JPH03500004A - アシル‐ペプチド ヒドロラーゼならびにその製造法および用途 - Google Patents
アシル‐ペプチド ヒドロラーゼならびにその製造法および用途Info
- Publication number
- JPH03500004A JPH03500004A JP63507504A JP50750488A JPH03500004A JP H03500004 A JPH03500004 A JP H03500004A JP 63507504 A JP63507504 A JP 63507504A JP 50750488 A JP50750488 A JP 50750488A JP H03500004 A JPH03500004 A JP H03500004A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- aph
- host
- acyl
- peptide
- dna molecule
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 102100032488 Acylamino-acid-releasing enzyme Human genes 0.000 title claims description 71
- 108010061216 Acylaminoacyl-peptidase Proteins 0.000 title claims description 64
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 10
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 54
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 32
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 32
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 31
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 26
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 26
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 24
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 15
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 15
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 11
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 11
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 9
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 9
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 9
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 8
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 8
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 6
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 5
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 3
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 claims description 3
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 claims description 3
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 claims description 2
- 125000004442 acylamino group Chemical group 0.000 claims description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 claims 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 34
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 34
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 31
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 25
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 24
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 23
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 22
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 14
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 12
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 12
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 12
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 10
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 9
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 9
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 9
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 9
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 9
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 8
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical group BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 7
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- -1 but not limited to Proteins 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 6
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 6
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 4
- 125000000738 acetamido group Chemical group [H]C([H])([H])C(=O)N([H])[*] 0.000 description 4
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000006229 amino acid addition Effects 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 4
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 4
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 4
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 3
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- 229920002271 DEAE-Sepharose Polymers 0.000 description 3
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 3
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 3
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 3
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 3
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 3
- 239000012506 Sephacryl® Substances 0.000 description 3
