JPH06504363A - 炭水化物の分析およびそのためのキット - Google Patents
炭水化物の分析およびそのためのキットInfo
- Publication number
- JPH06504363A JPH06504363A JP3513054A JP51305491A JPH06504363A JP H06504363 A JPH06504363 A JP H06504363A JP 3513054 A JP3513054 A JP 3513054A JP 51305491 A JP51305491 A JP 51305491A JP H06504363 A JPH06504363 A JP H06504363A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gel
- kit
- carbohydrate
- concentration
- polyacrylamide
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 238000012511 carbohydrate analysis Methods 0.000 title 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 claims description 44
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 32
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 27
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 22
- OVPVVOAYSGVQSZ-UHFFFAOYSA-L lucifer yellow carbohydrazide dye(2-) Chemical group [O-]S(=O)(=O)C1=CC(C(N(NC(=O)NN)C2=O)=O)=C3C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC3=C1N OVPVVOAYSGVQSZ-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 20
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 claims description 17
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 15
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 11
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 claims description 11
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 7
- BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N sodium cyanoborohydride Chemical group [Na+].[B-]C#N BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 claims description 5
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 claims description 4
- 239000011544 gradient gel Substances 0.000 claims description 4
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N hydrazine group Chemical group NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 2
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 claims 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 17
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 11
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 6
- KCIDZIIHRGYJAE-YGFYJFDDSA-L dipotassium;[(2r,3r,4s,5r,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] phosphate Chemical class [K+].[K+].OC[C@H]1O[C@H](OP([O-])([O-])=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O KCIDZIIHRGYJAE-YGFYJFDDSA-L 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 4
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 238000006862 quantum yield reaction Methods 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 238000001444 catalytic combustion detection Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 2
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 2
