JPH1033179A - 感染症診断用プローブ - Google Patents
感染症診断用プローブInfo
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- JPH1033179A JPH1033179A JP8194317A JP19431796A JPH1033179A JP H1033179 A JPH1033179 A JP H1033179A JP 8194317 A JP8194317 A JP 8194317A JP 19431796 A JP19431796 A JP 19431796A JP H1033179 A JPH1033179 A JP H1033179A
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- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
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Abstract
(57)【要約】
【課題】 消化器系疾患起炎菌の検出および同定に有用
なプローブを提供する。 【解決手段】 ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter
pylori)菌が保有するＤＮＡを抽出し、抽出したＤＮＡ
を制限酵素 HindIIIで完全消化した断片を適当なベクタ
ーにクローニングして、ヘリコバクター ピロリ菌が本
質的に保有するＤＮＡ断片を含むプローブを選抜する。
さらに、これらプローブの塩基配列を解明する。 【効果】 消化器系疾患起炎菌たるヘリコバクター ピ
ロリ菌を特異的に検出および同定できる。 解明された
塩基配列は、ＰＣＲ用プライマー作製のための指針とし
て、また臨床検体に含まれるゲノミックＤＮＡとの比較
参照用に適した標準配列として有用である。
なプローブを提供する。 【解決手段】 ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter
pylori)菌が保有するＤＮＡを抽出し、抽出したＤＮＡ
を制限酵素 HindIIIで完全消化した断片を適当なベクタ
ーにクローニングして、ヘリコバクター ピロリ菌が本
質的に保有するＤＮＡ断片を含むプローブを選抜する。
さらに、これらプローブの塩基配列を解明する。 【効果】 消化器系疾患起炎菌たるヘリコバクター ピ
ロリ菌を特異的に検出および同定できる。 解明された
塩基配列は、ＰＣＲ用プライマー作製のための指針とし
て、また臨床検体に含まれるゲノミックＤＮＡとの比較
参照用に適した標準配列として有用である。
Description
【０００１】
【発明の属する技術分野】本発明は、胃炎、胃潰瘍およ
び十二指腸潰瘍などの消化器系疾患の起炎菌であるヘリ
コバクター ピロリ (Helicobacter pylori)菌の検出お
よび同定に有用なプローブに関する。
び十二指腸潰瘍などの消化器系疾患の起炎菌であるヘリ
コバクター ピロリ (Helicobacter pylori)菌の検出お
よび同定に有用なプローブに関する。
【０００２】
【従来の技術および発明が解決しようとする課題】ヘリ
コバクター ピロリ〔旧名：カンピロバクター ピロリ
(Campylobacterpylori) 〕菌のヒトの胃粘膜での存在
が報告 (Warren J. R. et al., "Unidentified curved
bacilli on gastric epithelium in active chronic ga
stritis",Lancet 1: 1273-1275 (1983)) されて以来、
その生化学的性質、特に、胃・十二指腸潰瘍などの消化
器系疾患との関連について数々の研究が進められてい
る。
コバクター ピロリ〔旧名：カンピロバクター ピロリ
(Campylobacterpylori) 〕菌のヒトの胃粘膜での存在
が報告 (Warren J. R. et al., "Unidentified curved
bacilli on gastric epithelium in active chronic ga
stritis",Lancet 1: 1273-1275 (1983)) されて以来、
その生化学的性質、特に、胃・十二指腸潰瘍などの消化
器系疾患との関連について数々の研究が進められてい
る。
【０００３】ヘリコバクター ピロリ菌は、胃炎や胃潰
瘍患者の胃粘膜から高頻度に分離・検出され〔例えば、
慢性胃炎、表層性胃炎、萎縮性胃炎、糜爛性胃炎などか
らは、50〜80％の率で検出されたとの報告もある〕、ま
た、然るべき薬剤を投与して除菌することで症状も改善
することから、消化器系疾患との関連性が示唆されてい
た。 ヘリコバクター ピロリ菌は、粘膜細胞内へ侵入
する性質は無く、その定着・増殖部位は上皮粘膜面や細
胞間隙であり、菌の増殖による胃粘膜の PAS (Periodic
Acid-Sciff)反応陽性層のひ薄化により、粘膜を保護し
ているムチンの効果が低下し、胃粘膜の防御因子が減退
すると考えられている（伊藤武、「Helicobacter pylor
i に関する最近の知見」、 Medical Technology, 19 (1
0), 892-893 (1991 、９月))。
瘍患者の胃粘膜から高頻度に分離・検出され〔例えば、
慢性胃炎、表層性胃炎、萎縮性胃炎、糜爛性胃炎などか
らは、50〜80％の率で検出されたとの報告もある〕、ま
た、然るべき薬剤を投与して除菌することで症状も改善
することから、消化器系疾患との関連性が示唆されてい
た。 ヘリコバクター ピロリ菌は、粘膜細胞内へ侵入
する性質は無く、その定着・増殖部位は上皮粘膜面や細
胞間隙であり、菌の増殖による胃粘膜の PAS (Periodic
Acid-Sciff)反応陽性層のひ薄化により、粘膜を保護し
ているムチンの効果が低下し、胃粘膜の防御因子が減退
すると考えられている（伊藤武、「Helicobacter pylor
i に関する最近の知見」、 Medical Technology, 19 (1
0), 892-893 (1991 、９月))。
【０００４】そしてこれまでに、ヘリコバクター ピロ
リ菌が胃粘膜上皮に接して生息し、ヘリコバクター ピ
ロリ菌が保有するウレアーゼによる胃内の尿素の分解を
経て生成したアンモニアが直接胃粘膜障害を引き起こ
し、水素イオンの逆拡散などを発生せしめ、ひいては腫
瘍の形成に至るとの作用機序も報告されている(Tsujii,
M. et al., "Mechanism of gastric mucosal damage In
duced by ammonia", Gastroenterology 107: 1881-1888
(1992))。
リ菌が胃粘膜上皮に接して生息し、ヘリコバクター ピ
ロリ菌が保有するウレアーゼによる胃内の尿素の分解を
経て生成したアンモニアが直接胃粘膜障害を引き起こ
し、水素イオンの逆拡散などを発生せしめ、ひいては腫
瘍の形成に至るとの作用機序も報告されている(Tsujii,
M. et al., "Mechanism of gastric mucosal damage In
duced by ammonia", Gastroenterology 107: 1881-1888
(1992))。
【０００５】かような、ヒトの消化器系疾患との関連が
指摘されているヘリコバクター ピロリ菌の診断方法と
しては、大別して(1) 粘膜局所におけるヘリコバクター
ピロリ菌の直接的な証明（塗抹法、組織鏡検法、培養
法）、(2) ウレアーゼ活性などのヘリコバクター ピロ
リ菌の特性を利用した方法、および(3) 血清免疫診断法
がある（白井孝之、他、「Campylobacter pyloriの存在
診断」、最新医学、44(2)、284-288 (1989)) 。 この
内、胃粘膜の生検材料の微好気培養からヘリコバクター
ピロリ菌を検出する方法（培養法）が最も精度が高
く、確実な方法であるが、培養時間が長いため、結果と
して検査に長時間を要することになる。
指摘されているヘリコバクター ピロリ菌の診断方法と
しては、大別して(1) 粘膜局所におけるヘリコバクター
ピロリ菌の直接的な証明（塗抹法、組織鏡検法、培養
法）、(2) ウレアーゼ活性などのヘリコバクター ピロ
リ菌の特性を利用した方法、および(3) 血清免疫診断法
がある（白井孝之、他、「Campylobacter pyloriの存在
診断」、最新医学、44(2)、284-288 (1989)) 。 この
内、胃粘膜の生検材料の微好気培養からヘリコバクター
ピロリ菌を検出する方法（培養法）が最も精度が高
く、確実な方法であるが、培養時間が長いため、結果と
して検査に長時間を要することになる。
【０００６】また、ヘリコバクター ピロリ菌のウレア
ーゼ産生能力に鑑み、胃生検材料から直接ウレアーゼを
検出する方法なども利用されている（伊藤武、「特殊な
細菌感染症の診断法／4.Campylobacter pylori」、臨床
医、15 (増刊号) 、367-369 (1989)) 。 しかし、これ
ら方法はいずれも内視鏡検査による生検材料を対象とし
た検査法であるため、その検査処置において患者に少な
からずの苦痛を強いるものであった。
ーゼ産生能力に鑑み、胃生検材料から直接ウレアーゼを
検出する方法なども利用されている（伊藤武、「特殊な
細菌感染症の診断法／4.Campylobacter pylori」、臨床
医、15 (増刊号) 、367-369 (1989)) 。 しかし、これ
ら方法はいずれも内視鏡検査による生検材料を対象とし
た検査法であるため、その検査処置において患者に少な
からずの苦痛を強いるものであった。
【０００７】さらに、ヘリコバクター ピロリ菌によっ
て胃内の尿素がアンモニアと１４ＣＯ２に分解されるこ
とに着目し、この１４ＣＯ２ をシンチレーションカウ
ンターで測定する診断法もあるが、この方法では、放射
性同位元素の取扱いという繁雑で熟練を要する検査処置
を経なければならない。
て胃内の尿素がアンモニアと１４ＣＯ２に分解されるこ
とに着目し、この１４ＣＯ２ をシンチレーションカウ
ンターで測定する診断法もあるが、この方法では、放射
性同位元素の取扱いという繁雑で熟練を要する検査処置
を経なければならない。
【０００８】
【課題を解決するための手段】本発明は上記した技術背
景に鑑みて、ヘリコバクター ピロリ菌を、内視鏡など
の医療器具を患者体内に導入する必要が無く、より特異
的かつ効率良く検出できる技術の確立を目指して完成さ
れたものである。
景に鑑みて、ヘリコバクター ピロリ菌を、内視鏡など
の医療器具を患者体内に導入する必要が無く、より特異
的かつ効率良く検出できる技術の確立を目指して完成さ
れたものである。
【０００９】そして、その要旨とするところは、胃炎、
胃潰瘍、十二指腸潰瘍などの消化器系疾患の起炎菌／原
因菌であるヘリコバクター ピロリ菌が保有するＤＮＡ
またはＲＮＡと特異的な反応性を有するプローブ、およ
び、当該プローブに含まれるヘリコバクター ピロリ菌
が本質的に保有している遺伝子部分の塩基配列を解明す
ることにある。
胃潰瘍、十二指腸潰瘍などの消化器系疾患の起炎菌／原
因菌であるヘリコバクター ピロリ菌が保有するＤＮＡ
またはＲＮＡと特異的な反応性を有するプローブ、およ
び、当該プローブに含まれるヘリコバクター ピロリ菌
が本質的に保有している遺伝子部分の塩基配列を解明す
ることにある。
【００１０】すなわち、本発明のプローブにより、例え
ば、検出対象たる菌において維持されているＤＮＡを、
当該プローブとＤＮＡとの間の特異性に基づいて有為に
検出でき、これにより、菌を培養・増殖するといった手
間をかけることなく、迅速かつ確実に菌を検出・同定で
きるのである。
ば、検出対象たる菌において維持されているＤＮＡを、
当該プローブとＤＮＡとの間の特異性に基づいて有為に
