JPH10502674A - インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法 - Google Patents

インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法

Info

Publication number
JPH10502674A
JPH10502674A JP9512087A JP51208797A JPH10502674A JP H10502674 A JPH10502674 A JP H10502674A JP 9512087 A JP9512087 A JP 9512087A JP 51208797 A JP51208797 A JP 51208797A JP H10502674 A JPH10502674 A JP H10502674A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
peptide
organ
seq
molecule
tissue
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
JP9512087A
Other languages
English (en)
Other versions
JP3900305B2 (ja
Inventor
エリッキ ルオスラーティ,
レナタ パスカリーニ,
Original Assignee
ラ ホヤ キャンサー リサーチ ファウンデーション
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US08/526,710 external-priority patent/US5622699A/en
Application filed by ラ ホヤ キャンサー リサーチ ファウンデーション filed Critical ラ ホヤ キャンサー リサーチ ファウンデーション
Publication of JPH10502674A publication Critical patent/JPH10502674A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP3900305B2 publication Critical patent/JP3900305B2/ja
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/62Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
    • A61K47/64Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent
    • A61K47/6425Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent the peptide or protein in the drug conjugate being a receptor, e.g. CD4, a cell surface antigen, i.e. not a peptide ligand targeting the antigen, or a cell surface determinant, i.e. a part of the surface of a cell
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/04General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
    • C07K1/047Simultaneous synthesis of different peptide species; Peptide libraries
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5011Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing antineoplastic activity
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5044Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics involving specific cell types
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5044Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics involving specific cell types
    • G01N33/5058Neurological cells
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5044Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics involving specific cell types
    • G01N33/5067Liver cells
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5082Supracellular entities, e.g. tissue, organisms
    • G01N33/5088Supracellular entities, e.g. tissue, organisms of vertebrates
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/566Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor using specific carrier or receptor proteins as ligand binding reagents where possible specific carrier or receptor proteins are classified with their target compounds
    • G01N33/567Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor using specific carrier or receptor proteins as ligand binding reagents where possible specific carrier or receptor proteins are classified with their target compounds utilising isolate of tissue or organ as binding agent

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

(57)【要約】 本発明は、選択された器官または組織に帰巣する分子をインビボで同定する方法を提供する。さらに本発明は、選択された器官または組織に帰巣するペプチドを提供する。例えば、本発明は、脳または腎臓のような器官、あるいは腫瘍組織のような組織に選択的に帰巣するペプチドを提供する。本発明はさらに、例えば薬物のような因子を選択された器官に標的化するため、または選択された器官により発現された標的分子を同定するために器官帰巣分子を用いる方法を提供する。本発明はまた、器官または組織とαV含有インテグリンに特異的に結合する分子とを接触させることにより、脈管形成血管系を含有する器官または組織を標的化する方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子 および同分子を同定する方法 本発明は、国立衛生研究所より授与されたCA42507、CA62042、およびCancer C enter Support Grant CA30199の下で政府援助をともなってなされた。政府は本 発明に所定の権利を有する。 発明の背景 発明の分野 本発明は、一般に分子医薬および薬物送達の分野に関し、そしてより詳細には 、特定の器官に帰巣する(home)分子を同定するためのインビボパンニングの方 法、ならびに正常な器官および腫瘍を包含する、特定の器官に帰巣する分子に関 する。 背景の情報 特定の病理の影響は、しばしば罹患者の体全体に示されるが、一般的には、基 本的な病理は単一の器官または組織のみに影響し得る。多くの場合、薬物は、特 定の疾患を患う患者のために選択される処置法である。しかし、薬物が疾患にな った器官または組織のみを標的化することは希である。さらに一般的には、薬物 処置は、例えば、患者の体全体に広がった有毒な影響のために、望ましくない副 作用を生じる。化学療法薬を用いたガン患者の治療の結果として生じる悪心、抜 け毛、血球数の減少は、薬物処置のために生じ得る望ましくない副作用の例であ る。 薬物が疾患を治療するのに用いられた場合に生じ得る望ましくない副作用は、 最も頻繁には疾患になった器官または組織に薬物が特異的に標的化し得ないこと に起因する。例えば、急速に増殖する細胞を標的化するガン化学療法剤は、急速 に分裂するガン細胞を死滅させるのに有用である。しかし、このような薬物はま た、正常に増殖する造血細胞および上皮細胞を死滅させる。従って、患者に投与 され得るこのような薬物の用量は、その正常な細胞への有毒な影響のために制限 される。 種々の薬物の標的特異性を増加させるための努力がなされた。いくつかの場合 では、疾患になった組織または器官に存在する特定の細胞型は、独特の細胞表面 マーカーを発現し得る。このような場合では、抗体は独特の細胞表面マーカーに 対して惹起され得、そして薬物は抗体に結合され得る。患者への薬物/抗体複合 体の投与において、細胞表面マーカーへの抗体の結合は、疾患になった組織また は器官への比較的高濃度の薬物の送達を生じる。疾患になった器官中の特定の細 胞型が独特の細胞表面レセプターまたは特定のレセプターに対するリガンドを発 現する場合、類似した方法が用いられ得る。これらの場合、薬物はそれぞれ特異 的なリガンドまたはレセプターに結合され得、従って疾患になった器官に比較的 高濃度の薬物を送達する手段を提供する。 疾患になった器官または組織に存在する特定の細胞型に帰巣する分子への薬物 の結合は、その薬物単独の使用を越えて処置に顕著な利点を提供するが、この方 法の使用は厳格に制限されている。詳細には、細胞型特異的抗体はほとんど記載 されておらず、そして病理を患う特定の患者の器官を標的化する抗体を得ようと 試みることは、困難であり、そして手間を要し得る。さらに、細胞型特異的表面 マーカーはほとんど記載されていない。このようなマーカーが記載されている場 合であっても、マーカーを発現する細胞は種々の組織または器官に分布され得、 それによって、標的としてのそれらの有用性が限定される。従って、ただ1つま たは2、3の組織または器官で発現される特異的な標的細胞マーカーを同定する こと、およびそのようなマーカーと特異的に相互作用する分子を同定することが 重要である。 種々の細胞型は独特のマーカーを発現し得、それ故、器官帰巣分子(organ ho ming molecule)に対する潜在的な標的を提供し得る。内皮細胞(例えば血管の 内部表面を区画する)は、異なる細胞において異なる形態学および生化学的マー カーを有し得る。例えば、リンパ系の血管は、リンパ球の帰巣を誘導するように 働く種々の接着性タンパク質を発現する。さらに、リンパ節に存在する内皮細胞 は、L-セレクチンに対するリガンドである細胞表面マーカーを発現し、そしてパ イアー斑細静脈中の内皮細胞は、α4β7インテグリンに対するリガンドを発現す る。