JPH07231785A - 新規な酵素、該酵素を製造する方法、該酵素をコードするdna、該dnaを含む形質転換体、該酵素による光学活性アルコール等の製造方法 - Google Patents

新規な酵素、該酵素を製造する方法、該酵素をコードするdna、該dnaを含む形質転換体、該酵素による光学活性アルコール等の製造方法

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JPH07231785A
JPH07231785A JP6181308A JP18130894A JPH07231785A JP H07231785 A JPH07231785 A JP H07231785A JP 6181308 A JP6181308 A JP 6181308A JP 18130894 A JP18130894 A JP 18130894A JP H07231785 A JPH07231785 A JP H07231785A
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 光学活性アルコール等の合成に有用な新規な
2級アルコール脱水素酵素及び該酵素をコードするDN
Aを提供する。 【構成】 キャンディダ属に属する微生物が立体選択性
の高い、新規な2級アルコール脱水素酵素を生産するこ
とを見いだした。また、該酵素を利用して、光学活性ア
ルコール等を製造した。また、該酵素をコードするDN
Aをクローニングし、その塩基配列を明らかにした。 【効果】 新規な立体選択性の高い2級アルコール脱水
素酵素、該酵素をコードする遺伝子を提供したことによ
って、光学活性アルコール等の効率的な製造が可能にな
った。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、アルコール、アルデヒ
ド、ケトンの製造、特に光学活性アルコールの製造に有
用な新規な2級アルコール脱水素酵素、該酵素の製造方
法、該酵素をコードするDNA、該DNAにより形質転
換された微生物、及び該酵素を用いてアルコール、アル
デヒド、ケトン、特に光学活性アルコールを製造する方
法に関する。
【0002】
【従来の技術】微生物が産生する2級アルコール脱水素
酵素としては、補酵素としてニコチンアミドアデニンジ
ヌクレオチドリン酸(以下、NADP+ と略す)を要求
するサーモアナエロビウム・ブロッキー (Thermoanaero
bium brockii) 由来のアルコール脱水素酵素(J.Am.Che
m.Soc. 108, 162-169 (1986))が知られている。また、
補酵素としてニコチンアミドアデニンジヌクレオチド
(以下、NAD+ と略す)を要求する2級アルコール脱
水素酵素としては、ピキア・エスピー NRRL-Y-11328
(Pichia sp. NRRL-Y-11328: Eur.J.Biochem. 101, 401
-406 (1979) )、シュードモナス・エスピー SPD6 (Ps
eudomonas sp. SPD6: Bioorg.Chem. 19, 398-417 (199
1) )、シュードモナス・フルオレッセンス NRRL B-124
4(Pseudomonasfluorescens NRRL B-1244: 特開昭59-1
7982号)、シュードモナス・マルトフィラ MB11L(Pseu
domonas maltophilia MB11L: FEMS Microbiol.Lett. 9
3, 49-56(1992))、シュードモナス・エスピー PED(Ps
eudomonas sp. PED: J.Org.Chem.57, 1526-1532 (1992)
)、シュードモナス・エスピー ATCC 21439 (Pseudom
onas sp. ATCC 21439: Eur.J.Biochem. 119, 359-364
(1981))、キャンディダ・ボイディニー SAHM (Candid
a boidinii SAHM: Biochim.Biophys.Acta 716, 298-307
(1992) )、ミコバクテリウム・バカエ JOB-5(Mycoba
cterium vaccae JOB-5: J.Gen.Microbiol. 131, 2901-2
907 (1985))、ロドコッカス・ロドクロウスPNKb1(Rho
dococcus rhodochrous PNKb1: Arch.Microbiol. 153, 1
63-168 (1990))、コマモナス・テリゲナ(Comamonas t
errigena: Biochim.Biophys.Acta 661, 74-86 (1981)
)、アースロバクター・エスピー SBA(Arthrobacter
sp. SBA: 特開昭51-57882号)由来の酵素が報告されて
いる。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、これら
の2級アルコール脱水素酵素の立体選択性は満足できる
ものではない。例えば、2級アルコール脱水素酵素の基
質として最も報告の多い2−ブタノールに対して、
(S)−2−ブタノールを立体選択的に酸化し、2−ブ
タノンを生成する活性を有する酵素は知られていない
(シュードモナス・エスピー ATCC 21439 、シュードモ
ナス・エスピー SPD6 、コマモナス・テリゲナ、キャン
ディダ・ボイディニー SAHM 又はピキア・エスピー NRR
L-Y-11328 が産生する酵素においてはR体が優先的に酸
化され、シュードモナス・フルオレッセンス NRRL B-12
44が産生する酵素においては立体選択性を示さず、ミコ
バクテリウム・バカエ JOB-5、ロドコッカス・ロドクロ
ウス PNKb1、シュードモナス・エスピー PED又はシュー
ドモナス・マルトフィラ MB11Lが産生する酵素において
はその立体選択性は記載されていない)。なお、パン酵
母(Saccharomyces cerevisiae)由来の1級アルコール
脱水素酵素(SADH I)は、2−ブタノールに関してはS
体を優先的に酸化するという報告があるが(Arch.Bioch
em.Biophys.,126,933-944(1968) 、J.Biol.Chem.,268,7
792-7798(1993))、その相対活性はエタノールの1%程
度と極めて低く、到底実用に耐えられるものではない。
【0004】即ち、(S)−2−ブタノールを優先的に
酸化する2級アルコール脱水素酵素はこれまで知られて
おらず、立体選択性の高い2級アルコール脱水素酵素を
見い出すことが強く望まれていた。
【0005】また、該酵素の遺伝子をクローニングでき
れば、遺伝子工学の手法を用いて該酵素を大量に製造す
ることが可能となるので、該酵素をコードする遺伝子を
クローニングすることが強く望まれていた。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、(S)−
2−ブタノールを優先的に酸化する能力を有する微生物
を広くスクリーニングし、キャンディダ属に属する微生
物、特にキャンディダ・パラプシロシス (Candida para
psilosis)が(S)−2−ブタノールを優先的に酸化す
る能力を有することを見いだした。更に、この微生物を
培養し、その菌体より(S)−2−ブタノールを酸化す
る酵素を精製した。そして、その性質を検討した結果、
該酵素が(S)−2−ブタノールを高い立体選択性を持
って酸化すること、更に(S)−2−ブタノール以外の
多くの2級アルコールを立体選択的に酸化することを見
いだした。
【0007】即ち、本発明は、次のからに示す理化
学的性質を有する酵素を提供する。 作用 NAD+ を補酵素として、アルコールを酸化し、ケトン
又はアルデヒドを生成する。また、NADHを補酵素と
して、ケトン又はアルデヒドを還元し、アルコールを生
成する。
【0008】基質特異性 芳香族置換を含む脂肪族アルコールを酸化反応の基質と
する。1級アルコールに比較して2級アルコールに対し
て活性が高い。2−ブタノールのS体を優先的に酸化す
る。
【0009】アルデヒド又は芳香族置換を含む脂肪族ケ
トンを還元反応の基質とする。
【0010】分子量 SDS−PAGEで測定した場合、約4万。なお、本発
明の酵素の上記以外の理化学的性質、及び酵素学的性質
は以下の通りである。
【0011】至適pH及び安定pH範囲 (S)−2−ブタノール酸化反応の至適pHは8.5〜
9.5である。2−ブタノン還元反応の至適pHは5.
