JPH03502758A - ポリペプチド類においてノルロイシン含有量を制御するための発酵培地および方法 - Google Patents

ポリペプチド類においてノルロイシン含有量を制御するための発酵培地および方法

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 ポリペプチド類においてノルロイシン含有量を制御するための発酵培地および方 法 発明の分野 本発明は生化学エンジニアリングの分野に属する。さらに詳しくは、本発明はポ リペプチド類を生産するための発酵方法およびそれにより生産されたポリペプチ ド類に関する。
R更9遣屡 微生物類を培養するための合成培地されかつ化学的にはっきりとした培地はよく 知られている。細菌を培養するための通常の栄養培地は異種ポリペプチド類を生 産できる組換体細菌を増殖させるのに使用されてきた。酵母エキスのごときアミ ノ酸源および・カザミノ酸源は、通常、発酵期間を通じて発酵培地に高濃度で含 まれる。かかるアミノ酸は高価である。従って、同時に良質の望ましいポリペプ チド類の発現を高レベルに維持しつつ、発酵培地において補足アミノ酸の量を減 少させることは有用であろう。
情報の開示 ノルロイシンは微生物代謝におけるメチオニンの類似体として作用することは公 知である。外因性ノルロイシンを供給することによるメチオニン利用の競合的抑 制によってイー・コリ():、 co!i)増殖が妨げられたことが報告されて いる(ジェイ・ハリスおよびエイチ・アイ・コーン(J、 S、 Harris  and H,1,Kohn)、ジャーナル・オブ・ファルマコロジ−(J、  Pharmacol、 )、 73.383〜400頁(1941))。ノルロ イシン補足が最適下濃度のメチオニンを含有する培地におけるイー・コリのメチ オニン要求株の増殖を増大させたことも観察されている(ジェイ・オー・ランペ ンおよびエム・ジェイ・ジョーンズ(J、 O,Lampen、 and M、  J、 Jonei)、アーカイブズ1オブ・バイオケミストリー・アンド・バ イオフィジックス(Arch。
Biochem、 Biophys、)、  13+  47〜53頁(194 7))、しかしながら、ノルロイシンの生物学的役割を調べる研究は外因性アミ ノ酸源として供給されたノルロイシンを使用してきたに過ぎない。
アール・ムニエおよびシイ・エヌ・コーヘン[R,Munier and G。
N、 Cohen)、ビオシミ力・工・ビオフィジ力・アクタ(Biochim 。
Biophys、^eta、)、  31. 378 90頁(1959)]は 、外因的に供給したノルロイシンはメチオニンの代わりに細菌蛋白にin Vi VOにて取り込まれ得ることを示した。イー・コリ蛋白合成におけるメチオニン の代わりとしてのノルロイシンの運命についての詳細な研究は、ノルロイシンが イー・コリ蛋白類に取り込まれる能力を支持する(ディ・シイ・バーカーおよび シイ・ジェイ・ブルドン(D、 G。
Barker and C,J、 Bruton)、ジャーナル・オブ・モレキ ュラー・バイオロジー(J、 Mo1. Biol、)、  133. 217 〜31頁(1979))。
ノルロイシンはin vitroおよびin vivo双方においてtRNA” tおよびtRN A fM”をチャージ(charge) L得ることが示され ている。
ノルロイシンはアミノアシル−アデニレート・コンプレックスを形成し、メチオ ニル−t RNAシンテターゼの存在下でPP、を放出する(ATP−PPI交 換反応)ことが示されている(ビイ・ニスマンおよびエムーxル・ヒルシーL  (B、 Nisman and M、L、 Hirsch。
アヌ・インスト・パスツール(^nn、  1nst、 Pa5teur)、   95. 615〜34頁(1958);ジェイ・エム・オールドおよびディ・ ニス・ジョーンズ(J、 M、 Old and D、 S、 Jones)、 バイオケミカル・ジャーナル(Biochem、 J、)、  165.367 〜73頁(1977))。また、ノルロイシンはイー・コリt RN A”’の アシル化においてメチオニンと置き換わるとも示されている(ジェイ・トルビン ら(J。
Trupin et al)、バイオロジー・アンド・パイフィジカル・リサー チ・コミューニケーンヨンズ(Biochem、 Biophys、 Res、  Commun、)。
24.50〜55頁(1966);エイ・アール・フェルシュドおよびシイ・デ ィングウオール(A、 R,Fersht and C,Dingwall)。
66))。加工て、ノルロイシル−tRNA””はホルミルノルロイシル−tR NA””へ容易にホルミル化され、蛋白合成を開始するのにホルミルメチオニル −tRNA”etに置き換わることができる(ニス・ニス・ケルバーおよびエイ チ・ワイスバック(S、 S。
Kervar and H,Weissbach)、アーカイブズ・オブ・バイ オケミストリー・アンド・バイオフィジックス(Arch、 Biochem、  Biophys、)。
141.525−32頁(1970))。また、メチオニンが枯渇してノルロイ シンが供給された場合に、(はとんど絶対的にノルロイシンで)チャージされた tRNA”’合計パーセンテージは、合計tRNA”tのく50%であることも 示されている(バーカーおよびブルドン(Barker and Bruton )、前掲)。ノルロイシンによる増殖の抑制が報告されている(アール・ムニエ およびシイ・エヌ・コーヘン(R,Munier and G、 N、 Coh en)、前掲;ニス・ニス・ケルバーおよびエイチ・ワイスバック(S、 S、  Kerwar and H,胃eissbach)、前掲;バーカーおよびブ ルドン、前掲)。
従って、外因的に供給されたノルロイシンに関するin vivoおよびin  vitro実験を通じて、ノルロイシンはメチオニン類似体として作用すること が長い間知られている一方、本発明者らは、イー・コリ培養によるノルロイシン の合成に関するいずれの報告も知らない。
初期の報告はノルロイシンおよび構造的に類縁の化合物ノルバリンの天然の存在 を引用していた。ノルロイシンは動物神経組織中(イ−・アブデルハルデンおよ びケイ・ヘインズ(E、 Abderhalden andK、 Heyns) 、ツビシ二ル・フィシオル・ケム(Zvischr、 Physiol。
Chew、)、  214. 262〜66頁(1933))で、およびトウゴ マ(Ricinus communis)種子類の成分(アール・ヌ、コリニ( R,Nucco−rini)、アヌ・シム・アプル(Ann、 Chim、 A ppl、 )、  24 、 25−32頁(1934))として見い出されて おり、一方、ノルバリンはバチラス・スブチリス(Bacillus 5ubt ilis)によって合成された抗菌類蛋白の成分であると報告されている(ビイ ・ナンデイおよびシイ・ビイ・セン(1’、?1andi and G、 P、  5en)、 ネイチ+ −(Nature)。
171.871〜72頁(1953))。
セラチア・マルセセンス(Serratia marcescens)のコンプ レックス調節突然変異体によるノルロイシンの形成が報告されている(エム・キ スミら(L Kisumi et al)、ジャーナル・オブ・バイオケミスト リー(J、 Biochen、)、  80. 333〜39頁(1976): エム・キスミら(M、 Kisumi et al)、アプライド・アンド・バ イアロンメンタル・マイクロバイオロジー(Appl、 Environ、 M icrobiol、)。
34.135〜38頁(1977))。ロイシン生合成酵素について抑制解除さ れたニス・マルセセンス(S、 marcescens)が選択され、スレオニ ンデヒドラターゼを欠くインロイシン−依存性突然変異体をさらに選択するのに 用いられた。この二重突然変異体から、フィードバック−耐性α−イソプロピル マレートシンターゼを含有するインロイシン−非依存性(スレオニン−デヒドラ ターゼ欠損) 突然変異体が選択された。この最終複合突然変異体はノルロイシ ンを蓄積した。
発明の要約 本発明は、一般に、発酵培地において、メチオニン濃度を増加させるか、または ノルロイシンの量を減少させるか、あるいは双方を行うこ・とを特徴とする低濃 度のアミノよりなる発酵培地上で増殖させた微生物によって発現されるポリペプ チド類へのノルロイシンの取り込みを減少させる方法に関する。
さらに詳しくは、本発明は、メチオニン源、システィン源、またはロイシン源、 あるいはその組み合わせの源を培地に補足することを特徴とする低濃度のアミノ 酸を有するはっきりとした発酵培地上で増殖させた微生物によって発現されるポ リペプチドへ類のノルロイシン取り込みを減少させる方法に関する。ノルロイシ ン取り込みはメチオニンまたはロイシン補足によって妨げることができる。
さらに詳しくは、該微生物は組換体微生物であり、かく発現されるポリペプチド は異種ポリペプチドである。
また、本発明は、低濃度のアミノ酸を有し、かつメチオニン源、システィン源、 またはロイシン源、あるいはその組み合わせ源を補足した発酵培地に関する。
また、本発明は、メチオニンを過剰産生できる突然変異体微生物を利用すること を特徴とする微生物によって発現されるポリペプチド類へのノルロイシン取り込 みを阻止する方法に関する。
