JPH04501357A - フラジルx症候群を検出するためのプローブ - Google Patents
フラジルx症候群を検出するためのプローブInfo
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
フラジルX症候群を検出するためのプローブ本発明は、核酸断片およびフラジル
X症候群(fragileX syndrome)の診断におけるそれらの使用
に関する。
フラジルX(マーチン−ベル; Martin−Bell )症候群(McKu
sickカタログ番号:30955)は精神遅滞と、大きな耳、楕円形の顔貌お
よび男性患者での巨大事実を含む身体異常により特徴づけられる(1.2)。
患者由来のリンパ球をチミジン欠損培地で培養すると、2−50%の細胞がXq
27.3にフラジルサイトを発現する(4.5)。男性の場合の0.6−1/1
000および女性の場合の0.2−0.6/1000の最近の罹患数は、フラジ
ルX症候群がダウン症候群後の精神遅滞の最も共通の遺伝的原因であることを示
唆する(6.7)。しかしながら、信頼できるキャリア検出およびこの障害の胎
児期診断は、リンパ球および羊水細胞におけるフラジルサイトの発現が変動する
ために、まだ利用できない(8,9,10)。遺伝学的カウンセリングもまた、
外見上表現型が正常な男性を介しての突然変異の継承およびヘテロ接合性の女性
での発現変動性ゆえに難しい状態にある(11.12.13)。
フラジルX症候群に関連したDNAマーカーが開示されているが、フラジルサイ
トから遠位にあるマーカーの順位決定は、マーカー同土間の組み換えと比較して
、マーカーとフラジルサイトとの組み換えがより高い頻度で起こるために、困難
であることが分かった(文献14−23)。いくつかの研究は順位FRAXA−
DXS52−F8−Xqterを支持しく 24.27 )、他の研究はFRA
XA−F8−DXS52−Xqterを支持する( 26.27)。比較的最近
になって、DXS134をF8およびDXS 15から分離する交差(cros
s−over )が見いだされた(28)、DXS52とDXS15の間のDX
S 134の物理的地図を考慮すると(29)、このデータからは順位DXS5
2−DXS134−DXS 15−F8か得られよう。最も接近した近位マーカ
ーDX398 (4D8)は0.03−0.06の組み換え率で連結しており(
23,30) 、一方遠位マーカーDXS52 (St 14)は組み換え率0
.10で連結される(17)。この領域での高頻度の単一および二重交差現象を
考えると、これらの遺伝子座は日常的な臨床使用に足りるだけの信頼がもてない
。
遺伝パターンの複雑性および近接して連結されたマーカーの欠如を回避するもの
である、フラジルX遺伝子座を同定するための1つの戦略は、X q 27−q
terの物理的地図を作成することである。これによりマーカー順位を決定的に
確立できかつ病気の遺伝子座を同定できる筈である。これまで、これらの遺伝子
座は約2メガベースDNA配列にわたる3つの非連結遺伝子群として物理的地図
が作成されている(29.31−34 )。
従って、約12メガベースであると概算された(32)、この領域の完全な物理
的地図は新しいDNA配列の単離を必要としている。
この度本発明者らは意外にも、フラジルサイトから遠位にあるがDXS52より
も近接して存在するIAIと呼ばれる新しい遺伝子座を発見した。このIAI遺
伝子座は制限断片長条型性(RF L P)を示し、そしてIAI遺伝子座は近
位側のDXS98と一緒になってフラジルX遺伝子座の有用な隣接マーカーを提
供するであろうことがさらに見出された。従って、IAI遺伝子座を検出できる
プローブはフラジルX症候群および多数の他のX染色体関連疾患、例えばX染色
体性繰うつ病、X染色体性精神分裂病、X染色体性双極疾患(bipolar
1llness ) 、エメリー・ドレフユース(Emery Dreifus
s)ジストロフィーおよび副腎ロイコジストロフィーの診断に有用であるだろう
(文献15参照)。この遺伝子座はF8、DXS52および色盲(CB)のよう