これらのリガンドは、それぞれのリンパ系器官に帰巣する特異的なリンパ球 に関与する。従って、L-セレクチンまたはα4β7インテグリンに薬物を結合させ ることは、これらの分子が非常に多数の他の器官に存在する類似したリガンドに 結合しないのであれば、疾患になったリンパ節またはパイアー斑のそれぞれに薬 物を標的させる手段を提供し得る。 非リンパ系組織の血管に存在する帰巣分子は、明確に規定されていないが、リ ンパ球のそれらが最初に刺激された器官に回帰する能力は、器官特異的な内皮の マーカーが存在することを示す。同様に、特定の器官への特定の型の腫瘍細胞の 帰巣または転移は、器官特異的マーカーが存在することの更なる証拠を提供する 。しかし、他の器官特異的細胞マーカーおよびそれらに結合する分子を同定する 必要性が残されている。 目的の分子を同定するために、大集団の分子を生産する方法、および分子のラ イブラリーをスクリーニングする方法が現在利用可能である。例えば、ファージ ペプチドディスプレイライブラリーは、標的分子または細胞を特異的に結合する ペプチドを同定するために、特定の標的分子または目的の細胞を用いてインビト ロでスクリーニングされ得る多数のペプチドを発現するのに用いられ得る。この ようなファージディスプレイライブラリーのスクリーニングは、例えば、種々の 抗体および細胞表面レセプターを特異的に結合するリガンドを同定するのに用い られている。 ファージディスプレイライブラリーのスクリーニングは、一般的に、精製され た標的分子を用いるライブラリーのインビトロパンニングを包含する。標的分子 を結合するファージが回収され得、個々のファージがクローン化され得、そして クローン化されたファージによって発現されるペプチドが決定され得る。このよ うなペプチドは、標的分子を発現する細胞へのペプチドに結合された薬物の送達 に有用であり得る。 不運なことに、ただ1つまたは2、3の細胞型によって発現される標的分子は ほとんど同定されていない。さらに、そのような標的分子が知られていても、標 的分子を特異的に結合するペプチドが、インビトロでのパンニング法を用いて決 定されたように、インビボで標的分子に結合するかは不明である。結果として、 インビトロでのパンニング法を用いるファージディスプレイライブラリーからの ペプチドの同定は、本質的に同定されるペプチドがインビボでの手順に有用であ り得るかを決定するための出発点のみを示す。従って、1つ以上の選択される器 官または組織に帰巣し得る分子を同定するために、ペプチドのような多数の分子 をスクリーニングするためのインビボでの方法を開発する必要がある。本発明で は、この必要性を満たし、そしてさらに関連した利点を提供する。 発明の要約 本発明は、潜在的な器官帰巣分子のライブラリーをスクリーニングするインビ ボパンニングを用いることによって、1または2、3の選択された器官または組 織に特異的に帰巣する分子を同定する方法を提供する。インビボパンニング法は 、多種多様な分子の集団からなるライブラリーを被験体に投与すること、および その被験体の選択された1つ以上の器官または組織に帰巣する分子を同定するこ とを包含する。本発明は、ファージペプチドディスプレイライブラリーの被験体 への投与、およびその被験体の脳、腎臓、または腫瘍(例えば、乳ガンまたは黒 色腫)に帰巣するファージによって発現されるペプチドの同定により例示される 。インビボパンニングは、所望の選択性を有して選択された器官または組織に帰 巣する分子が回収されるまで、1回以上繰り返され得る。 本発明はまた、選択された器官または組織に選択的に帰巣するペプチドを提供 する。例えば、本発明は、ペプチドCLSSRLDAC(配列番号3)のようなSRL(セリ ン−アルギニン−リジン)モチーフまたはペプチドWRCVLREGPAGGCAWFNRHRL(配 列番号16)のようなモチーフVLRを有する脳帰巣ペプチドを提供する。さらに本 発明は、ペプチドCLPVASC(配列番号21)のような腎臓帰巣ペプチドを提供する 。さらに本発明は、ペプチドCGRECPRLCQSSC(配列番号48)(乳房の腫瘍に帰巣 する)、ならびにペプチドWGTGLC(配列番号52)およびCLSGSLSC(配列番号55) (黒色腫に帰巣する)のような腫瘍帰巣ペプチドを提供する。このような器官ま たは組織帰巣分子は、本明細書中において便宜上「器官帰巣」分子として記載さ れる。「腫瘍帰巣分子」は、器官帰巣分子の一例である。本発明の器官帰巣分子 は、例えば、薬物のような成分を選択された器官または組織に標的させるのに有 用であるか、またはサンプル中の標的分子の存在を同定するのに有用である。 本発明はさらに、標的分子の器官帰巣分子への選択的結合を検出することによ って標的分子を同定する方法を提供する。例えば、選択された器官または組織に 選択的に帰巣するペプチドは、アフィニティークロマトグラフィーに使用するた めの固体マトリックスに付着され得る。選択された器官または組織のサンプルが 得られ、そして標的分子の特異的結合を可能にする条件下でアフィニティーマト リックスを通過させ得る。次いで標的分子は、周知の生化学的方法を用いて回収 および同定され得る。標的分子は、例えば、標的分子に特異的な抗体を惹起する のに有用であり得る。 発明の詳細な説明 本発明はインビボパンニング(PasqualiniおよびRuoslahti、Nature 380:364- 366(1996)を参考のこと、これは本明細書中で参考として援用される)を用いて ライブラリーをスクリーニングすることによって、1または2、3の選択される 器官または組織(黒色腫または乳ガンのような腫瘍を含む)に特異的に帰巣する 分子を同定する方法を提供する。同定された器官帰巣分子は、例えば、薬物、毒 素、または検出可能なタグ(tag)(これらはその分子に結合され得る)のよう な所望の成分を選択された器官または組織に標的させるのに有用である。インビ ボパンニングは、選択された器官または組織に選択的に帰巣する分子を同定する ための直接的方法を提供し、そしてそれ故、従来の方法(インビトロでのスクリ ーニング法を用いて同定された分子は、その後にインビボでその特異性を維持し ているかを決定するために調査される必要がある)を越える顕著な利点を提供す る。 本明細書中で用いられる用語「ライブラリー」は、分子の収集物を意味する。 ライブラリーは、2、3または約10分子から数10億以上の分子まで変化する多数 の異なる分子を含有し得る。所望であれば、分子はタグに結合され得る。このタ グは、分子の回収または同定を促進し得る共有タグ(shared tag)または特異的 タグ(specific tag)であり得る。 本明細書で用いられる用語「分子」は、薬物のような有機化合物;ペプチド( ペプチド模倣物(peptidomimetic)またはペプトイド(peptoid)のような変異体ペ プチドまたは改変ペプチドあるいはペプチド様分子を含む);あるいは抗体また は成長因子レセプターのようなタンパク質もしくは結合ドメインを含有するそれ らのフラグメント(例えば、抗体のFv、Fd、またはFabフラグメント)を意味す るように広範に用いられ得る。便宜上、用語「ペプチド」は、ペプチド、タンパ ク質、タンパク質のフラグメントなどを意味するように本明細書中で広範に用い られる。分子は、天然に存在せずインビトロ法の結果として産生される非天然存 在分子であり得るか、またはcDNAライブラリーから発現されるタンパク質または そのフラグメントのような天然に存在する分子であり得る。 ペプチド、ペプトイド、およびペプチド模倣物のような種々の型の分子の多種 多様な集団を含有するライブラリーを調製する方法は、当該分野において周知で あり、そして商業的に利用可能である(例えば、EckerおよびCrooke、Biotechno logy 13:351-360(1995)およびBlondelleら、Trends Anal.Chem. 14:83-92(1995) 、ならびにそれらで引用されている参考文献(それぞれ本明細書中で参考として 援用される)を参照のこと;GoodmanおよびRo、Peptidomimetics for Drug Desi gn 、"Burger's Medicinal Chemistry and Drug Discovery"第1巻(M.E.Wolff編 ;John Wiley & Sons 1995)、803〜861頁、およびGordonら、J.Med.Chem.37:138 5-1401(1994)(それぞれ本明細書中で参考として援用される)をさらに参照の こと)。分子がペプチド、タンパク質、またはそのフラグメントである場合、そ の分子はインビトロで直接生産され得るか、または核酸から発現され得、これは インビトロで産生される。合成ペプチドおよび核酸化学の方法は、当該分野にお いて周知である。 分子のライブラリーはまた、例えば、目的の細胞、組織、器官、または生物か ら回収されたmRNAからcDNA発現のライブラリーを構築することによって産生され 得る。このようなライブラリーを産生する方法は、当該分野において周知である (例えば、Sambrookら、Molecular Cloning:A laboratory manual(Cold Spring Harbor Laboratory Press 1989)(これは、本明細書中で参考として援用され る)を参照のこと)。好ましくは、cDNAによってコードされるペプチドは、cDNA を含有する細胞またはウイルスの表面上で発現される。例えば、cDNAは、fuse5 (例Iを参照のこと)のようなファージベクター中にクローン化され得、ここで は、発現において、コードされるペプチドはファージの表面上に融合タンパク質 として発現される。 さらに、分子のライブラリーは、核酸分子のライブラリーを包含し得る。例え ば、細胞表面レセプターに結合する核酸分子は、当該分野において公知である( O'Connellら、Proc.Natl.Acad.Scl.,USA 93:5883-5887(1996);TuerkおよびGol d、Science 249:505-510(1990);Goldら、Ann.Rev.Biochem. 64:763-797(199 5)(それぞれ本明細書中で参考として援用される)を参照のこと)。従って、 核酸分子のライブラリーは、腫瘍を有する被験体に投与され得、そして腫瘍帰巣 分子は、本明細書に記載されているインビボパンニングによって同定され得る。 所望であれば、核酸分子は、例えば、ヌクレアーゼによる攻撃に影響されにくい 核酸アナログであり得る(例えば、Jelinekら、Biochemistry 34:11363-11372( 1995);Lathamら、Nucl.Acids Res. 22:2817-2822(1994);Tamら、Nucl.Acids Res 22:977-986(1994);Reedら、Cancer Res. 59:6565-6570(1990)(それぞ れ本明細書中で参考として援用される)を参照のこと。 明細書中に開示されるインビボパンニングは、被験体にライブラリーを投与す ること、選択された器官または組織を採集すること、および器官帰巣分子を同定 することを包含する。器官帰巣分子は、当該分野で周知の種々の方法を用いて同 定され得る。一般的に、選択された器官または組織中の器官帰巣分子の存在は、 ライブラリーに存在する分子に共通する1つ以上の特徴に基づいて同定され、次 いで、特定の器官帰巣分子の構造が同定される。例えば、単独またはガスクロマ トグラフィーのような方法と組み合わせるかのいずれかで高感度検出法(例えば 、質量分析法)が用いられ、選択された器官または組織中の器官帰巣分子が同定 され得る。従って、ライブラリーが、一般的に有機分子の構造に基づいて多種多 様な分子を含む場合、薬物のような器官帰巣分子の存在は、特定の分子に関する 親ピーク(parent peak)の存在を検出することによって同定され得る。 所望であれば、選択された器官または組織は採集され、次いでHPLCのような方 法で処理され得る。