JPH0916628A - 生化学情報処理装置及び生化学情報処理方法 - Google Patents

生化学情報処理装置及び生化学情報処理方法

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JPH0916628A
JPH0916628A JP8108265A JP10826596A JPH0916628A JP H0916628 A JPH0916628 A JP H0916628A JP 8108265 A JP8108265 A JP 8108265A JP 10826596 A JP10826596 A JP 10826596A JP H0916628 A JPH0916628 A JP H0916628A
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JP
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compound
data
enzyme
receptor
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JP8108265A
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Inventor
Atsushi Tomonaga
惇 朝永
Fumio Tamura
文男 田村
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Kureha Corp
Original Assignee
Kureha Corp
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Abstract

(57)【要約】 【課題】 本発明は、効率的に受容体についての情報が
得られる生化学情報処理装置を提供することを目的とす
る。 【解決手段】 化合物情報ファイル（３１）に格納され
た一覧表が参照され、正準化データに対応する化合物番
号が読み出される。次に、この化合物番号に基づいて、
相互関連情報ファイル（３３）が参照され、この化合物
が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体番号が読み出
される。さらに、この受容体番号に基づいて、受容体情
報ファイル（３６）が参照され、この受容体についての
付加情報が読み出される。そして、そのように読み出さ
れた受容体についての付加情報が表示手段に表示され
る。このように、化合物情報ファイル（３１）、受容体
情報ファイル（３６）、及び相互関連情報ファイル（３
３）を相互に参照することにより、化合物の構造を示す
正準化データをキーとした場合でも、この化合物が作動
物質あるいは拮抗物質となる受容体についての各種情報
を効率的に獲得することができる。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】
【産業上の利用分野】本発明は、生化学分野の情報処理
を行う処理装置及び処理方法に関し、特に、生体関連化
合物の反応経路の検索、及びこの反応経路の連続的表示
を行うと共に、生体関連物質に関する情報を得ることの
できる処理装置及び処理方法に関する。
【０００２】
【従来の技術】従来より、化合物情報を収載した化合物
データベースシステム、及び化合物の反応情報を収載し
た反応データベースシステムが開発されている。化合物
データベースシステムには、既存の化合物の物性や作用
などの化合物情報が収載されており、化合物の構造をキ
ーとして化合物情報にアクセスするものである。この化
合物データベースを用いれば、化合物の特性や作用を効
率良く参照することができる。また、反応データベース
システムには、既存の化合物の反応情報が収載されてお
り、化合物の構造をキーとして反応情報にアクセスする
ものである。この反応データベースシステムを用いれ
ば、合成化学の研究者が化合物の新規合成を行う際に、
既存の化合物の反応情報の中から類似する反応情報を効
率良く参照することができ、合成化学の研究では必須で
ある。
【０００３】なお、化合物データベースには、例えば、
米国ＭＤＬ社の化合物管理システム“ＭＡＣＣＳ”があ
る。また、反応データベースシステムには、例えば、米
国ＭＤＬ社の総合化学情報管理システム“ＩＳＩＳ”
や、反応情報管理システム“ＲＥＡＣＣＳ”がある。
【０００４】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、従来の
化合物／反応データベースシステムには、化合物と酵素
との関係及び生体関連物質に関する情報が、統合的に収
載されたものが存在しない。このため、化合物の構造を
キーとしたのでは、酵素についての情報、あるいは、酵
素・基質・生成物に関連した生化学情報を効率的に得る
ことができなかった。また、従来の化合物／反応データ
ベースシステムには、複数の化合物の反応経路が統合的
に構築されたものが存在しない。このため、効率的に複
数の化合物がかかわる反応経路を検索することができな
かった。
【０００５】さらに、従来の化合物／反応データベース
システムには、生体機能の調節や生体内での情報伝達の
ために存在する受容体に関する情報、及び生体関連物質
（作動物質・拮抗物質）に関する情報が、総合的に収載
されたものが存在しない。このため、効率的に受容体・
作動物質・拮抗物質に関連した生化学情報を得ることが
できなかった。
【０００６】本発明は、このような問題を解決し、化合
物構造をキーとした場合でも、酵素についての情報、あ
るいは、酵素・基質・生成物に関連した生化学情報を効
率的に得ることのできる生化学情報処理装置、及び生化
学情報処理方法を提供することを目的とする。また、複
数の化合物が関わる反応経路を効率的に検索することが
できる生化学情報処理装置、及び生化学情報処理方法を
提供することを目的とする。さらに、受容体・作動物質
・拮抗物質に関連した生化学情報を効率的に得ることが
できる生化学情報処理装置、及び生化学情報処理方法を
提供することを目的とする。
【０００７】
【課題を解決するための手段】上記課題を解決するため
に、本発明の第１の生化学情報処理装置は、化合物、酵
素及び受容体についての生化学情報が記憶された記憶手
段と、生化学情報を表す画像データまたは生化学情報を
表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、基質お
よび／または生成物である化合物についてのデータが入
力手段で受け付けられた場合に、このデータに基づいて
化合物の関わる化学反応式を検出する反応式検出手段
と、化合物についてのデータが入力手段で受け付けられ
た場合に、このデータに基づいて化合物が作動物質およ
び／または拮抗物質となる受容体についての付加情報を
検出する受容体情報検出手段と、少なくとも化学反応式
の反応式図を表示する表示手段とを備える処理装置であ
って、記憶手段は、化合物の番号と化合物に対応する正
準化データとの関係を示す一覧表、及び化合物について
の付加情報が格納された化合物情報ファイルと、酵素の
番号と酵素の基質である化合物の番号と酵素による生成
物である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び酵素
についての付加情報が格納された酵素情報ファイルと、
受容体の番号と受容体の作動物質および／または拮抗物
質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び受容
体についての付加情報が格納された受容体情報ファイル
と、少なくとも、化合物の番号と化合物が基質となる酵
素の番号と化合物が生成物となる酵素の番号と化合物が
作動物質となる受容体の番号と化合物が拮抗物質となる
受容体の番号との関係を示す一覧表が格納された相互関
連情報ファイルとを備え、反応式検出手段は、入力手段
で受け付けられた化合物についてのデータから化合物の
化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さらに
この正準化データに基づいて化合物情報ファイルを検索
して、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場
合に、正準化データに対応する化合物の番号を読み出す
第１の処理部と、第１の処理部で読み出された化合物の
番号に基づいて、化合物が基質あるいは生成物となる酵
素の番号を相互関連情報ファイルから読み出す第２の処
理部と、第２の処理部で読み出された番号の酵素と前記
化合物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び
前記酵素についての付加情報を酵素情報ファイルから読
み出す第３の処理部と、第１の処理部で読み出された化
合物の番号と、第２の処理部で読み出された酵素の番号
と、前記第３の処理部で読み出された他の化合物の番号
とから、前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式
図を表示手段に表示し、さらに、第３の処理部で読み出
された酵素についての付加情報を表示手段に表示する第
４の処理部とを備え、受容体情報検出手段は、入力手段
で受け付けられた化合物についてのデータから化合物の
化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さらに
この正準化データに基づいて化合物情報ファイルを検索
して、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場
合に、正準化データに対応する化合物の番号を読み出す
第５の処理部と、第５の処理部で読み出された化合物の
番号に基づいて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質と
なる受容体の番号を相互関連情報ファイルから読み出す
第６の処理部と、第６の処理部で読み出された番号の受
容体についての少なくとも付加情報を受容体情報ファイ
ルから読み出す第７の処理部と、第７の処理部で読み出
された受容体についての少なくとも付加情報を表示手段
に表示する第８の処理部とを備えている。
【０００８】また、本発明の第２の生化学情報処理装置
は、化合物、酵素及び受容体についての生化学情報が記
憶された記憶手段と、生化学情報を表す画像データまた
は生化学情報を表す記号データの入力を受け付ける入力
手段と、基質および／または生成物である化合物につい
てのデータが入力手段で受け付けられた場合に、このデ
ータに基づいて化合物の関わる化学反応式を検出する反
応式検出手段と、化合物についてのデータが入力手段で
受け付けられた場合に、このデータに基づいて化合物が
作動物質および／または拮抗物質となる受容体について
の付加情報を検出する受容体情報検出手段と、反応経路
を構成する複数の化合物の中から選択される所定の化合
物についてのデータが入力手段で受け付けられた場合
に、このデータに基づいて複数の化合物の反応経路を検
出する反応経路検出手段と、少なくとも化学反応式の反
応式図を表示する表示手段とを備える処理装置であっ
て、記憶手段は、化合物の番号と化合物に対応する正準
化データとの関係を示す一覧表、及び化合物についての
付加情報が格納された化合物情報ファイルと、酵素の番
号と酵素の基質である化合物の番号と酵素による生成物
である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び酵素に
ついての付加情報が格納された酵素情報ファイルと、受
容体の番号と受容体の作動物質および／または拮抗物質
である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び受容体
についての付加情報が格納された受容体情報ファイル
と、少なくとも、化合物の番号と化合物が基質となる酵
素の番号と化合物が生成物となる酵素の番号と化合物が
作動物質となる受容体の番号と化合物が拮抗物質となる
受容体の番号との関係を示す一覧表が格納された相互関
連情報ファイルとを備え、反応式検出手段は、入力手段
で受け付けられた化合物についてのデータから化合物の
化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さらに
正準化データに基づいて化合物情報ファイルを検索し
て、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場合
に、正準化データに対応する化合物の番号を読み出す第
１の処理部と、第１の処理部で読み出された化合物の番
号に基づいて、化合物が基質あるいは生成物となる酵素
の番号を相互関連情報ファイルから読み出す第２の処理
部と、第２の処理部で読み出された番号の酵素と前記化
合物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前
記酵素についての付加情報を酵素情報ファイルから読み
出す第３の処理部と、第１の処理部で読み出された化合
物の番号と、第２の処理部で読み出された酵素の番号
と、前記第３の処理部で読み出された他の化合物の番号
とから、前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式
図を表示手段に表示し、さらに、第３の処理部で読み出
された酵素についての付加情報を表示手段に表示する第
４の処理部とを備え、受容体情報検出手段は、入力手段
で受け付けられた化合物についてのデータから化合物の
化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さらに
この正準化データに基づいて化合物情報ファイルを検索
して、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場
合に、正準化データに対応する化合物の番号を読み出す
第５の処理部と、第５の処理部で読み出された化合物の
番号に基づいて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質と
なる受容体の番号を相互関連情報ファイルから読み出す
第６の処理部と、第６の処理部で読み出された番号の受
容体についての少なくとも付加情報を受容体情報ファイ
ルから読み出す第７の処理部と、第７の処理部で読み出
された受容体についての少なくとも付加情報を表示手段
に表示する第８の処理部とを備え、反応経路検出手段
は、入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
から化合物の化学構造を一意的に示す正準化データを作
成し、さらにこの正準化データに基づいて化合物情報フ
ァイルを検索して、正準化データが化合物情報ファイル
に存在する場合に、正準化データに対応する化合物の番
号を読み出す第９の処理部と、第９の処理部で読み出さ
れた化合物の番号に基づいて、この化合物を基質とする
酵素の番号とこの化合物を生成物とする酵素の番号とを
相互関連情報ファイルから読み出す第１０の処理部と、
第１０の処理部で読み出された酵素の番号に基づいて、
この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素による生
成物である化合物の番号を酵素情報ファイルから読み出
す第１１の処理部と、第１０の処理部による処理と第１
１の処理部による処理とを繰り返し、所定反応経路内の
化合物及び酵素を検索する第１２の処理部と、第１０の
処理部で読み出された酵素の番号と、第１１の処理部で
読み出された化合物の番号とから、これらの化合物の反
応式図を反応経路に沿って表示手段に表示する第１３の
処理部とを備えている。
【０００９】また、本発明の第３の生化学情報処理装置
は、化合物、酵素及び受容体についての生化学情報が記
憶された記憶手段と、生化学情報を表す画像データまた
は生化学情報を表す記号データの入力を受け付ける入力
手段と、化合物についてのデータが入力手段で受け付け
られた場合に、このデータに基づいて化合物が作動物質
および／または拮抗物質となる受容体についての付加情
報を検出する受容体情報検出手段と、反応経路を構成す
る複数の化合物の中から選択される所定の化合物につい
てのデータが入力手段で受け付けられた場合に、このデ
ータに基づいて複数の化合物の反応経路を検出する反応
経路検出手段と、少なくとも化学反応式の反応式図を表
示する表示手段とを備える処理装置であって、記憶手段
は、化合物の番号と化合物に対応する正準化データとの
関係を示す一覧表、及び化合物についての付加情報が格
納された化合物情報ファイルと、酵素の番号と酵素の基
質である化合物の番号と酵素による生成物である化合物
の番号との関係を示す一覧表、及び酵素についての付加
情報が格納された酵素情報ファイルと、受容体の番号と
受容体の作動物質および／または拮抗物質である化合物
の番号との関係を示す一覧表、及び受容体についての付
加情報が格納された受容体情報ファイルと、少なくと
も、化合物の番号と化合物が基質となる酵素の番号と化
合物が生成物となる酵素の番号と化合物が作動物質とな
る受容体の番号と化合物が拮抗物質となる受容体の番号
との関係を示す一覧表が格納された相互関連情報ファイ
ルとを備え、受容体情報検出手段は、入力手段で受け付
けられた化合物についてのデータから化合物の化学構造
を一意的に示す正準化データを作成し、さらにこの正準
化データに基づいて化合物情報ファイルを検索して、正
準化データが化合物情報ファイルに存在する場合に、正
準化データに対応する化合物の番号を読み出す第５の処
理部と、第５の処理部で読み出された化合物の番号に基
づいて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容
体の番号を相互関連情報ファイルから読み出す第６の処
理部と、第６の処理部で読み出された番号の受容体につ
いての少なくとも付加情報を受容体情報ファイルから読
み出す第７の処理部と、第７の処理部で読み出された受
容体についての少なくとも付加情報を表示手段に表示す
る第８の処理部とを備え、反応経路検出手段は、入力手
段で受け付けられた化合物についてのデータから化合物
の化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さら
にこの正準化データに基づいて化合物情報ファイルを検
索して、正準化データが化合物情報ファイルに存在する
場合に、正準化データに対応する化合物の番号を読み出
す第９の処理部と、第９の処理部で読み出された化合物
の番号に基づいて、この化合物を基質とする酵素の番号
とこの化合物を生成物とする酵素の番号とを相互関連情
報ファイルから読み出す第１０の処理部と、第１０の処
理部で読み出された酵素の番号に基づいて、この酵素の
基質である化合物の番号とこの酵素による生成物である
化合物の番号を酵素情報ファイルから読み出す第１１の
処理部と、第１０の処理部による処理と第１１の処理部
による処理とを繰り返し、所定反応経路内の化合物及び
酵素を検索する第１２の処理部と、第１０の処理部で読
み出された酵素の番号と、第１１の処理部で読み出され
た化合物の番号とから、これらの化合物の反応式図を反
応経路に沿って表示手段に表示する第１３の処理部とを
備えている。
【００１０】更に、本発明の生化学情報処理装置におい
ては、前記入力手段が、化合物を構成する各原子につい
ての固有データ及び原子間の結合対データの入力を受け
付けるものであり；前記生化学情報処理装置が、前記入
力手段で受け付けられた各データに基づいて、前記化合
物の化学構造を一意的に特定できる正準化データを作成
する以下の正準化データ作成手段を更に備えていること
が好ましい。すなわち、前記正準化データ作成手段は、
前記入力手段で受け付けられた各データに基づいて、各
原子を等価原子ごとに別のクラスに分類して、クラスご
とに異なるクラス番号を各原子に与える構成原子分類処
理部と、前記構成原子分類処理部で各原子に与えられた
クラス番号に基づいて、前記化合物の構造と一意的に対
応した正準化番号を各原子に与える正準化番号付与処理
部と、前記正準化番号付与処理部で各原子に与えられた
正準化番号に基づいて、前記正準化データを作成する正
準化データ作成処理部とを備える。
【００１１】このような構成を有する本発明にかかる正
準化データ作成手段によれば、入力手段で受け付けられ
た各原子についての固有データ及び原子間の結合対デー
タは正準化データ作成手段に与えられる。そして、正準
化データ作成手段では、これらのデータに基づいて正準
化データが作成される。
【００１２】即ち、正準化データ作成手段では、まず、
構成原子分類処理部の処理を実行し、各原子についての
固有データ及び原子間の結合対データに基づいて、各原
子を等価原子ごとに別のクラスに分類する。そして、ク
ラスごとに異なるクラス番号を各原子に与える。次に、
正準化番号付与処理部の処理を実行し、各原子に与えら
れたクラス番号及び原子間の結合対データに基づいて、
化合物の構造と一意的に対応した正準化番号を各原子に
与える。さらに、正準化データ作成処理部の処理を実行
し、各原子に与えられた正準化番号及び各原子について
の固有データに基づいて正準化データを作成する。
【００１３】ここで、前記構成原子分類処理部は、各原
子に３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）を与え、これら
の属性が一つでも異なる原子は非等価であると判定でき
ることを利用して、各原子を等価原子毎に異なるクラス
番号を付与しており、前記３種類の属性（ａi ，ｂij，
ｄij）の中で、ａi は入力番号ｉの原子の種類番号であ
り、ｂijは入力番号ｉの原子に隣接する結合のうち、そ
の種類番号がｊである結合の数であり、ｄijは入力番号
ｉの原子から最短経路によりｊ個の結合を経て巡れる道
筋の数であり；前記正準化番号付与処理部は、正準化番
号を１から昇順に各原子に与える過程において、前記ク
ラス番号の優先順位が最高である原子に正準化番号１を
与え、以降正準化番号ｎまでが付与されている時、既に
正準化番号が与えられている原子でかつ未だ正準化番号
が与えられていない原子が結合している原子の中で正準
化番号が最小である原子を選び、その原子に結合してい
る未だ正準化番号が与えられていない原子の中で前記ク
ラス番号の優先順位が最高である原子に正準化番号ｎ＋
１を与えており；前記正準化データ作成処理部は、各原
子に３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）を与えて、これ
らの属性を一列に並べることによって前記正準化データ
を作成しており、前記３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓ
