JPH0824580B2 - 新規コスミドベクタ− - Google Patents

新規コスミドベクタ−

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JPH0824580B2
JPH0824580B2 JP59112206A JP11220684A JPH0824580B2 JP H0824580 B2 JPH0824580 B2 JP H0824580B2 JP 59112206 A JP59112206 A JP 59112206A JP 11220684 A JP11220684 A JP 11220684A JP H0824580 B2 JPH0824580 B2 JP H0824580B2
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dna
ori
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cos
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正寛 石浦
博 大橋
驍 内田
善雄 岡田
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Banyu Phamaceutical Co Ltd
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli

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Description

【発明の詳細な説明】 本発明は遺伝子操作技術に関し、さらに詳しくは遺伝
子操作技術を使つて作成した新規コスミドベクターに関
する。
ヒトをはじめとする哺乳動物の遺伝子の大きさは20キ
ロ塩基対(以下キロ塩基対をKbpと略す)を越えるもの
が少なくない。現在、広く使われているラムダベクター
にクローン化できるDNAの大きさは20Kbpなので、これよ
り大きい遺伝子全体を機能のある形でクローン化するこ
とはできない。
ラムダフアージのcohesive end site(以下cosと略
す)を有するベクター、すなわちコスミドベクターを使
えば35〜45Kbpの大きさのDNAをクローン化できる。種々
のベクターの中で、コスミドベクターが最つとも大きい
長さのDNAをクローン化できるが、長いゲノムDNAの調製
がむづかしいことや、インサートのないベクターだけの
バツクグランドが高いこと、また効率が良くないことな
どが障害になつて、コスミドベクターの利用は進まなか
つた。ところが、Ish−Horowicz & Burkeはホスフアタ
ーゼを利用してベクターに方向性を持たせる工夫をし、
ベクターだけのバツクグランドの値を下げるとともにク
ローン化の効率を上げることに成功した〔D.Ish−Horow
icz & J.F.Burke,Nucleic Acids Res.,9,2889,(198
1)〕。
Ish−Horowicz & Burke法によるゲノムDNAの遺伝子
バンクの製造法は以下のようである(たとえば、現在、
広く使われているコスミドベクターの1つであるpJB−
8を例にとる)。pJB−8は5.44Kbpの大きさで、制限酵
素BamHI,HindIII,SalIでそれぞれ1カ所切断され、ラム
ダフアージのcosを1個有するコスミドベクターであ
る。、pJB−8をHindIIIで切断することによつて直線
状DNAとし、次にホスフアターゼ処理によつてHindIIIの
切断片を不活化する。そして、BamHIで切断することに
よつて2個のDNA断片が得られ、cosを含む大きなDNA断
片(5.4Kbp)をアガロースゲル電気泳動法によつて単離
する。得られたcosを含むDNA断片(5.4Kbp)が、ラムダ
フアージの左腕に相当する。、pJB−8をSalIで切断
することによつて直線状DNAとし、次にホスフアターゼ
で処理することによつてSalIの切断片を不活化する。そ
して、BamHIで切断することによつて2個のDNA断片が得
られ、cosを含む小さなDNA断片(2.34Kbp)をアガロー
スゲル電気泳動法によつて単離する。得られたcosを含
むDNA断片(2.34Kbp)が、ラムダフアージの右腕で相当
する。、たとえば、ヒトのゲノムDNAを制限酵素Sau3A
もしくはMboIで部分的に切断し、35〜45Kbpの大きさのD
NA断片を分画する。この35〜45Kbpの大きさのDNA断片
を、とで別々に調製した左腕と右腕との間に、連結
酵素(T−4−DNAリガーゼ)で挿入させて、組み換え
体DNAを調製する。、組み換え体DNAをin vitroパツケ
ージングで形質導入フアージ粒子に変え、次いで大腸菌
に感染させることによりヒトのゲノムDNAの遺伝子バン
クが製造できる。
以上がIsh−Horowicz & Burke法によるゲノムDNAの
遺伝子バンクの製造法であるが、次の3つの問題点があ
る。第1に、pJB−8はcosが1つしかなく、左腕と右腕
とを別々に調製しなければならない。第2に、左腕と右
腕について、それぞれcosを含むDNA断片をアガロースゲ
ル電気泳動で分離しなければならない。第3に、pJB−
8の左腕の長さは5.4Kbp、右腕の長さは2.34Kbpであ
り、左腕と右腕との長さが異なるので、35〜45Kbpのゲ
ノムDNAに連結する確率も異なり、左腕と右腕の混合す
る比率を検討しなければならない。
本発明者らは、これらの問題点を解決するために、同
一の方向性を持つたラムダフアージのcosを2個有し、
2種類の制限酵素で切ることによつて、それぞれcosを
1個づつ持つた長さのほぼ等しい右腕と左腕が等モルで
きることを特徴とする新規コスミドベクターを作成した
〔第36回日本細胞生物学会大会、講演要旨集、93,94ペ
ージ(1983)〕。
本発明のコスミドベクターは、同一分子内に同一の方
向性を持つた2個のcosが存在し、2種類の制限酵素で
切ることによつて、それぞれcosを1個づつ持つた長さ
のほぼ等しい右腕と左腕が等モルできるので、左腕と右
腕とを別々に調製する必要がなく、アガロースゲル電気
泳動で分離する必要もない。さらに、右腕と左腕の長さ
がほぼ等しいので、35〜45KbpのゲノムDNAにT4−DNAリ
ガーゼによつて連結される程度もほぼ等しいと考えてよ
く、2種類の制限酵素で切断してできた右腕と左腕の等
モル混合物を、そのまま35〜45KbpのゲノムDNAと連結す
れば、組み換え体DNAの半分が形質導入フアージ粒子に
変り得ることが期待できる。このように、本発明のベク
ターを用いれば、35〜45KbpのDNA断片として、ゲノムDN
Aの遺伝子バンクをより簡単、かつより効率よく製造で
きる。
本発明の新規コスミドベクターの1つであるpDcos Ap
r/oriを第1図に示す〔第36回日本細胞生物学会大会、
講演要旨集93ページ(1983)〕。pDcos Apr/oriは、フ
アージベクターであるCharon4A由来の同一方向性のある
cos2個と、Tn903由来のネオマイシン耐性遺伝子(ne
or)〔Oka,Sugisaki & Takanami,J.Mol.Biol.,147,217
(1981)〕、pBR−327由来のアンピシリン耐性遺伝子
(Apr)及び複製開始点(ori)〔Soberon,Cavarrubias
& Bolivar,Gene,9,287(1980)〕とからなる。大きさ
は4.7Kbpであり、制限酵素PvuII、Bam HI、PstIによつ
てそれぞれ1カ所、制限酵素Bst EIIによつて2カ所、
制限酵素Eco RIによつて3ケ所切断される。このベクタ
ーは次のような特徴を有する。、同一の方向性を持つ
た2つのcosがある。、Bam HIサイトにSau3Aもしくは
MboIなどで限定消化した35〜45KbpのゲノムDNAをクロー
ン化できる。、インサートはBam HIサイトの両側にあ
るEco RIサイトを切ることによつてベクターから切り出
すことができる。、PvuIIでベクターを切断し、ホス
フアターゼ処理することによつて、ベクターに方向性を
持たせ、さらにBam HIサイトを切ることによつて、等モ
ルの右腕と左腕ができる。T4−DNAリガーゼを使つ
て、Sau3AもしくはMboIなどで限定消化した35〜45Kbpの
ゲノムDNAの両側に、ベクターの右腕と左腕をBam HIサ
イトで連結し、組み換え体DNAを、in vitroパツケージ
ングによつて形質導入フアージ粒子に変換し、次いで大
腸菌に感染させることができる。この形質導入体DNA
は、ベクター由来のAprとoriを含むので、アンピシリン
で選択することによつて、組み換え体DNAをプラスミド
として持つ大腸菌のみを選択的に生かすことができる。
また、本ベクターを用いるゲノムDNA(外来DNA)の遺伝
子バンクの製造法を示せば以下のようになる(第2図参
照)。、pDcos Apr/oriをPvuIIで切断することによつ
て直線状DNAとし、次にホスフアターゼ処理によつてPvu
IIの切断片を不活化する。そしてBam HIで切断すること
によつて、それぞれcosを1個づつ持つた長さがほぼ等
しい右腕と左腕とを調製する。、外来DNAをSau3Aもし
くはMboIなどで限定消化し、35〜45Kbpの大きさのDNA断
片を調製する。、35〜45KbpのゲノムDNA断片をで調
製した左腕と右腕との間にT4−DNAリガーゼで挿入させ
て、組み換え体DNAを調製する。、組み換え体DNAをin
vitroパツケージングで形質導入フアージ粒子に変え、
大腸菌に感染させる。、形質導入したアンピシリン耐
性大腸菌をアンピシリンで選択することによつて、組み
換え体DNAをプラスミドとして持つ大腸菌のみを生かす
ことができる。このようにしてゲノムDNAの遺伝子バン
クを製造することができる。
また、本発明者らはトランスホーマント細胞から遺伝
子回収を目的とするコスミドベクター、pDcos Tcr(第
3図)、pDcos Tcr/ori(第4図)の作成に成功した
(第36回日本細胞生物学会大会、講演要旨集、94ページ
(1983)〕。哺乳動物の培養細胞への遺伝子移入を利用
して哺乳動物のマーカー遺伝子を単離することができ
る。その際、培養細胞に遺伝子移入したDNA配列をトラ
ンスホーマント細胞から大腸菌に回収する作業がある
が、本発明に包含される新規コスミドベクターpDcos Tc
r及びpDcos Tcr/oriは、この遺伝子回収のために有用な
ベクターである。pDcos TcrはCharon4A由来の同一の方
向性のあるcos2個と、pBR−327由来のテトラサイクリン
耐性遺伝子(Tcr)及び複製開始点(ori)とからなる。
pDcos Tcr/oriは、同様にcos2個と、pBR−327由来のTcr
及びoriと、スペーサーとしてのSV−ジヒドロ葉酸リダ
クターゼ遺伝子(SV−dhfr)〔Subramani,Mulligan &
Berg,Mol.Cell.Biol.,1,854(1981)〕とからなる。こ
れらのベクターは、先に述べたpDcosApr/ori(第1図)
と同様な特徴を有しており、同様にこれらを用いてゲノ
ムDNAの遺伝子バンクを製造することができるが、Bam H
Iサイトの代りにBglIIサイトにSau3AもしくはMboIなど
で限定消化した35〜45KbpのゲノムDNAをクローン化でき
る点が異なつている。pDcos Tcrで作成した形質導入フ
アージ粒子はプラスミドのoriを持たないので、大腸菌
に感染しても増殖できない。目的の遺伝子の近傍にori
