JPH04211370A - 新規プロテアーゼ - Google Patents
新規プロテアーゼInfo
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- JPH04211370A JPH04211370A JP2463391A JP2463391A JPH04211370A JP H04211370 A JPH04211370 A JP H04211370A JP 2463391 A JP2463391 A JP 2463391A JP 2463391 A JP2463391 A JP 2463391A JP H04211370 A JPH04211370 A JP H04211370A
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- JP
- Japan
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- dna
- protease
- sequence
- fragment
- asn
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は,ポリペプチドのアミノ
酸配列中のグルタミン酸残基のC末端を特異的に開裂す
る新規プロテアーゼ,該プロテアーゼをコードするDN
A配列,該DNA配列を有する発現ベクター,該発現ベ
クターを有する形質転換体,および該形質転換体を用い
たプロテアーゼの製造方法に関する。
酸配列中のグルタミン酸残基のC末端を特異的に開裂す
る新規プロテアーゼ,該プロテアーゼをコードするDN
A配列,該DNA配列を有する発現ベクター,該発現ベ
クターを有する形質転換体,および該形質転換体を用い
たプロテアーゼの製造方法に関する。
【0002】
【従来の技術】スタフィロコッカス アウレウス(S
taphylococcus aureus;以下,S
. aureusとする)V8株由来のV8プロテアー
ゼが知られている。この酵素はセリンプロテアーゼであ
り,タンパク(ポリペプチド)に作用して,グルタミン
酸(Glu)残基のC末端を特異的に開裂する。C.C
armona ら(Nucl. Acids Res.
,15,6757(1987))は,この酵素をコード
するDNA配列をクローン化している(配列表2)。
taphylococcus aureus;以下,S
. aureusとする)V8株由来のV8プロテアー
ゼが知られている。この酵素はセリンプロテアーゼであ
り,タンパク(ポリペプチド)に作用して,グルタミン
酸(Glu)残基のC末端を特異的に開裂する。C.C
armona ら(Nucl. Acids Res.
,15,6757(1987))は,この酵素をコード
するDNA配列をクローン化している(配列表2)。
【0003】V8プロテアーゼは,分析などの目的のた
めにタンパクを上記位置で特異的に切断したい場合;遺
伝子組換え技術により目的タンパクを融合タンパクとし
て生産させた場合に,該融合タンパクを切断して目的の
タンパクを得る場合などに有用である。後者の場合では
,目的タンパクをGlu残基を介して他のタンパクと結
合させて生産した後,この酵素で切断処理することによ
り目的タンパクを分離することができる。そのため,上
記以外にもこのような酵素活性を有するプロテアーゼが
さらに求められている。
めにタンパクを上記位置で特異的に切断したい場合;遺
伝子組換え技術により目的タンパクを融合タンパクとし
て生産させた場合に,該融合タンパクを切断して目的の
タンパクを得る場合などに有用である。後者の場合では
,目的タンパクをGlu残基を介して他のタンパクと結
合させて生産した後,この酵素で切断処理することによ
り目的タンパクを分離することができる。そのため,上
記以外にもこのような酵素活性を有するプロテアーゼが
さらに求められている。
【0004】
【発明の目的】本発明の目的は,Glu残基のC末端を
特異的に開裂する酵素活性を有する新規のV8様プロテ
アーゼ,該プロテアーゼをコードするDNA配列,該D
NA配列を有する発現ベクター,該発現ベクターを有す
る形質転換体,および該形質転換体を用いたプロテアー
ゼの製造方法を提供することにある。
特異的に開裂する酵素活性を有する新規のV8様プロテ
アーゼ,該プロテアーゼをコードするDNA配列,該D
NA配列を有する発現ベクター,該発現ベクターを有す
る形質転換体,および該形質転換体を用いたプロテアー
ゼの製造方法を提供することにある。
【0005】
【発明の構成】発明者らは,S. aureus のV
8株以外の菌株からV8プロテアーゼと同様の活性を有
するV8様プロテアーゼを得ようと種々の検討を行った
。その結果,S. aureusATCC 12600
株のゲノムDNAに新規のV8様プロテアーゼをコード
するDNA配列を見い出し,本発明を完成するに至った
。
8株以外の菌株からV8プロテアーゼと同様の活性を有
するV8様プロテアーゼを得ようと種々の検討を行った
。その結果,S. aureusATCC 12600
株のゲノムDNAに新規のV8様プロテアーゼをコード
するDNA配列を見い出し,本発明を完成するに至った
。
【0006】本発明のプロテアーゼは,配列表1に示さ
れる+1位のValから+289位のAlaまでのアミ
ノ酸配列を含む。
れる+1位のValから+289位のAlaまでのアミ
ノ酸配列を含む。
【0007】好適な実施態様によれば,本発明のプロテ
アーゼは,配列表1に示される−68位のMetから+
289位のAlaまでのアミノ酸配列を含む。
アーゼは,配列表1に示される−68位のMetから+
289位のAlaまでのアミノ酸配列を含む。
【0008】本発明のDNA配列は,上記プロテアーゼ
をコードする。
をコードする。
【0009】好適な実施態様によれば,本発明のDNA
配列は,配列表1の556位のGから1422位のAで
なる塩基配列を有する。
配列は,配列表1の556位のGから1422位のAで
なる塩基配列を有する。
【0010】好適な実施態様によれば,上記DNA配列
は,配列表1の352位のAから1422位のAでなる
塩基配列を有する。
は,配列表1の352位のAから1422位のAでなる
塩基配列を有する。
【0011】本発明の発現ベクターは,上記DNA配列
を有する。
を有する。
【0012】本発明の形質転換体は,上記発現ベクター
を宿主に導入して得られる。
を宿主に導入して得られる。
【0013】本発明のプロテアーゼの製造方法は,上記
記載の形質転換体を培養する工程,および生産されたプ
ロテアーゼを該培地から採取する工程を包含する。
記載の形質転換体を培養する工程,および生産されたプ
ロテアーゼを該培地から採取する工程を包含する。
【0014】以下に,本発明を説明するうえで用いられ
る用語を説明する。
る用語を説明する。
【0015】“オリゴヌクレオチド”とは,短い一本鎖
DNAを意味する。オリゴヌクレオチドは,既知の方法
により化学合成することができる。本発明に用いるオリ
ゴヌクレオチドは,特に明示しない限り,化学合成され
,セファデックスG50を用いたゲルクロマトグラフィ
ーおよび逆相シリゲルカラムを用いた高速液体クロマト
グラフィー(HPLC)により精製して得られる。
DNAを意味する。オリゴヌクレオチドは,既知の方法
により化学合成することができる。本発明に用いるオリ
ゴヌクレオチドは,特に明示しない限り,化学合成され
,セファデックスG50を用いたゲルクロマトグラフィ
ーおよび逆相シリゲルカラムを用いた高速液体クロマト
グラフィー(HPLC)により精製して得られる。
【0016】“PCR”とは,ポリメラーゼチェインリ
アクション(Polymerase chain re
action)の略であり,DNA上の一定の領域を酵
素的に増幅させる方法を意味する(Saikiら,Sc
ience, 239,487−497(1988))
。まず,増幅したいDNAを熱変性させて一本鎖とし,
この一本鎖の鋳型DNAのそれぞれの3’末端領域に相
補的なオリゴヌクレオチドプライマー(センス鎖および
アンチセンス鎖の2種類)をアニーリングさせる。次に
,DNAポリメラーゼの作用によってそれぞれのプライ
マーからDNA鎖の伸長反応を行わせる。この一連の反
応を繰り返すことにより,目的のDNAを10万倍〜1
00万倍に増幅することができる。
アクション(Polymerase chain re
action)の略であり,DNA上の一定の領域を酵
素的に増幅させる方法を意味する(Saikiら,Sc
ience, 239,487−497(1988))
。まず,増幅したいDNAを熱変性させて一本鎖とし,
この一本鎖の鋳型DNAのそれぞれの3’末端領域に相
補的なオリゴヌクレオチドプライマー(センス鎖および
アンチセンス鎖の2種類)をアニーリングさせる。次に
,DNAポリメラーゼの作用によってそれぞれのプライ
マーからDNA鎖の伸長反応を行わせる。この一連の反
応を繰り返すことにより,目的のDNAを10万倍〜1
00万倍に増幅することができる。
【0017】“サザン分析”とは,ある制限酵素によっ
て切断して得たDNA断片に目的の遺伝子が含まれてい
るかどうかを検定するための方法である。サザン分析を
行うには,まず二本鎖DNA上の特異的な塩基配列を認
識してDNAを切断する制限酵素でDNAを消化する。 得られた消化物の1%アガロースゲル電気泳動を行い,
アルカリ処理により変性させて1本鎖とし,ナイロンフ
ィルターに移す。一方,問題とする遺伝子の一部である
オリゴヌクレオチドもしくはDNA断片を準備し,標識
を施してプローブとする。このプローブとナイロンフィ
ルター上の1本鎖DNAとのハイブリッドを形成により
分析がなされる。
て切断して得たDNA断片に目的の遺伝子が含まれてい
るかどうかを検定するための方法である。サザン分析を
行うには,まず二本鎖DNA上の特異的な塩基配列を認
識してDNAを切断する制限酵素でDNAを消化する。 得られた消化物の1%アガロースゲル電気泳動を行い,
アルカリ処理により変性させて1本鎖とし,ナイロンフ
ィルターに移す。一方,問題とする遺伝子の一部である
オリゴヌクレオチドもしくはDNA断片を準備し,標識
を施してプローブとする。このプローブとナイロンフィ
ルター上の1本鎖DNAとのハイブリッドを形成により
分析がなされる。
【0018】“ライゲーション(結合)”とは,2個の
二本鎖DNA断片の間にホスホジエステル結合を形成さ
せることを意味する。その際,二本鎖DNA断片自身の
自己結合を防止するため,一方の断片の脱リン酸処理を
常法(T. Maniatisら,Molecular
Cloning,133−134(1982))により
行っておく。ライゲーションは,既知の緩衝液および反
応条件を用い, T4 DNAリガーゼにより行うこと
ができる。
二本鎖DNA断片の間にホスホジエステル結合を形成さ
せることを意味する。その際,二本鎖DNA断片自身の
自己結合を防止するため,一方の断片の脱リン酸処理を
常法(T. Maniatisら,Molecular
Cloning,133−134(1982))により
行っておく。ライゲーションは,既知の緩衝液および反
応条件を用い, T4 DNAリガーゼにより行うこと
ができる。
【0019】“形質転換”とは,外来性の遺伝子(DN
A)を細胞(宿主細胞)内に導入することにより,該細
胞の遺伝形質が変化する現象を指す。形質転換後の細胞
は形質転換体と呼ばれ,外来DNAを該細胞の染色体外
成分として,または染色体に組み込まれて,複製され得
る状態で有する。
A)を細胞(宿主細胞)内に導入することにより,該細
胞の遺伝形質が変化する現象を指す。形質転換後の細胞
は形質転換体と呼ばれ,外来DNAを該細胞の染色体外
成分として,または染色体に組み込まれて,複製され得
る状態で有する。
【0020】
(I)V8様プロテアーゼをコードするDNA配列の決
定次に,本発明のV8様プロテアーゼをコードするDN
A配列(以下,V8様遺伝子とする)の決定方法を,工
程の順に説明する。このDNA配列は,S. aure
us ATCC 12600株のゲノムDNAを,PC
R解析,サザン分析,直接シークエンス法などを組み合
わせて分析することにより決定された。
定次に,本発明のV8様プロテアーゼをコードするDN
A配列(以下,V8様遺伝子とする)の決定方法を,工
程の順に説明する。このDNA配列は,S. aure
us ATCC 12600株のゲノムDNAを,PC
R解析,サザン分析,直接シークエンス法などを組み合
わせて分析することにより決定された。
【0021】(A) ゲノムDNAのPCR解析V8様
プロテアーゼをコードするDNA配列(V8様遺伝子)
は,例えば,ゲノムDNAから得ることができる。それ
には,まずS. aureus ATCC 12600
株のゲノムDNA を,該菌株の培養細胞から既知の方
法(M. Stahlら,Journal ofBac
teriology,154,406−412(198
3))に従って調製する。 このゲノムDNAを,PCR解析の鋳型DNAとして用
いる。PCRに用いるオリゴヌクレオチドプライマーは
,S. aureus V8株由来のセリンプロテアー
ゼ(V8プロテアーゼ)をコードするDNA配列(C.
Carmona ら,前出;以下,V8遺伝子とする
)に基づいて,常法により合成することができる。例え
ば,配列表2に示すV8プロテアーゼのアミノ酸配列の
N末端側1位から6位に相当するアミノ酸をコードする
18merのオリゴヌクレオチド (5’−GTTAT
ATTACCAAATAAC)をセンスプライマーV8
4とし,該アミノ酸のC末端側 262位から257位
に相当するアミノ酸をコードするオリゴヌクレオチドに
相補的な18mer(5’−TGAATTATTGTT
ATCGCC)をアンチセンスプライマーV89とする
。上記ゲノムDNA,センスプライマーV84,および
アンチセンスプライマーV89を用いてPCRを行うこ
とより,ゲノムDNA中の目的DNA鎖が伸長され,増
幅される。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳
動により解析すると,約850bp長のDNA断片が得
られる。このDNA断片は,V8遺伝子よりも約60b
p長い。
プロテアーゼをコードするDNA配列(V8様遺伝子)
は,例えば,ゲノムDNAから得ることができる。それ
には,まずS. aureus ATCC 12600
株のゲノムDNA を,該菌株の培養細胞から既知の方
法(M. Stahlら,Journal ofBac
teriology,154,406−412(198
3))に従って調製する。 このゲノムDNAを,PCR解析の鋳型DNAとして用
いる。PCRに用いるオリゴヌクレオチドプライマーは
,S. aureus V8株由来のセリンプロテアー
ゼ(V8プロテアーゼ)をコードするDNA配列(C.
Carmona ら,前出;以下,V8遺伝子とする
)に基づいて,常法により合成することができる。例え
ば,配列表2に示すV8プロテアーゼのアミノ酸配列の
N末端側1位から6位に相当するアミノ酸をコードする
18merのオリゴヌクレオチド (5’−GTTAT
ATTACCAAATAAC)をセンスプライマーV8
4とし,該アミノ酸のC末端側 262位から257位
に相当するアミノ酸をコードするオリゴヌクレオチドに
相補的な18mer(5’−TGAATTATTGTT
ATCGCC)をアンチセンスプライマーV89とする
。上記ゲノムDNA,センスプライマーV84,および
アンチセンスプライマーV89を用いてPCRを行うこ
とより,ゲノムDNA中の目的DNA鎖が伸長され,増
幅される。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳
動により解析すると,約850bp長のDNA断片が得
られる。このDNA断片は,V8遺伝子よりも約60b
p長い。
【0022】このDNA断片を制限酵素SspIで消化
し,得られた消化物をアガロースゲル電気泳動により分
析すると,それぞれ262,243,222および12
2bpオリゴヌクレオチド長に相当する4本のバンドが
認められる。V8遺伝子にも同様のSspIの切断部位
が存在するため,上記DNA断片はV8遺伝子と同様の
SspI認識部位を有することがわかる。但し,V8様
遺伝子の3’末端側に相当する262 bp長のオリゴ
ヌクレオチドは,V8遺伝子のSspI消化物の相当す
るオリゴヌクレオチドよりも約60bp長い。
し,得られた消化物をアガロースゲル電気泳動により分
析すると,それぞれ262,243,222および12
2bpオリゴヌクレオチド長に相当する4本のバンドが
認められる。V8遺伝子にも同様のSspIの切断部位
が存在するため,上記DNA断片はV8遺伝子と同様の
SspI認識部位を有することがわかる。但し,V8様
遺伝子の3’末端側に相当する262 bp長のオリゴ
ヌクレオチドは,V8遺伝子のSspI消化物の相当す
るオリゴヌクレオチドよりも約60bp長い。
【0023】上記PCR産物(以下,V84−V89と
する)の構造解析は,直接シークエンス法により行うこ
とができる。それにはまず,V84−V89の上記85
0bpの断片をアガロースゲル電気泳動により単離し,
これを二次PCRの鋳型DNAとする。この鋳型DNA
に,センスプライマーV84のみを加えた検体(S),
およびアンチセンスプライマーV89のみを加えた検体
(AS)の2種の検体を作成し,二次PCRを行うこと
により一本鎖DNAを調製する。別に,直接シークエン
ス法に用いるオリゴヌクレオチドプライマーV84およ
びV89を,常法により5’末端を32P標識して調製
する。上記(S)で調製した一本鎖DNAと32P標識
アンチセンスプライマーとを用い,さらに,上記(AS
)で調製した一本鎖DNAと32P標識センスプライマ
ーとを用い,ジデオキシ法により塩基配列が決定され得
る。その結果, V84−V89領域の塩基配列は,V
8遺伝子と約92%の相同性を有することが認められた
。このように,S. aureus ATCC 126
00株のゲノムDNA由来のV8様遺伝子DNA配列は
,V8株由来のV8遺伝子DNA配列とかなりの相同性
を有するが,同一ではないことが確認される。
する)の構造解析は,直接シークエンス法により行うこ
とができる。それにはまず,V84−V89の上記85
0bpの断片をアガロースゲル電気泳動により単離し,
これを二次PCRの鋳型DNAとする。この鋳型DNA
に,センスプライマーV84のみを加えた検体(S),
およびアンチセンスプライマーV89のみを加えた検体
(AS)の2種の検体を作成し,二次PCRを行うこと
により一本鎖DNAを調製する。別に,直接シークエン
ス法に用いるオリゴヌクレオチドプライマーV84およ
びV89を,常法により5’末端を32P標識して調製
する。上記(S)で調製した一本鎖DNAと32P標識
アンチセンスプライマーとを用い,さらに,上記(AS
)で調製した一本鎖DNAと32P標識センスプライマ
ーとを用い,ジデオキシ法により塩基配列が決定され得
る。その結果, V84−V89領域の塩基配列は,V
8遺伝子と約92%の相同性を有することが認められた
。このように,S. aureus ATCC 126
00株のゲノムDNA由来のV8様遺伝子DNA配列は
,V8株由来のV8遺伝子DNA配列とかなりの相同性
を有するが,同一ではないことが確認される。
【0024】(B) ゲノムDNAのサザン分析(A)
項で調製したS. aureus ATCC 1260
0株由来のゲノムDNA を,制限酵素EcoRIで消
化し,これをアガロースゲル電気泳動にかけて分離した
後,該DNA断片をナイロンメンブランフィルターにブ
ロッティングし,サザン分析を行う。ハイブリダイゼー
ション用プローブは,(A)項で得られるV84−V8
9を 32P−dCTP を常法により標識して用いる
。このV84−V89とハイブリダイズしたDNA断片
は,アガロースゲル中の約3.5kb に相当するバン
ドに相当する。この実験により,上記PCRで増幅して
得られたDNA断片は,S. aureus ATCC
12600株由来のゲノムDNA中に存在することが
わかる。
項で調製したS. aureus ATCC 1260
0株由来のゲノムDNA を,制限酵素EcoRIで消
化し,これをアガロースゲル電気泳動にかけて分離した
後,該DNA断片をナイロンメンブランフィルターにブ
ロッティングし,サザン分析を行う。ハイブリダイゼー
ション用プローブは,(A)項で得られるV84−V8
9を 32P−dCTP を常法により標識して用いる
。このV84−V89とハイブリダイズしたDNA断片
は,アガロースゲル中の約3.5kb に相当するバン
ドに相当する。この実験により,上記PCRで増幅して
得られたDNA断片は,S. aureus ATCC
12600株由来のゲノムDNA中に存在することが