検出でき、これにより、菌を培養・増殖するといった手
間をかけることなく、迅速かつ確実に菌を検出・同定で
きるのである。
【００１１】また、これらプローブの塩基配列情報を参
照してプライマーをデザインすれば、ハイブリダイゼー
ションを行わなくとも、ＰＣＲ法によるＤＮＡの増幅の
有無を検出・確認することで、原因菌を同定できる。
照してプライマーをデザインすれば、ハイブリダイゼー
ションを行わなくとも、ＰＣＲ法によるＤＮＡの増幅の
有無を検出・確認することで、原因菌を同定できる。
【００１２】さらに、ハイブリダイゼーションに用いる
プローブを非放射性のもの、例えば、ビオチン化したプ
ローブとすることで、放射性同位元素使用施設のない一
般検査室でも菌の検出ができ、それにより、菌の同定検
出作業が迅速、簡便に行えるのである。
プローブを非放射性のもの、例えば、ビオチン化したプ
ローブとすることで、放射性同位元素使用施設のない一
般検査室でも菌の検出ができ、それにより、菌の同定検
出作業が迅速、簡便に行えるのである。
【００１３】
【発明の実施の形態】以下に、本発明のヘリコバクター
ピロリ菌に由来するプローブの実施例を示す。
ピロリ菌に由来するプローブの実施例を示す。
【００１４】
【実施例】実施例１：ヘリコバクター ピロリ菌由来のＤＮＡプロ
ーブ (1) ヘリコバクター ピロリ菌由来ＤＮＡプロ ーブの調
製 まず、下記表１に記載の組成を有するスキロー(Skirro
w) 培地を調製した。
ーブ (1) ヘリコバクター ピロリ菌由来ＤＮＡプロ ーブの調
製 まず、下記表１に記載の組成を有するスキロー(Skirro
w) 培地を調製した。
【００１５】
【表１】
【００１６】次に、臨床菌株ヘリコバクター ピロリ菌
を、ブルセラ寒天培地（ディフコ社製）および前記スキ
ロー培地にて、微好気的条件（２％水素、５％酸素、７
％二酸化炭素、86％窒素、相対湿度90％）下で、37℃
で、５日間培養して、ヘリコバクター ピロリ菌を分離
および増殖した。
を、ブルセラ寒天培地（ディフコ社製）および前記スキ
ロー培地にて、微好気的条件（２％水素、５％酸素、７
％二酸化炭素、86％窒素、相対湿度90％）下で、37℃
で、５日間培養して、ヘリコバクター ピロリ菌を分離
および増殖した。
【００１７】培養終了後に、培養菌体を集菌して、プロ
テイナーゼＫ（メルク社製）-0.1％SDS を用いた核酸の
単離を利用する Saito-Miura法 ("Preparation of tran
sforming deoxyribonucleic acid by phenol treatmen
t", Biochem. Biophys. Actavol.72, pp.619-629 (196
3))の変法に従って、そのゲノミックＤＮＡを抽出し
た。 抽出したＤＮＡを、制限酵素 HindIIIで完全消化
し、ベクターpGEM-3Z(プロメガ製）にランダムクローニ
ングした。 得られたクローンからヘリコバクターピロ
リ菌と特異的に反応するＤＮＡ断片を含む８種のプロー
ブを選抜した。
テイナーゼＫ（メルク社製）-0.1％SDS を用いた核酸の
単離を利用する Saito-Miura法 ("Preparation of tran
sforming deoxyribonucleic acid by phenol treatmen
t", Biochem. Biophys. Actavol.72, pp.619-629 (196
3))の変法に従って、そのゲノミックＤＮＡを抽出し
た。 抽出したＤＮＡを、制限酵素 HindIIIで完全消化
し、ベクターpGEM-3Z(プロメガ製）にランダムクローニ
ングした。 得られたクローンからヘリコバクターピロ
リ菌と特異的に反応するＤＮＡ断片を含む８種のプロー
ブを選抜した。
【００１８】そして選抜された各プローブを、プローブ
HP-32 、プローブHP-34 、プローブHP-49 、プローブHP
-55(down) 、プローブHP-55(up) 、プローブHP-60 、プ
ローブHP-64 、およびプローブHP-66 と命名した。
HP-32 、プローブHP-34 、プローブHP-49 、プローブHP
-55(down) 、プローブHP-55(up) 、プローブHP-60 、プ
ローブHP-64 、およびプローブHP-66 と命名した。
【００１９】(2) ヘリコバクター ピロリ菌由来ＤＮＡ
プローブの種特異性の検討 前述のプローブの選抜において、各プローブと各種感染
症原因菌株のＤＮＡとの反応性を、以下の方法により検
討した。
プローブの種特異性の検討 前述のプローブの選抜において、各プローブと各種感染
症原因菌株のＤＮＡとの反応性を、以下の方法により検
討した。
【００２０】まず、検討対象菌株として、下記表２に列
挙した臨床単離株および寄託菌株を準備した。 なお、
表２中の、ヒト・ゲノミックＤＮＡの入手源として１名
の健康な成人男子（30才）から採取した白血球、ならび
に対照試料の入手源としてプラスミドpGEM-3Z(生化学工
業製) を含んだ Escherichia coli K-12, JM109 株をそ
れぞれ準備した。
挙した臨床単離株および寄託菌株を準備した。 なお、
表２中の、ヒト・ゲノミックＤＮＡの入手源として１名
の健康な成人男子（30才）から採取した白血球、ならび
に対照試料の入手源としてプラスミドpGEM-3Z(生化学工
業製) を含んだ Escherichia coli K-12, JM109 株をそ
れぞれ準備した。
【００２１】
【表２】
【００２２】そして、表２中のヘリコバクター属に属す
る細菌は実施例１(1) に記載の方法、また、その他の細
菌については、各種溶菌株酵素〔リゾスタフィン（シグ
マ製）、リゾチーム（シグマ製）、アセチルムラミダー
ゼSG（生化学工業製) 〕を取り入れた Saito-Miura法
(前出）に従って、各菌株が保有する染色体ＤＮＡを抽
出した。 抽出したＤＮＡの一定量（例えば、 0.1μg/
５μl)をナイロンフィルタ（ポールダイン製）にスポッ
トし、アルカリ変性したものをドット ブロットハイブ
リダイゼーションの試料とした。 なお、ヒト ゲノミ
ックＤＮＡ試料は、先に入手した白血球を Saito-Miura
法 (前出）に適用することで調製した。一方、対照試料
は、後述する実施例２(1) に記載のプラスミドＤＮＡの
調製方法に、先に入手したプラスミド pGEM-3Zを含んだ
Escherichia coli K-12, JM109 株を適用することで調
製した。
る細菌は実施例１(1) に記載の方法、また、その他の細
菌については、各種溶菌株酵素〔リゾスタフィン（シグ
マ製）、リゾチーム（シグマ製）、アセチルムラミダー
ゼSG（生化学工業製) 〕を取り入れた Saito-Miura法
(前出）に従って、各菌株が保有する染色体ＤＮＡを抽
出した。 抽出したＤＮＡの一定量（例えば、 0.1μg/
５μl)をナイロンフィルタ（ポールダイン製）にスポッ
トし、アルカリ変性したものをドット ブロットハイブ
リダイゼーションの試料とした。 なお、ヒト ゲノミ
ックＤＮＡ試料は、先に入手した白血球を Saito-Miura
法 (前出）に適用することで調製した。一方、対照試料
は、後述する実施例２(1) に記載のプラスミドＤＮＡの
調製方法に、先に入手したプラスミド pGEM-3Zを含んだ
Escherichia coli K-12, JM109 株を適用することで調
製した。
【００２３】次いで、Digoxigenin-11-dUTP(ベーリンガ
ー・マンハイム社製) でラベルしたヘリコバクター ピ
ロリ菌由来のＤＮＡプローブを、マニアティスのマニュ
アル（T. Maniatis, et al., "Molecular Cloning (A L
aboratory Manual)", Cold Spring Harbour Laboratory
(1982))に従い、45％ホルムアミド（メルク社製）、５
×SSC 、42℃の条件下で、終夜ハイブリダイゼーション
を実施した。
ー・マンハイム社製) でラベルしたヘリコバクター ピ
ロリ菌由来のＤＮＡプローブを、マニアティスのマニュ
アル（T. Maniatis, et al., "Molecular Cloning (A L
aboratory Manual)", Cold Spring Harbour Laboratory
(1982))に従い、45％ホルムアミド（メルク社製）、５
×SSC 、42℃の条件下で、終夜ハイブリダイゼーション
を実施した。
【００２４】終夜ハイブリダイゼーションを終えた試料
を、55℃にて 0.1×SSC 、0.1% SDSによる20分間の洗浄
を２回行った後に、Anti-Dig-ALP conjugates(ベーリン
ガー・マンハイム社製) で検出・発色させ、ハイブリダ
イゼーションに関する特異性を確認した。
を、55℃にて 0.1×SSC 、0.1% SDSによる20分間の洗浄
を２回行った後に、Anti-Dig-ALP conjugates(ベーリン
ガー・マンハイム社製) で検出・発色させ、ハイブリダ
イゼーションに関する特異性を確認した。
【００２５】各プローブと各臨床菌株のＤＮＡとの反応
性に関する実験結果を図２に示した。 また、ウェルの
位置と被検試料（ブロッティングされた菌株ＤＮＡ）と
の対応関係を図１に示した。 すなわち、図１に示した
ウェルプレートの模式図に付したウェルの位置番号は、
表２に列挙した試料（菌株）に付した番号と符合する関
係にある。
性に関する実験結果を図２に示した。 また、ウェルの
位置と被検試料（ブロッティングされた菌株ＤＮＡ）と
の対応関係を図１に示した。 すなわち、図１に示した
ウェルプレートの模式図に付したウェルの位置番号は、
表２に列挙した試料（菌株）に付した番号と符合する関
係にある。
【００２６】図２の反応結果から明らかなように、試験
したいずれのプローブもヘリコバクター ピロリ菌に由
来するＤＮＡに対してのみ反応性を示し、ヘリコバクタ
ー属に属さない菌種に由来するＤＮＡはもちろん、ヘリ
コバクター ピロリ菌以外のヘリコバクター属に属する
他の菌種由来のＤＮＡに対しても反応性（ハイブリッド
の形成）が認められず、本願発明のプローブによる種特
異性が確認された。
したいずれのプローブもヘリコバクター ピロリ菌に由
来するＤＮＡに対してのみ反応性を示し、ヘリコバクタ
ー属に属さない菌種に由来するＤＮＡはもちろん、ヘリ
コバクター ピロリ菌以外のヘリコバクター属に属する
他の菌種由来のＤＮＡに対しても反応性（ハイブリッド
の形成）が認められず、本願発明のプローブによる種特
異性が確認された。
【００２７】実施例２：塩基配列の 解析 実施例１にて種特異性が確認されたＤＮＡプローブ（計
８本）の塩基配列を下記の方法に従って決定した。
８本）の塩基配列を下記の方法に従って決定した。
【００２８】(1) プラスミドＤＮＡの調製 サブクローンされた（塩基配列を決定すべき）挿入断片
を pGEM-3Z（プロメガ製) に含んだ Escherichia coli
K-12, JM109 株を、５mlの Luria-Bactani Medium (bac
to-tryptone, 10g/1L; bacto-yeast extract, 5g/1L; N
aCl, 10g/1L;５Ｎ NaOH でpH 7.0に調整）に植菌し、一
晩培養した。
を pGEM-3Z（プロメガ製) に含んだ Escherichia coli
K-12, JM109 株を、５mlの Luria-Bactani Medium (bac
to-tryptone, 10g/1L; bacto-yeast extract, 5g/1L; N
aCl, 10g/1L;５Ｎ NaOH でpH 7.0に調整）に植菌し、一
晩培養した。
【００２９】培養液を遠心分離(5,000rpm,５min.）して
集菌した。 沈澱物に2.5mg/mlの濃度でリゾチーム（シ
グマ製) を含む 50mM グルコース/25mM Tris-HCl(pH8.