また、本発明は、低濃度のアミノ酸を有し、かつ蛋白の過剰発現が可能であるは っきりとした発酵培地上で微生物を増殖させることを特徴とする該微生物によっ て発現されたポリペプチド類ヘノルロイシンを取り込む方法に関する。
また、本発明は、低濃度のアミノ酸を有し、かつノルロイシンを補足したはっき りとした発酵培地上で微生物を増殖させることを特徴とする該微生物によって発 現されたポリペプチドへフルロイシンを取り込む方法に関する。
また、低濃度のアミノ酸を有する発酵培地上でエシェリヒア・コリ(E、 co li)を増殖させ、次いで、かく生産されたノルロイシンを単離することを特徴 とするノルロイシンの生産方法を提供する。
また、アミノ酸残基5.124.149および179に位置するメチオニンが特 にロイシン、バリンまたはイソロイシンよりなる群から選択される異なるアミノ 酸残基で置き換えられたことを特徴とするbst様化合物類を提供する。
また、本発明は、ポリペプチドをコード付けする組換体DNA分子中のメチオニ ンをコード付けするコドンを異なるアミノ酸、例えばイソロイシンをコード付け するものに変化させることを特徴とする、該ポリペプチドをコード付けする該D NA分子で形質転換し、かつ低濃度のアミノ酸上で増殖させた微生物類によって 発現された異種ポリペプチド類、例えばウシ・ソマトトロピンへのノルロイシン の取り込みを阻止する方法に関する。
発明の詳細な説明 注目する形質転換宿主微生物によって天然には合成されないポリペプチド類をい う。例えば、イー・コリはウシおよびヒト・ソマトトロピン、インシュリン、イ ンターフェロン等を生産することができる。かく生産されたポリペプチド類は「 異種ポリペプチド類」と呼ばれる。本発明において特に注目すべきは、メチオニ ンよりなる異種ポリペプチド類である。
ソマトトロピン類の分子不均質性のため、種々のソマトトロピン類のアミノ酸残 基類の位置番号は異なり得る。「天然噛乳動物ソマトトロビン」なる語は天然に 生じる種を包含する。チャート1は、本発明により修飾された位置5、124、 149、および179残基に対応するbstの特異的アミノ酸残基を示す。池の ソマトトロピン類についての番号付けは、他の種または類似体類に関する場合は 異なり得る。当業者ならば、チャート1に記載したbstのメチオニン5、12 4、149または179を用い、別の動物ソマトトロピン類、例えば哺乳動物ソ マトトロビン類における対応するアミノ酸類、例えばブタ・ソマトトロピンまた はその類似体のメチオニン5を容易に位置決めして、ノルロイシン取り込みの所 望の回避を達成したり、本発明の均一性を生じさせたりできる。
本明細書中で用いるごとく、「低濃度のアミノ酸類」は、その上で。
培養される微生物によって、アミノ酸生合成酵素類(例えば、ロインン生合成酵 素類)の生合成を抑制したり、または当該酵素類の活性を効果的にフィードバノ ク抑制するには余りにも低過ぎる外因性アミノ酸濃度と定義される「最小濃度の アミノ酸」まで低下され得るのに十分低い濃度を意味する。特に定義がない限り 、「低濃度のアミノ酸類」は、その上で培養される微生物によって、メチオニル −t RNAの正常なチャージングにつき、メチオニンについてのK。
より十分低《、かくしてノルロイシンでのメチオニル−t RNAの不正確なチ ャージングが可能となる「最小濃度のアミノ酸類」まで減少され得る濃度を意味 する。「低−tI4度のアミノ酸類」の「最小濃度のアミノ酸類」へのかかる減 少は、所望の蛋白がメチオニンの代わりに7ルロインンの検出可能な取り込みを 含むようなときに起こる。
本明細書中で用いるごと《、「高濃度のアミノ酸類」は、「低濃度のアミノ酸類 」が過剰状態にあって、所望の蛋白の発現の誘導に先立ち、誘導の時に、または 誘導後まもなく「最小濃度のアミノ酸類」まで減少され得ない濃度のアミノ酸類 である。例えば、特別の実施例のイー・フリ宿主類およびrbStポリベプチド に関しては、「低濃度のアミノ酸類」は各々約0.50mM未満であり、0.1 %酵母エキス補足から得られる。「低濃度のアミノ酸類」は、各々約0、05m M満である「最小濃度のアミノ酸類」まで低下される。
かかるアミノ酸濃度は、特別の実施例のごとき方法に従う定量的なアミノ酸濃度 によって、与えられたいずれの宿主、与えられたいずれのポリペプチドについて のいずれの発酵に関しても容易に決定される。
本発明で用いる組換体宿主微生物類は、当業者によく知られ、例えば、ここに参 照のために挙げる、分子クローニング(MolecularCloning)、 ティ・マニアテイスら(T. Maniatis, et al)、コールド・ スプリング・ハーバ−・ラボラトリ−(Cold Spring Harbor Laboratory) ( 1 9 8 2 )およびビイ・ペルパル(B.  Perbal)、分子クローニングへの実用的ガイド(A Practica l Guide to Molecu−lar Cloning)、ジョン・ウ ィリー・アンド・サンズ(John Yiley &Sons)  (1984 )に記載されたD N A組換え技術によって作製される。有用な宿主微生物類 は異種遺伝子類をクローニングしそれを発現するのに適するよく知られたいずれ の宿主類も包含し、例えば、バチラス(Bacillus)、サツカロミセス( Saccharomyces)およびストレプトミセス(Streptomyc es)株を包含する。
異種ポリペプチドを生産する組換体微生物類は液体栄養培地中で培養する。該培 地は微生物の細胞増殖要件を満足し、それにより、微生物が増殖し所定の細胞密 度まで増加できる、過剰の通常の栄養物質よりなる。この物質は炭素源、窒素源 および硫黄、リン、マグネシウム、カリウム、銅、亜鉛、マンガンおよび鉄のご ときミネラル類を包含する。アミノ酸類は、カゼイン、大豆ミール、ラクトアル ブミン、動物組織、酵母細胞およびゼラチンのごとき天然に生じる蛋白様物質を 酸または酵素消化に付すことによって通常製造される蛋白加水分解物の形態で添 加することができる。純粋なアミノ酸類の混合物類も添加することができる。本 発明者らは、ノルロイシンの生合成および発現されたポリペプチドへ類の取り込 みが、低濃度のアミノ酸類を補足せずまたは補足したいずれかの最小培地(例え ば、はっきりとした無機塩および炭素源、例えばグルコースまたはグリセロール )よりなり、かつその中で蛋白の過剰発現が起こる発酵培地中で起こることを見 い出した。また、酸素も該培地に供給する。最大細胞密度を達成するには、培養 は、通常、酸素/液体の界面領域を増すように行う。
培養に影響する重要な環境因子はpHおよび温度を含む。温度は最小および最大 増殖温度の間の範囲とする。はとんどの細菌はかなり狭い温度範囲にわたり最大 増殖を示す。イー・コリのごとき中温菌については、最適温度範囲は約25°C ないし約42℃、好ましくは約37°Cである。はとんどの生物類はpH数単位 にわたる範囲の水素イオン濃度に耐える。イー・コリのごとき細菌については、 許容pHは約6ないし8の範囲にあり、約6.8が好ましい。
異種ポリペプチドをコード付けする遺伝子の発現が抑制可能な発現制御配列の制 御下にある場合、適当なリプレッサーを培地に添加びオペレーターの制御下にあ る場合はトリプトファン)によって、その遺伝子の発現を所定レベルの増殖が細 胞培養により達成されるまで抑制することができる。
収穫の後、細胞類を加工して異種ポリペプチドを回収する。これは、通常、細胞 の破壊、lまたはそれ以上の抽出工程による粗製異種ポリペプチドの細菌蛋白類 からの分離、(その疎水性度に依存する)当該ポリペプチドの可溶化、適当な場 合には、適当なジスルフィド結合を生成さ、せるためのスルフヒドリルの酸化、 およびさらにゲル濾過、高速液体クロマトグラフィーまたは他の蛋白精製手法に よるポリペプチドの精製を含む。
本発明者らは、微生物類におけるポリペプチド類、特に組換体宿主類における適 当なアミノ酸配列を有する(例えば、メチオニンに代えて置き換えたノルロイシ ン無し)異種ポリペプチド類の過剰発現を効果的に支持する低濃度のアミノ酸よ りなる発酵培地をかなり低減化した価格で作製した。これは重要である。という のは、生産物の精製において付随した節約を伴う同種生産物類の生産が可能にな るからである。また、シアノーゲンブロマイドによって切断できるメチオニン残 基により結合した異種ポリペプチド類の発現が容易となる。
他方、メチオニンの代わりに置き換えたノルロイシンを有するポリペプチド類を 生産するのも望ましいであろう。メチオニン残基のノルロイシンでの意図した置 換により、(メチオニンスルホンまたはスルホキシドへの)酸化に対する大きな 耐性およびメチオニン特異的プロテアーゼ類または修飾剤類に対する耐性を具備 した蛋白の合成が可能となる。
本発明者らは、組換体微生物類によって異種ポリペプチド類を生産するために、 例えばエシェリヒア・コリに一12株において組換えにより生産されるウシ・ソ マトトロピン(r bS t)を生産するために発酵を行ってきた。これらの発 酵は、比較的高濃度の酵母エキス(例えば、5重量/容量%までの酵母エキス) を補足したはっきりとした培地でまず開始した。比較的高濃度の酵母エキスを使 用した結果、これらの最初の発酵は「高酵母エキス」発酵と名付けた。
