JPH03187382A - ホスホリパーゼdの遺伝情報を有するdna及びその用途 - Google Patents

ホスホリパーゼdの遺伝情報を有するdna及びその用途

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JPH03187382A
JPH03187382A JP1325355A JP32535589A JPH03187382A JP H03187382 A JPH03187382 A JP H03187382A JP 1325355 A JP1325355 A JP 1325355A JP 32535589 A JP32535589 A JP 32535589A JP H03187382 A JPH03187382 A JP H03187382A
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phospholipase
dna
streptomyces
transformant
escherichia
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Kazuo Houriyou
一生 芳陵
Junzo Mizoguchi
溝口 順三
Masayasu Takahara
高原 昌靖
Shigeyuki Imamura
茂行 今村
Teruhiko Beppu
別府 輝彦
Sueji Horinouchi
末治 堀之内
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Toyo Jozo KK
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Toyo Jozo KK
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    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C12N15/76Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Actinomyces; for Streptomyces
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
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    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 〔産業上の利用分野〕 の製造法に関する。
〔従来の技術〕
ホスホリパーゼD (Phosphatidylcho
linePhosphatfdohydrolase 
;以下PLDと略すことがある)は、例えばリン脂質で
あるレシチン(ホスファチジルコリン)のリン酸とコリ
ン残基とのエステル結合を分解してホスファチジン酸(
Phosphatidic acid)とコリンを遊離
する酵素であって、キャベツ、ホウレンソウ、カブ、ジ
ャガイモ、レタス等の葉、ニンジン、サトウダイコン、
ヒート等の根、大麦芽、綿実、緑豆モヤシ、エントウ豆
等の植物組織(酵素ハンドブック451−452頁参照
)、ストレプトマイセス属(特公昭52−39918号
、特公昭60−4716号公報参照)やノカルデイオプ
シス属(特公昭63−62195号公報参照)等の微生
物にその存在を知られ、また、ストレプトマイセス・ク
ロモフスh 玉(Streptomyces chro
mofuscus)の培養液から抽出されたホスホリパ
ーゼDの精製についての報告がなされている。(J、 
Biochem、  85. 7995 (1979)
) ホスホリパーゼDは血中リン脂質測定試薬への利用のほ
か、リン脂質の加水分解やホスホリパーゼの可逆反応を
利用する塩基交換反応による誘導体の製造に利用されて
いる酵素であることが知られている。(特開昭63−3
6790号、特開昭61−236793号公報参照) 〔発明が解決しようとする問題点〕 上記の如くホスホリパーゼD生産菌は種々報告されてい
るが、これら種々生産菌によるホスホリパーゼDの基質
に対する特異性には個々差異があり、さらにホスホリパ
ーゼDのアミノ酸配列も不明であり、ましてや個々生産
菌によるホスホリパーゼDがどのようなアミノ酸配列で
あるかは全く推定できないものであった。このような状
況下、特にストレプトマイセス・クロモフスカス(S。
chromofuscus)培養液から抽出し、精製し
て得たホスホリパーゼDの生産効率は低いため、効率の
良い高純度かつ高品質ホスホリパーゼD生産法が望まれ
ていた。
また、ホスホリパーゼDを構成するポリペプチドの一次
構造、及び、該酵素のアミノ酸配列をコードするDNA
の塩基配列については未発表であった。
従って、ホスホリパーゼDを構成するポリペプチドの一
次構造の決定、該酵素のア【ノ酸配列をコードするDN
Aの塩基配列の決定、及び、遺伝子工学による該酵素の
生産が望まれていた。
〔問題点を解決するための手段〕
本発明者らは、上記問題点に関し鋭意研究の結果、上記
ストレプトマイセス・クロモフスヵス(S、 chro
+mofuscus)に属する微生物よりホスホリパー
ゼDを構成するポリペプチドのアミノ酸配列をコードす
る遺伝子を単離精製し、該酵素を構成するポリペプチド
の一次構造の決定、及び、該酵素のアミノ酸配列をコー
ドするDNAの塩基配列を決定した。
また、該ホスホリパーゼD遺伝子を任意のベクターに導
入し、好ましい宿主−ベクター系にて宿主微生物を形質
転換体とし、該形質転換体を培養して、ホスホリパーゼ
D遺伝子情報を発現させ、該培養物からホスホリパーゼ
Dを確認し、優れた工業的生産方法を確立し、本発明を
完成するに至った。
すなわち、本発明は以下の通りである。
