JPH04207195A - ウイルスの核酸成分採取方法及びウイルス検査法 - Google Patents
ウイルスの核酸成分採取方法及びウイルス検査法Info
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- JPH04207195A JPH04207195A JP2341083A JP34108390A JPH04207195A JP H04207195 A JPH04207195 A JP H04207195A JP 2341083 A JP2341083 A JP 2341083A JP 34108390 A JP34108390 A JP 34108390A JP H04207195 A JPH04207195 A JP H04207195A
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- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〈産業上の利用分野〉
本発明は、ウィルスを含む懸濁液からウィルスの核酸成
分を採取する方法及びその方法を用いたウィルス検査法
に関する。
分を採取する方法及びその方法を用いたウィルス検査法
に関する。
〈従来の技術〉
(ウィルスの核酸成分の採取) 通常のウィルスの核酸
成分採収法では、ウィルスを含む検体を溶液中でプロテ
ネースにのような酵素、あるいはドデシル硫酸ナトリウ
ムのような界面活性剤、あるいは水酸化ナトリウムのよ
うな7μカリを用いて溶解させたり、超音波、凍結融解
、あるいはミルのような物理的破砕方法でウィルスを含
んだ細胞とウィルスを破砕したりすることでまず粗精製
品を得る。その後、フェノール・クロロホルム抽出。
成分採収法では、ウィルスを含む検体を溶液中でプロテ
ネースにのような酵素、あるいはドデシル硫酸ナトリウ
ムのような界面活性剤、あるいは水酸化ナトリウムのよ
うな7μカリを用いて溶解させたり、超音波、凍結融解
、あるいはミルのような物理的破砕方法でウィルスを含
んだ細胞とウィルスを破砕したりすることでまず粗精製
品を得る。その後、フェノール・クロロホルム抽出。
エタノ−μ沈澱処理を施しDNAのfit+製品を簿る
。
。
(ウィルス検査) また従来のウィルス同定について、
直接的に病原微生物を検出する方法としては、■標的ウ
ィルスの生育し易い培養細胞に、なるべく無菌的に検体
から回収したウィルス全感染させ、細胞病変効果(cy
topathic effsct、 CPE )または
ブランクを検出する組織培養法、■乳呑みマウスなどの
動物に検体から回収しtウィルス全感染させ、臨床変化
音検出する動物接種試験法、■ふ化鶏卵に検体から回収
したウィルス全接種して病変効果を検出するふ化鶏卵接
種法、■あるいけウィルスに固有の抗体をラテックス凝
集法に固定しこれを前記試料中に添加しビーズ表面の抗
体が菌体?認識することによりビーズが凝集すること金
利用するラテックス凝集法、■ポリエチレン製プレート
ビーズに1次抗体を結合させこれにウィルスを作用させ
抗原−抗体反応により結合するものとしないものと七よ
り分けさらに酵素や螢光物質により標識された2次抗体
を作用させB/F ’W離後後酵素活性螢光強度を測定
することで同定するサンドイッチ抗体法、■ウィルスの
核酸成分をメンブランフィルタ−に転写し特異的なりN
A断片に酵素や放射活性物Wなどを標識したD N A
プローブを作用させて遺伝子レベルで検出するDNAプ
。−ブ法がある。この方法はコロニー中のDNA中にD
NAプローブと相補的′lx塩基配列があると両者の間
に水素結合が生じることを利用して目的のウィルス等を