しかしながら、特に生産規模における高価格の酵母エキス補足は、これらの発酵 を経済的に不可能なものとした。従って、本発明者らは、50.5%酵母エキス で補足することによって「低酵母エキス」発行培地およびプロセスを開発した。
低酵母エキス発酵培地を用いた場合、(合計rbStの30%までの量の)主要 異常rbSt種が、単離したrbStロットの逆相高圧液体クロマトグラフィー (RP−HPLC)分析に際して見い出された。かかる異常rbSt種は高酵母 エキス発酵の間に生産されたロフトでは検出されなかった。よって、新しく遭遇 したrbSt種の生産は価格的に有効な低酵母エキス発酵の使用に直接帰すべき ものであった。
該異常rbst種はRP−HPLCクロマトグラムでは正常なrbstよりも遅 く溶出することが判明し、遅延溶出rbSt  (LE−rbSt)と呼ぶ。L E−rbStを単離し、広範な構造分析を行った。構造データにより、LE−r bStはrbSt分子中のアミノ酸番号124におけるメチオニンに代えるノル ロイシンの置換の結果として低酵母エキス発酵の間に産生されることが確立され た。
さらに、他の内部メチオニン位置、5.149および179位におけるノルロイ シン置換も検出されたが、RP−HPLCに際してのrbStのクロマトグラフ ィー挙動の変化の直接原因ではないようである。
低酵母エキス発酵の間のノルロイシンのrbStへの取り込みは予期せぬことで あって、ノルロイシンの源は分からなかった。さらに、低酵母エキス発酵プロト コルの結果、何故ノルロイシンの取り込みが起こるか分からなかった。本発明に 先立っては、ノルロイシンのrbStへの取り込みを排除する公知手段はなかっ た。この問題を解決するために、本発明者らは、発酵培地にL−メチオニンを補 足し、それにより、ノルロイシンの取り込みを完全に排除した。
外因性り一ロイシンによるα−イソプロピルマレートシンターゼ(LeuA”) のフィードバック抑制もまたノルロイシンの生合成およびtr積、か(してノル ロイシンのrbStへの取り込みを完全に排除した。与えられた宿主および所望 のポリペプチドについてのノルロイシン取り込みを排除するために添加されるべ きメチオニンおよびロイシンの量は実施例に記載した方法によって容易に決定で きる。また、システィンでの補足もノルロイシンのrbStへの取り込み量を減 少させた。
天然のrbStは第5位にメチオニン残基を有する。他のメチオニン残基に関し 、第5位メチオニンもノルロイシン残基によって置き換えられ得る。理論に拘束 されるつもりはないが、通常メチオニン残基によって占められる位置におけるノ ルロイシンの取り込みは、ノルロイシンでのメチオニル−tRNAのチャージン グ(charging)および引き続いてのチャージされたt RNA分子とメ チオニンコドンとの相互作用の直接の結果のようである。従って、メチオニン以 外のアミノ酸についてのコドンでのメチオニンコドンの置き換えは、rbStま たはかかるメチオニン残基を有する他の異種ポリペプチド類へのノルロイシンの 取り込みを妨げるであろう。
細菌の培養 イー・コリ株BST−1を用いた。この株は、ラムダプロファージ およびFプラスミドの除去ならびにropH,112対立遺伝子の導入によって イー・コリに−12(ATCCe23716)の野生型株から得られた。次いで 、プラスミドpURA4、プラスミドpBEU−17およびpBR322に由来 し、かツrbイ?!製プラスミドでこの株を形質転換した(1987年2月19 日出願の米国特許出願S、N、016294号およびPCT特許出願、PCT/ US88100328をここに参照のために挙げる)。
培養培地:はっきりとした培地はエイチ・ジエイ・ボーゲルおよびディ・エム・ ボ不ル()1. J、 Vogel and D、 W、 Bonner)、ジ ャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー(J、 Biol、 Chew 、)。
218.97〜106頁(1955)の培地Eに基づくものであった。初代種お よび発酵培地を調製するための組成およびプロトコルは以下の通りである。
初代種培地 収−分            IQ当たりの量N a (N H4) HP  O−・Ht O10、90gK、HPo、                2 .61gクエン酸・H,02,10g Mg5O,・7H,00,99g (NH,)、So、              0.66g酵母エキス               10.40gグリセロール              5. OOg逆浸透水 初代種培養については、前記成分を水(逆浸透グレード、R,O,)で水和し適 量にて1000m12とし、滅菌に先立って300m12容量に分割した。種培 地を121’Cで20分間滅菌した。滅菌に続き、該種培地を冷却し、0.5m 12滅菌アンピシリン(NaOHでpH8,0に滴定し、濾過滅菌(0,45μ m)した逆浸透水中25g/+2)を添加した。
発酵培地 成 分             IQ当たりの量Na(NH4)HPO4・H tOlo、90gK*HP0.               2.61 gク エン酸(無水物)             1.92gMg5O,・7H,0 0,25g (NH,)、So、               0.66g酵母エキス                1.00g5AG4130              0.75m+2逆浸透水 発酵培地は、前記量の成分を200倍とし、それらを250リツトルのファーメ ンタ−にて逆浸透水165リットル中で水和させることによって調製した。次い で、発酵培地を121°Cで20分間滅菌した(滅菌の間、水蒸気凝縮のため、 20リツトルの培地容量の水増しを採用した)。滅菌に続き、培地のpHをチェ ックして6.6ないし6.9であることを確認した。冷却に際し、2種の無菌添 加を行い、発酵培地を完成させた。第1の添加は、予め濾過(0,45μm)に よって滅菌した微量養分20OmQ分(終濃度:C0CQ*−6H,02120 μM;CuS○4.39.9μM;MnC12t’4HtO1319gM; Z n5O,・7H,0,40,1,izM)よりなるものであった。第2の添加は 、セレロース(cerelose)15リツトル(8,24k gセレロースを 逆浸透水適量にて14リツトルとし、)(、S O,でpH4,0に調整)より なるものであった。
発酵培地は接種に先立って25%N a OHでpH7,2に調整した。
低酵母エキス発酵培地はBST−1培養用の0.1%酵母エキスを含有していた 。いつくかの実験において、カザミノ酸類、し−メチオニン、L−ロイシン、D 、L−ノルロイシン、食料−または飼料グレードのり、  L−メチオニンまた はし一システィン源を発酵培地に添加した。
プラスミドフピー数アッセイ:発酵の間に周期的に得られた培養試料について粗 製プラスミドコピー数アッセイを行った。かかる試料からの約2xlO”細菌を 含有するペレットを再懸濁緩衝液(90mMトリス、9OmMホウ酸塩、5Om M EDTA、25%スクロース)150μQに再懸濁した。リゾチウムを添加 しく10mg/m+2の30μe)、懸濁液を37℃で10分間インキニベート し、しかる後、リボヌクレアーゼA (20mg/me 、80℃で10分間予 熱)30μeを添加した。37°Cでの10分後、ブロテイナーゼK (1mg /mQ)30uQを添加し、さらに20分間インキュベーシヲンを継続した。次 いで、混合物を15分間で65°Cにシフトした。溶解混合物(90mMトリス 、90mMホウ酸塩、60mM  EDTA、1.25%(v/v) トリトン X−100)210μQを添加し、それらを氷上で10ないし20分間インキュ ベートすることによって細胞を溶解した。溶解物をミクロ遠心機中、4℃で40 分間遠心した。清澄化した溶解物を透明な1.5mQ ミクロ遠心機遠心管に注 ぎ、−20℃で保存した。90mM)!Jス、90mMホウ酸塩、2.5mM  EDTA緩衝液中で調製した0、8%アガロースゲルにて、1ないし5ボルト/  c mでの電気泳動によって含プラスミド溶解物を典型的な分析に付した。
実施例1 低酵母エキス発酵培地の使用によるノルロイシン置換rbStの生産 発酵プロトコル:各初代種培養を1の培養アンプル(約1m12)の内容物で接 種し、28℃でインキュベートして0.7ないし0.8A @ s6の培養密度 とした。インキュベーションに続き、ファーメンタ−の接種に使用するに先立っ て、各初代種培養を水上に乗せた。
すべての初代種培養をアンピシリンで補足して実質的にすべてのプラスミド担持 細菌を含有する培養を得た。600m12接種物での接種によってBST−1発 酵を開始した。ファーメンタ−のpHを無水アンモニアで制御してpHを7,2 ないし7.4に維持した。ファーメンタ−の撹拌およびエアレーション速度を、 10ps+の逆圧にて、320rpmおよび30051mに設定した。27°C の許容温間で培養増殖を行った。プラスミドランナウェイ複製およびrbSt合 或は自然に誘導されるので、BST−1発酵を終始27°Cに維持した。
分析手法 培養の一部を種々の時点に初代種およびファーメンタ−から取り出し 、一連の分析手法に付して培養密度(550nmにおける吸光r!i)、合計細 菌乾燥重量、合計rbSt濃度、グルコース濃度、遊離アンモニア濃度、アセテ ート濃度を定量し、および鏡検同定および封入体の定量を行った。