N末端側より第1図で表されるアミノ酸配列をコードす
るDNA。
N末端側より第1図で表されるアミノ酸配列を保持する
ことを特徴とするベクター 宿主が、エシェリヒア(Escherichia)属、
玉上しブトマイセス(Streptomyces)属、
サツカロミセス(Saccharomyces)属また
はバチルス(Bacillus)属に属する微生物であ
って、宿主にとって外来性であるN末端側より第1図で
表わされるアミノ酸配列をコードするDNAを保持する
ことを特徴とす示すアミノ酸配列、 宿主にとって外来性であるN末端側より第1図で表わさ
れるアミノ酸配列をコードするDNAを保持す示すアミ
ノ酸配列をコードするDNAの遺伝情報を保持する形質
転換体を培養して、該培養物からホスホリパーゼDを採
取することを特徴とするホスホリパーゼDの製造法。
本発明の第1図で表されるアミノ酸配列をコードするD
NAにおいて、その第1図にて表記されるアミノ酸配列
のN末端側及びC末端側はアミノ酸残基またはポリペプ
チド残基を含む場合であってもよく、N末端側であるA
laの上流にはさらに一個または複数のアミノ酸残基を
有してもよく、そのアミノ酸残基としては開始コドンま
たはシグナルペプチドが挙げられ、またC末端側のVa
lの下流には、さらに−個以上のアミノ酸残基を有して
もよい。
さらに、本発明のホスホリパーゼDを構成するアミノ酸
配列は第1図で表わされるアミノ酸残基からなるポリペ
プチドによる酵素活性発現と同様の効果を発現する第1
図中のアミノ酸配列の一部であってもよい。
本発明の第1図で表わされるアミノ酸配列をコードする
新規なりNAは、そのN末端側及びC末端側のアミノ酸
残基またはポリペプチド残基を含めたアミノ酸配列の各
アミノ酸に対応する一連のコドンのうちいずれか1個の
コドンからなるDNAであればよい。
さらに、本発明のホスホリパーゼDを構成するアくノ酸
配列をコードするDNAは第1図で表わされるアミノ酸
配列からなるポリペプチドによる酵素活性発現と同様の
効果を発現する第1図中の一部分のアミノ酸配列をコー
ドするDNAであってもよい。
上記DNAの代表例として、5′末端側より第2図で表
わされる塩基配列を有するDNAを挙げることができる
。該DNAは、5′末端の上流側にアミノ酸をコードす
るコドンを1個以上有したものでもよく、TAA、TA
G、及びTGA以外のコドンであればよい。さらに、好
ましくはATG、GTG、それら以外の開始コドン又は
シグナルペプチドに対応するコドンを有したものを挙げ
ることができる。3′末端たるGTGの下流側には、ア
ミノ酸をコードするコドンを1個以上有するか、又は翻
訳終止コドンを有するかのいずれでもよく、更に、その
3′末端側にアミノ酸をコードするコドンを1個以上有
する場合には、このアミノ酸をコードするコドンの3′
末端に翻訳終止コドンを有することが好ましい。
第1図に示されたアミノ酸配列をコードするDNA又は
第2図に示されたDNAは、例えば、ホスホリパーゼD
を生産するホスホリパーゼD遺伝子の供与体である微生
物より該微生物のDNAを分離精製した後、超音波、制
限酵素などを用いて切断した該DNAと切断してリニヤ
−にした発現ベクターとを両DNAの平滑または接着末
端部においてDNAリガーゼなどにより結合閉環させ、
斯くして得られた組み換えDNAベクターを複製可能な
宿主微生物に移入した後、ベクターのマーカーとホスホ
リパーゼDの活性とを指標としてスクリーニングして取
得した組み換えDNAベクターを保持する微生物を培養
し、該培養菌体から該組み換えDNAベクターを分離精
製し、次いで該組み換えDNAベクターからホスホリパ
ーゼD遺伝子であるDNAを取得すればよい。
DNAの供与体である供与微生物としては放線菌類、好
ましくはストレプトマイセス・クロモフスカス(S、 
chromofuscus) A −0848菌株(F
ERM P−3519,BP−361)又はその同一菌
株を再度寄託したストレプトマイセス・クロモフスカス
A−0848(FERM ’ BP−,2,6と−27
)を利用するとよい。
該菌株の菌学的性状、培養手段、精製手段については特
公昭60−4716号公報(第15頁29+1jl下か
ら3行乃至第17頁34欄4行)に記載の通りである。
遺伝子の供与体である微生物に由来するDNAを採取す
るには以下の如く行う。
例えば、上述の供与体である微生物を、液体培地で約1
−3日間通気撹拌培養し、得られる培養物を遠心分離し
て集菌し、次いでこれを溶菌させることによってホスホ
リパーゼD遺伝子を含有する溶菌物を調整する。溶菌方
法としては、例えばリゾチームやβ−グルカナーゼなど
の細胞壁溶解酵素による処理が施され、必要によりプロ
テアーゼなどの他の酵素やラウリル硫酸ナトリウムなど
の界面活性剤が併用され、さらに細胞壁の物理的破壊法
である凍結融解(特開昭63−185371号公報参照
)やフレンチプレス処理を上述の溶菌法との組み合わせ
で行ってもよい。
この様にして得られた溶菌物からDNAを分離精製する
には、常法に従って、例えばフェノール抽出による除蛋
白処理、プロテアーゼ処理、リボヌクレアーゼ処理、ア
ルコール沈澱、遠心分離などの方法を適宜組み合わせる
ことにより行うことができる。
分離精製された微生物DNAを切断する方法は、例えば
、超音波処理、制限酵素処理などにより行うことができ
るが、得られるDNA断片とベクターとの結合を容易な
らしめるため、制限酵素、とりわけ特定ヌクレオチド配
列に作用する。例えば、Sai T、 Sac I 、
 Kpn  I 、 Xho T、Mlu  Iなどの
■型制限酵素が適している。
ベクターとしては、宿主微生物体内で自律的に増殖しう
るファージ又はプラスミドから遺伝子組み換え用として
構築されたものが適している。
ファージベクターとしては、例えば、エシェリヒア・コ
リ(Escherichia cali)を宿主微生物
