JPH06504363A - 炭水化物の分析およびそのためのキット - Google Patents

炭水化物の分析およびそのためのキット

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JPH06504363A JP3513054A JP51305491A JPH06504363A JP H06504363 A JPH06504363 A JP H06504363A JP 3513054 A JP3513054 A JP 3513054A JP 51305491 A JP51305491 A JP 51305491A JP H06504363 A JPH06504363 A JP H06504363A
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ジャクソン,ピーター
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アストロスキャン,リミティド
グリコ,インコーポレイティド
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は炭水化物の分析に関する。
発明の背景 国際公開第WO38/10422号は、特に炭水化物構造を分析するためのまた は炭水化物物質を識別もしくは分離するための技術を開示しており、該技術は炭 水化物物質を電気泳動ゲルに適用し、ケルをゐ動して異なる物質の示差移動を引 き起こすことを含む。炭水化物物質を蛍光標識試薬、例えばアミンフルオレセイ ンで予め標識して該物質に電荷を付与し、それによって電気泳動的分離を可能に し、そしてゲルの泳動後の該物質の視覚化を可能にすることができる。この場合 、視覚化は内眼て行うことがてきるが、電荷結合素子(CCD)を使って見るこ とにより一層高い感度が獲得される。
本発明は、そのような技術の開発に関し、蛍光標識試薬として別の材料を利用す ることに基つく。
発明の要約 本発明によれば、炭水化物物質を分離または識別する方法であって、ヒドラジ〉 基を含む蛍光試薬で炭水化物物質を標識して蛍光標識された物質を生成せしめ、 前記標識された物質を電気泳動用ケルに適用し、前記ゲルを泳動して異なる物質 の示差移動を引き起こすことを含んで成る方法が提供される。
本発明の別の観点は、炭水化物物質を分離または識別するためのキットであって 、蛍光標識された物質を生成することかできる標識試薬、電気泳動用ゲル、およ び試験しようとする炭水化物物質と比較するための炭水化物標準を含んで成るキ ットに関する。このキ・ノドは電荷結合素子を更に含んでもよい。
標識試薬のヒドラジン基は、還元性末端基を含む炭水化物と容易に反応し、荷電 し且つ蛍光性でありそして電気泳動処理によく適しているであろう誘導体を生成 する。
良好な実用結果は、蛍光試薬としてルシファーイエロー(LuciferYel low) C84即ち6−アミノ−2−〔(ヒドラジノカルボニル)アミノ)− 2,3−ジヒドロ−1,3−ジオキソ−IH−ベンズ(d e)イソキノリン− 5,8−ンスルホン酸(LYCH)を使って得られた。ニカリウム塩の構造式は 図1に示される。ルノファーイエローCHおよびそのニカリウム塩は、Aldr ich Chemical Company。
Inc、、 Mo1ecular Probes、Inc、、Sigma Ch emical Company力1ら入手可能である。Stewart、 W、 、 Ce11.14.741 (+978)も参照のこと(これは参考として本 明細書中に組み込まれる)。LYCHの修飾変形および誘導体も同様な結果を与 えることかできる。
多数の他のヒドラジン基含有試薬も知られており、その幾つかを使って試験を行 った。例えば、ヒトランノアクリトンで標識された炭水化物は、電気泳動処理の 後、青色蛍光バンドを生した。この7<ノドは乾燥後は明るい空色になった。リ サミンローダミンBスルホニルヒドラジドを蛍光試薬として使用すると、電気泳 動ケル上ての泳動後に感光性の糖誘導体ノ1ントを生じた。
