JPH10500951A - コードされた組合せライブラリー - Google Patents
コードされた組合せライブラリーInfo
- Publication number
- JPH10500951A JPH10500951A JP7530459A JP53045995A JPH10500951A JP H10500951 A JPH10500951 A JP H10500951A JP 7530459 A JP7530459 A JP 7530459A JP 53045995 A JP53045995 A JP 53045995A JP H10500951 A JPH10500951 A JP H10500951A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- beads
- library
- reaction
- ala
- gly
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims abstract description 145
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 101
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 34
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims abstract description 25
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 124
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 45
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 10
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 4
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract 1
- BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 1,3-diisopropylcarbodiimide Chemical compound CC(C)N=C=NC(C)C BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- BGRWYRAHAFMIBJ-UHFFFAOYSA-N diisopropylcarbodiimide Natural products CC(C)NC(=O)NC(C)C BGRWYRAHAFMIBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 29
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 28
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 20
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 20
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 17
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 15
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 10
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 10
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 10
- SJVFAHZPLIXNDH-QFIPXVFZSA-N (2s)-2-(9h-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-phenylpropanoic acid Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)OCC1C2=CC=CC=C2C2=CC=CC=C21)C1=CC=CC=C1 SJVFAHZPLIXNDH-QFIPXVFZSA-N 0.000 description 9
- QWXZOFZKSQXPDC-NSHDSACASA-N (2s)-2-(9h-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoic acid Chemical compound C1=CC=C2C(COC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C3=CC=CC=C3C2=C1 QWXZOFZKSQXPDC-NSHDSACASA-N 0.000 description 9
- 230000004044 response Effects 0.000 description 9
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 7
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 6
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 6
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 6
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 6
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 6
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 6
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 5
- WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N hydroxymethyl benzene Natural products OCC1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 5
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 5
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 5
- AVFZOVWCLRSYKC-UHFFFAOYSA-N 1-methylpyrrolidine Chemical compound CN1CCCC1 AVFZOVWCLRSYKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PIPTUBPKYFRLCP-NHCYSSNCSA-N Ala-Ala-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PIPTUBPKYFRLCP-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 4
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Chemical compound CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- AHVYPIQETPWLSZ-UHFFFAOYSA-N N-methyl-pyrrolidine Natural products CN1CC=CC1 AHVYPIQETPWLSZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 4
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 3
- MZMNEDXVUJLQAF-UHFFFAOYSA-N 1-o-tert-butyl 2-o-methyl 4-hydroxypyrrolidine-1,2-dicarboxylate Chemical compound COC(=O)C1CC(O)CN1C(=O)OC(C)(C)C MZMNEDXVUJLQAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BYXHQQCXAJARLQ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BYXHQQCXAJARLQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N Ala-Gly-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N Ala-Gly-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- 108010011667 Ala-Phe-Ala Proteins 0.000 description 3
- XRUJOVRWNMBAAA-NHCYSSNCSA-N Ala-Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=CC=C1 XRUJOVRWNMBAAA-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- DHBKYZYFEXXUAK-ONGXEEELSA-N Ala-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=CC=C1 DHBKYZYFEXXUAK-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- MZZSCEANQDPJER-ONGXEEELSA-N Gly-Ala-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MZZSCEANQDPJER-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)CN CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- KAJAOGBVWCYGHZ-JTQLQIEISA-N Gly-Gly-Phe Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KAJAOGBVWCYGHZ-JTQLQIEISA-N 0.000 description 3
- WMGHDYWNHNLGBV-ONGXEEELSA-N Gly-Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 WMGHDYWNHNLGBV-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N Gly-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N 0.000 description 3
- FEUPVVCGQLNXNP-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FEUPVVCGQLNXNP-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 3
- 108010067902 Peptide Library Proteins 0.000 description 3
- BJEYSVHMGIJORT-NHCYSSNCSA-N Phe-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BJEYSVHMGIJORT-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- FPTXMUIBLMGTQH-ONGXEEELSA-N Phe-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FPTXMUIBLMGTQH-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- LBSARGIQACMGDF-WBAXXEDZSA-N Phe-Ala-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 LBSARGIQACMGDF-WBAXXEDZSA-N 0.000 description 3
- JJHVFCUWLSKADD-ONGXEEELSA-N Phe-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JJHVFCUWLSKADD-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N Phe-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N 0.000 description 3
- NHCKESBLOMHIIE-IRXDYDNUSA-N Phe-Gly-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 NHCKESBLOMHIIE-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 3
- JKJSIYKSGIDHPM-WBAXXEDZSA-N Phe-Phe-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(O)=O JKJSIYKSGIDHPM-WBAXXEDZSA-N 0.000 description 3
- IWZRODDWOSIXPZ-IRXDYDNUSA-N Phe-Phe-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CC=CC=C1 IWZRODDWOSIXPZ-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 3
- CBENHWCORLVGEQ-HJOGWXRNSA-N Phe-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 CBENHWCORLVGEQ-HJOGWXRNSA-N 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 108010017893 alanyl-alanyl-alanine Proteins 0.000 description 3
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 3
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 3
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 3
- 238000005828 desilylation reaction Methods 0.000 description 3
- KPUWHANPEXNPJT-UHFFFAOYSA-N disiloxane Chemical compound [SiH3]O[SiH3] KPUWHANPEXNPJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010075431 glycyl-alanyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010077435 glycyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010084525 phenylalanyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010065135 phenylalanyl-phenylalanyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- JRMUNVKIHCOMHV-UHFFFAOYSA-M tetrabutylammonium bromide Chemical compound [Br-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC JRMUNVKIHCOMHV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- ILAOVOOZLVGAJF-UHFFFAOYSA-N 1-methylpyrrole-2-carboxylic acid Chemical compound CN1C=CC=C1C(O)=O ILAOVOOZLVGAJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BFHRKLXYYTUWFT-UHFFFAOYSA-N 4-perylen-1-ylbutanoic acid Chemical compound C1=CC(C=2C(CCCC(=O)O)=CC=C3C=2C2=CC=C3)=C3C2=CC=CC3=C1 BFHRKLXYYTUWFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QXYRRCOJHNZVDJ-UHFFFAOYSA-N 4-pyren-1-ylbutanoic acid Chemical compound C1=C2C(CCCC(=O)O)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 QXYRRCOJHNZVDJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JAQNUEWEJWBVAY-WBAXXEDZSA-N Ala-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 JAQNUEWEJWBVAY-WBAXXEDZSA-N 0.000 description 2