5〜6.5である。
【0012】pH8.0〜10.0で比較的安定であ
る。
【0013】作用適温の範囲 25〜55℃で活性が高く、50℃が至適温度である。
【0014】温度による失活の条件 40℃10分間の熱処理後でも90%以上の残存活性を
有する。
【0015】阻害及び安定化 パラヒドロキシ安息香酸、塩化水銀、塩化銅、塩化亜
鉛、N−エチルマレイミドなどのSH試薬で阻害され
る。還元剤の2ーメルカプトエタノール、ジチオスレイ
トールで阻害され、o−フェナントロリンで阻害される
が、エチレンジアミン4酢酸では阻害されない。
【0016】精製方法 通常のタンパク質の精製方法を適当に組み合わせること
により精製することができる。例えば、菌体を破砕後、
プロタミン硫酸沈澱を行い、その遠心分離上清を硫酸ア
ンモニウムを用いて塩析し、更に、陰イオン交換クロマ
トグラフィー、疎水クロマトグラフィー、ゲルろ過を組
み合わせることにより、ドデシル硫酸ナトリウム−ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動(以下、SDS−PAGE
と略す)で単一バンドになるまで精製することができ
る。
【0017】等電点 等電点電気泳動に於いていくつかのバンドを生成する
が、主要なバンドの等電点は、6.7であった。
【0018】なお、本明細書中の実施例を含む全ての2
級アルコール脱水素酵素活性の測定は、以下に示す方法
により行った。即ち、トリス−塩酸緩衝液(pH9.0 )50
μmol, NAD+ 2.5 μmol, (S)−2−ブタノール
50μmol 及び酵素を含む反応液中30℃で反応させ、N
ADHの生成に由来する340nm の吸光度の増大を測定し
た。1Uは、1分間に 1μmol のNADHの生成を触媒
する酵素量とした。
【0019】また、本発明は、2級アルコール脱水素酵
素をコードするDNAを提供する。即ち、本発明者ら
は、精製した2級アルコール脱水素酵素をリジルエンド
ペプチダーゼにより消化し、逆相HPLCにより切断さ
れた断片を精製後、プロテインシーケンサーによりアミ
ノ酸配列の一部を決定した。得られたアミノ酸配列をも
とにして、PCR(Polymerase Chain Reaction) 用プラ
イマーを合成し、キャンディダ・パラプシロシス (Cand
ida parapsilosis)の染色体DNAを鋳型としたPCR
を行い、2級アルコール脱水素酵素をコードする遺伝子
の一部を増幅し、その塩基配列(コア配列)を明らかに
した。更に、得られたDNA配列(コア配列)の周辺領
域の塩基配列を明らかにするために、キャンディダ・パ
ラプシロシス (Candida parapsilosis)の染色体DNA
をコア配列中にその認識配列が存在しない制限酵素 Hae
II により消化し、生成したDNA断片をT4リガーゼ
により自己環化し、逆PCR(Nucleic Acids Res. 16,
8186 (1988))用の鋳型DNAを調製した。次に、コア
配列をもとに、コア配列の外側に向かうDNA合成の開
始点となるプライマーを合成し、逆PCRによりコア配
列の周辺領域を増幅した。得られたDNAの塩基配列を
明らかにした結果、自己環化したDNA中に、図6、
7、8に示す2級アルコール脱水素酵素の全コード領域
が含まれていることを確認した。更に、クローニングし
た遺伝子の大腸菌宿主中での発現産物が、キャンディダ
・パラプシロシス由来の2級アルコール脱水素酵素と同
様の活性を有することを確認した。
【0020】本願発明の、2級アルコール脱水素酵素を
コードするDNAは、2級アルコール脱水素酵素の活性
を有していて、アミノ酸配列が実質的に図6、7、8に
示されている蛋白質をコードする塩基配列を含むことを
特徴とする。ここで「実質的」とは、2級アルコール脱
水素酵素の活性を有する限り、図6、7、8に示したア
ミノ酸配列についてアミノ酸のいくつかの欠失、挿入、
置換等があってもよいことを示すものである。本発明の
DNAには、図6、7、8に示した1008塩基からな
るDNAが含まれることはいうまでもないが、本願発明
はこれに限られるものではない。なお、DNAがコード
するアミノ酸配列についてアミノ酸のいくつかの欠失、
挿入、置換等を生じるようにDNAを改変することは、
合成オリゴヌクレオチドを用いた部位特異的変異導入法
など、周知の方法で適宜行うことができる。また、図
6、7、8に示した1008塩基を含むDNAまたは該
DNAを適宜改変したDNAを鋳型にして、PCR法を
Mn2+イオンの存在下(通常0.5〜10mMの濃度)
または特定のヌクレオチドの濃度を低くして行うことに
よって、ランダムに変異が導入されたDNAを得ること
ができる。このようにして得られたDNAのうち、2級
アルコール脱水素酵素の活性を有するタンパク質をコー
ドするものが、本願発明に含まれることはいうまでもな
い。
【0021】更に本発明は、アミノ酸配列が実質的に図
6、7、8に示されている蛋白質をコードするDNAに
より形質転換された、2級アルコール脱水素酵素生産能
を有する微生物を提供する。
【0022】本発明において形質転換の対象となる微生
物は、2級アルコール脱水素酵素活性を有するポリペプ
チドをコードするDNAにより形質転換され、2級アル
コール脱水素酵素活性を発現することができる微生物で
あればいかなるものでもよく、具体的には、イシェリヒ
ア(Escherichia) 属,バチルス(Bacillus)属,シュード
モナス(Pseudomonas) 属,セラチア(Serratia)属,ブレ
ビバクテリウム(Brevibacterium)属,コリネバクテリイ
ウム(Corynebacterium) 属、ストレプトコッカス(Strep
tococcu)属、ラクトバチルス(Lactobacillus) 属など宿
主,ベクター系の開発されている細菌、サッカロマイセ
ス(Saccharomyces) 属,クライベロマイセス(Kluyverom
yces) 属,シゾサッカロマイセス(Schizosaccharomyce
s) 属,チゴサッカロマイセス属(Zygosaccharomyces)