0)/10mM EDTA 溶液を 100μl 加え、室温で５分間放置
した。 得られた懸濁液に１％の濃度でドデシル硫酸ナ
トリウム（シグマ製) を含む 0.2Ｍ水酸化ナトリウム水
溶液を加えて混合した。 ５Ｍ酢酸カリウム水溶液 (pH
4.8) 150μl をさらに加えて混合し、15分間氷冷した。
集菌した。 沈澱物に2.5mg/mlの濃度でリゾチーム（シ
グマ製) を含む 50mM グルコース/25mM Tris-HCl(pH8.
0)/10mM EDTA 溶液を 100μl 加え、室温で５分間放置
した。 得られた懸濁液に１％の濃度でドデシル硫酸ナ
トリウム（シグマ製) を含む 0.2Ｍ水酸化ナトリウム水
溶液を加えて混合した。 ５Ｍ酢酸カリウム水溶液 (pH
4.8) 150μl をさらに加えて混合し、15分間氷冷した。
【００３０】そして、遠心分離（15,000rpm, 15min.)し
て得た上清を、フェノール／クロロホルム(CHCl3) 処理
し、この上清に２倍量のエタノールを加え、さらに遠心
分離(12,000rpm, ５分間）して沈澱を得た。 この沈澱
物を、10mM Tris-HCl (pH7.5)/0.1mM EDTA溶液 100μl
に溶解し、10mg/ml RNaseA（シグマ製) 溶液を加え、室
温で15分間放置した。
て得た上清を、フェノール／クロロホルム(CHCl3) 処理
し、この上清に２倍量のエタノールを加え、さらに遠心
分離(12,000rpm, ５分間）して沈澱を得た。 この沈澱
物を、10mM Tris-HCl (pH7.5)/0.1mM EDTA溶液 100μl
に溶解し、10mg/ml RNaseA（シグマ製) 溶液を加え、室
温で15分間放置した。
【００３１】この調製物に 0.1M 酢酸ナトリウム水溶液
(pH4.8) を 300μl 加え、フェノール／クロロホルム(C
HCl3) 処理し、上清にエタノールを加えて沈澱を得た。
この沈澱物を乾燥し、10μl の蒸留水に溶解したもの
をＤＮＡ試料とした。
(pH4.8) を 300μl 加え、フェノール／クロロホルム(C
HCl3) 処理し、上清にエタノールを加えて沈澱を得た。
この沈澱物を乾燥し、10μl の蒸留水に溶解したもの
をＤＮＡ試料とした。
【００３２】(2) 塩基配列決定の前処理 塩基配列決定の前処理を AutoRead(登録商標) Sequenci
ng Kit (ファルマシア製）を用いて行った。
ng Kit (ファルマシア製）を用いて行った。
【００３３】すなわち、鋳型となるＤＮＡが32μl 溶液
中に５〜10μg の濃度になるように調整した。 1.5mlの
ミニチューブ（エッペンドルフ）に、鋳型DNA 32μl を
移し、２Ｍ水酸化ナトリウム水溶液を８μl 加えて穏や
かに混合した。 そして、軽く遠心した後、室温で10分
間放置した。
中に５〜10μg の濃度になるように調整した。 1.5mlの
ミニチューブ（エッペンドルフ）に、鋳型DNA 32μl を
移し、２Ｍ水酸化ナトリウム水溶液を８μl 加えて穏や
かに混合した。 そして、軽く遠心した後、室温で10分
間放置した。
【００３４】３Ｍ酢酸ナトリウム(pH4.8) ７μl と蒸留
水４μl を加え、さらにエタノールを 120μl 加えて混
合し、ドライアイス上で15分間放置した。 そして、15
分間遠心分離して沈澱したＤＮＡを集め、注意しながら
上清を除去した。 得られた沈澱物を70％エタノールで
洗浄し、10分間遠心分離した。 そして、注意しながら
再度上清を除去し、減圧条件下で沈澱物を乾燥した。
水４μl を加え、さらにエタノールを 120μl 加えて混
合し、ドライアイス上で15分間放置した。 そして、15
分間遠心分離して沈澱したＤＮＡを集め、注意しながら
上清を除去した。 得られた沈澱物を70％エタノールで
洗浄し、10分間遠心分離した。 そして、注意しながら
再度上清を除去し、減圧条件下で沈澱物を乾燥した。
【００３５】沈澱物を蒸留水10μl に溶解し、螢光性の
プライマー〔Fluorescent Primer,M13 Universal Prime
r; 5'-Fluorescein-d[CGACGTTGTAAAACGACGGCCAGT]-3'
(1.6pmol/μl; 0.42 A260 unit/ml); M13 Reverse Prim
er, 5'-Fluorescein-d[CAGGAAACAGCTATGAC]-3'(2.1pmol
/μl; 0.42 A260 unit/ml) 〕２μl (0.42 A260 unit/m
l, ４〜６pmol）とアニーリング用緩衝液２μl を加え
穏やかに混合した。
プライマー〔Fluorescent Primer,M13 Universal Prime
r; 5'-Fluorescein-d[CGACGTTGTAAAACGACGGCCAGT]-3'
(1.6pmol/μl; 0.42 A260 unit/ml); M13 Reverse Prim
er, 5'-Fluorescein-d[CAGGAAACAGCTATGAC]-3'(2.1pmol
/μl; 0.42 A260 unit/ml) 〕２μl (0.42 A260 unit/m
l, ４〜６pmol）とアニーリング用緩衝液２μl を加え
穏やかに混合した。
【００３６】そして、軽く遠心した後、65℃で５分間熱
処理を行い、素早く37℃条件下に置き、そこで10分間保
温した。 保温後10分以上室温で放置し、軽く遠心し
た。
処理を行い、素早く37℃条件下に置き、そこで10分間保
温した。 保温後10分以上室温で放置し、軽く遠心し
た。
【００３７】そして、延長用緩衝液１μl とジメチルス
ルホキシド３μl を加えたものを試料とした。
ルホキシド３μl を加えたものを試料とした。
【００３８】４本のミニチューブにＡ、Ｃ、ＧおよびＴ
と記入し、それぞれのチューブにＡMix (ddATPをdATP、
dCTP、dGTP、およびdTTPと共に溶解したもの) 、Ｃ Mix
(ddCTP をdATP、dCTP、dGTP、およびdTTPと共に溶解し
たもの) 、Ｇ Mix (ddGTP をdATP、dCTP、dGTP、および
dTTPと共に溶解したもの) およびＴ Mix(ddTTPをdATP、
dCTP、dGTP、およびdTTPと共に溶解したもの) を 2.5μ
l ずつ分注した。 なお、それぞれの溶液は使用時まで
は氷中で保存し、使用時には37℃で１分間以上保温して
から使用した。
と記入し、それぞれのチューブにＡMix (ddATPをdATP、
dCTP、dGTP、およびdTTPと共に溶解したもの) 、Ｃ Mix
(ddCTP をdATP、dCTP、dGTP、およびdTTPと共に溶解し
たもの) 、Ｇ Mix (ddGTP をdATP、dCTP、dGTP、および
dTTPと共に溶解したもの) およびＴ Mix(ddTTPをdATP、
dCTP、dGTP、およびdTTPと共に溶解したもの) を 2.5μ
l ずつ分注した。 なお、それぞれの溶液は使用時まで
は氷中で保存し、使用時には37℃で１分間以上保温して
から使用した。
【００３９】希釈したT7DNA ポリメラーゼ（ファルマシ
ア製；６〜８units/２μl)２μl をＤＮＡ試料に加え、
ピペッティングもしくは穏やかな混合により、完全に混
合した。 混合後すぐに、この混合液を 4.5μl ずつ保
温しておいた４種の溶液に分注した。 なお、分注に際
しては新しいチップを用いた。
ア製；６〜８units/２μl)２μl をＤＮＡ試料に加え、
ピペッティングもしくは穏やかな混合により、完全に混
合した。 混合後すぐに、この混合液を 4.5μl ずつ保
温しておいた４種の溶液に分注した。 なお、分注に際
しては新しいチップを用いた。
【００４０】37℃で５分間保温し、前出の AutoRead(登
録商標) Sequencing Kitに添付されていた反応停止溶液
を５μl ずつそれぞれの反応液に加えた。 この分注に
おいても、新しいチップを用いた。 90℃で２〜３分間
保温し、すぐに氷中で冷却した。 電気泳動には１レー
ンあたり４〜６μl を泳動した。
録商標) Sequencing Kitに添付されていた反応停止溶液
を５μl ずつそれぞれの反応液に加えた。 この分注に
おいても、新しいチップを用いた。 90℃で２〜３分間
保温し、すぐに氷中で冷却した。 電気泳動には１レー
ンあたり４〜６μl を泳動した。
【００４１】(3) 塩基配列の決定 実施例１に記載のヘリコバクター ピロリ菌が保有する
ＤＮＡに対して特異性を有するプローブそれぞれの塩基
配列の決定を、泳動温度45℃、泳動時間６時間として、
A.L.F. DNA Sequencerシステム（ファルマシア製）を用
いて行った。
ＤＮＡに対して特異性を有するプローブそれぞれの塩基
配列の決定を、泳動温度45℃、泳動時間６時間として、
A.L.F. DNA Sequencerシステム（ファルマシア製）を用
いて行った。
【００４２】その結果、プローブHP-32(配列番号１）、
プローブHP-34(配列番号２) 、プローブHP-49(配列番号
３) 、プローブHP-55(down)(配列番号４) 、プローブ H
P-55(up)(配列番号５）、プローブHP-60(配列番号
６）、プローブHP-64(配列番号７）、およびプローブSP
-66(配列番号８）それぞれの塩基配列の全容が明らかと
なった。
プローブHP-34(配列番号２) 、プローブHP-49(配列番号
３) 、プローブHP-55(down)(配列番号４) 、プローブ H
P-55(up)(配列番号５）、プローブHP-60(配列番号
６）、プローブHP-64(配列番号７）、およびプローブSP
-66(配列番号８）それぞれの塩基配列の全容が明らかと
なった。
【００４３】
【発明の効果】本発明のプローブを用いれば、例えば、
内視鏡などの医療器具を患者体内に導入することに伴う
患者の身体的負担を解消でき、また、ヘリコバクター
ピロリ菌の増殖・培養を経ることなく迅速・正確に直接
的に菌を検出および同定できる。 すなわち、本発明の
プローブを用いた診断では、検出率が飛躍的に向上する
のみならず、１回分の検体で菌の同定まで行え、診断に
要する時間も約１〜２日程度と短くなる。 それ故、早
期の内に有効な治療方針が示され、実施に移すことがで
きる。
内視鏡などの医療器具を患者体内に導入することに伴う
患者の身体的負担を解消でき、また、ヘリコバクター
ピロリ菌の増殖・培養を経ることなく迅速・正確に直接
的に菌を検出および同定できる。 すなわち、本発明の
プローブを用いた診断では、検出率が飛躍的に向上する
のみならず、１回分の検体で菌の同定まで行え、診断に
要する時間も約１〜２日程度と短くなる。 それ故、早
期の内に有効な治療方針が示され、実施に移すことがで
きる。
【００４４】また、ヒトの消化器系疾患に深く関連する
ヘリコバクター ピロリ菌が保有するＤＮＡに特異的に
反応するプローブの塩基配列を明らかにしたことによ
り、これらプローブを人工的に調製することを可能とし
た。 さらに、解析した塩基配列の情報の一部を利用し
て作製したプライマーを用いて、臨床検体に含まれる原
因菌のＤＮＡを、ＰＣＲ法によって増幅して、原因菌の
迅速な診断に役立てることができる。
ヘリコバクター ピロリ菌が保有するＤＮＡに特異的に
反応するプローブの塩基配列を明らかにしたことによ
り、これらプローブを人工的に調製することを可能とし
た。 さらに、解析した塩基配列の情報の一部を利用し
て作製したプライマーを用いて、臨床検体に含まれる原
因菌のＤＮＡを、ＰＣＲ法によって増幅して、原因菌の
迅速な診断に役立てることができる。
【００４５】さらに、臨床検体に含まれるゲノミックＤ
ＮＡの塩基配列と本発明によって解析された塩基配列と
を比較参照することにより、消化器系疾患原因菌の菌種
の迅速な同定が行える。