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DBTMGCOVALSLOR-UHFFFAOYSA-N 32-alpha-galactosyl-3-alpha-galactosyl-galactose Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(OC2C(C(CO)OC(O)C2O)O)OC(CO)C1O DBTMGCOVALSLOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150108397 Abcd2 gene Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 241000272201 Columbiformes Species 0.000 description 1
- RXVWSYJTUUKTEA-UHFFFAOYSA-N D-maltotriose Natural products OC1C(O)C(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 RXVWSYJTUUKTEA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 102000004366 Glucosidases Human genes 0.000 description 1
- 108010056771 Glucosidases Proteins 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 208000007256 Nevus Diseases 0.000 description 1
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 1
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 1
- 102000016611 Proteoglycans Human genes 0.000 description 1
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 description 1
- 241000221484 Tilletiaceae Species 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- FTNIPWXXIGNQQF-UHFFFAOYSA-N UNPD130147 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(CO)OC(OC2C(OC(OC3C(OC(OC4C(OC(O)C(O)C4O)CO)C(O)C3O)CO)C(O)C2O)CO)C(O)C1O FTNIPWXXIGNQQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LUEWUZLMQUOBSB-UHFFFAOYSA-N UNPD55895 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(CO)OC(OC2C(OC(OC3C(OC(O)C(O)C3O)CO)C(O)C2O)CO)C(O)C1O LUEWUZLMQUOBSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- BNABBHGYYMZMOA-AHIHXIOASA-N alpha-maltoheptaose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@H](O[C@@H]3[C@H](O[C@H](O[C@@H]4[C@H](O[C@H](O[C@@H]5[C@H](O[C@H](O[C@@H]6[C@H](O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]6O)CO)[C@H](O)[C@H]5O)CO)[C@H](O)[C@H]4O)CO)[C@H](O)[C@H]3O)CO)[C@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O BNABBHGYYMZMOA-AHIHXIOASA-N 0.000 description 1
- OCIBBXPLUVYKCH-QXVNYKTNSA-N alpha-maltohexaose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@H](O[C@@H]3[C@H](O[C@H](O[C@@H]4[C@H](O[C@H](O[C@@H]5[C@H](O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]5O)CO)[C@H](O)[C@H]4O)CO)[C@H](O)[C@H]3O)CO)[C@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O OCIBBXPLUVYKCH-QXVNYKTNSA-N 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004327 boric acid Substances 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- FYGDTMLNYKFZSV-ZWSAEMDYSA-N cellotriose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](OC(O)[C@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O FYGDTMLNYKFZSV-ZWSAEMDYSA-N 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 125000000118 dimethyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 150000002339 glycosphingolipids Chemical class 0.000 description 1