なこの領域のマーカーとして以前に報告されたものと相違している( 29.3
1−33 )。それゆえIAI遺伝子座検出用のプローブは付加的な診断用途を
有する。
それゆえ本発明は領域Xq27.3−DXS52でヒトX染色体と選択的にハイ
ブリダイズできる核酸断片を提供する。
本発明の断片は低または高緊縮条件下でXq27.3−DXS52領域とハイブ
リダイズでき、これらの条件下で他のヒト染色体DNAとハイブリダイズしない
という点で選択的であろう。この核酸断片はRNAであってもDNAであっても
よいが、後者が好適である。
より好ましくは、この断片は二本鎖DNAである。好ましくは、この核酸断片は
以下で定義されるIAI遺伝子座でハイブリダイズしよう。
プローブとして使用する場合、本発明の断片はヒトDNAとのハイブリダイゼー
ション後に検出可能であることが必要であり、これは任意の既知標識技法により
達成できよう。代表的には、プローブはオートラジオグラフィーによって検出で
きる放射性同位元素の、例えばニック・トランスレーションによる組み込みによ
り標識されよう。その他の標識方法には蛍光標識のような直接検出できる標識の
導入、および酵素標識のような間接的に検出できる標識の導入が包含される。
当業者はこれらおよび他の既知標識の導入並びにかかる標識の検出に必要とされ
る技法を熟知していよう。
従って、本発明は検出可能な標識が結合されている上記核酸断片を包含するプロ
ーブをも提供する。
IAI遺伝子座はワラジルXサイトとDXS52との間の少なくとも2Mbにわ
たる(しかし、DXS52遺伝子座と重ならない)X染色体の領域から成る。
制限酵素M1uL Notl、 NruIまたはSac l Iを用いて得られ
たヒトX染色体の消化物はいろいろなりNA断片を生成しく以下の実施例1に記
載される)、各断片はIAI遺伝子座とハイブリダイズする。それゆえ、lA1
遺伝子座は1種またはそれ以上の前記Mlul、 NotI。
Nru IおよびSac I !断片がハイブリダイズするヒトX染色体のX
q 27−qter領域の部分であると規定される。
前記MluI、 Notl、 NruIまたはSac I I断片はすべて本発
明による断片の例である。本発明による他の断片は、先に定義したIAI遺伝子
座とおよび/または1種またはそれ以上の前記M1uI、 NotI、 Nru
IまたはSac I I断片とハイブリダイズする核酸断片である。既知の技法
を使うことにより、本発明の断片はワラジルXサイトと先に定義したIAI遺伝
子座との間のヒトX染色体にハイブリダイズする別の断片を同定するのに使用で
きよう。
この種の断片の一部は1種またはそれ以上の前記MluI、 Notl、 Nr
ulまたはSac I r断片とハイブリダイズしよう。ワラジルXサイトとI
AI遺伝子座との間でハイブリダイズする断片の他のものは前記MluI、 N
otl。
NruIまたはSac I I断片のどれともハイリダイズしないであろうが、
それにもかかわらずそれらはIAI遺伝子座によりもワラジルXサイトに近い領
域を同定できるので、フラジルX疾患の診断に関しヒトX染色体を検索する上で
有用であろう。
本発明の別の断片はIAI遺伝子座とDXS52遺伝子座との間のヒトX染色体
とハイブリダイズする;この種の断片は前記Mlu1. Note、 NruI
またはSac I I断片とハイブリダイズするかもしれないし、しないかも知
れない。フラジルX疾患の診断におけるそれらの使用に加えて、ワラジルXサイ
トとIAI遺伝子座との間でハイブリダイズする本発明による断片は、他のX関
連遺伝子座の診断において更なる用途を有しうるし、また先に言及した他のX染
色体性疾患の診断にも使用できよう。本発明による断片はIAI遺伝子座とDX
S52疾患の間でハイブリダイズする。
ここに記載のハイブリダイゼーションは、ハイブリダイズ予定の断片を3xSS
C,O,1%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、10%デキストラン硫酸、お
よび1 x Denhardt溶液を含有する緩衝液中42°Cで混合し、次に