標識された炭水化物物質は蛍光性でなげればならない。標識試薬かそれ自体蛍光 性であってもよく、または炭水化物物質と反応後に蛍光性になってもよい。
好ましくは、ゲルは15%〜60%、好ましくは20%〜40%の範囲の濃度を 存する比較的濃厚なポリアクリルアミドゲルを含んで成るか、場合によっては、 より低濃度のゲルを使用することか可能であるかまたは好ましいかもしれない。
ゲルは均一濃度のゲルであるかまたは勾配ゲルの形である二とかできる。
ケルは、好ましくは、例えばN、N’−メチレンヒスアクリルアミド(ビス)に より架橋される。
現在好ましい1つのゲルは、20%(最上部)から40%(最下部)まで連続勾 配で異なるポリアクリルアミドゲル濃度(W/V)を存する直線ポリアクリルア ミド勾配ゲルを含んで成る。このケルは、最低濃度のポリアクリルアミドの所の 0.53%から最高濃度のポリアクリルアミドの所の1.06%まで異なる濃度 (W/V)でビスにより架橋される。
良好な分離および感度のために、ゲルは、タンパク質およびDNA断片を扱うだ めの既知の技術、例えばIRL Pressにより発光されたB、D、 Ham esおよびり、 Rickwood編の本”Gel electrophore sis ofl)roteins: a practical approac h”に記載された技術を使って、好ましくは濃縮用緩衝液系を使って泳動される (移動界面電気泳動、多相ゾーン電気泳動および他の名称で知られている)。
電気泳動は、便利には、Neville、 Jr、 D、M、、J、 Biol 、 Chem。
246.6328−6334に記載されたものに基づいた不連続電気泳動緩衝液 系を使って実施される。
ゲルを泳動した後、適当な波長の光、例えば紫外光を照射すると、場合によって は標識された炭水化物物質を肉眼で見ることかできるけれとも、CCDを使って 像化することにより、より良好な分離と感度を得ることができる。適当な励起に より、LYCHは黄色発光と高い量子収率て強力に蛍光を発する。発光はCCD による検出に非常に適し、スペクトルの赤色端で最大の感度と量子収率を有し、 スペクトルの青色端で最低の感度と量子収率を存する。CODの使用は、非常に 迅速に容易に量子化された結果を与えるという利点も有する。
更に、優れた定量的結果は、直線的動的範囲か広いためCCDによりすぐに利用 可能である。更に、CCDは、ゲルを泳動している最中にゲルを観察するのに用 いることができる。
冷却2−D CCDを使用し、遅いスキャン読み出して操作することが好ましい 。適当なCODシステムの一例は、Astromed Lim1ted。
Cambridge、 United Kingdomにより製造されたCCD  2200 Imagingsystemである。CCDは好ましくは少なくと も一25°Cはどの低温に冷却され、−160°Cまて更に冷却することにより 感度が有意に増大する。典型的な作業温度は一40°C〜−130°Cの範囲内 である。
標識試薬、例えばLYCHは、必要であれば結合した生体分子からの遊離後、炭 水化物物質上の部位に結合させることができる。あるいは、生体分子を既知の方 法で修飾して標識試薬の取り込みを可能にしてもよい。
炭水化物物質は、ことによると還元剤、例えば水素化シアノホウ素ナトリウムの 存在下で、該物質をLYCHと共にインキュベートすることにより、LYCHて 標識することができる。水素化シアノホウ素ナトリウムは、好ましくはジメチル スルホキッド(DMSO)中の溶液の形である。良好な標識のためには、酢酸と 水の混合物、例えば15容量部の酢酸と85容量部の水を含む混合物中の溶液の 形てLYCHを添加するのが育用であると判明した。LYCIIは例えはMo1 ecular ProbesInc、、Eugene、 Oregonから市販 されており、それらはカリウム塩の形で該材料を供給している。
