JPH0330679A - BanI制限エンドヌクレアーゼをコードするDNA - Google Patents

BanI制限エンドヌクレアーゼをコードするDNA

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JPH0330679A
JPH0330679A JP1163662A JP16366289A JPH0330679A JP H0330679 A JPH0330679 A JP H0330679A JP 1163662 A JP1163662 A JP 1163662A JP 16366289 A JP16366289 A JP 16366289A JP H0330679 A JPH0330679 A JP H0330679A
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文清 川上
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 [産業上の利用分野] 本発明はBan I制限エンドヌクレアーゼをコードす
るDNA、並びにBan lメチラーゼ及び、Ban 
lメチラーゼをコードするDNAに関する。
〔従来の技術〕
■型制限酵素はいままでのところ細菌等から約120種
類の■型制限酵素が発見され商品化されている。■型制
限酵素はデオキシリボ核酸(D N A)鎖中のある特
定の塩基配列を認識し、これを切断する極めて特異性の
高い酵素であり、遺伝子工学の分野で幅広く利用されて
いる。また遺伝子診断による臨床検査にもその利用が期
待されている。
Ban I制限エンドヌクレアーゼは■型制限酵素のひ
とつである。本酵素はDNAの塩基配列中のGGPyP
uCCを認識しこれを切断する酵素であり、バチルス 
アノイリノリティカス(Bacillus aneur
inolyticus) IAM1077において生産
される酵素であるが、このバチルス アノイリノリティ
カス(Bacillus  aneurinolyti
cus)  IAM1077は、  Ban  1以外
に他の制限酵素Ban U 、  Ban IIIを菌
体内に同時に生産するためこれらを除くことが非常に困
難であり製造上の問題を抱えていた。
一方、制限サイトメチラーゼは制限酵素の認識塩基配列
をメチル化するものであって、遺伝子操作では制限酵素
の認識配列をメチル化することによりそれに対応する制
限酵素による切断を防ぐことに使われているものである
が、Ban I制限エンドヌクレアーゼの認識塩基配列
をメチル化するBan lメチラーゼ、及びそのDNA
を取得した例は現在まで見当らない。
〔発明が解決しようとする課題] 遺伝子操作技術を使用してバチルス アノイリノリティ
カス(Bacillus aneurinolytic
us)以外の宿主にBan I制限エンドヌクレアーゼ
を生産させることができれば、該バチルス アノイリノ
リティカス(Bacillus aneurinoly
ticus)に由来する夾雑酵素の問題は解決し、純粋
なりan I制限エンドヌクレアーゼを得ることが可能
となる。本発明の課題は、この遺伝子操作技術によりB
an I制限エンドヌクレアーゼを生産する際に、まず
必要となる該酵素をコードするDNAを提供することに
あり、また、このBan I制限エンドヌクレアーゼを
コードするDNAを宿主に保持させる場合、宿主本来の
DNAが産生ずるBan I制限エンドヌクレアーゼに
より切断され宿主増殖が阻害されるのを防止するために
は、Ban lメチラーゼの産生能を宿主に付与せしめ
る必要があり、このために必須となるBan Iメチラ
ーゼをコードするDNAを提供することにある。
また、本発明の課題には、この他、種々の遺伝子操作技
術において有用なりan Iメチラーゼ自体を提供する
ことも含む。
〔課題を解決するための手段〕
本発明者らはBan I制限エンドヌクレアーゼ生産菌
から染色体DNAを採取し得られた染色体DNAを適当
な制限酵素で消化してpBR322などのプラスミドに
組み込み、このプラスミドにより大腸菌等に形質転換し
、形質転換菌を増殖させてBan■制限エンドヌクレア
ーゼ、またはBan !メチラーゼ生産菌をそれぞれ単
離し、これら生産菌を培養することにより、Ban I
制限エンドヌクレアーゼ及びBan Iメチラーゼを採
取するとともに、これら酵素をコードするDNAを単離
、同定することにも成功し、本発明を完成するに至った
ものである。
すなわち本発明は、 (1)バチルス アノイリノリティカス(Baci f
lusaneurinolyticus)由来のBan
 I制限エンドヌクレアーゼをコードするDNA断片。
(2)次の式Iで表わされるアミノ酸配列をコードする
塩基配列を有する(1)記載のDNA断片。
式1 %式% (3)次の式■で表わされる塩基配列を有する(2)記
載のDNA断片。
式■ GTTCCCACCC AATCTGTTTC TAAAGCATCT TGTTGTATTA TTACATAACA AAAGTGTTAG GGAAATTTGA ATTTTTTTGG Glu  Leu  Asn Val  Leu Le
u Lys Phe  lie LeuAAGGAGC
GTT  ATATTTTTGT  ΔへGCAGAA
TA  ACAGGAGGGGCTGAAGCAAA 
 TACGTTAGGT  CへへGTCGCTCAA
ACCCATGTGATATAA八^A GTAATGGAC八 CATへGAAGGT GTGACCCATA へへAAGGCAGC GTAACTACAA ^へへAGCGTTG  CGATTGAGAT  T
AGCTTCCAGATAGTACCAT  CGAG
CGT八八八 GCへへへACAAGTATAGCTT