i ）の中で、Ｐi は正準化番号ｉの原子に結合し且つ正
準化番号が最小の原子の正準化番号であり、Ｔi は正準
化番号ｉの原子と正準化番号Ｐi の原子との結合の種類
記号であり、Ｓi は正準化番号ｉの原子の種類記号であ
ることが好ましい。
【００１４】本発明の第１の生化学情報処理方法は、化
合物、酵素及び受容体についての生化学情報が記憶され
た記憶手段と、生化学情報を表す画像データまたは生化
学情報を表す記号データの入力を受け付ける入力手段
と、少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手
段とを備える情報処理装置を用いた処理方法であって、
記憶手段は、化合物の番号と化合物に対応する正準化デ
ータとの関係を示す一覧表、及び化合物についての付加
情報が格納された化合物情報ファイルと、酵素の番号と
酵素の基質である化合物の番号と酵素による生成物であ
る化合物の番号との関係を示す一覧表、及び酵素につい
ての付加情報が格納された酵素情報ファイルと、受容体
の番号と受容体の作動物質および／または拮抗物質であ
る化合物の番号との関係を示す一覧表、及び受容体につ
いての付加情報が格納された受容体情報ファイルと、少
なくとも、化合物の番号と化合物が基質となる酵素の番
号と化合物が生成物となる酵素の番号と化合物が作動物
質となる受容体の番号と化合物が拮抗物質となる受容体
の番号との関係を示す一覧表が格納された相互関連情報
ファイルとを備え、基質および／または生成物である化
合物についてのデータが入力手段で受け付けられた場合
に、このデータから化合物の化学構造を一意的に示す正
準化データを作成し、さらにこの正準化データに基づい
て化合物情報ファイルを検索して、正準化データが化合
物情報ファイルに存在する場合に、正準化データに対応
する化合物の番号を読み出す第１のステップと、第１の
ステップで読み出された化合物の番号に基づいて、この
化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番号を相互関
連情報ファイルから読み出す第２のステップと、第２の
ステップで読み出された番号の酵素と前記化合物と共に
反応系を構成する他の化合物の番号、及び前記酵素につ
いての付加情報を、酵素情報ファイルから読み出す第３
のステップと、第１のステップで読み出された化合物の
番号と、第２のステップで読み出された酵素の番号と、
前記第３のステップで読み出された他の化合物の番号と
から、前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式図
を表示手段に表示し、さらに、第３のステップで読み出
された酵素についての付加情報を表示手段に表示する第
４のステップと、化合物についてのデータが入力手段で
受け付けられた場合に、このデータから化合物の化学構
造を一意的に示す正準化データを作成し、さらにこの正
準化データに基づいて化合物情報ファイルを検索して、
正準化データが化合物情報ファイルに存在する場合に、
正準化データに対応する化合物の番号を読み出す第５の
ステップと、第５のステップで読み出された化合物の番
号に基づいて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質とな
る受容体の番号を相互関連情報ファイルから読み出す第
６のステップと、第６のステップで読み出された番号の
受容体についての少なくとも付加情報を受容体情報ファ
イルから読み出す第７のステップと、第７のステップで
読み出された受容体についての少なくとも付加情報を表
示手段に表示する第８のステップとを備えている。
【００１５】また、本発明の第２の生化学情報処理方法
は、化合物、酵素及び受容体についての生化学情報が記
憶された記憶手段と、生化学情報を表す画像データまた
は生化学情報を表す記号データの入力を受け付ける入力
手段と、少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表
示手段とを備える情報処理装置を用いた処理方法であっ
て、記憶手段は、化合物の番号と化合物に対応する正準
化データとの関係を示す一覧表、及び化合物についての
付加情報が格納された化合物情報ファイルと、酵素の番
号と酵素の基質である化合物の番号と酵素による生成物
である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び酵素に
ついての付加情報が格納された酵素情報ファイルと、受
容体の番号と受容体の作動物質および／または拮抗物質
である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び受容体
についての付加情報が格納された受容体情報ファイル
と、少なくとも、化合物の番号と化合物が基質となる酵
素の番号と化合物が生成物となる酵素の番号と化合物が
作動物質となる受容体の番号と化合物が拮抗物質となる
受容体の番号との関係を示す一覧表が格納された相互関
連情報ファイルとを備え、基質および／または生成物で
ある化合物についてのデータが入力手段で受け付けられ
た場合に、このデータから化合物の化学構造を一意的に
示す正準化データを作成し、さらにこの正準化データに
基づいて化合物情報ファイルを検索して、正準化データ
が化合物情報ファイルに存在する場合に、正準化データ
に対応する化合物の番号を読み出す第１のステップと、
第１のステップで読み出された化合物の番号に基づい
て、この化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番号
を相互関連情報ファイルから読み出す第２のステップ
と、第２のステップで読み出された番号の酵素と前記化
合物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前
記酵素についての付加情報を、酵素情報ファイルから読
み出す第３のステップと、第１のステップで読み出され
た化合物の番号と、第２のステップで読み出された酵素
の番号と、前記第３のステップで読み出された他の化合
物の番号とから、前記入力手段で受け付けられた化合物
の反応式図を表示手段に表示し、さらに、第３のステッ
プで読み出された酵素についての付加情報を表示手段に
表示する第４のステップと、化合物についてのデータが
入力手段で受け付けられた場合に、このデータから化合
物の化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さ
らにこの正準化データに基づいて化合物情報ファイルを
検索して、正準化データが化合物情報ファイルに存在す
る場合に、正準化データに対応する化合物の番号を読み
出す第５のステップと、第５のステップで読み出された
化合物の番号に基づいて、化合物が作動物質あるいは拮
抗物質となる受容体の番号を相互関連情報ファイルから
読み出す第６のステップと、第６のステップで読み出さ
れた番号の受容体についての少なくとも付加情報を受容
体情報ファイルから読み出す第７のステップと、第７の
ステップで読み出された受容体についての少なくとも付
加情報を表示手段に表示する第８のステップと、反応経
路を構成する複数の化合物の中から選択される所定の化
合物についてのデータが入力手段で受け付けられた場合
に、このデータから化合物の化学構造を一意的に示す正
準化データを作成し、さらにこの正準化データに基づい
て化合物情報ファイルを検索して、正準化データが化合
物情報ファイルに存在する場合に、正準化データに対応
する化合物の番号を読み出す第９のステップと、第９の
ステップで読み出された化合物の番号に基づいて、この
化合物を基質とする酵素の番号とこの化合物を生成物と
する酵素の番号とを相互関連情報ファイルから読み出す
第１０のステップと、第１０のステップで読み出された
酵素の番号に基づいて、この酵素の基質である化合物の
番号とこの酵素による生成物である化合物の番号を酵素
情報ファイルから読み出す第１１のステップと、第１０
のステップと第１１のステップとを繰り返し、所定反応
経路内の化合物及び酵素を検索する第１２のステップ
と、第１０のステップで読み出された酵素の番号と、第
１１のステップで読み出された化合物の番号とから、こ
れらの化合物の反応式図を反応経路に沿って表示手段に
表示する第１３のステップとを備えている。
【００１６】また、本発明の第３の生化学情報処理方法
は、化合物、酵素及び受容体についての生化学情報が記
憶された記憶手段と、生化学情報を表す画像データまた
は生化学情報を表す記号データの入力を受け付ける入力
手段と、少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表
示手段とを備える情報処理装置を用いた処理方法であっ
て、記憶手段は、化合物の番号と化合物に対応する正準
化データとの関係を示す一覧表、及び化合物についての
付加情報が格納された化合物情報ファイルと、酵素の番
号と酵素の基質である化合物の番号と酵素による生成物
である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び酵素に
ついての付加情報が格納された酵素情報ファイルと、受
容体の番号と受容体の作動物質および／または拮抗物質
である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び受容体
についての付加情報が格納された受容体情報ファイル
と、少なくとも、化合物の番号と化合物が基質となる酵
素の番号と化合物が生成物となる酵素の番号と化合物が
作動物質となる受容体の番号と化合物が拮抗物質となる
受容体の番号との関係を示す一覧表が格納された相互関
連情報ファイルとを備え、化合物についてのデータが入
力手段で受け付けられた場合に、このデータから化合物
の化学構造を一意的に示す正準化データを作成し、さら
にこの正準化データに基づいて化合物情報ファイルを検
索して、正準化データが化合物情報ファイルに存在する
場合に、正準化データに対応する化合物の番号を読み出
す第５のステップと、第５のステップで読み出された化
合物の番号に基づいて、化合物が作動物質あるいは拮抗
物質となる受容体の番号を相互関連情報ファイルから読
み出す第６のステップと、第６のステップで読み出され
た番号の受容体についての少なくとも付加情報を受容体
情報ファイルから読み出す第７のステップと、第７のス
テップで読み出された受容体についての少なくとも付加
情報を表示手段に表示する第８のステップと、反応経路
を構成する複数の化合物の中から選択される所定の化合
物についてのデータが入力手段で受け付けられた場合
に、このデータから化合物の化学構造を一意的に示す正
準化データを作成し、さらにこの正準化データに基づい
て化合物情報ファイルを検索して、正準化データが化合
物情報ファイルに存在する場合に、正準化データに対応
する化合物の番号を読み出す第９のステップと、第９の
ステップで読み出された化合物の番号に基づいて、この
化合物を基質とする酵素の番号とこの化合物を生成物と
する酵素の番号とを相互関連情報ファイルから読み出す
第１０のステップと、第１０のステップで読み出された
酵素の番号に基づいて、この酵素の基質である化合物の
番号とこの酵素による生成物である化合物の番号を酵素
情報ファイルから読み出す第１１のステップと、第１０
のステップと第１１のステップとを繰り返し、所定反応
経路内の化合物及び酵素を検索する第１２のステップ
と、第１０のステップで読み出された酵素の番号と、第
１１のステップで読み出された化合物の番号とから、こ
れらの化合物の反応式図を反応経路に沿って表示手段に
表示する第１３のステップとを備えている。
【００１７】更に、本発明の生化学情報処理方法におい
ては、前記入力手段が、化合物を構成する各原子につい
ての固有データ及び原子間の結合対データの入力を受け
付け；前記生化学情報処理方法が、前記入力手段で受け
付けられた各データに基づいて、各原子を等価原子ごと
に別のクラスに分類して、クラスごとに異なるクラス番
号を各原子に与える構成原子分類ステップと、前記構成
原子分類ステップで各原子に与えられたクラス番号に基
づいて、前記化合物の構造と一意的に対応した正準化番
号を各原子に与える正準化番号付与ステップと、前記正
準化番号付与ステップで各原子に与えられた正準化番号
に基づいて、前記化合物の化学構造を一意的に特定でき
る正準化データを作成する正準化データ作成ステップと
を更に備えていることが好ましい。
【００１８】このような構成を有する本発明にかかる正
準化データを作成するための諸ステップによれば、入力
手段で受け付けられた各原子についての固有データ及び
原子間の結合対データに基づいて正準化データが作成さ
れる。
【００１９】即ち、まず、構成原子分類ステップにおい
て、各原子についての固有データ及び原子間の結合対デ
ータに基づいて、各原子を等価原子ごとに別のクラスに
分類する。そして、クラスごとに異なるクラス番号を各
原子に与える。次に、正準化番号付与ステップにおい
て、各原子に与えられたクラス番号及び原子間の結合対
データに基づいて、化合物の構造と一意的に対応した正
準化番号を各原子に与える。さらに、正準化データ作成
ステップにおいて、各原子に与えられた正準化番号及び
各原子についての固有データに基づいて正準化データを
作成する。
【００２０】ここで、前記構成原子分類ステップは、各
原子に３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）を与え、これ
らの属性が一つでも異なる原子は非等価であると判定で
きることを利用して、各原子を等価原子毎に異なるクラ
ス番号を付与しており、前記３種類の属性（ａi ，
ｂij，ｄij）の中で、ａi は入力番号ｉの原子の種類番
号であり、ｂijは入力番号ｉの原子に隣接する結合のう
ち、その種類番号がｊである結合の数であり、ｄijは入
力番号ｉの原子から最短経路によりｊ個の結合を経て巡
れる道筋の数であり；前記正準化番号付与ステップは、
正準化番号を１から昇順に各原子に与える過程におい
て、前記クラス番号の優先順位が最高である原子に正準
化番号１を与え、以降正準化番号ｎまでが付与されてい
る時、既に正準化番号が与えられている原子でかつ未だ
正準化番号が与えられていない原子が結合している原子
の中で正準化番号が最小である原子を選び、その原子に
結合している未だ正準化番号が与えられていない原子の
中で前記クラス番号の優先順位が最高である原子に正準
化番号ｎ＋１を与えており；前記正準化データ作成ステ
ップは、各原子に３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）を
与えて、これらの属性を一列に並べることによって前記
正準化データを作成しており、前記３種類の属性（Ｐ
i ，Ｔi ，Ｓi ）の中で、Ｐi は正準化番号ｉの原子に
結合し且つ正準化番号が最小の原子の正準化番号であ
り、Ｔi は正準化番号ｉの原子と正準化番号Ｐi の原子
との結合の種類記号であり、Ｓi は正準化番号ｉの原子
の種類記号であることが好ましい。
【００２１】
【作用】本発明の第１の生化学情報処理装置によれば、
入力手段で受け付けられた化合物についてのデータが第
１の処理部に与えられると、このデータから正準化デー
タが作成される。そして、作成された正準化データに基
づいて化合物情報ファイルが検索され、正準化データが
化合物情報ファイルに存在する場合には、正準化データ
に対応する化合物の番号が読み出される。第１の処理部
で読み出された化合物の番号は第２の処理部に与えら
れ、第２の処理部では、この化合物が基質あるいは生成
物となる酵素の番号が相互関連情報ファイルから読み出
される。
【００２２】第２の処理部で読み出された酵素の番号は
第３の処理部に与えられ、第３の処理部では、この酵素
と前記化合物と共に反応系を構成する他の化合物の番
号、及び前記酵素についての付加情報が酵素情報ファイ
ルから読み出される。そして、第１の処理部で読み出さ
れた化合物の番号と、第２の処理部で読み出された酵素
の番号と、前記第３の処理部で読み出された他の化合物
の番号とが第４の処理部に与えられ、第４の処理部で
は、前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式図を
表示手段に表示させる。同様に、第３の処理部で読み出
された酵素についての付加情報も表示手段に表示させ
る。
【００２３】また、入力手段で受け付けられた化合物に
ついてのデータが第５の処理部に与えられると、このデ
ータから正準化データが作成される。そして、作成され
た正準化データに基づいて化合物情報ファイルが検索さ
れ、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場合
には、正準化データに対応する化合物の番号が読み出さ
れる。第５の処理部で読み出された化合物の番号は第６
の処理部に与えられ、第６の処理部では、この化合物が
作動物質あるいは拮抗物質となる受容体の番号が相互関
連情報ファイルから読み出される。第６の処理部で読み
出された受容体の番号は第７の処理部に与えられ、第７
の処理部では、この受容体についての少なくとも付加情
報が受容体情報ファイルから読み出される。そして、第
７の処理部で読み出された受容体についての少なくとも
付加情報が第８の処理部に与えられ、第８の処理部で
は、この受容体についての少なくとも付加情報を表示手
段に表示させる。
【００２４】本発明の第２の生化学情報処理装置によれ
ば、入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
が第１の処理部に与えられると、このデータから正準化
データが作成される。そして、作成された正準化データ
に基づいて化合物情報ファイルが検索され、正準化デー
タが化合物情報ファイルに存在する場合には、正準化デ
ータに対応する化合物の番号が読み出される。第１の処
理部で読み出された化合物の番号は第２の処理部に与え
られ、第２の処理部では、この化合物が基質あるいは生
成物となる酵素の番号が相互関連情報ファイルから読み
出される。
【００２５】第２の処理部で読み出された酵素の番号は
第３の処理部に与えられ、第３の処理部では、この酵素
と前記化合物と共に反応系を構成する他の化合物の番
号、及び前記酵素についての付加情報が酵素情報ファイ
ルから読み出される。そして、第１の処理部で読み出さ
れた化合物の番号と、第２の処理部で読み出された酵素
の番号と、前記第３の処理部で読み出された他の化合物
の番号とが第４の処理部に与えられ、第４の処理部で
は、前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式図を
表示手段に表示させる。同様に、第３の処理部で読み出
された酵素についての付加情報も表示手段に表示させ
る。
【００２６】また、入力手段で受け付けられた化合物に
ついてのデータが第５の処理部に与えられると、このデ
ータから正準化データが作成される。そして、作成され
た正準化データに基づいて化合物情報ファイルが検索さ
れ、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場合
には、正準化データに対応する化合物の番号が読み出さ
れる。第５の処理部で読み出された化合物の番号は第６
の処理部に与えられ、第６の処理部では、この化合物が
作動物質あるいは拮抗物質となる受容体の番号が相互関
連情報ファイルから読み出される。第６の処理部で読み
出された受容体の番号は第７の処理部に与えられ、第７
の処理部では、この受容体についての少なくとも付加情
報が受容体情報ファイルから読み出される。そして、第
７の処理部で読み出された受容体についての少なくとも
付加情報が第８の処理部に与えられ、第８の処理部で
は、この受容体についての少なくとも付加情報を表示手
段に表示させる。
【００２７】さらに、入力手段で受け付けられた化合物
についてのデータが第９の処理部に与えられると、この
データから正準化データが作成される。そして、作成さ
れた正準化データに基づいて化合物情報ファイルが検索
され、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場
合には、正準化データに対応する化合物の番号が読み出
される。第９の処理部で読み出された化合物の番号は第
１０の処理部に与えられ、第１０の処理部では、この化
合物を基質とする酵素の番号とこの化合物を生成物とす
る酵素の番号とが、相互関連情報ファイルから読み出さ
れる。
【００２８】第１０の処理部で読み出された酵素の番号
は第１１の処理部に与えられ、第１１の処理部では、こ
の酵素について、基質である化合物の番号とこの酵素に
よる生成物である化合物の番号とが、酵素情報ファイル
から読み出される。第１０の処理部と第１１の処理部の
各処理は、第１２の処理部によって繰り返される。
【００２９】そして、第１０の処理部で読み出された酵
素の番号と、第１１の処理部で読み出された化合物の番
号とは第１３の処理部に与えられ、第１３の処理部で
は、これらの化合物の反応式図を所定の反応経路に沿っ
て表示手段に表示させる。
【００３０】本発明の第３の生化学情報処理装置によれ
ば、入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
が第５の処理部に与えられると、このデータから正準化
データが作成される。そして、作成された正準化データ
に基づいて化合物情報ファイルが検索され、正準化デー
タが化合物情報ファイルに存在する場合には、正準化デ
ータに対応する化合物の番号が読み出される。第５の処
理部で読み出された化合物の番号は第６の処理部に与え
られ、第６の処理部では、この化合物が作動物質あるい
は拮抗物質となる受容体の番号が相互関連情報ファイル
から読み出される。第６の処理部で読み出された受容体
の番号は第７の処理部に与えられ、第７の処理部では、
この受容体についての少なくとも付加情報が受容体情報
ファイルから読み出される。そして、第７の処理部で読
み出された受容体についての少なくとも付加情報が第８
の処理部に与えられ、第８の処理部では、この受容体に
ついての少なくとも付加情報を表示手段に表示させる。
【００３１】さらに、入力手段で受け付けられた化合物
についてのデータが第９の処理部に与えられると、この
データから正準化データが作成される。そして、作成さ
れた正準化データに基づいて化合物情報ファイルが検索
され、正準化データが化合物情報ファイルに存在する場
合には、正準化データに対応する化合物の番号が読み出
される。第９の処理部で読み出された化合物の番号は第
１０の処理部に与えられ、第１０の処理部では、この化
合物を基質とする酵素の番号とこの化合物を生成物とす
る酵素の番号とが、相互関連情報ファイルから読み出さ
れる。
【００３２】第１０の処理部で読み出された酵素の番号
