JPH06501844A - candida control - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。 (57) [Summary] This bulletin contains application data before electronic filing, so abstract data is not recorded.
Description
【発明の詳細な説明】 カンジダ抑制 発明の分野 本発明はカンジダ感染用の診断、研究試薬および治療に関する。より詳細には本 発明は特定のカンジダメツセンジャーリボ核酸と相互反応するアンチセンスオリ ゴヌクレオチドに関する。特に、アンチセンスオリゴヌクレオチドはβ−チュー ブリン、アクチン、キチン合成酵素およびアスパギン酸プロテアーゼタンパク質 をコードするカンジダmRNAとハイブリダイズするように設計される。その他 のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、リポゾームL25タンパク質、翻訳延長 因子1および2(TEFlおよびTEF2) 、ATPageのbサブユニット およびシトクロームP450ラノステロール14ff−デメチラーゼ(LLAI )をコードするカンジダlllRNAに特異的にハイブリダイズするように設計 される。これらのオリゴヌクレオチドはカンジダRN^またはDNAの活性を変 調させること、即ちカンジダ感染の変調を導くことが見いだされた。緩和および 治療効果を生じる。[Detailed description of the invention] candida control field of invention The present invention relates to diagnostic, research reagents and treatments for Candida infections. More details in the book The invention relates to antisense oligonucleotides that interact with specific Candida senger ribonucleic acids. Concerning gonucleotides. In particular, antisense oligonucleotides Bulin, actin, chitin synthase and aspartic protease proteins is designed to hybridize with Candida mRNA encoding. others The antisense oligonucleotide of liposomal L25 protein, translation elongation Factors 1 and 2 (TEFl and TEF2), b subunit of ATPage and cytochrome P450 lanosterol 14ff-demethylase (LLAI ) designed to specifically hybridize to Candida lllRNA encoding be done. These oligonucleotides alter the activity of Candida RN^ or DNA. was found to lead to the modulation of Candida infection. relaxation and produce a therapeutic effect.
発明の背景 免疫無防備状態にある宿主での日和見感染は増大する重要な死亡率および罹患率 の症例を現す。カンジダ種は最も通常の種であるカンジダアルビヵン種((an dida albicans)の中の最も通常の真菌病原菌であるが、感染した 個体中にはカンジダトロピカリス(tropicalis)、カンジダクルセイ (Krusei)、カンジダゲラブラタ(glabrataX トルボシスグラ プラタ: Torulopsis glabrata)およびカンジダパラブシ ロシス(parapsilosis)もまた見いだされた。カンジダは種々の院 内感染の原因である。カンジダ感染の型および激しさに関する一般的な総説はモ イナー(Meunier、 F6. )Eur、 !、 Cl1n、 Micr obiol、 Infect、 Dis、 8 : 438−447(AW9) またはラデンッ(R adentz、 W、 、 )!、 A11. Acad、 Derm、 20 :989−1003を参照のこと。ガン患者、特に白血病患者はカンジダ感染の 高い危険性にある。全白血病患者の最高30%において検視の際にカンジダの侵 入の証拠が示される。種々の固形腫瘍をもつガン患者も日和見感染の危険性があ る。より大量の外科的および新規免疫療法の利用でのガン治療における改善では 、カンジダに感染して治療を必要とする非−末期書1者の数を増やすという結果 を生じた。Background of the invention Opportunistic infections in immunocompromised hosts are a significant source of increased mortality and morbidity A case of Candida species are the most common species, Candida albicans species ((an dida albicans), but is the most common fungal pathogen in infected Among the individuals, Candida tropicalis, Candida krusei (Krusei), Candida glabrata (Krusei), Candida glabrata Plata: Torulopsis glabrata) and Candida parabusi parapsilosis was also found. Candida is found in various It is a cause of internal infection. A general review of the types and severity of Candida infections Meunier (Meunier, F6.) Eur! , Cl1n, Micr obiol, Infect, Dis, 8: 438-447 (AW9) Or Raden (R) adentz, W,, )! , A11. Acad, Derm, 20 :989-1003. Cancer patients, especially leukemia patients, are at risk for Candida infections. At high risk. Candida infestations are detected at autopsy in up to 30% of all leukemia patients. Evidence of entry will be shown. Cancer patients with various solid tumors are also at risk for opportunistic infections. Ru. Improvements in cancer treatment with higher doses of surgery and use of novel immunotherapies The result is an increase in the number of non-terminally ill people who are infected with Candida and require treatment. occurred.
カンジダおよび日和見感染の危険性にあるもうひとつの群はAIDSの集団であ る。Another group at risk for candida and opportunistic infections is the AIDS population. Ru.
AIDS、ili、者においてはカンジダは口咽頭感染の問題がある。火傷叡者 、I、V薬剤使用者、カテーテルを有する者、および未成熟新生児も、すべてカ ンシタによる感染の疑いがある。Candida is a problem in oropharyngeal infections in people with AIDS. burn victim , I, V drug users, those with catheters, and premature neonates are all included in the category. There is a suspicion that the infection was caused by the virus.
カンシタは非−免疫無防備宿主においても問題である。正常成人女性において、 カンニンダは外陰膣炎の原因である。外陰に感染した圧倒的に大多数の酵母はカ ンシタ アルビカンス(Candida albicans)の単離物である。Cancita is also a problem in non-immunocompromised hosts. In normal adult women, Canninda is the cause of vulvovaginitis. The overwhelming majority of yeast infections in the vulva are mosquitoes. It is an isolate of Candida albicans.
この問題は妊娠によって一層悪化し、避妊薬の使用または疾患状態においては抗 生物質の使用が必要であり、これらすべてはカンジダの感染の可能性を増大させ る。This problem is exacerbated by pregnancy and the use of contraceptives or in disease states. The use of biological agents is necessary, all of which increase the likelihood of Candida infection. Ru.
現在カンジダ感染を扱うための数種の薬剤が使用されている。アンホテリシンB はカンシタの全身感染に関する標準的な治療であると一般的に考えられている。Several drugs are currently in use to treat Candida infections. Amphotericin B is generally considered to be the standard treatment for systemic infections of Cancita.
しかし、アンチセンスBは多くの激しい副作用を有しており、そのなかの幾つか は患者の肝臓および腎臓に決定的な障害を引き起こす。さらに、アンホテリシン Bの効力には限界があり、治療がいつも感染の排除をもたらさない。それゆえに 、カンジダ感染を抑制する効果はあるが、毒性の副作用を宿主に引き起こさない 薬剤に対する大きな要望がある。アンチセンスオリゴヌクレオチドはカンジダ感 染の治療剤として大きな見込みをもつ。以前アンチセンスオリゴヌクレオチドで カンジダを抑制する試みがあった。従って、治療の使用に効果のあるオリゴヌク レオチド類似体の設計について長い間の要望が引き続き存在している。However, antisense B has many severe side effects, some of which are causes definitive damage to the patient's liver and kidneys. Additionally, amphotericin B has limited efficacy and treatment does not always eliminate the infection. Hence , is effective in suppressing Candida infections but does not cause toxic side effects in the host. There is a great demand for drugs. Antisense oligonucleotides can cause candida It has great promise as a therapeutic agent for cancer. Previously with antisense oligonucleotides There have been attempts to suppress candida. Therefore, oligonucleotides effective for therapeutic use There continues to be a long-standing need for the design of leotide analogs.
発明の目的 本発明の目的はメンセンシャーRNAの機能を阻害するためにカンジダのメツセ ンツヤ−RNAとハイブリダイゼーションできるオリゴヌクレオチドおよびオリ ゴヌクレオチド類似体を提供することである。Purpose of invention The purpose of the present invention is to inhibit the function of Candida menssencher RNA. oligonucleotides and oligonucleotides that can hybridize with An object of the present invention is to provide oligonucleotide analogs.