、ヤロウイア(Yarrowia)属、トリコスポロン(Trichosp
oron)属、ロドスポリジウム(Rhodosporidium)属、ハン
ゼヌラ(Hansenula) 属、ピキア(Pichia)属、キャンディ
ダ(Candida) 属などの酵母、ノイロスポラ(Neurospora)
属、アスペルギルス(Aspergillus) 属、セファロスポリ
ウム(Cephalosporium)属、トリコデルマ(Trichoderma)
属などに属するカビなどが含まれる。
【0023】形質転換体の作製のための手順ないし、方
法そのものは、分子生物学、生物工学、遺伝子工学の分
野において慣用されている技術に準じて行うことができ
る。
【0024】微生物中において、本発明の遺伝子を発現
させるためには、まず微生物中において安定に存在する
プラスミドベクターやファージベクター中にこの遺伝子
を挿入する必要がある。また、本発明のDNAを微生物
中で発現させるためには、それが有する遺伝情報を転写
・翻訳させる必要がある。そのためには、転写・翻訳を
制御するユニットにあたるプロモーターを本発明のDN
Aの5'- 側上流に、ターミネーターを3'- 側下流に、そ
れぞれ組み込めばよい。このプロモーター、ターミネー
ターとしては、宿主として利用する微生物中において機
能することが知られているプロモーター、ターミネータ
ーを用いる必要がある。これら各種微生物において利用
可能なベクター、プロモーター、ターミネータ−などに
関して「微生物学基礎講座8遺伝子工学・共立出版」、
特に酵母に関しては「Adv.Biochem.Eng. 43, 75-102 (1
990)」又は「Yeast 8, 423-488 (1992) 」 などに詳細
に記述されている。
【0025】例えば、イシェリヒア属特に大腸菌イシェ
リヒア・コリ(Escherichia coli)においては、プラスミ
ドベクターとして、pBR, pUC 系プラスミドを利用する
ことが可能であり、lac(β−ガラクトシダーゼ), trp(
トリプトファンオペロン), tac(lac, trp の融合), λ
ファージ PL, PR などに由来するプロモーターなどが利
用できる。また、ターミネーターとしては、trpA 由
来、ファージ由来 rrnBリボソーマルターミネーターな
どを用いることができる。
【0026】バチルス属においては、ベクターとしてpU
B110系プラスミド、pC194 系プラスミドなどが利用可能
であり、染色体に直接挿入させることもできる。また、
プロモーター、ターミネーターとして apr( アルカリプ
ロテアーゼ), npr( 中性プロテアーゼ), amy( α−アミ
ラーゼ) などが利用できる。
【0027】シュードモナス属においては、シュードモ
ナス・プチダ(Pseudomonas putida)、シュードモナス・
セパシア(Pseudomonas cepacia) などで宿主ベクター系
が開発されており、トルエン化合物の分解に関与するプ
ラスミド TOL プラスミドを基本にした広宿主域ベクタ
ー(RSF1010 などに由来する自律的複製に必要な遺伝子
を含む) pKT240 などが利用可能であり、プロモータ
ー、ターミネーターとして、リパーゼ遺伝子(特開平5-
284973号)などが利用できる。
【0028】ブレビバクテリウム属、特にブレビバクテ
リウム・ラクトファーメンタム(Brevibacterium lactof
ermentum) においては、pAJ43 (Gene 39, 281 (1985))
などのプラスミドベクターが利用可能であり、プロモー
ター、ターミネーターとしては、大腸菌で使用されてい
るプロモーター、ターミネーターがそのまま利用可能で
ある。
【0029】コリネバクテリウム属、特にコリネバクテ
リウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)に
おいては、pCS11 ( 特開昭57-183799 号), pCB101 (Mo
l.Gen.Genet. 196, 175 (1984))などのプラスミドベク
ターが利用可能である。
【0030】ストレプトコッカス(Streptococcu)属にお
いては、pHV1301 (FEMS Microbiol.Lett. 26, 239 (198
5)),pGK1(Appl.Environ.MIcrobiol. 50, 94 (1985)
)などがプラスミドベクターとして利用可能である。
【0031】ラクトバチルス(Lactobacillus) 属におい
ては、ストレプトコッカス属用に開発された pAMβ1
(J.Bacteriol. 137, 614 (1979))などが利用可能であ
り、プロモーターとして大腸菌で利用されるているもの
が利用可能である。
【0032】サッカロマイセス(Saccharomyces) 属、特
にサッカロマイセス・セレビジアエ(Saccharomyces cer
evisiae) においては、YRp 系,YEp 系,YCp 系,YIp
系プラスミドが利用可能であり、染色体内に多コピー存
在するリボソームDNAとの相同組換えを利用したイン
テグレーションベクター(EP 537456 など)は、多コピ
ーで遺伝子を導入でき、かつ安定に遺伝子を保持できる
ため極めて有用である。また、ADH(アルコール脱水素酵
素), GAPDH( グリセルアルデヒド−3−リン酸脱水素酵
素), PHO( 酸性フォスファターゼ), GAL( β−ガラクト
シダーゼ), PGK( ホスホグリセレートキナーゼ), ENO(
エノラーゼ) などのプロモーター、ターミネーターが利
用可能でる。
【0033】クライベロマイセス属、特にクライベロマ
イセス・ラクティス(Kluyveromyceslactis)において
は、サッカロマイセス・セレビジアエ由来 2μm 系プラ
スミド, pKD1 系プラスミド(J.Bacteriol. 145, 382-
390 (1981)),キラー活性に関与する pGKl1 由来プラ
スミド, クライベロマイセス属における自律増殖遺伝子
KARS 系プラスミド,リボソームDNAなどとの相同組
換えにより染色体中にインテグレート可能なベクタープ