検出する方法である。
直接的に病原微生物を検出する方法としては、■標的ウ
ィルスの生育し易い培養細胞に、なるべく無菌的に検体
から回収したウィルス全感染させ、細胞病変効果(cy
topathic effsct、 CPE )または
ブランクを検出する組織培養法、■乳呑みマウスなどの
動物に検体から回収しtウィルス全感染させ、臨床変化
音検出する動物接種試験法、■ふ化鶏卵に検体から回収
したウィルス全接種して病変効果を検出するふ化鶏卵接
種法、■あるいけウィルスに固有の抗体をラテックス凝
集法に固定しこれを前記試料中に添加しビーズ表面の抗
体が菌体?認識することによりビーズが凝集すること金
利用するラテックス凝集法、■ポリエチレン製プレート
ビーズに1次抗体を結合させこれにウィルスを作用させ
抗原−抗体反応により結合するものとしないものと七よ
り分けさらに酵素や螢光物質により標識された2次抗体
を作用させB/F ’W離後後酵素活性螢光強度を測定
することで同定するサンドイッチ抗体法、■ウィルスの
核酸成分をメンブランフィルタ−に転写し特異的なりN
A断片に酵素や放射活性物Wなどを標識したD N A
プローブを作用させて遺伝子レベルで検出するDNAプ
。−ブ法がある。この方法はコロニー中のDNA中にD
NAプローブと相補的′lx塩基配列があると両者の間
に水素結合が生じることを利用して目的のウィルス等を
検出する方法である。
直接的に病原微生物全検出しない方法として)グ。
感染直後と感染から数週間後に患者または感染動物から
採血し、血清中の抗体価の増#をみる方法が一般に行わ
れている。
採血し、血清中の抗体価の増#をみる方法が一般に行わ
れている。
〈発明が解決しようとする課題〉
前記従来の方法ではCPE 、−!たけプラックを検出
するのに、−週間以上の培養を必要とし、−般継代細胞
においては、65から75%の血清型のウィルスしか成
育できないことから・あまり有用とは言えない。乳呑み
マウスに接種する方法の場合は、その他多くの血清型の
ウィルスを増殖させることができるが1時間がかかり1
手間がかかることから、必ずしも広く利用されていない
のが爽秋である・ 免疫学的検定法や、血清学的技術も、血清形量に抗原的
多用性があることから、十分なものとは言えない。
するのに、−週間以上の培養を必要とし、−般継代細胞
においては、65から75%の血清型のウィルスしか成
育できないことから・あまり有用とは言えない。乳呑み
マウスに接種する方法の場合は、その他多くの血清型の
ウィルスを増殖させることができるが1時間がかかり1
手間がかかることから、必ずしも広く利用されていない
のが爽秋である・ 免疫学的検定法や、血清学的技術も、血清形量に抗原的
多用性があることから、十分なものとは言えない。
核酸へイブリダイセーションを行うアプローチは、たく
さんの異なった血清形のウィルスを識別することができ
1組織培養法に比べてはるかに短時間で検出できるので
、きわめて将来性がある。
さんの異なった血清形のウィルスを識別することができ
1組織培養法に比べてはるかに短時間で検出できるので
、きわめて将来性がある。
しかし、検体からのウィルスの核酸の抽出方法が煩雑な
ため、まだ広く使われるには至っていない。
ため、まだ広く使われるには至っていない。
本発明の第一の目的は、自動化が可能で迅速かつ簡便に
試料懸濁液からウィルスの核酸成分を得ることができる
方法を提供することにある。本発明の第二の目的は、前
述の方法を用いて簡便に同定し得るウィルス検査方法?
提供することにある。
試料懸濁液からウィルスの核酸成分を得ることができる
方法を提供することにある。本発明の第二の目的は、前
述の方法を用いて簡便に同定し得るウィルス検査方法?