高または低緊縮緩衝液中65°Cで洗浄することにより実施される。SSCは0
.15M塩化ナトリウム、0.015Mクエン酸ナトリウム、pH7,0緩衝溶
液である。Denbardt溶液は0.02%ポリビニルピロリドン、0.02
%フィコール400、および0.02%ウシ血清アルブミン(BSA)である。
低緊縮緩衝液は3xSSCおよび0.1%SDSを含有するが、高緊縮緩衝液は
0.1xSSCおよび0.1%SDSを含有する。ここで用いる用語“ハイブリ
ダイゼーション”、“低緊縮”および“高緊縮”はこの通りに解釈されるべきで
ある。
本発明による断片はヒト染色体X1好ましくはX染色体のX q 27−qte
r領域を消化し、必要に応じて断片をクローニングし、そしてX q 27.3
とDXS 52の間で、例えばIAIでハイブリダイズできる断片を選択するこ
とにより得ることができる。当業者は先に定義した断片を作製するための消化、
クローニングおよびスクリーニングの実施に必要とされる技法を承知していよう
。
先に述べたように、本発明の核酸断片は特に検出可能な標識を担持する場合に、
フラジルX症候群の診断に使用できる。従って、本発明は潜在的にフラジルX症
候群にかかる危険のある個体からのDNAを、先に定義した核酸断片またはプロ
ーブと適当なハイブリッド形成条件下で接触させることから成るフラジルX症候
群の診断方法をも提供する。断片またはプローブのハイブリダイゼーションは慣
用技法により検出できる。
本発明の診断方法には、好ましくは、潜在的に危険のある個体の近いかまたは遠
い血縁者、特にその個体の祖父母、両親、おじとおば、兄弟姉妹および/または
子供からのDNAサンプルの同様のスクジー・ニングもさらに包含される。DN
Aサンプルは新しく得ることができるし、またはこの方法はガスジー(Guth
rie )試験の一部として誕生直後に得られたもののような保管物質にも適用
できる。フラジルX症候群の発生を示す症歴と結び合わせた、血縁者のこのよう
な試験を用いて、家系図を通して感受性DNAを追跡し、このようにして潜在的
に危険にさらされている個体が感受性X染色体骨は継いでもっているか否か判定
する。本発明の特定面においては、この診断方法はフラジルX症候群のキャリア
をスクリーニングするために、および/または危険にさらされている胎児を識別
するための胎児期スクリーニングとして実施される。
また、本発明による断片は先に述べた他のX染色体性疾患を診断するのにも同様
に使用できる。
本発明はさらに、先に定義した核酸断片またはプローブ、および1種またはそれ
以上の次の副成分:すなわち、核酸断片を標識するための1種以上の試薬;患者
のDNAを消化するための1種以上の制限酵素;消化を実施しかっ/またハイブ
リダイゼーション担体または支持体上へ消化DNAを負荷するための1種以上の
緩衝液;ハイブリダイゼーションを実施するためのハイブリダイゼーションフィ
ルターのような担体または支持体;ハイブリダイゼーションフィルターを洗うた
めの1種以上の緩衝液−低または高緊縮条件下でハイブリダイゼーションを実施
するための1種以上の緩衝液;先に定義したプローブを検出するための1種以上
の試薬;およびヒトDNAのフラジルX陽性および/または陰性サンプルおよび
/またはヒト以外のDNAサンプルのような対照試薬、並びに検出可能な標識か
らのシグナルを比較するための標準品;を含有するフラジルX症候群の診断試験
を実施するためのキットをも提供する。
ヒトX染色体のXAI遺伝子座は高度に保存された配列を有することが見いださ
れており、このことはlAl遺伝子座が1以上の機能遺伝子に相当することを示
している。IAIの遺伝子または遺伝子群が1種以上の蛋白をコードしておりそ
してこれらの蛋白は免疫原として使用する場合抗体を誘導しようことは当然予測
される。これらの遺伝子は慣用技法により単離および発現でき、そして遺伝子に
より発現された蛋白は公知方法によって抗体を生成させるために使用できる。
蛋白、および蛋白に対する抗体はそれら自体、フラジルX症候群の診断に使用で
きる。
従って、別の面においては本発明は、lAl遺伝子座に対応する遺伝子またはか
かる遺伝子に対応するCDNAのような、先に定義した本発明の核酸断片を1つ