は第１１の処理部に与えられ、第１１の処理部では、こ
の酵素について、基質である化合物の番号とこの酵素に
よる生成物である化合物の番号とが、酵素情報ファイル
から読み出される。第１０の処理部と第１１の処理部の
各処理は、第１２の処理部によって繰り返される。
【００３３】そして、第１０の処理部で読み出された酵
素の番号と、第１１の処理部で読み出された化合物の番
号とは第１３の処理部に与えられ、第１３の処理部で
は、これらの化合物の反応式図を所定の反応経路に沿っ
て表示手段に表示させる。
【００３４】本発明の第１の生化学情報処理方法によれ
ば、第１のステップから第４のステップまでの処理によ
って、反応式の検出を行うことができる。また、第５の
ステップから第８のステップまでの処理によって、受容
体情報の検出を行うことができる。
【００３５】反応式の検出は、まず、第１のステップの
処理が行われ、入力手段で受け付けられた化合物につい
てのデータから正準化データが作成される。そして、作
成された正準化データに基づいて化合物情報ファイルが
検索され、正準化データが化合物情報ファイルに存在す
る場合には、正準化データに対応する化合物の番号が読
み出される。次に、第２のステップの処理が行われ、第
１のステップで読み出された化合物の番号に基づいて、
この化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番号が、
相互関連情報ファイルから読み出される。
【００３６】さらに、第３のステップの処理が行われ、
第２のステップで読み出された番号の酵素と前記化合物
と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前記酵
素についての付加情報が酵素情報ファイルから読み出さ
れる。そして、第４のステップの処理が行われ、第１の
ステップで読み出された化合物の番号と、第２のステッ
プで読み出された酵素の番号と、前記第３のステップで
読み出された他の化合物の番号とから、前記入力手段で
受け付けられた化合物の反応式図を表示手段に表示させ
る。同様に、第３のステップで読み出された酵素につい
ての付加情報も表示手段に表示させる。
【００３７】また、受容体情報の検出は、まず、第５の
ステップの処理が行われ、入力手段で受け付けられた化
合物についてのデータから正準化データが作成される。
そして、作成された正準化データに基づいて化合物情報
ファイルが検索され、正準化データが化合物情報ファイ
ルに存在する場合には、正準化データに対応する化合物
の番号が読み出される。次に、第６のステップの処理が
行われ、第５のステップで読み出された化合物の番号に
基づいて、この化合物が作動物質あるいは拮抗物質とな
る受容体の番号が、相互関連情報ファイルから読み出さ
れる。さらに、第７のステップの処理が行われ、第６の
ステップで読み出された番号の受容体についての少なく
とも付加情報が受容体情報ファイルから読み出される。
そして、第８のステップの処理が行われ、第７のステッ
プで読み出された受容体についての少なくとも付加情報
を表示手段に表示させる。
【００３８】本発明の第２の生化学情報処理方法によれ
ば、第１のステップから第４のステップまでの処理によ
って、反応式の検出を行うことができる。また、第５の
ステップから第８のステップまでの処理によって、受容
体情報の検出を行うことができる。さらに、第９のステ
ップから第１２のステップまでの処理によって、反応経
路の検出を行うことができる。
【００３９】反応式の検出は、まず、第１のステップの
処理が行われ、入力手段で受け付けられた化合物につい
てのデータから正準化データが作成される。そして、作
成された正準化データに基づいて化合物情報ファイルが
検索され、正準化データが化合物情報ファイルに存在す
る場合には、正準化データに対応する化合物の番号が読
み出される。次に、第２のステップの処理が行われ、第
１のステップで読み出された化合物の番号に基づいて、
この化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番号が、
相互関連情報ファイルから読み出される。
【００４０】さらに、第３のステップの処理が行われ、
第２のステップで読み出された番号の酵素と前記化合物
と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前記酵
素についての付加情報が酵素情報ファイルから読み出さ
れる。そして、第４のステップの処理が行われ、第１の
ステップで読み出された化合物の番号と、第２のステッ
プで読み出された酵素の番号と、前記第３のステップで
読み出された他の化合物の番号とから、前記入力手段で
受け付けられた化合物の反応式図を表示手段に表示させ
る。同様に、第３のステップで読み出された酵素につい
ての付加情報も表示手段に表示させる。
【００４１】また、受容体情報の検出は、まず、第５の
ステップの処理が行われ、入力手段で受け付けられた化
合物についてのデータから正準化データが作成される。
そして、作成された正準化データに基づいて化合物情報
ファイルが検索され、正準化データが化合物情報ファイ
ルに存在する場合には、正準化データに対応する化合物
の番号が読み出される。次に、第６のステップの処理が
行われ、第５のステップで読み出された化合物の番号に
基づいて、この化合物が作動物質あるいは拮抗物質とな
る受容体の番号が、相互関連情報ファイルから読み出さ
れる。さらに、第７のステップの処理が行われ、第６の
ステップで読み出された番号の受容体についての少なく
とも付加情報が受容体情報ファイルから読み出される。
そして、第８のステップの処理が行われ、第７のステッ
プで読み出された受容体についての少なくとも付加情報
を表示手段に表示させる。
【００４２】さらに、反応経路の検出は、まず、第９の
ステップの処理が行われ、入力手段で受け付けられた所
定の化合物についてのデータから正準化データが作成さ
れる。そして、作成された正準化データに基づいて化合
物情報ファイルが検索され、正準化データが化合物情報
ファイルに存在する場合には、正準化データに対応する
化合物の番号が読み出される。次に、第１０のステップ
の処理が行われ、第９のステップで読み出された化合物
の番号に基づいて、この化合物を基質とする酵素の番号
とこの化合物を生成物とする酵素の番号とが、相互関連
情報ファイルから読み出される。
【００４３】さらに、第１１のステップの処理が行わ
れ、第１０のステップで読み出された酵素の番号に基づ
いて、この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素に
よる生成物である化合物の番号とが、酵素情報ファイル
から読み出される。第１０のステップと第１１のステッ
プとの各処理は、第１２のステップによって繰り返され
る。
【００４４】そして、第１３のステップの処理が行わ
れ、第１０のステップで読み出された酵素の番号と、第
１１のステップで読み出された化合物の番号とから、こ
れらの化合物の反応式図を反応経路に沿って表示手段に
表示させる。
【００４５】本発明の第３の生化学情報処理方法によれ
ば、第５のステップから第８のステップまでの処理によ
って、受容体情報の検出を行うことができる。さらに、
第９のステップから第１２のステップまでの処理によっ
て、反応経路の検出を行うことができる。
【００４６】受容体情報の検出は、まず、第５のステッ
プの処理が行われ、入力手段で受け付けられた化合物に
ついてのデータから正準化データが作成される。そし
て、作成された正準化データに基づいて化合物情報ファ
イルが検索され、正準化データが化合物情報ファイルに
存在する場合には、正準化データに対応する化合物の番
号が読み出される。次に、第６のステップの処理が行わ
れ、第５のステップで読み出された化合物の番号に基づ
いて、この化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受
容体の番号が、相互関連情報ファイルから読み出され
る。さらに、第７のステップの処理が行われ、第６のス
テップで読み出された番号の受容体についての少なくと
も付加情報が受容体情報ファイルから読み出される。そ
して、第８のステップの処理が行われ、第７のステップ
で読み出された受容体についての少なくとも付加情報を
表示手段に表示させる。
【００４７】さらに、反応経路の検出は、まず、第９の
ステップの処理が行われ、入力手段で受け付けられた所
定の化合物についてのデータから正準化データが作成さ
れる。そして、作成された正準化データに基づいて化合
物情報ファイルが検索され、正準化データが化合物情報
ファイルに存在する場合には、正準化データに対応する
化合物の番号が読み出される。次に、第１０のステップ
の処理が行われ、第９のステップで読み出された化合物
の番号に基づいて、この化合物を基質とする酵素の番号
とこの化合物を生成物とする酵素の番号とが、相互関連
情報ファイルから読み出される。
【００４８】さらに、第１１のステップの処理が行わ
れ、第１０のステップで読み出された酵素の番号に基づ
いて、この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素に
よる生成物である化合物の番号とが、酵素情報ファイル
から読み出される。第１０のステップと第１１のステッ
プとの各処理は、第１２のステップによって繰り返され
る。
【００４９】そして、第１３のステップの処理が行わ
れ、第１０のステップで読み出された酵素の番号と、第
１１のステップで読み出された化合物の番号とから、こ
れらの化合物の反応式図を反応経路に沿って表示手段に
表示させる。
【００５０】
【実施例】以下、本発明の好適な実施例について添付図
面を参照して説明する。図１は、本発明の実施例に係る
生化学情報処理装置１の構成を示すブロック図である。
同図より、本実施例の生化学情報処理装置１は、化合物
の分子構造図等を示す画像データを記憶する画像メモリ
１０と、データを一時的に記憶する作業用メモリ１１
と、オペレーティングシステム（ＯＳ）２１及び生化学
情報処理プログラム２２が記憶された第１記憶装置２０
と、各種ファイルが記憶された記憶手段である第２記憶
装置３０とを備えている。また、表示手段であるディス
プレイ４０と、画像データの入力を受け付けるマウス５
１及び記号データの入力を受け付けるキーボード５２を
有する入力手段である入力装置５０と、画像データ等を
出力するプリンタ６０と、生化学情報処理プログラム２
２の実行等を制御するＣＰＵ７０とを備えている。
【００５１】生化学情報処理プログラム２２は、処理を
統括するメインルーチン２３と、画像データを３次元表
示させる３次元表示ルーチン２４と、反応式検出手段で
ある反応式検出ルーチン２５と、受容体情報検出手段で
ある受容体情報検出ルーチン２６と、反応経路検出手段
である反応経路検出ルーチン２７とを備えている。反応
式検出ルーチン２５は、基質および／または生成物であ
る化合物に関する化学反応式を検出するルーチンで、第
１の処理部２５ａ〜第４の処理部２５ｄを備えている。
また、受容体情報検出ルーチン２６は、受容体について
の付加情報を検出するルーチンで、第５の処理部２６ａ
〜第８の処理部２６ｄを備えている。さらに、反応経路
検出ルーチン２７は、複数の化合物の反応経路を検出す
るルーチンで、第９の処理部２７ａ〜第１３の処理部２
７ｅを備えている。
【００５２】なお、受容体情報検出ルーチン２６では、
ホルモン受容体等の生体本来のもののみならず、薬物等
の受容体や存在が確認されていない概念上の受容体も取
り扱うことができる。
【００５３】第２記憶装置３０は、化合物情報ファイル
３１と、酵素情報ファイル３２と、相互関連情報ファイ
ル３３と、部分相互関連データファイル３４と、結合表
ファイル（結合表情報ファイルともいう）３５と、受容
体情報ファイル３６とを備えている。この内、化合物情
報ファイル３１には、化合物番号とこの化合物に対応す
る正準化データ（カノニカルデータともいう）との関係
を示す一覧表、及びこの化合物についての付加情報（例
えば図３の参照データ）が格納されている。また、酵素
情報ファイル３２には、酵素番号とこの酵素の基質であ
る化合物の化合物番号とこの酵素による生成物である化
合物の化合物番号との関係を示す一覧表、及びこの酵素
についての付加情報（例えば図４の参照データ）が格納
されている。さらに、相互関連情報ファイル３３には、
化合物番号と当該化合物が基質となる酵素の酵素番号と
当該化合物が生成物となる酵素の酵素番号と、当該化合
物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮抗物
質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納され
ている。さらにまた、部分相互関連データファイル３４
には反応経路情報が、結合表ファイル３５には結合表デ
ータがそれぞれ格納できるように用意されている。さら
にまた、受容体情報ファイル３６には、受容体番号とこ
の受容体の作動物質である化合物の化合物番号とこの受
容体の拮抗物質である化合物の化合物番号との関係を示
す一覧表、及びこの受容体についての付加情報（例えば
図５の参照データ）が格納されている。
【００５４】次に、化合物情報ファイル３１、酵素情報
ファイル３２、相互関連情報ファイル３３、及び受容体
情報ファイル３６の詳細な構成について説明する。図２
は、化合物番号Ｃ1 の化合物が、酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 の
複数の酵素を触媒として、化合物番号Ｃ2 ，Ｃ3 ，…の
化合物へと順次変化し、最終的に化合物番号Ｃ7 の化合
物に変化するまでの経路を示した反応経路図の例である
と共に、化合物Ｃ6 〜Ｃ12が受容体Ｒ1 〜Ｒ4 に対する
作動物質、或いは拮抗物質となっている状況を示す図の
例である。
【００５５】この反応経路図の一例に記載された化合物
番号Ｃ1 〜Ｃ7 は、図３に示す化合物情報ファイル３１
に記録されている。化合物情報ファイル３１には、化合
物番号Ｃ1 〜Ｃ7 の各化合物に対応した正準化データ
と、化合物Ｃ1 〜Ｃ7 の各化合物についての参照データ
（名称、文献、物性等）とが、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 に
対応した一覧表として記録されている。このため、化合
物番号Ｃ1 〜Ｃ7 をキーとして、化合物情報ファイル３
１にアクセスすれば、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 の各化合物
についての、正準化データ及び参照データを読み出すこ
とができる。ここで、正準化データは各化合物の化学構
造を一意的に特定する複数の記号データである。正準化
データの詳細は後述する。
【００５６】また、図２の反応経路図の一例に記載され
た酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 は、図４に示す酵素情報ファイル
３２に記録されている。酵素情報ファイル３２には、酵
素番号Ｅ1 〜Ｅ6 の各酵素の基質である化合物の化合物
番号Ｃ1 〜Ｃ6 と、酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 の各酵素による
生成物である化合物の化合物番号Ｃ2 〜Ｃ7 と、酵素番
号Ｅ1 〜Ｅ6 の各酵素についての参照データ（名称、文
献、物性、阻害物質、誘導物質、活性化物質等）とが、
酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 に対応した一覧表として記録されて
いる。
【００５７】このため、酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 をキーとし
て、酵素情報ファイル３２にアクセスすれば、酵素番号
Ｅ1 〜Ｅ6 の各酵素についての、基質及び生成物である
化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 と、参照データとを読み出すこと
ができる。また、酵素分類や酵素の同定がなされていな
い酵素による反応や光、熱、酸、塩基、金属イオン等が
関与する非酵素的な反応に加えて、複数の酵素による多
段階の反応についても同様に取り扱うことができる。
【００５８】さらに、受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4 は、図５に
示す受容体情報ファイル３６に記録されている。受容体
情報ファイル３６には、受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4 の各受容
体の作動物質である化合物の化合物番号Ｃ6 ，Ｃ10〜Ｃ
12と、受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4の各受容体の拮抗物質であ
る化合物の化合物番号Ｃ7 〜Ｃ9 と、受容体番号Ｒ1〜
Ｒ4 の各受容体についての参照データ（名称、文献、物
性、作用等）とが、受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4 に対応した一
覧表として記録されている。
【００５９】このため、受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4 をキーと
して、受容体情報ファイル３６にアクセスすれば、受容
体番号Ｒ1 〜Ｒ4 の各受容体についての、作動物質及び
拮抗物質である化合物番号Ｃ6 〜Ｃ12と、参照データと
を読み出すことができる。
【００６０】さらにまた、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ12、酵素
番号Ｅ1 〜Ｅ6 、及び受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4 の相互の関
係は、図６に示す相互関連情報ファイル３３に記録され
ている。詳細には、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ6 の各化合物が
基質となる酵素の酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 と、化合物番号Ｃ
2 〜Ｃ7 の各化合物が生成物となる酵素の酵素番号Ｅ1
〜Ｅ6 と、化合物番号Ｃ6 の化合物が阻害する酵素の酵
素番号Ｅ4 とが、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 に対応した一覧
表として記録されている。また、化合物番号Ｃ6 ，Ｃ10
〜Ｃ12の各化合物が作動物質となる受容体の受容体番号
Ｒ1 〜Ｒ4 と、化合物番号Ｃ7 〜Ｃ9 の各化合物が拮抗
物質となる受容体の受容体番号Ｒ2 ，Ｒ4 とが、化合物
番号Ｃ6 〜Ｃ12に対応した一覧表として記録されてい
る。
【００６１】このため、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 をキーと
して、相互関連情報ファイル３３にアクセスすれば、化
合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 の各化合物が基質或いは生成物とな
る酵素の酵素番号Ｅ1 〜Ｅ6 と、化合物番号Ｃ6 の化合
物が阻害する酵素の酵素番号Ｅ4 とを読み出すことがで
きる。また、化合物番号Ｃ6 〜Ｃ12をキーとして、相互
関連情報ファイル３３にアクセスすれば、化合物番号Ｃ
6 〜Ｃ12の各化合物が作動物質或いは拮抗物質となる受
容体の受容体番号Ｒ1 〜Ｒ4 を読み出すことができる。
【００６２】次に、酵素情報ファイル３２のデータ内容
について、具体的に説明する。まず、図２の反応経路図
より、酵素番号Ｅ1 の酵素の基質である化合物の化合物
番号はＣ1 である。また、酵素番号Ｅ1 の酵素による生
成物である化合物の化合物番号はＣ2 である。このた
め、図４の酵素情報ファイル３２には、酵素番号Ｅ1 に
対応した（基質）化合物番号の欄に、Ｃ1 が記録されて
いる。また、酵素番号Ｅ1 に対応した（生成物）化合物
番号の欄に、Ｃ2 が記録されている。
【００６３】同様に、図２の反応経路図より、酵素番号
Ｅ2 の酵素の基質である化合物の化合物番号はＣ2 であ
る。また、酵素番号Ｅ2 の酵素による生成物である化合
物の化合物番号はＣ3 である。このため、図４の酵素情
報ファイル３２には、酵素番号Ｅ2 に対応した（基質）
化合物番号の欄に、Ｃ2 が記録されている。また、酵素
番号Ｅ2 に対応した（生成物）化合物番号の欄に、Ｃ3
が記録されている。
【００６４】このような関係は、酵素番号Ｅ3 〜Ｅ6 に
ついても同様であり、酵素番号Ｅ3〜Ｅ6 に対応した
（基質）化合物番号及び（生成物）化合物番号の欄に
は、各々、図２の反応経路図に沿った化合物番号Ｃ3 〜
Ｃ7 が記録されている。
【００６５】次に、受容体情報ファイル３６のデータ内
容について、具体的に説明する。図５に示すように、受
容体番号Ｒ1 の受容体の作動物質である化合物の化合物
番号Ｃ6 が、（作動物質）化合物番号の欄に記録されて
いる。また、受容体番号Ｒ2の受容体の拮抗物質である
化合物の化合物番号Ｃ8 が、（拮抗物質）化合物番号の
欄に記録されている。さらに、受容体番号Ｒ3 の受容体
の作動物質である化合物の化合物番号Ｃ10，Ｃ11が、
（作動物質）化合物番号の欄に記録されている。さらに
また、受容体番号Ｒ4 の受容体の作動物質である化合物
の化合物番号Ｃ12が、（作動物質）化合物番号の欄に記
録され、受容体番号Ｒ4 の受容体の拮抗物質である化合
物の化合物番号Ｃ7 ，Ｃ9 が、（拮抗物質）化合物番号
の欄に記録されている。図２の反応経路図によれば、こ
れらの受容体番号と化合物番号との関係は明らかであ
る。
【００６６】次に、相互関連情報ファイル３３のデータ
内容について、具体的に説明する。まず、図２の反応経
路図より、化合物番号Ｃ1 の化合物が基質となる酵素の
酵素番号はＥ1 である。このため、図６の相互関連情報
ファイル３３には、化合物番号Ｃ1 に対応した（基質）
酵素番号の欄に、Ｅ1 が記録されている。
【００６７】同様に、図２の反応経路図より、化合物番
号Ｃ2 の化合物が基質となる酵素の酵素番号はＥ2 であ
る。また、化合物番号Ｃ2 の化合物が生成物となる酵素
の酵素番号はＥ1 である。このため、図６の相互関連情
報ファイル３３には、化合物番号Ｃ2 に対応した（基
質）酵素番号の欄に、Ｅ2 が記録されている。また、化
合物番号Ｃ2 に対応した（生成物）酵素番号の欄に、Ｅ
1 が記録されている。
【００６８】このような関係は、化合物番号Ｃ3 〜Ｃ7