RP−HPLC用試料調製:rbSt分析調製物を用いて蛋白のRP−HPLC 単離用に試料を調製した。発酵培養の10 A sso・mQ部を遠心によって 収穫し、上澄みを除去した。次いで、細胞ペレットを、15mg/mQヂチオス レイトールを含有する6Mグアニジン塩酸塩650JiCに再懸濁し、5分間沸 騰した。試料を冷却した後、イソプロパツール350μQを添加した。
rbStのRP−HPLC単離: Varian VisLa5500液体クロ マトグラフにて、4.6X100mmのBakerbondJidepore  C−3カラムでRP−HPLCを行った。グラジェント移動相は各々が0.1% トリフルオロ酢酸(T F A)を含有する水−イソプロパツールであった。波 速は1mf2/分であった。グラジェントは11分内で35ないし54%Bとし た。検出は215nm+こおけるUVによった。試料の一部500μQをインジ ェクトし、rbSt画分をスクリュー−キャップのミクロ遠心機遠心管中に収集 した。これらの試料を凍結乾燥し、4℃で保存した。これらの試料は1ないし3 ナノモルの蛋白を含有していた。
ポリペプチドの配列決定二N−末端アミノ酸配列決定分析はオンラインABI   120A  PTHアナライザーを装備したアプライド・バイオシステム(A pplied Biosystems) (A B I ) 470 Aシーケ ンサ−で行った。まず、カートリッジフィルターを1.5mgポリブレン(po lybrene)で調製し、ABIプログラム03PREを用いてプレサイクル させた。試料を0.1%TFA60μQに溶解し、30μg分にて該フィルター に負荷した。該フィルターを適用と適用の間にカートリッジオーブン中で乾燥し た。各試料につき、該ABIプログラムQ3PTHを少な(とも5サイクル用い た。ノルロイシン+メチオニンの合計ピコモル数で除することによって、第5サ イクルにおけるノルロイシンパーセントをフルロイシンのピコモル数として計算 した。最初の収量は3.9ナノモルから73ピコモルまで変動した。キャリア無 しの操作で平均収率91,2%、キャリアを用いた場合は92.7%であった。
アミノ酸分析:低酵母エキス発酵中に起こるアミノ酸フラックスを調べるために 、培地試料を発酵間に周期的に得、アミノ酸分析に付した。アミノ酸分析は、実 質的にビイ・エイ・ビドリングメイヤーら(B、 A、 Bidlingmey er、 et al)、  ジャーナル・オブ・クロマトグラフィー(J、 C hromatogr、)、 336.93 104頁(1984)に記載されて いるごときPTC法(アール・エル・ヘインリクソンお゛よびニス・シイ・メリ デス(R,L、 He1nrikson and S、 C,Meredith )、アナリティカル・バイオケミストリー(Anal、 Biochem、)、   136゜65−74頁(1984))によって行った。
発酵培地試料は株BST−1でのrbSt発酵から得、アミノ酸分析に付した。
株BST−1での低酵母エキス発酵は0.1%酵母エキスを含有していた。第1 表に示すデータは、株BST−1での典型的な低酵母エキス発酵について、アミ ノ酸は0.04mM(ヒスチジン)ないし0.38mM(ロイシン)の範囲の初 期濃度で存在し、実質的にすべてのアミノ酸がrbSt合成の自然誘導に先立っ て(接種後約15時間)消費されたことを示す。事実、はとんどのアミノ酸は接 種後約16時間までに消費された。アラニンおよびグルタミン酸は0.04mM (接種後15時間)および0.03mM(接種後17時間後)に達し、各々、0 .88mMおよび1.65mMの終濃度まで増加した。従って、これらのデータ は、はとんどのアミノ酸がrbSt合成の自然誘導のほぼ9時間先立って培地か ら枯渇したことを示す。さらに、それらは、培養増殖およびrbSt合成に要す るアミノ酸はde novo合成されるべきだったことを示す。
第2表のデータは、培地中のフルロイシン蓄積とrbStにおけるノルロイシン の取り込みとの間の関係を示す。接種後19時間まで(誘導後約4時間)、ノル ロイシンは培地中に検出されず、一方、N−末端アミノ酸配列決定により、rb StS位にすでに2.6モル%のフルロイシンが存在することが明らかとされた (第2表)。
接種後25および33.5時間(誘導後約10および18.5時間)に得た発酵 試料は、培地中でのノルロイシンの濃度の増加およびrbStのN−末端および 5位に取り込まれたノルロイシン画分(モル%)の対応しての増加を示した(第 2表)。これらの結果は、異なるイー・コリ宿主培養で確認された。
実施例2 株BST−1での低酵母エキス発酵間のフルロイシンの合成および分 泌 ノルロイシンがイー・コリ培養によって合成されたことを証明するために、低酵 母エキス発酵(実施例1)間に発酵培地試料を得、アミノ酸分析に付した。特に 、株BST−1での低酵母エキス発酵から得られた試料を用いた。これらの発酵 からのスペント(spent)培地試料は、ノルロイシンの一時的合成および蓄 積を示した。接種20時間後に得た培地試料は検出可能なノルロイシンをほとん ど含有しておらず(9,02分溶出時間)、一方、発酵中6時間後に調査した試 料はアミノ酸クロマトグラフでノルロイシンのピーク(0,15mM)を明らか に示した。該ノルロイシンのピークは接種後30および32時間後に得られた試 料で増加し続け、0.47mMの終濃度に達した。
収集したデータは、株BST−1での低酵母エキス発酵間のノルよび分泌は接種 後10ないし15時間に開始し、発酵の最後まで継続し、0.60mMの終濃度 に到達した。株BST−1で行い、長時間行ったlのrbSt発酵の間に、ノル ロイシンの濃度は接種66.2時間後までに2.47mMに達した。従って、本 発明者らは、低酵母エキス発酵の間に、イー・コリ培養によってフルロイシンが de flOVQ合成されたことを証明した。これらの結果は、第2のコー・フ リ株でも確認された。
株BsT−1での低酵母エキス発酵間のこれらの2種のアミノ酸間の関係を理解 するために、入手可能なメチオニンおよびノルロイシンの濃度を調べた。データ は、酵母エキス補足によって供給されたメチオニンの濃度は典型的には<Q、1 mMであり、メチオニンは接種後15時間までに発酵培地から枯渇したことを示 した。発酵におけるかかる見地より、培養代謝および増殖、ならびにrbSt合 成に要するすべてのメチオニンは培養によって合成された。メチオニンの枯渇に 付随して、発酵培地における過剰ノルロイシンの合成および蓄積が観察された。
これらのデータは、BST−1培養によるノルロイシンのde 1IOVO合成 速度はノルロイシン利用(例えば、蛋白合成)の速度よりもかなり大きかったこ とを示す。
実施例3 低酵母エキス発酵間の外因性アミノ酸での補足本実施例では、本発明 者らは、細胞質アミノ酸プールにおけるノルロイシンおよび他のアミノ酸類の濃 度を変更し、ノルロイシンのrbStへの取り込みについての得られた効果を観 察した。
rbstの公知アミノ酸組成、イー・コリ増殖(ジェイ・エル・イングラハムら (J、 L、 lngraham et at)、細菌細胞の増殖(Growt hof the Bacterial Ce1l)、108−10および122 −25頁(1983))iinついてのアミノ酸要求(乾燥重量当たりのダラム )の見積り、およびディフコ(Dirco)カザミノ酸の実験的に決定したアミ ノ酸組成より、本発明者らは、細胞増殖およびrbSt合成に要するすべてのア ミノ酸を供給するには、3%カザミノ酸および6mMグリシンを低酵母エキス発 酵(実施例1)に添加すべきことを見積もった。メチオニンに関しては、この付 加補足は、細胞増殖およびrbSt合成についてのアミノ酸要求の見積もりの1 25%と計算された。さらに3%カザミノ酸および6mMグリシンを補足した低 酵母エキス発酵を行った場合、N−末端アミノ酸配列決定法によると、rbSt のN−末端にノルロイシンは検出されず、痕跡量(0,3モル%)のノルロイシ ンが5位に検出されたに過ぎなかった。対照的に、非補足(カザミノ酸無し)低 酵母エキス対照発酵間に生産されたrbStはN−末端に2.8モル%ノルロイ シンおよび5位に15.3モル%ノルロイシンを含有していた。付加カザミノ酸 補足におけるアミノ酸はノルロイシンのrbStへの取り込みを妨げる。これら のデータは、含ノルロイシンrbSt  (LE−rbSt)は高濃度酵母エキ ス(例えば、5%酵母エキス)を含有する発酵では生産されなかったという観察 に一致する。
実施例4 低酵母エキス発酵間の外因性L−メチオニンでの補足次に、本発明者 らは、低酵母エキス発酵の5mM L−メチオニンでの補足を調べた。非補足低 酵母二牛ス発酵間に株BST−1によって生産されたrbStのN−末端アミノ 酸配列決定は、各々N〜末端および5位において2.1および22.1モル%ノ ルロイシンを示したく第3表)。低酵母エキス発酵培地の3mM D、L−ノル ロイシンでの補足は、さらに、N−末端および5位で検出されるノルロイシンの レベルを増加させた(第3表)。ノルロイシン補足はrbStにおけるノルロイ シン含有量を増強させる効果的手段を示した。