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 3
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 3
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 3
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 3
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 3
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 3
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 3
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 3
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 3
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Chemical group OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 2
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 2
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 2
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 2
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 2
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 108010027597 alpha-chymotrypsin Proteins 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 2
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 2
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 2
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 2
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 2
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 2
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- GUPXYSSGJWIURR-UHFFFAOYSA-N 3-octoxypropane-1,2-diol Chemical compound CCCCCCCCOCC(O)CO GUPXYSSGJWIURR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AAALVYBICLMAMA-UHFFFAOYSA-N 4,5-dianilinophthalimide Chemical compound C=1C=CC=CC=1NC=1C=C2C(=O)NC(=O)C2=CC=1NC1=CC=CC=C1 AAALVYBICLMAMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 241000859095 Bero Species 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical compound OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 1
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 102000005572 Cathepsin A Human genes 0.000 description 1
- 108010059081 Cathepsin A Proteins 0.000 description 1
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 description 1
- 108010073254 Colicins Proteins 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 244000303965 Cyamopsis psoralioides Species 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N D-alpha-Ala Natural products CC([NH3+])C([O-])=O QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N D-aspartic acid Chemical group OC(=O)[C@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 1
- 241001302584 Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 Species 0.000 description 1
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 1
- 241000282324 Felis Species 0.000 description 1
- 102100021181 Golgi phosphoprotein 3 Human genes 0.000 description 1
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 1
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N L-Alanine Natural products C[C@@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 102000003505 Myosin Human genes 0.000 description 1
- 108060008487 Myosin Proteins 0.000 description 1
- XUYPXLNMDZIRQH-UHFFFAOYSA-N N-acetylmethionine Chemical compound CSCCC(C(O)=O)NC(C)=O XUYPXLNMDZIRQH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000006181 N-acylation Effects 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 241000577979 Peromyscus spicilegus Species 0.000 description 1
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 1
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 101000731924 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 40S ribosomal protein S27-A Proteins 0.000 description 1
- 101000731894 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 40S ribosomal protein S27-B Proteins 0.000 description 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 1
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 1
- 241000607715 Serratia marcescens Species 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 241000723873 Tobacco mosaic virus Species 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000156473 Vallaris heynei Species 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 108010062688 alpha-N-acylamino acid hydrolase Proteins 0.000 description 1
- 125000000266 alpha-aminoacyl group Chemical group 0.000 description 1
- PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N aluminium oxide Inorganic materials [O-2].[O-2].[O-2].[Al+3].[Al+3] PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- 101150057950 aph gene Proteins 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003491 array Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000006482 condensation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 239000005546 dideoxynucleotide Substances 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 239000002532 enzyme inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- ZZUFCTLCJUWOSV-UHFFFAOYSA-N furosemide Chemical compound C1=C(Cl)C(S(=O)(=O)N)=CC(C(O)=O)=C1NCC1=CC=CO1 ZZUFCTLCJUWOSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 150000002430 hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 229910052588 hydroxylapatite Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 238000009940 knitting Methods 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 235000019626 lipase activity Nutrition 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical group CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 230000001035 methylating effect Effects 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 238000011580 nude mouse model Methods 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 238000007500 overflow downdraw method Methods 0.000 description 1
- XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D pentacalcium;hydroxide;triphosphate Chemical compound [OH-].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D 0.000 description 1
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002731 protein assay Methods 0.000 description 1
- 230000007065 protein hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 239000003488 releasing hormone Substances 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M thionine Chemical compound [Cl-].C1=CC(N)=CC2=[S+]C3=CC(N)=CC=C3N=C21 ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000004454 trace mineral analysis Methods 0.000 description 1
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 239000006200 vaporizer Substances 0.000 description 1
- 239000000052 vinegar Substances 0.000 description 1
- 235000021419 vinegar Nutrition 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
アシル−ペプチドヒドロラーゼならびにその製造法および用途発明の背景
発明の分野
本発明は組換えD N A法によるアシル−ペプチドヒドロラーゼの製造に関す
る。また、この酵素を用いてアシル化ペプチドまたはタンパク質の加水分解を、
および誘導体化Na−アセチルアミノ酸供与体と遊離のα−NH1基を有する受
容タンパク質の間の反応を触媒することにも関する。
技術的背景の簡単な説明
タバコモザイクウィルス コートタンパク質のアミノ末端にアセチル基が発見さ
れて以来、多数のN“−アセチル化タンパク質が動物、植物、゛およびそれらの
ウィルスにおいて、さらに細菌および菌類においても発見された。従って、N”
−アセチル化は生物における代表的なタンパク質修飾の1つと考えられている。
さらに、一部の真核細胞では、細胞内可溶性タンパク質の80%以上がN#−ア
セチル化されていることが示唆されていた[Brovn、 J、 L、 + J
、 Biol、 CheIll、 254 :1447−1449(1979ル
。
タンパク質のN′−アセチル化の生物学的な意義については今なお未解決の問題
である[Tsunasawa et al、、Method Enzysol、
106 : 165l65−170(19を参照コ。この翻訳後修飾は細胞内
タンパク質をタンパク質加水分解から保護するもので市ると提案されていた。し
かし、このことはすべてのタンパク質には当てはまらない。枯菌からのアクチン
の場合、タンパク質がN“−アセチル化されるとタンパク質加水分解は遅くなる
。対照的に、ネコのヘモグロビンはN#−アセチル化とは関係なく同じ速度で分
解される[Tsunasawa et al、、 1984コ。
最近のDNA配列決定の結果から、N#−アセチル化される分泌タンパク質の構
造遺伝子においては、アセチル化されるアミノ末端残基のコドンは付加的なアミ
ノ酸のコドンが挿入されることなく、直接、開始コドンが前に存在していること
がわかった[Tsunasava etal、 、 1984]。N“−アセチ
ル化と生物学的膜を通過する分泌タンパク質の運搬の間の関係を理解するための
努力はわずかしか行われていない。N“−アセチル化の機能を完全に理解するた
めには、タンパク質およびペプチド中のN ’−アセチル化アミノ酸を微量分析
尺度で同定することが重要となろう。このためには、Na−アセチル基またはN
“−アセチルアミノ酸の除去が効率的に行われなければならない。
アシル−ペプチド ヒドロラーゼ(API)はN″〜アシル化ペジペプチド水分
解に成功裏に用いられていた。動物の肝臓から精製されたそのような酵素の1つ
は、Na−アセチル化されたタンパク質由来のやや短いペプチドからNa−アセ
チルアミノ酸を放出させることができる[Tsunasata et sl、
+ 1984]。基質特異性はアミノ末端残基に対して広い。APRは、ブロッ
クされたペプチドからN’−末端のアセチルアミノ酸あるいはホルミル化アミノ
酸を切断する[Jones etal、 、 BBRC126: 933(19
85)]。この酵素は多種多様のペプチドの加水分解を触媒し、それを行う際に
ある種の基質に対しては異なる最適pHを示す。また、この酵素は生合成中のポ
リペプチド鎖のプロセッシングにおいて重要な役割を演じることもある。アセチ
ル化された基の存在は多くのタンパク質で検出されないが、これはほとんどの場
合、第1アミノ酸とともに形成期ポリペプチド鎖のブロック基が生合成中のどこ
かで除去されるためである。APHは、ラット肝臓から[Tsunasava
et al、、 J、BiocheIll、 77 : 89−102(197
5)コ、ウシ肝臓から[Gade et al、 、 Bioehim、 Bi
ophys、 Acta 662 : 86−93(1981)コ、ブタ肝臓か
ら[Tsunasawa et al、、 J、Biochem、 93 :
1217−1220(1983)コ、ラット脳から[Marks et al、
、 J、 Neuroche+n、 41 : 201−208(1983)]
、およびヒト赤血球から[Jones et al、、 Biochem、 a
nd Biophys、Res。
Comm、 12B : 933−940(1985)]、精製されている。
本発明は、第1図のアミノ酸配列からなるアシル−ペプチドヒドロラーゼ(AP
R)タンパク質に関する。また、本発明は、組換えDNA法によるAPHの製造
、およびペプチドまたはタンパク質のアミノ−アシル化または加水分解において
APRを利用することに関する。
本発明のAPRをコードしている組換えD N A分子を用いて多数のあらゆる
宿主を形質転換し、APHの新規な供給源およびその無制限の供給を得ることが
できる。本発明の目的は、無制限の供給が可能な実質的に純粋なAP)(の新規
供給源を提供することである。
さらに、本発明は、N#−アシル化タンパク質の加水分解、またはN“−アセチ
ルアミノ酸供与体と遊離のα−NH,Iを有する受容タンパク質の間の反応を触
媒させるためにこの酵素の利用することをも包含するものである。
従って、本発明の別の目的はAPHを用いることによって、N−アシル化タンパ
ク質を加水分解する方法、および遊離のα−N Hを基を有する受容体とN’−
アセチルアミノ酸供与体からあらゆるポリペプチドまたはタンパク質をアミノ−