- -1 hydrazinocarbonyl Chemical group 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- DLBFLQKQABVKGT-UHFFFAOYSA-L lucifer yellow dye Chemical compound [Li+].[Li+].[O-]S(=O)(=O)C1=CC(C(N(C(=O)NN)C2=O)=O)=C3C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC3=C1N DLBFLQKQABVKGT-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- DJMVHSOAUQHPSN-UHFFFAOYSA-N malto-hexaose Natural products OC1C(O)C(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(OC2C(C(O)C(OC3C(C(O)C(OC4C(C(O)C(O)C(CO)O4)O)C(CO)O3)O)C(CO)O2)O)C(CO)O1 DJMVHSOAUQHPSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FJCUPROCOFFUSR-UHFFFAOYSA-N malto-pentaose Natural products OC1C(O)C(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(OC2C(C(O)C(OC3C(C(O)C(O)C(CO)O3)O)C(CO)O2)O)C(CO)O1 FJCUPROCOFFUSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UYQJCPNSAVWAFU-UHFFFAOYSA-N malto-tetraose Natural products OC1C(O)C(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(OC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)C(CO)O1 UYQJCPNSAVWAFU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FJCUPROCOFFUSR-GMMZZHHDSA-N maltopentaose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@H]([C@H](O)CO)[C@H](O)[C@@H](O)C=O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)O)[C@@H](CO)O2)O)[C@@H](CO)O1 FJCUPROCOFFUSR-GMMZZHHDSA-N 0.000 description 1
- LUEWUZLMQUOBSB-OUBHKODOSA-N maltotetraose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](O[C@@H](O[C@@H]3[C@@H](O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3O)CO)[C@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O LUEWUZLMQUOBSB-OUBHKODOSA-N 0.000 description 1
- FYGDTMLNYKFZSV-UHFFFAOYSA-N mannotriose Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(CO)OC(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)C(O)C1O FYGDTMLNYKFZSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N n,n'-methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000012736 patent blue V Nutrition 0.000 description 1
- XAEFZNCEHLXOMS-UHFFFAOYSA-M potassium benzoate Chemical compound [K+].[O-]C(=O)C1=CC=CC=C1 XAEFZNCEHLXOMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007693 zone electrophoresis Methods 0.000 description 1
- FYGDTMLNYKFZSV-BYLHFPJWSA-N β-1,4-galactotrioside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O FYGDTMLNYKFZSV-BYLHFPJWSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
- G01N27/26—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
- G01N27/416—Systems
- G01N27/447—Systems using electrophoresis
- G01N27/44704—Details; Accessories
- G01N27/44717—Arrangements for investigating the separated zones, e.g. localising zones