またはそれ以上含有するクローニングおよび発現ベクター(この発現ベクターは
適宜に正しい位置、方向および読み枠で開始および終止シグナル、調節およびプ
ロモーター配列をさらに含有する);前記クローニングまたは発現ベクターで形
質転換された宿主細胞−発現ベクターを含有するかかる形質転換宿主細胞を培養
することにより発現されたポリペプチドまたは蛋白:かかるポリペプチドおよび
蛋白に対するポリクローナルおよびモノクローナル抗体、並びにかかる抗体を分
泌できるハイブリドーマのような抗体産生細胞;をも提供する。
本発明は添付図面を参照することによってさらに詳しく説明されよう:
図10体細胞ハイブリッドを使用したDNAの位置推定を示す。DNAt−Ps
t Iで消化した。プロットはAにおいては冷ヒトDNA競合物質と共に全I
AIコスミドと、BにおいてはサブフラグメントIA1.6とハイブリダイズさ
せた。A:1、全ヒトDNA ; 2、Xpter−Xqterを含有するヒト
/チャイニーズハムスターハイブリッド;3、チャイニーズハムスターDNA、
4、Xpter−Xq26を含有するヒト/マウスハイブリッド;5、Xq26
−qterを含有するヒト/マウスハイブリッド:6、Xp t e r−Xc
enを含有するヒト/チャイニーズハムスターハイブリッド。B:1.チャイニ
ーズハムスターDNA、2、ヒト男性DNA、3、ヒト女性DNA、4、Xq2
7−qterを含有するハイブリッドB17゜図2.A:正常個体のPstT消
化後に現れたIAIRFLP、(Qq、IAIの対立遺伝子)フラジルX家族に
おけるIAI RFLPの分離を示す。
図3.ヒト精子DNAのNru!消化を示す(トラック1および2)。パルスタ
イムおよび長さ。IAIとハイブリダイゼーション。ゲルは5C,100V、2
00Sで60時間操作した。
図4.異なる個体のEBVリンパ芽球細胞系から単離し、Notl消化しそして
IAI(AとC)およびF8 (BとD)とハイブリダイズさせたDNAのサザ
ンプロット分析を示す。プロットAおよびB:1、フラジルX男性;2、痙性対
麻痺男性患者;3、フラジルXキャリア女性;4、X:常染色体転座をもつ女性
;5、正常男性ワラジルXキャリア。プロットCおよびD:1,2、フラジルX
男性;3.5、正常女性;4、男性血友病患者;6、正常男性精子DNAサンプ
ル。
ゲルは50V、20分、パルスタイム5Cで130時間操作した。
図5.M1ul(A)およびSac I I (B)で消化して、IAIとハイ
ブリダイズさせた、EBVリンパ芽球細胞系から単離したヒトDNAのサザンプ
ロット分析を示す。A:1.5.6.7.9.1O111゜;2.1の祖母の祖
母;3、正常女性。B:l、2、正常男性;3.4.5、フラジルX男性;6、
正常女性;7、男性血友病患者:8、男性副腎を髄神経障害患者;9、トラック
10のフラジルX男性の祖母の祖母。ゲルは50V、20分のパルスタイム、1
0Cで130時間操作した。
本発明は以下の実施例を参照することにより説明さ本実施例では、フラジルサイ
トから遠位に存在する新しい遺伝子座IAIの遺伝子地図および物理的地図の作
成を説明する。本発明者らは、この遺伝子座がこの領域の物理的地図を少なくと
も2メガベースのDNA分延長させることを証明する。NotI消化物では、I
AIについて観察されたパルスフィールドゲルパターンが他の遠位マーカーと違
って個体間で変動する。
物質および方法
コスミドの単離 唯一のヒト成分としてヒトX染色体を含有するヒト/チャイニ
ーズハムスターハイブリッドDNAから作製したコスミドライブラリーをLTC
ベクター中に構築した(35)。このライブラリーを標準条件下にニック・トラ
ンスレートしたヒトゲノムDNAを使って低密度でスクリーニングし、0.1X
SSCを用いて65℃で洗った。陽性クローンを微量調製し、そして消化したコ
スミドDNAのサザンプロットをチャイニーズハムスターおよびヒトDNAにハ
イブリダイズさせて、ヒトX染色体配列の存在を確認した。
体細胞ハイブリッド ヒトX染色体のみのハイブリッドおよびX染色体の短腕を