さらに真菌のメツセンジャーRNAとのアンチセンス相互反応を介してカンジダ の発現を変調できるオリゴヌクレオチドおよび類似体を提供することがさらなる 目的である。In addition, Candida albicans can be detected through antisense interaction with fungal Metsenger RNA. It is further desirable to provide oligonucleotides and analogs that can modulate the expression of It is a purpose.
さらに本発明の目的は、動物のカンジダに関する診断および治療法を提供するこ とである。カンジダを含有すると疑われる試料中のカンシタの存在の有無を検出 する方法、物質およびキットの提供することが本発明のさらなる目的である。A further object of the present invention is to provide diagnostic and therapeutic methods for Candida in animals. That is. Detects the presence or absence of Candida in a sample suspected of containing Candida It is a further object of the present invention to provide methods, materials and kits for the methods.
新規オリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド雇似体は本発明の他の目的で ある。Novel oligonucleotides and oligonucleotide mimics may be used for other purposes of the invention. be.
これらのおよび他の目的は本明細書および添付の請求の範囲から当業者にとって 明らかなものとなろう。These and other objects will be apparent to those skilled in the art from this specification and the appended claims. Let it be obvious.
発明の概要 本発明によれば、少なくともカンジダのRNA由来の一部分と特異的にハイブリ ダイズするオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体が提供される。Summary of the invention According to the present invention, it is possible to specifically hybridize with at least a portion of RNA derived from Candida. Oligonucleotides and oligonucleotide analogs are provided.
オリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は好ましくはカンジダRN Aと直接結合するように設計される。Oligonucleotides and oligonucleotide analogs are preferably Candida RN Designed to combine directly with A.
この関係は通常”アンチセンス”と言われている。オリゴヌクレオチドおよびオ リゴヌクレオチド類似体はRNAの機能を阻害できる−それはそのタンパク質へ の翻訳、またはその細胞質への転移、またはその全生物学的機能に必要な任意の 他の活性のいずれかである。RNAがすべての、または部分的なその機能を行え ないということは、真菌の正常な生活環を制御するゲノムの部分の欠損を引き起 こす。This relationship is commonly referred to as "antisense." Oligonucleotides and oligonucleotides Ligonucleotide analogs can inhibit the function of RNA - it affects its proteins any necessary for its translation, or its translocation into the cytoplasm, or its entire biological function. Any other activity. RNA can perform all or part of its functions Absence causes defects in parts of the genome that control the normal life cycle of the fungus. Rub.
アンチセンスオリゴヌクレオチド攻撃に関して、カンジダRN^の特異的部分を 標的とすることが好ましいと見いだされた。β−チューブリン、アスパラギン酸 プロテアーゼ、アクチンおよびキチン合成酵素をコードする遺伝子がこの研究に 特に有用であることが発見された。リボゾームL25タンパク質、翻訳延長因子 1および2(TEFIおよびTEF2)、ATPageのbサブユニットおよび シトクローム?45Gラノステロール14a−デメチラーゼ(LIAI)ををコ ードする遺伝子もまた特に有用である。これらのタンパク質に関連するmRNA の翻訳を阻害することはカンジダ感染の治療に関して有用になると期待される。Regarding antisense oligonucleotide attack, specific parts of Candida RN^ It has been found preferable to target β-tubulin, aspartic acid Genes encoding protease, actin and chitin synthase were used in this study. It has been found to be particularly useful. Ribosomal L25 protein, translation elongation factor 1 and 2 (TEFI and TEF2), the b subunit of ATPage and Cytochrome? 45G lanosterol 14a-demethylase (LIAI) Also particularly useful are genes encoding. mRNA associated with these proteins It is expected that inhibiting the translation of Candida will be useful in the treatment of Candida infections.
動物を真菌の核酸とハイブリダイズできるオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌク レオチド類似体に接触させることから成るカンジダ感染を変調させる方法が提供 される。オリゴヌクレオチドまたは類似体はβ−チューブリン、アスパラギン酸 プロテアーゼ、アクチンおよびキチン合成酵素タンパク質をコードするmRNA とハイブリダイズできることが好ましい。オリゴヌクレオチドまたは類似体はり ボゾームL25タンパク質、TEFIおよびTEF2、ATPaseのbサブユ ニットおよびシトクロームP450 LIAIとハイブリダイズできることもま た好ましい。Oligonucleotides and oligonucleotides that allow animals to hybridize with fungal nucleic acids Provided is a method of modulating Candida infection comprising contacting with a leotide analog be done. Oligonucleotides or analogs β-tubulin, aspartic acid mRNA encoding protease, actin and chitin synthase proteins It is preferable that it can be hybridized with. Oligonucleotide or analogue beam Bosomal L25 protein, TEFI and TEF2, the b subunit of ATPase It is also possible to hybridize with Knit and cytochrome P450 LIAI. It is preferable.
図面のIIFI!な説明 図1はカンジダアルビカンス(9三中ia albicans)のβ−チューブ リン遺伝子の配列である。IIFI of drawings! explanation Figure 1 shows the β-tube of Candida albicans (Ia albicans) This is the sequence of the phosphorus gene.
図2AおよびBは05(^)および1.0μM (B)のオリゴヌクレオチド投 与でのカンジダ発芽管形成に関するアンチセンスオリゴヌクレオチドの効果を表 すグラフである。Figures 2A and B show oligonucleotide injections of 05 (^) and 1.0 μM (B). The effects of antisense oligonucleotides on Candida germ tube formation in This is a graph.
発明の詳細な説明 アンチセンスオリゴヌクレオチドは多くのヒトの疾患に関する治療剤として大き な見込みを持つ。オリゴヌクレオチドはワトンンークリック塩基対によって定義 されるように前−mRNAまたは成熟mRN^のいずれかの相補配列に特異的に 結合して、DNAからタンパク質への遺伝情報の流れを阻害する。多(の最近の 研究では、標的タンパク質を研究するための生化学学的道具としてのアンチセン スオリゴヌクレオチドの有用性が実証されている。ローセンバーブら(Roth enberg et al、 、 )ゼ耐性オリゴヌクレオチドの合成、増大さ れた細胞の取り込みを表すオリゴヌクレオチド類似体型の可能性により、今治療 の新規形態としてアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用を考えることが可能で ある。Detailed description of the invention Antisense oligonucleotides have become important therapeutic agents for many human diseases. have good prospects. Oligonucleotides are defined by Watton-Crick base pairs specifically for the complementary sequence of either the pre-mRNA or the mature mRNA^ It binds and blocks the flow of genetic information from DNA to proteins. Many (recent In research, antisensor as a biochemical tool to study target proteins. The utility of oligonucleotides has been demonstrated. Rothenbarb et al. enberg et al.) Synthesis and enhancement of enzyme-resistant oligonucleotides The potential of oligonucleotide analogues for cellular uptake now makes therapeutic use possible. It is possible to consider the use of antisense oligonucleotides as a new form of be.
治療についてはカンジダ感染を有すると疑われる動物は本発明のオリゴヌクレオ チドまたはオリゴヌクレオチド類似体を投与されることにより処置される。当業 者は容易に至適投与量、投与方法および反復割合を決定できる。そのような処置 は一般的に治癒効果があるまで、あるいは疾患状態の減少が達成されるまで続け られる。Regarding treatment, animals suspected of having a Candida infection should be treated with the oligonucleotides of the present invention. or oligonucleotide analogues. skilled in the art Those skilled in the art can readily determine optimal dosages, dosing methods and repetition rates. such treatment is generally continued until a curative effect or until a reduction in disease status is achieved. It will be done.