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005727 Friedel-Crafts reaction Methods 0.000 description 2
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 238000004163 cytometry Methods 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- -1 peptidomimetics Chemical class 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 238000000967 suction filtration Methods 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- SVUOLADPCWQTTE-UHFFFAOYSA-N 1h-1,2-benzodiazepine Chemical compound N1N=CC=CC2=CC=CC=C12 SVUOLADPCWQTTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZFFMLCVRJBZUDZ-UHFFFAOYSA-N 2,3-dimethylbutane Chemical group CC(C)C(C)C ZFFMLCVRJBZUDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NGNBDVOYPDDBFK-UHFFFAOYSA-N 2-[2,4-di(pentan-2-yl)phenoxy]acetyl chloride Chemical compound CCCC(C)C1=CC=C(OCC(Cl)=O)C(C(C)CCC)=C1 NGNBDVOYPDDBFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001156002 Anthonomus pomorum Species 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 1
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AFCARXCZXQIEQB-UHFFFAOYSA-N N-[3-oxo-3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)propyl]-2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound O=C(CCNC(=O)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F)N1CC2=C(CC1)NN=N2 AFCARXCZXQIEQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000233805 Phoenix Species 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004721 Polyphenylene oxide Substances 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 238000006254 arylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229940049706 benzodiazepine Drugs 0.000 description 1
- 235000019445 benzyl alcohol Nutrition 0.000 description 1
- 150000005347 biaryls Chemical group 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 1
- CSSAHMVUIOUXGE-UHFFFAOYSA-N butanoic acid;perylene Chemical compound CCCC(O)=O.C1=CC(C2=CC=CC=3C2=C2C=CC=3)=C3C2=CC=CC3=C1 CSSAHMVUIOUXGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- MGHPNCMVUAKAIE-UHFFFAOYSA-N diphenylmethanamine Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(N)C1=CC=CC=C1 MGHPNCMVUAKAIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006266 etherification reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 238000005206 flow analysis Methods 0.000 description 1
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 description 1
- 230000026030 halogenation Effects 0.000 description 1
- 238000005658 halogenation reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M hydroxide Chemical group [OH-] XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 150000002611 lead compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- SIAPCJWMELPYOE-UHFFFAOYSA-N lithium hydride Chemical compound [LiH] SIAPCJWMELPYOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000103 lithium hydride Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 238000001465 metallisation Methods 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- CMWYAOXYQATXSI-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylformamide;piperidine Chemical compound CN(C)C=O.C1CCNCC1 CMWYAOXYQATXSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006396 nitration reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010534 nucleophilic substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000006053 organic reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 1
- 102000014187 peptide receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010011903 peptide receptors Proteins 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 229920000570 polyether Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000001525 receptor binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical group 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000005556 structure-activity relationship Methods 0.000 description 1
- 238000006277 sulfonation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- FGTJJHCZWOVVNH-UHFFFAOYSA-N tert-butyl-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-dimethylsilane Chemical compound CC(C)(C)[Si](C)(C)O[Si](C)(C)C(C)(C)C FGTJJHCZWOVVNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
- C07K1/047—Simultaneous synthesis of different peptide species; Peptide libraries
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/005—Beads
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/0054—Means for coding or tagging the apparatus or the reagents
- B01J2219/00572—Chemical means
- B01J2219/00576—Chemical means fluorophore
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00592—Split-and-pool, mix-and-divide processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00596—Solid-phase processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00725—Peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/10—Libraries containing peptides or polypeptides, or derivatives thereof
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
(57)【要約】
本発明は組合せライブラリーの製法および該方法により調製される組合せライブラリーに関する。また、組合せライブラリーより所望の特性を有する化合物またはフローサイトメトリーを用いた一連の組合せライブラリーの同定方法に関する。さらに、蛍光団標識ビーズを用いる組合せライブラリーのコード方法も提供する。
Description
【発明の詳細な説明】
コードされた組合せライブラリー
発明の分野
本発明の分野は、種々の組成を有する数多くの生成物が得られる1つまたはそ
れ以上のコードされた組合せライブラリーの合成に係わる組合せケミストリーに
関する。本発明はまた、組合せライブラリーのコード法に関する。
発明の背景
種々の生物学的反応を効果的に調節できる新たな化学物質の検索を続行するに
あたり、検索を行うための常套手段は、既存の種々の化学物質、例えば天然に存
在する化合物または合成ライブラリーもしくはデータバンクに存する化合物をス
クリーニングすることである。既存の化学物質の生物活性は、スクリーニングさ
れる化学物質の特定の性質を試験するように企画した検定、例えばその物質の特
定のレセプター部位への結合能を試験するレセプター結合検定にその化学物質を
適用することで測定される。
無作為に選択された数多くの化合物を生物活性に関してスクリーニングするた
めの時間および経費を減少させる試みにおいて、リード化合物を発見するための
化合物のライブラリーを得るために数度の開発がなされてきた。分子多様性を化
学的に創製することは、新たなリード構造を検索するうえで主要な手段となって
いる。現在、非常に多くの分子的に多様な化合物を化学的に創製する既知の方法
は、一般に、固相合成法を使用し、特にペプチドおよびペプチドライブラリーを
合成し、同定するものである。例えば、以下の先行文献がある:レブル(Lebl
)ら、Int.J.Pept.Prot.Res.,41,p201(1993)には、ペプチ
ドおよび樹脂間を選択的に切断し得るリンカーを提供することで、樹脂に結合し
たままのペプチドがある状態で可溶性形態のペプチドの特定量を樹脂から遊離さ
せて検定できる方法が開示されており、これは連続的に行うことができる;ラム
(Lam)ら、Nature,354,p82(1991)および(WO 92/00
091)には、ポリスチレンまたはポリアクリルアミド樹脂などの固相支持体に
線状ペプチドを合成させる方法が開示されている;ゲイセン(Geysen)ら、J.
Immunol.Meth.,102,p259(1987)には、ブロック上に、96ウ
ェルマイクロタイタープレートのウェルの配列に対応するように配列した加工ポ
リスチレンピンでのペプチド合成を開示している。Houghtenら、Nature,35
4,p84(1991)およびWO 92/09300では、可溶性ペプチドプ
ールに係わる抗体もしくは受容体結合配列のデノボ研究の方法を開示している。
リード生成に関するこれらのすべての方法に伴う主要な障害は、技術的な考察
は別として、リードの品質である。線状ペプチドは、歴史的に、医薬的な目的の
ためには比較的粗成なリードとして知られている。とりわけ線状ペプチドを非ペ
プチドリードに変換する合理的な方法はない。上記のように、ペプチド受容体に
対する非ペプチドリードを決定するためには、化合物を膨大なデータバンクのス
クリーニングに付し、各化合物を個々に試験しなければならない。
広範な有機反応は、樹脂上に固定化した基質上で行うことができるということ
が知られている。これらの反応は、当業者に周知であるペプチド合成反応に加え
て、ベンジル化ハロゲン化物の求核置換、ハロゲン化、ニトロ化、スルホン化、
酸化、加水分解、酸塩化物形成、フリーデル-クラフツ反応、水素化リチウムア
ルミニウムによる還元、金属化、および有機金属化ポリマーと広範な試薬との反
応を包含する。例えば以下の先行文献がある:N.K.Mathurら、Polymers as
Aids in Organic Chemistry,Academic Press,New York,p.18(1
980)。加えて、Farrallら、J.Org.Chem.,41,p.3877(197
6)では、樹脂を用いて行ったこれらの反応のいくつかについて実験の詳細を記
載している。
非ペプチド有機化合物、例えばペプチド疑似物質は、ある種の酵素受容体に対
する親和性においてペプチドリガンドに優ることが多い。高い親和性を有する生
物学的リガンドおよび究極的に新規で重要な医薬品を迅速に同定するための効果
的な方法では、生物学的なアクセプター(例えば受容体または酵素)との間で1
またはそれ以上の形態の相互作用、例えば水素結合、塩架橋、π錯形成反応、疎
水効果等を確立することができる種々の構造単位を含有する非ペプチド構造の多
様なライブラリーを迅速に構築し、スクリーニングすることが必要とされる。し
かしながら、非ペプチド分子を含有する合成試験化合物のライブラリーの生成お
よびスクリーニングに関する研究は、現在、初期の段階にある。この分野に由来
する一例としては、EllmanおよびBuninの、固相支持体でのベンゾジアゼピン
類の組合せ合成に関する研究(J.Am.Chem.Soc.,114,10997,(1
992);Chemical and Engineering News,1993年1月18日,p.3
3参照)がある。
非ペプチドライブラリーの生成および使用の分野における未解決の問題の鍵は
、有望な生物学的活性を示すライブラリーから選択される分子構造の解明である
。
ペプチドライブラリーを用いて直列に合成した唯一のヌクレオチド配列コード
を用い、ライブラリーから選択されるペプチドの構造を明らかにする試みが、B
rennerおよびLerner(S.BrennerおよびR.A.Lerner、Proc.Nat'l.Acad.