含有するハイブリッドは以前に開示されている(36)。ヒトX染色体の長腕の
種々の領域を含有する体細胞ハイブリッドも使用された。2つの相反するマウス
/ヒトハイブリッドは細胞系GM3884.46、X、 t (X; 16)
(q26;q24)に由来する。一方は唯一のヒト染色体として誘導体Xを含有
し、他方は唯一のヒト染色体として誘導体16を含有する(37)、Xq27−
qterを含有する第三のハイブリッドは唯一のヒト染色体としてt (X:1
9)(Xqter−q24:19q13.2−pter)を含有する微小核ハイ
ブリッド系から照射により誘導された。このハイブリッドはF8C,DXS52
およびDXS 115を含めた既知のXq28マーカーをすべて含むが、DX3
98のようなフラジルXに近位のマーカーは何ら含まない(38;およびvan
0ost et al、未刊行)。
サザンブロツティング サザンプロット(39)は以前に記載された通りに実施
した(40)。コスミドはランダムブライミング(41)またはニック・トラン
スレーション(42)により標識し、熱変性し、そして熱変性および超音波処理
を行ったヒトDNA (1mg/ml)と2時間ブレインキュベートした。次に
混合物を適当なプロットを包含するハイブリダイゼーション緩衝液中に10倍希
釈した。フィルターは0.1xSSCを使って65°Cで洗った。
連結プログラム 2ポイントおよび多重ポイント計算のために、連結プログラム
を用いた(43.44)。
正常な家族はパリのthe Centre D’Etude du Polym
orphisme Humain (C,E、P、H,)から得られた。
プローブ 本発明者らはプローブの入手に対して次の人々に感謝する:5t14
(DXS52)(17)および55E (DXS105)(45)については
J−LMandel博士、R8(46)についてはJ、 Gitschier博
士、767 (DXS115)(45)についてはPearson教授、および
4D8(47)についてはR9Nussbaum博士。
パルスフィールドゲル電気泳動 これは以前に記載されたように六角形配置の電
極を使って実施した(33゜48)。アガロースブロック中でのDNAの酵素消
化は製造者の説明書に従って行い、Kenwrickら(49)に詳述されてい
る。
IAIの単離および位置推定
唯一のヒト成分としてX染色体を含有する体細胞ハイブリッド細胞系から構築さ
れたライブラリーを、ヒ)DNA配列を含有するコスミドを選択するために、全
ヒトDNAを使って低密度でスクリーニングした。
フラジルサイトの周囲のDNA配列マツピングはX;16転座をもつ細胞系由来
の2つのハイブリッドを含有する体細胞ハイブリッドパネルを使って位置推定し
た。一方のハイブリッドは誘導X染色体を含有し、他方は誘導染色体16を含有
していた。標識したコスミドを全ヒト競合DNAの存在下でプロットとハイブリ
ダイズさせた(方法を参照)が、試験したあらゆるコスミドに関して恐らく高レ
ベルの反復配列ゆえにシグナルが見られなかった。これらの条件下でうまくハイ
ブリダイズした1つの配列IAIは、X q 26−qterへのその局在を示
すシグナルを生じた(図IA参照)。
トラック2および5に見られるパターンは完全に同一というわけではなく、この
ことにより我々はPstIRFLPの可能性の研究をすることとなった(以下参
照)。この配列かフラジルサイトから遠位にあるかまたは近位にあるかを確立す
るために、コスミドIAIの単一コピー断片をXq27−Xqterを含有する
ハイブリッドB17由来のDNAとハイブリダイズさせた(方法を参照)。図I
Bの結果から、この断片はこのハイブリッドDNAで明確な陽性シグナルを生ず
ることが分かり、このことはB17 DNAで陰性シグナルを生ずる遺伝子座D
X398の遠位にIAIが存在することを示している。
IAIの遺伝子地図作成
IAIコスミドから単一コビーPstI断片を取り出し、種々の異なる制限酵素
で消化した正常個体からのDNAに対してハイブリダイズさせた。IAl、1と
名づけた1つの特定の断片は試験した白色人種集団においてPstl制限断片長
多型性(RFLP)を示した。対立遺伝子(5,2kbのバンドまたは2.9お