異種からの、ならびに同一種の異なる型からのカンジダのDNAにおいて、差異 が存在すると予想される。例えば、種々のカンジダ種の領域は、各種に関して本 質的に同じ機能として役立ち、ならびに遺伝情報の発現の妨害は種々の種におい て同様な結果を生じるものと思われる。疑い無く種間のヌクレオチド配列に差異 が存在してもそうである。Differences in Candida DNA from different species as well as from different types of the same species is expected to exist. For example, the area of various Candida species is serve qualitatively the same functions, as well as interference with the expression of genetic information in different species. It is thought that similar results will be produced. There are undoubtedly differences in nucleotide sequences between species. This is true even if there exists.
従って、本明細書で説明するヌクレオチド配列は記載された特定種に関し描写し たものであると理解されるであろう。カンジダの異なる種についてのホモロガス またはアナロガスな配列は本発明の観点に含まれること特に意図するものである 。Accordingly, the nucleotide sequences described herein are not depicted with respect to the specific species described. It will be understood that Homologues for different species of Candida or analogous arrangements are specifically intended to be included within aspects of the present invention. .
本発明はカンジダRN^の機能をアンチセンス阻害するために使用するオリゴヌ クレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体を使用する。本発明の文脈において 、”オリゴヌクレオチド”とは天然に存在する塩基から形成されたポリヌクレオ チドをいい、天然のホスホジエステル結合で結合したペントフラノシル基である 。この用語は天然に存在する種または天然に存在するサブユニットまたはそれら の近似した相同体から形成された合成種を効果的に言う。The present invention provides oligonucleotides used for antisense inhibition of the function of Candida RN^. Using cleotide and oligonucleotide analogs. In the context of the present invention , "oligonucleotide" is a polynucleotide formed from naturally occurring bases. It is a pentofuranosyl group linked by a natural phosphodiester bond. . The term refers to naturally occurring species or naturally occurring subunits or effectively refers to a synthetic species formed from close homologs of.
”オリゴヌクレオチド類似体”として本発明との関連において使用される用語は 、オリゴヌクレオチドと同様に機能する一部分であるが天然には存在しない部分 を言う。例えばオリゴヌクレオチド類似体は改変した糖部分または内部−糖結合 を有してもよい。これらの例としては、ホスホロチオエートおよび他の硫黄−含 有種として当業界で知られているものがあげられる。いくつかの好適な態様によ ればオリゴヌクレオチドの少なくともいくつかのホスホジエステル結合が、活性 を変調されるRNAまたはDNAが存在する細胞の領域への組成物の浸透能力を 増強させるように機能する構造に置換された。そのような置換はホスホジエステ ル結合、メチルホスホネート結合または短鎖アルキル、またはシクロアルキル構 造から成ることが好ましい。その他の好適な態様によれば、ホスホジエステル結 合は同時に、実質的に非−イオン性かつ非−キラル性である構造、またはキラル かつ鏡像異性的に特異的である他の構造に置換される。当業者は本発明の実施に 使用するためにその池の結合を選択することができるだろう。The term "oligonucleotide analog" used in the context of the present invention is , a part that functions similarly to an oligonucleotide but does not exist in nature say. For example, oligonucleotide analogs may have modified sugar moieties or internal-sugar linkages. It may have. Examples of these include phosphorothioates and other sulfur-containing Examples include those known in the art. According to some preferred aspects If at least some phosphodiester bonds in the oligonucleotide are active modulates the ability of the composition to penetrate into areas of the cell where the RNA or DNA is present. Replaced with a structure that functions to enhance. Such substitutions are phosphodiester methylphosphonate linkage or short chain alkyl, or cycloalkyl structure. Preferably, it consists of a structure. According to another preferred embodiment, the phosphodiester linkage At the same time, structures that are substantially non-ionic and non-chiral, or chiral and is substituted with other structures that are enantiomerically specific. Those skilled in the art will be able to carry out the invention. You would be able to select that pond combination to use.
オリゴヌクレオチド類似体は少な(ともいくつかの修飾塩基形を含む種を含んで もよい。例えば、天然に存在する以外のプリンおよびピリミジンをそのように使 用できる。同様にヌクレオチドサブユニットのペントフラノシル部分上の修飾は 本発明の本質的教示に付随する限り生じることができる。Oligonucleotide analogs include species that contain fewer (and some modified base forms) Good too. For example, such use of purines and pyrimidines other than naturally occurring Can be used. Similarly, the modification on the pentofuranosyl moiety of the nucleotide subunit is This may occur as long as it adheres to the essential teachings of the invention.
そのような類似体は、天然オリゴヌクレオチド(または天然系に沿って合成され たオリゴヌクレオチド)と機能的に内部交換可能であると最も良く記載されてい るが、天然構造とはひとつまたはそれ以上の差異を有する。すべてのそのような 類似体は、カンジダRN^と効果的にハイブリダイズできるかぎり本発明により 包含される。本発明のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は、 約3から約50核酸塩基単位から成る。そのようなオリゴヌクレオチドおよび類 似体は約8から約25核酸塩基単位が好ましく、約12から約25単位がなお一 層好ましい。理解されていることであるが、サブユニットまたは核酸塩基単位は 、ホスホノエステル結合または他の結合を介して隣接するサブユニットと適当に 結合した塩基−糖の組み合わせである。Such analogs can be synthesized from natural oligonucleotides (or synthesized along natural systems). is best described as being functionally internally interchangeable with However, it has one or more differences from the natural structure. all such Analogs can be used according to the invention as long as they can effectively hybridize with Candida RN^. Included. The oligonucleotides and oligonucleotide analogs of the invention are It consists of about 3 to about 50 nucleobase units. Such oligonucleotides and similar Preferably, the analog has about 8 to about 25 nucleobase units, and even more preferably about 12 to about 25 units. Layer preferred. It is understood that a subunit or nucleobase unit is , with adjacent subunits via phosphonoester bonds or other bonds, as appropriate. It is a combination of bound base-sugar.
本発明に使用するオリゴヌクレオチドおよび類似体は簡便および日常的に固相合 成の技術を通じて作成される。そのような合成のための装置はアブライドバイオ システムズを含む幾つかの販売者により販売されている。そのような合成のため のその他の手段も使用できる。しかしオリゴヌクレオチドの実際の合成は日常使 用者の技術の範囲内にある。ホスホロチオエートおよびアルキル化誘導体のよう な池のオリゴヌクレオチド類似体を調製するための同様な技術の使用もよく知ら れている。Oligonucleotides and analogues used in the present invention are conveniently and routinely synthesized into solid phase. It is created through the technology of creation. Equipment for such synthesis is available from Abride Bio. It is sold by several vendors including Systems. For such a synthesis Other means can also be used. However, the actual synthesis of oligonucleotides is It is within the skill of the user. Like phosphorothioates and alkylated derivatives The use of similar techniques to prepare oligonucleotide analogues is also well known. It is.
本発明によれば、当業者はメツセンジャーRNAが3文字の遺伝的コードを使用 するタンパク質をコードするための情報だけでなく、そのような者が知る5′− 非翻訳領域、3−非翻訳領域、5゛キヤツプおよびイントロン/エクソン結合リ ボヌクレオチドのような領域を形成する、結合したりボヌクレオチドをも含むこ とを理解するであろう。すなわち本発明により調製されるオリゴヌクレオチドお よびオリゴヌクレオチド類似体は情報のオリゴヌクレオチドと同様に、これらの 結合したりボヌクレオチドの全部または部分を標的とする。好適な態様によれば 、オリゴヌクレオチドまたは類似体は転写開始部位、翻訳開始部位、3′−非翻 訳領域中のインドロン/エクソン結合部または配列と特異的にハイブリダイズで きる。According to the present invention, those skilled in the art will understand that Metsenger RNA uses a three-letter genetic code. In addition to the information that encodes the protein that such a person knows, Untranslated region, 3-untranslated region, 5'cap and intron/exon joining region can be combined to form a region such as bonucleotides and also contain bonucleotides. You will understand that. That is, oligonucleotides prepared according to the present invention and and oligonucleotide analogues as well as informational oligonucleotides. Bind or target all or part of the nucleotide. According to a preferred embodiment , oligonucleotides or analogs at transcription start sites, translation start sites, 3'-untranslated specifically hybridizes with indolone/exon junctions or sequences in the translation region. Wear.