AT へAAAATGCAへ ^TTATCGATG TCACAACCAT GAGCGGGGAA  CTTCCAACGTTTG
TAATAAT  AGCCATTGC八ty 八rg Gへu Lys Lys 1e Leu Tyr Arg 11e Gly Ala  Ala Cys  Val Ala  Cys Glu  Glu Thr  Ser 八la  Gly Ala Gly Val Leu Gly  Ile Arg Lys  Arg Phe Leu  Ser  5er Glu Thr Tyr Pro Gln Gly Phe  Pro  Glu Phe Pro Cys Lys Gln Gln 八rg  Asp  Asn 11e Gly  Phe  Glu Glu  Leu  Glu  ThrGlu  li
e Asp Lys Ala  Leu  Asn  PheAsp Ile
 H4s Glu Phe Asp  Phe Leu Gln  Pro  Phe  5erGly Phe
 Gly Asp Arg Pro  Lys  Ala (4)バチルス アノイリノリティカス(Bacill
usane’urinolyticus)由来のBan
 lメチラーゼをコードするDNA断片。
(5)次の式IIIで表わされるアミノ酸配列をコード
する塩基配列を有する(4)記載のDNA断片。
弐■ Met  Lys  Ile Lys  Phe  V
al  Asp Leu  Phe Ala1e Tyr 1e Leu Gly  lie Leu Gly  Ser  Lys Ser Glu Lys Tyr Arg Cys S
er Asp Glu PhePhe Gin Asn
 Asn Val Asn Glu Leu Phe 
GlyAsn Phe Glu Leu Leu H4
s Gly Tyr Arg Leulle  Asp
  Tyr  Arg  Gly  Gly  Asn
  Ser  Ile  旧5Ser Trp Glu
 Leu Gly rle Lys Gly Asp 
Cys(6)次の弐■で表わされる塩基配列ををする(
5)記載のDNA断片。
弐■ ATGAAGATTA  AATTTGTTGA  C
TTGTTTGCT  GGAATTGGAGGAAT
TCGAAT  AGGATTTGAA  AGAGC
GGCCA  AACGGTTTGA八AGGCTTG
Cへ  ^へACATATGCCCTTAATTTT 
 AへへGAGGAACしys Val Val ilu Lys Val lie  Glu Asp Leu 1;’IしTAAI;に’l’に  ’rAAi’GT
TGGAGCAGCCGATT CTCACAAGTA TAAGAATGAA TGTATGA CAAATATCTT TATTTGATGA AAGCTATGCT (力 (4)〜(6)いずれか記載のDNA断片を含む
発現ベクター (8)  (7)記載の発現ベクターにより形質転換さ
れた形質転換体。
(9)エシャリヒア(esherichia)属に属す
る微生物を形質転換したものである(8)記載の形質転
換体。
GO)  (4)〜(6)いずれか記載のDNA断片を
組み込んだ発現ベクターにより、生物細胞あるいは微生
物を形質転換し、得られた形質転換体を培養して培養物
からBan Iメチラーゼを採取することを特徴とする
Ban Iメチラーゼの製造方法。
(11)バチルス アノイリノリティカス(Bacil
lusaneurinolyticus)由来の約4.
4000の分子量(S[lS−PAGE法による)を有
するBan Iメチラーゼ。
面 次の式IIIで表わされるアミノ酸配列を有するポ
リペプチドである(11)記載のBan Iメチラーゼ
式■ Met  Lys  lie  Lys  Phe  
Val  Asp  Leu  Phe  AlaGl
y  Ile Gly Gly  Ile Arg  
Ile Gly  Phe GluArg Ala  
Ala Glu Cys  Val Lys  Ala Cys Lys Glu Glu 11e  Thr  5er Leu Ala Gly Tyr Ala Gly Lys Leu 1u Pr。
Phe Phe Lys Arg  Phe Ser  5er Thr Tyr Gin Gly Pro  Glu Pro Cys Gin  Gln Glu  Leu  Glu Glu  Ile  Asp Ala  Leu  Asn Asp Ile His Phe Asp Phe Gln  Pro  Phe Gly Phe Gly Thr Lys Phe Glu 0 Leu Ser ^5p 11e Gly Gln Leu Ser Lys V
al  Vat  Gly Asnrne  Llin
  Asn  Asn  Vat  Asn  Glu
  Leu  Phe GlyGin  Met  L
ys  Leu  Ala  Asn  Vat  V
alに関する。
以下に本発明を詳述する。
本発明のBan l制限エンドヌクレアーゼ遺伝子を含
むプラスミドは例えばエシャリヒア(esherich
ia)属に属する微生物の染色体外遺伝子(プラスミド
)として知られるコリシンEl因子等の培養された細胞
内で増殖しうる形式をとるプラスミドにバチルス アノ
イリノリティカス(Bacillusaneurino
lyticus) IAM1077由来のBan l制
限エンドヌクレアーゼ遺伝子、Ban Iメチラーゼ遺
伝子を含むDNA断片、およびBan Iメチラーゼの
みを含むDNA断片を組み込んでなるプラスミドであり
、前記ベクターDNAとしては天然に存在するものを抽
出したものの他、増殖に必須な部分以外のDNAの部分
が一部欠失しているものでもよ(Co1E 1の系統、
pBR322の系統、psclolの系統、9M89の
