JPH10501132A - 腫瘍壊死因子レセプター関連因子 - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、TRAFと呼称される新たな腫瘍壊死因子レセプター関連因子に関するものである。この新しい因子は、TNFレセプター2型(TNF−R2)およびCD40の細胞内ドメインと特異的に関係することができ、TNFおよびCD40リガンド生物活性の仲介に関与している。
Description
【発明の詳細な説明】
腫瘍壊死因子レセプター関連因子
発明の分野
本発明は新規なポリペプチド因子に関するものである。より詳細には、本発明
は腫瘍壊死因子レセプター2型(TNF−R2)に関連する因子に関するもので
ある。
発明の背景
腫瘍壊死因子(TNF。TNF−αとも称される)は、主として活性化マクロ
ファージおよび少数の他の細胞型によって産生される強力なサイトカインである
。TNFにより導かれる多数の生物学的効果には、移植された腫瘍の出血性壊死
、細胞毒性、エンドトキシンショックにおける役割、炎症、免疫調節、増殖性お
よび抗ウイルス反応が包含される[D.V.ゲッデル等、Cold Spring Harbor Sympo
sia on Quantitative Biology、51巻597−609頁(1986);B.ビュ
ートラーおよびA.セラミ、Ann.Rev.Biochem.、57巻505−518頁(198
8);L.J.オールド、Sci.Am.、258(5)巻59−75頁(1988);W.
フィアス、FEBS Lett.、285(2)巻199−212頁(1991)]。文献
には、TNFおよびIL−1のようなその他のサイトカインが、放射線療法の最
中にもたらされる電離照射の有害な作用、例えば酵素の変性、脂質の過酸化物化
、およびDNA損傷から防護し得ることが報告されている[(ネータ等、J.Immu
nol.、136(7)巻2483頁(1987);ネータ等、Fed.Proc.、46巻
1200頁(抄録)(1987);アーバシェク等、Lymphokine Res.、6巻1
79頁(1987);米国特許第4861587号;ネータ等、J.Immunol.、1
40巻108頁(1988)]。活性化されたリンパ球により産生される関連分
子リンホトキシン(LT、TNF−βとも称される)は、TNFと類似ではある
が同一ではない生物活性スペクトルを示す(例えばD.V.ゲッデル等、上記、およ
びW.フィアス、上記、を参照されたい)。TNFはペニカ等、Nature、312巻
721頁
(1984)に、LTはグレイ等、Nature、312巻724頁(1984)に記
載された。
TNFまたはLTにより仲介される様々な細胞応答の誘導の第一段階は、特異
的細胞表面レセプターへのそれらの結合である。およそ55kDa(TNF−R
1)および75kDa(TNF−R2)である二つの明瞭なTNFレセプターが
同定され[H.P.ホフマン等、J.Biol.Chem.、264巻14927−14934頁
(1989);M.ブロックハウス等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、87巻3127
−3131頁(1990)]、そして、両方のレセプター型に対応するヒトおよ
びマウスcDNAが分離および特性決定されている[H.ロエッチャー等、Cell、
61巻351頁(1990);T.J.シャル等、Cel1、61巻361頁(1990
);C.A.スミス等、Science、248巻1019頁(1990);M.ルイス等、P
roc.Natl.Acad.Sci.USA、88巻2830−2834頁(1991);R.G.グッ
ドウィン等、Mol.Cell.Biol.、11巻3020−3026頁(1991)]。両
方のTNF−Rは、細胞外、貫膜、および細胞内領域を含む細胞表面レセプター
の典型的構造を共有している。両レセプターの細胞外部分は、可溶性TNF結合
蛋白としても天然に見いだされている[Y.ノファー等、EMBO J.、9巻3269
頁(1990);およびT.コーノ等、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.、87巻83
31頁(1990)]。ヒトTNF−R1のアミノ酸配列およびその基礎となる
ヌクレオチド配列はEP417563(1991年3月20日公開)に開示され
ており、一方EP418014(1991年3月20日公開)はヒトTNF−R
2のアミノ酸およびヌクレオチド配列を開示している。
まだ系統的に研究されてはいないが、大多数の細胞型および組織は両方のTN
Fレセプターを発現するように見える。
TNF−R1またはTNF−R2のいずれかに対し特異的なポリおよびモノク
ローナル抗体(mAb)によって行われた研究が、これらのレセプターの機能お
よび相互作用への非常に貴重な洞察を提供してはいるが、細胞のシグナル伝達に
おけるこの二つのTNFレセプターの個別的役割、とりわけTNF−R2の役割
は、十分理解されているには程遠い。
TNF−R1に対するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体はいずれ
もこのレセプターのための特異的アゴニストとして働き、細胞毒性、線維芽細胞
増殖、クラミジアに対する耐性、およびプロスタグランジンE2の合成といった
幾つかのTNF活性を表すことが観察されている[H.エンゲルマン等、J.Biol.C
hem.、265巻14497−14504頁(1990);T.エスペヴィック等、
J.Exp.Med.、171巻415−426頁(1990);M.R.シャラビー等、J.Ex
p.Med.、172巻1517−1520頁(1990)]。
さらに、マウスTNF−R1およびTNF−R2の両者に対するポリクローナ
ル抗体が開発され、特異的レセプターアゴニストとして挙動し且つマウスTNF
活性のサブセットを誘導する事が示された。マウスTNF−R1は細胞毒性のシ
グナル伝達および幾つかの遺伝子の誘導を司ることが示され、一方、マウスTN
F−R2は、一次胸腺細胞および細胞毒性TセルラインCT6の増殖をシグナル
伝達できることが示された[L.A.タータグリア等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA
、88巻9292−9296頁(1991)]。TNF−R2がヒト胸腺細胞の
増殖を刺激する能力が、ヒトレセプターに対して作製されたモノクローナル抗体
を用いた実験で証明された。
TNF−R1へのTNFの結合を遮断しTNF作用の幾つかに拮抗するヒトT
NF−R1に対するモノクローナル抗体もまた記載されている[T.エスペヴィ
ック等、上記;M.R.シャラビー等、上記;B.ナウメ等、J.Immunol.、146巻3
035−3048頁(1991)]。
加えて、幾つかの報告は、TNF−R1アゴニストにより誘導される同じTN
F応答(例えば細胞毒性およびNF−κBの活性化)に部分的に拮抗できる、T
NF−R2に対して作製されたモノクローナル抗体を記載した[M.R.シャラビー
等、上記;B.ナウメ等、上記;およびH.P.ホフマン等、J.Biol.Chem.、265巻
22409−22417頁(1990)]。
二つのヒトTNFレセプターは共にシグナル伝達において活性であるが、これ
らは別個の細胞応答を仲介できることが現在でははっきりと確立されている。T
NF−R1は殆どのTNF応答のシグナル伝達を司っているように見えるが、T
NFの胸腺細胞増殖刺激活性は、TNF−R2によって特異的に仲介される。さ
らに、TNF−R1およびTNF−R2はいずれも転写因子NF−κBのTNF
による活性化を独立して仲介していることが示されている[レナードおよびバル
ティモア、Cell、58巻227−229頁(1989);A.ラグレイド等、J.Bi
ol.Chem.、269巻7785−7791頁(1994);ロス等、Cell、78巻
681−692頁(1994);ウィーグマン等、J.Biol.Chem.、267巻17
997−18001頁(1992)]。NF−κBは、種々の重要な細胞および
ウイルス遺伝子の発現を調節する、転写アクティベーターのRelファミリーの
一員である[レナードおよびバルティモア、上記、ならびにタノスおよびマニア
ティス、Cell、80巻529−532頁(1995)]。TNF−R2はさらに
、CT6細胞において顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)
遺伝子[ミヤタケ等、EMBO J.、4巻2561−2568頁(1985);スタ
ンレイ等、EMBO J.、4巻2569−2573頁(1985)]およびA20亜
鉛フィンガー蛋白遺伝子[オピパリ等、J.Biol.Chem.、265巻14705−1
4708頁(1990)]の転写誘導を仲介し、そして、細胞毒性のような主と
してTNF−R1により仲介される応答のシグナル伝達においてTNF−R1に
対するアクセサリー成分として参加する[L.A.タータグリアおよびD.V.ゲッデル
、Immunol.Today、13巻151−153頁(1992)]。
発明の要約
TNF自身、TNFレセプターおよび二つのレセプターにより仲介されるTN
F活性は広範に研究されてきたが、レセプター後のシグナル伝達機構はわかって
いない[R.ベイアートおよびW.フィアス、「腫瘍壊死因子の誘導する細胞毒性の
分子機構:理解されていることおよび理解されていないこと」、FEBS Letters、
340巻9−16頁(1994)による総説を参照されたい]。この事は特に、
TNFレセプターシグナル伝達カスケードの最初の工程、即ち、膜結合したレセ
プターがいかにしてリガンドTNFによる活性化後の細胞内にシグナルを送り込
むのかという問題に関して真実である。
本発明は、TNF−R2の細胞内ドメインに関係するポリペプチド因子が存在
し、TNF−R2シグナル伝達カスケードに参加しているという仮説に基づいて
いる。より詳細には、本発明は、TNF−R2の細胞内ドメインに関係できTN
F生物活性の細胞内レセプター後シグナル伝達に参加する、天然ポリペプチド因
子の同定および分離を目的とする研究に基づいている。
TNFにより誘導されるマウスCT6細胞の増殖はTNF−R2によって仲介
されるということが知られている[タータグリア等(1991)、上記]。hT
NF−R2の細胞内ドメインに関係する因子を同定するため、このレセプターを
、[35S]標識しトランスフェクトさせたCT6細胞の溶菌液および標識してい
ないトランスフェクトさせたヒト胚腎臓293細胞から免疫沈降させ、次いでこ
れらを、トランスフェクトさせていないCT6細胞由来の標識した溶菌液と共に
インキュベートした。見掛けの分子量が約45ないし50−56kDである幾つ
かのポリペプチドおよびおよその分子量が68kDである一つのポリペプチドが
、免疫沈降したhTNF−R2と共に特異的に共同沈降した。以後、これらを腫
瘍壊死因子レセプター関連ポリペプチド、またはTRAFと総称する。同定され
た因子のうち、これまでに二つが精製およびクローニングされている。これら二
つの因子を腫瘍壊死因子レセプター関連因子1および2(TRAF1およびTR
AF2;配列番号2および4)と称する。TRAF1およびTRAF2のアミノ
酸配列の比較により、これらはC末端ドメインに高度のアミノ酸一致を有する(
230アミノ酸にわたり53%の一致)が、一方N末端ドメインは関連性がない
ことが明らかとなった。これらの新たな因子は、TNFのレセプター後シグナル
伝達で重要な役割を演じていると信じられる。TNF−R2の細胞内ドメインは
他のいかなる既知のレセプターまたは蛋白に対しても配列相同性を表さないこと
から、これらのシグナル伝達分子は、その理解がTNFの治療学的価値を改善す
るための新たな手段の開発に大きく貢献することのできる、新規なシグナル伝達
機構を表しているかも知れない。
一つの態様において本発明は、天然TNF−R2の細胞内ドメインと特異的に
関係することのできる、新規な因子(TRAF)のファミリーに関するものであ
る。本発明は特に、任意のヒトまたはヒト以外の動物種由来の天然因子およびそ
れらの機能的誘導体を包含する、腫瘍壊死因子レセプター関連因子1および2(
TRAF1およびTRAF2、配列番号2および4)に関するものである。
別の態様において、本発明は、TRAFポリペプチドをコードしているヌクレ
オチド配列を含む分離された核酸分子に関するものである。
さらに別の態様において、本発明は、該ベクターにより形質転換された宿主細
胞により認識される調節配列と機能的に結合した前記核酸分子を含む発現ベクタ
ーに関するものである。
さらなる態様において、本発明は、前記発現ベクターにより形質転換された宿
主細胞に関するものである。
さらに別の態様において本発明は、TNF−R2レセプター関連因子およびT
NF−R2の相互作用を妨げる分子(ポリペプチド、例えば抗体およびTRAF
類似体およびフラグメント、ペプチドならびに小型有機分子を包含する)に関す
るものである。
本発明は特に、天然TRAFポリペプチドに特異的に結合できる抗体、および
係る抗体を産生するハイブリドーマセルラインに関するものである。
別の態様において本発明は、上記定義によるTRAFポリペプチドをコードし
ている核酸分子を使用する方法であって、ベクターにより形質転換された宿主細
胞により認識される調節配列と機能的に結合した該核酸分子を含むベクターによ
って形質転換された培養宿主細胞中で係る核酸分子を発現させ、そしてコードさ
れているポリペプチドを宿主細胞から回収することからなる方法に関するもので
ある。
本発明はさらに、上記定義によるTRAFポリペプチドを生産する方法であっ
て、転写調節要素を、転写に影響を与えるに十分な近さおよび向きで、該ポリペ
プチドをコードしている核酸を含む細胞のDNA中に挿入することからなる方法
に関するものである。
本発明はまた、TRAFポリペプチドの存在を決定する方法であって、係るポ
リペプチドをコードしているDNAを被験試料の核酸とハイブリダイズし、TR
AFポリペプチドDNAの存在を決定することからなる方法を提供する。
さらなる態様において本発明は、天然TNF−R2の細胞内ドメイン配列およ
び転写アクティベーターのDNA結合ドメインの融合物をコードしている分離さ
れた核酸分子に関するものである。
さらに別の態様において本発明は、TRAFと転写アクティベーターの活性化
ドメインとの融合物をコードしている分離された核酸分子に関するものである。
本発明はさらに、前記核酸によりコードされるハイブリッド(融合)ポリペプ
チドに関するものである。
本発明はまた、前記融合蛋白をコードしている核酸分子の1または両方を含む
ベクターを包含する。
別の態様において本発明は、
(a)リポーター遺伝子を有する単一の宿主細胞において、天然TNF−R2
の細胞内ドメイン配列と転写アクティベーターのDNA結合ドメインとの融合物
、および、候補因子と転写アクティベーターの活性化ドメインとの融合物を含む
ポリペプチドをコードしている核酸分子を発現させ;そして、
(b)リポーター遺伝子によりコードされている分子を検出することによって
、候補因子とTRAF−R2細胞内ドメイン配列の結合を監視する、
ことからなる、天然TNF−R2の細胞内ドメインに特異結合できる因子を同定
するための検定に関するものである。
さらに本発明は、
(a)該TNF−R2と特異結合できるポリペプチド因子をコードしている核
酸およびリポーター遺伝子をコードしている核酸によってトランスフェクトされ
た単一の宿主細胞において、天然TNF−R2の細胞内ドメイン配列と転写アク
ティベーターのDNA結合ドメインとの融合物を含むポリペプチド、および、候
補ポリペプチド因子と転写アクティベーターの活性化ドメインとの融合物を含む
第二のポリペプチドをコードしている核酸分子を発現させ;そして、
(b)該リポーター遺伝子によりコードされているポリペプチドを検出するこ
とによって、該候補因子と該TNF−R2または該TNF−R2と特異結合でき
る該ポリペプチド因子との関係を監視する、
ことからなる、天然TNF−R2の細胞内ドメインと特異的に関係できる因子を
同定するための検定に関するものである。
さらなる態様において本発明は、TRAFと天然TNF−R2の細胞内ドメイ
ンとの関係を妨げることのできる分子を同定するための検定であって、1.天然
TNF−R2の細胞内ドメイン配列と転写アクティベーターのDNA結合ドメイ
ンとの融合物、2.天然TRAFポリペプチドと該転写アクティベーターの活性
化ドメインとの融合物、および、3.リポーター遺伝子を発現する細胞を、候補
分子と接触させ、そして、リポーター遺伝子によりコードされている分子を検出
することによって、該候補分子が該TRAFおよびTNF−R2細胞内ドメイン
配列の関係を妨げる能力を監視することからなる検定に関するものである。上記
の検定中の細胞は、好ましくは酵母細胞である。
上記の「二ハイブリッド」形式に加えて、この検定は任意の常套的結合/イン
ヒビター検定形式で実施することができる。例えば、一方の結合相手(TNF−
R2またはTRAF)を固定し、そして、放射性標識、例えば32Pのような検出
可能な標識を備えた他方の結合相手と接触させ、そして、二つの相手の結合(関
係)を候補インヒビターの存在下で検出する。特異的結合検定の設計は、十分に
当業者の技量内にある。
別の態様において本発明は、上記定義のようなTRAFポリペプチドをコード
している核酸により核酸ポリメラーゼ反応を開始することからなる、核酸被験試
料を増幅する方法に関するものである。
別の態様において本発明は、TRAFポリペプチドの全体または一部を含むポ
リペプチド分子をコードしている核酸配列または関連核酸配列を検出するための
方法であって、該核酸配列を、該核酸配列の少なくとも一部と特異的に結合する
検出可能なマーカーと接触させ、そしてこのように結合したマーカーを検出する
ことからなる方法に関するものである。
さらに別の態様において本発明は、TNF−R2によって完全にまたは部分的
に仲介されるTNF生物活性に関連する病理学的状態を処置する方法であって、
必要な患者に、治療的有効量のTRAF、またはTRAFおよびTNF−R2の
相互作用を妨げることのできる分子を投与することからなる方法に関するもので
ある。
さらに別の態様において本発明は、TRAF蛋白とCD40との相互作用のイ
ンヒビターを同定するための検定であって、CD40と直接または間接的に結合
できるTRAF蛋白、CD40、およびリポーター遺伝子(ここでその発現はC
D40:TRAF相互作用に依存している)を同時発現する組換え宿主細胞を、
候補インヒビターと接触させ、そして該リポーター遺伝子の発現を阻害する分子
を選択することからなる検定に関するものである。
さらに別の態様において本発明は、TRAF蛋白とLMP1との相互作用のイ
ンヒビターを同定するための検定であって、LMP1と直接または間接的に結合
できるTRAF蛋白、LMP1およびリポーター遺伝子(ここでその発現はLM
P1:TRAF相互作用に依存している)を同時発現する組換え宿主細胞を、候
補インヒビターと接触させ、そして該リポーター遺伝子の発現を阻害する分子を
選択することからなる検定に関するものである。
TRAF蛋白とTNF−R2との相互作用に基づく検定と全く同様に、CD4
0:TRAFおよびLMP1:TRAF検定は「二ハイブリッド」形式で実施さ
れるのが好ましい。しかし、これらは、前述のものと全く同様に、任意の常套的
結合/インヒビター検定形式で実施することもできる。個々の検定形式の設計は
、十分に当業者の技術内にある。
本発明はさらに、TRAF2(87−501)、またはTNF−R2、CD4
0もしくはLMP1により仲介される生物活性を阻害することのできるその機能
的誘導体に関するものである。
図面の簡単な説明
図1。CT6細胞におけるTNF−R2による転写因子NF−κBの活性化。
1:500希釈の抗mTNF−R2ポリクローナル抗体またはそれぞれの免疫前
血清で20分間刺激しておいたCT6細胞から調製された核抽出物6μgを、2
個の野生型(wt)または突然変異体(mt)NF−κB結合部位のいずれかを
含む放射標識された二本鎖オリゴヌクレオチドとインキュベートし、そして、電
気泳動移動度シフト検定によってNF−κB DNA結合活性の誘導について分
析した[シュッツェ等、Cell、71巻765−776頁(1992)]。結合反
応は、競合オリゴヌクレオチド無しで、または、突然変異体NF−κB結合部位
もしくは転写因子AP−1のための結合部位を含む非標識化競合オリゴヌクレオ
チドの500倍過剰の存在下で実施した[P.エンジェル等、Mol.Cell.Biol.、7
巻2256−2266頁(1987)]。FおよびBはそれぞれ遊離のオリゴヌ
クレオチドプローブおよび蛋白と複合体形成しているオリゴヌクレオチドプロー
ブを指す。
図2。hTNF−R2の免疫沈降。
(A)35S標識されたCT6細胞またはhTNF−R2を発現するCT6細胞
を、100ng/mlのhTNFで10分間刺激するかまたは処置せずにおいた
。細胞を溶解し、hTNF−R2を本明細書に記載のように免疫沈降させ、そし
てSDS−PAGEおよびオートラジオグラフィーにより分析した。星印は75
−80kdのhTNF−R2に相当するバンドを示している。
(B)hTNF−R2を非刺激またはTNF刺激293または293/TNF
−R2細胞から免疫沈降させ、35S標識化CT6細胞からの溶解液と共にインキ
ュベートした。矢印は、両実験でhTNF−R2により特異的に共同沈降する4
5ないし50−56kdおよび68kdのバンドを示している。分子量マーカー
を右側にkdで示す。
図3。GST−hTNF−R2icd融合蛋白の精製。
グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)およびGST−hTNF−
R2icd融合蛋白を大腸菌で発現させ、本明細書に記載のように精製し、そし
てSDS−PAGEおよびクマシー染色により分析した。分子量マーカーを右側
にkdで示す。
図4。CT6細胞抽出物中でのGST−hTNF−R2icd融合蛋白の共同
沈降。
GSTおよびGST−hTNF−R2icd融合蛋白ビーズを本明細書に記載
のように35S標識化CT6細胞からの溶解液と共にインキュベートし、そしてS
DS−PAGEおよびオートラジオグラフィーにより分析した。矢印は、GST
−hTNF−R2icd融合蛋白により特異的に共同沈降する45ないし50−
56kdおよび68kdのバンドを示している。分子量マーカーを右側にkdで
示す。
図5。CT6細胞抽出物中でのGST−突然変異体hTNF−R2icd融合
蛋白の共同沈降。
GSTおよびhTNF−R2の突然変異体細胞内ドメインを含むGST融合蛋
白をグルタチオン−アガロースビーズに結合させ、35S標識化CT6細胞からの
溶解液とインキュベートし、そしてSDS−PAGEおよびオートラジオグラフ
ィーにより分析した。矢印は、hTNF−R2の野生型(wt)、突然変異体−
16、△304−345および384−424細胞内ドメインを含むGST融合
蛋白とは特異的に共同沈降するが、突然変異体−37および−59細胞内ドメイ
ンとは関係しない45ないし50−56kdおよび68kdのバンドを示してい
る。非標識化融合蛋白が同じ大きさの位置に移動するため、幾つかの場合ではこ
れらのバンドのパターンが圧縮されていることに留意されたい。分子量マーカー
は右側にkdで示す。
図6。TNF−R2関連因子とGST−hTNF−R2icd融合蛋白との競
合。
(A)hTNF−R2を293および293/TNF−R2細胞から免疫沈降
させ、競合物質として示されたGST−hTNF−R2icd融合蛋白ビーズ5
0μlと共にプレインキュベートしておいた35S標識化CT6細胞からの溶解液
と共にインキュベートした。反応をSDS−PAGEおよびオートラジオグラフ
ィーにより分析した。矢印は、hTNF−R2と特異的に共同沈降し、hTNF
−R2の野生型(wt)および突然変異体−16細胞内ドメインを含むGST融
合蛋白とのプレインキュベーションにより涸渇しているが突然変異体−37およ
び−59細胞内ドメイン融合蛋白とのプレインキュベーションによっては涸渇し
ていない、45ないし50−56kdおよび68kdのバンドを示している。
(B)(A)に記載のものと類似の実験の68kd領域を示す。
分子量マーカーは右側にkdで示す。
図7。ジャーカット細胞抽出液中でのGST−hTNF−R2icd融合蛋白
の共同沈降。
GSTおよびGST−hTNF−R2icd融合蛋白ビーズを、100ng/
mlのhTNFで10分間刺激したまたは非処置のままでおいた35S標識化ジャ
ーカット細胞からの溶解液と共にインキュベートした。反応をSDS−PAGE
およびオートラジオグラフィーにより分析した。矢印は、GST−hTNF−R
2icd融合蛋白と特異的に共同沈降する45ないし50−56kd、67kd
および73−75kdのバンドを示している。分子量マーカーは右側にkdで示
す。
図8。TNF−R2関連因子の細胞内位置決定。
本明細書に記載のようにして35S標識化CT6細胞から細胞質および細胞膜画
分を調製した。これらの画分およびCT6細胞からのデタージェント(総)抽出
液をGSTおよびGST−hTNF−R2icd融合ビーズと共にインキュベー
トし、この反応をSDS−PAGEおよびオートラジオグラフィーにより分析し
た。矢印は、GST−hTNF−R2icd融合蛋白と特異的に共同沈降する4
5ないし50−56kdおよび68kdのバンドを示している。分子量マーカー
は右側にkdで示す。
図9。TNF−R2関連因子の精製。
GST−hTNF−R2icd融合蛋白親和クロマトグラフィーによるCT6
細胞からのTNF−R2関連因子の大規模精製を、本明細書に記載のように実施
した。得られた材料の十分の一をSDS−PAGEおよび銀染色により分析した
。矢印は、GST−hTNF−R2icd融合蛋白親和カラムから特異的に溶出
した45ないし50−56kdおよび68−70kdのバンドを示している。分
子量マーカーは右側にkdで示す。
図10。TRAF1 cDNAのヌクレオチドおよび予想アミノ酸配列(配列
番号1および2)。
TRAF1 cDNAの核酸配列を、SalIクローニングリンカー後の最初
の塩基から始まる番号を付けて示す。推定蛋白配列を、開始メチオニンから番号
を付して上部に示す。開始メチオニンの上流のフレーム内停止コドンに下線を付
す。精製されたTRAF1蛋白の配列決定により同定されたアミノ酸を太字で示
す。TRAFドメイン(明細書を参照されたい)はアミノ酸180(>)−40
9(<)を含んでいる。考え得るロイシンジッパー領域(明細書を参照されたい
)はアミノ酸183(+)−259(−)の間に広がっている。この七個組のモ
チーフを規定する領域内のアミノ酸をイタリック体で示す。
図11。TRAF2 cDNAのヌクレオチドおよび予想アミノ酸配列(配列
番号3および4)。
最長のTRAF2 cDNAの核酸配列を、SalIクローニングリンカー後
の最初の塩基から始まる番号を付けて示す。さらに、4個の独立して分離されて
いるpPC86 cDNA挿入物(*)および最長のλファージcDNA挿入物
(^)の最初のヌクレオチドを示す。推定蛋白配列を、全ての分離されたpPC
86TRAF2 cDNAクローンにおいてGAL4活性化ドメインコード化領
域のフレーム内にある、予想開始メチオニンから番号を付して上部に示す(明細
書を参照されたい)。RINGフィンガーモチーフを規定するシステインおよび
ヒスチジン残基、ならびに2個のTFIIIA様亜鉛フィンガーモチーフ(明細書
を参照されたい)を、それぞれ太字でまたは下線を付して示す。TRAFドメイ
ン(明細書を参照されたい)はアミノ酸272(>)−501(<)を含む。考
え得るロイシンジッパー領域(明細書を参照されたい)はアミノ酸275(+)
−351(−)の間に広がっている。七個組モチーフを規定しているこの領域内
のアミノ酸をイタリック体で示す。
図12。TRAF2内の領域と亜鉛結合モチーフとの配列類似性。
(A)RINGフィンガーモチーフを含むアミノ酸配列の比較。TRAF2
RINGフィンガーモチーフを、A.タリアナ由来の調節蛋白COP1[デング等
、Cell、71巻791−801頁(1992);配列番号5]、ヒトエストロゲ
ン応答フィンガー蛋白EFP[イノウエ等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、90巻1
1117−11121頁(1993);配列番号6]、S.セレヴィシアエおよび
N.
クラッサにおけるDNA修復にそれぞれ要するRAD18およびUVS−2遺伝
子産物[ジョーンズ等、Nucl.Acids Res.、16巻7119−7131頁(19
88);配列番号7];[トミタ等、Mol.Gen.Genet.、238巻225−233
頁(1993);配列番号8]、ヒトV(D)J組換え活性化遺伝子産物RAG
−1[シャッツ等、Cell、59巻1035−1048頁(1989);配列番号
9]、ヒト52kdリボクレオ蛋白SS−A/Ro[チャン等、J.Clin.Invest.
、87巻68−76頁(1987)];イトー等、J.Clin.Invest.、87巻17
7−186頁(1987);文献1のA52は文献2のP52である;配列番号10
];ヒトRING1[ロヴァリング、GBTRANS受理番号Z14000(1
992);配列番号11]、マウスTリンパ球調節蛋白RPT−1[パターカ等
、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、85巻2733−2737頁(1988);配列番
号12]、ヒト調節蛋白RFP[タカハシ等、Mol.Cell.Biol.、8巻1853−
1856頁(1988);配列番号13]、およびヒトプロトオンコジーンc−
cblの産物[ブレイク等、Oncogene、6巻653−657頁(1991);配
列番号14]の各々の亜鉛結合モチーフと並置する。
(B)TFIIIA型亜鉛フィンガーモチーフを含むアミノ酸配列の比較。2個
の隣接する共通配列C/H−X2-4−C/H−X2-15−C/H−X2-4−C/Hの
反復を含むTRAF2中の領域[バーグ、J.Biol.Chem.、265巻6513−6
516頁(1990)]を、発育と共に調節されるD.ディスコイデウム由来のD
G17遺伝子産物[ドリスコルおよびウィリアムズ、Mol.Cell.Biol.、7巻44
82−4489頁(1987);配列番号15]、転写因子IIIA型X.ラエヴィ
ス[ミラー等、EMBO J.、4巻1609−1614頁(1985);配列番号1
6]、ツメガエル亜鉛フィンガー蛋白XLCOF14およびXFIN[ニートフ
ェルド等、J.Mol.Biol.、208巻639−659頁(1989);配列番号1
7];[ルイーズ・イ・アルタバ等、EMBO J.、6巻3065−3070頁(1
987);配列番号18]、マウスZFY1/2およびMFG2遺伝子産物[マ
ードンおよびペイジ、Cell、56巻765−770頁(1989):配列番号1
9];[パサナンティ等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、86巻9421−9471
頁(1
989);配列番号20]、およびRAD18およびUVS−2蛋白(上記参照
;配列番号21および22)の類似の亜鉛結合モチーフと並置する。
図13。TRAF1およびTRAF2の間の相同性。
TRAF1およびTRAF2の蛋白配列の最適化された並置を示す。同一のア
ミノ酸に囲みを付す。C末端TRAFドメイン(明細書を参照されたい)は、T
RAF1のアミノ酸180−409およびTRAF2の272−501からなる
。
図14。TRAF1およびTRAF2のハイドロパシー。
20のアミノ酸のウインドウを用いるカイトおよびドゥーリトル、J.Mol.Biol
.、157巻105−132頁(1982)の方法によって、TRAF1(A)
およびTRAF2(B)のアミノ酸配列のハイドロパシープロフィルを得た。各
プロットの下の数は、それぞれの蛋白のアミノ酸の位置を示す。
図15。TRAF1およびTRAF2 mRNAのノーザンブロット分析。
(A)CT6細胞におけるTRAF1およびTRAF2 mRNAのノーザン
ブロット分析。列当たりCT6細胞由来のポリ(A)+RNA3μgがある。
(B)マウス組織におけるTRAF1およびTRAF2 mRNAのノーザン
ブロット分析。マウスの複数組織ノーザンブロット(クロンテク)を、本明細書
に記載のように、放射標識されたTRAF1およびTRAF2プローブとハイブ
リダイズさせた。
図16。293細胞抽出液におけるGST−TRAF2融合蛋白の共同沈降。
GSTおよびGST−TRAF2融合蛋白ビーズを、本明細書に記載のように
293および293/TNF−R2細胞由来の溶解液と共にインキュベートした
。反応をSDS−PAGEならびに抗ヒトTNF−R1モノクローナル抗体98
6(0.5μg/ml)および抗ヒトTNF−R2モノクローナル抗体1036
(0.5μg/ml)を用いるウェスタンブロット分析によって分析した。矢印
は、GST−TRAF2融合蛋白と特異的に共同沈降する75−80kd hT
NF−R2バンドを示す。分子量マーカーは右側にkdで示す。
図17。転写因子NF−κBをTRAF2過剰発現により活性化する。293
細胞(106)を、7.5μgのpRK対照(第1−5列)またはTRAF1(
第6列)、TRAF3(第7列)およびTRAF2(第7−16列)のための発
現ベクターでトランスフェクトした。発現ベクターおよび293細胞での一過性
トランスフェクションは実施例6に記載されている。細胞を、100ng/ml
のヒトTNF(第2列)、免疫前血清(第3列)、抗ヒトTNF−R1抗体(第
4列)または抗ヒトTNF−R2抗体(第5列)を用い1:500の希釈で、収
穫前に1時間処理した[ロース等、Cell、78巻681頁(1994)]。核抽
出物をトランスフェクションの24時間後に調製し、6μgのアリコートを、2
個のNF−κB結合部位を含む放射標識化二本鎖オリゴヌクレオチドと共にイン
キュベートした[シュッツェ等、Cell、71巻765頁(1992)]。野生型
(第9列)または突然変異した(第10列)NF−κB配列のいずれかを含む5
0倍過剰の非標識化競合物質オリゴヌクレオチドを各反応に添加した[シュッツ
ェ等、上記]。反応混合物を、1μlの免疫前血清(第11列)、抗p50血清
(第12列)、抗p65血清(第13列)、抗c−rel血清(第14列)、抗
relB血清(第15列)または抗p52血清(第16列)と共にインキュベー
トした[サンタ・クルーズ・バイオテクノロジー]。FおよびBはそれぞれ遊離
オリゴヌクレオチドプローブまたは蛋白と複合体形成しているオリゴヌクレオチ
ドプローブを指す。
図18。TRAF2の過剰発現はNF−κB依存性リポーター遺伝子活性を誘
導する。(A)293細胞における、NF−κB依存性リポーター遺伝子活性に
及ぼすTRAF過剰発現の効果。293細胞を、実施例6に記載のように、E−
セレクチン−ルシフェラーゼリポーター遺伝子プラスミド[シンドラーおよびバ
イクウォール、Mol.Cell.Biol.、14巻5820頁(1994)]およびTRA
F発現ベクター(1μg)を用いて一過性に同時トランスフェクトさせた。細胞
は、処置しない(塗りつぶした棒)かまたは収穫前に100ng/mlのヒトT
NFで8時間刺激(斜線を施した棒)した。ルシフェラーゼの活性を測定し、β
−ガラクトシダーゼ発現に基づいて正規化した。示されている値は一つの代表的
実験の平均値(平均±SD)であって、ここで各トランスフェクションは三重に
実施した。(B)CT6細胞におけるNF−κB依存性リポーター遺伝子活性に
及ぼすTRAF発現の効果。CT6細胞を、E−セレクチン−ルシフェラーゼリ
ポーター遺伝子プラスミド(実施例6に記載の通り)およびTRAF発現ベクタ
ー(6μg)を用いて一過性に同時トランスフェクトした。(CT6細胞の一過
性トランスフェクションは、DEAE−デキストラン法を用いて実施した[F.M.
