JPH09505461A - Dnaウィルスリボザイム - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、ハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで成るリボザイムであって、ここで前記ハイブリダイズ領域は植物細胞に感染できる DNAウィルスに結合した DNA分子から転写された標的mRNAの少なくとも一部にハイブリダイズでき、ここで前記触媒領域は前記標的mRNAを解裂でき、これにより前記 DNAウィルスの複製、感染及び/又は集成を実質的に抑制できるようなリボザイムに関する。
Description
【発明の詳細な説明】
DNAウィルスリボザイム
本発明はウィルス特異的mRNAの解裂を触媒することのできる合成リボザイム及
びその突然変異体並びに誘導体に関し、そしてより詳しくは、 DNAウィルス特異
的mRNAに関する。本発明は更に遺伝子導入細胞の作製におけるこのようなリボザ
イムの利用、そして特に、これらのウィルスによる感染を阻害することのできる
遺伝子導入植物細胞及び植物に関する。
ウィルスはヒト、動物及び植物の数多くの重症及び潜在的に重症な病気の原因
因子である。植物ウィルスは特に穀類農産物を破壊又は減少させる能力を有し、
あるいは農業及び園芸産業に経済的に有意義なレベルで有害な影響を及ぼす。
これに関して特に重要視されているウィルスは DNAウィルス、例えばカウリモ
ウィルス(Caulimoviruse)及びジェミニウィルス(Geminviruse)、並びに2種類の
非分類化ウィルス、即ち、サブテラニアン・クローバー・スタント・ウイルス(S
ubterranean Clover Stunt Virus)(SCSV,Shu and helms,Virology,1986,16
7,38-49)及びココナッツ・フォリアー・デケイ・ウィルス(Coconut Foliar De
cay Virus)(CFDV,Rohde ら、Virology,1990,176,648-51)である。ジェミニ
ウィルスは小型ウィルスの群であり、これは植物細胞に感染する。これらは約29
00塩基対以下の「ビリオン・センス」又は「ポジティブ・センス」 DNAと呼ばれ
る一本鎖環状 DNAを含む。ジェミニウィルスによる宿主細胞の感染により、ウィ
ルスコートタンパク質は除去され、そしてビリオン・センスストランド及び「相
補性・センス」ストランドを含んで成る二本鎖の DNA複製形態が
合成される。転写は、ビリオン・センスストランド及び「相補性・センス」スト
ランドの両者から起こり、(+)及び(−)センス RNA転写体のそれぞれが出来
き上がる。
ジェミニウィルスの例には、メイズ・ストリーク・ウィルス(MSV)、ビーン・
ゴールデン・モザイクウィルス(BGMV)、アフリカン・カッサバ・モザイクウィ
ルス(ACMV)、クロリス・ストリエート・モザイクウィルス(Chloris Striate M
osaic Virus:CSMV)、トマト・イエロー・リーフ・カール・ウィルス(TYLCV)、
トマト・ゴールデン・モザイクウィルス(TGMV)、ビート・カーリー・トップ・
ウィルス(BCTV)及びトマト・リーフ・カール・ウィルス(TLCV)がとりわけ含
まれる(以降の表1に記載のウィルスも参照のこと)。これらのウィルスは、葉
のカーリング及びその他の葉の変形を含む、栽培植物における経済的に重要視さ
れている病気の原因となる。特にTLCVはオーストラリアの北部においてひどい作
物ダメージを引き起こし、そして感染植物は中東及びヨーロッパにおける TYLCV
により起こるものと似たような症状を示す。便宜上、そして何らかのことわりの
ない限り、TLCV及び TYLCVは同義語として利用し、そしてTLCVのイスラエル及び
サルジニア単離体についての本明細書での言及は TYLCV単離体と解されるべきで
ある。一般に、「TLCV」はオーストラリア「単離体」を意味する。
ジェミニウィルスは感染細胞の核の中で複製し、そして一本鎖 DNA含有コリフ
ァージ(例えばQX174)並びに一定のスタフィロコッカス・アウレウス(Staphyloc occus aureus
)及びバチルス・スブチリス(Bacillus subtilis )プラスミド
により利用されるものと類似のローリング・サークル機構を利用するものと考え
られる。他の公知の植物ウィルス、例えばその他の植物 DNAウィルスは RNA中間
体を介して複製する。
ジェミニウィルス粒子は感染細胞の核の中にたまり、そこでおそらく DNA複製
及びウィルス集成が行われる(Davies ら、J.Cell.Sci(Suppl)(1987)7:9
5-107)。その推定複製形態はクロマチン様構造をとる約 2.7kbの二本鎖の共有閉
環環状 DNAであり、そして転写活性ウィルス形態のようである(Abouzid ら、Mol
.Gen.Genet.(1988)212:252-258)。宿主域及び昆虫ベクターに基づき、こ
れらは通常3つのサブグループに分けられる。即ち、双子葉類ホストに感染し、
2分節系ゲノムを有し、そしてシロアリ(white-fly)ベクター、ベミシア・タバ
チ(Bemisia tabaci)(Genn.)により伝染するウィルス(ACMV,アリカン・カ
ッサバ・モザイクウィルス( Stanley and Gay,Nature(1983)301:260);TG
MV 、トマト・コールデン・モザイクウィルス(HamiHon ら、EMBO J.(1984)
3:2197);BGMV 、ビーン・ゴールデン・モザイクウィルス(Horwarth ら、PNA
S(1985)82:3512);1分節系ゲノムを有し、イネ科のホストに感染し、そし
てリーフホッパーベクターにより伝染するもの(MSV、メイズ・ストリーク・ウィ
ルス(Nigeria 株、Mullinauxら EMBO J.(1984)3:3063;ケニヤ(Kenyan
)株、Havel NAR(1984)12 :7359);DSV、ディジタリアン・ストリーク・ウィ
ルス(Donson ら、Virology(1987)161:160);WDV、ホイート・ドゥウォー
フ・ウィルス(Mac Dowell ら EMBO J.(1985)4:2173));そして1分節系
ゲノムを有し、そしてリーフホッパにより伝染されるもの(BCTV、ビート・カー
リー・トップ・ウィルス(Stanley ら、EMBO J.(1986)5:1761);ToYDV、
タバコ・イエロー・ドゥウォーフ・ウィルス(Maris ら、Virology(1992)187
:633))又はシロアリにより伝染されるもの(TYLCV、トマト・イエロー・リーフ
・カール・ウィルス(イスラエル単離体、Navet ら、Virology(1991)185:151
;サルジアン単離体、Kheyr-Pour ら NAT(1
991)19:6763),TLCV 、トマト・リーフ・カール・ウィルス(オーストラリア単
離体、Dry ら J.Gen.Virol.(1993)74:147))。
植物 DNAウィルス、特にジェミニウィルスの経済的重要性により、病気耐性手
法についての要望が生じた。
一つの手法は相補性 RNAを標的とするアンチセンス RNAにより人工的に遺伝子
発現を抑制することにある(Helene,C.& Tolume J.J.Biochim.Biophys.Ac
ta 1049:99-125,1990; Vander Kroら Biotechniques 6:958-976,1988)。
アンチセンス RNAは細菌及び動物組織のウィルス感染を抑えるのに効果的に利用
されているが(Helene,C & Tolume,J.J.前掲)、植物におけるその利用は限
られた成功しか収められていない(Van Del Elzen, P.J.M.ら Plant Mol.B
iol.13:337-346,1989; Powell,P.A.ら Proc.Nad.Aca.Sci.USA 86:69
49-6952,1989)。
事実、別の領域に対するキュウリ・モザイクウィルス(CMV)アンチセンス RNA
を発現する遺伝子導入植物は、非常に低レベルのアンチセンス RNAのみを不合理
的に生成する一の系を除き、 CMV感染に対して一般に耐性でなかった(Rezaianら
、Plant Mol.Biol.(1988)11:463)。アンチセンスがこの耐性の原因である
証拠はない。ポテトにおいて、遺伝子導入植物における PVXコートタンパク質 R
NA配列に対するアンチセンスは低レベルでの接種においてのみ PVXから守った(H
emenwayら、EMBO J.(1988)7:1273)。
2つの主たる問題は、大量のウィルス核酸を迅速に生成できる複製系に対抗さ
せるのに必要なアンチセンスの量、及びウィルス RNAはほとんどサイトプラズマ
にあり、一方アンチセンス転写体は核の中で生成されることにあるようである。
ジェミニウィルスに関して、アンチセンス技術は、薬剤耐性遺伝
子に転写融合されたTGMVのウィルスによりコードされる ALI遺伝子のアンチセン
ス DNA配列を発現するタバコ植物に応用されている(Day A.G.らProc.Nad.A cad.Sci.
USA 88:6721-6725,1991)。アンチセンス転写体を発現する遺伝子
導入植物系は低い症状発症を示したが、この遺伝子導入植物は不毛となる可能性
があり、このことはウィルス耐性植物の大量生産の妨げとなるであろう。
本発明に至るまで研究において、本発明者らはリボザイムの手法を採用するこ
とにより植物 DNAウィルス耐性植物を作製するアンチセンス手法の欠点の解消を
試みた。
リボザイムは特異性の高いエンドリボヌクレアーゼ活性を有する合成 RNA分子
である。特に、これらは、標的 RNAの少なくとも一部に対してヌクレオチド配列
が相補性となっているハイブリダイズ領域及び標的 RNAを解裂する触媒領域を含
んで成る。リボザイムはHaseloff J.and Gerlach L. Nature 334:586-591 及
び国際特許出願第WO89/05852 によく説明されている。
しかしながら、リボザイム技術の存在にもかかわらず、現在まで、それは植物
DNAウィルス、そして特にジェミニウィルスの如くの植物一本鎖 DNAウィルスに
は利用されていない。事実、 DNAウィルスに対するリボザイムの利用の成功は、
その非常に複雑な複製及び転写メカニズムの観点から、並びにこのような様々な
操作の達成及びウィルスのライフサイクルにおける種々の標的配列の介在レベル
の正確なレベルを考慮するうえで現状入手できる情報の欠如から、予測できるも
のではなかった。例えば、レプリカーゼC1は「ローリングサークル」複製段階
には介在するが、ウィルスの二本鎖複製形態の形成の前段階には介在しないと推
定されている(Elmer ら、Nucl.Acid.Res.,1988,16,p7043-7060)。
本発明に従うと、本発明者らは植物 DNAウィルスを標的とするこ
とのできるリボザイムの開発に成功し、これによりかかるウィルスをコントロー
ルする経済的に価値のある、且つ効率的な手段を提供する。
従って、本発明の一の観点は、ハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで成る
リボザイムに関し、ここでこのハイブリダイズ領域は DNAウィルスに係る DNA分
子から転写された標的 RNAの少なくとも一部にハイブリダイズすることができ、
ここで前記触媒領域はこの標的mRNA配列を解裂することができ、これによりこの
DNAウィルスの複製、感染及び/又は集成を実質的に抑えることができる。
より詳しくは、本発明はハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで成るリボザ
イムに関し、ここでこのハイブリダイズ領域は植物一本鎖 DNAウィルスのビリオ
ン・センス DNAストランド又は相補性・センス DNAストランドから転写された標
的mRNAの少なくとも一部とハイブリダイズすることができ、ここで前記触媒領域
はこの標的mRNA配列を解裂することができ、これによりこの DNAウィルスの複製
、感染及び/又は集成を実質的に抑えることができる。
便宜上、一本鎖 DNAウィルスについての言及には、その二本鎖複製形態につい
ての言及も含む。
好適な態様において、植物一本鎖 DNAウィルスはジェミニウィルスであり、そ
して標的mRNAは複製にとって必須のタンパク質をコードする。「必須」とは、ウ
ィルスゲノム(又はその相補性形態)に特異的とされ、且つ特定の機能、例えば
複製、感染及び/又はウィルス集成のために必要又は実質的に必要とされるタン
パク質を意味する。必須タンパク質のレベルの低下はその機能のレベルの低下、
即ち、特定の機能のレベルの減少を意味する。好ましくは、必須のタンパク質の
レベル(又は特定機能のレベル)は、リボザイム抜きでの必須タンパク質のレベ
ル(又は特定機能のレベル)に対して、
20%低い、より好ましくは少なくとも30%低い、更により好ましくは少なくとも
45%低い、更により好ましくは少なくとも55%低い、そして更により好ましくは