系統、ラムダファージの系統が挙げられる。
また前記ベクターDNAに前記染色体DNA断片を組み
込む方法は既知のいずれの方法も適用しうる。例えば適
当な制限酵素で処理して染色体DNAを特定部位で切断
し、ついで同様に処理したベクターDNAと混合しりガ
ーゼによって再結合する方法が用いられる。
ベクターDNAとしてpBR322プラスミドを用いこ
れにバチルスアノイリノリティカス(Bacillus
aneurinolyticus) IAM1077か
ら調製された染色体DNA断片を組み込むことにより、
新規プラスミドpBANIRM 8が得られる。pBA
NIRM 8プラスミドの制限酵素地図を第1図に示す
。第1図に示す様にこのプラスミドはpBR322プラ
スミドの制限サイトにバチルス アノイリノリティカス
(Bacillusaneurinolyticus)
 IAM1077のBan l制限エンドヌクレアーゼ
遺伝子、およびBan Iメチラーゼ遺伝子を含むDN
A断片が組み込まれた8kbの塩基対を有するプラスミ
ドである。
本発明のBan l制限エンドヌクレアーゼをコード遺
伝子、およびBan Iメチラーゼ遺伝子は次の様にし
て同定できる。
まず本発明者らは、Ban l制限エンドヌクレアーゼ
遺伝子を同定するため本プラスミド菌株エッジエリヒア
 コリ (Escherichia colt) HB
IOI(pBanlRM8) (FERM P−942
4) (エシェリヒア コリ (Escherihia
 colt)蚤IBIOI (pBANll) と同じ
である。〕を培養し、菌体を取得した。
本菌体より Ban l制限エンドヌクレアーゼ、Ba
n Iメチラーゼをそれぞれ電気泳動(SO5PAGE
)でシングルバンドになるまで精製純化し本標品にてア
ミノ酸シーケンサ−によりN末端アミノ酸配列を決定し
た。
更にBan [制限エンドヌクレアーゼを生産する上記
菌株を培養しその培養菌体よりプラスミドを調製した。
本プラスミドは当然ながらBan l制限エンドヌクレ
アーゼを暗号化しているDNAとBanIメチ・ラーゼ
を暗号化しているDNAを保有しており、これを用いて
塩基配列を決定できる。DNA塩基配列を決めるため本
プラスミドより上記2つの酵素を暗号化していると思わ
れる領域のDNA断片を塩基配列決定に適したベクター
、例えばpUc18. M13mplBに移し、M13
−ジオキシ法(Sanger、 Pro、Na tl 
、 Acad、 Sc i 、 74.5463−54
67 (1977)より決定した。即ちpUc18. 
M13mplBに組み換えプラスミドに変えた後、種々
制限酵素による制限酵素サイトの決定、及びサブクロー
ニング、マングビーンヌクレアーゼ、エキソヌクレアー
ゼ■を用いるデレージョン法により、種々デレーション
ミュータントを作成しBan r制限エンドヌクレアー
ゼ遺伝子、Ban Iメチラーゼ遺伝子の領域を決定し
た。さらに、デレージョン ミュータントの挿入DNA
断片の塩基配列を決定した。また、制限酵素活性、メチ
ラーゼ活性のうち前者の活性のみが発現するデレージョ
ン ミュータントでは菌が死滅するため、塩基配列を決
めるべき領域のDNAが取れないため塩基配列が決めら
れないことがある。そのような場合、カスタムプライマ
ー法等を活用して決定した。その結果、前記式■で表わ
されるBan l制限エンドヌクレアーゼをコードする
DNA配列及び弐■で表わされるBan Iメチラーゼ
をコードするDNA配列を決定した。
塩基配列から決定したN末端のアミノ酸配列は精製Ba
n I制限エンドヌクレアーゼ、Ban [メチラーゼ
標品から得たN末端のアミノ酸配列と一致した。ここで
塩基配列を決定したDNA配列を利用して各々の遺伝子
を採取することが可能となると同時に遺伝子操作の手法
を利用してBan 1制限エンドヌクレアーゼ、Ban
 Iメチラーゼの生産系を構築することができる。遺伝
子操作の手法を用いて物質生産を行うには大腸菌、酵母
または動物細胞を用いた系のいずれを使用してもよい。
(日本生化学会場“遺伝子研究法If ”pp126−
150.ap170−204(1986)) 、例えば
大腸菌を宿主としてBan 1制限エンドヌクレアーゼ
を生産するには前記のDNA配列に発現のため制御部位
、例えばトリプトファンオペロンのプロモーターとSD
配列を付加したDNA配列をBan Iメチラーゼ遺伝
子を付加したpBR322などのベクターDNAに連結
し、大腸菌に導入すればよい。
酵母を宿主とする場合、発現の制御部位としては、抑制
性酸性フォスファターゼ遺伝子やグリセロアルデヒド3
−リン酸デヒドロゲナーゼ遺伝子のプロモーターなどが
知られており、酵母内での複製オリジンとしては2μm
プラスミド由来、酵母染色体由来のものを用いるとよい
。動物細胞を宿主とする場合、発現制御部位としたSV
40プロモーターやIIBウィルス遺伝子のプロモータ
ーなどがしられており、複製開始としてはSV40やポ
リオーマウィルスのものを用いるとよい。また、Ran
 1制限エンドヌクレアーゼをコードするDNAのみを
使用する場合には宿主が増殖できない場合があるから本
発明のRan I制限エンドヌクレアーゼをコードする
DNAと、Ban IメチラーゼをコードするDNAと
併用して上記のような発現系を構築すれば、Ban I
制限エンドヌクレアーゼを大量に生産することができる
。Ban Iメチラーゼのみを生産したい時は上記発現
系にBan ■メチラーゼ遺伝子のみ利用すれば本酵素
のみを大量に生産できる。
以下実施例により本発明を具体的に説明する。
実施例1 (1)  BanI制限エンドヌクレアーゼの遺伝子を
もつ染色体DNAの調製 バチルス アノイリノリティカス(Bacillusa
neurinolyticus) IAM1077をL