がある場合にのみテトラサイクリン耐性(Tcr)のクロ
ーンとして目的の遺伝子を大腸菌に回収することができ
る。一方、pDcosTcr/oriで作成した形質導入フアージ粒
子は、oriとTcrマーカーを持つており、Tcrクローンと
してゲノムDNAの遺伝子バンクを作成することができ
る。もし、目的の遺伝子の近傍にAprなどの薬剤耐性マ
ーカーがあれば、アンピシリン耐性(Apr)などの薬剤
耐性クローンとして目的のものだけを選択的に大腸菌に
回収できる。
さらに、本発明者らは哺乳動物細胞に対する選択マー
カーを持つていて、哺乳動物細胞への遺伝子移入を目的
とするコスミドベクター、pDcosApr/ori/gpt/TK(第5
図)を作成した。pDcosApr/ori/gpt/TKは、Charon4A由
来の同一方向性のあるcos2個と、pBR−327由来のApr
びori、スペーサーとしてのpSV2−dhfr由来のSV−dhfr
遺伝子、pSV2−gpt由来のgpt遺伝子〔Richard,Mulligan
& Berg,Mol.Cell.Biol.,1,449(1981)〕、及びpTK−
4由来のTK遺伝子〔Ishiura,M.,etal.,Mol.Cell.Biol.,
2,607(1982)〕とからなる。このコスミドベクター
は、前記したpDcosApr/oriと同様に、ゲノムDNAの遺伝
子バンクを製造できる。すなわち、同一の方向性を持つ
た2個のcosがあり、PvuIIとBamHIで切断することによ
り、cosを1個づつ持つた長さがほぼ等しい右腕と左腕
とが等モルでき、BamHIサイトに35〜45KbpのゲノムDNA
を挿入させた組み換え体DNAを作成できる。そして、こ
の組み換え体DNAは、in vitroパツケージングによつて
形質導入フアージ粒子に変換し、大腸菌に移すことがで
き、組み換え体DNAはベクター由来のAprとoriを含むの
で、組み換え体DNAを含む大腸菌は、アンピシリンで選
択することによつて、アンピシリン耐性クローンとして
得ることができる。さらに、この組み換え体プラスミド
は、gpt遺伝子とTK遺伝子を持つので、哺乳動物の培養
細胞への遺伝子移入した際に、キサンチングアニンホス
ホリボシルトランスフエラーゼ(gpt)活性もしくはチ
ミジンキナーゼ(TK)活性をマーカーとすることによつ
て、ベクター由来の組み換え体DNAの挿入の判定が培養
細胞のレベルで可能であるという利点がある。
本発明に用いられるcosとしては、ラムダフアージま
たはラムドイドフアージ由来のものが挙げられる。特
に、ラムダフアージ由来のcosが好ましいものとして挙
げられる。
本発明のベクターは、2種類の制限酵素で切ることに
よつて、それぞれcosを1個づつ持つた右腕と左腕がで
きるのであるが、この2種類の制限酵素の組み合せとし
ては、PvuIIとBamHI,PvuIIとBglII,ClaIとBamHI,ClaIと
BglIIなどを挙げることができる。勿論この他にも組合
せは考えることができるので、これらに限定されるもの
ではない。
本発明のベクター中には、ベクター由来のDNA断片が
挿入されたことを、判定するためには一般的に薬剤耐性
による選択が行われる。従つて、本発明のベクター中に
も薬剤耐性を発現するDNA断片が組み込まれていること
が好ましい。薬剤耐性としては、アンピシリン耐性、テ
トラサイクリン耐性、ネオマイシン(カナマイシン)耐
性、もしくはクロラムフエニコール耐性など通常の抗生
物質耐性が挙げられる。pDcos Apr/oriはアンピシリン
耐性遺伝子及びネオマイシン耐性遺伝子を持ち、pDcosT
crとpDcosTcr/oriはテトラサイクリン耐性遺伝子を有し
ている。pDcosApr/ori/gpt/TKはアンピシリン耐性遺伝
子を持つている。
本発明のベクターを用いてゲノムDNA(外来DNA)の遺
伝子バンクを製造し、哺乳動物の培養細胞へ遺伝子(遺
伝子バンク)移入する際には、ベクター由来のDNA断片
が挿入されたことを判定するために特定の生理機能を発
現するDNA断片が本発明のベクター中に組み込まれてい
るのが好ましい。特定の生理機能を発現せしめる遺伝子
としては、アミノグリコシド3′−ホスホトランスフェ
ラーゼ(neo)遺伝子〔Oka,Sugisaki&Takanami,J.Mol.
Biol.,147,217(1981)〕、チミジンキナーゼ(TK)遺
伝子〔Wigler,M.etal.,Cell,14,725(1978)、アデニン
ホスホリボシルトランスフエラーゼ(APRT)遺伝子〔Wi
gler,M.,etal.,Pro.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,76,1373(19
79)〕、ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトラン
スフエラーゼ(HGPRT)遺伝子〔Graf,L.H.Jr.,etal,Som
at.Cell.Genet.,5,1031(1979)〕、キサンチングアニ
ンホスホリボシルトランスフエラーゼ(XGPRT又はgpt)
遺伝子〔Berg,P.,etal.Mol.Cell.Biol.,1,449(198
1)〕などが挙げられる。本発明の新規コスミドベクタ
ーpDcosApr/ori/gpt/TKはgpt遺伝子とTK遺伝子を有して
いる。
さらに、本発明のベクター中には、ColEI由来の複製
機能を有する遺伝子画分を有することが好ましい。
本発明において用いられる外来DNAの例としては、細
菌、糸状菌、酵母などの微生物、高等動植物もしくは各
種フアージ等に由来するDNAが挙げられる。
また、本発明において用いられる制限酵素(DNA断片
の特定の塩基配列部位を選択的に切断する機能を有する
酵素)や制限酵素により切断されて生じるDNA接着末端
と、これを相補的な関係のある他のDNA断片接着末端を
結合させる為に用いる酵素(リガーゼ)、あるいは互い
に相補的でないDNA末端同志を結合させるためにDNA末端
同志を互いに相補的な接着末端にする酵素、あるいはこ
れらを結合させるリガーゼについてはすでに良く知ら
れ、数多くの酵素が市販され、それらを用いる手法等に
ついても広く開示されている〔Molecular Cloning,Cold
Spring Harbor Laboratory,Maniatis,T.,etal.,(198
2)〕ので、それらを利用すればよい。
本発明のベクターを用いることによつて、ヒトをはじ
めとする哺乳動物のガンや遺伝病などを分子レベルで解
析することがより容易となるであろう。たとえば、ヒト
の正常細胞由来のゲノムDNAの遺伝子バンクをpDcos Apr
/oriで作成し、この遺伝子バンクで遺伝病細胞をトラン
スホーム(正常化)し、トランスホーマント細胞を得
る。トランスホーマント細胞からゲノムDNAを抽出し、p
DcosTcrもしくはpDcosTcr/oriでゲノムDNAの遺伝子バン
クを作成し、目的の遺伝子を回収する。目的の遺伝子を
種々の面から検討することによつて、ヒトの遺伝病を分
子レベルで解析することができる。
また、本発明のベクターを用い、ゲノムDNA(外来DN
A)の遺伝子バンクを作成することによつて、有用物質
を発現せしめる特定の遺伝子を効率よく見い出すことが
可能である。この特定の遺伝子とは、細菌、糸状菌、酵
母などの微生物、高等動植物あるいは各種フアージ等に
由来するDNAがあり、具体的な有用物質としては、例え
ば各種ホルモン、酵素、さらには抗生物質やアミノ酸な
どの合成系酵素等が挙げられる。
以下、実施例を示して本発明をいつそう詳細に説明す
る。
実施例1 pDcosTcrの作成及び調製(第6図) (a)pAPcosの作成及び調製 i)作成 フアージベクターであるCharon4A由来のcosを1個有
するコスミドベクターであるpHC79〔Hohn & Collins,G
ene,11,291(1980)〕20μgを、反応混液200μl(10m
MTris−HCl(pH7.6)、12mM MgCl2、10m MDTT、100μg/
ml BSA(ウシ血清アルブミン)で、29.9ユニツトの制限
酵素BalI(New England Biolabs社製)と37℃で2時間
反応させて完全に消化したのち、さらに反応混液500μ
l(150mM NaCl,6mM Tris−HCl(pH7.9)、6mM MgCl2
6mMDTT、100μg/μl BSA〕で、41.1ユニツトの制限酵素
Bst EII(New England Biolabs社製)と60℃で2時間反
応させて完全に消化した。反応終了後、等量の水飽和フ
エノールで抽出を行ない、水層をセカンダリブタノール
で濃縮後、0.1倍容量の3M酢酸ナトリウムと2倍容量の
エタノールを加えて、DNAを沈澱として得、95%エタノ
ールで洗つたのち、水流ポンプで乾燥を行ない、沈澱を
10mM Tris−HCl(pH8.0)、0.1mMEDTAからなる水溶液
(以下10t/0.1Eと略す)14μl(〜1μg/μl)に溶解
させた。
次に、このBalI及びBstEIIで消化したDNA溶液1μl
(〜1μg)を反応混液25μl〔50mM Tris−HCl(pH7.
2)、10mMMgSO4、0.1mM DTT、50μg/mlBSA、80μM dCT
R、80μMdGDP、80μM dATP、80μMdTTp〕で、2ユニツ
トのKlenow酵素(Boehringer Mannheim社製)と22℃で3
0分間反応させて、互いに相補鎖が存在する2本鎖DNA断
片(cohesive end)を両端がそろつた2本鎖DNA断片(b
lunt end)に変えた。反応終了後、反応液を65℃で10分
間熱処理してKlenow酵素を失活させた。
そして、この液10μl(DNA〜0.4μg)を反応混液50
μl(50mM Tris−HCl(pH7.4)、10mM MgCl2、10mMDT
T、1mMスペルミジン、1mM ATP、100μg/mlBSA)で、15
ユニツトのT4−DNAリガーゼ(New England Biolabs社製
と12℃で17.5時間反応させて、cos及びori,Apr 1Tcrを含
むDNA断片(4.75Kbp)を閉環化させた。反応終了後、フ
エノール抽出を行なつたのち、DNAをエタノール沈澱と
して得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに
溶解させた。
ii)トランスホーメーシヨン このDNA溶液10μlを大腸菌HB101のcompetent cell 1
00μl(対数増殖期の大腸菌HB101を0〜4℃で0.1M Ca
Cl2溶液で15分間処理後、もとの培養液の1/10溶量の0.1
M CaCl2/14%glycerol溶液に再懸濁し、−70℃に保存)
とよく混合し、0℃で10分間、続いて37℃で5分間保温
して、DNAを大腸菌内に取りこませたのち、これにL−
ブロス(1%Bactotryptone,0.5%酵母エキス0.5%NaC
l,0.1%グルコース)2mlを加えて、37℃で1時間振盪培
養した。この菌体懸濁液を20μg/mlのアンピシリン及び
20μg/mlのテトラサイクリンを含むL−プレート(L−
ブロースに寒天を1%添加したプレート)上にまき、37
℃で24〜48時間培養し、アンピシリン及びテトラサイク
リン耐性のクローンを得た。
iii)少量培養、及び少量DNA調製 Apr 1TcrであるクローンをL−ブロス2ml中(Ap20μg/
ml含有)で37℃、1晩振盪して、増殖させた。培養液1.