ＮＡの塩基配列と本発明によって解析された塩基配列と
を比較参照することにより、消化器系疾患原因菌の菌種
の迅速な同定が行える。
【００４６】上記したように、本発明は、所期の目的で
あった感染症診断用プローブを提供するのみならず、Ｐ
ＣＲ用プライマー作製の指針として、また臨床検体に含
まれるゲノミックＤＮＡとの比較参照用に適した標準配
列として優れた有用性が期待され、さらには消化器系疾
患の原因菌であるヘリコバクター ピロリ菌が保有する
ＤＮＡに特異的に反応するプローブの今後の探究・開発
における貴重な手がかりをもたらすなどの優れた効果を
奏するものである。
あった感染症診断用プローブを提供するのみならず、Ｐ
ＣＲ用プライマー作製の指針として、また臨床検体に含
まれるゲノミックＤＮＡとの比較参照用に適した標準配
列として優れた有用性が期待され、さらには消化器系疾
患の原因菌であるヘリコバクター ピロリ菌が保有する
ＤＮＡに特異的に反応するプローブの今後の探究・開発
における貴重な手がかりをもたらすなどの優れた効果を
奏するものである。
【００４７】また、本願にて開示した塩基配列は、臨床
分離株のゲノミックＤＮＡをランダムにクローニングし
て得られたものであり、それ故、本発明の塩基配列の有
用性はその相補鎖にまで及ぶものである。
分離株のゲノミックＤＮＡをランダムにクローニングし
て得られたものであり、それ故、本発明の塩基配列の有
用性はその相補鎖にまで及ぶものである。
【００４８】さらに、野性株が保有するＤＮＡに変異部
分が存在することは当然考えられる。 しかしながら、
上記実施例の開示から明らかなように、当該ＤＮＡ変異
部分は、消化器系疾患診断のためのハイブリダイゼーシ
ョンへ利用する際の本発明プローブの特異性、あるいは
本願にて開示した塩基配列情報を消化器系疾患の迅速診
断を目的としたＰＣＲ用のプライマーをデザインするた
めに利用できる等の本発明が奏する有用性には何ら影響
を与えるものではない。
分が存在することは当然考えられる。 しかしながら、
上記実施例の開示から明らかなように、当該ＤＮＡ変異
部分は、消化器系疾患診断のためのハイブリダイゼーシ
ョンへ利用する際の本発明プローブの特異性、あるいは
本願にて開示した塩基配列情報を消化器系疾患の迅速診
断を目的としたＰＣＲ用のプライマーをデザインするた
めに利用できる等の本発明が奏する有用性には何ら影響
を与えるものではない。
【００４９】
配列番号：１ 配列の長さ：1778 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-32 配列 AAGCTTCTAG TAAAGAAATC ACTCTTTTTT GCTGTTCCAA TAGTGCGTCT ATCTTGGCAC 60 TCAAACGATT TATTTTACTT TCCATGCGTT CAATACTAAC CACTAAAAAT AAATAGCTAT 120 TTAATCATTA AAAATGATTA TTTTAATACC ATGCTCTTAA ATTAAGATGT GTTTTTATGA 180 TCATGCTACA ATAAAAACAC AAAATGATTT CAAAGAAAAA GGGTTTAAAA TGAAAACTTT 240 TGAAGTAATG ATTCAAACCG ATTCAAAAGG GTATTTGGAC GCTAAATTTG GCGGTACGCT 300 CCTAGAGGGT TTCTCAATCC AAACGGCTTA CCCACTTATT CGCCTAAAAT CTCATGGCAA 360 AAAGTAGAAG GCGCTCAAAG CTATGCACTA GAACTCATCG ATCATGACGC TCAAAAAGTG 420 TGTGGCATGT CGTTTGTCAT TGGGTCGTGG GCAATATTTC TTATAATGTT TTAGAAGAAA 480 ACGCTTCCAT GATGGATAAA AGAATTGTTC AAGGGGTCAA TTCGCTCACT CAAGGCTTTA 540 TCCGTTCCCC ACTTAATGAA AGCGAAAAAC AACGCTCCAA TCTCAATAAC AGCACCTATA 600 TCGGCCCCAT GCCCCCTAAT GGCGATCACC ATTACTTAAT CCAAGTGTAT GCCCTAGACA 660 TTCCTAAACT CGCCTTAAAA GCCCCGTTTT TCTTAGGCGA TTTGCATGAC AGAATGCGCG 720 GACATATCAT CGCCATAGGG AGAAAAGAAT TTTTATACAA GCAGTTTGTG AGGAAATAGG 780 CTACTGCTTG TAGCTATTCT TTCGCTAAAT TGAATTTTTG ATACATCTCT AAAATTCTCT 840 TTTCATCTAG CATGCTTTCT TCAATCCTTG TGCCTATCAA ATCGGCATGG TGCTTTTTAA 900 AATCTTTTAA AGGGATTAAA TCATTATCAA CAAGAGCGTT TCGCCTCTTT TTAGCTAAAG 960 GGAAGTGCCA TTGCACGAGT TCTTTATCCT TAAATATGGT GTTTATCCTT AAGCCTTAAA 1020 GTTTTATAAG CATCACCATT ATATTGCCAA ATTTCAAAAG GCTCACAATC GTTATAAAAT 1080 AACCAATGAT CTCCCCATGC GTCTAAAAAT CCAAAATCCC CATCATTACG CATAAACACC 1140 TCAAAATCTT GCACCACAAA ATTAATACGC GAATACATCA CAACCTCTTT AATGCTCTTA 1200 GGGATATAAA AACTTTCATA AAGTTTTTTA GCGTCATAAA TATGATCACA ATCAATTTTG 1260 ATAACCCACT CATTTTTAGG GATAAAAGAA AGCGTATAAT TATAGTAATG ATAGAGTTGG 1320 TGCCACAAAC TCGGGCAATC CTTTAGTATG ACTTCATAAG GATAGCTGAT AGGGATAAAT 1380 GAGGGGAACT TTTTACAAAA CTCTAAAATC ACTTCTTTAG AGCCATCATC GCAATCATTA 1440 AAACCAATGA CCCCCCTTTG AATGGCAGGA AGCATAGAAA ACAAACTCTC TTCTAAAGTA 1500 ACGATTTCAT TTTTGACTCT AATAAAAGNC CATGGGTTTA GAGGGCTTTT AGGGTTTTGA 1560 CTTTTTTATC ATAGTCAAAA TAACCTGAAT GCGTGGGATT GGGTAGAGTT AAAGTGGGAT 1620 GGATAACCCT ATCTTCTAAA TGCCCCCCCC CCCCCCATAA TTATAATTAA GAGAACTATT 1680 TTTATAAATA CTCTTATTGC GTTCAATGAA ACTTTCATTA TTTAAAGAAG CGATAGCCAA 1740 AAACACGCTT TCTTGATGGT CATGGTTGAA TAAAGCTT 1778 配列番号：２ 配列の長さ：1426 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-34 配列 AAGCTTTACC TCTAATAGCG TTTTAAACTT TTTTGTGGTT TTGTCTTTCA TCACGATAGG 60 GCTAGTTTTT TTCTTTTTGC GTTCCCAACC CACTAGCGTG GTCTCTAAAG AAAATATTCC 120 TAAAATTGAA TTAGAAAATT TTAAAGCGTT TCAAATCAAC GATAAAATCC TTGATCTGTC 180 CATAGAGGGC AAAAAAGCTC TACAATACGA TGATCATGAG ATCTTTTTTG ATTCCAAAAT 240 CAAGCGTTAT GATGAAGACA CGATAGAAAG CGTTGAATCC CCTAAAGCCA AACGGCAGCA 300 GGATTTGTAT TTCTTCCCTA ATGGGGTAAC TTATAAAAGA AGCGATGATT CTAGTTTTTG 360 GAGTGAAACA GGGATTTACA ACCATAAGGA GCAAAATTTT AAAGGCAAGG GCCGTTTCAT 420 TCTCACTCAA AGGACAGCAA GGTTGAAGGG CTTGACATTT CTTATTCGCA TGCTTTAGCC 480 ATTATTGAAG CCCAAAGCAT TCAAGCTAAT TTATTCTTAG ATGAAATCAA ACAAAGCCAG 540 AAAGAAAAGA AAAAATTCCC CACTTTCAAA GGAGGGGTTT TAATGCGTTG GTGGTGTGTT 600 CTTGTGTGTT GTTTTGGAAT TTTAAGCGTG ATGAACGCTC AAAAAACAGA CAATAAAGGT 660 TTGAAAAAAG AAAGAGAAAC TTTTAGAAAT TACCGGCAAC AAATTCGTAG CGAACGACAA 720 AACAAAAACC GCCGTTATTC AAGGCAATGT GCAGATCAAA AAAGGTAAAG ACCGGTTGTT 780 TGCGGATAAG GTGAGCGTGT TTTTAAACGA TAAACGAAAG CCAGAGCGCT ATGAAGCCAC 840 AGGGAACACG CATTTTAACA TCTTTACAGA GGATAATCGT GAAATCAGCG GGAGTGCTGA 900 CAAGCTCATT TATAACGCAC TGAATGGGGA ATACAAATTA TTGCAAAATG CGGTGGTTAG 960 AGAAGTGGGG AAATCTAATG TTATTACCGG TGATGAGATC ATTTTAAACA AAGCTAAGGG 1020 TTATGCTGAT GTGTTGGGGA GCACGAAACG GCCCGCTAAA TTTGTGTTTG ATATGGAAGA 1080 CATTAATGAA GAAAATCGTA AGGCCAAATT GAAGAAGAAA GGCGCTAAGG AAAAACCATG 1140 ATCGCTATTA AAGACGCTCA TTTTCTCACT TCTTCTAGCC AACTTTCGCA ATGCCCTGCG 1200 AGCTTGACTT CTGAAATGGT CATTTTAGGG CGCAGCAATG TCGGTAAAAG CTCGTTTATT 1260 AATACCTTGT TAGGAAAAAA TCTCGCTAAA AGTTCAGCAA CGCCTGGAAA AACCCGTTTA 1320 GTGAATTTTT TTTCCACCAC TTGGGAAGAT AAAGAAAACG CCTTAAGGGC CACTTTTAAT 1380 GTGATTGATT TGCCTGGGTT TGCTACGCTA AAGTTTCTAA AAGCTT 1426 配列番号：３ 配列の長さ：723 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-49 配列 AAGCTTTGCC AACTTTACCA ACACAACAAA GATTTAGTAG CAAGTATATG ATTTTGGTCA 60 AATCAAATGA GTTATACTAT GCAATAGGTA GTGCTATTAA TCAAGATTTA AGCTCTTCTC 120 CTATCTTCAA