる地図を示した。前者のうち
最も長いクローンでも全長をコードしていないことが判
明したので、5′末端のEcoRI −SmaIフラグ
メントを切り出し精製し、同じF9 cDNAバンク
を再スクリーニングした。5GT個のファージのうち、
4個の陽性クローンを得た後、型通り制限酵素地図の作
成、及び全長cDNAであるヒトβ1−4 GTc D
N Aの各部分とハイブリダイズを行い、全長をコー
ドすると思われるcDNAクローン(λmGT−5)の
塩基配列決定を行った(第1図)。
実施例2のマウス全長βl−4GT[クローン(pmG
T −5)Eの塩基配列(1〜1197)を実施例1
のヒト全長β1−4GT cDNA (1〜1194
)と比較した結果では、塩基配列で約75%、アミノ酸
配列で約83%の相同性があった。さらにC末端側20
0個のアミノ酸はきわめて相同性が高く(約90%)、
マウスβ1−4GTの376〜1197の塩基配列とヒ
トβ1−4CTの373〜1194の塩基配列とは約8
0%の相同性があった。
T −5)Eの塩基配列(1〜1197)を実施例1
のヒト全長β1−4GT cDNA (1〜1194
)と比較した結果では、塩基配列で約75%、アミノ酸
配列で約83%の相同性があった。さらにC末端側20
0個のアミノ酸はきわめて相同性が高く(約90%)、
マウスβ1−4GTの376〜1197の塩基配列とヒ
トβ1−4CTの373〜1194の塩基配列とは約8
0%の相同性があった。
チョウ−77ス−v :/ (Chow−Fasman
)のプログラムを用いて蛋白二次構造を計算したが、相
同性の高い部分はα−ヘリックス、β−シートに富み、
逆に、低い部分は、いわゆるランダムコイル構造をとる
結果を得た。マウスβl−4GTもやはりN末端に18
個の疎水性アミノ酸よりなるアンカ一部をもち、開始コ
ドン、停止コドンともヒトcDNAと同じ位置にあった
が途中、ヒトと相同性の少ない部分に1個のアミノ酸の
インサージョンがあり、全アミノ酸敗400個であり、
計算されるM、W、 は48KDaである。このこと
からも、異種間のアミノ酸配列で相同性の低い部分は、
酵素の基質特異性、活性中心部位とは関係のない部位と
思われる(第5図)。
)のプログラムを用いて蛋白二次構造を計算したが、相
同性の高い部分はα−ヘリックス、β−シートに富み、
逆に、低い部分は、いわゆるランダムコイル構造をとる
結果を得た。マウスβl−4GTもやはりN末端に18
個の疎水性アミノ酸よりなるアンカ一部をもち、開始コ
ドン、停止コドンともヒトcDNAと同じ位置にあった
が途中、ヒトと相同性の少ない部分に1個のアミノ酸の
インサージョンがあり、全アミノ酸敗400個であり、
計算されるM、W、 は48KDaである。このこと
からも、異種間のアミノ酸配列で相同性の低い部分は、
酵素の基質特異性、活性中心部位とは関係のない部位と
思われる(第5図)。
第1図はマウスβ1−4GTをコードするcONAの塩
基配列及びアミノ酸配列、第2図はヒトβ1−40Tと
コードするcDNAの塩基配列及びアミノ酸配列、第3
図はウシβ1−4GTcDNAの制限酵素地図、第4図
はヒトβ1−4GTcDNAの制限酵素地図、第5図は
ヒト及びマウスβ1−4GTのアミノ酸配列の相同性を
示す。
基配列及びアミノ酸配列、第2図はヒトβ1−40Tと
コードするcDNAの塩基配列及びアミノ酸配列、第3
図はウシβ1−4GTcDNAの制限酵素地図、第4図
はヒトβ1−4GTcDNAの制限酵素地図、第5図は
ヒト及びマウスβ1−4GTのアミノ酸配列の相同性を
示す。
Claims (2)
- (1)第1図に示す塩基配列のうち、376番目のTか
ら始まり、1197番目のAで終わる塩基配列と86%
以上の相同性を有するDNAを含むN−アセチルグルコ
サミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼを
コードするcDNA。 - (2)第1図に示す塩基配列のうち、1番目のAから始
まり、1197番目のAで終わる塩基配列と75%以上
の相同性を有するDNAを含むN−アセチルグルコサミ
ン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼをコー
ドするcDNA。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP17634688A JPH0227987A (ja) | 1988-07-15 | 1988-07-15 | N−アセチルグルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼをコードすするcDNA |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP17634688A JPH0227987A (ja) | 1988-07-15 | 1988-07-15 | N−アセチルグルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼをコードすするcDNA |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH0227987A true JPH0227987A (ja) | 1990-01-30 |
Family
ID=16011990
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP17634688A Pending JPH0227987A (ja) | 1988-07-15 | 1988-07-15 | N−アセチルグルコサミン(β1−4)ガラクトシルトランスフェラーゼをコードすするcDNA |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH0227987A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1999040205A1 (en) * | 1998-02-04 | 1999-08-12 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Glycosyltransferase and dna encoding the same |
-
1988
- 1988-07-15 JP JP17634688A patent/JPH0227987A/ja active Pending
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1999040205A1 (en) * | 1998-02-04 | 1999-08-12 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Glycosyltransferase and dna encoding the same |
| US6475761B1 (en) | 1998-02-04 | 2002-11-05 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Glycosyltransferase and DNA encoding the same |
| US6830908B2 (en) | 1998-02-04 | 2004-12-14 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Glycosyltransferase and DNA encoding the same |
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