アウスベル等、カレント・プロトコルズ・イン・モレキュラー・バイオロジー(
グリーン・パブリッシング・アソシエイツ/ウィレイ・アンド・サンズ、Inc
.)、ニューヨーク(1994)]。107のCT6細胞を、250μg/mlDE
AE−デキストラン中のプラスミドDNA計10μgで90分間トランスフェク
トした。リポーター遺伝子活性を、トランスフェクションの40時間後に検定し
た)。24時間後、細胞を非処置のまま放置(塗りつぶした棒)、または100
ng/mlマウスTNFでさらに16時間刺激(斜線を施した棒)した後、収穫
した。ルシフェラーゼ活性を測定し、β−ガラクトシダーゼ発現に基づき正規化
した。示されている値は一つの代表的実験の平均値(平均±SD)であって、こ
こで各トランスフェクションは三重に実施した。数字は、それぞれのトランスフ
ェクションに関してTNF刺激によりリポーター遺伝子活性の誘導された倍数を
表す。
図19。TRAF2は、TNF−R2およびCD40によるNF−κB依存性
リポーター遺伝子活性の誘導を仲介する。(A)293細胞における、NF−κ
B依存性リポーター遺伝子活性に及ぼすTNF−R2およびTRAFの同時発現
の効果。293細胞を、実施例6に記載のように、E−セレクチン−ルシフェラ
ーゼリポーター遺伝子プラスミド[シンドラーおよびバイクウォール、上記]お
よびTNF−R2(1μg)およびTRAF(1μg)のための発現ベクターを
用いて一過性に同時トランスフェクションした。細胞を、収穫前に非処置(塗り
つぶした棒)とするかまたは100ng/mlヒトTNFで8時間刺激(斜線を
施した棒)した。ルシフェラーゼ活性を測定し、β−ガラクトシダーゼ発現に基
づき正規化した。示されている値は一つの代表的実験の平均値(平均±SD)で
あって、ここで各トランスフェクションは三重に実施した。(B)293細胞に
おける、NF−κB依存性リポーター遺伝子活性に及ぼすCD40およびTRA
Fの同時発現の効果。293細胞を、実施例6に示されるような、E−セレクチ
ン−ルシフェラーゼリポーター遺伝子プラスミド[シンドラーおよびバイクウォ
ール、上記]およびCD40(1μg)およびTRAF(1μg)のための発現
ベクターを用いて一過性に同時トランスフェクションした。24時間後、細胞を
収穫し、ルシフェラーゼ活性を測定し正規化した(塗りつぶした棒)。示されて
いる値は一つの代表的実験の平均値(平均±SD)であって、ここで各トランス
フェクションは三重に実施した。
発明の詳細な説明
A.定義
「因子」、「腫瘍壊死因子レセプター関連因子」、「TNF−R2関連因子」
および「TRAF」という句は互換的に使用され、天然TNF−R2の細胞内ド
メインと特異的に関係できる天然因子および係る天然因子の機能的誘導体を指す
。この定義の文脈において、「特異的な関係」という句は最も広い意義で使用さ
れ、ヒトまたは任意の動物種の天然TNF−R2の細胞内ドメイン内の一部位ま
たは領域との直接結合、および、さらなる分子、例えばTRAFにより仲介され
る天然TNF−R2細胞内ドメインとの間接的な関係を包含する。「天然TRA
F」という句は、天然供給源から精製され、合成され、組換えDNA技術により
、またはこれらのおよび/またはその他の方法の任意の組み合わせにより生産さ
れているとに拘わらず、任意のヒトまたは非ヒト動物種の任意の細胞型に天然に
存在するTRAFポリペプチドを指し、開始メチオニンを伴っていても伴ってい
なくても良い。天然TRAFは特に、このような天然に存在するポリペプチドの
単量体、ホモおよびヘテロ二量体およびホモおよびヘテロオリゴマー型を包含す
る。天然のマウスTRAF1およびTRAF2ポリペプチド(配列番号2および
4)は、TRAF2のN末端領域(RINGフィンガードメイン)の部分では関
連性がない。対照的に、このドメインの外部では、これらは41%の配列一致を
示す。この相同性はさらに二つの領域に分けられる。28%という配列一致性の
低い領域は、TRAF1のアミノ酸28−136およびTRAF2のアミノ酸1
59−
271を含む。この領域は、TRAF1(アミノ酸180−409)およびTR
AF2(アミノ酸272−501)のC末端ドメインからなる230アミノ酸に
わたり53%という高い配列一致性を有する領域から、TRAF1では43個の
アミノ酸挿入によって分離されている。この配列類似性は、これによりTRAF
ドメインと呼称される新規な構造ドメインの証拠を提供する。天然TRAFポリ
ペプチドは好ましくはそれらのアミノ酸配列のC末端部分に新規な配列モチーフ
を共有しており、好ましくはこのC末端「TRAFドメイン」内で少なくとも約
40%、より好ましくは少なくとも約50%、最も好ましくは少なくとも約55
%ホモローガスである。「TRAFドメイン」は、天然マウスTRAF2アミノ
酸配列のほぼアミノ酸272ないし501、天然マウスTRAF1アミノ酸配列
のほぼアミノ酸180ないし409、および他の天然TRAFおよびそれらの機
能的誘導体の相同的ドメインを包含する。天然TRAFはさらに、CD40およ
び/またはLMP1と結合し且つそれらの生物活性を仲介するという好ましい性
質を有する。
「天然TNFレセプター2型」および「天然TNF−R2」という語は互換的
に用いられ、天然供給源から精製され、合成され、組換えDNA技術により、ま
たはこれらのおよび/またはその他の方法の任意の組み合わせにより生産されて
いるとに拘わらず、任意の(ヒトおよび非ヒト)動物種由来の任意の天然に存在
する(天然)TNFレセプター2型を指し、開始メチオニンを伴っていても伴っ
ていなくても良く、そしてN末端に結合したシグナル配列を伴っていても伴って
いなくても良い。
互換的に用いられる「天然ヒトTNFレセプター2型」および「天然ヒトTN
F−R2」という語は、天然供給源から精製され、合成され、組換えDNA技術
により、またはこれらのおよび/またはその他の方法の任意の組み合わせにより
生産されているとに拘わらず、開始メチオニンを伴うまたは伴わない、そしてN
末端に結合したシグナル配列を伴うまたは伴わない、EP418014(199
1年3月20日公開)に開示されているアミノ酸配列を有するヒトTNF−R2
、および、天然供給源から精製され、インビトロで合成により生産され、または
組
換えDNA技術の方法を包含する遺伝学的操作により得られるとに拘わらず、天
然全長ヒトTNF−R2の可溶性型および種々のグリコシル化型を包含する、そ
の他の天然に存在するヒトTNF−R2を指す。
天然ポリペプチドの「機能的誘導体」とは、その天然ポリペプチドと共通の質
的生物活性を有する化合物である。したがって、天然TRAFポリペプチドの機
能的誘導体は、天然TRAFと共通の質的生物活性を有する化合物である。「機
能的誘導体」は、それらがそれぞれの天然ポリペプチドと共通の生物活性を有す
るならば、任意の動物種(ヒトを包含する)由来の天然ポリペプチドのフラグメ
ント、ならびに天然(ヒトおよび非ヒト)ポリペプチドの誘導体およびそれらの
フラグメントを包含するが、これらに限定される訳ではない。「フラグメント」
は成熟天然ポリペプチドの配列内にある領域を含む。「誘導体」という語は天然
ポリペプチドのアミノ酸配列およびグリコシル化変異体ならびに共有結合修飾体
を定義するのに用いられ、一方「変異体」という語はこの定義内のアミノ酸配列
およびグリコシル化変異体を指す。好ましくは、機能的誘導体は、対応する天然
ポリペプチドの配列と、少なくとも約65%のアミノ酸配列一致、より好ましく
は約75%のアミノ酸配列一致、さらに好ましくは少なくとも約85%のアミノ
酸配列一致、最も好ましくは少なくとも約95%のアミノ酸配列一致を有するポ
リペプチドである。最も好ましくは、天然TRAFポリペプチドの機能的誘導体
は、TNF−R2細胞内ドメインとの関係および/またはホモもしくはヘテロ二
量体化に直接参加する、天然ポリペプチド配列内の領域または領域群を保持また
は模倣している。「機能的誘導体」という句は特に、天然TRAFと共通の質的
生物活性を有するペプチドおよび小有機分子を包含する。
機能的誘導体の定義の文脈中の「生物活性」という語は、天然ポリペプチド(
例えばTRAF)と質的に共通の少なくとも一つの接着、調節またはエフェクタ
ー機能の所有として定義される。本明細書中の天然TRAFポリペプチドの機能
的誘導体の好ましい生物学的性質は、天然TNF−R2の細胞内ドメインと関係
(直接結合によって、または別のTRAFとの相互作用を介して)し、それによ
りそれらの関係しているTNF−R2によりシグナル伝達(全面的にまたは部分
的に)
される生物学的応答を仲介または遮断する能力である。別の好ましい生物活性は
、本発明に係るTRAFポリペプチドが転写因子NF−κBの活性化をシグナル
伝達する能力である。天然TRAF蛋白のさらなる好ましい機能的誘導体は、典
型的には、他のTRAFと同様、TNF−R2の細胞質ドメインと相互作用する
能力を保持しつつTNF−R2仲介NF−κB活性化を遮断することを特徴とし
ている。別の好ましい生物活性は、或るTRAF機能的誘導体がCD40の細胞
質ドメインと関係する能力である。このような機能的誘導体は、CD40の生物
活性を仲介または遮断することができる。TRAF機能的誘導体のさらなる好ま
しい群は、LMP1オンコジーンと関係し(実施例6を参照されたい)その生物
活性を仲介または遮断することができる。
天然ポリペプチドおよびその機能的誘導体に関する「一致」または「相同性」
とは、本明細書中、いかなる同類置換も配列一致の一部とは考えずに、最大の相
同性パーセントを達成するようにその配列群を並べ、必要ならば間隙を導入した
後の、対応する天然ポリペプチドの残基と一致する候補配列中のアミノ酸残基の
パーセントとして定義される。NもしくはC末端延長または挿入は、一致または
相同性を低下させるとは解釈されない。並置のための方法およびコンピューター
プログラムは当分野で良く知られている。
本発明に係るTRAFポリペプチドは特に、天然マウスTRAF1(配列番号
2)および天然マウスTRAF2(配列番号4)、それらのホモおよびヘテロ二
量体ならびにホモおよびヘテロオリゴマー型、ならびに他の哺乳動物種、例えば
ラット、豚、馬、牛、高等霊長類、およびヒトにおけるそれらの類似体、ならび
に係る天然ポリペプチドの機能的誘導体を包含する。天然TRAF1または天然
TRAF2レセプターの機能的誘導体は、好ましくは、緊縮条件下で天然TRA
FポリペプチドをコードしているDNAの相補物とハイブリダイズすることので
きるDNAによってコードされている。より好ましくは、この機能的誘導体は、
天然TRAFポリペプチドの任意のドメインと、そして好ましくはTNF−R2
結合ドメインおよび/または二量体化ドメインと、少なくとも約40%の配列相
同性、より好ましくは少なくとも約50%の配列相同性、さらに好ましくは少な
くとも約55%の配列相同性、最も好ましくは少なくとも約60%の配列相同性
を共有する。最も好ましい態様において、機能的誘導体は、マウスTRAF2の
C末端TRAF領域と少なくとも約50%の配列相同性、より好ましくは少なく
とも約55%の配列相同性、最も好ましくは少なくとも約60%の配列相同性を
共有し、または、緊縮条件下でマウスTRAF2のTRAF領域をコードしてい
るDNAの相補物とハイブリダイズすることのできるDNAによってコードされ
ている。もう一つの好ましい態様において、天然TRAFポリペプチドの機能的
誘導体は、唯一の機能的に無傷なドメインとして「TRAF」ドメインを有する
フラグメントであって、ここで「TRAF」ドメインは、天然マウスTRAF2
アミノ酸配列の大体アミノ酸272ないし501、天然マウスTRAF1アミノ
酸配列の大体アミノ酸180ないし409、および他の天然TRAFのホモロー
ガスなドメインを包含する。さらなる好ましい態様において、天然TRAFポリ
ペプチドの機能的誘導体は、TRAF2のRINGフィンガードメインを欠く。
後者の変異体の一つであるTRAF2(87−501)は、NF−κB活性化の
シグナル伝達が全くできない。
「緊縮条件」とは、20%ホルムアミド、5xSSC(150mM NaCl
、15mMクエン酸三ナトリウム)、50mM燐酸ナトリウム(pH7.6)、
5xデンハート溶液、10%硫酸デキストラン、および20μg/ml変性剪断
鮭精子DNAからなる溶液中42℃での一晩のインキュベーションである。
「アミノ酸」および「アミノ酸群」という語は、天然に存在する全てのL−α
アミノ酸を指す。アミノ酸は一文字または三文字表記により特定される:
Asp D アスパラギン酸 Ile I イソロイシン
Thr T スレオニン Leu L ロイシン
Ser S セリン Tyr Y チロシン
Glu E グルタミン酸 Phe F フェニルアラニン
Pro P プロリン His H ヒスチジン
Gly G グリシン Lys K リジン
Ala A アラニン Arg R アルギニン
Cys C システイン Trp W トリプトファン
Val V バリン Gln Q グルタミン
Met M メチオニン Asn N アスパラギン
これらのアミノ酸はそれらの側鎖の化学的組成および性質に従って分類するこ
とができる。これらは大きく二つの群、荷電および非荷電に分類される。これら
の群のそれぞれはアミノ酸をより正確に分類するため、小群に分けられる:
I.荷電アミノ酸
酸性残基:アスパラギン酸、グルタミン酸
塩基性残基:リジン、アルギニン、ヒスチジン
II.非荷電アミノ酸
親水性残基:セリン、スレオニン、アスパラギン、グルタミン
脂肪族残基:グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン
非極性残基:システイン、メチオニン、プロリン
芳香族残基:フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン
「アミノ酸配列変異体」という語は、天然アミノ酸配列と比較してそれらのア
ミノ酸配列に幾らかの相違を有する分子を指す。
置換変異体とは、天然配列中の少なくとも1個のアミノ酸が除去され、その場
所に同じ位置で異なるアミノ酸が挿入されている変異体である。置換は、分子中
の1個のアミノ酸だけが置換されている単一であっても、または同じ分子中で2
またはそれ以上のアミノ酸が置換されている複数であっても良い。
挿入変異体とは、天然配列の特定の一のアミノ酸と直接隣接して1またはそれ
以上のアミノ酸が挿入されている変異体である。アミノ酸に直接隣接して、とは
、当該アミノ酸のα−カルボキシまたはα−アミノ官能基のいずれかに結合して
いることを意味する。
除去変異体とは、天然アミノ酸配列中の1またはそれ以上のアミノ酸が除去さ
れている変異体である。通常、除去変異体は分子の特定の領域で1またはそれ以
上のアミノ酸が除去されている。
「グリコシル化変異体」という語は、天然のものとは異なったグリコシル化プ
ロフィルを有する糖蛋白、または天然型ではグリコシル化されていないポリペプ
チドのグリコシル化変異体を指すのに用いられる。ポリペプチドのグリコシル化
は典型的にはN結合またはO結合のいずれかである。N結合は、アスパラギン残
基の側鎖への炭水化物部分の結合を指す。トリペプチド配列アスパラギン−X−
セリンおよびアスパラギン−X−スレオニン(ここでXはプロリン以外の任意の
アミノ酸である)は、アスパラギン側鎖への炭水化物部分の酵素的結合のための
認識配列である。O−結合グリコシル化は、ヒドロキシアミノ酸、最も一般的に
はセリンまたはスレオニンへの、糖N−アセチルガラクトサミン、ガラクトース
、またはキシロースのうちの一つの結合を指すが、5−ヒドロキシプロリンまた
は5−ヒドロキシリジンもまたO−結合グリコシル化に含めてよい。
「抗体」(Ab)および「免疫グロブリン」(Ig)は、同じ構造特性を有す
る糖蛋白である。抗体は特異抗原に対する結合特異性を示すのに対し、免疫グロ
ブリンは、抗体および抗原特異性を欠く他の抗体様分子の両方を包含する。後者
の種類のポリペプチドは、例えばリンパ系によって低レベルが、そして骨髄腫に
よって高レベルが産生される。
天然の抗体および免疫グロブリンは、通常、二つの同一の軽(L)鎖および二
つの同一の重(H)鎖で構成される約150000ダルトンのヘテロ四量体糖蛋
白である。それぞれの軽鎖は一個のジスルフィド共有結合により重鎖に連結して
いるが、但しジスルフィド結合の数は異なる免疫グロブリンイソタイプの重鎖間
で異なっている。各々の重および軽鎖はさらに、規則的に間隔のあいた鎖内ジス
ルフィド橋を有する。それぞれの重鎖は一方の端に可変ドメイン(VH)、その
後に幾つかの不変ドメインを持っている。それぞれの軽鎖は一方の端に可変ドメ
イン(VL)、そして他方の端に不変ドメインを持っている。軽鎖の不変ドメイ
ンは重鎖の最初の不変ドメインと並んでおり、軽鎖可変ドメインは重鎖の可変ド
メインと並んでいる。特定のアミノ酸残基が軽および重鎖可変ドメインの間の界
面を形成していると信じられている[クロチア等、J.Mol.Biol.、186巻65
1−663頁(1985);ノヴォトニーおよびヘイバー、Proc.Natl.Acad.Sci
.USA、82巻4592−4596頁(1985)]。
「可変」という語は、可変ドメインの或る部分が配列の上で抗体間で甚だしく
異なっている事実を指し、特定の抗原に対する特定の各抗体の結合および特異性
に用いられる。しかしながら、可変性は抗体の可変ドメインに均等に分布しては
いない。それは、軽鎖および重鎖可変ドメインの両方にある相補性決定領域(C
DR)または超可変領域と呼ばれる三つのセグメントに集中している。可変ドメ
インの、より高度に保存された部分はフレームワーク(FR)と呼ばれる。天然
の重および軽鎖の可変ドメインはそれぞれ四つのFR領域を含んでおり、これら
は大抵βシートコンフィギュレーションを採用しており、三つのCDRによって
連結しているが、それらはこのβシート構造を連結するループを形成するか、幾
つかの場合にはそのβシート構造の一部を形成している。各鎖のCDRはFR領
域によって極めて近接して保持されており、他の鎖のCDRと共に、抗体の抗原
結合部位の形成に寄与している[E.A.カバット等、シークエンシズ・オブ・プロ
テインズ・オブ・イミュノロジカル・インタレスト、ナショナル・インスティテ
ュート・オブ・ヘルス、ベセスダ、MD(1991)を参照されたい]。不変ド
メインは抗体の抗原への結合に直接関与している訳ではないが、抗体の抗体依存
細胞毒性への参加といったような様々なエフェクター機能を示す。
抗体のパパイン消化は、それぞれが1個の抗原結合部位を伴うFabフラグメ
ントと呼ばれる二つの等しい抗原結合フラグメント、および、その名称が容易に
結晶化する能力を反映している、残りの「Fc」フラグメントを生成する。ペプ
シン処理は、二つの抗原結合部位を持ち、なお抗原と架橋できるF(ab')2フラ
グメントを生成する。
「Fv」は、完全な抗原認識および結合部位を含む最小の抗体フラグメントで
ある。この領域は、緊密に非共有結合している1個の重鎖および1個の軽鎖可変
ドメインの二量体で構成されている。各可変ドメインの三つのCDRが相互作用
してVH−VL二量体表面の抗原結合部位を規定しているのはこのコンフィギュレ
ーションにおいてである。まとめると、6個のCDRが抗体に抗原結合特異性を
付与している。しかしながら、ただ一つの可変ドメイン(または、或る抗原に特
異的な3個のCDRのみを含むFvの半分)でさえ、結合部位全体より親和性は
低いものの、抗原を認識し結合する能力を持っている。
Fabフラグメントはまた、軽鎖の不変ドメインおよび重鎖の最初の不変ドメ
イン(CH1)を含んでいる。Fab'フラグメントは、抗体のヒンジ領域由来
の1またはそれ以上のシステインを含む数個の残基が重鎖CH1ドメインのカル
ボキシ末端に加わっている点でFabフラグメントと異なっている。Fab'−
SHは本明細書において、不変ドメインのシステイン残基が遊離チオール基を持
っているFab'の表記である。F(ab')2抗体フラグメントは元々、間にヒン
ジシステインを持っているFab'フラグメントの対として生成された。別の、
抗体フラグメントの化学的結合もまた知られている。
任意の脊椎動物種由来の抗体(免疫グロブリン)の軽鎖は、それらの不変ドメ
インのアミノ酸配列に基づいて、カッパおよびラムダ(λ)と呼ばれる極めて明
瞭な二つのタイプのうち一つに割り当てることができる。
重鎖の不変ドメインのアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンは異なるクラス
に割り当てることができる。五つの主要な免疫グロブリンのクラス:IgA、I
gD、IgE、IgGおよびIgM、があり、これらのうち幾つかはさらにサブ
クラス(イソタイプ)、例えばIgG−1、IgG−2、IgG−3、およびI
gG−4;IgA−1およびIgA−2、に分けることができる。免疫グロブリ
ンの異なるクラスに対応する重鎖不変ドメインは、それぞれα、デルタ、イプシ
ロン、γ、およびμと呼ばれる。免疫グロブリンの異なるクラスのサブユニット
構造および三次元コンフィギュレーションは良く知られている。
「抗体」という語は最も広い意味で用いられ、特に、単一のモノクローナル抗
体(アゴニストおよびアンタゴニスト抗体を包含する)、多エピトープ特異性を
有する抗体組成物、そして、それらが所望の生物活性を示す限り、抗体フラグメ
ント(例えばFab、F(ab')2およびFv)を包含する。
本明細書中使用される「モノクローナル抗体」という語は、実質上均質な抗体
の集団から得られた抗体、即ち、その集団を構成する個々の抗体が、少量存在し
得る天然に存在する可能な突然変異を除いては同一である抗体を指す。モノクロ
ーナル抗体は、極めて特異的であり、単一の抗原部位に対するものである。さら
に、典型的には異なる決定基(エピトープ)に対して作製される異なった抗体を
含む常套的(ポリクローナル)抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体
は抗原上の一つの決定基に対して作製されたものである。それらの特異性に加え
て、モノクローナル抗体は、他の免疫グロブリンにより汚染されていないハイブ
リドーマ培養によって合成されるという点で有利である。修飾語句「モノクロー
ナル」は、実質上均質な抗体の集団から得られる抗体の性格を示すものであり、
特定の方法によりその抗体を産生することを要求すると解してはならない。例え
ば、本発明に従って使用されるモノクローナル抗体は、コーラーおよびミルシュ
タイン、Nature、256巻495頁(1975)により最初に記載されたハイブ
リドーマ法により作製することができ、または、組換えDNA法により作製する
ことができる[例えば、米国特許第4816567号(キャビリー等)を参照さ
れたい]。
本明細書に記載のモノクローナル抗体は、それらが所望の生物活性を示す限り
、重および/または軽鎖の一部が特定の種から誘導されるまたは特定の抗体クラ
スもしくはサブクラスに属する抗体の対応配列と同一またはホモローガスである
が、一方、鎖の残部は、別の種から誘導されるまたは別の抗体クラスもしくはサ
ブクラスに属する抗体の対応配列と同一またはホモローガスである、「キメラ」
抗体(免疫グロブリン)および係る抗体のフラグメントを特に包含する[米国特
許第4816567号;キャビリー等;モリソン等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、
81巻6851−6855頁(1984)]。
非ヒト(例えばマウス)抗体の「ヒト化」型は、非ヒト免疫グロブリンから誘
導された最小の配列を含む、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはそ
のフラグメント(例えば、抗体の、Fv、Fab、Fab'、F(ab')2または
その他の抗原結合サブ配列)である。大抵は、ヒト化抗体は、受容者の相補性決
定領域(CDR)由来の残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウ
ス、ラットまたはウサギのようなヒト以外の種(ドナー抗体)のCDR由来の残
基により置き換えられている、ヒト免疫グロブリン(受容者抗体)である。幾つ
かの例では、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基が、対応する非ヒト
残基に置き換えられている。さらに、ヒト化抗体は、受容者抗体にも取り入れら
れたCDRまたはフレームワーク配列にも見いだされない残基を含み得る。これ
らの修飾は、抗体の挙動をさらに洗練および最適化するためになされる。一般に
、ヒト化抗体は、少なくとも1個、典型的には2個の可変ドメインの実質上全て
を含み、ここで、全てまたは実質上全てのCDR領域は非ヒト免疫グロブリンの
ものに対応し、全てまたは実質上全てのFR領域はヒト免疫グロブリン共通配列
のものである。ヒト化抗体は、最適には、免疫グロブリン不変領域(Fc)、典
型的にはヒト免疫グロブリンの不変領域の少なくとも一部をも含むであろう。さ
らなる詳細については、ジョーンズ等、Nature、321巻522−525頁[1
986];リーチマン等、Nature、332巻323−329頁[1988];お
よびプレスタ、Curr.Op.Struct.Biol.、2巻593−596頁[1992]を参
照されたい。
本発明の文脈中、「細胞」、「セルライン」、および「細胞培養」は互換的に
用いられ、係る表現は全て子孫を包含する。全ての子孫は、故意のまたは偶然の
突然変異のために、DNA含有量が厳密に同一ではないかも知れないということ
もまた理解される。最初に形質転換された細胞においてスクリーニングされたも
のと同じ機能または生物学的性質を有する突然変異体子孫が包含される。
「形質転換」とは、或る生物中にDNAを導入し、その結果そのDNAが染色
体外要素としてまたは染色体への統合によって複製可能となることを意味する。
「トランスフェクション」とは、コード化配列が実際に発現されるか否かに拘
わらず、宿主細胞による発現ベクターの取り込みを指す。
「形質転換された宿主細胞」および「形質転換された」という語は、細胞内へ
のDNAの導入を指す。この細胞は「宿主細胞」と呼ばれ、原核細胞でも真核細
胞でもよい。典型的な原核生物宿主細胞には、大腸菌の様々な菌株が包含される
。典型的な真核生物宿主細胞は、哺乳動物のもの、例えばチャイニーズハムスタ
ー卵巣細胞またはヒト胚腎臓293細胞である。導入されたDNAは通常、挿入
されたDNA断片を含むベクターの形をとっている。導入されたDNA配列は、
宿主細胞と同じ種由来、または宿主細胞とは異なる種由来であってよく、または
、
幾らかの外来および幾らかのホモローガスDNAを含むハイブリッドDNA配列
であってもよい。
「複製可能な発現ベクター」および「発現ベクター」という語は、その中に一片
の外来DNAを挿入した、通常二本鎖のDNA片を指す。外来DNAとは、宿主
細胞中に天然では見いだされないDNAである、ヘテロローガスなDNAとして
定義される。このベクターは、外来またはヘテロローガスDNAを適当な宿主細
胞中に運ぶために使用される。いったん宿主細胞に入ると、このベクターは宿主
染色体DNAとは独立して複製でき、該ベクターおよびその挿入された(外来)
DNAを数コピー作り出すことができる。さらに、このベクターはその外来DN
Aをポリペプチドに翻訳させるのに必要な要素を含んでいる。このようにして外
来DNAによりコードされているポリペプチドの分子が多数、迅速に合成される
。
「オリゴヌクレオチド」とは、既知の方法により化学合成される、短い一本鎖
または二本鎖のポリデオキシヌクレオチドである[例えば、ホスホトリエステル
、ホスファイト、またはホスホルアミダイト化学、EP266032(1988
年5月4日公開)に記載のような固相技術の使用、またはフレーラー等、Nucl.A
cids Res.、14巻5399頁(1986)に記載のようなデオキシヌクレオシ
ドH−ホスホナート中間体を介する]。これらはポリアクリルアミドゲル上で精
製される。
B.TRAFの同定および精製
天然TRAFポリペプチドは、TNFレセプター2型(TNF−R2)mRN
Aを有しこれを検出可能なレベルで発現することが知られている組織中に同定さ
れそしてこれから精製することができる。したがって、マウスTRAFは、例え
ばマウスインターロイキン2(IL−2)依存性細胞傷害TセルラインCT6か
ら取得することができる[レインジズ等、J.Immunol.、142巻1203−12
08頁(1989)]。マウスTRAF1はまた脾臓、肺および精巣から精製す
ることもでき、一方マウスTRAF2は、心臓、脳、脾臓、肺、肝臓、骨格筋、
腎臓および精巣を包含するさらに多様な組織から分離精製することができる(図
15bを参照されたい)。一般に、TRAF蛋白はTNF−R2を発現すること
が知られているヒト組織で発現されると予想されているが、このような組織が全
て、全TRAFを発現する訳ではない。これに代わり、TRAFポリペプチドは
、天然TNF−R2、またはTRAFとの相互作用に参加する細胞内ドメイン配
列を含むTNF−R2誘導体をコードしているDNAでトランスフェクトしたセ
ルラインから分離することもできる。天然TNF−R2の細胞内ドメインと関係
する因子は、それを発現する細胞から、レセプターまたはレセプター誘導体の免
疫沈降によって同定することができる。一般に免疫沈降は、もしTNF−R2が
膜に結合しているならば細胞を洗浄剤で溶解し、TNF−R2を抗TNF−R2
抗体に結合させ、抗体複合体を沈澱させ、沈澱を洗浄し、そして免疫複合体から
TNF−R2と関連因子とを分離する、ということを含む、多段階工程で構成さ
れる。次に、分離された因子を電気泳動法により分析することができる。好まし
い態様において、放射標識されたTNF−R2(または誘導体)を、プロテイン
A−アガロース(オンコジーン・サイエンス)またはプロテインA−セファロー
ス(ファルマシア)で免疫沈降させる。この場合、TNF−R2/抗TNF−R
2抗体免疫複合体は、アガロースまたはセファロースに結合したスタフィロコッ
カス・アウレウスのプロテインAにより沈澱する。次いでこの免疫沈降体を、用
いられた実際の放射標識に応じてオートラジオグラフィーまたはフルオログラフ
ィーにより分析する。TRAF蛋白(これはTNF−R2の細胞内ドメインと関
係する能力を特徴とする)は該レセプターまたはレセプター誘導体と共同沈降し
、親和カラム上での精製といったような当分野で既知の方法によってさらに精製
することができる。
TNF−R2の細胞内ドメインと関係する因子を精製するための大規模精製計