5mlをエツペンドルフチユーブにとり、机上遠心分離機
にかけて集菌後、この菌体を抽出液(8%シヨ糖、0.5
%TritonX−100,50mMEDTA(pH8.0)、10mM Tris−HCl
(pH8.0))0.35mlに再懸濁させた。次に、リゾチーム
溶液25μl〔10mg/ml、10mM Tris−HCl(pH8.0)〕を加
え混合したのち、チユーブを沸騰水中に40秒間おいた。
そして、直ちにチユーブを4℃にて遠心分離機(21,000
rpm、15分間)にかけて上澄液を得、これにRNaseA溶液
(20mg/ml、10t/0.1E)0.5μlを加えて37℃で1時間保
温してRNAを分解させた。その後、フエノール抽出で除
蛋白後、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1
E20μlに溶解させて、プラスミドDNA溶液を得た。
iv)プラスミドDNAの特性化 そして、このプラスミドDNA溶液1μl又は2μlを
制限酵素EcoRI,BstEII,BglII,PvuIIなどで消化したの
ち、0.4〜1.5%アガロースゲル電気泳動〔40mM Tris,20
mM酢酸ナトリウム、2mM EDTA(pH8.15);10mA,12〜24時
間〕にかけた。分解されたDNA断片は臭化エチジウム染
色と長波長紫外線照明によつて検出できる。このように
して、プラスミドDNAの制限地図を作成することによつ
て、各クローンが持つているプラスミドDNAを特性化し
た。そして、PHC79のBalIサイトとBstEIIサイトの間のD
NA断片(1.68Kbp)を欠いたプラスミド:pAPcos(第6
図)を持つ大腸菌を得た。
V)大量培養、及びプラスミドDNAの調製 この大腸菌を、TYG−P培地(1%Bactotryptone,0.1
%酵母エキス、0.2%グルコース、0.1% NH4Cl,0.3%
NaCl,0.01% Na2SO4,0.08%MgCl2・6H2O,1.52% Na2
HPO4・12H2O,0.3% KH2PO4)1中で(Ap20μg/ml含
有)、37℃で振盪培養し、600nmでの吸光度(A600)が
1.0になつた時点で、クロラムフエニコールを100μg/ml
の濃度になるように添加し、さらに15時間37℃で振盪培
養した。培養終了後、遠心分離機(6,000rpm,10分間)
にかけて集菌を行ない、次に菌体を25%シヨ糖、50mM T
ris−HCl(pH8.0)からなる等張緩衝液18mlに再懸濁し
た。これに、リゾチーム溶液〔5mg/ml、0.25M Tris−HC
l(pH8.0)〕3.6mlを加え、おだやかに混合し、0℃で
5分間おいたのち、0.25MEDTA(pH8.0)溶液7.2mlを加
え、おだやかに混合し、0℃で5分間おいた。その後、
10%SDS溶液2.7mlと5M NaCl溶液8.1mlとを加えおだやか
に混合し、0℃で1晩おいたのち、遠心分離機(20,000
rpm,45分間)にかけて粗溶菌液(cleared lysate)〜39
mlを得た。この粗溶菌液に、RNaseA溶液(20mg/ml,10t/
0.1E)20μlを加えて37℃にて1時間保温してRNAを分
解させたのち、フエノール抽出で除蛋白を行ない、さら
にセフアロース2Bのゲルロ過にかけた。プラスミドDNA
を含むボイドフラクシヨンから、DNAをエタノール沈澱
として得、次にDNAを塩化セシウム−臭化エチジウム溶
液〔1M Tris−HCl(pH8.0)0.375ml、0.25MEDTA(pH8.
0)0.30ml、H2O6.45ml、CsCl7.5g、EtBr溶液(4mg/ml)
0.375ml〕で平衡密度勾配遠心(60,000rpm12時間)にか
けた。そうすると、共有結合で閉鎖された環状のプラス
ミドDNA(ccc−DNA)は、遠沈管中で長波長紫外線照射
下において、線状のプラスミドDNA及び染色体のけい光
帯の下にバンド状に見えてくる。このccc−DNAのバンド
を分画し、CsCl水溶液で飽和したイソプロパノールで抽
出を行なつて、臭化エンジウムを取り除いた後、10t/0.
1E 1に対して透析を行なつた。そして、透析内液か
ら、ccc−DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.
1E2mlに溶解させてpAPcosのプラスミドDNA溶液(0.418m
g/ml)を調製した。
(b)pAPcosΔ(EcoRI)の作成及び調製 pAPcos10μgを反応混液100μl(100mM Tris−HCl
(pH7.5)、50mM NaCl、5mM MgCl2、100μg/ml BSA)
で、60.6ユニツトの制限酵素EcoRI(New England Biola
bs社製)と37℃で2時間反応させて完全に消化した。そ
して、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈
澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に
溶解させた。
次に、このEcoRIで消化したDNA溶液1μl(〜1μ
g)を反応混液25μl(50mM Tris−HCl(pH7.2)、10m
M MgSO4、0.1mM DTT、50μg/mlBSA、80μM dATP,80μM
dCTP,80μM dGTP,80μM dTTP)で、2ユニツトのKlenow
酵素と22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt
endに変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理し
てKlenow酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(〜0.4μg)を反応混液50
μl(50mM Tris−HCl(pH7.4)、10mM MgCl2、10mM DT
T,1mMスペルミジン、1mMATP,100μg/mlBSA)で、15ユニ
ツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉
環化したのちフエノール抽出を行ない、DNAをエタノー
ル沈澱として得、沈澱を0.1MT ris−HCl(pH7.5)溶液2
0μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)とトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得
た。次に、これらのクローンについて少量培養及び少量
DNA調製を行なつたのち、各クローンのもつプラスミドD
NAの特性を調べて、pAPcosのEcoRIサイトを欠いたプラ
スミド:pAPcosΔ(EcoRI)(第6図)を持つ大腸菌を得
た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpAPcosΔ(EcoR
I)のプラスミドDNAを調製した。
(c)pHPcosの作成及び調製 pAPcosΔ(EcoRI)20μgを、反応混液200μl〔60mM
NaCl,6mM Tris HCl(pH8.0)、10mM MgCl2 6mM DTT,10
0μg/mlBSA〕で75.8ユニツトの制限酵素AvaI(New Engl
and Biolabs社製)と37℃で2時間反応させて完全に消
化したのち、さらに反応混液500μl〔60mM NaCl,7mM T
ris−HCl(pH7.4)、7mM MgCl2,100μg/mlBSA〕で、101
ユニツトの制限酵素HindIII(New England Biolabs社
製)と37℃で2時間反応させて完全に消化した。そし
て、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱
として得、沈澱を10t/0.1E 14μl(〜1μg/μl)に
溶解させた。
次に、このAvaIとHindIIIで消化したDNA溶液1μl
(〜1μg)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlen
ow酵素と22℃で30分間反応させて、cohesive endをblun
t endに変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理
してKlenow酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(〜0.4μg)を反応混液50
μlで、15ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時
間反応させて、cos及びori,Aprを含むDNA断片(3.75Kb
p)を閉環化させた(HindIIIサイトは再構成される)。
その後、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈
澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μ
lに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、AprかつTcs(テトラサイ
クリン感受性)クローンを得た。次でこれらのクローン
のもつプラスミドDNAの特性を調べて、pAPcosΔ(EcoR
I)のAvaIサイトとHindIIIサイトの間のDNA断片(1Kb
p)を欠いたプラスミド:pHPcos(第6図)を持つ大腸菌
を得た。
この大腸菌をTYG−P培地1中で増殖させたのち、
菌体よりccc−DNAを分離精製してpHPcosのプラスミドDN
Aを調製した。
(d)pHBglIIcosの作成及び調製 pHPcos10μgを、反応混液100μl〔60mM NaCl,6mM T
ris−HCl(pH7.5)、6mM MgCl2 6mM DTT,100μg/mlBS
A〕で、51.2ユニツトの制限酵素PvuII(Takara社製)と
37℃で2時間反応させて完全に消化した。(blunt en
d)。そして、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
次に、このPvuIIで消化したDNA溶液0.4μl(〜0.4μ
g)とBglIIリンカー〔d(pC−A−G−A−T−C−
T−G)〕2μgとを、反応混液20μl〔50mM Tris−H
Cl(pH7.4)、10mM MgCl2,10mM DTT,1mMスペルミジン、
1mM ATP,100μg/mlBSA〕で、6ユニツトのT4−DNAリガ
ーゼと22℃で6時間反応させて連結した。その後フエノ
ール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液250μl〔60mM NaCl,10mM T
ris−HCl(pH7.4)、10mM MgCl2,10mMDTT,100μg/mlBS
A〕で、200ユニツトの制限酵素BglII(Takara社製)と3
7℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調製用アガ
ロースゲルにかけて、10mAで12時間電気泳動した。分解
されたDNA断片は臭化エチジウム染色と長波長紫外線照
明によつて見えてくる。cos及びori,AprからなるDNA断
片(2.55Kbp)を含有するゲルを切り出したのち、5倍
容量の抽出液(0.5M NH4OAc,1mM EDTA(pH7.5):水飽
和フエノール=1:1)の存在下で、ゲルをすりつぶしてD
NAを溶出させた。そして、溶出液をセカンダリーブタノ
ールで濃縮後、0.1倍容量の3M酢酸ナトリウムと2倍容
量のエタノールを加えてDNAを沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで、6ユニツトのT4−D
NAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて、cos及びori,A
prからなるDNA断片(2.55Kbp)を閉環化させた。その
後、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱と
して得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに
溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、pHPcosのPvuIIサイトにBglIIリンカーを挿入させ
たプラスミド:pHBglIIcos(第6図)を持つ大腸菌を得
た。
この大腸菌を、TYG−P培地1で増殖させたのち、
菌体よりccc−DNAを分離精製してpHBglIIcosのプラスミ
ドDNAを調製した。
(e)pAPcos(BglII)の作成及び調製 pAPcos10μgを、反応混液100μlで60.6ユニツトのE
coRIと37℃で2時間反応させて消化した。そして、フエ
ノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に溶解させ
た。
次に、このEcoRIで消化したDNA溶液1μl(〜1μ
g)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えた。そして反応液を65℃で10分間熱処理してKlenow
酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(0.4μg)とBglIIリンカ
ー〔d(pC−A−G−A−T−C−T−G)〕2μgと
を、反応混液20μlで、6ユニツトのT4−DNAリガーゼ
と22℃で6時間反応させて連結した。
そして、この反応液10μlを、反応混液50μlで、15
ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させ
て、cos及びori,Apr.TcrからなるDNA断片(4.75Kbp)
を閉環化させた。その後、フエノール抽出を行ないDNA
をエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH
7.5)溶液20μlに溶解させた。
このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトランスホー
メーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得た。次い
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、pAPcosのEcoRIサイトにBglIIリンカーを挿入させ
たプラスミド:pAPcos(BglII)(第6図)を持つ大腸菌
を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpAPcos(BglII)
のプラスミドDNAを調製した。
(f)pDcos Apr/Tcr(2BglII)の作成及び調製 pAPcos(BglII)20μgを、反応混液200μlで202ユ
ニツトのBglIIと37℃で2時間反応させて消化したの
ち、0.8%調製用アガロースゲル電気泳動にかけて、cos
及びTcrを含むDNA断片(1.86Kbp)を分離精製して、DNA
をエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 5.5μl
(〜1μg/μl)に溶解させた。
一方、pHBglIIcos10μgを、反応混液100μlで94ユ