わかる。
【0025】
(C) サブゲノムライブラリーの作製およびPCR解
析(A) 項で調製したS. aureus ATCC
12600株由来のゲノムDNAをEcoRIで消化
して得られる上記3.5kbのDNA断片を,ファージ
ベクターM13mp10に組み込む。次いで,この組換
えM13mp10ベクターを,既知の方法(Mande
lら,J. Mol. Biol.,53,159 (
1970))に従って適当な宿主細胞に導入することに
より,サブゲノムライブラリーが作製される。宿主細胞
としては,大腸菌JM103株が好適である。
析(A) 項で調製したS. aureus ATCC
12600株由来のゲノムDNAをEcoRIで消化
して得られる上記3.5kbのDNA断片を,ファージ
ベクターM13mp10に組み込む。次いで,この組換
えM13mp10ベクターを,既知の方法(Mande
lら,J. Mol. Biol.,53,159 (
1970))に従って適当な宿主細胞に導入することに
より,サブゲノムライブラリーが作製される。宿主細胞
としては,大腸菌JM103株が好適である。
【0026】上記形質転換体の培養により得られるファ
ージDNAを熱変性させ,以下のPCRに用いる鋳型D
NAとする。PCRに用いるプライマーは,上述のV8
4センスプライマーおよびV89アンチセンスプライマ
ー,ならびにM13mp10ベクター中に存在するDN
Aに相補的なオリゴヌクレオチドであるM4アンチセン
スプライマー(5’−GTTTTCCCAGTCACG
AC)(配列表3に示す)およびRVセンスプライマー
(5’−CAGGAAACAGCTATGAC)(配列
表4に示す)の4種類である。これらのプライマーをV
84−V89,V84−M4,V84−RV,V89−
M4,およびV89−RVの5種類の組合せで用い,P
CRを行う。
ージDNAを熱変性させ,以下のPCRに用いる鋳型D
NAとする。PCRに用いるプライマーは,上述のV8
4センスプライマーおよびV89アンチセンスプライマ
ー,ならびにM13mp10ベクター中に存在するDN
Aに相補的なオリゴヌクレオチドであるM4アンチセン
スプライマー(5’−GTTTTCCCAGTCACG
AC)(配列表3に示す)およびRVセンスプライマー
(5’−CAGGAAACAGCTATGAC)(配列
表4に示す)の4種類である。これらのプライマーをV
84−V89,V84−M4,V84−RV,V89−
M4,およびV89−RVの5種類の組合せで用い,P
CRを行う。
【0027】次いで,それぞれのPCR産物のサザン分
析を行う。サザン分析に用いるハイブリダイゼーション
用プローブは,先に決定したV84−V89領域内の塩
基配列に基づいて合成したV811(5’−TGAGT
AATAATGCTGAAA)(この配列は配列表1内
に存在;その位置は図1,2および3に明示)の5’末
端を放射標識することにより作成される。サザン分析の
結果, V84−V89,V84−M4,およびV89
−RVのPCR産物について,陽性バンドが検出された
。陽性バンドは,V84−V89のPCR産物について
は約850bp,V84−M4のPCR産物については
約2.5kb,そしてV89−RVのPCR産物につい
ては約1.8kbに相当するバンドであった。 V84
−V89領域はV84−M4領域に含まれる。従って,
V84−M4およびV89−RVのPCR産物を解析す
ることにより,S. aureus ATCC 126
00株由来のV8様遺伝子が決定され得る。
析を行う。サザン分析に用いるハイブリダイゼーション
用プローブは,先に決定したV84−V89領域内の塩
基配列に基づいて合成したV811(5’−TGAGT
AATAATGCTGAAA)(この配列は配列表1内
に存在;その位置は図1,2および3に明示)の5’末
端を放射標識することにより作成される。サザン分析の
結果, V84−V89,V84−M4,およびV89
−RVのPCR産物について,陽性バンドが検出された
。陽性バンドは,V84−V89のPCR産物について
は約850bp,V84−M4のPCR産物については
約2.5kb,そしてV89−RVのPCR産物につい
ては約1.8kbに相当するバンドであった。 V84
−V89領域はV84−M4領域に含まれる。従って,
V84−M4およびV89−RVのPCR産物を解析す
ることにより,S. aureus ATCC 126
00株由来のV8様遺伝子が決定され得る。
【0028】(D) S. aureus ATCC
12600株由来のV8様遺伝子の構造解析 V8様遺伝子のDNA配列の決定は,上記サブゲノムラ
イブラリーから得られたV84−M4およびV89−R
VのPCR産物を用い,直接シークエンス法により行わ
れ得る。それには,まず,V84−M4およびV89−
RVのPCR産物の二次PCRをそれぞれ行い,1本鎖
DNAを合成する。これとは別に,以下の6種類のオリ
ゴヌクレオチドプライマーを常法により合成し,5’末
端を放射標識する。これらのプライマーはV8様遺伝子
のDNA配列(配列表1に示す)上の一部と同じであり
,その位置を図1,2および3に下線を施して示す。
12600株由来のV8様遺伝子の構造解析 V8様遺伝子のDNA配列の決定は,上記サブゲノムラ
イブラリーから得られたV84−M4およびV89−R
VのPCR産物を用い,直接シークエンス法により行わ
れ得る。それには,まず,V84−M4およびV89−
RVのPCR産物の二次PCRをそれぞれ行い,1本鎖
DNAを合成する。これとは別に,以下の6種類のオリ
ゴヌクレオチドプライマーを常法により合成し,5’末
端を放射標識する。これらのプライマーはV8様遺伝子
のDNA配列(配列表1に示す)上の一部と同じであり
,その位置を図1,2および3に下線を施して示す。
【0029】
V85 : 5’−GCTTCTGGTGTAGTTG
TAV812: 5’−ATATCAATTTCGCA
AATGV815: 5’−GGCGATAACAAT
AATTCAV810: 5’−GTTTATTTGT
TAAAAGV814: 5’−TGCATAATGA
CCATTCGTV86 : 5’−TGAACCTG
AGTTACCACC上記1本鎖DNAとそれぞれのプ
ライマーとを用い,ジデオキシ法により,V8様遺伝子
のDNA配列が得られる。このDNA配列を配列表1お
よび図1,2および3に示す。 配列表1および図1,2および3から,V8様遺伝子は
,翻訳開始コドンATGがコードするメチオニン(Me
t)を含む68残基のシグナルペプチド,および289
残基の成熟アミノ酸をコードすることがわかる。このシ
グナルペプチド68残基は,V8遺伝子のコードするア
ミノ酸配列のシグナルペプチドと同じ長さである。しか
し,成熟アミノ酸289残基は,V8遺伝子のコードす
る成熟アミノ酸に比べて21残基長い。これは,該成熟
アミノ酸のC末端のPro Asn(Asp) Asn
の繰り返しが,V8遺伝子がコードするアミノ酸配列
よりも7回多いことに起因する。この繰り返しのアミノ
酸配列を,V8遺伝子がコードするアミノ酸配列と比較
して,図4に示す。図4では,アミノ酸を1文字で表し
ており,DはAsp,HはHis,QはGln,PはP
ro,そしてNはAsnをそれぞれ表す。この成熟アミ
ノ酸の繰り返し部分は,V8遺伝子がコードするアミノ
酸配列の220位と221位との間に存在する。これ以
外に,塩基置換に伴うアミノ酸置換が6箇所あり,これ
は以下の表1のとおりである。表1では,塩基配列がV
8遺伝子と異なる部分に下線を施して示してある。
TAV812: 5’−ATATCAATTTCGCA
AATGV815: 5’−GGCGATAACAAT
AATTCAV810: 5’−GTTTATTTGT
TAAAAGV814: 5’−TGCATAATGA
CCATTCGTV86 : 5’−TGAACCTG
AGTTACCACC上記1本鎖DNAとそれぞれのプ
ライマーとを用い,ジデオキシ法により,V8様遺伝子
のDNA配列が得られる。このDNA配列を配列表1お
よび図1,2および3に示す。 配列表1および図1,2および3から,V8様遺伝子は
,翻訳開始コドンATGがコードするメチオニン(Me
t)を含む68残基のシグナルペプチド,および289
残基の成熟アミノ酸をコードすることがわかる。このシ
グナルペプチド68残基は,V8遺伝子のコードするア
ミノ酸配列のシグナルペプチドと同じ長さである。しか
し,成熟アミノ酸289残基は,V8遺伝子のコードす
る成熟アミノ酸に比べて21残基長い。これは,該成熟
アミノ酸のC末端のPro Asn(Asp) Asn
の繰り返しが,V8遺伝子がコードするアミノ酸配列
よりも7回多いことに起因する。この繰り返しのアミノ
酸配列を,V8遺伝子がコードするアミノ酸配列と比較
して,図4に示す。図4では,アミノ酸を1文字で表し
ており,DはAsp,HはHis,QはGln,PはP
ro,そしてNはAsnをそれぞれ表す。この成熟アミ
ノ酸の繰り返し部分は,V8遺伝子がコードするアミノ
酸配列の220位と221位との間に存在する。これ以
外に,塩基置換に伴うアミノ酸置換が6箇所あり,これ
は以下の表1のとおりである。表1では,塩基配列がV
8遺伝子と異なる部分に下線を施して示してある。
【0030】
【表1】
【0031】(II)発現ベクターの構築本発明のプロ
テアーゼをコードする上記DNA配列は,適当なベクタ
ーに組み込まれて,該プロテアーゼを発現させるための
発現ベクターとされる。
テアーゼをコードする上記DNA配列は,適当なベクタ
ーに組み込まれて,該プロテアーゼを発現させるための
発現ベクターとされる。
【0032】ここでは,枯草菌または酵母細胞に導入し
得る,次の発現ベクターを構築した:(ア)pHY30
0V8R,(イ)pHY300V8Rtt,(ウ)pH
Y300BAAMYV8tt,(エ)pHY300BA
AKPSV8tt,(オ)pHYUBV8R,pHYU
BV8L,(カ)pHY300CAHV8,および(キ
)pAM82SIGV8。
得る,次の発現ベクターを構築した:(ア)pHY30
0V8R,(イ)pHY300V8Rtt,(ウ)pH
Y300BAAMYV8tt,(エ)pHY300BA
AKPSV8tt,(オ)pHYUBV8R,pHYU
BV8L,(カ)pHY300CAHV8,および(キ
)pAM82SIGV8。
【0033】上記発現ベクターのうち(ア)〜(カ)は
枯草菌で発現可能であり,(キ)は酵母中で発現可能で
ある。 次に,発現ベクター(ア)〜(キ)の構築方法を説明す
る。
枯草菌で発現可能であり,(キ)は酵母中で発現可能で
ある。 次に,発現ベクター(ア)〜(キ)の構築方法を説明す
る。
【0034】(ア)発現ベクターpHY300V8Rの
構築本発明の発現ベクターの一例であるpHY300V
8Rは,図5に示すように,大腸菌および枯草菌のシャ
トルベクターであるpHY300PLK(宝酒造)に,
本発明のV8様プロテアーゼをコードするDNA断片(
プロモーター,シグナルペプチドをコードするDNA配
列,およびV8様プロテアーゼ成熟タンパクをコードす
る配列を含む)を組み込むことにより得られる。
構築本発明の発現ベクターの一例であるpHY300V
8Rは,図5に示すように,大腸菌および枯草菌のシャ
トルベクターであるpHY300PLK(宝酒造)に,
本発明のV8様プロテアーゼをコードするDNA断片(
プロモーター,シグナルペプチドをコードするDNA配
列,およびV8様プロテアーゼ成熟タンパクをコードす
る配列を含む)を組み込むことにより得られる。
【0035】上記工程を順に説明すると,まず,S.
aureusATCC12600株の培養細胞からM.
Stahlらの方法に従って,ゲノムDNAを単離し,
これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする。次に,セ
ンスプライマーとして,S. aureus ATCC
12600株由来のV8様プロテアーゼ遺伝子のプロモ
ーター上流の5’末端付近の配列に相当し,EcoRI
部位が付加された27ヌクレオチド長の一本鎖断片(セ
ンスプライマーA;配列表5に示す),そして,アンチ
センスプライマーとして,該遺伝子の3’末端付近(成
熟タンパクに相当するDNA配列よりも下流)の配列に
相補的であり,XbaI部位が付加された26ヌクレオ
チド長の一本鎖断片(アンチセンスプライマーB;配列
表6に示す)を化学合成し,これを用いてPCR反応を
行う。
aureusATCC12600株の培養細胞からM.
Stahlらの方法に従って,ゲノムDNAを単離し,
これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする。次に,セ
ンスプライマーとして,S. aureus ATCC
12600株由来のV8様プロテアーゼ遺伝子のプロモ
ーター上流の5’末端付近の配列に相当し,EcoRI
部位が付加された27ヌクレオチド長の一本鎖断片(セ
ンスプライマーA;配列表5に示す),そして,アンチ
センスプライマーとして,該遺伝子の3’末端付近(成
熟タンパクに相当するDNA配列よりも下流)の配列に
相補的であり,XbaI部位が付加された26ヌクレオ
チド長の一本鎖断片(アンチセンスプライマーB;配列
表6に示す)を化学合成し,これを用いてPCR反応を
行う。
【0036】
センスプライマーA:5’−GAGGAATTCTAA
TTGTTCTTCGAAACT−3’ アンチセンスプライマーB:5’−GAGTCTAGA
TATTTTGCGTTGTTAAG−3’ 得られたDNA断片を,EcoRIおよびXbaIで分
解し,図5に示す断片■を得る。次に,pHY300P
LKをEcoRIおよびXbaIで分解し,大きい方の
断片■を得る。これらの断片■および■を常法(Mol
ecular cloning:Cold Sprin
g Harbor Laboratory, NewY
ork, 1982)によりT4DNAリガーゼを用い
て連結することにより,発現ベクターpHY300V8
Rが得られる。
TTGTTCTTCGAAACT−3’ アンチセンスプライマーB:5’−GAGTCTAGA
TATTTTGCGTTGTTAAG−3’ 得られたDNA断片を,EcoRIおよびXbaIで分
解し,図5に示す断片■を得る。次に,pHY300P
LKをEcoRIおよびXbaIで分解し,大きい方の
断片■を得る。これらの断片■および■を常法(Mol
ecular cloning:Cold Sprin
g Harbor Laboratory, NewY
ork, 1982)によりT4DNAリガーゼを用い
て連結することにより,発現ベクターpHY300V8
Rが得られる。
【0037】このpHY300V8Rは,V8様プロテ
アーゼのプロモーターの支配下に,V8様プロテアーゼ
のシグナルペプチド(−68位のMetから−1位のA
sn)をコードするDNA配列,該プロテアーゼの成熟
タンパク(+1位のValから+289位のAla)を
コードするDNA配列,および該成熟タンパクをコード
するDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域を有す
る。
アーゼのプロモーターの支配下に,V8様プロテアーゼ
のシグナルペプチド(−68位のMetから−1位のA
sn)をコードするDNA配列,該プロテアーゼの成熟
タンパク(+1位のValから+289位のAla)を
コードするDNA配列,および該成熟タンパクをコード
するDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域を有す
る。
【0038】(イ)発現ベクターpHY300V8Rt
tの構築本発明の発現ベクターの一例であるpHY30
0V8Rttは,図6に示すように,上記(ア)項で得
られたpHY300V8Rに,さらにBacillus
subtilis ATCC 6051株由来のアル
カリ性プロテアーゼのターミネーターが付加された形態
を有する。この発現ベクターは,■上記アルカリ性プロ
テアーゼのターミネーターをコードする塩基配列を含む
断片,■V8様プロテアーゼのプロモーター,V8様プ
ロテアーゼのシグナルペプチドをコードする塩基配列,
およびV8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードする
塩基配列を含む断片,および■pHY300PLKベク
ターを用いて構築される。図6に示すように,(ア)項
で得られた発現ベクターpHY300V8Rを利用する
と簡便に構築がなされ得る。
tの構築本発明の発現ベクターの一例であるpHY30
0V8Rttは,図6に示すように,上記(ア)項で得
られたpHY300V8Rに,さらにBacillus
subtilis ATCC 6051株由来のアル
カリ性プロテアーゼのターミネーターが付加された形態
を有する。この発現ベクターは,■上記アルカリ性プロ
テアーゼのターミネーターをコードする塩基配列を含む
断片,■V8様プロテアーゼのプロモーター,V8様プ
ロテアーゼのシグナルペプチドをコードする塩基配列,
およびV8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードする
塩基配列を含む断片,および■pHY300PLKベク
ターを用いて構築される。図6に示すように,(ア)項
で得られた発現ベクターpHY300V8Rを利用する
と簡便に構築がなされ得る。
【0039】この発現ベクターの構築を順に説明すると
,まず,Bacillus subtilis ATC
C 6051株の培養細胞からM. Stahlら(前
出)の方法に従って,ゲノムDNAを単離し,これをP
CR反応に用いる鋳型DNAとする。次に,センスプラ
イマーとして,B. subtilis I 168株
由来のアルカリ性プロテアーゼ(MARK L. ST
AHLら,Journal of Bacteriol
ogy,1984,vol.158,No2,pp41
1−418)のC末端付近に相当するDNA配列(ター
ミネーターの5’側に存在)を含み,XbaI部位が付
加された27ヌクレオチド長の一本鎖断片(センスプラ
イマーC:配列表7に示す),そして,アンチセンスプ
ライマーとして,該プロテアーゼの3’非翻訳領域の一
部(ターミネーターの3’側に存在)に相補的であり
HindIII部位が付加された26ヌクレオチド長
の一本鎖断片(アンチセンスプライマーD;配列表8に
示す)を化学合成し,これを用いてPCR反応を行う。
,まず,Bacillus subtilis ATC
C 6051株の培養細胞からM. Stahlら(前
出)の方法に従って,ゲノムDNAを単離し,これをP
CR反応に用いる鋳型DNAとする。次に,センスプラ
イマーとして,B. subtilis I 168株
由来のアルカリ性プロテアーゼ(MARK L. ST
AHLら,Journal of Bacteriol
ogy,1984,vol.158,No2,pp41
1−418)のC末端付近に相当するDNA配列(ター
ミネーターの5’側に存在)を含み,XbaI部位が付
加された27ヌクレオチド長の一本鎖断片(センスプラ
イマーC:配列表7に示す),そして,アンチセンスプ
ライマーとして,該プロテアーゼの3’非翻訳領域の一
部(ターミネーターの3’側に存在)に相補的であり
HindIII部位が付加された26ヌクレオチド長
の一本鎖断片(アンチセンスプライマーD;配列表8に
示す)を化学合成し,これを用いてPCR反応を行う。
【0040】
センスプライマーC:5’−GAGTCTAGAGCA
GCTGCACAATAATAG−3’ アンチセンスプライマーD:5’−GAGAAGCTT
GACAGAGAACAGAGAAG−3’ 得られたDNA断片をXbaI及びHindIIIで分
解し,図6に示す断片■を得る。次に,(ア)項で得ら
れたpHY300VR8をEcoRIとXbaIとで分
解して小さい方の断片■を得る。この断片は上記(ア)
項のpHY300VR8を構築するときに用いられたD
NA断片■と同一であり,(ア)項に示されたPCR法
によっても得られる。この断片は,V8様プロテアーゼ
のシグナルペプチドをコードするDNA配列,該プロテ
アーゼの成熟タンパクをコードするDNA配列,および
該プロテアーゼのターミネーターをコードするDNA配
列を有する。次に,(ア)項で得られた発現ベクターp
HY300V8RをEcoRIとHindIIIとで分
解して,大きい方の断片■を得る。上記断片■および■
は,pHY300V8RをEcoRI,HindIII
およびXbaIで分解して,最も大きい断片(断片■)
,および次に大きい断片(断片■)を単離することによ
っても得られる。これらのDNA断片■,■,および■
を常法(Molecular cloning:Col
d SpringHarbor Laboratory
, New York 1982)によりT4 DNA