画は、D.B.スミスおよびK.S.ジョンソン、Gene、67巻31−40頁(1988
)に記載されるように、外来ポリペプチドを大腸菌中でグルタチオンS−トラン
スフェラーゼ(GST)のC末端との融合物として合成することを目的とするプ
ラスミド発現ベクターを利用する。TNF−R2の細胞内ドメインは大腸菌組換
え宿主細胞中でGSTとの融合蛋白として発現され、グルタチオン−アガロース
ビーズ(シグマ)上への吸着により、粗製の細菌溶解液から精製することができ
る。
次に、精製されるべき因子を含有する細胞溶解液をGST−TNF−R2融合蛋
白親和カラムに適用する。カラムに結合した蛋白(群)を溶離し、沈澱させ、そ
して還元条件下でSDS−PAGEにより分離し、そして銀染色によって可視化
する。GST遺伝子融合ベクター(pGEXベクター)ならびにGST融合系の
クローニングおよび発現のためのキットはファルマシアから市販品が入手できる
(ファルマシアカタログ、1994、133頁;および142−143頁を参照
されたい)。
精製された蛋白は、120A PTHアミノ酸分析機を装備したモデル470
Aアプライド・バイオシステムズ気相シークエンサーを用いて自動エドマン分解
により直接配列決定するか、または、種々の化学物質もしくは酵素で消化した後
に配列決定することができる。PTHアミノ酸はクロムパーフェクトのデータシ
ステムを用いて統合した(ジャスティス・イノヴェーションズ、パロアルト、C
A)。配列の解釈は、ヘンゼル等、J.Chromatography、404巻41頁(198
7)に記載のようにVAX 11/785ディジタル・イクイップメント・コー
ポレーションのコンピューター上で実施することができる。幾つかの場合には、
SDSポリアクリルアミドゲル上で電気泳動された溶出液をPVDF膜(プロブ
ロット、ABI、フォスターシティー、CA)に電気的に移し、クマシーブリリ
アントブル−R250(シグマ)で染色する。特異的な蛋白をN末端配列決定用
にブロットから切り取る。内部蛋白配列を決定するため、逆相毛管HPLCによ
り得られた精製画分を、典型的には減圧乾燥(スピードヴァク)し、適当な緩衝
液に再懸濁し、そして臭化シアンおよび/または種々のプロテアーゼ、例えばト
リプシン、リジン特異酵素Lys−C(ワコー・ケミカルズ、リッチモンド、V
A)またはAsp−N(ベーリンガー・マンハイム、インディアナポリス、In
d.)で消化する。消化後、得られたペプチドを混合物として配列決定するか、
HPLCにより分析する。
C.TRAFポリペプチドの組換え生産
好ましくは、TRAFポリペプチドは、TRAFポリペプチド核酸を発現する
ようトランスフェクトさせた(典型的には細胞を発現ベクターにより形質転換す
ることによる)細胞を培養し、そしてこの細胞からポリペプチドを回収すること
による、標準的組換え法によって製造する。しかし、TRAFポリペプチドは、
ホモローガスな組換えによって、または、TRAFポリペプチドをコードしてい
るDNAを既に含んでいる細胞中に導入された調節要素を利用する組換え生産法
によって生産し得るということが考えられる。例えば、強力なプロモーター/エ
ンハンサー要素、サプレッサー、または外因性転写調節要素を、所望のTRAF
ポリペプチドをコードしているDNAの転写に影響を与えるに十分な近さおよび
向きで、意図される宿主細胞のゲノムに挿入することができる。調節要素はTR
AFポリペプチドをコードしておらず、このDNAは宿主細胞ゲノムに固有のも
のである。次に、本発明に係るポリペプチドを作っている細胞、または所望によ
り増大もしくは低下した発現レベルについてスクリーニングする。
したがって、本発明は、TRAFポリペプチドをコードしている核酸を含む細
胞のゲノム中に転写調節要素を、その転写に影響を及ぼすに十分な該核酸分子に
対する近さおよび向きで挿入し、転写調節要素および核酸分子を含む細胞を培養
するさらなる工程を所望により伴う、TRAFポリペプチドを生産する方法を意
図するものである。本発明はさらに、宿主細胞により認識される外因性調節配列
と機能的に結合した固有のTRAFポリペプチド核酸分子を含む宿主細胞を意図
するものである。
1.TRAFポリペプチドをコードしているDNAの分離
本発明の目的のため、TRAFポリペプチドをコードしているDNAは、TN
Fレセプター2型(TNF−R2)mRNAを持ちこれを検出可能なレベルで発
現すると信じられる組織から調製されたcDNAライブラリーから得ることがで
きる。例えば、cDNAライブラリーは、TNF−R2を発現することが知られ
ているセルラインからポリアデニル化mRNAを取得し、そしてこのmRNAを
鋳型として使用し二本鎖cDNAを合成することによって組み立てることができ
る。この目的のために好適なヒトおよび非ヒトセルラインは上に列挙した。しか
しながら、TNF−R2は、TRAFファミリーの全ての成員が全てのTNF−
R2発現組織で発現される訳ではないにしても、全てTRAF cDNAの供給
源として働く可能性のある極めて多様なその他の組織で発現されることが知られ
ている。これに代わり、新たなTRAFポリペプチドをコードしているDNAを
、かつて同定されたTRAFポリペプチドが検出可能レベルで発現されることが
知られている組織から調製されたcDNAライブラリーから取得することができ
る。TRAFポリペプチド遺伝子はまた、ゲノムライブラリー、例えばヒトゲノ
ムコスミドライブラリーから取得することができる。
cDNAまたはゲノムいずれかのライブラリーは、目的遺伝子またはそれによ
りコードされている蛋白を同定するよう設計されたプローブでスクリーニングす
る。cDNA発現ライブラリーのためには、好適なプローブはTRAFポリペプ
チドを認識しこれに特異的に結合するモノクローナルおよびポリクローナル抗体
を包含する。cDNAライブラリーのためには、好適なプローブは、同じまたは
異なる種由来のTRAFポリペプチドの既知のまたは予想される部分をコードし
ている、注意深く選択されたオリゴヌクレオチドプローブ(通常約20−80塩
基長)、および/または同じまたは類似遺伝子をコードしている相補的または相
同的cDNAまたはそのフラグメントを包含する。ゲノムDNAライブラリーを
スクリーニングするための適当なプローブは、オリゴヌクレオチド、cDNA、
または同じもしくは類似の遺伝子をコードしているそのフラグメント、および/
またはホモローガスなゲノムDNAもしくはそのフラグメントを包含するが、こ
れらに限定される訳ではない。選ばれたプローブによるcDNAまたはゲノムラ
イブラリーのスクリーニングは、サムブルック等、モレキュラー・クローニング
:ア・ラボラトリー・マニュアル、ニューヨーク、コールド・スプリング・ハー
バー・ラボラトリー・プレス、1989、の10−12章に記載されるような標
準法を用いて実施することができる。
本発明を実施する好ましい方法は、注意深く選択されたオリゴヌクレオチド配
列を用いて種々の組織由来のcDNAライブラリーをスクリーニングすることで
ある。プローブとして選択されたオリゴヌクレオチド配列は、十分な長さがあり
、且つ偽陽性を最小限とするに十分明確でなければならない。実際のヌクレオチ
ド配列(群)は通常、コドンの重複が最小であるTRAFの領域を元に設計され
る。このオリゴヌクレオチドは、1またはそれ以上の位置で縮重していてよい。
縮重オリゴヌクレオチドの使用は、或るライブラリーが、優先的コドンの使用が
知られていない種からスクリーニングされる場合、特に重要である。
このオリゴヌクレオチドは、スクリーニングされるライブラリー中のDNAと
ハイブリダイズする時に検出できるよう、標識しなければならない。好ましい標
識方法は、ATP(例えば、γ32P)およびポリヌクレオチドキナーゼを用いて
オリゴヌクレオチドの5'末端を放射標識することである。しかしながら、ビオ
チニル化または酵素標識化を包含するその他の方法を用いてオリゴヌクレオチド
を標識することもできるが、これらに限定される訳ではない。
TRAFをコードしているcDNAはまた、直接発現クローニングまたは米国
特許第4683195号(1987年7月28日登録)、サムブルック等、モレ
キュラー・クローニング:ア・ラボラトリー・マニュアル、第二版、コールド・
スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク、1989、14
項、またはカレント・プロトコルズ・イン・モレキュラー・バイオロジー、15
章、アウスベル等編、グリーン・バブリッシング・アソシエイツおよびウィレイ
−インターサイエンス、1991に記載のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)の使
用によるような、その他の既知の組換えDNA技術によって同定および分離する
こともできる。この方法は、TRAFをコードしているDNAとハイブリダイズ
するオリゴヌクレオチドプローブを使用する必要がある。
本発明を実施するための好ましい方法によれば、TRAF蛋白のためのコード
化配列を、これらがTNF−R2の細胞内ドメインと相互作用する能力に基づき
、組換えcDNAライブラリーまたはゲノムDNAライブラリー中で同定するこ
とができる。この目的のためには、フィールズおよび共同研究者により記載され
た酵母遺伝子系[フィールズおよびソング、Nature(London)、340巻245−
246頁(1989);チエン等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、88巻9578−
9
582頁(1991)]を、シェヴレイおよびナタンス[Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA、89巻5789−5793頁(1991)]により開示されたように使用す
ることができる。酵母GAL4のような多くの転写アクティベーターは二つの物
理的に別個のモジュールドメインで構成され、一方はDNA結合ドメインとして
作用し、他方は転写活性化ドメインとして機能する。前記刊行物に記載の酵母発
現系(一般に「二ハイブリッド系」と称される)はこの性質を利用し、そして、
一方では標的蛋白がGAL4のDNA結合ドメインと融合し他方では候補活性化
蛋白が活性化ドメインと融合する、二ハイブリッド蛋白を使用する。GAL4−
活性化されたプロモーターの調節下にあるGAL1−lacZリポーター遺伝子
の発現は、蛋白−蛋白相互作用を介したGAL4活性の再構築に依存している。
相互作用しているポリペプチドを含むコロニーは、β−ガラクトシダーゼのため
の色素生成基質で検出する。二ハイブリッド技術を用いて二つの特異的蛋白間の
蛋白−蛋白相互作用を同定するための完全なキット(マッチメーカー(商標))
がクロンテクから市販されており入手できる。この系はさらに拡大して、特異的
蛋白相互作用に関与する蛋白ドメインの地図作成およびこれらの相互作用に必須
なアミノ酸残基の正確な指摘を行うことができる。
TNF−R2の細胞内ドメインと関係する蛋白をコードしている遺伝子を直接
分離するために、TNF−R2細胞内ドメインをコードしているDNAまたはそ
のフラグメントをGAL4のDNA結合ドメインをコードしているDNAを含む
ベクター中にクローニングする。次に、GAL4転写活性化ドメインをコードし
ているDNAを含むベクターに、候補因子をコードしている二本鎖cDNAをク
ローニングすることによって、プラスミドcDNAライブラリーを組み立てる。
その後、リポーター遺伝子を含んでいる酵母細胞を、TNF−R2−GAL4
DNA結合ドメインベクターおよびライブラリープラスミドDNAで同時形質転
換する。典型的には、二つのリポーター遺伝子:lacZ(βgal)およびH
is遺伝子を含んでいるS.セレヴィシアエ細胞が、同時形質転換のための宿主と
して働く。トリプトファン、ロイシンおよびヒスチジンを欠く補足合成デキスト
ロース培地上に蒔くことにより酵母形質転換体を選択し、蛋白−蛋白相互作用を
、
シェヴレイおよびナタンス、上記、の記載と本質上同様にして、酵母コロニーフ
ィルターβ−ガラクトシダーゼ検定により監視する。蛋白−蛋白相互作用を伴う
コロニーのみがhisプレート上で生育し、次いでさらなる対照としてのβ−g
alについて分析する。
一つの種からTRAFをコードしているcDNAが分離されたなら、種間ハイ
ブリダイゼーションによって他の種からもcDNAを得ることができる。このア
プローチに従い、ヒトまたは他の哺乳動物のcDNAまたはゲノムライブラリー
を、既知の基準(その中には、当該配列は十分な長さがあり且つ偽陽性を最小限
とするに十分明確であるということがある)に合致して既知のTRAF配列(例
えば本出願に開示されるマウスTRAF1およびTRAF2)から選択された標
識化オリゴヌクレオチド配列によりプロービングする。典型的には、特にそのオ
リゴヌクレオチドがメチオニンまたはトリプトファンに相当する1またはそれ以
上のコドンを含む場合、約30ないし50塩基を有する32P標識化オリゴヌクレ
オチドで十分である。分離された核酸は、核酸の供給源由来の他のポリペプチド
をコードしている夾雑核酸から分離同定されているDNAであろう。
配列がわかったならば、特定のTRAFポリペプチドをコードしている遺伝子
もまた、エンゲルスおよびアールマン、Angew.Chem.Int.Ed.Engl.、28巻71
6頁(1989)に記載の方法の一つに従い、化学合成によって取得することが
できる。これらの方法には、トリエステル、ホスファイト、ホスホルアミダイト
およびH−ホスホナート法、PCRおよびその他の自己プライマー法、ならびに
固体支持体上でのオリゴヌクレオチド合成が包含される。
2.天然TRAF蛋白またはフラグメントのアミノ酸配列変異体
天然TRAFおよびTRAFフラグメントのアミノ酸配列変異体は、天然また
は変異体TRAF DNA中に適当なヌクレオチド変化を導入することにより、
または、所望ポリペプチドのインビトロ合成により、当分野で既知の方法によっ
て製造される。アミノ酸配列変異体の組み立てには二つの主要な変数:突然変異
部位の位置および突然変異の性質がある。TRAFをコードしているDNA配列
の操作を必要としない、天然に存在する対立遺伝子(アレル)を除いて、TRA
Fのアミノ酸配列変異体は、好ましくは、対立遺伝子または天然に存在しないア
ミノ酸配列変異体に到達するために該DNAを突然変異させることにより組み立
てる。
突然変異の一つの群は、TNF−R2、CD40またはLMP1の細胞内ドメ
インとの相互作用に関与すると同定されているドメインもしくはドメイン群の内
部に作られるであろう。NF−κB活性化のシグナル伝達の能力を低下させまた
は排除しつつ、TNF−R2、CD40またはLMP1との関係(結合または間
接的な関係)を促進するよう、そして/または結合能を保持するように突然変異
したTRAF変異体は、天然TNF−R2、CD40またはLMP1蛋白により
仲介される天然の生物活性のインヒビターとして有用であろう。さらに、係る変
異体は、これらの蛋白の過剰発現に伴う病的状態の診断に、そしてTNF−R2
、CD40またはLMP1の精製に有用であろう。このような突然変異の標的は
、TRAF2および関連因子のN末端RINGフィンガードメインであるが、こ
れは、このドメインがTNF−R2の細胞内ドメインとの相互作用に関与すると
信じられているためである。このようなTRAF2変異体の典型的な代表は、天
然TRAF2のN末端フィンガードメインを欠く突然変異体TRAF2蛋白であ
る(TRAF2(87−501))。この変異体はTNF−R2、CD40、T
RAF1およびTRAF2と相互作用する能力を保持しているが、NF−κB活
性化のシグナル伝達の点で全く不完全である。TRAF−TNF−R2/CD4
0/LMP1生物活性のインヒビターとして働くその他のTRAFアミノ酸配列
変異体は、例えば、下に記載される生化学的スクリーニング検定により同定する
ことができる。
突然変異のもう一つの群は、他のTNF−R2関連因子との相互作用に関与す
る領域内で実施されるであろう。即ち、TRAF1、TRAF2およびTRAF
ファミリーの他の因子のホモローガスなC末端ドメイン(蛋白二量体化モチーフ
)内部でのアミノ酸変化は、TNF−R2レセプターによるシグナル伝達に必要
な安定な二量体を形成させるこのような因子の能力を亢進することができる。
これに代わり、またはこれに加えて、アミノ酸変化は、達成すべき目標に応じ
て、様々な種由来のTRAF蛋白において相違している部位に、または高度に保
存された領域に施すことができる。
このような位置にある部位は、例えば(1)最初に同類アミノ酸選択肢で、次
いで、達成される結果に応じて、より過激な選択で置換することにより、(2)
標的残基または残基群を除去することにより、または、(3)存在する部位に隣
接して、同じまたは異なるクラスの残基を挿入することにより、または選択肢1
−3の組み合わせにより、典型的には連続して修飾することができる。
役に立つ一つの技術は「アラニンスキャニング」である[カニングハムおよび
ウェルズ、Science、244巻1081−1085頁(1989)]。ここでは
、或る残基または標的残基群を特定し、アラニンまたはポリアラニンによって置
き換える。次に、アラニン置換に対する機能的感受性を示すドメインを、アラニ
ン置換部位にまたは置換部位のためのさらなるまたはその他の置換を導入するこ
とによって改良する。
所望の突然変異を特定した後、TRAF変異体をコードしている遺伝子を、例
えば上記のような化学合成によって得ることができる。
より好ましくは、TRAFアミノ酸配列変異体をコードしているDNAは、先
に製造されたTRAFの変異体または非変異体をコードしているDNAの位置指
定突然変異生成によって製造される。位置指定(位置特異的)突然変異生成は、
安定な二本鎖を、区切られている除去連結点の両側に形成するに十分な大きさお
よび配列複雑性のプライマー配列を提供する、所望の突然変異のDNA配列をコ
ードしている特異的オリゴヌクレオチド配列、ならびに十分な数の隣接ヌクレオ
チドを使用することにより、TRAF変異体の生産を可能にする。典型的には、
約20ないし25ヌクレオチド長のプライマーが好ましく、その配列の連結点の
両側の約5ないし10残基が変化を受ける。一般に、位置特異的突然変異生成の
技術は、エーデルマン等、DNA、2巻183頁(1983)のような刊行物に例
示されるように、当分野で良く知られている。理解されるように、位置特異的突
然変異生成技術は、典型的には、一本鎖および二本鎖型の両方で存在するファー
ジベクターを使用する。位置指定突然変異生成に有用な典型的なベクターは、例
えばメシング等、サード・クリーヴランド・シンポジアム・オン・マクロモレキ
ュールズ・アンド・リコンビナント・DNA、A.ウォルトン編、エルセヴィア、
アムステルダム(1981)により開示されるようなM13ファージのようなベ
クターを包含する。このおよびその他のファージベクターは市販品が入手可能で
あり、それらの使用は当業者に良く知られている。M13から誘導されたベクタ
ーを使用するDNAフラグメントにおけるオリゴデオキシリボヌクレオチド指向
位置特異的突然変異の組み立てのための多用途の且つ有効な方法は、M.J.ゾラー
およびM.スミス、Nucleic Acids Res.、10巻6487−6500頁[1982
]により公開された。また、一本鎖ファージ複製起点を含むプラスミドベクター
[ヴェイラ等、Meth.Enzymol.、153巻3頁(1987)]を使用して一本鎖
DNAを得ることができる。別法として、適当なDNAフラグメントをインビト
ロで合成し、これを当分野で既知のPCR法により増幅することによってヌクレ
オチド置換が導入される。
一般に、この位置特異的突然変異生成は、最初に、関連する蛋白をコードして
いるDNA配列をその配列内部に含む一本鎖ベクターを取得することにより実施
される。例えばクレア等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、75巻5765頁(197
8)の方法により、一般的には合成により、所望の突然変異した配列を有するオ
リゴヌクレオチドプライマーを調製する。次にこのプライマーを、一本鎖の蛋白
配列含有ベクターとアニーリングし、大腸菌ポリメラーゼIクレノウフラグメン
トのようなDNA重合酵素を作用させて突然変異を有する鎖の合成を完成させる
。このようにして、一方の鎖が元の非突然変異配列をコードし、第二の鎖が所望
の突然変異を有する、ヘテロ二本鎖が形成される。次いでこのヘテロ二本鎖ベク
ターを用いてJP101細胞のような適当な宿主細胞を形質転換し、そして突然
変異した配列の配置を有する組換えベクターを含むクローンを選択する。その後
、突然変異した領域を除去し、蛋白産生のための適当な発現ベクター中に入れる
。
PCR技術をTRAFのアミノ酸配列変異体の作成に使用することもできる。
少量の鋳型DNAをPCRにおける出発物質として使用する場合、鋳型DNA中
の対応領域と僅かに配列が異なるプライマーを使用して、プライマーが鋳型と異
なる位置でのみ鋳型配列と異なっている特異的DNAフラグメントを比較的大量
に生成させることができる。プラスミドDNA中に突然変異を導入するためには
、プライマーの一方は突然変異の位置と部分重複し且つその突然変異を含むよう
設計し;他方のプライマーの配列は、そのプラスミドの反対の鎖の配列一つなが
りと同一でなければならないが、この配列はプラスミドDNAのどこに位置して
もよい。しかしながら、第二のプライマーの配列は、プライマーにより境界を与
えられるDNAの増幅された領域全体が最終的に容易に配列決定されるよう、第
一プライマーの配列の200ヌクレオチド以内に位置させるのが好ましい。今記
載したようなプライマー対を用いるPCR増幅は、プライマーにより特定される
突然変異の位置で、そして鋳型の複製は多少誤りが起こり易いのであるいはその
他の位置で相違するDNAフラグメントの集団を生成する。
生成物に対する鋳型の比が極端に低い場合、生成物のDNAフラグメントの大
多数に所望の突然変異(群)が組み込まれる。この生成物は、標準的DNA技術
を用いて、PCR鋳型として働いたプラスミド中の対応領域を置き換えるのに使
用される。別々の位置にある突然変異は、突然変異体第二プライマーを使用する
ことにより、または、異なる突然変異体プライマーによる第二のPCRを行い、
得られた二つのPCRフラグメントを三部(またはそれ以上の)ライゲーション
でベクターフラグメントに同時にライゲーションすることによって同時に導入す
ることができる。
PCR突然変異生成の特別な例においては、プラスミドDNA中の増幅される
領域の外に特異な認識部位を有する制限エンドヌクレアーゼで消化することによ
り、鋳型プラスミドDNA(1μg)を線状化する。この物質から100ngを
、4種のデオキシヌクレオチド三燐酸を含有しジーンアンプ(商標)キット(パ
ーキン−エルマー・シータス、ノルウォーク、CTおよびエメリーヴィル、CA
、より入手)に含まれるPCR緩衝液、および各オリゴヌクレオチドプライマー
25pmoleを含有するPCR混合物に加え、最終容量50μlとする。この
反応混合物を鉱油35μlに積層する。反応を100℃で5分間変性させ、短時
間氷上に置き、次いで鉱油層の下にサーマス・アクアティクス(Taq)DNA
ポ
リメラーゼ1μl(5単位/l、パーキン−エルマー・シータス、ノルウォーク
、CTおよびエメリーヴィル、CAより購入)を添加する。次いでこの反応混合
物を、以下のようにプログラムしたDNAサーマル・サイクラー(パーキン−エ
ルマー・シータスより購入)中に入れる:
55℃2分間、
72℃30秒間、次いで以下を19サイクル:
94℃30秒間、
55℃30秒間、そして
72℃30秒間。
このプログラムの終了時に反応バイアルをサーマルサイクラーから取り出し、
水相を新しいバイアルに移し、フェノール/クロロホルム(50:50容量)で
抽出し、そしてエタノール沈澱させ、DNAを標準法により回収する。この物質
を、続いてベクターへの挿入のための適当な処理に付す。
変異体を製造するためのもう一つの方法、カセット突然変異生成は、ウェルズ
等[Gene、34巻315頁(1985)]により記載された技術に基づく。出発
物質は、突然変異させようとするTRAF DNAを含むプラスミド(またはベ
クター)である。突然変異させるべきTRAF 内のコドンを特定する。特定さ
れた突然変異部位の両側には特異な制限エンドヌクレアーゼ部位がなければなら
ない。このような制限部位が存在しない場合は、それらをTRAF DNAの適
当な位置に導入するための上記オリゴヌクレオチド仲介突然変異生成法を用いて
、それらを作り出すことができる。制限部位がプラスミド中に導入された後、こ
のプラスミドをこれらの部位で切断して線状化する。制限部位間のDNAの配列
をコードしており所望の突然変異を含んでいる二本鎖オリゴヌクレオチドを標準
法を用いて合成する。2本の鎖を別々に合成し、次いで標準技術を用いてハイブ
リダイズする。この二本鎖オリゴヌクレオチドをカセットと称する。このカセッ
トは、プラスミドに直接ライゲーションできるよう、線状化されたプラスミドの
末端と適合する3'および5'末端を有するよう設計される。その結果このプラス
ミドは突然変異したTRAF DNA配列を含むことになる。
さらに、いわゆるファージミドディスプレー法は、天然もしくは変異体TRA
Fのアミノ酸配列変異体またはそれらのフラグメントの作成に有用であるかも知
れない。この方法は、(a)突然変異すべきレセプターをコードしている第一の
遺伝子、天然または野生型ファージコート蛋白の少なくとも一部をコードしてい
る第二の遺伝子(ここで第一および第二の遺伝子はヘテロローガスである)、お
よび第一および第二の遺伝子と機能的に結合している転写調節要素からなる複製
可能な発現ベクターを組み立て、それにより融合蛋白をコードしている遺伝子融
合物を形成させ;(b)このベクターを第一遺伝子内の1またはそれ以上の選択
された位置で突然変異させ、それにより関連するプラスミドのファミリーを形成
させ;(c)このプラスミドで適当な宿主細胞を形質転換し;(d)この形質転
換した宿主細胞を、ファージコート蛋白をコードしている遺伝子を有するヘルパ
ーファージに感染させ;(e)この形質転換し感染した宿主細胞を、少なくとも
該プラスミドの一部を含む組換えファージミド粒子を形成するのに好適であり且
つ宿主を形質転換させることのできる条件下で(この条件は、ごく少量のファー
ジミド粒子がその粒子表面に1コピー以上の融合蛋白を表示するように調節する
)培養し;(f)このファージミド粒子を適当な抗原と接触させて、ファージミ
ド粒子の少なくとも一部がその抗原と結合するようにさせ;そして、(g)結合
しているファージミド粒子を結合していないものと分離する、ことを含む。(d
)から(g)までは、1回またはそれ以上反復することができる。好ましくはこ
の方法において、プラスミドは転写調節要素の厳密な制御下にあり、培養条件は
、粒子表面に1コピー以上の融合蛋白を表示しているファージミド粒子の量また
は数が約1%未満であるよう調節する。また、好ましくは、1コピー以上の融合
蛋白を表示しているファージミド粒子の量は、1コピーの融合蛋白を表示してい
るファージミド粒子の量の10%未満である。最も好ましくは、その量は20%
未満である。この方法において典型的には、発現ベクターはさらに、該ポリペプ
チドの各サブユニットをコードしているDNAと融合した分泌シグナル配列を含
み、転写調節要素はプロモーター系であろう。好ましいプロモーター系は、la
cZ、λPL、tac、T7ポリメラーゼ、トリプトファン、およびアルカリホス
ファタ
ーゼプロモーターならびにこれらの組み合わせから選択される。また、通常この
方法は、M13K07、M13R408、M13−VCS、およびPhiX17
4から選ばれるヘルパーファージを使用するであろう。好ましいヘルパーファー
ジはM13K07であり、好ましいコート蛋白はM13ファージ遺伝子IIIコー
ト蛋白である。好ましい宿主は大腸菌、および大腸菌のプロテアーゼ欠失株であ
る。
前記の内容のさらなる詳細および類似の突然変異生成技術は、例えばサムブル
ック等、上記、およびカレント・プロトコルズ・イン・モレキュラー・バイオロ
ジー、アウスベル等編、上記、といったような一般的教科書に見いだされる。
天然に存在するアミノ酸は、共通する側鎖の性質に基づく群に分けられる:
(1)疎水性:ノルロイシン、met、ala、 val、leu、ile;
(2)中性疎水性:cys、ser、thr;
(3)酸性:asp、glu;
(4)塩基性:asn、gln、his、lys、arg;
(5)鎖の向きに影響する残基:gly、pro;および、
(6)芳香族:trp、tyr、phe。
同類置換は一つの群の中の或る成員を同じ群の中の別の成員に交換することを
含み、これに対して非同類置換は、これらのクラスのうち或るものの成員を別の
ものの成員に交換することを必要とする。非同類置換によって得られる変異体は
、得られる変異体の生物学的性質/機能に有意な変化を産むと予想され、TRA
F変異体が独占的にまたは主としてTNF−R2により仲介される場合、TNF
生物活性を遮断するTRAF変異体をもたらし得る。様々な種間で、そして/ま
たはTRAFファミリーの様々なレセプター間で保存されているアミノ酸位置は
、一般に、目標が生物学的機能の保持である場合、相対的に保存的に置換されて
いる。
アミノ酸配列の除去は一般に約1から30残基まで、より好ましくは約1ない
し10残基の範囲であり、典型的には隣接している。除去はTNF−R2細胞内
ドメインとの相互作用に直接関与しない領域中に導入することができる。
アミノ酸配列の挿入は、長さが1残基から100またはそれ以上の残基を含む
ポリペプチドまでの範囲のアミノおよび/またはカルボキシ末端融合、ならびに
単一もしくは複数アミノ酸残基の配列内挿入を包含する。配列内挿入(即ち、T
RAF蛋白アミノ酸配列内部への挿入)は一般に、約1ないし10残基、より好
ましくは1ないし5残基、最も好ましくは1ないし3残基の範囲であり得る。末
端挿入の例には、細菌組換え細胞培養中での直接発現の所産である、N末端メチ
オニン残基を有するTRAFポリペプチド、および、組換え宿主細胞からの成熟
TRAFの分泌を促進させるための、TRAF分子のN末端へのヘテロローガス
なN末端シグナル配列の融合が包含される。このようなシグナル配列は一般に、
意図される宿主細胞の種から得られ、従ってこれとホモローガスであろう。好適
な配列には、大腸菌のためのSTIIまたはlpp、酵母のためのα因子、および