よび2.3kbでの2本のバンド)を図2に示す。
試験した女性の35%はIAI位置でヘテロ接合性であった。
本発明者らが以前にXq26−qter領域における他のマーカーを使って分類
したC、 E、 P、 H、パネルからの正常DNAをIAI多型注型性いて分
類した。2ポイントロツドスコアが表1に示しである。
(本頁以下余白)
多重ポイント分析は、最もありそうな順位のうちで、順位Xcen−DXS10
5−IAI−DXS52−F2O−DXSI l 5−XqterがDXS10
5−DXSI 15−F2O−DX52−IAI−Xqterの2倍ありそうで
あることを示唆している。RFLPが一家族で情報を得られたにすぎなかったの
で、DXS98について有意義なデータは得られなかった。
また、IAIをフラジルX家族に対しても試験した。
2ポイントロツドスコアを表1に示す。この家族および他の家族のデータは、フ
ラジルサイトから遠位にあるがDXS52には近位にあるIAIの位置推定が一
致している(位置スコアxxxx)。
パルスフィールドゲル電気泳動実験
パルスフィールドゲル電気泳動実験は、分子量範囲800−2000kbのバン
ドを分離できるような方法で記載の通りに行った。得られた結果の例を図3に示
す。IAIはヒト精子DNAのNruI消化物中の1.2メガベース(Mb)の
バンドを識別する(図3)。
このIAI断片はF8およびDXS52並びに色盲(CB)のようなこの領域の
マーカーについて以前に報告されたものと相違している(29.3l−33)。
IAIに関する特異な発見は、異なる個体のNotI消化後に観察されるバンド
サイズの変動である(図4A)。これは、F8にハイブリダイズした同じプロッ
トが全ての個体において同じ分子量バンドを生ずるので、ゲルの人工産物ではな
い(図4B)。このパターンはまたゲル間で再現性がある。同一個体からの精子
およびリンパ球DNAのサンプルは同一のバンドパターンを生ずる(データは示
さず)。遺伝子解析においてはフラジルサイトにIAIが近接していることを考
慮して、本発明者らはフラジルX陽性の男性および女性におけるIAI Not
Iパターンも研究した(図4Aのトラック1.3および5、図4Cのトラック1
および2)。正常な個体ばかりでなく、血縁関係のないフラジルX陽性の男性に
おいても変動が観察される。N0tl消化後、IAIは約0.85Mb、1.2
Mbおよび1.4Mbの3つの異なるバンドのすべてを検出する。2本のバンド
が往々にして男性にも女性にも見られ、このことはこのパターンが断片長条型性
によって生ずるのではなく、むしろ制限酵素部位の可変的なメチル化によって生
ずることを示唆している。
また、IAIにハイブリダイズさせたヒトDNAのMluI消化物も可変的なパ
ターンを示し、このパターンはフラジルX陰性および陽性の両方の個体に現れる
(図5A)。この実験では、本発明者らはまた、細胞の増殖状態がゲルパターン
を変化させるかどうか調べるために、その増殖状態について検べた。図5Aのト
ラック5および6(それぞれ初期および後期対数期に細胞を収穫した)から分か
るように、バンドパターンは同一である。
個体の5acII消化物もIAIにハイブリダイズさせた場合に数本のバンドを
示す。しかしながら、この場合、観察されたバンドパターンは全てのサンプルに
おいて類似している(図5B)。(わずかな見掛は上の変動は負荷人工産物のた
めと考えられる)。
IAIによって検出された断片はどれも、この領域で以前に地図作成がなされた
遺伝子座に関して観察されたものと重複しない。例えば、IAI、DXS52お
よびF2Oに対するN0tI断片はそれぞれ1. 2Mb、1.0Mbおよび1
.8Mbである。従って、IAIはDXS52と物理的に別個の遺伝子座である
。
PFGEバンドのどれも最も接近した近位マーカーDXS98に関して観察され
たバンドと重複しない(Be11 and DaVieS、未発表の観察)。
考察
本発明者らは、ヒトX染色体の長腕の末端小粒領域の種々の部分を含有する体細
胞ハイブリッドを用いて、DNA配列IAIを領域Xq27−qterに局在決