65〜75%低い、そしてより更に好ましくは85〜90%低いものとする
好都合には、必須タンパク質のレベル(又は特定機能のレベル)は、インビボ
での生物学的バリエーションの範囲内で、インビトロで試験できうる。かかる試
験は、例えばインビトロでのmRNA分解生成物の分析によって行うことができうる
。
本発明の一の好適な観点に従うと、ハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで
成るリボザイムを提供し、ここでこのハイブリダイズ領域はジェミニウィルスの
ビリオン・センス DNA分子から転写した評的mRNA又は前記ビリオン・センス DNA
に相補性の DNA分子の少なくとも一部にハイブリダイズでき、前記mRNAは植物細
胞中での前記ジェミニウィルスの複製にとって必須のタンパク質をコードし、こ
こで前記触媒領域は前記標的mRNA配列を解裂でき、これにより前記ジェミニウィ
ルスの複製を実質的に抑えることができる。
更により好ましい態様において、この標的mRNA配列は細胞内で少ない量で存在
している。かかるmRNA分子の例は、ジェミニウィルスにおける、例えばTLCV又は
TYLCVにおけるC1遺伝子又はその同等物、並びにその突然変異体、誘導体及び
変異体である。TLCVの一本鎖 DNAは6つのオープンリーディングフレーム(ORF)
を含み、2つはリーフ・カール感染植物の中で生成された複製形態 DNAのビリオ
ン・センスストランド上にあり、そして4つはその相補性・センスストランド上
にある。感染植物細胞におけるウィルスmRNAの分析は、複製にとって必須である
C1遺伝子をコードするmRNAが、TLCVゲノムに特異的とされる他のmRNA転写体よ
りも少ない量で認められることを示した。C1遺伝子の同等物形態には遺伝子L
1,AL1及び
AC1が含まれ、そして本明細書における「C1遺伝子」についての言及はその同
等物を含むものと解される。
その他の標的にはC2,C3及びC4転写体が含まれ、これはビリオン・セン
ス遺伝子発現のトランス作用において、並びにウィルスの感染、病気表現型の発
現及び病気の発症のそれぞれにおいて役割を担っている。
別の好適な態様に従うと、本発明はハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで
成るリボザイムに関し、ここでこのハイブリダイズ領域はジェミニウィルス、そ
して特にTLCVのC1遺伝子をコードする標的mRNA配列の少なくとも一部にハイブ
リダイズでき、そしてここで前記触媒領域は前記標的mRNA配列を解裂でき、これ
により前記ジェミニウィルス(例えばTLCVの複製を実質的に抑制することができ
る。
好適な態様において、本発明のリボザイムはエンドリボヌクレアーゼ活性を有
し、且つDNAウィルスの複製、感染又は集成を阻害できる核酸化合物と定義する
ことができ、この化合物は次式を有する少なくとも一単位「R」を含んで成る:
5′(X−Y−X′)3′
(ここで:
X及びX′はそれぞれ独立して少なくとも4個の塩基を有するヌクレオチド配
列を表わし、そしてウィルスゲノム又は DNAウィルスの(−)センス RNA転写体
のいづれかの少なくとも一部に相補性であり、
Yはリボザイムの触媒領域を表わす)。
この変異体に従うと、この標的 RNAは好ましくは(−)センス RNA転写体、即
ち、 DNAウィルスゲノム、特にジェミニウィルスの二本鎖複製形態の相補性・セ
ンスストランドの転写に由来するmRNAで
ある。この配列X及びX′は従って、(−)センス RNA転写体の少なくとも一部
に相補性である(これは一本鎖ゲノム DNAの少なくとも一部に相補性であること
と同等である)。
以降「バイブリダイズアーム」と呼ぶ配列X及びX′は、基質 RNAに対するリ
ボザイムの安定的なハイブリダイゼーション及びこの基質の効率的な解裂の両方
を可能とするに足りる長さである。通常X及びX′はそれぞれ少なくとも4個の
ヌクレオチド、そして好ましくは少なくとも6個のヌクレオチドの長さを有する
。このハイブリダイズアームの長さの上限は一般に標的とする基質の長さにより
決定され、そして 800又は1000塩基以上の長さでありうる。好適な長さは6〜 3
00塩基、例えば10〜 150塩基である。基質に対する、又は基質の一部に対するハ
イブリダイズアームの相補性は、通常ハイブリダイズアームの全長にわたる。
リボザイムの触媒領域「Y」は任意のタイプの適当なリボザイム、例えば「ハ
ンマーヘッド」又は「ヘアーピン」に由来する。これらのリボザイムは特許出願
EP-A-321201及び EP-A-360257のそれぞれに記載されている。特に好ましいのは
「ハンマーヘッド」触媒領域であり(例えば図7参照のこと)、そして以降に詳
しく説明する。
リボザイムは式[X−Y−X′]の一の「R」単位を有し、そして一の触媒領
域のみを有する「モノリボザイム」であってよい。
他方、リボザイムは複数の「R」単位を含んで成り、そして一般式:R1−R2
…Rn(ここでn>1、そして50又は 100ほどの高い値を有してよい)を有する
「ポリリボザイム」であってよい。実際、約5〜10の「n」値が頻繁である。従
って、ポリリボザイムは頭から尾に至る一連のリボザイムにより成り、モノリボ
ザイム「R」又は「X−Y−X′」単位は単位モチーフである。授言すれば、
これはハイブリダイズアームで互いと連結した一連の触媒領域である。以降、何
らかのことわりのない限り、全てのリボザイムの「R」単位により表わされるX
及びX′モチーフの凝集体をまとめて「相補性性」又は「ハイブリダイズ」配列
と呼ぶ。ポリリボザイムは通常単一転写体に対して「単一分子」として作用する
。即ち、各触媒領域の解裂部位は同一の転写体上にある。
ポリリボザイムの正確な構造は実際には、解裂させる基質の種類により主に決
定される。触媒領域の数、相補性配列におけるその位置、及び2つの連続する触
媒領域間の距離は基質中の「三塩基標的」部位の位置に大いに依存する。
「ハンマーヘッド」リボザイムは基質を「標的」部位 XXX、好ましくは XUX(
ここでXは4塩基A,C,G,Uのうちのいづれかを表わし、そしてUはウラシ
ルを表わす)のすぐ下流で解裂する。一の特に好ましい標的配列はX0UYである(
ここで、X0は任意のリボヌクレオチド、Uはウラシル、そしてYはアデニン、
シトシン又はウラシルを表わす)。X0UYは塩基対隣接領域の一部を構成し、そし
てYは塩基対ではない。X+ OUYを規定する好適なトリプレットには、限定する
ことなく、GUC,GUA,GUU,UUC及び CUCが含まれる。その他の標的部位、例えば
CAC,UAC及び AACも可能だが、効率性が低い。Perrimanら(Gene,1992,113:15
7)はハンマーヘッドリボザイムについての長い標的部位を研究した。GUC,UUC,
CUC,GUA及び GUU標的は同等の進行の研究を示した。 GUGに関しては、通常のリ
ボザイムは解裂を誘導できなかったが、触媒ドメインのステム・ループの変化が
弱い活性リボゾームの形成をもたらした。有意に認識できる解裂を示す、中心位
置にU以外のヌクレオチドを有するいくつかの標的があった。
「ヘアーピン」タイプのリボザイムの場合、好適な標的配列はAG
UCである。
これらの標的配列はポリリボザイムの構造及び機能において重要であり、その
理由はそれらが基質の解裂の位置を示唆するのみならず、それらが、触媒領域が
相補性配列の中に挿入されなけれぱならない位置をも規定するからである。事実
、ポリリボザイムの各触媒領域は、転写体の XUX部位に相当する相補性配列中の
部位になければならない。例えば、もし一つの XUX部位がC1遺伝子の 412位に
あり、そして他方が 711にあるなら、触媒領域は相補性配列の 412に対応する位
置に、そして他方は 711に対応する位置に挿入する。授言すれば、各「R」単位
中の触媒ドメインに隣接するX及びX′ハイブリダイズ配列を、基質において標
的とされる XUX部位のまわれの塩基と相補性となるように選ぶ。
モチーフ XUXは RNA配列の中で非常に頻繁に見い出せるモチーフである。例え
ば、平均して、ランダム且つ等分布の塩基を有する配列の中で64塩基毎に GUCモ
チーフがある。このことは、基質が通常複数の XUX解裂部位を含むことを意味す
る。前記の通り、ポリリボザイムの触媒領域は XUX部位に相当する相補性配列の
位置にある。しかながら、本発明に従う効率的な解裂を得るために、基質の各 X
UX標的配列のための触媒領域を含む必要はない。ポリリボザイムの中に含まれて
いる触媒領域の総数は転写標的の中に存在している XUX部位の総数と通常等しい
、又はそれより少ない。本発明のポリリボザイム変異体は従って非常に多様な数
の触媒領域を含みうる。例えば、TLCVのC1の場合、ポリリボザイムは、標的配
列が GUCであるとき、約2〜約6個の触媒領域を含みうる。基質の中の XUX部位
の数よりも少ない数の触媒領域を相補性配列の中に含ませることを決めたとき、
選択する部位の選定は以下の基準に従って行うことができる:
a)標的とする2つの XUX部位間の距離、従ってリボザイム中の2つの触媒領
域の距離は、対応の触媒領域の間にあるポリリボザイムのハイブリダイズアーム
が安定な状況で基質とハイブリダイズでき、且つ触媒領域同志のハイブリダイズ
が阻止できるほどに十分に長くなくてはならない。少なくとも8塩基、そして好
ましくは少なくとも14塩基、例えば約20塩基の距離が極めて好都合である。むろ
ん、この基準は基質が XUX部位を互いと非常に近い距離で含んでいるときにのみ
考慮しなければならないものである。そうでなければ、も基質の XUX部位が互い
と8〜20塩基以上で離れているなら、この選定基準は重要でない。
b)標的とする XUXは好ましくは有意な二次構造を有さない基質の一部にある
。このことは、基質に対するリボザイムのアクセス及びその効果を高める。三次
元フォールディング分析を実施してよい。
c)標的とする XUX部位は、一つの及び同一のウィルスの種々の株間で、又は
変異体もしくは突然変異体間で、又は異なる辺線ウィルス間で保存されている相
同性領域の一部を成しうる。本発明の観点は以降に詳細に考慮する。
d)標的とする XUX部位のその他の選定基準は、形質転換すべき植物の内因性
遺伝子との相同性の欠落である。事実、稀ではあるが、一部のウィルスは植物の
ゲノムにおいて相同性のある配列を有する。従って、かかる配列内にある XUX部
位を避けることが重要である。
本発明のリボザイムにおいて、任意の一の「R」単位内のハイブリダイズX′
及びXモチーフは往々にして基質の隣接連続部に対して相補性である。この場合
、このリボザイムは「対称性」であると考えられ、そして触媒性ドメインは2つ
の隣接アームの相補性によ
り決定される固有部位において働く。この対称型リボザイムの好適な例は「純粋
相補性」リボザイムであり、それにおいては一定の「R」単位の3′ハイブリダ
イズアーム及び隣接「R」単位の5′ハイブリダイズアームは、(−)センス R
NA転写体又は DNAゲノムの中に連続している配列に対して相補性である。
授言すれば、本態様において、ハイブリダイズアームの凝集体は標的配列に対
する非介在型相補性の配列を備える。このタイプのポリリボザイムは、その配列
の中の個々の部位に複数のリボザイム触媒領域が挿入されている相補性配列と考
えられうる。この相補性配列は標的転写体の全長とハイブリダイズしうる。他方
、それは標的転写体のフラグメントのみとハイブリダイズしうる。注目のフラグ
メントはポリリボザイムの対応の配列の中に少なくとも2つの触媒領域を含むこ
とができるほどに長くなくてはならない。一般に、この変異体に関し、相補性配
列の長さは、触媒領域を数えずに(ハイブリダイズアームの合計)、約40〜2000
塩基でありうる。 400〜1000の長さが極めて好ましい。
本発明の変異体に従うと、前述のように「対称性」であるよりも、リボザイム
は「非対称性」である少なくとも一の「R」単位でありうる又はそれを有しうる
。このことは、一定の「R」単位内のX及びX′ハイブリダイズアームが基質の
中で非連続的な2つの配列に対して相補性であることを意味する。このことは事
実上、「非対称性」「R」単位の触媒ドメインが基質の中で2つの異なる XUX部
位において作用しうることを意味する。その一方はその5′アームに対して相補
性である配列に隣接する XUX部位であり、そして他方は3′アームに対して相補
性である配列に隣接する XUX部位である。このタイプのリボザイムは特別に構築
するか、又は合成の際の自発的な再配列(rearrangement)の結果でありうる。他
方、3′隣接
アームがハイブリダイズする配列の位置、及び5′隣接アームがハイブリダイズ
する配列の位置は、数百の塩基により、又は10もしくは20塩基ほどの少なさで隔
てられていてよい。このタイプの構造は有列であり、なぜならこれは触媒領域に
おいて有意義な「経済性」を与えるからである;例えば、5つの「非対称性」「
R」単位は10の対称性単位と同一の結果を達しめうる。
本発明の別の非常に好適な態様に従うと、次式
R1−R2−R3…Rn
を有するポリリボザイムにおいて、一定の「R」単位の3′ハイブリダイズアー