−broth培地(純水12当りトリプトン(Dirc
o)10g、酵母エキス5g、 NaCl Logをp
H7,0に調製したもの) 50m1に接種し、30°
Cで振とう培養をおこない、14時間後菌体を集めた。
次に集めた菌体をlO■/−のリゾチーム(太陽化学■
製)、20%ショ糖、l mM EDT^を含む50m
M )リス塩酸緩衝液(p)(7,6)20mQに懸濁
し、37°Cで10分間静置した。次に1%ラウロイル
サルコシン酸を含む0.1 M EDTA溶液(pH9
,6)44d及び5.44■/dのプロナーゼ溶液2.
 Odを加え、500°Cで30分間静置した。次に塩
化セシウム66g。
lO■/成のエチジウムブロマイド溶液3.3 dを加
え、混合した後に38.OOOrpm 、40時間の遠
心分離をおこなった。DNAを注射器で抜取り、n−ブ
タノール抽出によってエチジウムブロマイドを除去し、
1 mM EDTAを含むIOIIM トリス塩酸緩衝
液(pH8,O)に透析することにより約500μgの
染色体DNAを取得した。
(2)染色体DNA断片のベクターへの挿入(1)で得
られた染色体DNA3μgについて0.02ユニツトの
5Au3AI制限エンドヌクレアーゼを加え、37°C
11時間の反応を行うことにより、これを部分分解した
。次にベクタープラスミドpBR322(東洋紡績型)
1μgについて4ユニツトのBamHI 制限酵素を加
え、37°C11時間の反応を行うことによりこれを完
全分解し、更にlユニットのアルカリフォスファターゼ
を加え、37°C11時間の反応を行うことにより、5
′末端のリン酸を除去した。
以上の方法により得られた3μgの染色体DNA断片と
1μgのpBR322のDNA断片を混合し、更に1m
MATP及び5IIIMジチオスライトールの存在下に
5ユニツトのT4ファージ由来のDNAリガーゼを用い
て15°C116時間の連結反応を行うことにより染色
体DNAを組込んだプラスミドDNAを取得した。
(3)  BanI制限エンドヌクレアーゼ遺伝子を含
む組換えプラスミドによる形質転換 エシェリヒア・コリに一12株とエシリヒア・398株
のハイブリッド株であるエシェリヒア・3988101
株をLB培地(純水11当りトリプトン(Dirco)
 10g、酵母エキス5g、 NaC110g@pH7
,0に調製したもの)lOIdに接種し、37°Cで振
とう培養を行い、対数増殖期まで生育させた後に集菌し
た。これを水冷下、最終濃度で0.03M CaC1z
の溶液に懸濁させてコンピテントな細胞とした。この細
胞懸濁液に(2)で得たプラスミドDNAの溶解液を加
えて、水冷下で60分反応させ、42°C,1−2分間
ヒートショックをあたえて、前記プラスミドDNAを細
胞内にとり込ませた0次いでこの細胞懸濁液を別途前記
LB培地に接種し、37’C,35時間振とう培養して
且つBan [制限エンドヌクレアーゼを生産する株を
分離し、ニジエリチア・コリ)IBIOI (pBan
lRM8) (FERM P−9424)を得た。この
形質転換微生物に含まれるプラスミドpBanlRM8
の制限酵素地図を第1図に示す。またpBanIRM8
をサブクローニングしてBan Iメチラーゼを生産す
る株を分離しエシェリヒア・コリ (pBanIM 4
 )(FERM P−10741)を得た。
(4)  :L’yエリヒア・コリHBIOI (pB
anlllM 8 )によるBan l制限エンドヌク
レアーゼの生産(3)で得られた形質転換株エシェリヒ
ア・11月lB101 (pBanlRM8) (FE
RM P−9424)を前記LB培地200L発酵タン
クで37°C,16時間通気攪拌培養を行った。これを
遠心分離して集菌、培養菌体385gをえた。得られた
菌体100gよりBan l制限エンドヌクレアーゼを
精製した。菌体100gをBufferA(10mM 
Mgch、 7mM 2−メルカプトエタノールを含ん
だ20mM トリス塩酸緩衝液pH7,5)500成に
懸濁した。この懸濁液を超音波破砕器ソニファイアにて
10分間破砕後、上澄液を調製した。上澄液を0゜2M
NaC1存在下でポリエチレンイミンを0.2%になる
ように添加し、8000rpm 、20分間遠心分離を
行い上澄液を得た。この上澄液に硫安を70%飽和加え
、硫安沈澱後洗澱物を集め、10mM MgC1z、7
mM2−メルカプトエタノールを含む20mMのトリス
塩酸緩衝液(pH7,5)に懸濁し透析を行った。透析
後、フォスフォセルロース力ラム(体積200d)クロ
マトグラフィを行った。Ran l制限エンドヌクレア
ーゼはKCI濃度0.5M付近で溶出された。溶出され
た酵素液を透析チューブに入れ透析した。透析液を更に
ヒドロキシアパタイトカラム(80In1)クロマトグ
ラフィを行った。リン酸濃度0.3MにてBan I画
分が溶出された。更にこの画分を透析後DEAE−セフ
ァロース(40d)クロマトグラフィを行うとRan 
Iは洗浄画分に溶出することが認められた。この両分を
濃縮後セファクリルS−200ゲル濾過を実施した。ゲ
ル濾過Ban I画分を透析チューブに入れ、2a+M
  メルカプトエタノール、50%グリセロールを含ん
だリン酸緩衝液に透析することにより2.8 In1の
酵素液が得られた。
この精製Ban I酵素を5DS−PAGE法にて蛋白
純度を調べると単一の13an I蛋白であることがわ
かった。またセファクリル5−200の溶出位置により
Ban Iの分子量は約72.000(SO5−PAG
Eよりサブユニット分子136,000のダイマー)と
推定された(第2図)。本酵素標品についてアミノ酸シ
ーケンサ−にてN末端アミノ酸配列を決めるとAlaG
 ln−Leu−Lys−Tyr−Asn−Lys−A