5mML−メチオニンでの補足は、rbSt5位におけるノルロイシンの取り込 みを完全に排除し、一方、痕跡量の(0,2モル%)ノルロイシンがN−末端で 検出されたに過ぎない。rbStのN−末端における痕跡量のノルロイシンの検 出は、発酵の後期段階での、メチオニン制限のため、ホルミル−メチオニンの利 用可能性が減少したことに起因するであろう。メチオニン濃度≧5mMで行った 他の発酵はrbstのN−末端および5位いずれでもノルロイシンを示さなかっ た。さらに% 1.25mMと低い濃度のし一メチオニンを用いるタイトレージ 1ン実験は、rbStへのフルロイシンの取り込みは5位においてく1モル%ノ ルロイシンまで減少されることを示した。
実施例5 低酵母エキス発酵間のメチオニンの他の源での補足本実施例は、低酵 母エキス発酵(実施例1)が行い得ること、およびノルロイシンのrbstへの 取り込みがL−メチオニンよりも安価なメチオニン源での補足によって妨げられ ることを示す。
5mM D、L−メチオニンを使用する最初の発酵(シンテックス・アグリ・ビ ジネス・インコーポレイテノド(Syntex Agri Busi−ness 、 I nc、 )、スプリングフィールド(Springf 1eld)、ミ ズリー州)を行い、N−末端または5位いずれでもノルロイシンが検出されない ごとく、ノルロイシンのrbStへの取り込みを防止するのに効果的であること が判明した。従って、食品−または飼料グレードのり、  L−メチオニン(デ グサ・コーポレーション(Degussa Corp、)、テオドレ(Theo dore)、アラバマ州)を濃度5mMで用いて株BST−1での低酵母エキス 発酵を補足した。第4表のデータは、これらの2種グレードのり、  L−メチ オニンがノルロイシンのrbStへの取り込みを妨げたことを示す。食品グレー ドのり、L−メチオニンはノルロイシンの取り込みを完全に妨げ、一方、飼料グ レードのり、  L−メチオニンで補足して発酵間に生産されたrbStの5位 においてはわずかな痕跡量のノルロイシン(0,1モル%)が見いだされたに過 ぎず、これは恐らく後者においては2.5mML−メチオニン成分の消費による ものであろう(第4表)。引き続いての実験において、≧5mM飼料グレードの り、  L−メチオニンでの補足はノルロイシンのrbStへの取り込みを完全 に妨げた。高レベルの酵母エキス、カザミノ酸類、D、L−メチオニンまたはL −メチオニンいずかを介するメチオニン補足はノルロイシンのrbStへの取り 込みを排除した。
実施例6 株BST−1によるメチオニンおよびノルロイシン生合成への影響 メチオニン補足がノルロイシン生合成に与える影響を調べるために、メチオニン を補足してまたは補足せずに行った発酵の間の株BST−1によるノルロイシン の合成および分泌をモニターした。データは、メチオニン補足はノルロイシンの 合成を妨げなかったことを示す。むしろ、メチオニン補足は調べた各側について ノルロイシン生合成の特異的活性を減少させた(ミリモル・ノルロイシン/g・ 時・As1a)。事実、ノルロイシンは、メチオニン補足なくして行った低酵母 エキス発酵の最後までに終濃度0.60mMまで、およびメチオニン補足での同 時発酵の最後までに0.57mMまで蓄積した。平均酸素摂取量(OUR)およ び二酸化炭素発生(CER)速度がメチオニン補足なくして観察されたものより も53%および58%高いごとく、メチオニン補足は細胞の代謝を変化させ、培 養増殖を促進した。培養乾燥細胞重量収率および最終濁度もメチオニン補足では 高かった(各々、24%および38%)。
実施例7  rbSt合成とノルロイシンの生合成および分泌との間の関係 株BST−1での低酵母エキス発酵の間に培養の一部を得、アミノ酸を分析し、 合計rbStを定量した。データは、接種15時間後までに、培地中のメチオニ ン濃度は0.05から0.00mMに減少したことを示す。接種15時間後まも なく、ノルロイシン生合成が開始し、接種後40時間までに終濃度0.86mM に達した。
rbSt合成の自然誘導はノルロイシンの生合成および分l・が開始したのと同 時点で起こった。これらのデータは、イー・コリ培養によるrbstの合成およ び蓄積はノルロイシンの生合成を媒介する原因かも知れないことを示唆し、そこ で、本発明者らはこれをテストした。
BST−1培養によるrbstの生産はプラスミドランナウェイ復製の自然誘導 に従う。従って、本発明者らは、ランナウェイプラスミド複製およびrbSt合 成(BST−1)双方が可能な培養、rbSt合成なくしてプラスミドランナウ ェイ複製が可能な培養(pURA4 (米国時”許出願016294号)に由来 するものであってランナウェイ複製が可能であるが、rbSt遺伝子のほとんど のの850bp  EcoRI/HindII[欠失のためrbStを合成でき ないプラスミドpURA4  ΔbghE/Hを含有するBST−IC)、およ びランナウェイプラスミド複製もrbSj合成も有しない培養(株BST−IC 、ランナウェイプラスミド複製およびrbSt合成から独立して増殖する株BS T−1の同系プラスミドフリー誘導体)によってノルロイシン生合成を調べた。
第5表のデータは、株BST−ICおよびBST−IC(pURA4  Δbg h8、H)はBST−1よりも2.2ないし2.5倍大きな密度(乾燥重量)ま で増殖したことを示す。また、これらのデータは、株BST−1CおよびBST −IC(pURA4  ΔbghtzH)はそれらの低酵母エキス発酵の間に実 質的に等量のノルロイシン(約0.01ミリモルノルロイシン/g乾燥細胞重量 )を合成したことを示す。
しかしながら、株BST−1は調さた他の株いずれよりもかなり多いノルロイシ ン(約14倍高い)を合成し、平均濃度0.14ミリモルノルロイシン/g乾燥 細胞重量に達した(第5表)。本発明者らは、両プラスミド担持株がランナウェ イプラスミド複製を有することも確認した。
まとめると、これらのデータは、イー・コリによるノルロイシン生合成は低酵母 エキス発酵間にrbSt合成に関与したことを示す。
プラスミドランナウェイ複製の現象とは無関係に、感知されるノルロイシンの蓄 積はrbSt合成無合成石は観察されなかった。幾分不十分ではあるが、ノルロ イシンは異種ポリペプチド類を発現していなかった低酵母エキス発酵の間にイー ・コリ株によってノルロイシンが生産された。
ロイシン補足 ・ 本実施例では、本発明者らは、低酵母エキス補足および生合成における外因性ロ イシンおよび他のアミノ酸とノルロイシンのrbStへの取り込みとの間の関係 を調べた。
発酵培地試料のアミノ酸分析により、実質的にすべての外因性ロイシンが、ノル ロイシンの生合成および分泌が開始する時点にほぼ対応する発酵間での時点であ る接種後14時間までに枯渇した(最初0.17mMが0.03mMまで減少) ことが明らかとされた。
さらに発酵を行って、ロイシン補足がノルロイシンの生合成および分泌、ならび にノルロイシンのrbStへの取り込みに与える影響を直接に調べた。データは 、低酵母エキス発酵のロイシン補足がなければ、ノルロイシンの生合成および分 泌は接種後約15時間に開始し、接種後40時間までに終濃度0.86mMに達 したことを示した。第2発酵の15mML−ロイシンでの補足の結果、ノルロイ シンの生合成および分泌の完全な抑制が生じた。外因性ロイシンによるα−イソ プロピルマレートシンターゼのフィードバック抑制は、ノルロイシン生合成に至 る経路における最初の反応を阻止することによってノルロイシン生合成を妨げた 。データは、ロイシン補足培養の増殖は接種後最初の19時間は非補足培養のも のと区別できないことを示した。その時点の後、ロイシン補足培養の増殖が停止 し始め、非補足培養についての24.4Assoと比較して11.4A55゜の 経密度に達した。ロイシン補足および非補足培養によるrbStの生産について のデータを比較すると、ロイシン補足培養によるrbSt生産は接種後20時間 に減衰し始めた。ロイシン補足および非補足培養についてのrbSt合成の初期 速度は非常によく似ており(各々、K=0.66および0.78/時間)、ロイ シン補足による初期の乱れを示さない。これらの発酵から得た発酵培地の試料の アミノ酸分析により、ロイシン補足培養によってノルロイシンは合成されず、一 方、ノルロイシン終濃度は非補足培養では0.60mMに達したことが確認され た。
非補足および15mML−ロイシン−補足発酵から得たrbSt試料のN−末端 アミノ酸配列決定により、非補足発酵からのrbStのN−末端および5位にお ける1、3および220モル%ノルロイシンが示され、一方、L−ロイシン−補 足発酵から得たrbStについてはいずれの位置にもノルロイシンは検出されな かった(第6表)。