リガーゼを用いて連結することにより,発現ベクターp
HY300V8Rttが得られる。
GCTGCACAATAATAG−3’ アンチセンスプライマーD:5’−GAGAAGCTT
GACAGAGAACAGAGAAG−3’ 得られたDNA断片をXbaI及びHindIIIで分
解し,図6に示す断片■を得る。次に,(ア)項で得ら
れたpHY300VR8をEcoRIとXbaIとで分
解して小さい方の断片■を得る。この断片は上記(ア)
項のpHY300VR8を構築するときに用いられたD
NA断片■と同一であり,(ア)項に示されたPCR法
によっても得られる。この断片は,V8様プロテアーゼ
のシグナルペプチドをコードするDNA配列,該プロテ
アーゼの成熟タンパクをコードするDNA配列,および
該プロテアーゼのターミネーターをコードするDNA配
列を有する。次に,(ア)項で得られた発現ベクターp
HY300V8RをEcoRIとHindIIIとで分
解して,大きい方の断片■を得る。上記断片■および■
は,pHY300V8RをEcoRI,HindIII
およびXbaIで分解して,最も大きい断片(断片■)
,および次に大きい断片(断片■)を単離することによ
っても得られる。これらのDNA断片■,■,および■
を常法(Molecular cloning:Col
d SpringHarbor Laboratory
, New York 1982)によりT4 DNA
リガーゼを用いて連結することにより,発現ベクターp
HY300V8Rttが得られる。
【0041】このpHY300V8RttはV8様プロ
テアーゼのプロモーターの支配下に,V8様プロテアー
ゼのシグナルペプチド(−68位のMetから−1位の
Asn)をコードするDNA配列,該プロテアーゼを成
熟タンパク(+1位のValから+289位のAla)
をコードするDNA配列,および該成熟タンパクをコー
ドするDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域を有
し,さらに,その下流にBacillus subti
lis ATCC 6051株由来のアルカリ性プロテ
アーゼのターミネーターを有する。
テアーゼのプロモーターの支配下に,V8様プロテアー
ゼのシグナルペプチド(−68位のMetから−1位の
Asn)をコードするDNA配列,該プロテアーゼを成
熟タンパク(+1位のValから+289位のAla)
をコードするDNA配列,および該成熟タンパクをコー
ドするDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域を有
し,さらに,その下流にBacillus subti
lis ATCC 6051株由来のアルカリ性プロテ
アーゼのターミネーターを有する。
【0042】(ウ)発現ベクターpHY300BAAM
YV8ttの構築本発明の発現ベクターの一例であるp
HY300BAAMY8ttは,図7に示すように,■
V8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードする塩基配
列を含むDNA断片,■Bacillus amylo
liquefaciens E−18株由来のα−アミ
ラーゼのプロモーターおよびシグナルペプチドをコード
するDNA断片,および■Bacillus subt
ilis ATCC 6051株由来のアルカリ性プロ
テアーゼのターミネーターを含むpHY300PLK由
来のベクターを用いて構築される。
YV8ttの構築本発明の発現ベクターの一例であるp
HY300BAAMY8ttは,図7に示すように,■
V8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードする塩基配
列を含むDNA断片,■Bacillus amylo
liquefaciens E−18株由来のα−アミ
ラーゼのプロモーターおよびシグナルペプチドをコード
するDNA断片,および■Bacillus subt
ilis ATCC 6051株由来のアルカリ性プロ
テアーゼのターミネーターを含むpHY300PLK由
来のベクターを用いて構築される。
【0043】この発現ベクターを構築するには,まず,
S. aureus ATCC12600株の培養細胞
からM. Stahlらの方法に従って,ゲノムDNA
を単離し,これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする
。次に,センスプライマーとして,V8様プロテアーゼ
の+1位のValから+7位のAspにわたるペプチド
に相当するDNA配列にpmaCI部位が付加された2
7ヌクレオチド長の一本鎖断片(センスプライマーE;
配列表9に示す),および,アンチセンスプライマーと
して,上記(ア)項で使用したのと同様のアンチセンス
プライマーBを化学合成し,これらを用いてPCR反応
を行う。
S. aureus ATCC12600株の培養細胞
からM. Stahlらの方法に従って,ゲノムDNA
を単離し,これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする
。次に,センスプライマーとして,V8様プロテアーゼ
の+1位のValから+7位のAspにわたるペプチド
に相当するDNA配列にpmaCI部位が付加された2
7ヌクレオチド長の一本鎖断片(センスプライマーE;
配列表9に示す),および,アンチセンスプライマーと
して,上記(ア)項で使用したのと同様のアンチセンス
プライマーBを化学合成し,これらを用いてPCR反応
を行う。
【0044】センスプライマーE:5’−GAGCAC
GTGATATTACCAAATAACGAT−3’ 得られたDNA断片をpmaCIおよびXbaIで分解
し,図7に示す断片■を得る。次に,Bacillus
amyloliquefaciens 8380株の
培養細胞から,M. Stahlら(前出)の方法に従
ってゲノムDNAを単離し,該DNAをPCR法(前出
)に用いる鋳型DNAとする。センスプライマーとして
,Bacillus amyloliquefacie
ns E−18株由来のα−アミラーゼ遺伝子(Iik
ka Palvaら,Gene,1981,15,pp
43−51)の5’末端付近のDNA配列に相当し,E
coRI部位が付加された24ヌクレオチド長の一本鎖
断片(センスプライマーF;配列表10に示す),およ
びアンチセンスプライマーとして,該α−アミラーゼの
−6位のIleから−1位のAlaまでのペプチドをコ
ードするDNA配列に相補的であり,NaeI部位が付
加された24ヌクレオチド長の一本鎖断片(アンチセン
スプライマーG;配列表11に示す)を化学合成し,こ
れらを用いてPCR反応を行う。
GTGATATTACCAAATAACGAT−3’ 得られたDNA断片をpmaCIおよびXbaIで分解
し,図7に示す断片■を得る。次に,Bacillus
amyloliquefaciens 8380株の
培養細胞から,M. Stahlら(前出)の方法に従
ってゲノムDNAを単離し,該DNAをPCR法(前出
)に用いる鋳型DNAとする。センスプライマーとして
,Bacillus amyloliquefacie
ns E−18株由来のα−アミラーゼ遺伝子(Iik
ka Palvaら,Gene,1981,15,pp
43−51)の5’末端付近のDNA配列に相当し,E
coRI部位が付加された24ヌクレオチド長の一本鎖
断片(センスプライマーF;配列表10に示す),およ
びアンチセンスプライマーとして,該α−アミラーゼの
−6位のIleから−1位のAlaまでのペプチドをコ
ードするDNA配列に相補的であり,NaeI部位が付
加された24ヌクレオチド長の一本鎖断片(アンチセン
スプライマーG;配列表11に示す)を化学合成し,こ
れらを用いてPCR反応を行う。
【0045】センスプライマーF:5’−CGCGAA
TTCGCCCCGCACATACGA−3’ アンチセンスプライマーG:5’−CGCGCCGGC
TGATGTTTTTGTAAT−3’ 得られたDNA断片をEcoRIとNaeIとで分解す
ることにより,α−アミラーゼのプロモーターおよび該
α−アミラーゼのシグナルペプチドをコードするDNA
配列を有する断片■が得られる。次に(イ)項で得られ
た発現ベクターpHY300V8RttをEcoRIお
よびXbaIで分解し,大きい方の断片■を得る。これ
ら■,■および■の断片を常法(前出)によりT4 D
NAリガーゼを用いて連結することにより,図7に示す
ように,発現ベクターpHY300BAAMYV8tt
が得られる。
TTCGCCCCGCACATACGA−3’ アンチセンスプライマーG:5’−CGCGCCGGC
TGATGTTTTTGTAAT−3’ 得られたDNA断片をEcoRIとNaeIとで分解す
ることにより,α−アミラーゼのプロモーターおよび該
α−アミラーゼのシグナルペプチドをコードするDNA
配列を有する断片■が得られる。次に(イ)項で得られ
た発現ベクターpHY300V8RttをEcoRIお
よびXbaIで分解し,大きい方の断片■を得る。これ
ら■,■および■の断片を常法(前出)によりT4 D
NAリガーゼを用いて連結することにより,図7に示す
ように,発現ベクターpHY300BAAMYV8tt
が得られる。
【0046】このpHY300BAAMYV8ttは,
Bacilus amyloliquefaciens
8380株由来のα−アミラーゼのプロモーターの支
配下に,α−アミラーゼのシグナルペプチド(−31位
のMetから−1位のAla)をコードするDNA配列
,V8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードするDN
A配列,および該成熟タンパクをコードするDNA配列
の下流に存在する3’非翻訳領域を有し,さらにその下
流にBacillus subtilis ATCC
6051株由来のアルカリ性プロテアーゼのターミネー
ターを有する。
Bacilus amyloliquefaciens
8380株由来のα−アミラーゼのプロモーターの支
配下に,α−アミラーゼのシグナルペプチド(−31位
のMetから−1位のAla)をコードするDNA配列
,V8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードするDN
A配列,および該成熟タンパクをコードするDNA配列
の下流に存在する3’非翻訳領域を有し,さらにその下
流にBacillus subtilis ATCC
6051株由来のアルカリ性プロテアーゼのターミネー
ターを有する。
【0047】(エ)発現ベクターpHY300BAAK
PSV8ttの構築本発明の発現ベクターの一例である
pHY300BAAKPSV8ttは,図8に示すよう
に,■V8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードする
塩基配列を含むDNA断片,■Bacillus am
yloliquefaciens由来のアルカリ性プロ
テアーゼのプロモーターおよびシグナルペプチドをコー
ドする塩基配列を含むDNA断片,および■Bacil
lus sabtilis由来のアルカリ性プロテアー
ゼのターミネーターをコードする塩基配列を含むpHY
300PLK由来のベクター断片を用いて構築される。
PSV8ttの構築本発明の発現ベクターの一例である
pHY300BAAKPSV8ttは,図8に示すよう
に,■V8様プロテアーゼの成熟タンパクをコードする
塩基配列を含むDNA断片,■Bacillus am
yloliquefaciens由来のアルカリ性プロ
テアーゼのプロモーターおよびシグナルペプチドをコー
ドする塩基配列を含むDNA断片,および■Bacil
lus sabtilis由来のアルカリ性プロテアー
ゼのターミネーターをコードする塩基配列を含むpHY
300PLK由来のベクター断片を用いて構築される。
【0048】この発現ベクターを構築するには,まず,
上記(ウ)項で行ったのと同様の方法によりS. au
reus ATCC 12600株のゲノムDNAと,
センスプライマーEとアンチセンスプライマーBとから
PCR法により,V8様プロテアーゼの成熟タンパクを
コードする塩基配列を含むDNA断片■を調製する。次
いで,Bacillus amyloliquefac
iens 8380株の培養細胞から,M. Stah
lら(前出)の方法に従ってゲノムDNAを単離し,該
DNAをPCR法(前出)に用いる鋳型DNAとする。 センスプライマーとして,Bacillus amyl
oliquefaciens ATCC 23844株
由来のアルカリ性プロテアーゼ遺伝子(N.VASAN
THAら,Jouranal of Bacterio
logy,1984,vol.159,No3,pp8
11−819)のN末端付近のDNA配列(プロモータ
ーから上流側に位置する)を含み,EcoRI部位が付
加された25ヌクレオチド長の断片(センスプライマー
H;配列表12に示す),および該プロテアーゼの−5
位のHisから−1位のTyrまでのペプチドをコード
するDNA配列に相補的であり,SnaBI部位が付加
された24ヌクレオチド長の断片(アンチセンスプライ
マーI;配列表13に示す)を化学合成し,これらを用
いてPCR反応を行う。
上記(ウ)項で行ったのと同様の方法によりS. au
reus ATCC 12600株のゲノムDNAと,
センスプライマーEとアンチセンスプライマーBとから
PCR法により,V8様プロテアーゼの成熟タンパクを
コードする塩基配列を含むDNA断片■を調製する。次
いで,Bacillus amyloliquefac
iens 8380株の培養細胞から,M. Stah
lら(前出)の方法に従ってゲノムDNAを単離し,該
DNAをPCR法(前出)に用いる鋳型DNAとする。 センスプライマーとして,Bacillus amyl
oliquefaciens ATCC 23844株
由来のアルカリ性プロテアーゼ遺伝子(N.VASAN
THAら,Jouranal of Bacterio
logy,1984,vol.159,No3,pp8
11−819)のN末端付近のDNA配列(プロモータ
ーから上流側に位置する)を含み,EcoRI部位が付
加された25ヌクレオチド長の断片(センスプライマー
H;配列表12に示す),および該プロテアーゼの−5
位のHisから−1位のTyrまでのペプチドをコード
するDNA配列に相補的であり,SnaBI部位が付加
された24ヌクレオチド長の断片(アンチセンスプライ
マーI;配列表13に示す)を化学合成し,これらを用
いてPCR反応を行う。
【0049】
センスプライマーH:5’−CGCGAATTCTCC
GCAATTATATCAT−3’アンチセンスプライ
マーI:5’−CGCTACGTACGCATGTGC
TACGTG−3’ 得られたDNA断片をEcoRIとSnaBIとで分解
することにより,Bacillus amyloliq
uefaciens由来のアルカリ性プロテアーゼのプ
ロモーター,および該プロテアーゼのシグナルペプチド
をコードする塩基配列を有するDNA配列■が得られる
。次に(イ)項で得られた発現ベクターpHY300V
8Rttを上記(ウ)項における方法と同様の方法で処
理して,(ウ)項と同様にアルカリ性プロテアーゼのタ
ーミネーターを有するベクター断片■を得る。これら■
〜■の断片を,常法(前出)によりT4 DNAリガー
ゼを用いて連結することにより,図8に示すように,発
現ベクターpHY300BAAKPSV8ttが得られ
る。
GCAATTATATCAT−3’アンチセンスプライ
マーI:5’−CGCTACGTACGCATGTGC
TACGTG−3’ 得られたDNA断片をEcoRIとSnaBIとで分解
することにより,Bacillus amyloliq
uefaciens由来のアルカリ性プロテアーゼのプ
ロモーター,および該プロテアーゼのシグナルペプチド
をコードする塩基配列を有するDNA配列■が得られる
。次に(イ)項で得られた発現ベクターpHY300V
8Rttを上記(ウ)項における方法と同様の方法で処
理して,(ウ)項と同様にアルカリ性プロテアーゼのタ
ーミネーターを有するベクター断片■を得る。これら■
〜■の断片を,常法(前出)によりT4 DNAリガー
ゼを用いて連結することにより,図8に示すように,発
現ベクターpHY300BAAKPSV8ttが得られ
る。
【0050】このpHY300BAAKPSV8ttは
,Bacillus amyloliquefacie
ns 8380株由来のアルカリ性プロテアーゼのプロ
モーター支配下に,該アルカリ性プロテアーゼのシグナ
ルペプチド(−107位のfMetから−1位のTyr
)をコードするDNA配列,S aureus ATC
C 12600株由来のV8様プロテアーゼの成熟タン
パクをコードするDNA配列,および該成熟タンパクを
コードするDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域
を有し,さらに,その下流にBacillus sub
tilis ATCC 6051株由来のアルカリ性プ
ロテアーゼのターミネーターを有する。
,Bacillus amyloliquefacie
ns 8380株由来のアルカリ性プロテアーゼのプロ
モーター支配下に,該アルカリ性プロテアーゼのシグナ
ルペプチド(−107位のfMetから−1位のTyr
)をコードするDNA配列,S aureus ATC
C 12600株由来のV8様プロテアーゼの成熟タン
パクをコードするDNA配列,および該成熟タンパクを
コードするDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域
を有し,さらに,その下流にBacillus sub
tilis ATCC 6051株由来のアルカリ性プ
ロテアーゼのターミネーターを有する。
【0051】(オ)発現ベクターpHYUBV8Rおよ
びpHYUBV8Lこれらの発現ベクターは,図10に
示すように,■V8様プロテアーゼのプロモーター,該
プロテアーゼのシグナルペプチドをコードするDNA配
列,及び該プロテアーゼの成熟タンパクをコードするD
NA配列を含むDNA断片,およびpHY300PLK
由来のベクターpHYUBを用いて構築される。
びpHYUBV8Lこれらの発現ベクターは,図10に
示すように,■V8様プロテアーゼのプロモーター,該
プロテアーゼのシグナルペプチドをコードするDNA配
列,及び該プロテアーゼの成熟タンパクをコードするD
NA配列を含むDNA断片,およびpHY300PLK
由来のベクターpHYUBを用いて構築される。
【0052】この発現ベクターを構築するには,まず,
S. aureus ATCC12600株の培養細胞
からM. Stahlらの方法に従って,ゲノムDNA
を単離し,これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする
。次に,センスプライマーとして,S. aureus
ATCC 12600株由来のV8様プロテアーゼ遺伝
子の5’末端付近に相当し(プロモーター上流に存在す
る),HindIII部位が付加された27ヌクレオチ
ド長の断片(センスプライマーJ;配列表14に示す)
,そして,アンチセンスプライマーとして,該遺伝子の
3’末端付近(成熟タンパクに相当するDNA配列より
も下流に存在)に相補的であり,HindIII部位が
付加された28ヌクレオチド長の断片(アンチセンスプ
ライマーK;配列表15に示す)を化学合成し,これを
用いてPCR反応を行う。
S. aureus ATCC12600株の培養細胞
からM. Stahlらの方法に従って,ゲノムDNA
を単離し,これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする
。次に,センスプライマーとして,S. aureus
ATCC 12600株由来のV8様プロテアーゼ遺伝
子の5’末端付近に相当し(プロモーター上流に存在す
る),HindIII部位が付加された27ヌクレオチ
ド長の断片(センスプライマーJ;配列表14に示す)
,そして,アンチセンスプライマーとして,該遺伝子の
3’末端付近(成熟タンパクに相当するDNA配列より
も下流に存在)に相補的であり,HindIII部位が
付加された28ヌクレオチド長の断片(アンチセンスプ
ライマーK;配列表15に示す)を化学合成し,これを
用いてPCR反応を行う。
【0053】センスプライマーJ;5’−GAGAAG
CTTTAATTGTTCTTCGAAACT−3’ アンチセンスプライマーK;5’−GAGAAGCTT
TATAATACCCTCCATTTAA−3’ 得られたDNA断片をHindIIIで分解することに
より,S. aureus ATCC 12600株由
来のV8様プロテアーゼのプロモーター,シグナルペプ
チドをコードするDNA配列,および成熟タンパクをコ