HPLCは、規定された範囲の分子量あるいは極性または非極性 などの特徴を有する分子が富化された画分を提供し得る。HPLCの条件は、特定の 分子の化学特性に依存し、そして該当分野に周知である。同様に、潜在的に干渉 する細胞性物質(例えば、DNA、RNA、タンパク質、脂質、または炭水化物)の大 部分を除去する方法は、例えば、選択的抽出法を用いる有機分子を含有する画分 を富化する方法として当該分野で周知である。例えば、ライブラリーが各々に特 異的なオリゴヌクレオチドタグに結合した多種多様な有機化学分子の集団を含有 する場合、特定の分子がポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いてオリゴヌクレオチ ド配列分析することによって同定されるように、ゲノムDNAはバックグラウンドP CR反応に関する潜在性を減少させるために回収された器官のサンプルから除去さ れ得る。さらに、ライブラリーは、各々共通の共有タグと結合した有機化学分子 のような多種多様な分子の集団を有し得る。共有タグの存在および特徴に基づき 、器官または組織に選択的に帰巣するライブラリーの分子は、器官または組織の サンプルから実質的に単離され得る。これらおよび他の方法は、採集された器官 のサンプルを特定の器官帰巣分子について富化し、それによって採集された器官 サンプルから潜在的に混入している物質を除去し、そして分子を検出する感度を 増加させるのに有用であり得る。 本明細書中に提供される証拠は、器官帰巣分子が容易に同定され得るような十 分な数の器官帰巣分子が、インビボパンニング中に選択される器官または組織に 選択的に帰巣することを示す。例えば、同一のペプチドを発現する種々の独立フ ァージを、脳(表1)、腎臓(表2)、および移植された乳ガン細胞から形成さ れた腫瘍(表3)または移植された黒色腫細胞から形成された腫瘍(表4)にお いて同定した。特に、配列決定した腎臓帰巣ペプチドのほとんど半分は、アミノ 酸配列CLPVASC(配列番号21)を有していた;脳に帰巣した2つのペプチドは、 配列決定された脳帰巣ペプチドの約40%を構成していた;乳房に帰巣した1つの ペプチドは、配列決定した乳房腫瘍帰巣ペプチドの約43%を構成していた;そし て黒色腫に帰巣した2つのペプチドは、配列決定した黒色腫帰巣ペプチドの75% より多くを構成していた(実施例IIおよびIIIを参照のこと)。 同定された器官帰巣分子の実質的な画分は同一の構造を有するが、ごく少数の 単離したファージのペプチド挿入物を決定した。しかし、器官帰巣分子に関する 種々のインビボパンニングの後、幾十万から百万の、器官帰巣ペプチドを発現す るファージを回収したことを理解されたい。これらの結果は、特定の器官帰巣分 子が、インビボ帰巣の後、器官に十分量存在し、それによって、分子が同定され 得る容易さを増大することを示す。 器官帰巣分子(特に非タグ化分子(untagged molecule))の同定の容易さは、 潜在的に混入しているバックグラウンド細胞性物質の存在を含む種々の因子に依 存する。従って、器官帰巣分子が非タグ化ペプチドである場合、細胞性タンパク 質のバックグランドに対して特異的なペプチドを同定するためにより多数の分子 が帰巣しなければならない。対照的に、はるかにより少数の非タグ化有機化学帰 巣分子が同定可能である。なぜなら、このような分子は、通常身体に存在しない か、またはごく少数しか存在しないためである。このような場合、質量分析のよ うな高い感度の方法が、器官帰巣分子を同定するのに用いられ得る。分子を同定 する方法が、部分的に、特定の分子の化学的特性に依存することを当業者は理解 する。 器官帰巣分子が核酸であるか、または核酸分子でタグ化(tagged)されている 場合、PCRのようなアッセイが、分子の存在を同定するのに特に有用であり得る 。なぜなら、原則として、PCRは1本鎖核酸分子の存在を検出し得るからである (例えば、Erlich、PCR Technology :Principles and APPlications for DNA Am plification (Stockton Press 1989)(これは本明細書中で参考として援用され る)を参照のこと)。予備実験は、約6,000塩基対プラスミドの10ngをマウスに 静脈注射し、そして2分間の循環の後に、そのプラスミドを肺のサンプル中にPC Rによって検出し得たことを示した。これらの結果は、核酸が循環に投与された 場合、インビボパンニングが選択された器官に選択的に帰巣する核酸分子を同定 し得るほどその核酸が十分に安定であることを示している。 ライブラリーの分子はタグ化され得、これは分子の回収または同定を容易にし 得る。本明細書中で用いられる用語「タグ」は、それぞれライブラリーの分子に 結合されたプラスチックマイクロビーズ、オリゴヌクレオチド、またはバクテリ オファージのような物理学的、化学的、または生物学的な部分を意味する。分子 をタグ化する方法は当業者に周知である(Hermanson、Bioconjugate Techniques (Academic Press 1996)、これは本明細書中で参考として援用される。 タグ(共有タグまたは特異的タグであり得る)は、ライブラリーの分子の存在 または構造を同定するのに有用であり得る。本明細書中で用いられる用語「共有 タグ」は、ライブラリー中の各分子に共通する物理学的、化学的、または生物学 的な部分を意味する。例えば、ビオチンは、ライブラリー中の各々の分子に結合 される共有タグであり得る。共有タグは、サンプル中のライブラリーの分子の存 在を同定するのに有用であり得、そしてさらにサンプルから分子を実質的に単離 するのに有用であり得る。例えば、共有タグがビオチンである場合、ライブラリ ー中のビオチンタグ化分子は、ストレプトアビジンへの結合によって実質的に単 離され得るか、またはそれらの存在は、標識されたストレプトアビジンとの結合 によって同定され得る。ライブラリーがファージディスプレイライブラリーであ る場合、ペプチドを発現するファージは共有タグのその他の例である。なぜなら 、ライブラリーの各ペプチドがファージに結合されるからである。さらに、ヘマ グルチニン抗原のようなペプチドは、ライブラリー中の各分子に結合される共有 タグであり得、それによって選択される器官または組織のサンプルからライブラ リーの分子を実質的に単離するためのヘマグルチニン抗原に対して特異的な抗体 の使用を可能にする。 共有タグはまた、サンプル中のライブラリーの分子の存在を同定するためか、 またはサンプルからライブラリーの分子を実質的に単離するために有用であり得 る核酸配列であり得る。例えば、ライブラリーの各分子は、同一の選択されたヌ クレオチド配列に結合され得、これは共有タグを構成する。次いで、共有タグに 相補的なヌクレオチド配列を含有するアフィニティーカラムは、共有タグを有す るライブラリーの分子をハイブリダイズさせるのに有用であり得、そのようにし て器官または組織サンプルから分子を実質的に単離する。共有ヌクレオチド配列 タグの一部に相補的なヌクレオチド配列はまた、共有タグを含有する分子の存在 がPCRによってサンプル中で同定され得るように、PCRプライマーとして用いられ 得る。 タグはまた、特異的タグであり得る。本明細書中で用いられる用語「特異的タ グ」は、ライブラリー中で特定の分子に結合され、そしてその特定の分子に独特 である物理学的、化学的、または生物学的タグを意味する。特異的タグは、それ が容易に同定し得る場合に特に有用である。ライブラリーの特定の分子に独特な ヌクレオチド配列は、特異的タグの一例である。例えば、独特なヌクレオチド配 列でタグ化したペプチドを合成する方法は、ヌクレオチド配列を同定することに おいて、そのペプチドの同一性が知られているような、各々特異的タグを含有す る分子のライブラリーを提供する(BrennerおよびLerner、Proc.Natl.Acad.Sci. ,USA 89:5381-5383(1992)を参照のこと、これは本明細書中で参考として援用さ れる)。ペプチドまたはその他の型の分子のための特異的タグとしてのヌクレオ チド配列の使用は、サンプル中の分子の存在を同定する簡便な手段を供給する。 なぜなら、PCRのような極めて感度の高い方法は、特異的タグのヌクレオチド配 列を決定するのに用いられ得、それによってそこに結合した分子の配列を同定し 得るからである。同様に、ファージ上で発現されるペプチドをコードする核酸配 列は、特異的タグの他の例である。なぜなら、特異的タグの配列決定は、発現さ れるペプチドのアミノ酸配列を同定するからである。 共有タグまたは特異的タグの存在は、インビボパンニングの後、本発明の器官 帰巣分子を同定または回収する手段を提供し得る。さらに、共有タグおよび特異 的タグの組み合わせは、器官帰巣分子を同定するのに特に有用であり得る。例え ば、ペプチドのライブラリーは、各々が特異的ヌクレオチド配列タグに結合する ように調製され得(例えば、BrennerおよびLerner、前出、1992を参照のこと)、 ここで、各々の特異的ヌクレオチド配列タグはビオチンのような共有タグ中に取 り込まれている。器官への帰巣において、特定の器官に帰巣するペプチドは、共 有タグに基づいて器官のサンプルから実質的に単離され得、そして特異的ペプチ ドは、例えば、特異的タグのPCR(Erlich、前出、1989を参照のこと)によって 同定され得る。 タグはまた、支持体として働き得る。本明細書に用いられる用語「支持体」は 、分子が付着され得る規定された表面を有するタグを意味する。一般的に、支持 体として有用なタグは共有タグである。例えば、支持体は、生物学的タグ(例え ば、ウイルスまたはバクテリイオファージのようなウイルス様粒子「ファージ」 ;E.coliのような細菌;あるいは酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞のよ うな 真核細胞)であり得るか;または、リポソームまたはマイクロビーズのような物 理的タグであり得、これは、プラスチック、アガロース、ゼラチン、またはその 他の物質から構成され得る。所望であれば、支持体として有用な共有タグは、そ れ自身に特異的タグを結合し得る。従って、例示した方法において用いられるフ ァージディスプレイライブラリーは、ファージからなると考えられ得、これは支 持体でもある共有タグであり、そして核酸配列は発現されるペプチドをコードし 、この核酸配列は特異的タグである。 一般に、支持体が被験体中に存在するキャピラリーベッド(capillary bed)を 比較的妨害されずに通過し得、そして循環を閉鎖しないように、支持体はその最 も短い寸法(dimension)において約10μm〜約50μmよりも短い直径を有するべ きである。さらに、支持体は、それが細胞表面分子の正常な発現または被験体の 正常な生理機能を混乱しないように非毒性であり得、特に、インビボパンニング に用いられる被験体が選択された器官または組織を採集するために屠殺されない 場合には、生分解性であり得る。 分子が支持体に結合される場合、被験体の細胞中の標的と相互作用し得ると思 われる分子の一部が相互作用に関与するように位置されるように、タグ化された 分子は、支持体の表面に付着した分子を含む。例えば、分子がβアドレナリン作 用性アゴニストであると思われる場合、支持体に付着した分子の結合部分は、そ れが選択された器官または組織中の細胞上のβアドレナリン作用性レセプターと 相互作用し得るように位置される。同様に、分子が成長因子レセプターに対する リガンドであると思われる場合、分子は、それがレセプターを結合し得るように 支持体上に位置される。所望であれば、適切なスペーサー分子が、潜在的な器官 帰巣分子の標的分子と相互作用する能力を妨げないように分子と支持体との間に 位置され得る。スペーサー分子はまた、反応基を含有し得、これは支持体に分子 を結合させる簡便で有効な手段を提供し、そして所望であればタグを含有し得、 これは分子の回収または同定を促進し得る(Hermanson、前出、1996を参照のこ と)。 