Sci.USA,1992 89,5381−5383)により報告されている。各
ペプチドに付着するコードのヌクレオチド配列はポリメラーゼ連鎖反応(PCR
)を介して増幅可能でなければならない。しかしながら、ヌクレオチド合成技術
は、多くの型の分子ライブラリーの合成に必要な合成技術のすべてと合致するも
のではない。さらに、ヌクレオチドとライブラリー中の合成試験化合物を非常に
接近させると、生物検定の間にこれらの分子間で酵素の標的受容体とリガンドと
の結合を妨害する相互作用が生じることがあり、このこともこの方法を限定的な
ものとしている。ライブラリーのヌクレオチド成分は、生物検定の間、種々の他
の方法に干渉することもある。
Kerrら(J.Am.Chem.Soc.,1993,115,2520−2531)は
、ペプチドコード鎖と同時に非天然アミノ酸残基を含有するペプチドの液相ライ
ブラリーを合成することにについて報告した。このライブラリーにおけるペプチ
ドリガンドとそのコード鎖は互いに共有結合しており、合成試験化合物および対
応するコードの対を単離および配列決定することができる。しかしながら、上記
のBrennerおよびLernerに説明されている核酸コード化ライブラリーについて
い
えば、コード化ペプチドがスクリーニング検定を妨害することがある。
PCT/US93/09345は、所定の二コード系において、多数のタグ(
tag)を結合させることによって組合せライブラリーの活性部分を同定する方
法について記載している。
PCT/HU93/0030は、ペプチド合成にて用いるための蛍光標識化サ
ブライブラリーペプチドキットを記載している。
PCT/US94/06078は、多重配列を用いる組合せライブラリーのコ
ード方法について記載している。
公知方法による多くの欠点およびそれらにより未解決の多くの要求が本発明に
より処理され、以下にさらに詳しく説明するように、本発明は既知の方法に比べ
多くの利点を提供するものである。
発明の要約
本発明は、1またはそれ以上のコードされた組合せライブラリーを特定の一連
の反応シーケンスより調製し、その化合物を生物活性について試験することから
なる、所望の特性を有する化合物の同定方法およびリード構造に不可欠な部分の
同定方法に関与する。
本発明はまた、一連の組合せライブラリーの各組合せライブラリーにおける単
一のレジストリーのコード方法および単一のコードされたレジストリーを有する
組合せライブラリーにも関する。
本発明はさらに、タグを付したビーズを利用することからなる、組合せライブ
ラリーのコード方法に関する。
本発明はまた、組合せライブラリーの各々の選択肢のコード方法およびそれに
よりコードされた組合せライブラリーに関する。
本発明はまた、それに結合した蛍光標識化アイデンティファイアーを有するビ
ーズに関する。
発明の詳細な記載
本明細書で用いる「ビーズ」なる用語は、組合せ合成についての基材を提供す
ることができ、フローサイトメトリーによる処理能を有するいずれの固相支持物
質をも意味し、例えば1〜2%架橋ポリスチレン、ポリアクリルアミド、ポリエ
チレングリコールポリスチレン共重合体、好ましくはテンタゲル(Tentagel)1
0〜100ミクロン粒子、最も好ましくはテンタゲル10〜30ミクロン粒子で
ある。
本明細書で用いる「分類する」なる用語は、ビーズをフローサイトメトリーで
共通のタグを付した状態を有する群を形成させることを意味する。
本明細書で用いる「分離」または「分裂」なる用語は、コード化したビーズま
たは組合せライブラリーのビーズについて言及する場合、ビーズの混合物を群に
分割し、それにより各群が混合物を、好ましくは全構成要素を統計的に平均に含
有することを意味する。
本明細書で用いる「タグ」なる用語は、特記しない場合、フローサイトメトリ
ーにより分類可能な、1つのビーズまたはビーズ群のコード化特性、例えば大き
さの差異、材料組成物の差異、フロー特性の差異、単一の蛍光マーカー、好まし
くは蛍光標識アイデンティファイアーを意味する。
本明細書で用いる「蛍光標識アイデンティファイアー」または「アイデンティ
ファイアー」なる用語は、蛍光団および非蛍光団の添加比率によるか、または多
数、好ましくは2つの、異なる蛍光団を種々の比率で添加することにより、1つ
のビーズまたはビーズ群に付着した解読標識を意味する。
本明細書で用いる「強度分別した」なる用語は、蛍光団および非蛍光団を種々
の比率で1つのビーズまたはビーズ群に添加した(本明細書で用いる)アイデン
ティファイアーを意味する。
本明細書で用いる「選択肢」なる用語は、(ペプチド化学に限定しない)組合
せ合成における規定の段階の択一的な変更、例えば反応物、試薬、反応条件、お
よびそれらの組み合わせを意味する。「段階」なる用語が化合物またはリガンド
の連続合成における一工程に対応する場合、化合物またはリガンドは組合せ合成
の最終産生物である。本明細書で用いる「レジストリー」なる用語は、上記で示
す「段階」なる用語と同じ意味である。
本発明の好ましい態様において、一連の組合せライブラリーを調製し、各個々
のライブラリーを実質的に同一の特定の組の反応シーケンスから調製し、そこで
は各組合せライブラリー内で単一のレジストリーをコードし、均質なレジストリ
ーを有する化合物の混合物に応じて分析する。好ましくは、いずれかのライブラ
リーの特定のコードされたレジストリーは、他のライブラリーと異なり、調製さ
れたライブラリーの数は単一のライブラリーのレジストリーの数に等しいであろ
う。
第1のライブラリー調製についての合成を実施するにあたり、まず始めに多く
のビーズ、通常少なくとも103個、さらに通常少なくとも104個、および望ま
しくは少なくとも105個、一般的に少なくとも1015個を超過しないで、さら
に通常少なくとも1010個を超過しないビーズで開始し、ビーズを群に分離し、
ビーズを各群内で同様にタグを付し、各群を、好ましくはアイデンティファイア
ーにより単一的にタグを付すか、または一群はタグを付さず、残りの各群は、好
ましくはアイデンティファイアーにより単一的にタグを付す。速やかに同定可能
なビーズ群の数は、最初のレジストリーにおける選択肢数に対応するであろうし
、各群の全体を別の容器に入れる。マイクロタイターウェルプレート、フラスコ
、メリーフィールド合成器等を用いることができる。ビーズは通常、少なくとも
各々1ビーズ、通常は多くのビーズ、一般的には1000またはそれ以上のビー
ズの群に分割し、ライブラリーに関与するレジストリーの全数に依存して105
またはそれ以上にすることができる。
次に適当な試薬を個々の容器の各々に加えて、段階(または本明細書において
用いる「レジストリー」)においてこれらを加工する。一度反応(複数の反応)
が完了すると、ビーズを洗浄して試薬を除去し、次に全ビーズを単一の混合物に
まとめ、次いでビーズを次のレジストリーのための選択肢数に応じて分離する。
ビーズの分割過程に続くのは(レジストリー形成のための)合成段階であり、次
いで再度まとめたビーズを、第1の組合せライブラリーが完了するまで繰り返し
行う。
ある例では、同じ反応を2またはそれ以上の容器で行い、その他の選択肢に比
較して特定のレジストリーにおける特定の反応性を有する産生物の比率を増強す
ることができる。別の例では、1またはそれ以上のレジストリーに、別に取って
おき反応に寄与しなかったビーズの一部を関与させることができ、最終産生物に
関連する可変性を増強できる。別の態様では、一定量を異なる合成経路に供する
ことができる。
このように調製したライブラリーは、第1のレジストリーのみの反応シーケン
スを同定するタグを付したビーズを含有する。
第1のレジストリーのみの反応シーケンスを同定するタグを付したビーズを含
有する組合せライブラリーは、以下のスキーム1の概要に従って調製できる。
1) 合して分離する。
2) FMOCを脱保護する;FMOC−NHCHRB1-BNCO2Hを連結する
。
3) ライブラリー合成を完了するまで、FMOC−NHCHRB1-BNCO2H
をFMOC−NHCHRC1-CNCO2H,...FMOC−NHCHRX1-XNCO2
Hと置き換える以外は工程1および2を繰り返す。
4) フローサイトメトリーによりビーズを分類する。
5a) 分類したビーズの化合物を切断するか、または
5b) 好ましくはバイオパニングまたはフローサイトメトリーにより、直接的
にビーズに結合した化合物を試験する。
スキーム1は、第1のレジストリーのみがコード化された組合せライブラリー
の調製の概要を示す。スキーム1で示すように結合した蛍光標識化アイデンティ
ファイアーを有するビーズは、試験する化合物の切断を可能にするリンカーで誘
導させる。その後、同様にタグを付したビーズの各群を別の容器に入れ、規定の
反応条件(または本明細書で用いる可変ビルディングブロック)に供して第1の
レジストリーを形成する。一度反応を完了すると、ビーズを単一の混合物に合し
、第2のレジストリーの選択肢数に応じて分離し反応させる。ビーズを分割し、
次いで規定の反応条件に供し、次いでビーズを再び合するこの方法は、最初のラ
イブラリーを完了するまで繰り返し行う。完全なライブラリーは、次に生物活性
を試験する。均質な最初のレジストリーを有する化合物の混合物の相対活性に関
する情報は、このライブラリーから得られる。
第2のライブラリーの調製についての合成を行う場合、第1のライブラリーで
用いたのと同数のビーズで開始するのが好ましく、上記ビーズは第1のライブラ
リーと同様の方法でタグを付すことができる。第2のライブラリーで使用するビ
ーズは、最初単一の混合物に合し、次いで第1のレジストリーの選択肢数に応じ
て分離する。第2のライブラリーおよびその後のすべてのライブラリーの各レジ
ストリーのための合成図式の選択肢は、最初のライブラリーにおける対応するレ
ジストリーの合成図式/選択肢と、実質的に同一である。一旦、第2のライブラ
リーの最初のレジストリーの反応(複数)が完了すると、ビーズを洗浄して試薬
を除去し、続いて全ビーズを単一の混合物に合し、次に同様にタグを付したビー
ズに応じて混合物を群に分類できる。このビーズを合したものは、フローサイト
メトリーを用いて分類するのが好ましい。一旦、第1のレジストリーからのビー
ズを分類し、同様にタグを付した標識化した各群のビーズを別の容器に入れ、第
1のライブラリーの第2のレジストリーで用いたのと同一の合成スキーム(複数
)/選択肢(複数)に供する。一度、反応(複数)が完了すると、ビーズを洗浄
して試薬を除去することが望ましく、続いて全ビーズを単一の混合物に合し、次
いでビーズを第1のライブラリーの第3のレジストリーにおける選択数に応じて
分離できる。このビーズの分割工程に続いて、第1のライブラリーの対応するレ
ジストリーの合成スキーム(複数)/選択肢(複数)に供し、次いでビーズを再
度合し、これを第2のライブラリーが完了するまで行う。
このように調製したライブラリーは、第2のレジストリーのみの反応シーケン
スを同定するタグを付したビーズを含有する。
第2のレジストリーのみの反応シーケンスを同定する、タグを付したビーズを
含有する組合せライブラリーは、以下のスキーム2の概要に従って調製できる。
1) 合して分離する。
2) FMOC−NHCHRA1-ANCO2Hを連結する。
3) フローサイトメトリーにより、合して分類する。
4) FMOCを脱保護する;FMOC−NHCHRB1-BNCO2Hを連結する。
5) 合して分離する。
6) FMOC−NHCHRB1-BNCO2HをFMOC−NHCHRC1-CNCO2H
,....FMOC−NHCHRX1-XNCO2Hで置き換える以外は、合成を完了
するまで工程4および5を繰り返す。
7) フローサイトメトリーにより、合して分類する。
8a) 分類したビーズの化合物を切断するかまたは、
8b) ビーズに直接結合した化合物を、好ましくはバイオパニングまたはフロ
ーサイトメトリーにより試験する。
スキーム2は第2のレジストリーのみがコードされた組合せライブラリーの調
製の概要を示す。スキーム2で用いられる蛍光標識化アイデンティファイアーを
結合したビーズは最初単一の混合物に合し、次いで第1のライブラリーの第1の
レジストリーの選択肢数に応じて群に分離する。続いて各群を別の容器に入れ、
第1のライブラリーの第1のレジストリーと同一の反応条件に供し、第2のライ
ブラリーの第1のレジストリーを形成する。一旦、反応(複数)が完了すると、
ビーズを単一の混合物に合し、次いで同様にタグを付したビーズに応じて群に分