アシル化する方法を提供するこ第1図はAPHのアミノ酸配列を示すものである
。下線部分および斜線部分は、APHのトリプシンおよび臭化シアンフラグメン
トのエドマン分解法、およびクローンAPH36、l cDNAのジデオキシ鎖
終止配列決定法によって決定した領域である。星印はグリコジル化の可能性のあ
る部位を示す。斜線部分はセリンとヒスチジンの両方を含む活性部位を示す。
第2図は、縮重プローブYS17.2およびYS20.1の配列を得たAPIペ
プチドを示すものである。
第3図は、APHをコードしている遺伝子を同定および単離するために、プロー
ブでcDNAライブ、ラリ−をスクリーニ・ングする際の工程図を示すものであ
る。
第4図は、API36.1クローンのファージD N A挿入体のDNA配列を
示すものであり、ラット肝臓クローンAPH36,1由来の付加的な3°非翻訳
化配列を加え、ラット血清アルブミン配列を除くものである。
第1図および第4図において、アミノ酸は次の1文字のアルファベットで示され
ている:A=アラニン、B=アスパラギン酸またはアスパラギン、C=システィ
ン、D=アスパラギン酸、E=グルタミン酸、F=フェニルアラニン、G=ニブ
リシンH=ヒスチジン、1=インロイシン、K=リジン、L=ロイシン、M=メ
チオニン、N=アスパラギン、P=ニブロリンQ=グルタミン、R=アルギニン
、S=セリン、T=トレオニン、■=バリン、W=ニトリブトファンY=チロシ
ン、Z=グルタミンまたはグルタミン酸。
用語の意味する範囲を示し、明細書および請求の範囲の理解を助けるために以下
に定義を挙げる。
れは転写と翻訳の組合せである。
プラスミド:特定の抗生物質に対する耐性を伝達する遺伝子を含有している生物
の主染色体の一部ではない環状の2本鎖DNA分子。
プラスミドが単細胞生物中に入れられると、プラスミドDNAのために生物の性
質が変化、即ち形質転換される。例えば、テトラサイクリン耐性の遺伝子(T
et”)を担持しているプラスミドは、それまでテトラサイクリンに感受性であ
った細胞を耐性の細胞に形質転換する。プラスミドによって形質転換された細胞
は「形質転換体Jとド、ファージDNAまたはその他のDNA配列。クローニン
グ媒体は、そのDNAの必須の生物学的機能を失うことなくDNA配列を決定可
能な方法で切断することができる1または少数のエンドヌクレアーゼ認識部位を
特徴とし、形質転換された細胞を同定する際に用いるのに適したマーカーを含ん
でいることもある。マーカーは、例えばテトラサイクリン耐性またはアンピシリ
ン耐性である。クローニング媒体はベクターと呼ばれることが多い。
組換えDNA分子またはハイブリッドDNA :生細胞の外で末端−末端結合さ
れた異なるゲノム由来のD N Aセグメントで構成される分子であり、ある種
の宿主細胞に感染する能力を有し、その中で維持される分子。
それによって隣接遺伝子(群)の転写をコントロールすることができるDNA配
列。
プロモーター: RNAポリメラーゼが結合し、隣接遺伝子(群)の転写を開始
させるD N A配列。
アシル−ペプチドヒドロラーゼ(、APH):この用語は、インビボまたはイン
ビトロの系においてあらゆるタンパク質またはペプチドからN’−末端アシル化
アミノ酸を放出させる活性を有する、あらゆる種由来のアシル−ペプチドヒドロ
ラーゼ(群)を含むことを意味する。また、本発明においては、アシル−ペプチ
ドヒドロラーゼなる用語は、ペプチドまたはタンパク質のNa−末端部分からN
”−アセチル化アミノ酸を切断する、天然のアシル−ペプチドヒドロラーゼのあ
らゆる類似体、同族体、突然変異体または誘導体を含むように用いる。また、こ
の用語は、タンパク質またはペプチドのN−末端からアシル化アミノ酸を切断す
る活性を保持している天然アシル−ペプチドヒドロラーゼの部分フラグメントな
どの、天然のアミノ酸数よりも少ないアミノ酸を有するフラグメントをも含むこ
とを意味する。さらに、この用語は、天然のアシル−ペプチドヒドロラーゼまた
はその類似体の配列を1またはそれ以上の周辺のアミノ酸とともに含有し、そし
てアシル−ペプチドヒドロラーゼ活性を示すあらゆる産物を含むように用いる。
また、アシル−ペプチドヒドロラーゼなる用語は、アシル−アミノ酸放出因子、
アシル−アミノ酸放出酵素、アシルーアミノベブチドヒド屯ラーゼおよびアセチ
ルアミノアシル−p−ニトロアニリダーゼなどの同義体をも包含する。
実質的に純粋な形態二本明細書で用いる「実質的に純粋」または「実質的に純化
された」なる用語は、天然の状態でこの因子に通常伴われるあらゆる化合物を実
質的に含まないタンパク質を説明するものである。さらに、この用語は、当分野
で通常の技術を有する者が用いるlまたはそれ以上の純度または均質性の性質か
ら均質である因子を記述するものである。例えば、実質的に純粋な因子は、分子
量、クロマトグラフィー法およびそのような他のパラメーターに対して標準実験
偏差内の一定かつ再現性ある性質を示すであろう。
しかし、この用語はこの因子と他の化合物との人工あるいは合成の混合物を除外
することを意味するものではない。また、この用語は、この因子の生物学的活性
を妨げず、かつ例えば不完全な精製のゆえに存在することもある少量の不純物の
存在を排除することを意味するものではない。
創りすμ秒羞
本発明は、第1図に示したアミノ酸配列を有する酵素、この酵素をコードしてい
る遺伝子配列、この遺伝子配列を含有している媒体、これによって形質転換した
宿主、形質転換宿主発現による酵素の製造、およびペプチドまたはタンパク質の
アミノ−アシル化または加水分解におけるこの酵素の利用を包含するものである
。
ゲル濾過で測定するとラット肝臓APHの分子量は290.000−320.0
00である。サブユニットあたりに1つの活性セリンを有する4つの同じサブユ
ニットが存在するようである。APRのN1−末端はアシル化されている。AP
)Iは、セリン、ヒスチジンおよびカルボキシル基が関与する電荷リレー系を有
するセリンプロテアーゼのようである。活性部位の周辺は、ヒスチジンの存在に
より他のトリプシン族のプロテアーゼとは異なっている。APHは基質に対して
広い特異性を示すが、Ac−Ala−1A c−3er−1およびAc−Met
−含有のペプチド(最も普通のN−末端残基)を他のアシル化ジペプチドよりも
一層効率的に切断する。APHは、A c−T rp−1Ac−Asp−1A
c−G 1u−1A c−A rg−1A c−P he−1およびAc−Pr
o−含有のペプチドに対しては活性を有していないか、または極めて低い活性し
か有していない。
アシル−ペプチドヒドロラーゼ(APH)は、タンパク質がアセチル−CoAか
らアセチル基を受け取る反応を触媒するN’−アセチルトランスフェラーゼとは
区別されるべきである[Tsunasawa et al、、Methods
in Enbryology 106 : 165−170(1984)コ。ま
た、アシル−ペプチド ヒドロラーゼは、α−N−アシルアミノ酸ヒドロラーゼ
jGade etal、、Biochim、 et Biophys、Acta
662 : 86−93(1981)]としても知られているアミノアシラー
ゼC5zajani、Acta Biochim、 et Biophys、A
cad。
Sci、 Hung、15 : 223−228(1980)]とも区別される
べきである。
APHはいくつかの供給源から単離および精製されているが、APHの配列は決
定されていなかった。本発明はこの配列を開示するものである(第1図)。
APRをコードしているDNA配列は種々の供給源から得ることができる。例え
ば、ノーザン・プロ。2ト法[A15ine et al、、MethodEn
zymol、 68 : 220−242(1979)]、およびラベルしたオ
リゴヌクレオチドプローブを用いて、APHを産生じているあらゆる種の組織か
らAPHをコードしているmRNAを単離することができる。次いで、このmR
NAを当業者には既知の方法によってcDNAに変換することができる。プロー
ブはAPRペプチドの既知のアミノ酸配列に基づいて合成することができる。
別法では、縮重DNAプローブを用いてAPIを産生じている種のDNAライブ
ラリーをスクリーニングし、それによってAPIをコードしているDNA配列を
含有しているクローンを単離することができる。このDNAライブラリーは、1
またはそれ以上の制限エンドヌクレアーゼを用いるゲノムDNAのフラグメント
化、それに続くベクターへの導入、およびそれを用いることによる宿主細胞の形
質転換によって得られ、次いで宿主細胞を培養およびスクリーニングする。
DNAプローブは検出可能な一団によってラベルすることができる。そのような
検出可能な一団は、検出しうる物理的または化学的性質を有するあらゆる物質で
あってよい。そのような物質は免疫検定法の分野で広く開発されており1、通常
、そのような方法でを用なほとんどすべてのラベルを本発明に適用することがで
きる。特に有用なものは、酵素的に活性な群、例えば酵素[CI in、 Ch
ew、μ: 1243(1976)を参照]、酵素基質[英国特許明細書1.5
48.741を参照コ、補酵素[米国特許N o、 4.230.797および
4.238.565を参照]および酵素阻害物質口米国特許No、 4.134
.792を参照コなど:蛍光物質[CI in、 Chew。
25 : 353(1979)を参照]:発色物質;ルミネッセンス物質、例え
ば化学ルミネッセンス物質および生物ルミネッセンス物質[CI in、 Ch
ew。
25 : 512(1979)を参照]:特異的に結合しうる配位子;近接の相
互作用する対:ならびに放射性同位体、例えばsH,@SS、@tp、ttJお
よびI4Cなどである。このようなラベルおよびラベルする対は、それら自身の
物理的な性質(例えば、蛍光物質、発色物質および放射性同位体)またはそれら
の反応もしくは結合の性質(例えば、酵素、基質、補酵素および阻害物質)に基
づいて検出される。例えば、補助因子ラベルされたプローブは、酵素(ラベルは
この酵素のための補助因子である)と酵素のための基質を加えることによって検