ム(X′)及び隣りの「R」単位の5′ハイブリダイズアームは、ゲノムの又は
(−)センス RNA転写体の非連続部分に対して相補性である。このタイプのポリ
リボザイムは以降「ショートアームポリリボザイム」と呼ぶ。
このようなポリリボザイムの構造は基本的に、標的配列に対して相補性である
配列であり、それにおいてはリボザイム触媒領域は埋没しており、そしてそれは
相補性配列の欠点を有する。このポリリボザイム中の2つの触媒領域間の距離は
標的配列中の対応の XUX部位間の距離よりも短い。リボザイム間の距離は、基質
中の対応の標的部位間の距離に関係して有意に小さくしてよく、例えば、もし基
質の中の2つの隣接標的 XUX部位が1000ヌクレオチドの距離で隔てられているの
なら、この「ショートアームリボザイム」の触媒領域間の距離は30又は40ヌクレ
オチドほどの短さであってよい。従って、ハイブリダイズ配列の長さの90%以上
の削減を施してよい。2つの隣接触媒領域間の最短の長さは通常約8個のヌクレ
オチド、そして好ましくは少なくとも20個のヌクレオチドとする。本発明者らは
、驚くべきことに、かかる短いハイブリダイズ配列が、ポリリボザイムが基質を
有効に解裂することの妨げとならず、そして事実、多
くの場合には失活の効率性を改善しうることを示す。
例えば、相補性配列の長さの削減はリボザイムの失活に至るような二次構造の
形成に係る問題を回避する。即ち、一定の長さのリボザイム分子に関して、基質
中のより多くの解裂部位を標的とするより多くの触媒領域を挿入してよい。
更に、ショートアームポリリボザイムの利用は、たとえ基質の配列の一部しか
わかっていないときでも有効なポリリボザイムを構築できうることを意味する。
XUX標的部位のまわりの10又は15個の塩基を知るだけで十分である。
別の重要な利点は、短いハイブリダイズアームとして、もっぱら種々のウィル
ス、例えば同タイプのウィルスにおいて保存されている配列を利用することがで
きることにある。このようにして、種々のウィルスは、たとえ保存領域間の配列
が全体的には非類似であっても、同一のポリリボザイムにより失活されうる。
最後に、分子の小ささは、より簡単、且つより経済的な合成を可能とする。本
発明の「ショートアーム」リボザイムの機能的性質は、ポリリボザイムにおいて
、種々の触媒領域が互いと独立して作用しうることにある。
本発明のどのポリリボザイムも「ロングアーム」と「ショートアーム」リボザ
イムの混合物、並びに「対称性」及び「非対称性」リボザイムの混合物を含みう
る。他方、それはロングアームリボザイムのみ、もしくはショートアームのみを
、又は非対称のみ、等を含んでよい。リボザイムの構造は従って最適化して試験
できうる。
本発明の更なる態様に従うと、このポリリボザイムのハイブリダイズアームは
少なくとも2種類のウィルスに由来しうる。かかるポリリボザイムを以降「キメ
ラ ポリリボザイム」と呼ぶ。このタイプの構築体の例として、TLCV及び TYLCV
由来配列の混合物、例えば
サルジニア、イスラエル又はチュニジア株が挙げられる。このタイプのポリリボ
ザイムは、もし一緒に存在しているなら、両タイプのウィルスの失活を確実なも
のとし、又は異なる地理領域での単独の構築体の利用を可能にする。
本発明の更なる観点に従うと、このポリリボザイムは、2つの連続「R」単位
の間に、少なくとも4塩基の長さを有し、且つ(−)センス RNA転写体又は DNA
ゲノムに対して相補性でない非相補性配列(A)を含みうる。
このポリリボザイムの非相補性配列は正確な機能を有することができ、例えば
それは形質転換体を選別するのに利用できうるコード配列により、又は更に DNA
ウィルスの主標的以外で基質上に作用するもしくはポリリボザイムの一部に cis
作用を及ぼすリボザイムを含む配列より成りうる。それは一般にクローニング用
のポリリンカ、又はキメラポリリボザイムの構築を助けるアダプターを含む。こ
の非相補性配列は通常4〜 500塩基、例えば20〜 100塩基の長さを有する。複数
の非相補性配列があるとき、これらは一緒になってポリリボザイムの長さの約90
%まで、例えば50%を占めうる。このような非相補性配列は通常相補性配列X及
びX′の一部を代替するが、しかし触媒ドメインのすぐ隣りの少なくとも4個の
相補性塩基を残す。
最も好適な態様に従うと、本発明のリボザイムは、同一の株の変異体もしくは
突然変異体間、同一のウィルスタイプの株間、又は異なるタイプのウィルス間で
高度に保存されている一又は複数の領域に対してハイブリダイズアームが相補性
となるように構築する。
ジェミニウィルスの種々のオープンリーディングフレーム、即ち、V1,V2
,C1,C2,C3及びC4によりコードされる推定アミノ酸配列の対比を行っ
た(例えば、表1に記載の文献を参照の
こと)。C1レプリカーゼポリペプチドに関して、TLCVと TYLCV-Iとの間での最
大相同性は83%の相同性を伴った。TLCVと TYLCV-S間では、C1オープンリーデ
ィングフレーム上で79%のアミノ酸同一性があった。
この対比を、TLCVに対する TYLCVのイスラエル、サルジニア及びチュニジア単
離体で行うと、類似の相同性が見い出された(表1参照のこと)。
表1についての解説
1〜14について、アミノ酸同一性はプログラムBest Fit of the UWGCG-Sequen
ce analysis package による%で示す。ワードサイズ
(K-tuple)は2、ギャップウェイトは 2.0、そしてギャップレングスウェイトは
0.1とした。プログラム FastAは同一の関係をもたらした。
15〜21について、アミノ酸同一性は構造−遺伝子対比マトリックスを用い、PC
/GENE Sequence analysis packageのPALIGNプログラムを利用して計算した(オ
ープンギャップコストバリュー10;ユニットギャップコストバリュー10)。
ABMVA :アブチロン(Abutilon)・モザイクウィルスDNA A;
ACMVA :アメリカン・カッサバ・モザイクウィルスDNA A;
BGMVA :ビーン・ゴールデン・モザイクウィルスDNA A;
ICMV:インディアン・カッサバ・モザイクウィルスDNA A;
SqlCV :スカッシュ(Squash)・リーフ・カール・ウィルスDNA A;
PYMVA :ポテト・イエロー・モザイクウィルスDNA A;
TGMVA :トマト・ゴールデン・モザイクウィルスDNA A;
TYLCV-I :トマト・イエロー・リーフ・カール・ウィルス・イスラエル単離体;
TYLCV-S :トマト・イエロー・リーフ・カール・ウィルス・タイ単離体;
TLCV :トマト・リーフ・カール・ウィルス;
BCTV :ビート・カーリー・トップ・ウィルス;
TobYDV:タバコ・イエロードゥウォーフ・ウィルス;
MSV :メイズ・ストリーク・ウィルス; WDV:ホイート・ドゥウォーフ・ウィル
ス。
表にまとめた結果はDry ら(J.Gen.Virol.(1993)74・147)及びKheyr-pour
ら(Nucl.Acid.Res.(1991)19:6763)より得た。 TYLCV及びTLCVの3つの単
離体間の配列多様度は、種々のジェミニウィルス単離体又は株間での通常の非常
に高い配列類似性に対して
非常に対照的である。例えば、ACMVのケニヤ及びナイジェリア単離体の DNA配列
は96%の同一性を示し、そして MSVのケニヤ、ナイジェリア及び南アフリカ単離
体は最大約2%異なる。 TYLCV及びTLCVの3単離体間の強い配列多様度にかかわ
らず、本発明者らはC1 RNA転写体の対比を行い、そして3つの非常に高度の保存
領域を同定した。その2つを図9に示す。これらの領域は以下の通りである(以
下の数え方は相補性・センス転写体のTLCVの数え方である)。
1.ほぼ 365〜435
2.ほぼ 634〜737
3.ほぼ 895〜972
これら3つのTLCV単離体(それぞれオーストラリア、イスラエル及びサルジニ
ア由来)中のC1遺伝子のヌクレオチド配列を図1に示す。TLCV由来のC1遺伝
子の完全ヌクレオチド配列はMullinaux ら Virology,193:414-423,1993及びDry
ら J.Gen.Virol.,74:147-151,1993に開示されている。このイスラエル
単離体はNavot らVirology,185:151-161,1991 により開示され、そしてサル
ジニア単離体はKhyer-PourらNucl.Acid.Res.19:6763-6769,1991により開示
されている。
これらの保存領域中の標的部位により構築したポリリボザイムは従って全ての
辺縁株又は変異体が失活することを確実なものとするために利用されうる。上記
の通り、もしポリリボザイムが欠失ショートアームバージョンであってハイブリ
ダイズアームがもっぱら保存領域に対応するものであるなら、保存領域間での配
列多様度は基質に対するポリリボザイムの効率的なハイブリダイゼーションに影
響を与えない。
本発明のこの観点に従うと、「保存領域」は約20塩基の長さにわたって 100%
の相同性を有するものと考える。一般に、この相同性
は30塩基にわたって約90%でありうる。リボザイムR1,R4,R5及びR2は
、以下の実施例に示している通り、これらの保存領域内にくるようにデザインす
る。
従って、この態様に従うと、本発明はハイブリダイズ領域及び触媒領域を含ん
で成るリボザイムであって、そのハイブリダイズ領域が特定のジェミニウィルス
のうちの少なくとも2つの変異体、そして特にTLCVの少なくとも2つの変異体の
C1遺伝子をコードする標的mRNA配列の少なくとも一部にハイブリダイズし、そ
してここで前記触媒領域は前記標的mRNA配列を解裂でき、これにより前記ジェミ
ニウィルス(例えば、TLCV,TYLC、並びにその突然変異体、誘導体及び変異体)
の複製を実質的に抑制できるリボザイムに関する。
本発明のポリリボザイムは通常 RNAより成る。にもかかわらず、通常ポリリボ
ザイムの一部、例えば、ハイブリダイズアームもしくはそのアームの一部、又は
更に触媒領域の一部、特に触媒活性が保たれていることを条件に「ループ」の一
部、を DNAに置き換えてよい(例えば、国際特許出願WO-9119789に記載の DNAに
よる RNAの置換を参照のこと)。
触媒領域を考慮する限り、本発明のリボザイムは次式(I)の分子として表わ
すことができる:
(式中、(X)n及び(X)n′は DNAウィルスのmRNA配列に実質的に相補性であ
るリボヌクレオチド配列を表わし;nとn′との合計は同一又は異なっていてよ
く;(*)は相補性リボヌクレオチド間の塩基対合を表わし;Yは任意のリボヌ
クレオチドを表わし、そして各Yは同一又は異なっていてよく;Y′及びY″は
オリゴヌクレオチド間での塩基対合が可能となるようにその全長の少なくとも一
部の間が相補性配列のリボヌクレオチドで表わすか、又はY′及びY″は一緒に
なって一本の RNA配列を形成しており、ここでこの配列の少なくとも一部は相補
性ヌクレオチド間の塩基対合により形成されるステムを含んで成り;そして任意
的にA,G,C又はUのいづれかより選ばれる追加のヌクレオチドが1Aの後方
に挿入されている)。
別の態様において、このリボザイムは次式(II)に記載の通りである:
(式中、(X)n及び(X)n′は DNAウィルス、そして特にジェミニウィルス、
例えばTLCVのmRNAに対して実質的に相補性であるリボヌクレオチド配列を示し;
Yは任意のリボヌクレオチドを表わし、そして各Y残基は同一又は異なっていて
よく;(*)は相補性ヌクレオチド間での塩基対合を表わし;n及びn′は先に
定義の通りであり;Bは結合、塩基対合、リボヌクレオチド又は少なくとも2
個のリボヌクレオチドを含むオリゴリボヌクレオチドを表わし;m及びm′は1
以上であり、そして同一又は異なっていてよく;そして任意的に、A,G,C又
はUのいづれかより選ばれる追加のヌクレオチドが1Aの後方に挿入されている
)。
好適な態様において、リボザイムは次式(III)に記載の通りである:
(式中、(X)n及び(X)n′は DNAウィルス、そして特にジェミニウィルス、
例えばTLCVのmRNAに実質的に相補性であるリボヌクレオチドを表わし;Yは任意
のリボヌクレオチドを表わし、そして各Y残基は同一又は異なっていてよく;(
*)は相補性リボヌクレオチド間での塩基対合を表わし;n及びn′は先に定義
の通りである)。
好ましくは、この DNAウィルスは一本鎖 DNAウィルスである。好ましくは、こ
の一本鎖 DNAウィルスはジェミニウィルスである。最も好ましくは、このジェミ
ニウィルスはTLCVであり、そして(X)n及び(X)n′はC1遺伝子mRNAの領域
にハイブリダイズできる配列を表わす。
最も好適な態様において、(X)n及び(X)n′は図1に記載のTLCV又は TYL
CVのC1遺伝子mRNA転写体にハイブリダイズする。
体に特異的であり、そして以下に記載のヌクレオチド配列を含んで成る:
及び
上記及び図7の触媒領域は保存構造及び配列を有するが、一部のヌクレオチド
のリボザイム活性を損うことなく欠失、挿入、置換又は改変されうることが認め