とする場合にはλgt・λC9λgt・λ8などが使用
できる。
また、プラスミドベクターとしては、例えば、エシェリ
ヒア−:2 ’J (Escherichia col
t)を宿主微生物とする場合には、プラスミドpBR3
22,pBR325、pACYC184,pUc 12
. pUc 13. pUc 1B、 pUc19、 
pUC11B、 pIN  Iなどが、同様にバチルス
・ズブチルス(Bacillus 5ubtilis)
には、プラスミドpTUB 、 pTUB 285など
が使用でき、サツカロミ(−2=セレビシエ(Sacc
haromyces cerevisiae)には、プ
ラスミドpAM 82、ストレプトマイセス・リビダン
ス(Streptomyces 1ividans)に
はプラスミドpSEV 1(Mol Gen Gene
t (1987) 210: 468−475 (FE
RM  BP−L12ダ ))、pu 680などが使
用できる。さらに、エシェリヒア ・’:1 ’J (
E、 colt)及びストレプトマイセス・1ビダンス
(S、 1ividans)などの二種以上の宿主微生
物体内で自律的に増殖可能なシャトルベクターを利用す
ることもできる。
この様なベクターを、先に述べたホスホリパーゼD遺伝
子供与体である微生物DNAの切断に使用した制限酵素
と同じ制限酵素で切断して、ベクター断片を得ることが
好ましい。
微生物DNA断片とベクター断片とを結合させる方法は
、公知のDNAリガーゼを用いる方法であればよく、例
えば、微生物DNA断片の接着末端とベクター断片の接
着末端とのアニーリングの後、適当なりNAリガーゼの
作用により微生物DNA断片とベクター断片との組み換
えDNAを作成する。必要ならばアニーリングの後、宿
主微生物に移入して、生体内のDNAリガーゼを利用し
て組み換えDNAを作成することもできる。
宿主微生物としては、組み換えDNAが安定かつ自律的
に増殖可能で、且つ外来性DNAの形質が発現のできる
ものであればよく、例えば宿主微生物がエシェリヒア・
D ’J (Escherichia coli)に属
する微生物の場合、エシェリヒア・DIJD)11 (
Escherichia coli DHI) 、エシ
ェリヒア・旦IJ)I8101 (ε5cherich
ia coli HB 101)、エシェリヒア・コリ
IA 3110 (Escherichia coli
 W 3110)、エシェリヒア・D ’J C600
(Escherichia coli C600)、等
が利用できる。また、宿主微生物が玉上しプトマイセス
・リビダンス(Streptomyces 1ivid
ans)の場合、ストレプトマイセス・リビダンスTK
−24(Streptomyces 1ividans
 TK−24) (FERMBP−11F1.S  )
、ストレプトマイセス・リビダンス TK −21(S
treptomyces 1ividans TK−2
1)、その他、ストレプトマイセス・グリセロファスカ
ス(Streptomyces griseofusc
us) 、ストレプトマ(Streptomyces 
ambofaciens)等を利用できる。
宿主微生物に組み換えDNAを移入する方法としては、
例えば、宿主微生物がエシェリヒア(Escher i
ch ia)属に属する微生物の場合には、カルシウム
イオンの存在下で組み換えDNAの移入を行い、またバ
チルス属に属する微生物の場合にはコンピテントセル法
またはリポソーム組み換えDNAのプロトプラスト宿主
細胞内への電気的な融合移入法などを採用することがで
き、さらにマイクロインジェクション法を用いてもよい
宿主微生物への目的組み換えDNA移入の有無について
の選択は、予め台底したホスホリパーゼDのDNAプロ
ーブを32p等で放射能ラベル化し、予め予想した遺伝
子ライブラリーとのコロニーハイブリダイゼーション法
によりポジティブ株を目的の形質転換体として選択すれ
ばよい。
上記の遺伝子操作に−、船釣に使用される量的関係は、
供与微生物からのDNA及びプラスミドDNAを0.1
−10μgに対し、制限酵素を約110u、リガーゼ約
300 u、その他の酵素約110u、程度が例示され
る。
かくして得られた形質転換体である微生物例えば、エシ
ェリヒア属に属し、エシェリヒア・ニ悲(E、 col
i)に属する微生物は、栄養培地に培養されることによ
り多量のホスホリパーゼDを安定して産生じ得る。
形質転換体を具体的に例示すれば、第2図に示されたD
NAをプラスミドpUC11B (宝酒造■製)に組み
込み、宿主微生物エシェリヒア・zlJD)11  (
E、coli Dlll)  (ATCC33849)
 (T、Maniatis、。
et、  Mo1ecular cloning、  
cold Spring Harbor(1982)、
  504−506)にトランスフォーメーションし、
ホスホリパーゼDを生成する微生物を選択して得たエシ
ェリヒア・コリ DH1(E、coliDlll) ・
pcPLDl(FERM−BP −2/y I? 3 
 )が挙げられる。
この様にして一度選択された組み換えDNAは、該組み
換えDNAを保持する形質転換微生物から取り出され、
他の宿主微生物に移入することも容易に実施できる。
また、さらに、該組み換えDNAから制限酵素などによ
り切断してホスホリパーゼDを構成するポリペプチドの
アミノ酸配列をコードするDNAを切出し、前記と同様
な方法により切断して得られる他の開環ベクター末端と
を結合させて新規な特徴を有する組み換えDNAを作製
して、他の宿主微生物に移入することも容易に実施でき
る。
この様な例を具体的に例示すれば、第2図に示すレタD
NAヲフラスミトpSEV1 (FERM−”j (g
タ )に組み込み、宿主微生物ストレプトマイセス・ユ
ビダンス TK−24(Streptomyces 1
ividans TK−24)(PERM  BP−!