AACAAATGTT TCCCCAAACA AATTGATGCT GTATAAAAAT GGAAAAATTT 180 CATCTATGAT CAAAGGAGAA AAAGGGTTTG GGGGTCATGA AGGTTCTGAG ATAGTAGATG 240 CTACTGAGCT AGCTACAGGA TTTATGAACC ACATTGTCCC TATTCTTAGT TATAAACTAG 300 ATTGTCCATA TTCTTAATTA TAAACTAGCG GAAATCTATT ATGAAGCATA TGTCGAAACT 360 AATCGTCTTT TAACGAAAAT CAAAGGCTAC TCGCACAACA AAACACTTTT GTTACCCAAC 420 AAATTAATGC CTTAAAAGCT AAAACTAAAT TTCTCCAAAA AGTTTATAAG GATATTTCTC 480 AAATTTCTAA AAGTGATGTT TTGATACAAT CAACATGCAC AAATTTACAA AGAATACGCA 540 TTGAACTAGA TGAAATTTTT TATAATTTTA TATCCCAAAT AAATCAAGGA CTAATGGTAA 600 AAAACTTTAA TGATGTAAGT GGTAACTACA TTTGTGCAAG ATACGCTCTT TCTCATTATA 660 TTTTTGCGTT GGTTTTAGAA TATGTTGTTG CAGGACTCAT TGATAATGAG AGCATGGAAG 720 CTT 723 配列番号：４ 配列の長さ： 339 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-55(down) 配列 AAGCTTTTGC CTGGCACGGC TATGCCTAGA GTGGGGTTGA GCGAACAGGC TCAAAAACAA 60 GTCATCGCAT ATTTGGAAAA AGCGGGCGAT AGGAAAAAAC ATGAAAGGAA CACCTTAGGG 120 ATAAAAATCA TGATTTTCTT TGCGGTGCTG TCGTTCTTGG CTTATGCGTG GAAAAGAAAG 180 GTTTGGAGCG AAGTGCATTG AATTAAAAAA AGGGGGAGGG CATGGTTTTA TGATTTTTGA 240 TCTATGGTGG GGTGTTTGAA TGGCGTTTTC AAAACAACCT TTATTTTAGG ATTTTATTAT 300 TACTAATACC CCTATAAGGA TTTTATGGCT ACAAAGCTT 339 配列番号：５ 配列の長さ： 925 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-55(up) 配列 AAGCTTGAAA TATTAATGCT TCAAATGAGT TTGGTTTAAT CTTTAATTAA AGAAAAAGTC 60 ATCAAACTAG CCCAAACATT AGGAATCAAC ATGATCATTG GCGGGCCTCC CTGTCAAGGC 120 TTTTCTAATA AAGGGAAAAA TTTAGGGCTA AAAGACTCTA GGAATTTTTT ATTTTTAGAA 180 TATATAGAGA TAGTAAAAGC CTTAAAACCA GAAATTTTTA TCATTAAAAA CATGAAAAAC 240 CTCATCTCTT GCGCTAAAGG CTATTTTTTA GAAGAAATTA AAGAAAGATT GAACGCTTTA 300 GGGTATCAAT TAAGCTATCA AATCCTAAAT GCTAAAGATT ATGGCGTGCC TCAAAACAGA 360 GAGAGGGCCT TTATTGTGGG GGCTAGTCGT TTTAGTTTTG ATTTCAATCT TTTAGAGCCT 420 TCTCAAAGCG TGAATGTTCA GGATGCGATA AGCGATTTAG CCTATCTTGT TCTAATGAGG 480 GGGCGTTTGA AAGCGATTAT TTAAACCCTA TCCAATCAAG CTATCAAGCC TTGATGCGAA 540 AAGATAGCCC TAAATTATAC AACCATCAAG CCACCAACCA CTCGCAAGCC GCTTTAGAGA 600 AATTAAAGCT CATTAACAAA GAGCAAGGCA AAGAATGCTT GCCTAAAAAC TTGCATGGCA 660 AACAGCAATT CAAAAGCACA TGGGGGCGTT TGAATTGGAA TAAAATCAGC CCCACCATAG 720 ACACACGATT TGACACTCCA AGTAATGGCA CCAACTCCCA CCCTGAATTG CACCGCTCTA 780 TCACGCCCAG AGAAGCCGCT AGGATACAAA GTTTTAGCGA TAATTATATC TTTTATGGCA 840 ATAAAACGAG CGTTTGCAAG CAAATCGGTA ACGCTGTGCC CCCTCTTCTA GCCCTAGCTT 900 TAGGCAAAGC GATCTTAAAA AGCTT 925 配列番号：６ 配列の長さ：2393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-60 配列 AAGCTTGAAG GTGCGTTAAA ATGAAAATCT CTTTATTTGG GCATGGCAAA ACCACTCTAG 60 CCTTAGGGCG TTTTTTTAGA AAAAACCATA ACGAAGTCAA ATTTTTTGAC GACCAATTCA 120 CTGCATCTTT TAAAGATAGC GAGGGTTTTG TTTGCTATCC CAGTAAGGAT TTCAACCCTA 180 ATGATTCCCA ACTAGAGATA GTCAGCCCTG GCATTAGCTT CACGCACCCT TTAGTCATAA 240 AAGCCAAGCA TTTAGTGAGC GAATACGATT ATATTGATAG CTTGTTTGAT TTGGTTTTCA 300 CGCCTACTAT AATAAGTATT AGCGGCACTA ATGGTAAAAC CACCACGACA GAAATGCTCA 360 CCATGCTTTT AGAAGATTTT AAGGCTGTGA ATGGGGGGAA TATCGGCACG CCCTTGATTG 420 AATTGTTTGA AAAACAATCG CCCTTGTGGG TGTTAGAAAC AAGCTCCTTT TCTTTGCATT 480 ACACTAATAA GGCTTACCCT TTAATCTACT TGCTCATCAA TGTGGAAGCT GATCATTTGA 540 CTTGGCATTG CAATTTTGAA AATTATTTGA ACGCTAAACT CAAGGTTTTA ACATTGATGC 600 CTAAAACTTC ACTCGCTATC CTCCCTTTAA AATTCAAAGA ACATTCAAGC GTTCAAAATT 660 CGCAAGCGCA AAAAATCTTT TTTGACAAAA GCGAAGAGGT TTTAGAGCGT TTAAAAATCC 720 CTTCTAACGC CCTTTTTTTT AAAGGAGCGT TTTTATTAGA CGCTGCATTA GCCCTTTTAG 780 TTTACGAGCA ATTTTTAAAA ATAAAGAATT TAAAATGGCA AGATTATAGA GAAAACGCCC 840 TTAAAAGACT GAACGCTTTT AAAATCGGCT CGCATAAAAT GGAAGAATTT AGGGATAAAC 900 AAGGGCGTTT GTGGGTAGAT GACAGCAAAG CCACAAACAT TGATGCCACC TTGCAAGCCC 960 TAAAAACCTT TAAAAACCAA AAAATCCATT TGATTTTAGG GGGCGATATT AAAGGGGTCA 1020 ATTTAACCCC CCTTTTTGAA GAATTTAAAA ATCATGAAAT AAGCCTTTAT GCCATAGGAT 1080 CAAGCGCTTT TATTATCCAA TCCTTAGCAT TAGAATTTAA TGTTTCTTGT CAGGTTTGTT 1140 TGGAGTTAGA AAAAGCGGTT CAAGAAATTA AAAGCGTTTT ATCGCAAAAT GAAATTGCTT 1200 TGCTTTCACC CAGCGCAGCC AGTTTGGATC AATTTTCTTC GTATAAAGAA AGGGGTGAAA 1260 GATTTAAAGC GTTTGTTTTA AAAGATTAAA GCACATGCAC CACTTGGTCT AATTGTGAAA 1320 TTTTTTGAAA AATCTCGTTC CGTTCTTCTT CATTTGAAAC TTCCATAGAA ACATTAAAGC 1380 TATAAAATTT AGCGTTTTTA GAAGTGTTTT TTAATTCCAA TTTAAAGGGG CGTTGGTAGG 1440 TTTCTAAAAG CTCTTTTAAC ACGCTTGTAT CTTTAGTAGT CATAATCACC CTATAATCCC 1500 AAAGACAAGG GTAAATAATA GTGGGTTTTC CTGAATCAGA TGGCATTGAA CAGCTCCTTA 1560 AACACTTTAG GAATGGCAAT AGGGCTGTAT GTAGAGCGAT TGACAAAGCC AAACTTGATT 1620 TCTGAAGCAA AGACCTTAAA AGGCTTCATA GGCTCTAAAG AAGCGTTTTG GATGCAATAA 1680 ATTTCTTGAA AAAGCACCAC AAAAACCTTT CTTAATTCTT TAATTTGCGT TCTTATTTCT 1740 AAGACCTGCC CAAGGCTTGC GGGGGTGAAA AAATCCGCTT TGATAGAGCG GATAACAAAC 1800 ACGCCTTCTT CATTTTCTGG CAAGACATTT TGTTTAAAAA AAAACTCGCT CCTAGCCCTT 1860 TCGCAATATT TCAAATAATT CGCATGATAG ACCACGCCTT CAGAGTCGGT ATCTTCGTAA 1920 TATACCCTAC AGCGCATTGA TTCCCCTTAC TCAAATAATG AAATTTTCTT GAAATTATAC 1980 AACTATGTAA CTTAACTATA GTATAATCTA GGGGCGTTGC TTATATTTTT TAGGTATTTT 2040 TAAAGTGGTT TTTGTGGTTT TTTTCTTAAA TCTTAAGATC TTTAAAGATT TTAGAAAACT 2100 AATACAGCAA TAGTTGGACG ATTAAAGACA TTGCTCTTTA ATTTTAATCA TTTATAAGGA 2160 GTTTGGTAGT TAAGATATGG GTAATCATTT TTCTAAATTA GGATTTGTTT TAGCCGCATT 2220 AGGAAGCGCG ATAGGTTTAG GGCATATCTG GCGATTCCCC TATATGACCG GGGTGAGTGG 2280 TGGGGGTGCT TTTGTTTTAT TGTTTTTATT TTTATCTTTA AGCGTTGGCG CGGCGATGTT 2340 TATCGCTGAA ATGCTATTAG GACAAAGCAC GCAAAAAAAT GTAACAGAAG CTT ２