類する。このビーズを合したものはフローサイトメトリーを用いて分類するのが
好ましい。同様にタグを付したビーズの各群は別の容器に入れ、第1のライブラ
リーの第2のレジストリーと同一の反応条件に供し、第2のライブラリーの第2
のレジストリーを形成する。一旦、反応が完了すると、ビーズを単一の混合物に
合し、次いで第1のライブラリーの第3のレジストリーの選択肢数に応じて分離
し、適宜反応させる。ビーズを分割し続いて第1のライブラリーの対応するレジ
ストリーの規定の反応条件に供し、再度合するこの方法は、第2のライブラリー
が完了するまで繰り返し行う。ついで、完了したライブラリーを生物活性につい
て試験する。均質な第2のレジストリーを有する化合物の混合物の相対活性に関
する情報は、このライブラリーから得られる。
各ライブラリーにおける種々の合成段階の前に分類操作を実施するという条件
で、(所望であれば)上記工程を繰り返し、その後のライブラリーを調製する。
このように調製した組合せライブラリーは単一のレジストリーのみの反応シーケ
ンスを同定するタグを付したビーズを含有する。さらに、各組合せライブラリー
における同定可能なコード化レジストリーは異なる。
後の組合せライブラリー
X番目のレジストリーがコード化された組合せライブラリーの調製は、「好ま
しくはフローサイトメトリーによる、結集および分類」の段階をX番目の可変ビ
ルディングブロックの組み込みの直前に行うこと以外はスキーム2に記載した方
法と同一の方法で行う。次に完全なライブラリーの生物活性を試験する。均質な
X番目の可変レジストリーを有する化合物の混合物相対活性に関する情報は、こ
のライブラリーから得られる。
合成を完了した後、各ライブラリーを別個に生物活性について試験する。
本明細書で用いる「生物活性を試験する」または「望ましい特性を試験する」
なる用語は、以下に示す方法を含む医薬的な活性を試験するいずれの形態も含む
。ライブラリーの化合物は、例えば可溶性受容体検定を用いてバイオパニングに
より、ビーズ上で試験でき、活性はフローサイトメトリーにより分析するのが好
ましい。別法として、ライブラリーの内容物をフローサイトメトリーにより分類
し、化合物をビーズ上で試験するか、または分類した化合物を試験の前にビーズ
から切断してもよい。
すべての情報を組み合わせた時点で、どの可変ビルディングブロック(複数)
が活性に重要であり、どれが重要でないかを示す各組合せライブラリーの母集団
分析が得られる。この種の分析は、活性または不活性の分析によりリード化合物
の不可欠部分を同定する構造活性相関(Structure Activity Relationship:
SAR)の研究と同等である。この分析により、特定のリード構造が得られ、(
ペプチド組合せライブラリーの位置的な検査におけるように)さらに多数のリー
ド構造が潜在的に得られ、さらなる最適化のための最初の方向づけが即座に示唆
される。
上記のスキームのように調製した3レジストリー−3組合せライブラリーの分
析を、以下の表1に概要を示す。
第1の組合せライブラリーの分析により、可変ビルディングブロックAのSA
Rが形成される。第2の組合せライブラリーの分析により、可変ビルディングブ
ロックBのSARが形成される。第3の組合せライブラリーの分析により、可変
ビルディングブロックCのSARが形成される。3個の可変ビルディングブロッ
ク(A、BおよびC)のSARの分析は所望の反応シーケンスを同定し、多数の
リード構造を示唆する。
本発明のさらなる態様において、蛍光標識化アイデンティファイアーを用いる
コード化/タグ化組合せライブラリーの好ましい方法を提供する。本明細書で用
いる「蛍光標識化アイデンティファイアー」なる用語は、蛍光団標識化ビーズに
言及する場合、以下のことを意味する:
i) 特定のプールにおけるすべてのビーズは同一の蛍光強度を有し、異な
るプールでは少なくとも2、好ましくは3またはそれ以上の因子によりいずれか
他のプールとは異なる強度を有するかまたは、
ii) 特定のプールの全ビーズが、同一の比率で蛍光タグの同一の組み合わ
せを有するように、多数の、好ましくは2個の異なる蛍光タグを種々の比率で用
い、異なるプールでは:
a) 同一の蛍光タグだが、いずれか他のプールとは異なる比率で
b) 異なる蛍光タグの組みを特定の比率で、または
c) a)およびb)の組み合わせ
である。
フローサイトメーターは、2の因子により蛍光強度の異なるビーズを分類でき
ることが知られている。フローサイトメトリーおよびフローサイトメトリーを用
いる一般的な方法の原理は、GroganおよびCollins、Guide to Flow Cyto−
metry Methpds,Marcel Dekker,Inc.出版(1990)に記載されている。
強度分別蛍光団−標識化ビーズは、種々の量の蛍光団および非蛍光団を有する
ビーズのプールを誘導することにより、または単一の反応性蛍光タグの反応時間
を変化させることにより調製できる。加えて、複数、好ましくは2個の蛍光タグ
は、種々の比率でビーズのコード化に用いることができる。これは、例えばタグ
化工程(複数)において最初の蛍光タグ(A)および第2の蛍光タグ(B)の化
学量を、A:B=1:1,1:2,2:1,1:4,4:1など種々に変化させ
ることにより行うのが好ましい。
本明細書で用いる強度分別蛍光標識化ビーズは、以下のスキーム3および実施
例で概要を示す方法により調製できる。
上記スキーム1から3で用いる様に、Rは、蛍光タグT1またはドーピング試
薬Dであり、R'は蛍光タグT2またはドーピングDであり、RがDである場合R
'はDではないと規定する。
スキーム3で用いられる様に、ビーズのサンプル、好ましくはテンタゲル10
〜30ミクロン粒子は、一般的な共役反応により、リンカー、好ましくはε−B
oc−FMOCリジンで誘導させる。別法として、ワング(Wang)リンカーと一
緒に用いられるようなベンジルアルコールリンカー、またはメリーフィールド(
Merrifield)リンカーと一緒に用いられるようなベンジルハロゲン化リンカー
、またはリンク(Rink)リンカーと用いられるようなベンズヒドリルアミンリ
ンカーは、アルコールのアルキル化、フリーデルクラフツ反応によるアルキル化
もしくはアリール化によるエーテル形成することにより、またはパラジウム媒介
交差共役反応による、または標準的なアミド共役反応によるビアリール形成に
より、ビーズに結合できる。スキーム3に用いられるように、単一脱保護工程、
例えば20%ピペリジン/DMFを、FMOCの除去のために実施する。反応時
間を制限することによりタグ化反応を部分的に完了させ、それにより二機能リン
カーの使用を避けることもできる。次にビーズをN個のプールに分割する。プー
ル1は蛍光団例えばピレンブチル酸で誘導させる。プール2は蛍光団、例えばピ
レンブチル酸、および非蛍光団(以下、「ドーピング試薬」という)、例えばブ
チル酸、または異なる蛍光団例えばペリレンブチル酸の1:3混合物で誘導させ
る。プールNは蛍光団例えばピレンブチル酸、およびドーピング試薬、例えばブ
チル酸、または異なる蛍光団、例えばペリレンブチル酸を1:3(n-1)の比率で
誘導させる。
これらビーズのプールの各々は、フローサイトメトリーによりその他のビーズ
のプールと区別できる。各々のビーズのプールはまた、肉眼で検査することによ
り、互いに区別できるが、少しの変異体しかこの方法でコード化できない。さら
に、異なる吸収及び放射波長を有する異なる蛍光団、並びに複数の蛍光団は、蛍
光抑制によりコード化でき、さらなる変異体をコード化する。それの比率がアイ
デンティファイアーとなる複数の蛍光団の使用すると、同数のタグを用いて同定
できる変異体の数を非常に増加させることができ、ビーズの大きさに依存しない
で分析できるなどの種々の利点がある。また、同じ方法を用い、好ましくは少な
くとも50ピコモルのリンカーを有するビーズで開始することにより、蛍光で不
要な分子量を有するライブラリーの構成成分を区別をするために用いることがで
きるビーズを調製することができる。
本発明のとりわけ好ましい態様において、単一の組合せライブラリーは、各選
択肢を、タグ、好ましくは蛍光標識アイデンティファイアーを用いてコード化し
、生物活性を試験し、好ましくは最後のプールを混合することなく調製する。
本発明の特に好ましい態様において、以下のスキーム4に記載する「コンバイ
ンおよびスピリットのプロトコル」を、コード化されたビーズを好ましくはその
ビーズに蛍光標識アイデンティファイアーを結合して合成するのに用いる。「コ
ンバインおよびスピリットのプロトコル」は、1または2個の蛍光タグしか含有
しないライブラリーを再合成または同時合成の必要がないという点で優れている
。この本発明の態様は、コード化されたビーズを、組合せライブラリーを実際に
合成する前に大量に調製できるので、実践という観点からみた場合、特に魅力的
である。
さらに本発明の好ましい態様は、蛍光標識アイデンティファイアーによりコー
ドされたビーズを用いて調製した組合せライブラリーおよびこのような組合せラ
イブラリーにより同定した医薬的に活性な化合物に関する。
さらに本発明の好ましい態様は、各選択肢が蛍光標識アイデンティファイアー
によりコードされた組合せライブラリーおよび、このような組合せライブラリー
により同定した医薬的に活性な化合物に関する。
さらに本発明の好ましい態様は、蛍光標識アイデンティファイアーによりコー
ドされたビーズを用いて調製した組合せライブラリーで、上記ビーズがコンバイ
ンおよびスピリットのプロトコルにより得られたもの、およびこのような組合せ
ライブラリーにより同定した医薬的に活性な化合物に関する。
さらに本発明の好ましい態様は、各選択肢が蛍光標識アイデンティファイアー
によりコードされた組合せライブラリーで、上記ビーズがコンバインおよびスピ
リットのプロトコルにより得られたもの、およびこのような組合せライブラリー
により同定した医薬的に活性な化合物に関する。
本発明に準じて調製した組合せライブラリーの例を、以下のスキーム4に概要
を示す。
スキーム4は各選択肢が唯一のアイデンティファイアーによりコードされる組
合せライブラリーの調製の概要を示す。スキーム4で用いるように、タグを付し
ていないビーズは、(スキーム3で記載するように)第1のアイデンティファイ
アーでコードされる。コードされたビーズを、単一の混合物に合し、次に第2の
アイデンティファイアーの序数に応じて群に分ける。次いでビーズを第2のアイ
デンティファイアーでコードする。(上記のコード化の工程を、望ましいサイズ
のコードされたビーズ群が得られるまで繰り返す。)スキーム4に従って、第2
のアイデンティファイアーでコードされたビーズを、単一の混合物に合し、次に
第3のアイデンティファイアーの序数に応じて群に分ける。次いでビーズを第3
のアイデンティファイアーでコードする。
上記の方法に従って調製したコードされたビーズおよび上記の方法は、本発明
の請求の範囲の好ましい態様を表す。
このように調製したビーズは、第3のアイデンティファイアーに応じて、同様
のアイデンティファイアーの別個の均質なプールに保持し、特定の反応条件の第
1の段階(または本明細書で用いるレジストリー)に供する。第1のレジストリ
ーの選択肢は、第3のアイデンティファイアーによりコードされる。次いでビー
ズを、好ましくはフローサイトメトリーにより、第1のアイデンティファイアー
に従って同様のアイデンティファイアーの均質なプールに合し、分類する。この
ように得られたビーズを別個のプールに保持し、特定の反応条件の第2の段階に
供する。第2のレジストリーの選択肢は第1のアイデンティファイアーによりコ
ードされる。次にビーズを、好ましくはフローサイトメトリーにより、第2のア
イデンティファイアーに従って同様のアイデンティファイアーの均質なプールに
合して分類する。こうして得られたビーズは、別個のプールに保持し、特定の反
応条件の第3の段階に供する。第3のレジストリーの選択肢は、第2のアイデン
ティファイアーによりコードされる。次にビーズを合し、第4の段階の選択肢数
に応じて群に分け、特定の反応条件の第4の段階に供する。このようにして得ら
れたビーズのプールを、これらの別個の群で保持し、生物活性を試験する。第4
のレジストリーの選択肢は別個に保持する。
上記で示すように、これらの群は、各々、好ましくはフローサイトメトリーに
より、または個々の群もしくは個々の群のより小さい集合体から化合物を切断す
ることにより別個に生物活性を試験し、分析する。活性体の正確な反応歴は、各