- G01N27/44721—Arrangements for investigating the separated zones, e.g. localising zones by optical means
- G01N27/44726—Arrangements for investigating the separated zones, e.g. localising zones by optical means using specific dyes, markers or binding molecules
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/66—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving blood sugars, e.g. galactose
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
本発明は炭水化物の分析に関する。
発明の背景
国際公開第WO38/10422号は、特に炭水化物構造を分析するためのまた
は炭水化物物質を識別もしくは分離するための技術を開示しており、該技術は炭
水化物物質を電気泳動ゲルに適用し、ケルをゐ動して異なる物質の示差移動を引
き起こすことを含む。炭水化物物質を蛍光標識試薬、例えばアミンフルオレセイ
ンで予め標識して該物質に電荷を付与し、それによって電気泳動的分離を可能に
し、そしてゲルの泳動後の該物質の視覚化を可能にすることができる。この場合
、視覚化は内眼て行うことがてきるが、電荷結合素子(CCD)を使って見るこ
とにより一層高い感度が獲得される。
本発明は、そのような技術の開発に関し、蛍光標識試薬として別の材料を利用す
ることに基つく。
発明の要約
本発明によれば、炭水化物物質を分離または識別する方法であって、ヒドラジ〉
基を含む蛍光試薬で炭水化物物質を標識して蛍光標識された物質を生成せしめ、
前記標識された物質を電気泳動用ケルに適用し、前記ゲルを泳動して異なる物質
の示差移動を引き起こすことを含んで成る方法が提供される。
本発明の別の観点は、炭水化物物質を分離または識別するためのキットであって
、蛍光標識された物質を生成することかできる標識試薬、電気泳動用ゲル、およ
び試験しようとする炭水化物物質と比較するための炭水化物標準を含んで成るキ
ットに関する。このキ・ノドは電荷結合素子を更に含んでもよい。
標識試薬のヒドラジン基は、還元性末端基を含む炭水化物と容易に反応し、荷電
し且つ蛍光性でありそして電気泳動処理によく適しているであろう誘導体を生成
する。
良好な実用結果は、蛍光試薬としてルシファーイエロー(LuciferYel
low) C84即ち6−アミノ−2−〔(ヒドラジノカルボニル)アミノ)−
2,3−ジヒドロ−1,3−ジオキソ−IH−ベンズ(d e)イソキノリン−
5,8−ンスルホン酸(LYCH)を使って得られた。ニカリウム塩の構造式は
図1に示される。ルノファーイエローCHおよびそのニカリウム塩は、Aldr
ich Chemical Company。
Inc、、 Mo1ecular Probes、Inc、、Sigma Ch
emical Company力1ら入手可能である。Stewart、 W、
、 Ce11.14.741 (+978)も参照のこと(これは参考として本
明細書中に組み込まれる)。LYCHの修飾変形および誘導体も同様な結果を与
えることかできる。
多数の他のヒドラジン基含有試薬も知られており、その幾つかを使って試験を行
った。例えば、ヒトランノアクリトンで標識された炭水化物は、電気泳動処理の
後、青色蛍光バンドを生した。この7<ノドは乾燥後は明るい空色になった。リ
サミンローダミンBスルホニルヒドラジドを蛍光試薬として使用すると、電気泳
動ケル上ての泳動後に感光性の糖誘導体ノ1ントを生じた。
標識された炭水化物物質は蛍光性でなげればならない。標識試薬かそれ自体蛍光
性であってもよく、または炭水化物物質と反応後に蛍光性になってもよい。
好ましくは、ゲルは15%〜60%、好ましくは20%〜40%の範囲の濃度を
存する比較的濃厚なポリアクリルアミドゲルを含んで成るか、場合によっては、
より低濃度のゲルを使用することか可能であるかまたは好ましいかもしれない。
ゲルは均一濃度のゲルであるかまたは勾配ゲルの形である二とかできる。
ケルは、好ましくは、例えばN、N’−メチレンヒスアクリルアミド(ビス)に
より架橋される。
現在好ましい1つのゲルは、20%(最上部)から40%(最下部)まで連続勾
配で異なるポリアクリルアミドゲル濃度(W/V)を存する直線ポリアクリルア
ミド勾配ゲルを含んで成る。このケルは、最低濃度のポリアクリルアミドの所の
0.53%から最高濃度のポリアクリルアミドの所の1.06%まで異なる濃度
(W/V)でビスにより架橋される。
良好な分離および感度のために、ゲルは、タンパク質およびDNA断片を扱うだ
めの既知の技術、例えばIRL Pressにより発光されたB、D、 Ham
esおよびり、 Rickwood編の本”Gel electrophore
sis ofl)roteins: a practical approac
h”に記載された技術を使って、好ましくは濃縮用緩衝液系を使って泳動される
(移動界面電気泳動、多相ゾーン電気泳動および他の名称で知られている)。
電気泳動は、便利には、Neville、 Jr、 D、M、、J、 Biol
、 Chem。
246.6328−6334に記載されたものに基づいた不連続電気泳動緩衝液
系を使って実施される。
ゲルを泳動した後、適当な波長の光、例えば紫外光を照射すると、場合によって
は標識された炭水化物物質を肉眼で見ることかできるけれとも、CCDを使って
像化することにより、より良好な分離と感度を得ることができる。適当な励起に
より、LYCHは黄色発光と高い量子収率て強力に蛍光を発する。発光はCCD
による検出に非常に適し、スペクトルの赤色端で最大の感度と量子収率を有し、
スペクトルの青色端で最低の感度と量子収率を存する。CODの使用は、非常に
迅速に容易に量子化された結果を与えるという利点も有する。
更に、優れた定量的結果は、直線的動的範囲か広いためCCDによりすぐに利用