についても同様であり、化合物番号Ｃ3 〜Ｃ7 に対応し
た（基質）酵素番号及び（生成物）酵素番号の欄には、
各々、図２の反応経路図に沿った酵素番号Ｅ2 〜Ｅ6 が
記録されている。さらに、化合物番号Ｃ6 の化合物は、
酵素番号Ｅ6 の基質であり、酵素番号Ｅ5 の生成物であ
ると同時に、酵素番号Ｅ4 の阻害剤であるので、（阻
害）酵素番号の欄にＥ4が記録されている。
【００６９】さらにまた、化合物番号Ｃ6 の化合物につ
いての作動物質の受容体番号Ｒ1 が（作動）受容体番号
の欄に記録されている。また、化合物番号Ｃ7 の化合物
についての拮抗物質の受容体番号Ｒ4 が（拮抗）受容体
番号の欄に記録されている。以下同様に、化合物番号Ｃ
8 〜Ｃ12の化合物についての作動物質／拮抗物質の受容
体番号Ｒ2 〜Ｒ4 が、（作動）受容体番号／（拮抗）受
容体番号の各欄に記録されている。
【００７０】次に、生化学情報処理装置１内でのデータ
の流れを図７に示す。まず、操作者がマウス５１を用い
て、ディスプレイ４０上に分子構造図を作画すると、こ
の分子構造図は画像データ８０として、画像メモリ１０
に記憶される。この画像データ８０は、結合表データ８
１、正準化データ８２、３次元データ８３のいずれにも
変換することができる。
【００７１】画像データ８０・結合表データ８１間の変
換は、使用ＯＳに対応したグラフィック・ライブラリを
使用して行うことができる。なお、結合表データ８１・
正準化データ８２間の変換アルゴリズムについては後で
詳細に説明する。また、結合表データ８１・３次元デー
タ８３間の変換アルゴリズムは、本発明者による“第１
３回情報科学討論会要旨集 ２５頁”に記載されてい
る。
【００７２】変換された結合表データ８１は結合表ファ
イル３５に、正準化データ８２は作業用メモリ１１に、
３次元データ８３は画像メモリ１０にそれぞれ記憶され
る。また、操作者がキーボード５２を用いて、名称等を
表わす記号データ８４を入力すると、文字列による検索
処理８４ｂが化合物情報ファイル３１に対して行われ、
該当する化合物の正準化データから、結合表データ８１
が作成される。この結合表データ８１も同様に、画像デ
ータ８０、３次元データ８３のいずれかに変換すること
ができる。一方、酵素名等を表わす記号データ８４が入
力された場合、文字列による検索処理８４ｂは酵素情報
ファイル３２に対して行われ、該当する酵素番号が読み
だされ、以後の処理に用いることができる。
【００７３】図８（ａ）〜図８（ｃ）に、画像データ８
０ａ、結合表データ８１ａ、及び正準化データ８２ａの
具体例を示す。図８（ａ）は、化合物“４−メチルピリ
ジン”の分子構造を示す画像データ８０ａである。この
画像データ８０ａは、図８（ｂ）に示す結合表データ８
１ａに変換することができる。結合表データ８１ａは、
原子数、結合数、各原子の座標、各元素の元素名などが
記録されたテーブルである。この結合表データ８１ａを
用いれば、全ての化合物の構造を数値データとして表現
することができる。
【００７４】さらに、結合表データ８１ａは、図８
（ｃ）に示す正準化データ８２ａに変換することができ
る。正準化データ８２ａは、数字及び符号等が並んだ記
号列である。図８（ｃ）に示すように、化合物“４−メ
チルピリジン”の正準化データ８２ａは、“１％１％１
−２％３％５％Ｎ／６％７／”である。このように、正
準化データ８２ａは、化合物の構造を非常に短い記号列
で表すことができる。このため、この正準化データ８２
ａを、例えば化合物検索システムに適用すれば、検索速
度が向上すると共に、記憶資源を有効に利用することが
できる。
【００７５】ところが、上述の結合表データでは、化合
物を一意的に特定することが困難であり、化合物検索シ
ステムに使用することは適当でない。つまり、図９
（ａ）〜図９（ｃ）に示すように、画像データ８０ｂ
は、画像データ８０ａと同一の化合物を表したデータで
あるにも関わらず、結合表データ８１ａと結合表データ
８１ｂとは、全く異なったものになる。このことから、
結合表データから化合物を一意的に特定できないことが
判る。これに対して、結合表データ８１ｂを変換した正
準化データ８２ｂは、正準化データ８２ａと同一であ
り、化合物を一意的に特定することができる。
【００７６】なお、結合表データ８１ａ及び８１ｂにお
いて、各データが記録されたテーブルは、原子の番号か
ら質量までのテーブルと、結合原子対からＵＰ／ＤＯＷ
Ｎまでのテーブルとに分けられる。従って、例えば結合
表データ８１ａにおいて、原子の番号（４）と元素名
（Ｎ）とは対応するが、原子の番号（４）と結合原子対
（４ ５）、結合種（１）及びＵＰ／ＤＯＷＮ（０）と
は対応しない。
【００７７】特に、図１０（ａ）〜図１０（ｃ）に示す
ように、２つの画像データ８０ｃ，８０ｄは、同一の化
合物を示す画像データであるにも関わらず、見た目には
全く異なる。このような画像データ８０ｃ，８０ｄを変
換した正準化データ８２ｃは同一であり、化合物を一意
的に特定できることが判る。
【００７８】このように、正準化データは、化合物を一
意的に特定できる点で、結合表データに比べて優れてお
り、このため、本実施例の生化学情報処理装置１の各処
理では、主に正準化データが用いられている。
【００７９】一方、結合表データは座標データを有して
いるので、化合物の分子構造図をディスプレイ４０上に
表示するのに有用である。更に、その二次元座標データ
（Ｘ座標、Ｙ座標）は結合表データの他のデータから演
算により求められ得るものである（無論、結合の長さや
結合間の角度、ディスプレイ上に表示する際の中心位置
などは予め指定しておく必要がある）。
【００８０】次に、本発明の実施例に係る生化学情報処
理方法について説明する。この処理方法には、生化学情
報処理装置１が用いられる。まず、ＯＳ２１の制御の下
で、生化学情報処理プログラム２２のメインルーチン２
３が起動される。
【００８１】図１１のフローチャートに示すように、メ
インルーチン２３では、まず、入力方法の選択画面がデ
ィスプレイ４０に表示される（Ｓ１００）。この画面表
示に従って、操作者がマウス５１による入力を選択する
と（Ｓ１０１）、ディスプレイ４０に分子構造図作画用
の画面が表示される。次に、操作者がマウス５１を用い
て、所定の化合物の構造を示す分子構造図を入力する
と、この図形は画像データとして受け付けられ、画像メ
モリ１０に記憶される（Ｓ１０２）。この画像データ
は、ディスプレイ４０にも表示される（Ｓ１０３）。そ
して、この画像データは、上述した変換アルゴリズムに
従って、結合表データに変換される（Ｓ１０４）。
【００８２】また、Ｓ１００の画面表示に従って、操作
者がキーボード５２による入力を選択すると（Ｓ１０
１）、ディスプレイ４０に記号列入力画面が表示され
る。次に、操作者がキーボードを用いて、所定の化合物
を特定する化合物名や化学式などの記号列を入力する
と、この入力は受け付けられ（Ｓ１０５）、この記号列
で特定される化合物の検索（Ｓ１０６）が、化合物情報
ファイル３１に対して行われ、該当する化合物の正準化
データ８２から結合表データ８１が作成される（Ｓ１０
６ｂ）。そして、結合表データは、上述の二次元座標デ
ータに基づき画像データに変換され（Ｓ１０７）、この
画像データがディスプレイ４０に表示される（Ｓ１０
８）。
【００８３】一方、キーボード５２による入力で、酵素
名等を表わす記号データ８４を入力した場合、文字列に
よる検索（Ｓ１０６）が酵素情報ファイル３２に対して
行われ、該当する酵素番号が読み出され、同様の処理に
供することができる。
【００８４】Ｓ１０４、及びＳ１０８の処理終了後、以
下のいずれかの処理の選択画面がディスプレイ４０に表
示される（Ｓ１０９）。この画面表示に従って、操作者
が結合表データの保存処理を選択すると、結合表データ
は結合表ファイル３５に書き込まれる（Ｓ１１１）。そ
して、結合表ファイル３５への書き込みが終了した後
に、処理はＳ１０９に戻る。また、Ｓ１０９の画面表示
に従って、操作者が３次元表示処理を選択すると、３次
元表示ルーチン２４が呼び出される（Ｓ１１２）。３次
元表示ルーチン２４は、化合物の分子構造図を３次元表
示させるための処理ルーチンである。そして、３次元表
示ルーチン２４の処理が終了した後に、処理はＳ１０９
に戻る。
【００８５】さらに、Ｓ１０９の画面表示に従って、操
作者が反応式検出処理を選択すると、反応式検出ルーチ
ン２５が呼び出される（Ｓ１１３）。反応式検出ルーチ
ン２５は、相互関連情報ファイル３３等を検索して、化
合物の関わる反応式を検出する処理ルーチンである。そ
して、反応式検出ルーチン２５の処理が終了した後に、
処理はＳ１０９に戻る。さらにまた、Ｓ１０９の画面表
示に従って、操作者が反応経路検出処理を選択すると、
反応経路検出ルーチン２７が呼び出される（Ｓ１１
４）。反応経路検出ルーチン２７は、相互関連情報ファ
イル３３等を検索して、複数の化合物の反応経路を検出
する処理ルーチンである。そして、反応経路検出ルーチ
ン２７の処理が終了した後に、処理はＳ１０９に戻る。
【００８６】さらにまた、Ｓ１０９の画面表示に従っ
て、操作者が受容体情報表示処理を選択すると、受容体
情報検出ルーチン２６が呼び出される（Ｓ１１５）。受
容体情報検出ルーチン２６は、相互関連情報ファイル３
３を検索して、特定の化合物の作動受容体番号及び／又
は拮抗受容体番号を読み出す（第６の処理部２６ｂ）と
共に、受容体情報ファイル３６を検索して、読み出され
た受容体番号の受容体の参照データを検出し（第７の処
理部２６ｃ）、更に検出された参照データを表示する
（第８の処理部２６ｄ）処理ルーチンである。そして、
受容体情報検出ルーチン２６の処理が終了した後に、処
理はＳ１０９に戻る。さらにまた、Ｓ１０９の画面表示
に従って、操作者が終了処理を選択すると、メインルー
チンの全処理が終了する。
【００８７】次に、図１２のフローチャートを用いて、
Ｓ１１２で呼び出される３次元表示ルーチン２４の処理
について説明する。この処理は、まず、上述した変換ア
ルゴリズムに従って、結合表データが分子構造図の３次
元データに変換される（Ｓ１２０）。そして、この３次
元データの回転表示等を行うかについての入力促進画面
がディスプレイ４０に表示される（Ｓ１２１）。この画
面で３次元表示ルーチン２４の起動を選択すると、使用
ＯＳに対応したグラフィック・ライブラリを使用して３
次元データは画像データに変換され（Ｓ１２４）、この
画像データがディスプレイ４０に表示される（Ｓ１２
５）。さらに、この画面表示に従って、操作者が配座の
変更処理、回転処理、拡大処理、縮小処理のいずれかを
選択する（Ｓ１２２）と、一般的な３次元グラフィック
スの作成手法によって、これらの処理が行われる（Ｓ１
２３）。
【００８８】次に、図１３のフローチャートを用いて、
Ｓ１１３で呼び出される反応式検出ルーチン２５の処理
について説明する。この処理は、まず、上述した変換ア
ルゴリズムに従って、結合表データが正準化データに変
換される（Ｓ１３０）。そして、検索対象の選択画面が
ディスプレイ４０に表示される（Ｓ１３１）。ここで、
操作者が反応式を選択する場合には、前のＳ１０２或い
はＳ１０５で、入力された化合物が基質または生成物の
いずれであるかを予め指定しておくのが好ましい。或い
は、Ｓ１３０の処理の直前で、化合物についての結合表
データと共に、基質であるか生成物であるかの指定の入
力を受け付けてもよい。
【００８９】このような条件の下で、Ｓ１３１の画面表
示に従って、操作者が反応式を選択すると（Ｓ１３
２）、以下の反応式検出処理が行われる。この処理は、
まず、化合物情報ファイル３１がアクセスされ、化合物
の検索が行われる（Ｓ１３３）。この検索処理は、Ｓ１
３０で変換された化合物の正準化データに基づいて行わ
れる。この検索処理で、化合物の正準化データと同一の
正準化データが、化合物情報ファイル３１内に存在しな
い場合（Ｓ１３４）には、処理を終了する。また、化合
物の正準化データと同一の正準化データが化合物情報フ
ァイル３１内に存在する場合には、この正準化データに
対応する化合物番号が、化合物情報ファイル３１から読
み出される。
【００９０】Ｓ１３３で読み出された化合物番号に基づ
いて、化合物が基質あるいは生成物となる（前記指定に
よる）酵素番号が、相互関連情報ファイル３３から読み
出される（Ｓ１３５）。さらに、Ｓ１３５で読み出され
た酵素番号に基づいて、この酵素番号に対応した（基
質）化合物番号、（生成物）化合物番号及び参照データ
が酵素情報ファイル３２から読み出される（Ｓ１３
６）。
【００９１】このように、Ｓ１３３で読み出された化合
物番号と、Ｓ１３５で読み出された酵素番号とから、化
合物が関わる反応式図が作成され、この反応式図の画像
データがディスプレイ４０に表示される。また、Ｓ１３
６で読み出された酵素についての参照データがディスプ
レイ４０に表示される（Ｓ１３７）。
【００９２】なお、反応式図の画像データは、得られた
（基質）化合物番号の化合物の分子構造図と、（生成
物）化合物番号の化合物の分子構造図とを矢印で結び、
該矢印の近傍に酵素の参照データ（特に名称）を配した
配置でディスプレイ４０に表示されるのが好ましい。化
合物番号から分子構造図への変換は、例えば、化合物番
号→結合表データ（結合表ファイルにアクセス）→分子
構造図（ニ次元座標を用いて）の順序で行ってもよい。
【００９３】ここで、第１の処理部２５ａがＳ１３０か
らＳ１３３までの処理を行っており、これらの処理は第
１のステップに対応する。また、第２の処理部２５ｂが
Ｓ１３５の処理を行っており、この処理は第２のステッ
プに対応する。さらに、第３の処理部２５ｃがＳ１３６
の処理を行っており、この処理は第３のステップに対応
する。さらにまた、第４の処理部２５ｄがＳ１３７の処
理を行っており、この処理は第４のステップに対応す
る。
【００９４】本発明において、第１の処理部及びステッ
プと、第５の処理部及びステップと、第９の処理部及び
ステップとが、それぞれ同じ処理部及びステップであっ
てもよい。
【００９５】次に、Ｓ１３１の画面表示に従って、操作
者が分子構造図を選択すると（Ｓ１３２）、以下の分子
構造図検出処理が行われる。この処理は、まず、化合物
情報ファイル３１がアクセスされ、検出対象の化合物の
検索が行われる（Ｓ１３８）。検索処理は、Ｓ１３０で
変換された化合物の正準化データに基づいて行われる。
この検索処理で、検出対象の正準化データと同一の正準
化データが、化合物情報ファイル３１内に存在しない場
合（Ｓ１３９）には、処理を終了する。また、検出対象
の正準化データと同一の正準化データが化合物情報ファ
イル３１内に存在する場合には、この正準化データに対
応する化合物の化合物番号が、化合物情報ファイル３１
から読み出される。
【００９６】Ｓ１３８で読み出された化合物番号に基づ
いて、参照データ等が化合物情報ファイル３１及び相互
関連情報ファイル３３から読み出される（Ｓ１４０）。
このように、Ｓ１３８で読み出された化合物番号から、
検出対象である化合物の分子構造図が作成され、この分
子構造図の画像データがディスプレイ４０に表示され
る。また、Ｓ１４０で読み出されたこの化合物について
の参照データがディスプレイ４０に表示される（Ｓ１４
１）。
【００９７】次に、図１４，図１５のフローチャートを
用いて、Ｓ１１４で呼び出される反応経路検出ルーチン
２７の処理について説明する。この処理は、まず、上述
した変換アルゴリズムに従って、中心化合物の結合表デ
ータが正準化データに変換され、引き続き、検出される
反応経路領域を確定するため、所定の反応ステップ数
（例えば、中心化合物を中心として上流側３反応ステッ
プ、下流側５反応ステッフといったように）の入力を受
け付ける（Ｓ１５０）。
【００９８】次に、化合物情報ファイル３１がアクセス
され、Ｓ１５０で変換した正準化データに基づいて、中
心化合物の検索が行われる（Ｓ１５１）。この検索処理
で、中心化合物の正準化データと同一の正準化データ
が、化合物情報ファイル３１内に存在しない場合（Ｓ１
５２）には、処理を終了する。また、中心化合物の正準
化データと同一の正準化データが化合物情報ファイル３
１内に存在する場合には、この正準化データに対応する
化合物番号が、化合物情報ファイル３１から読み出され
る。
【００９９】Ｓ１５１で読み出された化合物番号（キ
ー）に基づいて、この化合物を基質とする酵素の酵素番
号とこの化合物を生成物とする酵素の酵素番号とが、相
互関連情報ファイル３３から読み出される（Ｓ１５
３）。さらに、Ｓ１５３で読み出された酵素番号に基づ
いて、この酵素の基質である化合物の化合物番号とこの
酵素による生成物である化合物の化合物番号とが、酵素
情報ファイル３２から読み出される（Ｓ１５４）。そし
て、Ｓ１５３で読み出された酵素番号と、Ｓ１５４で読
み出された化合物番号とは、順次、部分相互関連データ
ファイル３４に追加される（Ｓ１５５）。
【０１００】Ｓ１５３からＳ１５５までの処理は、Ｓ１
５４で新たに呼び出された化合物番号について繰り返さ
れ、所定ステップ数の反応経路内の全ての化合物の化合
物番号と酵素の酵素番号とが、部分相互関連データファ
イル３４に書き込まれる（Ｓ１５６）。
【０１０１】次に、操作者の指示に従って、反応経路内
の所定の酵素が指定されると（Ｓ１５７）、この酵素の
基質である化合物、及びこの酵素による生成物である化
合物が、化合物情報ファイル３１と酵素情報ファイル３
２とから読み出され、これらの化合物及び酵素から反応
式データが作成される（Ｓ１５８）。そして、この反応
式データがディスプレイ４０に表示される（Ｓ１５
９）。さらに、部分相互関連データファイル３４がアク
セスされ、この反応式の全ての隣接反応が求められ、こ
れらの隣接反応を示す矢印がディスプレイ４０に表示さ
れる（Ｓ１６０）。
【０１０２】このようにディスプレイ４０に表示された
反応式データに基づいて、操作者がいずれかの隣接反応
を表示させる選択を行った場合（Ｓ１６１）、Ｓ１５７
の処理に戻って、隣接反応についての反応式データが作
成される。
【０１０３】ここで、第９の処理部２７ａがＳ１５０，
Ｓ１５１の処理を行っており、これらの処理は第９のス
テップに対応する。また、第１０の処理部２７ｂがＳ１
５３の処理を行っており、この処理は第１０のステップ
に対応する。さらに、第１１の処理部２７ｃがＳ１５４
の処理を行っており、この処理は第１１のステップに対
応する。さらにまた、第１２の処理部２７ｄがＳ１５６
の処理を行っており、この処理は第１２のステップに対
応する。さらにまた、第１３の処理部２７ｅがＳ１５７
からＳ１６１までの処理を行っており、これらの処理は
第１３のステップに対応する。
【０１０４】Ｓ１５９及びＳ１６０の処理によるディス
プレイ４０への表示例を、図１６，図１７に示す。これ
らの図より、ディスプレイ４０には、どちらも反応式デ
ータを示す画像データ８０ｆ，８０ｇが表示されてお
り、反応式データの両端には隣接反応を示す矢印が付加
されている。Ｓ１６１で行う隣接反応の選択は、いずれ
かの矢印の部分をマウス５１でクリックして行う。ここ
では、画像データ８０ｆの左端の矢印がマウス５１でク
リックされた場合に、１ステップ前の反応である画像デ
ータ８０ｇが表示される。このような画面の切り替えに
よって、反応経路内のいずれの反応式の表示も自在に行
うことができる。
【０１０５】次に、本発明に好適な正準化データ作成手
段及び方法について説明する。
【０１０６】前述の結合表データ８１・正準化データ８
２間の変換アルゴリズムとしてはいずれも、モルガン・
アルゴリズム（H.L.Morgan,J.Chem.Doc.,5(2),107(196
5)）のような既知のものが適用可能であり、また、本発
明者による“第１３回情報科学討論会要旨集 ２５頁”
に記載された変換アルゴリズムも適用可能である。しか
しながら、上記従来の本発明者による変換アルゴリズム
においては、原子を等価原子毎に分類する処理過程を経
ないモルガン・アルゴリズムより高速に正準化データを
求めることができたものの、原子の属性としてその原子
から特定の最小距離にある原子の数を用いており、等価
原子の判別に厳密性が欠け、得られる正準化データの信
頼性が未だ充分ではなかった。従って、本発明において
は、以下に詳細に説明する正準化データ作成手段及び方
法が特に好ましく採用される。
【０１０７】先ず、本発明に好適な正準化データ作成手
段について説明する。図３９に示す本発明の実施形態で
ある生化学情報処理装置１は本発明にかかる正準化デー
タ作成手段を備えており、すなわち、分子構造図の画像
データを記憶する画像メモリ１０と、記号データなどを
一時的に記憶する作業用メモリ１１と、オペレーティン
グシステム（ＯＳ）２１及び正準化データ作成ルーチン
９１が記憶された第１記憶装置２０と、結合表ファイル
３５及び化合物情報ファイル３１が記憶された第２記憶
装置３０とを備えている。
【０１０８】また、生化学情報処理装置１は、分子構造
図を表示するディスプレイ４０と、手書き図形の入力を
受け付けるポインティングデバイスであるマウス５１
と、化学式等の記号データの入力を受け付けるキーボー
ド５２と、分子構造図を出力するプリンタ６０と、正準
化データ作成ルーチン９１の実行等を制御するＣＰＵ７
０とを備えている。なお、ポインティングデバイスに
は、マウス５１以外に、タブレット、ディジタイザ、ラ
イトペンなどがあり、これらのいずれの装置をマウス５
１の代わりに備えてもよい。
【０１０９】正準化データ作成ルーチン９１は、化合物
を構成する各原子についての固有データ及び原子間の結
合対データに基づいて正準化データを作成するプログラ
ムである。この正準化データ作成ルーチン９１は、処理
を統括するメイン処理部（正準化データ作成メインステ
ップ）９１ａと、化合物を構成する各原子にクラス番号
を与える構成原子分類処理部（構成原子分類ステップ）
９１ｂとを備えている。また、正準化データ作成ルーチ
ン９１は、クラス番号に基づいて各原子に正準化番号を
与える正準化番号付与処理部（正準化番号付与ステッ
プ）９１ｃと、各原子の正準化番号に基づいて正準化デ
ータを作成する正準化データ作成処理部（正準化データ
作成ステップ）９１ｄとを備えている。
【０１１０】第２記憶装置３０には、複数の結合表８１
を格納できる結合表ファイル３５が設けられている。結
合表８１には化合物を構成する各原子についての固有デ
ータ及び原子間の結合対データが記録されており、正準
化データ作成ルーチン９１は結合表８１を介して、これ
らのデータにアクセスできる。
【０１１１】図１８（ａ）及び図１８（ｂ）に示すよう
に、結合表８１は、各原子についての固有データが記録
された原子テーブル８１ｃと、原子間の結合対データが
記録された原子対テーブル８１ｄとを備えている。具体
的には、原子テーブル８１ｃには、入力番号（原子の番
号ともいう）、原子の二次元座標（Ｘ座標・Ｙ座標）、
元素名（一般に元素記号が用いられる）、属性、原子
数、及び結合数を書き込む欄が設けられており（図１８