41rH:)−yンス7.r−メーションし、ホスホリ
パーゼDを生成する微生物を選択して得たストレプトマ
イセス・リビダンスTK −24(Streptomy
ces 1ividans TK−24) ・pSEV
l−PLD(PERM−”’21g  )を挙げること
ができへ る。
また、本発明のホスホリパーゼDは公知の遺伝子操作手
段によりペプチドの変異をなしてもよく、この様なムテ
ィンのDNAは、本発明のホスホリパーゼD遺伝子から
遺伝子工学的手法により作製される人工変異遺伝子を意
味し、この人工変異遺伝子は部位特異的塩基変換法及び
目的遺伝子の特定DNA断片を人工変異DNA断片で置
換するなどの種々なる遺伝子工学的方法を使用して得ら
れ、斯くして取得された人工変異遺伝子のうち特に優れ
た性質を有するホスホリパーゼDムティンDNAについ
ては最終的にはこのムティンDNAをベクターに挿入せ
しめて組み換えDNAを作威し、これを宿主微生物に移
入させることによって、ホスホリパーゼDムティンの製
造が可能である。
ホスホリパーゼDをコードするDNAを含むベクターの
具体的な例示としては、エシェリヒア・] 茎DHI 
(E、 coli DHI) ・pcPLD 1より採
取したプラスミドpcPLD1 、ストレプトマイセス
・g 5ダンス TK−24(Streptomyce
s 1ividans TK−24)より採取したpS
EV−PLDが挙げられる。(それぞれの制限酵素地図
を第4図、第5図に示す。)また、プラスミドpcPL
D1より得られるPLD遺伝子の制限酵素開裂地図は、
第6図に示される通りであった。(図中tZZ2Zlは
シグナルペプチドを示す、)上述の方法によって得られ
たホスホリパーゼDを構成するポリペプチドのアミノ酸
配列をコードするDNAの塩基配列は、5cience
 214 12051210(1981年)に示されて
いるジデオキシ法で解読し、またホスホリパーゼDを構
成するポリペプチドの全アミノ酸配列は、塩基配列より
予測決定した。また、以下の方法により培養精製した該
ホスホリパーゼDであるポリペプチドを用いて、液相プ
ロティンシーケンサ−(ベックマン社製:BECKMA
N 5yste+* 890 ME)によりそのN末端
アミノ酸配列が、予測決定されたアミノ酸配列の一部と
一致することを確認した。プラスミドpcPLD1及び
プラスミドpSEV−PLDの構築については第7図に
示す。(図中〔コはホスホリパーゼD遺伝子を示す。〕 形質転換体により該ホスホリパーゼDを製造するに当た
っては、該形質転換体を栄養培地で培養して菌体内又は
培養液中に該ホスホリパーゼDを産生せしめ、培養終了
後、得られた培養物を濾過又は遠心分離などの手段によ
り菌体を採取し、次いでこの菌体を機械的方法又はリゾ
チームなどの酵素的方法で破壊し、又、必要に応じてE
DTA及び/又は適当な界面活性剤等を添加して該ホス
ホリパーゼDを可溶化し、水溶液として分離採取する。
この様にして得られた該ホスホリパーゼDの水溶液を濃
縮するか、又は濃縮することなく硫安分画、ゲル濾過、
アフィニティークロマトグラフィー等の吸着クロマトグ
ラフィー、イオン交換クロマトグラフィーにより処理し
て、純度のよい該ホスホリパーゼDを得ることができる
形質転換体である微生物の培養形態はその栄養生理的性
質を考慮して培養条件を選択すれば良く、通常多くの場
合は、液体培養で行うが、工業的には深部通気撹拌培養
を行うのが有利である。培地の栄養源としては、微生物
の培養に通常用いられるものが広く使用されうる。
炭素源としては、資化可能な炭素化合物であればよく、
例えばグルコース、サッカロース、ラクトース、マルト
ース、フラクトース、糖蜜などが使用される。窒素源と
しては利用可能な窒素化合物であれば良く、例えばペプ
トン、肉エキス、酵母エキス、カゼイン加水分解物など
が使用される。
その他、リン酸塩、炭酸塩、硫酸塩、マグネシウム、カ
ルシウム、カリウム、鉄、マンガン、亜鉛などの塩類、
特定のアミノ酸、特定のビタミンなどが必要に応じて使
用される。
培養温度は微生物が発育し、ホスホリパーゼDを生産す
る範囲で適宜変更し得るが、エシェリヒア・:l IJ
 (E、 coli)の場合、好ましくは2042°C
程度、ストレプトマイセス・リビダンス(S。
1ividance)の場合は28−30°C程度であ
る。培養条件は、条件によって多少異なるが、ホスホリ
パーゼDが最高収量に達する時期を見計って適当な時期
に培養を終了すればよく、エシェリヒア・コリ(E、 
colt)の場合、通常は12−48時間程度、ストレ
プトマイセス・リビーダンス(S。
1ividance)の場合、48〜72時間程度であ
る。
培地pHは菌が発育し、ホスホリパーゼDを生産する範
囲で適宜変更し得るが、エシェリヒア・二1(E、co
lL)の場合、好ましくはpH6,0−8,0程度、ス
トレプトマイセス・リビダンス(S、 1ividan
ce)の場合、pH7,0−7,5程度である。
培養物中のホスホリパーゼDは、菌体を含む培養液その
ままを採取し、利用することもできるが、一般には常法
に従って、ホスホリパーゼDが培養液中に存在する場合
には、濾過、遠心分離などによりホスホリパーゼD含有
溶液と微生物菌体とを分離した後に利用される。ホスホ
リパーゼDが菌体内に存在する場合には、得られた培養
物を濾過又は遠心分離などの手段により、菌体を採取し
、次いでこの菌体を機械的方法又はリゾチームなどの酵
素的方法で破壊し、又、必要に応じてEDTA等のキレ
ート剤及び/又は界面活性剤を添加してホスホリパーゼ
Dを可溶化し水溶液として分離採取する。
この様にして得られたホスホリパーゼD含有溶液を、例
えば、減圧濃縮、膜濃縮、更に、硫安、硫酸ナトリウム
などの塩析処理、或いは親水性有機溶媒、例えば、メタ
ノール、エタノール、アセトンなどによる分別沈澱法に
より沈澱せしめればよい。
次いでこの沈澱物を、水に溶解し、半透膜にて透析せし
めて、より低分子量の不純物を除去することができる。
また、吸着剤或いはゲル濾過剤などによるゲル濾過、ア
フィニティークロマトグラフィー等の吸着クロマトグラ
フィー、イオン交換クロマトグラフィー等により精製し
、これらの手段を用いて得られるホスホリパーゼD含有
溶液から、減圧濃縮凍結乾燥等の処理により精製された
ホスホリパーゼDが得られる。
以上の製造法により得られるホスホリパーゼDとして例
えば下記の諸物性を有するホスホリパーゼDが例示され
る。
(1)作用 リン脂質のリン酸と含窒素塩基とのエステル結合に作用
してリン化合物と相当する含窒素塩基と遊離する。レシ
チンについての作用を例示すれば次式の通りである。
CH,0COR レシチン(ホスファチジルコリン) CH20COR ホスファチジン酸 コリン また、レシチンをホスホリパーゼDで加水分解を行ない
、またその可逆反応において核酸系ヌクレオシドとレシ
チン等リン脂質を基質とする塩基交換反応による制癌剤
効果を有する核酸系ヌクレオシドリン脂質複合体を製造
することもできる。
(2)活性の測定法 0、2 M t−IJ 、2.−塩酸緩衝液(pH8,
0) 0.1 rgl。
0.1mMレシチンエマルジョン    0.1mf。
0.1M塩化カルシウム       0.05n/!