哺乳動物細胞のためのヘルペスgDのようなウイルスシグナルが包含される。
天然TRAF分子のその他の挿入変異体は、免疫原性ポリペプチド、例えば細
菌性ポリペプチド、例えばβラクタマーゼまたはE.coli trp遺伝子座
によりコードされている酵素、または酵母蛋白への、TRAF分子のNまたはC
末端の融合、および、1989年4月6日公開のWO89/02922に記載の
、半減期の長い蛋白、例えば免疫グロブリン領域(好ましくは免疫グロブリン不
変領域)、アルブミン、またはフェリチンを用いたC末端融合を包含する。
変異体TRAFの性質を前もって予測することはしばしば困難であるため、最
適な変異体を選択するためにスクリーニングを必要とすることは理解できるであ
ろう。この目的のため、下記のような生化学的スクリーニング検定が容易に利用
できるであろう。
天然TRAF2蛋白の好ましいアミノ酸配列変異体は天然蛋白のアミノ酸87
−501を含み、TRAF2(87−501)と呼称される。RINGフィンガ
ードメインを欠くこの変異体は、TNF−R2、CD40およびLMP1と相互
作用する能力を保持するが、NF−κB活性化のシグナル伝達においては全く不
完全である。
3.クローニング伝達体中へのDNAの挿入
天然または変異体TRAFをコードしている核酸が得られたならば、一般に、
さらなるクローニング(DNAの増幅)のためまたは発現のためにこれを複製可
能な発現ベクター中にライゲーションする。
発現およびクローニングベクターは、当分野で良く知られており、そのベクタ
ーを1またはそれ以上の選ばれた宿主細胞中で複製することを可能にする核酸を
含んでいる。適当なベクターの選択は、1)それがDNA増幅に使用されるのか
またはDNA発現に使用されるのか、2)ベクター中に挿入されるDNAの大き
さ、および、3)ベクターにより形質転換される宿主細胞、に依存するであろう
。各々のベクターは、その機能(DNAの増幅またはDNAの発現)およびそれ
が適合する宿主細胞に応じて様々な構成成分を含んでいる。ベクターの構成成分
は一般に、1またはそれ以上の以下のもの:シグナル配列、複製起点、1または
それ以上のマーカー遺伝子、エンハンサー要素、プロモーター、および転写終止
配列を含むが、これらに限定される訳ではない。
(i)シグナル配列成分
一般に、シグナル配列はベクターの構成成分であってよく、またはこれは、ベ
クター中に挿入されるTRAF分子の一部であってよい。シグナル配列がヘテロ
ローガスである場合、それは宿主細胞によって認識され且つ処理される(即ちシ
グナルペプチダーゼにより開裂される)ように選択せねばならない。
TRAF分子は細胞内蛋白であるため、これらは天然シグナル配列を持ってい
そうにない。原核生物宿主細胞に好適なヘテロローガスなシグナル配列は、例え
ばアルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、lpp、または熱安定性エンテロ
トキシンIIリーダーのような原核生物シグナル配列である。酵母の分泌のために
は、酵母インベルターゼ、α因子、または酸ホスファターゼリーダーを使用する
ことができる。哺乳動物細胞の発現においては哺乳動物シグナル配列が適当であ
る。
(ii)複製起点成分
発現およびクローニングベクターの両者は、そのベクターを1またはそれ以上
の選ばれた宿主細胞で複製できるようにする核酸配列を含んでいる。一般に、ク
ローニングベクターにおいては、この配列は、そのベクターを宿主染色体とは独
立して複製できるようにする配列であって、複製起点または自立的複製配列を含
む。このような配列は様々な細菌、酵母、およびウイルスについて良く知られて
いる。周知のプラスミドpBR322由来の複製起点は殆どのグラム陰性菌に適
しており、2μプラスミド起点は酵母に適しており、そして様々なウイルス起点
(SV40、ポリオーマ、アデノウイルス、VSVまたはBPV)が哺乳動物細
胞におけるクローニングベクターに有用である。複製起点は哺乳動物の発現ベク
ターには必要ない(SV40起点は、それが初期プロモーターを含むという理由
でのみ典型的に使用され得る)。殆どの発現ベクターは「シャトル」ベクターで
あり、即ちこれらは少なくとも一つのクラスの生物で複製可能であるが、発現の
ため別の生物中にトランスフェクトすることができる。例えば、或るベクターは
大腸菌中でクローニングされ、次いでその同じベクターが、たとえそれが宿主細
胞染色体と独立して複製できなくても、発現のため酵母または哺乳動物細胞中に
トランスフェクトされる。
DNAは宿主ゲノム中への挿入によってクローニングすることもできる。これ
は、バシルス種を宿主に用いて、例えば、バシルスゲノムDNA中に見いだされ
る配列に相補的なDNA配列を該ベクターに含ませることによって容易に達成さ
れる。このベクターによるバシルスのトランスフェクションは、ゲノムによるホ
モローガスな組換えおよび所望のヘテロローガスポリペプチドをコードしている
DNAの挿入をもたらす。しかし、ゲノムDNAの回収は、コードされているポ
リペプチド分子の切除に制限酵素消化を必要とするため、外因性複製ベクターの
回収より複雑である。
(iii)選択遺伝子成分
発現およびクローニングベクターは、選択マーカーとも呼ばれる選択遺伝子を
含んでいなければならない。これは、ベクターにより形質転換された宿主細胞の
生存または生育に必要な蛋白をコードしている遺伝子である。この遺伝子の存在
は、該ベクターを欠失する任意の宿主細胞が、形質転換された宿主を上回る生育
または再生の点での利点を獲得しないことを確実にする。典型的な選択遺伝子は
、
(a)抗生物質またはその他の毒素、例えばアンピシリン、ネオマイシン、メソ
トレキサート、またはテトラサイクリンに対する耐性を付与し、(b)栄養要求
性突然変異体の欠失を補完し、または(c)複合培地から得られない重要な栄養
素を供給する、蛋白をコードしている(例えばバシルスのためのD−アラニンラ
セマーゼをコードしている遺伝子)。
選択計画の一例は、宿主細胞の生育を停止させる薬物を利用する。ヘテロロー
ガスな遺伝子によってうまく形質転換された細胞は、薬物耐性を付与する蛋白を
発現し、よって選択処方中で生き残る。このような顕著な選択の例は、薬物ネオ
マイシン[サザン等、J.Molec.Appl.Genet.、1巻327頁(1982)]、ミ
コフェノール酸[ミュリガン等、Science、209巻1422頁(1980)]
またはハイグロマイシン[サグデン等、Mol.Cell.Biol.、5巻410−413頁
(1985)]を使用する。上に挙げた3つの例は、細菌遺伝子を真核生物の調
節の下で使用して、それぞれ適当な薬物G418またはネオマイシン(ジェネテ
ィシン)、xgpt(ミコフェノール酸)、またはハイグロマイシンに対する耐
性を伝達する。
哺乳動物細胞のためのその他の好適な選択マーカーの例は、ジヒドロ葉酸レダ
クターゼ(DHFR)またはチミジンキナーゼである。このようなマーカーは、
所望の核酸の取り込みについてコンピテントな細胞の同定を可能にする。哺乳動
物細胞形質転換体を、マーカーを取り込んだために形質転換体のみが特異に適合
して生き残るという選択圧の下に置く。培地中の選択薬物の濃度を連続的に変化
させる条件の下で形質転換体を培養することによって選択圧を課し、それにより
選択遺伝子および所望ポリペプチドをコードしているDNAの両者の増幅を導く
。増幅は、生育に必須の蛋白の産生にとって極めて重要な遺伝子が、連続する世
代の組換え細胞の染色体内部で縦に反復される工程である。増幅されたDNAか
ら、増加した量の所望ポリペプチドが合成される。
例えば、ヒポキサンチン、グリシン、およびチミジンを欠く培地中で全形質転
換体を培養することにより、DHFR選択遺伝子により形質転換された細胞をま
ず同定する。この場合の適当な宿主細胞は、ウアラウプおよびチェイシン、Proc
.Nat'l.Acad.Sci.USA、77巻4216頁(1980)による記載のように調製
され増殖される、DHFR活性を欠失するチャイニーズハムスター卵巣(CHO
)セルラインである。特に有用なDHFRは、MTXに対し高度に耐性である突
然変異体DHFRである(EP117060)。この選択薬剤は、内因性DHF
Rの存在にも拘わらず、その他の点で適当な任意の宿主、例えばATCC No
.CCL61 CHO−K1と共に使用することができる。次に、DHFRおよ
び所望ポリペプチドをそれぞれコードしているDNAを、DHFRを失活させる
薬物(メソトレキサート、またはMTX)に暴露することにより、増幅する。次
の回に常により高濃度のMTX中で生育できる細胞のみを選択することにより、
その細胞がより多くのDHFRを必要とする(その結果全ての外因性DNAが増
幅する)ことが確実になる。別法として、所望ポリペプチド、野生型DHFR、
およびneo遺伝子のような別の選択マーカーをコードしている遺伝子により同
時形質転換された宿主を、G418のようなその選択マーカーのための選択薬剤
を用いて同定し、次いで内因性DHFRを含む野生型宿主においてメソトレキサ
ートを用いて選択および増幅することができる。[米国特許第4965199号
を参照されたい]。
酵母での使用に好適な選択遺伝子は、酵母プラスミドYRp7中に存在するt
rp1遺伝子である[スティンチコウム等、Nature、282巻39頁(1979
);キングズマン等、Gene、7巻141頁(1979);またはチェンパー等、
Gene、10巻157頁(1980)]。trp1遺伝子は、トリプトファン中で
生育する能力を欠く酵母の突然変異株、例えばATCC No.44076また
はPEP4−1のための選択マーカーを提供する[ジョーンズ、Genetics、85
巻12頁(1977)]。そうすると、酵母宿主細胞ゲノム中のtrp1損傷の
存在が、トリプトファン不在下での生育による形質転換の検出のための有効な環
境を提供する。同様に、Leu2欠失酵母株(ATCC No.20622また
は3
8626)は、Leu2遺伝子を有する既知のプラスミドによって補完される。
(iv)プロモーター成分
クローニングベクターと異なり発現ベクターは、宿主生物により認識され且つ
所望ポリペプチドをコードしている核酸と機能的に結合しているプロモーターを
含んでいなければならない。プロモーターは、構造遺伝子の開始コドンの上流に
位置する(一般に約100ないし1000bp以内)翻訳されない配列であって
、それらの調節下にある核酸の転写および翻訳を調節する。これらは典型的には
二つのクラス、誘導性および構成性に分類される。誘導性プロモーターは、培養
条件の何らかの変化、例えば或る栄養素の存在もしくは不在、または温度の変化
に応答したそれらの調節の下で、DNAからの増強されたレベルの転写を開始す
るプロモーターである。現時点において、可能性ある様々な宿主細胞により認識
される多数のプロモーターが良く知られている。これらのプロモーターは、制限
酵素消化によりそれらを供給源の遺伝子から取り出し、その後、発現されるべき
ポリペプチドのための開始コドンの5'に挿入することにより、所望ポリペプチ
ドをコードしているDNAと機能的に結合させる。TRAFポリペプチドのため
のゲノムプロモーターは使用できないとは言えない。しかし、一般にヘテロロー
ガスなプロモーターは、天然TRAFプロモーターと比較してより多くの転写お
よび高収量の発現TRAFをもたらすであろう。
原核生物宿主と共に使用するのに好適なプロモーターには、β−ラクタマーゼ
およびラクトースプロモーター系[チャング等、Nature、275巻615頁(1
978);およびゲッデル等、Nature、281巻544頁(1979)]、アル
カリホスファターゼ、トリプトファン(trp)プロモーター系[ゲッデル、Nu
cleic Acids Res.、8巻4057頁(1980)およびEPO出願公開第367
76号]およびtacプロモーターのようなハイブリッドプロモーター[H.デボ
ーア等、Proc.Nat'l.Acad.Sci.USA、80巻21−25頁(1983)]が包含
される。しかしながら、他の既知の細菌プロモーターもまた好適である。これら
のヌクレオチド配列は公表されており、それによって当業者は、必要な制限部位
を供給するリンカーまたはアダプターを使用して、TRAFをコードしているD
NAにそれらを機能的にライゲーションすることができる[ジーベンリスト等、
Cell、20巻269頁(1980)]。細菌系に使用するためのプロモーターは
さらに、TRAFをコードしているDNAに機能的に結合したシャイン−ダルガ
ルノ(S.D.)配列をも含んでいるであろう。
酵母宿主と共に使用するための好適なプロモーター配列は、3−ホスホグリセ
ラートキナーゼ[ヒッツェマン等、J.Biol.Chem.、255巻2073頁(198
0)]またはその他の解糖酵素[ヘス等、J.Adv.Enzyme Reg.、7巻149頁(
1978);およびホランド、Biochemistry、17巻4900頁(1978)]
、例えばエノラーゼ、グリセルアルデヒド−3−燐酸デヒドロゲナーゼ、ヘキソ
キナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、グルコー
ス−6−燐酸イソメラーゼ、3−ホスホグリセラートムターゼ、ピルビン酸キナ
ーゼ、トリオース燐酸イソメラーゼ、ホスホグルコースイソメラーゼ、およびグ
ルコキナーゼのためのプロモーターを包含する。
増殖条件により転写が調節されるというさらなる利点を有する誘導性プロモー
ターである、その他の酵母プロモーターは、アルコールデヒドロゲナーゼ2、イ
ソチトクロムC、酸ホスファターゼ、窒素代謝に関連する分解酵素、メタロチオ
ネイン、グリセルアルデヒド−3−燐酸デヒドロゲナーゼ、ならびにマルトース
およびガラクトース利用を司る酵素のプロモーター領域である。酵母の発現で用
いられる好適なベクターおよびプロモーターは、R.ヒッツェマン等、EP736
57Aにさらに記載されている。酵母のエンハンサーもまた酵母プロモーターと
共に有利に使用される。
真核生物のためのプロモーター配列が知られている。実際全ての真核生物遺伝
子は、転写が開始される部位からおよそ25ないし30塩基上流に位置するAT
に富む領域を持っている。多くの遺伝子の転写開始位置から70ないし80塩基
上流に見いだされるもう一つの配列は、CXCAAT領域(ここでXは任意のヌ
クレオチドであってよい)である。殆どの真核生物遺伝子の3'末端には、コー
ディング配列の3'末端にポリA尾を付加するためのシグナルとなり得るAAT
AAA配列がある。これらの配列は全て哺乳動物の発現ベクター中に適当に挿入
される。
哺乳動物宿主細胞におけるベクターからのTRAF転写は、プロモーターが宿
主細胞系と適合し得る限り、例えば、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス[19
89年7月5日公開のUK2211504]、アデノウイルス(例えばアデノウ
イルス2)、ウシ乳頭腫ウイルス、鳥の肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、
レトロウイルス、B型肝炎ウイルスおよび最も好ましくはシミアンウイルス40
(SV40)のようなウイルスのゲノムから得られるプロモーター、ヘテロロー
ガスな哺乳動物プロモーター、例えばアクチンプロモーターまたは免疫グロブリ
ンプロモーターから、熱衝撃プロモーターから、そしてTRAF配列に通常付随
するプロモーターから得られるプロモーターによって調節される。
SV40ウイルスの初期および後期プロモーターは、SV40ウイルス複製起
点をも含むSV40制限フラグメントとして簡便に得られる[フィアス等、Natu
re、273巻113頁(1978)、ミュリガンおよびバーグ、Science、20
9巻1422−1427頁(1980);パヴラキス等、Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA、78巻7398−7402頁(1981)]。ヒトサイトメガロウイルスの
即時初期プロモーターは、HindIII E制限フラグメントとして簡便に得られ
る[グリーナウェイ等、Gene、18巻355−360頁(1982)]。ベクタ
ーとしてウシ乳頭腫ウイルスを用いて哺乳動物宿主でDNAを発現する系がUS
4419446に開示されている。この系の修飾はUS4601978に記載さ
れている。さらに、サルの細胞におけるヒト免疫インターフェロンをコードして
いるcDNAの発現に関するグレイ等、Nature、295巻503−508頁(1
982);単純ヘルペスウイルス由来のチミジンキナーゼプロモーターの調節下
でのマウス細胞におけるヒトβ−インターフェロンcDNAの発現に関するレイ
エス等、Nature、297巻598−601頁(1982);培養されたマウスお
よびウサギの細胞におけるヒトインターフェロンβ1遺伝子の発現に関するキャ
ナーニおよびバーグ、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、79巻5166−5170頁(
1982);ならびに、プロモーターとしてラウス肉腫ウイルスの長い末端反復
を用いた、CV−1サル腎臓細胞、鶏の胚線維芽細胞、チャイニーズハムスター
卵
巣細胞、HeLa細胞、およびマウスHIN−3T3細胞における細菌CAT配
列の発現に関するゴーマン等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、79巻6777−67
81頁(1982)を参照されたい。
(v)エンハンサー要素成分
本発明に係るTRAFをコードしているDNAの、高等真核生物による転写は
、しばしばベクター中にエンハンサー配列を挿入することによって増強される。
エンハンサーは、プロモーターに作用してその転写を増大させる、通常約10か
ら300bpまでの、cis作動要素のDNAである。エンハンサーは相対的に
、方向および位置に独立しており、転写ユニットの5’[ライミンズ等、Proc.N
atl.Acad.Sci.USA、78巻993頁(1981)]および3’[ラスキー等、Mo
l.Cell Biol.、3巻1108頁(1983)]、イントロン内部[バネルジ等、
Cell、33巻729頁(1983)]、ならびにコーディング配列自身の内部[
オスボーン等、Mol.Cell Biol.、4巻1293頁(1984)]に、見いだされ
ている。哺乳動物遺伝子由来の多くのエンハンサー配列が現在知られている(グ
ロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテインおよびインシュリン
)。しかしながら、典型的には、真核細胞ウイルス由来のエンハンサーが使用さ
れるであろう。例には、複製起点の後期側のSV40エンハンサー(bp100
−270)、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の
後期側のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーが包含さ
れる。真核生物プロモーターの活性化のための増強要素についてのヤニヴ、Natu
re、97巻17−18頁(1982)もまた参照されたい。エンハンサーはTR
AF DNAの5'または3'位でベクター中にスプライスすることができるが、
好ましくはプロモーターの5'部位に位置させる。
(vi)転写終止成分
真核宿主細胞(酵母、真菌、昆虫、植物、動物、人間、または他の多細胞生物
由来の有核細胞)に使用される発現ベクターはさらに、転写の終止およびmRN
Aの安定化に必要な配列を含むであろう。このような配列は普通、真核生物のま
たはウイルスのDNAまたはcDNAの5'および時には3'非翻訳領域から取得
することができる。これらの領域は、TRAFをコードしているmRNAの非翻
訳部分にポリアデニル化フラグメントとして転写されるヌクレオチドセグメント
を含んでいる。
上に列挙された構成成分の1またはそれ以上、所望のコード化および調節配列
を含む適当なベクターの組み立てには、標準的ライゲーション技術を使用する。
分離されたプラスミドまたはDNAフラグメントを開裂させ、整え、そして必要
なプラスミドの生成のために望まれる型に再ライゲーションする。
組み立てられたプラスミドが正しい配列であることを確認する分析のために、
ライゲーション混合物を用いてE.coli K12菌株294(ATCC31
446)を形質転換し、成功した形質転換体を適宜アンピシリンまたはテトラサ
イクリン耐性によって選択する。形質転換体からプラスミドを調製し、制限エン
ドヌクレアーゼ消化により分析し、そして/またはメシング等、Nucleic Acids
Res.、9巻309頁(1981)の方法によって、またはマクサム等、Methods
in Enzymology、65巻499頁(1980)の方法によって配列決定する。
哺乳動物細胞においてTRAFをコードしているDNAの一過性発現を提供す
る発現ベクターは、本発明の実施において特に有用である。一般に、一過性発現
は、宿主細胞が発現ベクターの多数のコピーを蓄積し、その発現ベクターにより
コードされている所望のポリペプチドを高レベルで合成するように、宿主細胞中
で効率的に複製できる発現ベクターを使用することを含む。適当な発現ベクター
および宿主細胞からなる一過性発現系は、クローンDNAによりコードされてい
るポリペプチドの簡便な正の同定、および、所望の生物学的または生理学的性質
についての係るポリペプチドの迅速なスクリーニングを可能にする。よって、一
過性発現系は、TRAFの類似体および変異体を同定する目的のために本発明に
おいて特に有用である。
組換え脊椎動物細胞培養でのTRAFポリペプチドの合成に当てはめるのに好
適なその他の方法、ベクター、および宿主細胞は、ゲティング等、Nature、29
3巻620−625頁(1981);マンテル等、Nature、281巻40−46
頁(1979);レヴィンソン等;EP117060およびEP117058に
記載されている。TRAFポリペプチドの哺乳動物細胞培養発現にとって特に有
用なプラスミドは、pRK5[EP307247]である。
(vii)ベクターの組み立ておよび分析
上に列挙された構成成分の1またはそれ以上を含む適当なベクターの組み立て
には、標準的ライゲーション技術を使用する。分離されたプラスミドまたはDN
Aフラグメントを開裂させ、整え、そして必要なプラスミドの生成のために望ま
れる型に再ライゲーションする。
組み立てられたプラスミドが正しい配列であることを確認する分析のために、
ライゲーション混合物を用いてE.coli K12菌株294(ATCC31
446)を形質転換し、成功した形質転換体を適宜アンピシリンまたはテトラサ
イクリン耐性によって選択する。形質転換体からプラスミドを調製し、制限エン
ドヌクレアーゼ消化により分析し、そして/またはメシング等、Nuclei Acids R
es.、9巻309頁(1981)の方法によって、またはマクサム等、Methods i
n Enzymology、65巻499頁(1980)の方法によって配列決定する。
(viii)一過性発現ベクター
哺乳動物細胞においてTRAFポリペプチドをコードしているDNAの一過性
発現を提供する発現ベクターは、本発明の実施において特に有用である。一般に
、一過性発現は、宿主細胞が発現ベクターの多数のコピーを蓄積し、その発現ベ
クターによりコードされている所望のポリペプチドを高レベルで合成するように
、宿主細胞中で効率的に複製できる発現ベクターを使用することを含む。サムブ
ルック等、上記、16.17−16.22頁。適当な発現ベクターおよび宿主細
胞からなる一過性発現系は、所望の生物学的または生理学的性質についての係る
ポリペプチドの簡便な正のスクリーニングを可能にする。よって、一過性発現系
は、TRAFの生物活性を有する天然TRAFポリペプチドの類似体および変異
体を同定する目的のために本発明において特に有用である。
(ix)好適な脊椎動物細胞ベクターの例
組換え脊椎動物細胞培養でのTRAFポリペプチド(天然蛋白の機能的誘導体
を包含する)の合成に当てはめるのに好適なその他の方法、ベクター、および宿
主細胞は、ゲシング等、Nature、293巻620−625頁(1981);マン
テイ等、Nature、281巻40−46頁(1979);レヴィンソン等、EP1
17060;およびEP117058に記載されている。TRAFポリペプチド
の哺乳動物細胞培養発現にとって特に有用なプラスミドは、pRK5(EP30
7247)またはpSVI6B[PCT公開第WO91/08291号]である。
D.宿主細胞の選択および形質転換
本明細書に記載のベクターのクローニングまたは発現に好適な宿主細胞は、原
核生物、酵母、または上記の高等真核生物細胞である。適当な原核生物は、グラ
ム陰性またはグラム陽性菌、例えば大腸菌、またはバシルスを包含する。好まし
いクローニング宿主はE.coli294(ATCC31446)であるが、E
.coli B、E.coli X1776(ATCC31537)、E.col
i W3110(ATCC27325)、シュードモナス種、またはセラティア
・マルセサンスのようなその他のグラム陰性またはグラム陽性原核生物もまた適
当である。
原核生物に加えて、糸状菌または酵母のような真核微生物は、本発明に係るベ
クターのための好適な宿主である。サッカロミセス・セレヴィシアエ、またはパ
ン酵母は、下等真核宿主微生物の中で最も一般的に用いられる。しかしながら、
幾つかのその他の属、種、および菌株、例えばS.ポンベ[ビーチおよびナース、
Nature、290巻140頁(1981)]、クルイヴェロミセス・ラクティス[
ルーヴェンコート等、J.Bacteriol.、737頁(1983)];ヤロウィア[E
P402226];ピチア・パストリス[EP183070]、トリコデルマ・
リーシア[EP244234]、ニューロスポラ・クラッサ[ケイス等、Proc.N
atl.Acad.Sci.USA、76巻5259−5263頁(1979)];およびアスペ
ルギルス宿主、例えばA.ニデュランス[バランス等、Biochem.Biophys.Res.Co
mmun.、112巻284−289頁(1983);ティルバーン等、Gene、26
巻205−221頁(1983);イェルトン等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、8
1巻1470−1474頁(1984)]およびA.ニガー[ケリーおよびハイ
ンズ、EMBO J.、4巻475−479頁(1985)]が一般的に利用でき且つ
本
発明において有用である。
好適な宿主細胞は多細胞生物からも誘導される。このような宿主細胞は、複雑
な処理およびグリコシル化活動が可能である。原則として、脊椎動物または無脊
椎動物培養由来の如何に拘わらず、任意の高等真核生物細胞培養が使用可能であ
るが、人間のような哺乳動物由来の細胞が好ましい。無脊椎動物細胞の例には、
植物および昆虫細胞が包含される。多数のバキュロウイルス株および変異体なら
びに、スポドプテラ・フルギペルダ(毛虫)、アエデス・アエジプティ(蛾)、
アエデス・アルボピクトゥス(蛾)、ドゥロソフィラ・メランガスター(ショウ
ジョウバエ)、およびボンビクス・モリ宿主細胞のような宿主からの対応する受
容可能な昆虫宿主細胞が特定されている。例えば、ラッコウ等、Bio/Technology
、6巻47−55頁(1988);ミラー等、Genetic Engineering、J.K.セッ
トロウ等編、8巻(プレナム・パブリッシング、1986)、277−279頁
;およびマエダ等、Nature、315巻592−594頁(1985)を参照され
たい。このような様々なウイルス株、例えばオートグラファ・カリフォルニカN
PVのL−1変異体が一般に入手可能であり、このようなウイルスは、本発明に
従い本明細書に記載のウイルスとして、特にスポドブテラ・フルギペルダ細胞の
トランスフェクションに使用することができる。
綿花、トウモロコシ、馬鈴薯、ダイズ、ペチュニア、トマト、およびタバコと
いった植物細胞培養を宿主として利用できる。典型的には、TRAF DNAを
含むよう前もって操作しておいた細菌アグロバクテリウム・トゥメファシエンス
の或る菌株と共にインキュベートすることにより、植物細胞をトランスフェクト
する。A.トゥメファシエンスと共に植物細胞培養をインキュベートする間に、
TRAFをコードしているDNAがその植物細胞宿主に移され、これがトランス
フェクトされ、そして適当な条件の下でTRAF DNAを発現する。加えて、
ノパリンシンターゼプロモーターおよびポリアデニル化シグナル配列のような、
植物細胞と適合し得る調節およびシグナル配列が利用できる。デピッカー等、J.
Mol.Appl.Gen.、1巻561頁(1982)。さらに、T−DNA780遺伝子
の上流領域から分離されるDNAセグメントは、組換えDNA含有植物組織中の
植物発現遺伝子の転写レベルを活性化または増強することができる。1989年
6月21日公開のEP321196を参照されたい。
しかしながら、脊椎動物細胞への関心が最も高く、培養(組織培養)中での脊
椎動物細胞の増殖は、自体良く知られている。ティシュー・カルチャー、アカデ
ミック・プレス、クルースおよびパターソン編(1973)を参照されたい。有
用な哺乳動物宿主セルラインの例は、SV40により形質転換されたサル腎臓C
V1ライン(COS−7、ATCC CRL1651);ヒト胚腎臓セルライン
[293または懸濁培養での増殖のためにサブクローニングされた293細胞。
グラハム等、J.Gen.Virol.、36巻59頁(1977)];ハムスター乳児腎細
胞9BHK、ATCC CCL10);チャイニーズハムスター卵巣細胞/−D
HFR[CHO、ウアラウプおよびチェイシン、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、77
巻4216頁(1980)];マウスセルトリ細胞[TM4、マザー、Biol.Rep
rod.、23巻243−251頁(1980)];サル腎細胞(CV1 ATCC
CCL70);アフリカミドリザル腎細胞(VERO−76、ATCC CRL
−1587);ヒト子宮頸癌細胞(HELA、ATCC CCL2);イヌ腎細
胞(MDCK、ATCC CCL34);バッファローラット肝細胞(BRL3
A、ATCC CRL1442);ヒト肺細胞(W138、ATCC CCL75
);ヒト肝細胞(Hep G2、HB8065);マウス乳癌(MMT 0605
62、ATCC CCL51);TRI細胞[マザー等、Annals.N.Y.Acad.Sci.