本明細書中で例示されるように、脳のような選択された器官または組織に帰巣 し得ると思われるペプチドを、融合タンパク質のN末端として発現させた。ここ でC末端はファージコートタンパク質からなる。融合タンパク質の発現において 、C末端コートタンパク質を、N末端ペプチドが器官中の標的分子と相互作用す る位置にあるように、ファージの表面に融合タンパク質を結合させた。従って、 共有タグを有する分子を、ペプチドのファージへの結合によって形成させた。こ こで、ファージは生物学的支持体を提供し、ペプチド分子は融合タンパク質とし て結合されており、融合タンパク質のファージをコードする部分は、スペーサー 分子として作用し、そしてペプチドをコードする核酸は、器官帰巣ペプチドの同 定を可能にする特異的タグを提供した。 本明細書中で用いられる用語「インビボパンニング」は、被験体にライブラリ ーを投与すること、および選択的に1つまたは2、3の選択された器官または組 織を同定することによってライブラリーをスクリーニングする方法を意味する。 用語「被験体に投与すること」は、分子のライブラリーまたはその一部に言及す るときに用いられる場合、ライブラリーの分子が選択された器官または組織に接 触するように、ライブラリーが選択された器官または組織(所望であれば腫瘍を 含む)に送達されることを示す最も広範な意味で用いられる。 ライブラリーは、例えば、分子が選択された器官または組織を通過し得るよう に、被験体の循環系へライブラリーを注入することにより被験体に投与され得る 。適切な期間後、循環は被験体を屠殺する、または器官のサンプルを取り出すこ とにより、終了される(実施例Iを参照のこと)。あるいは、カニューレを被験 体の血管に挿入し得ることにより、適切な期間の灌流によりこのライブラリーが 投与され、その後カニューレを介して循環系からライブラリーが取り出され得る か、あるいは被験体が屠殺され得るか、または器官がサンプリングされ得て循環 が終了される。同様に、ライブラリーは、被験体における適切な血管のカニュレ 挿入によって、1つまたは数個の器官を介して短絡され得る。ライブラリーはま た、単離され、灌流された器官に投与され得るということが認識されている。単 離され、灌流された器官におけるこのようなパンニングは、器官に結合する分子 を同定するために有用であり得、そして所望であれば、ライブラリーの最初のス クリーニングとしても使用され得る。例えば、腎臓帰巣分子が所望であれば、ラ イブラリーは単離された腎臓を介して灌流され得、次いで灌流された腎臓に結合 した 分子は腎臓帰巣分子を同定するためにインビボパンニングによりスクリーニング され得る。 インビボパンニング法は、マウスのファージペプチドディスプレイライブラリ ーをスクリーニングすることにより、および、脳、腎臓、または腫瘍に選択的に 帰巣する特定のペプチドを同定することにより本明細書中で例示される(実施例 IIおよびIIIを参照のこと)。しかし、タンパク質レセプター分子(例えば、抗 体、あるいはFv、Fd、またはFabフラグメントのような抗体の抗原結合フラグメ ント;増殖因子レセプターのようなホルモンレセプター;あるいはインテグリン またはセレクチンのような細胞接着レセプターを含む)を呈示するファージライ ブラリーはまた本発明の実施のために使用され得る。このような分子の改変体は 、ランダム変異誘発、部位特異的変異誘発、コドンに基づく変異誘発のような周 知の方法を使用して構築され得る(Huse,米国特許第5,264,563号、1993年11月23 日発行、本明細書中に参考として援用される)。従って、種々のタイプのファー ジディスプレイライブラリーが開示のインビボパンニング法を利用してスクリー ニングされ得る。 ファージディスプレイ技術は、異なる集団の無作為なまたは選択的に無作為化 したペプチドを発現するための手段を提供する。種々のファージディスプレイ方 法および異なるペプチドの集団を作製するための方法は、当該分野で周知である 。例えば、Ladnerら(米国特許第5,223,409号、1993年6月29日発行、本明細書 に参考として援用される)は、ファージ表面上での異なる結合ドメインの集団を 調製するための方法を記載する。特に、Ladnerらは、ファージディスプレイライ ブラリーを作製するために有用なファージベクター、ならびに潜在的な結合ドメ インを選択し、および変異された結合ドメインを無作為にまたは選択的に生成す る方法を記載する。 同様に、SmithおよびScott(Meth.Enzymol.217:228-257(1993);また、scottお よびSmith、Science 249:386-390(1990)を参照のこと)、これら各々は本明細書 中に参考として援用される)は、ファージペプチドディスプレイライブラリーを 作製する方法を記載し、この方法は、ベクターおよび発現されるペプチドの集団 を多様化させる方法を包含する(Huse、WO/91/07141およびWO/91/07149をまた参 照のこと、これらの各々は本明細書中に参考として援用される、実施例Iもまた 参照のこと)。ファージディスプレイ技術は、例えば、ランダムペプチドまたは 無作為にまたは望ましく偏したペプチドを生成するために使用され得るコドンに 基づく変異誘発法とともに使用される場合、特に効果的であり得る(Huse、米国 特許第5,264,563号、前出、1993)。これらまたは他の周知の方法は、ファージ ディスプレイライブラリーを作製するために使用され得、これは、1つまたは数 個の選択された器官または組織に帰巣するペプチドを同定するために本発明のイ ンビボパンニング法に供され得る。 さらに、ファージディスプレイライブラリーをスクリーニングするために、イ ンビボパンニングは、種々の他のタイプのライブラリー(例えば、RNAまたはcDN Aライブラリーあるいは化学的ライブラリーを包含する)をスクリーニングする ために使用され得る。所望であれば、器官に帰巣する分子がタグ化され得、選択 された器官または組織からの分子の回収、あるいは器官または組織における分子 の同定を容易にし得る。例えば、有機分子(それぞれ、共有タグを含む)のライ ブラリーをスクリーニングする場合タグはビオチンのような部分であり得、これ は、分子に直接連結され得るか、または分子を含む支持体に連結され得る。ビオ チンは、(アビジンまたはストレプトアビジン親和性基質を使用して)、選択さ れた器官または組織から分子を回収するために、有用な共有タグを提供する。さ らに、分子または分子を含む支持体は、ハプテン(4−エトキシ−メチレン−2 −フェニル−2−オキサゾリン−5−オン(phOx)、これはタグ化された分子を回 収する手段として、磁気ビーズに結合される抗phOx抗体により結合され得る)の ような共有タグに連結され得る。ビオチンまたはphOxでタグ化された分子を精製 するための方法は、当該分野で公知であり、そして、これらの手順を行うための 材料は商業的に利用可能である(例えば、Invitrogen;La Jolla CA;およびPromeg a Corp.;Madison WI)。ファージライブラリーがスクリーニングされる場合、フ ァージは実施例Iに開示するような方法を用いて回収され得る。 インビボパンニングは、1つまたは数個の選択された器官または組織に帰巣し 得る分子を直接同定するための方法を提供する。本明細書中で用いられる用語「 帰巣する」または「選択的に帰巣する」は、特定の分子が、被験体への投与後 に1つまたは数個の選択された器官または組織に存在する標的分子に比較的特異 的に結合することを意味する。一般に、選択的な帰巣は、部分的には、コントロ ールの器官または組織に比べて、選択された器官または組織への分子の少なくと も2倍(2×)以上の特異的な結合を検出することにより特徴づけられる。 いくつかの場合において、分子が器官または組織に非特異的に局在し得ること が認識されるべきである。例えば、ファージディスプレイライブラリーのインビ ボパンニングの結果、多数のファージが網内細胞系(RES)の構成要素を含む器官 (例えば、肝臓、肺、および脾臓)に局在した。このような組織における選択的 な帰巣は、例えば、異なる個々のファージが選択された器官または組織(RES構 成要素を含む器官を含む)に帰巣する能力における差異を検出することにより、 非特異的な結合とは区別され得る。例えば、選択的な帰巣は、推定の器官帰巣分 子(例えばファージ上で発現されるペプチド)と大過剰の非感染ファージまたは 非選択的なペプチドを発現する約5倍量過剰のファージとを組み合わせる工程、 この混合物を被験体に注入する工程、および選択された器官または組織のサンプ ルを回収する工程により同定され得る。後者の場合、例えば、器官帰巣ペプチド を発現する注入されたファージの数が、標的分子については非飽和状態であるよ うに十分少ないならば、選択された器官または組織において、20%を超えるファ ージが推定の器官帰巣分子を発現するという決定は、ファージにより発現するペ プチドは特定の器官帰巣分子であるということの決定的な証明である。さらに、 非特異的局在は、実施例II.DおよびIVに記載されるような競合実験を行うこと によって、選択的帰巣とは区別され得る。 種々の方法がRESの構成要素を含む器官への分子の非特異的な結合を妨げるた めに有用であり得る。例えば、選択的にこのような器官に帰巣する分子は、ポリ スチレンラテックス粒子またはデキストランサルフェートのような材料を用いて RESをまずブロックする工程(Kalinら、Nucl.Med.Biol.20:171-174(1993);Illum ら、J.Pharm.Sci.75:16-22(1986);Takeyaら、J.Gen.Microbiol.100:373-379(197 7)を参照のこと;これら各々は本明細書中に参考として援用される)、次いで被 験体にライブラリーを投与する工程により得られ得る。従って、Illumらは、デ キストランサルフェート500またはポリスチレンマイクロスフェアを、試験物質 の投与の前に、肝臓のRES構成要素であるKupffer細胞による試験物質の非特異的 な取り込みをブロックするために投与した(Illumら、前出、1986)。さらに、T akeyaらは、肝臓中のRESは、炭素粒子、デキストランサルフェート500(DS-500) 、または二酸化珪素を用いてブロックされ得ることを報告した(Takeyaら、前出 、1977)。また、Kalinらは、RESのブロックはゼラチンコロイドを用いて達成さ れ得ることを報告した(Kalinら、前出、1993)。RESによる非特異的取り込みを ブロックするために有用な、これらのおよび種々の他の因子は、既知であり、日 常的に使用されている。 RESへのまたは他の部位への、ファージの望ましくない結合はまた、特定のフ ァージディスプレイライブラリーを複製欠損された同じファージとともにマウス に同時注入することにより妨げられ得る(Smithら、前出、1990、1993を参照の こと)。さらに、RES構成要素を含む器官に帰巣するペプチドは、このような器 官に低いバックグラウンド結合を示すファージを用いてファージディスプレイラ イブラリーを調製することにより同定され得る。例えば、Merrillら(Proc.Natl .Acad.Sci.,USA 93:3188-3192(1996)、これは本明細書中に参考として援用され る)は、RESにより取り込まれず、その結果として、長期間、循環系に残存する λ型ファージを選択した。繊維状ファージ改変体は同様の方法を用いて選択され 得る。 本明細書中に開示されているように、肝臓におけるRESによるペプチド呈示フ ァージの取り込みは、例えば、増殖可能でない非感染ファージの同時投与により ブロックされた。CX9ライブラリーを発現するファージは、単独または過剰な非 感染ファージとともにのいずれかで、マウスに注入された(実施例II.E.を参照 のこと)。非感染ファージとライブラリーファージとの同時投与は、実質的に肝 臓において回収されたファージの量を減少しそしてより小さな範囲の脾臓に減少 した。