1%ト’J )ンX100        0.1  
ml。
水                       0
.1mj2よりなる反応液に、酵素溶液0.05n+f
を加え37°C110分間反応させた後、5分間煮沸し
て反応を停止した。次いで反応液を37℃まで冷却し、
これに、4−アミノアンチピリン(3■/d)0、IT
III!、、2u、/mI!、パーオキシダーゼ0.1
mj!、水0.1−を加えて37°Cl2O分間反応せ
しめた後1%トリトンX1002 tnlを加え、50
0nmの吸光度を求めた。ホスホリパーゼD、1単位(
Unit、 u、)は1分間に1 p moleのコリ
ンを生成せしめる酵素活性と定める。また、酵素活性の
算出は次式に従う。
%式% (式中、ΔA、。。は500nmにおける吸光度を示す
。) (3)基質特異性 上記の活性の測定の反応液において、基質としてレシチ
ン、リゾレシチン、スフィンゴミエリンのエマルジョン
(10mM、 0.1 ml>を用い、同様の操作を行
ない、コリンの定量をして、リゾレシチンに対する酵素
作用を100として相対活性を求める。
(4)  pH安定性 pH5:酢酸緩衝液 pH6−7:ジメチルグルタル酸−水酸化ナトリウム緩
衝液 pl+8−9:)リスー塩酸緩衝液 pHlOニゲリシン−水酸化ナトリウム緩衝液(各々1
0mパ)の各ρUで、酵素溶液(Img/巌)を37゛
C160分間インキユヘートした後、上記の活性測定法
に従ってホスホリパーゼDの活性を求める。
酵素はpH’l−9で比較的安定である。
(5)至適pH pH6−7、5ニジメチルグルタル酸−水酸化ナトリウ
ム緩衝ン夜、 pl+7−9ニドリス−塩酸緩衝液、 pl+9−10ニゲリシン−水酸化ナトリウム緩衝液の
各々の緩衝液を用い、上記の活性測定法に従ってホスホ
リパーゼDの活性を求める。その至適pnは7.5−8
付近である。
(6)熱安定性 10mMトリス−塩酸緩衝液(pH8,0) 、酵素溶
液濃度(1mg/ mp、 )の条件で、40,50゜
60.70,80°C(7)各/?(7)温度にて1o
分間インキュベートした後、上記の活性測定法に従って
ホスホリパーゼDの活性を求める。
酵素は70°Cまで安定である。
(7)分子量及び等電点 セファデツクス(、−150ゲル濾過による分子量約5
0,000 、 S D S−ボリアクリルアよドディ
スク電気泳動による分子量約57.000゜また、等電
点電気泳動法による等電点(P【)はpH5,1である
このようにして得られたホスホリパーゼDは、同様の微
生物由来であるストレプトマイセス・ハチジヨウエンシ
ス(Streptomyces hachijoens
is)A 1143菌株より得られるホスホリパーゼD
(特開昭4f3−99386号)よりも至適pH,pH
安定性、熱安定性においてより優れている。さらにスト
レプトマイセス・ハチジヨウエンシス(S trep 
tomyceshachijoensis )A 11
43菌株はホスホリパーゼDのほかにホスホリパーゼC
をも生産する(特開昭49−55893号)ため、はぼ
完全な精製を行なわない限り、その最終標品にホスホリ
パーゼCの混入を住い、これによる副反応を生じる欠点
を有している。これに対し、本発明においては容易な精
製で、しかも純度の高いホスホリパーゼDが得られるも
ので、従って、本発明で得られるホスホリパーゼDは特
に有用な酵素であるといえる。
(実施例〕 以下、実施例を挙げて本発明の詳細な説明するが本発明
はこれによって何ら限定されるものではない。
実施例1゜ く放線菌からのDNAの抽出〉 I−リブティックソイ培地(30g / Q Tryp
ticSoy Broth  (DTFCO社製))5
00mj2に、ホスホリパーゼD生産性放線菌ストレプ
トマイセス・り0 ’E ’7 スカスA−0848(
PERM−131’ L/ygL)を植菌し30°Cで
3日間振盪培養した。培養液を高速冷却遠心機(日立5
CR−20BA型)を用い、14.000 rpm (
25,000G)で10分間遠心分離し、放線菌体を集
菌した。放線菌体を20m1のTES(50mM  T
ris−t(Cffi pH8,0、50mM EDT
A pH8,0,15%5ucrose)に懸濁し、最
終濃度が1mg / mlになるようにリゾチーム(S
IGMA社製)を加え、37°Cで10分間処理し、細
胞壁を破壊した。これに10%SDSを0.5 ml加
え、さらに21m1のフェノール:クロロホルム−1:
1混合液を加え撹拌した後、14.00Orpm  (
25,0OOG)で15分間遠心し、分離した水層を他
の容器に移し、42mflのエタノールを加え析出して
くる染色体をガラス棒にからめて取得した。
この染色体を20 ml T E (10mM Tri
s−tic 1pH8,0、1mM EDTA pH8
,0)に?容器し、20mflのフェノール:クロロホ
ルム−1:1混合ン夜を加え撹拌した後、14.00O
rpm (25,000G)で15分間遠心し、分離し
た水層を他の容器に移し、3M酢酸ナトリウムpH5,
5緩衝液2戚とエタノール50m1を加え、撹拌後−7
0°Cで20分間冷却した後、3.000 rpm (
2,000G)で15分間遠心し、沈殿した染色体を7
5%エタノールで洗い、乾燥せしめ、染色体標品550
μgを得た。
実施例2゜ く放線菌遺伝子ライブラリー〇作成〉 放線菌染色体2μgを制限エンドヌクレアーゼ5afl
(東洋紡績社製)4uで50mM Tris−HCl2
(pH7、5) 、100mM Na+、e、10mM
 MgC42g、1mM  DTT  (ジチオスレイ