ラスミド(EP 537456 など)などが利用可能である。ま
た、ADH, PGK などに由来するプロモーター、ターミネ
ーターが利用可能である。
【0034】シゾサッカロマイセス(Schizosaccharomyc
es) 属においては、シゾサッカロマイセス・ポンベ由来
の ARS (自律複製に関与する遺伝子) 及びサッカロマイ
セス・セレビジアエ由来の栄養要求性を相補する選択マ
ーカーを含むプラスミドベクターが利用可能である(Mo
l.Cell.Biol. 6, 80 (1986) )。また、シゾサッカロマ
イセス・ポンベ由来の ADH プロモーターなどが利用で
きる(EMBO J. 6, 729(1987) )。
【0035】チゴサッカロマイセス属(Zygosaccharomyc
es) においては、チゴサッカロマイセス・ロウキシ (Zy
gosaccharomyces rouxii) 由来の pSB3 (Nucleic Acid
s Res. 13, 4267 (1985))などに由来するプラスミドベ
クターが利用可能であり、サッカロマイセス・セレビシ
エ由来 PHO5 プロモーターや、チゴサッカロマイセス・
ロウキシ由来 GAP-Zr(グリセルアルデヒド−3−リン酸
脱水素酵素) のプロモーター(Agri.Biol.Chem. 54, 25
21 (1990) )などが利用可能である。
【0036】ハンゼヌラ(Hansenula) 属においては、ハ
ンゼヌラ・ポリモルファ(Hansenulapolymorpha)におい
て宿主ベクター系が開発されている。ベクターとして
は、ハンゼヌラ・ポリモルファ由来自律複製に関与する
遺伝子(HARS1, HARS2)も利用可能であるが、比較的不
安定であるため、染色体への多コピーインテグレーショ
ンが有効である(Yeast 7, 431-443 (1991) )。また、
メタノールなどで誘導される AOX(アルコールオキシダ
ーゼ), FDH( ギ酸脱水素酵素) のプロモーターなどが利
用可能である。
【0037】ピキア(Pichia)属においては、ピキア・パ
ストリス(Pichia pastoris) などにピキア由来自律複製
に関与する遺伝子 (PARS1, PARS2) などを利用した宿主
ベクター系が開発されており(Mol.Cell.Biol. 5, 3376
(1985) )、高濃度培養とメタノールで誘導可能な AOX
など強いプロモーターが利用できる(Nucleic Acids
Res. 15, 3859 (1987))。
【0038】キャンディダ(Candida) 属においては、キ
ャンディダ・マルトーサ(Candida maltosa) 、キャンデ
ィダ・アルビカンス(Candida albicans)、キャンディダ
・トロピカリス(Candida tropicalis)などにおいて宿主
ベクター系が開発されている。キャンディダ・マルトー
サにおいてはキャンディダ・マルトーサ由来ARSがク
ローニングされ(Agri.Biol.Chem. 51, 51, 1587 (198
7) )、これを利用したベクターが開発されている。
【0039】アスペルギルス(Aspergillus) 属において
は、カビの中で最もよく研究されており、プラスミドや
染色体へのインテグレーションが利用可能であり、菌体
外プロテアーゼやアミラーゼ由来のプロモーターが利用
可能である(Trends in Biotechnology 7, 283-287 (19
89) )。
【0040】トリコデルマ(Trichoderma) 属において
は、トリコデルマ・リーゼイ(Trichoderma reesei)を利
用したホストベクター系が開発され、菌体外セルラーゼ
遺伝子由来プロモーターなどが利用できる(Biotechnol
ogy 7, 596-603 (1989) )。
【0041】本発明の酵素は、キャンディダ(Candida)
属に属する下記からに示す性質を有する酵素を産生
する微生物もしくはその変異株、又は該酵素をコードす
る遺伝子を異種の微生物宿主に導入し該酵素生産能を付
与された遺伝子組換え体を培養することなどにより製造
することができる。
【0042】作用 NAD+ を補酵素として、アルコールを酸化し、ケトン
又はアルデヒドを生成する。また、NADHを補酵素と
して、ケトン又はアルデヒドを還元し、アルコールを生
成する。
【0043】基質特異性 芳香族置換を含む脂肪族アルコールを酸化反応の基質と
する。1級アルコールに比較して2級アルコールに対し
て活性が高い。2−ブタノールのS体を優先的に酸化す
る。
【0044】アルデヒド又は芳香族置換を含む脂肪族ケ
トンを還元反応の基質とする。
【0045】分子量 SDS−PAGEで測定した場合、約4万。
【0046】更に、本発明の2級アルコール脱水素酵
素、又は該酵素を含む微生物(変異株や遺伝子組換え微
生物を含む)もしくはその処理物を、芳香族で置換され
てもよい脂肪族2級アルコール、例えば、2−ブタノー
ル、2−オクタノール、フェニルエタノール、1,3−
ブタンジオール、β−ヒドロキシ−n−酪酸エチルエス
テルなどのラセミ体アルコールに作用させ、光学異性体
の一方(2−ブタノール、2−オクタノール、フェニル
エタノール、1,3−ブタンジオール、β−ヒドロキシ
−n−酪酸エチルエステルにおいてはそのS体)のみを
酸化することにより、他方の光学活性アルコール(2−
ブタノール、2−オクタノール、フェニルエタノール、
1,3−ブタンジオール、β−ヒドロキシ−n−酪酸エ
チルエステルにおいてはそのR体)を生産することがで
きる。この酸化反応により補酵素NAD+ は還元され、
NADHが生成する。
【0047】生成したNADHは、例えば、微生物の有
するNADHをNAD+ に変換する能力により、NAD
+ に変換(再生)されることができる。また、グルタミ
ン酸脱水素酵素、グルコース脱水素酵素、NADH脱水
素酵素、NADHオキシダーゼなどのNADHをNAD
+ に酸化する活性を有する酵素、又はこれら酵素を含有
する微生物もしくはその処理物を反応系に添加すること
により、NAD+ を再生することもできる。また、本発