一方、脳、腎臓、または肺から回収されたファージ数において、ほとんど または全く差異は観察されなかった。これらの結果は、肝臓および脾臓のような 器官(少なくとも一部分は、これらの器官のRES構成要素により非特異的であり 得る)によるファージの取り込みが、非感染ファージとペプチドディスプレイン グファージライブラリーとの同時投与によってブロックされ得るということを示 唆する。 さらなる実験が、非感染ファージとの同時投与の際に肝臓に存在するファージ が選択的に肝臓に帰巣したかどうかを決定するために行われた。ファージライブ ラリーが、非感染ファージと同時投与され、次いで第1回のインビボパンニング が後に肝臓から回収されたファージがインビトロで増幅され、そして第2回のイ ンビボパンニングのために使用される(実施例II.E.を参照のこと)。ファージ は、肝臓および脳(コントロール器官)から回収され、そして各回のインビボパ ンニングの後に定量された。肝臓に帰巣したファージは、第2回のインビボパン ニング後に脳に比べてより多く回収され、第1回のインビボパンニング後に肝臓 から回収されたファージの集団は、肝臓に選択的に帰巣するファージとともに富 化された。これらの結果は、肝臓のような器官のRES成分がブロックされ得るこ とを実証し、従ってインビボパンニング法の使用により、選択的にこのような器 官に帰巣する分子を同定することが可能である。 肝臓で観察されたように、高量のファージ局在が肺においてまた観察された。 しかし、肺によるファージの取り込みは、非特異的なものではなく、例えば、肺 においてRES成分を構成する肺胞の食細胞による取り込みに起因する。特に、フ ァージの回収は、ファージライブラリーが単独で注入されたかまたは非感染ファ ージと同時投与されたかどうかにかかわらず、本質的に同じであった(実施例II .E.を参照のこと)。従って、肺において観察されたファージの高取り込み(Pas qualiniおよびRuoslahti、前出、1996)は、肺における大量の脈管形成に起因す るようである。 選択的な帰巣は、コントロールの器官または組織に比べて、選択された器官ま たは組織に対する器官帰巣分子の特異性を決定することにより実証され得る。例 えば、最大9:1の脳:腎臓帰巣の比率が、脳帰巣ペプチドについて観察された (すなわち、選択された器官にコントロール器官に比べて9倍を超えて結合する ;実施例II.A.を参照のこと)。 選択的帰巣はまた、選択された器官に帰巣する分子が、1回のインビボパンニ ングにより同定されたように、続く回のインビボパンニングにおいて器官帰巣分 子について富化されることを示すことにより実証され得る。例えば、選択的に脳 に帰巣するペプチドを発現するファージは、インビボパンニングにより単離され 、次いでさらなる回のインビボパンニングに供された。実施例II.A.に実証され るように、第1回のスクリーニング後の脳から回収されたファージは、第2回の スクリーニング後には、腎臓に比べて脳への帰巣において8倍の富化を示し、第 3回のインビボパンニング後では13倍の富化を示した。選択的に脳に帰巣するペ プチドが部分(すなわち、赤血球細胞(RBC))に連結された場合、ペプチド/RBC 複合体は、選択的に脳に帰巣した(実施例II.D.)。 細胞レセプターおよび特定のレセプターを結合するリガンドの保存された性質 により、当業者は、例えば、マウスにおけるインビボパンニングを用いて同定さ れた器官帰巣分子はまた、ヒトまたは他の種の選択された器官または組織におい て対応する標的分子に結合することを認識する。例えば、ヒト被験体における細 胞により発現されるインテグリンに特異的に結合し得るRG0含有ペプチドはまた 、種々の種において発現されているインテグリンを結合し得る。インテグリンは 、哺乳動物の細胞(例えば、マウスおよびウシ細胞)において、ならびにより進 化的に離れた種(例えば、ドロソフィア)の細胞において発現されるインテグリ ンを含む。マウスのような実験動物において、インビボパンニングを使用して同 定された器官帰巣分子の能力は、例えば、その分子はまたヒト被験体から得られ た選択された器官または組織のサンプルに、インビトロで特異的に結合し得るこ とを実証することにより、ヒト被験体において対応する器官または組織に結合す る能力について容易に試験され得る。従って、日常的な方法は、実験動物におい てインビボパンニングを用いて同定された器官帰巣分子がまた、ヒト被験体にお いて器官特異的な標的分子を結合し得ることを確認するために用いられ得る。さ らに、選択された器官または組織を含む疑いのあるサンプルと器官帰巣分子との このようなインビトロでの接触は、サンプルにおける選択された器官または組織 の存在を同定し得る。 さらに、腫瘍帰巣分子に関して、当業者は、例えば、黒色腫のような規定され た組織学的型のマウス腫瘍を有するマウスにおいてインビボパンニングを用いて 同定された腫瘍帰巣分子はまた、ヒトまたは他の哺乳動物種における黒色腫にお ける対応する標的分子に結合し得ることを認識する。さらに、マウスにおいて増 殖された腫瘍中の脈管形成に存在する標的分子を結合する腫瘍帰巣分子はまた、 ヒトまたは他の哺乳動物被験体における腫瘍の脈管形成における対応する標的分 子に結合し得る。実験動物においてインビボパンニングを使用して同定された腫 瘍帰巣分子は、例えば、その分子はまた、インビトロで患者から得られた腫瘍の サンプルに特異的に結合し得ることを実証することにより、ヒト患者の対応する 腫瘍に結合する能力について容易に試験され得る。従って、日常的方法は、実験 動物において、インビボパンニングを用いて同定された腫瘍帰巣分子がまた、ヒ ト腫瘍の標的分子を結合し得ることを確認するために使用され得る。 被験体にライブラリーを投与する工程、選択された器官または組織を採集する 工程、そして選択された器官または組織に帰巣する分子を同定する工程は、単回 のインビボパンニングを包含する。必要ではないが、1またはそれ以上のさらな る回数のインビボパンニングを一般に行う。さらなる回数のインビボパンニング を行う場合、以前の回において選択された器官または組織から回収された分子は 、被験体に投与される。被験体は以前の回において使用された同じ被験体であり 得、ここでは選択された器官または組織の一部のみを採集した。 第2回のインビボパンニングを行うことによって、最初の回から回収した分子 の相対的な結合選択性が、同定した分子を被験体に投与する工程、選択された器 官または組織を採集する工程、そして最初の回のパンニングに比べて器官または 組織からより多くのファージが回収されるかどうかを決定する工程により決定さ れ得る。さらに、所望であれば、コントロールの器官または組織が採集され得、 選択された器官から回収された分子とコントロールの器官から回収された分子と を比較するための基準として用いられ得る。さらなる回のインビボパンニングは また、最初に選択された器官または組織から同定された分子はまた、さらなる器 官または組織に帰巣し得るかどうかを示し得、従って選択された器官または組織 のファミリーを規定する。さらなる回のパンニングは、所望されるように行われ 得る。 理想的には、分子は、第2回の、またはその後の回のインビボパンニング後に コントロール器官または組織からは回収されない。しかし、一般的には、ある割 合の分子はまた、コントロールの器官または組織に存在する。この場合、コント ロール器官に比べて選択された器官における分子の比率(選択された器官:コン トロール器官)が、決定され得る。上記のように、例えば、第1回のインビボパ ンニング後に脳に帰巣するファージは、さらなる2回のパンニング後に、コント ロール器官である腎臓に比べて選択された器官への帰巣においては13倍富化され たことを実証した(実施例II)。 さらなる回のインビボパンニングは、特定の分子が選択された器官または組織 にのみに帰巣するかどうか、または特定の分子が1つまたはそれ以上の他の器官 または組織においてまた発現する選択された器官上に標的を認識し得るかどうか 、または特定の分子が元来選択された器官または組織における標的に十分に類似 するかどうかを決定するために使用され得る。分子が元来選択された器官以外の 器官または組織への帰巣を指向することが見出される場合、この器官または組織 は、選択された器官または組織のファミリーを構成すると考えられる。インビボ パンニング法を用いることにより、単一の選択された器官または組織にのみ帰巣 する分子および選択された器官または組織のファミリーに帰巣する分子が決定さ れ得る。このような同定は、続く回のインビボパンニングの間、種々の器官また は組織を採集することにより促進される。 本明細書中で用いられる用語「選択された器官または組織」は、最も広い意味 において、分子が選択的に帰巣する器官または組織を意味するために使用される 。さらに、用語「器官または組織」は、器官、組織、または細胞型を意味するた めに広く使用され、選択された器官または組織が一次腫瘍または転移病巣のよう な腫瘍であり得る場合において、ガン細胞を包含する。一般に、選択された器官 または組織は、器官帰巣分子が結合し得る細胞表面レセプターのような特定の標 的分子を発現する細胞を含む。少なくとも2回のインビボパンニングを行うこと により、選択された器官または組織への分子の帰巣の選択性が決定され得る(実 施例IIを参照のこと)。しかし、上記で考案したように、いくつかの場合では器 官帰巣分子が1つより多くの器官または組織に選択的に帰巣し得る。このような 場合、分子は選択された器官または組織のファミリーに選択的に帰巣し得ると考 えられる。 用語「コントロールの器官または組織」は、選択された器官以外の器官または 組織を意味する。コントロールの器官または組織は、コントロールの器官または 組織に帰巣する器官帰巣分子の無能力(inability)により特徴付けられる。コン トロールの器官または組織は、分子の非特異的結合を同定するために有用である 。コントロールの器官または組織を採集して、例えば、分子の非特異的結合を同 定し得るが、または分子の帰巣選択性を決定し得る(実施例IおよびIIを参照の こと)。さらに、非特異的な結合は、例えば、ある器官または組織に帰巣しない ことが知られているが、潜在的な器官帰巣分子に化学的に類似するコントロール 分子を投与することによって同定され得る。あるいは、投与される分子が支持体 に連結される場合、支持体単独での投与が、非特異的結合を同定するために用い られ得る。例えば、遺伝子IIIタンパク質を単独で発現するが、ペプチド融合タ ンパク質を含まないファージは、ファージ支持体の非特異的結合のレベルを決定 するために、インビボパンニングによってスクリーニングされ得る。 いくつかの場合、コントロールの器官または組織を同定するために、数回のイ ンビボパンニングを行い得る。なぜなら元来の選択された器官に選択的に帰巣す る分子はまた、さらなる器官または組織に選択的に帰巣する能力を有し得るから である。従って、選択された器官または組織のファミリーを決定する。選択され た器官または組織の1つまたはファミリーに帰巣する分子の能力は、器官帰巣分 子のパネルの調製を可能にし、個々の分子は1つの選択された器官または組織、 または任意の選択された器官または組織のファミリーに変化しやすい選択性で様 々に帰巣する。 さらに、特定の型の腫瘍に選択的に帰巣する分子がまた、腫瘍が由来する正常 な組織に選択的に帰巣する分子かどうかを決定することは有用であり得る。例え ば、乳腫瘍に帰巣する分子がまた、正常な乳組織にも帰巣するかどうかを決定す ることは望ましくあり得る。従って、腫瘍帰巣分子を同定するためにインビボパ ンニングを使用する場合は、腫瘍に対応する正常組織サンプルは、分子の帰巣が 、腫瘍細胞または腫瘍に存在する血管組織によってのみ発現される標的分子に対 して選択的であるかどうか、または腫瘍が由来する器官または組織において正常 に発現される標的分子に対して選択的であるかどうかを決定するために試験され 得る。 