３９３ 配列番号：７ 配列の長さ： ９２６ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-64 配列 AAGCTTTAGT GCGAGATTCC AATTTGATTT CTGCTAAAGC CCAAGCGGTG CCTATTGTTT 60 TGCAATTGCA TGCGCTATAC AATGAAGAAA ACAATTACAC GCAATACCTT TTAAGCGTGA 120 TGCTGCCTTG CATGTGGCTT ATTTTGATTG CGATTGGCAT GCTCAATTTC ATTCAAAAAG 180 CCTCTAACAT GCACGAGCTT TTAATCAGTA TTTTAGCGAA TATGTGCGTG TTTAGTTTTT 240 GGGGGATGGG CATGGCGTTT TATTTTAATC TCATTGGCAT GGAGGGACAT TATGCGCATT 300 TGTCATTGGT CTTTTTGGCG GTCGTTTTAA TGGCGCTCAT TATGAGCGGG TTTGTGGTGT 360 TGGTTTATGG CGTTTCAAAA AGCGTTATTG AAACCGCTGG CGCAATTGGG GTCTATACCG 420 CTCCAAGTTT TGCGTTTGCT GGGGTTACTT ACCCGCAAAA TAACATGGAA ATTTTTGGGA 480 GTTTTTGGAG CCATTGCTTG CCTATTAGCC ATTTTATGAA GTTCTTTTTA CAAGAGGCCT 540 ATTATAAGAC GGATTTTACA GAGTCTTTAA ATTCTCTAAT GCCGCTTGCG TTCTTTTTAA 600 TCTTTTTAGT CTTAGGGCTT TTGATTTTTT ATTTTTCTTT TAAAAAAGGC AAGGCTAGCG 660 CATGAATTTT TTTAAAATCC TTTTAATGGA GTTAAGGGCT ATTGTTTCTC ATAAGGGCGT 720 TTTGTTAATC CTTATAGGCG CGCCTTTAAT CTATGGCTTA TTATACCCTT TGCCTTATTT 780 AAAAGACATC GTAACGCAGC AAAAAATCGC CCCTTGTAGA TGAAGACAAT TCCTTTCTTT 840 CCAGGCAATT AGCCTTCATG GTGCAAAGCT CCAACGAGTT AGAAATCGCT TTTTTTAGCC 900 CCTCTATGCT GGAAGCCAAA AAGCTT 926 配列番号：８ 配列の長さ：1219 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-66 配列 AAGCTTATGG GGTTTATGAA AGCAGCTATT TGCAAGAAGT CCCTAGAGAT CAATTTGAAG 60 GCATTGAATT GGAAAAAGGC ATGAGCGTTT TTGGGCAAAC TGAAGACCAC AAAACCATTC 120 AAGCCACTAT CAAAGACTTT AGCAGCACGC ATGTGATGGT GGATTATAAC CATCCGTTAG 180 CCGGGAAAAC TTTAGCGTTT CGTTTCAAGG TTTTGGGCTT TAGGGAAGTG AGCGAAGAAG 240 AAATTTTAGC TTCACACCAT GGCGGTGGGA CAGGTTGCTG TGGCGGTCAT GGGGGTCATG 300 GCGGAAAGAA AGGTGGGGGC TGTGGTTGCT CATGTTCGCA TGGGTAGTAG GGTATAGGAG 360 CATTTAAAAG GCAAGGTCAT GAATAGTTCT AATCTCAAAA ATTGGCTGTT CCCTACCATT 420 TGCTTTTTTT TGTTTTGTTA TATTTTAATT TTTTTGATGT TTTTTATGTT TAAAAGTTTG 480 CAATCGCAAT CTTTTGGCTC TGTGGCAGAA ACCGGAAAAA AACCCATCAC CACCACCAAG 540 AAATTTGGTA AGGAATTGCA AAAACAGATT TCAAAGATCC ATTAACTTTT TTTCTTTTTT 600 GCCGATACTT GCCGTAATGG AATGAATATC AAATTAAAGG ATTTTACAAT GATCAATGCC 660 GTTTCTTCTC TTTCTCCGGT GCAATCTGTG GGGAATTACA AGCGTGTGGA AAAGAATGAA 720 AAAGTTGAAA ATAGCGAGGC CGCTCTTGAT AGGGTGGCTG AAATCAAGCA AGCTATTGAA 780 AACAACCAGT ATAAAATCAA CTTGCATGAG ACTTCTCACA AAATGGCACA GGATTTATTG 840 GGGATAGGCT AAGGGTTTTA AGGGCTTCAT TTCTAGGGGG GGTTATTCTT GCTGTCGTTT 900 TGTTTTTCAT TAAATTTTAG TTTCTTTATG TTTTGAGTTT TTTGCTCTCT TAAATAGGGC 960 GTGTTTTTGT TGCGTGTTAG GAATGATTGA TTGGGAATTT TAACTTTTAT GGATTTTTGT 1020 TCTGGTATTG GTGGAGGCCG TTTGGGCTTG GAGCAATGCC ATTTAAAATG CGTAGGGCAT 1080 GCAGAAATCA ATCATGAAGC CATTAGAACT TATGGATTAT TTTTTAAAGA TACCCATAAT 1140 TTTGGGGATT TGATGCGAAT CAACCCTAAT GATTTACCCG ATTTTGATGC GCTCATTAGC 1200 GGGTTTCCTT GTCAAGCTT １２
１９
i) 株名：臨床分離株 HP-32 配列 AAGCTTCTAG TAAAGAAATC ACTCTTTTTT GCTGTTCCAA TAGTGCGTCT ATCTTGGCAC 60 TCAAACGATT TATTTTACTT TCCATGCGTT CAATACTAAC CACTAAAAAT AAATAGCTAT 120 TTAATCATTA AAAATGATTA TTTTAATACC ATGCTCTTAA ATTAAGATGT GTTTTTATGA 180 TCATGCTACA ATAAAAACAC AAAATGATTT CAAAGAAAAA GGGTTTAAAA TGAAAACTTT 240 TGAAGTAATG ATTCAAACCG ATTCAAAAGG GTATTTGGAC GCTAAATTTG GCGGTACGCT 300 CCTAGAGGGT TTCTCAATCC AAACGGCTTA CCCACTTATT CGCCTAAAAT CTCATGGCAA 360 AAAGTAGAAG GCGCTCAAAG CTATGCACTA GAACTCATCG ATCATGACGC TCAAAAAGTG 420 TGTGGCATGT CGTTTGTCAT TGGGTCGTGG GCAATATTTC TTATAATGTT TTAGAAGAAA 480 ACGCTTCCAT GATGGATAAA AGAATTGTTC AAGGGGTCAA TTCGCTCACT CAAGGCTTTA 540 TCCGTTCCCC ACTTAATGAA AGCGAAAAAC AACGCTCCAA TCTCAATAAC AGCACCTATA 600 TCGGCCCCAT GCCCCCTAAT GGCGATCACC ATTACTTAAT CCAAGTGTAT GCCCTAGACA 660 TTCCTAAACT CGCCTTAAAA GCCCCGTTTT TCTTAGGCGA TTTGCATGAC AGAATGCGCG 720 GACATATCAT CGCCATAGGG AGAAAAGAAT TTTTATACAA GCAGTTTGTG AGGAAATAGG 780 CTACTGCTTG TAGCTATTCT TTCGCTAAAT TGAATTTTTG ATACATCTCT AAAATTCTCT 840 TTTCATCTAG CATGCTTTCT TCAATCCTTG TGCCTATCAA ATCGGCATGG TGCTTTTTAA 900 AATCTTTTAA AGGGATTAAA TCATTATCAA CAAGAGCGTT TCGCCTCTTT TTAGCTAAAG 960 GGAAGTGCCA TTGCACGAGT TCTTTATCCT TAAATATGGT GTTTATCCTT AAGCCTTAAA 1020 GTTTTATAAG CATCACCATT ATATTGCCAA ATTTCAAAAG GCTCACAATC GTTATAAAAT 1080 AACCAATGAT CTCCCCATGC GTCTAAAAAT CCAAAATCCC CATCATTACG CATAAACACC 1140 TCAAAATCTT GCACCACAAA ATTAATACGC GAATACATCA CAACCTCTTT AATGCTCTTA 1200 GGGATATAAA AACTTTCATA AAGTTTTTTA GCGTCATAAA TATGATCACA ATCAATTTTG 1260 ATAACCCACT CATTTTTAGG GATAAAAGAA AGCGTATAAT TATAGTAATG ATAGAGTTGG 1320 TGCCACAAAC TCGGGCAATC CTTTAGTATG ACTTCATAAG GATAGCTGAT AGGGATAAAT 1380 GAGGGGAACT TTTTACAAAA CTCTAAAATC ACTTCTTTAG AGCCATCATC GCAATCATTA 1440 AAACCAATGA CCCCCCTTTG AATGGCAGGA AGCATAGAAA ACAAACTCTC TTCTAAAGTA 1500 ACGATTTCAT TTTTGACTCT AATAAAAGNC CATGGGTTTA GAGGGCTTTT AGGGTTTTGA 1560 CTTTTTTATC ATAGTCAAAA TAACCTGAAT GCGTGGGATT GGGTAGAGTT AAAGTGGGAT 1620 GGATAACCCT ATCTTCTAAA TGCCCCCCCC CCCCCCATAA TTATAATTAA GAGAACTATT 1680 TTTATAAATA CTCTTATTGC GTTCAATGAA ACTTTCATTA TTTAAAGAAG CGATAGCCAA 1740 AAACACGCTT TCTTGATGGT CATGGTTGAA TAAAGCTT 1778 配列番号：２ 配列の長さ：1426 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-34 配列 AAGCTTTACC TCTAATAGCG TTTTAAACTT TTTTGTGGTT TTGTCTTTCA TCACGATAGG 60 GCTAGTTTTT TTCTTTTTGC GTTCCCAACC CACTAGCGTG GTCTCTAAAG AAAATATTCC 120 TAAAATTGAA TTAGAAAATT TTAAAGCGTT TCAAATCAAC GATAAAATCC TTGATCTGTC 180 CATAGAGGGC AAAAAAGCTC TACAATACGA TGATCATGAG ATCTTTTTTG ATTCCAAAAT 240 CAAGCGTTAT GATGAAGACA CGATAGAAAG