られた。本発明は、その触媒活性が保存されていることを条件に、これらの改変
触媒領域の利用を含んで成る。この活性は以下の試験を利用して確認できる。
例えば、式I,II及びIIIに記載の触媒領域の1又は複数のヌクレオチドはヌ
クレオチド含有塩基、例えばアデニン、グアニン、シトシン、メチルシトシン、
ウラシル、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、イノシン又はその他のメチル
化塩基により変換されうる。触媒ループの最初の塩基対合を形成し合う「保存」
塩基C−GはU−Aに置き代わりうる(Koizumi らFEBS Letts.228,2,228-230
,1988)。
図7に示す触媒領域のヌクレオチドも化学修飾してよい。このヌクレオチドは
塩基、糖及びモノリン酸基より成る。これらの基それぞれを修飾してよい。かか
る修飾は「Principles of Nucleic Acid Structure」(Wolfran Sanger編、Sprin
ger Verlag,New York,1
984)に記載されている。例えば、この塩基はハロゲン、ヒドロキシ、アミノ、ア
ルキル、アジド、ニトロ、フェニル基等の置換に耐えうる。このヌクレオチドの
糖成分はハロゲノ、アミノ又はアジド基による第二ヒドロキシル基の置換又は2
′メチル化の如くの修飾に重ねてもよい。
ヌクレオチドのリン酸基は、ホスホラミデート、ホスホロチオエート及びホス
ホネートのそれぞれをもたらしめるN,S又はCによる酸素の変換により修飾さ
れうる。この後者は有用な薬理動力学的特性を示しうる。
触媒領域の塩基及び/又はヌクレオチドは置換基、例えばチロシン又はヒスチ
ジンの如くのアミノ酸も有しうる。
本発明の態様に従うと、リボザイムは触媒領域として図17に示しているかの如
くの1又は複数の構造体を含んで成りうる。この構造体、いわゆる「ミニザイム
」は国際特許出願WO-A-9119789に記載されている。これは「ハンマーヘッド」タ
イプの触媒領域を示し、その「ループ」は「P」基により置き換えられている。
PはGと1Aとの共有結合、1もしくは複数のヌクレオチド(RNAもしくは DNA、
又は混合物、又は上記の誘導体)、又は触媒活性に影響を及ぼさない任意の原子
もしくはヌクレオチド以外の原子団であってよい。Pが複数のヌクレオチドを表
わすとき、それは内部塩基対合を含みうる。基「P」を構成するヌクレオチドの
配列及び数は重要でなく、そして1〜20個のヌクレオチドの間でよく、例えば好
ましくは1〜6個でよい。ワトソン・クリック型の内部塩基対合を欠く配列を選
ぶことが好ましい。
本発明のリボザイムの触媒活性はリボザイム又は事後転写によりリボザイムを
もたらす配列を基質と接触させ、次いで解裂を実証することによってインビトロ
で確認できうる。インビトロ解裂反応の
ための実験条件は下記の通りである:温度は4〜60℃、そして好ましくは20〜55
℃、pHは約 7.0〜 9.0、二価金属、例えばMg2+の1〜 100mM(好ましくは1〜20
mM)での存在下。ポリリボザイムは通常基質と等モニ比、又は過剰量で存在させ
る。インビトロ解裂反応は好都合にはLamb and Hay(J.Gen.Virol.,1990,71
,2257-2264)に記載の手順に従って実施する。この文献はプラスミドに挿入さ
れたオリゴデオキシリボヌクレオチドからのリボザイムの生成のためのインヒド
ロ転写にとって適切な条件も述べている。
インビトロ解裂条件は細胞に天然に存在している条件とする。
上記に記載の本発明の態様及び観点に従い、このリボザイムは標的mRNA配列に
「ハイブリダイズ」する又は「相補性」であるハイブリダイズアームを有すると
言われる。かかるハイブリダイゼーション及び相補は本明細書においては、標的
トリプレットでの解裂が生ずるよう、十分に安定な構造を形成するに足りる二本
鎖形成の度合いとして定義する。標的配列に依存して、このリボザイム及びmRNA
の二次構造は、標的mRNA配列とリボザイムの片方又は両方のハイブリダイズアー
ムとの間で好ましくは約5〜10以下、より好ましくは約3〜5、そして更により
好ましくは1〜3塩基以下で該対合するであろう。ハイブリダイズアーム全長で
、10%より多くの該対合が起こるべきでない。従って、本発明は本明細書に記載
のリボザイム、特にRz1,Rz2,Rz3,Rz4及び Rz5、それらを含むポリリボザイム
、並びにそれらの任意の又は全ての機能的突然変異体、誘導体、一部、同族体又
は類似体に及ぶ。かかる突然変異体の例にはリボザイムのハイブリダイズ領域及
び/又は触媒領域に対する一又は複数のヌクレオチド置換、欠失及び/又は付加
が含まれ、ただしかかる修飾リボザイムは標的mRNA配列を解裂する機能を維持し
ていることを条件とする。
別の観点からすると、本発明はハイブリダイズドメイン及び触媒ドメインを有
するリボザイムであって、このハイブリダイズドメインがTLCVもしくは TYLCVの
C1遺伝子をコードするmRNA分子中のヌクレオチド配列に実質的に相補性である
ヌクレオチド配列を含んで成るか、又は前記TLCVもしくはTYLCV mRNA配列と高ス
トリンジェンシー条件が高ストリンジェンシー条件下でインビトロでハイブリダ
イズし、そして前記触媒領域が前記mRNA配列を解裂できるリボザイムに及ぶ。本
発明の観点はインビトロでの標的mRNAの解裂の程度により好適に決定される。
本発明の目的にとって、SambrookらMolecular Cloning:A Laboratory Manual
,Cold Spring Harbor Laboratories,Cold SpringHarbor,NY,USA.頁 387-389
、パラグラフ11に記載のストリンジェンシー条件と考えられる。他方、中ストリ
ンジェンシーは0.25〜 0.5% W/VSDS、45℃、2〜3時間の利用でありうる。他
の条件も、核酸分子の濃度、純度及び起源に依存して適用できうる。
本発明は本明細書記載のリボザイムを含んで成る遺伝子構築体に及ぶ。これら
の遺伝子構築体は一般にリボザイムを宿主細胞に移し入れる媒体としてのベクタ
ー配列及びリボザイムの転写を指令するプロモーター配列並びにターミネーター
を含んで成る。好適なプロモーターには、限定することなく、35Sカリフラワー
・モザイクウィルス(CaMV)又はダブル35SCaMVプロモーターが含まれる。CaMV
プロモーターはOdell ら Nature 313:810-812,1985 に記載されている。これ
らのリボザイムは一般に相補性形態であり、転写により、リボザイムが生成され
る。本発明の遺伝子構築体は、本明細書記載のリボザイムを構成的、発育的又は
誘導的(例えば一定の刺激に応答して)に発現できる遺伝子導入植物を作るため
に用いられる。最も好ましい遺伝子細胞はTLCV感染に実質的に耐性とされる。
本発明のリボザイム及び遺伝子構築体は、ウィルス感受性植物を用いてインビ
ボで簡単に試験できうる。特に有用なインジケーター植物はタバコ植物である。
この分析は例えば症状の症度をスクリーニングすることにより定性的なものとす
るか、又はサンプルを例えばリボザイム発現レベルもしくは標的mRNAのレベルを
測定することにより定量的なものとすることができる。定性又は定量分析の組合
せも利用できうる。
外来 DNAを植物に導入するための全ての公知の手段、例えばアグロバクテリア
(Agrobacterium )、コレクトロポレーション、プロトプラスト融合、粒子ガン
によるボンバードメント、又は花粉、微小胞子、種子及び未熟胚の如くの細胞へ
の DNA浸透、ウィルベクター、例えばジェミニウィルス又はサテライトウィルス
を用いてよい。アグロバクテリア・トウメファシエンス(A.tumefaciens)及びリゾジーンス
(Rhizogenes)が好適な手段を成す。この場合、ポリリボザイムを
コードする配列を適当なベクターの中に、必要な全ての調節配列、例えばプロモ
ーター、ターミネーター等、並びに形質転換体の選別に必要な任意の配列と一緒
に導入する。
一の手法において、タバコ細胞を、試験すべき遺伝子構築体と一緒にアグロバ クテリア
を採用する標準手順を利用して形質転換する。一般に、タバコのアグロ バクテリア・トウメファシエンス
媒介形質転換はHorschらScience 227:1229-12
31,1985 に本質的に記載の通りにして実施するか、慣用の株LBA 4404を用い、
そして苗木を 250μl/mlの濃度のカナマイシンで選別する。形質転換細胞を小
植物に再生させ、そして発現のスクリーニングのためにサンプルを取り出す。こ
の植物を自己繁殖及び発芽(seed)させ、そして遺伝子導入種子を新植物を作る
のに用いる。この遺伝子導入植物を適当なコントロールを伴ってウィルスにさら
し、そして症状発症度を分
析する。別に、又は更に、生化学分析により定量評価を行ってよい。この手法は
ジェミニウィルス、そして特にTLCVに対するリボザイムのスクリーニングにとっ
て極めて有用である。適当なリボザイム遺伝子構築体がこの手順を利用して同定
できたら、これらの特定の構築体を、例えばTLCV及び TYLCVの場合、遺伝子導入
トマト植物を作るために用いることができる。類似の形質転換及びスクリーニン
グ手順を採用してよい。
遺伝子導入植物の耐性的性質は自己繁殖を実施することにより、又はT1を得
るための一世代子孫に基づいての非形質転換ゲノタイプとのかけ合わせにより試
験できうる。次いで、T1植物に、アグロ接種により DNAウィルスを接種する。
耐性度(即ち、「完全耐性」は症状の総合的な欠如を意味し、「寛容」は植物が
感染し、そして症状を示すが、回復することを意味し、「感受性」は、植物が症
状を示し、そしてウィルスを複製させることを意味する)を記録する。
本発明は特に、TLCV及び TYLCV感染に対して少なくとも多少耐性を示す遺伝子
導入トマト植物に関する。感染に対する耐性とは、約30%以上、好ましくは約50
%以上、そして更には約70%以上の症状の定量的軽減を意味する(一般にウィル
ス複製の阻害に基づく)。生物系の多様性に基づき、 100%のTLCV複製阻害を達
成するのは困難であるが、リボザイムの効果は様々な分子生物学的技術により高
まりうる。
本発明のこの観点に従うと、非遺伝子導入植物に比べてTLCVに対する曝露を経
て軽減した症状を示す遺伝子導入植物の方法を提供し、この方法はトマト植物細
胞を、TLCV由来のC1mRNAを解裂できる上記のリボザイムをコードする遺伝子構
築体で形質転換し、この形質転換細胞から植物を再生させ、この再生植物を自己
繁殖させ、そ
してそれから種子を換得し、そしてその種子から遺伝子導入植物を成育させるこ
とを含んで成る。
本発明は植物 DNAウィルス、より詳しくはジェミニウィルス、そして更には特
にTLCVに対する耐性を示す遺伝子導入植物に及ぶ。一の好適な態様において、こ
の遺伝子導入植物はトマト植物とする。本発明はかかる遺伝子導入植物由来の再
生材料及び種子にも及ぶ(例えばトマト植物)。このリボザイムは構成的、発育
的又は誘導的に発現されうる。
本発明は更に以下の限定でない図面及び実施例を参照することにより説明する
。
図面において:
図1は3種のTLCV単離体由来の相補性・センスストランドのヌクレオチド配列
を示す:上列、TLCV(オーストラリア);中列、TLCV(イスラエル);下列、TL
CV(サルジニア)。配列は5′→3′方向で示す。
図2はBamHI切断 Bin19にクローニングしたCaMV35S-1568bp TLCV フラグメン
ト(Rz1,Rz2,及び Rz3含有)− CaMVpolyAを含んで成る pRIBO5BINの模式図で
ある。3つのリボザイムRz1,Rz2,及び Rz3の挿入部位は位置1111,2056及び23
55に示す。この番号付けはビリオン−センス番号付けであり、そして図8及び10
に示す(−)センス番号付けを用いると、それぞれ位置1654,711 及び 412に相
当する。
図3はBamHI切断 Bin19にクローニングしたCaMV35S-1346bp TMCV フラグメン
ト(Rz1,Rz2,及び Rz3含有)− CaMVpolyA発現カセットを含んで成る pRIBO5B
IN DeLの模式図である。
図4はBamHI切断 Bin19にクローニングしたCaMV35S-3966bp TLCV フラグメン
ト(Rz1及び Rz2含有)− CaMVpolyA発現カセットを含
んで成る pRIBO7BINの模式図である。
図5はBamHI切断 Bin19にクローニングしたCaMV35S-30bp TLCVフラグメント(
Rz1含有)−CaMVpolyA 発現カセットを含んで成る pRIBO2BINの模式図である。
図6は遺伝子導入タバコにおけるリボザイム構築体発現のRT-PCR分析のために
用いたプライマーの位置の模式図である。
図7はリボザイムモデルの模式図である(Haselhoff and Gerlach,Nature,1
988 由来)。基質 RNAは、示している通り、リボザイムと塩基対合を形成する長
さの GUCに隣接する任意の配列(X)を解裂部位に有しうる。矢印は解裂部位を
示す。リボザイム中の保存塩基を枠で囲った。天然のハンマーヘッドにおいて、