提供することにある。
く課題を解決するための手段〉
(1)第1の発明に係るウィルスの核酸成分採取方法は
、ウィルスを含む懸濁液からウィルスの核酸成分を採取
する方法である。
、ウィルスを含む懸濁液からウィルスの核酸成分を採取
する方法である。
この方法は、懸濁液中にウィルス吸着中F4”c加えて
ウィルスを樹脂上に捕捉することと。
ウィルスを樹脂上に捕捉することと。
フィルターによって前記樹脂をフィルター上に分離する
ことと。
ことと。
前記フィルターにウィルス溶解剤を流通させて。
ウィルスの核酸成5fヲ含む液を得ることと・全含んで
いる。
いる。
(2)第2の発明に係るウィルス検査方法は、第1の発
明による方法で得られたウィルスの核酸成分を含むl?
i−、PCR法(Polymerase Chain
Reaction法)に付して、所望のウィルスのDN
Aを増幅することと。
明による方法で得られたウィルスの核酸成分を含むl?
i−、PCR法(Polymerase Chain
Reaction法)に付して、所望のウィルスのDN
Aを増幅することと。
前記項部したDNAを用いて、前記懸濁液中の所望のD
NAウィルスの有無を検査することと。
NAウィルスの有無を検査することと。
を含んでいる。
なお、第2の発明に汀、第1の方法で得られたRNAウ
イ〃スの核酸成分を含む液を逆転写酵素の反応に付して
コンプリメンタリ−DNAを作製することと。
イ〃スの核酸成分を含む液を逆転写酵素の反応に付して
コンプリメンタリ−DNAを作製することと。
前記DNAをPCR法に付して、所望のウィルスのRN
Aのコンプリメンタリ−DN A全増幅することと。
Aのコンプリメンタリ−DN A全増幅することと。
前記増幅したDNAを用いて、前記懸濁液中の所望のR
NAウィルスの有無を検査することと。
NAウィルスの有無を検査することと。
ケ含んでいる。
〈作用〉
(1)第1の発明に係るウィルスの核酸成分採取方法で
は、ウィルス吸着位1脂を用いることで、ウィルス粒子
よりはるかに大きな粒子としてウィルスを扱うことが出
来るので、操作がしやすく、自動化が可能で迅速かつ簡
便に試料懸濁液からウィルスの該fy成分?得ることが
できる。
は、ウィルス吸着位1脂を用いることで、ウィルス粒子
よりはるかに大きな粒子としてウィルスを扱うことが出
来るので、操作がしやすく、自動化が可能で迅速かつ簡
便に試料懸濁液からウィルスの該fy成分?得ることが
できる。
(2)第2の発明に係るウィルス検査方法では、第1の
発明に係る迅速かつ簡便なウィルスの核酸成分採取方法
金床用しているので、ウィルス検査全体としても迅速か
つ簡fiI!なものとなる。
発明に係る迅速かつ簡便なウィルスの核酸成分採取方法
金床用しているので、ウィルス検査全体としても迅速か
つ簡fiI!なものとなる。
〈実施例〉
まず、本発明に係るウィルスの核酸成分採取方法の一例
を説明する。なお、第1図に本発明の生業工程を示す。
を説明する。なお、第1図に本発明の生業工程を示す。
(試料液の調製ニステップl)
ウシ胎児血清1mlに、センダイウィルス(林原生物化
学研究所製)lo8@を懸濁させ、試料液金得た。
学研究所製)lo8@を懸濁させ、試料液金得た。
(吸着処理ニステップ2.3)
予め水洗したウィルス吸着樹脂PB−100(花王製)
lomg k試料液に加え、これについてシリンジ(
1ml用2図示せず)で吸引、排出を数回繰り返してウ
ィルス粒子を樹脂に吸着させた。
lomg k試料液に加え、これについてシリンジ(
1ml用2図示せず)で吸引、排出を数回繰り返してウ
ィルス粒子を樹脂に吸着させた。
(ウィルス粒子の洗浄、ステップ4〜6)吸着処理後、
試料液を前記ンリンジ内に全量吸い上げた後、シリンジ
の先端に第2図に示すフィルターユニット全装着し、試
料St排出し、フィルター上に樹脂を担持させた。なお
、第2図中。
試料液を前記ンリンジ内に全量吸い上げた後、シリンジ
の先端に第2図に示すフィルターユニット全装着し、試
料St排出し、フィルター上に樹脂を担持させた。なお
、第2図中。
1はフィルターユニットのボディー、2はフィルターを
抑えるパツキン、3はガラス繊維ろ紙OF’/B(ワッ
トマン社Ilり、4はガラス*維ろ紙GF/F(同社I