CGTTGAATCC CCTAAAGCCA AACGGCAGCA 300 GGATTTGTAT TTCTTCCCTA ATGGGGTAAC TTATAAAAGA AGCGATGATT CTAGTTTTTG 360 GAGTGAAACA GGGATTTACA ACCATAAGGA GCAAAATTTT AAAGGCAAGG GCCGTTTCAT 420 TCTCACTCAA AGGACAGCAA GGTTGAAGGG CTTGACATTT CTTATTCGCA TGCTTTAGCC 480 ATTATTGAAG CCCAAAGCAT TCAAGCTAAT TTATTCTTAG ATGAAATCAA ACAAAGCCAG 540 AAAGAAAAGA AAAAATTCCC CACTTTCAAA GGAGGGGTTT TAATGCGTTG GTGGTGTGTT 600 CTTGTGTGTT GTTTTGGAAT TTTAAGCGTG ATGAACGCTC AAAAAACAGA CAATAAAGGT 660 TTGAAAAAAG AAAGAGAAAC TTTTAGAAAT TACCGGCAAC AAATTCGTAG CGAACGACAA 720 AACAAAAACC GCCGTTATTC AAGGCAATGT GCAGATCAAA AAAGGTAAAG ACCGGTTGTT 780 TGCGGATAAG GTGAGCGTGT TTTTAAACGA TAAACGAAAG CCAGAGCGCT ATGAAGCCAC 840 AGGGAACACG CATTTTAACA TCTTTACAGA GGATAATCGT GAAATCAGCG GGAGTGCTGA 900 CAAGCTCATT TATAACGCAC TGAATGGGGA ATACAAATTA TTGCAAAATG CGGTGGTTAG 960 AGAAGTGGGG AAATCTAATG TTATTACCGG TGATGAGATC ATTTTAAACA AAGCTAAGGG 1020 TTATGCTGAT GTGTTGGGGA GCACGAAACG GCCCGCTAAA TTTGTGTTTG ATATGGAAGA 1080 CATTAATGAA GAAAATCGTA AGGCCAAATT GAAGAAGAAA GGCGCTAAGG AAAAACCATG 1140 ATCGCTATTA AAGACGCTCA TTTTCTCACT TCTTCTAGCC AACTTTCGCA ATGCCCTGCG 1200 AGCTTGACTT CTGAAATGGT CATTTTAGGG CGCAGCAATG TCGGTAAAAG CTCGTTTATT 1260 AATACCTTGT TAGGAAAAAA TCTCGCTAAA AGTTCAGCAA CGCCTGGAAA AACCCGTTTA 1320 GTGAATTTTT TTTCCACCAC TTGGGAAGAT AAAGAAAACG CCTTAAGGGC CACTTTTAAT 1380 GTGATTGATT TGCCTGGGTT TGCTACGCTA AAGTTTCTAA AAGCTT 1426 配列番号：３ 配列の長さ：723 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-49 配列 AAGCTTTGCC AACTTTACCA ACACAACAAA GATTTAGTAG CAAGTATATG ATTTTGGTCA 60 AATCAAATGA GTTATACTAT GCAATAGGTA GTGCTATTAA TCAAGATTTA AGCTCTTCTC 120 CTATCTTCAA AACAAATGTT TCCCCAAACA AATTGATGCT GTATAAAAAT GGAAAAATTT 180 CATCTATGAT CAAAGGAGAA AAAGGGTTTG GGGGTCATGA AGGTTCTGAG ATAGTAGATG 240 CTACTGAGCT AGCTACAGGA TTTATGAACC ACATTGTCCC TATTCTTAGT TATAAACTAG 300 ATTGTCCATA TTCTTAATTA TAAACTAGCG GAAATCTATT ATGAAGCATA TGTCGAAACT 360 AATCGTCTTT TAACGAAAAT CAAAGGCTAC TCGCACAACA AAACACTTTT GTTACCCAAC 420 AAATTAATGC CTTAAAAGCT AAAACTAAAT TTCTCCAAAA AGTTTATAAG GATATTTCTC 480 AAATTTCTAA AAGTGATGTT TTGATACAAT CAACATGCAC AAATTTACAA AGAATACGCA 540 TTGAACTAGA TGAAATTTTT TATAATTTTA TATCCCAAAT AAATCAAGGA CTAATGGTAA 600 AAAACTTTAA TGATGTAAGT GGTAACTACA TTTGTGCAAG ATACGCTCTT TCTCATTATA 660 TTTTTGCGTT GGTTTTAGAA TATGTTGTTG CAGGACTCAT TGATAATGAG AGCATGGAAG 720 CTT 723 配列番号：４ 配列の長さ： 339 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-55(down) 配列 AAGCTTTTGC CTGGCACGGC TATGCCTAGA GTGGGGTTGA GCGAACAGGC TCAAAAACAA 60 GTCATCGCAT ATTTGGAAAA AGCGGGCGAT AGGAAAAAAC ATGAAAGGAA CACCTTAGGG 120 ATAAAAATCA TGATTTTCTT TGCGGTGCTG TCGTTCTTGG CTTATGCGTG GAAAAGAAAG 180 GTTTGGAGCG AAGTGCATTG AATTAAAAAA AGGGGGAGGG CATGGTTTTA TGATTTTTGA 240 TCTATGGTGG GGTGTTTGAA TGGCGTTTTC AAAACAACCT TTATTTTAGG ATTTTATTAT 300 TACTAATACC CCTATAAGGA TTTTATGGCT ACAAAGCTT 339 配列番号：５ 配列の長さ： 925 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-55(up) 配列 AAGCTTGAAA TATTAATGCT TCAAATGAGT TTGGTTTAAT CTTTAATTAA AGAAAAAGTC 60 ATCAAACTAG CCCAAACATT AGGAATCAAC ATGATCATTG GCGGGCCTCC CTGTCAAGGC 120 TTTTCTAATA AAGGGAAAAA TTTAGGGCTA AAAGACTCTA GGAATTTTTT ATTTTTAGAA 180 TATATAGAGA TAGTAAAAGC CTTAAAACCA GAAATTTTTA TCATTAAAAA CATGAAAAAC 240 CTCATCTCTT GCGCTAAAGG CTATTTTTTA GAAGAAATTA AAGAAAGATT GAACGCTTTA 300 GGGTATCAAT TAAGCTATCA AATCCTAAAT GCTAAAGATT ATGGCGTGCC TCAAAACAGA 360 GAGAGGGCCT TTATTGTGGG GGCTAGTCGT TTTAGTTTTG ATTTCAATCT TTTAGAGCCT 420 TCTCAAAGCG TGAATGTTCA GGATGCGATA AGCGATTTAG CCTATCTTGT TCTAATGAGG 480 GGGCGTTTGA AAGCGATTAT TTAAACCCTA TCCAATCAAG CTATCAAGCC TTGATGCGAA 540 AAGATAGCCC TAAATTATAC AACCATCAAG CCACCAACCA CTCGCAAGCC GCTTTAGAGA 600 AATTAAAGCT CATTAACAAA GAGCAAGGCA AAGAATGCTT GCCTAAAAAC TTGCATGGCA 660 AACAGCAATT CAAAAGCACA TGGGGGCGTT TGAATTGGAA TAAAATCAGC CCCACCATAG 720 ACACACGATT TGACACTCCA AGTAATGGCA CCAACTCCCA CCCTGAATTG CACCGCTCTA 780 TCACGCCCAG AGAAGCCGCT AGGATACAAA GTTTTAGCGA TAATTATATC TTTTATGGCA 840 ATAAAACGAG CGTTTGCAAG CAAATCGGTA ACGCTGTGCC CCCTCTTCTA GCCCTAGCTT 900 TAGGCAAAGC GATCTTAAAA AGCTT 925 配列番号：６ 配列の長さ：2393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-60 配列 AAGCTTGAAG GTGCGTTAAA ATGAAAATCT CTTTATTTGG GCATGGCAAA ACCACTCTAG 60 CCTTAGGGCG TTTTTTTAGA AAAAACCATA ACGAAGTCAA ATTTTTTGAC GACCAATTCA 120 CTGCATCTTT TAAAGATAGC GAGGGTTTTG TTTGCTATCC CAGTAAGGAT TTCAACCCTA 180 ATGATTCCCA ACTAGAGATA GTCAGCCCTG GCATTAGCTT CACGCACCCT TTAGTCATAA 240 AAGCCAAGCA TTTAGTGAGC GAATACGATT ATATTGATAG CTTGTTTGAT TTGGTTTTCA 300 CGCCTACTAT AATAAGTATT AGCGGCACTA ATGGTAAAAC CACCACGACA GAAATGCTCA 360 CCATGCTTTT AGAAGATTTT AAGGCTGTGA ATGGGGGGAA TATCGGCACG CCCTTGATTG 420 AATTGTTTGA AAAACAATCG CCCTTGTGGG TGTTAGAAAC AAGCTCCTTT TCTTTGCATT 480 ACACTAATAA GGCTTACCCT TTAATCTACT TGCTCATCAA TGTGGAAGCT GATCATTTGA 540 CTTGGCATTG CAATTTTGAA AATTATTTGA ACGCTAAACT CAAGGTTTTA ACATTGATGC 600 CTAAAACTTC ACTCGCTATC CTCCCTTTAA AATTCAAAGA ACATTCAAGC GTTCAAAATT 660 CGCAAGCGCA AAAAATCTTT TTTGACAAAA GCGAAGAGGT TTTAGAGCGT TTAAAAATCC 720 CTTCTAACGC CCTTTTTTTT AAAGGAGCGT TTTTATTAGA CGCTGCATTA GCCCTTTTAG 780 TTTACGAGCA ATTTTTAAAA ATAAAGAATT TAAAATGGCA AGATTATAGA GAAAACGCCC 840 TTAAAAGACT GAACGCTTTT AAAATCGGCT CGCATAAAAT GGAAGAATTT AGGGATAAAC 900 AAGGGCGTTT GTGGGTAGAT GACAGCAAAG CCACAAACAT TGATGCCACC TTGCAAGCCC 960 TAAAAACCTT TAAAAACCAA AAAATCCATT TGATTTTAGG GGGCGATATT AAAGGGGTCA 1020 ATTTAACCCC