本発明によれば、オリゴヌクレオチドは少なくともカンジダの核酸部分と特異的 にハイブリダイズできる。好適な態様によれば、核酸部分にはβ−チューブリン 、アクチン、キチン合成酵素およびアスパラギン酸プロテアーゼタンパク質をコ ードするmRNAの部分を含む。その他の好適な態様によれば核酸部分にはりボ ゾーム125タンパク質、TEFlおよびTEF2、ATPaseのbサブユニ ットおよびノドクロームP450 LIAIをコートする工RマAの部分を含む 。対応する配列、またはその部分から成るオリゴヌクレオチドまたは類似体は本 発明において有用である。すなわち本発明のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌ クレオチド類似体はカンジダのメツセンジャーRNAとハイブリダイズできるよ うに設計される。そのようなハイブリダイゼーションは、達成された時、メツセ ンジャーRNAの正常機能を干渉して真菌にとってのその有用性を損失を引き起 こす。干渉されるメンセンジャーRN^の機能には、たとえばタンパク質を翻訳 する場へのRNAの転移、RNAからタンパク質の実際の翻訳、RNAのスプラ イソングおよび他のプロセンノング、ならびに可能性としてRNAにより行われ 得る別個の触媒活性の場合でさえあり、すべての生存機能が挙げられる。RN八 へ能をそのように干渉する全体的な効果は、カンジダにとりでRNAの利点を失 わせ、そして全体としてそのゲノムの発現を干渉するという経験を生じる。その ような干渉は一般的に真菌にとって致命的である。According to the invention, the oligonucleotide is specific to at least a nucleic acid portion of Candida. can be hybridized to. According to a preferred embodiment, the nucleic acid portion contains β-tubulin. , actin, chitin synthase and aspartic protease proteins. Contains the part of the mRNA that encodes. According to another preferred embodiment, the nucleic acid portion includes a bridge. 125 proteins, TEFl and TEF2, b subunit of ATPase Contains the part of the engineer A that coats the cut and Nodochrome P450 LIAI. . Oligonucleotides or analogues consisting of the corresponding sequences, or parts thereof, are Useful in inventions. That is, the oligonucleotides and oligonucleotides of the present invention Creotide analogs can hybridize with Candida metsenger RNA. It is designed to be Such hybridization, when achieved, interferes with the normal function of the trigger RNA and causes a loss of its usefulness to the fungus. Rub. Functions of the mensenger RN^ that are interfered with include, for example, protein translation. transfer of RNA to the place where it is to be processed, actual translation of protein from RNA, Isong and other prosenongs, and possibly by RNA. Even in the case of distinct catalytic activity obtained, all survival functions are mentioned. RN8 The overall effect of such interference with Candida's ability is to eliminate the benefits of RNA for Candida. resulting in the experience of interfering with the expression of the genome as a whole. the Such interference is generally fatal to fungi.
1ffllはカンジダアルビカンス(Candida albicans)のβ −チューブリン遺伝子配列である。カンジダアルビカンスのβ−チューブリン遺 伝子配列は既知である。スミスら(Smith et al、、) Gene、 63:53−63(1988)。これらカンジダアルビカンスの遺伝子配列は 知られている。オー−ヤングら(Au−Young)、 、 Mo1ecula r Microbiol。1ffll is β of Candida albicans - Tubulin gene sequence. β-tubulin gene of Candida albicans The gene sequence is known. Smith et al. Gene, 63:53-63 (1988). The gene sequences of these Candida albicans Are known. Au-Young et al., Molecula r Microbiol.
鉦、 4:197−207(1990)。カンジダアルビカンスのアクチン遺伝 子はよく知られている。ロスバーガーら(Losbergeret al、 、 )Nucl、 Ac1d、 Res、 11 :9488(1989)。カン Wダ アルビカンスのアスパラチルブロティナーゼ遺伝子はロッテら(Lott et al、 、 )によりNucl、 Ac1d Res、 、 17:1779 (1989)により説明されている。カンジダアルビカンスのシトクロームP4 50LIA1配列はライら(Lai et al、 、 )Nucl、 Ac1 d、 Res、 、 17:804(P 989)に記載されている。カンジダアルビカンスの延長因子TEFIおよびT EF2はサンドストームら(Sundstram et al、 、 )J、 Bacteriol、 、 172:2036(1990)に開示されて■ る。リボゾームL25遺伝子の配列はカンジダゲラブラタ(トルロポシスグラプ ラタ・Torulopsis glabrata)およびカンジダユテリス(C andida utilis)において既知である。つ1ングら(long e t al、 、 )Nucl、 Ac1d Res、 、 18: 1888( 1990) ;ウォウhゥ ら(Woudt et al、、)Curr、Genet、、12:193(1 987)。カンジダ トロピカリス(Candidatropicalis)空 胞ATPaseサブユニットbに関する遺伝子配列はグーら(Gu et al 、。Gong, 4:197-207 (1990). Actin genetics in Candida albicans The child is well known. Losbergeret al. ) Nucl, Ac1d, Res, 11:9488 (1989). Kan W da The asparatyl brotinase gene of C. albicans was developed by Lott et al. al, , ) by Nucl, Ac1d Res, , 17:1779 (1989). Candida albicans cytochrome P4 50LIA1 sequence was prepared by Lai et al., Nucl, Ac1 d, Res, , 17:804 (P 989). Candida albicans elongation factors TEFI and T EF2 is from Sundstram et al., J. Bacteriol, 172:2036 (1990) ■ Ru. The sequence of the ribosomal L25 gene is Torulopsis glabrata) and Candida eutelis (C andida utilis). long e t al, , ) Nucl, Ac1d Res, , 18: 1888 ( 1990); Wow Woodt et al., Curr, Genet, 12:193 (1 987). Candida tropicalis sky The gene sequence for ATPase subunit b was published by Gu et al. ,.
)Nucl、 Ac1dRes、 、 18ニア446(1990)に開示され ている。) Nucl, Ac1dRes, 18 Near 446 (1990). ing.