々、対応するビーズの唯一のアイデンティファイアーを解読することにより同定
できる。上記のスキームでは、活性化合物が2群で見いだされた場合、次に蛍光
検出により個々のビーズを分析できる。もしT3c、T2a、T2bがビーズ上に存在
すれば、活性構造の反応歴は:Y3−Z2−P2−Q2である。
本明細書で用いる「コンバインおよびスピリットのプロトコル」なる用語は、
上記スキーム4の工程で同様に記載している。コンバインおよびスピリットのプ
ロトコルによってコードされたビーズの形成は、スキーム4の工程1〜4に同様
に記載されている。各選択肢がコンバインおよびスピリットのプロトコルにより
コードされる組合せライブラリーの形成は、スキーム4の工程1〜7に同様に記
載されている。
当業者であれば、さらに工夫することなく、前の記載に従って、本発明を最大
限利用するであろう。従って、以下の実施例は、単なる例示として、何ら本発明
の範囲を限定するものではないと解釈すべきである。
実施例1
ドーピング法による蛍光強度差によるフローサイトメトリーにより分類できる
蛍光標識化ビーズの調製。方法A
:
二機能リンカー、例えばe−Boc−FMOC−L−リジン(8.4g、6当
量、18ミリモル、ノヴァバイオケム)、アミド共役試薬、例えばジイソプロピ
ルカルボジイミド(2.3g、2.8ml、6当量、18ミリモル、アルドリッヒ
)を交差連結ポリスチレンビーズに連結したポリエチレングリコール(テンタゲ
ルMNH2、粒径10ミクロン、15.0g、3ミリモル、ラップポリメーア)に
加え、適当な溶媒、例えばN−メチルピロリジン(300ml)に懸濁し、一晩
撹拌する。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×100m
l)で洗浄する。
次にビーズを25%ピペリジン/DMF(300ml)と15分間撹拌する。
反応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×100ml)次いで
CH2Cl2(5×100ml)で洗浄し、次いで風乾する。方法B
:
方法Aで記載するように、リジン誘導ビーズ(5.0g)をN−メチルピロリ
ジン(100ml)に懸濁し、次いで蛍光団例えば1−ピレンブチル酸(1.7
g、6当量、6ミリモル、アルドリッヒ)およびジイソプロピルカルボジイミド
(0.76g、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反
応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いで
CH2Cl2(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニ
ンヒドリン試験により反応が完了するまで繰り返す。
次にビーズを25%TFA/CH2Cl2(100ml)中2時間撹拌し、Boc
保護基を除去する。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×
30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。
次にビーズをリンカー群、例えば4−(メチルヒドロキシフェニル)酢酸のt
−ブチルジメチルシリルエーテル(1.3g、6ミリモル)、ジイソプロピルカ
ルボジイミド(0.76g、0.94ml,6ミリモル)と、N−メチルピロリジ
ン(100ml)中一晩反応させる。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過
し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×100ml)で洗浄し、
次いで風乾する。
次にビーズをTHF(100ml)に再懸濁し、脱シリル化試薬、例えばフッ
化テトラブチルアンモニウム(6ml、1.0M溶液、6ミリモル、アルドリッ
ヒ)/酢酸アンモニウム(0.92g、12ミリモル)を用いてシリルエーテル
を脱保護し、望ましいベンジルアルコール誘導体を生成する。反応物をガラスフ
リットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×
30ml)で洗浄し、次いで風乾する。方法C
:
方法Bで調製したビーズ(5g)を、次にN−メチルピロリジン(100ml
)に懸濁し、次いで単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、
6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.9
4ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリッ
トを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30
ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により
反応が完了するまで繰り返す。方法D
:
方法Aで記載するようにリジン誘導のビーズ(5.0g)を、N−メチルピロ
リジン(100ml)に懸濁し、次に蛍光団例えば1−ピレンブチル酸(0.4
3g、1.5当量、1.5ミリモル)およびドーピング試薬、例えばブチル酸(0
.4g、0.41ml、4.5当量、4.5ミリモル)を化学量的に1:3、並びに
ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94ml、6ミリモル)を加え
、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DM
F(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾
する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応が完了するまで繰り返す
。
次にビーズを25%TFA/CH2Cl2(100ml)中で2時間撹拌し、B
oc保護基を除去する。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(
5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する
。
次にビーズをリンカー群、例えば4−(メチルヒドロキシフェニル)酢酸のt
−ブチルジメチルシリルエーテル(1.3g、6ミリモル)、ジイソプロピルカ
ルボジイミド(0.76g、0.94ml,6ミリモル)と、N−メチルピロリ
ジン(100ml)中一晩反応させる。反応物をガラスフリットを通して吸引濾
過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×100ml)で洗浄し
、次いで風乾する。
次にビーズをTHF(100ml)に再懸濁し、脱シリル化試薬、例えばフッ
化テトラブチルアンモニウム(6ml、1.0M溶液、6ミリモル、アルドリッ
ヒ)/酢酸アンモニウム(0.92g、12ミリモル)を用いてシリルエーテル
を脱保護し、望ましいベンジルアルコール誘導体を生成する。反応物をガラスフ
リットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×
30ml)で洗浄し、次いで風乾する。方法E
:
方法Dで調製したビーズ(5g)を、次にN−メチルピロリジン(100ml
)に懸濁し、次いで単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量
、
6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.9
4ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリッ
トを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30
ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により
反応が完了するまで繰り返す。方法F
:
方法Aで記載するようにリジン誘導のビーズ(5.0g)を、N−メチルピロ
リジン(100ml)に懸濁し、次に蛍光団、例えば1−ピレンブチル酸(0.
173g、0.6当量、0.6ミリモル)およびドーピング試薬、例えばブチル酸
(0.48g、0.49ml、5.4当量、5.4ミリモル)を化学量的に1:9、
並びにジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94ml、6ミリモル)
を加え、次に反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを通して吸引濾
過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml)で洗浄し、
次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応が完了するま
で繰り返す。
次にビーズを25%TFA/CH2Cl2(100ml)中で2時間撹拌し、B
oc保護基を除去する。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(
5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する
。
次にビーズをリンカー群、例えば4−(メチルヒドロキシフェニル)酢酸のt
−ブチルジメチルシリルエーテル(1.3g、6ミリモル)、ジイソプロピルカ
ルボジイミド(0.76g、0.94ml,6ミリモル)と、N−メチルピロリジ
ン(100ml)中一晩反応させる。反応物をガラスフリットを通して吸引濾過
し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×100ml)で洗浄し、
次いで風乾する。
次にビーズをTHF(100ml)に再懸濁し、脱シリル化試薬、例えばフッ
化テトラブチルアンモニウム(6ml、1.0M溶液、6ミリモル、アルドリッ
ヒ)/酢酸アンモニウム(0.92g、12ミリモル)を用いてシリルエーテル
を脱保護し、望ましいベンジルアルコール誘導体を生成する。反応物をガラスフ
リットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×
30ml)で洗浄し、次いで風乾する。方法G
:
方法Fで調製したビーズ(5g)を、次にN−メチルピロリジン(100ml
)に懸濁し、次いで単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g
、6当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.7
6g、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物を
ガラスフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2C
l2(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒド
リン試験により反応が完了するまで繰り返す。方法H
:
ついで、方法C、EおよびGから得られたビーズを合し、三等分する。
プールH1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールH2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールH3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
スフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(
5×30ml)で洗浄し、次いで空気乾燥する。この方法をカイザーニンヒドリ
ン試験により反応が完了するまで繰り返す。方法I
:
次に方法Hで得られたビーズを合し、三等分する。
プールI1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールI2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールI3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
スフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(
5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試
験により反応が完了するまで繰り返す。方法J
:
方法Iで得られたビーズを合し、フローサイトメトリーにより蛍光強度の差で
区別した異なるサブライブラリーに分類する。サブライブラリーの構成物は、ト
リペプチドの最初のアミノ酸が同一である。
サブライブラリーJ1は、Gly−X−X、またはGly−Gly−Gly、
Gly−Gly−Ala、Gly−Gly−Phe、Gly−Ala−Gly、
Gly−Ala−Ala、Gly−Ala−Phe、Gly−Phe−Gly、
Gly−Phe−Ala、Gly−Phe−Pheからなる。
サブライブラリーJ2は、Ala−X−X、またはAla−Gly−Gly、
Ala−Gly−Ala、Ala−Gly−Phe、Ala−Ala−Gly、
Ala−Ala−Ala、Ala−Ala−Phe、Ala−Phe−Gly、
Ala−Phe−Ala、Ala−Phe−Pheからなる。
サブライブラリーJ3は、Phe−X−X、またはPhe−Gly−Gly、
Phe−Gly−Ala、Phe−Gly−Phe、Phe−Ala−Gly、
Phe−Ala−Ala、Phe−Ala−Phe、Phe−Phe−Gly、
Phe−Phe−Ala、Phe−Phe−Pheからなる。方法K
:
次に方法B、DおよびFで得られたビーズを合し、三等分する。
プールK1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールK2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールK3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
スフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(
5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試
験により反応が完了するまで繰り返す。方法L
:
次に方法Kで得られたビーズを合し、フローサイトメトリーにより蛍光強度で
区別した異なるプールに分類する。
プールL1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールL2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールL3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
ス
フリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5
×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験
により反応が完了するまで繰り返す。方法M
:
次に方法Lで得られたビーズを合し、三等分する。
プールM1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールM2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールM3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
スフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(
5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試
験により反応が完了するまで繰り返す。方法N
:
次に方法Mで得られたビーズを合し、フローサイトメトリーにより蛍光強度の
差で区別した、異なるサブライブラリーに分類する。サブライブラリーの構成物
は、トリペプチドの2番目のアミノ酸が同一である。
サブライブラリーN1は、X−Gly−X、またはGly−Gly−Gly、
Gly−Gly−Ala、Gly−Gly−Phe、Ala−Gly−Gly、
Ala−Gly−Ala、Ala−Gly−Phe、Phe−Gly−Gly、
Phe−Gly−Ala、Phe−Gly−Pheからなる。
サブライブラリーN2は、X−Ala−X、またはGly−Ala−Gly、
Gly−Ala−Ala、Gly−Ala−Phe、Ala−Ala−Gly、
Ala−Ala−Ala、Ala−Ala−Phe、Phe−Ala−Gly、
Phe−Ala−Ala、Phe−Ala−Pheからなる。
サブライブラリーN3は、X−Phe−X、またはGly−Phe−Gly、
Gly−Phe−Ala、Gly−Phe−Phe、Ala−Phe−Gly、
Ala−Phe−Ala、Ala−Ala−Phe、Phe−Phe−Gly、
Phe−Phe−Ala、Phe−Phe−Pheからなる。方法O
:
方法Kで記載するように、ビーズ(5.0g)を合し、3等分する。
プールO1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールO2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールO3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物を減圧
下ガラスフリットを通して濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2
(5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン
試験により完了するまで繰り返す。方法P
:
次に方法Oで得られたビーズを合し、三等分する。
プールP1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールP2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールP3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
スフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(
5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試
験により反応が完了するまで繰り返す。方法Q
:
次に方法Pで得られたビーズを合し、フローサイトメトリーにより蛍光強度で
区別した異なるプールに分類する。
プールQ1を単量体、例えばFMOC−L−グリン(1.8g、6当量、6ミ
リモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94m
l、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリットを
通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30ml
)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反応
が完了するまで繰り返す。
プールQ2を単量体、例えばFMOC−L−アラニン(1.9g、6当量、6
ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g、0.94
ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラスフリット
を通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(5×30m
l)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試験により反
応が完了するまで繰り返す。
プールQ3を単量体、例えばFMOC−L−フェニルアラニン(2.3g、6
当量、6ミリモル)と反応させる。ジイソプロピルカルボジイミド(0.76g
、0.94ml、6ミリモル)を加え、反応物を3時間撹拌する。反応物をガラ
スフリットを通して吸引濾過し、DMF(5×30ml)、次いでCH2Cl2(
5×30ml)で洗浄し、次いで風乾する。この方法をカイザーニンヒドリン試
験により反応が完了するまで繰り返す。
方法Qで得られたビーズのプールはすでに各構成物のトリペプチドの3番目の
アミノ酸が同一であるサブライブラリーに分類されている。
サブライブラリーQ1は、X−X−Gly、またはGly−Gly−Gly、
Gly−Ala−Gly、Gly−Phe−Gly、Ala−Gly−Gly、
Ala−Ala−Gly、Ala−Phe−Gly、Phe−Gly−Gly、
Phe−Ala−Gly、Phe−Phe−Glyからなる。
サブライブラリーQ2は、X−X−Ala、またはGly−Gly−Ala、
Gly−Ala−Ala、Gly−Phe−Ala、Ala−Gly−Ala、
Ala−Ala−Ala、Ala−Phe−Ala、Phe−Gly−Ala、
Phe−Ala−Ala、Phe−Phe−Alaからなる。
サブライブラリーQ3は、X−X−Phe、またはGly−Gly−Phe、
Gly−Ala−Phe、Gly−Phe−Phe、Ala−Gly−Phe、
Ala−Ala−Phe、Ala−Phe−Phe、Phe−Gly−Phe、
Phe−Ala−Phe、Phe−Phe−Pheからなる。方法R
:
各サブライブラリーJ1、J2、J3、N1、N2、N3、Q1、Q2および
Q3は水酸化物もしくは強酸、例えばHFで化合物をビーズから切断して生物活
性を試験するかまたは、バイオパニングもしくはフローサイトメトリーにより化
合物をビーズ上で試験する。この試験の結果から、特定のレジストリーまたは位
置における好ましい単量体の集団分析ができる。
実施例2
異なる波長で最大放射する蛍光団で標識化する方法による、蛍光強度差で、フ
ローサイトメトリーにより、分類可能な蛍光団標識化ビーズの調製。方法;
ドーピング試薬を2番目の蛍光団、例えばペリレンブチル酸で置き換える以外
は、実施例1の方法を用いる。
本発明の好ましい具体例は前記により説明されるが、本発明はここに開示の説
明そのものに限定されるものではなく、後記する請求の範囲の範疇にあるすべて
の修飾する権利を保有していると理解すべきである。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(31)優先権主張番号 08/382,542
(32)優先日 1995年2月1日
(33)優先権主張国 米国(US)
(31)優先権主張番号 08/410,436
(32)優先日 1995年3月23日
(33)優先権主張国 米国(US)
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M
C,NL,PT,SE),JP,US
(72)発明者 ウェインストック,ジョゼフ
アメリカ合衆国19460ペンシルベニア州
フェニックスビル、ポットハウス・ロード
1234番