トール)、10μg/dBSA(牛血清アルブミン(ベ
ーリンガー・マンハイム社製))、存在下37°C12
時間切断処理した。
また、ベクタープラスミドpUc 118  (Cof
E 1ori、 Amp’ + M 131G  ;宝
酒造社製)2μgを、先と同じ条件下で5affi14
uで、37°C116時間切断処理した後、フェノール
・クロロホルム処理を行い、エタノール沈澱した。この
直鎖状になったpUC118を大腸菌由来アルカリホス
ファターゼ(東洋紡績社製)で50mM Tris−H
Cl2 (pH8,0)1mMMgCffiz存在下、
65°C11時間反応させ、5′末端のリン酸基を除去
した。
以上の操作を行ったpUc 118100ng、放線菌
染色体200ngをT4DNAライゲース(宝酒造社製
)100uで、66mM Tris−11cf (pH
17,6)、6.6mMMgCL!z、10n+M  
DTT  (ジチオスレイトール)、660uM AT
P (ベーリンガー・マンハイム社製)存在下16°C
116時間ライゲーションした。これをに、 Shig
esadaの方法(細胞工学(1983)2.616−
626)によってコンピテント細胞としたE、 col
i DH1(ATCC33849)(FLrec A 
1+ end A 1. gyr A96+ thi−
1+ hsdR17CT w−+ mk+ )、 Su
p E 44+ rej! A 1+  λ−(T、 
Maniatis、、 et al、 Mo1ecul
ar Cloning :Co1d Spring H
arbor (1982) 、  504−506 )
にトランスフォーメーションし、50μg/mlアンピ
シリン含有り平板寒天培地(バタトトリプトン(DIF
CO社製)15 g/l、酵母エキス(DIFCO社製
)5g/j2.Na(/!5g/f、バタトアガ−(D
IFCO社製)  15 g/l)にて−夜培養し、約
100,000のアンピシリン耐性コロニーを得、放線
菌遺伝子ライブラリーとした。
実施例3゜ 〈放射性オリゴヌクレオチドプローブの作製〉遺伝子的
解析が未だ行われていないホスホリパーゼDにおけるオ
リゴヌクレオチドプローブを作製するにあたって、まず
はじめに発酵法により得られたホスホリパーゼDを完全
なまでに精製し、次いでそのホスホリパーゼDのN末端
側のアごノ酸配列について研究し、その結果N末端側か
らの20アミノ酸配列を後述Aにて示されるアミノ酸配
列のとうり解析・決定した。この判明したN末端側から
の207ξノ酸をベースとして、オリゴヌクレオチドプ
ローブを作製するに当り、この2゜アミノ酸配列を基に
、その遺伝子の5“末端側からの60塩基配列を後述B
にて示される多種のオリゴヌクレオチドとして予想した
。この予想配列を基に設計されるオリゴヌクレオチドプ
ローブには無数の配列がありうるが、本発明ではその内
の数種類を設計し、幾度かの試行錯誤の結果、その中で
も特に後述Cにて示される50塩基からなる1つのオリ
ゴヌクレオチドが本発明に最も有用であることを見出し
、 該オリゴヌクレオチドを以下 の操作でプローブとして使用した。
上記Cにて示されるオリゴヌクレオチドをアール・エル
・レッシンジャーらの方法(R,L。
Letsinger、、 W、B、 Lursford
 Journal Am、 Chem。
5ociety 98.3655)に基づきDNAシン
セサイザー(ヘックマン社製: Beckman Sy
steml plus)を用いて作製した。
完成したオリゴヌクレオチド200ngをT4ポリヌク
レオチドキナーゼバッファー(50mMTris−11
cffi (pal 8.0 )、10mM MgCl
2.10mM2−メルカプトエタノール)および、20
μCiの:lZP  ATP (アマ−ジャムジャパン
社製)存在下、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(東洋紡
績社製)865μで37°C130分間反応せしめ、ア
イソトープ32pを取り込ませ放射性オリゴヌクレオチ
ドプローブとした。
実施例4゜ くホスホリパーゼD遺伝子含有クローンのスクリーニン
グ〉 前述の如くにより得た遺伝子ライブラリー即ち平板寒天
培地上のアンピシリン耐性コロニー上にナイロンメンブ
レンフィルター(PALL社製:バイオダインA)を重
ね、フィルター上に該コロニ菌体の一部を移行させた。
該コロニー菌体の一部を移行させたフィルターを別の5
0μg7mlアンピシリン含有り寒天平板培地上に重ね
、フィルター上の菌体を37°Cで16時間培養した。
培養後、このフィルターをアルカリ変性溶液(0,5N
 Na01l、1、5 N NaC1)に5分間浸し、
さらに3M酢酸すI・リウム緩衝液(pl+5.5 )
に5分間浸した後乾燥した。このフィルターを80°C
で1時間加熱し、菌体中にあったプラスミドDNAをフ
ィルターに固定した。
さらにこのフィルターをハイブリダイゼーション?8液
(NaCff143.8 g/ Q、クエン酸三ナトリ
ウム22.tg/ff、50mMリン酸3ナトリウム(
pHa 5 ) 、ドデシル硫酸ナトリウム1g/2、
フィコール(ファルマシア社製)Ig/ff、ホIJビ
ニルピロリドンLg/12、BSA(ヘーリンガー・マ
ンハイム社製)Ig/42、サケ精子DNA(ファルマ
シア社製)250■/2、ホルムアミド0.41/iり
に浸し、42°Cで1時間プレハイブリダイゼーション
を行った。その後、フィルターを新しいハイブリダイゼ
ーション溶液に浸し、先に用意した放射性オリゴヌクレ
オチドプローブを加え、42°Cで24時間ハイブリダ
イゼーションを行った。