（ａ）参照）、原子対テーブル８１ｄには、結合原子対
データ、結合種（例えば、単結合は１、二重結合は２と
する）、及び構造（各原子が分子構造図の環状部に属す
るか、鎖状部に属するかを区別する欄）を書き込む欄が
設けられている（図１８（ｂ）参照）。ここで、入力番
号は、化合物を構成する各原子をコンピュータで識別す
るための番号であり、図１８（ａ）の例では数字である
が、記号であっても良い。また、結合原子対データは、
入力番号の組合せとして表現されるのが良い。
【０１１２】なお、正準化データを作成するためには、
上記の原子テーブル８１ｃ及び原子テーブル８１ｄの全
てのデータが必要であるのではなく、固有データとして
原子の番号と元素名、結合対データとして結合原子対デ
ータと結合種があれば充分である。
【０１１３】また、第２記憶装置３０には、化合物番号
とこの化合物に対応する正準化データ（カノニカルデー
タともいう）との関係を示す一覧表が記録された化合物
情報ファイル３１が格納されている。図３に示すよう
に、化合物情報ファイル３１は、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7
の各化合物に対応した正準化データと、化合物Ｃ1 〜Ｃ
7 の各化合物についての参照データ（名称、文献、物性
等）とを、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 に対応した一覧表とし
て記録したファイルである。このため、化合物番号Ｃ1
〜Ｃ7 をキーとして、化合物情報ファイル３１にアクセ
スすれば、化合物番号Ｃ1 〜Ｃ7 の各化合物について
の、正準化データ及び参照データを読み出すことができ
る。ここで、正準化データは各化合物の化学構造を一意
的に特定する複数の記号からなるデータである。
【０１１４】なお、構成原子分類処理部９１ｂが構成原
子分類ステップに、正準化番号付与処理部９１ｃが正準
化番号付与ステップに、正準化データ作成処理部９１ｄ
が正準化データ作成ステップにそれぞれ対応する。
【０１１５】次に、正準化データ作成手段の動作の概要
について説明する。図１９に示すように、操作者はマウ
ス５１又はキーボード５２を操作して、正準化データの
作成対象となる化合物の結合表８１を結合表ファイル３
５内に作成することができる。
【０１１６】マウス５１による入力は、マウス５１を用
いてディスプレイ４０上に化合物の分子構造図を手書き
入力するもので、入力順に定まる各原子の入力番号が、
第２記憶装置３０内に作成された結合表８１の入力番号
の欄に書き込まれる。さらに、この分子構造図Ｅ1 の各
原子の結合関係を示す結合原子対データが、結合表８１
の結合原子対の欄に書き込まれる。このように、マウス
５１による入力では、化合物を特定する結合表８１が手
書きされた原子構造図Ｅ1 から作成される。
【０１１７】また、キーボード５２による入力は、キー
ボード５２を用いて所定の化合物に対応する結合表名を
特定する記号列を入力するもので、入力された記号デー
タ１１ａに基づいて、この結合表名によって特定される
結合表８１が結合表ファイル３５から読み出される。
【０１１８】このように、マウス５１及びキーボード５
２が入力手段Ａ（５０）を構成し、マウス５１とキーボ
ード５２とのいずれを用いても結合表８１が得られる。
そして、正準化作成手段Ｂである正準化データ作成ルー
チン９１が実行されて、結合表８１の各データに基づい
て正準化データ８２が作成される。このように作成され
た正準化データ８２は、化合物情報ファイル３１に書き
込まれて保存される。ここで、結合表８１から正準化デ
ータ８２を作成して保存するのは、結合表８１のままで
保存するよりも記憶領域を小さくできかつ一意的に化合
物が特定されるからである。即ち、図１８（ａ）〜
（ｂ）に示した結合表８１に基づいて作成した正準化デ
ータ８２は“１％１％１−２％３％５％Ｎ／６％７／”
であり、化合物の構造を非常に短い文字・数字・記号列
でかつ一意的に表すことができる。このように短い記号
列を保存の対象とすれば、記憶資源を有効に利用でき装
置の小型軽量化に寄与することができる。
【０１１９】また、結合表８１の各データに基づいて、
二次元座標演算処理が行われることによって、各原子の
二次元座標データを得ることができる。このように得ら
れた二次元座標データから美的に優れた分子構造図Ｅ2
が作成される。作成された分子構造図Ｅ2 は、ディスプ
レイ４０に表示することやプリンタ６０から出力するこ
とができる。
【０１２０】なお、キーボード５２による入力は、原子
の結合状態を示す前記データ等を第２記憶装置３０内に
作成された結合表８１に直接書き込んでも良い。また、
イメージスキャナーやオプティカルカードリーダー（Ｏ
ＣＲ）などの光学的に図形や文字を読み取る装置を本発
明の入力装置として用いて、結合表データの入力の受付
けを行っても良い。
【０１２１】次に、本発明に係る実施形態である正準化
データ作成方法について説明する。この作成方法には、
上述の正準化データ作成手段が用いられる。まず、ＯＳ
２１の制御の下で、正準化データ作成ルーチン９１のメ
イン処理部９１ａが起動される。
【０１２２】図２０のフローチャートに示すように、メ
イン処理部９１ａは、まず、構成原子分類処理部９１ｂ
を呼び出して、化合物を構成する各原子にクラス番号を
付与する（Ｓ９１０）。次に、正準化番号付与処理部９
１ｃを呼び出して、各原子に付与されたクラス番号に基
づいて各原子に正準化番号を付与する（Ｓ９２０）。さ
らに、正準化データ作成処理部９１ｄを呼び出して、各
原子に付与された正準化番号に基づいて正準化データを
作成する（Ｓ９３０）。このように作成された正準化デ
ータは、化合物情報ファイル３１に書き込まれて保存さ
れる。
【０１２３】次に、Ｓ９１０で呼び出される構成原子分
類処理部９１ｂの処理について説明する。この処理は、
化合物を構成する各原子を等価原子毎に別のクラスに分
類して、属するクラスに対応するクラス番号を各原子に
与える処理である。例えば、ベンゼンの各原子は全て等
価なので、全てに同一のクラス番号が与えられる。ま
た、トルエンの各原子はそれぞれ非等価なので、それぞ
れ異なったクラス番号が与えられる。
【０１２４】図２１のフローチャートに示すように、ま
ず、結合表８１に基づいて化合物を構成する各原子に３
種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）をそれぞれ与える（Ｓ
９１１）。ここで、属性ａi は入力番号ｉの原子の種類
番号（この例では原子番号）である。また、属性ｂijは
入力番号ｉの原子に隣接する結合のうち、その種類番号
（この例では結合種（単結合は１、二重結合は２、三重
結合は３、芳香結合は４、…））がｊである結合の数
（ベクトル量）である。さらに、属性ｄijは入力番号ｉ
の原子から最短経路によりｊ個の結合を経て巡れる道筋
の数（ベクトル量）である。
【０１２５】次に、原子ごとに属性（ａi ，ｂij，
ｄij）を並べて９桁の数字列とし、この数字列が小さい
順番にクラス番号Ｃi 0 を与えて、各原子を複数のクラ
スに分類する（Ｓ９１２）。ここで与えられるクラス番
号Ｃi 0 は０次のクラス番号であり、Ｓ９１３以降のル
ープ処理で１次のクラス番号Ｃi 1 、２次のクラス番号
Ｃi 2 、…を順次求めていく。
【０１２６】次に、次数ｎを１にする（Ｓ９１３）。そ
して、各原子に属性Ｖij 1を与える（Ｓ９１４）。属性
Ｖij n は入力番号ｉの原子に結合し、次数ｎ−１におい
てクラス番号がｊである原子の数である。さらに、原子
ごとに属性（ａi ，ｂij，ｄij，Ｖij n ）を並べて、こ
の数字列が小さい順番にクラス番号Ｃi n を与えて、各
原子を複数のクラスに分類する（Ｓ９１５）。そして、
クラスの数Ｎn がＮ(n -1) と等しいか調べて、等しい場
合には処理を終了する。または、クラスの数Ｎn が総原
子数と等しいか調べて、等しい場合には処理を終了する
（Ｓ９１６）。いずれも等しくない場合には、ｎに１を
加えて処理をＳ９１４に戻す（Ｓ９１７）。
【０１２７】次に、３，５−ジメチル−２，３，４，５
−テトラハイドロピリジンを例にして構成原子分類処理
部９１ｂのステップごとの処理を詳細に説明する。
【０１２８】まず、Ｓ９１１の処理が実行される。この
処理を実行する際には、図２２（ａ）〜（ｂ）に示すよ
うなデータが既に結合表８１に書き込まれており、この
結合表８１に書き込まれた各データに基づいて、各原子
に３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）を与える。ここ
で、この結合表８１に記録された入力番号は、図２３に
示すように各原子が手書き入力された順番に与えられる
任意の数字である。
【０１２９】属性ａi は次のように求められる。上述し
たように属性ａi は入力番号ｉの原子の種類番号であ
る。ここで、結合表８１には各原子の元素名が記録され
ており、これらの元素名から種類番号を求めることがで
きる。従って、元素名を結合表８１から読み出すことに
よって、この元素名に対応した属性ａi を得ることがで
きる。その結果、ａ1 ，ａ2 ，ａ4 〜ａ8 ＝６、ａ3 ＝
７がそれぞれ得られる。
【０１３０】また、属性ｂijは次のように求められる。
上述したように属性ｂijは入力番号ｉの原子に隣接する
結合のうち、その種類番号がｊである結合の数である。
結合表８１には各原子の結合種が記録されており、この
結合種を結合表８１から読み出すことによって属性ｂij
を得ることができる。その結果、ｂ1j＝（３，０，０，
０）、ｂ2j＝（１，１，０，０）、ｂ3j＝（１，１，
０，０）、ｂ4j＝（２，０，０，０）、ｂ5j＝（３，
０，０，０）、ｂ6j＝（２，０，０，０）、ｂ7j＝
（１，０，０，０）、ｂ8j＝（１，０，０，０）がそれ
ぞれ得られる。
【０１３１】具体的には、属性ｂijは図２４（ａ）〜
（ｂ）に示す参照テーブルＴを用いて求められる。参照
テーブルＴは２つの原子の結合関係を示す配列Ｄ（ｘ，
ｙ）として構成されており、結合表８１の結合原子対及
び結合種のデータに基づいて作成される。即ち、結合原
子対が示す配列要素に結合種ｊが書き込まれて、参照テ
ーブルＴが作成されている。
【０１３２】この参照テーブルＴを用いた属性ｂijの抽
出は次のように行われる。まず、参照テーブルＴの配列
要素のうち、ｘ＝１又はｙ＝１を満たす配列要素（図２
４（ａ）において斜線で示した配列要素）を探索して、
この配列要素に書き込まれたデータ（結合種）ｊを抽出
する。その結果、Ｄ（１，２）＝１、Ｄ（１，６）＝
１、Ｄ（１，８）＝１が得られる。このように得られた
３つの配列要素のデータｊは全て１なので、ｂ11＝３と
なる。また、データｊが２以上の配列要素は得られない
ので、ｂ12〜ｂ14＝０となる。
【０１３３】次に、参照テーブルＴの配列要素のうち、
Ｘ＝２又はＹ＝２を満たす配列要素（図２４（ｂ）にお
いて斜線で示した配列要素）を探索して、この配列要素
に書き込まれたデータを抽出する。その結果、Ｄ（１，
２）＝１、Ｄ（２，３）＝２が得られる。このように得
られた配列要素のデータｊは１，２で、それぞれ１つな
ので、ｂ21＝ｂ22＝１となる。また、データｊが３以上
の配列要素は得られないので、ｂ23＝ｂ24＝０となる。
【０１３４】ｉ＝３〜８についても同様に処理すること
により、図２５に示す属性ｂij（ｉ＝１〜８、ｊ＝１〜
４）が得られる。
【０１３５】さらに、属性ｄijは次のように求められ
る。上述したように属性ｄijは入力番号ｉの原子から最
短経路によりｊ個の結合を経て巡れる道筋の数である。
即ち、図２３の分子構造図に基づいて説明すると、入力
番号１の原子から１個の結合を経て巡れる道筋は、（入
力番号１〜入力番号２）、（入力番号１〜入力番号
６）、（入力番号１〜入力番号８）の計３本である。ま
た、入力番号１の原子から２個の結合を経て巡れる道筋
は、（入力番号１〜入力番号２〜入力番号３）、（入力
番号１〜入力番号６〜入力番号５）の計２本である。
【０１３６】さらに、入力番号１の原子から最短経路に
より３個の結合を経て巡れる道筋は、（入力番号１〜入
力番号２〜入力番号３〜入力番号４）、（入力番号１〜
入力番号６〜入力番号５〜入力番号４）、（入力番号１
〜入力番号６〜入力番号５〜入力番号７）の計３本であ
る。さらにまた、入力番号１の原子から最短経路により
４個の結合を経て巡れる道筋は０本である。以上の処理
の結果、ｄ1j＝（３，２，３，０）が得られる。
【０１３７】同様の処理によって、ｄ2j＝（２，３，
２，２）、ｄ3j＝（２，２，４，０）、ｄ4j＝（２，
３，２，２）、ｄ5j＝（３，２，３，０）、ｄ6j＝
（２，４，２，０）、ｄ7j＝（１，２，２，３）、ｄ8j
＝（１，２，２，３）がそれぞれ得られる。
【０１３８】具体的には、属性ｄijも属性ｂijと同様
に、参照テーブルＴを参照して求められる。この参照テ
ーブルＴを参照した属性ｄijの抽出はｉ＝１、ｉ＝２、
…の順番で行われる。まず、属性ｄ1j（ｉ＝１）が抽出
される。
【０１３９】属性ｄ1j（ｉ＝１）の抽出は、参照テーブ
ルＴの配列要素のうち、Ｘ＝１又はＹ＝１を満たす配列
要素（図２６（ａ）において斜線で示した配列要素）を
探索して、データが書き込まれた配列要素を抽出する。
そして、抽出された配列要素に結合経路数として１を書
き込む。その結果、Ｄ（１，２）、Ｄ（１，６）、Ｄ
（１，８）に結合経路数１が書き込まれる（図２６
（ａ）では結合経路数を三角形で囲んで示す）。
【０１４０】次に、結合経路数１が書き込まれた各配列
要素の添字Ｓ＝（１，２），（１，６），（１，８）を
抽出する。これらの添字Ｓから前段の抽出処理で利用し
た１を除き、Ｓ＝２，６，８を得る。このようにして得
られたＳ＝２，６，８に基づいて、Ｘ＝２，６，８又は
Ｙ＝２，６，８を満たす配列要素（図２６（ｂ）におい
て斜線で示した配列要素）を探索し、データが書き込ま
れて且つ結合経路数が書き込まれていない配列要素を抽
出する。そして、抽出された配列要素に結合経路数とし
て２を書き込む。その結果、Ｄ（２，３）、Ｄ（５，
６）に結合経路数２が書き込まれる。
【０１４１】さらに、結合経路数２が書き込まれた各配
列要素の添字Ｓ＝（２，３），（５，６）を抽出する。
これらの添字Ｓから前段の抽出処理で利用した２，６を
除き、Ｓ＝３，５を得る。このようにして得られたＳ＝
３，５に基づいて、Ｘ＝３，５又はＹ＝３，５を満たす
配列要素（図２７において斜線で示した配列要素）を探
索し、データが書き込まれて且つ結合経路数が書き込ま
れていない配列要素を抽出する。そして、抽出された配
列要素に結合経路数として３を書き込む。その結果、Ｄ
（３，４）、Ｄ（４，５）、Ｄ（５，７）に結合経路数
３が書き込まれる。
【０１４２】以上の処理によって、全ての配列要素に結
合経路数が書き込まれる。その結果、結合経路数１の配
列要素が３個、結合経路数２の配列要素が２個、結合経
路数３の配列要素が３個、結合経路数４の配列要素が０
個となり、ｄ1j＝（３，２，３，０）が得られる。
【０１４３】次に、属性ｄ2j（ｉ＝２）が抽出される。
属性ｄ2j（ｉ＝２）の抽出は、参照テーブルＴの配列要
素のうち、Ｘ＝２又はＹ＝２を満たす配列要素（図２８
（ａ）において斜線で示した配列要素）を探索して、デ
ータが書き込まれた配列要素を抽出する。そして、抽出
された配列要素に結合経路数として１を書き込む。その
結果、Ｄ（１，２）、Ｄ（２，３）に結合経路数１が書
き込まれる（図２８（ａ）では結合経路数を三角形で囲
んで示す）。
【０１４４】次に、結合経路数１が書き込まれた各配列
要素の添字Ｓ＝（１，２），（２，３）を抽出する。こ
れらの添字Ｓから前段の抽出処理で利用した２を除き、
Ｓ＝１，３を得る。このようにして得られたＳ＝１，３
に基づいて、Ｘ＝１，３又はＹ＝１，３を満たす配列要
素（図２８（ｂ）において斜線で示した配列要素）を探
索し、データが書き込まれて且つ結合経路数が書き込ま
れていない配列要素を抽出する。そして、抽出された配
列要素に結合経路数として２を書き込む。その結果、Ｄ
（１，６）、Ｄ（１，８）、Ｄ（３，４）に結合経路数
２が書き込まれる。
【０１４５】さらに、結合経路数２が書き込まれた各配
列要素の添字Ｓ＝（１，６），（１，８），（３，４）
を抽出する。これらの添字Ｓから前段の抽出処理で利用
した１，３を除き、Ｓ＝４，６，８を得る。このように
して得られたＳ＝４，６，８に基づいて、Ｘ＝４，６，
８又はＹ＝４，６，８を満たす配列要素（図２９（ａ）
において斜線で示した配列要素）を探索し、データが書
き込まれて且つ結合経路数が書き込まれていない配列要
素を抽出する。そして、抽出された配列要素に結合経路
数として３を書き込む。その結果、Ｄ（４，５）、Ｄ
（５，６）に結合経路数３が書き込まれる。
【０１４６】さらにまた、結合経路数３が書き込まれた
各配列要素の添字Ｓ＝（４，５），（５，６）を抽出す
る。これらの添字Ｓから前段の抽出処理で利用した４，
６を除き、Ｓ＝５，５（即ち、Ｓ＝５が２重に適用され
る。）を得る。このようにして得られたＳ＝５，５に基
づいてＸ＝５又はＹ＝５を満たす配列要素（図２９
（ｂ）において斜線で示した配列要素）を探索して、デ
ータが書き込まれて且つ結合経路数が書き込まれていな
い配列要素を抽出する。そして、抽出された配列要素に
結合経路数として４を書き込む。その結果、Ｄ（５，
７）に結合経路数４が２つ書き込まれる。
【０１４７】以上の処理によって、全ての配列要素に結
合経路数が書き込まれる。その結果、結合経路数１の配
列要素が２個、結合経路数２の配列要素が３個、結合経
路数３の配列要素が２個、結合経路数４の配列要素が２
個となり、ｄ1j＝（２，３，２，２）が得られる。
【０１４８】ｉ＝３〜８についても同様に処理すること
により、図２５に示すｄij（ｉ＝１〜８、ｊ＝１〜４）
が得られる。以上説明したＳ９１１の処理によって、
３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラハイドロピ
リジンを構成する各原子に３種類の属性（ａi ，ｂij，
ｄij）が与えられた。
【０１４９】次に、Ｓ９１２の処理が実行される。上述
したように、Ｓ９１２では原子ごとに属性（ａi ，
ｂij，ｄij）を並べて９桁の数字列とし、この数字列が
小さい順番にクラス番号Ｃi 0 を与えて、各原子を複数
のクラスに分類している。ここで与えられるクラス番号
Ｃi 0 は０次のクラス番号である。
【０１５０】Ｓ９１２の処理を具体的に説明すると、入
力番号１の原子の数字列は“６３０００３２３０”であ
り、入力番号２の原子の数字列は“６１１００２３２
２”である。以下順番に、“７１１００２２４０”、
“６２０００２３２２”、“６３０００３２３０”、
“６２０００２４２０”、“６１０００１２２３”、
“６１０００１２２３”となる。
【０１５１】その結果、入力番号７及び８の原子の数字
列が最小となり、これらの原子にクラス番号Ｃ7 0 ＝Ｃ
8 0 ＝１が与えられる。同様に、入力番号２の原子にク
ラス番号Ｃ2 0 ＝２が与えられて、入力番号４の原子に
クラス番号Ｃ4 0 ＝３が与えられる。また、入力番号６
の原子にクラス番号Ｃ6 0 ＝４が与えられて、入力番号
１及び５の原子にクラス番号Ｃ1 0 ＝Ｃ5 0 ＝５が与え
られる。さらに、入力番号３の原子にクラス番号Ｃ3 0
＝６が与えられる（図３０（ａ）参照）。このようにし
て各原子は６つのクラスに分類されて、クラスの数Ｎ0
は６となる。
【０１５２】次に、Ｓ９１３の処理が実行されて、次数
ｎを１にする。
【０１５３】さらに、Ｓ９１４の処理が実行される。上
述したように、Ｓ９１４では各原子に属性Ｖij 1(n=1)を
与えている。ここで、属性Ｖij n は入力番号ｉの原子に
結合し、クラス番号がｊである原子の数である。即ち、
図３０（ｂ）の分子構造図に基づいて説明すると、入力
番号１の原子に結合した原子の入力番号は２，６，８で
あり、これらの原子のクラス番号はＣ2 0 ＝２、Ｃ6 0
＝４、Ｃ8 0 ＝１である。その結果、ｊ＝１，２，４の
属性Ｖ1j 1 に１が書き込まれて、Ｖ1j 1 ＝（１，１，
０，１，０，０）が得られる。
【０１５４】また、入力番号２の原子に結合した原子の
入力番号は１，３であり、これらの原子のクラス番号は
Ｃ1 0 ＝５、Ｃ3 0 ＝６である。その結果、ｊ＝５，６
の属性Ｖ2j 1 に１が書き込まれて、Ｖ2j 1 ＝（０，０，
０，０，１，１）が得られる。入力番号３〜８の原子に
ついても同様に処理することにより、Ｖ3j 1 ＝（０，
１，１，０，０，０）、Ｖ4j 1 ＝（０，０，０，１，
１，０）、Ｖ5j 1 ＝（１，０，１，１，０，０）、Ｖ6j
1 ＝（０，０，０，０，２，０）、Ｖ7j 1 ＝（０，０，
０，０，１，０）、Ｖ8j 1 ＝（０，０，０，０，１，
０）がそれぞれ得られる。
【０１５５】具体的には、属性Ｖij n は図２４（ａ）〜
（ｂ）に示す参照テーブルＴを用いて求められる。この
参照テーブルＴを用いた属性Ｖij 1 の抽出はｉ＝１、ｉ
＝２、…の順番で行われる。まず、属性Ｖ1j 1 （ｉ＝
１）が抽出される。属性Ｖ1j 1（ｉ＝１）の抽出は、参
照テーブルＴの配列要素のうち、ｘ＝１又はｙ＝１を満
たす配列要素（図２４（ａ）において斜線で示した配列
要素）を探索して、データが書き込まれた配列要素の添
字Ｓ＝（１，２），（１，６），（１，８）を抽出す
る。これらの添字Ｓからｉ＝１を除き、Ｓ＝２，６，８
を得る。このようにして得られたＳの値を０次のクラス
番号Ｃi 0 に代入して、Ｃ2 0 ＝２、Ｃ6 0＝４、Ｃ8 0
＝１を得る。そして、ｊ＝１，２，４の属性Ｖ1j 1 に
１を書き込むことにより、Ｖ1j 1 ＝（１，１，０，１，
０，０）が求められる。
【０１５６】次に、属性Ｖ2j 1 （ｉ＝２）が抽出され
る。属性Ｖ2j 1 （ｉ＝２）の抽出は、参照テーブルＴの
配列要素のうち、Ｘ＝２又はＹ＝２を満たす配列要素
（図２４（ｂ）において斜線で示した配列要素）を探索
して、データが書き込まれた配列要素の添字Ｓ＝（１，
２），（２，３）を抽出する。これらの添字Ｓからｉ＝
２を除き、Ｓ＝１，３を得る。このようにして得られた
Ｓの値を０次のクラス番号Ｃi 0 に代入して、Ｃ1 0 ＝
５、Ｃ3 0 ＝６を得る。そして、ｊ＝５，６の属性Ｖ2j
1 に１を書き込むことにより、Ｖ2j 1 ＝（０，０，０，
０，１，１）が求められる。
【０１５７】ｉ＝３〜８についても同様に処理すること
により、図３１に示す属性Ｖij 1 （ｉ＝１〜８、ｊ＝１
〜６）が得られる。
【０１５８】次に、Ｓ９１５の処理が実行される。上述
したように、Ｓ９１５では原子ごとに属性（Ｃi n-1，Ｖ
ij n ）を並べて、この数字列が小さい順番にクラス番号
Ｃi nを与えて、各原子を複数のクラスに分類している。
【０１５９】具体的には、入力番号１の原子の数字列は
“５１１０１００”であり、入力番号２の原子の数字列
は“２００００１１”である。以下順番に、“６０１１