本発明に有用なオリゴヌクレオチドまたは類似体はこれらの配列のひとつ、また はそれらの部分から成る。たとえば上記に説明したこれら任意のオリゴヌクレオ チド(またはそれらの類似体)、または当業者が真菌の感染変調についての好ま しいアンチセンス標的の知識から調製できる任意の同様なヌクレオチドを使用す ることが好ましい。Oligonucleotides or analogs useful in the invention may have one of these sequences or consists of those parts. For example, any of these oligonucleotides described above (or analogues thereof), or as those skilled in the art would prefer for fungal infection modulation. Use any similar nucleotide that can be prepared from knowledge of the new antisense target. It is preferable that
本発明のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は診断、治療およ び研究試薬およびキットに使用できる。治療の使用に関して、オリゴヌクレオチ ドおよびオリゴヌクレオチド類似体はカンジダ感染に罹患している動物に投与で きる。本配列の治療剤は一般的に局所的または損傷内部的に投与することが好ま しい。経皮内または筋肉内のような投与のその他の形態も有効であろう。座薬内 への包含は、現在大変有用になるであろうと思われている。本発明のオリゴヌク レオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体を予防薬として使用することも有効に なると思われる。それらは例えばコンドームのようなものについての被覆として 投薬することにより達成できる。薬学的に受容できるキャリアーもある態様につ いては好ましい。The oligonucleotides and oligonucleotide analogs of the invention can be used for diagnostic, therapeutic and and research reagents and kits. Regarding therapeutic use, oligonucleotides Candida and oligonucleotide analogs can be administered to animals suffering from Candida infections. Wear. It is generally preferred that therapeutic agents of this sequence be administered locally or intra-injury. Yes. Other forms of administration may also be effective, such as intradermal or intramuscular. Inside the suppository It is currently believed that its inclusion would be very useful. Oligonucleus of the present invention Reotide and oligonucleotide analogues can also be used effectively as prophylactic agents It seems that it will be. They are used as coatings on things like condoms, for example. This can be achieved by administering medication. In some embodiments, a pharmaceutically acceptable carrier may also be used. It is preferable if
本発明は診断および研究においても有用である。本配列のオリゴヌクレオチドお よびオリゴヌクレオチド類似体はカンジダ由来の核酸とハイブリダイズするので 、サンドインチおよびその他のアッセイをこの事実を利用するために構成できる 。オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体とカンジダが存在すると 疑われる試料のハイブリダイゼーションを検出するための手段の供給は日常的に 達成できる。そのような供給には酵素結合、放射標識またはその他の適当な検出 系がある。カンジダの存在または不存在を検出するキ・ントも調製できる。The invention is also useful in diagnosis and research. Oligonucleotides of this sequence and oligonucleotide analogs hybridize with Candida-derived nucleic acids. , sandwich and other assays can be constructed to take advantage of this fact. . When oligonucleotides or oligonucleotide analogs and Candida are present The provision of means for detecting hybridization of suspected samples is routinely It can be achieved. Such supplies may include enzyme-linked, radiolabeled or other suitable detection methods. There is a system. Quints that detect the presence or absence of Candida can also be prepared.
本発明のいくつかの好適な態様が以下の実施例によって例示される。変調のため の標的mRN^はカンジダのβ−チューブリン、アクチン、キチン合成酵素およ びアスパラギン酸プロテアーゼタンパク質に関連する。その他の好適なmRNA 標的はりポゾームL25タンパク質、翻訳延長因子1および2(TEFIおよび TEF2)、ATPaseのbサブユニットおよびントクロームP450ラノス テロール14a−デメチラーゼ(LIAI)である。当業者は本発明がそれほど 限定されないが、一般的に応用できることを理解するであろう。これらカンジダ RNA5の抑制は疾病の治療において有!な治療的便宜を有するものと期待され るっ組成物の効果を評価するために、アッセイまたはアッセイ系が必要である。Some preferred embodiments of the invention are illustrated by the following examples. for modulation The target mRNA^ is Candida β-tubulin, actin, chitin synthase and and aspartic protease proteins. Other suitable mRNA Targets aliposome L25 protein, translation elongation factors 1 and 2 (TEFI and TEF2), ATPase b subunit and chromochrome P450 lanos terol 14a-demethylase (LIAI). Those skilled in the art will appreciate that the present invention It will be understood that it has general, but not limited, application. These candida Suppression of RNA5 is useful in disease treatment! expected to have significant therapeutic benefits. An assay or assay system is needed to evaluate the effectiveness of the composition.
以下の記載は本発明の非限定的ないくつかの実施例と!図する。The following description includes some non-limiting examples of the invention! Figure.
実施例 実施例1 β−チューブリン、アクチン、キチン合成酵素およびアスパラギン酸プロテア− シダβ−チューブリン、アスパラギン酸プロテアーゼ、アクチンおよびキチン合 成酵素のmRNAに相補的である一連のアンチセンスオリゴヌクレオチド配列が 選択された。これらを表1に示す。Example Example 1 β-tubulin, actin, chitin synthase and aspartic acid protea Fern β-tubulin, aspartic protease, actin and chitin synthesis A series of antisense oligonucleotide sequences complementary to the mRNA of the enzyme chosen. These are shown in Table 1.
カンジダ アルビカンスを標的とするアンチセンス第1ノゴヌクレオチド化合物 配列(5° −3°) 標的RNA1275 CAA Trr CTCTCA 丁^CTrCTA チューブ1ノン 翻訳開始部1276 CCG AACAT A CAA m CTCTCチューブ1ノン 5°スプライス結合部イントロン 1 1277 CAA AACCACTrA (T人TAT Tr チューブ1Jン スプライス分枝、慨イントロン1 1278 ^AAMτT訂丁^G TAA AAT CA チューブリン スプ ライス分枝7点イントロン2 1279 CTA AAA AAA AGCGCA AM GCチ、j IJ ン3°スプライス結合部イントロン1 1280 TrCCCA AAA (1:CAn;CACCCT チューブ1ノ ン 3゛スプライス結部イントロン2 12111 ATG ATA ACT ccATCA TGT TC7スパラギ ン酸 翻訳の開始プロテアーゼ 1212 cc^^cc ATr CCCGTG TGCGC7スバラギン酸 585位プロテアーゼ 12113 AACjLAT ACCTAA ACCTTCCk 7 スハラギ ン酸 転写の終止プロテアーゼ 1284ACCACCGTCCAT TrT GAA TCアクチン 転写の開 始1285 、TrA AAA CAT ACA CCcTCCA 7クチン5 ゛スプライス部位12!+7 TにTTGTC[;人丁品丁へττACCA キ チン合成酵素 翻訳の開始1288 cTcT八τGへTCATG TTCご人 ワ キチン合成酵素 第二枠内■et1289 TrTAGC丁CT AACA TG ACCACキチン合成酵素 翻訳の終結カンシタアルビカンスはサブロー デキストロースブロス(Difco)またはグルコースを加えた酵母窒素原基礎 培地のような標準ブロス中で成長する。カンシタは、50s!!アンチセンスオ リゴヌクレオチド、およびその1/2の対数希釈を加えた1mlの溶液中で生育 する。各投与に関して三重の試験官を用意する。カンシタの成長阻害はr、c5 oが1−10μのりオリゴヌクレオチド化合物で起こると予想される。Antisense first nogonucleotide compound targeting Candida albicans Sequence (5°-3°) Target RNA1275 CAA Trr CTCTCA Ding^CTrCTA Tube 1 Non Translation Start Section 1276 CCG AACAT A CAA m CTCTC tube 1 non 5° splice junction intron 1 1277 CAA AACCACTTrA (T person TAT Tr tube 1J) Splice branch, intron 1 1278 ^AAMτT correction^G TAA AAT CA Tubulin sp Rice branch 7-point intron 2 1279 CTA AAA AAA AGCGCA AM GC Chi, j IJ 3° splice junction intron 1 1280 TrCCCA AAA (1: CAn; CACCCT tube 1 no. 3゛Splice junction intron 2 12111 ATG ATA ACT ccATCA TGT TC7 Sparagi Translation initiation protease 1212 cc^^cc ATr CCCGTG TGCGC7 Subaragic acid 585th protease 12113 AACjLAT ACCTAA ACCTTCCk 7 Suharagi Transcription termination protease 1284ACCACCGTCCAT TrT GAA TC actin transcriptional activation First 1285, TrA AAA CAT ACA CCcTCCA 7cutin 5 ゛Splice site 12! +7 TTGTC[; Chin synthase Start of translation 1288 cTcT8τG TCATG TTC person Wakitin synthase second frame ■et1289 TrTAGC-CT AACA TG ACCAC chitin synthase Termination of translation Cancita albicans is a sabro Yeast nitrogen base with dextrose broth (Difco) or glucose Grow in standard broth like medium. Kanshita is 50s! ! antisense o Grow in 1 ml solution of oligonucleotide and its 1/2 log dilution. do. There will be triplicate examiners for each dose. Cancita growth inhibition is r, c5 is expected to occur with 1-10μ oligonucleotide compounds.