ニツトのBglIIと37℃で2時間反応させて消化した。そ
してフエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱
として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に溶
解させた。
そして、pAPcos(BglII)のcos及びTcrを含むBglII断
片のDNA溶液1μl(〜1μg)と、pHBglIIcosをBglII
で消化したDNA溶液1μl(〜1μg)とを、反応混液2
0μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間
反応させて連結した。その後、フエノール抽出を行な
い、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−
HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得
た。次いでこれらのクローンのもつプラスミドDNAの特
性を調べて、同一の方向性を持つたcosを2個有するプ
ラスミド:pDcos Apr/Tcr(2BglII)(第6図)を持つ
大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpDcos Apr/Tc
r(2BglII)のプラスミドDNAを調製した。
(g)pDcos Apr/Tcrの作成及び調製 pDcos Apr/Tcr(2BglII)10μgを反応混液100μl
で、11.0ユニツトのBglIIと37℃で30分間反応させて限
定消化した。次で、フエノール抽出で除蛋白後、DNAを
エタノール沈澱として得た。このDNA沈澱を反応混液100
μlで21.8ユニツトのPvuIIと37℃で2時間反応させて
完全に消化したのち、0.8%調製用アガロースゲル電気
泳動にかけて、2個のcos及びori,Apr,Tcrを含むDNA断
片(4.2Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱と
して得、沈澱を10t/0.1E 6.5μl(〜1μg/μl)に溶
解させた。
次に、このDNA溶液1μl(〜1μg)を、反応混液2
5μlで、2ユニツトのKlenow酵素と22℃で30分間反応
させて、cohesive endをblunt endに変えた。そして、
反応液を65℃で10分間熱処理してKlenow酵素を失活させ
た。
次に、このDNA溶液10μl(0.4μg)とPvuIIリンカ
ー〔d(pC−C−A−G−C−T−G−G)〕2μgと
を、反応混液20μlで、6ユニツトのT4−DNAリガーゼ
と22℃で6時間反応させて連結した。
そして、この反応液10μlを、反応混液50μlで、15
ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させ
て、2個のcos及びori,Apr,TcrからなるDNA断片(4.2K
bp)を閉環化させた。その後、フエノール抽出を行な
い、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−
HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得
た。そして、これらのクローンのもつプラスミドDNAの
特性を調べて、pDcos Apr/Tcr(2BglII)のPvuIIサイ
トとBglIIサイトの間のDNA断片(0.2Kbp)を欠いたプラ
スミド:pDcos Apr/Tcr(第6図)を持つ大腸菌を得
た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpDcos Apr/Tcr
プラスミドDNAを調製した。
(h)pDcos Apr/Tcr・XhoIaの作成及び調製 pDcos Apr/Tcr 10μgを反応混液100μlで、42.9ユ
ニツトのAvaIと37℃で2時間反応させて消化した。そし
て、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱
として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に溶
解させた。
次に、このAvaIで消化したDNA溶液1μl(〜1μ
g)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えた。そして反応液を65℃で10分間熱処理してKlenow
酵素を失活させた。
このDNA溶液10μl(0.4μg)と、XhoIリンカー〔d
(pC−C−T−C−G−A−G−G)〕2μgとを、反
応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと22℃で
6時間反応させて連結した。その後、フエノール抽出を
行ない、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液600μl(150mM NaCl,6mM T
ris−HCl(pH7.9)、6mM MgCl2,6mM DTT,100μg/m lBS
A)で、1000ユニツトのXhoI(New England Biolabs社
製)と37℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調
製用アガロースゲル電気泳動にかけて、2個のcos及びo
ri,Apr,Tcrを含むDNA断片(4.2Kbp)を分離精製して、
DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで、6ユニツトのT4−D
NAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化したの
ち、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱と
して得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに
溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得
た。次で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特
性を調べて、pDcos Apr/TcrのAvaIサイトにXhoIリンカ
ーを挿入させたプラスミド:pDcos Apr/Tcr・XhoIa(第
6図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpDcos Apr/Tcr
XhoIaのプラスミドDNAを調製した。
(i)pDcos Tcrの作成及び調製 pDcos Apr/Tcr・XhoIa10μgを反応混液100μlで6.
2ユニツトのBstEIIと60℃で30分間反応させて限定消化
した。そしてフエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を10t/0.1 E7μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
次に、このBstEIIで限定消化したDNA溶液1μl(〜
1μg)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵
素と22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt en
dに変えた。そして反応液を65℃で10分間熱処理してKle
now酵素を失活させた。
このDNA溶液10μl(0.4μg)と、PstIリンカー〔d
(pG−C−T−G−C−−A−G−C)〕2μgとを、
反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと22℃
で6時間反応させて連結した。その後、フエノール抽出
を行ない、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液400μl(50mM(NH4)2SO4、2
0mM Tris−HCl(pH7.5)、10mM MgCl2、100μg/mlBSA)
で、600ユニツトのPstI(New England Biolabs社製)と
37℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調製用ア
ガロースゲル電気泳動にかけて、2個のcos及びori,Tcr
を含むDNA断片(〜4Kbp)を分離精製して、DNAをエタノ
ール沈澱として得た。
次に、このDNA沈澱を反応混液20μlで、6ユニツト
のT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化
したのち、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール
沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20
μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Tcrクローンを得た。次
いでこれらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、pDcos Apr/Tcr・XhoIaのBstEIIサイトとPstIサ
イトの間のDNA断片(〜0.2Kbp)を欠いたプラスミド:pD
cos Tcr(第3,6図)を持つ大腸菌を得た。なお、本菌株
は、工業技術院微生物工業技術研究所に「微工研菌第75
51号(FERMP−7551)」として寄託されている。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpDcos Tcrのプラ
スミドDNAを調製した。
実施例2 pDcos Tcr/oriの作成及び調製(第7図) (a)pBR−327・XhoIpの作成及び調製 pBR−327 10μgを反応混液100μlで、24.8ユニツト
のPstIと37℃で2時間反応させて消化した。そして、フ
エノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に溶解させ
た。次に、このPstIで消化したDNA溶液1.5μl(〜1.5
μg)を、反応混液30μl(33mM Tris−aceta−te(pH
7.9)、66mM酢酸カリ、10mM MgCl2、0.5mM DTT,100μg/
me BSA、0.1mM dATP、0.1mM dCTP、0.1mM dGTP、0.1mM
dTTP)で、5ユニツトのT4−DNAポリメラーゼ(P.L社
製)と、37℃で15分間反応させて、cohesive endをblun
t endに変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理
してT4−DNAポリメラーゼを失活させた。
このDNA溶液8μl(0.4μg)と、XhoIリンカー〔d
(pC−C−T−C−G−A−G−G)〕2μgとを、反
応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと22℃で
6時間反応させて連結した。その後、フエノール抽出を
行ない、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液600μlで1000ユニツトのXh
oIと37℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調製
用アガロースゲル電気泳動にかけて、3.27KbpのDNA断片
を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNA
リガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化したのち、
フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解
させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Tcrクローンを得た。次
いでこれらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べてpBR−327のPstIサイトにXhoIリンカーを挿入させた
プラスミド:pBR−327・XhoIp(第7図)を持つ大腸菌を
得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpBR−327・XhoIp
のプラスミドDNAを調製した。
(b)pDcos Tcr(2ori)の作成及び調製 pDcos Tcr20μgを、反応混液500μl(150mM NaCl、
6mM Tris−HCl(pH7.9)、6mM MgCl2,6mM DTT,100μg/m
l BSA)で、167ユニツトの制限酵素BamHI(New England
Biolabs社製)及び500ユニツトのXhoIと37℃で2時間
反応させて完全に消化したのち、0.8%調製用アガロー
スゲル電気泳動にかけて、2個のcos及びoriを含むDNA
断片(2.4Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱
として得、沈澱を10t/0.1E 9.5μl(〜1μg/μl)に
溶解させた。
一方、pBR−327 XhoIp 20μgを反応混液500μlで、
167ユニツトのBamHI及び500ユニツトのXhoIと37℃で2
時間反応させて完全に消化したのち、0.8%調製用アガ
ロースゲル電気泳動にかけて、oriを含むDNA断片(2.14
Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得、
沈澱を10t/0.1E 9.0μl(〜1μg/μl)に溶解させ
た。
そして、pDcos Tcrのcos及びoriを含むBamHI/XhoI断
片のDNA溶液1μl(〜1μg)と、pBR−327・XhoIp
oriを含むBamHI/XhoI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)
とを、反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼ
と12℃で17.5時間反応させて連結した。その後、フエノ
ール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として得、沈
澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させ
た。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Tcrクローンを得た。次い
でこれらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調べ
て、2個のcos及び2個のori,Tcrを有するプラスミド:p
Dcos Tcr(2ori)(第7図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpDcos Tcr(2or
i)のプラスミドDNAを調製した。
(c)pSV2−dhfrΔ(BglII)の作成及び調製 pSV2−dhfr〔Subramani,Mulligan & Berg,Mol.Cell.