０００”、“３０００１１０”、“５１０１１００”、
“４００００２０”、“１００００１０”、“１０００
０１０”となる。
【０１６０】その結果、入力番号７及び８の原子の数字
列が最小となり、これらの原子にクラス番号Ｃ7 1 ＝Ｃ
8 1 ＝１が与えられる。同様に、入力番号２の原子にク
ラス番号Ｃ2 1 ＝２が与えられて、入力番号４の原子に
クラス番号Ｃ4 1 ＝３が与えられる。さらに、入力番号
６の原子にクラス番号Ｃ6 1 ＝４が与えられて、入力番
号５の原子にクラス番号Ｃ5 1 ＝５が与えられる。さら
にまた、入力番号１の原子にクラス番号Ｃ1 1 ＝６が与
えられて、入力番号３の原子にクラス番号Ｃ3 1 ＝７が
与えられる。このようにして各原子は７つのクラスに分
類されて、クラスの数Ｎ1 は７となる。
【０１６１】次に、Ｓ９１６の処理を実行して、クラス
の数Ｎn がＮ(n-1) と等しいか調べて、等しい場合には
処理を終了する。また、クラスの数Ｎn が総原子数と等
しいか調べて、等しい場合には処理を終了する。ここで
は、クラスの数Ｎ1 が７で、クラスの数Ｎ0 が６なの
で、Ｎ1 とＮ0 とは等しくない。また、総原子数は８な
ので、クラスの数Ｎ1 と総原子数とは等しくない。この
ようにいずれも等しくないので、Ｓ９１７の処理を実行
してｎを２とする。
【０１６２】さらに、Ｓ９１４に戻って各原子に属性Ｖ
ij 2 を与える。その結果、図３２に示すように、Ｖ1j 2
＝（１，１，０，１，０，０，０）、Ｖ2j 2 ＝（０，
０，０，０，０，１，１）、Ｖ3j 2 ＝（０，１，１，
０，０，０，０）、Ｖ4j 2 ＝（０，０，０，０，１，
０，１）、Ｖ5j 2 ＝（１，０，１，１，０，０，０）、
Ｖ6j 2 ＝（０，０，０，０，１，１，０）、Ｖ7j 2 ＝
（０，０，０，０，１，０，０）、Ｖ8j 2 ＝（０，０，
０，０，０，１，０）が得られる。
【０１６３】そして、Ｓ９１５の処理を実行して、各原
子にクラス番号Ｃi 2 を与える。その結果、図３０
（ｃ）に示すように、Ｃ1 2 ＝７、Ｃ2 2 ＝３、Ｃ3 2
＝８、Ｃ4 2 ＝４、Ｃ5 2 ＝６、Ｃ6 2 ＝５、Ｃ7 2 ＝
２、Ｃ8 2 ＝１が得られる。このようにして各原子は８
つのクラスに分類されて、クラスの数Ｎ2 は８となる。
クラスの数Ｎ2 ＝８は総原子数と等しいので、Ｓ９１６
の判定によって処理を終了する。
【０１６４】次に、図３３のフローチャートを用いて、
図２０のＳ９２０で呼び出される正準化番号付与処理部
９１ｃの処理について説明する。ここで正準化番号と
は、化合物の構造によって一意的に定まる各原子の番号
である。即ち、分子構造図を手書き入力することによっ
て与えられる入力番号は、入力する順番が異なることに
よって変わる任意的な番号である。これに対して正準化
データ８２は、化合物の構造にのみ依存した一意的なデ
ータである。このため、任意的な入力番号から一意的な
正準化データ８２を直接作成することは困難である。そ
こで、正準化データ作成ルーチン９１では、入力番号を
一旦正準化番号に変換して、この一意的な正準化番号に
基づいて正準化データ８２を作成することにより、円滑
な正準化データ８２の作成を可能にしている。
【０１６５】正準化番号付与処理部９１ｃの処理は、ま
ず、変数ｋに１を与える（Ｓ９２１）。次に、構成原子
分類処理部９１ｂで得られた最終クラス番号Ｃi fを調べ
て、最大の原子に正準化番号ｋ（ここではｋ＝１）を与
える（Ｓ９２２）。最大の原子が複数個ある場合には、
これらの原子の中から任意の原子を選び、この原子に正
準化番号ｋを与える。そして、全ての原子に正準化番号
が与えられた後に処理を終了する（Ｓ９２３）。
【０１６６】次に、変数ｋに１を加えて（Ｓ９２４）、
正準化番号の決まった原子（以下、既決原子という）の
中から、まだ正準化番号が決まっていない原子（以下、
未決原子という）が結合している既決原子を抽出する
（Ｓ９２５）。そして、抽出された既決原子が複数ある
か判定して（Ｓ９２６）、抽出された既決原子が複数あ
る場合には、これらの既決原子の中で正準化番号が最小
の既決原子を選択する（Ｓ９２７）。そして、選択され
た既決原子に結合している未決原子の中からクラス番号
Ｃi fが最大の未決原子を抽出して、この未決原子の正準
化番号をｋとする（Ｓ９２８）。なお、クラス番号Ｃi f
が最大の既決原子が複数ある場合には、これらの既決原
子の中から任意に選択する。
【０１６７】また、Ｓ９２６で既決原子が１つであると
判定された場合には、この既決原子に結合している未決
原子の中からクラス番号Ｃi fが最大の未決原子を選択し
て、この未決原子に正準化番号ｋを与える（Ｓ９２
９）。Ｓ９２８及びＳ９２９の処理が終了した後にＳ９
２３に処理を戻し、全ての原子に正準化番号が与えられ
るまで、Ｓ９２３〜Ｓ９２９のループを繰り返す。
【０１６８】次に、正準化番号付与処理部９１ｃの処理
について、３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラ
ハイドロピリジンを用いた具体例を説明する。まず、Ｓ
９２１の処理で変数ｋに１を与えて、次にＳ９２２の処
理が行う。Ｓ９２２の処理では、入力番号３の原子がＣ
3 f＝８で最大なので、入力番号３の原子に正準化番号ｋ
＝１を与える。次に、Ｓ９２４の処理で変数ｋを２にし
て、Ｓ９２５の処理で入力番号３の原子を既決原子とし
て抽出する。
【０１６９】このように抽出された既決原子は１つだけ
なので、次にＳ９２９の処理を行う。入力番号３の原子
に結合している未決原子は入力番号２，４の原子なの
で、これらの原子の中からクラス番号Ｃi fが最大の原子
を選択する。即ち、入力番号２の原子のクラス番号はＣ
2 f＝３で、入力番号４の原子のクラス番号はＣ4 f＝４で
ある。このため、入力番号４の原子を選択して、この原
子に正準化番号ｋ＝２を与える。
【０１７０】次に、Ｓ９２４の処理に戻って変数ｋを３
にして、Ｓ９２５の処理で入力番号３，４の原子を既決
原子として抽出する。このように抽出された既決原子は
複数あるので、次にＳ９２７の処理を行い、抽出された
既決原子の中から正準化番号が最小の原子を選択する。
即ち、入力番号３の原子の正準化番号は１で、入力番号
４の原子の正準化番号は２である。このため、入力番号
３の原子を選択する。そして、Ｓ９２８の処理を行い、
入力番号３の原子に結合した入力番号２の原子に正準化
番号ｋ＝３を与える。
【０１７１】さらに、Ｓ９２４の処理に戻って変数ｋを
４にして、Ｓ９２５の処理で入力番号２，４の原子を既
決原子として抽出する。このように抽出された既決原子
は複数あるので、次にＳ９２７の処理を行い、抽出され
た既決原子の中から正準化番号が最小の原子を選択す
る。即ち、入力番号２の原子の正準化番号は３で、入力
番号４の原子の正準化番号は２である。このため、入力
番号４の原子を選択する。そして、Ｓ９２８の処理を行
い、入力番号４の原子に結合した入力番号５の原子に正
準化番号ｋ＝４を与える。
【０１７２】同様の処理を繰り返すことにより、入力番
号１の原子に正準化番号１が、入力番号６の原子に正準
化番号６がそれぞれ与えられる。また、入力番号７の原
子に正準化番号７が、入力番号８の原子に正準化番号８
がそれぞれ与えられる。
【０１７３】その後、Ｓ９２３の処理を行い、この段階
では全ての原子の正準化番号が求められているので処理
を終了する。その結果、図３４に示すような正準化番号
が得られる。
【０１７４】次に、図３５のフローチャートを用いて、
Ｓ９３０で呼び出される正準化データ作成処理部９１ｄ
の処理について説明する。この処理は、まず、図３６
（ａ）〜（ｂ）に示すように入力番号を正準化番号に置
き換えて、結合表８１を書き替える（Ｓ９３１）。そし
て、この結合表８１に基づいて、各原子に対して３種類
のデータ（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）を求める（Ｓ９３２）。
ここで、Ｐi は正準化番号ｉ（ｉ＞１）の原子に結合し
て、番号が最小である原子の正準化番号である。また、
Ｔi は正準化番号ｉ（ｉ＞１）の原子と正準化番号Ｐi
の原子との結合の種類記号（この例では単結合は一、二
重結合は＝、三重結合は＃、芳香結合は％など）であ
る。さらに、Ｓi は正準化番号ｉ（ｉ＞０）の原子の種
類記号（この例では元素番号）である。
【０１７５】具体的には、まず、正準化番号１の原子の
元素番号について、原子テーブル８１ｇを参照して調べ
る。その結果、Ｓ1 ＝“Ｎ”が得られる。次に、正準化
番号２の原子と結合した原子について、原子対テーブル
８１ｈを参照して調べる。その結果、正準化番号１，４
の原子が得られる。これらの原子の中で最小の正準化番
号は１なので、Ｐ2 ＝１となる。そして、正準化番号２
の原子と正準化番号１の原子との結合は単結合なので、
Ｔ2 ＝“−”となる。さらに、原子テーブル８１ｇを参
照することにより、Ｓ2 ＝“Ｃ”が得られる。
【０１７６】次に、正準化番号３の原子と結合した原子
について、原子対テーブル８１ｈを参照して調べる。そ
の結果、正準化番号１，５の原子が得られる。これらの
原子の中で最小の正準化番号は１なので、Ｐ3 ＝１とな
る。そして、正準化番号３の原子と正準化番号１の原子
との結合は二重結合なので、Ｔ3 ＝“＝”となる。さら
に、原子テーブル８１ｇを参照することにより、Ｓ3 ＝
“Ｃ”が得られる。以下同様に処理を行うことにより、
Ｐ4 ＝２、Ｐ5 ＝３、Ｐ6 ＝４、Ｐ7 ＝４、Ｐ8 ＝５、
Ｔ4 〜Ｔ8 ＝“−”、Ｓ4 〜Ｓ8 ＝“Ｃ”が得られる。
【０１７７】次に、Ｓ９３２の処理でＴi を求めた際に
参照されなかった結合原子対を抽出する（Ｓ９３３）。
この処理は原子対テーブル８１ｈを参照して行う。その
結果、正準化番号５の原子と正準化番号６の原子との結
合原子対が抽出される。そして、抽出された結合原子対
に対して３種類のデータ（Ｒ1 j ，Ｒ2 j ，Ｈj ）を求
める（Ｓ９３４）。ここで、Ｒ1 j ，Ｒ2 j はその結合
を構成する２つの原子の正準化番号である。また、Ｈj
はその結合の種類記号（この例ではＴi と同じものを用
いる）である。なお、Ｒ1 j とＲ2 j とは、Ｒ1 j ＞Ｒ
2 j の関係を満たすものとする。また、別の結合原子対
（Ｒ1 k ，Ｒ2 k ）とは、Ｒ1 j ≦Ｒ1 k の関係を満た
すか、Ｒ1 j ＝Ｒ1 k で且つＲ2 j ＜Ｒ2 k の関係を満
たすものとする。
【０１７８】以上の処理によって、図３７に示す正準化
木構造データが作成できた。
【０１７９】次に、Ｓ９３２及びＳ９３４の処理で求め
た各データを一列に並べて、正準化データを作成する
（Ｓ９３５）。即ち、原子の種類記号及び結合の種類記
号と異なる区切り記号Ｆを定義して、Ｓ９３２及びＳ９
３４の処理で求めた各データを以下のように並べる。
【０１８０】Ｓ1 、Ｐ2 、Ｔ2 、Ｓ2 、Ｐ3 、Ｔ3 、Ｓ
3 、Ｐ4 、Ｔ4 、Ｓ4 、……、ＰN、ＴN 、ＳN 、Ｆ、
Ｒ1 1 、Ｈ1 、Ｒ2 1 、Ｆ、Ｒ1 2 、Ｈ2 、Ｒ2 2 、…
…、Ｆ、Ｒ1 M 、ＨM 、Ｒ2 M 、Ｆ ここで、Ｎは総原子数であり、ＭはＳ９３４の抽出され
た結合原子対の総数である。
【０１８１】このようにして得られたデータ列は、化合
物の構造と一意的に対応する正準化データである。具体
的には、区切り記号Ｆを“／”として、得られたデータ
を所定の順番に並べると、 “Ｎ１＝Ｃ１＝Ｃ２−Ｃ３−Ｃ４−Ｃ４−Ｃ５−Ｃ／５
−６／” が得られる。そして、この正準化データは化合物情報フ
ァイル３１に書き込まれて保存される（Ｓ９３６）。そ
の後、処理は終了する。
【０１８２】なお、本発明にかかる正準化データ作成手
段及び方法は上記実施形態に限定されることなく、本発
明の趣旨から逸脱しない範囲内において、例えば以下の
ように変更することも可能である。
【０１８３】（１）上記実施形態では、正準化データと
して原子の種類記号Ｓi を含めたデータ列を用いている
が、最も出現頻度が高い原子の種類記号（通常は炭素の
Ｃ）をデータ列から除いてもよい。即ち、上述した正準
化データから炭素Ｃの記号を省略することにより、 “Ｎ１−１＝２−３−４−４−５−／５−６／” が得られる。このようにしてデータ列を短くすることに
より、化合物情報ファイル３１に書き込まれるデータ量
を削減することができる。
【０１８４】（２）正準化番号付与処理部９１ｃでは、
Ｓ９２９の処理でクラス番号Ｃi fが最大の未決原子が複
数選択された場合に、次の処理を追加してもよい。
【０１８５】（ａ）クラス番号Ｃi fが最大の未決原子が
環状構造部分に属していない場合には、複数の未決原子
の中から任意の未決原子を選択して、この未決原子の正
準化番号をｋとする。その後に処理をＳ９２３に戻す。
【０１８６】（ｂ）クラス番号Ｃi fが最大の未決原子が
環状構造部分に属している場合には、Ｓ９２９で選択さ
れた未決原子（以下、候補原子という）とこれらの候補
原子に結合した既決原子との結合を切断した構造につい
て、各候補原子に対して次のベクトル量を定義する。
【０１８７】ｍik：候補原子ｉと、正準化番号ｋである
原子間の最小結合数 予め、この属性について優先順位を定めておき、最も優
先順位の高い原子ｉを選択して、その原子の正準化番号
をｋとする。その後に処理をＳ９２３に戻す。
【０１８８】ここで、原子の属性値における優先順位の
判定基準は以下の通りである。まず、非ベクトル量につ
いては優先順位の大小による。また、ベクトル量につい
ては２つのベクトルｉ，ｋの要素が属性Ｖij，Ｖkjのと
き、Ｖij≠Ｖkjである要素の中で最小のｊにおける大小
を優先順位の判定基準とする。このような判定基準を用
いることにより、属性ｂij，ｄij，Ｖij n ，ｍijの優先
順位を定めることができる。また複数の属性によって優
先順位が定まる場合には、予め、属性間にも優先順位を
定めておき、優先順位の高い属性での判定を優先する。
【０１８９】なお、上記の本発明にかかる正準化データ
作成方法によって図３８（ａ）に示すＣ60分子の正準化
データを求めたところ、Ｃ60分子の構造を一意的に特定
する正準化データ（図３８（ｂ））を僅か１．５秒で得
ることができた。これに対して、原子を等価原子毎に分
類する処理過程を経ないモルガン・アルゴリズムによっ
て同一性能の情報処理装置を用いてＣ60分子の正準化デ
ータを求めたところ、正準化データを得るのに５５０秒
を要した。従って、本発明において上記本発明にかかる
正準化データ作成手段及び方法を採用すれば、本発明に
かかる生化学情報処理の速度が大幅に向上する。
【０１９０】なお、本発明は上記実施例に限定されるこ
となく、種々の変形が可能である。例えば、酵素情報フ
ァイル３２の参照データの欄に、酵素の構造を規定する
アミノ酸配列、あるいは塩基配列を記録してもよい。同
様に、受容体情報ファイル３６の参照データの欄に、受
容体の構造を規定するアミノ酸配列、あるいは塩基配列
を記録してもよい。これらの配列を参照データに記録す
ることにより、遺伝情報と関連させて利用することも可
能となる。
【０１９１】また、特定の酵素の機能に異常があると、
それが代謝異常病として知られる疾患となることがあ
る。そこで、酵素情報ファイル３２の参照データの欄
に、異常酵素の情報を記録して、代謝異常病の研究に用
いてもよい。
【０１９２】さらに、化合物情報ファイル３１、酵素情
報ファイル３２、相互関連情報ファイル３３に、生体に
異物（本来、生体にない物質）が投与されることにより
生じるその異物の変換の情報を記録してもよい。
【０１９３】さらにまた、化合物情報ファイル３１、酵
素情報ファイル３２、相互関連情報ファイル３３に、酵
素や微生物による物質の生産や変換に関する情報を記録
してもよい。
【０１９４】さらにまた、医薬、農薬には、それ自身が
酵素阻害剤やアゴニスト（作動物質）、アンタゴニスト
（拮抗物質）となっているものも多い。そこで、化合物
情報ファイル３１に、医薬、農薬の構造や関連する情報
を、生体関連物質として記録してもよい。
【０１９５】さらにまた、化合物情報ファイル３１の参
照データの欄に、化学物質の毒性等、安全性に関する情
報を記録して、生体系での物質の挙動と関連させてなが
ら利用してもよい。
【０１９６】さらにまた、化合物情報ファイル３１の参
照データの欄に、栄養学分野の情報を記録してもよい。
【０１９７】さらにまた、反応経路の表示法について
は、例えば、全反応経路図をあらかじめ作成し、任意の
位置や縮尺で表示し、画面を上下左右にスクロールする
こにより、希望する反応経路部分を表示してもよい。化
合物の検索では、部分構造による検索（部分一致検
索）、あるいは類似性に基づく検索等も採用できる。ま
た、反応経路の検索において、例えばステロイドの代謝
のような特定の化合物群を対象としてもよい。
【０１９８】本処理装置または本処理方法は化合物デー
タベースシステムとしても用いることができ、物性値等
の化合物データに基づく検索も可能である。また、化合
物の三次元構造データに基づき、分子軌道計算や分子力
場計算等の理論化学計算機能を、本処理装置または本処
理方法に付加することもできる。本処理装置あるいは本
処理方法を用いれば、特定の酵素が阻害、失活された場
合、もしくは酵素が欠損している場合の反応経路も知る
ことができる。
【０１９９】
【発明の効果】以上詳細に説明したように、本発明の第
１の生化学情報処理装置、及び本発明の第１の生化学情
報処理方法であれば、反応式の検出、及び受容体情報の
検出を効率よく行うことができる。
【０２００】反応式の検出は、まず、化合物情報ファイ
ルに格納された一覧表が参照され、正準化データに対応
する化合物番号が読み出される。次に、この化合物番号
に基づいて、相互関連情報ファイルが参照され、この化
合物が基質あるいは生成物となる酵素番号が読み出され
る。さらに、この酵素番号に基づいて、酵素情報ファイ
ルが参照され、この酵素と前記化合物と共に反応系を構
成する他の化合物の番号、及び前記酵素についての付加
情報が読み出される。そして、このように読み出された
化合物番号、前記の他の化合物番号及び酵素番号とか
ら、この化合物が関わる化学反応式が得られる。
【０２０１】このように、化合物情報ファイル、酵素情
報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照す
ることにより、化合物の構造をキーとした場合でも、こ
の化合物が基質或いは生成物となる酵素についての各種
情報を効率的に獲得することができる。
【０２０２】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が基質或いは生成物となる酵素との関係を
示す一覧表が格納されているので、基質である化合物
と、生成物である化合物と、基質から生成物に変化させ
る酵素との関係が容易に検索でき、効率的に化学反応式
を得ることができる。
【０２０３】また、受容体情報の検出は、まず、化合物
情報ファイルに格納された一覧表が参照され、正準化デ
ータに対応する化合物番号が読み出される。次に、この
化合物番号に基づいて、相互関連情報ファイルが参照さ
れ、この化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容
体番号が読み出される。さらに、この受容体番号に基づ
いて、受容体情報ファイルが参照され、この受容体につ
いての少なくとも付加情報が読み出される。そして、こ
のように読み出された受容体についての少なくとも付加
情報が表示手段に表示される。
【０２０４】このように、化合物情報ファイル、受容体
情報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照
することにより、化合物の構造をキーとした場合でも、
この化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体に
ついての各種情報を効率的に獲得することができる。
【０２０５】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体
との関係を示す一覧表が格納されているので、作動物質
である化合物と、拮抗物質である化合物と、受容体との
関係が容易に検索でき、効率的に受容体についての各種
情報を得ることができる。
【０２０６】また、本発明の第２の生化学情報処理装
置、及び本発明の第２の生化学情報処理方法であれば、
反応式の検出、受容体情報の検出、及び反応経路の検出
を効率よく行うことができる。
【０２０７】反応式の検出は、まず、化合物情報ファイ
ルに格納された一覧表が参照され、正準化データに対応
する化合物番号が読み出される。次に、この化合物番号
に基づいて、相互関連情報ファイルが参照され、この化
合物が基質あるいは生成物となる酵素番号が読み出され
る。さらに、この酵素番号に基づいて、酵素情報ファイ
ルが参照され、この酵素と前記化合物と共に反応系を構
成する他の化合物の番号、及び前記酵素についての付加
情報が読み出される。そして、このように読み出された
化合物番号、前記の他の化合物番号び酵素番号とから、
この化合物が関わる化学反応式が得られる。
【０２０８】このように、化合物情報ファイル、酵素情
報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照す
ることにより、化合物の構造をキーとした場合でも、こ
の化合物が基質或いは生成物となる酵素についての各種
情報を効率的に獲得することができる。
【０２０９】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が基質或いは生成物となる酵素との関係を
示す一覧表が格納されているので、基質である化合物
と、生成物である化合物と、基質から生成物に変化させ
る酵素との関係が容易に検索でき、効率的に化学反応式
を得ることができる。
【０２１０】また、受容体情報の検出は、まず、化合物
情報ファイルに格納された一覧表が参照され、正準化デ
ータに対応する化合物番号が読み出される。次に、この
化合物番号に基づいて、相互関連情報ファイルが参照さ
れ、この化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容
体番号が読み出される。さらに、この受容体番号に基づ
いて、受容体情報ファイルが参照され、この受容体につ
いての少なくとも付加情報が読み出される。そして、こ
のように読み出された受容体についての少なくとも付加
情報が表示手段に表示される。
【０２１１】このように、化合物情報ファイル、受容体
情報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照
することにより、化合物の構造をキーとした場合でも、
この化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体に
ついての各種情報を効率的に獲得することができる。