sp−I 1e−Asp−G lu−LeuGluであ
ることが判明した。
(5)  BanIメチラーゼ遺伝子を含む組換えプラ
スミドによる形質転換 Ban l制限エンドヌクレアーゼのDNAを含む組換
えプラスミドpBanlRM 8よりメチラーゼ遺伝子
のみを含むBan III −5ph I断片をpUc
18のAccf−sph Iサイトに挿入しpBanl
M 4を調製した(第3図)。次いでpBanlM 4
を用いて常法によりE、coliHBIOIを形質転換
した。
(6)エシェリヒア・コリHBIOI (pBan I
M 4 )によるRan Iメチラーゼの生産 Ban IメチラーゼをコードするDNAをもつpBa
nlM4を保有するE、coli HBIOI (pB
anlM4)(FIERM P−10741)をL−b
roth培地で0.52フラスコを用いて培養し、菌体
を集めた。菌体をBufferA 50m1に懸濁後超
音波破砕(3A、10分)した。35,000rpm 
、30分遠心して上澄液を得た。この上澄液をフォスフ
ォセルロース力ラム(40d) クロマトグラフィを実
施した。Ban Iメチラーゼはカラムを通過するので
これを集め、DEAEカラムクロマトグラフィを行った
。Ban IメチラーゼはKCI 0.3Mで溶°出さ
れる。この両分を再びフォスフォセルロース力ラム(2
0d)クロマトを実施した。Ban 1メチラーゼは0
.45M KCIで溶出された。この両分を濃縮し、セ
ファクリルS−200ゲル濾過(2cmx37cm)を
おこなった。Ban Iメチラーゼ画分を透析し更にヘ
パリン(10d)カラムクロマトグラフィを行った。溶
出画分をポリエチレングリコール濃縮後、50%グリセ
ロール溶液で透析した。全活性4キロユニツトのBan
 Iメチラーゼを得た。
本標品を5O3−PAGE後銀染後注染色法白純度を調
べると単一のバンド(第8図)を示した。またこの場合
、分子量は約44,000であった。ゲル濾過法では約
45,000であった(第4図)。本酵素はモノマー酵
素であると推定された。
(7)  Ban I制限エンドヌクレアーゼ、Ban
 IメチラーゼをコードするDNAの単離及び塩基配列
の決定 (3)で得られたBan I制限エンドヌクレアーゼを
生産する株エシェリヒア・コリHBIOI (pBan
lRM 8 )(FERM P−9424)を培養し常
法により組み換えプラスミド(pBanlRM 8 )
を調製した。調製したpBanlllMBを制限酵素旧
ndlI[、5phIで切断し、Ban 1制限エンド
ヌクレアーゼ、Ban IメチラーゼをコートするDN
A断片(6,2kb)を切り出しクレノーフラグメン[
・に平滑末端化した後、これをpUclBの旧nclI
サイトに挿入しρBanlRM6.2を作成した(第5
図)。このptlc 18に挿入されたpBanlRM
 8由来のDNA断片の制限酵素地図を示す(第6図)
また、この挿入断片におけるBan I制限エンドヌク
レアーゼ及びBan Iメチラーゼのコーディング領域
を第7図に示す。図中、BanIRはBan I制限エ
ンドヌクレアーゼのコーディング領域を表わし、Ban
IMはBan Iメチラーゼのコーディング領域を表わ
す。なお、Cmp 1〜4は塩基配列を決定するのに使
用したカスタムメイトプライマーを示す。
次にpBanlRM6.2を制限酵素; BamHI、
 Kpnlで切断しBamHI−にpnl D N A
断片を調製した。このDNA断片をエキソヌクレアーゼ
■、マングビーンヌクレアーゼでBan I制限エンド
ヌクレアーゼ遺伝子側より漸次的欠失(Deletio
n)を行い、得られた漸次的デレーシコン ミュタント
を作成し、ジオキシ法にてシーケンス決定を行った。こ
れによりDNAの1.方の鎖の塩基配列が決定された。
他方の鎖については、上述のとおり決定した塩基配列に
相補的なヌクレオチド(17mar)を合成しこれらを
プライマーとしジオキシ方にて塩基配列の決定を行った
。その結果、前記式■及び■に示されるBan I制限
エンドヌクレアーゼをコードするDNA及びBan I
メチラーゼをコードするDNAの塩基配列を決定した。
また、この■及び■の塩基配列に対応する式I及び式■
のアミノ酸配列は、N末端において前記(4)及び(6
)の項に示したBan 1制限エンドヌクレアーゼ及び
Ban IメチラーゼのN末端のアミノ酸配列とそれぞ
れ一致した。
〔発明の効果) 本発明により、Ran 1制限エンドヌクレアーゼをコ
ードするDNA及びBan Iメチラーゼをコードする
DNAを提供することができた。これにより夾雑酵素を
含有しない純粋なりan I制限エンドヌクレアーゼ標
品を遺伝子操作技術を用いることにより効率的かつ大量
に生産することが可能となる。また、本発明により提供
されるBan [メチラーゼ自体も遺伝子操作技術にお
いて試薬等として極めて重要なものであり、遺伝子操作
技術の発展に大いに寄与するものである。
【図面の簡単な説明】
第1図はpBanlRM 8のプラスミドの制限酵素地
図、第2図はpBan I制限エンドヌクレアーゼの分
子量の測定結果を示す図、第3図はplan IRM 
8よりpBanlM 4への構築図、第4図はRan 
Iノチラーゼ分子量、の測定結果を示す図、第5図はp
BanlRM6.2の構築図、第6図はpBanlRM
6.2の作成に際し、pUclBに挿入されたpBan
lRM 8由来のDNA断片の制限酵素地図を、第7図
はpUclBに挿入されたpBanlRM 8由来のD
NA断片におけるBan 1制限エンドヌクレアーゼ及
びBan Iメチラーゼのコーディング領域、並びにこ
れら酵素のDNA塩基配列決定のストラキジーを示す図
である。 第8図は本発明により得られたBan Iメチラーゼの
電気泳動パターンを表わす写真である。