Biol.,1,854(1981)〕10μgを反応混液100μlで、4
8.5ユニツトのBglIIと37℃で2時間反応させて消化し
た。そして、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
次に、このBglIIで消化したDNA溶液1μl(〜1μ
g)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えた。そして反応液を65℃で10分間熱処理してKlenow
酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(〜0.4μg)を反応混液50
μlで、15ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時
間反応させて閉環化したのち、フエノール抽出を行な
い、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−
HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
いで、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を
調べて、pSV2−dhfrのBglIIサイトを欠いたプラスミド:
pSV2−dhfrΔ(BglII)(第7図)を持つ大腸菌を得
た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpSV2−dhfrΔ(Bg
lII)のプラスミドDNAを調製した。
(d)pDcos Tcr/oriの作成及び調製 pDcos Tcr(2ori)20μgを反応混液500μl〔60mM N
aCl,6mM Tris−HCl(pH7.5)、6mM MgCl2、6mM DTT,100
μg/ml BSA〕で、42.5ユニツトのPvuII及び35.8ユニツ
トのPstIと37℃で2時間反応させて完全に消化したの
ち、0.8%調製用アガロースゲル電気泳動にかけて、2
個のcos及びori,Tcrを含むDNA断片(3.1Kbp)を分離精
製して、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1
E 9.5μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
一方、pSV2−dhfrΔ(BglII)20μgを反応混液500μ
lで、38.8ユニツトのPvuII及び32.7ユニツトのPstIと3
7℃で2時間反応させて完全に消化したのち、0.8%調製
用アガロースゲル電気泳動にかけて、SV−dhfrを含むDN
A断片(2.45Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈
澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に
溶解させた。
そして、pDcos Tcr(2ori)のcos及びori,Tcrを含むP
vuII/PstI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)と、pSV2−
dhfrΔ(BglII)のSV−dhfrを含むPvuII/PstI断片のDNA
溶液1μl(〜1μg)とを、反応混液20μlで6ユニ
ツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて連
結した。その後、フエノール抽出を行ない、DNAをエタ
ノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)
溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Tcrクローンを得た。次い
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、2個のcos及びori,Tcr,SV−dhfrを有するプラス
ミド:pDcos Tcr/ori(第4、7図)を持つ大腸菌を得
た。なお、本菌株は、工業技術院微生物工業技術研究所
に「微工研菌第7554号(FERMD−7554)」として寄託さ
れている。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Tcr/ori
のプラスミドDNAを調製した。
実施例3 pDcos Apr/oriの作成及び調製(第8図) (a)pBR−327 XhoIaの作成及び調製 pBR−32710μgを反応混液100μlで、110ユニツトの
AvaIと37℃で2時間反応させて消化した。そして、フエ
ノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に溶解させ
た。
次に、このAvaIで消化したDNA溶液1μl(〜1μ
g)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理してKlen
ow酵素を失活させた このDNA溶液10μl(0.4μg)と、XhoIリンカー〔d
(pC−C−T−C−G−A−G−G)〕2μgとを、反
応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと22℃で
6時間反応させて連結した。その後、フエノール抽出を
行ない、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液600μlで、1000ユニツトの
XhoIと37℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調
製用アガロースゲル電気泳動にかけて、3.27KbpのDNA断
片を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNA
リガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化したのち、
フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解
させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得
た。次いで、これらのクローンのもつプラスミドDNAの
特性を調べて、pBR−327のAvaIサイトにXhoIリンカーを
挿入させたプラスミド:pBR−327・XhoIa(第8図)を持
つ大腸菌を得た。
この大腸菌をTYG−P培地1中で増殖させたのち、
菌体よりccc−DNAを分離精製して、pBR−327・XhoIa
プラスミドDNAを調製した。
(b)pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BglII)の作成及び調製 pDcos Tcr/ori 20μgを反応混液200μlで106ユニツ
トのEcoRIと37℃で2時間反応させて消化したのちさら
に反応混液500μlで530ユニツトのXhoIと37℃で2時間
反応させて消化した。その後、0.8%調製用アガロース
ゲル電気泳動にかけて2個のcos及びSV−dhfrを含むDNA
断片(〜2.9Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈
澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μl)に
溶解させた。
一方、pBR−327・XhoIa 20μgを反応混液200μlで1
67ユニツトのEcoRIと37℃で2時間反応させて消化した
のち、さらに反応混液500μlで880ユニツトのXhoIと37
℃で2時間消化した。その後、0.8%調製用アガロース
ゲル電気泳動にかけて、ori及びAprを含むDNA断片(1.8
4Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 8μl(〜1μg/μl)に溶解させ
た。
そして、pDcos Tcr/oriのcos及びSV−dhfrを含むEcoR
I/XhoI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)と、pBR−327
・XhoIaのori及びAprを含むEcoRI/XhoI断片のDNA溶液1
μl(〜1μg)とを、反応混液20μlで6ユニツトの
T4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて連結し
た。その後、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノー
ル沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液2
0μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)とトラン
スホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次い
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、2個のcos及びori,Apr,SV−dhfrΔ(BglII)を有
するプラスミド:pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BglII)(第8
図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori/
dhfrΔ(BglII)のプラスミドDNAを調製した。
(c)pSV2−dhfrΔ(BamHI/BglII)の作成及び調製 pSV2−dhfr 10μgを反応混液100μlで48.5ユニツト
のBglIIと37℃で2時間反応させて消化したのち、さら
に反応混液250μlで58.2ユニツトのBamHIと2時間反応
させて消化した。そして、フエノール抽出で除蛋白後、
DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl
(〜1μg/μl)に溶解させた。
次に、このBglIIとBamHIで消化したDNA溶液1μl
(〜1μg)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlen
ow酵素と22℃で30分間反応させてcohesive endをblunt
endに変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理し
て、Klenow酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(〜0.4μg)を反応混液50
μlで、15ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時
間反応させて閉環化したのち、フエノール抽出を行な
い、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−
HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
でこれらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調べ
て、pSV2−dhfrのBglIIサイトとBamHIサイトとの間のDN
A断片(0.85Kbp)を欠いたプラスミド:pSV2−dhfrΔ(B
amHI/BglII)(第8図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌をTYG−P培地1中で増殖させたのち、
菌体よりccc−DNAを分離精製して、pSV2−dhfrΔ(BamH
I/BglII)のプラスミドDNAを調製した。
(d)pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BamHI/BglII)の作成及
び調製 pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BglII)20μgを反応混液200
μlで、2.9ユニツトのPstIと37℃で30分間反応させて
限定消化した。次いでフエノール抽出で除蛋白後、DNA
をエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液200μlで34.0ユニツトのPvuI
Iと37℃で2時間反応させて消化した。その後、0.8%調
製用アガロースゲル電気泳動にかけて、2個のcos及びo
ri,Aprを含むDNA断片(2.3Kbp)を分離精製して、DNAを
エタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1
μg/μl)に溶解させた。
一方、pSV2−dhfrΔ(BamHI/BglII)20μgを反応混
液500μlで、46.8ユニツトのPvuII及び39.5ユニツトの
PstIと37℃で2時間反応させて完全に消化したのち、0.
8%調製用アガロースゲル電気泳動にかけて、SV−dhfr
を含むDNA断片(1.61Kb)を分離精製して、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 5.5μl(〜1μg/
μl)に溶解させた。
そして、pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BglII)のcos及びor
i,Aprを含むPvuII/PstI断片のDNA溶液1μl(〜1μ
g)と、pSV2−dhfrΔ(BamHI/BglII)のSV−dhfrを含
むPvuII/PstI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)とを反
応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で1
7.5時間反応させて連結した。その後、フエノール抽出
を行ない、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M
Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次い
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、2個のcos及びori,Apr,SV−dhfrΔ(BamHI/BglI
I)を有するプラスミド:pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BamHI/
BglII)(第8図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori/
dhfrΔ(BamHI/BglII)のプラスミドDNAを調製した。
(e)pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BamHI)の作成及び調製 pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BamHI/BglII)10μgを、反
応混液100μlで、73.7ユニツトのEcoRIと37℃で2時間
反応させて消化した。そして、フエノール抽出で除蛋白
後、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7
μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
次に、このEcoRIで消化したDNA溶液1μl(〜1μ
g)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理してKlen
ow酵素を失活させた。
このDNA溶液10μl(0.4μg)と、BamHIリンカー
〔d(pC−G−G−A−T−C−C−G)〕2μgとを
反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと22℃
で6時間反応させて連結した。その後、フエノール抽出
を行ないDNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液600μlで1000ユニツトのBa
mHIと37℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調製
用アガロースゲル電気泳動にかけて、3.91KbpのDNA断片
を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNA
リガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化したのち、
フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解
させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
いで、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を
調べて、pDcos Apr/ori/dhfrΔ(BamHI/BglII)のEcoRI
サイトにBamHIリンカーを挿入させたプラスミド(この
場合、BamHIサイトの両側にEcoRIサイトが再構成され
る):pDcos Apr/ori/dhfr(BamHI)(第8図)を持つ大
腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori/
dhfr(BamHI)のプラスミドDNAを調製した。
(f)pSVO10/neorの作成及び調製 pAO43(Oka,Sugisaki & Takanami,J.Mol,Biol,147,2
14(1981))20μgを反応混液200μl(60mM NaCl,6mM
Tris−HCl(pH8.0),10mM MgCl2,6mM DTT,100μg/ml B
SA)で、150ユニツトの制限酵素AvaII(New England Bi
olabs社製)と37℃で2時間反応させて消化したのち、
0.8%調製用アガロースゲル電気泳動にかけて、neor
含むDNA断片(1.24Kbp)を分離精製して、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 5μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
このDNA溶液2μl(〜2μg)を、反応混液50μl
で、4ユニツトのKlenow酵素と22℃で30分間反応させ
て、cohesive endをblunt endに変えた。そして、フエ
ノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 1.5μl(〜1μg/μl)に溶解さ
せた。
一方、pSVO10〔{πVX〔Brain seed,Nucleic Acids R
es.,11,2427(1983)〕由来のポリリンカーを持つたpSV
O1〔Tjan,R,et al,Proc,Natl,Acad.Sci.U.S.A.,77,6491
(1980)〕の類縁プラスミド}〕10μgを、反応混液10