ハイブリダイゼーション後、洗浄液(Na(、e4.3
8g/l、クエン酸三ナトリウム2.21g/l、ドデ
シル硫酸ナトリウム1g/l)でフィルターを3回洗浄
し、次いでこのフィルターを50°Cの洗浄液に10分
間浸し、余分なプローブを洗い落とした。フィルターは
風乾後X線フィルム(富士写真フィルム社製:  Ne
y RXO−)1)に重ね、遮光下、−70”Cで24
時間オートラジオグラフィーを行った。
オートラジオグラフィー終了後、フィルムを現像し、ポ
ジティブシグナルを示すコロニーを確認した。該コロニ
ーを、ホスホリパーゼDをコードするDNAを含む形質
転換体として取得し、エシェリヒア・コリ DHI  
・pcPLDl (微工研条寄第2683号、 FER
M  BP−!6♂3 )として寄託した。
なお、ハイブリダイゼーションの最適条件はオリゴヌク
レオチドプローブの形状によって様々異なるため、本発
明では何度かの試行錯誤の末に選択した前述Cの50塩
基オリゴヌクレオチドプローブが上記のハイブリダイゼ
ーション条件下で最適となることを見出し、それにより
約10万のコロニーの中にただ一つ存在した、ホスホリ
パーゼDの遺伝子を含む形質転換体のポジティブシグナ
ルが識別可能となった。
実施例5゜ く組み換えプラスミドの抽出〉 エシェリヒア・コリ DHI・pcPLDlよりティー
・マニアチスらの方法(T、 Maniatis、、 
et al。
Mo1ecular Cloning、 Co1d S
pring Harbor (1982)+86−94
)によって、ホスホリパーゼDをコードするDNAを含
む組み換えプラスごドpcPLD1を抽出した。その制
限酵素地図を第4図に示す。
このプラスミド中の放線菌染色体由来部分のDNAをジ
デオキシ法(Science 214 1205121
0 (1981))により塩基配列を決定し、ホスホリ
パーゼDをコードする全DNAが含まれていることを確
認すると共にその全塩基配列を決定した。結果を第3図
に示す。
実施例6゜ 〈培養と細胞抽出物の調製〉 pcPLDlを保有したE、 coli DHI ・p
cPLDlを50μg/mlアンピシリン含有り培地(
1,0%Bacto Tripton  (DIFCO
社製)0.5%酵母エキス(DIFCO社製)1.0%
NaC1) 20 ml中で37゛cで18時間培養し
た後、遠心分離(6,000rpn+。
10分間)により集菌し100μj2の10mM Tr
is−HCfpH8,O緩衝液に懸濁した。超音波破砕
機を用いて菌体を破砕した後、14.000 rpm 
、5分間遠心分離し、上滑を取得して細胞抽出物とした
実施例7゜ く細胞抽出液のホスホリパーゼD活性の確認〉E、 c
oli DHI  ・pcPLDlでのPLD遺伝子の
発現を確認するために、細胞抽出液中のホスホリパーゼ
D活性を測定した。
基質溶液(5mMホスファチジルコリン、3.8%クロ
ロホルム、1%トリトンX−100,40IIMTri
s−HCf (pH8,0)、10 mM CaC12
)を0.5 d取り、37°Cに5分間置いた後、細胞
抽出液を50μl加え、撹拌し、37℃で10分間反応
させた。その後、クロモジエン溶液(0,6mM、4−
アミノアンチビリン、80μg 7mlフェノール、2
、4mM EDTA 、 40mM Tris−H(/
! (pH8,0)、7、2 purpurogall
in units/ W11ペルオキシダーゼ、1、2
 units/ rtdlコリンオキシダーゼ)を2.
51R1を加え、撹拌し、37°Cで4時間反応させた
。この反応液の500nmの吸光度を測定し、ホスホリ
パーゼD活性の指標とした。
形質転換していないE、 coli DH1の抽81に
ついて、上記と同じ操作を行ない対照とした。結果を第
1表に示す。
E、 coli Dt(1・pcPLDlでのホスホリ
パーゼD活性の発現が確認された。
第 表 実施例8゜ 〈放線菌へのホスホリパーゼD遺伝子の導入〉プラスミ
ドベクターpcPL012μgを制限エンドヌクレアー
ゼMluI6uとXhollOu(東洋紡績社製)で切
断し、ホスホリパーゼD(PLD)遺伝子を含む3 K
bpのDNAフラグメントを1%低融点アガロースゲル
(Bethesda Re5earchLaborat
ories社製)電気泳動で分離し、67mMTris
−H(、e (pH8,8) 、 6.7mM M*C
fz 、  16.6mM (Nun)zsO4+ 1
0mM2−メルカプトエタノール。
6.7μHエチレンジアミン4酢酸、50μM dNT
P(ベーリンガー・マンハイム社製)、167μg/d
BSA(ベーリンガー・マンハイム社製)存在下、T4
DNAポリメラーゼ(東洋紡績社製)2.4uでフラグ
メントの両端を平滑末端化した。
また、放線菌のベクタープラスミドpSEV 1(Ho
rinovchi、 S、、 NiN15hiya、 
M、+ Nakamura。
A、、 Beppu、 T、 Mol Gen Gen
et  (1987)210:468 475 (PE
RM  BP−,2/6r41))2μgを制限エンド
ヌクレアーゼ5aclC東洋紡績社製)8uで切断し、
先と同じ条件下で両端を平滑末端化した後、50mM 
Tris−HCf (pH8,0)、10mM  Mg
C1z存在下バクテリアアルカリフオスフアターゼ(東
洋紡績社製)6uで両末端のリン酸基を除去した。以上
の操作を行ったPLD遺伝子含有フラグメント200n
gとプラス5ドpSEV1100ngをT4DNAライ
ゲース(宝酒造社製)100uで、66mM Tris
−HCf (pH7,6)、 6.6mM MgCl!