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、バチルスアノイリノリティカス(Bacillus
    aneurinolyticus)由来のBanI制限
    エンドヌクレアーゼをコードするDNA断片。 2、次の式 I で表わされるアミノ酸配列をコードする
    塩基配列を有する請求項1記載のDNA断片。 式 I                          
                10 Met Ala Gln Leu Lys Tyr A
    sn Lys Asp Ile           
                             
      20 Asp Glu Leu Glu Arg Asn A
    la Ala Lys Trp           
                             
      30 Trp Pro Asp Phe Leu Ala L
    ys Lys Glu Ser           
                             
      40 Ser Thr Ser Ile Ile Pro L
    ys Leu Val Glu           
                             
      50 Ser Gln Asp Ala Phe Ile S
    er Leu Leu Asn           
                             
      60 Leu Ser Lys Asn Asn Pro P
    he Asp Ile Phe           
                             
      70 Gln Leu Ile Asp Ala Ser L
    ys Phe Pro Pro           
                             
      80 Asn Leu Phe Leu Lys His L
    eu Val Val Leu           
                             
      90 Thr Asp Phe Gly Gly Glu P
    ro Leu Asn Arg           
                             
     100 Leu Asn Gln Asn Phe Asp S
    er Leu Phe Pro           
                             
     110 Met Ile Pro Tyr Gly Ile H
    is Tyr Ile Thr           
                             
     120 Lys Val Leu Gly Lys Phe G
    lu Phe Phe Trp           
                             
     130 Asn Glu Lys Lys Tyr Glu T
    yr Val Phe Gln           
                             
     140 Glu Leu Pro Val Thr Ser L
    eu Thr Asn Ser           
                             
     150 Lys Leu Lys Ile Asp Gly A
    la Ser Ile Ser           
                             
     160 Lys Thr Val Pro Leu Ser A
    sp Leu Tyr Lys           
                             
     170 Asp Val Ile Val Leu Leu M
    et Phe Gly Ala           
                             
     180 Asn Ala Val Asn Ser Glu V
    al Ser Glu Val           
                             
     190 Leu Met Lys Cys Glu Val G
    ly Asn Leu Ile           
                             
     200 Gly Lys Thr Asp Glu Leu L
    ys Lys Phe lle           
                             
     210 Lys Glu Arg Tyr lle Phe V
    al Ser Arg Ile           
                             
     220 Thr Gly Gly Ala Glu Ala A
    sn Thr Leu Gly           
                             
     230 Gln Val Ala Gln Thr His V
    al Ile Asp Phe           
                             
     240 Leu Arg Thr Arg Phe Gly S
    er Lys Gly His           
                             
     250 Asp Ile Lys Ser Asn Gly H
    is Ile Glu Gly           
                             
     260 Val Thr His Asn Asp Gly G
    ln Thr Leu Thr           
                             
     270 Thr Phe Asp Val Val Ile L
    ys Lys Gly Ser           
                             
     280 Lys Ser Val Ala Ile Glu I
    le Ser Phe Gln           
                             
     290 Val Thr Thr Asn Ser Thr I
    le Glu Arg Lys           
                             
     300 Ala Gly Gln Ala Lys Ala A
    rg Tyr Asp Met           
                             
     310 Val Ser Asp Thr Gly Asn T
    yr Ile Ala Tyr           
                             
     320 Ile Ile Asp Gly Ala Gly A
    sn Phe Gln Arg           
                             
     330 Lys Asn Ala Ile Thr Thr I
    le Cys Asn Asn           
                             
     340 Ser His Cys Thr Val Ala T
    yr Tyr Glu Glu           
                             
     350 Glu Leu Asn Val Leu Leu L
    ys Phe Ile Leu Glu Lys Le
    u Glu 3、次の式IIで表わされる塩基配列を有する請求項2記
    載のDNA断片。 式II         10         20    
         30        ATGGCACAGC
     TTAAATACAA TAAAGATATT GA
    TGAAT 40 TGG         50         60    
         70        AAAGAAACGC
     TGCAAAGTGG TGGCCGGATT TT
    CTAGC 80 TAA         90        100    
        110        AAAGGAGTCG
     TCAACGAGCA TTATTCCTAA AC
    TGGTC120 GAA        130        140    
        150        TCGCAAGATG
     CTTTTATATC TTTATTAAAT CT
    CACTA160 AGA        170        180    
        190        ACAACCCTTT
     CGACATTTTC CAACTAATAG AC
    GCATC200 TAA        210        220    
        230        GTTCCCACCC
     AATCTGTTTC TAAAGCATCT TG
    TTGTA240 TTA        250        260    
        270        ACCGACTTTG
     GTGGAGAGCC ACTAAATCGC TT
    GAATC280 AAA        290        300    
        310        ACTTTGATTC
     GCTTTTTCCC ATGATTCCCT AT
    GGAAT320 CCA        330        340    
        350        TTACATAACA
     AAAGTGTTAG GGAAATTTGA AT
    TTTTT360 TGG        370        380    
        390        AATGAGAAAA
     AATATGAATA TGTTTTTCAA GA
    ACTTC400 CGG        410        420    
        430        TTACATCATT
     AACTAATTCA AAACTCAAGA TT
    GACGG440 ACC        450        460    
        470        AAGTATTTCT
     AAGACAGTCC CACTTTCTGA TT
    TATAT480 AAA        490        500    
        510        GATGTAATTG
     TATTACTCAT GTTCGGTGCT AA
    TGCTG520 TTA        530        540    
        550        ATTCGGAAGT
     ATCCGAAGTT TTGATGAAAT GT
    GAAGT560 TGG        570        580    
        590        AAATCTCATT
     GGTAAGACTG ACGAGTTGAA GA
    AGTTT600 ATT        610        620    
        630        AAGGAGCGTT
     ATATTTTTGT AAGCAGAATA AC
    AGGAG640 GGG        650        660    
        670        CTGAAGCAAA
     TACGTTAGGT CAAGTCGCTC AA
    ACCCA680 TGT        690        700    
        710        AATAGATTTT
     CTAAGAACTC GATTCGGGTC TA
    AGGGT720 CAC        730        740    
        750        GATATAAAAA
     GTAATGGACA CATTGAAGGT GT
    GACCC760 ATA        770        780    
        790        ACGATGGACA
     AACACTAACC ACTTTTGATG TA
    GTCAT800 AAA        810        820    
        830        AAAAGGCAGC
     AAAAGCGTTG CGATTGAGAT TA
    GCTTC840 CAG        850        860    
        870        GTAACTACAA
     ATAGTACCAT CGAGCGTAAA GC
    TGGAC880 AAG        890        900    
        910        CTAAAGCACG
     ATACGATATG GTTAGTGATA CT
    GGCAA920 TTA        930        940    
        950        TATAGCTTAT
     ATTATCGATG GAGCGGGGAA CT
    TCCAA960 CGT        970        980    
        990       1AAAAATGCAA
     TCACAACCAT TTGTAATAAT AG
    CCATT000 GCA       1010       1020    
       1030       1CAGTAGCTTA
     TACCGAAGAA GAACTAAATG TC
    TTGCT040 AAA       1050       1060 ATTCATCTTA GAAAAACTTG AA 4、バチルスアノイリノリティカス(Bacillus
    aneurinolyticus)由来のBanIメチ
    ラーゼをコードするDNA断片。 5、次の式IIIで表わされるアミノ酸配列をコードする
    塩基配列を有する請求項4記載のDNA断片。 式III                          
                10 Met Lys Ile Lys Phe Val A
    sp Leu Phe Ala           
                             