0μlで129ユニツトのBamHIと37℃で2時間反応させて
消化したのち、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
このDNA溶液2μl(〜2μg)を、反応混液50μl
で、4ユニツトのKlenow酵素と22℃で30分間反応させ
て、cohesive endをblunt endに変えた。そして、フエ
ノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 1.5μl(〜1μg/μl)に溶解さ
せた。
次に、pAO43のneorを含むDNA断片をKlenow酵素で処理
したDNA溶液1μl(〜1μg)と、pSVO10をBamHIで消
化し、Klenow酵素で処理したDNA溶液1μl(〜1μ
g)とを、反応液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガー
ゼと12℃で17.5時間反応させて連結した。その後、フエ
ノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として得、
沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させ
た。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、AprかつKmr(neor)クロ
ーンを得た。次いでこれらのクローンをもつプラスミド
DNAの特性を調べてpSVO10のBamHIサイトにneorを挿入さ
せたプラスミド:pSVO10/neor(第8図)を持つ大腸菌を
得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pSVO10/neor
プラスミドDNAを調製した。
(g)pBR−322/neorの作成及び調製 pSVO10/neor 20μgを反応混液200μlで46.6ユニツ
トのPstIと37℃で2時間反応させて消化したのち、さら
に反応混液500μlで166ユニツトのEcoRIと37℃で2時
間反応させて消化した。その後、0.8%調製用アガロー
スゲル電気泳動にかけて、neorを含むDNA断片(1.24Kb
p)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得、沈
澱を10t/0.1E 5μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
一方、pBR−322 20μgを反応混液200μlで37.2ユニ
ツトのPstIと37℃で2時間反応させて消化したのち、さ
らに反応混液500μlで132ユニツトのEcoRIと2時間反
応させて消化した。その後、0.8%調製用アガロースゲ
ル電気泳動にかけて、ori及びTcrを含むDNA断片(3.6Kb
p)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得、沈
澱を10t/0.1E 11μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
そして、pSVO10/neorのneorを含むEcoRI/PstI断片のD
NA溶液1μl(〜1μg)と、pBR−322のori及びTcr
含むEcoRI/PstI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)と
を、反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと1
2℃で17.5時間反応させて連結した。その後、フエノー
ル抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱
を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Kmr(neor)かつTcr,Aps
クローンを得た。次いでこれらのクローンをもつプラス
ミドDNAの特性を調べて、pBR−322にneor断片を挿入さ
せたプラスミド:pBR−322/neor(第8図)を持つ大腸菌
を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpBR−322/neor
プラスミドDNAを調製した。
(h)pBR−322/neorΔ(EcoRI/BalI)の作成及び調製 pBR−322/neor 10μgを反応混液100μlで40ユニツ
トのBalIと37℃で2時間反応させて消化したのち、さら
に反応混液250μlで120ユニツトのEcoRIと37℃で2時
間反応させて消化した。そして、フエノール抽出で除蛋
白後、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E
7μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
次に、このBalIとEcoRIで消化したDNA溶液1μl(〜
1μg)を、反応混液25μlで、2ユニツトのKlenow酵
素と22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt en
dに変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理してK
lenow酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(〜0.4μg)を反応混液50
μlで、15ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時
間反応させて閉環化したのち(この場合、EcoRIサイト
が再構成される)、フエノール抽出を抽出を行ない、DN
Aをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(p
H7.5)溶液20μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、neor(Kmr)かつTcs,Ap
sクローンを得た。次いでこれらのクローンのもつプラ
スミドDNAの特性を調べて、pBR−322/neorのEcoRIサイ
トとBalIサイトとの間のDNA断片(1.42Kbp)を欠いたプ
ラスミド:pBR−322/neorΔ(EcoRI/BalI)(第8図)を
持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pBR−322/neor
Δ(EcoRI/BalI)のプラスミドDNAを調製した。
(i)pDcos Apr/oriの作成及び調製 pDcos Apr/ori/dhfr(BamHI)20μgを反応混液200μ
lで、4.1ユニツトのPstIと37℃で30分間反応させて限
定消化した。次いでフエノール抽出で除蛋白後、DNAを
エタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液200μlで49ユニツトのPvuI
Iと37℃で2時間反応させて消化した。
その後、0.8%調製用アガロースゲル電気泳動にかけ
て、2個のcos及びori,Aprを含むDNA断片(2.3Kbp)を
分離精製して、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を1
0t/0.1E 8μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
一方、pBR−322/neorΔ(EcoRI/BalI)20μgを反応
混液500μlで、56ユニツトのPvuII及び47ユニツトのPs
tIと37℃で2時間反応させて完全に消化したのち、0.8
%調製用アガロースゲル電気泳動にかけて、neorを含む
DNA断片(1.9Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈
澱として得、沈澱を10t/0.1E 8μl(〜1μg/μl)に
溶解させた。
そして、pDcos Apr/ori/dhfr(BamHI)のcos及びori,
Aprを含むPvuII/PstI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)
と、pBR−322/neorΔ(EcoRI/BalI)のneorを含むPvuII
/PstI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)とを、反応混液
20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時
間反応させて連結した。その後、フエノール抽出を行な
いDNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HC
l(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Aprかつneor(Kmr)クロー
ンを得た。次でこれらのクローンをもつプラスミドDNA
の特性を調べて、2個のcos及びori,Apr,neorを有する
プラスミド:pDcos Apr/ori(第1,8図)を持つ大腸菌を
得た。なお、本菌株は、工業技術院微生物工業技術研究
所に「微工研菌第7553号(FERMP−7553)」として寄託
されている。
この大腸菌をTYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori
のプラスミドDNAを調製した。
実施例4 pDcos Apr/ori/gpt/TKの作成及び調製(第9
図) (a)pSV2−gptΔ(HindIII/BglII)の作成及び調製 pSV2−gpt〔Richard,Mulligan & Berg,Mol.Cell.Bio
l.,1,449,(1981)〕10μgを、反応混液100μlで、46
ユニツトのHindIII及び46ユニツトのBglIIと37℃で2時
間反応させて消化した。そして、フエノール抽出で除蛋
白後、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E
7μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
次に、このHindIII及びBglIIで消化したDNA溶液1μ
l(〜1μg)を、反応混液25μlで2ユニツトのKlen
ow酵素と22℃で30分間反応させて、cohesive endをblun
t endに変えた。そして、反応液を65℃で10分間熱処理
してKlenow酵素を失活させた。
次に、このDNA溶液10μl(〜4.9μg)を反応混液50
μlで、15ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時
間反応させて閉環化したのち、フエノール抽出を行な
い、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−
HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
いで、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を
調べて、pSV2−gptのHindIIIサイトとBglIIサイトとの
間のDNA断片(0.12Kbp)を欠いたプラスミド:pSV2−gpt
Δ(HindIII/BglII)(第9図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpSV2−gptΔ(Hin
dIII/BglII)のプラスミドDNAを調製した。
(b)pSV2−gptΔ(HindIII/BglII)/BamHIの作成及び
調製 pSV2−gptΔ(HindIII/BglII)10μgを反応混液100
μlで18.8ユニツトのPvuIIと37℃で2時間反応させて
消化した。そして、フエノール抽出で除蛋白後、DNAを
エタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1
μg/μl)に溶解させた。
次に、このDNA溶液0.4μl(〜0.4μg)と、BamHIリ
ンカー〔d(pC−A−G−A−T−C−C−G)〕2μ
gとを、反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガー
ゼと22℃で6時間反応させて連結した。その後、フエノ
ール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を、反応混液600μlで1000ユニツトのBa
mHIと37℃で4時間反応させて消化したのち、0.8%調製
用アガロースゲル電気泳動にかけて、5.1Kbpの長さのDN
A断片を分離精製して、DNAをエタノール沈澱とした。
このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNA
リガーゼと12℃17.5時間反応させて閉環化したのち、フ
エノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解
させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
で、これらのクローンをもつプラスミドDNAの特性を調
べて、pSV2−gptΔ(HindIII/BglII)のPvuIIサイトにB
amHIリンカーを挿入させたプラスミド:pSV2−gptΔ(Hi
ndIII/BglII)/BamHI(第9図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpSV2−gptΔ(Hin
dIII/BglII)/BamHIのプラスミドDNAを調製した。
(c)pDcos Apr/ori/gpt(2 BamHI)の作成及び調製 pSV2−gptΔ(HindIII/BglII)BamHI 20μgを反応混
液200μlで、226ユニツトのBamHIと37℃で2時間反応
させて消化したのち、0.8%調製用アガロースゲル電気
泳動にかけて、gptを含むDNA断片(2.2Kbp)を分離精製
して、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E
8.5μl(〜1μg/μl)に溶解させた。
一方、pDcosApr/ori/dhfr(BamHI)10μgを反応混液
100μlで74ユニツトのBamHIと37℃で2時間反応させて
消化した。そして、フエノール抽出で除蛋白後、DNAを
エタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1 E7μl(〜1
μg/μl)に溶解させた。
そして、pSV2−gptΔ(HindIII/BglII)/BamHIのgpt
を含むBamHI断片のDNA溶液1μl(〜1μg)と、pDco
sApr/ori/dhfr(BamHI)をBamHIで消化したDNA溶液1μ
l(〜1μg)とを、反応混液20μlで6ユニツトのT4
−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて連結した。
その後、フエノール抽出を抽出を行ない、DNAをエタノ
ール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶
液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次い
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、pDcos Apr/ori/dhfrのBamHIサイトにgptを挿入さ
せたプラスミド:pDcos Apr/ori/gpt(2BamHI)(第9
図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製してpDcos Apr/ori/gp
t(2BamHI)のプラスミドDNAを調製した。
(d)pDcos Apr/ori/gptの作成及び調製 pDcos Apr/ori/gpt(2BamHI)10μgを、反応混液100
μlで9.1ユニツトのBamHIと37℃で30分間反応させて限
定消化した。そして、フエノール抽出で除蛋白後、DNA
をエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 7μl(〜
1μg/μl)に溶解させた。
次に、このBamHIで限定消化したDNA溶液1μl(〜1
μg)を、反応混液25μlで2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えたのち、0.8%調製用アガロースゲル電気泳動にか
けて、6.3Kbpの長さのDNA断片を分離精製して、DNAをエ
タノール沈澱として得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNA
リガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化したのち、
フエノール抽出を抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱
として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μl
に溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラ
ンスホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次
でこれらのクローンをもつプラスミドDNAの特性を調べ
て、pDcos Apr/ori/gpt(2BamHI)のcosとgptとの間のB
amHIサイトを欠いたプラスミド:pDcos Apr/ori/gpt(第
9図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori/
gptのプラスミドDNAを調製した。
(e)pTK−4/BamHIの作成及び調製 pTK−4〔Ishiura,M.,etal.Mol.Cell Biol,2,607(19
82)〕10μgを反応混液100μlで、3.0ユニツトのPvuI
Iと37℃で30分間反応させて限定消化したのち、0.8%調
製用アガロースゲル電気泳動にかけて、6.43Kbpの長さ
のDNA断片を分離精製して、DNAをエタノール沈澱として
得、沈澱を10t/0.1E 3μl(〜1μg/μl)に溶解させ
た。
次に、このDNA溶液0.4μl(〜0.4μg)と、BamHIリ
ンカー〔d(pC−G−G−A−T−C−C−G)〕2μ
gとを、反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガー
ゼと22℃で6時間反応させて連結した。
そして、この反応液10μlを、反応混液50μlで15ユ
ニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて
閉環化した。その後フエノール抽出を行ない、DNAをエ
タノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.