ードするDNA断片■が得られる(図10)。
CTTTAATTGTTCTTCGAAACT−3’ アンチセンスプライマーK;5’−GAGAAGCTT
TATAATACCCTCCATTTAA−3’ 得られたDNA断片をHindIIIで分解することに
より,S. aureus ATCC 12600株由
来のV8様プロテアーゼのプロモーター,シグナルペプ
チドをコードするDNA配列,および成熟タンパクをコ
ードするDNA断片■が得られる(図10)。
【0054】次に,大腸菌および枯草菌のシャトルベク
ターであるpHY300PLK(宝酒造)を,NcoI
切断し,クレノーフラグメントで処理し切断面を平滑化
する。これをEcoRIで切断し,得られた断片のうち
大きい方の断片■を得る。この断片■は,大腸菌におけ
るレプリケーションオリジンおよびアンピシリン耐性遺
伝子を有する(図9)。次に,枯草菌のプラスミドpu
B110(Plasmid, 15, 93−10,
1986)をEcoRIおよびPvuIIで分解し,大
きい方の断片■を得る。この断片■は,枯草菌における
レプリケーションオリジンおよびカナマイシン耐性遺伝
子を有する(図9)。これらの断片■および■を常法(
前出)により,T4 DNAリガーゼを用いて連結する
ことにより,大腸菌および枯草菌のシャトルベクターで
あるpHYUBが得られる。次にこのpHYUBを図1
0に示すように,HindIIIで切断し,BAPで処
理することにより,DNA断片■が得られる。
ターであるpHY300PLK(宝酒造)を,NcoI
切断し,クレノーフラグメントで処理し切断面を平滑化
する。これをEcoRIで切断し,得られた断片のうち
大きい方の断片■を得る。この断片■は,大腸菌におけ
るレプリケーションオリジンおよびアンピシリン耐性遺
伝子を有する(図9)。次に,枯草菌のプラスミドpu
B110(Plasmid, 15, 93−10,
1986)をEcoRIおよびPvuIIで分解し,大
きい方の断片■を得る。この断片■は,枯草菌における
レプリケーションオリジンおよびカナマイシン耐性遺伝
子を有する(図9)。これらの断片■および■を常法(
前出)により,T4 DNAリガーゼを用いて連結する
ことにより,大腸菌および枯草菌のシャトルベクターで
あるpHYUBが得られる。次にこのpHYUBを図1
0に示すように,HindIIIで切断し,BAPで処
理することにより,DNA断片■が得られる。
【0055】上記DNA断片■および■を常法(前出)
によりT4 DNAリガーゼを用いて連結することによ
り,発現ベクターpHYUBV8RおよびpHYUBV
8Lが得られる。これらの発現ベクターは,V8様プロ
テアーゼのプロモーターの支配下に,V8様プロテアー
ゼのシグナルペプチド(−68位のMetから−1位の
Asn)をコードするDNA配列,該プロテアーゼの成
熟タンパク(+1位のValから+289位のAla)
をコードするDNA配列,および該成熟タンパクをコー
ドするDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域を有
する。これらの発現ベクターは,大腸菌内でのレプリケ
ーションオリジン,アンピシリン耐性遺伝子,枯草菌内
でのレプリケーションオリジン,およびカナマイシン耐
性遺伝子を有する。そして,pHYUBV8Rにおいて
は,これらの遺伝子に対して同一方向でV8様プロテア
ーゼ遺伝子が転写され,pHYUBV8Lにおいては,
これらの遺伝子に対して逆方向でV8様プロテアーゼ遺
伝子が転写される。
によりT4 DNAリガーゼを用いて連結することによ
り,発現ベクターpHYUBV8RおよびpHYUBV
8Lが得られる。これらの発現ベクターは,V8様プロ
テアーゼのプロモーターの支配下に,V8様プロテアー
ゼのシグナルペプチド(−68位のMetから−1位の
Asn)をコードするDNA配列,該プロテアーゼの成
熟タンパク(+1位のValから+289位のAla)
をコードするDNA配列,および該成熟タンパクをコー
ドするDNA配列の下流に存在する3’非翻訳領域を有
する。これらの発現ベクターは,大腸菌内でのレプリケ
ーションオリジン,アンピシリン耐性遺伝子,枯草菌内
でのレプリケーションオリジン,およびカナマイシン耐
性遺伝子を有する。そして,pHYUBV8Rにおいて
は,これらの遺伝子に対して同一方向でV8様プロテア
ーゼ遺伝子が転写され,pHYUBV8Lにおいては,
これらの遺伝子に対して逆方向でV8様プロテアーゼ遺
伝子が転写される。
【0056】(カ)発現ベクターpHY300CAHV
8の構築本発明の発現ベクターの一例であるpHY30
0CAHV8は,図12に示すように,■V8様プロテ
アーゼのシグナルペプチドおよび成熟タンパクをコード
する塩基配列を有するDNA断片,■セファロスポリン
アチルハイドロラーゼ(CAH)のプロモーターをコー
ドする塩基配列を有するDNA断片,および■pHY3
00PLK由来のベクターを用いて構築される。
8の構築本発明の発現ベクターの一例であるpHY30
0CAHV8は,図12に示すように,■V8様プロテ
アーゼのシグナルペプチドおよび成熟タンパクをコード
する塩基配列を有するDNA断片,■セファロスポリン
アチルハイドロラーゼ(CAH)のプロモーターをコー
ドする塩基配列を有するDNA断片,および■pHY3
00PLK由来のベクターを用いて構築される。
【0057】この発現ベクターを構築するには,まず,
S. aureus ATCC12600株の培養細胞
からM. Stahlらの方法に従って,ゲノムDNA
を単離し,これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする
。次に,センスプライマーとして,S. aureus
ATCC 12600株由来のV8様プロテアーゼのシ
グナルペプチドのN末端付近に相当するDNA配列を含
み,SacI部位が付加された26ヌクレオチド長の一
本鎖断片(センスプライマーL;配列表16に示す)を
,そして,アンチセンスプライマーとして,(ア)項で
調製したのと同様にアンチセンスプライマーBを化学合
成し,これらを用いてPCR反応を行った。
S. aureus ATCC12600株の培養細胞
からM. Stahlらの方法に従って,ゲノムDNA
を単離し,これをPCR反応に用いる鋳型DNAとする
。次に,センスプライマーとして,S. aureus
ATCC 12600株由来のV8様プロテアーゼのシ
グナルペプチドのN末端付近に相当するDNA配列を含
み,SacI部位が付加された26ヌクレオチド長の一
本鎖断片(センスプライマーL;配列表16に示す)を
,そして,アンチセンスプライマーとして,(ア)項で
調製したのと同様にアンチセンスプライマーBを化学合
成し,これらを用いてPCR反応を行った。
【0058】センスプライマーL:5’−CGAGAG
CTCTAAAGGTAAATTTTTAA−3’ 得られたDNA断片をSacIおよびXbaIで分解す
ることにより,V8様プロテアーゼのシグナルペプチド
と成熟タンパクとをコードする塩基配列を有するDNA
断片■が得られる。
CTCTAAAGGTAAATTTTTAA−3’ 得られたDNA断片をSacIおよびXbaIで分解す
ることにより,V8様プロテアーゼのシグナルペプチド
と成熟タンパクとをコードする塩基配列を有するDNA
断片■が得られる。
【0059】次いで,CAH遺伝子およびそのプロモー
ターを有するプラスミドpCAH10から,次のように
して,該プロモーターを有する断片を得る。このプラス
ミドpCAH10は,図11に示すように,pCAH0
3をEcoRVおよびBamHIで分解し,4.1kb
の断片を得,クレノー断片で処理後,T4 DNAリガ
ーゼで処理し,再環化することにより得られる(特願平
2−113483号)。このpCAH10をPCR反応
の鋳型とする。センスプライマーとしてCAH遺伝子(
特願平2−113483号)の5’末端領域に相当し,
EcoRI部位が付加された27ヌクレオチド長の一本
鎖断片(センスプライマーM;配列表17に示す),お
よびアンチセンプライマーとして,該遺伝子の開始コド
ン付近の領域のDNA配列に相補的であり,SacI部
位が付加された26ヌクレオチド長の一本鎖断片(アン
チセンスプライマーN;配列表18に示す)を化学合成
し,これらを用いてPCR反応を行う。
ターを有するプラスミドpCAH10から,次のように
して,該プロモーターを有する断片を得る。このプラス
ミドpCAH10は,図11に示すように,pCAH0
3をEcoRVおよびBamHIで分解し,4.1kb
の断片を得,クレノー断片で処理後,T4 DNAリガ
ーゼで処理し,再環化することにより得られる(特願平
2−113483号)。このpCAH10をPCR反応
の鋳型とする。センスプライマーとしてCAH遺伝子(
特願平2−113483号)の5’末端領域に相当し,
EcoRI部位が付加された27ヌクレオチド長の一本
鎖断片(センスプライマーM;配列表17に示す),お
よびアンチセンプライマーとして,該遺伝子の開始コド
ン付近の領域のDNA配列に相補的であり,SacI部
位が付加された26ヌクレオチド長の一本鎖断片(アン
チセンスプライマーN;配列表18に示す)を化学合成
し,これらを用いてPCR反応を行う。
【0060】センスプライマーM:5’−GAGGAA
TTCAAAGAACCGCTATGTCAG−3’ アンチセンスプライマーN:5’−GAGGAGCTC
ATTTCCGATTATTCCCC−3’ 得られたDNA断片をEcoRIおよびSacIで分解
することによりCAHのプロモーターを有するDNA断
片■が得られる。次いで,(オ)項で得られた発現ベク
ターpHY300V8RをEcoRIとXbaIとで分
解して,大きい方のDNA断片■を得る。pHY300
V8Rを用いる代わりに,pHY300PLKを利用す
ることも可能である。
TTCAAAGAACCGCTATGTCAG−3’ アンチセンスプライマーN:5’−GAGGAGCTC
ATTTCCGATTATTCCCC−3’ 得られたDNA断片をEcoRIおよびSacIで分解
することによりCAHのプロモーターを有するDNA断
片■が得られる。次いで,(オ)項で得られた発現ベク
ターpHY300V8RをEcoRIとXbaIとで分
解して,大きい方のDNA断片■を得る。pHY300
V8Rを用いる代わりに,pHY300PLKを利用す
ることも可能である。
【0061】上記断片■,■および■を常法によりT4
DNAリガーゼで連結することにより,発現ベクター
pHY300CAHV8が得られる(図12)。この発
現ベクターは,CAHのプロモーターの支配下に,V8
様プロテアーゼのシグナルペプチドをコードするDNA
配列,該プロテアーゼの成熟タンパクをコードするDN
A配列,および該成熟タンパクをコードするDNA配列
の下流に存在する3’非翻訳領域を有する。但し,上記
シグナルペプチドをコードするDNA配列においては,
−68位のMetをコードするATGと−67位のLy
sをコードするAAAとの間にAGCTCT(SerS
er)の配列が挿入されている。
DNAリガーゼで連結することにより,発現ベクター
pHY300CAHV8が得られる(図12)。この発
現ベクターは,CAHのプロモーターの支配下に,V8
様プロテアーゼのシグナルペプチドをコードするDNA
配列,該プロテアーゼの成熟タンパクをコードするDN
A配列,および該成熟タンパクをコードするDNA配列
の下流に存在する3’非翻訳領域を有する。但し,上記
シグナルペプチドをコードするDNA配列においては,
−68位のMetをコードするATGと−67位のLy
sをコードするAAAとの間にAGCTCT(SerS
er)の配列が挿入されている。
【0062】セファロスポリンアセチルハイドロラーゼ
のプロモーターと,V8様プロテアーゼのシグナルペプ
チドのN末端付近に対応するDNA配列を図12下部に
示す。
のプロモーターと,V8様プロテアーゼのシグナルペプ
チドのN末端付近に対応するDNA配列を図12下部に
示す。
【0063】(キ)発現ベクターpAM82SIGV8
の構築本発明の発現ベクターの一例であるpAM82S
IGV8は,図16に示すように,■ラット膵臓ホスホ
リパーゼA2のシグナルペプチドおよびV8様プロテア
ーゼをコードする塩基配列をコードするDNA配列を含
む断片,および■pAM8Lベクターを用いて構築され
る。
の構築本発明の発現ベクターの一例であるpAM82S
IGV8は,図16に示すように,■ラット膵臓ホスホ
リパーゼA2のシグナルペプチドおよびV8様プロテア
ーゼをコードする塩基配列をコードするDNA配列を含
む断片,および■pAM8Lベクターを用いて構築され
る。
【0064】上記DNA断片■は,プラスミドpGEM
4SIGV8から得られる。このpGEM4SIGV8
の調製法を次に説明する。まず,プラスミドpGEM4
(プロメガ社)をSacIで切断し,クレノー処理によ
り切断面を平滑化する。これに,5’−CCTCGAG
G−3’でなる8merの2本鎖のXhoIリンカーを
,T4 DNAリガーゼを用いて連結し,XhoI切断
部位を有するプラスミドpGEM4(XhoI)を得る
。このプラスミドを,図14に示すように,XhoIお
よびSmaIで分解し,大きい方の断片■を得る。これ
とは別に,ラットの膵臓からモレキュラークローニング
(Cold Spring Harber Labor
atory, New York, 1982)の方法
に従ってm−RNAを調製し,次いでc−DNAを調製
する。このc−DNAをPCR法に用いる鋳型DNAと
する。PCR反応のセンスプラマーとして,ラット膵臓
ホスホリパーゼA2遺伝子(小原ら,J. Bioch
em 99, 733−739(1986))の5’末
端付近の塩基配列(18〜35位;シグナルペプチドの
N末端部に相当する)に相当し,XhoI部位が付加さ
れた27ヌクレオチド長の一本鎖断片(センスプライマ
ーO;配列表19に示す),およびアンチセンスプライ
マーとして該遺伝子の75〜100位の塩基配列(シグ
ナルペプチドのC末端部に相当する)に相補的でありS
tuI部位が付加された26ヌクレオチド長の一本鎖断
片(アンチセンスプライマーP;配列表20に示す)を
化学合成し,これらを用いてPCR反応を行う。
4SIGV8から得られる。このpGEM4SIGV8
の調製法を次に説明する。まず,プラスミドpGEM4
(プロメガ社)をSacIで切断し,クレノー処理によ
り切断面を平滑化する。これに,5’−CCTCGAG
G−3’でなる8merの2本鎖のXhoIリンカーを
,T4 DNAリガーゼを用いて連結し,XhoI切断
部位を有するプラスミドpGEM4(XhoI)を得る
。このプラスミドを,図14に示すように,XhoIお
よびSmaIで分解し,大きい方の断片■を得る。これ
とは別に,ラットの膵臓からモレキュラークローニング
(Cold Spring Harber Labor
atory, New York, 1982)の方法
に従ってm−RNAを調製し,次いでc−DNAを調製
する。このc−DNAをPCR法に用いる鋳型DNAと
する。PCR反応のセンスプラマーとして,ラット膵臓
ホスホリパーゼA2遺伝子(小原ら,J. Bioch
em 99, 733−739(1986))の5’末
端付近の塩基配列(18〜35位;シグナルペプチドの
N末端部に相当する)に相当し,XhoI部位が付加さ
れた27ヌクレオチド長の一本鎖断片(センスプライマ
ーO;配列表19に示す),およびアンチセンスプライ
マーとして該遺伝子の75〜100位の塩基配列(シグ
ナルペプチドのC末端部に相当する)に相補的でありS
tuI部位が付加された26ヌクレオチド長の一本鎖断
片(アンチセンスプライマーP;配列表20に示す)を
化学合成し,これらを用いてPCR反応を行う。
【0065】センスプライマーO:5’−GAGCTC
GAGCCCTCGCCAAGATGAAAC−3’ アンチセンスプライマーP:5’−CACAGGCCT
AGTGCTGATGCTGTGTG−3’ 得られたDNA断片をクレノー断片で処理し,XhoI
で切断することにより,ラット膵臓ホスホリパーゼA2
のシグナルペプチドを有する断片■が得られる(図14
)。上記断片■および■を,常法によりT4 DNAリ
ガーゼで連結することにより,プラスミドpGEM4S
IGが得られる。
GAGCCCTCGCCAAGATGAAAC−3’ アンチセンスプライマーP:5’−CACAGGCCT
AGTGCTGATGCTGTGTG−3’ 得られたDNA断片をクレノー断片で処理し,XhoI
で切断することにより,ラット膵臓ホスホリパーゼA2
のシグナルペプチドを有する断片■が得られる(図14
)。上記断片■および■を,常法によりT4 DNAリ
ガーゼで連結することにより,プラスミドpGEM4S
IGが得られる。
【0066】このpGEMSIGを,図15に示すよう
に,StuIとHindIIIとで切断し,大きい方の
断片■を得る。次に,S. aureus ATCC1
2600株の培養細胞からM. Stahlらの方法に
従って,ゲノムDNAを単離し,これをPCR反応に用
いる鋳型DNAとする。センスプライマーとして,(ウ
)項で用いたのと同様のセンスプライマーEを,そして
アンチセンスプライマーとして,(オ)項で用いたのと
同様のアンチセンスプライマーKをそれぞれ化学合成し
,PCR反応を行う。得られたDNA断片をpmaCI
及びHindIIIで分解することにより,V8様プロ
テアーゼの成熟タンパクをコードする塩基配列を有する
断片■が得られる。上記断片■および■を,常法により
T4 DNAリガーゼで連結することにより,プラスミ
ドpGEM4SIGV8が得られる(図15)。このプ
ラスミドは,ラット膵臓ホスホリパーゼA2のシグナル
ペプチドをコードするDNA配列を有する。このプラス
ミドを図16に示すように,XhoI及びPvuIII
で分解することにより,上記断片■が得られる。別に,
プラスミドpAM82(Miyanoharaら,Pr
oc. NatI. Acad Sci, USA 8
0, 1−5(1983))をXhoIおよびPvuI
Iで分解し,大きい方の断片■を得る。これらの断片■
および■を,常法によりT4 DNAリガーゼを用いて
連結することにより,発現ベクターpAM82SIGV
8が得られる。この発現ベクターは,PHO5プロモー
ターの支配下に,ラット膵臓ホスホリパーゼA2のシグ
ナルペプチドをコードするDNA配列,V8様プロテア
ーゼの成熟タンパクをコードするDNA配列および該成
熟コードをコードするDNA配列の下流に存在する3’
非翻訳領域を有する。
に,StuIとHindIIIとで切断し,大きい方の
断片■を得る。次に,S. aureus ATCC1
2600株の培養細胞からM. Stahlらの方法に
従って,ゲノムDNAを単離し,これをPCR反応に用
いる鋳型DNAとする。センスプライマーとして,(ウ
)項で用いたのと同様のセンスプライマーEを,そして
アンチセンスプライマーとして,(オ)項で用いたのと
同様のアンチセンスプライマーKをそれぞれ化学合成し
,PCR反応を行う。得られたDNA断片をpmaCI
及びHindIIIで分解することにより,V8様プロ
テアーゼの成熟タンパクをコードする塩基配列を有する
断片■が得られる。上記断片■および■を,常法により
T4 DNAリガーゼで連結することにより,プラスミ
ドpGEM4SIGV8が得られる(図15)。このプ
ラスミドは,ラット膵臓ホスホリパーゼA2のシグナル
ペプチドをコードするDNA配列を有する。このプラス
ミドを図16に示すように,XhoI及びPvuIII
で分解することにより,上記断片■が得られる。別に,
プラスミドpAM82(Miyanoharaら,Pr
oc. NatI. Acad Sci, USA 8
0, 1−5(1983))をXhoIおよびPvuI
Iで分解し,大きい方の断片■を得る。これらの断片■
および■を,常法によりT4 DNAリガーゼを用いて
連結することにより,発現ベクターpAM82SIGV
8が得られる。この発現ベクターは,PHO5プロモー
ターの支配下に,ラット膵臓ホスホリパーゼA2のシグ
ナルペプチドをコードするDNA配列,V8様プロテア
ーゼの成熟タンパクをコードするDNA配列および該成
熟コードをコードするDNA配列の下流に存在する3’
非翻訳領域を有する。
【0067】上記(ア)〜(キ)項で得られる発現ベク
ターにおいては,いずれも適当な宿主に導入し,アンピ
シリン含有平板寒天培地上で選択を行い,アンピシリン
耐性コロニーからDNAを単離し,制限酵素切断パター
ンを確認することにより,目的とするDNA断片が正し
い位置および方向で挿入されていることが確認され得る
。
ターにおいては,いずれも適当な宿主に導入し,アンピ
シリン含有平板寒天培地上で選択を行い,アンピシリン