      20 Gly Ile Gly Gly Ile Arg I
    le Gly Phe Glu           
                             
      30 Arg Ala Ala Lys Arg Phe G
    lu Leu Glu Thr           
                             
      40 Glu Cys Val Leu Ser Ser G
    lu Ile Asp Lys           
                             
      50 Lys Ala Cys Glu Thr Tyr A
    la Leu Asn Phe           
                             
      60 Lys Glu Glu Pro Gln Gly A
    sp Ile His Glu           
                             
      70 Ile Thr Ser Phe Pro Glu P
    he Asp Phe Leu           
                             
      80 Leu Ala Gly Phe Pro Cys G
    ln Pro Phe Ser           
                             
      90 Tyr Ala Gly Lys Gln Gln G
    ly Phe Gly Asp           
                             
     100 Thr Arg Gly Thr Leu Phe P
    he Glu Val Glu           
                             
     110 Arg Val Leu Arg Asp Asn A
    rg Pro Lys Ala           
                             
     120 Phe Leu Leu Glu Asn Val A
    rg Gly Leu Val           
                             
     130 Thr His Asp Lys Gly Arg T
    hr Leu Lys Thr           
                             
     140 Ile Ile Ser Lys Leu Glu G
    lu Leu Gly Tyr           
                             
     150 Gly Val Ser Tyr Leu Leu L
    eu Asn Ser Ser           
                             
     160 Thr Phe Gly Val Pro Gln A
    sn Arg Val Arg           
                             
     170 Ile Tyr Ile Leu Gly Ile L
    eu Gly Ser Lys           
                             
     180 Pro Lys Leu Thr Leu Thr S
    er Asn Val Gly           
                             
     190 Ala Ala Asp Ser His Lys T
    yr Lys Asn Glu           
                             
     200 Gln Ile Ser Leu Phe Asp G
    lu Ser Tyr Ala           
                             
     210 Thr Val Lys Asp Ile Leu G
    lu Asp Ser Pro           
                             
     220 Ser Glu Lys Tyr Arg Cys S
    er Asp Glu Phe           
                             
     230 Ile Gly Gln Leu Ser Lys V
    al Val Gly Asn           
                             
     240 Asn Phe Glu Leu Leu His G
    ly Tyr Arg Leu           
                             
     250 Ile Asp Tyr Arg Gly Gly A
    sn Ser Ile His           
                             
     260 Ser Trp Glu Leu Gly Ile L
    ys Gly Asp Cys           
                             
     270 Thr Lys Glu Glu Ile Glu P
    he Leu Asn Gln           
                             
     280 Leu Ile Ala Asn Arg Arg L
    ys Lys Ile Tyr           
                             
     290 Gly Thr His Gln Asp Gly L
    ys Ala Leu Thr           
                             
     300 Leu Glu Gln Ile Arg Thr P
    he Tyr Asn His           
                             
     310 Asp Gln Leu Glu Val Ile I
    le Lys Ser Leu           
                             
     320 Leu Gln Lys Gly Tyr Leu A
    rg Glu Glu Glu           
                             
     330 Asn Lys Phe Asn Pro Vat C
    ys Gly Asn Met           
                             
     340 Ser Phe Glu Val Phe Lys P
    he Leu Asp Pro           
                             
     350 Asp Ser Ile Ser Ile His L
    eu Thr Ser Ser           
                             
     360 Asp Ala His Lys Leu Gly V
    al Val Gln Asn           
                             
     370 Asn Val Pro Arg Arg Ile T
    hr Pro Arg Glu           
                             
     380 Cys Ala Arg Leu Gln Gly P
    he Pro Asp Asp           
                             
     390 Phe Ile Leu His Ser Asn A
    sp Asn Phe Ala           
                             
     400 Tyr Lys Gln Leu Gly Asn S
    er Val Thr Val           
                             
     410 Lys Val Val Glu Lys Val I
    le Glu Asp Leu           
                             
     420 Phe Gln Asn Asn Val Asn G
    lu Leu Phe Gly Gln Met Ly
    s Leu Ala Asn Val Va l6、次の式IVで表わされる塩基配列を有する請求項5
    記載のDNA断片。 式IV                          
               ATGAAGATTA
     AATTTGTTGA CTTGTTTGCT GG
    AATTG 40 GAG GAATTCGAAT AGGATTTGAA AGA
    GCGGCCA AACGGTT 80 TGA ATTGGAGACT GAGTGTGTAC TTT
    CTAGTGA GATCGAC120 AAA                      
                   AAGGCTTGCG
     AAACATATGC CCTTAATTTT AA
    AGAGG160 AAC CTCAAGGTGA TATACACGAA ATT
    ACCAGCT TTCCAGA200 ATT CGATTTTCTT CTTGCTGGAT TTC
    CTTGTCA ACCCTTT240 TCA TATGCAGGTA AACAACAAGG ATT
    TGGGGAT ACAAGAG280 GAA CATTATTTTT TGAGGTGGAG AGG
    GTTCTTA GGGATAA320 CCG CCCAAAGGCT TTCTTATTAG AAA
    ATGTTCG GGGACTG360 GTA ACACACGACA AAGGAAGAAC TTT
    AAAGACG ATCATTT400 CAA AATTAGAGGA ATTGGGTTAC GGG
    GTTAGCT ACCTATT440 ACT TAACAGTAGT ACGTTTGGTG TCC
    CCCAAAA CCGAGTA480 AGG ATTTATATTT TAGGCATACT CGG
    AAGTAAA CCAAAGT520 TAA CTCTAACCTC TAATGTTGGA GCA
    GCCGATT CTCACAA560 GTA TAAGAATGAA CAAATATCTT TAT
    TTGATGA AAGCTAT600 GCT ACTGTTAAAG ACATTTTAGA AGA
    TTCTCCA AGTGAAA640 AAT ATCGCTGTTC TGACGAATTT ATC
    GGTCAAC TTTCAAA680 GGT                      
                   TGTTGGTAAT
     AACTTTGAAT TGCTACATGG CT
    ATCGC720 TTA ATTGATTATC GTGGCGGTAA TTC
    GATTCAT TCTTGGG760 AAC TTGGCATCAA GGGTGATTGT ACA
    AAAGAGG AAATTGA800 ATT TCTAAATCAG TTGATTGCAA ATA
    GAAGAAA GAAAATT840 TAT GGTACGCACC AAGACGGAAA AGC
    CTTAACT TTAGAGC880 AAA TTCGGACGTT TTATAACCAC GAT
    CAGCTTG AGGTAAT920 AAT AAAATCCCTA CTCCAAAAAG GAT
    ATTTAAG AGAAGAA960 GAA
    1AATAAATTT
    A ATCCCGTTTG TGGGAATATG T
    CTTTTG000 AGG                          
                  1TCTTTAAGTT
     CCTTGACCCA GACAGTATTT CA
    ATCCA040 CCT                      
                             