実施例2 オリゴヌクレオチドおよび類似体の合成および特性決定未修飾DNAオリゴヌク レオチドを自動DNA合成装置(アブライドバイオシステムズ380B)で標準 ホスホアミダイト化学を使用しヨウ素による酸化により合成した。Example 2 Synthesis and Characterization of Oligonucleotides and Analogs Unmodified DNA Oligonucleotides Reotide was used as standard using an automatic DNA synthesizer (Abride Biosystems 380B). It was synthesized by oxidation with iodine using phosphoramidite chemistry.
β−シアノエチルジイソブロピルホスホアミダイトをアブライドバイオシステム ズ(カリフォルニア州ホスター市)から購入した。ホスホロチオエートオリゴヌ クレオチドに関しては、ホスファイト結合の段階的チェージョン(thiati on)のために標準酸化ビンを、アセトニトリル中の0.2輩の3H−1,2− ベンゾジチオール−3−オン1゜1−ジオチントの溶液と交換した。チェージョ ンサイクル待ち工程を68秒に増加し、次ぎにキャッピング工程を行った。β-cyanoethyl diisopropyl phosphoramidite abride biosystem (Hoster City, California). Phosphorothioate oligonucleotide For cleotides, a stepwise change in phosphite bonds (thiati 3H-1,2- in acetonitrile for standard oxidation (on) It was replaced with a solution of benzodithiol-3-one 1°1-diotinto. Chejo The waiting cycle time was increased to 68 seconds, and then the capping step was performed.
調節細孔ガラスカラム(アプライドバイオシステムズ)からの開裂および脱ブロ ッキングを濃水酸化アンモニウム中で55℃にて18時間行った後、オリゴヌク レオチドは2.5容量のエタノール中の0.5MNaC1で二度沈殿を行い精製 した。分析ゲル電気泳動は20%アクリルアミド、8M尿素、45mMトリス− 硼酸緩衝液、pa7.0で行った。オリゴヌクレオチドおよびそのホスホロチオ エート類似体は電気泳動から判断し80%以上が完全長の物質であった。Cleavage and deblotting from controlled pore glass columns (Applied Biosystems) After packing in concentrated ammonium hydroxide at 55°C for 18 hours, the oligonuclear Reotide was purified by precipitation twice with 0.5 M NaCl in 2.5 volumes of ethanol. did. Analytical gel electrophoresis was performed using 20% acrylamide, 8M urea, 45mM Tris- The test was carried out using boric acid buffer, pa 7.0. Oligonucleotides and their phosphorothio More than 80% of the ate analog was a full-length substance as judged by electrophoresis.
実施例3 カンジダのアンチセンス不すゴヌクレオチド阻害に関する発芽管アッセイ発芽管 の発達は、菌糸形成の初期段階であるが、カンシタガマクロファージの影響から 逃れるために重要であると考えられている。細胞内の発芽管形成を阻害する薬剤 は、カンジダ感染からの宿主防御を効果的に助長できる。ブアンウォウトら(V an’ t 1out et al、 、 )、 J、 Antimicrob 、 Chemotherapy、25:803 (19X0)。Example 3 Germ tube assay for antisense oligonucleotide inhibition of Candida germ tube The development of hyphae is an early stage of hyphal formation, but due to the influence of macrophages considered important for escape. Drugs that inhibit intracellular germ tube formation can effectively promote host defense against Candida infection. Buanwout et al. (V an’t 1out et al, , J, Antimicrob , Chemotherapy, 25:803 (19X0).
カンツタアルビカンスは0.15%のアスパラギンおよび2%デキストロースを 補充した酵母窒素原基礎培地成分(デフコラボラトリーズ、ミズーリ州、デトロ イト)中で一昼夜成長させる。細胞をベレットとなし、IXPBSで2度洗浄す る。急性ノ効果を分析するために最終ベレットに、DMEMに2%グルコースを 加えて5x105細胞/mlとし再懸濁させる。200μmのこのカンツタ懸濁 液を96−ウェルマイクロタイタープレート中のウェルに加え、オリゴヌクレオ チドを所望の濃度で加える。プレートを5%CO□下で37℃にて、1時間イン キュベーションする。インキュベーションの終わりに、グルタルアルデヒドを0 .5%になるように加え、そしてプレートを4℃に冷却する。Cantuta albicans contains 0.15% asparagine and 2% dextrose. Supplemented yeast nitrogen source basal medium components (Defco Laboratories, Detro, Missouri) Grow the seeds in a container for a day and a night. Cells were pelleted and washed twice with IXPBS. Ru. Add 2% glucose in DMEM to the final pellet to analyze acute effects. Add and resuspend to 5x105 cells/ml. This suspension of 200 μm Add the solution to the wells in a 96-well microtiter plate and add the oligonucleotide Add Tido at desired concentration. Incubate the plate for 1 hour at 37°C under 5% CO□. cuvate. At the end of the incubation, remove 0 glutaraldehyde. .. Add to 5% and cool the plate to 4°C.
細胞を顕微鏡て検査し、3分画を計数した後、形成した発芽管を持つ全細胞百分 率を測定する。After examining the cells under a microscope and counting the three fractions, the percentage of total cells with germ tubes formed was determined. Measure the rate.
長期間の暴露に関する効果を分析するために、細胞を0.15%のアスパラギン および2%デキストロースを含有するYNB中に懸濁しオリゴヌクレオチドを加 える。プレートを室温で4時間インキュベーションし、その後細胞をペレットと なしPBSで洗浄する。最終ペレットを2%グルコースを含有し、新しいオリゴ ヌクレオチドを補充したDMEM中に再懸濁させる。細胞を次に5%CO□下で 37℃にてインキュベーションし、上記の短期間の効果をアッセイしたように発 芽管アッセイを行う。To analyze effects on long-term exposure, cells were exposed to 0.15% asparagine. and suspended in YNB containing 2% dextrose to which oligonucleotides were added. I can do it. Incubate the plate for 4 hours at room temperature, then pellet the cells. Wash with none PBS. The final pellet contained 2% glucose and the new oligo Resuspend in DMEM supplemented with nucleotides. Cells were then placed under 5% CO□. Incubation at 37°C and development as assayed for short-term effects as described above. Perform the bud tube assay.