、z 。
10mM DTT、  660 μM ATP (ベー
リンガー・マンハイム社製)存在下16°c、16時間
ライゲーションした。これをホップウッドらの方法(D
、A、 Hopwood、、 et al、 Gene
tic Manipulationof  Strep
tomyces、  八 Laboratory  M
anual、  TheJohn Innes Fou
ndation John Innes In5ttt
ute。
103−122)によってコンピテント細胞としたスト
レプトマイセス・リビダンスTK−24(FERM26
♂r)にトランスフォーメーションし、トリブチツクソ
イ平板寒天培地(3%トリブチイックソイ、2%バタト
アガー(以上DIFCO社製))上に拡げ、28°Cで
1日間培養した後、その上に100μg/ydチオスト
レプトンを含むニュートリエンドブロース寒天培地(1
,8%ニュートリエンドブロース (田辺製薬社製L1
1.3%シュークロース、0.5%アガー(和光純薬工
業社製))を重層し、28°C11日間培養してチオス
トレプトン耐性コロニーを得た。これをPLD遺伝子含
有ベクターであるプラスミドpSEVI−PLD(第5
図参照)保有放線菌株とした。こうして得られた形質転
換体をストレプトマイセス・リビダンスTK−24・p
SEVl−PLD (微工研条寄第 96g6号。
FERM−r3F↓6れ)として寄託した。
実施例9゜ 〈ストレプトマイセス・リビダンスTK−24・pSE
Vl −PLDの培養と活性発現〉 前述の如くして得た放線菌の形質転換体であるストレプ
トマイセス・リビダンスTK−24・pSEVIPLD
を10μg/mlのチオストレプトンを含む3%トリブ
チイックソイ (DIFCO社製)培地で28°C13
日間培養した。この培養液を14.000rpI11で
2分間遠心分離し、上清を分取した。この培養上清のホ
スホリパーゼD活性を前述実施例7と同様の方法で測定
した。また形質転換していないストレプトマイセス・リ
ビダンスTK−24の培養上清についても、同様にホス
ホリパーゼD活性を測定した。結果を第2表に示す。ベ
クターpSEVIPLDの移入により、ホスホリパーゼ
D活性の発現が確認された。
第2表 〔発明の効果〕 ホスホリパーゼDのN末端アミノ酸配列に基いて合成し
たオリゴヌクレオチドを使用して、ホスホリパーゼD生
産菌株に由来する染色体DNAライブラリーからホスホ
リパーゼD遺伝子の全DNA配列を明確とした新規なホ
スホリパーゼD遺伝子を分離したもので、該ホスホリパ
ーゼD遺伝子を使用して、任意の宿主−ベクター系でホ
スホリパーゼDの生産及び培養を行うことを可能とした
さらに、ホスホリパーゼD遺伝子の単離により、ホスホ
リパーゼDの耐熱性向上や基質特異性の変換など種々の
プロティンエンジニアリングが可能となった。
【図面の簡単な説明】
第1図はホスホリパーゼDを構成するポリペプチドのア
ミノ酸配列を示す。 第2図はホスホリパーゼDを構成するポリペプチドのア
ミノ酸配列をコードするDNAを示す。 第3図はプラスミドpcPLD1の放線菌由来部分のD
NAの全塩基配列を示す。 第4図は大腸菌プラスミドpcPLD1の制限酵素地図
を示す。 第5図は放線菌プラスミドpSEV−PLDの制限酵素
地図を示す。 第6図はホスホリパーゼD遺伝子の制限酵素サイト地図
を示す(図中 匹〃はシグナル配列を示す。) 第7図はプラスミドの構築を示す。(図中口はホスホリ
パーゼD遺伝子を示す。)

Claims (11)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)N末端側より第1図で表されるアミノ酸配列をコ
    ードするDNA。
  2. (2)DNA塩基配列が5′末端側より第2図で表わさ
    れる請求項第1項記載のDNA。
  3. (3)N末端側より第1図に表わされるアミノ酸配列を
    コードするDNAを保持することを特徴とするベクター
  4. (4)上記ベクターがプラスミドpcPLD1又はプラ
    スミドpSEV−PLDである請求項第3項記載のベク
    ター。
  5. (5)宿主が、¥エシェリヒア¥(Escherich
    ia)属、¥ストレプトマイセス¥(Streptom
    yces)属、¥サッカロミセス¥(Saccharo
    myces)属又は¥バチルス¥(Bacillus)
    属に属する微生物であって、宿主にとって外来性である
    第1図に示すアミノ酸配列をコードするDNAを保持す
    ることを特徴とする形質転換体。
  6. (6)¥エシェリヒア¥(Escherichia)属
    に属する微生物が、¥エシェリヒア¥・¥コリ¥(Es
    cherichia coli)に属する微生物である
    請求項第5項記載の形質転換体。
  7. (7)形質転換体が、¥エシェリヒア¥・¥コリ¥ D
    H1(Escherichia coli DH1)・
    pcPLD1「微工研条寄第2683号、FERM B
    P−2683」である請求項第6項記載の形質転換体。
  8. (8)ストレプトマイセス(Streptomyces
    )属に属する微生物が、¥ストレプトマイセス¥・¥リ
    ビダンス¥(Streptomyces livida
    ns)に属する微生物である請求項第5項記載の形質転
    換体。
  9. (9)形質転換体が、¥ストレプトマイセス¥・¥リビ
    ダンス¥ TK24(Streptomyces li
    vidans TK24)・pSEV1−PLD「微工
    研条寄第2686号、FERM BP−2686」であ
    る請求項第8項記載の形質転換体。
  10. (10)宿主が、¥エシェリヒア¥・¥コリ¥(Esc
    herichiacoli)、¥ストレプトマイセス¥
    ・¥リビダンス¥(Streptomyces liv
    idans)、¥サッカロミセス¥・¥セレビシエ¥(
    Saccharomyces cerevisiae)
    、又は¥バチルス¥・¥ズブチルス¥(Bacillu
    s subtilis)であって、宿主にとって外来性
    である第1図に示すアミノ酸配列をコードするDNAを
    保持する形質転換体を培養して、該DNAの遺伝情報を
    発現せしめ、該培養物からホスホリパーゼDを採取する
    ことを特徴とするホスホリパーゼDの製造法。
  11. (11)第2図に示すDNAを保持する形質転換体を培
    養して、該DNAの遺伝情報を発現せしめ、該培養物か
    らホスホリパーゼDを採取することを特徴とする請求項
    第10項記載の製造法。
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