5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、AprかつTcrクローンを得
た。そして、これらのクローンのもつプラスミドDNAの
特性を調べて、pTK−4のoriとTKとの間のPvuIIサイト
にBamHIリンカーを挿入させたプラスミド:pTK−4/BamHI
(第9図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pTK−4/BamHIの
プラスミドDNAを調製した。
(f)pTK−4/BamHI/BamHIの作成及び調製 pTK−4/BamHI 10μgを反応混液100μlで9ユニツト
のBamHIと37℃で30分間反応させて限定消化したのち、
フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として
得た。
このエタノール沈澱を反応混液100μlで15ユニツト
のPvuIIと37℃で2時間反応させて完全に消化したの
ち、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱と
して得、沈澱を10t/0.1E 3μl(〜1μg/μl)に溶解
させた。
次に、このBamHIで限定消化し、さらにPvuIIで消化し
たDNA溶液1μl(〜1μg)を、反応混液25μlで2
ユニツトのKlenow酵素と22℃で30分間反応させて、cohe
sive endをblunt endに変えたのち、0.8%調製用アガロ
ースゲル電気泳動にかけて、ori及びApr,TKを含むDNA断
片(4.67Kbp)を分離精製して、DNAをエタノール沈澱と
して得た。
このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツトのT4−DNA
リガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化したのち
(この場合、BamHIサイトが再構成される)、フエノー
ル抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱
を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
そして、このDNA溶液10μlで、大腸菌(HB101)をト
ランスホーメーシヨンしたのち、AprかつTcsクローンを
得た。次いでこれらのクローンのもつプラスミドDNAの
特性を調べて、pTK−4/BamHIのPvuIIサイトとBamHIサイ
ト(Tcr上)の間のDNA断片(1.76Kbp)を欠いたプラス
ミド:pTK−4/BamHI/BamHI(第9図)を持つ大腸菌を得
た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pTK−4/BamHI/B
amHIのプラスミドDNAを調製した。
(g)pDcos Apr/ori/gpt/TK(2BamHI)の作成及び調製 pTK−4/BamHI/BamHI 20μgを反応混液200μlで247
ユニツトのBamHIと37℃で2時間反応させて消化したの
ち、1.0%調製用アガロースゲル電気泳動にかけて、TK
を含むDNA断片(2Kbp)を分離精製して、DNAをエタノー
ル沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 6μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
一方、pDcos Apr/ori/gpt 10μgを反応混液100μl
で、91ユニツトのBamHIと37℃で2時間反応させて消化
した。そして、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタ
ノール沈澱として得沈澱を10t/0.1E 7μl(〜1μg/μ
l)に溶解させた。
そして、pTK−4/BamHI/BamHIのTKを含むBamHI断片のD
NA溶液1μl(〜1μg)と、pDcos Apr/ori/gptをBam
HIで消化したDNA溶液1μl(〜1μg)とを、反応混
液20μlで6ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5
時間反応させて連結した。その後フエノール抽出を行な
い、DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−
HCl(pH7.5)溶液20μlに溶解させた。
次に、このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトラン
スホーメーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次い
で、これらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調
べて、pDcos Apr/ori/gptのBamHIサイトにTKを挿入させ
たプラスミド:pDcos Apr/ori/gpt/TK(2BamHI)(第9
図)を持つ大腸菌を得た。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori/
gpt/TK(2BamHI)のプラスミドDNAを調製した。
(h)pDcos Apr/ori/gpt/TKの作成及び調製 pDcos Apr/ori/gpt/TK(2BamHI)10μgを反応混液10
0μlで、6.9ユニツトのBamHIと37℃で30分間反応させ
て限定消化した。そしてフエノール抽出で除蛋白後、DN
Aをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E7μl(〜
1μg/μl)に溶解させた。
次に、このBamHIで限定消化したDNA溶液1μl(〜1
μg)を、反応混液25μlで2ユニツトのKlenow酵素と
22℃で30分間反応させて、cohesive endをblunt endに
変えたのち、0.8%調製用アガロースゲル電気泳動にか
けて、8.3Kbpの長さのDNA断片を分離精製して、DNAをエ
タノール沈澱として得た。
そして、このDNA沈澱を反応混液20μlで6ユニツト
のT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させて閉環化
したのち、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール
沈澱として得、沈澱を0.1M Tris−HCl(pH7.5)溶液20
μlに溶解させた。
このDNA溶液10μlで大腸菌(HB101)をトランスホー
メーシヨンしたのち、Aprクローンを得た。次いで、こ
れらのクローンのもつプラスミドDNAの特性を調べて、p
Dcos Apr/ori/gpt/TK(2BamHI)のTKと Aprとの間のBa
mHIサイトを欠いたプラスミド:pDcosApr/ori/gpt/TK
(第5、9図)を持つ大腸菌を得た。なお、本菌株は、
工業技術院微生物工業技術研究所に「微工研菌第7552号
(FERMP−7552)」として寄託されている。
この大腸菌を、TYG−P培地1中で、増殖させたの
ち、菌体よりccc−DNAを分離精製して、pDcos Apr/ori/
gpt/TKのプラスミドDNAを調製した。
実施例5 pDcos Apr/oriによるゲノムDNA(外来DNA)
の遺伝子バンクの製造(第2図参照) (a)高分子量のゲノムDNAの調製 pBR−322の塩基配列を持つ、ヘルペスシンプレツクウ
イルス1型(HSV−1)のチミジンキナーゼ(TK)遺伝
子の組み換え体を移入したマウスL細胞(Ltk-〔HSV−
1TK+〕)は、10%仔牛血清を添加したイーグルMEMで培
養し、confluent monolayers(100mm−プレート9枚、
〜107cells/プレート)とし、PBS(137mM NaCl1,3mMKCl
1,8mM Na2HPO4,1mM KH2PO4)で2度洗つたのち、可溶化
剤(100μg/mlProteinase K 0.5%SDS,150mM NaCl,10mM
EDTA,10mM Tris−HCl(pH7.5))をプレート当り1.0ml
加え、65℃で15〜30分間保温して可溶化した。この可溶
化物は50ml容量の遠沈管に移し、さらに37℃で一晩保温
し、途中、ProtinaseKをさらに100μg/ml添加した。反
応後、等量のトリス緩衝液で飽和したフエノールでおだ
やかに2度抽出し、水層を50mM Tris−HCl(pH8.0)、1
0mM EDTA,10mM NaClからなる透析緩衝液3lに対して4回
透析を行なつた。透析内液は、50μg/mlのDNase−free
RNase Aを加えて37℃で3時間保温してRNAを分解した。
反応後、等量のフエノール:クロロホルム混液で2度お
だやかに抽出し、水層を10mM Tris−HCl(pH8.0),1mM
EDTAからなる水溶液(TE)3lに対して9回透析して、精
製DNA溶液50mlを得た。DNA溶液の260nmと280nmでの吸光
度(OD)は、10倍希釈でそれぞれ0.667,0.363(OD280
OD260=0.544)であり、DNAの濃度は0.667×0.050(μg
/1OD)×10=0.334μg/μlであつた。
(b)35〜45KbpのゲノムDNAの調製 精製したゲノムDNA溶液5.98ml(2mg)を、反応混液2
9.96ml(50mM NaCl,10mM Tris−HCl(pH7.5),10mM MgC
l2,100μg/ml BSA)で15.6ユニツトのSau 3A(New Engl
and Biolabs社製)と37℃で1時間反応させて限定消化
したのち、0.5MEDTA(pH8.0)溶液を1.3ml加え、等量の
トリス緩衝液飽和フエノールで2度おだやかに抽出し
た。そして水層をセカンダリーブタノールで10mlまで濃
縮したのち、3.0M酢酸ナトリウム1.1mlとエタノール20m
lを加え、エタノール沈澱としてゲノムDNAを得、70%エ
タノールで洗つたのち水流ポンプにて乾燥を行ない、エ
タノール沈澱をTE2mlに溶解させた。
次に、このDNA溶液300μlを5〜25%シヨ糖密度勾配
遠心〔20mM Tris−HCl(pH7.6)、5mM EDTA、ベツクマ
ンSW28、20,000rpm、9時間、20℃〕にかけて30滴ごと
に分画した。各分画20μlを0.4%アガロースゲル電気
泳動にかけて長さを測定し、35〜45Kbpの大きさのDNA分
画を集めたのち、TE3lに対して3回透析を行なつた。そ
して透析内液をフエノール抽出後、水層をセカンダリー
ブタノールで濃縮し、DNAをエタノール沈澱として得、
沈澱をTE1mlに溶解させて、35〜45KbpのゲノムDNA溶液
を得た。DNA溶液のOD260及びOD280は50倍希釈でそれぞ
れ0.216,0.112(OD280/OD260=0.519)であり、DNAの
濃度は0.216×0.050(μg/1OD)×50=0.54μg/μlで
あつた。
(c)コスミドベクターDNAの調製 pDcos Apr/ori 40μgを、反応混液800μlで152ユニ
ツトのPvuIIと37℃で2時間反応させて消化した。その
後、フエノール抽出を行ない、DNAをエタノール沈澱と
して得、沈澱を10t/0.1E 100μlに溶解させた。
このPvuIIで消化したDNA溶液95μlを、反応混液500
μl(50mM Tris−HCl(pH9.0),1mM MgCl2,0.1mM ZnCl
2,1mMスペルジミン)で、6ユニツトのホスフアターゼ
(Calf intestinal alkaline phosphatase,Boehringer,
Mannheim社製)と、37℃で15分間、56℃で15分間反応
後、さらに6ユニツトのホスフアターゼを加え、37℃で
15分間、続いて56℃で15分間反応させて、PvuIIの切断
片を不活化した。その後、H2O400μl,STE(100mM Tris
−HCl(pH8.0)、1M NaCl,10mM EDTA)100μl、10% S
DS 50μlを加え、68℃で15分間保温してホスフアター
ゼを失活させた。そして、フエノール抽出で除蛋白後、
DNAをエタノール沈澱として得、沈澱を10t/0.1E 30μl
に溶解した。
次に、このPvuIIで消化し、ホスフアターゼで不活化
したDNA溶液30μlを、反応混液500μlで、152ユニツ
トのBamHIと37℃で2時間反応させて消化した。そし
て、フエノール抽出で除蛋白後、DNAをエタノール沈澱
として得、沈澱を10t/0.1E 30μlに溶解させて、コス
ミドベクターDNA溶液を得た。DNA溶液のOD260及びOD280
は300倍希釈でそれぞれ0.046,0.026(OD280/OD260=0.