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.一連の組合せライブラリーをコードする方法であって、 a)特定の一連の反応シーケンスをタグを付したビーズに対して行うことで第 1の組合せライブラリーを調製し、それにより第1のレジストリーの各選択肢を コードし; b)第1のライブラリーと実質的に同じ特定の一連の反応シーケンスより第2 の組合せライブラリーを調製し、ここにタグを付したビーズを第1の反応シーケ ンスの前に合して分離し、該ビーズを第2の反応シーケンスの前に分類し、それ により第2のレジストリーの各選択肢をコードし;および c)分類工程を後の各ライブラリーにおける異なるレジストリーの前に行う以 外、b)の操作に従って後のライブラリーを調製する; ただし、組合せライブラリーシリーズにおけるライブラリーの数はレジストリ ーの数に等しい ことからなることを特徴とする方法。 2. a)個々のライブラリーを実質的に同一の特定の一連の反応シーケンスより調 製し、 b)ライブラリーの数が単一のライブラリーにおけるレジストリーの数に等し く、および c)異なるレジストリーが各ライブラリーにおいてコードされる ことを特徴とする一連の組合せライブラリー。 3.コードされたレジストリーが、蛍光的にタグが付されている請求項2記載 の一連の組合せライブラリー。 4.コードされたレジストリーを蛍光標識アイデンティファイアーでコードす る請求項3記載の一連の組合せライブラリー。 5.請求項4に記載の個々の組合せライブラリー。 6.所望の特性を有する化合物の同定方法であって、 a)請求項1に記載の一連の組合せライブラリーを調製し、 b)各ライブラリーを、所望の特性を有する化合物を同定する検定にて試験し 、および c)各ライブラリーをフローサイトメトリーに付し、それにより公知の反応歴 を受けたことのあるビーズの群を得る ことを特徴とする方法。 7.蛍光標識アイデンティファイアーでコードされたビーズ。 8.コンバインおよびスピリットのプロトコルにより調製された請求項7記載 のビーズ。 9.各選択肢を蛍光標識アイデンティファイアーによりコードした組合せライ ブラリー 10.コンバインおよびスピリットのプロトコルにより調製された請求項9記載 の組合せライブラリー。 11.請求項10に記載の組合せライブラリーにより同定される医薬上活性な化 合物。 12.特定の一連の反応シーケンスに付す前に、タグを付した固相支持体ビーズ をフローサイトメトリーにより分類することからなる組合せライブラリーの製法 。 13.請求項12に記載の方法により調製される組合せライブラリー。
Applications Claiming Priority (9)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US24779394A | 1994-05-23 | 1994-05-23 | |
| US08/247,793 | 1994-05-23 | ||
| US26733394A | 1994-06-28 | 1994-06-28 | |
| US08/267,333 | 1994-06-28 | ||
| US38254295A | 1995-02-01 | 1995-02-01 | |
| US08/382,542 | 1995-02-01 | ||
| US41043695A | 1995-03-23 | 1995-03-23 | |
| US08/410,436 | 1995-03-23 | ||
| PCT/US1995/006392 WO1995032425A1 (en) | 1994-05-23 | 1995-05-23 | Encoded combinatorial libraries |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH10500951A true JPH10500951A (ja) | 1998-01-27 |
Family
ID=27500266
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP7530459A Pending JPH10500951A (ja) | 1994-05-23 | 1995-05-23 | コードされた組合せライブラリー |
Country Status (3)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0763202A4 (ja) |
| JP (1) | JPH10500951A (ja) |
| WO (1) | WO1995032425A1 (ja) |
Cited By (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6054047A (en) * | 1998-03-27 | 2000-04-25 | Synsorb Biotech, Inc. | Apparatus for screening compound libraries |
| WO2001059454A1 (en) * | 2000-02-07 | 2001-08-16 | Kyowa Medex Co., Ltd. | Method for detecting substance |
| JP2002542463A (ja) * | 1999-04-15 | 2002-12-10 | バーチャル・アレイズ・インコーポレーテッド | コード位置に指標を有するコンビナトリアルケミカルライブラリー |
| US6607921B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-08-19 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6613575B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-09-02 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6627453B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-09-30 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
Families Citing this family (40)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7034110B2 (en) | 1994-01-05 | 2006-04-25 | Arqule, Inc. | Method of identifying chemical compounds having selected properties for a particular application |
| US5712171A (en) | 1995-01-20 | 1998-01-27 | Arqule, Inc. | Method of generating a plurality of chemical compounds in a spatially arranged array |
| US5866341A (en) * | 1996-04-03 | 1999-02-02 | Chugai Pharmaceutical Co., Ltd. | Compositions and methods for screening drug libraries |
| US6096496A (en) * | 1997-06-19 | 2000-08-01 | Frankel; Robert D. | Supports incorporating vertical cavity emitting lasers and tracking apparatus for use in combinatorial synthesis |
| CA2298629A1 (en) * | 1997-08-01 | 1999-02-11 | Novalon Pharmaceutical Corporation | Method of identifying and developing drug leads |
| EP1036332B1 (en) * | 1997-12-04 | 2005-07-13 | Amersham Biosciences UK Limited | Multiple assay method |
| US6455263B2 (en) * | 1998-03-24 | 2002-09-24 | Rigel Pharmaceuticals, Inc. | Small molecule library screening using FACS |
| DK1105360T3 (da) | 1998-08-17 | 2009-11-02 | Bristol Myers Squibb Co | Identifikation af forbindelse-protein-interaktioner ved anvendelse af biblioteker af protein-nukleinsyrefusionsmolekyler |
| US6642062B2 (en) * | 1998-09-03 | 2003-11-04 | Trellis Bioinformatics, Inc. | Multihued labels |
| AUPP737298A0 (en) * | 1998-11-30 | 1998-12-24 | University Of Queensland, The | Combinatorial libraries |
| WO2000061281A1 (en) * | 1999-04-09 | 2000-10-19 | Glaxo Group Limited | Encoding scheme for solid phase chemical libraries |
| EP1250463B1 (en) | 2000-01-24 | 2006-04-05 | Compound Therapeutics, Inc. | Sensitive, multiplexed diagnostic assays for protein analysis |
| US7022479B2 (en) | 2000-01-24 | 2006-04-04 | Compound Therapeutics, Inc. | Sensitive, multiplexed diagnostic assays for protein analysis |
| WO2001080622A2 (en) * | 2000-04-26 | 2001-11-01 | Streamline Proteomics | Apparatus and methods for assays of one or more analytes |
| ATE359512T1 (de) * | 2001-02-13 | 2007-05-15 | Pronostics Ltd | Biochemisches verfahren und vorrichtung zur bestimmung von eigenschaften von proteinen |
| AU2002229977A1 (en) * | 2001-02-13 | 2002-08-28 | Smartbead Technologies Limited | Biochemical method and apparatus for detecting genetic characteristics |
| US7869011B2 (en) | 2003-12-22 | 2011-01-11 | Novo Norkisk A/S | Apparatus and methods for analysis and sorting of particles such as polymer beads |
| US20090210165A1 (en) | 2003-12-22 | 2009-08-20 | Carlsberg A/S | Identification of encoded beads |
| US8492098B2 (en) | 2006-02-21 | 2013-07-23 | The Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of reaction components that affect a reaction |
| US11237171B2 (en) | 2006-02-21 | 2022-02-01 | Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of target analyte concentration in solution |
| GB2456236B8 (en) | 2007-03-22 | 2009-12-09 | Heptares Therapeutics Ltd | Stable muscarinic receptor mutants |
| EP2201374B1 (en) | 2007-08-30 | 2015-10-07 | Trustees Of Tufts College | Methods for determining the concentration of an analyte in solution. |