耐性コロニーからDNAを単離し,制限酵素切断パター
ンを確認することにより,目的とするDNA断片が正し
い位置および方向で挿入されていることが確認され得る
。
【0068】(III)形質転換体の調製上記発現ベク
ターのうち,(ア)pHY300V8R,(イ)pHY
300V8Rtt,(ウ)pHY300BAAMYV8
tt,(エ)pHY300BAAKPSV8ttおよび
(オ)pHYUBV8R,pHYUBV8L,(カ)p
HY300CAHV8は,枯草菌に導入されて形質転換
体が得られる。たとえば,J. Spizizenらの
方法(Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 44, 1072(1958))に従って
,枯草菌ISW 1214株に上記発現ベクターが導入
されて,形質転換体が得られる。上記(ア),(イ),
(ウ),(エ)および(カ)の発現ベクターが導入され
た形質転換体は,テトクサイクリン含有平板寒天培地上
で選択される。このようにして,(ア),(イ),(ウ
),(エ)および(カ)の発現ベクターがそれぞれ導入
された,次の形質転換体が得られる。:Bacillu
s subtilis pHY300V8R/ISW1
214, Bacillus subtilis pH
Y300V8Rtt/ISW1214, Bacill
us subtilis pHY300BAAMYV8
tt/ISW1214, Bacillus subt
ilis pHY300BAAKPSV8tt/ISW
1214, およびBacillus subtili
s pHY300CAHV8/ISW1214。上記(
オ)の発現ベクターが導入された形質転換体は,カナマ
イシン含有平板寒天培地上で選択される。このようにし
て,(オ)の発現ベクター(pHYUBV8Rおよびp
HYUBV8L)がそれぞれ導入された,次の形質転換
体が得られる。:Bacillus subtilis
pHYUBV8R/ISW1214およびBacil
lus subtilis pHYUBV8L/ISW
1214。
ターのうち,(ア)pHY300V8R,(イ)pHY
300V8Rtt,(ウ)pHY300BAAMYV8
tt,(エ)pHY300BAAKPSV8ttおよび
(オ)pHYUBV8R,pHYUBV8L,(カ)p
HY300CAHV8は,枯草菌に導入されて形質転換
体が得られる。たとえば,J. Spizizenらの
方法(Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 44, 1072(1958))に従って
,枯草菌ISW 1214株に上記発現ベクターが導入
されて,形質転換体が得られる。上記(ア),(イ),
(ウ),(エ)および(カ)の発現ベクターが導入され
た形質転換体は,テトクサイクリン含有平板寒天培地上
で選択される。このようにして,(ア),(イ),(ウ
),(エ)および(カ)の発現ベクターがそれぞれ導入
された,次の形質転換体が得られる。:Bacillu
s subtilis pHY300V8R/ISW1
214, Bacillus subtilis pH
Y300V8Rtt/ISW1214, Bacill
us subtilis pHY300BAAMYV8
tt/ISW1214, Bacillus subt
ilis pHY300BAAKPSV8tt/ISW
1214, およびBacillus subtili
s pHY300CAHV8/ISW1214。上記(
オ)の発現ベクターが導入された形質転換体は,カナマ
イシン含有平板寒天培地上で選択される。このようにし
て,(オ)の発現ベクター(pHYUBV8Rおよびp
HYUBV8L)がそれぞれ導入された,次の形質転換
体が得られる。:Bacillus subtilis
pHYUBV8R/ISW1214およびBacil
lus subtilis pHYUBV8L/ISW
1214。
【0069】発現ベクターpAM82 SIGV8(キ
)は,酵母に導入されて形質転換体が得られる。例えば
Saccharomyces cerevisiae
AH22株に導入され,ヒスチジン含有寒天培地上で選
択され,ロイシン非要求性の形質転換体Sacchar
omyces cerevisiae pAM82SI
GV8/AH22が得られる。
)は,酵母に導入されて形質転換体が得られる。例えば
Saccharomyces cerevisiae
AH22株に導入され,ヒスチジン含有寒天培地上で選
択され,ロイシン非要求性の形質転換体Sacchar
omyces cerevisiae pAM82SI
GV8/AH22が得られる。
【0070】(IV)V8様プロテアーゼの発現上記(
III)節で得られた形質転換体で培養することにより
V8様プロテアーゼが生産される。例えば,上記枯草菌
の形質転換体はSc+培地で培養することによりV8様
プロテアーゼを産出する。上記酵母の形質転換体につい
ては,PHO5プロモーターを有するため,培地中の無
機リン酸の有無によって発現のON−OFFのスイッチ
が行われ得る(Nakaoら,Molec. Cell
. Biol. 6, 2613−2623, 198
6)。従って,まず無機リン酸を含有する培地で増殖を
行い,次いで,これを無機リン酸を含有しない培地に移
すことにより,効果的にV8様プロテアーゼが産出され
る。V8様プロテアーゼの活性は,次の方法により測定
され得る。
III)節で得られた形質転換体で培養することにより
V8様プロテアーゼが生産される。例えば,上記枯草菌
の形質転換体はSc+培地で培養することによりV8様
プロテアーゼを産出する。上記酵母の形質転換体につい
ては,PHO5プロモーターを有するため,培地中の無
機リン酸の有無によって発現のON−OFFのスイッチ
が行われ得る(Nakaoら,Molec. Cell
. Biol. 6, 2613−2623, 198
6)。従って,まず無機リン酸を含有する培地で増殖を
行い,次いで,これを無機リン酸を含有しない培地に移
すことにより,効果的にV8様プロテアーゼが産出され
る。V8様プロテアーゼの活性は,次の方法により測定
され得る。
【0071】V8様プロテアーゼの活性測定法培養液を
2500×gで5分間遠心分離し,上清を採取する。試
験管に10mMのZ−Phe−deu−Glu−PNA
(Carbobenzoxy−L−phenylala
nyl−L−α−gluamyl−4−nitrani
lid,ベーリンガーマンハイム社,#775843)
20μl,10倍濃縮緩衝液(0.5M NH4HCO
3,50mM EDTA,PH7.8)100μl,お
よび上記培養上清を入れ,蒸留水を加えて1mlとし,
25℃で10分間反応させる。この反応液のA410に
おける吸光度を測定する。発現量の算出には標準V8プ
ロテアーゼ(シグマ社,S. aureus V8 株
由来Type XVII)を用いる。
2500×gで5分間遠心分離し,上清を採取する。試
験管に10mMのZ−Phe−deu−Glu−PNA
(Carbobenzoxy−L−phenylala
nyl−L−α−gluamyl−4−nitrani
lid,ベーリンガーマンハイム社,#775843)
20μl,10倍濃縮緩衝液(0.5M NH4HCO
3,50mM EDTA,PH7.8)100μl,お
よび上記培養上清を入れ,蒸留水を加えて1mlとし,
25℃で10分間反応させる。この反応液のA410に
おける吸光度を測定する。発現量の算出には標準V8プ
ロテアーゼ(シグマ社,S. aureus V8 株
由来Type XVII)を用いる。
【0072】
【実施例】本発明を以下の実施例につき説明する。
【0073】
(I)V8様プロテアーゼをコードするDNA配列の決
定(A) ゲノムDNAのPCR解析 S. aureus ATCC 12600 株の培養
細胞から,M. Stahlら(前出)の方法に従って
ゲノムDNAを調製し,該DNAをPCR解析に用いる
鋳型DNAとした。PCRに用いるオリゴヌクレオチド
プライマーは,S. aureus V8遺伝子に基
づいて,常法により合成した。つまり,配列表2に示す
V8遺伝子がコードするアミノ酸配列の,N末端側1位
から6位に相当するアミノ酸をコードするオリゴヌクレ
オチド18mer (5’−GTTATATTACCA
AATAAC)をセンスプライマーV84とし,該アミ
ノ酸のC末端側262位から257位に相当するアミノ
酸をコードするオリゴヌクレオチドに相補的な18me
r(5’−TGAATTATTGTTATCGCC)を
アンチセンスプライマーV89とし,これら2種類のプ
ライマーを合成した。次いで,PCR法によりDNAの
増幅を行うため,500μl容のエッペンドルフチュー
ブに次の■〜■を入れた。
定(A) ゲノムDNAのPCR解析 S. aureus ATCC 12600 株の培養
細胞から,M. Stahlら(前出)の方法に従って
ゲノムDNAを調製し,該DNAをPCR解析に用いる
鋳型DNAとした。PCRに用いるオリゴヌクレオチド
プライマーは,S. aureus V8遺伝子に基
づいて,常法により合成した。つまり,配列表2に示す
V8遺伝子がコードするアミノ酸配列の,N末端側1位
から6位に相当するアミノ酸をコードするオリゴヌクレ
オチド18mer (5’−GTTATATTACCA
AATAAC)をセンスプライマーV84とし,該アミ
ノ酸のC末端側262位から257位に相当するアミノ
酸をコードするオリゴヌクレオチドに相補的な18me
r(5’−TGAATTATTGTTATCGCC)を
アンチセンスプライマーV89とし,これら2種類のプ
ライマーを合成した。次いで,PCR法によりDNAの
増幅を行うため,500μl容のエッペンドルフチュー
ブに次の■〜■を入れた。
【0074】
■ATCC 12600株由来のゲノムDNA(0.5
μg)■上記センスプライマーV84およびアンチセン
スプライマーV89(各100pmol) ■10μlのPCR緩衝液(100mM Tris−H
Cl(pH 8.3),500mM KCl,15mM
MgCl2,0.1%(w/v)ゼラチン)■1μl
のdNTP溶液(dATP,dCTP,dGTPおよび
dTTP,各25mM) ■2.5単位のタックポリメラーゼ ■上記■〜■までを合わせた総量が100μlとなるよ
うな量の滅菌蒸留水 このチューブを,PCR自動化装置(サーモサイクラー
,Cetus社製)を用いて,以下のように加熱処理し
た。
μg)■上記センスプライマーV84およびアンチセン
スプライマーV89(各100pmol) ■10μlのPCR緩衝液(100mM Tris−H
Cl(pH 8.3),500mM KCl,15mM
MgCl2,0.1%(w/v)ゼラチン)■1μl
のdNTP溶液(dATP,dCTP,dGTPおよび
dTTP,各25mM) ■2.5単位のタックポリメラーゼ ■上記■〜■までを合わせた総量が100μlとなるよ
うな量の滅菌蒸留水 このチューブを,PCR自動化装置(サーモサイクラー
,Cetus社製)を用いて,以下のように加熱処理し
た。
【0075】i)94℃,30秒間(DNAの熱変性)
ii)50℃,30秒間(プライマーとのアニーリング
)iii)72℃,1分間(DNA鎖の伸長反応)上記
i)〜iii)のサイクルを30回繰り返した。ただし
,最終回のDNA鎖の伸長反応は5分間行った。得られ
た反応液の一部(10μl)をアガロースゲル電気泳動
により解析したところ,約850bp長のDNA断片が
得られた。この断片は,V8遺伝子よりも約60bp長
かった。
ii)50℃,30秒間(プライマーとのアニーリング
)iii)72℃,1分間(DNA鎖の伸長反応)上記
i)〜iii)のサイクルを30回繰り返した。ただし
,最終回のDNA鎖の伸長反応は5分間行った。得られ
た反応液の一部(10μl)をアガロースゲル電気泳動
により解析したところ,約850bp長のDNA断片が
得られた。この断片は,V8遺伝子よりも約60bp長
かった。
【0076】次に,このDNA断片を制限酵素SspI
で消化するために,PCR産物 8.5μlに10×S
spI緩衝液[200mM Tris−HCl(pH
8.5),100mM MgCl2,10mM ジチオ
スレイトール,1000mM KCl]1μlと,5単
位のSspIとを加え,37℃にて1時間反応させた。 得られた消化物をアガロースゲル電気泳動により分析し
たところ,それぞれ262,243,222および12
2bpオリゴヌクレオチド長に相当する4本のバンドが
認められた。このことにより,上記DNA断片は,V8
遺伝子が有するSspI認識部位と同じ認識部位を有す
ることが確認された。しかし,V8様遺伝子の3’末端
側に相当する262 bp長のオリゴヌクレオチドは,
V8遺伝子のSspI消化物の3’末端側に相当するオ
リゴヌクレオチドよりも約60bp長かった。そこで,
この約850bpのPCR産物(V84−V89)の構
造解析を直接シークエンス法により行うことにした。
で消化するために,PCR産物 8.5μlに10×S
spI緩衝液[200mM Tris−HCl(pH
8.5),100mM MgCl2,10mM ジチオ
スレイトール,1000mM KCl]1μlと,5単
位のSspIとを加え,37℃にて1時間反応させた。 得られた消化物をアガロースゲル電気泳動により分析し
たところ,それぞれ262,243,222および12
2bpオリゴヌクレオチド長に相当する4本のバンドが
認められた。このことにより,上記DNA断片は,V8
遺伝子が有するSspI認識部位と同じ認識部位を有す
ることが確認された。しかし,V8様遺伝子の3’末端
側に相当する262 bp長のオリゴヌクレオチドは,
V8遺伝子のSspI消化物の3’末端側に相当するオ
リゴヌクレオチドよりも約60bp長かった。そこで,
この約850bpのPCR産物(V84−V89)の構
造解析を直接シークエンス法により行うことにした。
【0077】まず,V84−V89反応混合物のアガロ
ースゲル電気泳動を行い,得られた約850bpのバン
ドをカミソリで切り出して細片化した。この細片中のD
NAを次の二次PCRの鋳型DNAとした。この細片化
ゲルを2本のチューブに入れ,一方のチューブにはセン
スプライマーV84のみを加え(S),他方のチューブ
には,アンチセンスプライマーV89のみを加え(AS
),それぞれのチューブにおいて,上述と同様にPCR
(二次PCR)を行なった。このPCR反応を繰り返し
て行うことにより,合成されたセンスもしくはアンチセ
ンスの1本鎖DNAのみが大部分を占めるようになる。 反応後,それぞれのチューブ中のDNAを常法によりフ
ェノールおよびクロロホルムを用いて抽出し,水層を得
た。この水層画分に,等量の5M 酢酸アンモニウムお
よび2.5倍量のエタノールを加え,4℃にて2〜16
時間静置した。この液を遠心分離することによりペレッ
トを集め,該ペレットを70%エタノールで洗浄した後
,減圧乾燥し,滅菌水10μlに溶かした。
ースゲル電気泳動を行い,得られた約850bpのバン
ドをカミソリで切り出して細片化した。この細片中のD
NAを次の二次PCRの鋳型DNAとした。この細片化
ゲルを2本のチューブに入れ,一方のチューブにはセン
スプライマーV84のみを加え(S),他方のチューブ
には,アンチセンスプライマーV89のみを加え(AS
),それぞれのチューブにおいて,上述と同様にPCR
(二次PCR)を行なった。このPCR反応を繰り返し
て行うことにより,合成されたセンスもしくはアンチセ
ンスの1本鎖DNAのみが大部分を占めるようになる。 反応後,それぞれのチューブ中のDNAを常法によりフ
ェノールおよびクロロホルムを用いて抽出し,水層を得
た。この水層画分に,等量の5M 酢酸アンモニウムお
よび2.5倍量のエタノールを加え,4℃にて2〜16
時間静置した。この液を遠心分離することによりペレッ
トを集め,該ペレットを70%エタノールで洗浄した後
,減圧乾燥し,滅菌水10μlに溶かした。
【0078】直接シークエンス法に用いるオリゴヌクレ
オチドプライマーV84およびV89は,5’末端を3
2P標識して使用した。標識は,以下の■〜■を混合し
て37℃にて30分間反応させた後,100℃にて2分
間加熱して反応停止させることにより行った。
オチドプライマーV84およびV89は,5’末端を3
2P標識して使用した。標識は,以下の■〜■を混合し
て37℃にて30分間反応させた後,100℃にて2分
間加熱して反応停止させることにより行った。
【0079】■10pmolのセンスプライマーV84
またはアンチセンスプライマーV89 ■1.5μlの10×キナーゼ緩衝液(500mM T
ris−HCl(pH 8.0),100mM MgC
l2,100mM2−メルカプトエタノール)■3.7
MBqの32P−γATP(185TBq/mmol)
■10単位のT4ポリヌクレオチドキナーゼ■上記■〜
■までを合わせた総量が15μlとなるような量の滅菌
蒸留水 上記(S)で調製した一本鎖DNA 5μlに32P標
識アンチセンスプライマー3μlを加えた。上記(AS
)で調製した一本鎖DNA 5μlには32P標識セン
スプライマー3μlを加えた。各検体に,5×ポリメラ
ーゼ緩衝液(200mMTris−HCl(pH 7.
5),100mM MgCl2,250mM NaCl
)2μlを加えて混和し,65℃にて10分間加熱し,
次いで室温にて20分間アニーリングを行った。
またはアンチセンスプライマーV89 ■1.5μlの10×キナーゼ緩衝液(500mM T
ris−HCl(pH 8.0),100mM MgC
l2,100mM2−メルカプトエタノール)■3.7
MBqの32P−γATP(185TBq/mmol)
■10単位のT4ポリヌクレオチドキナーゼ■上記■〜
■までを合わせた総量が15μlとなるような量の滅菌
蒸留水 上記(S)で調製した一本鎖DNA 5μlに32P標
識アンチセンスプライマー3μlを加えた。上記(AS
)で調製した一本鎖DNA 5μlには32P標識セン
スプライマー3μlを加えた。各検体に,5×ポリメラ
ーゼ緩衝液(200mMTris−HCl(pH 7.
5),100mM MgCl2,250mM NaCl
)2μlを加えて混和し,65℃にて10分間加熱し,
次いで室温にて20分間アニーリングを行った。
【0080】これとは別に,2μlの溶液中に80μM
dNTP,8μM ddNTP,50mM NaCl
および2単位のシークエネースを含有するチューブを,
4種類の塩基(G,A,T,C)についてそれぞれ準備
した。これらのチューブに,先にアニーリングを行った
試料をそれぞれ2.4μlずつ添加し,50℃にて40
分間反応させた。さらに,これらの検体に3μlの反応
停止液(95%ホルムアミド,20mM EDTA,0
.05%ブロムフェノール青,0.05%キシレンシア
ノール)を添加して反応を停止させた。この液を7M尿
素を含有する6%ポリアクリルアミドゲル電気泳動にか
けて塩基配列の決定を行った。その結果,測定されたV
84−V89領域の塩基配列は,V8遺伝子と約92%
の相同性を有することが認められた。
dNTP,8μM ddNTP,50mM NaCl
および2単位のシークエネースを含有するチューブを,
4種類の塩基(G,A,T,C)についてそれぞれ準備
した。これらのチューブに,先にアニーリングを行った
試料をそれぞれ2.4μlずつ添加し,50℃にて40
分間反応させた。さらに,これらの検体に3μlの反応
停止液(95%ホルムアミド,20mM EDTA,0
.05%ブロムフェノール青,0.05%キシレンシア
ノール)を添加して反応を停止させた。この液を7M尿
素を含有する6%ポリアクリルアミドゲル電気泳動にか
けて塩基配列の決定を行った。その結果,測定されたV
84−V89領域の塩基配列は,V8遺伝子と約92%
の相同性を有することが認められた。
【0081】(B) ゲノムDNAのサザン分析(A)
項で調製した S. aureus ATCC 126
00株由来のゲノムDNAの10μgに,50単位のE
coRIを含む10μlの 10×EcoRI緩衝液(
1000mM Tris−HCl (pH 7.5),
70mM MgCl2,500mM NaCl,70m
M 2−メルカプトエタノール)を加え,37℃にて5
時間反応させた。得られたEcoRIを消化物を1%ア
ガロースゲル電気泳動にかけてDNA断片を分離した後
,転写装置(Vacu Gene,ファルマシア社製)
を用いて該DNA断片をナイロンメンブレンフィルター
(Zeta Probe,バイオラッド社製)にブロッ
ティングし,サザン分析を行った。サザン分析に用いる
ハイブリダイゼーション用プローブは,(A)項で得た
V84−V89PCR産物を,常法により32P−dC
TPで標識することにより調製した。上記EcoRI切
断DNA 断片がブロッティングされたナイロンメンブ
ランフィルターを,この32P 標識プローブを含有す
るGMC緩衝液(0.5M NaHPO4(pH 7.