出することができる。例えば、基質に作用して測定可能な物理的性質を有する産
物を生成する酵素を用いることができる。後者の例には、β−ガラクトシダーゼ
、アルカリホスファターゼおよびペルオキシダーゼが含まれるがこれらに限定は
されない。
連結(ライゲート)のための平滑末端化または付着末端化、適切な末端を得るた
めの制限酵素消化、適当なところでの付着末端の充填、望ましくない結合を避け
るためのアルカリホスファターゼ処理、および適当なりガーゼによる連結を包含
する常法に従い、ベクターDAPHを発現させるためには、適当な宿主要素によ
って認識される転写および翻訳シグナルが必要である。真核宿主は、インビトc
で培養することができる哺乳動物細胞、特に白血球、とりわけ骨髄腫細胞または
他の形質転虜されたかもしくは腫瘍性のリンパ球、例えばEBV形質転換された
細胞であってよい。別法によれば、非哺乳動物細胞も用いることができ、細菌、
菌類、例えば酵母、糸状菌などを用いることができる。
APR製造のための可能性ある宿主は、インビトロの組織培養で、または動物中
インビボで増殖させた哺乳動物細胞である。哺乳動物細胞は、正しい折り畳みあ
るいは正しい部位のグリコジル化を含むAPH分子に対する翻訳後修飾を付与す
ることができる。宿主として有用な哺乳動物細胞には、BEROもしくはCHO
−Klなどの線維芽細胞起源の細胞、またはハイブリドーマS P 210−A
G 14もしくは骨髄腫P3x63Sghなどのリンパ様細胞起源の細胞、およ
びそれらの誘導体が含まれる。通常、APH構築物は、宿主細胞によって認識さ
れる複製系を有するベクターの一部であろう。
好ましい態様では、APHをコードしている遺伝子を担持しているプラスミドに
よって原核細胞を形質転換する。特に重要な細菌性宿主には、大腸菌(E、co
li)K 12株294(ATCC31446)、大腸菌X1776(ATCC
31537)、大腸菌W3110(F−1λ−、プロトトロピー性:ATCC2
7325)、およびその他の腸内細菌科の細菌、例えばSalmonella
typhimuriumあるいはSerratiamarcescens、およ
び種々のPseudomona種が含まれる。このような条件下ではAPHはグ
リコジル化されないであろう。原核性宿主は、発現プラスミド中のレプリコンお
よびコントロール配列に適合するものでなければならない。APHをコードして
いるcDNAを含有するプラスミドを保持している原核性宿主は、1987年8
月21日にアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクシラン[American
Type Cu1ture Col Iection、 Rockville
、 MIL L:SAコに寄託され、受託番号ATCC67504を得ている。
通常、宿主細胞に適合しうる種から導かれるレプリコンおよびコントロール配列
を含有しているそのようなベクターは、宿主との関係で用いられる。このベクタ
ーは、通常、レプリコン部位ならびに形質転換細胞において表現型選択を与える
ことができる特定の遺伝子を担持している。また、APRをコードしているDN
Aの発現を、他の調節配列(形質転換されていない状態の生物にとってホモロー
ガスであってよい)の支配下に置くこともできる。例えば、ラクトース依存性の
大腸菌染色体DNAは、酵素β−ガラクトシダーゼを同化してラクトース利用を
仲介するラクトースまたはlacオペロンを含有している。lacコントロール
要素は、大腸菌に感染性であるバクテリオファージλplac5から得ることが
できる。lacプロモーター−オペレーター系はI PTGによって誘導するこ
とができる。
他のプロモーター/オペレーター系またはその一部も同様に用いることができる
。例えば、コリシンE1、ガラクトース、アルカリホスファターゼ、トリプトフ
ァン、キシロース、taxなどを用いることができる。
哺乳動物宿主のために、いくつかの可能性あるベクター系を発現用に利用するこ
とができる。ある群のベクターは、ウシ乳頭楯ウィルス、ポリオーマウィルス、
アデノウィルス、または5B40ウイルスなどの動物ウィルスから得られる、自
律的に複製する染色体外プラスミドを与えるDNA要素を利用している。第2の
群のベクターは、所望の遺伝子配列の宿主染色体への組込みに依存している。
導入DNAを染色体中に安定に組込んでいる細胞は、発現ベクターを含有してい
る宿主細胞の選択を可能にするマーカーをも導入することによって選択すること
ができる。このマーカーは、栄養要求変異宿主にプロトトロピーを、生物致死剤
(例えば、抗生物質、または銅などの重金属)耐性を付与するものであってよい
。選択マーカー遺伝子は発現させようとするDNA配列に直接結合させてもよい
し、また同時形質転換によって同−細胞中に導入してもよい。また、別の要素が
mRNAの合成を最適にするために必要となることもある。これらの要素には、
スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサ−1および終止シ
グナルが含まれる。このような要素を導入したc D N A発現ベクターには
、Okayama、 H,+ Mo1. Cel。
Biol、 3 : 280(1983)が記載しているベクターなどが含まれ
る。
宿主の性質に依存して多種多様の転写および翻訳調節配列を用いることができる
。この転写および翻訳シグナルは、調節シグナルが発現レベルの高い特定の遺伝
子に結合しているアゾ/ウィルス、ウシ乳頭腫ウィルス、サルウィルスなどのウ
ィルス供給源から得ることができる。別の方法によれば、アクチン、コラーゲン
、ミオシンなどの哺乳動物発現産物由来のプロモーターを用いることができる。
また、抑制または活性化を与える転写開始シグナルを選択して遺伝子の発現を調
節することもできる。重要なのは、温度感受性であって温度が変わると発現を抑
制するかまたは開始させることができる調節シグナル、または化学的な調節(例
えば、中間代謝物)を受ける調節シグナルである。
構築物を含有しているDNA配列またはベクターが発現用に調製されたなら、こ
のDNA構築物を適当な宿主に導入することができる。プロトプラスト融合法、
リン酸カルシウム沈澱法、電気穿孔法あるいはその他の通常の方法など、種々の
方法を用いることができる。融合の後、細胞を培地中で増殖させ、適当な活性に
ついてスクリーニングする。遺伝子(群)が発現されるとAPHが産生される結
果になる。
APH産生のための宿主細胞は、永久細胞、主に骨髄腫あるいはリンパ腫細胞で
あってよい。これらの細胞を、培養フラスコ中の適切な栄養培地で増殖させるか
、または相乗的宿主(例えば、マウスまたはラット)もしくは免疫欠損宿主もし
くは宿主部位(例えば、ヌードマウスまたはハムスター嚢)に注射することがで
きる。
本発明のAPRは、例えば抽出、沈澱、クロマトグラフィー、アフィニティーク
ロマトグラフィー、電気泳動などの通常の方法に従って単離および精製すること
ができる。
里養
製造および精製されたAPHを例えば医薬製造の分野で用いて、N−アシル化さ
れたペプチドを加水分解するか、あるいはペプチドのN’−末端をアミノアシル
化することができる。前者は水溶液中で行われ、無反応性のタンパク質をエドマ
ン配列決定に対して感受性にする。後者は無水に近い環境下で行われ、治療に用
いるタンパク質の分解を減少させるのに有用である。有機合成のための2相系で
酵素を使用することについては、A、 K11binovの記載r L!neo
nvent 1onender編、1973)を参照。
無水に近い環境はAPIの基質特異性を変え、ペプチドのアミノアシル化が起こ
るであろう。有機溶媒中での酵素の基質特異性は、水中での特異性とは根本的に
異なっていることがあり、時には逆であることもある[Zaks et al、
、 J、 Am、 Chew、 Soc、旦8 : 2767−2768(1
91116)を参照コ。水と混和するかまたは混和しない溶媒中、トリプシンお
よびα−キモトリプシンによってペプチドを合成することができカビのリパーゼ
が、多数のほぼ無水の溶媒中で触媒として強力に作用することがわかった。有機
媒体中でのリパーゼの活性は、リパーゼを回収した水溶液のpHに依存している
。有機溶媒中での最大のリパーゼ活性は、水中での酵素活性のpH最適条件に一
致する[Zakset al、 、 Proc、 Nat’ 1. Acad、
Sci、 USA 82 : 3192−3196(1985)を参照コ。
さらに、酵母から得られるカルボキシペプチダーゼYなどのセリンカルボキシペ
プチダーゼが、アミノ酸エステルまたはアミドまたは他の基質とアミノ酸または
他のアミン成分との反応によってペプチドを合成することができることが示され
た(米国特許N o、 4.339.534)。
APHなどの酵素は、いくつかの基本的な規則に従うという条件のもと、有機溶
媒中で触媒として強力に機能することができる。これらの規則には次のものが含
まれる=(1)溶媒の適切な選択(酵素分子から必須の水層を取り除くものでな
いときには疎水性の溶媒が最も良い) ; (2)酵素活性にとって最適pHの
水溶液から回収された酵素の使用;および(3)有機溶媒中での酵素粉末の微細
な分散および激しい撹拌による拡散の制限の排除[Zaks et al−+
1986を参照]。
APR触媒の縮合反応の反応物質は、受容ポリペプチド、例えば遊離のN“−末
端基を有するタンパク質、および基質、例えばアシル化されたアミノ酸のベンジ
ルアルコール誘導体である。基質の濃度はアミノ−アシル化反応を起こさせるに
十分なものであることが必要である。選択される溶媒は、酵素を囲んでいる必須
の水分子の層を除去しない疎水性の溶媒である。溶媒に入れる前のAPRは、酵
素活性にとって最適のpHの水溶液から回収される。溶媒中の微細なAPI粉末
の分散、および激しい撹拌を行って拡散が制限されることを抑制する[Zaks
et al、、J、Am、Chem、Soc、 108: 2767−276
8(1986)コ。さらに、有機の条件は、酵素が有機媒体に不溶性であること