定した。従って、IAIはフラジルX症候群の分離(segregation
)分析のための有用な新しいマーカーであろう。C,E、 P、 H,家族での
IAIの遺伝子解析は、IAIとDXS52およびF2Oの両方(Xq27゜3
のフラジルサイトに最も接近した遠位マーカー)との密接な連結を示している。
これらの正常家族におけるデータの多重ポイント分析は、IAIがDXS 52
およびF2Oの近位に存在する順位支持している。lAlと、DXS105 (
55E)のようなXq26/q27のマーカーとの間には、これらの家族のフラ
ジルサイト領域を横断する密接な連結が観察されない。
フラジルX家族では、IAIとDXS52間の密接な連結が再び観察される。マ
ーカーの分離の多重ポイント分析は、IAIがDXS52の近位に存在するとい
う正常家族から示唆された順位を支持している。
集団での高頻度のIAI RFLPを考えると、IAIは近位側のDXS98と
一緒になってフラジルX遺伝子座のための有用な側面マーカーである筈である。
また、この遺伝子座はX染色体性双極疾患、エメリー・ドレフユースジストロフ
ィーおよび副腎ロイコジストロフィーのような、DXS52と密接に関連するこ
とが分かっている他の症候群の研究にも有用であろう(文献15参照)。
PFGEを使った物理的地図作成実験は、IAIが以前に報じられた遺伝子座と
重複しないXq27の新しい領域を規定することを示している(29.3l−3
4)。用いたプローブにより検出された最大断片から誘導されたNotI地図を
以下に要約する:FRAXA −IJl−DXS52. DxS33. DX!
;15− G6PD、 FB、 Dxsl15− XqtarWb l−21,
00,30,!、、2色盲プローブにより検出された最大NotI断片は300
kbより小さい(32,50)が、この遺伝子座は上に示した他の遺伝子座に対
して順位が規定されていない。
このように、IAIは物理的地図をかなり延長させる。IMbより大きいバンド
が酵素Not I、NruI、Mlu!および5acIIに関して観察されると
いう事実にもかかわらず、重複する断片がI A、 1とDXS52の間に見ら
れない。IAIにより同定された最大M 1 u Iバンドは、最も接近した隣
接遺伝子座DXS52(ヒトDNAのMlul消化物中の約550kbの部分消
化物バンドを検出する)と重複しない2Mbにわたって広がっている(31)。
図5Aのフィルターと同じフィルターにハイブリダイズしたDXS52はどの高
分子量バンドともハイブリダイズしない。
IAIによるPFGE実験では常に多重バンドパターンか得られ、このことはX
q27/28のこの領域での個体間の可変的なメチル化度を示している。これら
のバンドパターンは各個体のDNAサンプルにおいて再現性がある。DNAを5
acIIで消化した後のプロット中に数本のバンドが得られたということは特に
注目に値する。本発明者らの経験では、多くの5acII部位はHTF島中の非
メチル化CpGジヌクレオチドと関係があるという観察と一致して、この酵素は
試験したこの領域の他の全ての遺伝子座の付近においてほぼ完全な消化を常にも
たらしている(51)。
IAIは認識部位中にCpGをもつ数種の酵素に対して大きい断片(1メガベー
スまたはそれ以上)を生ずる。それ故に、IAIはF2O,G6PDおよびDX
S52と比べて相対的にCpGリッチでない領域に存在する。ゲノム構造に関す
るこの観察の生物学的意義はまだ解明されないでいる。近年、GCリッチ領域は
Aiu配列を含有する可染色Gバンドと関連があることが示されており(52)
、IAIは暗染色バンドXq27内に存在するのかもしれない。他方では、IA
IはXq28内の異なる機能を有する領域を規定するのかもしれない。この疑問
を解くためには、更なる物理的地図作成が必要とされよう。
Mlu!およびNotIの場合に見られたサイズの変動は数百kbの準位であり
、断片長条型性と一致しない。M 1 u I消化物において比較的小さいバン
ドを生ずる個体はNotI消化物で最小のバンドを必ずしも生じず、その逆も言
える。いくつかのNotl消化男性および女性DNAサンプルでは、主要ハイブ