電気泳動にかけた物質の移動速度は、物質の大きさく分子量)および構造によっ て異なる。よって本発明を使って炭水化物物質の大きさおよび形状に関する情報 を得ることができ、そして既知の標準の結果と比較することにより、未知の炭水 化物物質を部分的にまたは完全に特徴付けることか可能であろう。本発明の1つ の利用は、参考として本明細書中に組み込まれるWO38/+0422に記載さ れたように、グルコシダーゼを使って未知の炭水化物を小さい断片に開裂せしめ 、そして生じた断片を同定することにより、炭水化物構造を明らかにすることに おいてである。
本発明は、糖タンパク質、プロテオグリカン、糖脂質およびスフィンゴ糖脂質並 びに池の生体分子から誘導されるものを包含する、広範囲の炭水化物構造におい て利用可能である。
下記の実施例によりおよび添付図面への参照により、本発明を例示のつもりで更 に説明する。
図1は、ニカリウム塩の形のLYCHの構造を示す。
図2は、LYCHて標識された種々の糖を示す電気泳動ゲルの写真である。
実施例 LYCHはニカリウム塩としてMo1ecular Probes Inc、か ら入手した。
氷酢酸/水(15: 85. v/v)中に微細な懸濁液(5,21g/l)を 調製した。水素化シアノホウ素ナトリウム(NaCNBH3)はAldrich Chemical Co、から入手し、ジメチルスルホキシド(DMSO)中の 0.1N1溶液として使用する。
次の還元糖(全てD配置)を各々5ナノモル含存する溶液を超遠心管中に凍結乾 燥した。6−ジオキシグルコース、グルコース、ガラクトース、N−アセチルガ ラクトース、ガラクトノルα−1,4−ガラクトース、ラクトース、マルトース 、ガラクトースース、セロトリオース、マルトトリオース、マルトテトラオース 、マルトペンタオース、マルトヘキサオースおよびマルトヘプタオース。凍結乾 燥した糖にLYCH懸濁液5μlと水素化シアノホウ素ナトリウム溶液5μlを 添加した。生した溶液をよく混合し、室温で30分間インキュベートし、そして 遠心真空蒸発器を使って40″Cにて4時間凍結乾燥した。この反応混合物に、 0.04]Mトリス塩基、0.04Mホウ酸(pH8,64)中に6M尿素を含 む溶液(電気泳動用試料緩衝液)を適量加えた。得られた試料を即座に使用する かまたは電気泳動するまで一70″Cで保存した。
52.1g/lのLYCH懸濁液を使って上記手順を繰り返し、そして全く糖を 含まない対照も調製した。
LYCHて標識された糖と対照をポリアクリルアミドゲル中ての電気泳動にかけ た。分離は各糖の分子量および構造に依存する。移動界面(濃縮用)緩衝液系を 使ってシャープなバンドと高分解能を与える。この系は上記に言及したNevi lleの方法に基づく。
電気泳動は、20%w/vアクリルアミド、0,53%w/v N、 N’ − メチレンビスアクリルアミド(ビス)から40%W/Vアクリルアミド、1、0 6%W/V ヒスまての直線勾配から成る分離用ゲルを使って実施した。3.0 %W/Vアクリルアミドと0.08%W/Vビスを含む濃縮用ケルを使った。N evilleにより記載されたものに基つく不連続電気泳動緩衝液系を使用した か、ただしSDSを削除した。ゲルを5〜7°Cの周囲緩衝液により冷却した。
使用した電圧は100V (定電圧)で30分間、次いて500V (定電圧) で60分間、次いて100V (定電圧)で90分間であった。
4レーンにおいて次の試料を使ってゲルを泳動した。
レーン1 糖+LYC)! (52,1g/ i溶液)。
レーン2 糖なし+LYC)I (52,1g/ I!温溶液。
レーン3 糖+LYCH(5,21g/l溶液)。
レーン4 糖なし+LYCH(5,21g/l溶液)。
下方から紫外照明ボックスにより照射した結果生じたゲルの写真を図2に示す。
照明ボックスからの紫外光と青色光を減らすためにカメラにWratten N o、8フイルターを使った。糖に相当するハントは、それらが明瞭である場所に 示される。
LYCH標識は、適当な照射光(吸光度最大波長=428 nm)で刺激した時 に強く蛍光を発する。予備実験は、おそら< LYCH中の不純物により生じた と忠われるゲル上の幾つかのほやけたバントを示した。