カンシタアルビカンスの阻害に関し、発芽管アッセイにおいて試験したオリゴヌ クレオチド類似体を表2に表す・ 表2 【処番号 堡 5−−−−−−−一配デー−−−−−−3” 皇n 習1 22 14 TCT TGT CGA TAA TAT TACCA キチン合成酵素 ^UG P−0#2216 P−3 22215CAA TTT CTCTCA TAG TrCTA J−チューブ リンAUG P=OI2217 P=S 3 2754 TC”A C’rG にAT C;GA GCCATr TrC リボゾームL25^UG P=042839CACTCC; ATG CACC CA TTT TにT リボゾームL25^UG P=0#2845 P=S 5 2938 TGT TGT GCA TAA TAT TACCA キチン 合成酵素A[IG P=S73156Trr ACCCAT GAT TGA TTA TAT TEFI オヨヒTEF2 AUG p、、□J3122 P =S 8 3121 TCA CTC: GAT GにA GCCATT ’!Til : リボゾームL25 AUG P=Og 3152 TGA CAT CAT CAAπG ATG八CへATPaseサブ−Lニー/ ) b AUG P =0#3125 P=S 10 3150 cTG cλT AAT ATTATCATCAjlα キチ ン合成酵素AUG P=S113151AGCCAT ATT GA(: TT 入τGA TcTチトクロームP 450 LIAIP冨S 12 1049 GCCGAG GTCCAT GTCcrx ccc 対照− ■SV UL13 P=0’ 1082 P=S 図2AおよびBはカンシタアルビカンスのキチン合成酵素遺伝子と特異的にハイ ブリダイズするアンチセンスオリゴヌクレオチド(ホスホンエステルおよびホス ホロチオエート類似体)の効果を数種の対照と比較する、タイムコース分析の結 果を表す。l5IS 2214(SEo 10 NO:1)はキチン合成酵素の AUG領域を標的とするホスホジエステルオリゴヌクレオチドである訂SJS 2216 (SEQ IDN0:1)ハl5IS 2214ノホスホoチオx− ト類似体である訂SIS 1049およびl5IS 1082は(SEQ ID NO:12)単純ヘルペスウィルスUL13遺伝子のmRNA産物である翻訳 開始コドンとハイブリダイズする対照配列の、それぞれホスホジエステルおよび ホスホロチオエート類似体である。”対照”とは未処理細胞を指す。05および 1. hiiの2種のオリゴヌクレオチド投与量での発芽管アッセイは図2(A )及び図2(B)にそれぞれ表される。両方の投与において、l5IS 221 6(カンシタキチン合成酵素をコードするmRNAとハイブリダイズするホスホ ロチオエートオリゴヌクレオチド類似体)は、カンシタの発芽管形成を他の化合 物と比較し大いに阻害することを示した。Oligonucleotides tested in germ tube assays for inhibition of C. albicans The cleotide analogues are shown in Table 2. Table 2 [Place number: 5---------Ichidai-----3" Emperor n Xi 1 22 14 TCT TGT CGA TAA TAT TACCA Chitin synthase ^UG P-0#2216 P-3 22215CAA TTT CTCTCA TAG TrCTA J-tube Lin AUG P=OI2217 P=S 3 2754 TC"A C'rG to AT C; GA GCCATr TrC Ribosome L25^UG P=042839CACTCC; ATG CACC CA TTT T to T Ribosome L25^UG P=0#2845 P=S 5 2938 TGT TGT GCA TAA TAT TACCA Chitin Synthetic enzyme A [IG P=S73156Trr ACCCAT GAT TGA TTA TAT TEFI Oyohi TEF2 AUG p,, □J3122 P =S 8 3121 TCA CTC: GAT G to A GCCATT’! Til : Ribosome L25 AUG P=Og 3152 TGA CAT CAT CAAπG ATG 8C to ATPase sub-L knee/) b AUG P =0#3125 P=S 10 3150 cTG cλT AAT ATTATCATCAjlα Kichi Synthase AUG P=S113151AGCCAT ATT GA (: TT Enter τGA TcT cytochrome P 450 LIAIP Tomi S 12 1049 GCCGAG GTCCAT GTCcrx ccc control- ■SV UL13 P=0' 1082 P=S Figures 2A and B are specifically linked to the chitin synthase gene of Cancita albicans. hybridizing antisense oligonucleotides (phosphonic esters and phosphonates) Results of a time-course analysis comparing the effects of Holothioate analogs) with several controls. represents the fruit. l5IS 2214 (SEo 10 NO: 1) is a chitin synthase Revised SJS, a phosphodiester oligonucleotide targeting the AUG region 2216 (SEQ IDN0:1) Hal5IS 2214 nophospho o thio x- SIS 1049 and 15IS 1082, which are analogues of (SEQ ID NO: 12) Translation of the mRNA product of the herpes simplex virus UL13 gene phosphodiester and control sequences that hybridize to the initiation codon, respectively. It is a phosphorothioate analog. "Control" refers to untreated cells. 05 and 1. Germ tube assay with two oligonucleotide doses of H.ii is shown in Figure 2 (A ) and FIG. 2(B), respectively. In both administrations, l5IS 221 6 (phosphorus that hybridizes with mRNA encoding kanshita chitin synthase) (rothioate oligonucleotide analogues) inhibit germ tube formation in Cancita as compared to other compounds. It was shown that it was greatly inhibited compared to the physical object.
配列表 (1)一般情報: (i)出願人ホーケ、グレンC,(Hoke Glenn C,)エッカーデイ ビソトJ、 (Ecker、 David J、 )(丘)発明の名称カンシタ の抑制 (i)配列の数・12 (i+)宛て先・: (A)住所ウッドコック・オオノンユバーン・カーラ・マキーヴイノツ・ アンド1ノリス(Woodcock Washburn Kurtz Mack ievicz & Norris) (B)地〆ワン・リバティ・ブレイス−4 6階(One Liberty Place)(C)市名:フィラデルフィア (D)州名ペンンルベニア (E)国名米国 (F)郵便番号19103 (V)コンピューター読み取り形式。Sequence list (1) General information: (i) Applicant Hoke Glenn C. Eckerday Bisoto J, (Ecker, David J,) (Hill) Name of invention Kanshita suppression of (i) Number of arrays: 12 (i+) Address: (A) Address: Woodcock, Onon Yuban, Carla McKeevinotsu, AND1 Norris (Woodcock Washburn Kurtz Mack ievicz & Norris) (B) One Liberty Brace-4 6th floor (One Liberty Place) (C) City name: Philadelphia (D) State name: Pennluvenia (E) Country name: United States (F) Postal code 19103 (V) Computer-readable format.
(A)中型・小型ディスク、35インチ、記憶装置1.44Mb(B)コンピュ ーター・IBM PS/2(C)操作システム:PC−DO3 (D)ソフトウェア、ワートハーフェクト5.0(WORDPERFECT 5 .0)(vi)現行出願資料 (A)出願番号n/a (B)出願日9本明細書とともに (C)分類。(A) Medium/small disk, 35 inches, storage device 1.44Mb (B) Computer IBM PS/2 (C) operating system: PC-DO3 (D) Software, WORDPERFECT 5.0 .. 0) (vi) Current application materials (A) Application number n/a (B) Filing date 9 Together with this specification (C) Classification.
(vi)弁理士/代理人情報: (A)氏名、リカタ・ジx−ン・M(Licata、 Jane M、 )(B )登録番号:32.257 (C)照会/事件整理番号:l5IS −0432(ix)通信情報。(vi) Patent attorney/agent information: (A) Name, Licata, Jane M. (B) ) Registration number: 32.257 (C) Inquiry/case reference number: l5IS-0432 (ix) Communication information.