【０２１２】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体
との関係を示す一覧表が格納されているので、作動物質
である化合物と、拮抗物質である化合物と、受容体との
関係が容易に検索でき、効率的に受容体についての各種
情報を得ることができる。
【０２１３】さらに、反応経路の検出は、まず、化合物
情報ファイルに格納された一覧表が参照され、正準化デ
ータに対応する化合物番号が読み出される。次に、この
化合物番号に基づいて、相互関連情報ファイルが参照さ
れ、この化合物を基質とすると酵素番号とこの化合物を
生成物とする酵素番号とがそれぞれ読み出される。さら
に、これらの酵素番号に基づいて、酵素情報ファイルが
参照され、酵素ごとに基質である化合物番号と生成物で
ある化合物番号とが読み出される。相互関連情報ファイ
ルと酵素情報ファイルとからの呼び出しは、繰り返して
行われる。そして、このように読み出された複数の化合
物番号及び複数の酵素番号から、これらの化合物の反応
経路が得られる。
【０２１４】このように、化合物情報ファイル、酵素情
報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照す
ることにより、効率的に複数の化合物が関わる反応経路
を検索することができる。
【０２１５】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が基質或いは生成物となる酵素との関係を
示す一覧表が格納されているので、基質である化合物
と、生成物である化合物と、基質から生成物に変化させ
る酵素との関係が容易に検索でき、効率的に複数の化合
物が関わる反応経路を得ることができる。
【０２１６】また、本発明の第３の生化学情報処理装
置、及び本発明の第３の生化学情報処理方法であれば、
受容体情報の検出及び反応経路の検出を効率よく行うこ
とができる。
【０２１７】受容体情報の検出は、まず、化合物情報フ
ァイルに格納された一覧表が参照され、正準化データに
対応する化合物番号が読み出される。次に、この化合物
番号に基づいて、相互関連情報ファイルが参照され、こ
の化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体番号
が読み出される。さらに、この受容体番号に基づいて、
受容体情報ファイルが参照され、この受容体についての
少なくとも付加情報が読み出される。そして、このよう
に読み出された受容体についての少なくとも付加情報が
表示手段に表示される。
【０２１８】このように、化合物情報ファイル、受容体
情報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照
することにより、化合物の構造をキーとした場合でも、
この化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体に
ついての各種情報を効率的に獲得することができる。
【０２１９】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体
との関係を示す一覧表が格納されているので、作動物質
である化合物と、拮抗物質である化合物と、受容体との
関係が容易に検索でき、効率的に受容体についての各種
情報を得ることができる。
【０２２０】さらに、反応経路の検出は、まず、化合物
情報ファイルに格納された一覧表が参照され、正準化デ
ータに対応する化合物番号が読み出される。次に、この
化合物番号に基づいて、相互関連情報ファイルが参照さ
れ、この化合物を基質とすると酵素番号とこの化合物を
生成物とする酵素番号とがそれぞれ読み出される。さら
に、これらの酵素番号に基づいて、酵素情報ファイルが
参照され、酵素ごとに基質である化合物番号と生成物で
ある化合物番号とが読み出される。相互関連情報ファイ
ルと酵素情報ファイルとからの呼び出しは、繰り返して
行われる。そして、このように読み出された複数の化合
物番号及び複数の酵素番号から、これらの化合物の反応
経路が得られる。
【０２２１】このように、化合物情報ファイル、酵素情
報ファイル、及び相互関連情報ファイルを相互に参照す
ることにより、効率的に複数の化合物が関わる反応経路
を検索することができる。
【０２２２】特に、相互関連情報ファイルには、化合物
とこの化合物が基質或いは生成物となる酵素との関係を
示す一覧表が格納されているので、基質である化合物
と、生成物である化合物と、基質から生成物に変化させ
る酵素との関係が容易に検索でき、効率的に複数の化合
物が関わる反応経路を得ることができる。
【０２２３】さらに、本発明にかかる正準化データ作成
手段（正準化データ作成プログラム）を採用すれば、入
力手段で受け付けられた各原子についての固有データ及
び原子間の結合対データは正準化データ作成手段に与え
られる。そして、正準化データ作成手段では、これらの
データに基づいて正準化データが短時間に作成される。
また、本発明にかかる正準化データ作成方法によれば、
化合物を構成する各原子についての固有データ及び原子
間の結合対データに基づいて正準化データが短時間に作
成される。このように、本発明にかかる正準化データ作
成手段（正準化データ作成プログラム）及び正準化デー
タ作成方法で作成された正準化データは、非常に短い文
字・数字・記号列であり、少ない記憶領域で正準化デー
タを保存することができる。そのため、本発明にかかる
正準化データ作成手段（正準化データ作成プログラム）
及び正準化データ作成方法を化合物／反応データベース
システムで利用すれば、化合物／反応データベースシス
テムの記憶領域の使用量を大幅に削減させることができ
る。
【図面の簡単な説明】
【図１】本実施例に係る生化学情報処理装置の構成を示
すブロック図である。
【図２】化合物番号Ｃ1 の化合物が化合物番号Ｃ7 の化
合物に変化するまでの経路を示す反応経路図の一例であ
る。
【図３】化合物情報ファイルの構成を示す図である。
【図４】酵素情報ファイルの構成を示す図である。
【図５】受容体情報ファイルの構成を示す図である。
【図６】相互関連情報ファイルの構成を示す図である。
【図７】生化学情報処理装置内でのデータの流れを示す
図である。
【図８】画像データ、結合表データ、及び正準化データ
の具体例を示す図である。
【図９】画像データ、結合表データ、及び正準化データ
の具体例を示す図である。
【図１０】画像データと正準化データの関係を示す図で
ある。
【図１１】メインルーチンの処理の流れを示すフローチ
ャートである。
【図１２】３次元表示ルーチンの処理の流れを示すフロ
ーチャートである。
【図１３】反応式検出ルーチンの処理の流れを示すフロ
ーチャートである。
【図１４】反応経路検出ルーチンの処理の流れを示すフ
ローチャートである。
【図１５】反応経路検出ルーチンの処理の流れを示すフ
ローチャートである。
【図１６】ディスプレイへの表示例を示す図である。
【図１７】ディスプレイへの表示例を示す図である。
【図１８】（ａ）は結合表の原子テーブルの内容を示す
図であり、（ｂ）は結合表の原子対テーブルの内容を示
す図である。
【図１９】正準化データ作成装置の動作の概要を示す概
略図である。
【図２０】メインルーチンの処理の概要を示すフローチ
ャートである。
【図２１】構成原子分類ルーチンの処理の概要を示すフ
ローチャートである。
【図２２】（ａ）は結合表の原子テーブルの内容を示す
図であり、（ｂ）は結合表の原子対テーブルの内容を示
す図である。
【図２３】３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラ
ハイドロピリジンを構成する各原子と入力番号との関係
を示す図である。
【図２４】（ａ）〜（ｂ）はそれぞれ参照テーブルのデ
ータ内容を示す図である。
【図２５】３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラ
ハイドロピリジンを構成する各原子に与えられた３種類
の属性（ａi ，ｂij，ｄij）を示す図である。
【図２６】（ａ）〜（ｂ）はそれぞれ参照テーブルのデ
ータ内容を示す図である。
【図２７】参照テーブルのデータ内容を示す図である。
【図２８】（ａ）〜（ｂ）はそれぞれ参照テーブルのデ
ータ内容を示す図である。
【図２９】（ａ）〜（ｂ）はそれぞれ参照テーブルのデ
ータ内容を示す図である。
【図３０】（ａ）〜（ｃ）はそれぞれ３，５−ジメチル
−２，３，４，５−テトラハイドロピリジンを構成する
各原子とクラス番号との関係を示す図である。
【図３１】３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラ
ハイドロピリジンを構成する各原子に与えられた属性Ｖ
ij 1 を示す図である。
【図３２】３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラ
ハイドロピリジンを構成する各原子に与えられた属性Ｖ
ij 2 を示す図である。
【図３３】正準化番号付与ルーチンの処理の概要を示す
フローチャートである。
【図３４】３，５−ジメチル−２，３，４，５−テトラ
ハイドロピリジンを構成する各原子と正準化番号との関
係を示す図である。
【図３５】正準化データ作成ルーチンの処理の概要を示
すフローチャートである。
【図３６】（ａ）は結合表の原子テーブルの内容を示す
図であり、（ｂ）は結合表の原子対テーブルの内容を示
す図である。
【図３７】正準化木構造データのデータ内容を示す図で
ある。
【図３８】（ａ）はＣ60の分子構造図であり、（ｂ）は
その正準化データを示す図である。
【図３９】本実施例に係る生化学情報処理装置の構成を
示すブロック図である。
【符号の説明】
１…生化学情報処理装置、２５…反応式検出ルーチン
（反応式検出手段）、２５ａ…第１の処理部、２５ｂ…
第２の処理部、２５ｃ…第３の処理部、２５ｄ…第４の
処理部、２６…受容体情報検出ルーチン（受容体情報検
出手段）、２６ａ…第５の処理部、２６ｂ…第６の処理
部、２６ｃ…第７の処理部、２６ｄ…第８の処理部、２
７…反応経路検出ルーチン（反応経路検出手段）、２７
ａ…第９の処理部、２７ｂ…第１０の処理部、２７ｃ…
第１１の処理部、２７ｄ…第１２の処理部、２７ｅ…第
１３の処理部、３０…第２記憶装置（記憶手段）、３１
…化合物情報ファイル、３２…酵素情報ファイル、３３
…相互関連情報ファイル、３６…受容体情報ファイル、
４０…ディスプレイ（表示手段）、５０…入力装置（入
力手段）、９１…正準化データ作成ルーチン、９１ａ…
正準化データ作成メイン処理部、９１ｂ…構成原子分類
処理部、９１ｃ…正準化番号付与処理部、９１ｄ…正準
化データ作成処理部。

Claims (10)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 化合物、酵素及び受容体についての生化
    学情報が記憶された記憶手段と、 前記生化学情報を表す画像データまたは前記生化学情報
    を表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、 基質および／または生成物である化合物についてのデー
    タが前記入力手段で受け付けられた場合に、このデータ
    に基づいて前記化合物の関わる化学反応式を検出する反
    応式検出手段と、 化合物についてのデータが前記入力手段で受け付けられ
    た場合に、このデータに基づいて前記化合物が作動物質
    および／または拮抗物質となる受容体についての付加情
    報を検出する受容体情報検出手段と、 少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手段と
    を備える生化学情報処理装置であって、 前記記憶手段は、 化合物の番号と当該化合物に対応する正準化データとの
    関係を示す一覧表、及び当該化合物についての付加情報
    が格納された化合物情報ファイルと、 酵素の番号と当該酵素の基質である化合物の番号と当該
    酵素による生成物である化合物の番号との関係を示す一
    覧表、及び当該酵素についての付加情報が格納された酵
    素情報ファイルと、 受容体の番号と当該受容体の作動物質および／または拮
    抗物質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び
    当該受容体についての付加情報が格納された受容体情報
    ファイルと、 少なくとも、化合物の番号と当該化合物が基質となる酵
    素の番号と当該化合物が生成物となる酵素の番号と当該
    化合物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮
    抗物質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納
    された相互関連情報ファイルとを備え、 前記反応式検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第１の処理部
    と、 前記第１の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番号を前
    記相互関連情報ファイルから読み出す第２の処理部と、 前記第２の処理部で読み出された番号の酵素と前記化合
    物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前記
    酵素についての付加情報を前記酵素情報ファイルから読
    み出す第３の処理部と、 前記第１の処理部で読み出された化合物の番号と、前記
    第２の処理部で読み出された酵素の番号と、前記第３の
    処理部で読み出された他の化合物の番号とから、前記入
    力手段で受け付けられた化合物の反応式図を前記表示手
    段に表示し、さらに、前記第３の処理部で読み出された
    酵素についての付加情報を前記表示手段に表示する第４
    の処理部とを備え、 前記受容体情報検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第５の処理部
    と、 前記第５の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体の
    番号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第６の処
    理部と、 前記第６の処理部で読み出された番号の受容体について
    の少なくとも付加情報を前記受容体情報ファイルから読
    み出す第７の処理部と、 前記第７の処理部で読み出された受容体についての少な
    くとも付加情報を前記表示手段に表示する第８の処理部
    とを備えることを特徴とする生化学情報処理装置。
  2. 【請求項２】 化合物、酵素及び受容体についての生化
    学情報が記憶された記憶手段と、 前記生化学情報を表す画像データまたは前記生化学情報
    を表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、 基質および／または生成物である化合物についてのデー
    タが前記入力手段で受け付けられた場合に、このデータ
    に基づいて前記化合物の関わる化学反応式を検出する反
    応式検出手段と、 化合物についてのデータが前記入力手段で受け付けられ
    た場合に、このデータに基づいて前記化合物が作動物質
    および／または拮抗物質となる受容体についての付加情
    報を検出する受容体情報検出手段と、 反応経路を構成する複数の化合物の中から選択される所
    定の化合物についてのデータが前記入力手段で受け付け
    られた場合に、このデータに基づいて前記複数の化合物
    の反応経路を検出する反応経路検出手段と、 少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手段と
    を備える生化学情報処理装置であって、 前記記憶手段は、 化合物の番号と当該化合物に対応する正準化データとの
    関係を示す一覧表、及び当該化合物についての付加情報
    が格納された化合物情報ファイルと、 酵素の番号と当該酵素の基質である化合物の番号と当該
    酵素による生成物である化合物の番号との関係を示す一
    覧表、及び当該酵素についての付加情報が格納された酵
    素情報ファイルと、 受容体の番号と当該受容体の作動物質および／または拮
    抗物質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び
    当該受容体についての付加情報が格納された受容体情報
    ファイルと、 少なくとも、化合物の番号と当該化合物が基質となる酵
    素の番号と当該化合物が生成物となる酵素の番号と当該
    化合物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮
    抗物質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納
    された相互関連情報ファイルとを備え、 前記反応式検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらに前記正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第１の処理部
    と、 前記第１の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番号を前
    記相互関連情報ファイルから読み出す第２の処理部と、 前記第２の処理部で読み出された番号の酵素と前記化合
    物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前記
    酵素についての付加情報を前記酵素情報ファイルから読
    み出す第３の処理部と、 前記第１の処理部で読み出された化合物の番号と、前記
    第２の処理部で読み出された酵素の番号と、前記第３の
    処理部で読み出された他の化合物の番号とから、前記入
    力手段で受け付けられた化合物の反応式図を前記表示手
    段に表示し、さらに、前記第３の処理部で読み出された
    酵素についての付加情報を前記表示手段に表示する第４
    の処理部とを備え、 前記受容体情報検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第５の処理部
    と、 前記第５の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体の
    番号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第６の処
    理部と、 前記第６の処理部で読み出された番号の受容体について
    の少なくとも付加情報を前記受容体情報ファイルから読
    み出す第７の処理部と、 前記第７の処理部で読み出された受容体についての少な
    くとも付加情報を前記表示手段に表示する第８の処理部
    とを備え、 前記反応経路検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第９の処理部
    と、 前記第９の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、この化合物を基質とする酵素の番号とこの化合物を
    生成物とする酵素の番号とを前記相互関連情報ファイル
    から読み出す第１０の処理部と、 前記第１０の処理部で読み出された酵素の番号に基づい
    て、この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素によ
    る生成物である化合物の番号を前記酵素情報ファイルか
    ら読み出す第１１の処理部と、 前記第１０の処理部による処理と前記第１１の処理部に
    よる処理とを繰り返し、所定反応経路内の化合物及び酵
    素を検索する第１２の処理部と、 前記第１０の処理部で読み出された酵素の番号と、前記
    第１１の処理部で読み出された化合物の番号とから、こ
    れらの化合物の反応式図を反応経路に沿って前記表示手
    段に表示する第１３の処理部とを備えることを特徴とす
    る生化学情報処理装置。
  3. 【請求項３】 化合物、酵素及び受容体についての生化
    学情報が記憶された記憶手段と、 前記生化学情報を表す画像データまたは前記生化学情報
    を表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、 化合物についてのデータが前記入力手段で受け付けられ
    た場合に、このデータに基づいて前記化合物が作動物質
    および／または拮抗物質となる受容体についての付加情
    報を検出する受容体情報検出手段と、 反応経路を構成する複数の化合物の中から選択される所
    定の化合物についてのデータが前記入力手段で受け付け
    られた場合に、このデータに基づいて前記複数の化合物
    の反応経路を検出する反応経路検出手段と、 少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手段と
    を備える生化学情報処理装置であって、 前記記憶手段は、 化合物の番号と当該化合物に対応する正準化データとの
    関係を示す一覧表、及び当該化合物についての付加情報
    が格納された化合物情報ファイルと、 酵素の番号と当該酵素の基質である化合物の番号と当該
    酵素による生成物である化合物の番号との関係を示す一
    覧表、及び当該酵素についての付加情報が格納された酵
    素情報ファイルと、 受容体の番号と当該受容体の作動物質および／または拮
    抗物質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び
    当該受容体についての付加情報が格納された受容体情報
    ファイルと、 少なくとも、化合物の番号と当該化合物が基質となる酵
    素の番号と当該化合物が生成物となる酵素の番号と当該
    化合物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮
    抗物質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納
    された相互関連情報ファイルとを備え、 前記受容体情報検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第５の処理部