基質及びリボザイム部はループにより接続され、分子内解裂がもたらされる。
図8は TYLCV-Sの相補性・センスストラントのヌクレオチド配列を示す。小文
字はリボザイム解裂部位を示す。 TYLCV-Sの配列はKher-Pour ら(Nucl.AcidRes
.(1991)19:6763)により公開されている。
図9はTLCVと TYLCV-S間の、レプリカーゼ遺伝子における保存領域を示す:図
9(a)はリボザイムR1,R4及びR5まわりに高度に保存されている領域を
示す;図9(b)はリボザイムR2のまわりに高度に保存されている領域を示す
。“:”は該対合を意味し、ギャップはヌクレオチドがないことを意味する。小
文字はリボザイム解裂部位を示す。
図10はTLCVの相補鎖のヌクレオチド配列を示す。Dry ら(J.Gen.Virol.(19
93)74:147)。小文字はリボザイム解裂部位を示す。
図11はポリリボザイムD,F及びEの標的配列を示す。小文字はリボザイム解
裂部位を示す。大文字はリボザイムアームの相補性配列に相当する。
図12はリボザイム構築体の模式図である。斜線は TYLCV-S相補性・センススト
ランドを表わし、そして実線はTLCV相補性・センスストランドを表わす。R=リ
ボザイム。
図13は二重ベクターpGAZE の模式物理地図である。
図14はリボザイムプラスミド、pGAZE-RzA,pGAZE-polyRzC,pGAZE-polyRzD,p
GAZE-polyRzE,pGAZE-polyRzF,の模式物理地図である。
図15(a)は EcoRV切断 Bluescript SK+に平滑末端化した pRIBO5BS:1690b
d TLCV C1/C2/C3相補性フラグメント(3つのリボザイムを含む)の模式図で
ある; 図15(b)は BamHI切断 BIN19にクローニングした pRIBO5BIN:2660bp
BgL II35S-C1/C2/C3相補性(3つのリボザイム含有)CaMVpolyA カセットの
模式図である;白抜き三角形は22bpのリボザイム挿入の位置を示す。E:EcoRI;
H:HindIII;K:KpnI;P:Pst I;Sm:SamI;B:BamHI;SL:SaLI;St:SstI;X:
Xho I;Xb:XbaI;C:Cla I。
図16はリボザイム構築体の模式図であり、それらの相互関係並びに「ショート
アーム」リボザイム、polyE,polyF及びpolyD を得るのに実施した欠失を示す。
図17は「ミニザイム」構造を示し(WO-A-9119789)、ここで触媒領域のループ
は要素「P」により置き換えられている。Pは、「P」基のリボヌクレオチドが
、配列(X′)n及び(X)n 2及びPがもっぱらリボヌクレオチドより成るとき
に「ワトソン・クリック」塩基対合により塩基対合しないことを条件として、少
なくとも1個のヌクレオチドである(リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオ
チド、誘導体又は混合物)。「P」は結合又は任意の原子もしくは原子団であっ
てもよく、ただしリボザイムの触媒活性に影響を及ぼしてはならない。Xは式I
,II,IIIにおけるものと同じ意味を有
する。
実施例実施例I−TLCVの標的mRNAの選別:
適当な標的 RNAの選別ができるようにするため、主要mRNA転写体を同定し、そ
してTLCVのオーストラリア単離体の環状ゲノムの上で地図化した[TLCV(オース
トラリア)Mullineauxら、前掲;Dry ら前掲]。ウィルス DNAの相補性・センス
ストランド由来のウィルスmRNAの一つは他のTLCV転写体より少ない量で見い出さ
れた。この少量mRNA転写体はC1遺伝子をコードするものとして同定され、その
生成物はウィルスの複製にとって必要である。Daviesら、Trends in Genetics,
5:77-81,1989 ]。このmRNAはC2,C3及びC4と命名された。3つのその
他の遺伝子生成物もコードする。それらの機能はあまりよく分かっていない。従
って、C1遺伝子をコードするこの量の少ないmRNAを標的mRNAとして選んだ。こ
の転写体の量の少なさは高率のリボザイム標的配列を意味し、これによりC1遺
伝子生成物のより実質的な低下が潜在的に可能である。実施例II−TLCV単離体間でのC1遺伝子の保存領域に基づくリボザイムの選別
3つのTLCV単離体[TLCV(オーストラリア)、TLCV(イスラエル)及びTLVC(
サルジニア)]の相補性センスストランドのヌクレオチド配列を、リボザイムに
より標的とされる保存領域を同定するために比較した。この配列対比を図1に示
す。3つの保存領域をリボザイムのデザインのために同定した。これらの保存領
域のうちの2つを図1に示す。配列対比に加えて、リボザイムのより高い効果が
可能となるように標的部位の二次構造を推定するためにコンピュータープログラ
ムを用いた。実施例III−TLCVのC1遺伝子の保存配列を標的とするリボザイムの合成
実施例IV−Rz1,Rz2及び/又はRz3:pHIBO5BIN を担持する遺伝子構築体:
C1,C2,C3及びC4リーディングフレーム(ORPS)を含むヌクレオチド
1075-2643 由来のTLCVの1568フラグメントをpALTER-1(Promega)の中にクローニ
ングした。リボザイム配列1,2及び3(それぞれRz1,Rz2及びRz3)を実施例III
に記載の通りにして合成し、そしてインビトロ突然変異誘発系(Promega)におい
て改変部位を利用してTLCV配列に導入した。導入リボザイム配列の組込みはジデ
オキシ連鎖停止法を利用する配列決定により確認した。Rz1,Rz2及びRz3 は50℃
及び37℃において、57 RNAポリメラーゼにより作った相補性・センスウィルス R
NA転写体のインビトロ解裂を触媒することを示した。Rz1,Rz2及びRz3 を含む改
変1634bp相補性・センスTLCVフラグメントをアンチセンス方向で(C1 ORF転写に
対し)、ダブル35S CaMVプロモーターとCaMVpolyA 終止配列との間にクローニン
グし、そして完全発現カセットを二重(binary)ベクター Bin19のの多重クロー
ニング部位のBsmHI部位の中に導入した。得られる構
築体を pRIBO5BINとし、そして図2に示す。実施例V−Rz1,Rz2及び/又は Rz3:pRIBO5BIN DeLを担持する遺伝子構築体
この構築体は pRIBO5BIN(実施例IV)より、TLCVのBstBI部位(ヌクレオチド
2424)から3′末端に至る 216bpの領域の欠失により得た。得られる構築体をpR
IBO5BINDeLとし、そして図3に示す。実施例VI−Rz1,Rz2及び/又は Rz3:pRIBO7BINを担持する遺伝子構築体
:
この構築体は pRIBO5BINDeL(実施例V)より、TLCVフラグメントの5′末端
(ヌクレオチド1075)から XhoI部位(ヌクレオチド2425)に至る 950bpの領域
の除去により得た。得られる構築体を pRIBO7BINとし、そして図4に示す。実施例VII−Rz1,Rz2及び/又は Rz3:pRIBO2BINを担持する遺伝子構築体
:
Rz1 を含む52bpのフラグメントを pRIBO5BIN(実施例IV)よりポリメラーゼ連
鎖反応(PCR)によって増幅させ、そしてアンチセンス方向(C1 ORF転写に対し)
で、ダブル35S CaMVプロモーターとCaMVPolyAS終止配列との間にクローニングし
、そして完全発現カセットを二重ベクター Bin19の多重クローニング部位のBamH
I部位の中に導入した。得られる構築性を pRIBO2BINとし、そして図5に示す。実施例VIII−遺伝子導入タバコ細胞系におけるリボザイム遺伝子構築体の発現:
実施例5〜8記載のリボザイム構築体を PCR分析を利用して遺伝子導入タバコ
植物における発現について試験した。
葉のサンプル(150mg)を、温室の中で鉢植えする前に遺伝子導入タバコ細胞系
から集め、そして液体N2の中で凍結した。サンプルを粉末となるまで粉砕し、
そして 0.5mlの抽出バッファー(0.1Mの
トリス−HCL(pH9),0.1MのNaCl,10mMのEDTA,1% W/V の SDS及び1% V/
V のベータメルカプトエタノール含有)及び 0.5mlのフェノールを伴って30S間
ボルテックスにかけた。この抽出物を12,000gで10分遠心し、そして上清画分を
集めた。この上清画分を更にフェノール、次いでフェノール/クロロホルム(1
:1)で抽出した。全核酸画分を−20℃で酢酸ナトリウム/エタノールで沈殿さ
せ、そして 12000gで10分遠心した。このペレットを80% V/V のエタノールで
洗い、乾かし、そして50μlの減菌水に再懸濁した。
第一ストランドcDNA反応は以上の通りに実施した。核酸サンプルを65℃で5分
、 100mgの CaMV Termプライヤー(5′-TTTACAAATACAAATACATACTAAGGGT )と全
容量を5mlにおいてアニールした。このプライマーはこれらの転写体から生成し
た全てのリボザイム構築体(図6参照)転写体の中に存在しているCaMV終止配列
内の領域に相補性である。
アニールした鋳型に、50mgのトリス−HCl (pH8.3),50mMのKCl,10mMのMgCl2
,0.5mM のスペルミジン、10mMの DTT,1単位のリボヌクレアーゼインヒビタ
ー及び2.25単位の AMV逆転写酵素を含む5μlの逆転写酵素混合物を加えた。こ
の混合物を42℃で60分、次いで94℃で2分インキュベートした。表示している場
合、コントロール反応を実施し、それにおいては AMV逆転写酵素は、反応体mMト
リス−HCl (pH9),1.5mM のMgCl2,1.5mMのMgCl2,0.1% V/V のTriton X-100
,200 μMのdNTP,250 μMのCaMV Term プライヤー(図6参照)、 0.5単位の
Tag DNAポリメラーゼ及び2μlの第一ストランドcDNA反応混合物から排除して
ある。2つの交互の5′末端プライマーを使用し、その位置は添付図面に示して
いる:
PCR サイクル条件は、94℃で1分、50℃〜55℃で1分、72℃で3分を15〜30サ
イクルとした。 PCR生成物は 1.2〜 1.8% W/V アガロースゲルで分析した。
C3/CaMV Term プライヤー組合せを用いるRIBO5BIN及びRIBO5BINDeL の逆転写
酵素(RT)-PCR 分析はほぼ推定のサイズ、即ち、それぞれ1690bp及び1450bpの DN
A生成物を生成した。
R1B /CaMV Term プライヤー組合せを用いるRIBO5BIN,RIBO5BINDeL 及びRIBO
2BINのRT-PCR分析は、ほぼ推定のサイズ、即ち、それぞれ 504bp, 264bp及び 2
35bpの DNA生成物を生成した。
コントロール反応においては PCR生成物は認められなかった:(a)逆転写酵
素なし(b)ベクター配列のみで形質転換された植物由来の核酸サンプル、即ち
、リボザイム配列を含まないもの。このことは、これらのプライマーにより観察
された PCR生成物が、導入したリボザイム構築体の RNA転写体に特異的に由来す
ることを実証する。
C3/CaMV Term プライヤー組合せを用いる推定 PCR生成物のサイズは以下の通
りである:
1.RIBO5BIN 1690 bp
2.RIBO5BINDel 1450 bp
3.RIBO7BIN −
4.RIBO2BIN −
RIB /CaMV Term プライマー組合せを用いる推定PCR 生成物のサイズは以下の
通りである:
1.RIBO5BIN 504 bp
2.RIBO5BINDel 264 bp
3.RIBO7BIN 264 bp
4.RIBO2BIN 235 bp
実施例IX−リボザイム遺伝子の構築
:
ジェミニウィルスのC1 ORFによりコードされる推定アミノ酸配列の対合対比を
調べた(表1)。
サルジニア(Kheyr-Pourら、NAR (1991)19:6763),タイ(Rochester ら、Vi
rology(1990)178:520)),イスラエル(Navotら、Virology(1991)185: 15
1)),オーストラリア(Dry ら、J.Gen.Vir.(1993)74:147)由来の TYVCV
ゲノム単離体のヌクレオチド配列の整合は、それらが、ウィルスの複製に必須の
ポリペプチドをコードするC1転写体の内部フラグメントにおける3つの保存領
域であることを示す。TYLCV-S ゲノムのこのBstBI/ Eco0190I内部フラグメン
ト(nt346〜nt982)を DraII/ SmaI消化 pBluescriptII SK +ファージミド(ST
RATAGENE)にクローニングした。このクローンを、最も高度に保存された領域の
中に2つのリボザイムを導入する鋳型として用いた。二及び三次元フォルディン
グ分析も、リボザイムによる解裂のためのより理論的なアクセス可能な標的部位
を維持するために行った。
ハンマーヘッドタイプ RNA(図1)の触媒ドメイン、この場合ではタバコ・リ
ングスポット・ウィルス(STobRV)のサテライト RNAを、完全に無縁の基質 RNA