565)であり、DNAの濃度は0.046×0.050(μg/1OD)×3
00=0.690μg/μlであつた。
(d)35〜45KbpのゲノムDNAとコスミドベクターDNAと
の連結 (b)で調製した35〜45Kbpのゲノム溶液2.61μl
(1.4μg)と、(c)で調製したコスミドベクターDNA
溶液0.86μl(0.59μg)とを、反応混液10μlで5.9
ユニツトのT4−DNAリガーゼと12℃で17.5時間反応させ
て連結した。反応終了後、反応液は4℃で保存した。
(e)パツケージング抽出液の調製 i)BHB2690から超音波処理して得られる菌体抽出液の
調製 大腸菌BHB2690をNZY培地(1%NZamine,0.5%酵母エ
キス、0.5%NaCl,0.2% MgCl2・6H2O,pH7.5)100mlで
一晩培養した液のOD600を測定後、あらかじめ32℃に保
温しておいたNZY培地500ml(2lフラスコ中)に最初のOD
600が0.025になるように菌を接種し、32℃で振盪培養を
開始した。そして、OD600が0.3になつた時点で(培養開
始から2時間40分後)、45℃で15分間おきプロフアージ
の誘導を行なつた。その後、培養温度を38〜39℃に変
え、さらに3時間激しく振盪培養した(培養液の少量に
クロロホルムを一滴滴下することによつて誘導の検査を
した)。
培養終了後、6,000rpmで10分間遠心分離機にかけて集
菌を行ない、菌体を20mM Tris−HCl(pH8.0),1mM EDT
A,5mMβ−メルカプトエタノールからなる緩衝液3.6mlに
懸濁させた。そして、4℃以下で超音波処理(最大出力
で5秒間×20回)を行なつたのち、20,000rpmで10分間
遠心分離機にかけて(4℃)、上澄液〜3mlを得た。
次に、上澄み液3mlに等量の上記緩衝液とパツケージ
ング緩衝液(6mM Tris−HCl(pH8.0)、50mMスペルジミ
ン、50mMプトレシン、20mM MgCl2,30mM ATP,30mMβ−メ
ルカプトエタノール)0.5mlを加えたのち、15μlづつ
1.5mlのエツペンドルフチユーブに分注し、直ちに液体
窒素中で冷凍し、−70℃で保存した。
ii)BHB2688から凍結・融解によつて得られる菌体抽出
液の調製 大腸菌2688を、NZY培地100mlで一晩培養した液のOD
600を測定したのち、あらかじめ32℃に保温しておいたN
ZY培地500ml(2lフラスコ中)に最初のOD600が0.025に
なるように菌を接種し、32℃で振盪培養を開始した。そ
して、OD600が0.3になつた時点で(培養開始から2時間
40分後)、45℃で15分間おきプロフアージの誘導を行な
つた。その後、培養温度を38〜39℃に変え、さらに3時
間激しく振盪培養した(培養液の少量にクロロホルムを
一滴、滴下することによつて誘導の検査をした)。
培養終了後、6,000rpmで10分間遠心分離機にかけて集
菌を行ない、菌体をシヨ糖溶液(10%シヨ糖、50mM Tri
s−HCl(pH8.0)3mlに懸濁させたのち、0.5mlづつエツ
ペンドルフチユーブ6本にとり、この各々のチユーブに
リゾチーム溶液(2mg/ml、0.25M Tris−HCl(pH8.0))
25μlを加え(4℃)、おだやかに混合し、すばやく液
体窒素中にて凍結させた。
次に、チユーブを氷上において抽出物を融解させたの
ち、各チユーブにパツケージング緩衝液25μlを加えて
混合した。そして、各抽出物を一緒にして、21,000rpm
で1時間(4℃)遠心分離機にかけて上澄液を得、これ
の10μlづつを1.5mlのエツペンドルフチユーブに分注
し、直ちに液体窒素中で冷凍し、−70℃で保存した。
(f)in vitroパツケージング −70℃に保存しておいたBHB2690とBHB2688の菌体抽出
液を氷上におき、まず先に融解するBHB2688の抽出液をB
HB2690の抽出液に加えておだやかに混合した。ほぼ全部
融解したところで、(d)で調製した組み換え体DNA溶
液2.5μl(0.5μg)を加えてよく混合したのち、室温
で1時間反応させてin vitroパツケージングを行なつ
た。
反応終了後、SM溶液(0.58%NaCl,0.2%MgSO4・7H
2O,50mM Tris−HCl(pH7.5)0.01%ゲラチン)1mlとク
ロロホルム一滴を加えて混合した。そして、エツペンド
ルフチユーブを机上遠心機に30秒間かけて、上澄液を形
質導入フアージ粒子溶液として得た。
(g)形質導入及びプレーテイング 大腸菌HB101のL−ブロス(マルトース0.4%添加)で
一晩培養した液200μlを机上遠心機にかけて集菌を行
ない、その菌体を10mM MgCl2溶液100μlに再懸濁し
た。次に、この菌体懸濁液100μlにSM溶液で10倍希釈
した形質導入フアージ粒子溶液100μlを加え、37℃で1
5分間保温して形質導入を行なつたのち、さらにL−ブ
ロス1.1mlを加え37℃で45分間振盪培養した。そして、
この菌体懸濁液を100μlづつアンピシリン20μg/ml含
有する100mmのL−プレートに塗布し、プレートを37℃
で一晩おいたのち、生ずるコロニーを竹ぐしでついてL
−ブロス(アンピシリン20μg/ml含有)で増殖させた。
また、プレート当りのコロニー数は20〜100個であつ
た。
(h)トランスホーマントの培養及び、それの持つプラ
スミドDNAの調製と特性化 アンピシリン耐性コロニー(トランスホーマント)20
個を、L−ブロス(アンピシリン20μg/ml含有)2mlで
一晩培養したのち、各培養液1.5mlを1.5mlのエツペンド
ルフチユーブにとり、机上遠心機にかけて集菌した。こ
れらの菌体を溶液I(50mMグルコース、25mM Tris−HCl
(pH8.0)、10mM EDTA、4mg/mlリゾチーム)100μlに
再懸濁したのち、室温で5分間おいた。次に、溶液II
(0.2N NaoH,1%SDS)200μlを加えておだやかに混合
し、氷上に5分間おいたのち、溶液III〔5M酢酸カリ(p
H4.8)〕150μlを加えておだやかに混合し、氷上に5
分間おいた。そして、エツペンドルフチユーブを机上遠
心機にかけて上澄液を得、これに2倍容量のエタノール
を加えて、プラスミドDNAをエタノール沈澱として得
た。
各トランスホーマントのもつプラスミドDNAを少量の1
0t/0.1Eに溶解させたのち、サイズマーカーDNA(ラムダ
DNA:48Kbp,ラムダDNAをHindIIIで消化したもの:22.3Kb
p,9.5Kbp)と一緒に、0.4%アガロースゲル電気泳動に
かけたところ、アンピシリン耐性コロニー20個のうち、
すべてが22.3Kbp〜48Kbpの大きさのところにプラスミド
DNAの存在が認められた。
【図面の簡単な説明】
第1図は新規コスミドベクターpDcos Apr/oriを示し、 第2図は第1図の新規コスミドベクターを用いるゲノム
DNAの遺伝子バンクの製造法を示し、 第3図は新規コスミドベクターpDcos Tcrを示し、 第4図は新規コスミドベクターpDcos Tcr/oriを示し、 第5図は新規コスミドベクターpDcos Apr/ori/gpt/TKを
示し、 第6図はpDcos Tcrの作成方法を示し、 第7図はpDcos Tcr/oriの作成方法を示し、 第8図はpDcos Apr/oriの作成方法を示し、 第9図はpDcos Apr/ori/gpt/TKの作成方法を示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 岡田 善雄 大阪府箕面市半町2−22―28 (56)参考文献 Gene,26,[1983]P.137−146

Claims (5)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】同一の方向性を持った下記の cos :ラムダファージのcos ori :複製開始点 Apr:アンピシリン耐性を発現する領域 neor:ネオマイシン耐性を発現する領域 で示されるコスミドベクターpDcosApr/oriおよび下記の cos:ラムダファージのcos ori:複製開始点 Tcr:テトラサイクリン耐性を発現する領域 で示されるコスミドベクターpDcos Tcrおよび下記の cos:ラムダファージのcos ori:複製開始点 Tcr:テトラサイクリン耐性を発現する領域 SV−dhfr:SV−40 ジヒドロ葉酸リダクターゼ活性を発
    現する領域 で示されるコスミドベクターpDcos Tcr/oriまたは下記
    cos:ラムダファージのcos ori:複製開始点 Apr:アンピシリン耐性を発現する領域 SV−dhfr:SV−40 ジヒドロ葉酸リダクターゼ活性を発
    現する領域 TK:チミジンキナーゼ活性を発現する領域 gpt:キサンチングアニンホスホリボシルトランス
    フェラーゼ活性を発現する領域 で示されるコスミドベクターpDcos Apr/ori/gpt/TKであ
    るcosを2個有し、2種類の制限酵素で切ることによっ
    て、それぞれcosを1個づつ持った長さがほぼ等しい右
    腕と左腕とが等モルできるようにしたことを特徴とする
    新規コスミドベクター。
  2. 【請求項2】コスミドベクター由来の遺伝子画分の挿入
    を判定するための薬剤耐性、もしくは特定の生理機能を
    発現せしめる遺伝子配列を含有する特許請求の範囲第1
    項記載の新規コスミドベクター。
  3. 【請求項3】薬剤耐性としてアンピシリン耐性、テトラ
    サイクリン耐性、ネオマイシン耐性もしくはクロラムフ
    エニコール耐性を発現せしめる遺伝子配列を有する特許
    請求の範囲第2項記載の新規コスミドベクター。
  4. 【請求項4】特定の生理機能として、アミノグリコシド
    3′−ホスホトランスフエラーゼ(neo)活性、チミジ
    ンキナーゼ(TK)活性、アデニンホスホリボシルトラン
    スフエラーゼ(APRT)活性、ヒポキサンチングアニンホ
    スホリボシルトランスフエラーゼ(HGPRT)活性、キサ
    ンチングアニンホスホリボシルトランスフエラーゼ(XG
    PRT又はgpt)活性、もしくはジヒドロ葉酸リダクターゼ
    (dhfr)活性を発現せしめる遺伝子配列を有する特許請
    求の範囲第2項記載の新規コスミドベクター。
  5. 【請求項5】Col EI由来の複製機能を有する遺伝子画分
    を含有する特許請求の範囲第2項記載の新規コスミドベ
    クター。
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