明の酵素の基質特異性を利用して、反応系にアセトン、
2−ブタノンなどの安価な本酵素の還元反応の基質を共
存させることにより、1種類の酵素でNAD+ の再生も
同時に行うことができる。
【0048】また、ケトン体に本発明の2級アルコール
脱水素酵素、又は該酵素を産生する微生物(変異株や形
質転換微生物を含む)もしくはその処理物を作用させ、
光学活性なアルコールを生産することができる。例え
ば、2−ブタノンから(S)−2−ブタノール、2−オ
クタノンから(S)−2−オクタノール、アセトフェノ
ンから(S)−1−フェニルエタノール、4−ヒドロキ
シ−2−ブタノンから(S)−1,3−ブタンジオー
ル、アセト酢酸エステルから(S)−β−ヒドロキシ−
n−酪酸エステルなどを生産することができる。この還
元反応により補酵素NADHは酸化され、NAD+ が生
成する。
【0049】生成したNAD+ は、例えば、微生物の有
するNAD+ をNADHに変換する能力により、NAD
Hに変換(再生)されることができる。このNAD+
元活性は、反応系にグルコース、エタノール、ギ酸など
を添加することにより促進することが可能である。ま
た、反応系に、ギ酸脱水素酵素、リンゴ酸脱水素酵素、
グルコース脱水素酵素などのNAD+ をNADHへ還元
する能力を有する酵素、又はこれら酵素を含む微生物も
しくはその処理物を添加することにより、NAD+ の還
元を行うこともできる。また、本発明の酵素の基質特異
性を利用して、反応系にイソプロパノールやエタノール
などの酸化反応の基質を添加することにより、1種類の
酵素でNADHの再生反応を同時に行うこともできる。
【0050】
【実施例】以下、実施例により本発明を更に詳しく説明
するが、本発明はこれに限定されるものではない。
【0051】[実施例1](2級アルコール脱水素酵素
の精製) キャンディダ・パラプシロシス IFO 1396 株をYM培地
(グルコース10g,バクトペプトン5g,酵母エキス
3g,麦芽エキス3g/L, pH6.0)で培養し、遠心分
離により菌体を調製した。
【0052】得られた湿菌体を超高圧細胞破砕装置によ
り菌体を破砕後、遠心分離により菌体残渣を除去し、無
細胞抽出液を得た。この無細胞抽出液にプロタミン硫酸
を添加し、核酸及びミクロゾームを除去した。遠心分離
により得られた上清に、硫安を添加して70%飽和にお
いて沈澱した画分を回収した。更に、Q−セファロース
FFを用いたアニオン交換クロマトグラフィーを行い、
塩化ナトリウムの濃度勾配溶出を行い、2級アルコール
脱水素酵素活性を有するピークを回収した。得られた画
分を1.62M硫安を含む緩衝液で平衡化したフェニル
−セファロースに添加し、疎水クロマトグラフィーを行
った。硫安濃度を0Mまで減少させ、2級アルコール脱
水素酵素活性画分を回収した(酵素活性の測定法は前述
の方法で行った)。この活性画分をレッド−セファロー
スのアフィニティーカラムに添加し、素通り画分をスー
パーデックス200のゲルろ過カラムに添加し、ゲルろ
過を行った。活性画分を回収し、モノQカラムに添加
し、塩化ナトリウムの濃度勾配を用いて陰イオン交換ク
ロマトグラフィーを行い、活性画分をSDS−PAGE
で純度検定を行い、単一バンドを示す画分のみを回収し
た。
【0053】得られた2級アルコール脱水素酵素標品
は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(Native-PAGE )
において1本メジャーなバンドと近接する数本の薄いバ
ンドがみられた。活性染色の結果、全てのバンドが2級
アルコール脱水素酵素活性を有しており、この酵素標品
をSDS−PAGEで解析した結果、単一バンドであっ
た。
【0054】SDS−PAGEにおけるバンドの分子量
は、約40000であった(図1)。
【0055】精製の要約を表1に示したが、精製酵素の
比活性は、1370U/mg−蛋白質であった。
【0056】
【表1】 [実施例2](2級アルコール脱水素酵素の至適pH) 2級アルコール脱水素酵素をカリウム−リン酸緩衝液
(KPB)、トリス−塩酸緩衝液(Tris-HCl)、ブリッ
トン−ロビンソン緩衝液を用いてpHを変化させて
(S)−2−ブタノールの酸化活性、2−ブタノンの還
元活性((S)−2−ブタノール 酸化活性測定時の条
件でNAD+ をNADH(0.4 μmol )に代えて測定
し、NADHの減少に伴う340nm の吸光度の減少を測定
したもの)を測定した。最大活性を100とした相対活
性で表し、図2、図3に示した。反応の至適pHは、
(S)−2−ブタノール酸化反応が8.5〜9.5、2
−ブタノンの還元反応が5.5〜6.5であった。
【0057】[実施例3](2級アルコール脱水素酵素
の作用至適温度) 2級アルコール脱水素酵素活性を標準反応条件のうち温
度だけを変化させて測定した表2に示した。至適温度は
50℃であった。
【0058】
【表2】 [実施例4](2級アルコール脱水素酵素のpH安定
性) トリス−塩酸緩衝液pH8.0−9.0、ブリットン−
ロビンソン緩衝液pH5.0−12.0中で30℃, 3
0分間処理後の残存活性を測定し図4に示した。pH
8.0〜10.0において最も安定であった。
【0059】[実施例5](2級アルコール脱水素酵素
の耐熱性) 2級アルコール脱水素酵素をpH8.0で10分間放置
した後、残存活性を測定し図5に示した。40℃、10
分間の熱処理後でも90%以上の残存活性を有してい
た。
【0060】[実施例6](2級アルコール脱水素酵素
の基質特異性) 2級アルコール脱水素酵素を種々のアルコール、アルデ
ヒドと反応し、その酸化,還元反応の活性を (S)−
2−ブタノールの酸化,2−ブタノンの還元をそれぞれ
100とした相対活性で表し、表3及び表4に示した。
【0061】
【表3】
【表4】 [実施例7](2級アルコール脱水素酵素の阻害剤に対
する挙動) 2級アルコール脱水素酵素を種々の試薬中で30℃、3
0分間処理し、処理後の活性を、未処理の活性を100
とした残存活性で表し、表5に示した。
【0062】
【表5】 酵素活性は、ジチオスレイトール(DTT)、ヨードア
セトアミド、パラクロロ水銀安息香酸、塩化水銀、塩化