一般に、分子のライブラリー(無作為のまたは選択的に無作為化された目的の 分子の異なる集団を含む)が調製され、次いで被験体に投与される。投与後の選 択された時間に、被験体を屠殺し、そして選択された器官または組織あるいはそ の器官または組織の一部が採集されて、選択された器官または組織に存在する分 子が同定され得る。例えば、マウスをファージペプチドディスプレイライブラリ ーで注入し、次いで約1〜4分後、マウスを麻酔し、ファージの循環を終結させ るために液体窒素中で凍結し、選択された器官(脳または腎臓;実施例IおよびI Iを参照のこと)または組織(乳腫瘍または黒色腫;実施例IIIを参照のこと)を 採集し、選択された器官に存在するファージを回収し、そして選択された器官ま たは組織に選択的に帰巣したペプチドを同定した。 提供する実施例において、動物は、選択された器官または組織を採集するため に屠殺された。しかし、その器官に帰巣する分子を回収するために、選択された 器官の一部のみが採集されるのに必要であることが認識されるべきである。例え ば、選択された器官または組織の一部は、バイオプシーによって採集され得、フ ァージにより発現されたペプチドのような分子は、所望のように、同じ被験体に 2回またはそれ以上投与され得る。同じ被験体に2回投与される分子が、例えば 、支持体またはタグに連結される場合、この支持体またはタグは、その後の回の スクリーニングを妨害しないように、非毒性でなくてはならず、または生分解性 であるべきである。 インビトロのファージライブラリースクリーニングは以前に、抗体または細胞 表面レセプターに結合するペプチドを同定するために使用されている(Smithおよ びscott.前出、1993)。例えば、ファージペプチドディスプレイライブラリーの インビトロのスクリーニングは、インテグリン接着レセプター(Koivunenら、J. Cell Biol. 124:373-380(1994a)、これは本明細書中に参照として援用される) およびヒトウロキナーゼレセプター(Goodsonら、Proc.Natl.Acad.Sci.,USA 91:7 129-7133(1994))に特異的に結合する新規のペプチドを同定するために使用され ている。しかし、このようなインビトロの研究は、インビトロで選択されたレセ プターに特異的に結合し得るペプチドはまた、インビボでレセプターに結合する かどうか、または結合ペプチドまたはレセプターが身体の特定の器官に独特 であるかどうかということについては何の洞察も提供しない。さらに、インビト ロ法は、人工系において決定され、十分に特徴づけられた標的分子を用いて行わ れる。例えば、Goodsonらは組換えウロキナーゼレセプターを発現する細胞を利 用した。従って、インビトロ法は、標的分子の先の知識を必要とし、そしてイン ビボの有用性に関する情報はたとえあったにせよほとんど生じない。対照的に、 本明細書に開示したインビボパンニング法は先の知識または標的分子の利用性を 必要とせず、そして、それゆえ、インビボで選択的に帰巣する分子および器官ま たは組織内に存在する標的分子を同定することにより、以前の方法よりも有意な 利点を提供する。 インビボパンニングの開示された方法が作用されるメカニズムは完全に決定さ れていないが、一つの可能性は、ファージ上で発現するペプチドのような分子は 、選択された器官における血管に並ぶ内皮細胞上に存在する標的分子を認識して 結合することである。この証拠は、例えば、種々の器官における管組織はお互い 異なっており、そしてこのような差異は体内を通行する細胞の調節することに関 与し得ることを示す。例えば、リンパ球はリンパ節または他のリンパ組織に帰巣 し、一部分は、これらの組織における内皮細胞による特異的「アドレス」分子の 発現に起因する(Salmiら、Proc.Natl.Acad.Sci.,USA 89:11436-11440(1992))。 同様に、種々の白血球は、炎症の部位を認識し得、一部分は、炎症シグナルによ り誘導される内皮細胞マーカーの発現に起因する(ButcherおよびPicker.Scienc e 272:60-66(1996);Springer,Cell 76:301-314(1994)を参照のこと)。さらに、 腎臓糸球体に存在する内皮細胞は、心房のナトリウム尿排泄増加性ペプチドの結 合タンパク質(LewickiおよびProtter、「高血圧、病態生理学、診断、および処 置」第2版(Raven Press 1995),第61章を参照のこと)を含む。従って、内皮細 胞マーカーは、例えば、被験体における特定器官に薬物を指向させるために、潜 在的な標的を提供する。 いくつかの場合において、特定の器官に対するガン細胞の転移はまた、器官特 異的マーカー(器官特異的内皮細胞マーカーを含む)の腫瘍細胞による認識に起 因し得る(FidlerおよびHart,Science 217:998-1003(1982))。多くのガンの転移 パターンは、循環する腫瘍細胞が遭遇する第1の脈管床において優先的にトラッ プされることを仮定することによって説明され得る。従って、肺および肝臓は、 ガン転移の最も頻繁な部位である。しかし、いくつかのガンは、循環経路により 説明されない転移パターンを示す。このようなガンの転移は、ガンが転移する器 官において発現される内皮細胞表面分子のような選択的に発現されるアドレス分 子の存在に代わりに起因し得る(Goetzら、Intl.J.Canc. 65:192-199(1996);Zhu ら、Proc.Natl.Acad.Sci.,USA 88:9568-9572(1991);Pauliら、Canc.Metast.Rev. 9:175-189(1990);Nicolson、Biochim.Biophys.Acta 948:175-224(1988)を参照 のこと)。このような器官特異的内皮細胞マーカーに結合する分子の同定は、腫 瘍細胞が特定の器官に転移することを妨げる手段を提供し得る。 脳、腎臓、および二つの異なった実験的腫瘍は、これらの選択された器官また は組織に選択的に帰巣するペプチドを発現するファージを同定するための標的器 官または組織として選択された。なぜならこれらの器官内における血管が独特の 特徴を有するからである。例えば、脳内の血管は「血液脳関門」を形成し、そし て少なくとも一つの特異的な抗原を発現する(SchlosshauerおよびHerzog、J.Cel l Biol. 110:1261-1274(1990))。さらに、腫瘍内の脈管形成は一般に活性な血管 形成をうけ、増殖する腫瘍を支持するために新しい血管の連続的形成が生じる。 このような血管系の血管は、その血管系の脈管形成が、内皮細胞表面マーカー( αVβ3インテグリン(Brooks,Cell 79:1157-1164(1994)を含む)、および血管系 の増殖因子のレセプター(MustonenおよびAlitalo、J.Cell Biol. 129:895-898(1 995);Lappi,Semin.Canc.Biol.6:279-288(1995))が単独で発現することにおいて 、成熟脈管形成と区別できる。さらに、腫瘍脈管形成は、一般に腫瘍の脈管形成 は有窓であるという点で組織学的に血管と区別できる(Folkman、Nat.Med. 1:27- 31(1995);Rakら、Anticancer Drugs 6:3-18(1995))。従って腫瘍脈管形成の独特 の特徴は、腫瘍脈管形成を腫瘍に特異的に帰巣する分子がインビボパンニングに よって同定され得るかどうかを決定することに対して特に魅力のある標的にする 。このような腫瘍帰巣分子は、腫瘍に対する化学療法薬のような因子を指向する が、一方この因子は正常で健康な器官または組織に対して毒性の影響を有する見 込みを減少させるために有用であり得る。さらに、腫瘍脈管形成に選択的に帰巣 する分子はまた、炎症性組織、再生または創傷組織に存在するような他の型 の新生血管系を標的化することにおいてまた用いられ得る。 インビボパンニングを用いて、脳に、腎臓に、乳腫瘍に、または黒色腫に選択 的に帰巣する種々のペプチドを発現するファージが同定された(表1〜4を参照 のこと)。大きなサイズのファージ(300nm)および短時間でのファージの循環に 起因して、実質的に多くのファージが循環系、特に脳および腎臓において存在し なかったようである。従って、同定された器官帰巣分子は、器官特異的な様式で 発現されている内皮細胞表面マーカー(例えば、Springer、Cell 76:301-314(19 94)を参照のこと)に帰巣し、そしてこれを主に結合した。これらの結果は、イ ンビボパンニングは内皮細胞特異性を同定し、分析するために使用され得ること を示す。 脳帰巣ペプチドCLSSRLDAC(配列番号3)を示すファージの投与後の脳の免疫 組織化学的染色で、脳の毛細血管内での染色が示された。脳の任意の特定の領域 へのファージの帰巣についての明白な優先は観察されなかった(Pasqualiniおよ びRuoslahti、前出、1995)。同様に、腎臓帰巣ペプチドCLPVASC(配列番号21) を発現するファージは、腎臓毛細血管、特に糸球体と細管との間に局在した。こ のような分析は、培養中の内皮細胞を用いては可能ではない。なぜなら、培養細 胞はこれらの組織特異的な差異を失う傾向があるからである(PauliおよびLee、L ab.Invest. 58:379-387(1988))。 インビボパンニングが行われた条件で、一般に内皮細胞マーカーに結合する器 官帰巣ペプチドを同定するが、腫瘍帰巣ペプチドを発現するファージの特異的な 結合もまた、腫瘍実質において観察された。このことは、器官または組織内の特 異的な細胞上で発現される標的分子がまた同定され得ることを示す(実施例III を参照のこと)。これらの結果は、ペプチドを発現しているファージは、腫瘍内 の血管を通過し得るか、または血管から漏出し得ることを示し、これはおそらく 血管の有窓性質に起因する。肝臓のような、種々の正常な器官はまた、例えば、 ある実質細胞にペプチドを発現しているファージが特定の柔組織細胞に接触する ことを可能にする脈管形成を含む。従って、インビボパンニングは、器官内の特 定の細胞または特定の組織型に、ならびに内皮細胞に帰巣する分子を同定するた めに有用であり得る。 ファージペプチドディスプレイライブラリーは、本質的にSmithおよびscott( 前出、1993;Koivunenら、Biotechnology 13:265-270(1995)も参照のこと。これ は、本明細書中に参考として援用される)に記載されているように構築された。 実質的にランダムなアミノ酸配列を有するペプチドをコードするオリゴヌクレオ チドは、「NNK」コドンに基づいて合成された。ここで、「N」は、A、T、C またはGであり、そして「K」は、GまたはTである。「NNK」は、20個のアミ ノ酸およびアンバー停止コドンをコードする32個のトリプレットをコードする(S cottおよびSmith、前出、1990)。システインをコードする少なくとも一つのコド ンはまた、環状ペプチドがジスルフィド結合によって形成され得るように、各オ リゴヌクレオチドに含まれた(実施例Iを参照のこと)。オリゴヌクレオチドは 、ペプチド-gIII融合タンパク質が発現され得るように、ベクターfuse 5内に遺 伝子IIIタンパク質(gIII)をコードする配列とともにインフレームで挿入された 。発現に続いて、融合タンパク質は、ベクターを含むファージの表面上で発現さ れる(SmithおよびScott、前出、1993;Koivunenら、Meth.Enzymol. 245:346-369 (1994b)、これは、本明細書中に参考として援用される)。 注目すべきことに、インビボパンニング後、脳、腎臓、または腫瘍に選択的に 帰巣したファージは、ほんの少しの異なるペプチド配列を呈示した(表1〜4な らびに実施例IIおよびIIIを参照のこと)。いくつかの場合において、同じアミ ノ酸配列を有するペプチドは、このペプチドをコードする異なるオリゴヌクレオ チド配列を有するファージによってコードされた。