                             
        1CACATCTAGC GATGCTCAT
    A AGTTGGGAGT AGTTCAG080 AAT                          
                  1AATGTTCCTA
     GAAGGATAAC ACCTCGGGAA TG
    TGCTA120 GAC                          
                  1TGCAAGGTTT
     CCCAGATGAT TTCATACTAC AT
    TCCAA160 TGA                          
                  1CAATTTTGCA
     TACAAGCAGT TGGGGAATTC AG
    TCACT200 GTC                          
                  1AAAGTAGTGG
     AAAAAGTGAT CGACGATTTA TT
    TCAAA240 ACA                          
                  1ATGTAAATGA
     ATTGTTTGGA CAGATGAAAC TT
    GCAAA280 TGT TGTATGA 7、請求項4〜6のいずれか記載のDNA断片を含む発
    現ベクター。 8、請求項7記載の発現ベクターにより形質転換された
    形質転換体。 9、エシャリヒア(esherichia)属に属する
    微生物を形質転換したものである請求項8記載の形質転
    換体。 10、請求項4〜6いずれか記載のDNA断片を組み込
    んだ発現ベクターにより、生物細胞あるいは微生物を形
    質転換し、得られた形質転換体を培養して培養物からB
    an I メチラーゼを採取することを特徴とするBan
    I メチラーゼの製造方法。 11、バチルスアノイリノリティカス(Bacillu
    saneurinolyticus)由来の約4,40
    00の分子量(SDS−PAGE法による)を有するB
    an I メチラーゼ。 12、次の式IIIで表わされるアミノ酸配列を有するポ
    リペプチドである請求項11記載のBan I メチラー
    ゼ。 式III                          
                10 Met Lys Ile Lys Phe Val A
    sp Leu Phe Ala           
                             
      20 Gly Ile Gly Gly Ile Arg I
    le Gly Phe Glu           
                             
      30 Arg Ala Ala Lys Arg Phe G
    lu Leu Glu Thr           
                             
      40 Glu Cys Val Leu Ser Ser G
    lu Ile Asp Lys           
                             
      50 Lys Ala Cys Glu Thr Tyr A
    la Leu Asn Phe           
                             
      60 Lys Glu Glu Pro Gln Gly A
    sp Ile His Glu           
                             
      70 Ile Thr Ser Phe Pro Glu P
    he Asp Phe Leu           
                             
      80 Leu Ala Gly Phe Pro Cys G
    ln Pro Phe Ser           
                             
      90 Tyr Ala Gly Lys Gln Gln G
    ly Phe Gly Asp           
                             
     100 Thr Arg Gly Thr Leu Phe P
    he Glu Val Glu           
                             
     110Arg Val Leu Arg Asp A
    sn Arg Pro Lys Ala       
                             
         120 Phe Leu Leu Glu Asn Val A
    rg Gly Leu Val           
                             
     130 Thr His Asp Lys Gly Arg T
    hr Leu Lys Thr           
                             
     140 Ile Ile Ser Lys Leu Glu G
    lu Leu Gly Tyr           
                             
     150 Gly Val Ser Tyr Leu Leu L
    eu Asn Ser Ser           
                             
     160 Thr Phe Gly Val Pro Gln A
    sn Arg Val Arg           
                             
     170 Ile Tyr Ile Leu Gly Ile L
    eu Gly Ser Lys           
                             
     180 Pro Lys Leu Thr Leu Thr S
    er Asn Val Gly           
                             
     190 Ala Ala Asp Ser His Lys T
    yr Lys Asn Glu           
                             
     200 Gln Ile Ser Leu Phe Asp G
    lu Ser Tyr Ala           
                             
    210 Thr Val Lys Asp Ile Leu G
    lu Asp Ser Pro           
                             
     220 Ser Glu Lys Tyr Arg Cys S
    er Asp Glu Phe           
                             
     230 Ile Gly Gln Leu Ser Lys V
    al Val Gly Asn           
                             
     240 Asn Phe Glu Leu Leu His G
    ly Tyr Arg Leu           
                             
     250 Ile Asp Tyr Arg Gly Gly A
    sn Ser Ile His           
                             
     260 Ser Trp Glu Leu Gly lle L
    ys Gly Asp Cys           
                             
     270 Thr Lys Glu Glu Ile Glu P
    he Leu Asn Gln           
                             
     280 Leu Ile Ala Asn Arg Arg L
    ys Lys Ile Tyr           
                             
     290 Gly Thr His Gln Asp Gly L
    ys Ala Leu Thr           
                             
     300 Leu Glu Gln Ile Arg Thr P
    he Tyr Asn His           
                             
    310 Asp Gln Leu Glu Val Ile I
    le Lys Ser Leu           
                             
     320 Leu Gln Lys Gly Tyr Leu A
    rg Glu Glu Glu           
                             
     330 Asn Lys Phe Asn Pro Val C
    ys Gly Asn Met           
                             
     340 Ser Phe Glu Val Phe Lys P
    he Leu Asp Pro           
                             
     350 Asp Ser Ile Ser Ile His L
    eu Thr Ser Ser           
                             
     360 Asp Ala His Lys Leu Gly V
    al Val Gln Asn           
                             
     370 Asn Val Pro Arg Arg Ile T
    hr Pro Arg Glu           
                             
     380 Cys Ala Arg Leu Gln Gly P
    he Pro Asp Asp           
                             
     390 Phe Ile Leu His Ser Asn A
    sp Asn Phe Ala           
                             
     400Tyr Lys Gln Leu Gly A
    sn Ser Val Thr Val       
                             
         410 Lys Val Val Glu Lys Val I
    le Glu Asp Leu           
                             
     420 Phe Gln Asn Asn Val Asn G
    lu Leu Phe Gly Gln Met Ly
    s Leu Ala Asn Val Val
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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EP0321268A2 (en) * 1987-12-17 1989-06-21 New England Biolabs, Inc. Method for producing the BanI restriction endonuclease and methylase

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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0321268A2 (en) * 1987-12-17 1989-06-21 New England Biolabs, Inc. Method for producing the BanI restriction endonuclease and methylase

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