    と、 前記第５の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体の
    番号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第６の処
    理部と、 前記第６の処理部で読み出された番号の受容体について
    の少なくとも付加情報を前記受容体情報ファイルから読
    み出す第７の処理部と、 前記第７の処理部で読み出された受容体についての少な
    くとも付加情報を前記表示手段に表示する第８の処理部
    とを備え、 前記反応経路検出手段は、 前記入力手段で受け付けられた化合物についてのデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第９の処理部
    と、 前記第９の処理部で読み出された化合物の番号に基づい
    て、この化合物を基質とする酵素の番号とこの化合物を
    生成物とする酵素の番号とを前記相互関連情報ファイル
    から読み出す第１０の処理部と、 前記第１０の処理部で読み出された酵素の番号に基づい
    て、この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素によ
    る生成物である化合物の番号を前記酵素情報ファイルか
    ら読み出す第１１の処理部と、 前記第１０の処理部による処理と前記第１１の処理部に
    よる処理とを繰り返し、所定反応経路内の化合物及び酵
    素を検索する第１２の処理部と、 前記第１０の処理部で読み出された酵素の番号と、前記
    第１１の処理部で読み出された化合物の番号とから、こ
    れらの化合物の反応式図を反応経路に沿って前記表示手
    段に表示する第１３の処理部とを備えることを特徴とす
    る生化学情報処理装置。
  4. 【請求項４】 前記入力手段が、化合物を構成する各原
    子についての固有データ及び原子間の結合対データの入
    力を受け付け；前記生化学情報処理装置が、前記入力手
    段で受け付けられた各データに基づいて、前記化合物の
    化学構造を一意的に特定できる正準化データを作成する
    正準化データ作成手段を更に備えており；前記正準化デ
    ータ作成手段は、 前記入力手段で受け付けられた各データに基づいて、各
    原子を等価原子ごとに別のクラスに分類して、クラスご
    とに異なるクラス番号を各原子に与える構成原子分類処
    理部と、 前記構成原子分類処理部で各原子に与えられたクラス番
    号に基づいて、前記化合物の構造と一意的に対応した正
    準化番号を各原子に与える正準化番号付与処理部と、 前記正準化番号付与処理部で各原子に与えられた正準化
    番号に基づいて、前記正準化データを作成する正準化デ
    ータ作成処理部とを備える；請求項１〜３のうちのいず
    れかに記載の生化学情報処理装置。
  5. 【請求項５】 前記構成原子分類処理部は、 各原子に３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）を与え、こ
    れらの属性が一つでも異なる原子は非等価であると判定
    できることを利用して、各原子を等価原子毎に異なるク
    ラス番号を付与しており、 前記３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）の中で、ａi は
    入力番号ｉの原子の種類番号であり、ｂijは入力番号ｉ
    の原子に隣接する結合のうち、その種類番号がｊである
    結合の数であり、ｄijは入力番号ｉの原子から最短経路
    によりｊ個の結合を経て巡れる道筋の数であり；前記正
    準化番号付与処理部は、 正準化番号を１から昇順に各原子に与える過程におい
    て、前記クラス番号の優先順位が最高である原子に正準
    化番号１を与え、以降正準化番号ｎまでが付与されてい
    る時、既に正準化番号が与えられている原子でかつ未だ
    正準化番号が与えられていない原子が結合している原子
    の中で正準化番号が最小である原子を選び、その原子に
    結合している未だ正準化番号が与えられていない原子の
    中で前記クラス番号の優先順位が最高である原子に正準
    化番号ｎ＋１を与えており；前記正準化データ作成処理
    部は、 各原子に３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）を与えて、
    これらの属性を一列に並べることによって前記正準化デ
    ータを作成しており、 前記３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）の中で、Ｐi は
    正準化番号ｉの原子に結合し且つ正準化番号が最小の原
    子の正準化番号であり、Ｔi は正準化番号ｉの原子と正
    準化番号Ｐi の原子との結合の種類記号であり、Ｓi は
    正準化番号ｉの原子の種類記号である；請求項４に記載
    の生化学情報処理装置。
  6. 【請求項６】 化合物、酵素及び受容体についての生化
    学情報が記憶された記憶手段と、 前記生化学情報を表す画像データまたは前記生化学情報
    を表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、 少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手段と
    を備える情報処理装置を用いた生化学情報処理方法であ
    って、 前記記憶手段は、 化合物の番号と当該化合物に対応する正準化データとの
    関係を示す一覧表、及び当該化合物についての付加情報
    が格納された化合物情報ファイルと、 酵素の番号と当該酵素の基質である化合物の番号と当該
    酵素による生成物である化合物の番号との関係を示す一
    覧表、及び当該酵素についての付加情報が格納された酵
    素情報ファイルと、 受容体の番号と当該受容体の作動物質および／または拮
    抗物質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び
    当該受容体についての付加情報が格納された受容体情報
    ファイルと、 少なくとも、化合物の番号と当該化合物が基質となる酵
    素の番号と当該化合物が生成物となる酵素の番号と当該
    化合物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮
    抗物質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納
    された相互関連情報ファイルとを備え、 基質および／または生成物である化合物についてのデー
    タが前記入力手段で受け付けられた場合に、このデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第１のステップ
    と、 前記第１のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、この化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番
    号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第２のステ
    ップと、 前記第２のステップで読み出された番号の酵素と前記化
    合物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前
    記酵素についての付加情報を、前記酵素情報ファイルか
    ら読み出す第３のステップと、 前記第１のステップで読み出された化合物の番号と、前
    記第２のステップで読み出された酵素の番号と、前記第
    ３のステップで読み出された他の化合物の番号とから、
    前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式図を前記
    表示手段に表示し、さらに、前記第３のステップで読み
    出された酵素についての付加情報を前記表示手段に表示
    する第４のステップと、 化合物についてのデータが前記入力手段で受け付けられ
    た場合に、このデータから当該化合物の化学構造を一意
    的に示す前記正準化データを作成し、さらにこの正準化
    データに基づいて前記化合物情報ファイルを検索して、
    前記正準化データが前記化合物情報ファイルに存在する
    場合に、前記正準化データに対応する化合物の番号を読
    み出す第５のステップと、 前記第５のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体
    の番号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第６の
    ステップと、 前記第６のステップで読み出された番号の受容体につい
    ての少なくとも付加情報を前記受容体情報ファイルから
    読み出す第７のステップと、 前記第７のステップで読み出された受容体についての少
    なくとも付加情報を前記表示手段に表示する第８のステ
    ップとを備えることを特徴する生化学情報処理方法。
  7. 【請求項７】 化合物、酵素及び受容体についての生化
    学情報が記憶された記憶手段と、 前記生化学情報を表す画像データまたは前記生化学情報
    を表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、 少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手段と
    を備える情報処理装置を用いた生化学情報処理方法であ
    って、 前記記憶手段は、 化合物の番号と当該化合物に対応する正準化データとの
    関係を示す一覧表、及び当該化合物についての付加情報
    が格納された化合物情報ファイルと、 酵素の番号と当該酵素の基質である化合物の番号と当該
    酵素による生成物である化合物の番号との関係を示す一
    覧表、及び当該酵素についての付加情報が格納された酵
    素情報ファイルと、 受容体の番号と当該受容体の作動物質および／または拮
    抗物質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び
    当該受容体についての付加情報が格納された受容体情報
    ファイルと、 少なくとも、化合物の番号と当該化合物が基質となる酵
    素の番号と当該化合物が生成物となる酵素の番号と当該
    化合物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮
    抗物質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納
    された相互関連情報ファイルとを備え、 基質および／または生成物である化合物についてのデー
    タが前記入力手段で受け付けられた場合に、このデータ
    から当該化合物の化学構造を一意的に示す前記正準化デ
    ータを作成し、さらにこの正準化データに基づいて前記
    化合物情報ファイルを検索して、前記正準化データが前
    記化合物情報ファイルに存在する場合に、前記正準化デ
    ータに対応する化合物の番号を読み出す第１のステップ
    と、 前記第１のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、この化合物が基質あるいは生成物となる酵素の番
    号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第２のステ
    ップと、 前記第２のステップで読み出された番号の酵素と前記化
    合物と共に反応系を構成する他の化合物の番号、及び前
    記酵素についての付加情報を、前記酵素情報ファイルか
    ら読み出す第３のステップと、 前記第１のステップで読み出された化合物の番号と、前
    記第２のステップで読み出された酵素の番号と、前記第
    ３のステップで読み出された他の化合物の番号とから、
    前記入力手段で受け付けられた化合物の反応式図を前記
    表示手段に表示し、さらに、前記第３のステップで読み
    出された酵素についての付加情報を前記表示手段に表示
    する第４のステップと、 化合物についてのデータが前記入力手段で受け付けられ
    た場合に、このデータから当該化合物の化学構造を一意
    的に示す前記正準化データを作成し、さらにこの正準化
    データに基づいて前記化合物情報ファイルを検索して、
    前記正準化データが前記化合物情報ファイルに存在する
    場合に、前記正準化データに対応する化合物の番号を読
    み出す第５のステップと、 前記第５のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体
    の番号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第６の
    ステップと、 前記第６のステップで読み出された番号の受容体につい
    ての少なくとも付加情報を前記受容体情報ファイルから
    読み出す第７のステップと、 前記第７のステップで読み出された受容体についての少
    なくとも付加情報を前記表示手段に表示する第８のステ
    ップと、 反応経路を構成する複数の化合物の中から選択される所
    定の化合物についてのデータが前記入力手段で受け付け
    られた場合に、このデータから当該化合物の化学構造を
    一意的に示す前記正準化データを作成し、さらにこの正
    準化データに基づいて前記化合物情報ファイルを検索し
    て、前記正準化データが前記化合物情報ファイルに存在
    する場合に、前記正準化データに対応する化合物の番号
    を読み出す第９のステップと、 前記第９のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、この化合物を基質とする酵素の番号とこの化合物
    を生成物とする酵素の番号とを前記相互関連情報ファイ
    ルから読み出す第１０のステップと、 前記第１０のステップで読み出された酵素の番号に基づ
    いて、この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素に
    よる生成物である化合物の番号を前記酵素情報ファイル
    から読み出す第１１のステップと、 前記第１０のステップと前記第１１のステップとを繰り
    返し、所定反応経路内の化合物及び酵素を検索する第１
    ２のステップと、 前記第１０のステップで読み出された酵素の番号と、前
    記第１１のステップで読み出された化合物の番号とか
    ら、これらの化合物の反応式図を反応経路に沿って前記
    表示手段に表示する第１３のステップとを備えることを
    特徴する生化学情報処理方法。
  8. 【請求項８】 化合物、酵素及び受容体についての生化
    学情報が記憶された記憶手段と、 前記生化学情報を表す画像データまたは前記生化学情報
    を表す記号データの入力を受け付ける入力手段と、 少なくとも化学反応式の反応式図を表示する表示手段と
    を備える情報処理装置を用いた生化学情報処理方法であ
    って、 前記記憶手段は、 化合物の番号と当該化合物に対応する正準化データとの
    関係を示す一覧表、及び当該化合物についての付加情報
    が格納された化合物情報ファイルと、 酵素の番号と当該酵素の基質である化合物の番号と当該
    酵素による生成物である化合物の番号との関係を示す一
    覧表、及び当該酵素についての付加情報が格納された酵
    素情報ファイルと、 受容体の番号と当該受容体の作動物質および／または拮
    抗物質である化合物の番号との関係を示す一覧表、及び
    当該受容体についての付加情報が格納された受容体情報
    ファイルと、 少なくとも、化合物の番号と当該化合物が基質となる酵
    素の番号と当該化合物が生成物となる酵素の番号と当該
    化合物が作動物質となる受容体の番号と当該化合物が拮
    抗物質となる受容体の番号との関係を示す一覧表が格納
    された相互関連情報ファイルとを備え、 化合物についてのデータが前記入力手段で受け付けられ
    た場合に、このデータから当該化合物の化学構造を一意
    的に示す前記正準化データを作成し、さらにこの正準化
    データに基づいて前記化合物情報ファイルを検索して、
    前記正準化データが前記化合物情報ファイルに存在する
    場合に、前記正準化データに対応する化合物の番号を読
    み出す第５のステップと、 前記第５のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、化合物が作動物質あるいは拮抗物質となる受容体
    の番号を前記相互関連情報ファイルから読み出す第６の
    ステップと、 前記第６のステップで読み出された番号の受容体につい
    ての少なくとも付加情報を前記受容体情報ファイルから
    読み出す第７のステップと、 前記第７のステップで読み出された受容体についての少
    なくとも付加情報を前記表示手段に表示する第８のステ
    ップと、 反応経路を構成する複数の化合物の中から選択される所
    定の化合物についてのデータが前記入力手段で受け付け
    られた場合に、このデータから当該化合物の化学構造を
    一意的に示す前記正準化データを作成し、さらにこの正
    準化データに基づいて前記化合物情報ファイルを検索し
    て、前記正準化データが前記化合物情報ファイルに存在
    する場合に、前記正準化データに対応する化合物の番号
    を読み出す第９のステップと、 前記第９のステップで読み出された化合物の番号に基づ
    いて、この化合物を基質とする酵素の番号とこの化合物
    を生成物とする酵素の番号とを前記相互関連情報ファイ
    ルから読み出す第１０のステップと、 前記第１０のステップで読み出された酵素の番号に基づ
    いて、この酵素の基質である化合物の番号とこの酵素に
    よる生成物である化合物の番号を前記酵素情報ファイル
    から読み出す第１１のステップと、 前記第１０のステップと前記第１１のステップとを繰り
    返し、所定反応経路内の化合物及び酵素を検索する第１
    ２のステップと、 前記第１０のステップで読み出された酵素の番号と、前
    記第１１のステップで読み出された化合物の番号とか
    ら、これらの化合物の反応式図を反応経路に沿って前記
    表示手段に表示する第１３のステップとを備えることを
    特徴する生化学情報処理方法。
  9. 【請求項９】 前記入力手段が、化合物を構成する各原
    子についての固有データ及び原子間の結合対データの入
    力を受け付け；前記生化学情報処理方法が、 前記入力手段で受け付けられた各データに基づいて、各
    原子を等価原子ごとに別のクラスに分類して、クラスご
    とに異なるクラス番号を各原子に与える構成原子分類ス
    テップと、 前記構成原子分類ステップで各原子に与えられたクラス
    番号に基づいて、前記化合物の構造と一意的に対応した
    正準化番号を各原子に与える正準化番号付与ステップ
    と、 前記正準化番号付与ステップで各原子に与えられた正準
    化番号に基づいて、前記化合物の化学構造を一意的に特
    定できる正準化データを作成する正準化データ作成ステ
    ップとを更に備える；請求項６〜８のうちのいずれかに
    記載の生化学情報処理方法。
  10. 【請求項１０】 前記構成原子分類ステップは、 各原子に３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）を与え、こ
    れらの属性が一つでも異なる原子は非等価であると判定
    できることを利用して、各原子を等価原子毎に異なるク
    ラス番号を付与しており、 前記３種類の属性（ａi ，ｂij，ｄij）の中で、ａi は
    入力番号ｉの原子の種類番号であり、ｂijは入力番号ｉ
    の原子に隣接する結合のうち、その種類番号がｊである
    結合の数であり、ｄijは入力番号ｉの原子から最短経路
    によりｊ個の結合を経て巡れる道筋の数であり；前記正
    準化番号付与ステップは、 正準化番号を１から昇順に各原子に与える過程におい
    て、前記クラス番号の優先順位が最高である原子に正準
    化番号１を与え、以降正準化番号ｎまでが付与されてい
    る時、既に正準化番号が与えられている原子でかつ未だ
    正準化番号が与えられていない原子が結合している原子
    の中で正準化番号が最小である原子を選び、その原子に
    結合している未だ正準化番号が与えられていない原子の
    中で前記クラス番号の優先順位が最高である原子に正準
    化番号ｎ＋１を与えており；前記正準化データ作成ステ
    ップは、 各原子に３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）を与えて、
    これらの属性を一列に並べることによって前記正準化デ
    ータを作成しており、 前記３種類の属性（Ｐi ，Ｔi ，Ｓi ）の中で、Ｐi は
    正準化番号ｉの原子に結合し且つ正準化番号が最小の原
    子の正準化番号であり、Ｔi は正準化番号ｉの原子と正
    準化番号Ｐi の原子との結合の種類記号であり、Ｓi は
    正準化番号ｉの原子の種類記号である；請求項９に記載
    の生化学情報処理方法。
JP8108265A 1995-04-28 1996-04-26 生化学情報処理装置及び生化学情報処理方法 Withdrawn JPH0916628A (ja)

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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2026009634A1 (ja) * 2024-07-03 2026-01-08 パナソニックＩｐマネジメント株式会社 情報処理方法、情報処理システム、および情報処理プログラム

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