本発明の好ましい実施態様の上記記載は例示と説明のために提供されている。そ れは開示される正確な形式に本発明を限定するつもりのものではない。明らかに 、当業界の専門家には多数の改良および変更が明白であろう。本発明の原理およ びそれの実用を最も良く説明し、それによって当業者か本発明の様々な実施態様 を理解できるようにするために、そして期待される特定の用途に適するように様 々な変更を伴って、実施態様を選択し記載した。本発明の範囲は次の請求の範囲 およびそれらの同等物により定義される。
〒H2 H ! H2 FIG、I FIG、2 国際調査報告 1*ltr+−啼一静−−一一宮テ/1m1八鳩ζ

Claims (21)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.炭水化物物質を分離または識別する方法であって、ヒドラジン基を含む標識 試薬で炭水化物物質を標識して蛍光標識された物質を生成せしめ、前記標識され た物質を電気泳動用ゲルに適用し、そして前記ゲルを泳動して異なる物質の示差 移動を引き起こすことを含んで成る方法。
  2. 2.前記標識試薬がルシファーイエロー(Lucifer Yellow)CH を含んで成る、請求項1の方法。
  3. 3.前記炭水化物物質が、前記物質を還元剤の存在下でルシファーイエローCH と共にインキュベートすることによりルシファーイエローCHで標識される、請 求項2の方法。
  4. 4.前記還元剤が水素化シアノホウ素ナトリウムである、請求項3の方法。
  5. 5.前記ゲルが、15%〜60%の範囲の濃度を有する比較的濃厚なポリアクリ ルアミドゲルを含んで成る、請求項1の方法。
  6. 6.前記ゲルが20%〜40%の範囲の濃度を有する、請求項5の方法。
  7. 7.前記ゲルが勾配ゲルの形である、請求項1,2,3,4または5の方法。
  8. 8.前記ゲルが架橋される、請求項1,2,3,4,5,6または7に記載の方 法。
  9. 9.前記ゲルが、20%(最上部)から40%(最下部)までの連続勾配で異な るポリアクリルアミドゲル濃度(w/v)を有する直線ポリアクリルアミド勾配 ゲルを含んで成り、前記ゲルが最低濃度のポリアクリルアミドの所の0.53% から最高濃度のポリアクリルアミドの所の1.06%まで異なる濃度(w/v) でビスにより架橋される、請求項1,2,3,4,5,6,7または8の方法。
  10. 10.前記ゲルが濃縮用緩衝液系を使って泳動される、請求項1,2,3,4, 5,6,7,8または9の方法。
  11. 11.前記標識された炭水化物物質が電荷共役装置を使ってゲル中で像化される 、1,2,3,4,5,6,7,8,9または10の方法。
  12. 12.前記電荷結合素子が、遅いスキャン読み出しで操作される冷却20dCC Dである、請求項11の方法。
  13. 13.炭水化物物質を分離または識別するためのキットであって、a)蛍光標識 された物質を生成することができるヒドラジン基を含む標識試薬; b)電気泳動用ゲル:および c)試験しようとする炭水化物物質と比較するための炭水化物標準 を含んで成るキット。
  14. 14.前記標識試薬がルシファーイエローCHである、請求項13のキット。
  15. 15.前記キットが還元剤を更に含んで成る、請求項13のキット。
  16. 16.前記還元剤が水素化シアノホウ素ナトリウムである、請求項15のキット 。
  17. 17.前記電気泳動用ゲルが15%〜60%の範囲の濃度を有する比較的濃厚な ポリアクリルアミドゲルである、請求項13のキット。
  18. 18.前記ゲルが20%〜40%の範囲の濃度を有する、請求項16のキット。
  19. 19.前記ゲルが勾配ゲルの形である、請求項16または17のキット。
  20. 20.前記ゲルが架橋される、請求項16,17または18のキット。
  21. 21.前記キットが電荷結合素子を含んで成る、請求項16,17,18または 19のキット。
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