、383巻44068頁(1982)];MRC 5細胞;FS4細胞;および
ヒト肝癌セルライン(Hep G2)である。好ましい宿主細胞はヒト胚腎臓2
93およびチャイニーズハムスター卵巣細胞である。
本発明の目的にとって特に好ましい宿主細胞は、TRAFポリペプチドを産生
する脊椎動物細胞である。
もう一つの特に好ましい態様において、本発明に係るTRAFポリペプチドは
昆虫細胞で発現される。この発現は、例えば、ファーミノゲン、サンディエゴか
ら市販品を入手し得るバキュロウイルス発現キット(バキュロゴールド)を用い
てHi5昆虫細胞(インビトロゲン、サンディエゴ)で行うことができる。
宿主細胞をトランスフェクトし、そして好ましくは上記の発現またはクローニ
ングベクターにより形質転換し、プロモーターの誘導または増幅された遺伝子を
含む形質転換体の選択にとって適当であるよう修飾した常套的栄養培地で培養す
る。
E.宿主細胞の培養
本発明に係るTRAFポリペプチドの産生に使用される原核細胞は、サムブル
ック等、上記、に一般的に記載されるような適当な培地で培養される。
哺乳動物細胞は様々な培地で培養することができる。ハムのF10(シグマ)
、最少必須培地(MEM、シグマ)、RPMI−1640(シグマ)、およびダ
ルベッコの改良イーグル培地(DMEM、シグマ)のような市販品が入手できる
培地が、当該宿主細胞の培養に適している。さらに、ハムおよびワレス、Meth.E
nzymol.、58巻44頁(1979)、バーンズおよびサトー、Anal.Biochem.、
102巻255頁(1980)、US4767704;4657866;492
7762;もしくは4560655;WO90/03430;WO87/001
95または米国特許Re.30985に記載される任意の培地を当該宿主細胞の
ための培養基として使用することができる。これらの培地はいずれも、ホルモン
および/またはその他の成長因子(例えばインシュリン、トランスフェリン、ま
たは表皮成長因子)、塩類(例えば塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム
、および燐酸塩)、緩衝剤(例えばHEPES)、ヌクレオシド(例えばアデノ
シンおよびチミジン)、抗生物質(例えばゲンタマイシン(商標)薬)、微量元
素(最終濃度が通常マイクロモルの範囲で存在する無機化合物と定義される)、
およびグルコースまたは同等のエネルギー源を、必要に応じて添加することがで
きる。他の必要な添加物もまた、当業者により知られる適当な濃度で含有させる
ことができる。温度、pH等といった培養条件は、場合によってはクローニング
または発現のために選択された宿主細胞についてかつて用いられた条件であるの
が適当であり、当業者には明らかであろう。
本明細書中で言及される宿主細胞は、インビトロ細胞培養中の細胞および宿主
動物または植物内にある細胞を包含する。
さらに、本発明に係るTRAFポリペプチドは、ホモローガスな組換えによっ
て、または、特定のTRAFをコードしているDNAを既に含んでいる細胞中に
導入された調節要素を利用する組換え生産法を用いて生産することができるとい
うことが考えられる。
F.遺伝子の増幅/発現の検出
遺伝子の増幅および/または発現は、例えば、本明細書中に供される配列に
基づき、適当に標識されたプローブを用いて、常套的サザンブロッティング、m
RNAの転写を定量するためのノーザンブロッティング[トマス、Proc.Natl.Ac
ad.Sci.USA、77巻5201−5205頁(1980)]、ドットブロッティン
グ(DNA分析)、またはインサイトゥハイブリダイゼーションによって直接試
料中で測定することができる。様々な標識、最も一般的には放射性同位元素、特
に32Pが使用できる。しかしながら、ポリヌクレオチド中への導入のためのビオ
チン修飾されたヌクレオチドの使用といったようなその他の技術を利用すること
もできる。次いでこのビオチンは、多岐にわたる標識、例えば放射性核種、蛍光
剤、酵素等で標識することのできるアビジンまたは抗体への結合部位として働く
。別法として、DNA二本鎖、RNA二本鎖、およびDNA−RNAハイブリッ
ド二本鎖またはDNA−蛋白二本鎖を包含する特異的二本鎖を認識できる抗体を
使用することもできる。次いで、抗体を標識し、二本鎖が表面に結合していると
ころで検定を実施し、その結果、表面での二本鎖の形成の時点でその二本鎖に結
合した抗体の存在が検出できる。
別法として、遺伝子の発現を、組織切片の免疫組織化学的染色および細胞培養
または体液の検定といった免疫学的方法により測定して、遺伝子産物の発現を直
接定量することもできる。免疫組織化学的染色技術では、典型的には脱水および
固定により細胞試料を作成し、その後、結合した遺伝子産物に対し特異的な標識
化抗体と反応させるが、この標識は通常、酵素的標識、蛍光標識、ルミネセンス
標識等のような視覚的に検出できるものである。本発明における使用に好適な特
に鋭敏な染色技術は、シュー等、Am.J.Clin.Pharm.、75巻734−738頁(
1980)に記載されている。
試料液の免疫組織化学的染色および/または検定に有用な抗体は、モノクロー
ナルまたはポリクローナルのいずれかであってよく、任意の動物で作成すること
ができる。簡便には、この抗体は、下にさらに記載されるように、天然TRAF
ポリペプチドに対して、または本明細書に供されるDNA配列に基づく合成ペプ
チドに対して作製することができる。
G.TRAFポリペプチドの精製
TRAFポリペプチドは典型的には宿主細胞溶菌液から回収する。
TRAFポリペプチドがヒト起源以外の組換え細胞で発現される場合、このT
RAFは、ヒト起源の蛋白またはポリペプチドを全く含んでいない。しかし、T
RAFに関して実質上均質な調製品を得るためには、TRAF蛋白を組換え細胞
蛋白またはポリペプチドから精製することが必要である。第一段階として、培養
基または溶菌液を遠心して粒状の細胞破片を除去する。次に、膜および可溶性蛋
白画分を分離する。次いで、TRAF蛋白を可溶性蛋白画分から精製することが
できる。以下の方法は、好適な精製法の例である:免疫親和またはイオン交換カ
ラム上での分画;エタノール沈澱化;逆相HPLC;シリカまたはDEAEのよ
うな陽イオン交換樹脂上でのクロマトグラフィー;クロマトフォーカシング;S
DS−PAGE;硫酸アンモニウム沈澱化;例えばセファデックスG−75を用
いるゲル濾過;およびIgGのような夾雑物を除くためのプロテインAセファロ
ースカラム。特異的精製法は上に記載されている。
残基が除去され、挿入され、そして/または置換されたTRAF機能的誘導体
は、その変化により惹起された性質の実質的変化を考慮に入れて、天然レセプタ
ー鎖と同じ様式で回収される。例えば、TRAF蛋白と、別の蛋白またはポリペ
プチド、例えば細菌またはウイルス抗原との融合物は、精製を促進し;当該抗原
に対する抗体を含む免疫親和カラムを用いて該融合物を吸着することができる。
ウサギポリクローナル抗TRAFカラムのような免疫親和カラムを使用して、少
なくとも1個の残存している免疫エピトープに結合させることにより、TRAF
変異体を吸着することができる。フェニルメチルスルホニルフルオリド(PMS
F)のようなプロテアーゼインヒビターもまた、精製中の蛋白分解的減成を阻害
するのに有用であり、また、偶発的汚染物質の生育を防止するため、抗生物質を
含有させることができる。本発明に係るTRAF蛋白は、TNF−R2の細胞内
ドメインと特異的に関係する能力に基づき、親和クロマトグラフィーによって簡
便に精製される。
当業者には、天然TRAFに好適な精製法は、組換え細胞培養中での発現時の
天然TRAFまたはその変異体の性質の変化を説明できる修飾が必要となり得る
という事が理解できるであろう。
H.TRAFポリペプチドの共有結合的修飾
TRAFの共有結合的修飾は本発明の範囲内に包含される。このような修飾は
、選ばれた側鎖または末端残基と反応できる有機誘導体形成試薬とTRAFの標
的アミノ酸残基を反応させることによって、または、選ばれた組換え宿主細胞中
で機能する翻訳後修飾の機構を利用することによって、常套的に導入される。得
られた共有結合的誘導体は、生物活性、TRAFのイムノアッセイ、または組換
え体の免疫親和精製のための抗TRAFレセプター抗体の作製のために重要な残
基の同定を目的とする計画に有用である。例えば、ニンヒドリンとの反応後の蛋
白の生物活性の完全な失活は、少なくとも1個のアルギニンまたはリジン残基が
その活性に必須であることを示唆するものであり、その後、選ばれた条件下で修
飾された個々の残基を、修飾されたアミノ酸残基を含むペプチドフラグメントの
分離によって同定する。このような修飾は当分野における通常の知識の範囲内に
あり、過度の実験をすることなく実施される。
システイン残基は、最も一般的にはα−ハロアセタート(および対応するアミ
ン)、例えばクロロ酢酸またはクロロアセトアミドと反応させてカルボキシメチ
ルまたはカルボキシアミドメチル誘導体を生成する。システイン残基はまた、ブ
ロモトリフルオロアセトン、α−ブロモ−β−(5−イミドゾイル)プロピオン
酸、クロロアセチルホスファート、N−アルキルマレイミド、3−ニトロ−2−
ピリジルジスルフィド、メチル2−ピリジルジスルフィド、p−クロロ水銀ベン
ゾアート、2−クロロ水銀−4−ニトロフェノール、またはクロロ−7−ニトロ
ベンゾ−2−オキサ−1,3−ジアゾールとの反応により、誘導体化される。
ヒスチジン残基はpH5.5−7.0でジエチルピロカルボナートとの反応に
より誘導体化されるが、これは、この試薬がヒスチジン側鎖に対し相対的に特異
的であるためである。p−ブロモフェナシルブロミドもまた有用であり、この反
応は好ましくは0.1Mカコジル酸ナトリウム中pH6.0で実施する。
リジンおよびアミノ末端残基は無水琥珀酸またはその他のカルボン酸無水物と
反応する。これらの試薬を用いた誘導体形成は、リジン残基の電荷を逆転させる
効果を有する。α−アミノ含有残基を誘導体化するためのその他の好適な試薬は
、イミドエステル類、例えばメチルピコリンイミダート;燐酸ピリドキサル;ピ
リドキサル;クロロボロヒドリド;トリニトロベンゼンスルホン酸;O−メチル
イソ尿素;2,4−ペンタンジオン;およびグリオキシラートを用いたトランス
アミナーゼにより触媒される反応を包含する。
アルギニン残基は1または数種の常套的試薬との反応により修飾され、それら
の中にはフェニルグリオキサル、2,3−ブタンジオン、1,2−シクロヘキサ
ンジオン、およびニンヒドリンがある。アルギニン残基の誘導体化は、グアニジ
ン官能基の高いpKaのため、反応をアルカリ条件で行う必要がある。さらに、
これらの試薬は、アルギニンのε−アミノ基と同様リジンの基とも反応するかも
知れない。
チロシン残基の特異的修飾は、芳香族ジアゾニウム化合物またはテトラニトロ
メタンとの反応によるチロシン残基へのスペクトル標識の導入に特段の興味を伴
って行われる。最も一般的には、N−アセチルイミジゾールおよびテトラニトロ
メタンを使用して、それぞれO−アセチルチロシル種および3−ニトロ誘導体が
形成される。チロシン残基は、ラジオイムノアッセイに使用するための標識化蛋
白を製造するために125Iまたは131Iを用いてヨウ素化される。
カルボキシ側鎖(アスパルチルまたはグルタミル)は、カルボジイミド(R’
−N=C=N−R')、例えば1−シクロヘキシル−3−(2−モルホリニル−
4−エチル)カルボジイミドまたは1−エチル−3−(4−アゾニア−4,4−
ジメチルペンチル)カルボジイミドとの反応により、選択的に修飾される。さら
に、アスパラギン酸およびグルタミン酸残基はアンモニウムイオンとの反応によ
り、アスパラギンおよびグルタミン残基に変換される。
グルタミンおよびアスパラギン残基はしばしば、対応するグルタミン酸および
アスパラギン酸残基に脱アミド化される。別法としてこれらの残基は緩和な酸性
条件下で脱アミド化される。これらの残基はいずれの型も本発明の範囲内にある
。
その他の修飾には、プロリンおよびリジンのヒドロキシル化、セリン、スレオ
ニンまたはチロシン残基のヒドロキシ基の燐酸化、リジン、アルギニン、および
ヒスチジン側鎖のαアミノ基のメチル化(T.E.クレイトン、プロテインズ:スト
ラクチャー・アンド・モレキュラー・プロパティーズ、W.H.フリーマン・アンド
・Co.、サンフランシスコ、79−86頁[1983])、N−末端アミンの
アセチル化、およびC末端カルボキシ基のアミド化が包含される。この分子はさ
らに、PCT公開WO90/05534(1990年5月31日公開)または米
国特許4640835;4496689;4301144;4670417;4
791192または4179337に開示される方法で、非蛋白性ポリマー、例
えばポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコールまたはポリオキシアル
キレン類に共有結合させることができる。
二価の試薬による誘導体形成は、TRAFとポリペプチドとの分子内凝集体の
製造にとって、そして検定または親和精製で使用するための、水不溶性支持体マ
トリックスまたは表面へのTRAFポリペプチドの架橋にとって有用である。さ
らに、鎖間架橋の研究は、コンホメーション構造に関する直接の情報を提供する
であろう。一般的に用いられる架橋剤は、1,1−ビス(ジアゾアセチル)−2
−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、N−ヒドロキシスクシンイミドエステ
ル類、ホモ二価イミドエステル類、および二価マレイミド類を包含する。メチル
−3−[(p−アジドフェニル)ジチオ]プロピオイミダートのような誘導体形
成試薬は、光の存在下で架橋を形成することのできる光活性化中間体を生成する
。別法として、臭化シアン活性化炭水化物のような反応性水不溶性マトリックス
および米国特許第3959642号;3969287号;3691016号;4
195128号;4247642号;4229537号;4055635号;お
よび4330440号に記載の系反応性基質が、蛋白の固定および架橋に使用さ
れ
る。
ある種の翻訳後修飾は、発現されたポリペプチドへの組換え宿主細胞の作用の
所産である。グルタミンおよびアスパラギン残基はしばしば対応するグルタミン
酸およびアスパラギン酸残基へと翻訳後脱アミド化される。別法として、これら
の残基は緩和な酸性条件下で脱アミド化される。これらの残基のいずれの型も本
発明の範囲内にある。
その他の翻訳後修飾には、プロリンおよびリジンのヒドロキシル化、セリン、
スレオニンまたはチロシン残基のヒドロキシ基の燐酸化、リジン、アルギニン、
およびヒスチジン側鎖のαアミノ基のメチル化[T.E.クレイトン、プロテインズ
:ストラクチャー・アンド・モレキュラー・プロパティーズ、W.H.フリーマン・
アンド・Co.、サンフランシスコ、79−86頁(1983)]が包含される。
その他の誘導体には、非蛋白性ポリマーと共有結合した本発明に係る新規ペプ
チドが包含される。非蛋白性ポリマーとは、通常、親水性合成ポリマー、即ち他
の状態では天然に見いだされないポリマーである。しかしながら、天然に存在し
組換えまたはインビトロ法により産生されるポリマーは有用であり、天然から分
離されるポリマーもまた同様である。親水性ポリビニルポリマー、例えばポリビ
ニルアルコールおよびポリビニルピロリドンは本発明の範囲内にある。ポリエチ
レングリコール、ポリプロピレングリコールのようなポリビニルアルキレンエー
テル類が特に有用である。
TRAFポリペプチドは、米国特許第4640835;4496689;43
01144;4670417;4791192または4179337号に開示さ
れる方法で、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコールまたはポリオ
キシアルキレン類のような様々な非蛋白性ポリマーに結合させることができる。
TRAFは、例えばコアセルベーション技術または界面重合により製造された
マイクロカプセル内に、コロイド薬物デリバリーシステム(例えばリポソーム、
アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子およびナノカプセ
ル)内に、またはマクロエマルジョン内に捕捉することができる。このような技
術はレミントンズ・ファーマシューティカル・サイエンシズ、16版、A.オソ
ール編(1980)に開示されている。
I.TRAFのグリコシル化変異体
天然TRAFはグリコシル化されていないと信じられているが、グリコシル化
されている変異体は本発明の範囲内にある。容易にするため、天然ポリペプチド
のグリコシル化パターンにおける変化は、アミノ酸配列変異体に関して上に論じ
た技術を本質的に使用して、通常DNAレベルで施す。したがって、グリコシル
化シグナルは天然TRAFポリペプチドのDNA配列中に導入することができる
。
本発明に係る分子のTRAF分子へのグリコシドの化学的または酵素的結合も
また炭水化物置換基の添加に使用することができる。これらの方法は、O結合(
またはN結合)グリコシル化が可能なポリペプチドを産生させる必要が無いとい
う点で有利である。使用される結合様式に応じて、糖は、(a)アルギニンおよ
びヒスチジン、(b)遊離カルボキシ基、(c)遊離ヒドロキシ基、例えばシス
テインの遊離ヒドロキシ基、(d)遊離スルフヒドリル基、例えばセリン、スレ
オニン、またはヒドロキシプロリンの遊離スルフヒドリル基、(e)芳香族残基
、例えばフェニルアラニン、チロシン、またはトリプトファンの芳香族残基、ま
たは(f)グルタミンのアミド基、に結合させることができる。これらの方法は
、WO87/05330(1987年9月11日公開)、およびアプリンおよび
リストン、CRC Crit.Rev.Biochem.、259−306頁に記載されている。
J.抗TRAF抗体の製造
(i)ポリクローナル抗体
TRAF分子に対するポリクローナル抗体は一般に、TRAFおよびアジュバ
ントを複数回皮下(sc)または腹腔内(ip)注射することにより、動物にお
いて作製される。TRAFまたは標的アミノ酸配列を含むフラグメントを、二価
または誘導体形成試薬、例えばマレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエス
テル(システイン残基を介するコンジュゲーション)、N−ヒドロキシスクシン
イミド(リジン残基を介する)、グルタルアルデヒド、無水琥珀酸、SOCl2
、またはR1N=C=NR[式中、RおよびR1は異なるアルキル基である]を用
いて、免疫される種において免疫原性である蛋白、例えばスカシガイヘモシアニ
ン、
血清アルブミン、牛チログロブリン、または大豆トリプシンインヒビターとコン
ジュゲートさせることが有用であるかも知れない。
動物は、コンジュゲート1mgまたは1μg(それぞれウサギまたはマウスの
場合)を完全フロイントアジュバント3容量と合し、この溶液を複数部位に皮内
注射することによって、免疫原性コンジュゲートまたは誘導体に対して免疫する
。1ヶ月後、この動物を、完全フロイントアジュバントに入れた初回量の1/5
ないし1/10のコンジュゲートを用いて複数部位に皮下注射することにより、
追加免疫する。7ないし14日後、動物を採血し、抗TRAF抗体価について血
清を検定する。動物は、力価がプラトーに達するまで追加免疫する。好ましくは
、動物は、同じTRAFのコンジュゲートで、但し異なった蛋白にコンジュゲー
トさせた、そして/または異なった架橋剤を介してコンジュゲートさせたコンジ
ュゲートで追加免疫する。コンジュゲートはまた、蛋白融合物として組換え細胞
培養中で製造することができる。さらに、ミョウバンのような凝集化剤が、免疫
反応の増強のために使用される。
(ii)モノクローナル抗体
モノクローナル抗体は、実質上均質な抗体の集団、即ち、その集団を構成する
個々の抗体が、少量存在するかも知れない天然に起こる可能性のある突然変異を
除いて同一であるような集団から取得される。したがって、修飾語「モノクロー
ナル」とは、別々の抗体の混合物ではないという、抗体の性格を示している。
例えば、本発明に係る抗TRAFモノクローナル抗体は、コーラーおよびミル
シュタイン、Nature、256巻495頁(1975)により最初に記載されたハ
イブリドーマ法を用いて作製でき、または組換えDNA法[キャビリー等、米国
特許第4816567号]によって作製することができる。
ハイブリドーマ法においては、マウスまたはその他の適当な宿主動物、例えば
ハムスターを上記のように免疫し、免疫に用いられた蛋白と特異的に結合する抗
体を産生する、または産生することのできるリンパ球を導き出す。別法として、
リンパ球をインビトロで免疫することもできる。次に、リンパ球を、ポリエチレ
ングリコールのような適当な融合剤を用いて骨髄腫細胞と融合させ、ハイブリド
ーマ細胞を形成させる[ゴディング、モノクローナル・アンティボディーズ:プ
リンシプルズ・アンド・プラクティス、59−103頁(アカデミック・プレス
、1986)]。
このようにして製造されたハイブリドーマ細胞を、融合していない親の骨髄腫
細胞の増殖または生存を阻害する1またはそれ以上の物質を好ましくは含有する
適当な培養基に蒔き、増殖させる。例えば、親の骨髄腫細胞が酵素ヒポキサンチ
ングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRTまたはHPRT)を
欠失するならば、ハイブリドーマのための培養基は、典型的には、HGPRT欠
失細胞の増殖を妨げる物質であるヒポキサンチン、アミノプテリン、およびチミ
ジンを含有するであろう(HAT培地)。
好ましい骨髄腫細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体
の安定な高レベルの発現を支持し、そしてHAT培地のような培地に対して感受
性である細胞である。これらの中でも好ましい骨髄腫セルラインは、マウス骨髄
腫ライン、例えば、ソーク・インスティテュート・セル・ディストリビューショ
ン・センター、サンディエゴ、カリフォルニア、USAより入手し得るMOPC
−21およびMPC−11マウス腫瘍、ならびに、アメリカン・タイプ・カルチ
ャー・コレクション、ロックヴィル、メリーランド、USAより入手し得るSP
−2細胞から誘導されるものである。ヒトモノクローナル抗体の産生のためのヒ
ト骨髄腫およびマウス−ヒトヘテロ骨髄腫セルラインもまた記載されている[コ
ズボア、J.Immunol.、133巻3001頁(1984);ブロデュア等、モノク
ローナル・アンティボディー・プロダクション・テクニークス・アンド・アプリ
ケーションズ、51−63頁(マーセル・デッカー、Inc.、ニューヨーク、
1987)]。
ハイブリドーマ細胞が生育している培養基を、TRAFに対するモノクローナ
ル抗体の産生について検定する。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生さ
れるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降またはインビトロ結合検定、
例えばラジオイムノアッセイ(RIA)または酵素結合免疫吸着検定(ELIS
A)によって測定する。モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、マンソン
およびポラード、Anal.Biochem.、107巻220頁(1980)のスキャッチ
ャード分析により測定することができる。
ハイブリドーマ細胞が所望の特異性、親和性、および/または活性の抗体を産
生することが確定された後、このクローンを限界希釈法によりサブクローニング
し、標準法により増殖させることができる。ゴディング、モノクローナル・アン
ティボディーズ:プリンシプルズ・アンド・プラクティス、59−104頁(ア
カデミック・プレス、1986)。この目的にとって好適な培養基は、例えばダ
ルベッコの改良イーグル培地またはRPMI1640培地を包含する。加えて、
このハイブリドーマ細胞は、動物において腹水症腫瘍としてインビボで増殖させ
ることができる。
サブクローンにより分泌されたモノクローナル抗体は、例えばプロテインA−
セファロース、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析
、または親和クロマトグラフィーのような常套的免疫グロブリン精製法により、
培養基、腹水、または血清から好適に分離される。
本発明に係るモノクローナル抗体をコードしているDNAは、常法を用いて(
例えば、マウス抗体の重鎖および軽鎖をコードしている遺伝子に特異的に結合で
きるオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより)容易に分離および配列決
定される。本発明に係るハイブリドーマ細胞は、係るDNAの好ましい供給源と
して働く。分離されたならば、このDNAは発現ベクター中に入れ、次にこれを
、これ以外では免疫グロブリン蛋白を産生しないサルCOS細胞、チャイニーズ
ハムスター卵巣(CHO)細胞、または骨髄腫細胞のような宿主細胞中にトラン
スフェクトし、組換え宿主細胞におけるモノクローナル抗体の合成を獲得するこ
とができる。このDNAはまた、例えば、ホモローガスなマウス配列の代わりに
ヒト重鎖および軽鎖不変ドメインのコード化配列で置換することにより(モリソ
ン等、Proc.Nat.Acad.Sci.、81巻6851頁[1984])、または、免疫グ
ロブリンコード化配列に非免疫グロブリンポリペプチドのコード化配列の一部ま
たは全てを共有結合させることにより、修飾することができる。このようにして
、本発明に係る抗TRAFモノクローナル抗体の結合特異性を有する「キメラ」
ま
たは「ハイブリッド」抗体が作製される。
典型的には、本発明に係る抗体の不変ドメインを、または本発明に係る抗体の
1個の抗原結合部位の可変ドメインを、このような非免疫グロブリンポリペプチ
ドで置換して、TRAFに対する特異性を有する1個の抗原結合部位、および異
なる抗原に対する特異性を有するもう一つの抗原結合部位を含むキメラ二価抗体
を作り出す。
キメラまたはハイブリッド抗体は、架橋剤を用いる方法を包含する、合成蛋白
化学において知られる方法を用いてインビトロで製造することもできる。例えば
、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応を用いて、またはチオエステル結合を形成
することにより、組み立てることができる。この目的のための好適な試薬の例は
、イミノチオラートおよびメチル−4−メルカプトブチルイミダートを包含する
。
診断への適用のため本発明に係る抗体は、典型的には、検出可能な原子団で標
識されるであろう。検出可能な原子団は、検出可能なシグナルを直接的または間
接的に生成することのできる任意のものとすることができる。例えば、検出可能
な原子団は、3H、14C、32P、35S、または125Iのような放射性同位元素、蛍
光または化学ルミネセンス化合物、例えばフルオレセインイソチオシアナート、
ローダミン、またはルシフェリン;ビオチン;放射性同位元素標識、例えば125
I、32P、14C、または3H、または酵素、例えばアルカリホスファターゼ、β
−ガラクトシダーゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼであってよい。
ハンター等、Nature、144巻945頁(1962);デイヴィッド等、Bioc
hemistry、13巻1014頁(1974);ペイン等、J.Immunol.Meth.、40
巻219頁(1981);およびニグレン、J.Histochem.and Cytochem.、30
巻407頁(1982)に記載の方法を包含する、検出可能な原子団に抗体を別
々にコンジュゲートするための当分野で知られる任意の方法を使用することがで
きる。
本発明に係る抗体は、競合的結合検定、直接および間接サンドイッチ検定、お
よび免疫沈降検定といったような任意の既知の検定法に使用することができる。
ゾラ、モノクローナル・アンティボディーズ:ア・マニュアル・オブ・テクニー
クス、147−158頁(CRCプレス、Inc.、1987)。
競合的結合検定は、標識された標準(これはTRAFポリペプチドまたはその
免疫学的に反応性の部分であってよい)が限られた量の抗体との結合について被
験試料検体(TRAF)と競合する能力に依るものである。被験試料中のTRA
Fの量は、抗体と結合するようになる標準の量と逆比例する。結合するようにな
る標準の量の測定を容易にするため、抗体は一般に競合の前または後に不溶化し
、その結果、抗体に結合する標準および検体が、未結合のままである標準および
検体から簡便に分離され得るようにする。
サンドイッチ検定は二つの抗体の使用を含み、各々が、検出すべき蛋白の異な
る免疫原性部分またはエピトープと結合することができる。サンドイッチ検定に
おいては、被験試料検体は、固体支持体上に固定された第一の抗体と結合し、そ
の後第二の抗体が検体と結合し、こうして不溶性三部複合体が形成される。デイ
ヴィッドおよびグリーン、米国特許第4376110号。第二の抗体は、検出可
能な原子団で自身標識されていてよく(直接サンドイッチ検定)、または検出可
能な原子団で標識された抗免疫グロブリン抗体を用いて測定することもできる(
間接サンドイッチ検定)。例えば、サンドイッチ検定の一つの型はELISA検
定であり、この場合、検出可能な原子団は酵素である。
(iii)ヒト化抗体
非ヒト抗体をヒト化する方法は当分野で良く知られている。一般に、ヒト化抗
体は、ヒト以外の供給源から導入された1またはそれ以上のアミノ酸残基を有す
る。これらの非ヒトアミノ酸残基はしばしば「移入」残基と呼ばれ、これは典型
的には「移入」可変ドメインから取られている。ヒト化は、本質的にはウィンタ
ーおよび共同研究者の方法[ジョーンズ等、Nature、321巻522−525頁
(1986);リーチマン等、Nature、332巻323−327頁(1988)
;ベルホーエン等、Science、239巻1534−1536頁(1988)]に
従って、齧歯類CDRまたはCDR配列でヒト抗体の対応配列を置換することに
より、実施することができる。したがって、このような「ヒト化」抗体は、無傷
のヒト可変ドメインより実質上小さい部分が非ヒト種由来の対応配列によって置
換されている、キメラ抗体である(キャビリー等、上記)。実際、ヒト化抗体は
、典型的には、幾つかのCDR残基およびことによると幾つかのFR残基が、齧
歯類抗体の類似部位からの残基によって置換されているヒト抗体である。
抗体は、抗原に対する高親和性およびその他の望ましい生物学的性質を保持し
たままヒト化することが重要である。この目的を達成するため、好ましい態様に
よれば、親配列および様々な概念的ヒト化生成物を、親およびヒト化配列の三次
元モデルを用いて分析する工程によって、ヒト化抗体を製造する。三次元免疫グ
ロブリンモデルは一般に利用でき、当業者には良く知られている。選ばれた候補
免疫グロブリン配列の可能な三次元コンホメーション構造を例示し表示するコン
ピュータープログラムが利用できる。これらの表示を調べることにより、候補免
疫グロブリン配列の機能における当該残基の可能な役割の分析、即ち、候補免疫
グロブリンがその抗原を結合させる能力に影響を及ぼす残基の分析、が可能とな
る。このようにして共通および移入配列からFR残基を選択しそして結びつける
ことができ、その結果、所望の抗体の性格、例えば標的抗原に対する親和性の増
加が達成される。一般に、CDR残基は、直接且つ最も実質的に抗原結合への影
響に関与する。さらなる詳細については、1991年6月14日出願の出願番号
第07/715272号の一部継続出願である1992年8月21日出願の米国
出願第07/934373号を参照されたい。
別法として、免疫時に内因性免疫グロブリンの産生無しにヒト抗体の全レパー
トリーを産生することのできる、形質転換動物(例えば、マウス)を作ることが
現在可能である。例えば、キメラおよび生殖系列突然変異体マウスにおける抗体
重鎖結合領域(JH)遺伝子の同型接合除去が内因性抗体産生の完全な阻害をも
たらすということが記載されている。このような生殖系列突然変異体マウスでの
ヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子列の転移は、抗原チャレンジ時にヒト抗体の
産生をもたらすであろう。例えば、ジャコボヴィッツ等、Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA、90巻2551−255頁(1993);ジャコボヴィッツ等、Nature、3