可能である。更に、CCDは、ゲルを泳動している最中にゲルを観察するのに用
いることができる。
冷却2−D CCDを使用し、遅いスキャン読み出して操作することが好ましい
。適当なCODシステムの一例は、Astromed Lim1ted。
Cambridge、 United Kingdomにより製造されたCCD
2200 Imagingsystemである。CCDは好ましくは少なくと
も一25°Cはどの低温に冷却され、−160°Cまて更に冷却することにより
感度が有意に増大する。典型的な作業温度は一40°C〜−130°Cの範囲内
である。
標識試薬、例えばLYCHは、必要であれば結合した生体分子からの遊離後、炭
水化物物質上の部位に結合させることができる。あるいは、生体分子を既知の方
法で修飾して標識試薬の取り込みを可能にしてもよい。
炭水化物物質は、ことによると還元剤、例えば水素化シアノホウ素ナトリウムの
存在下で、該物質をLYCHと共にインキュベートすることにより、LYCHて
標識することができる。水素化シアノホウ素ナトリウムは、好ましくはジメチル
スルホキッド(DMSO)中の溶液の形である。良好な標識のためには、酢酸と
水の混合物、例えば15容量部の酢酸と85容量部の水を含む混合物中の溶液の
形てLYCHを添加するのが育用であると判明した。LYCIIは例えはMo1
ecular ProbesInc、、Eugene、 Oregonから市販
されており、それらはカリウム塩の形で該材料を供給している。
電気泳動にかけた物質の移動速度は、物質の大きさく分子量)および構造によっ
て異なる。よって本発明を使って炭水化物物質の大きさおよび形状に関する情報
を得ることができ、そして既知の標準の結果と比較することにより、未知の炭水
化物物質を部分的にまたは完全に特徴付けることか可能であろう。本発明の1つ
の利用は、参考として本明細書中に組み込まれるWO38/+0422に記載さ
れたように、グルコシダーゼを使って未知の炭水化物を小さい断片に開裂せしめ
、そして生じた断片を同定することにより、炭水化物構造を明らかにすることに
おいてである。
本発明は、糖タンパク質、プロテオグリカン、糖脂質およびスフィンゴ糖脂質並
びに池の生体分子から誘導されるものを包含する、広範囲の炭水化物構造におい
て利用可能である。
下記の実施例によりおよび添付図面への参照により、本発明を例示のつもりで更
に説明する。
図1は、ニカリウム塩の形のLYCHの構造を示す。
図2は、LYCHて標識された種々の糖を示す電気泳動ゲルの写真である。
実施例
LYCHはニカリウム塩としてMo1ecular Probes Inc、か
ら入手した。
氷酢酸/水(15: 85. v/v)中に微細な懸濁液(5,21g/l)を
調製した。水素化シアノホウ素ナトリウム(NaCNBH3)はAldrich
Chemical Co、から入手し、ジメチルスルホキシド(DMSO)中の
0.1N1溶液として使用する。
次の還元糖(全てD配置)を各々5ナノモル含存する溶液を超遠心管中に凍結乾
燥した。6−ジオキシグルコース、グルコース、ガラクトース、N−アセチルガ
ラクトース、ガラクトノルα−1,4−ガラクトース、ラクトース、マルトース
、ガラクトースース、セロトリオース、マルトトリオース、マルトテトラオース
、マルトペンタオース、マルトヘキサオースおよびマルトヘプタオース。凍結乾
燥した糖にLYCH懸濁液5μlと水素化シアノホウ素ナトリウム溶液5μlを
添加した。生した溶液をよく混合し、室温で30分間インキュベートし、そして
遠心真空蒸発器を使って40″Cにて4時間凍結乾燥した。この反応混合物に、
0.04]Mトリス塩基、0.04Mホウ酸(pH8,64)中に6M尿素を含
む溶液(電気泳動用試料緩衝液)を適量加えた。得られた試料を即座に使用する
かまたは電気泳動するまで一70″Cで保存した。
52.1g/lのLYCH懸濁液を使って上記手順を繰り返し、そして全く糖を
含まない対照も調製した。
LYCHて標識された糖と対照をポリアクリルアミドゲル中ての電気泳動にかけ
た。分離は各糖の分子量および構造に依存する。移動界面(濃縮用)緩衝液系を
使ってシャープなバンドと高分解能を与える。この系は上記に言及したNevi
lleの方法に基づく。
電気泳動は、20%w/vアクリルアミド、0,53%w/v N、 N’ −
メチレンビスアクリルアミド(ビス)から40%W/Vアクリルアミド、1、0
6%W/V ヒスまての直線勾配から成る分離用ゲルを使って実施した。3.0
%W/Vアクリルアミドと0.08%W/Vビスを含む濃縮用ケルを使った。N
evilleにより記載されたものに基つく不連続電気泳動緩衝液系を使用した
か、ただしSDSを削除した。ゲルを5〜7°Cの周囲緩衝液により冷却した。
使用した電圧は100V (定電圧)で30分間、次いて500V (定電圧)
で60分間、次いて100V (定電圧)で90分間であった。
4レーンにおいて次の試料を使ってゲルを泳動した。
レーン1 糖+LYC)! (52,1g/ i溶液)。
レーン2 糖なし+LYC)I (52,1g/ I!温溶液。
レーン3 糖+LYCH(5,21g/l溶液)。
レーン4 糖なし+LYCH(5,21g/l溶液)。
下方から紫外照明ボックスにより照射した結果生じたゲルの写真を図2に示す。
照明ボックスからの紫外光と青色光を減らすためにカメラにWratten N
o、8フイルターを使った。糖に相当するハントは、それらが明瞭である場所に
示される。
LYCH標識は、適当な照射光(吸光度最大波長=428 nm)で刺激した時
に強く蛍光を発する。予備実験は、おそら< LYCH中の不純物により生じた
と忠われるゲル上の幾つかのほやけたバントを示した。
本発明の好ましい実施態様の上記記載は例示と説明のために提供されている。そ
れは開示される正確な形式に本発明を限定するつもりのものではない。明らかに
、当業界の専門家には多数の改良および変更が明白であろう。本発明の原理およ
びそれの実用を最も良く説明し、それによって当業者か本発明の様々な実施態様
を理解できるようにするために、そして期待される特定の用途に適するように様
々な変更を伴って、実施態様を選択し記載した。本発明の範囲は次の請求の範囲
およびそれらの同等物により定義される。
〒H2
H
!