CCTTTTTGAA GAATTTAAAA ATCATGAAAT AAGCCTTTAT GCCATAGGAT 1080 CAAGCGCTTT TATTATCCAA TCCTTAGCAT TAGAATTTAA TGTTTCTTGT CAGGTTTGTT 1140 TGGAGTTAGA AAAAGCGGTT CAAGAAATTA AAAGCGTTTT ATCGCAAAAT GAAATTGCTT 1200 TGCTTTCACC CAGCGCAGCC AGTTTGGATC AATTTTCTTC GTATAAAGAA AGGGGTGAAA 1260 GATTTAAAGC GTTTGTTTTA AAAGATTAAA GCACATGCAC CACTTGGTCT AATTGTGAAA 1320 TTTTTTGAAA AATCTCGTTC CGTTCTTCTT CATTTGAAAC TTCCATAGAA ACATTAAAGC 1380 TATAAAATTT AGCGTTTTTA GAAGTGTTTT TTAATTCCAA TTTAAAGGGG CGTTGGTAGG 1440 TTTCTAAAAG CTCTTTTAAC ACGCTTGTAT CTTTAGTAGT CATAATCACC CTATAATCCC 1500 AAAGACAAGG GTAAATAATA GTGGGTTTTC CTGAATCAGA TGGCATTGAA CAGCTCCTTA 1560 AACACTTTAG GAATGGCAAT AGGGCTGTAT GTAGAGCGAT TGACAAAGCC AAACTTGATT 1620 TCTGAAGCAA AGACCTTAAA AGGCTTCATA GGCTCTAAAG AAGCGTTTTG GATGCAATAA 1680 ATTTCTTGAA AAAGCACCAC AAAAACCTTT CTTAATTCTT TAATTTGCGT TCTTATTTCT 1740 AAGACCTGCC CAAGGCTTGC GGGGGTGAAA AAATCCGCTT TGATAGAGCG GATAACAAAC 1800 ACGCCTTCTT CATTTTCTGG CAAGACATTT TGTTTAAAAA AAAACTCGCT CCTAGCCCTT 1860 TCGCAATATT TCAAATAATT CGCATGATAG ACCACGCCTT CAGAGTCGGT ATCTTCGTAA 1920 TATACCCTAC AGCGCATTGA TTCCCCTTAC TCAAATAATG AAATTTTCTT GAAATTATAC 1980 AACTATGTAA CTTAACTATA GTATAATCTA GGGGCGTTGC TTATATTTTT TAGGTATTTT 2040 TAAAGTGGTT TTTGTGGTTT TTTTCTTAAA TCTTAAGATC TTTAAAGATT TTAGAAAACT 2100 AATACAGCAA TAGTTGGACG ATTAAAGACA TTGCTCTTTA ATTTTAATCA TTTATAAGGA 2160 GTTTGGTAGT TAAGATATGG GTAATCATTT TTCTAAATTA GGATTTGTTT TAGCCGCATT 2220 AGGAAGCGCG ATAGGTTTAG GGCATATCTG GCGATTCCCC TATATGACCG GGGTGAGTGG 2280 TGGGGGTGCT TTTGTTTTAT TGTTTTTATT TTTATCTTTA AGCGTTGGCG CGGCGATGTT 2340 TATCGCTGAA ATGCTATTAG GACAAAGCAC GCAAAAAAAT GTAACAGAAG CTT ２
３９３ 配列番号：７ 配列の長さ： ９２６ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-64 配列 AAGCTTTAGT GCGAGATTCC AATTTGATTT CTGCTAAAGC CCAAGCGGTG CCTATTGTTT 60 TGCAATTGCA TGCGCTATAC AATGAAGAAA ACAATTACAC GCAATACCTT TTAAGCGTGA 120 TGCTGCCTTG CATGTGGCTT ATTTTGATTG CGATTGGCAT GCTCAATTTC ATTCAAAAAG 180 CCTCTAACAT GCACGAGCTT TTAATCAGTA TTTTAGCGAA TATGTGCGTG TTTAGTTTTT 240 GGGGGATGGG CATGGCGTTT TATTTTAATC TCATTGGCAT GGAGGGACAT TATGCGCATT 300 TGTCATTGGT CTTTTTGGCG GTCGTTTTAA TGGCGCTCAT TATGAGCGGG TTTGTGGTGT 360 TGGTTTATGG CGTTTCAAAA AGCGTTATTG AAACCGCTGG CGCAATTGGG GTCTATACCG 420 CTCCAAGTTT TGCGTTTGCT GGGGTTACTT ACCCGCAAAA TAACATGGAA ATTTTTGGGA 480 GTTTTTGGAG CCATTGCTTG CCTATTAGCC ATTTTATGAA GTTCTTTTTA CAAGAGGCCT 540 ATTATAAGAC GGATTTTACA GAGTCTTTAA ATTCTCTAAT GCCGCTTGCG TTCTTTTTAA 600 TCTTTTTAGT CTTAGGGCTT TTGATTTTTT ATTTTTCTTT TAAAAAAGGC AAGGCTAGCG 660 CATGAATTTT TTTAAAATCC TTTTAATGGA GTTAAGGGCT ATTGTTTCTC ATAAGGGCGT 720 TTTGTTAATC CTTATAGGCG CGCCTTTAAT CTATGGCTTA TTATACCCTT TGCCTTATTT 780 AAAAGACATC GTAACGCAGC AAAAAATCGC CCCTTGTAGA TGAAGACAAT TCCTTTCTTT 840 CCAGGCAATT AGCCTTCATG GTGCAAAGCT CCAACGAGTT AGAAATCGCT TTTTTTAGCC 900 CCTCTATGCT GGAAGCCAAA AAGCTT 926 配列番号：８ 配列の長さ：1219 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：Genomic DNA 起源 生物名：ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter pylor
i) 株名：臨床分離株 HP-66 配列 AAGCTTATGG GGTTTATGAA AGCAGCTATT TGCAAGAAGT CCCTAGAGAT CAATTTGAAG 60 GCATTGAATT GGAAAAAGGC ATGAGCGTTT TTGGGCAAAC TGAAGACCAC AAAACCATTC 120 AAGCCACTAT CAAAGACTTT AGCAGCACGC ATGTGATGGT GGATTATAAC CATCCGTTAG 180 CCGGGAAAAC TTTAGCGTTT CGTTTCAAGG TTTTGGGCTT TAGGGAAGTG AGCGAAGAAG 240 AAATTTTAGC TTCACACCAT GGCGGTGGGA CAGGTTGCTG TGGCGGTCAT GGGGGTCATG 300 GCGGAAAGAA AGGTGGGGGC TGTGGTTGCT CATGTTCGCA TGGGTAGTAG GGTATAGGAG 360 CATTTAAAAG GCAAGGTCAT GAATAGTTCT AATCTCAAAA ATTGGCTGTT CCCTACCATT 420 TGCTTTTTTT TGTTTTGTTA TATTTTAATT TTTTTGATGT TTTTTATGTT TAAAAGTTTG 480 CAATCGCAAT CTTTTGGCTC TGTGGCAGAA ACCGGAAAAA AACCCATCAC CACCACCAAG 540 AAATTTGGTA AGGAATTGCA AAAACAGATT TCAAAGATCC ATTAACTTTT TTTCTTTTTT 600 GCCGATACTT GCCGTAATGG AATGAATATC AAATTAAAGG ATTTTACAAT GATCAATGCC 660 GTTTCTTCTC TTTCTCCGGT GCAATCTGTG GGGAATTACA AGCGTGTGGA AAAGAATGAA 720 AAAGTTGAAA ATAGCGAGGC CGCTCTTGAT AGGGTGGCTG AAATCAAGCA AGCTATTGAA 780 AACAACCAGT ATAAAATCAA CTTGCATGAG ACTTCTCACA AAATGGCACA GGATTTATTG 840 GGGATAGGCT AAGGGTTTTA AGGGCTTCAT TTCTAGGGGG GGTTATTCTT GCTGTCGTTT 900 TGTTTTTCAT TAAATTTTAG TTTCTTTATG TTTTGAGTTT TTTGCTCTCT TAAATAGGGC 960 GTGTTTTTGT TGCGTGTTAG GAATGATTGA TTGGGAATTT TAACTTTTAT GGATTTTTGT 1020 TCTGGTATTG GTGGAGGCCG TTTGGGCTTG GAGCAATGCC ATTTAAAATG CGTAGGGCAT 1080 GCAGAAATCA ATCATGAAGC CATTAGAACT TATGGATTAT TTTTTAAAGA TACCCATAAT 1140 TTTGGGGATT TGATGCGAAT CAACCCTAAT GATTTACCCG ATTTTGATGC GCTCATTAGC 1200 GGGTTTCCTT GTCAAGCTT １２
１９
【図１】 ウェルの位置と被験試料（ブロッティングさ
れた菌株ＤＮＡ）との対応関係を示す図である。
れた菌株ＤＮＡ）との対応関係を示す図である。
【図２】 本発明のプローブと各種菌株由来のＤＮＡと
の反応性を示すドットハイブリダイゼーションの結果を
示す図である。
の反応性を示すドットハイブリダイゼーションの結果を
示す図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 ＦＩ 技術表示箇所 Ｃ１２Ｒ 1:01） (72)発明者 上原 啓嗣 大阪府大阪市城東区森之宮２丁目３番30号 扶桑薬品工業株式会社研究開発センター 内 (72)発明者 西田 圭吾 大阪府大阪市城東区森之宮２丁目３番30号 扶桑薬品工業株式会社研究開発センター 内 (72)発明者 松久 明生 大阪府大阪市城東区森之宮２丁目３番30号 扶桑薬品工業株式会社研究開発センター 内
Claims (2)
- 【請求項１】 ヘリコバクター ピロリ (Helicobacter
pylori)菌が保有する染色体ＤＮＡを制限酵素 HindIII
で消化して得られるＤＮＡ断片を含み、およびヘリコバ
クター ピロリ菌が保有するＤＮＡと特異的に反応す
る、ことを特徴とする感染症診断用プローブ。 - 【請求項２】 前記ＤＮＡ断片が、配列番号１乃至８に
記載の少なくとも一つの塩基配列を含む請求項１に記載
の感染症診断用プローブ。
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|---|---|---|---|---|
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Cited By (1)
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