62巻255−258頁(1993)を参照されたい。
(iv)二重特異性抗体
二重特異性抗体は、少なくとも二つの異なる抗原に対する結合特異性を有する
、モノクローナルの、好ましくはヒト抗体またはヒト化抗体である。本発明の場
合、一方の結合特異性はTRAFに対するものであり、他方は他の任意の抗原、
好ましくは別のレセプターまたはレセプターサブユニットに対するものである。
例えば、二つの異なるTRAF、またはTNFレセプター(好ましくはTNF−
R2)およびTRAFと特異結合する二重特異性抗体は本発明の範囲内にある。
二重特異性抗体を作製する方法は当分野において既知である。
常套的には、二重特異性抗体の組換え産生は二つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖
の対の同時発現に基づき、ここでこの二つの重鎖は異なる特異性を持っている[
ミルシュタインおよびキュエロ、Nature、305巻537−539頁(1983
)]。免疫グロブリン重鎖および軽鎖が無作為に取り揃えられているため、これ
らのハイブリドーマ(四部雑種)は10個の異なる抗体分子の可能性ある混合物
を産生し、そのうちただ一つが正しい二重特異性構造を有する。通常、親和クロ
マトグラフィー工程により行われる正しい分子の精製は、かなり煩わしく、そし
て生成物の収率は低い。同様の方法は、PCT出願公開第WO93/08829
号(1993年5月13日公開)およびトラウネッカー等、EMBO、10巻365
5−3659頁(1991)に開示されている。
異なったそしてより好ましいアプローチによると、所望の結合特異性を有する
抗体可変ドメイン(抗原−抗体結合部位)を、免疫グロブリン不変ドメイン配列
と融合させる。この融合は好ましくは、少なくともヒンジの一部、ならびに免疫
グロブリン重鎖の第二および第三不変領域(CH2およびCH3)を含む免疫グ
ロブリン重鎖不変ドメインとの融合である。軽鎖の結合に必要な部位を含む第一
の重鎖不変領域(CH1)を、融合物の少なくとも一つに存在させることが望ま
しい。免疫グロブリン重鎖の融合物、および、所望ならば免疫グロブリン軽鎖を
コードしているDNAを、別個の発現ベクター中に挿入し、適当な宿主生物に同
時トランスフェクトする。この事により、組み立てに使用される三つのポリペプ
チド鎖の等しくない比率が最適の収率を提供する態様において、三つのポリペプ
チドフラグメントの相互の割合の調節に大きな融通性が与えられる。しかし、少
なくとも二つのポリペプチド鎖の等しい比率での発現が高収率をもたらす時、ま
たは、その比率が特に重要性を持たない時は、2または3個全てのポリペプチド
鎖のためのコード化配列を一つの発現ベクターに挿入することが可能である。こ
のアプローチの好ましい態様において、二重特異性抗体は、一方の腕に第一の結
合特異性を有するハイブリッド免疫グロブリン重鎖、そして他方の腕のハイブリ
ッド免疫グロブリン重鎖−軽鎖対(第二の結合特異性を提供する)で構成される
。その二重特異性分子の半分しか免疫グロブリン軽鎖がないことで容易な分離法
が提供されるため、この非対称的構造は、所望の二重特異性化合物を不要な免疫
グロブリン鎖の組み合わせから分離することを容易にするとわかった。このアプ
ローチは、1992年8月17日出願の同時係属出願第07/931811号に
開示されている。
二重特異性抗体を作製するさらなる詳細については、例えばスレッシュ等、Me
thods in Enzymology、121巻210頁(1986)を参照されたい。
(v)ヘテロコンジュゲート抗体
ヘテロコンジュゲート抗体もまた本発明の範囲内にある。ヘテロコンジュゲー
ト抗体は、共有結合により連結した二つの抗体で構成される。このような抗体は
、例えば、不要の細胞に対する免疫系細胞を標的とするため[米国特許第467
6980号]、そしてHIV感染の処置のため[PCT出願公開第WO91/0
0360およびWO92/200373;EP03089]に提唱された。ヘテ
ロコンジュゲート抗体は、任意の簡便な架橋法を用いて作製することができる。
好適な架橋剤は当分野において良く知られており、幾つかの架橋技術と共に米国
特許第4676980号に開示されている。
L.TRAF分子の用途
本発明に係るTRAF蛋白の重要な一つの適用は、TNF−R2、CD40お
よび/またはエプスタイン−バールウイルストランスフォーミング蛋白LMP1
の細胞質ドメインと、直接的または間接的に関係する能力に基づくものである。
したがって、TRAF蛋白は、TNF−R2、CD40および/またはLMP1
により仲介される生物活性のインヒビターを同定する生化学検定に使用すること
ができる。例えば、TNF−R2 TRAF蛋白、例えばTRAF2の相互作用
のインヒビターは、TNFの発現に付随する種々の病理学的状態、例えばエンド
トキシン(敗血症性)ショックおよび慢性関節リウマチ(RA)の処置に有用と
なり得る。同様に、LMP1:TRAF(例えばTRAF2)相互作用のインヒ
ビターは、LMP1オンコジーンにより仲介される病理学的状態の遮断に使用で
きる。
好ましくは、これらの検定は、例えばマッチメイカー・二ハイブリッド系(ク
ロンテク)を用いて、本質的には下記の実施例に例示されるように、「二ハイブ
リッド」検定様式で実施する。TNF−R2、CD40またはLMP1の細胞質
ドメインを含む組換えグルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)融合蛋
白の大規模生産および精製は、実施例に記載のように行う。組換えTRAF蛋白
の大規模生産のため、対応するTRAF cDNAを、バキュロウィルス発現系
(ファーミノゲン、サンディエゴから入手し得る市販の「バキュロゴールド」発
現キット)を用いてHi5昆虫細胞(インビトロゲン、サンディエゴ)において
発現させる。組換えTRAFに、精製を可能にするためのポリヒスチジン標識(
実施例4の抗TRAF抗体の産生の記述を参照されたい)、および、インビトロ
での放射性標識化のための心筋キナーゼ(シグマ)の認識部位を付ける。生化学
的スクリーニング検定をロボット自動化システムで実施するが、そこでは、GS
T−TNF−R2または/CD40または/LMP1融合蛋白を96ウェル微量
定量プレート中に被覆し、放射標識されたTRAF蛋白を種々の化合物の存在下
で加える。1時間のインキュベーションの後、プレートを洗浄して非結合TRA
F蛋白を除去し、捕捉された放射能を計数する。化合物が添加されなかった対照
ウェルと比較して低下した捕捉放射能によって、TRAF蛋白およびGST−T
NF−R2/CD40/LMP1融合蛋白の間の相互作用を防止するインヒビタ
ーを同定する。
特別な態様において、TRAF/TNF−R2、TRAF/CD40、および
/またはTRAF/LMP1相互作用のインヒビターは天然TRAFの機能的誘
導体、例えばアミノ酸配列変異体である。このようなアミノ酸配列変異体の一つ
は、天然TRAF2とTNF−R2、CD40およびLMP1の相互作用の強力
なインヒビターである、天然TRAF2アミノ酸配列のアミノ酸87−501を
含む蛋白:TRAF2(87−501)である(実施例6を参照されたい)。T
NF−R2の細胞内ドメインと特異的に関係するそれらの能力に基づき、本発明
に係るTRAF分子はTNF−R2の精製に使用できるが、一方このTNF−R
2は、可溶性TNF−R2蛋白として、または免疫グロブリン融合蛋白の形で、
TNFの発現に付随する様々な病理学的状態、例えばエンドトキシン(敗血症性
)ショックおよび慢性関節リウマチ(RA)の処置に有用である。これらのおよ
びその他の疾病の処置に有効な用量は、常套的実験により決定することができる
。CD40およびLMP1は、TRAF蛋白、例えばTRAF2がこれらの蛋白
に結合する能力を利用して、類似の方法で精製することができる。
本発明に係るTRAF分子はさらに、遮断(アンタゴニスト)またはアゴニス
ト抗TRAF抗体(これはTNF−R2により仲介(全面的にまたは部分的に)
されるTNF生物活性の遮断もしくは模倣に、または該抗体が結合するエピトー
プを有する他のTRAF蛋白の精製に使用することができる)の作成に使用する
ことができる。抗TRAF抗体を作製する遺伝学的方法は上に記載されており、
特に実施例4に例示されている。このような抗体は、TRAF/TNF−R2/
CD40/LMP1相互作用のインヒビターの同定のために上に記載されたもの
と類似の検定系で、アゴニストおよびアンタゴニスト性についてスクリーニング
することができる。
本発明に係るTRAF蛋白を用いて同定されまたは精製された抗体、他のポリ
ペプチドまたは小有機分子を含む、または本発明に係るTRAF蛋白(機能的誘
導体を包含する)を含む治療用調製品は、所望の純度を有する活性成分を、所望
により生理学的に許容し得る担体、賦形剤または安定剤と混合[レミントンズ・
ファーマシューティカル・サイエンシズ、16版、A.オソール編(1980)
]することにより、凍結乾燥調整品または水溶液の形で保存用に製造される。許
容し得る担体、賦形剤または安定剤は、使用される用量および濃度において受容
者にとって非毒性であり、燐酸塩、クエン酸塩およびその他の有機酸のような緩
衝
剤;アスコルビン酸を包含する抗酸化剤;低分子量(約10残基未満)ポリペプ
チド;血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリンのような蛋白;ポリビニ
ルピロリドンのような親水性ポリマー、グリシン、グルタミン、アスパラギン、
アルギニンまたはリジンのようなアミノ酸;グルコース、マンノース、またはデ
キストリンを包含する単糖類、二糖類およびその他の炭水化物;EDTAのよう
なキレート試薬;マンニトールまたはソルビトールのような糖アルコール;ナト
リウムのような塩形成対イオン;および/またはトゥイーン、プルロニクスまた
はPEGのような非イオン性界面活性剤を包含する。
活性成分はまた、例えばコアセルベーション技術または界面重合(それぞれ例
えばヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチンマイクロカプセルおよびポリ−
(メチルメタクリラート)マイクロカプセル)により製造されるマイクロカプセ
ル中に、コロイド薬物デリバリー系(例えば、リポソーム、アルブミンミクロス
フェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子およびナノカプセル)中に、またはマ
クロエマルジョン中に捕捉することもできる。このような技術はレミントンズ・
ファーマシューティカル・サイエンシズ、上記、に開示されている。
インビボ投与のために使用される調製物は無菌でなければならない。これは、
凍結乾燥および再構成の前または後に、無菌濾過膜での濾過によって容易に達成
される。
本発明に係る治療用組成物は、一般に、無菌取り出し口を有する容器、例えば
静脈内溶液用袋または皮下注射針が貫通し得る栓を有するバイアル中に入れる。
投与経路は既知の方法、例えば静脈内、腹腔内、脳内、筋肉内、眼内、動脈内
もしくは病変内経路による注射または注入、局所投与、または持続放出系に従う
。
持続放出製剤の好適な例には、成型された材料の形の半透過性ポリマーマトリ
ックス、例えばフィルムまたはマイクロカプセルが包含される。徐放性マトリッ
クスは、ポリエステル類、ヒドロゲル類、ポリラクチド類[米国特許37739
19、EP58481]、L−グルタミン酸およびγエチル−L−グルタマート
のコポリマー[U.シドマン等、Biopolymers、22(1)巻547−556頁(
1983)]、ポリ(2−ヒドロキシエチル−メタクリラート)[R.ランガー等
、
J.Biomed.Mater.Res.、15巻167−277頁(1981)およびR.ランガー
、Chem.Tech.、12巻98−105頁(1982)]、エチレンビニルアセター
ト[R.ランガー等、同]またはポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸[EP1
33988A]を包含する。持続放出組成物はリポソームをも包含する。本発明
の範囲内の分子を含有するリポソームは、自体既知の方法によって製造される:
DE3218121A;エプシュタイン等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、82巻3
688−3692頁(1985);ファング等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、77
巻4030−4034頁(1980);EP52322A;EP36676A;
EP88046A;EP143949A;EP142641A;日本国特許出願
83−118008;米国特許4485045および4544545;ならびに
EP102324A。通常、リポソームは、脂質含有量が約30mol%コレス
テロール以上である、小さな(約200−800オングストローム)単層型のも
のであり、選択される比率は最適なNT−4療法のために調節される。
活性分子の有効量は、例えば治療目的、投与経路、および患者の状態に依存す
るであろう。したがって治療者は、最適の治療効果の獲得に必要な用量を滴定し
投与経路を修飾する必要があるであろう。典型的な日用量は、上に述べた因子に
応じて、約1μg/kgから100mg/kgまでまたはこれ以上の範囲となろ
う。典型的には、臨床医は、本発明に係る分子を、必要な生物学的効果を提供す
る用量に到達するまで投与するであろう。この治療の進行は常套的検定により容
易に監視される。
本発明のさらなる詳細は、以下の非限定的実施例から明らかであろう。
実施例1 TRAF1の精製
A.細胞培養および生物学的試薬
マウスインターロイキン2(IL−2)依存性細胞障害性TセルラインCT6
[レインジズ等、J.Immunol.、142巻1203−1208頁(1989)]を
、10−20単位の組換えヒトIL−2(ベーリンガー・マンハイム)、10−
15%牛胎児血清(ハイクローン)、2mML−グルタミン、10-5Mβ−メル
カプトエタノール、ml当たり100単位のペニシリン、およびml当たり10
0μgのストレプトマイシン(ジブコ/BRL)を添加したRPMI1640培
地で培養した。ヒトT細胞リンパ腫ラインジャーカットをアメリカン・タイプ・
カルチャー・コレクション(ATCC、ロックヴィル、MD)より取得し、10
%牛胎児血清を含有するRPMI1640培地に維持した。ヒト胚腎臓セルライ
ン293(ATCC CRL1573)およびhTNF−R2を過剰発現する2
93細胞(293/TNF−R2)を、記載に従って維持した[ペニカ等、J.Bi
ol.Chem.、267巻21172−21178頁(1992)]。組換えhTNF
および組換えmTNF(比活性>107単位/mg)はジェネンテク・マニュフ
ァクチュアリング・グループにより提供された。ウサギ抗ヒトおよび抗マウスT
NF−R2抗体はかつて記載された[ペニカ等、上記;タータグリア等、J.Biol
.Chem.、267巻4304−4307頁(1991)]。抗ヒトTNF−R1モ
ノクローナル抗体986(IgG2aイソタイプ)および抗ヒトTNF−R2モ
ノクローナル抗体1036、1035および1038(それぞれIgG2b、I
gG2aおよびIgG2bイソタイプ)は記載のようにして作製した[ペニカ等
、Biochemistry、31巻1134−1141頁(1992)]。
B.hTNF−R2の細胞内ドメインの突然変異分析
TNFにより誘導されるマウスCT6細胞の増殖は75kdTNFレセプター
により仲介されることが示された[TNF−R2;タータグリア等、1991、
上記]。さらに、TNF−R2は転写因子NF−κBを活性化し[レナードおよ
びバルティモア、Cell,58巻227−229頁(1989)]、顆粒球−マク
ロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)遺伝子[ミヤタケ等、EMBO J.、
4巻2561−2568頁(1985);スタンレイ等、EMBO J.、4巻256
9−2573頁(1985)]およびA20亜鉛フィンガー蛋白遺伝子[オピパ
リ等、J.Biol.Chem.、265巻14705−14708頁(1990)]の転写
誘導をCT6細胞中で仲介する(図1)。
TNFシグナル伝達に必要なhTNF−R2の細胞内ドメイン(hTNF−R
2icd)内の配列を同定するため、末端切除された細胞内ドメインを有するレ
セプターをコードしている一連の突然変異体hTNF−R2発現ベクターを作成
した。C末端切除されているhTNR−R2icdを含むDNAフラグメントを
、PfuDNAポリメラーゼ(ストラタジーン)を用いるPCRによって、全長
発現ベクターpRK−TNF−R2から増幅した[タータグリア等、Cell、73
巻213−216頁(1993)]。PCRを、95℃6分間の最初の工程後、
20サイクル(95℃で45秒間;55℃で60秒間;72℃で60秒間)実施
した。野生型hTNF−R2のアミノ酸424−439を欠く細胞内ドメインを
コードしている0.5kbDNAフラグメントを、オリゴヌクレオチドプライマ
ー5'−CCTTGTGCCTGCAGAGAGAAG−3'(配列番号23)お
よび5'−CTAGGTTAACTTTCGGTGCTCCCCAGCAGGG
TCTC−3'(配列番号24)を用いて増幅した。このフラグメントをPst
IおよびHindIIで消化し、ゲル精製し、そして発現ベクターpRISを用い
てhTNF−R2 cDNA中に再クローニングした[タータグリアおよびゲッ
デル、J.Biol.Chem.、267巻4304−4307頁(1992);hTNF−
R2(−16)]。アミノ酸403−439(5'−CTAGGTTAACTG
GAGAAGGGGACCTGCTCGTCCTT−3'(配列番号25);h
TNF−R2(−37))、アミノ酸381−439(5'−CTAGGTTA
ACTGCTGGCTTGGGAGGAGCACTGTGA−3'(配列番号2
6);hTNF−R2(−59)、アミノ酸346−439(5'−CTAGG
TTAACTGCTCCCGGTGCTGG CCCGGGCCTC−3'(配列
番号27);hTNF−R2(−94))およびアミノ酸308−439(5'
−CTAGGTTAACTGCACTGGCCGAGCTCTCCAGGGA−
3'(配列番号28);hTNF−R2(−132))を欠くレセプターをコー
ドしている類似の突然変異体hTNF−R2発現ベクターを作成した。hTNF
−R2のアミノ酸304−345の除去は、pRK−TNF−R2のSacIに
よる部分消化およびこのベクターの再ライゲーションによって組み立てた(hT
NF
−R2(△304−345))。hTNF−R2の細胞内ドメイン全体の除去は
、貫膜ドメインに隣接するPstI部位とClaI部位との間の配列を、Gln273
の直後のフレーム内停止コドンを含む二本鎖オリゴヌクレオチド(5'−GT
GATGAGAATTCAT−3'(配列番号29)および5'−CGATGAA
TTCTCATCACTGCA−3')(配列番号30)で置き換えることによ
り、pRK−TNF−R2から組み立てた。Ser393をAlaに変換する突然
変異を、記載のような位置指定突然変異生成によってhTNF−R2cDNAに
導入した[タータグリア等、Cell、74巻845−853頁(1993);hT
NF−R2(S393A)]。正しく修飾されたcDNAの確認を、シークエナ
ーゼ2.0配列決定キット(U.S.バイオケミカル)を用いる二本鎖配列決定によ
って行った。
無傷のおよび末端切除されたhTNF−R2をコードしている発現ベクターを
、電気穿孔によりCT6細胞中に導入した。RPMI1640培地0.3ml中
の5x106細胞を、キャパシタンスエキステンダーつきのバイオ−ラド・ジー
ン・パルサー(0.4cmキュベット、960μF、250V)を用いて、Sc
aI消化されたpRK.neo0.5μg[タータグリアおよびゲッデル、19
92、上記]およびScaI消化されたhTNF−R2発現ベクター20μgで
同時トランスフェクトした。電気穿孔された細胞を培地50mlに再懸濁し、2
日後、100μg/mlのG418(ジブコ/BRL)を含有する選択培地での
限界希釈により96ウェル微量定量プレートに入れた。3週間後、個々のG41
8耐性クローンを釣り上げ、拡張した。hTNF−R2を発現するクローンを、
記載のようにFACS分析によって同定した[第1表;ペニカ等、J.Biol.Chem.
、1992、上記]。
全長および末端切除されたhTNF−R2を発現するCT6クローンの増殖を
、記載のように[3H]チミジン取り込みにより測定した[タータグリア等、Pro
c.Natl.Acad.Sci.USA、88巻9292−9296頁(1991)]。NK−κ
B活性化を、記載のように、刺激または非刺激CT6細胞から調製された核抽出
物を用いる電気泳動移動度シフト検定によって分析した[シュッツェ等、Cell、
7
1巻765−776頁(1992)]。
第1表は、CT6細胞におけるトランスフェクトされたhTNF−R2シグナ
ルの増幅およびNF−κB活性化を示している。さらに、C末端16アミノ酸ま
たは内部42アミノ酸304−345を欠く突然変異体ヒトレセプターはこれら
の活性の仲介において尚機能的である。対照的に、C末端37アミノ酸を欠く、
またはさらなるC末端除去を含む突然変異体レセプターはこれらの検定において
不活性である。これらの結果は、アミノ酸346−423を含むhTNF−R2
の細胞内ドメイン中の78個のアミノ酸領域が、TNFシグナル伝達の仲介に必
要であることを示している。この領域は、可能性ある蛋白キナーゼC燐酸化部位
(Ser393−Pro394−Lys395)を含んでおり、これはマウスTNF−R
2において保存されている。しかしながら、Ser393の代わりにAlaを含む
突然変異体hTNF−R2は生物学的に機能的であり(第1表)、これは、この
燐酸化部位がTNF−R2仲介シグナル伝達に関与していないことを示すもので
ある。
C.hTNF−R2の細胞内ドメインと関係する因子の同定
hTNF−R2の細胞内ドメインと関係する因子を同定するため、[35S]標
識されトランスフェクトされたCT6細胞の溶解液由来のレセプターの免疫沈降
を行った。野生型hTNF−R2を発現するCT6細胞5x106を、システイ
ンおよびメチオニン無しの低グルコースダルベッコ改良イーグル培地で2回洗浄
し、新しい培地中で30分間インキュベートした。この細胞を、[35S]システ
インおよび[35S]メチオニン(L−[35S]−インビトロ細胞標識化混合物5
0μCi/ml;アマーシャム)を含有する培地(システインおよびメチオニン
無し)5mlを入れた100mmプレートに蒔いた。細胞を37℃で4時間イン
キュベートし、100ng/mlのhTNFで10分間刺激し、収穫し、冷PB
Sで2回洗浄し、そして50mM HEPES pH7.2、250mM NaC
l、10%グリセロール、2mM EDTA、1mM PMSF、1μg/mlベ
ンズアミジン、1μg/mlアプロチニン、1μg/mlロイペプチンを含有す
る0.1%NP40溶菌緩衝液1mlで4℃で20分間溶菌した。4℃、100
00xgで10分間遠心することにより、核および細胞の破片を除去した。この
細胞溶菌液をパンソルビン(カルビオケム)50μlで4℃で1時間、前もって
清澄化した。トランスフェクトしていないCT6細胞由来の非標識化溶菌液1m
lを用いて前吸着しておいた抗hTNF−R2モノクローナル抗体1035およ
び1038各1μg(hTNF−R2の細胞外ドメインの異なったエピトープに
対するもの)と共に4℃で8時間、溶菌液をインキュベートし、そしてプロテイ
ンA−アガロースビーズ(オンコジーン・サイエンス)15μlと共に集めた。
ビーズを溶菌緩衝液で良く洗浄し、SDS試料緩衝液に再懸濁し、そして上清を
4−12%または8%トリス/グリシンポリアクリルアミドゲル上で電気泳動し
た。ゲルを固定し、アンプリファイ(アマーシャム)中でインキュベートし、乾
燥し、そして−80℃でフィルムに暴露した。
45ないし50−56kdの範囲の幾つかのバンドおよびおよそ68kdの1
個のバンドが、CT6細胞において免疫沈降したhTNF−R2と共に特異的に
共同沈降した(図2a)。hTNF−R2を非標識化293/TNF−R2細胞
から免疫沈降させ、続いてトランスフェクトしていないCT6細胞からの標識化
溶菌液と共にインキュベーションする時にも同じ結果が得られた(図2b)。h
TNF−R2と共同沈降したバンドのパターンは、溶菌液がhTNFで刺激して
おいた細胞から調製されたか、または、刺激していない細胞から調製されたかに
拘わらず、同一であったが、これは、これらの蛋白がhTNF−R2と構造的に
関係していることを示すものである。これは、エリスロポエチンレセプターの細
胞内ドメインと関係しているチロシンキナーゼJAK2について観察される結果
と同様である[ウィトフーン等、Cell、74巻227−236頁(1993)]。
hTNF−R2icdと関係する因子のための大規模精製法を確立するため、
hTNF−R2の細胞内ドメインを、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(
GST)融合蛋白として発現させた[スミスおよびジョンソン、1988、上記
]。hTNF−R2の細胞内ドメインを、オリゴヌクレオチドプライマー5'−
GATCGGATCCAAAAAGAAGCCCTTGTGCCTGCA−3'
(配列番号31)および5'−GCCTGGTTAACTGGGC−3'(配列番
号3
2)を使用し上記のようにPfu DNAポリメラーゼを用いるPCRによって
pRK−TNF−R2から増幅させた。増幅した0.55kb DNAフラグメ
ントを平滑末端化し、BamHIで消化し、そしてBamHI/SmaI消化さ
れたpGEX−2TKベクター中にクローニングした(ファルマシア;pGST
−hTNF−R2icd)。このpGST−hTNF−R2icdプラスミドを
、染色体上にlacIq遺伝子を有するE.coliK12のプロテアーゼ欠失
株(ジェネンテク)中に導入し、一夜培養を、カルベニシリン100μg/ml
を含有する新鮮なLB培地で1:10に希釈し、そして37℃で2時間増殖させ
た。0.1mM IPTGで誘導した後、細胞を37℃で1時間増殖させ、ペレ
ット化し、冷PBSで1回洗浄した。この細胞を、20mMトリスHCl pH
7.5、1M NaCl、5mM EDTA、1mM DTT、1mM PMSF、
1μg/mlベンズアミジン、1μg/mlアプロチニン、1μg/mlロイペ
プチンを含有する再懸濁緩衝液1/100培養容量に再懸濁した。氷上で超音波
処理した後、不溶性物質を4℃、10000xgで15分間遠心することにより
除去した。トリトンX−100を1%となるまで加え、細胞溶解液を、培養容量
1L当たりPBS中のグルタチオン−アガロースビーズの50%スラリー(硫黄
結合;シグマ)500μlと共に、回転体上で30分間室温でインキュベートし
た。500xgで短時間遠心することによりビーズを集め、再懸濁緩衝液で良く
洗浄した。精製されたGST−hTNF−R2icd融合蛋白のアリコートをS
DS−PAGEにより分析した(図3)。5−8mgの融合蛋白/ml(膨潤し
たビーズ)の濃度が常法により得られた。
共有結合したGST−hTNF−R2icd融合蛋白親和マトリックスを調製
するため、50mM還元型グルタチオン(シグマ)を含有する250mMトリス
HCl pH8.0の1ビーズ容量による3x30分間洗浄を用いて遊離グルタ
チオンと競合させることにより、この融合蛋白をグルタチオン−アガロースビー
ズから溶離した。溶離した融合蛋白を、0.1M HEPES pH7.2、15
0mMNaClに対して透析し、製造者の指示に従ってアフィゲル10/15(
2:1比;バイオ−ラド)と共有結合させた。10mg/ml(膨潤したビーズ
)
までの融合蛋白濃度が得られた。
融合蛋白3μlを、上記のようにして[35S]標識したCT6細胞から調製さ
れた細胞溶菌液1mlとインキュベートすることにより、GST−hTNF−R
2icd融合蛋白による共同沈降実験を実施した。4℃で8時間の後、融合蛋白
ビーズを溶菌緩衝液で良く洗浄し、SDS−PAGEおよびオートラジオグラフ
ィーによって分析した。バンドのパターンは、グルタチオン−アガロースビーズ
に結合した、またはアフィゲル10/15に共有結合したGST−hTNF−R
2icd融合蛋白と特異的に共同沈降することが判明し(図4)、これは免疫沈
降したhTNF−R2と共同沈降しているバンドと極めて大きさが似ていた(図
3を参照されたい)。この事は、大腸菌で発現されたGST−hTNF−R2i
cd融合蛋白こそが、CT6細胞中で野生型hTNF−R2と同じ細胞内因子と
関係することを示唆している。
上記の突然変異分析に従って、突然変異体細胞内ドメインを有するGST−h
TNF−R2icd融合蛋白をコードしている発現ベクターを作成した。突然変
異体−16、−37、−59および△304−345hTNF−R2をコードし
ている野生型hTNF−R2icd DNAフラグメントのための方法と同じ方
法を用いて、細胞内ドメインをPCRにより増幅し、そしてpGEX−2TKベ
クター中にクローニングした。さらに、オリゴヌクレオチドプライマー5'−G
ATCGGATCCGGAGACACAGATTCCAGCCCC−3'(配列
番号53)および5'−GATCGAATTCTTAACTCTTCGGTGC
TCCCCAGCAG−3'(配列番号54)を用いて0.14kbDNAフラ
グメントを増幅し、BamHIおよびEcoRIで消化し、そしてpGEX−2
TK中にクローニングした。このDNAフラグメントはhTNF−R2icdの
アミノ酸384−424に対応する41アミノ酸のペプチドをコードしている。
融合蛋白を発現させ、精製し、そして共同沈降する蛋白について上記のように検
定した。
図5に示されるように、機能的レセプター突然変異体hTNF−R2(−16
)およびhTNF−R2(△304−345)の細胞内ドメインを含むGST−
h
TNF−R2icd融合蛋白は、野生型hTNF−R2icdを含む融合蛋白と
同じバンドを共同沈降させた。対照的に、不活性突然変異体hTNF−R2(−
37)およびhTNF−R2(−59)の細胞内ドメインを含むGST−hTN
F−R2icd融合蛋白は、これらのバンドを共同沈降させなかった。突然変異
体細胞内ドメインを伴うhTNF−R2の生物活性と、対応するGST−hTN
F−R2icd融合蛋白で得られた共同沈降結果との間のこの相関は、野生型G
ST−hTNF−R2icd融合蛋白が免疫沈降したhTNF−R2と同じ細胞
内因子と関係するという観察を支持するものである。
加えて、GST−hTNF−R2icd(384−424)融合蛋白は、他の
融合蛋白より程度は弱いものの、45ないし50−56kdおよび68kdにバ
ンドを共同沈降させることができた(図5)。このGST融合蛋白中に含まれる
hTNF−R2icdの41個のアミノ酸は、CT6細胞においてTNFシグナ
ル伝達を仲介するのに必要であると同定されている(上記参照)hTNF−R2
icdの78アミノ酸領域の中に含まれている。この事は、hTNF−R2ic
dのこの短い領域が、可能性あるシグナル伝達分子とレセプターとの関係の仲介
に十分であることを示唆している。
hTNF−R2を非標識化293/TNF−R2細胞から免疫沈降させ、次い
で、GST−hTNF−R2icd融合蛋白ビーズ50μlで前もって清澄化し
ておいた標識化CT6細胞溶菌液とインキュベートする、競合的共同沈降実験を
実施した。GSTビーズのみまたはGST−hTNF−R2icd(−37)お
よびGST−hTNF−R2icd(−59)融合蛋白ビーズとのCT6抽出液
の前インキュベーションは、免疫沈降したhTNF−R2と共同沈降する蛋白の
パターンに影響しなかった(図6)。ところが、細胞溶菌液をGST−hTNF
−R2icdまたはGST−hTNF−R2icd(−16)融合蛋白ビーズで
前もって清澄化した場合、これらの蛋白は免疫沈降したhTNF−R2と共同沈
降せず、この事は、これらがGST−hTNF−R2icd融合蛋白によって、
標識化CT6細胞抽出液から涸渇していたことを示すものである。この結果は、
野生型GST−hTNF−R2icd融合蛋白が、免疫沈降したhTNF−R2
と同じ細胞内因子と関係することを証明する。したがって、このGST融合蛋白
材料は、hTNF−R2の細胞内ドメインと関係する因子の大規模精製に使用す