亜鉛、高濃度の金属キレーター、2−メルカプトエタノ
ールによって顕著に阻害された。
【0063】[実施例8](2級アルコール脱水素酵素
の部分アミノ酸配列の解析) 精製した2級アルコール脱水素酵素 0.153mg を 50mM
トリス−塩酸 pH9.0,4M 尿素中において 0.53 μg の
リジルエンドペプチダーゼで30℃, 6時間消化した。切
断されたペプチド断片を逆相HPLC( 東ソー製 TSK O
DS-120T カラム) を用い、0.1% トリフルオロ酢酸中に
おけるアセトニトリルの勾配溶出により分離し、分取し
た。
【0064】分取したペプチドをABI製プロテインシ
ーケンサー477Aによりアミノ酸配列を決定した。
【0065】プロテインシーケンサーによって決定され
たアミノ酸配列は、図6、7、8のアミノ酸配列にアン
ダーラインで示した。
【0066】[実施例9](2級アルコール脱水素酵素
をコードする遺伝子のPCRクローニング) 2級アルコール脱水素酵素のN末端に近い部分のアミノ
酸配列から予想されるDNA配列を縮重を考慮して合成
し混合PCRプライマー(CpN) とした。また、C末端に
近い部分のアミノ酸配列から予想されるDNA配列の相
補配列をもう一方の混合PCRプライマー(CpT10) とし
て合成した。これら配列を図9に示した。なお、DNA
の合成は、ABI製DNAシンセサイザー381Aによ
り行った。
【0067】[実施例10](キャンディダ・パラプシ
ロシスからの染色体DNAの調製) キャンディダ・パラプシロシス IFO 1396 をYEPD培
地(1%酵母エキス、2%ポリペプトン、2%グルコー
ス)100mL 中で培養し、遠心分離により菌体を回収し
た。菌体を 25mL の 1M ソルビトール, 0.1M エチレン
ジアミン4酢酸(EDTA)に澱懸し、再度遠心分離に
より菌体を回収した。回収した菌体を 10mL の 50mM リ
ン酸カリウム緩衝液 pH7.5, 1M ソルビトール, 0.1M 2
- メルカプトエタノールで懸濁し、更に、2.5mg/mL チ
モリアーゼを0.4mL 添加し、30℃でインキュベートする
ことによりプロトプラストを形成した。検鏡によりプロ
トプラスト形成を確認後、遠心分離により菌体を回収し
た。回収した菌体を、12mLの 50mM トリス−塩酸 pH7.
4, 20mM EDTA に澱懸し、更に、1.2mL の 10% SDS(ド
デシル硫酸ナトリウム)を添加後よく混合した。この状
態で65℃, 30分間インキュベートした後、3.6mL の 5M
酢酸カリウム pH5.0 を添加し、氷上で60分間放置し、
タンパク質を変性沈殿させた。
【0068】遠心分離により変性タンパク質を分離し、
上清を回収後、等量のイソプロパノールを室温で添加
し、ゆっくりと混合した。遠心分離により沈殿したDN
Aを回収し、乾燥後、15mL の 10mM トリス−塩酸緩衝
液 pH7.4, 1mM EDTA に溶解し、1mg/mL RNase( リボヌ
クレアーゼ) 0.75mL を添加し、37℃, 1 時間インキュ
ベートし、夾雑するRNAを分解した。RNA分解後、
フェノール抽出、フェノール/クロロホルム抽出、クロ
ロホルム抽出を行った後、エタノール沈殿によりDNA
を回収し、実施例11におけるPCR反応の鋳型DNA
とした。
【0069】[実施例11](2級アルコール脱水素酵
素遺伝子のPCR法によるクローニング) 実施例9において合成した2種類の混合PCRプライマ
ー(CpN 及び CpT10)100pmol, 実施例10において調
製したキャンディダ・パラプシロシス染色体DNA 50n
g を含むPCR用緩衝液(10mM トリス−塩酸緩衝液 p
H8.3, 50mM 塩化カリウム, 1.5mM 塩化マグネシウム,
各 0.2mM dNTP, 0.01% ゼラチン, 2U TaqDNAポリメ
ラーゼ( ロシュ社製) )を調製し、熱変性(94℃, 30
秒)、アニーリング(45℃, 30秒)、伸長反応(60℃,
2 分)を30サイクル行い、4 ℃まで冷却後、アガロース
ゲル電気泳動により増幅DNAを確認した。
【0070】[実施例12](PCR法によって増幅し
たDNAのサブクローニング) 実施例11においてPCR法により増幅されたDNAを
SureClone LigationKit (ファルマシア社製)により
pUC18 にサブクローニングし、その塩基配列をABI
製DNAシーケンサー373Aにより決定した結果、P
CRプライマー配列を含めて 971塩基からなっていた。
その配列は図6、7、8に示したDNAのうち、プライ
マー CpN 及びCpT10 間に当たる部分である。以後この
配列を「コア配列」と記す。
【0071】[実施例13](逆PCR法によるコア配
列周辺配列のクローニング) コア配列の5'- 側に近い部分の相補配列 CAATTGACCCGCT
TTGGGC (CPA-MUN)、及び、3'- 側に近い部分の配列 TTC
GAATCTTGGGATGTTTTTG (CPA-NSP) を化学合成した。2級
アルコール脱水素酵素をコードするDNAにおける合成
した逆PCRプライマーの位置を図6、7、8に示し
た。
【0072】逆PCRのDNA鋳型として、まず、キャ
ンディダ・パラプシロシスの染色体DNAを制限酵素 H
aeII により消化し、消化物をT4DNAリガーゼを用
いて自己環化した。この自己環化物 50ng 、化学合成し
たプライマー CPA-MUN 及びCPA-NSP をそれぞれ 20pm
ol 含むPCR用緩衝液(実施例11に記載のもの)を
用い、熱変性(94℃, 30秒)、アニーリング(50℃, 30
秒)、伸長反応(70℃, 2 分)のサイクルを30回行っ
た。増幅されたDNA断片を実施例12と同様に SureC
lone Ligation Kit (ファルマシア社製)を用いて pUC
18 にサブクローニングし、ABI製DNAシーケンサ
ー373Aにより全塩基配列を決定した。
【0073】PCR及び逆PCRにより得られた2級ア
ルコール脱水素酵素をコードするDNAの全塩基配列及
び該DNAがコードするアミノ酸配列を図6、7、8に