II)でおる。純水1mlをこのシリンジで吸引、排出
しく2度)、ウィルス粒子に付いた血清成分を洗い落と
した。
抑えるパツキン、3はガラス繊維ろ紙OF’/B(ワッ
トマン社Ilり、4はガラス*維ろ紙GF/F(同社I
II)でおる。純水1mlをこのシリンジで吸引、排出
しく2度)、ウィルス粒子に付いた血清成分を洗い落と
した。
(ウィルス粒子の溶解:ステクツ゛7)前記シリンジに
界面活性剤(1%SDS水溶液200μm)を吸引し、
フィルター二二ツ)内廻i通させた。
界面活性剤(1%SDS水溶液200μm)を吸引し、
フィルター二二ツ)内廻i通させた。
(核酸成分の沈澱ニステップ8〜10)さらに400μ
mのエタノールと20μmの3M酢酸ナトリウム水溶液
の混液420μl′f!:o’cにて前記シリンジに吸
引し、これを排出して、フィルター上に核酸成分を沈澱
の状態で担持した。次いで1mlの70%エタノール(
0°C)の吸引・排出。
mのエタノールと20μmの3M酢酸ナトリウム水溶液
の混液420μl′f!:o’cにて前記シリンジに吸
引し、これを排出して、フィルター上に核酸成分を沈澱
の状態で担持した。次いで1mlの70%エタノール(
0°C)の吸引・排出。
1mlの9096エタノールの吸引・排出により、この
核酸成分の沈澱物を洗浄した。
核酸成分の沈澱物を洗浄した。
(核酸成分の溶出ニステップ11)
次いで0.5 *Twa@n20 、0.54Noni
det P −40水溶!100μmを前記シリンジに
吸引し、フィルターユニット内に流通させ、60″Cで
10分間インキ−ベート後この液を排出して核酸成分の
溶液を得た。
det P −40水溶!100μmを前記シリンジに
吸引し、フィルターユニット内に流通させ、60″Cで
10分間インキ−ベート後この液を排出して核酸成分の
溶液を得た。
(逆転写反応及びコンプリメンタリ−DNAの増幅ニス
テップ12) 上記溶出液′!!1l−3μm取り、RNAの特定の領
域に。
テップ12) 上記溶出液′!!1l−3μm取り、RNAの特定の領
域に。
ついて相補的なりNAを合成する逆転写反応と。
特異的に目的DNAf増幅する方法であるPCR法(5
aiki、R,に、et al、5cience 23
9487−491(1988))を行った。
aiki、R,に、et al、5cience 23
9487−491(1988))を行った。
すなわち、蒸留水12.2μm、1ライマ一25μm(
20μM ) 2 櫟、 dNTP4.8μl (1,
25mM各dNTP)。
20μM ) 2 櫟、 dNTP4.8μl (1,
25mM各dNTP)。
リバ〜ストランスクリフ゛テース0,5μ+(200ユ
ニット/ml ; BRL製) 、 RNasin l
μI (40−L = 7ト/m’ ; TOYOB
O製) 、0.596Non+det P−40゜0
.5μlween20水溶23μ1.10倍m東液3μ
m(パーキンエルマーシータス社%)、Taqポリメラ
ーゼ15ユニット(同社製)、■合計30μmにミネラ
ル油50μmを蒸発防止剤として重層して・DNA T
hermal (:ycler (同社製)にセットし
たつここで言うプライマーとは、20塩基対のオリゴヌ
クレオチドである。また、ここで言う10倍緩衝液とは
100mM)リスq酸緩衝H(pH9,0) 。
ニット/ml ; BRL製) 、 RNasin l
μI (40−L = 7ト/m’ ; TOYOB
O製) 、0.596Non+det P−40゜0
.5μlween20水溶23μ1.10倍m東液3μ
m(パーキンエルマーシータス社%)、Taqポリメラ
ーゼ15ユニット(同社製)、■合計30μmにミネラ
ル油50μmを蒸発防止剤として重層して・DNA T
hermal (:ycler (同社製)にセットし
たつここで言うプライマーとは、20塩基対のオリゴヌ
クレオチドである。また、ここで言う10倍緩衝液とは
100mM)リスq酸緩衝H(pH9,0) 。
500mMKt、:l 、 15tnM MgCl2
である。
である。
逆転写反応の条件は42°C40分、 PCR反応の温
度サイク/L/は変性94°C1分、アニーリング50
°C1分・鎖長伸長72°C1分、1サイク/L15.