さらに、脳帰巣ペプチドのフ ァミリーが同定された。ここで、このファミリーにおけるそれぞれのペプチドは 、共通のアミノ酸モチーフであるSRL(セリン-アルギニン-ロイシン)を含んでい たが、異なるフランキングアミノ酸配列を含んでいた(表1;配列番号1、3、お よび5を参照のこと)。さらに二つの異なるペプチドが、モチーフVLR(バリン-ロ イシン-アルギニン;表1、配列番号4および16を参照のこと)を示した。これら の結果は、選択された器官または組織への帰巣を指向するのは、ファージの何ら かの偶発的な変異体特性よりもむしろ、ファージによって呈示されるペプチドで あることを実証する。 脳、腎臓、または腫瘍に帰巣するモチーフの配列は、内皮細胞レセプターの公 知のリガンドに対していかなる有意な類似性も示さないだけではなく、種々のデ ータバンクに列記されるどの配列とも似ていない。しかし、脳帰巣モチーフのい くつかは、インテグリン結合配列と類似性を共有する。例えば、一つの脳帰巣ペ プチドは、RLD配列を含有し、RLD配列は、特定のインテグリンによって認識され (Altieriら,J.Biol.Chem.265:12119-12122(1990);Koivunenら,前出,1994a)、そ して別のペプチドにおけるDXXR(配列番号44)モチーフは、特定のインテグリン と結合する、RGD、DGR、およびNGRモチーフと似ている(Ruoslahti,J.Clin.Inves t .87:1-5(1991);Koivunenら、前出,1994a)。 インビボパンニングはまた、腫瘍に選択的に帰巣する分子を同定するために使 われた。乳腫瘍を有するマウスはファージライブラリーを注射され、そして乳腫 瘍に帰巣したファージは回収され、14個のファージのペプチドが決定された(実 施例III.Aを参照のこと)。14個のファージは、14個のファージのうち6個で発現 されたペプチドCGRECPRLCQSSC(配列番号48)を含む4つの異なるペプチドを発 現した。 腫瘍に帰巣する分子を同定するためのインビボパンニング法の一般的な適用は 、同系黒色腫を有するマウスに様々なペプチド集団を発現するファージを注射す ることにより調べられた(実施例III.B.を参照のこと)。B16マウス黒色腫モデル は、これらの研究のために選択された。なぜなら形成する腫瘍は、高度に血管化 されるためであり、そしてこの腫瘍系統の生物学は、完全に特徴づけられていた からである(Minerら,Cancer Res. 42:4631-4638(1982)を参照のこと)。さらに、 B16黒色腫細胞はマウス起源であるため、宿主と腫瘍細胞ドナーとの間での種の 相異は影響しない(例えば、正常な器官と比較して腫瘍へのファージの分布)。 脳(コントロール器官)と比較して腫瘍に帰巣する約3倍富化されたファージ が得られた。特に、二つのペプチド、WGTGLC(配列番号52)およびCLSGSLSC(配 列番号55)は、腫瘍から回収されたファージで発現され、そして配列決定された ペプチドの75%より多くを表した(実施例III.B.を参照のこと)。抗ファージ抗 体を使用する、腫瘍および他の器官の免疫組織化学的染色は、CLSGSLSC(配列番 号50)を発現するファージは、黒色肺において強い染色を生じたが、しかし皮膚 または腎臓(コントロール器官)において本質的に染色を生じないことを実証し た。染色パターンは、一般的に黒色腫内の血管に沿っていたが、しかし、厳密に 血管に限定されたわけではなかった。これらの結果は、腫瘍帰巣分子は、インビ ボパンニングによって同定され得、そしておそらく循環系からのファージの容易 な退出を可能にする血管の有窓性のため、このような分子は、腫瘍ならびに腫瘍 実質における脈管組織に帰巣し得ることを示す。 「RE」および「NGR」のような潜在的なインテグリン結合モチーフを含有する 脳帰巣ペプチドおよび乳腫瘍帰巣ペプチドの同定は、インビボパンニングが、イ ンテグリン結合ペプチドを同定するために有用であり得ることを示す(Koivunen ら、前出、1995を参照のこと)。例えば、αVβ3インテグリンは、脈管形成を受 ける血管において発現されるが、静止期の内皮細胞においては発現されない。αv β3インテグリンに対するペプチドまたは抗体アンタゴニストの結合は、おそら く細胞外マトリックスに対するαVβ3インテグリンの結合の結果として、増殖内 皮細胞に伝達されるシグナルを中断することにより、脈管形成管のアポトーシス を誘導する(Brooksら、前出、1994)。 αVβ3インテグリンは、脈管形成血管系における内皮細胞によって発現される ので、実験は、脈管形成を受ける腫瘍の血管系が、本明細書中で開示されるよう な方法を使用してインビボで標的化され得るかどうか決定するために行われた。 αVβ3インテグリンと結合することが知られているペプチド、CDCRGDCFC(配列番 号57;「RGDファージ」;Koivunenら、前出、1995を参照のこと)を発現するファ ージは、ヒト乳ガン細胞、ヒト黒色腫細胞、またはマウス黒色腫細胞から形成さ れた腫瘍を有するマウスに注射された(実施例IVを参照のこと)。RGDファージ は、それぞれの腫瘍に選択的に帰巣するが、一方このような帰巣は、コントロー ルファージでは起こらなかった。例えば、ヒト乳ガン細胞の移植によって形成さ れた腫瘍を有するマウスにおいて、選択されないコントロールファージと比較し て、20〜80倍多い数のRGDファージが腫瘍内に蓄積した。 ファージについての組織染色は、腫瘍内の血管におけるRGDファージの蓄積を 示したが、一方脳または腎臓(コントロール器官)において、染色は観察されな かった。RGDファージの腫瘍帰巣の特異性は、競合実験によって実証された。競 合実験において、RGD含有ペプチドの同時注入は、RGDファージの腫瘍帰巣を著し く低下させたが、一方非RGD含有コントロールペプチドの同時注入は、RGDファー ジの帰巣には効果がなかった(実施例IVを参照のこと)。これらの結果は、αv β3標的分子は、腫瘍における内皮細胞の管腔表面上で発現され、そしてαv含有 インテグリンと結合するペプチドは、このインテグリンと選択的に結合し得、従 って脈管形成を受ける血管系と選択的に結合し得るということを実証する。これ らの結果を考慮して、当業者は、RGDペプチドまたはαVインテグリンと結合する 抗体(例えば、モノクローナル抗体LM609、これは、αvβ3インテグリンと結合 する(Brooksら、前出、1994を参照のこと))は、脈管形成血管系を含有する腫 瘍を包含する、脈管形成血管系を含有する器官または組織を標的化するために使 用され得ることを認識する。 特定の腫瘍に帰巣する分子の同じまたは類似の組織学的タイプの別の腫瘍に選 択的に帰巣する能力は、例えば、これらの実験のためにヌードマウスで増殖させ たヒト腫瘍または同系マウスで増殖させたマウス腫瘍を使用して決定され得る。 例えば、MDA-MB-435乳ガン(Priceら、Cancer Res. 50:717-721(1990))、SKBR-1- 11およびSKBR-3(Foghら、J.Natl.Cancer Inst. 59:221-226(1975))を包含する種 々のヒト乳ガン細胞株、ならびにEMT6(Rosenら、Intl.J.Cancer 57:706-714(199 4)およびC3-L5(LalaおよびParhar,Intl.J.Cancer 54:677-684(1993))を包含する マウス乳ガン株は容易に入手でき、そしてヒト乳ガンのためのモデルとして一般 に使用される。このような乳腫瘍モデルを使用して、例えば、様々な乳腫瘍につ いて同定された乳腫瘍帰巣分子の特異性に関する情報が得られ得、そして広い範 囲の様々な乳腫瘍に帰巣するか、または最も有利な特異性プロフィールを提供す る分子が同定され得る。さらに、このような分析は、新しい情報を、例えば、腫 瘍支質について、得られ得る。なぜなら、内皮細胞の遺伝子発現のような支質細 胞の遺伝子発現は、インビトロで再現され得ない方法で腫瘍によって改変され得 るからである。 選択された器官または組織に対する分子(例えば、ペプチドまたはタンパク質 )の選択的帰巣は、特定の細胞標的分子(例えば、器官または組織において細胞 上に存在する細胞表面レセプター)のペプチドによる特異的認識に起因し得る。 帰巣の選択性は、分子が一つのみまたは少しの器官または組織に帰巣するように 、 一つのみまたは少しの異なる細胞型で発現される特定の標的分子に依存する。上 記で議論したように、同定された脳、腎臓、および少なくとも一部は腫瘍に帰巣 するペプチドは、これらの器官または組織に存在する血管における内皮細胞表面 マーカーを認識するようである。しかし、ほとんどの異なる細胞型、特に器官ま たは組織に独特である細胞型は、独特の標的分子を発現し得る。従って、血液が 器官に特異的な細胞によって形成された洞様毛細血管を通って循環する、肝臓、 脾臓またはリンパ節のような器官において、インビボパンニングは、特定の器官 に帰巣する分子を同定するために有用であり得る。 器官帰巣分子(例えば、表1〜4に例示されるペプチド)は、部分(moiety) を分子に結合させることにより、選択された器官または組織に対して部分を指向 させるために使用され得る。本明細書中において用いられる用語「部分(moiety) 」は、器官帰巣分子に結合される、物理的、化学的、または生物学的な物質を意 味するように広く使われる。例えば、部分は、薬物のような因子であり得、また は因子を含有し得る室のあるマイクロデバイス(chambered microdevice)であ り得る。さらに、部分は、タンパク質または核酸のような分子であり得、器官帰 巣分子は、タンパク質または核酸を選択された器官または組織に指向させる目的 のために部分と合体される。例えば、ペプチドの器官帰巣分子は、ペプチドがタ ンパク質を選択された器官に指向させるような所望のタンパク質を有する融合タ ンパク質として発現され得る。 部分は、放射性標識のような検出可能な標識であり得、あるいは毒素(例えば 、リシン)または薬物(例えば、化学療法剤)を含む細胞傷害性因子であり得、 あるいは物理的、化学的、または生物学的な物質(例えば、リポソーム、マイク ロカプセル、マイクロポンプ、または他の室のあるマイクロデバイス、これらは 、例えば、薬物送達系として使用され得る)であり得る。一般的に、このような マイクロデバイスは、非毒性で、そして所望であれば生分解性であるべきである 。因子を含有し得る種々の部分(マイクロカプセルを包含する)、および部分ま たは室のあるマイクロデバイスを本発明の分子と結合させるための方法は、当該 分野で周知であり、そして商業的に利用可能である(例えば、「Remington's Ph armaceutical Sciences」第18版、(Mack Publishing Co.1990)、第89〜91章;H a rlowおよびLane、Antibodies:A Laboratory manual(Cold Spring Harbor Labora tory Press 1988)を参照のこと、これらのそれぞれは本明細書中に参考として援 用される;Hermanson、前出、1996もまた参照のこと)。 選択された器官または組織に部分の帰巣を指向させる目的のために、器官帰巣 分子への部分の結合は、RBCへの脳帰巣ペプチドの結合によって例示される。こ こで、このペプチドは、脳へのRBCの帰巣を指向した(実施例II.D.を参照のこと )。これらの結果は、本発明の器官帰巣分子は、他の細胞型あるいは物理的、化 学的、または生物学的な送達系(例えば、選択された器官または組織にその細胞 型または送達系を指向させるために、薬物のような因子を含有し得るリポソーム または他のカプセル化デバイス)と結合され得ることを示す。例えば、インビボ パンニングによって同定される腫瘍帰巣分子は、白血球(WBC)(例えば、細胞 傷害性T細胞またはキラー細胞)と結合され得、ここで、腫瘍帰巣分子/WBC複合 体の投与に際し、この分子は、WBCの腫瘍への帰巣を指向し、そこでWBCは、その エフェクター機能を働かせ得る。