からAPHの抽出を容易にするであろう[Zaks et al、 、 Pro
c、 Nat’ 1゜APRはその微細な水和粉末形態で懸濁させてもよいし、
また担体上に固定してもよい。−価アルコールなどの不活化試薬に対する酵素の
安定性は固定化によって高められることが多い。トリプシンおよびα−キモトリ
プシンは、不溶性のアルミナーホスホコラミノコンプレックス上に固定化される
と、水混和性のm個アルコールを含む有機溶媒に対して顕著な耐性を示すことが
わかった[Pugniereet al、 、 1986]。APHを当業者に
は既知の方法によってビーズおよびその他の担体に固定化し、次いでこれをバッ
チで、またはカラムで用いることができる。
ここまで本発明を一般的に説明したが、本発明は以下の具体的な実施例を参照す
ることによってさらによく理解されるであろう。これらの実施例は説明のために
だけ本明細書中に挙げたものであって、特に記載がなければ本発明はこれらに限
定されるものではない。
実施例
実施例I APHの抽出および精製
應扶科: DEAEセファロースCL−68%FPLCカラム(モノQHR51
5、およびモノ5HR515)、セファクリル5−so。
スーパーファイン、オクチル−セファロース、およびポリバッファー74はP
harmaciaから、スフェロゲルCAA−HICカラム(0゜46xlOc
x)はB eclvanから、ヒドロキシルアパタイト(バイオゲルHT)はB
1o−Radから、グリセロールはBRLから、リアクチゲル6XはP 1e
rceから、そしてアミノ酸(A e−L −A la)はS igmaから入
手した。他のすべての化学物質は試薬級またはそれ以上であっ酵素の精製:DE
AEセルロースおよびセファロース6Bの代わりにDEAEセファロースCL−
6BおよびセファクリルS−300をそれぞれ用いたことを除き、Tsunas
awa et al、 、 J、 Biochem、 (Tokyo)77 :
89−102(1975)ノ記載のようにしr300yの5ット肝1m(雄、
CD株)からAPRを精製した。力・ラムの大きさおよび勾配も変えた。ヒドロ
キシルアパタイト クロマトグラフィーに対しては、出発の勾配は20s+ll
リン酸緩衝液ではなく5mMリン酸緩衝液であり、10%のグリセロールを勾配
に用いた。4119の精製酵素を得た。DEAEセファロースCL−5Bクロマ
トグラフイーの間に全活性の増加が観察された。セファクリルS−300からの
タンパク質の均質性を確認するために追加のクロマトグラフィーを行った:即ち
、(i)pH5〜8の種々の緩衝液を用いるモノQおよびモノSによるPhar
macia FPLCシステムでのイオン交換クロマトグラフィー:0)オクチ
ル−セファロースおよびスフェロゲルCAA−HICによる疎水性相互作用クロ
マトグラフィー;(i)ポリバッファー74を用いるモノPによるクロマトフオ
ーカシング:および(m)リアクチゲル6X(Pierce)およびアセチル−
L−アラニンから調製したAc−L −A la−セファロースを用いるアフィ
ニティークロマトグラフィーである。いずれの場合にも、なお一層の分離あるい
は活性の増加は観察されなかった。
工程 活性 タンパク質 比活性 収率 精製度(単位) (i9) (単位/
119)(%)1 本モジトド 194 44200 G、00439 100
1.00212000xg上清 194 3940G 0.00492 10
0 1.124熱処理 139 2520 0.(15526511,55DE
AE−セフTO−ス 20g 29.3 7.10 108 16306 ヒF
o4ジルアパタイト 148 5゜90 25.1 76 571110実施例
2 APIのトリプシンおよび臭化シアンフラグメントのアミノ酸配列決定およ
びプローブの作成本実施例の方法は第3図の左側に示されているものである。
原材料:APHは実施例1のようにして精製した。純度はLaemmli。
Nature 227 : 680−685(1970)の方法によりSDSポ
リアクリルアミドゲル電気泳動によって確認した。
臭化シアン、グアニジン−HCQ、2−メルカプトエタノール、上りフルオロ酢
酸(TFA)はP 1erceから、アセトニトリル(HPLCグレードUV遮
断188 nm)はJ−T−Bakerから入手した。N−トシル−PheCh
*Cgで処理したトリプシンはWorthingtonから購入した。B ra
dformタンパク質検定試薬および電気泳動試薬はB 1o−Radから入手
した。ただし、分子量マーカーおよびトリスはSigmaから購入した。Z w
i ttergent 3−14はCalbiochemから、[14C]ヨー
ド酢酸(9,8+lIC1/mモル)はNew England Nuclea
rから入手した。
他のすべての試薬は、入手可能な市販品のなかで最高純度のものを用いた。
ジスルフィド結合の還元およびヨード酢酸によるアルキル化7Mグア=シフHC
(!/2mM EDTAを含有する0、5M )リス−HCl2(pH8,5)
中でAPH(3nモル)を変性し、アルゴン下、室温で12時間または37°C
で3時間、8〜10mM2−メルカプトエタノールを用いて還元した。この混合
物(0,19mのにi’ l A Cコヨード酢酸[30μQの0,5晃 トリ
ス−HCQ(pH8,5)/7聞グアニジンHCl2/2mM’EDTA中に2
.6μモル]を加え、この反応を暗所中、37°Cで1時間行った。次いで、2
−メルカプトエタノールを最終濃度Q、2M1mなるまで加えた。このタンパク
質を、4容量のアセトン/メタノール(3:1、v/v)による沈澱またはO,
LMの酢酸に対する透析によって脱塩し、5avantコンセントレータ−/エ
バポレーターで凍結乾燥した。
カルボキシメチル化したタンパク質を70%ギ酸(0,1〜0.2112)に溶
解し、これにCNBr溶液(70%ギ酸中100o/xの(10〜15μe)を
加えた。この混合物を室温で24時間インキュベートし、水で希釈した後に真空
乾燥した。このCN B r切断したペプチドフラグメントを逆相HPLC(R
PLC)で精製するか、またはトリプシン消化によってさらにフラグメント化し
た。
トリプシンによる消化
0.2%Z wittergnt 3−14を含有する()、2M炭酸水素アン
モニウム(0,2112)にCNBrペプチドを溶解し、N−)シル−PheC
H,。
CQで処理したトリプシン(50pモル)を用いて37℃で20時間消化した。
この消化物を真空乾燥し、RPLC精製用に0.1%TFA中の6Mグアニジン
HCi2に溶解した。
逆相HPLCによるペプチドフラグメントの精製CNBrフラグメントについて
は04カラム(Vydaclo、 46 x 25cm、300人の孔を有する
10ミクロンの粒子)、またトリプシンフラグメントについてはPhenylカ
ラム(Vydac、 O−46x20 ”5300人の孔を有する5ミクロンの
粒子)を用い、Beckman HP LCシステム344によるRPLCによ
ってペプチドを精製した。
粗製のペプチド混合物を、0.1%TFAで平衡化したカラムにかけ、0.1%
TFA中の0〜80%アセトニトリルの直線勾配液を用い、1 w(1/分の流
速で160分で溶離した。溶出液は214nImと280nmの両成敗でモニタ
ーした。それぞれのピークを集め、必要なら、乾燥して6MグアニジンHCe−
0,1%T F A(0,:)+Q’)に再溶解した後に同じカラムを用いてイ
ンクラティックRPLCによりさらに精製した。それぞれの分画のペプチドを分
離するためのアセトニトリルの最適濃度は最初のHPLCの溶出ノくターンから
めた[Wong et al、 、 Proc、 Fiat’ 1. Acad
、 Sci、 USA 82 : 7711−7715(198T)の式
]
アミノ酸分析
アシル−ペプチドヒドロラーゼを0.1M酢酸に対して徹底的に透析し、凍結乾
燥し、そして0.1%フェノールを含有する5NHCQ中、48時間および24
時間、110℃で加水分解した。アミノ酸組成をBeckman 6300アミ
ノ酸分析機によって測定した[111rs。
ペプチドの配列決定
Applied Biosystems 470Aタンパク質配列決定機および
Al)I)liedBiosystems 120A Pth分析機を用いてペ
プチド配列の分析を行った[[1esick et al、、J、Biol、C
hem、 256: 7900−7997(1981)を参照コ。
プローブの作成
2種類のオリゴヌクレオチドプローブYS20.1およびYS17.2を2種類
のペプチドのアミノ酸配列から作成した(第2図を参照〉。これらのプローブは
、シリカを基剤とする固相法[Matteucciet al、 、 J、 A
m、 Chew、 Soc、 103 : 31’85−3191(1981)
Eおよびプロトン活性化ヌクレオシドホスホルアミダイト法rBeaucage
et al、、Tetrahedron Lett、 22 : 1859−
1962(1981)Uを用い1.Applied Biosystems 3
g0ADNA合成機によって合成した。精製したオリ゛ゴヌクレオチドをPAG
Eによって粗製の合成混合物から単離し、[−”P]ATPで9xlo’の比活
性ニラヘルした。YS17.2およびYS20゜1は128−倍の縮重オリゴヌ
クレオチドのプールである。このYS17.2およびYS20.1プールは長さ
がそれぞれ17および20ヌクレオチドであった。2つのプローブは12ヌクレ
オチドが重なっており、これらのプローブを連続して用いてD N Aライブラ
リーをスクリーニングすると25ヌクレオチド片のAPHをコードしているD
N Aが効率的にスクリーニングされる。
衷旌f’AI3 cDNAライブラリーの作成およびスクリーニングならびにA
PRをコードしているcDNAの配列決定本実施例の方法は第3図の右側と下の
部分に示されているものである。
ラットの肝臓を液体N、中で急速冷凍し、グアニジンインチオシアネート中で解
凍し、RNAをC5(J!を用いる遠心によって精製しプローブpACT−1へ
のハイブリダイゼーションによって無傷であることが示された[Spiegel