(A)電話: (215)568〜3100(B)テレファックス: (215 )56g−3439(2)配列番号1の情報・ (i)配列の特徴 (^)長さ20塩基対 (B)種子:核酸 (ii)分子種類:他の核酸 (i)仮説無し くm)アンチ−センス正 (コ)配列の記載配列番号I T G T T G T CG A T 、A A T 、A T T A C CA 20(2)配列番号2の情報 (i)配列の特徴 (A)長さ20塩基対 (B)種類、核酸 (C)鎖=1本 (D)トポロジー・直線 (i)分子種類:他の核酸 (i)仮説、無し くi)アンチ−センス正 (m)配列の記載:配列番号2 CAATTTCTCT CATAGTTCTA 20(2)配列番号3の情報: (i)配列の特徴 (A)長さ21塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖、1本 (D)トポロジー二直線 (fi)分子種類・他の核酸 (i)仮説:無し くXl)配列の記載:配列番号3 TCACTGGATG GAGCCATTTT C21(2)配列番号4の情報 : (1)配列の特徴 (A)長さ=21塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖1本 (D)トポ日ノ−。直線 (Ii)分子種類能の核酸 (i)仮説無し くff)アンチ−センス正 (Xl)配列の記載゛配列番号4 CACTGGATGC、へCCCATTTTG T 21(2)配列番号5の情 報− (1)配列の特徴 (入)長さ21塩基対 (B)種類、核酸 (C)鎖:1本 (D)トポロン−1II線 (li)分子種類、池の核酸 (i)仮説・無し くff)アンチ−センス:正 (刀)配列の記載:配列番号5 CTCATAGTTCTATAATGTTG A 21(2)配列番号6の情報 : (1)配列の特徴 (A)長さ=20塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖=1本 (D)トポロジー二直線 (i)分子種類:他の核酸 (i)仮説・無し くit)アンチ−センス:正 (=)配列の記載:配列番号6 TGTTGTGCAT AATATTACCA 20(2)配列番号7の情報。(A) Telephone: (215) 568-3100 (B) Telefax: (215) ) 56g-3439 (2) Information on SEQ ID NO: 1・ (i) Features of array (^) Length 20 base pairs (B) Seed: Nucleic acid (ii) Molecule type: other nucleic acids (i) No hypothesis m) anti-sense positive (c) Sequence description Sequence number I T G T T G T CG A T, A A T, A T T A C CA20(2) Information on sequence number 2 (i) Features of array (A) Length 20 base pairs (B) Type, nucleic acid (C) Chain = 1 chain (D) Topology/straight line (i) Molecule type: other nucleic acids (i) Hypothesis, none i) anti-sense positive (m) Sequence description: Sequence number 2 CAATTTCTCT CATAGTTCTA 20 (2) Information on sequence number 3: (i) Features of array (A) Length 21 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Chain, 1 (D) Topology two straight lines (fi) Molecule types/other nucleic acids (i) Hypothesis: None Xl) Sequence description: Sequence number 3 TCACTGGATG GAGCCATTT C21 (2) Information on SEQ ID NO: 4 : (1) Characteristics of array (A) Length = 21 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) One chain (D) Topo day no. straight line (Ii) Nucleic acid with molecular type ability (i) No hypothesis ff) anti-sense positive (Xl) Description of sequence゛Sequence number 4 CACTGGATGC, CCCATTTTG T21 (2) Information of SEQ ID NO: 5 Information (1) Characteristics of array (In) Length 21 base pairs (B) Type, nucleic acid (C) Chain: 1 (D) Topolon-1II line (li) Molecule type, Ike's nucleic acid (i) Hypothesis/None ff) Anti-sense: Correct (Sword) Sequence description: Sequence number 5 CTCATAGTTCTATAATGTTG A 21 (2) Information on SEQ ID NO: 6 : (1) Characteristics of array (A) Length = 20 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Chain = 1 chain (D) Topology two straight lines (i) Molecule type: other nucleic acids (i) Hypothesis/None quit) anti-sense: positive (=) Sequence description: Sequence number 6 TGTTGTGCAT AATATTACCA 20 (2) Information on SEQ ID NO: 7.
(i)配列の特徴 (A)長さ:21塩基対 (B)種類核酸 (C)鎖゛1本 (D)トポロジー直線 (ii)分子種類能の核酸 (i)仮説無し くW)アンチ−センス、正 (コ)配列の記載配列番号7 TTTACCCATG ATTGATTAT、八 T 21(2)配列番号8の 情報 (i)配列の特徴 (A)長さ21塩基対 (B)種類・核酸 (C)鎖、1本 (D)トポロジー直線 (fi)分子種類能の核酸 (i)仮説無し くy)アンチ−センス正 (n)配列の記載、配列番号8 TCACTGGATG GAGCCATTTT G 21(2)配列番号9の情 報。(i) Features of array (A) Length: 21 base pairs (B) Type of nucleic acid (C) 1 chain (D) Topology straight line (ii) Nucleic acids with molecular type capabilities (i) No hypothesis W) anti-sense, correct (J) Sequence description Sequence number 7 TTTACCCATG ATTGATTAT, 8 T 21 (2) SEQ ID NO: 8 information (i) Features of array (A) Length 21 base pairs (B) Type/nucleic acid (C) Chain, 1 (D) Topology straight line (fi) Nucleic acid with molecular type ability (i) No hypothesis y) Anti-sense positive (n) Sequence description, SEQ ID NO. 8 TCACTGGATG GAGCCATTT G 21 (2) Information of SEQ ID NO: 9 News.
(i)配列の特徴 (A)長さ21塩基対 (B)種類核酸 (C)鎖゛1本 (D)トポロジーtl!1! (j)分子種類能の核酸 (i)仮説・無し くff)アンチ−センス正 (コ)配列の記載、配列番号9 TGACATGATG A、ATGGATGAC、八 21(2)配列番号10 の情報。(i) Features of array (A) Length 21 base pairs (B) Type of nucleic acid (C) 1 chain (D) Topology tl! 1! (j) Nucleic acid with molecular type ability (i) Hypothesis/None ff) anti-sense positive (J) Sequence description, SEQ ID NO. 9 TGACATGATG A, ATGGATGAC, 821(2) SEQ ID NO: 10 information.
(1)配列の特徴 (A)長さ・21塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖1本 (D)トポロジー直線 (6)分子種類、他の核酸 (i)仮説・無し くff)アンチ−センス、正 (r)配列の記載配列番号10 GTGCATAAT、A TTACCATCAA T 21(2)配列番号11 の情報 (1)配列の特徴 (A)長さ21塩基対 (B)種類核酸 (C)鎖。1本 (D)トポロジー・直線 (D分子種類数の核酸 (i)仮説無し くit)アンチ−センス、正 (コ)配列の記載:配列番号11 AGCCATATTG AGTTATGATCT 21(2)配列番号12の情 報: (1)配列の特徴 (A)長さ、21塩基対 (B)種類、核酸 (C)鎖:1本 (D)トポロジー:直線 (云)分子種類:他の核酸 (i)仮説:珊し くW)アンチ−センス:正 (f+)配列の記載、配列番号12 GCCGAGGTCCATGTCGTACG C21no、1 1201 TTrAAGAAAA TTGGCAGTCA ATrTGGTrC (: ATTCCCAAGA TrACATTTCT1251 TTATC;C :TTにG TTATG(TCCA rrcAcrrcrATGGGTrCTA A Arcrrrcac^1851 G’f’TCACTTCT AA’KAT AATrA TGGmmT TGGmAG蜂書く内容に真夏なし) FIG、 2A 手続補正書(1) Characteristics of array (A) Length/21 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) One chain (D) Topology straight line (6) Molecule types, other nucleic acids (i) Hypothesis/None ff) anti-sense, positive (r) Sequence description Sequence number 10 GTGCATAAT, A TTACCATCAA T 21 (2) SEQ ID NO: 11 information (1) Characteristics of array (A) Length 21 base pairs (B) Type of nucleic acid (C) Chain. 1 piece (D) Topology/straight line (D number of molecule types of nucleic acids (i) No hypothesis (quit) anti-sense, positive (J) Sequence description: Sequence number 11 AGCCATATTG AGTTATGATCT 21 (2) Information of SEQ ID NO: 12 Information: (1) Characteristics of array (A) Length, 21 base pairs (B) Type, nucleic acid (C) Chain: 1 (D) Topology: straight line (Yu) Molecule type: other nucleic acids (i) Hypothesis: Coral W) Anti-sense: Correct (f+) Sequence description, SEQ ID NO: 12 GCCGAGGTCCATGTCGTACG C21no, 1 1201 TTrAAGAAAA TTGGCAGTCA ATrTGGTrC (: ATTCCCAAGA TrACATTTCT1251 TTATC;C :TT to G TTATG (TCCA rrcAcrrcrATGGGTrCTA A Arcrrrrcac^1851 G’f’TCACTTCT AA’KAT AATrA TGGmmT TGGmAG There is no midsummer in the content written by Bee) FIG, 2A Procedural amendment
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