と共にin transのハンマーヘッド構造をデザインするために用い、これにより標
的部位は推定部位において特異的に解裂する(Haseloff and Gerlach (1989),Ge
ne,82:43-52)。これらの著者により述べられている一般法則に従うと、ハンマ
ーヘッドタイプのリボザイムにより解裂される基質 RNAにとっての唯一の要件は
、トリヌクレオチド配列の存在にある(その自己解裂は述べられている)(Perr imanら
Gene(1992)113:157)。 TYLCV-SのC1転写体の最も高度に保存され
た領域上に残っているハンマーヘッドタイプリボザイムのための2つの位置を図
2及び3に
示す。
*位置R4、ヌクレオチド 407(標的部位 GUC);
*位置R5、ヌクレオチド 430(標的部位 UUC);
これらの位置に TobRVのサテライト RNAの22塩基のハンマーヘッド配列を導入
するため、Kammann ら(Nucl.Acid.Res.(1989)17:5404)に記載のポリメラ
ーゼ連鎖反応(PCR)による DNAの迅速挿入突然変異誘発手法を利用した。
この方法は以下の合成オリゴヌクレオチドを必要とする:
2つのハンマーヘッドタイプリボザイムを担持するオリゴR4−R5:
下線配列は ToRSTのサテライトのハンマーヘッド構造に相当する大文字は標的
部位に相当する。
オリゴR4−R5はApplied Biosystems Model 380B DNA 合成装置で合成した
:
オリゴT7 配列決定用プライマー(Pharmacia):
オリゴT3 配列決定用プライマー(Pharmacia):
第一 PCR(PCR)工程において、オリゴR4−R5及びオリゴT3配列決定用プ
ライマー間の配列を増幅させた。この増幅フラグメントをモレキュラー・シーブ
・カラム(Prime Erase Quick(商標)キット、STRATAGENE)で精製した。第二 PC
R(PCRII)工程において、この増幅フラグメントをそれ自身プライマーとして、オ
リゴT7の配列決定用プライマーと組合せて用いた。 PCR条件は FILのと通りと
した:
PCR は50mMのKCl,10mMのトリス−HCl pH8.3,1.5mM のMgCl2,300mMづつの
dNTP,2Uの Tagポリメラーゼ(Perkin Elmer Cetus),40pgの鋳型 DNA,100p
M づつのプライマーを含む全反応容量100μlで実施した。 PCRIIは PCRIと同
じだが、5μl(アガロースゲルから推定して 300ngの増幅フラグメント)アッ
セイ容量の PCRIをプライミングに直接用いた。変性:2min 94℃;アニーリン
グ2min 40℃;合成3min 72℃;各工程を30サイクル。
アガロース電気泳動を用いる精製後、 PCR生成物をBstBIで消化し、クレノウ
フラグメントでフィル・インし、そして最後にEco0109Iで消化した。得られる
679ntフラグメントを SmaI/ DraII消化Bluescript SK +ベクターにクローニ
ングした。クローニング配列を含むクローニングベクターを当業界公知の技術を
利用して細菌宿主XL 1 Blue(STRATAGENE)の中に形質転換し、そして繁殖させた
(Maniatis,Molecular cloning,A Laboratory quide,第2版、1939,Cold Sp
ring Harbor Laboratory publishers)。
TobRV のサテライト RNAの2つのハンマーヘッド配列の存在はT7配列決定用
キット(Pharmacia)を用いる配列分析により確認した。この結果は触媒性R4及
びR5部位の完全挿入を示した。実施例X−リボザイムプラスミドの構築
:
図15に示すプラスミドpRIBO5BSはその外のプラスミドの構築のための基礎であ
る。このプラスミドは1690bpの5′末端− AseIフラグメントをもつpBluescrip
t SK+ベクターであり、それは次の位置に3つのハンマーヘッドタイプリボザイ
ムをもつTLCV(図4)のC1/C4/C2/C3相補性フラグメントに相当する
:
−R1(ヌクレオチド 412、標的部位 CUU)、
−R2(ヌクレオチド 711、標的部位 CUU)及び
−R3(ヌクレオチド1654、標的部位 GUA)。
プラスミドpポリリボザイムEはプラスミドpRIBO5BSより、位置R2及びR3
にある2つのハンマーヘッドタイプ配列間の領域に相当する 877bpの「クレノウ
ポリメラーゼを用いてフィル・インした XhoI-BclI」フラグメントと、 264bp
の「5′末端− TthIIII」フラグメントを欠失させることにより得た。このTth
IIII部位をクレノウポリメラーゼを用いてフィル・インした。この「Tth III
I−HindIII(pBluescript SK +ベクターの部位)フラグメントをアガロースゲル
の電気泳動による分離後に単離した。このフラグメントを、マング・ビーン・ヌ
クレアーゼフラグメントを用いて消化した SacI-XbaIから予め欠失させた、pB
luescript SK+ベクターのクレノウポリメラーゼを用いてフィル・インしたEcoR
I及びHindIII部位の中にクローニングした。
ポリリボザイムEは 434個の塩基を含み、そして図5及び6に示す通り3つの
リボザイムR1(位置28),R2(位置 327)及びR3(位置 399)を含む(pol
y R2E-R2)。リボザイムの触媒性ドメインに隣接するアームのサイズは:
*5′末端からリボザイムR1に至る27ヌクレオチド;
*R1とR2との間の 298ヌクレオチド;
*R2とR3との間の71ヌクレオチド;
*リボザイムR3から3′末端に至る35ヌクレオチド。
ポリリボザイムFプラスミドはpポリリボザイムEプラスミドに由来する。リ
ボザイムR1を含むTLCVのレプリカーゼ遺伝子の56bpの「 SmaI(pBluescript
SK+ベクターの中の5′末端付近の位置)−SacI」フラグメントを、先に記載
の通りにして2つのリボザイムR4及びR5をもつ TYLCV−サルジニア単離体の
レプリカーゼ遺伝子の98bpの「クレノウ−ポリメラーゼを用いてフィル・インし
たBstBI-SacI」フラグメントに置き換えた。変換したフラグメン
トは TYLCVとTLCV株間で非常に高度に保存されている領域を有する。TLCVの 365
nt〜 435ntと TYLCV−サルジニア単離体の 370nt〜 440nt領域との間でのヌクレ
オチド配列同一性は97%に相当した(図3)。
キメラポリリボザイムFは2つの異なる起源: TYLCV−サルジニア単離体及び
TLCV−オーストラリア単離体を有するレプリカーゼ遺伝子フラグメントを含む。
これらのフラグメントの集成を SacI部位において行った。人工ポリリンカーを
用いて2つのフラグメントを集成することも可能である。この非相補性配列の一
体化はポリリボザイムの触媒活性に有害な影響を与えなかった。
ポリリボザイムFは 479塩基を含み、そして図5及び6に示している通り、4
つのリボザイム、R4(位置59),R5(位置83),R2(位置 372)及びR3
(位置 444)を含む。
リボザイムの触媒ドメインに隣接するアームのサイズは以下の通りである:
*5′末端からリボザイムR4に至るまで59ヌクレオチド;
*リボザイムR4とR5との間で22ヌクレオチド;
*リボザイムR5とR2との間で 288ヌクレオチド;
*リボザイムR2とR3との間で71ヌクレオチド;
*R3から3′末端に至るまで35ヌクレオチド。
キメラpポリリボザイムDはpポリリボザイムFに由来する。TLCVに由来する
206bpの「Sac I-SwaI」フラグメントを欠失させた。 SacI部位はT4-DNAポリ
メラーゼの作用により破壊した。ポリリボザイムDは 270塩基を含み、そして図
5及び6に示している通り4つのリボザイム、R4(位置59),R5(位置83)
、R2(位置 163)及びR3(位置 235)を含む。
リボザイムの触媒ドメインに隣接するアームのサイズは以下の通
りである:
*5′末端からリボザイムR4に至るまで59ヌクレオチド;
*リボザイムR4とR5間で22ヌクレオチド;
*リボザイムR5とR2間で79ヌクレオチド;
*リボザイムR2とR3間で71ヌクレオチド;
*リボザイムR3から3′末端に至るまで35ヌクレオチド。
ポリリボザイムE,F及びDの配列を Pharmaciaより供給のT7配列決定用キ
ットを用いて確認した。
ポリリボザイムE,F及びDの機能は Pormege由来の「Protocol and Applica
tion Book 」に記載のプロトコールに従ってインビトロで試験した。
発現シグナルはポリリボザイムの中に含ませなかった。このため、これらはダ
ブル35Sプロモーター及びCaMVの35S RNAのポリ(A)のコントロール下に置い
た。
このような構築を実現するため、ダブル35Sプロモーター、モノリボザイムR
1及びCaMVの35Sのポリ(A)より成る発現カセットを下記の pRIBO2BINプラス
ミドから単離した。
pRIBO2BINプラスミドを SacIで消化した。 SacI部位をT4-DNAポリメラーゼ
を用いて平滑末端にした。
線状化 pRIBO2BINプラスミドをSalIで消化し、発現カセットを含む「 SacI
フィルド・イン SalI」フラグメントをアガロースゲルで構築し、そしてpBlues
cript SK+ベクターの中に「クレノウポリメラーゼを用いてフィル・インした X
baI及び SalI」部位においてクローニングした。
次にモノリボザイムR1に相当するHindIII- BamHIフラグメントを、pポリ
リボザイムE,F及びDのそれぞれから単離したポリリボザイムE,F及びDを
含むHindIII- BamHIフラグメントに置き換
えた。HindIII- BamHIフラグメントは発現ベクターにおいて逆方向となってい
る。
ポリリボザイムE,F又はDを有する発現カセットpGA492(An,Plant Physiol
.(1986)81:86)由来の二重ベクター pGAZE(図7)にクローニングした。こ
のpGA492ベクターを SacI及びSca Iで二重消化し、T4ポリメラーゼを用いて
平滑末端にし、そしてアガロースゲル精製の後にライゲーションした。
排除されたフラグメントはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ
遺伝子のほぼ全体に相当する。このHindIII部位をStratageneにより供給されたH
indIII- EcoRIアダプターによりEcoRI部位に変換させもした。pGA492に関し、
pGAZEは植物形質転換のために必要な cis作用要素、例えば T-DNAボーダー、植
物において発現可能な選択マーカー(カナマイシン耐性)、クローニング部位、
及び広宿主域レプリコンを含む。カナマイシン耐性マーカーはtn5のノパリンシ
ンターゼコントロール領域及びネオマイシンホスホトランスフェラーゼコード領
域から構築した。
pGAZEベクターをEcoRIで消化し、そしてクレノウポリメラーゼを用いしフィ
ル・インした。ポリリボザイムE,F又はDを有する発現カセットを含む「 Sac
Iフィル・イン SalI」フラグメントをpGAZE のEcoRIフィル・イン部位にクロ
ーニングした。
得られる組換二重ベクター、 pGAZE−ポリリボザイムE,pGAZE −ポリリボザ
イムF及び pGAZE−ポリリボザイムD(図9)を直接形質転換(Holstersら、Mo
l.Gen.Genet.(1978)163:181 由来のプロトコール)により、アグロバクテ リア・トウメファシエンス
のデスアーム株 LBA4404(Hoekema ら、Nature(1983
)303:179)の中に導入した。
触媒ドメイン及び隣接アーム(長さ15塩基)を含むモノリボザイ
ムR1に相当するリボザイムA、並びに上記のポリリボザイムC(実施例V)に
ついて、上記の通りにして pGAZE及び/又は pGA492 の中に発現カセットを導入
した。
これにより、 pGAZE−リボザイムA, pGA492 −リボザイムA及び pGAZE−ポ
リリボザイムC(図8)が得られた。上記の構築体全ての課題の遺伝子をアグロ
バクテリアを基礎とする共培養系を利用してトマトに導入した。トマトの形質転
換及び再生はEillattiら(Biotechnology(1987)5:726)に記載の通りにして
実施した。実施例XI−遺伝子導入植物の分子分析
* RNA分析:
全 RNAをChandlerら(Plant Physiol.(1983)74:47)に従い、グリーンハウ
スの中で成育させた遺伝子導入及び非遺伝子導入植物の幼葉から単離した。 RNA
をアガロース・ホルムアルデヒドゲルで分離し、そしてニトロセルロース膜に転
写した。そのブロットを課題の遺伝子のラベル化フラグメント又は全体とハイブ
リダイズさせた。等量の RNAが各ラインに適用されたかをチェックするため、ニ
トロセルロース膜をメチレンブルーで染色した。
* DNA分析:
サザンブロット分析のため、全 DNAをDellaportaら(Plant Mol.Biol.Rep.