2),1mM EDTA,7% SDS,1%(w/v
)BSA)中で65℃にて16時間インキュベートし,
ハイブリダイゼーションを行った。このナイロンメンブ
レンフィルターを洗浄液(0.3M NaCl,0.0
3Mクエン酸3−ナトリウム,0.1%SDS)で室温
にて 10分間,3回,さらに65℃にて15分間,2
回洗浄した。ナイロンメンブレンフィルターのオートラ
ジオグラフィーを行ったところ,アガロースゲル中の約
3.5kb に相当するバンドが陽性バンドとして検出
された。
項で調製した S. aureus ATCC 126
00株由来のゲノムDNAの10μgに,50単位のE
coRIを含む10μlの 10×EcoRI緩衝液(
1000mM Tris−HCl (pH 7.5),
70mM MgCl2,500mM NaCl,70m
M 2−メルカプトエタノール)を加え,37℃にて5
時間反応させた。得られたEcoRIを消化物を1%ア
ガロースゲル電気泳動にかけてDNA断片を分離した後
,転写装置(Vacu Gene,ファルマシア社製)
を用いて該DNA断片をナイロンメンブレンフィルター
(Zeta Probe,バイオラッド社製)にブロッ
ティングし,サザン分析を行った。サザン分析に用いる
ハイブリダイゼーション用プローブは,(A)項で得た
V84−V89PCR産物を,常法により32P−dC
TPで標識することにより調製した。上記EcoRI切
断DNA 断片がブロッティングされたナイロンメンブ
ランフィルターを,この32P 標識プローブを含有す
るGMC緩衝液(0.5M NaHPO4(pH 7.
2),1mM EDTA,7% SDS,1%(w/v
)BSA)中で65℃にて16時間インキュベートし,
ハイブリダイゼーションを行った。このナイロンメンブ
レンフィルターを洗浄液(0.3M NaCl,0.0
3Mクエン酸3−ナトリウム,0.1%SDS)で室温
にて 10分間,3回,さらに65℃にて15分間,2
回洗浄した。ナイロンメンブレンフィルターのオートラ
ジオグラフィーを行ったところ,アガロースゲル中の約
3.5kb に相当するバンドが陽性バンドとして検出
された。
【0082】
(C)サブゲノムライブラリーの作製およびPCR解析
(A)項で調製したS. aureus ATCC 1
2600株由来のゲノムDNAを,(B)項と同様にE
coRIで消化し,得られた消化物をアガロースゲル電
気泳動にかけてDNA断片を分離し,3.5kbのバン
ドをゲルから切り出した。このゲルから約3.5kbの
DNA断片をDEAEメンブレンフィルターで溶出し,
回収した。これとは別に,ファージベクターM13mp
10のDNAをEcoRIで消化した後,T. Man
iatisら(前出)に従って 5’末端の脱リン酸化
反応を行った。この M13mp10の EcoRI
消化DNAの脱リン酸化物の0.1μgに,先に回収し
た3.5kb DNA断片,2μlの 10×ライゲー
ション緩衝液(660mM Tris−HCl (pH
7.5),66mM MgCl2,100mMジチオ
スレイトール,10mM ATP),および350単位
のT4 DNAリガーゼを加えて総量20μlとし,1
2℃にて16時間ライゲーション反応を行った。
(A)項で調製したS. aureus ATCC 1
2600株由来のゲノムDNAを,(B)項と同様にE
coRIで消化し,得られた消化物をアガロースゲル電
気泳動にかけてDNA断片を分離し,3.5kbのバン
ドをゲルから切り出した。このゲルから約3.5kbの
DNA断片をDEAEメンブレンフィルターで溶出し,
回収した。これとは別に,ファージベクターM13mp
10のDNAをEcoRIで消化した後,T. Man
iatisら(前出)に従って 5’末端の脱リン酸化
反応を行った。この M13mp10の EcoRI
消化DNAの脱リン酸化物の0.1μgに,先に回収し
た3.5kb DNA断片,2μlの 10×ライゲー
ション緩衝液(660mM Tris−HCl (pH
7.5),66mM MgCl2,100mMジチオ
スレイトール,10mM ATP),および350単位
のT4 DNAリガーゼを加えて総量20μlとし,1
2℃にて16時間ライゲーション反応を行った。
【0083】次いで,この組換えM13mp10ベクタ
ーを,既知の方法(Mandelら,前出)に従って大
腸菌JM103株に導入し,該大腸菌の形質転換を行っ
てサブゲノムライブラリーを作製した。この形質転換体
をLB寒天培地(1%バクトトリプトン,0.5%酵母
エキス,0.5%NaCl,0.2%マルトース,1.
5%寒天)上で培養するとプラークが形成された。そこ
で,この寒天培地1枚あたり2.5mlのLB液体培地
を加え,37℃にて1時間インキュベートした後,該液
体培地を回収し,遠心分離により菌体を除去してファー
ジ粒子を含む培養液上清を得た。
ーを,既知の方法(Mandelら,前出)に従って大
腸菌JM103株に導入し,該大腸菌の形質転換を行っ
てサブゲノムライブラリーを作製した。この形質転換体
をLB寒天培地(1%バクトトリプトン,0.5%酵母
エキス,0.5%NaCl,0.2%マルトース,1.
5%寒天)上で培養するとプラークが形成された。そこ
で,この寒天培地1枚あたり2.5mlのLB液体培地
を加え,37℃にて1時間インキュベートした後,該液
体培地を回収し,遠心分離により菌体を除去してファー
ジ粒子を含む培養液上清を得た。
【0084】この培養上清液を70℃にて10分間熱処
理することにより,ファージDNAを熱変性させた。そ
のうちの一部(2μl)を以下のPCRに用いる鋳型D
NAとした。このPCRに用いるプライマーとしては,
上述のV84センスプライマーおよびV89アンチセン
スプライマー,ならびにM13mp10のベクターDN
Aに相補的なオリゴヌクレオチドであるM4アンチセン
スプライマー(5’−GTTTTCCCAGTCACG
AC)(配列表3に示す),および該ベクターDNA
中に存在するオリゴヌクレオチドであるRVセンスプラ
イマー(5’−CAGGAAACAGCTATGAC)
(配列表4に示す)の4種類を用意した。そして,これ
らのプライマーをV84−V89,V84−M4,V8
4−RV,V89−M4,およびV89−RVの5種類
の組合せで用い,(A)項と同様にしてPCRを行った
。
理することにより,ファージDNAを熱変性させた。そ
のうちの一部(2μl)を以下のPCRに用いる鋳型D
NAとした。このPCRに用いるプライマーとしては,
上述のV84センスプライマーおよびV89アンチセン
スプライマー,ならびにM13mp10のベクターDN
Aに相補的なオリゴヌクレオチドであるM4アンチセン
スプライマー(5’−GTTTTCCCAGTCACG
AC)(配列表3に示す),および該ベクターDNA
中に存在するオリゴヌクレオチドであるRVセンスプラ
イマー(5’−CAGGAAACAGCTATGAC)
(配列表4に示す)の4種類を用意した。そして,これ
らのプライマーをV84−V89,V84−M4,V8
4−RV,V89−M4,およびV89−RVの5種類
の組合せで用い,(A)項と同様にしてPCRを行った
。
【0085】次いで,それぞれのPCR産物の一部(1
0μl)をアガロースゲル電気泳動にかけた後に,(B
)項と同様にナイロンメンブレンフィルターにブロッテ
ィングしてサザン分析を行った。サザン分析に用いるハ
イブリダイゼーション用プローブは,先に決定したV8
4−V89領域内の塩基配列に基づいて合成したV81
1(5’−TGAGTAATAATGCTGAAA)(
この配列は配列表1内に存在し,その位置は図1,図2
および図3に明示)5’末端を,常法により32P−γ
ATPで標識することにより調製した。上記DNA 断
片がブロッティングされたナイロンメンブレンフィルタ
ーを,この32P 標識プローブを含有するGMC緩衝
液中で42℃にて16時間インキュベートし,ハイブリ
ダイゼーションを行った。このナイロンメンブレンフィ
ルターを上記(B)項と同様に洗浄し,該フィルターの
オートラジオグラフィーを行った。その結果,V84−
V89,V84−M4,およびV89−RVのPCR産
物について,それぞれアガロースゲル中の約850bp
,約2.5kbおよび約1.8kbに相当するバンドが
陽性バンドとして検出された。V84−V89領域はV
84−M4領域に含まれている。従って,S. aur
eus ATCC12600株由来のV8様遺伝子を決
定するために,V84−M4およびV89−RVのPC
R産物を解析することにした。
0μl)をアガロースゲル電気泳動にかけた後に,(B
)項と同様にナイロンメンブレンフィルターにブロッテ
ィングしてサザン分析を行った。サザン分析に用いるハ
イブリダイゼーション用プローブは,先に決定したV8
4−V89領域内の塩基配列に基づいて合成したV81
1(5’−TGAGTAATAATGCTGAAA)(
この配列は配列表1内に存在し,その位置は図1,図2
および図3に明示)5’末端を,常法により32P−γ
ATPで標識することにより調製した。上記DNA 断
片がブロッティングされたナイロンメンブレンフィルタ
ーを,この32P 標識プローブを含有するGMC緩衝
液中で42℃にて16時間インキュベートし,ハイブリ
ダイゼーションを行った。このナイロンメンブレンフィ
ルターを上記(B)項と同様に洗浄し,該フィルターの
オートラジオグラフィーを行った。その結果,V84−
V89,V84−M4,およびV89−RVのPCR産
物について,それぞれアガロースゲル中の約850bp
,約2.5kbおよび約1.8kbに相当するバンドが
陽性バンドとして検出された。V84−V89領域はV
84−M4領域に含まれている。従って,S. aur
eus ATCC12600株由来のV8様遺伝子を決
定するために,V84−M4およびV89−RVのPC
R産物を解析することにした。
【0086】(D) S. aureus ATCC
12600株由来のV8様遺伝子の構造解析 上記(C)項において,サブゲノムライブラリーから得
られたV84−M4およびV89−RVのPCR産物を
用い,直接シークエンス法により構造解析を行った。そ
れには,まずV84−M4およびV89−RVのPCR
産物の二次PCRをそれぞれ行い,1本鎖DNAを合成
した。これとは別に,オリゴヌクレオチドプライマーと
して,以下の6種類のプライマーを合成した。各オリゴ
ヌクレオチドプライマーの位置を図1,図2および図3
に示す。
12600株由来のV8様遺伝子の構造解析 上記(C)項において,サブゲノムライブラリーから得
られたV84−M4およびV89−RVのPCR産物を
用い,直接シークエンス法により構造解析を行った。そ
れには,まずV84−M4およびV89−RVのPCR
産物の二次PCRをそれぞれ行い,1本鎖DNAを合成
した。これとは別に,オリゴヌクレオチドプライマーと
して,以下の6種類のプライマーを合成した。各オリゴ
ヌクレオチドプライマーの位置を図1,図2および図3
に示す。
【0087】V85 : 5’−GCTTCTGGTG
TAGTTGTAV812: 5’−ATATCAAT
TTCGCAAATGV815: 5’−GGCGAT
AACAATAATTCAV810: 5’−GTTT
ATTTGTTAAAAGV814: 5’−TGCA
TAATGACCATTCGTV86 : 5’−TG
AACCTGAGTTACCACC(A)項と同様に,
上記1本鎖DNAとそれぞれのプライマーとをアニーリ
ングさせ,シークエネース反応を行い,ポリアクリルア
ミドゲル電気泳動を行った後にオートラジオグラフィー
により分析した。これらの結果を総合し,V8様遺伝子
のDNA配列を決定した。その結果を配列表1および図
1,図2および図3に示す。
TAGTTGTAV812: 5’−ATATCAAT
TTCGCAAATGV815: 5’−GGCGAT
AACAATAATTCAV810: 5’−GTTT
ATTTGTTAAAAGV814: 5’−TGCA
TAATGACCATTCGTV86 : 5’−TG
AACCTGAGTTACCACC(A)項と同様に,
上記1本鎖DNAとそれぞれのプライマーとをアニーリ
ングさせ,シークエネース反応を行い,ポリアクリルア
ミドゲル電気泳動を行った後にオートラジオグラフィー
により分析した。これらの結果を総合し,V8様遺伝子
のDNA配列を決定した。その結果を配列表1および図
1,図2および図3に示す。
【0088】
(II)発現ベクターの構築および形質転換体の調製「
発明の構成」の「(II)発現ベクターの構築」の節に
記載の方法により,次の発現ベクターの構築を行った:
(ア)pHY300V8R,(イ)pHY300V8R
tt,(ウ)pHY300BAAMYV8tt,(エ)
pHY300BAAKPSV8tt,(オ)pHYUB
V8R,pHYUBV8L,(カ)pHY300CAH
V8,および(キ)pAM82SIGV8。これらの発
現ベクターにおいて目的とする遺伝子が正しい位置およ
び方向で挿入されていることは,次の方法により確認さ
れた。まずこれらの発現ベクターを大腸菌に導入し,ア
ンピシリン含有平板寒天培地上で選択を行った。アンピ
シリン耐性コロニーより数個のコロニーを採取してプラ
スミドDNAを単離した。制限酵素により生じる断片の
サイズを確認することにより,目的とする遺伝子が正し
い位置および方向で挿入されていることを確認した。
発明の構成」の「(II)発現ベクターの構築」の節に
記載の方法により,次の発現ベクターの構築を行った:
(ア)pHY300V8R,(イ)pHY300V8R
tt,(ウ)pHY300BAAMYV8tt,(エ)
pHY300BAAKPSV8tt,(オ)pHYUB
V8R,pHYUBV8L,(カ)pHY300CAH
V8,および(キ)pAM82SIGV8。これらの発
現ベクターにおいて目的とする遺伝子が正しい位置およ
び方向で挿入されていることは,次の方法により確認さ
れた。まずこれらの発現ベクターを大腸菌に導入し,ア
ンピシリン含有平板寒天培地上で選択を行った。アンピ
シリン耐性コロニーより数個のコロニーを採取してプラ
スミドDNAを単離した。制限酵素により生じる断片の
サイズを確認することにより,目的とする遺伝子が正し
い位置および方向で挿入されていることを確認した。
【0089】上記発現ベクターのうち,(ア)pHY3
00V8R,(イ)pHY300V8Rtt,(ウ)p
HY300BAAMYV8tt,(エ)pHY300B
AAKPSV8ttおよび(オ)pHYUBV8R,p
HYUBV8L,(カ)pHY300CAHV8を,J
. Spizizenらの方法(Proc. Natl
.Acad. Sci., 44, 1072(195
8))により,それぞれ枯草菌ISW 1214株に導
入した。形質転換処理を行った枯草菌は,(ア),(イ
),(ウ),(エ)および(カ)の発現ベクターを含む
菌については,テトラサイクリンを含有する平板寒天培
地で選択し,テトラサイクリン耐性の形質転換体を得た
。このようにして,それぞれの発現ベクターが導入され
た形質転換体である,Bacillus subtil
is pHY300V8R/ISW1214, Bac
illus subtilis pHY300V8Rt
t/ISW1214, Bacillus subti
lis pHY300BAAMYV8tt/ISW12
14, Bacillus subtilis pHY
300BAAKPSV8tt/ISW1214, およ
びBacillus subtilis pHY300
CAHV8/ISW1214を得た。(オ)のベクター
を含む菌については,カナマイシンを含有する平板寒天
培地で選択を行い,カナマイシン耐性菌,Bacill
us subtilis pHYUBV8R/ISW1
214およびBacillus subtilis p
HYUBV8L/ISW1214が得られた。
00V8R,(イ)pHY300V8Rtt,(ウ)p
HY300BAAMYV8tt,(エ)pHY300B
AAKPSV8ttおよび(オ)pHYUBV8R,p
HYUBV8L,(カ)pHY300CAHV8を,J
. Spizizenらの方法(Proc. Natl
.Acad. Sci., 44, 1072(195
8))により,それぞれ枯草菌ISW 1214株に導
入した。形質転換処理を行った枯草菌は,(ア),(イ
),(ウ),(エ)および(カ)の発現ベクターを含む
菌については,テトラサイクリンを含有する平板寒天培
地で選択し,テトラサイクリン耐性の形質転換体を得た
。このようにして,それぞれの発現ベクターが導入され
た形質転換体である,Bacillus subtil
is pHY300V8R/ISW1214, Bac
illus subtilis pHY300V8Rt
t/ISW1214, Bacillus subti
lis pHY300BAAMYV8tt/ISW12
14, Bacillus subtilis pHY
300BAAKPSV8tt/ISW1214, およ
びBacillus subtilis pHY300
CAHV8/ISW1214を得た。(オ)のベクター
を含む菌については,カナマイシンを含有する平板寒天
培地で選択を行い,カナマイシン耐性菌,Bacill
us subtilis pHYUBV8R/ISW1
214およびBacillus subtilis p
HYUBV8L/ISW1214が得られた。
【0090】次に,発現ベクターpAM82SIGV8
(キ)を酵母株であるSaccharomyces c
erevisiae AH22株に導入した。形質転換
処理を行った酵母はヒスチジン含有寒天培地上で選択し
,ロイシン非要求性の形質転換体Saccharomy
ces cerevisiae pAM82SIGV8
/AH22を得た。
(キ)を酵母株であるSaccharomyces c
erevisiae AH22株に導入した。形質転換
処理を行った酵母はヒスチジン含有寒天培地上で選択し
,ロイシン非要求性の形質転換体Saccharomy
ces cerevisiae pAM82SIGV8
/AH22を得た。
【0091】(III)V8様プロテアーゼの発現(A
)枯草菌における発現 可溶性デンプン10g,グリセリン5g,バクトソイト
ーン5g,CSL2.5g,酵母抽出物1gおよび炭酸
カルシウム3gに水を加えて1Lとし,攪拌後,pHを
7.0に調整し,Sc+培地を得た。これを120℃に
て20分間オートクレーブ処理して減菌した。
)枯草菌における発現 可溶性デンプン10g,グリセリン5g,バクトソイト
ーン5g,CSL2.5g,酵母抽出物1gおよび炭酸
カルシウム3gに水を加えて1Lとし,攪拌後,pHを
7.0に調整し,Sc+培地を得た。これを120℃に
て20分間オートクレーブ処理して減菌した。
【0092】形質転換体Bacillus subti
lis pHY300V8R/ISW1214, Ba
cillus subtilis pHY300V8R
tt/ISW1214, Bacillus subt
ilis pHY300BAAMYV8tt/ISW1
214, Bacillus subtilis pH
Y300BAAKPSV8tt/ISW1214, B
acillus subtilis pHY300CA
HV8/ISW1214,Bacillus subt
ilis pHYUBV8R,およびBacillus
subtilis pHYUBV8Lをそれぞれ,次
のように培養した。まず,プレート上に生育した形質転
換体のコロニーをLB培地5mlに植菌し,37℃にて
18時間振盪培養した。これを上記Sc+培地10ml
に移し,28℃にて4日間振盪培養を行った。培養液を
「発明の構成」の項に記したV8様プロテアーゼの活性
測定法に従って測定し,V8様プロテアーゼの産出量を
算出した。その結果を表2に示す。
lis pHY300V8R/ISW1214, Ba
cillus subtilis pHY300V8R
tt/ISW1214, Bacillus subt
ilis pHY300BAAMYV8tt/ISW1
214, Bacillus subtilis pH
Y300BAAKPSV8tt/ISW1214, B
acillus subtilis pHY300CA
HV8/ISW1214,Bacillus subt
ilis pHYUBV8R,およびBacillus
subtilis pHYUBV8Lをそれぞれ,次
のように培養した。まず,プレート上に生育した形質転
換体のコロニーをLB培地5mlに植菌し,37℃にて
18時間振盪培養した。これを上記Sc+培地10ml
に移し,28℃にて4日間振盪培養を行った。培養液を
「発明の構成」の項に記したV8様プロテアーゼの活性
測定法に従って測定し,V8様プロテアーゼの産出量を
算出した。その結果を表2に示す。
【0093】
【表2】
【0094】(B)酵母における発現
Burkholder最少培地のリン酸添加培地(1.