man et al、j、Biol、chem、 258 : 10083−1
00890983)]。
Gubler et al、、Gene 25 : 263−269(1983
)が修飾を加えたOkayamaet al。、Mo1.Ce11.Biol、
2: 161l61−170(19の方法によって10μiFのポリ(A)’
RNAからcDNAを合成した。このcDNAの末端をT4 DNAポリメラー
ゼで平滑にし、内部のEcoR1部位をメチル化した後、このcDNAをEco
RIリンカ−に連結した。次いで、このc D N Aを過剰のEcoRIで消
化し、セファロースCL−4Bのクロマトグラフィーにかけた。500bp以上
のcDNAを集め、トリスホウ酸緩衝液中、0.8%アガロースゲルでさらに分
画した。
lkb以上で移動するc D N AをNA−45紙(Schleicher
& 5chuell)を用いて集めた。20μQ中、大きさの選択を行ったcD
NA(100μ9)に脱ホスホリル化したgtl IEYoung et al
、、Proc、Nat’1.Acad、Sl」謀奪堕: 1194−1198(
1983)を参照]DNA(10μg)を連結し、インビトロでパッケージング
を行った[Maniatis et al、、Mo1ecular Cloni
ng : A Laboratory Manual、 (1982)(Col
d Spring Harbor Laboratories、 Co1d S
pring Harbor、 NY)を参照コ。大腸菌(E、coli)株Y1
088を組換えファージで感染させ、ライブラリーをスクリーニング用に培養し
た。
始めに450,000のクローンを培養し、YS20.1を用いてスクリーニン
グした。450.000のうち27の複製するポジティブなプラークが観察され
た。これら27のうち12を単離し、精製し、次いでYS17.2を用いて再ス
クリーニングした。12のうちの1つのプラークだけが真のポジティブであるこ
とが観察された。
このクローンをAPH5,2と命名した。APH5,2中のcDNA挿入体が正
しくAPRをコードしていることを確認するため、オリゴハイブリダイゼーショ
ン部位の領域をジデオキシヌクレオチド鎖終止法ISanger et al、
、 J、 Mo1. Biol、 94 : 441−448(1975)を
参照]によって配列決定した。この配列を翻訳させると、オリゴヌクレオチドプ
ローブの設計に用いたペプチド配列と同一のペプチド配列が産生された。
クローンAP85.2中のcDNA挿入体は制限酵素分析によって〜1.3kb
であることがわかった。APH遺伝子の長さの概算値を得るため、「染色体歩行
j法を用いてもつと大きいプローブを得、次いでこれを用いてノーザンプロット
上のAPHをコードしている1RNAをハイブリダイズさせた。APH5,2の
部分制限地図に基づいて660bPのKpn−XmnIフラグメントを選択した
。放射ラベルしたプローブをニック−トランスレーションによって作成し、これ
を用いて、ノーサンプロット法に従って調製したラット組織mRNAをスクリー
ニングした[Alwine et al、 、 (1979)]。660bpの
プローブは、大きさが〜2.9kbの1個のmRNAとハイブリダイズした。
クローンAP85.2の1.3kbのフラグメントは2.9kbのmRNAに比
べてかなり短いので、660bpのフラグメントを用いてラット肝臓cDNAラ
イブラリーを再スクリーニングした。培養した110万のクローンのなかで、1
5の複製するポジティブなプラークが観察された。これらクローンのうちの13
を単離し、ファージDNAを単離した。最も長い鎖は2.5kbのcDNA挿入
体を含有しており、これをAPH36,1と命名した。
ファージDNA APH36,1を精製し、配列決定した。この配列決定法は、
cDNAの特異的配列領域にハイブリダイズさせたオリゴヌクレオチド配列決定
プライマー、またはエキソヌクレアーゼ■によって生成させた欠失突然変異体、
M13へのAPH36,1c D N A 挿入体のエンドヌクレアーゼフラグ
メントのサブクローニングを包含する。
APH36,1cDNAの5°末端の翻訳された配列、即ち最初の40アミノ酸
は、ラット血清アルブミンのアミノ酸配列と同一であることがわかった。従って
、APH36,1は2.5kbのAPHをコードしているcDNAだけを含有し
ているスクランブル・クローンであった。
第1図は、ラット血清アルブミン配列を含まないAPH36,1cDNA翻訳配
列翻訳室ものである。下線を引いた配列および斜線で示した配列はAPHのトリ
プシンおよび臭化シアンフラグメントの配列決定によって得た配列である。活性
部位は斜線領域で示し、それぞれの星印は可能性あるグリコシド修飾の部位を示
す。
それぞれのAPHサブユニットは分子量go、oooまたはおよそ700〜75
5のアミノ酸残基を有するので、またクローンAP836.1のAPHコード化
配列配列184塩基対(即ち、728アミノ酸)であることがわかったので、別
の「染色体歩行」がAPIをコードしている遺伝子の5′末端を見つけるために
必要であった。
この末端に、平均の挿入体の大きさ1.1kbおよび6.8xlO’の独立クロ
ーンを含むC1onetechから市販のλ−gtllラット肝臓cDNAライ
ブラリー(HRLlooI)を、クローンAPI36.1の先端5’APR暗号
配列由来のBan2−Pstlフラグメントから作成した放射ラベルプローブで
スクリーニングした。延長した5°配列を含有しているクローンを単離し、その
ファージDNAを精製した。ファージDNAの配列決定はジデオキシ鎖終止法に
よって行う[Sanger et al6.1975]。翻訳配列の最端の3°
末端は停止コドンの配置によって同定した[星印で示した]。
アシル−ペプチドヒドロラーゼの暗号配列の失われた5°末端の配列は、アシル
−ペプチドヒドロラーゼmRNAのプライマー延長分析によって決定する。AP
H36−1の暗号領域の5°−最末端に相補的な合成オリゴヌクレオチドを用い
てcDNA鎖の合成をプライムする。この反応の鋳型は、前もって行うハイブリ
ッド選択によってアシル−ペプチドヒドロラーゼのメツセージを豊富化した全細
胞性ポリA’RNAまたはmRNAである。このように合成したcDN以上の記
載は特に好ましい態様に関するものであるが、本発明がこれらに限定されないこ
とは理解されよう。当業者なら、開示した態様に種々の修飾を加えることもあろ
うが、このような修飾は本発明の範囲内に含まれる。
微生物
(寄託機関の名称)
アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(寄託機関の住所)
12301 パークローン・ドライブ
ロックビル、メリーランド20852、アメリカ合衆国(寄託臼) (受は入れ
番号)
1987年8月21日 67504
(追加の表示)
大腸菌DKI中の、部分ラット肝臓アシルペプチドヒドロラーゼcDNAを含む
pBR322、pAPH36,11VLLSEPQEAA
60? FAVEQVLQEE HFDARFiVALM GGSHGGFLS
CHLIGQYPETY 5ACIAR?JPVIご==:二:ニコ
FIG、1
F I G、 3
Tcvcc’rccrcAcTcAcccccAc cAccc cccAcc
ccvcv^ccccc CC(TTACCCCCCAG@CC
CACTCTCCAAA CCCOCCGCGACCT(i(TCACCACA
CAC;T(T(CTrCA CCCA(CAT CAA`G C
TCTC(TTC(2CAACCCC(icAcccAcAcTcTCACGA
CACCAAAAA CACTrCTrG CA(: CT@CTO
FIG、 4C
CCTCTCCACTCACTCAATCCCCACACC^CTAACAAC
T^TO’口’ATCATAATAAACCAACAC^cAc c
国際調査報告
PC?10588102841
1PCI Cl2N 9780: Cl2hl 151001 C07Ff 1
5/12; Cl2P 21106υJ+! 435/69. 435/lフ2
.3. 435/320; 536/26
Claims (18)
- 1.第1図に示すアミノ酸配列からなる実質的に純粋な形態のアシル−ペプチド ヒドロラーゼ(APH)。
- 2.天然のグリコシル化を伴わないアシル−ペプチドヒドロラーゼ。
- 3.アシル−ペプチドヒドロラーゼをコードしている遺伝子配列を含有する組換 えDNA分子。
- 4.遺伝子配列が哺乳動物APHをコードしている請求項3記載の組換えDNA 分子。
- 5.哺乳動物がラットである請求項4記載の組換えDNA分子。
- 6.遺伝子配列がcDNAの形態にある請求項3または4記載の組換えDNA分 子。
- 7.分子がベクターである請求項3〜5のいずれかに記載の組換えDNA分子。
- 8.ベクターがプラスミドである請求項7記載の組換えDNA分子。
- 9.請求項3〜5のいずれかに記載の組換えDNA分子で形質転換された宿主。
- 10.細菌である請求項9記載の宿主。
- 11.酵母である請求項9記載の宿主。
- 12.哺乳動物細胞である請求項9記載の宿主。
- 13.(a)請求項3〜5のいずれかに記載のDNA分子を得;(b)該DNA 分子をベクター中に挿入し;(c)該ベクターで宿主系を形質転換し;(d)該 宿主中で組換えDNA分子のAPHのDNA配列を発現させ;そして (e)該発現によって生成したAPHを回収すること;を特徴とするアシル−ペ プチドヒドロラーゼの製造方法。
- 14.請求項13記載の方法によって製造したAPH。
- 15.アシル化されたポリペプチドを請求項1または2記載のAPHと接触させ ることを特徴とする、該アシル化されたポリペプチドのN−末端アシルアミノ酸 を加水分解する方法。
- 16.請求項1または2記載のAPHの存在下で誘導体化N■−アセチルアミノ 酸供与体と遊離のα−NH2を有する受容体とを接触させることを特徴とする、 該供与体と該受容体の間の反応を触媒する方法。
- 17.触媒反応を無水に近い媒体中で行う請求項16記載の方法。