(1983)1:19)に従ってグリーンハウスの中で成育させた遺伝子導入及び非遺
伝子導入植物の幼葉から単離し、制限酵素によってその製造者の仕様書に従って
消化し、アガロースゲルで電気泳動させることにより分離し、そして毛細管作用
によりニトロセルロースに移した。このブロットを課題の遺伝子のラベル化フラ
グメント又は全体でプロービングした。実施例XII−アグロ接種による種々の構築体により形質転換したトマト植物の T YLCV耐性の評価
TYLCV又はそのクローニング DNAは機械的に導入できないため、アグロ接種技
術(Grimsley ら Plant DNA Infections Agents,Hoho and Schell(編)Springe
r,Wien,New york(1987)pp87-107)をクローニング DNAの感染能をアッセイ
するために用いた。
TYLCV−サルジニア株ゲノムを二重植物形質転換用ベクターpBin19(Stanley
ら EMBO J.(1986)5:1761)の SstI部位に挿入し、そしてpBin19のポリリ
ンカーから TYLCVの遺伝子内領域を通じて TYLCVの地図位地 152にあるBamHI部
位に及ぶ約 600bpのBamHIフラグメントを欠失させた。次に TYLCVの完全ゲノム
ユニットも残りの SstI部位に挿入してpBin19中の 1.8量体の TYLCV−ゲノムを
得た。このプラスミドを直接アグロバクテリア・トウメファシエンス株 LBA4404
に導入した。アグロバクテリア・トウメファシエンス培養物を28℃で約48時間増
殖させた。この細胞をペレット化し、そして水で2回洗い、そして最初の減菌水
の1/10の量に再懸濁した。
3〜4葉段階にある若い形質転換トマト植物を18ゲージ針を用いて、濃縮アグ
ロバクテリアにより3枚の最も若い葉の葉柄に接種した。
この植物を密閉成育槽の中に16h、日光のもとで24℃、70%の相対湿度で入れ
ておいた。
当業者は本発明は本発明の範囲で遠脱することなく改良できることを予測でき
るであろう。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(72)発明者 ボーディノ,シルビー
フランス国,エフ―63870 オーチン,ロ
ティスメン―レ―ボルカン,2
(72)発明者 メイソン,ジョン
オーストラリア国,ビクトリア 3066,コ
リングウッド,ジップス ストリート
16,カルジーン パシフィック プロプラ
イアタリー リミティド
(72)発明者 コミュー,デビッド
フランス国,エフ―63000 クレルモン―
フェーラン,リュ―ア.―カルル,9
(72)発明者 レザラン,モハマッド アリ
オーストラリア国,サウス オーストラリ
ア 5066,バーンサイド,シッターズ メ
モリアル ドライブ 14
(72)発明者 ドライ,イアン バリー
オーストラリア国,メルローズ パート
5039,キンストン アベニュ 111
(72)発明者 リグデン,ジャスティン エリス
オーストラリア国,サウス オーストラリ
ア 5024,ウエスト ビーチ,チェットウ
インド ストリート 10
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.ハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで成るリボザイムであって、ここ で前記ハイブリダイズ領域が、植物細胞に感染できる DNAウィルスに結合してい る DNA分子から転写された標的mRNA配列の少なくとも一部にハイブリダイズする ことができ、ここで前記触媒領域が前記標的mRNA配列を解裂でき、これにより前 記 DNAウィルスの複製、感染及び/又は集成を実質的に抑制することができる、 リボザイム。 2.前記植物 DNAウィルスが一本鎖 DNAウィルスである、請求項1記載のリボ ザイム。 3.前記一本鎖 DNAウィルスがジェミニウィルスである、請求項2記載のリボ ザイム。 4.前記ジェミニウィルスが、メイズ・ストリーク・ウィルス(MSV)、ビーン ・ゴールデン・モザイクウィルス(BGMV)、アフリカン・カッサバ・モザイクウ ィルス(ACMV)、クロリス・ストリエート・モザイクウィルス(CSMV)、トマト ・イエロー・リーフ・カール・ウィルス(TYLCV)、トマト・ゴールデン・モザイ クウィルス(TGMV)、トマト・リーフ・カール・ウィルス(TLCV)及びビート・ カーリー・トップ・ウィルス(BCTV)より成る群から選ばれる、請求項3記載の リボザイム。 5.前記ジェミニウィルスがトマト・リーフ・カール・ウィルス(TLCV)、ト マト・イエロー・リーフ・カール・ウィルス(TYLCV)又はそれらの突然変異体、 誘導体もしくは変異体である、請求項4記載のリボザイム。 6.ハイブリダイズ領域及び触媒領域を含んで成るリボザイムであって、ここ で前記ハイブリダイズ領域がジェミニウィルスのビリ オン・センス DNA分子又はこのビリオン・センス DNA分子に相補性である DNA分 子から転写された標的mRNA配列の少なくとも一部にハイブリダイズでき、ここで 前記触媒領域が前記標的mRNA配列を解裂でき、これにより前記ジェミニウィルス の複製を実質的に抑制する、リボザイム。 7.前記mRNA転写物が、ウィルスにより指令されたその他のmRNA転写物よりも 少ない量となっている、請求項6記載のリボザイム。 8.前記mRNA転写物が、C1,L1,AL1,AC1又はジェミニウィルス遺伝子 の複製に関するその他の遺伝子に由来する、請求項7記載のリボザイム。 9.前記C1遺伝子が前記ジェミニウィルスの相補性・センス DNAストランド により特異的とされてる、請求項8記載のリボザイム。 10.前記ジェミニウィルスが、メイズ・ストリーク・ウィルス(MSV)、ビーン ・ゴールデン・モザイクウィルス(BGMV)、アフリカン・カッサバ・モザイクウ ィルス(ACMV)、クロリス・ストリエート・モザイクウィルス(CSMV)、トマト ・イエロー・リーフ・カール・ウィルス(TYLCV)、トマト・ゴールデン・モザイ クウィルス(TGMV)、トマト・リーフ・カール・ウィルス(TLCV)及びビート・ カーリー・トップ・ウィルス(BCTV)、好ましくはTLCV,TYLCV又はその突然変 異体、誘導体もしくは変異体より成る群から選ばれる、請求項9記載のリボザイ ム。 11.前記リボザイムのハイブリダイズ領域が配列X0UYに隣接するリボヌクレオ チドの配列にハイブリダイズすることができ、ここでXは任意のリボヌクレオチ ド、Uはウラシル、そしてYはアデニン、シトシン又はウラシルであり、前記ハ イブリダイズ領域は図1に示す配列の領域の一部と実質的に同一であるヌクレオ チド配列を含 んで成る、請求項10記載のリボザイム。 12.次の群 及び から選ばれる、請求項11記載のリボザイム。 13.エンドヌクレアーゼ活性を有し、且つ DNAウィルスの複製、感染又は集成 を阻害できる核酸化合物であって、次の一般式を有する少なくとも一の単位「R 」 5′(X−Y−X′)3′ (ここで: X及びX′はそれぞれ独立して少なくとも4個のヌクレオチド配列を示し、そ してウィルスのゲノム又は DNAウィルスの(−)センス RNA転写物のいづれかの 少なくとも一部に相補性であり; Yはリボザイムの触媒領域を表す)を含んで成る、核酸化合物。 14.一の「R」単位のみを含んで成り、且つ次の一般式 [X−Y−X′] (ここでX,X′及びYは先に定義の通りである)を有する、請求項13記載の核 酸化合物。 15.複数の「R」単位を含んで成り、且つ次の一般式 R1−R2…Rn (ここでRは先に定義の通りであり、そしてn>1である)を有する、請求項13 記載の核酸化合物。 16.任意の「R」単位内のX及びX′配列が DNAゲノムウィルス又は(−)セ ンス RNA転写物の隣接連続部に相補性である、請求項14記載の核酸化合物。 17.一定の「R」単位の3′X′配列及びその隣接の「R」単位の5′X配列 が、 DNAゲノム又は(−)センス RNA転写物の中で連続となっている配列に相補 性である、請求項15記載の核酸化合物。 18.任意の「R」単位内のX及びX′配列がゲノム又は(−)センス RNA転写 物の不連続部に相補性である、請求項14記載の核酸化合物。 19.一定の「R」単位の3′X′配列及び隣接の「R」単位の5′X配列が、 ゲノム又は(−)センス RNA転写物の不連続部に相補性である、請求項15記載の 核酸化合物。 20.少なくとも4個の塩基を有し、且つウィルスのゲノム又は(−)センス R NA転写物に対して相補性でない配列「A」を2つの連続「R」単位の間に含む、 請求項13〜19のいづれか1項記載の核酸化合物。 21.前記相補性でない配列「A」がポリリンカー又はスペーサーである、請求 項20記載の核酸化合物。 22.少なくとも2種のタイプの DNAウィルスの単離体のゲノム又は(−)セン ス転写物に対して相補性であるX及びX′配列を含んで成る請求項15〜21のいづ れか1項記載の核酸化合物。 23.少なくとも一の「R」単位が、 DNAウィルス間、例えば同一のタイプの D NAウィルス間で高度に保存されている領域に対して相補性である、請求項15〜21 のいづれか1項記載の核酸化合物。 24.前記リボザイム触媒領域「Y」がハンマーヘッド触媒領域で ある、先の請求項のいづれか1項に記載の核酸化合物。 25.次式(I)のリボザイム (式中、(X)n及び(X)n′は DNAウィルスのmRNA配列に実質的に相補性であ るリボヌクレオチド配列を表わし;nとn′の合計は同一又は異なっていてよく ;(* )は相補性リボヌクレオチド間の塩基対合を表わし;Yは任意のリボヌク レオチドを表わし、そして各Yは同一又は異なっていてよく;Y′及びY″はオ リゴヌクレオチド間での塩基対合が可能となるようにその全長の少なくとも一部 の間が相補性配列のリボヌクレオチドで表わすか、又はY′及びY″は一緒にな って一本の RNA配列を形成しており、ここでのこの配列の少なくとも一部は相補 性ヌクレオチド間の塩基対合により形成されるステムを含んで成り;そして任意 的にA,G,C又はUのいづれかより選ばれる追加のヌクレオチドが1Aの後方 に挿入されている)。 26.次式(II)の請求項25のリボザイム (式中、(X)n及び(X)n′は DNAウィルス、そして特にジェミニウィルス、 例えばTLCV又は TYLCVのmRNAに対して実質的に相補性であるリボヌクレオチド配 列を示し;Yは任意のリボヌクレオチドを表わし、そして各Y残基は同一又は異 なっていてよく;(*)は相補性ヌクレオチド間での塩基対合を表わし;n及び n′は先に定義の通りであり;Bは結合、塩基対合、リボヌクレオチド又は少な くとも2個のリボヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドを表わし;m及びm′ は1以上であり、そして同一又は異なっていてく;そして任意的に、A,G,C 又はUのいづれかより選ばれる追加のヌクレオチドが1Aの後方に挿入されてい る)。 27.次式(III)の請求項26記載のリボザイム (式中、(X)n及び(X)n′は DNAウィルス、そして特にジェミニウィルス、 例えばTLCVのmRNAに実質的に相補性であるリボヌクレオチドを表わし;Yは任意 のリボヌクレオチドを表わし、そして各Y残基は同一又は異なっていてよく;( *)は相補性リボヌクレオチド間での塩基対合を表わし;n及びn′は先に定義 の通りであ)。 28.次の群から選ばれる、請求項27記載のリボザイム 及び 29.請求項1,6,13,25又28に記載のリボザイムの相補性配列及びベクター 配列を含んで成る遺伝子構築体。 30.前記相補性リボザイム配列に作動連結しているプロモーターを更に含んで 成る請求項29記載の遺伝子構築体。 31.次の群、pRIBO5BIN,pRIBO5BINDel,pRIBO7BIN,pRIBO2BIN,pGAZE-RzA, pGAZE-polyRzC,pGAZE-polyRzD,pGAZE-polyRzE,pGAZE-polyRzF,pGA492-RzA及 びpGA492polyRzC より選ばれる遺伝子構築体。 32.植物 DNAウィルスの複製、感染及び/又は集成を抑制でき、前記植物細胞 が請求項1,6,13,25又は28のいづれか1項記載のリボザイムを発現する、遺 伝子導入植物。 33.前記植物 DNAウィルスが一本鎖 DNAウィルスである、請求項32記載の遺伝 子導入植物。 34.前記一本鎖 DNAウィルスがジェミニウィルスである、請求項33記載の遺伝 子導入植物。 35.前記ジェミニウィルスがTLCV又はTYLCVである、請求項34記載の遺伝子導 入植物。 36.前記発現させるリボザイムが、RIBO5,RIBO5DeL,RIBO7,RIBO2,RzA,po lyRzC,polyRzD,polyRzE,polyRzFより成る群から選ばれる、請求項35記載の遺 伝子導入植物。 37.前記植物がトマト植物である、請求項3〜36のいづれか1項記載の遺伝子 導入植物。 38.植物に DNAウィルス耐性を授ける方法であって、植物に請求項1,6,13 ,25又は28のいづれか1項記載のリボザイムを、例えばリボザイムをコード DNA 配列による植物の器官の安定的な遺伝子形質転換、その後の遺伝子導入植物の再 生により行う方法。
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|---|---|---|---|---|
| US5998193A (en) * | 1994-06-24 | 1999-12-07 | Gene Shears Pty., Ltd. | Ribozymes with optimized hybridizing arms, stems, and loops, tRNA embedded ribozymes and compositions thereof |
| US6350934B1 (en) | 1994-09-02 | 2002-02-26 | Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. | Nucleic acid encoding delta-9 desaturase |
| FR2724536B1 (fr) * | 1994-09-15 | 1996-12-27 | Centre Nat Rech Scient | Plantes et semences transgeniques resistantes aux virus a adn phytopathogenes, et leurs procedes d'obtention |
| US6789310B1 (en) | 1995-11-06 | 2004-09-14 | Matsushita Electric Industrial Co., Ltd. | Component mounting apparatus |
| EP0922767A1 (en) * | 1997-12-03 | 1999-06-16 | Gene Shears Pty Limited | Ribozymes capable of conferring resistance to potyvirus infection, and plants expressing said ribozymes |
| US6747188B2 (en) | 1998-10-01 | 2004-06-08 | North Carolina State University | Transgenic plants expressing a mutant geminivirus AL3/C3 coding sequence |
| US6473739B1 (en) | 1999-04-27 | 2002-10-29 | Robert S. Showghi | Remote ordering system |
| EP2199397A3 (en) | 2002-12-24 | 2010-07-07 | CropDesign N.V. | Plants having modified growth characteristics and a method for making the same |
| WO2004087755A2 (en) | 2003-04-01 | 2004-10-14 | Cropdesign N.V. | Plant haemoglobin |
| EP2316953A3 (en) | 2003-10-20 | 2011-10-05 | CropDesign N.V. | Identification of novel E2F target genes and use thereof |
| AR056790A1 (es) | 2005-11-08 | 2007-10-24 | Cropdesign Nv | Plantas con caracteristicas de crecimiento aumentado y un metodo para obtenerlas |
| EP1954805B1 (en) | 2005-12-01 | 2015-07-22 | CropDesign N.V. | Plants having improved growth characteristics and methods for making the same |
| CA2638978A1 (en) | 2006-03-31 | 2007-10-11 | Basf Plant Science Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2035562A2 (en) | 2006-05-30 | 2009-03-18 | CropDesign N.V. | Plants with modulated expression of extensin receptor-like kinase having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| CA2659414A1 (en) | 2006-08-02 | 2008-02-07 | Cropdesign N.V. | Use of synovial sarcoma translocation (syt) polypeptide for increasing plant yield under abiotic stress |