5gリン酸二水素カリウム/L)および無添加培地(1
.5g塩化カリウム/L)を次のように調製した。まず
,表3および表5に示すリン酸添加4倍濃縮ストック溶
液,リン酸無添加4倍濃縮ストック溶液およびビタミン
ストック溶液を調製した。
5gリン酸二水素カリウム/L)および無添加培地(1
.5g塩化カリウム/L)を次のように調製した。まず
,表3および表5に示すリン酸添加4倍濃縮ストック溶
液,リン酸無添加4倍濃縮ストック溶液およびビタミン
ストック溶液を調製した。
【0095】
【表3】
【0096】
【表4】
【0097】
【表5】
【0098】上記リン酸添加4倍濃縮ストック溶液25
0ml,ビタミンストック溶液1ml,グルコース20
g,およびアスパラギン2gに水を加えて1Lとした。 これに50mgのヒスチジン塩酸塩を添加し,0.2N
水酸化ナトリウム溶液を用いてpH6.0に調整した。 このようにしてリン酸添加(p+)培地を得た。別に,
リン酸添加4倍濃縮ストック溶液の代わりにリン酸無添
加4倍濃縮ストック溶液を用い,同様に混合して,pH
を7.5に調整することによりリン酸無添加(p−)培
地を得た。p+培地は120℃で10分間,そしてP−
培地は110℃で10分間,それぞれオートクレーブで
滅菌操作を行った。
0ml,ビタミンストック溶液1ml,グルコース20
g,およびアスパラギン2gに水を加えて1Lとした。 これに50mgのヒスチジン塩酸塩を添加し,0.2N
水酸化ナトリウム溶液を用いてpH6.0に調整した。 このようにしてリン酸添加(p+)培地を得た。別に,
リン酸添加4倍濃縮ストック溶液の代わりにリン酸無添
加4倍濃縮ストック溶液を用い,同様に混合して,pH
を7.5に調整することによりリン酸無添加(p−)培
地を得た。p+培地は120℃で10分間,そしてP−
培地は110℃で10分間,それぞれオートクレーブで
滅菌操作を行った。
【0099】プレート上に生育したSaccharom
yces cerevisiae pAM82SIGV
8/AH22を上記p+培地10mlに植菌し,30℃
で2昼夜振盪培養した。この培養液0.2mlを,2M
トリス−塩酸緩衝液(pH7.0)0.05mlが添加
されたp−培地10mlに加え,30℃にて4日間振盪
培養を行った。得られた培養液には1mg/Lの割合で
V8様プロテアーゼが産生されていた。
yces cerevisiae pAM82SIGV
8/AH22を上記p+培地10mlに植菌し,30℃
で2昼夜振盪培養した。この培養液0.2mlを,2M
トリス−塩酸緩衝液(pH7.0)0.05mlが添加
されたp−培地10mlに加え,30℃にて4日間振盪
培養を行った。得られた培養液には1mg/Lの割合で
V8様プロテアーゼが産生されていた。
【0100】
【発明の効果】本発明によれば,このように,S. a
ureus ATCC12600株から新規のV8様プ
ロテアーゼをコードするDNA配列が得られる。さらに
,該DNA配列を有する発現ベクターおよび該発現ベク
ターを有する形質転換体が得られ,この形質転換体を培
養することにより新規V8様プロテアーゼが大量かつ安
価で生産され得る。このようにして生産されたV8様プ
ロテアーゼは,従来使用されていたS. aureus
由来のV8プロテアーゼと一部アミノ酸配列が異なる新
規物質である。このプロテアーゼは,V8プロテアーゼ
と同様の酵素活性を有するので,V8プロテアーゼと同
様に使用することができる。
ureus ATCC12600株から新規のV8様プ
ロテアーゼをコードするDNA配列が得られる。さらに
,該DNA配列を有する発現ベクターおよび該発現ベク
ターを有する形質転換体が得られ,この形質転換体を培
養することにより新規V8様プロテアーゼが大量かつ安
価で生産され得る。このようにして生産されたV8様プ
ロテアーゼは,従来使用されていたS. aureus
由来のV8プロテアーゼと一部アミノ酸配列が異なる新
規物質である。このプロテアーゼは,V8プロテアーゼ
と同様の酵素活性を有するので,V8プロテアーゼと同
様に使用することができる。
【0101】
【0102】
【配列番号:1】配列の長さ:1586配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:Genomic DNA
起源
生物名:スタフィロコッカス アウレウス(Staph
ylococcus aureus)株名:ATCC1
2600 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:352..1425 特徴を決定した方法:E 特徴を表す記号:sig peptide存在位置:3
52..555 特徴を決定した方法:E 特徴を表す記号:mat peptide存在位置:5
56..1425 特徴を決定した方法:E 配列 TAATTGTTCT TCGAAACTTA AGC
ACTCAAA TAAAATATCA GCATTC
ATAT TAATCTACCT 60TTG
ACCAAAC AATTATTATT CAAACG
TTAC TATTTATTAT TATAAACAA
A TACTTTCTCT 120TCGCTC
TCAA TTCCTTTCTT ATTTATTCT
T TTAGATAAAT GCAAACAATT G
ACGACCTTA 180CCAATTTAA
C ACAATCGAAT AAAGTATAAT A
CAATTCAAT TTTAATTCTC TTAA
TGTTTT 240TGTAAACTCT A
ATCTTTACA GAAACTTTTT AATT
TATTTA TATATTCTTA TTGACTT
AAA 300AATTTTTAGT GTTA
TATTTA ACTTGTAAAT AAATTTT
TTG GAGGTTTTTA G ATG AAA
357
Met Lys GGT AAA TTT TTA AAA GTT A
GT TCT TTA TTC GTT GCA AC
T TTG ACA ACA 405Gly
Lys Phe Leu Lys Val Ser
Ser Leu Phe Val Ala Thr L
eu Thr Thr −65
−60
−55GCG ACA CTT GTG AG
T TCT CCA GCA GCA AAT GCG
TTA TCT TCA AAA GCT
453Ala Thr Leu Val Ser S
er Pro Ala Ala Asn Ala Le
u Ser Ser Lys Ala−50
−45
−40
−35ATG GAC AAT CAT CCA
CAA CAA ACG CAG ACA GAC A
AA CAG CAA ACA CCT 5
01Met Asp Asn His Pro Gln
Gln Thr Gln Thr Asp Lys
Gln Gln Thr Pro
−30
−25 −20A
AG ATT CAA AAA GGC GGT AA
C CTT AAA CCA TTA GAA CAA
CGT GAA CGC 549Lys
Ile Gln Lys Gly Gly Asn L
eu Lys Pro Leu Glu Gln Ar
g Glu Arg −15
−10
−5GCT AAT GTT
ATA TTA CCA AAT AAC GAT
CGT CAC CAA ATC ACA GAT A
CA 597Ala Asn Val Il
e Leu Pro Asn Asn Asp Arg
His Gln Ile Thr Asp Thr
1
5 10ACG
AAT GGT CAT TAT GCA CCT G
TT ACT TAT ATT CAA GTT GA
A GCA CCT 645Thr Asn
Gly His Tyr Ala Pro Val
Thr Tyr Ile Gln Val Glu A
la Pro 15
20 25
30ACT GG
T ACA TTT 5ATT GCT TCT GG
T GTA GTT GTA GGT AAA GAT
ACA CTT 693Thr Gly
Thr Phe Ile Ala Ser Gly V
al Val Val Gly Lys Asp Th
r Leu 35
40
45TTA ACA AAT
AAA CAC GTC GTA GAT GCT
ACG CAC GGT GAT CCT CAT G
CT 741Leu Thr Asn Ly
s His Val Val Asp Ala Thr
His Gly Asp Pro His Ala
50
55
60TTA AAA GCA TTC CCT T
CT GCA ATT AAC CAA GAC AA
T TAT CCT AAT GGT 78
9Leu Lys Ala Phe Pro Ser
Ala Ile Asn Gln Asp Asn T
yr Pro Asn Gly 65
70
75GGT TTC AC
T GCT GAA CAA ATC ACT AAA
TAT TCA GGC GAA GGT GAT
TTA 837Gly Phe Thr A
la Glu Gln Ile Thr Lys Ty
r Ser Gly Glu Gly Asp Leu
80
85 90GCA
ATC GTT AAA TTC TCC CCT
AAT GAG CAA AAC AAA CAT A
TT GGC GAA 885Ala Il
e Val Lys Phe Ser Pro Asn
Glu Gln Asn Lys His Ile
Gly Glu 95
100 105
110GTA G
TT AAA CCA GCA ACA ATG AG
T AAT AAT GCT GAA ACA CAA
GTT AAC 933Val Val
Lys Pro Ala Thr Met Ser A
sn Asn Ala Glu Thr Gln Va
l Asn 115
120
125CAA AAT ATT
ACT GTA ACA GGA TAT CCT
GGT GAT AAA CCT GTC GCA A
CA 981Gln Asn Ile Th
r Val Thr Gly Tyr Pro Gly
Asp Lys Pro Val Ala Thr
130
135
140ATG TGG GAA AGT AAA G
GA AAA ATA ACG TAC TTA AA
A GGT GAA GCA ATG 102
9Met Trp Glu Ser Lys Gly
Lys Ile Thr Tyr Leu Lys G
ly Glu Ala Met 145
150
155CAA TAT GA
T TTA AGT ACA ACT GGT GGT
AAC TCA GGT TCA CCT GTA
TTT 1077Gln Tyr Asp L
eu Ser Thr Thr Gly Gly As
n Ser Gly Ser Pro Val Phe
160 1
65 170AAT
GAA AAA AAT GAA GTC ATT
GGC ATT CAT TGG GGT GGC G
TT CCA AAT 1125Asn Gl
u Lys Asn Glu Val Ile Gly
Ile His Trp Gly Gly Val
Pro Asn175
180 185
190CAA T
TT AAC GGT GCA GTA TTT AT
T AAT GAA AAT GTA CGC AAC
TTC TTA 1173Gln Phe
Asn Gly Ala Val Phe Ile A
sn Glu Asn Val Arg Asn Ph
e Leu 195
200
205AAA CAA AAT
ATT GAA GAT ATC AAT TTC
GCA AAT GAT GAC CAC CCT A
AC 1221Lys Gln Asn Il
e Glu Asp Ile Asn Phe Ala
Asn Asp Asp His Pro Asn
210
215
220AAC CCT GAT AAT CCA G
AC AAT CCA AAT AAT CCG GA
C AAT CCT AAC AAC 126
9Asn Pro Asp Asn Pro Asp
Asn Pro Asn Asn Pro Asp A
sn Pro Asn Asn 225
230
235CCT GAT AA
C CCT AAC AAC CCT GAT AAT
CCA GAC AAT CCT AAT AAT
CCT 1317Pro Asp Asn P
ro Asn Asn Pro Asp Asn Pr
o Asp Asn Pro Asn Asn Pro
240 2
45 250GAT
AAC CCT AAC AAC CCG GAC
AAT CCA AAT AAC CCT GAC C
AA CCT AAC 1365Asp As
n Pro Asn Asn Pro Asp Asn
Pro Asn Asn Pro Asp Gln
Pro Asn255
260 265
270AAC C
CA AAT AAC CCG GAC AAT GG
C GAT AAC AAT AAT TCA GAC
AAC CCT 1413Asn Pro
Asn Asn Pro Asp Asn Gly A
sp Asn Asn Asn Ser Asp As
n Pro 275
280
285GAC GCT GCA
TAAACTTCAT CTTAATTTGG AT
TTAGTATA TAGAAGCAAA AACTT
AACAA 1472Asp Ala Ala 289 CGCAAAATAT TTTGACTTAA ATG
GAGGGTA TTATATGAAT AGTTCA
TGTA AAACTAGAGT 1532ATT
CAATATT ATAAGCATCA TAATGG
TTTC AATGCTTATT TTATCACTA
G GCGC 1584
ylococcus aureus)株名:ATCC1
2600 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:352..1425 特徴を決定した方法:E 特徴を表す記号:sig peptide存在位置:3
52..555 特徴を決定した方法:E 特徴を表す記号:mat peptide存在位置:5
56..1425 特徴を決定した方法:E 配列 TAATTGTTCT TCGAAACTTA AGC
ACTCAAA TAAAATATCA GCATTC
ATAT TAATCTACCT 60TTG
ACCAAAC AATTATTATT CAAACG
TTAC TATTTATTAT TATAAACAA
A TACTTTCTCT 120TCGCTC
TCAA TTCCTTTCTT ATTTATTCT
T TTAGATAAAT GCAAACAATT G
ACGACCTTA 180CCAATTTAA
C ACAATCGAAT AAAGTATAAT A
CAATTCAAT TTTAATTCTC TTAA
TGTTTT 240TGTAAACTCT A
ATCTTTACA GAAACTTTTT AATT
TATTTA TATATTCTTA TTGACTT
AAA 300AATTTTTAGT GTTA
TATTTA ACTTGTAAAT AAATTTT
TTG GAGGTTTTTA G ATG AAA
357
Met Lys GGT AAA TTT TTA AAA GTT A
GT TCT TTA TTC GTT GCA AC
T TTG ACA ACA 405Gly
Lys Phe Leu Lys Val Ser
Ser Leu Phe Val Ala Thr L
eu Thr Thr −65
−60
−55GCG ACA CTT GTG AG
T TCT CCA GCA GCA AAT GCG
TTA TCT TCA AAA GCT
453Ala Thr Leu Val Ser S
er Pro Ala Ala Asn Ala Le
u Ser Ser Lys Ala−50
−45
−40
−35ATG GAC AAT CAT CCA
CAA CAA ACG CAG ACA GAC A
AA CAG CAA ACA CCT 5
01Met Asp Asn His Pro Gln
Gln Thr Gln Thr Asp Lys
Gln Gln Thr Pro
−30
−25 −20A
AG ATT CAA AAA GGC GGT AA
C CTT AAA CCA TTA GAA CAA
CGT GAA CGC 549Lys
Ile Gln Lys Gly Gly Asn L
eu Lys Pro Leu Glu Gln Ar
g Glu Arg −15
−10
−5GCT AAT GTT
ATA TTA CCA AAT AAC GAT
CGT CAC CAA ATC ACA GAT A
CA 597Ala Asn Val Il
e Leu Pro Asn Asn Asp Arg
His Gln Ile Thr Asp Thr
1
5 10ACG
AAT GGT CAT TAT GCA CCT G
TT ACT TAT ATT CAA GTT GA
A GCA CCT 645Thr Asn
Gly His Tyr Ala Pro Val
Thr Tyr Ile Gln Val Glu A
la Pro 15
20 25
30ACT GG
T ACA TTT 5ATT GCT TCT GG
T GTA GTT GTA GGT AAA GAT
ACA CTT 693Thr Gly
Thr Phe Ile Ala Ser Gly V
al Val Val Gly Lys Asp Th
r Leu 35
40
45TTA ACA AAT
AAA CAC GTC GTA GAT GCT
ACG CAC GGT GAT CCT CAT G
CT 741Leu Thr Asn Ly
s His Val Val Asp Ala Thr
His Gly Asp Pro His Ala
50
55
60TTA AAA GCA TTC CCT T
CT GCA ATT AAC CAA GAC AA
T TAT CCT AAT GGT 78
9Leu Lys Ala Phe Pro Ser
Ala Ile Asn Gln Asp Asn T
yr Pro Asn Gly 65
70
75GGT TTC AC
T GCT GAA CAA ATC ACT AAA
TAT TCA GGC GAA GGT GAT
TTA 837Gly Phe Thr A
la Glu Gln Ile Thr Lys Ty
r Ser Gly Glu Gly Asp Leu
80
85 90GCA
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AAT GAG CAA AAC AAA CAT A
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Glu Gln Asn Lys His Ile
Gly Glu 95
100 105
110GTA G
TT AAA CCA GCA ACA ATG AG
T AAT AAT GCT GAA ACA CAA
GTT AAC 933Val Val
Lys Pro Ala Thr Met Ser A
sn Asn Ala Glu Thr Gln Va
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120
125CAA AAT ATT
ACT GTA ACA GGA TAT CCT
GGT GAT AAA CCT GTC GCA A
CA 981Gln Asn Ile Th
r Val Thr Gly Tyr Pro Gly
Asp Lys Pro Val Ala Thr
130
135
140ATG TGG GAA AGT AAA G
GA AAA ATA ACG TAC TTA AA
A GGT GAA GCA ATG 102
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Lys Ile Thr Tyr Leu Lys G
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150
155CAA TAT GA
T TTA AGT ACA ACT GGT GGT
AAC TCA GGT TCA CCT GTA
TTT 1077Gln Tyr Asp L
eu Ser Thr Thr Gly Gly As
n Ser Gly Ser Pro Val Phe
160 1
65 170AAT
GAA AAA AAT GAA GTC ATT
GGC ATT CAT TGG GGT GGC G
TT CCA AAT 1125Asn Gl
u Lys Asn Glu Val Ile Gly
Ile His Trp Gly Gly Val
Pro Asn175
180 185
190CAA T
TT AAC GGT GCA GTA TTT AT
T AAT GAA AAT GTA CGC AAC
TTC TTA 1173Gln Phe
Asn Gly Ala Val Phe Ile A
sn Glu Asn Val Arg Asn Ph
e Leu 195
200
205AAA CAA AAT
ATT GAA GAT ATC AAT TTC
GCA AAT GAT GAC CAC CCT A
AC 1221Lys Gln Asn Il
e Glu Asp Ile Asn Phe Ala
Asn Asp Asp His Pro Asn
210
215
220AAC CCT GAT AAT CCA G
AC AAT CCA AAT AAT CCG GA
C AAT CCT AAC AAC 126
9Asn Pro Asp Asn Pro Asp
Asn Pro Asn Asn Pro Asp A
sn Pro Asn Asn 225
230
235CCT GAT AA
C CCT AAC AAC CCT GAT AAT
CCA GAC AAT CCT AAT AAT
CCT 1317Pro Asp Asn P
ro Asn Asn Pro Asp Asn Pr
o Asp Asn Pro Asn Asn Pro
240 2
45 250GAT
AAC CCT AAC AAC CCG GAC
AAT CCA AAT AAC CCT GAC C
AA CCT AAC 1365Asp As
n Pro Asn Asn Pro Asp Asn
Pro Asn Asn Pro Asp Gln
Pro Asn255
260 265
270AAC C
CA AAT AAC CCG GAC AAT GG
C GAT AAC AAT AAT TCA GAC
AAC CCT 1413Asn Pro
Asn Asn Pro Asp Asn Gly A
sp Asn Asn Asn Ser Asp As
n Pro 275
280
285GAC GCT GCA
TAAACTTCAT CTTAATTTGG AT
TTAGTATA TAGAAGCAAA AACTT
AACAA 1472Asp Ala Ala 289 CGCAAAATAT TTTGACTTAA ATG
GAGGGTA TTATATGAAT AGTTCA
TGTA AAACTAGAGT 1532ATT
CAATATT ATAAGCATCA TAATGG
TTTC AATGCTTATT TTATCACTA
G GCGC 1584
【0103】
【配列番号:2】配列の長さ:1558配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:Genomic DNA起源
生物名:スタフィロコッカス アウレウス(Stap
hylococcus aureus)株名:V8 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:354..1364 特徴を決定した方法:S 特徴を表す記号:sig peptide存在位置:3
54..557 特徴を決定した方法:S 特徴を表す記号:mat peptide存在位置:5
58..1364 特徴を決定した方法:S 配列 TAATTGTTCT TCGAAACTTA AGC
ACTCAAA TAATATATCA CCATTC
ATAT TAATCTACCT 60TTG
GGCCCAA ACAATTATTA TTCAAA
AGTT ACTATTTATT ATTATAAAC
A AATACTTTCC 120ATTCGC
TCTC AATTCCTTTC TTATTTATT
C TTTTAGATAA ATGCAAACAA T
TGACGATCT 180TATCAATTT
A ACTCAATTGA ATAAAGTATA A
TACAATTCA ATTTTAATTC CCTT
AATGTA 240TTTGTAAACT C
TAATCTTTA CAAAAACTTT TTAA
TTTATT TATATATTCT TATTGAC
TTA 300AAAATTTTTA TTGT
TATATT TAACTTGTAA ATAAATT
TTT TGGAGGTTTT TAG ATG
356
Met AAA GGT AAA TTT TTA AAA G
TT AGT TCT TTA TTC GTT GC
A ACT TTG ACA 404Lys
Gly Lys Phe Leu Lys Val
Ser Ser Leu Phe Val Ala T
hr Leu Thr −65
−60
−55ACA GCG ACA CT
T GTG AGT TCT CCA GCA GCA
AAC GCG TTA TCT TCA AAG
452Thr Ala Thr Leu V
al Ser Ser Pro Ala Ala As
n Ala Leu Ser Ser Lys
−50 −45
−40GCT ATG
GAC AAT CAT CCA CAA CAA
ACG CAG TCA AGC AAA CAG C
AA ACA 500Ala Met As
p Asn His Pro Gln Gln Thr
Gln Ser Ser Lys Gln Gln
Thr−35 −3
0 −25
−20CCT AAG A
TT CAA AAA GGC GGT AAC CT
T AAA CCA TTA GAA CAA CGT
GAA 548Pro Lys Ile
Gln Lys Gly Gly Asn Leu L
ys Pro Leu Glu Gln Arg Gl
u −15