まとめた。
【0074】[実施例14](2級アルコール脱水素酵
素をコードする遺伝子のPCR法を用いた合成) まず、プライマーを用いてPCR法により制限酵素部位
の導入を行った。実施例10において得たDNAを鋳型
とし、プライマーとしては、EcoRIの制限酵素部位
を含む5´−プライマー「CPA-ATG 」(5'-TCGCGAATTCAA
TGTCAATTCCATCAAGCCAG-3')とBgIII部位を含む3´
−プライマー「CPA-TAG 」(5'-AGATCTTACTATGGATTAAAA
ACAACTCTA-3')により約1030bpのDNA断片をP
CR法により増幅し、遺伝子断片を得た。DNAの合成
は、ABI社製DNAシンセサイザー381Aにより行
い、PCR反応は実施例11と同様に行った。
【0075】[実施例15](PCR法によって増幅し
たDNAのサブクローニング) 実施例14により増幅されたPCR断片を SureClone L
igation Kit (ファルマシア社製)にてプラスミドpU
C18マルチクローニングサイトのSmal部位に連結
した(図10)。構築されたプラスミド(pCPA6
R)は、ラクトースプロモーター(図中「lacZ」で
示す部分に含まれる)とは逆向きに挿入されていた。
【0076】[実施例16](2級アルコール脱水素酵
素遺伝子発現プラスミドpKK−CPA1の構築) さらに、2級アルコール脱水素酵素を発現ベクターpK
K223−3(ファルマシイ社製)にサブクローニング
し、pKK−CPA1を構築した。pKK−CPA1の
構築方法は以下の通りである。pCPA6RをEcol
CRI(プロメガ社製)消化し、HindIIIリンカ
ー(タカラ社製)を連結した上でEcoRI(タカラ社
製)およびHindIII(タカラ社製)で切断後、2
級アルコール脱水素酵素を有する断片を抽出し、発現ベ
クターpKK223−3を制限酵素EcoRIおよびH
indIIIで切断したものと連結することにより、2
級アルコール脱水素酵素遺伝子発現ベクターpKK−C
PA1を構築した(図11)。
【0077】[実施例17](2級アルコール脱水素酵
素の生産) イシェリヒア・コリ(Esherichia coli )JM109 のコン
ピテントセルを調製し、発現ベクターpKK−CPA1
で形質転換することにより、2級アルコール脱水素酵素
生産菌株を作成した。この菌株を、0.1mg/mlの濃度でア
ンピシリンを添加したLB培地(1.0%ポリペプトン、0.
5%酵母エキス、1.0%塩化ナトリウム、pH7.2)中で30℃、
3時間培養した。最終濃度1mMとなるようにイソプロピ
ルチオガラクトシド(IPTG)を加えてさらに5時間
培養し、培養液を遠心分離し、集菌した。
【0078】[実施例18](酵素反応での活性評価) 実施例17に従って調製した菌体を 50mM Tris-HCl pH
9.0、0.01%2- メルカプトエタノールに懸濁し、超音波
粉砕して粗酵素溶液を得た。該酵素液を 50mm トリス塩
酸緩衝液 pH9.0、50mM(S)-1,3-ブタンジオール、2.5mM
NAD+ から成る30℃の反応液に加え、NAD+ の増加
に伴う340nm の吸光度を測定することで(S)−1,3
−ブタンジオール酸化活性を測定した。結果を表6に示
す。なお、対照として、発現プラスミドpKK−CPA
1で形質転換していない宿主イシェリヒア・コリを用
い、実施例18と同様に行った結果を表6に同時に示
す。
【0079】
【表6】 [実施例19](遺伝子組換え菌体による(R)−1,
3−ブタンジオールの生産) 実施例17に従って調製した菌体に最終濃度5%となる
ようラセミ1,3−ブタンジオールと0.8%炭酸カルシウ
ム水を加え、直径21mm試験管にて30℃、250rpmで17時
間振とう反応させた。なお、反応開始時における菌体濃
度を660nm におけるODが20となるようにした。反応
終了後、遠心分離にて除菌し、得られた上澄液500μ
lを塩化ナトリウムで飽和させた後、酢酸エチル2ml を
用いて残存する1,3−ブタンジオールを抽出した。抽
出液を脱溶媒後、残渣に塩化アセチル100 μlを加え
て、アセチル化した。これに1ml n−ヘキサンを加えて
アセチル化した1,3−ブタンジオールを溶解し、光学
分割カラムを用いた高速液体クロマトグラフィー[カラ
ム:キラルセルOB(ダイセル化学工業株式会社製)、
溶媒:n−ヘキサン/2−プロパノール=19:1、波長22
0nm 、流速1.0ml/分、温度40℃]にて光学純度を測定し
た(保持時間:(S)体15分、(R)体19.3分)。ま
た、先の上澄液を蒸溜水にて適宜希釈した後、ガスクロ
マトグラフィー[カラム:Thermon 3000 5% / chromoso
rb W 80 〜100 メッシュ(内径3mm ×長さ2.1m)(信和
化工株式会社製)、温度130 ℃]にて1,3−ブタンジ
オール濃度を定量した。得られた1,3−ブタンジオー
ルの光学純度、収率を表7に示す。なお、対照として、
発現プラスミドpKK−CPA1で形質転換していない
宿主イシェリア・コリを用い、実施例19と同様に行っ
た結果を表7に同時に示す。なお、表7中で、収率とは
「最初に添加したラセミ1,3−ブタンジオールに対す
る、反応終了後残存した1,3−ブタンジオールのモル
比」を表す。
【0080】
【表7】
【0081】
【発明の効果】本発明により、新規な、立体特異性を有
する2級アルコール脱水素酵素、該酵素をコードするD
NA、該酵素をコードするDNAにより形質転換された
微生物を得ることが可能になった。
【0082】本酵素又は本酵素を産生する微生物(変異
株や形質転換微生物を含む)もしくはその処理物を用い
ることにより、ラセミ体アルコールからの光学活性アル
コールの製造、非対称ケトンからの光学活性アルコール
の製造などを効率的に行うことが可能となった。
【図面の簡単な説明】
【図1】 精製した2級アルコール脱水素酵素のドデシ
ル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に
おけるパターンを示す図である。
【図2】 2級アルコール脱水素酵素の(S)−2−ブ