H2
FIG、I
FIG、2
国際調査報告
1*ltr+−啼一静−−一一宮テ/1m1八鳩ζ
Claims (21)
- 1.炭水化物物質を分離または識別する方法であって、ヒドラジン基を含む標識 試薬で炭水化物物質を標識して蛍光標識された物質を生成せしめ、前記標識され た物質を電気泳動用ゲルに適用し、そして前記ゲルを泳動して異なる物質の示差 移動を引き起こすことを含んで成る方法。
- 2.前記標識試薬がルシファーイエロー(Lucifer Yellow)CH を含んで成る、請求項1の方法。
- 3.前記炭水化物物質が、前記物質を還元剤の存在下でルシファーイエローCH と共にインキュベートすることによりルシファーイエローCHで標識される、請 求項2の方法。
- 4.前記還元剤が水素化シアノホウ素ナトリウムである、請求項3の方法。
- 5.前記ゲルが、15%〜60%の範囲の濃度を有する比較的濃厚なポリアクリ ルアミドゲルを含んで成る、請求項1の方法。
- 6.前記ゲルが20%〜40%の範囲の濃度を有する、請求項5の方法。
- 7.前記ゲルが勾配ゲルの形である、請求項1,2,3,4または5の方法。
- 8.前記ゲルが架橋される、請求項1,2,3,4,5,6または7に記載の方 法。
- 9.前記ゲルが、20%(最上部)から40%(最下部)までの連続勾配で異な るポリアクリルアミドゲル濃度(w/v)を有する直線ポリアクリルアミド勾配 ゲルを含んで成り、前記ゲルが最低濃度のポリアクリルアミドの所の0.53% から最高濃度のポリアクリルアミドの所の1.06%まで異なる濃度(w/v) でビスにより架橋される、請求項1,2,3,4,5,6,7または8の方法。
- 10.前記ゲルが濃縮用緩衝液系を使って泳動される、請求項1,2,3,4, 5,6,7,8または9の方法。
- 11.前記標識された炭水化物物質が電荷共役装置を使ってゲル中で像化される 、1,2,3,4,5,6,7,8,9または10の方法。
- 12.前記電荷結合素子が、遅いスキャン読み出しで操作される冷却20dCC Dである、請求項11の方法。
- 13.炭水化物物質を分離または識別するためのキットであって、a)蛍光標識 された物質を生成することができるヒドラジン基を含む標識試薬; b)電気泳動用ゲル:および c)試験しようとする炭水化物物質と比較するための炭水化物標準 を含んで成るキット。
- 14.前記標識試薬がルシファーイエローCHである、請求項13のキット。
- 15.前記キットが還元剤を更に含んで成る、請求項13のキット。
- 16.前記還元剤が水素化シアノホウ素ナトリウムである、請求項15のキット 。
- 17.前記電気泳動用ゲルが15%〜60%の範囲の濃度を有する比較的濃厚な ポリアクリルアミドゲルである、請求項13のキット。
- 18.前記ゲルが20%〜40%の範囲の濃度を有する、請求項16のキット。
- 19.前記ゲルが勾配ゲルの形である、請求項16または17のキット。
- 20.前記ゲルが架橋される、請求項16,17または18のキット。
- 21.前記キットが電荷結合素子を含んで成る、請求項16,17,18または 19のキット。
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PCT/US1991/004555 WO1993002356A1 (en) | 1991-07-22 | 1991-07-22 | Analysis of carbohydrates and kits therefore |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH06504363A true JPH06504363A (ja) | 1994-05-19 |
Family
ID=22225633
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP3513054A Pending JPH06504363A (ja) | 1991-07-22 | 1991-07-22 | 炭水化物の分析およびそのためのキット |
Country Status (3)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0595806A1 (ja) |
| JP (1) | JPH06504363A (ja) |
| WO (1) | WO1993002356A1 (ja) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0938675B1 (en) | 1996-10-07 | 2003-05-07 | Amersham plc | Analysis of carbohydrates |
| US6190522B1 (en) * | 1998-04-24 | 2001-02-20 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Analysis of carbohydrates derivatized with visible dye by high-resolution polyacrylamide gel electrophoresis |
| GB201012417D0 (en) * | 2010-07-23 | 2010-09-08 | Cambridge Entpr Ltd | Capilary electrophoresis of carbohydrates |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4163779A (en) * | 1978-01-09 | 1979-08-07 | International Diagnostic Technology, Inc. | Test for quantitation of immunoglobulin and identification of abnormal immunoglobulin |
| US4473693A (en) * | 1978-08-04 | 1984-09-25 | Stewart Walter W | Aminonaphthalimide dyes for intracellular labelling |
| US4238195A (en) * | 1979-01-18 | 1980-12-09 | Miles Laboratories, Inc. | Fluorescer-labeled specific binding assays |
| US4867973A (en) * | 1984-08-31 | 1989-09-19 | Cytogen Corporation | Antibody-therapeutic agent conjugates |
| US5034514A (en) * | 1986-03-17 | 1991-07-23 | Cetus Corporation | Novel cross-linking agents |