| GB0724051D0 (en) | 2007-12-08 | 2008-01-16 | Medical Res Council | Mutant proteins and methods for producing them |
| GB0724860D0 (en) | 2007-12-20 | 2008-01-30 | Heptares Therapeutics Ltd | Screening |
| GB0802474D0 (en) | 2008-02-11 | 2008-03-19 | Heptares Therapeutics Ltd | Mutant proteins and methods for selecting them |
| US8222047B2 (en) | 2008-09-23 | 2012-07-17 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules on single molecule arrays |
| GB0904904D0 (en) | 2009-03-23 | 2009-05-06 | Univ Leiden Medical Ct | Angiogenesis methods, medicaments and agents |
| GB0910725D0 (en) | 2009-06-22 | 2009-08-05 | Heptares Therapeutics Ltd | Mutant proteins and methods for producing them |
| GB201002082D0 (en) | 2010-02-09 | 2010-03-24 | Univ Leiden Medical Ct | Biological material |
| US8236574B2 (en) | 2010-03-01 | 2012-08-07 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules or particles using beads or other capture objects |
| WO2011109379A1 (en) | 2010-03-01 | 2011-09-09 | Quanterix Corporation | Methods and systems for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
| US9678068B2 (en) | 2010-03-01 | 2017-06-13 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules using dual detection methods |
| US8415171B2 (en) | 2010-03-01 | 2013-04-09 | Quanterix Corporation | Methods and systems for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
| US20140030218A1 (en) | 2011-01-05 | 2014-01-30 | Imperial Innovations Limited | Treatment And Screening |
| US9952237B2 (en) | 2011-01-28 | 2018-04-24 | Quanterix Corporation | Systems, devices, and methods for ultra-sensitive detection of molecules or particles |
| US20140302532A1 (en) | 2011-04-12 | 2014-10-09 | Quanterix Corporation | Methods of determining a treatment protocol for and/or a prognosis of a patient's recovery from a brain injury |
| US9932626B2 (en) | 2013-01-15 | 2018-04-03 | Quanterix Corporation | Detection of DNA or RNA using single molecule arrays and other techniques |
| GB201501004D0 (en) | 2015-01-21 | 2015-03-04 | Cancer Rec Tech Ltd | Inhibitors |
| GB201601690D0 (en) | 2016-01-29 | 2016-03-16 | Heptares Therapeutics Ltd | G proteins |
| GB201814451D0 (en) | 2018-09-05 | 2018-10-17 | Valerie Nicholas Carl Kristoffer | Methods |
-
1995
- 1995-05-23 WO PCT/US1995/006392 patent/WO1995032425A1/en not_active Ceased
- 1995-05-23 JP JP7530459A patent/JPH10500951A/ja active Pending
- 1995-05-23 EP EP95920576A patent/EP0763202A4/en not_active Withdrawn
Cited By (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6607921B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-08-19 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6355163B2 (en) | 1998-03-27 | 2002-03-12 | Ole Hindsgaul | Apparatus for screening compound libraries |
| US6387257B1 (en) | 1998-03-27 | 2002-05-14 | Ole Hindsgaul | Apparatus for screening compound libraries |
| US6395169B1 (en) | 1998-03-27 | 2002-05-28 | Ole Hindgual | Apparatus for screening compound libraries |
| US6054047A (en) * | 1998-03-27 | 2000-04-25 | Synsorb Biotech, Inc. | Apparatus for screening compound libraries |
| US6613575B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-09-02 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6627453B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-09-30 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6649415B1 (en) | 1998-03-27 | 2003-11-18 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6656739B2 (en) | 1998-03-27 | 2003-12-02 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6720190B1 (en) | 1998-03-27 | 2004-04-13 | Ole Hindsgaul | Methods for screening compound libraries |
| US6723235B2 (en) | 1998-03-27 | 2004-04-20 | Ole Hindsgaul | Apparatus for screening compound libraries |
| JP2002542463A (ja) * | 1999-04-15 | 2002-12-10 | バーチャル・アレイズ・インコーポレーテッド | コード位置に指標を有するコンビナトリアルケミカルライブラリー |
| WO2001059454A1 (en) * | 2000-02-07 | 2001-08-16 | Kyowa Medex Co., Ltd. | Method for detecting substance |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO1995032425A1 (en) | 1995-11-30 |
| EP0763202A1 (en) | 1997-03-19 |
| EP0763202A4 (en) | 1998-12-09 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| WO1995032425A1 (en) | Encoded combinatorial libraries | |
| US6210900B1 (en) | Method of encoding a series of combinatorial libraries and developing structure activity relationships | |
| US5708153A (en) | Method of synthesizing diverse collections of tagged compounds | |
| US5541061A (en) | Methods for screening factorial chemical libraries | |
| Lebl et al. | One‐bead–one‐structure combinatorial libraries | |
| EP0705279B1 (en) | Topologically segregated, encoded solid phase libraries | |
| EP1310510B1 (en) | Topologically segregated, encoded solid phase libraries | |
| JP4278872B2 (ja) | 蛋白質・核酸融合分子ライブラリーを用いた化合物・蛋白質相互作用の同定 | |
| WO2009077173A2 (en) | Dna-encoded chemical libraries | |
| EP1034183A1 (en) | Carrier-reporter bead assemblies | |
| US20050100968A1 (en) | Self-encoded combinatorial synthesis of compound multiplets | |
| US20050095638A1 (en) | Factorial chemical libraries | |
| WO2023100976A1 (ja) | ペプチドを固定化したビーズライブラリー | |
| EP1749020B1 (en) | Method for the purification of polymers carrying a lipophilic group | |
| JP2000510819A (ja) | コンビナトリアルライブラリーについての硫黄比率標識法 | |
| AU742678B2 (en) | Carrier-reporter bead assemblies | |
| WO2020264441A1 (en) | Peptide libraries having enhanced subsequence diversity and methods for use thereof | |
| Lebl et al. | Felder zyxwvutsrqponmlkj | |
| Lowe et al. | Combinatorial Libraries for Studying Molecular Recognition |