ることができる。[35S]標識化ヒトジャーカット細胞から調製された細胞溶菌
液によるGST−hTNF−R2icd融合ビーズの共同沈降実験は、マウスC
T6溶菌液で観察されたパターンと大きさが極めて似通った共同沈降蛋白のパタ
ーンを明らかにした(図7)。この事は、TNF−R2関連因子がマウスおよび
ヒトの種間で密接に関連していることを示唆している。
hTNF−R2関連因子の細胞内局在を研究するため、CT6細胞の細胞質画
分および膜画分を、本質上、記載のようにして調製した[ドイチャー、Methods
in Enzymol.、182巻:アカデミック・プレス、サンディエゴ(1990)]
。簡潔に述べると、[35S]標識化CT6細胞を冷PBSで1回、そして50m
MトリスHCl pH7.4、100mM NaCl、1mM EDTA、1mM
PMSF、1μg/mlアプロチニンおよび1μg/mlロイペプチンを含有す
る等張塩緩衝液で1回洗浄した。細胞を5mlの等張塩緩衝液に再懸濁し、そし
てガラスドウンサー(フィートン)中、「B」乳棒を用いて20ストロークで溶
菌した。大きな細胞破片を750xgで10分間4℃で遠心することにより除去
し、そして上清を100000xgで30分間、4℃で超遠心に付した。細胞質
画分を構成する上清を除去し、ペレットを、50mMトリスHCl pH7.4
、1mM EDTA、1mM PMSF、1μg/mlアプロチニン、1μg/m
lロイペプチンに再懸濁した。この粗製の膜画分をPBS中の35%w/vショ
糖のクッション上に積層し、そして30000xgで45分間4℃で遠心した。
ショ糖および緩衝液相の間の界面にある精製された細胞膜画分を注意深く除去し
、100000xgで30分間、4℃での遠心により濃縮し、そして4℃で30
分間、0.1%NP40溶菌緩衝液で抽出した。細胞膜溶菌液および細胞質画分
を、上記のように、GST−hTNF−R2融合蛋白ビーズによる共同沈降実験
に使用した。
hTNF−R2icdと関係する因子は、細胞質の細胞画分に存在することが
判明した(図8)。これらの因子がhTNF−R2icdと構成的に関係してい
るという観察(上記参照)と合致して、少量が、精製された細胞膜画分にも検出
された。
D.大規模精製
hTNF−R2icd関連因子の大規模精製のため、CT6細胞(3x1010
細胞)601を収穫し、そして冷PBSで2回洗浄した。以下の全ての操作は4
℃で行った。100mM NaClを含有する0.1%NP40溶菌緩衝液12
0mlを添加することにより、細胞を溶菌し、30分間穏やかに振盪した。10
000xgで10分間遠心することにより、不溶性物質を除去した。次に、上清
を100000xgで1時間遠心し、そして500mM NaClを含有する溶
菌緩衝液に対して透析した。以下の全ての精製工程は、500mM NaClを
含有する溶菌緩衝液中で実施した。細胞溶菌液を、15mlのグルタチオン−ア
ガロースGST−hTNF−R2icd(−37)融合蛋白前吸着カラムに通し
た。流出液を、0.3mlアフィゲル10/15 GST−hTNF−R2ic
d融合蛋白親和カラムに適用した。対照のため、平行してこの溶菌液を、類似の
アフィゲル10/15 GST−hTNF−R2icd(−37)融合蛋白親和
カラムに通した。良く洗浄した後、樹脂に結合した蛋白を、0.1M DTTを
含有するイムノピュア・ジェントルAg/Ab溶離緩衝液(ピアス)5カラム容
量で溶出し、メタノール/クロロホルムで沈澱させ、そして5%SDSを含有す
るSDS試料緩衝液に再懸濁した。この物質の十分の一を還元条件下のSDS−
PAGEにより分離し、銀染色により可視化した(図9)。GST−hTNF−
R2icd融合蛋白親和カラムから特異的に溶出した蛋白バンドは、およそ45
ないし50−56kdおよび68−70kdに観察された。
残りの精製された物質をSDS−PAGEにより分離し、PVDF配列決定膜
(ミリポア)に電気泳動的に移し、蛋白をR250での染色により可視化した。
45kdの蛋白バンド(TNFレセプター関連因子1またはTRAF1)を切り
取り、アプライド・バイオシステムズシークエンサー上で自動エドマン分解によ
るアミノ酸配列分析に付した。この物質はN末端遮断されているとわかったため
、内部配列情報は、個々のペプチドをプロテアーゼ消化後、逆相毛管HPLCに
よ
り精製した後に配列分析して得た。それぞれトリプシンおよびリジンC消化から
得られた2個のペプチドは、配列APMALERおよびKHAYVK(配列番号
41および42)を持っていた。
実施例2 TRAF1の組換え生産
上のペプチドの配列に基づき、以下の縮重オリゴヌクレオチドを設計した:B
P50−1センス、5'−GCNCCNATGGCNYTNGARC/AG(配
列番号33−35);BP50−1アンチセンス、5'−CT/GYTCNAR
NGCCATNGGNGC(配列番号36−38);BP50−11センス、5
'−AARCAYGCNTAYGTNAA(配列番号39);BP50−11ア
ンチセンス、5'−TTNACRTANGCRTGYTT(配列番号40)。C
T6細胞から分離されたポリ(A)+mRNA1μgをオリゴ(dT)プライミ
ングし、そして製造者の指示に従いcDNAサイクル・キット(インビトロゲン
)を用いて逆転写した。第一の鎖CT6cDNAを、上に列挙した縮重オリゴヌ
クレオチドの組み合わせにより、シータス・ジーンアンプ・キットおよびパーキ
ン−エルマー・サーモサイクラーを用いてPCRに付した。PCRは、95℃6
分間の最初の工程後、35サイクル(95℃で45秒間;55℃で60秒間;7
2℃で150秒間)実施した。PCR生成物を1.6%アガロースゲル上の電気
泳動により分析した。BP50−1センスおよびBP50−11アンチセンス
クーマニー・ブリリアント・ブルーR−250(シグマ)というプライマーの組
み合わせにより得られたPCR反応は、およそ0.75kgの増幅されたDNA
フラグメントを含んでいた。このフラグメントをゲル精製し、pブルースクリプ
トKS(ストラタジーン)中にサブクローニングし、そして配列決定した。
クローニングされたPCRフラグメントから0.65kb PstI DNAフ
ラグメントを分離し、T7クイック・プライム・キット(ファルマシア)を用い
て[α32P]dCTPで標識した。製造者の指示に従い、cDNA合成およびラ
ムダクローニングのためのスーパースクリプトラムダシステム(ジブコ/BRL
)を使用し、λgt22a中に組み立てておいたCT6 cDNAライブラリー
由来のおよそ1x106の組換えファージクローンをスクリーニングするため、
こ
の標識されたフラグメントを使用した。ハイブリダイゼーションおよびフィルタ
ーの洗浄を、標準プロトコルに従い高緊縮条件下で実施した[アウスベル等、カ
レント・プロトコルズ・イン・モレキュラー・バイオロジー、グリーン・パブリ
ッシング・アソシエイツ・アンド・ウィレイ・インターサイエンス、ニューヨー
ク、1987]。4個の陽性クローンを二次スクリーニングによりプラーク精製
した。これらのファージクローンのcDNA挿入物をpブルースクリプトKS中
にサブクローニングし、両方の鎖について配列決定した(図10)。最長のcD
NAは2kbであるとわかった。他の3個のcDNAクローンは、この2kb
cDNAクローンの末端切除型を表していた。2kb cDNAクローンは、4
09アミノ酸の蛋白をコードしているオープンリーディングフレームを含んでい
た(図10)。予想された蛋白内部には、配列APMALER(配列番号41)
およびKHAYVK(配列番号42)、ならびに蛋白配列分析から得られた別の
2個のペプチド配列に対応する配列PGSNLGS(配列番号43)およびKD
DTMFLK(配列番号44)があった。これらの結果により、分離された2k
b cDNAクローンが、精製されたTRAF1をコードしていることが確認で
きる。
TRAF1および他の既知の配列の間の類似性を分析するため、TRAF1配
列をジェネンテク蛋白データベースに対して検索した。TRAF1および他の既
知の蛋白の間には有意性のある明白な類似性は見いだされず、この事はTRAF
1が新規な分子であることを示している。
実施例3 TRAF2の同定およびクローニング
TNF−R2の細胞内ドメインと関係する蛋白をコードしている遺伝子を直接
分離するため、蛋白−蛋白相互作用の検出のための酵母二ハイブリッド系(フィ
ールズおよびソング、Nature、340巻245−245頁[1989])を使用
した。
オリゴヌクレオチドプライマー5'−TCGATCGTCGACCAAAAA
GAAGCCCTCCTGCCTACAA−3'(配列番号45)および5'−C
TAGAGATCTCAGGGGTCAGGCCACTTT−3'(配列番号4
6)を使用し、上記のようにしてPfuDNAポリメラーゼによるPCRにより
、
hTNF−R2の細胞内ドメインをpRK−TNF−R2から増幅した。増幅さ
れた0.55kb DNAフラグメントをSalIおよびBglIIで消化し、ゲ
ル精製し、そしてGAL4 DNA結合ドメインベクターpPC97(シェヴレ
イおよびナタンス、1992、上記;pPC97−hTNF−R2icd)中に
クローニングした。hTNF−R2icd(−16)(5'−CTAGA GAT
CTGTTAACTTTCGGTGCTCCCCAGCAGGGTCTC−3'
(配列番号47);pPC97−hTNF−R2icd(−16))、hTNF
−R2icd(−37)(5'−CTAGAGATCTGTTAACTGGAG
AAGGGGACCTGCTCGTCC TT−3'(配列番号48);pPC9
7−hTNF−R2icd(−37))、hTNF−R2icd(−59)(5
'−CTAGAGATCTGTTAACTGC TGGCTTGGGAGGAGC
ACTGTGA−3'(配列番号49);pPC97−hTNF−R2icd(
−59))およびマウスTNF−R2の細胞内ドメイン(5'−TCGATCG
TCGACCAAAAAGAAGCCCTCCTGCCT ACAA−3'(配列
番号50)。5'−CTAGAGATCTCAGGGGTCAGGCCACTT
T−3'(配列番号51);pPC97−mTNF−R2icd)と融合させた
GAL4 DNA結合ドメインを含む類似の組み立て物を作成した。
GAL4転写活性化ドメインベクターpPC86におけるプラスミドcDNA
ライブラリー[シェヴレイおよびナタンス、1992、上記]を、記載のように
して[シェヴレイおよびナタンス、1992、上記]SalI/NotI適合さ
せた二本鎖胎児肝間質セルライン7−4cDNA(B.ベネットおよびW.マシュー
ズの寄贈)から組み立てた。プラスミドDNAを2x106の形質転換させたE
.coliDH10B(ジブコ/BRL)コロニーから直接分離した。
S.セレヴィシアエHF7c(クロンテク)を、pPC97−hTNF−R2i
cdおよび250μgのライブラリープラスミドDNAによって、マッチメーカ
ー二ハイブリッド系(クロンテク)に記載されるようにして連続的に形質転換し
た。最終的形質転換混合物を、L−トリプトファン、L−ロイシン、L−ヒスチ
ジンを欠失し、20mM3−アミノトリアゾール(シグマ)を含有する50個の
150mm合成デキストロース寒天プレート上に蒔いた。合計で2x106の形
質転換されたコロニーを蒔いた。30℃で4日後、42個の生き残ったHis+
コロニーが得られ、うち15個が、フィルター検定でβ−ガラクトシダーゼ活性
について陽性であった[ブリーデンおよびナスミス、酵母HO遺伝子の調節、Co
ld Spring Harbor Sympodia on Quantitative Biology、50巻643−650
頁、コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク(
1985)]。酵母DNAを調製し[ホフマンおよびウィンストン、Gene、57
巻267−272頁(1987)]、電気穿孔によりE.ColiDH10Bに
導入し、そしてpPC86ライブラリープラスミドを含むコロニーを制限分析に
より同定した。15個のうち14個のcDNA挿入物がおよそ2.1kbという
類似の大きさであった。DdeIによる制限分析により、これらが同じmRNA
種から誘導された独立したcDNAクローンであることが明らかとなった。
それぞれpPC97およびpPC97−hTNF−R2icdによる、HF7
c細胞中への3個の代表的cDNAクローンの再導入は、コードされているGA
L4活性化ドメイン融合蛋白は、GAL4 DNA結合ドメイン単独では相互作
用しないがGAL4 DNA結合hTNF−R2icd融合蛋白とのみ相互作用
することを確認した。一つの代表的クローン(pPC86Y17)の2.1kb
cDNA挿入物を、両方の鎖について配列決定した(図11)。さらに、他の
6個の独立したcDNAクローンの5'および3'領域を配列決定したところ、こ
れらは同じmRNA種から誘導されていることが確認された。全てのクローンは
、同じリーディングフレームで互いに20ヌクレオチド以内でGAL4 DNA
結合ドメインに融合することが示された。
さらに2個のcDNAクローンがCT6λファージcDNAライブラリーから
分離され(上記参照)、そしてさらに5個のクローンが、pPC86Y17 c
DNA挿入物の5'領域由来の[32P]標識化0.5kb PstI DNAフラ
グメントをハイブリダイゼーションプローブとして使用して、マウス肝λファー
ジcDNAライブラリー(クロンテク)から分離された。これらのcDNA挿入
物はいずれもpPC86 cDNA挿入物の5'配列を延長しなかった。さらに、
pPC86 cDNA挿入物の大きさは、CT6 mRNAのノーザンブロット分
析により明らかとなった実際のメッセージの大きさに良く対応する(下記参照)
。これらの発見は、二ハイブリッド系で分離されたcDNA挿入物は全長のクロ
ーンを表していること、そして、GAL4 DNA結合ドメインへの融合は、p
PC86Y17cDNA挿入物の30位にイニシエーターATGを伴うフレーム
内の非常に短い5'−非翻訳領域で起こったという事を示している(やはり下記
を参照されたい)。このcDNAクローンは、501アミノ酸の蛋白をコードし
ているオープンリーディングフレームを含んでいる(TNFレセプター関連因子
2またはTRAF2;図11)。
TNF−R2の細胞質ドメインと関係した、生化学的に精製された56kd蛋
白のアミノ酸配列分析(図9を参照されたい)は、この蛋白をTRAF2と同定
し、このTRAF2配列をcDNA配列から予想されたものとして確認した(図
11を参照されたい)。
ジェネンテク蛋白データベースに対するTRAF2配列の相同性検索は、TR
AF2がN末端RINGフィンガー配列モチーフを含む新規な蛋白であることを
明らかにした[フリーモント等、Cell、64巻483−484頁(1991)]
;ハウプト等、Cell、65巻753−763頁(1991);イノウエ等、上記
;図12a]。この配列モチーフは幾つかの調節蛋白のN末端ドメインで観察さ
れており、蛋白−DNA相互作用に関与するらしい2個の亜鉛結合フィンガー構
造を形成すると考えられる[フリーモント等、上記;ハウプト等、上記;レディ
等、Trends Biochem.Sci.、17巻344−345頁(1992)]。RING
フィンガーファミリーの成員は推定のDNA結合蛋白であり、その幾つかは、転
写調節、DNA修復、および位置特異的組換えに関係している(図12aを参照
されたい)。さらに、RINGフィンガーモチーフおよび他の亜鉛結合配列モチ
ーフは、蛋白−蛋白相互作用に関与していると議論されてきた[フリーモント等
、上記;ハウプト等、上記;バーグ、J.Biol.Chem.、265巻6513−651
6頁(1990)]。TRAF2中のこの構造的モチーフの重要性は、分離され
ている全てのGAL4 DNA結合ドメインTRAF2融合物はTRAF2の完
全
なN末端を含んでいるという発見によって支持される(上記参照)。この事は、
TRAF2のN末端RINGフィンガードメインがTNF−R2の細胞内ドメイ
ンとの相互作用に関与しているという事を示唆するものである。
加えて、TRAF2は、ツメガエルTFIIIA型亜鉛フィンガー蛋白の亜鉛フ
ィンガーモチーフと配列類似性を共有する[ミラー等、EMBO J.、4巻1609
−1614頁(1985);バーグ、上記;図12b]。TFIIIA様亜鉛フィ
ンガーモチーフは、RINGフィンガー蛋白RAD18およびUVS−2にも観
察されている(図12)。
TRAF2のC末端ドメインと他のどの既知蛋白の間にも、有意性のある明白
な類似性は見いだされなかった。TRAF1およびTRAF2の配列比較は、こ
れらがC末端ドメインに高度のアミノ酸一致を共有していることを明らかにした
(230アミノ酸にわたり53%の一致;図13)。両蛋白は、新規な配列相同
性モチーフ「TRAFドメイン」を含む、蛋白の新たなファミリーの成員を構成
している。より保存性の低い、TRAF1およびTRAF2のTRAFドメイン
内のN末端領域は、ことによるとロイシンジッパー様構造を形成しているかも知
れない(図10、11、13)。ロイシンジッパーは、アミノ酸7個毎の間隔で
存在するロイシンを含むDNA結合蛋白の一員中に最初発見された、αヘリック
ス構造である[ランドシュルツ等、Science、240巻1759−1764頁(
1988);ヴィンソン等、Science、246巻911−916頁(1989)
]。この構造は、ロイシン側鎖の分子間相互作用により蛋白の二量体化を仲介す
る。ロイシンジッパー構造はまた、他の二つのRINGフィンガーファミリー成
員、SS−A/Roリボ核蛋白およびc−cblプロトオンコジーンの遺伝子産
物にも予想されている(図12を参照されたい)。TRAF1およびTRAF2
のN末端ドメインは、特にTRAF2のRINGフィンガードメインに関しては
関連性が無い。
実施例4 TRAF1およびTRAF2の機能分析
TRAF1およびTRAF2のハイドロパシープロフィル[カイトおよびドゥ
ーリトル、1982、上記](図14)は、これらはシグナル配列および明らか
な貫膜領域を欠き、全体として親水性である事を示唆している。したがって、実
験的に決定されたTRAFの細胞質局在に合致して、これらは細胞内蛋白である
ようである(上記参照)。
ポリ(A)+mRNAをCT6細胞から調製した[バドリー等、Current Opinion
in Structural Biolog、3巻11−16頁(1988)]。上に記載されたよ
うな放射標識化TRAF2ハイブリダイゼーションプローブを用いたノーザン分
析[サムブルック等、1989、上記]は、TRAF2がCT6細胞中で2.1
kbメッセージとして発現されることを示した(図15a)。同様に、TRAF
1はCT6細胞において2kbメッセージとして発現される(図15a)。
TRAF1およびTRAF2 mRNAの組織分布を調べるため、製造者の指
示に従いマウス多組織ノーザンブロット(クロンテク)を、放射標識されたTR
AF1およびTRAF2プローブとハイブリダイズさせた。TRAF2は、調べ
たマウスの組織全てにおいて構成的に発現される(心臓、脳、脾臓、肺、肝臓、
骨格筋、腎臓および精巣;図15b)。最も高いレベルの発現は脾臓で観察され
た。対照的に、TRAF1は組織特異的発現を示した。TRAF1 mRNAは
脾臓、肺および精巣で検出されただけであった(図15b)。
HF7c細胞での、pPC86Y17(pPC86TRAF2)の、上記GA
L4 DNA結合TNF−R2icd融合組み立て物との同時形質転換は、TR
AF2は、ヒトおよびマウスTNF−R2両方の野生型細胞内ドメインと、そし
て生物活性突然変異体hTNF−R2(−16)の細胞内ドメインと相互作用す
ることを示した(第2表)。しかし、これは、GAL4 DNA結合ドメインの
みとは相互作用せず、また生物学的に不活性な突然変異体hTNF−R2(−3
7)およびhTNF−R2(−59)の細胞内ドメインとも相互作用しない。こ
の事は、CT6細胞抽出物における野生型および突然変異体GST−hTNF−
R2icd融合蛋白との共同沈降実験から得られる結果と合致する(上記参照)
。
GST−TRAF2融合蛋白をコードしている発現ベクターを組み立てた。オ
リゴヌクレオチドプライマー5'−GATCGGATCCTTGTGGTGTG
TGGGGG TTGT(配列番号55)および5'−CCTGGCTGGCCT
AATGT(配列番号56)を使用し、上記のようにしてPfuDNAポリメラ
ーゼによるPCRにより、TRAF2コード化領域をpPC86TRAF2から
増幅した。増幅された1.6kb DNAフラグメントをE.coli DNAポ
リメラーゼIを用いて平滑末端化し、BamHIで消化し、そしてBamHI/
SmaI消化されたpGEX−2TKベクター中にクローニングした。GST−
TRAF2融合蛋白を1mM ZnCL2の存在下に発現させ、上記のように精製
した。GSTおよびGST−TRAF2融合蛋白ビーズを293および293/
TNF−R2細胞由来の溶菌液と共にインキュベートし、ECL検出試薬(アマ
ーシャム)を用いてSDS−PAGEおよびウェスタンブロット分析[サムブル
ック等、「モレキュラー・クローニング:ア・ラボラトリー・マニュアル」コー
ルド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、N.Y.(1989)]によ
って分析した。hTNF−R2およびhTNF−R1の細胞外ドメインに対する
一次抗体(対照として)は0.5μg/mlの濃度で使用し、二次ヒツジ抗マウ
ス西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲート(アマーシャム)は1:6000
の希釈で使用した。図16に示されるように、GST−TRAF2融合蛋白は2
93細胞抽出物中でhTNF−R2を共同沈降させ、したがって、二つのハイブ
リッド分析で得られた結果が確認された。
TRAF1、TRAF2およびTNF−R2の細胞内ドメインの間のホモおよ
びヘテロマー的蛋白−蛋白相互作用の可能性について試験するため、pPC86
TRAF2の2.1kb cDNA挿入物をSalIおよびNotIで消化する
ことにより切り取り、そしてpPC97中にクローニングした(pPC97TR
AF2)。TRAF1コーディングおよび3'非翻訳領域を、T7配列決定プラ
イマー(ストラタジーン)およびオリゴヌクレオチドプライマー5'−TCGA
TCGTCGACCGCCTCCAGCTCAGCCCCTGAT−3'(配列
番号52)を使用し上記のようにしてPfu DNAポリメラーゼによるPCR
によってpブルースクリプトKSで全長TRAF1 cDNAクローンから増幅
した。増幅された1.7kbDNAフラグメントをSalIおよびNotIで消
化し、ゲル精製し、そしてpPC97およびpPC86の両方にクローニングし
た(pPC97TRAF1;pPC86TRAF1)。
野生型ヒトおよびマウス細胞内ドメインをコードしているGAL4DNA結合
TNF−R2融合組み立て物による、HF7c細胞中へのpPC86TRAF1
の同時導入は、TRAF1およびTNF−R2の細胞内ドメインの間の直接相互
作用が弱いことを示した(第2表)。しかし、pPC97TRAF1およびpP
C86TRAF2またはpPC97TRAF2およびpPC86TRAF1の同
時形質転換は、TRAF1およびTRAF2が互いに相互作用することを明らか
にし(第2表)、この事は、TRAF1およびTRAF2のヘテロ二量体複合体
がTNF−R2の細胞内ドメインと関係する事を示唆するものである。続いて、
TRAF2が直接発現される、即ちGAL4融合蛋白としてではなく発現される
酵母ベクターを組み立てた。pPC97TRAF2をHindIIIおよびSal
Iで消化してGAL4 DNA結合ドメインをコードしている0.5kbDNA
フラグメントを放出させ、クレノウ酵素で末端を満たし、ゲル精製し、そして再
ライゲーションした(pPCTRAF2)。さらに、オリゴヌクレオチドプライ
マー5'−GATCGACTCGAGATGCCCAAGAAGAAGCGGA
AGGTGGC TGCAGCCAGTGTGACTTCCCCT(配列番号5
7)および5'−CTCTGGCGAAGAAGTCC(配列番号58)を使用
し上記のようにしてPfu DNAポリメラーゼによりpPC86TRAF2か
らTRAF2を増幅した。増幅された2.1kb DNAフラグメントをXho
Iで消化し、クレノウ酵素で末端を満たし、NotIで消化し、ゲル精製し、そ
して、HindIIIで消化し、末端を満たし、そしてNotIで消化したpPC
97中にクローニングした(pPCTRAF2NLS)。この発現ベクターは、
TRAF2のN末端に融合したサルウイルス40大腫瘍抗原核局在シグナル(me
t-pro-lys-lys-lys-arg-lys-val;シェヴレイおよびナタンス、1992と比較
されたい)をコードしている。プラスミドpPC86TRAF1およびpPC9
7hTNF−R2icdまたはpPC97mTNF−R2icdを有するHF7
c細胞中への、pPCTRAF2ではなくpPCTRAF2NLSの導入は、こ
の宿主細胞のヒスチジン欠失を補完した(第3表)。この結果は、TRAF1お
よびTRAF2のヘテロ二量体複合体がTNF−R2の細胞内ドメインと相互作
用することを確認するものである。この蛋白複合体において、突然変異分析およ
び共同沈降実験から示唆されるように(上記参照)、主としてTRAF2が、恐
らくはそのRINGフィンガードメインと、ヒトTNF−R2のアミノ酸304
−345からなる細胞内ドメインのC末端領域との相互作用によって、レセプタ
ーと直接接触する。pPC97TRAF1およびpPC86TRAF1またはp
PC97TRAF2およびpPC86TRAF2の同時形質転換により示される
ように、TRAF1およびTRAF2は、ホモ二量体複合体をも形成することが
できる(第2表)。これらの結果は、TRAF1およびTRAF2のホモローガ
スなC末端ドメインが新規な蛋白二量体化モチーフを表す事を示唆している。同
様に、アラビドプシス・タリアナ由来のRINGフィンガー蛋白COP1のC末
端ドメインは、蛋白−蛋白の認識に関与していると論じられた三量体G蛋白のβ
サブユニットとの相同性を有する領域を含んでいる[デング等、Cell、71巻7
91−801頁(1992)]。
TRAF1の組織特異的発現に基づくと(上記参照)、TRAF1およびTR
AF2の間のヘテロマー的複合体の形成は、脾臓、肺および精巣といったマウス
の或る組織でのみ起こり得る。この事により、他のTRAFドメイン蛋白が、構
成的に発現されるTRAF2のための組織特異的二量体化の相手である可能性が
浮上する。恐らくは異なった生物活性を有するこのような組織特異的ヘテロ複合
体は、様々な組織においてTNF−R2により仲介される異なったTNF応答を
決定し得る。
TRAF1およびTRAF2に対する特異的抗体を作製するため、両蛋白のN
末端ドメインを、QIA発現系(キアゲン)を用いて6xhis標識融合物とし
て大腸菌で発現させた。TRAF1のアミノ酸2−181をコードしているDN
Aフラグメントを、オリゴヌクレオチドプライマー5'−GATCGGATCC
GCCTCCAGCTCAGCCCCTGAT(配列番号59)および5'−G
ATCGGATCCAGCCAGCAGCTTCTCCTTCAC(配列番号6
0)を使用し上記のようにPfu DNAポリメラーゼによるPCRによってp
ブルースクリプトKSで全長cDNAクローンから増幅した。増幅された0.5
5kbDNAフラグメントをBamHIで消化し、BamHI消化したpQE1
2ベクター(キアゲン)中にクローニングした。発現ベクター中に正しい向きの
DNA挿入物を含む形質転換体を制限分析によって決定した(pQETRAF1
)。同様に、TRAF2のアミノ酸1−162をコードしているDNAフラグメ
ントを、オリゴヌクレオチドプライマー5'−GATCGGATCCTTGTG
GTGTGTGGGGGTTGT(配列番号61)および5'−GATCGGA
TCCGCTCAGG CTCTTTTGGGGCA(配列番号62)を使用し
てpPC86TRAF2から増幅し、BamHIで消化し、BamHI消化した
pQE12ベクター中にクローニングした(pQETRAF2)。
プラスミドpQETRAF1およびpQETRAF2をE.coliM15[
pREP4](キアゲン)に導入した。細胞を増殖させ、誘導し、収穫し、そし
て6xhis標識TRAF1およびTRAF2融合蛋白を、製造者の指示に従っ
て変性条件下でNi−NTA親和クロマトグラフィー(キアゲン)により精製し
た。精製されたTRAF1およびTRAF2融合蛋白を13%トリス/グリシン
ポリアクリルアミドゲル上で分離し、0.05%クマシー・ブリリアント・ブル
ーR−250水溶液で染色し、適当なバンドを切り取った。100−200μg
のTRAF1またはTRAF2融合蛋白を含有するゲル切片を、ウサギの免疫に
使用した。
無傷のおよび末端切除されたhTNF−R2をコードしている発現ベクターを
CT6細胞中にトランスフェクトした。個々のCT6クローンの野生型または突
然変異体レセプターの発現レベルをフローサイトメトリーにより分析し、値を平
均の蛍光として表す。機能分析のため、2個の独立したCT6クローンを、取り
揃えられた細胞のプールを表すhTNF−R2(△304−345)以外の各h
TNF−R2突然変異体について調べた。抗hTNF−R2ポリクローナル抗体
の1:1000希釈液で24時間処理しておいた細胞の[3H]チミジン取り込
みによって増殖を測定した。値を、無関係な抗体で処理しておいた細胞と比較し
た刺激の倍率として表した。示されたデータは三重の測定の平均である。標準偏
差は一般に5%未満である。抗hTNF−R2ポリクローナル抗体の1:500
希釈液で20分間刺激しておいた細胞から調製された核抽出物を用いる電気泳動
移動度シフト検定によって、NF−κB活性化を分析した。プラス記号は、無関
係な抗体で処理しておいた細胞から調製された核抽出物と比較した、NF−κB
DNA結合活性の誘導を示す。全てのCT6クローンは、内因性マウスTNF−
R2を介した増殖およびNF−κB活性化を誘導する能力を保持していた(デー
タは示されていない)。ndは測定されていない。
示されるように、種々のGAL4 DNA結合ドメイン(DB)およびGAL
4転写活性化ドメイン(TA)融合蛋白をコードしているプラスミド(明細書を参
照されたい)でHF7c細胞を同時形質転換した。同じ形質転換混合物のアリコ
ートを、trpおよびleuを欠く合成デキストロースプレートならびにtrp
、leu、hisを欠き3−アミノトリアゾール20mMを含有するプレート上
に蒔いた。プラス記号は、形質転換された酵母コロニーがそれぞれのプレート上
で生育したことを示す。同じ形質転換混合物から、極めて似通った数の形質転換
体(90−100%)が、trp、leu、hisを欠くプレートならびにtr
pおよびleuのみを欠くプレート上で得られた。マイナス/プラス記号は、t
rp、leu、hisを欠くプレート上で生育する形質転換体の数が、trpお
よびleuのみを欠くプレート上の同じ形質転換体混合物から得られるコロニー
の数のおよそ1−2%であったことを示す。三種のアミノ酸全てを欠くプレート
上で生育するコロニーについて、β−ガラクトシダーゼ活性のためのフィルター
検定を実施した。全てのコロニーが青色を発色した(データは示されていない)
。
示されているGAL4 DNA結合ドメイン(DB)融合蛋白、GAL4転写
活性化ドメイン(TA)TRAF1融合蛋白、および、TRAF2またはサルウ
イルス40大腫瘍抗原核局在シグナル(NLS)に融合させたTRAF2をコー
ドしているプラスミド(明細書を参照されたい)でHF7c細胞を連続して形質
転換した。最終的形質転換混合物を、trp、leu、hisを欠き3−アミノ
トリアゾール20mMを含有する合成デキストロースプレート上に蒔いた。プラ
ス記号は、それぞれのプレート上で形質転換した酵母コロニーが生育したことを
示す。*第2表を参照されたい。
実施例5 TRAF2の構造−機能分析
ホモ二量体化、TRAF1とのヘテロ二量体化、およびTNF−R2の細胞質
ドメインとの相互作用に必要なTRAF2蛋白内の領域を同定するため、突然変
異体TRAF2蛋白を発現するGAL4−TRAF2融合蛋白ベクターを組み立
てた。オリゴヌクレオチドプライマー5'−GATCGAGTCGACCAGT
AGTTCGGCCTTTCAA GAT(配列番号63)および5'−CTCT
GGCGAAGAAGTCC(配列番号64)を使用し、前記実施例に記載のよ
うにして、Pfu DNAポリメラーゼを用いるPCRによって、TRAF2の