タノール酸化反応のpH依存性を至適pHを100とし
た相対活性で示す図である。
【図3】 2級アルコール脱水素酵素の2−ブタノン還
元反応のpH依存性を至適pHにおける活性を100と
した相対活性で示す図である。
【図4】 2級アルコール脱水素酵素を各pHにおいて
30℃、30分処理した後の残存活性を示す図である。
【図5】 2級アルコール脱水素酵素を各温度で10分
処理した後の残存活性を示す図である。
【図6】 2級アルコール脱水素酵素をコードするDN
Aの塩基配列、該塩基配列から予想されるアミノ酸配
列、PCRプライマー及び逆PCRプライマーの部位を
示す図である。
【図7】 2級アルコール脱水素酵素をコードするDN
Aの塩基配列、該塩基配列から予想されるアミノ酸配
列、PCRプライマー及び逆PCRプライマーの部位を
示す図である。
【図8】 2級アルコール脱水素酵素をコードするDN
Aの塩基配列、該塩基配列から予想されるアミノ酸配
列、PCRプライマー及び逆PCRプライマーの部位を
示す図である。
【図9】 PCR用混合プライマーCpN、CpT10
の構造を示す図である。なお、図中同一部位に複数の塩
基が記載してあるものは、混合プライマーがそれら複数
の塩基を有するプライマーの混合物になっていることを
示す。
【図10】 プラスミドpCPA6Rの構成を示す図で
ある。
【図11】 発現ベクターpKK−CPA1の構成を示
す図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12P 41/00 C 9452−4B //(C12N 9/04 C12R 1:72) (C12N 9/04 E C12R 1:19) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:72) (C12P 41/00 C12R 1:72) C12R 1:72)

Claims (15)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 次のからに示す理化学的性質を有す
    る酵素。 作用 NAD+ (酸化型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチ
    ド)を補酵素として、アルコールを酸化し、ケトン又は
    アルデヒドを生成する。また、NADH(還元型ニコチ
    ンアミドアデニンジヌクレオチド)を補酵素として、ケ
    トン又はアルデヒドを還元し、アルコールを生成する。 基質特異性 芳香族置換を含む脂肪族アルコールを酸化反応の基質と
    する。1級アルコールに比較して2級アルコールに対し
    て活性が高い。2−ブタノールのS体を優先的に酸化す
    る。アルデヒド又は芳香族置換を含む脂肪族ケトンを還
    元反応の基質とする。 分子量 SDS−PAGEで測定した場合、約4万。
  2. 【請求項2】 キャンディダ(Candida) 属に属し請求項
    1の酵素を産生する微生物を培養し、培養物から該酵素
    を取得することを特徴とする、請求項1記載の酵素の製
    造方法。
  3. 【請求項3】 請求項2記載の方法において、キャンデ
    ィダ属に属する微生物が、キャンディダ・パラプシロシ
    ス (Candida parapsilosis) であることを特徴とする方
    法。
  4. 【請求項4】 請求項1記載の酵素をコードするDN
    A。
  5. 【請求項5】 請求項4記載のDNAにおいて、アミノ
    酸配列が実質的に図6、7、8に示されている蛋白質を
    コードする塩基配列を含むことを特徴とするDNA。
  6. 【請求項6】 請求項5記載のDNAにおいて、アミノ
    酸配列が図6、7、8に示されている蛋白質をコードす
    る塩基配列を含むことを特徴とするDNA。
  7. 【請求項7】 請求項5記載のDNAにおいて、アミノ
    酸配列が図6、7、8に示されている配列を置換、挿入
    又は欠失したものである蛋白質をコードする塩基配列を
    含むことを特徴とするDNA。
  8. 【請求項8】 請求項4〜7のいずれかに記載のDNA
    を含むことを特徴とするベクター。
  9. 【請求項9】 請求項4〜7のいずれかに記載のDNA
    によって形質転換された微生物。
  10. 【請求項10】 請求項9に記載の微生物を培養し、培
    養物から請求項1記載の酵素を取得することを特徴とす
    る、請求項1記載の酵素の製造方法。
  11. 【請求項11】 請求項1に記載の酵素、又は該酵素を
    産生する微生物もしくはその処理物を、ケトン又はアル
    デヒドに作用させ、該ケトン又はアルデヒドを還元して
    アルコールを製造することを特徴とする、アルコールの
    製造方法。
  12. 【請求項12】 請求項1に記載の酵素、又は該酵素を
    産生する微生物もしくはその処理物を、非対称ケトンに
    作用させ、該非対称ケトンを還元して光学活性アルコー
    ルを製造することを特徴とする、光学活性アルコールの
    製造方法。
  13. 【請求項13】 請求項1に記載の酵素、又は該酵素を
    産生する微生物もしくはその処理物をアルコールに作用
    させ、該アルコールを酸化してケトン又はアルデヒドを
    製造することを特徴とする、ケトン又はアルデヒドの製
    造方法。
  14. 【請求項14】 請求項1に記載の酵素、又は該酵素を
    産生する微生物もしくはその処理物をラセミ体アルコー
    ルに作用させ、光学異性体の一方を優先的に酸化し、残
    存する光学活性アルコールを取得することを特徴とす
    る、光学活性アルコールの製造方法。
  15. 【請求項15】 請求項9に記載の微生物由来の酵素、
    又は請求項9に記載の微生物もしくはその処理物を作用
    させることを特徴とする請求項11〜14のいずれかに
    記載の方法。
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