−10
−5CAC GCA AAT GTT
ATA TTA CCA AAT AAC GAT C
GT CAC CAA ATC ACA GAT
596His Ala Asn Val Ile
Leu Pro Asn Asn Asp Arg
His Gln Ile Thr Asp
1 5
10 ACA
ACG AAT GGT CAT TAT GCA C
CC GTA ACT TAT ATT CAA GT
T GAA GCA 644Thr Thr
Asn Gly His Tyr Ala Pro
Val Thr Tyr Ile Gln Val G
lu Ala 15
20
25CCT ACT GGT ACA TTT AT
T GCT TCC GGT GTA GTT GTA
GGT AAA GAT ACT 692
Pro Thr Gly Thr Phe Ile A
la Ser Gly Val Val Val Gl
y Lys Asp Thr 30
35
40 4
5CTT TTA ACA AAT AAA CAC
GTC GTA GAT GCT ACG CAC G
GT GAT CCT CAT 740Le
u Leu Thr Asn Lys His Val
Val Asp Ala Thr His Gly
Asp Pro His
50 55
60GCT T
TA AAA GCA TTC CCT TCT GC
A ATT AAC CAA GAC AAT TAT
CCA AAT 788Ala Leu
Lys Ala Phe Pro Ser Ala I
le Asn Gln Asp Asn Tyr Pr
o Asn 65
70
75GGT GGT TTC ACT
GCT GAA CAA ATC ACT AAA
TAT TCA GGC GAA GGT GAT
836Gly Gly Phe Thr Al
a Glu Gln Ile Thr Lys Tyr
Ser Gly Glu Gly Asp
80 8
5 90TTA
GCA ATA GTT AAA TTC TCC C
CT AAT GAG CAA AAC AAA CA
T ATT GGT 884Leu Ala
Ile Val Lys Phe Ser Pro
Asn Glu Gln Asn Lys His I
le Gly 95
100
105GAA GTA GTT AAA CCA GC
A ACA ATG AGT AAT AAT GCT
GAA ACA CAA GTT 932
Glu Val Val Lys Pro Ala T
hr Met Ser Asn Asn Ala Gl
u Thr Gln Val110
115
120 12
5AAC CAA AAT ATT ACT GTA
ACA GGA TAT CCT GGT GAT A
AA CCT GTA GCA 980As
n Gln Asn Ile Thr Val Thr
Gly Tyr Pro Gly Asp Lys
Pro Val Ala
130 135
140ACA A
TG TGG GAA AGT AAA GGA AA
A ATC ACT TAC CTC AAA GGC
GAA GCT 1028Thr Met
Trp Glu Ser Lys Gly Lys I
le Thr Tyr Leu Lys Gly Gl
u Ala 145
150
155ATG CAA TAT GAT
TTA AGT ACA ACT GGT GGT
AAT TCA GGT TCA CCT GTA
1076Met Gln Tyr Asp Le
u Ser Thr Thr Gly Gly Asn
Ser Gly Ser Pro Val
160 16
5 170TTT
AAT GAA AAA AAT GAA GTG A
TC GGA ATT CAT TGG GGC GG
T GTA CCA 1124Phe Asn
Glu Lys Asn Glu Val Ile
Gly Ile His Trp Gly Gly V
al Pro 175
180
185AAT GAA TTT AAT GGT GC
G GTA TTT ATT AAT GAA AAT
GTA CGC AAC TTC 1172
Asn Glu Phe Asn Gly Ala V
al Phe Ile Asn Glu Asn Va
l Arg Asn Phe190
195
200 20
5TTA AAA CAA AAT ATT GAA
GAT ATC CAT TTT GCC AAC G
AT GAC CAA CCT 1220Le
u Lys Gln Asn Ile Glu Asp
Ile His Phe Ala Asn Asp
Asp Gln Pro
210 215
220AAT A
AC CCA GAT AAT CCT GAT AA
C CCT AAC AAT CCT GAT AAC
CCT AAC 1268Asn Asn
Pro Asp Asn Pro Asp Asn P
ro Asn Asn Pro Asp Asn Pr
o Asn 225
230
235AAC CCA GAT GAA
CCA AAT AAC CCT GAC AAC
CCT AAC AAC CCT GAT AAT
1316Asn Pro Asp Glu Pr
o Asn Asn Pro Asp Asn Pro
Asn Asn Pro Asp Asn
240 24
5 250CCA
GAC AAT GGC GAT AAC AAT A
AT TCA GAC AAT CCA GAT GC
A GCT 1361Pro Asp
Asn Gly Asp Asn Asn Asn
Ser Asp Asn Pro Asp Ala A
la 255
260 265
TAATTAACAA TTAAGTTCGT CTA
GATAAAA TAGAAGCAAA GTCTTA
GCAA CGTAAAATAT 1421TTT
GATTTAA ATGGAGGGTA TTATAT
GAAT AGTTCATGTA AATCTAGAG
T ATTCAATATT 1481ATAAGC
ATCA TAATGGTTTC AATGCTTAT
T TTATCACTAG GCGCATTTGC T
AATAACAAT 1541AAAGCCAAA
G CCGATTC
1558
hylococcus aureus)株名:V8 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:354..1364 特徴を決定した方法:S 特徴を表す記号:sig peptide存在位置:3
54..557 特徴を決定した方法:S 特徴を表す記号:mat peptide存在位置:5
58..1364 特徴を決定した方法:S 配列 TAATTGTTCT TCGAAACTTA AGC
ACTCAAA TAATATATCA CCATTC
ATAT TAATCTACCT 60TTG
GGCCCAA ACAATTATTA TTCAAA
AGTT ACTATTTATT ATTATAAAC
A AATACTTTCC 120ATTCGC
TCTC AATTCCTTTC TTATTTATT
C TTTTAGATAA ATGCAAACAA T
TGACGATCT 180TATCAATTT
A ACTCAATTGA ATAAAGTATA A
TACAATTCA ATTTTAATTC CCTT
AATGTA 240TTTGTAAACT C
TAATCTTTA CAAAAACTTT TTAA
TTTATT TATATATTCT TATTGAC
TTA 300AAAATTTTTA TTGT
TATATT TAACTTGTAA ATAAATT
TTT TGGAGGTTTT TAG ATG
356
Met AAA GGT AAA TTT TTA AAA G
TT AGT TCT TTA TTC GTT GC
A ACT TTG ACA 404Lys
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Ser Ser Leu Phe Val Ala T
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−60
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GAC AAT CAT CCA CAA CAA
ACG CAG TCA AGC AAA CAG C
AA ACA 500Ala Met As
p Asn His Pro Gln Gln Thr
Gln Ser Ser Lys Gln Gln
Thr−35 −3
0 −25
−20CCT AAG A
TT CAA AAA GGC GGT AAC CT
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−10
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GT CAC CAA ATC ACA GAT
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10 ACA
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T GAA GCA 644Thr Thr
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lu Ala 15
20
25CCT ACT GGT ACA TTT AT
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GGT AAA GAT ACT 692
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35
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70
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GCT GAA CAA ATC ACT AAA
TAT TCA GGC GAA GGT GAT
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80 8
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GCA ATA GTT AAA TTC TCC C
CT AAT GAG CAA AAC AAA CA
T ATT GGT 884Leu Ala
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Asn Glu Gln Asn Lys His I
le Gly 95
100
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GAA ACA CAA GTT 932
Glu Val Val Lys Pro Ala T
hr Met Ser Asn Asn Ala Gl
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115
120 12
5AAC CAA AAT ATT ACT GTA
ACA GGA TAT CCT GGT GAT A
AA CCT GTA GCA 980As
n Gln Asn Ile Thr Val Thr
Gly Tyr Pro Gly Asp Lys
Pro Val Ala
130 135
140ACA A
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A ATC ACT TAC CTC AAA GGC
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le Thr Tyr Leu Lys Gly Gl
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150
155ATG CAA TAT GAT
TTA AGT ACA ACT GGT GGT
AAT TCA GGT TCA CCT GTA
1076Met Gln Tyr Asp Le
u Ser Thr Thr Gly Gly Asn
Ser Gly Ser Pro Val
160 16
5 170TTT
AAT GAA AAA AAT GAA GTG A
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T GTA CCA 1124Phe Asn
Glu Lys Asn Glu Val Ile
Gly Ile His Trp Gly Gly V
al Pro 175
180
185AAT GAA TTT AAT GGT GC
G GTA TTT ATT AAT GAA AAT
GTA CGC AAC TTC 1172
Asn Glu Phe Asn Gly Ala V
al Phe Ile Asn Glu Asn Va
l Arg Asn Phe190
195
200 20
5TTA AAA CAA AAT ATT GAA
GAT ATC CAT TTT GCC AAC G
AT GAC CAA CCT 1220Le
u Lys Gln Asn Ile Glu Asp
Ile His Phe Ala Asn Asp
Asp Gln Pro
210 215
220AAT A
AC CCA GAT AAT CCT GAT AA
C CCT AAC AAT CCT GAT AAC
CCT AAC 1268Asn Asn
Pro Asp Asn Pro Asp Asn P
ro Asn Asn Pro Asp Asn Pr
o Asn 225
230
235AAC CCA GAT GAA
CCA AAT AAC CCT GAC AAC
CCT AAC AAC CCT GAT AAT
1316Asn Pro Asp Glu Pr
o Asn Asn Pro Asp Asn Pro
Asn Asn Pro Asp Asn
240 24
5 250CCA
GAC AAT GGC GAT AAC AAT A
AT TCA GAC AAT CCA GAT GC
A GCT 1361Pro Asp
Asn Gly Asp Asn Asn Asn
Ser Asp Asn Pro Asp Ala A
la 255
260 265
TAATTAACAA TTAAGTTCGT CTA
GATAAAA TAGAAGCAAA GTCTTA
GCAA CGTAAAATAT 1421TTT
GATTTAA ATGGAGGGTA TTATAT
GAAT AGTTCATGTA AATCTAGAG
T ATTCAATATT 1481ATAAGC
ATCA TAATGGTTTC AATGCTTAT
T TTATCACTAG GCGCATTTGC T
AATAACAAT 1541AAAGCCAAA
G CCGATTC
1558
【0104】
【配列番号:3】配列の長さ:17
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GTTTTCCCAG TCACGAC
17
17
【0105】
【配列番号:4】配列の長さ:17
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
CAGGAAACAG CTATGAC
17
17
【0106】
【配列番号:5】配列の長さ:27
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGGAATTCT AATTGTTCTT CGA
AACT
27
AACT
27
【0107】
【配列番号:6】配列の長さ:26
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGTCTAGAT ATTTTGCGTT GTT
AAG
26
AAG
26
【0108】
【配列番号:7】配列の長さ:27
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGTCTAGAG CAGCTGCACA ATA
ATAG
27
ATAG
27
【0109】
【配列番号:8】配列の長さ:26
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGAAGCTTG ACAGAGAACA GAG
AAG
26
AAG
26
【0110】
【配列番号:9】配列の長さ:27
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGCACGTGA TATTACCAAA TAA
CGAT
27
CGAT
27
【0111】
【配列番号:10】配列の長さ:24
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
CGCGAATTCG CCCCGCACAT ACG
A
24
A
24
【0112】
【配列番号:11】配列の長さ:24配列の型:核酸鎖
の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 CGCGCCGGCT GATGTTTTTG T
AAT
24
の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 CGCGCCGGCT GATGTTTTTG T
AAT
24
【0113】
【配列番号:12】配列の長さ:25
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
CGCGAATTCT CCGCAATTAT ATC
AT
25
AT
25
【0114】
【配列番号:13】配列の長さ:24
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
CGCTACGTAC GCATGTGCTA CGT
G
24
G
24
【0115】
【配列番号:14】配列の長さ:27
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGAAGCTTT AATTGTTCTT C
GAAACT
27
GAAACT
27
【0116】
【配列番号:15】配列の長さ:28
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGAAGCTTT ATAATACCCT CCA
TTTAA
28
TTTAA
28
【0117】
【配列番号:16】配列の長さ:26
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
CGAGAGCTCT AAAGGTAAAT TTT
TAA
26
TAA
26
【0118】
【配列番号:17】配列の長さ:27
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGGAATTCA AAGAACCGCT A
TGTCAG
27
TGTCAG
27
【0119】
【配列番号:18】配列の長さ:26
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGGAGCTCA TTTCCGATTA TTC
CCC
26
CCC
26
【0120】
【配列番号:19】配列の長さ:27
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
GAGCTCGAGC CCTCGCCAAG ATG
AAAC
27
AAAC
27
【0121】
【配列番号:20】配列の長さ:26
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
CACAGGCCTA GTGCTGATGC T
GTGTG
26
GTGTG
26
【図1】本発明のV8様プロテアーゼのDNA配列およ
び該配列から推定されるアミノ酸配列を示す配列図であ
る。
び該配列から推定されるアミノ酸配列を示す配列図であ
る。
【図2】図1の配列の続きであり,本発明のV8様プロ
テアーゼのDNA配列および該配列から推定されるアミ
ノ酸配列を示す配列図である。
テアーゼのDNA配列および該配列から推定されるアミ
ノ酸配列を示す配列図である。
【図3】図1および図2の配列の続きであり,本発明の
V8様プロテアーゼのDNA配列および該配列から推定
されるアミノ酸配列を示す配列図である。
V8様プロテアーゼのDNA配列および該配列から推定
されるアミノ酸配列を示す配列図である。
【図4】本発明のDNA配列がコードする成熟アミノ酸
のC末端付近のアミノ酸配列と,V8遺伝子がコードす
るアミノ酸配列のC末端付近のアミノ酸配列との比較図
である。
のC末端付近のアミノ酸配列と,V8遺伝子がコードす
るアミノ酸配列のC末端付近のアミノ酸配列との比較図
である。
【図5】本発明の発現ベクターpHY300V8Rの構
築を示す概略図である。
築を示す概略図である。
【図6】本発明の発現ベクターpHY300V8Rtt
の構築を示す概略図である。
の構築を示す概略図である。
【図7】本発明の発現ベクターpHY300BAAMY
V8ttの構築を示す概略図である。
V8ttの構築を示す概略図である。
【図8】本発明の発現ベクターpHY300BAAKP
SV8ttの構築を示す概略図である。
SV8ttの構築を示す概略図である。
【図9】本発明の発現ベクターpHYUBV8Rおよび
pHYUBV8Lの構築に用いるpHYUBの構築を示
す概略図である。
pHYUBV8Lの構築に用いるpHYUBの構築を示
す概略図である。
【図10】本発明の発現ベクターpHYUBV8Rおよ
びpHYUBV8Lの構築を示す概略図である。
びpHYUBV8Lの構築を示す概略図である。
【図11】本発明の発現ベクターpHY300CAHV
8の構築に用いるpCAH10の構築を示す概略図であ
る。
8の構築に用いるpCAH10の構築を示す概略図であ
る。
【図12】本発明の発現ベクターpHY300CAHV
8の構築を示す概略図である。
8の構築を示す概略図である。
【図13】本発明の発現ベクターpAM82SIGV8
の構築に用いるpGEM4(XhoI)の構築を示す概
略図である。
の構築に用いるpGEM4(XhoI)の構築を示す概
略図である。
【図14】本発明の発現ベクターpAM82SIGV8
の構築に用いるpGEMSIGの構築を示す概略図であ
る。
の構築に用いるpGEMSIGの構築を示す概略図であ
る。
【図15】本発明の発現ベクターpAM82SIGV8
の構築に用いるpGEM4SIGV8の構築を示す概略
図である。
の構築に用いるpGEM4SIGV8の構築を示す概略
図である。
【図16】本発明の発現ベクターpAM82SIGV8
の構築を示す概略図である。
の構築を示す概略図である。
Claims (12)
- 【請求項1】配列表1に示される+1位のValから+
289位のAlaまでのアミノ酸配列を含むプロテアー
ゼ。 - 【請求項2】配列表1に示される−68位のMetから
+289位のAlaまでのアミノ酸配列を含む請求項1
に記載のプロテアーゼ。 - 【請求項3】ポリペプチドのGlu残基のC末端を特異
的に開裂する,請求項1に記載のプロテアーゼ。 - 【請求項4】スタフィロコッカス アウレウス(St
aphylococcus aureus )ATCC
12600株由来である,請求項1に記載のプロテア
ーゼ。 - 【請求項5】請求項1に記載のプロテアーゼをコードす
るDNA配列。 - 【請求項6】配列表1の556位のGから1422位の
Aでなる塩基配列を有する,請求項5に記載のDNA配
列。 - 【請求項7】配列表1の352位のAから1422位の
Aでなる塩基配列を有する,請求項6に記載のDNA配
列。 - 【請求項8】請求項5に記載のDNA配列を有する発現
ベクター。 - 【請求項9】前記発現ベクターが,pHY300V8R
, pHY300V8Rtt, pHY300BAAM
YV8tt, pHY300BAAKPSV8tt,
pHYUBV8R, pHYUBV8L, pHY30
0CAHV8,またはpAM82SIGV8である,請
求項8に記載の発現ベクター。 - 【請求項10】請求項8に記載の発現ベクターを宿主に
導入して得られる形質転換体。 - 【請求項11】前記宿主が枯草菌または酵母である,請
求項10に記載の形質転換体。 - 【請求項12】請求項10に記載の形質転換体を培養す
る工程,および生産されたプロテアーゼを該培地から採
取する工程を包含する,プロテアーゼの製造方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2463391A JPH04211370A (ja) | 1990-02-20 | 1991-02-19 | 新規プロテアーゼ |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2-40398 | 1990-02-20 | ||
| JP4039890 | 1990-02-20 | ||
| JP2463391A JPH04211370A (ja) | 1990-02-20 | 1991-02-19 | 新規プロテアーゼ |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH04211370A true JPH04211370A (ja) | 1992-08-03 |
Family
ID=26362183
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2463391A Pending JPH04211370A (ja) | 1990-02-20 | 1991-02-19 | 新規プロテアーゼ |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH04211370A (ja) |
-
1991
- 1991-02-19 JP JP2463391A patent/JPH04211370A/ja active Pending
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