アミノ酸87−501をコードしている1.9kb DNAフラグメントをpP
C86TRAF2から増幅した。同様に、このプラスミドから、オリゴヌクレオ
チドプライマー5'−GATCGAGTCGACCGTGGGGCCAGAGC
TACTCCAG(配列番号65)および5'−GTACGTGCGGCCGC
CTACCACCTGGTTCAAGGTTCCTG(配列番号66)を使用し
て、TRAF2のアミノ酸264−501をコードしている1.4kb DNA
フラグメントを増幅した。増幅されたDNAフラグメントをSalIおよびNo
tIで消化し、ゲル精製し、そしてpPC97およびpPC86中にクローニン
グした(pPC97TRAF2(87−501);pPC86TRAF2(87
−501);pPC97TRAF2(264−501);pPC86TRAF2
(264−501))。第4表に列記されるHF7c細胞の同時形質転換実験は
、RINGフィンガードメイン(アミノ酸1−86)の除去された突然変異体T
R
AF2蛋白が尚TNF−R2の細胞質ドメインと関係できることから、TRAF
2のRINGフィンガードメインはTNF−R2の細胞質ドメインとの相互作用
にとって必要でないことを示している。さらに、この突然変異体TRAF2蛋白
はTRAF1および野生型TRAF2の両者とも関係できる。TRAFドメイン
および幾つかのさらなるアミノ酸(アミノ酸264−501;第4表)のみを含
む突然変異体TRAF2蛋白についても同じ結果が得られた。これらの結果は、
TRAF2のTRAFドメインは、TRAF1およびTRAF2のホモおよびヘ
テロ二量体化ならびにTNF−R2の細胞質ドメインとTRAF2の相互作用に
とって十分であることを証明している。
実施例4中および前記第2表の後に記載された方法を用いて、この表に開示さ
れるデータを作成した。
本発明は、必然的に好ましい態様および個々の実施例と結びつけて記載してき
たが、当業者は、前述の明細書の読後に、本発明の精神および範囲を逸脱するこ
となく、本明細書に開示される事柄に様々な変化、置換または等価物、および変
更を施すことができるであろう。よって本発明は、本明細書に個別に記載された
以外の方法で実施することができる。このような修飾は全て本発明の範囲内にあ
ることが意図されている。
本明細書中に引用される全ての文献は、説明のため引用されて本明細書の一部
とする。
実施例6 TRAFの機能的役割
A.TRAFの相互作用
TRAF2はTNF−R2の細胞質ドメインと直接に関係し、一方TRAF1
およびTNF−R2の間の相互作用がTRAF2を介して仲介される[ロース等
、Cell、78巻681頁(1994)]。安定なヘテロマー複合体を形成するこ
とに加えて、TRAF1およびTRAF2はホモ二量体を形成することができる
。本発明者等は、TRAF3[元々はCD40bp、CRAF、またはLAP1
と命名された。フー等、J.Biol.Chem.、269巻30069頁(1994);チ
ェング等、Science、267巻1494頁(1995);およびモシアロス等、C
ell、80巻389頁(1995)。]がTRAF1またはTRAF2と相互作
用するか否かを決定するため、酵母二ハイブリッド系を使用した。酵母二ハイブ
リッド系における、TRAFおよびTNFレセプタースーパーファミリー成員の
細胞質ドメインのための発現ベクターはかつて報告されている[ロース等、Cell
、78巻681頁(1994);フー等、J.Biol.Chem.、269巻30069頁
(1994)]。ベイト・アンド・プレイコード化融合蛋白間の二ハイブリッド
相互作用分析は、記載のように実施された[ロース等、上記、フー等、J.Biol.C
hem.、269巻30069頁(1994)]。TRAF3は自己結合したが、T
RAF1またはTRAF2のいずれともヘテロ型複合体を形成しなかった(第5
表)。
この発見は、許容され得るホモ−および/またはヘテロマーの組み合わせを特定
するオリゴマー化インターフェースが、TRAFファミリー成員の内部に存在す
ることを示唆している。
B.TRAFとTNFレセプタースーパーファミリーの他の成員との相互作用
次に本発明者等は、各TRAFとTNFレセプタースーパーファミリーの他の
成員との相互作用を試験した。三つのTRAFはいずれもTNF−R1またはF
as抗原のいずれの細胞質ドメインとも関係しなかった(第5表)。また、TR
AF1はCD40と相互作用せず、TRAF3もまたTNF−R2と相互作用し
なかった。しかし、TRAF2は、CD40およびTNF−R2両者の細胞質ド
メインと強く関係することが判明した(第5表)。
TNFおよびCD40リガンドはいずれもNF−κB活性化のシグナル伝達が
できる。TNFによるNF−κB活性の誘導は、ヒト胚腎臓293細胞を包含す
る多数の細胞型で立証されている[シュー等、Cell、印刷中(1995)](図
17)。レセプター特異的アゴニスト抗体での刺激により明らかであるように、
293細胞におけるTNF誘導されたNF−κB活性化は、恐らくは内因性TN
F−R2のレベルが低いため(下記参照)、専らTNF−R1によって仲介され
る(図17)[ペニカ等、J.Biol.Chem.、267巻21172頁(1992)]
。NF−κB活性化におけるTRAFに対する機能的役割を調べるため、293
細胞をTRAF発現ベクターで一過性にトランスフェクトした。24時間後、核
抽出物を調製し、電気泳動移動度シフト検定によりNF−κB活性について検定
した。
TRAF1、TRAF2およびTRAF2(87−501)のための発現ベク
ターは、pRKにおいて、サイトメガロウイルス(CMV)即時初期プロモータ
ー−エンハンサーの転写調節下に、それぞれのコード化領域を含んでいた[シャ
ル等、Cell、61巻361頁(1990)]。一過性トランスフェクトされた2
93細胞でのTRAF蛋白の発現は、それぞれTRAF1およびTRAF2に対
するポリクローナル抗体を用いたウェスタン・ブロット分析によって確認された
(ロースおよびゲッデル、公開されていない結果)。TRAF3、CD40[フ
ー等、J.Biol.Chem.、269巻30069頁(1994)]およびTNF−R2
[タータグリア等、Cell、73巻213頁(1993)]のための発現ベクター
は、かつて記載された。
293細胞をTRAF発現ベクターで一過性にトランスフェクトした。24時
間後、核抽出物を調製し、NF−κB活性化を電気泳動移動度シフト検定により
分析した[シュッツェ等、上記]。活性化されたNF−κB複合体の組成を、特
異的NF−κBサブユニットを認識する抗体(サンタ・クルーズ・バイオテクノ
ロジー)を用いるスーパーシフト分析により調べた。TRAF1またはTRAF
3の発現はNF−κBDNA結合活性の誘導を導かなかった。対照的に、TRA
F2を発現している293細胞は有意な量の活性化NF−κBを含んでいた(図
17)。特異的NF−κBサブユニットに対する抗体を用いるスーパーシフト実
験により示されるように、活性NF−κB複合体の主要な成分はp65:p50
ヘテロ二量体らしく見受けられた(図17)。
C.TRAF2発現によるNF−κB依存性リポーター遺伝子の活性化
TRAF2発現がNF−κB依存性リポーター遺伝子を活性化できるか否かを
決定するため、E−セレクチン−ルシフェラーゼリポーター組み立て物[シンド
ラーおよびバイクウォール、上記]を、様々なTRAF発現ベクターで293細
胞中に同時トランスフェクトした。同時トランスフェクト実験のために、E−セ
レクチン−ルシフェラーゼリポーター遺伝子プラスミド0.5μg[シンドラー
およびバイクウォール、Mol.Cell.Biol.、14巻5820頁(1994)]およ
び各発現組み立て物1μgで3x105の293細胞をトランスフェクトした。
pRKでの抑制により、DNA濃度を一定に維持した。トランスフェクションの
24時間後に細胞を溶菌し、ルシフェラーゼ検定系(プロメガ)を用いてリポー
ター遺伝子活性を測定した。pRSV−βgalベクター(0.5μg)を用い
てトランスフェクション効率を正規化した。TRAF2発現はリポーター遺伝子
を強く活性化したが、一方TRAF1またはTRAF3の発現は効果がなかった
(図18a)。全ての場合において、リポーター遺伝子の活性は、TNFの添加
によるTNF−RI経路を介して(同時)誘導され得た(図18a)。TRAF
2発現が、E−セレクチンプロモーター中のNF−κB部位が突然変異している
対照リポーター組み立て物を活性化することができなかったことから、観察され
たリポーター遺伝子誘導はNF−κB活性化に依存していた。これらの結果は、
TRAF1またはTRAF3ではなくTRAF2の過剰発現だけで、293細胞
でのNF−κB活性化を誘導するのに十分であることを証明している。
TRAF2およびTRAF3は、TNF−R2およびCD40との相互作用に
必要とされないN末端RINGフィンガーモチーフを含んでいる[ロース等、上
記;フー等、上記;チェング等、Science、267巻1494頁(1995);
およびモシアロス等、Cell、80巻389頁(1995)]。RINGフィンガ
ードメインを含むN末端86アミノ酸を欠失するTRAF2の末端切除変異体(
TRAF2(87−501))は、TNF−R2およびCD40の細胞質ドメイ
ンならびにTRAF1および野生型TRAF2と関係する能力を保持している(
第5表)(ロース等、上記)。興味深いことに、他の点では機能的なこのTRA
F2(87−501)蛋白は、293細胞でのNF−κB依存性リポーター遺伝
子活性の誘導においては全く無効である(図18a)。したがって、TRAF2
のRINGフィンガードメインがNF−κB活性化にとって必要であるようであ
る。
293細胞で得られた結果を確認するため、マウス細胞毒性TセルラインCT
6において類似の一過性トランスフェクション実験を実施した。CT6細胞は、
検出可能レベルのTNF−R1を発現せず[ルイス等、Proc.Natl.Acad.Sci.USA
、88巻2830頁(1991)]、そしてこのセルラインにおけるTNF誘導
されたNF−κB活性化はTNF−R2によって仲介される[ロース等、上記]
。293細胞で観察されたように、野生型TRAF2の発現はCT6細胞におい
てE−セレクチン−ルシフェラーゼリポーター遺伝子を強く誘導したが、一方T
RAF1、TRAF3、およびTRAF2(87−501)は誘導しなかった(
図18b)。CT6細胞の一過性トランスフェクションをDEAE−デキストラ
ン法を用いて実施した[F.M.アウスベル等、カレント・プロトコルズ・イン・モ
レキュラー・バイオロジー(グリーン・パブリッシング・アソシエイツ/ウィレ
イ・アンド・サンズ、Inc.、ニューヨーク(1994)]。107のCD6
細胞
を、250μg/mlのDEAE−デキストラン中、計10μgのプラスミドD
NAで90分間トランスフェクトした。トランスフェクションの40時間後にリ
ポーター遺伝子活性を検定した。さらに、突然変異体TRAF2(87−501
)の発現は、CT6細胞のTNF刺激により誘導されるNF−κB依存性リポー
ター遺伝子活性を抑制したが、野生型TRAF1、2または3は抑制しなかった
。このように、TRAF2(87−501)は、CT6細胞におけるTNF−R
2仲介NF−κB活性化の顕著な負のインヒビターとして働く。
CT6細胞とは対照的に、293細胞におけるTNF誘導NF−κB活性化は
TNF−R1により仲介される(上記参照)。293細胞における突然変異体T
RAF2(87−501)の過剰発現は、TNF誘導E−セレクチン−ルシフェ
ラーゼリポーター遺伝子活性を僅かに低下させただけであり(図18a)、これ
は、TNF−R1シグナル伝達が顕著な負のTRAF2突然変異により遮断され
ないことを示している。293細胞におけるTNF−R2シグナル伝達に及ぼす
TRAFの効果を試験するため、TNF−R2を野生型または突然変異体TRA
Fで一過性に同時発現させた。TNFの同時刺激が無くとも、TNF−R2の過
剰発現だけでNF−κB依存性リポーター遺伝子活性の開始に十分であった(図
19a)。同様に、外因性TNFの不在下でのTNF−R1過剰発現は、HeL
a細胞および293細胞の両者においてアポトーシスおよびNF−κB活性化を
誘導することが知られている[ボールディン等、J.Biol.Chem.、270巻387
頁(1995);シュー等、上記]。突然変異体TRAF2(87−501)の
同時発現は、TNF−R2により誘導されるリポーター遺伝子活性化を完全に損
なった(図19a)。このように、CT6細胞の場合と同様、TRAF2(87
−501)は、293細胞でのTNF−R2シグナル伝達に顕著な負の効果を及
ぼす。しかしながら、hTNF−R2およびTRAF2(87−501)を同時
発現した293細胞でのNF−κB依存性リポーター遺伝子活性は、TNFの添
加によりTNF−R1経路を介して、尚誘導された(図19a)。これらの観察
は、TRAF2シグナル伝達経路はTNF−R2により仲介される反応には必須
であるが、TNF−R1シグナル伝達には関わっていないことを証明している。
D.TRAF2はCD40によるNF−κB活性化を仲介している
TRAF2がTNF−R2およびCD40の両者と関係することから(上記参
照)、次に本発明者等は、TRAF2がCD40によるNF−κB活性化をも仲
介しているか否かを調べた。TNF−R2について観察されるように、293細
胞におけるCD40の過剰発現は、リガンドの不在下でNF−κB活性化を誘導
するに十分である(図19b)。CD40および突然変異体TRAF2(87−
501)の同時発現は、CD40により誘導されるリポーター遺伝子活性を完全
に阻害し(図19b)、この事は、TRAF2(87−501)が、CD40シ
グナル伝達およびTNF−R2シグナル伝達に顕著な負の効果を及ぼしているこ
とを証明している。これらの結果は、TRAF2がTNF−R2およびCD40
の両者のためのNF-κB活性化の共通仲介物質であることを示している。
293細胞における野生型TRAF2およびTNF−R2またはCD40の同
時発現は、TRAF2単独の発現より実質上強いE−セレクチン−ルシフェラー
ゼリポーター遺伝子活性をもたらさなかった(図18a、19a、b)が、この
事は、シグナル伝達カスケード中の下流の要素が293細胞中に限定されている
ことを示唆している。本発明者等の結果はさらに、TRAF1:TRAF2ヘテ
ロ二量体がNF−κB活性化において機能的であり得ることを示している。TR
AF1およびCD40の同時発現はCD40の誘導するNF−κB活性化の微弱
な低下をもたらしたものの(図19b)、内因性TRAF2ホモ二量体をTRA
F1:TRAF2ヘテロ二量体中へ運ぶと予想されているTRAF1の過剰発現
は、CT6または293細胞のいずれにおいてもTNF−R2仲介リポーター遺
伝子活性化を阻害しなかった。むしろ、TNF−R2およびTRAF1が293
細胞で同時発現される時には、僅かな、それでいて再現性のあるリポーター遺伝
子活性の増加が観察された(図19a)。
驚くべき結果は、野生型TRAF3が293細胞においてCD40誘導された
NF−κB依存性リポーター遺伝子活性を抑制したことである(図19b)。即
ち、TRAF2はCD40誘導されたNF−κB活性化を仲介する正のシグナル
伝達体として働き、一方TRAF3は、恐らくはCD40上の部分重複している
TRAF合体部位に結合することにより、この活性に拮抗する。TRAF3はま
た、293細胞においてTNF−R2誘導されるNF−κB活性化を阻害した(
図19a)が、この効果はCT6細胞では観察されなかった(図18b)。二ハ
イブリッド分析によりTRAF3とTRAF1、TRAF2またはTNF−R2
との直接の相互作用は検出されなかった(上記参照)が、293細胞におけるT
RAF3の顕著な負の効果は、TRAF3がこれらの構成因子の一つと弱く相互
作用していることを意味しているかも知れない。それならばTNF−R2仲介さ
れたNF−κB活性化の阻害は、CT6細胞と比較して293細胞中でのTRA
F3の高いレベルの過剰発現によって説明できる。さらに、TRAF3は、TR
AF2仲介されたNF−κB活性化経路とは異なったシグナル伝達経路に参加し
ているということもあり得る。TRAF2との類推により、このような経路の始
まりはTRAF3のRINGフィンガードメインを含んでいるかも知れない。チ
ェング等[チェング等、上記]は近年、分子のN末端側半分を欠失する末端切除
TRAF3蛋白が、CD40の仲介するCD23の誘導を抑制することを観察し
た。チェング等[チェング等、上記]が天然TRAF3の効果を報告しなかった
のに対し、本発明者等の結果は、CD40によるCD23発現の誘導がTRAF
2により仲介され、そして天然TRAF3により阻害され得ることを指摘するこ
とができた。
E.TRAF2とLMP1との相互作用
エプスタイン−バールウイルストランスフォーミング蛋白LMP1のC末端細
胞質ドメインはTRAF1およびTRAF3と相互作用することが報告された[
モシアロス等、Cell、80巻389頁(1995)]。TRAF1およびLMP
1の間の相互作用は間接的であることが判明し、そしてまだ未知のTRAF蛋白
により仲介されているという仮説が立てられた。本発明者等は、酵母二ハイブリ
ッド系を用いてTRAF2がLMP1と相互作用するか否かを調べた。第6表に
示されるとおり、TRAF2、TRAF2(87−501)およびTRAF3は
LMP1のC末端細胞質ドメインと強く関係している。これらの発見に基づくと
、TRAF2はTRAF1−LMP1相互作用を仲介していると信じられる。L
M
P1は、細胞増殖および遺伝子の発現に多数の下流効果を有する支配的オンコジ
ーンであり、少なくともその幾つかはNF−κB活性化を必要とする[ラハーテ
ィ等、J.Biol.Chem.、267巻24157頁(1992);ロウウェ等、J.Viro
l.、68巻5602頁(1994)]。既知の3種のTRAFの全てについての
本発明者等の比較分析は、TRAF2が、TNF−R2、CD40およびことに
よるとLMP1のための共通のシグナル伝達体としてNF-κB活性化を開始さ
せるということを示唆している。
考察
TNFレセプタースーパーファミリーの幾つかの成員により始動する重要な活
性は、転写因子NF−κBの活性化である。本明細書に報告されている結果は、
TRAF1またはTRAF3ではなくTRAF2の過剰発現がNF−κB活性化
の誘導にとって十分であることを証明している。さらに、N末端RINGフィン
ガードメインを欠く末端切除されたTRAF2蛋白は、支配的な負の突然変異と
して働くことにより、TNF−R2およびCD40で仲介されるNF−κB活性
化を抑制する。故に本発明者等は、TRAF2はNF−κBの活性化に決定的に
関わる、TNF−R2およびCD40シグナル伝達の共通仲介物質であると結論
付ける。概念的には、このシグナル伝達カスケードは、レセプターの集中または
TRAF2過剰発現が引き金となって起こるTRAF2凝集によって活性化され
る。さらに本発明者等は、TRAF2がLMP1のためのシグナル伝達物質であ
るらしいということを示した。
この研究において概説された発見は、TNF仲介されるNF−κB活性化にお
けるTRAF2の関与はTNF−R2シグナル伝達に限定され、TNF−R1に
よるNF−κB活性化には必要ないことを立証するものである。この観察は、T
RAFファミリーには無関係でTNF−R1によるNF−κB活性化を仲介する
新規な蛋白TRADDの最近の同定によって支持される[シュー等、上記]。二
つの別個なシグナル伝達物質TRAF2およびTRADDの同定は、NF−κB
の活性化は複数の独立したシグナル伝達経路を介して達成されるという初期の指
摘に対する分子上の証拠を提供する[タノスおよびマニアティス、同書、80巻
529頁(1995)]。N末端RINGフィンガードメインを欠く突然変異体
TRAF2蛋白がTNF−R2、CD40、TRAF1、およびTRAF2と相
互作用する能力を保持し、それでいてNF−κB活性化のシグナル伝達において
全く不完全であるという事は注目に値する。この発見は、TRAF2のRING
フィンガードメインが、NF−κB活性化に関与し、そしてシグナル伝達カスケ
ードにおいてTRAF2を次の工程に連結する、可能性ある蛋白−蛋白相互作用
ドメインを表していることを示唆するものである。
第5表。TRAFおよびTNFレセプタースーパーファミリーの成員の間の相
互作用。酵母Y190細胞を、示されたGal4 DNA結合ドメインおよびG
al4転写活性化ドメイン融合蛋白をコードしている発現ベクターで同時形質転
換した。それぞれの形質転換混合物を、トリプトファンおよびロイシンを欠く合
成デキストロースプレート上に蒔いた。融合蛋白間の相互作用を検出するため、
β−ガラクトシダーゼ活性についてのフィルター検定を実施した。プラス記号は
、検定の1時間以内の強い色素発色を示す。マイナス記号は、24時間以内に色
素の発色がないことを示す。空のGal4ベクターによる対照の形質転換は陰性
であり、列記していない。
第6表。TRAFおよびLMP1の細胞質ドメインの間の相互作用。酵母Y1
90細胞を、示されたGal4 DNA結合ドメインおよびGal4転写活性化
ドメイン融合蛋白(14)をコードしている発現ベクターで同時形質転換した。
Gal4 DNA結合ドメイン−LMP1組み立て物は、LMP1のC末端の1
76アミノ酸を含んでいた(S.フェンネワルド、V.ヴァン・サンテン、E.キエフ
。潜在的成長トランスフォーミングウイルス感染において転写されたmRNAの
ヌクレオチド配列は、それが膜蛋白をコードしているかも知れないことを示して
いる。J.Virol.、51巻411−419頁、1984)。各々の形質転換混合物
を、トリプトファンおよびロイシンを欠く合成デキストロースプレート上に蒔い
た。融合蛋白間の相互作用を検出するため、β−ガラクトシダーゼ活性について
のフィルター検定を実施した。プラス記号は、検定の1時間以内の強い色素発色
を示す。マイナス記号は、24時間以内に色素の発色がないことを示す。空のG
al4ベクターによる対照の形質転換は陰性であり、列記していない。
本明細書に引用されている全ての文書およびその中に引用されている参考文献
は、説明的に引用して本明細書の一部とするものである。
特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約の下に、199
5年2月10日にアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション、ロックヴィ
ル、MD、U.S.A.に以下の寄託をおこなった。
名称: ATCC番号
TRAF2プラスミドpPC86−TRAF2 97053
TRAF1プラスミドpBst−TRAF1 97054
この寄託の実施は、本発明を可能とするために寄託が必要であることの容認で
は断じてない。逆に、本発明はこれらの寄託に関係なく完全に実施することがで
きる。
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フロントページの続き
(51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI
C12P 21/08 0276−2J G01N 33/53
C12Q 1/68 9356−4H C07K 14/715
G01N 33/53 9735−4B C12N 5/00 A
// C07K 14/715 9282−4B 15/00 C
(31)優先権主張番号 08/446,915
(32)優先日 1995年5月22日
(33)優先権主張国 米国(US)
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M
C,NL,PT,SE),CA,JP,MX
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.天然TNFレセプター2型(TNF−R2)の細胞内ドメインと特異的に 関係することのできる、分離された腫瘍壊死レセプター関連因子(TRAF)。 2.マウスのものである、請求項1に記載のTRAF。 3.天然ヒトTNF−R2の細胞内ドメインと特異的に関係することのできる 、請求項1に記載のTRAF。 4.天然ヒトTNF−R2の細胞内ドメインと特異的に結合することのできる 、請求項1に記載のTRAF。 5.天然のものである、請求項1に記載のTRAF。 6.ホモ二量体型である、請求項5に記載のTRAF。 7.ヘテロ二量体を形成するためもう一つのTRAFと関係している、請求項 5に記載のTRAF。 8.TRAF1(配列番号2)またはTRAF2(配列番号4)である、請求 項5に記載のTRAF。 9.TRAF2アミノ酸配列(配列番号4)のaa272−501アミノ酸領 域と少なくとも50%の配列一致を有するドメインを含む、請求項1に記載のT RAF。 10.TRAF2アミノ酸配列(配列番号4)のアミノ酸272−501をコ ードしているヌクレオチド配列の相補物に、緊縮条件下でハイブリダイズするこ とのできる核酸分子によりコードされている、請求項1に記載のTRAF。 11.請求項1に記載のTRAFをコードしているヌクレオチド配列を含む、 分離された核酸分子。 12.該ベクターにより形質転換された宿主細胞により認識される調節配列と 機能的に結合している、請求項11に記載の核酸分子を含むベクター。 13.請求項12に記載のベクターにより形質転換された宿主細胞。 14.TRAFおよび天然TNF−R2の相互作用を妨げることのできる分子 。 15.天然TRAFポリペプチドと特異的に結合することのできる抗体。 16.請求項15に記載の抗体を産生するハイブリドーマセルライン。 17.TRAFをコードしている核酸分子を使用する方法であって、宿主細胞 により認識される調節配列と機能的に結合した係る核酸分子を含むベクターによ って形質転換された培養宿主細胞中で係る核酸分子を発現させ、そして該核酸分 子によりコードされているポリペプチドを宿主細胞から回収することからなる方 法。 18.TRAFポリペプチドを生産する方法であって、該ポリペプチドをコー ドしている核酸を含む細胞のDNA中に、その転写に影響を与えるに十分な該核 酸分子に対する近さおよび向きで、転写調節要素を挿入することからなる方法。 19.TRAFポリペプチドの存在を決定する方法であって、係るポリペプチ ドをコードしているDNAを被験試料核酸にハイブリダイズし、TRAFポリペ プチドDNAの存在を決定することからなる方法。 20.天然TNF−R2の細胞内ドメイン配列の、転写アクティベーターのD NA結合ドメインへの融合物をコードしている、分離された核酸分子。 21.転写アクティベーターが酵母GAL4である、請求項20に記載の核酸 分子。 22.転写アクティベーターの活性化ドメインへのTRAFの融合物をコード している、分離された核酸分子。 23.該転写アクティベーターが酵母GAL4である、請求項22に記載の核 酸分子。 24.請求項20に記載の核酸分子を含むベクター。 25.請求項22に記載の核酸分子を含むベクター。 26.(a)天然TNF−R2の細胞内ドメイン配列と転写アクティベーター のDNA結合ドメインとの融合物、および、候補ポリペプチド因子と転写アクテ ィベーターの活性化ドメインとの融合物を含むポリペプチドをコードしている核 酸分子を、リポーター遺伝子を有する単一の宿主細胞で発現させ; (b)該リポーター遺伝子によりコードされている分子のシグナルを検出する ことにより、候補因子とTNF−R2の細胞内ドメインとの結合を監視する、 ことからなる、天然TNF−R2の細胞内ドメインに特異結合できる因子を同定 するための検定。 27.(a)天然TNF−R2の細胞内ドメイン配列と転写アクティベーター のDNA結合ドメインとの融合物、および、候補因子と転写アクティベーターの 活性化ドメインとの融合物を含むポリペプチドをコードしている核酸分子を、該 TNF−R2に特異結合できるポリペプチド因子をコードしている核酸、および リポーター遺伝子をコードしている核酸でトランスフェクトした、単一の宿主細 胞で発現させ; (b)該リポーター遺伝子によりコードされているポリペプチドのシグナルを 検出することにより、該候補因子とTNF−R2との、または該TNF−R2に 特異結合できる該ポリペプチド因子との関係を監視する、 ことからなる、天然TNF−R2の細胞内ドメインと特異的に関係することので きる因子を同定するための検定。 28.天然TNF−R2の細胞内ドメインと特異的に関係することのできるT RAFポリペプチドをコードしている核酸で核酸ポリメラーゼ反応を開始するこ とからなる、核酸被験試料を増幅する方法。 29.TRAFポリペプチドまたは関連する核酸配列の全体または一部を含む ポリペプチド分子をコードしている核酸配列を検出する方法であって、核酸配列 を、該核酸配列の少なくとも一部と特異結合する検出可能なマーカーと接触させ 、そしてこのように結合したマーカーを検出することからなる方法。 30.TNF−R2によって完全にまたは部分的に仲介されるTNF生物活性 に関連する病理学的状態の防止または処置の方法であって、それを必要とする患 者に、予防的または治療的有効量のTRAFまたはTRAFおよび該TNF−R 2の相互作用を妨げることのできる分子を投与することからなる方法。 31.TRAFと天然TNF−R2の細胞内ドメインとの関係を破壊すること のできる分子を同定するための検定であって、天然TNF−R2、天然TRAF ポリペプチドおよびリポーター遺伝子を同時発現する細胞を候補分子と接触させ 、そして、リポーター遺伝子によりコードされている分子を検出することにより 、該候補分子が該TRAFおよびTNF−R2細胞内ドメイン配列の関係を破壊 す る能力を監視することからなる検定。 32.TRAFと天然TNF−R2の細胞内ドメインとの関係を破壊すること のできる分子を同定するための検定であって、1.天然TNF−R2の細胞内ド メイン配列と転写アクティベーターのDNA結合ドメインとの融合物、2.天然 TRAFポリペプチドと該転写アクティベーターの活性化ドメインとの融合物、 および3.リポーター遺伝子、を発現する細胞を、候補分子と接触させ、そして 、リポーター遺伝子によりコードされている分子を検出することにより、該候補 分子が該TRAFおよびTNF−R2細胞内ドメイン配列の関係を破壊する能力 を監視することからなる検定。 33.TRAF蛋白とCD40との相互作用のインヒビターを同定するための 検定であって、CD40と直接または間接的に結合できるTRAF蛋白、CD4 0、およびその発現がCD4:TRAF相互作用に依存するリポーター遺伝子を 同時発現する組換え宿主細胞を候補インヒビターと接触させ、そして該リポータ ー遺伝子の発現を阻害する分子を選択することからなる検定。 34.該TRAF蛋白がTRAF2である、請求項33に記載の検定。 35.該組換え宿主細胞がTRAF1およびTRAF2を同時発現する、請求 項33に記載の検定。 36.該リポーター遺伝子がNF−κB依存性である、請求項33に記載の検 定。 37.該NF−κB依存性リポーター遺伝子がE−セレクチン−ルシフェラー ゼリポーター遺伝子組み立て物である、請求項36に記載の検定。 38.二ハイブリッド法で実施される、請求項33に記載の検定。 39.TRAF蛋白とLMP1との相互作用のインヒビターを同定するための 検定であって、LMP1と直接または間接的に結合できるTRAF蛋白、LMP 1、およびその発現がLMP1:TRAF相互作用に依存するリポーター遺伝子 を同時発現する組換え宿主細胞を候補インヒビターと接触させ、そして該リポー ター遺伝子の発現を阻害する分子を選択することからなる検定。 40.該TRAF蛋白がTRAF2である、請求項39に記載の検定。 41.該組換え宿主細胞がTRAF1およびTRAF2を同時発現する、請求 項39に記載の検定。 42.該リポーター遺伝子がNF−κB依存性である、請求項39に記載の検 定。 43.該NF−κB依存性リポーター遺伝子がE−セレクチン−ルシフェラー ゼリポーター遺伝子組み立て物である、請求項42に記載の検定。 44.二ハイブリッド法で実施される、請求項39に記載の検定。 45.TNF−R2、CD40またはLMP1により仲介される生物活性を阻 害することのできる、TRAF2(87−501)またはその機能的誘導体。 46.TRAF−R2、CD40またはLMP1により仲介されるNF−κB 活性化を阻害することのできる、請求項45に記載の機能的誘導体。
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