| US4876188A (en) * | 1986-11-18 | 1989-10-24 | Scripps Clinic And Research Foundation | Novel immunochemical method for assaying stable glycosylated hemoglobin |
| US4937183A (en) * | 1988-02-03 | 1990-06-26 | Cytogen Corporation | Method for the preparation of antibody-fragment conjugates |
| US5047227A (en) * | 1988-02-08 | 1991-09-10 | Cytogen Corporation | Novel and improved antibodies for site specific attachment of compounds |
-
1991
- 1991-07-22 EP EP91913717A patent/EP0595806A1/en not_active Withdrawn
- 1991-07-22 WO PCT/US1991/004555 patent/WO1993002356A1/en not_active Ceased
- 1991-07-22 JP JP3513054A patent/JPH06504363A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO1993002356A1 (en) | 1993-02-04 |
| EP0595806A1 (en) | 1994-05-11 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Matthews et al. | Urea-induced unfolding of the. alpha. subunit of tryptophan synthase: evidence for a multistate process | |
| Ogawa et al. | The histochemical distribution of protein bound sulfhydryl groups in human epidermis by the new staining method. | |
| US5877310A (en) | Glycoconjugated fluorescent labeling reagents | |
| US6972326B2 (en) | Labeling of immobilized proteins using dipyrrometheneboron difluoride dyes | |
| US7371745B2 (en) | Bis-transition-metal-chelate probes | |
| JPS62174067A (ja) | レゾルフイン誘導体並びにその製法 | |
| US4689307A (en) | Fluorescence microscopy sample mounting method and structure | |
| DE60016233T2 (de) | Differenz-nachweismethoden unter verwendung einer vielzahl von abgestimmten farbstoffen | |
| US20090004641A1 (en) | Site-specific labeling of affinity peptides in fusion proteins | |
| DE69632913D1 (de) | Borathaltige speicherpuffer und probenverdünner | |
| US5132439A (en) | Protein staining compositions and methods | |
| JPH06504363A (ja) | 炭水化物の分析およびそのためのキット | |
| US5273906A (en) | Protein staining compositions and methods | |
| US6919333B2 (en) | Bis-transition-metal-chelate probes | |
| Nerenberg et al. | Rapid fluorescent “staining” of nondenatured protein bands in agar and polyacrylamide gels | |
| Basile et al. | A new method for separating and comparing arabinogalactan proteins for the chemosystematics of the Hepaticae | |
| US3891670A (en) | N-(1-anilino naphthyl-4) malemide thiol-group detecting reagent | |
| Hildenbrand et al. | Sugar transport by the bacterial phosphotransferase system. Nanosecond fluorescence studies of the phosphocarrier protein (HPr) labeled at the NH2-terminal methionine. | |
| JPH0315752A (ja) | 分子量マーカー | |
| Inglis et al. | Sephadex G-200 gel electrophoresis of human serum alkaline phosphatases | |
| EP0673392B1 (en) | Method of preferential labelling of phycobiliprotein with amine-reactive dye for use in a multiple color assay | |
| WO2006019179A1 (ja) | 希土類蛍光錯体を用いた標識方法と分析検出法 | |
| US11186719B2 (en) | Hemicyanine dyes | |
| Toome et al. | Chiroptical properties of fluorescamine condensation compounds with secondary amino acids insitu | |
| Nalty et al. | Transfer of proteins from acrylamide gels to nitrocellulose paper after silver stain detection |