7分、42サイクルで行っ友。
度サイク/L/は変性94°C1分、アニーリング50
°C1分・鎖長伸長72°C1分、1サイク/L15.
7分、42サイクルで行っ友。
(検出)
上記pcR1の溶液を10μmとり、エチジウムブロマ
イドを含む2%アガロースゲルで100V35分関電R
激動を行った浸、トランスイルミネーター上にゲ/L’
をおき、e長320nmのUV光を照射したところPC
R反応で増幅したDNAは螢光を発した。その螢光をイ
ンスタントフィルムを装着したカメラにて書影した結果
金第3図に示した。
イドを含む2%アガロースゲルで100V35分関電R
激動を行った浸、トランスイルミネーター上にゲ/L’
をおき、e長320nmのUV光を照射したところPC
R反応で増幅したDNAは螢光を発した。その螢光をイ
ンスタントフィルムを装着したカメラにて書影した結果
金第3図に示した。
センタイウィルスがサンプル中に含まれている懸濁液に
ついて本発明による方法5r実施した後の電気泳動パタ
ーンを第3図のレーア1に示す。その結果、予想される
173塩基対の位置にバンドが出現した。これは同時に
t貧泳動したポジティブコントロールサンプル(Z31
Jのレーン3)、!:同じ位置であることからもセンダ
イウィルス金特異的に検出でき几ことがわかる。ここで
言うポジティブコントロールとはセンダイフィルスを界
面活性剤で溶解した彼、フエノートクロロホルム抽出、
エタノール沈#を施して得たDNA浴液?用いたもので
ある。
ついて本発明による方法5r実施した後の電気泳動パタ
ーンを第3図のレーア1に示す。その結果、予想される
173塩基対の位置にバンドが出現した。これは同時に
t貧泳動したポジティブコントロールサンプル(Z31
Jのレーン3)、!:同じ位置であることからもセンダ
イウィルス金特異的に検出でき几ことがわかる。ここで
言うポジティブコントロールとはセンダイフィルスを界
面活性剤で溶解した彼、フエノートクロロホルム抽出、
エタノール沈#を施して得たDNA浴液?用いたもので
ある。
なお、レーン2け故意にウィルスを入れずに血清だけ?