スティン補足の影響 5または15mML−システィンで補足したまたは補足しない発酵を行った。当 該補足がノルロイシンの生合成を低減させ、およびrbStへのその取り込みを 減少させ得るかを否かを決定するために、ノルロイシンの生合成および分泌なら びにノルロイシンのrbStへの取り込みをモニターした。第7表のデータは、 外因性システィンを補足した場合でも、株BST−1によってノルロイシンがい くらか合成されたことを示す。15mML−システィンで補足した発酵の間に細 胞外培地で検出されたノルロイシン濃度のわずかな減少は高システィンレベルで の増殖の乱れのためであるようだった。15mML−システィン補足培養につい ての平均最終培養吸光度(A6.。)、合計乾燥重量、およびrbSt収率は、 非補足発酵からの培養から得た各レベルの51%、48%、および45%であっ た。5mML−システィンでの補足は、非補足発酵と比較して、培養の増殖を変 更することは感知されず、ノルロイシン量の減少は検出されなかった(第7表) 。しかしながら、5mML−システィンでの補足は、rbStのN−末端および 5位で検出されたノルロイシン量を、各々、1.7および21.8モル%から1 .6および18.9モル%に減少させた(第7表)。さらに、15mMし一シス ティンでの補足はN−末端および5位におけるノルロイシンの濃度を、各々、1 1モル%および13.8モル%まで減少させた。
また、株BST−IC(pURA4cmS)で発酵を行った。プラスミドpUR A4C−3は、rbStの各4個の内部システィン残基をセリン残基で置き換え 、部位定方向化(site−directed)突然変異誘発によってpURA 4から得た。この株によるrbStの合成は、rbSt合成についてのde n ovo合成されたシスティンに対しいずれの要求もなくして進行した。株BST −1(pURA4cmS)での非補足低酵母エキス発酵の最後までに、ノルロイ シンは0’−43mMの細胞外濃度まで蓄積した。さらに、N−末端アミノ酸配 列決定により、rbStのN−末端および5位において、各々、09および17 .7モル%であることが明らかとされた。
システィン補足およびシスティンを欠<rbStの合成いずれもノルロイシンの 合成に大きく影響することはなかったが、それらはメチオニンのレベルをわずか に上昇させた。メチオニンの利用可能性の増大の結果、tRNA”tおよびtR NA””の正しいチャージングについてノルロイシンとのより効果的な競合が生 じた。さらに、メチオニン生合成の増大の結果はノルロイシンのrbStへの取 り込みの量依存性減少であった。
実施例10 それにより発現された異種ポリペプチド類へのフルロイシンの取り 込みを排除するためのメチオニンを過剰生産する突然変異体微生物の使用 ポリペプチド類を発現する宿主としてメチオニンを過剰生産する微生物を用いる ことによって、ノルロイシンの異種ポリペプチド類への取り込みを排除すること もできる。かかる突然変異体はフィードバック−非感受性ホモセリントランスス クシニラーゼ(metA)突然変異体類、またはメチオニンについて抑制された 突然変異体類(metJまたはもmetK突然変異体)、あるいは双方を包含す る(アール・ジェイ・ロウベリ(R,J、 Rowbury)  ニアミノ酸生 合成および遺伝子調節(Amino Ac1ds Biosynthesis  and Genetic Regulation)、ケイ・エム・バーマンおよ びアール・エル・ソメルビル(L M。
)1errman and R,L、 Somerville)iei、 19 1 211頁(1983))。
メチオニン−原末養生物を75−90%殺傷の結果となるに十分な用量にて紫外 線照射または化学突然変異誘発物質(例えば、メチルメタンスルホネートのまた は1−メチル−3−ニトロ−1−二トロングアニジン)に暴露し、α−メチルメ チオニン、オチオニン、またはノルロイシンで補足したはっきりとした培地の平 板に希釈物を接種する。ミクロシン15.93または136に対する耐性につい ての選択を使用する別法アプローチを用いてメチオニン過剰生産者を得ることも できる(エフ・バケロら(F、 Baquero、 et al)、ジャーナル ・オブ・バタテリオロジー(J、 Bacteriol、 )、 135 、3 42−347頁(1978) ) 、 metA、 metJ、およびffIe tK突然変異体を得るさらなる別法は、II的な形質導入アプローチ(ジェイ・ エイチ・ミラー(J、 H,Miller)、分子遺伝学における実験(Exp erimentsin Mo1ecular Genetics)+  201 −205頁、コールド・スプリング・ハーバ−噂ラボラトリーズ(Cold S pring Harbor Laboratories)(1971))による 、公知突然変異体メチオニン対立遺伝子(例えば、metA : : TnlO 等、イー・フリ遺伝子ストックセンター、エール大学、c / o  ビイ・ジ ェイ・バックマン(B、 J、 Bachmann)より入手可能)の導入を包 含する。いずれかのプロトコルから、指標生物として非逆転メチオニン要求菌で 接種した頂部寒天を、メチオニンフリーのはっきりとした培地の平板上で予め増 殖させた推定クローン類のコロニーに重ねることによって、交差育種(cros sfeeding)実験においてメチオニン過剰生産(および分泌)について当 該クローンをテストする。インキュベーションに続き、メチオニン要求株の増殖 を、メチオニンを過剰生産しそれを分泌するコロニー上または周囲で観察する。
前記実施例に記載したごとき定量的アミノ酸分析の方法によって、(乾燥重量1 g当たりの)全細胞メチオニン含量および細胞外環境(細胞フリーのスペント( spent)培地)中のメチオニン含量の定量をはっきりとした液体培地中での 増殖により達成する。公知技術による異種遺伝子で形質転換したメチオニン過剰 生産株で行った(メチオニン補足なしの)低酵母二牛ス発酵の結果、ノルロイシ ンの異種ポリペプチド類への取り込みが阻止される。
実施例11 メチオニンに代えて置き換えたノルロイシンを含有するrbStの 酸化安定性の増加 蛋白を3%H,O,に暴露し、続いて逆相HPLC(RP−HPLC)で分析す ることにより、メチオニンがノルロイシンによって置き換えられているrbSt の対酸化安定性の増加を測定した。H* Otへの暴露に際し、天然rbSt( ノルロイシン−フリー)は、RP−HPLCによると2つのより初期の溶出位置 にシフトした。第1の位置シフトは非常に急速に起こり(半減期約1.2分)、 分子のサイトAにおける修飾のため、修飾rbSt分子をして、既にH,O。
に暴露されたrbStよりわずかに早く溶出せしめた。第2の位置シフトはより ゆっくりと起こり(半減期約14.3分)、その結果、分子のサイトBにおける 修飾のため、より大きいRP−HPLCシ4個のメチオニン残基を表すために任 意に名付けたものである)。
各々メチオニン−およびノルロイシン補足発酵から得られた天然rbSt(メチ オニン−フリー)およびノルロイシン−置換(rbSt位5.124.149お よび179において約36%ノルロイシフ)rbStを、室温で、2mg rb St/mQにて、5mM(NH,)、Co、、pH10,0中の3%H! O* に暴露した。暴露に続き、該H,O,を同緩衝液中で平衡化したファルマシア( Pharmacia)PD−10G−25カラム上のゲル濾過によって除去した 。次いで、試料をRP−HPLCによって分析した。40分の暴露の後、天然r bStは、各々、サイ)AおよびBの100%および85.6%修飾を呈し、一 方、ノルロイシン−置換rbStはこれらのサイトの47.6%および51.4 %修飾を含有するに過ぎなかった。従って、ノルロイシンによるメチオニンの置 換は、RP−HPLC挙動によって決定されたごと(、rbSt分子に対する酸 化安定性の増大に寄与した。
遺伝子におけるメチオニン・コドンの置換天然rbSt遺伝子についてのメツセ ンジャーRNA転写体の翻訳の結果、5位におけるメツセンジャー残基の取り込 みが起こる。
rbStにおけるメツセンジャー残基によって通常占められる他の位置に関して は、位置5をノルロイシン残基によって置き換えることができる。従って、メチ オニン・コドンのメチオニン以外のアミノ酸についてのコドンでの置換はrbS tへのノルロイシン取り込みを阻止するであろう。
当業者によく知られた技術(1989年1月19日出願のU、S。
S、N、 07/299.107)に従う合成オリゴヌクレオチドの組み込みに よって、rbStをコード付けする遺伝子における5位のメチオニン・コドンA TGをイソロイシンをフード付けするATCに変化させ、その結果、rbstm oと命名した構築体を得た。
250リツトル規模での低酵母エキス培地中での撹拌タンク発酵の間、この遺伝 子を有するベクターを持つベクターを担持するイー・フリ宿主の増殖およびそれ によるtbst合成をモニターした。発酵培地試料を発酵の間に得て、アミノ酸 分析に付した。加えて、rbS tを単離し、N−末端アミノ酸配列決定に付し て5位に見い出されるアミノ酸残基を定量した。発酵の間にノルロイシンが生産 され、発酵の最後までに細胞外に0.36mMの終濃度まで蓄積された。mo遺 伝子によってコード付けされるrbStのN−末端アミノ酸配列決定により、イ ンロイシンのみが5位に存在し、ノルロイシンまたはメチオニンは存在しないこ とが明らかとされた。
同様に、rbSt分子における他の位置のメチオニン・コドンの置換はノルロイ シンのrbStへの取り込みを阻止するであろう。
X線結晶分析は、メチオニン残基5位がはっきりとした2次構造をほとんど持た ないbstの部分に存在し、残基124および179はアルファ・ヘリックスに 存在し、149は、β巻とほとんど同様に、鎖逆転の領域に存在することを示す (ニス・ニス・アブデルーメギドら(S、 S、 Abdel−Meguid、 et at)、プロシーデイングズ・オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サ イエンシズ(Proc、 Natl。