- 18.固定化された形態にある請求項1、2、または14のいずれかに記載の酵 素。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US8793687A | 1987-08-21 | 1987-08-21 | |
| US087,936 | 1987-08-21 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH03500004A true JPH03500004A (ja) | 1991-01-10 |
Family
ID=22208151
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP63507504A Pending JPH03500004A (ja) | 1987-08-21 | 1988-08-22 | アシル‐ペプチド ヒドロラーゼならびにその製造法および用途 |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0303997B1 (ja) |
| JP (1) | JPH03500004A (ja) |
| KR (1) | KR890701748A (ja) |
| AT (1) | ATE113073T1 (ja) |
| AU (1) | AU618286B2 (ja) |
| DE (1) | DE3851864T2 (ja) |
| DK (1) | DK46190D0 (ja) |
| ES (1) | ES2061574T3 (ja) |
| PT (1) | PT88293B (ja) |
| WO (1) | WO1989001509A1 (ja) |
| ZA (1) | ZA885915B (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5268267A (en) * | 1987-08-21 | 1993-12-07 | The General Hospital Corporation | Method for diagnosing small cell carcinoma |
-
1988
- 1988-08-11 ZA ZA885915A patent/ZA885915B/xx unknown
- 1988-08-13 AT AT88113186T patent/ATE113073T1/de active
- 1988-08-13 DE DE3851864T patent/DE3851864T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1988-08-13 EP EP88113186A patent/EP0303997B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1988-08-13 ES ES88113186T patent/ES2061574T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1988-08-18 PT PT88293A patent/PT88293B/pt not_active IP Right Cessation
- 1988-08-22 AU AU23830/88A patent/AU618286B2/en not_active Ceased
- 1988-08-22 WO PCT/US1988/002841 patent/WO1989001509A1/en not_active Ceased
- 1988-08-22 KR KR1019890700678A patent/KR890701748A/ko not_active Ceased
- 1988-08-22 JP JP63507504A patent/JPH03500004A/ja active Pending
-
1990
- 1990-02-21 DK DK046190A patent/DK46190D0/da not_active Application Discontinuation
Non-Patent Citations (3)
| Title |
|---|
| BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMMUN.=1985 * |
| J.BIOCHEM.=1975 * |
| J.BIOCHEM.=1983 * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| ES2061574T3 (es) | 1994-12-16 |
| DE3851864D1 (de) | 1994-11-24 |
| AU2383088A (en) | 1989-03-09 |
| PT88293B (pt) | 1995-03-31 |
| KR890701748A (ko) | 1989-12-21 |
| PT88293A (pt) | 1989-09-14 |
| EP0303997A2 (en) | 1989-02-22 |
| AU618286B2 (en) | 1991-12-19 |
| EP0303997B1 (en) | 1994-10-19 |
| DE3851864T2 (de) | 1995-03-16 |
| ATE113073T1 (de) | 1994-11-15 |
| ZA885915B (en) | 1989-04-26 |
| EP0303997A3 (en) | 1990-05-16 |
| DK46190A (da) | 1990-02-21 |
| DK46190D0 (da) | 1990-02-21 |
| WO1989001509A1 (en) | 1989-02-23 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| McGuire et al. | Purification and characterization of dipeptidyl peptidase I from human spleen | |
| US5270176A (en) | Method for the selective cleavage of fusion proteins with lysostaphin | |
| RU2093519C1 (ru) | Способ энзиматического получения основного фактора роста фибробластов bfgf (10 - 155) и фармацевтическая композиция на его основе | |
| JP2001505403A (ja) | エステラーゼ | |
| JP2001510983A (ja) | 熱安定性ホスファターゼ | |
| JPH04502557A (ja) | 小細胞癌の検出方法およびアシル―ペプチド加水分解酵素およびそれをコードしている配列 | |
| CN100418985C (zh) | 使用粒酶b蛋白酶切割融合蛋白 | |
| Hannappel et al. | Limited proteolysis of liver and muscle aldolases: effects of subtilisin, cathepsin B, and Staphylococcus aureus protease | |
| CA1337283C (en) | Method for the selective cleavage of fusion proteins | |
| JP2002523059A (ja) | 基質置換での酵素活性スクリーン | |
| Kula et al. | Consecutive use of ω-aminoalkylagaroses. Resolution and purification of clostripain and collagenase from Clostridium histolyticum | |
| JP3518868B2 (ja) | バシラスリケニフォーミス菌株から由来したアミノペプチダーゼ及び天然蛋白質の製造方法 | |
| JP5754682B2 (ja) | D−,l−ペプチドの立体選択的合成法 | |
| Leone et al. | Removal of N‐Terminal Blocking Groups from Proteins | |
| AU618286B2 (en) | Acyl-peptide hydrolase and methods of production and use | |
| KR20010109348A (ko) | 췌장의 프로카복시-펩티다제 b, 이의 동질 효소 및뮤테인의 제조 방법, 및 이들의 용도 | |
| JP4815568B2 (ja) | 好熱性プロリルエンドペプチダーゼ | |
| Ryle | An insolubilised pepsin | |
| JP4752026B2 (ja) | 新規なピリドキサール4−デヒドロゲナーゼ及びその利用 | |
| JP2002523060A (ja) | 直接基質再装填による酵素活性スクリーン | |
| JP3024684B2 (ja) | ヒトアシルアミノ酸遊離酵素様ポリペプチド | |
| WO2005080584A1 (ja) | α-アミノ-ε-カプロラクタムラセマーゼを用いた、D及びL-アミノ酸アミドの混合物の製造方法、D又はL-アミノ酸の製造方法、D又はL-アミノ酸アミドの製造方法 | |
| CN116334051A (zh) | 一种对核酸提取裂解液中异硫氰酸胍耐受时间延长的蛋白酶k突变体及其应用 | |
| WO1990002813A1 (en) | Isolation, purification, and characterization of the aminopeptidases: ap1 and ap122 | |
| JPH07163341A (ja) | 安定化された改変タンパク質 |