試料液と同様に処理したパターン、レーン4は溶出附を
入れずにPCR法を行ったもの。
試料液と同様に処理したパターン、レーン4は溶出附を
入れずにPCR法を行ったもの。
MはψX174DNAを制限酵素)1 i n c l
Iで完全消化して得られた分子量マーカーであり、A
、B。
Iで完全消化して得られた分子量マーカーであり、A
、B。
C,D、Eけ対応する塩基対′71′数である。
上記結果力・ら、この発明のウィルスの核酸成分採取法
分よひウィルスS査法(てよれば、血清中のセンダイウ
ィルスを上記方法により簡便かつ5時間程度と1ハう短
時間′″′′検出ることがわかった。
分よひウィルスS査法(てよれば、血清中のセンダイウ
ィルスを上記方法により簡便かつ5時間程度と1ハう短
時間′″′′検出ることがわかった。
〈発明の効果〉
第1の発明によれば、ウィルス吸着樹脂?採用し九ので
、ウィルスの取扱が容易になり、ウィルスの核酸成分の
抽出の自動化が可能となり、迅速かつ簡便に操作が行え
るようになるつ 第2の発明(てよれば、第1の発明を用いてDNAウィ
ルスの該;1!成分を潟、PCR反応?施すので。
、ウィルスの取扱が容易になり、ウィルスの核酸成分の
抽出の自動化が可能となり、迅速かつ簡便に操作が行え
るようになるつ 第2の発明(てよれば、第1の発明を用いてDNAウィ
ルスの該;1!成分を潟、PCR反応?施すので。
第1の発明と同様に簡便かつ迅速にDNAウィルス金検
歪検査ことができる。
歪検査ことができる。
更に、第1の発明を用いてRNAウィルスの核酸成分ケ
得、逆転写反応及びPCB反応を施すので、第1の発明
と同様に簡便かつ迅速にRNAウィルスを検査すること
ができる。
得、逆転写反応及びPCB反応を施すので、第1の発明
と同様に簡便かつ迅速にRNAウィルスを検査すること
ができる。
第1図は本発明の一実施例の作業?:r程に示すフロー
チャート、第2図はフィルターユニットの構造を示すも
の、第3図はこの発明の方法ケ実旌し急談の電電泳動パ
ターンである。 (′外2名)ミ、54〜 A=−1,Q57bp 8−−=770 0、−、 ++−e 12 D−−−2−−−495 E−++350
チャート、第2図はフィルターユニットの構造を示すも
の、第3図はこの発明の方法ケ実旌し急談の電電泳動パ
ターンである。 (′外2名)ミ、54〜 A=−1,Q57bp 8−−=770 0、−、 ++−e 12 D−−−2−−−495 E−++350
Claims (2)
- (1)ウィルスを含む懸濁液からウィルスの核酸成分を
採取する方法であって、前記懸濁液中にウィルス吸着樹
脂を加えてウィルスを樹脂上に捕捉することと、前記ウ
ィルスを捕捉した樹脂をフィルター上に分離することと
、前記フィルター上に分離したウィルス捕捉樹脂にウィ
ルス溶解剤を流通させて、ウィルスの核酸成分を含む液
を得ることとを含むウィルスの核酸成分採取方法。 - (2)請求項1の方法で得られたウィルスの核酸成分を
含む液を直接又は逆転写酵素の反応を介した後PCR法
に付して、所望のウィルスのDNAを増幅することと、
前記増幅したDNAを用いて、前記懸濁液中の所望のD
NAウィルスの有無を検査することとを含むウィルス検
査法
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2341083A JPH04207195A (ja) | 1990-11-30 | 1990-11-30 | ウイルスの核酸成分採取方法及びウイルス検査法 |
| EP91120362A EP0488270A1 (en) | 1990-11-30 | 1991-11-28 | Method for collecting the nucleic acid component of virus and method for identifying virus |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2341083A JPH04207195A (ja) | 1990-11-30 | 1990-11-30 | ウイルスの核酸成分採取方法及びウイルス検査法 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH04207195A true JPH04207195A (ja) | 1992-07-29 |
Family
ID=18343095
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2341083A Pending JPH04207195A (ja) | 1990-11-30 | 1990-11-30 | ウイルスの核酸成分採取方法及びウイルス検査法 |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0488270A1 (ja) |
| JP (1) | JPH04207195A (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
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Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
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1990
- 1990-11-30 JP JP2341083A patent/JPH04207195A/ja active Pending
-
1991
- 1991-11-28 EP EP91120362A patent/EP0488270A1/en not_active Withdrawn
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0488270A1 (en) | 1992-06-03 |
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