Acad、 Sci、)USA、 84.6434−37頁(1987))、チ ョウおよびファスマン(Chou and Fasman)の予測パラメーター は残基5.124および179周囲の2次構造を正しく予allするが、残基1 79はβ−プリーツシートの領域に存在すると誤って示唆する(ビイ・シイ・チ ョウおよびシイ・ディ・ファスマン(P、 Y、 Chou and GD、  Fasman)、アヌ・レブ・バイオケム(Ann、 Rev、 Bioche m、)、  47゜251−76 (1978);シイ・ジェイ・エイチ・ジエ ンおよびエム・ソネンブルグ(C,J、 H,Chen and M、 Son enburg)、バイオケミストリー(Biochem、)、  16. 21 10 18頁(1977))。。
ウシ(エル・グラフおよびシイ・エイチ・リイ(L、 Graf and C。
1(、Li)、バイオケミカル・バイオフィジカル・リサーチ・コミューニケー ションズ(Biochei+、 Biophys、 Res、 Comm、)、   56+  168−76頁(1974)) 、ブタ(ビイ・エイチ・シーベ ルブら(P。
H,Seeberg、  et al)、ディ・エフ・エイ(DNA)、2.3 7−45頁(1983))、ヒツジ(シイ・エイチ・リイら(C,’A、 Li 、 etal)、インド・ジェイ・ベブ・ブo・レス(Int、 J、 Pep 、 Pro、 Res、)。
4、.151−53頁(1972))、ウマ(エム・エム・ザキンら(Zaki n、 et at)、インド・ジェイ・ベブ・ブo−レス(Int、 J。
Pep、 Pro、 Res、)+  s、  435−44頁(1976)) 、う・/ト(シイ・ニス・ペイジら(G、 S、 Page、 et al)、 ヌクレイツク・アシノズ・リサーチ0fue1. Ac1dsRes、)、 9 . 2087 2104頁(1981))、ヒト(エフ・エム・プツトら(F、  M、 DeNoto、 etal)、ヌクレイツク・アシノズ・リサーチ(N ucl、 Ac1ds Res、)、  9+3719−30頁(1981)) 、サル(シイ・エイチ・リイら(C,H,Li、 et al)、アーカイブズ ・オブ・バイオケミストリー・アンド・パイフィジックス(Arch、 Bio chem、 Biophys、)、  245゜287−91頁(1986)) 、およびニワトリ(エル・エム・スーザら(L、 M、 5ouza、 et  al)、ジャーナル・オブーxクスペリメンタル・ズーロジ−(J、 Exp、  Zool、)、  232.465 73頁(1983))ソマトトロピン類 のアミノ酸配列の分析は、bs t。
pS t、○St、eSt、ラットStおよびニワトリStにおける5位のメチ オニンはヒトおよびサル・ソマトトロピンにおけるイソロイシンであることを示 す。ニジマス(エル・ビイ・アゲロンおよびティ・ティ・ヘン(L、 B、 A gellon and T、 T、 Chen)、ディ・エフ・エイ(DNA) 、5,463−71頁(1986))およびサケ(ニス・七キンら(S、 5e kine、 et al)、欧州特許出願85107987.1号)のアミノ酸 配列は哺乳動物およびニワトリStからかなり発散しており、これらの配列の配 置はこの領域では困難である。
124位におけるメチオニンは7種の哺乳動物およびニワトリ・ソマトトロピン 類で不変である。
ウシ、ヒツジ、およびラットStにおける149位のメチオニンはブタ、ウマ、 およびニワトリStにおけるロイシンおよびヒトおよびサルStにおけるセリン である。ニジマスおよびサケStにおける対応アミノ酸はほとんどロイシンのよ うである。ヒトおよびサルStの残基147〜149についてのスレオニン−ア スパラギン−セリンのアミノ酸配列は、イソアスパラギン酸の形成および鎖切断 がそこで起こるbstおよびpStの98〜100と同一であるので、メチオニ ン149をセリンに変化させると同一タイプの切断に至り得る。
bstSpSt、oSt、ラットStおよびニワトリStにおける179位のメ チオニンはヒトおよびサルStにおけるバリン、およびニジマスおよびサケSt におけるアラニンである。
哺乳動物およびニワトリ・ソマトトロピンのアミノ酸配列において、bstにお いてメチオニン以外のアミノ酸が生じ、メチオニンがもう1つの種からのStで 見い出されるさらに4つの位置がある。
bStSpSt、oSt、eSt、ラットStおよびニワトリStにおける15 位のバリンはヒトおよびサル・ソマトトロピンにおけるメチオニンである。bS  t、oStShs t、およびサルStにおける73位のロイシンはpStに おけるバリンおよびウマ、ラット、およびニワトリStにおけるメチオニンであ る。bst、pSt。
oS t、S tS、hSt、サルおよびニワトリStにおける102位のバリ ンはラットStにおけるメチオニンである。最後に、bst。
p S t 、o S t 1e S t sラットおよびニワトリStにおけ る169位のロイシンはヒトおよびサルStにおけるメチオニンである。
哺乳動物およびニワトリ・ソマトトロピンにおける非メチオニン/メチオニン置 換の中では、16例(例=位置数+その位置におけるバリンを持つ種の数)にお いて、バリンが4位におけるメチオニンを置き換え、ロイシンおよびメチオニン は3位および13例で相互交換可能であり、インロイシンは1位および2例でメ チオニンを置き換える。
前記のことを考慮すると、bstにおける4個の含メチオニン部位が独立と考え られると、5位についての好ましい変化は前記したごとくインロイシンへのもの であり、124位における不変メチオニンについてもやはりそうである。バリン もまた好ましい。149位についてはロイシンが好ましい。179位については バリンが好ましい。
bstにおけるすべての4個のメチオニン残基が単一の同一アミノ酸に変化する 場合、選択は1)ロイシン、2)バリン、または3)イソロイシンである。
同様の分析により、他の異種ポリペプチド類におけるメチオニンに代えての他の 適当なアミノ酸置換も当業者ならば選択できる。
実施例13 ロイシン、イソロイシン、およびバリンでの補足が組換体ウシ・ソ マトトロピンを生産するための発酵に与える影響 り一ロイシンでの低酵母エキス発酵の補足は株BST−1によるノルロイシンの 合成を完全に抑制した。加えて、かかる発酵により、N−末端アミノ酸配列決定 に付した場合に、rbSt分子の5位にノルロイシンを含有しないrbStを生 じた。しかしながら、低酵母エキス発酵のし一ロイシンでの補足は、単独で、培 養増殖を乱し、rbSt生産量を低下させた。
L−ロイシン補足により媒介される可能性のある培養増殖がイソロイシンおよび /またはバリンのde novo合成に与えるいずれの抑制をも解消するために 、L−ロイシン、L−インロイシン、およびL−バリンでの補足を用いて発酵を 行った。各3種のアミノ酸での補足は、L−ロイシンのみで補足した平行発酵と 比較して大いに培養増殖を促進させた(各々、44.9および12.9Asso の培養密度)。加えて、ロイシン、イソロイシン、およびバリンでの補足の結果 、ロインンー補足発酵からの単に0.43グラムrbSt/リツトルと比較して 、1.97グラムrbSt/リツトルの最終rbSt力価となった。N−末端ア ミノ酸配列決定データにより、いずれの低酵母エキス発酵から得たrbStにつ いても5位にノルロイシンが存在しないことを明らかとされた。さらに、定量的 アミノ酸分析により、いずれの発酵についての発酵培地試料にもノルロイシンは 検出されなかった。まとめると、これらのデータは、rbStの生産についての 低酵母エキス発酵のし一ロイシン補足はノルロイシンt7)de novo合成 およびrbSt分子へのその取り込みを抑制するという観察を支持する。
第1表 接種に先立って得た、およびBST−1発酵の間のrbSt合成の自然誘導時に 得た発酵培地試料におけるアミノ酸濃度6アミノ酸濃度(mM)b アミノ酸         最初    誘導時アラニン        0. 35   0.04アルギニン       0.07   0.00アスパラ ギン      0.06   0.00アスパラギン酸     0.10    0.00システイン        nde    ndグル9ミン        0.16   0.03グルタミン酸       0.16     0.03グリシン        0.13   0.00ヒスチジン        0.04   0.00インロイシン      0.23   0.0 0ロイシン        0.38   0.03リジン          0.03   0.02メチオニン       0.07   0.00フエ ニルアラニン    0.19   0.00プロリン         0. 16   0.03セリン        0.13   0.00スレオニン        0.13   0.00トリプトフアン     0゜05    0.00チロシン        0.06   0.03バリア          0.28   0.036接種約15時間後に自然に誘導されたrbs t合成″0.1%(重jl/容量)酵母エキスでの補足によって発酵培地を調製 した。示されたグルタミンおよびグルタミン酸濃度は定量されたグルタミン+グ ルタミン酸(Glx)の50%である。