| EP2543733A1 (en) | 2006-08-02 | 2013-01-09 | CropDesign N.V. | Plants having improved characteristics and a method for making the same |
| EP2084284A1 (en) | 2006-11-24 | 2009-08-05 | Cropdesign N.V. | Transgenic plants comprising as transgene a class i tcp or clavata 1 (clv1) or cah3 polypeptide having increased seed yield and a method for making the same |
| ES2546394T3 (es) | 2007-01-29 | 2015-09-23 | University Of The Witwatersrand, Johannesburg | Uso de duplos horquillados de ARN bicatenarios en el silenciamiento genético |
| WO2008092935A2 (en) | 2007-01-31 | 2008-08-07 | Basf Plant Science Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and/or increased abiotic stress resistance, and a method for making the same |
| EP2228386B1 (en) | 2007-05-03 | 2015-03-18 | BASF Plant Science GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2078090A2 (en) | 2007-06-29 | 2009-07-15 | BASF Plant Science GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
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| EP2240009A2 (en) | 2007-12-20 | 2010-10-20 | BASF Plant Science GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| WO2009092772A2 (en) | 2008-01-25 | 2009-07-30 | Basf Plant Science Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| BRPI0906719A2 (pt) | 2008-01-31 | 2015-08-04 | Nat Inst For Biolog Sciences | Método para alterar o crescimento e/ou desenvolvimento de planta, construção, uso de uma construção, planta, parte de planta ou célula de planta, método para a produção de uma planta transgênica, partes colhíveis de uma planta, produtos derivados de uma planta, e, uso de um ácido nucleico. |
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| BRPI0912244A2 (pt) | 2008-05-05 | 2016-10-11 | Basf Plant Science Gmbh | método para intensificar as características relacionadas com o rendimento em plantas em relação às plantas de controle, constructo, uso do mesmo, planta, parte de planta ou célula de planta, método para a produção de uma planta transgênica, planta transgênica, partes colhíveis de uma planta, produtos, e, uso de um ácido nucleico. |
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| DE112009001560T5 (de) | 2008-07-04 | 2012-01-26 | Basf Plant Science Gmbh | Planzen mit gesteigerten ertragsbezogenen Eigenschaften und Verfahren zur Herstellung derselben |
| CN102099480A (zh) | 2008-07-17 | 2011-06-15 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 具有增强的产量相关性状的植物和用于产生该植物的方法 |
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| BRPI0918991A2 (pt) | 2008-09-24 | 2017-09-19 | Basf Plant Science Gmbh | Métodos para intensificar traços relacionados com o rendimento em plantas em relação ás plantas de controle, e para produzir uma planta transgênica, planta, parte de planta ou célula de planta, construção, uso de uma construção, partes colhíveis de uma planta, produtos, uso em um ácido nucleico, molécula de ácido nucleico isolada, e, polipeptídeo isolado |
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| US20120102599A1 (en) | 2009-04-29 | 2012-04-26 | Crop Functional Genomics Center | Plants Having Enhanced Yield-Related Traits and a Method for Making the Same |
| WO2010125036A2 (en) | 2009-04-29 | 2010-11-04 | Basf Plant Science Company Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2427480A1 (en) | 2009-05-06 | 2012-03-14 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and/or enhanced abiotic stress tolerance and a method for making the same |
| US9683023B2 (en) | 2009-06-19 | 2017-06-20 | Basf Plant Science Company Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| CN104530202A (zh) | 2009-08-19 | 2015-04-22 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 具有增强的产量相关性状的植物和用于产生该植物的方法 |
| EA201270440A1 (ru) | 2009-09-25 | 2012-10-30 | Басф Плант Сайенс Компани Гмбх | Растения с улучшенными характеристиками урожайности и способ их получения |
| PH12012500517A1 (en) | 2009-09-25 | 2012-11-12 | Basf Plant Science Co Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| KR20120126061A (ko) | 2009-10-22 | 2012-11-20 | 재단법인 작물유전체기능연구사업단 | 향상된 수확량 관련 형질을 갖는 식물 및 이의 제조 방법 |
| DE112010004383T5 (de) | 2009-11-13 | 2012-08-23 | Basf Plant Science Company Gmbh | Pflanzen mit gesteigerten Ertragsmerkmalen und Verfahren zu deren Herstellung |
| CN102939385A (zh) | 2010-02-24 | 2013-02-20 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 具有增强的产量相关性状的植物和用于产生该植物的方法 |
| US9388423B2 (en) | 2010-02-24 | 2016-07-12 | Basf Plant Science Company Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2361927A1 (en) | 2010-02-26 | 2011-08-31 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2361985A1 (en) | 2010-02-26 | 2011-08-31 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| BR112012022880A2 (pt) | 2010-03-18 | 2015-09-15 | Basf Plant Science Co Gmbh | métodos para aumentar o rendimento e/ou traços relacionados ao rendimento em plantas em relação a plantas de controle, para a produção de uma planta transgênica e para a produção de um produto, planta, construção, uso de uma construção, planta transgênica, partes colhíveis de uma planta, produtos derivados de uma planta e uso de um ácido nucleíco |
| DE112011100940T5 (de) | 2010-03-18 | 2013-01-24 | Basf Plant Science Company Gmbh | Pflanzen mit gesteigerten Ertragsmerkmalen und Verfahren zu deren Herstellung |
| EA201290937A1 (ru) | 2010-03-19 | 2013-06-28 | Басф Плант Сайенс Компани Гмбх | Растения с улучшенными характеристиками урожайности и способ их получения |
| CN102892891A (zh) | 2010-03-19 | 2013-01-23 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 具有增强的产量相关性状的植物和用于产生该植物的方法 |
| EP2371845A1 (en) | 2010-03-22 | 2011-10-05 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2998401A3 (en) | 2010-06-24 | 2016-07-06 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| AU2011268562A1 (en) | 2010-06-25 | 2013-01-10 | Basf Plant Science Company Gmbh | Plants with enhanced yield-related traits and producing method thereof |
| EP2593555A4 (en) | 2010-07-16 | 2014-02-26 | Basf Plant Science Co Gmbh | PLANTS HAVING ENHANCED YIELD LINKS AND METHOD FOR OBTAINING SAME |
| MX2013002137A (es) | 2010-08-24 | 2013-05-17 | Basf Plant Science Co Gmbh | Plantas que tienen mejores rasgos relacionados con el rendimiento y un metodo para prepararlas. |
| CA2815969A1 (en) | 2010-11-10 | 2012-05-18 | Basf Plant Science Company Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and method for making the same |
| EP2665819A4 (en) | 2011-01-20 | 2014-09-10 | Basf Plant Science Co Gmbh | PLANTS WITH IMPROVED PERFORMANCE CHARACTERISTICS AND METHOD FOR THE PRODUCTION THEREOF |
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| US20140033368A1 (en) | 2011-02-28 | 2014-01-30 | Valerie Frankard | Plants Having Enhanced Yield-Related Traits and Producing Methods Thereof |
| US20140068816A1 (en) | 2011-03-01 | 2014-03-06 | Christophe Reuzeau | Plants Having Enhanced Yield-Related Traits and Producing Methods Thereof |
| GB201106845D0 (en) | 2011-04-26 | 2011-06-01 | Vib Vzw | Methods and means to produce abiotic stress tolerant plants |
| EP2677035A1 (en) | 2012-06-22 | 2013-12-25 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| EP2896698A1 (en) | 2014-01-17 | 2015-07-22 | BASF Plant Science Company GmbH | Plants having one or more enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| CN108265054A (zh) * | 2018-02-08 | 2018-07-10 | 江苏省农业科学院 | 赋予植物黄化曲叶病毒病抗性的sl-linc2基因的应用 |
Family Cites Families (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE3933384A1 (de) * | 1989-10-06 | 1991-04-18 | Hoechst Ag | Multifunktionelle rna mit selbstprozessierungsaktivitaet, ihre herstellung und ihre verwendung |
| US5180818A (en) * | 1990-03-21 | 1993-01-19 | The University Of Colorado Foundation, Inc. | Site specific cleavage of single-stranded dna |
| WO1992006693A1 (en) * | 1990-10-22 | 1992-04-30 | Fox Chase Cancer Center | Dna construct for providing rna therapy |
| DE4203441C1 (de) * | 1992-02-06 | 1993-10-14 | Max Planck Gesellschaft | RNA- und DNA-Moleküle zur Erzeugung von Virusresistenzen |
| CA2135646A1 (en) * | 1992-05-11 | 1993-11-25 | Kenneth G. Draper | Method and reagent for inhibiting viral replication |
-
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