リッド形成バンドのほかに、弱いバンドが可視化できよう。
それゆえこのパターンはXq27/28のこの領域でのCpG部位の異なるメチ
ル化のためであると思われる。La1rd (53)はフラジルX症候群で観察
される分離パターンを説明するためにインプリンティング理論(imprint
ing theory )を最近提案し、メチル化がこのインプリンティングが
達成されうる1つの手段でありうることを示唆した。ここに記載された実験は、
活性X染色体メチル化パターンを保持していないがもじれないEBV系において
行われた。現在、本発明者らは、いずれにしてもフラジルX症候群の表現型発現
およびXq27.3でのフラジルサイトの細胞遺伝学的発現にIAIメチル化多
化性型性係しているがどうか調べるために、パルスフィールドゲル実験に適する
フラジルX患者のリンパ球由来のDNAサンプルを収集している。
説明と実施例1のための文献
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ρCT/GB 89101303
Claims (15)
- 1.領域Xq27.3−DXS52でヒトX染色体と選択的にハイブリダイズし うる核酸断片。
- 2.高緊縮条件下でハイブリダイズしうる、請求項1記載の断片。
- 3.請求項1または請求項2に記載の二本鎖DNA断片。
- 4.1A1遺伝子座でハイブリダイズする、請求項1−3のいずれか1項記載の 断片。
- 5.請求項1−4のいずれか1項記載の断片およびそれに結合した検出可能な標 識を含んで成る核酸プローブ。
- 6.標識が放射性標識、蛍光標識または酵素標識である、請求項5記載のプロー ブ。
- 7.潜在的にフラジルX症候群または他のX染色体性疾患にかかる危険のある個 体からのDNAを、請求項1−5のいずれか1項に記載の核酸断片またはプロー ブと適当なハイブリッド形成条件下で接触させることから成る、フラジルX癌候 群または他のX染色体性疾患の診断方法。
- 8.フラジルX症候群を診断するための、請求項7記載の方法。
- 9.X染色体性躁うつ病、X染色体性精神分裂病、X染色体性双極疾患(bip olarillness)、エメリー・ドレフュース(EmeryDreifu ss)ジストロフィーまたは副腎ロイコジストロフィーを診断するための、請求 項7記載の方法。
- 10.請求項1−6のいずれか1項記載の核酸断片またはプローブ、および1種 またはそれ以上の次の副成分:核酸断片を標識するための1種以上の試薬;患者 のDNAを消化するための1種以上の制限酵素;消化を実施しかつ/またハイブ リダイゼーション担体または支持体上へ消化DNAを負荷するための1種以上の 緩衝液;ハイブリダイゼーションを実施するための担体または支持体;ハイブリ ダイゼーションフィルターを洗うための1種以上の緩衝液;低または高緊縮条件 下でハイブリダイゼーションを実施するための1種以上の緩衝液;先に定義した プローブを検出するための1種以上の試薬;ヒトDNAのフラジルX陽性および 陰性サンプル並びにヒト以外のDNAサンプルから選ばれた1種以上の対照試薬 ;および検出可能な標識からのシグナルを比較するための1種以上の標準品;を 含有するフラジルX症候群または他のX染色体性疾患の診断試験を実施するため のキット。
- 11.請求項1−4のいずれか1項記載の核酸断片を1つまたはそれ以上含有す るクローニングまたは発現ベクターであって、該発現ベクターが適宜に正しい位 置、方向および読み枠で開始および終止シグナル、調節およびプロモーター配列 をさらに包含する、上記のクローニングまたは発現ベクター。
- 12.請求項11記載のクローニングまたは発現ベクターで形質転換された宿主 細胞。
- 13.請求項11記載の発現ベクターで形質転換された宿主細胞を培養すること により得られたポリペプチドまたは蛋白。
- 14.請求項13記載のポリペプチドまたは蛋白に対するポリクローナルまたは モノクローナル抗体。
- 15.請求項14記載の抗体を分泌できる抗体産生細胞。
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