第2表 ノルロイシンの合成および分泌と非補足低酵母エキス発酵の間に合成されたr  b S tへのノルロイシンの取り込みとの間の関係時間(接種後)11  ノ ルロイシン取込(モル%)ノルロイシン濃度N−末端   5位     (m M)19.0     0.0    2.6     0.025.0      1.4   18.3     0.133.5     2.0   2 4.9     0.6”rbSt合成の自然誘発は接種後約15時間に起こっ た。
第3表 株BST−1での発酵の間の、D、1.−ノルロイシンまたはL−メチオニンで の補足がrbStのN−末端および5位におけるノルロイシンの取り込みに与え る影響 培地ノルロイシン取り込み(モル%) 補足″            N−末端   5位非補足              2.1   22.13mM D、L−ノルロイシン   4.4    34.35mM L、−1fオ=7     0.2    0.08接種後 30時間に収穫した発酵試料 5前記で示した補足に加えてすべての培地を0.1%醇母エキスで補足した。
第4表 −株BST〜1での発酵の間の、飼料および食品グレードのり、 L5、    −メチオ°′で0補足がrbstON−末端お2び5位における′ルロイシンの 取り込みに与える影響1 培地           ノルロイシン取す込み(モル%)補足”             N−末端    5位非補足            2.04    24.915mM L−)ftエニン    0.00    0.00 5mM D、l、−メチ、i=7    o、oo     O,07飼料グレ ード0 5mM D、 L−yl+オ=7   0.00    0.00食品グレード 1接種後31時間に収穫した発酵試料 1前記で示した補足に加えてすべての培 地に0.1%酵母エキスを補足した。
cD、L−メチオニンの飼料および食品グレード源はデグサ・コーポレーシ1ン (Degussa Corp)がら得た。
第5表 ノルロイシン生合成および分泌と株BST−1にょるrbStの合成との間の関 係 株    ブラスミF          乾燥型11   ノルロイシン     ノルロイシン濃度(g/リフドル) 濃度(mM) (mM/g乾燥重量) BST−1pURA4      5.4   0.73    0.14BS T−IC無し      l:(,30,090,01BST−ICpuRA4  Abghtzo  11.7   0.12    0.016発酵は各々二 連で行い、データは平均値として示す。発酵培地は0.1%酵母エキスで補足し た。
第6表 株BST−1での発酵の開の、L−ロイシン補足がrbStのN−末端および5 位におけるノルロイシンの取り込みに与える影響培地           ノ ルロイシン取り込み(モル%)補足I′N−末端    5位 非補足           1.3    22.0° 各々、非補足および ロイシン−補足発酵についての、接種後40および46時間に収穫した発酵試料 5前記で示した補足に加えて、発酵培地には0.1%酵母エキスを補足した。
第7表 L−システィン補足がフルロイシンの生合成および分泌とノルロイシンのrbS tへのフルロイシンの取り込みに与える影響a培地       ノルロイシン  ノルロイシン取り込み(モル%)補足5      濃度(mM)    N −末端   5位非補足      0.73    1.7   21.85 mM  L−システィン      1.18         1.6        18.915mM  L−システィン      0.59          1.1       13.86発酵試料は接種後40時間に収穫した 。
5前記で示した補足に加えて発酵培地に0.1%酵母エキスを補足した。
チャート1. ウシ・ソマトトロピンのアミノ酸配列 −aha pha pr o ala tIIat ser Leu sex gly lau pha  ala asn ala valpro thr gly lys asn g lu JLIJL gin gin lys sar asp tau glu  1aulau arg ll@sar Leu l@u lau ila g ln set trp leu gly pro 1aulau  ala   lau  +nae  arg  glu  leu  glu  asp   gly  chr  pro  ar■@ ala  gly 補正書の翻訳文提出書 (特許法第184条の8) 平成2年7月25日 1

Claims (26)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.発酵培地において、メチオニン濃度を増加させるか、またはノルロイシンの 量を減少させるか、あるいは双方を行うことを特徴とする、低濃度のアミノより なる発酵培地上で増殖させた微生物類によって発現されるポリペプチド類へのノ ルロイシンの取り込みを減少させる方法。
  2. 2.該培地をメチオニンまたはロイシンあるいは双方で補足することよりなる請 求の範囲第1項記載の方法。
  3. 3.該培地をシステインで補足することよりなる請求の範囲第1項記載の方法。
  4. 4.該微生物が組換体宿主微生物であってかく発現されたポリペプチドが異種ポ リペプチドである請求の範囲第1項記載の方法。
  5. 5.該組換体宿主微生物がバチラス(Bacillus)、サッカロミセス(S accharomyces)、ストレプトミセス(Streptomyces) 、およびエシェリヒア・コリ(E.coli.)株よりなる群から選択される請 求の範囲第4記載の方法。
  6. 6.該組換体微生物がエシェリヒア・コリであって該異種ポリペプチドがソマト トロピンである請求の範囲第5項記載の方法。
  7. 7.該ソマトトロピンがウシ・ソマトトロピンである請求の範囲第6項記載の方 法。
  8. 8.低濃度のアミノ酸を有し、かつ培地においてメチオニンの量を増加させるか またはノルロイシンの量を減少させる、あるいは双方を行う化合物を補足した発 酵培地。
  9. 9.該補足化合物がメチオニン、ロイシンおよびシステインから選択される請求 の範囲第8項記載の発酵培地。
  10. 10.メチオニン生合成酵素類について抑制され、メチオニンを過剰生産する突 然変異体微生物を利用することを特徴とする低濃度のアミノ酸上で増殖された微 生物類によって発現されたポリペプチド類へのノルロイシンの取り込みを阻止す る方法。
  11. 11.該突然変異体微生物が組換体宿主微生物であってかく発現されたポリペプ チドが異種ポリペプチドである請求の範囲第10項記載の方法。
  12. 12.低濃度のアミノ酸を有する発酵培地上で微生物を増殖させることを特徴と する該微生物によって発現されたポリペプチド類へのノルロイシン取り込みを引 き起こす方法。
  13. 13.該微生物が組換体宿主微生物であってかく発現されたポリペプチドが異種 ポリペプチドである請求の範囲第12項記載の方法。
  14. 14.さらに、メチオニンを有しない発酵培地へノルロイシンを添加することよ りなる請求の範囲第12項記載の方法。
  15. 15.該微生物が組換体宿主微生物であってかく発現されたポリペプチドが異種 ポリペプチドである請求の範囲第14項記載の方法。
  16. 16.低濃度のアミノ酸を有する発酵培地上でエシェリヒア・コリを増殖し、次 いで、該エシエリヒア・コリによって生産されたノルロイシンを単離することを 特徴とするノルロイシンの生産方法。
  17. 17.少なくとも1つのメチオニン残基が少なくも1つの異なるアミノ酸で置き 換えられたウシ・ソマトトロピン。
  18. 18.該少なくとも1つの異なるアミノ酸がイソロイシン、ロイシンおよびバリ ンよりなる群から選択される請求の範囲第17項記載のウシ・ソマトトロピン。
  19. 19.該少なくとも1つの異なるアミノ酸がイソロイシンである請求の範囲第1 8項記載のウシ・ソマトトロピン。
  20. 20.異種ポリペプチドをコード付けする組換体DNA分子におけるメチオニン をコード付けするコドン類を異なるアミノ酸をコード付けするものに変化させる ことを特徴とする該DNA分子で形質転換された微生物によって発現された該ポ リペプチド類へのノルロイシン取り込みを阻止する方法。
  21. 21.該異種ポリペプチドがソマトトロピンである請求の範囲第20項記載の方 法。
  22. 22.該少なくとも1つの異なるアミノ酸がイソロイシン、ロイシンおよびバリ ンよりなる群から選択される請求の範囲第21項記載の方法。
  23. 23.該少なくとも1つの異なるアミノ酸がイソロイシンである請求の範囲第2 2項記載の方法。
  24. 24.該異種ポリペプチドがウシ・ソマトトロピンである請求の範囲第21項記 載の方法。
  25. 25.該異種ポリペプチドがウシ・ソマトトロピンである請求の範囲第22項記 載の方法。
  26. 26.該異種ポリペプチドがウシ・ソマトトロピンである請求の範囲第23項記 載の方法。
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