同様に、器官帰巣分子は、リポソームあるいは 、例えば、透過性または半透過性の膜を含有するマイクロカプセルと結合され得 る。ここで、選択された器官または組織に送達されるべき因子(例えば、薬物) は、リポソームまたはマイクロカプセル内に含有される。 一つの実施態様において、器官帰巣分子は、インビボ診断画像化研究を行うた めに、被験体の外部で検出され得る部分と結合される。例えば、検出可能に標識 された脳帰巣ペプチドを使用するインビボ画像化は、循環が閉塞される脳内の領 域を同定し得る。このような研究のために、γ線放出放射性核種(例えば、イン ジウム-111またはテクネチウム-99)が脳帰巣分子と結合され得、そして被験体 への投与の後、固体シンチレーション検出器を使用して検出され得る。あるいは 、陽電子放出放射性核種(例えば、炭素-11)または常磁性スピン標識(例えば 、炭素-13)は、この分子と結合され得、そして被験体への投与後に、部分/分子 の局在が、それぞれ陽電子放射断層撮影法または核磁気共鳴画像法を使用して検 出され得る。 このようなインビボ画像法はまた、腫瘍細胞によって、または腫瘍内の脈管形 成により形成される血管によって発現される独特の標的を認識し得る腫瘍帰巣分 子に適切な部分を結合させることによって、被験体内のガンの存在を同定するた めに使用され得る。このような方法は、他の方法を使用して検出されないかもし れない初期性腫瘍ならびに転移性病巣を同定し得る。このようなガンの存在が同 定されれば、本発明の別の実施態様において、腫瘍帰巣分子は、腫瘍に対して部 分を指向させるために細胞傷害性因子(例えば、リシンまたはガン化学療法剤) と結合され得るか、または例えば、化学療法薬または他の細胞傷害性因子を含有 し得る室のあるマイクロデバイスと結合され得る。このような方法は、腫瘍の選 択的殺傷を可能にするが、一方実質的に正常な組織は助命する。 被験体に投与される場合、分子/部分複合体は、例えば、複合体および薬学的 に受容可能なキャリアを含有する薬学的組成物として投与される。薬学的に受容 可能なキャリアは、当該分野で周知であり、そして例えば、水溶液(例えば、水 または生理学的緩衝化食塩水)あるいは他の溶媒またはビヒクル(例えば、グリ コール、グリセロール、オリーブ油のような油または注入可能な有機エステル) を包含する。 薬学的に受容可能なキャリアは、例えば、複合体の吸収を安定化または増加さ せるように作用する生理学的に受容可能な化合物を含有し得る。このような生理 学的に受容可能な化合物は、例えば、グルコース、スクロースまたはデキストラ ンのような炭水化物、アスコルビン酸またはグルタチオンのような抗酸化剤、キ レート剤、低分子量タンパク質、あるいは他の安定剤または賦形剤を包含する。 当業者は、生理学的に受容可能な化合物を含む薬学的に受容可能なキャリアの選 択が、例えば、その組成物の投与経路に依存することを知っている。薬学的組成 物はまた、ガン治療剤のような因子を含有し得る。 当業者は、器官帰巣分子を含有する薬学的組成物は、例えば、経口または非経 口(例えば、静脈内)を包含する種々の経路によって、被験体に投与され得るこ とを知っている。この組成物は、注射または挿管によって投与され得る。薬学的 組成物はまた、例えば化学療法剤のような薬物をそれらの中に取り込み得る、リ ポソームまたは他のポリマーマトリックスに結合された器官帰巣分子であり得る (Gregoriadis,Liposome Technology,第1巻(CRC Press,Boca Raton,FL 1984)、 これは、本明細書中に参考として援用される)。例えば、リン脂質または他の脂 質からなるリポソームは、非毒性で、生理学的に受容可能で、かつ代謝可能なキ ャリアであり、作製および投与が比較的簡略である。 本明細書において開示された診断方法または治療方法のために、分子/部分複 合体の有効量が被験体に投与されなければならない。本明細書中で用いられる用 語「有効量」は、所望の効果を生じる複合体の量を意味する。有効量は、しばし ば器官帰巣分子と結合される部分に依存する。従って、治療目的のために投与さ れる薬物/分子複合体の量と比較して、より少ない量の放射性標識分子が、画像 化に必要とされ得る。特定の目的のための特定の分子/部分の有効量は、当業者 に周知の方法を使用して決定され得る。 器官帰巣分子の投与経路は、部分的に、分子の化学構造に依存する。例えばペ プチドは、経口投与される場合、それらが消化管内で分解され得るために、特に 有用というわけではない。しかし、内在性プロテアーゼによる分解を受けにくく するか、または消化管を通してより吸収され易くするために、ペプチドを化学的 に修飾するための方法は、周知である(例えば、Blondelleら、前出、1995;Ecker およびCrooke、前出、1995;GoodmanおよびRo、前出、1995を参照のこと)。この ような方法は、インビボパンニングによって同定されるペプチドについて実施さ れ得る。さらに、ペプチドアナログ(例えば、D-アミノ酸を含有するペプチド ;ペプチドの構造を模倣する有機分子からなるペプチド模倣物;またはビニル性 (vinylogous)ペプトイドのようなペプトイド)のライブラリーを調製するため の方法は、当該分野で公知であり、そして選択された器官または組織に帰巣し、 かつ経口投与に安定な分子を同定するために使用され得る。 本明細書中で開示される方法を使用して得られる器官帰巣分子はまた、器官帰 巣分子によって認識される標的分子(例えば、細胞表面レセプターまたはレセプ ターに対するリガンド)の存在を同定するために、または標的分子を実質的に単 離するために有用であり得る。例えば、器官帰巣ペプチドは、固体支持体(例え ば、クロマトグラフィーマトリックス)に結合され得る。次いで、結合されたペ プチドは、特定の標的分子を結合するために、選択された器官または組織の適切 に処理されたサンプルをカラムに通過させることによるアフィニティークロマト グラフィーに使用され得る。次いで、器官帰巣分子と複合体を形成する標的分子 が、カラムから溶出され得、そして実質的に単離された形態で採集され得る。実 質的に単離された標的分子は、周知の方法を使用して特徴づけられ得る。器官帰 巣分子はまた、検出可能な部分(例えば、放射性核種、蛍光分子、酵素、または ビオチン)に結合され得、そして例えば、標的分子の存在を検出するためにサン プルをスクリーニングするために、または種々の単離工程の間に標的分子を追跡 するために使用され得る。 本発明の方法は、選択された器官または組織へ選択的に帰巣するペプチドを同 定するために使用された。従って、本発明はまた、脳帰巣ペプチド(例えば、CN SRLHLRC(配列番号1)、CENWWGDVC(配列番号2)、WRCVLREGPAGGCAWFNRHRL( 配列番号16)、および表1に示されるような他のペプチド);腎臓帰巣ペプチド (例えば、CLPVASC(配列番号21)、CGAREMC(配列番号22)、および表2に示さ れるような他のペプチド);腫瘍帰巣ペプチド(例えば、乳腫瘍帰巣ペプチドCGR ECPRLCQSSC(配列番号48)および表3に示されるような他のペプチド);ならび に黒色腫帰巣ペプチド(WGTGLC(配列番号52)、CLSGSLSC(配列番号55)および 表4に示されるような他のペプチド)を包含する、器官帰巣ペプチドを提供する 。 システイン残基が、ペプチドの環状化がもたらされ得るようにペプチド内に含 有されたことは認識されるべきである。実際に、少なくとも2つのシステイン残 基を含有するペプチドは、自発的に環状化する。しかし、このような環状ペプチ ドはまた、線状形態で存在する場合、活性であり得る(例えば、Koivunenら、J. Biol.Chem. 268:20205-20210(1993)を参照のこと)。従って、いくつかの場合に おいて、ペプチド内の1つまたは両方のシステイン残基は、本発明のペプチドの 器官帰巣活性に著しく影響することなく、欠失され得る。例えば、配列LSSRLDA (配列番号19;配列番号3と比較のこと)を有するペプチドはまた、脳帰巣ペプ チドであり得る。同様に、WRCVLREGPAGGCAWFNRHRL(配列番号16)のようなペプ チドにおける、最初および最後のシステイン残基に対するそれぞれN末端および C末端のアミノ酸残基は、実質的にこのペプチドの脳帰巣活性を変えることなく 分配され得る。従って、配列VLREGPAGG(配列番号20)を有するペプチドはまた 、脳帰巣ペプチドとして有用であり得る。本発明のペプチドの器官帰巣活性につ い て、システイン残基またはシステイン残基に対してN末端およびC末端のアミノ 酸残基の必要性を決定する方法は、日常的であり、そして当該分野で周知である 。 器官帰巣ペプチドは、例えば、上記で議論したように所望の部分を選択された 器官または組織に対して標的化するために有用である。さらに、器官帰巣ペプチ ドは、サンプルにおける標的分子の存在を同定するために使用され得る。本明細 書内で用いられる用語「サンプル」は、身体から単離される細胞、組織、器官ま たはそれらの一部を意味するその最も広い意味で使用される。例えば、サンプル は、生検によって得られる組織切片または標本あるいは組織培養に置かれるか、 または適応させられた細胞であり得る。所望であれば、サンプルは、例えばホモ ジナイゼーションによって処理され得、それは器官帰巣分子が結合する標的分子 を単離するための最初の工程であり得る。 器官帰巣ペプチド(例えば、脳帰巣ペプチド)は、脳において発現される標的 分子を同定するために使用され得る。例えば、脳帰巣ペプチドは、ペプチドアフ ィニティーマトリックスを生成するために、マトリックス(例えば、クロマトグ ラフィーマトリックス)に付着され得る。ホモジナイズされた脳のサンプルは、 脳帰巣ペプチドの標的分子に対する特異的な結合を可能にする条件下で、ペプチ ド-アフィニティーマトリックスにアプライされ得る(例えば、Deutshcer,Meth. Enzymol. ,Guide to Protein Purification(Academic Press,Inc.,M.P.Deutscher 編,1990),第182巻を参照のこと;これは、本明細書中に参考として援用される; 例えば、357〜379頁を参照のこと)。結合しない物質および非特異的に結合した 物質は取り除かれ得、そして特異的に結合した脳由来標的分子が、実質的に精製 得された形態で単離され得る。 開示されたインビボパンニング法は、腫瘍における異なる4種類の標的分子を 検出するために使用され得る。最初に、腫瘍血管系は活発な脈管形成を受けるの で、一般的には脈管形成血管系または特に脈管形成腫瘍血管系に特徴的である標 的分子が同定され得る。2番目に、腫瘍起源の組織に特徴的である脈管標的分子 が同定され得る。3番目に、特定のタイプの腫瘍の血管系において発現される標 的分子が同定され得る。4番目に、腫瘍支質または腫瘍細胞標的分子は、腫瘍血 管系の有窓性によって同定され得る。これは、潜在的な器官帰巣分子を循環から 離れさせ、そして腫瘍実質を接触させることを可能にする。 器官または組織サンプルを使用する代わりのものとして、培養された内皮細胞 の抽出物は、サンプル内のレセプター濃度を増加させるために出発物質として使 用され得る。例えば、BEND細胞のような脳由来内皮細胞株(Montesanoら、Cell 62:435-445(1990)、これは、本明細書中に参考として援用される)は、脳帰巣ペ プチドの特定のレセプターの発現について調べられ得る(1995年10月9日に提出さ れたPCT/FR95/01313も参照のこと、これは、本明細書中に参考として援用される )。レセプターの存在は、ファージ結合および細胞接着アッセイ(例えば、Barry ら、Nat.Med. 2:299-305(1996)を参照のこと、これは、本明細書中に参考として 援用される)を使用することにより確立され得る。 特定のレセプターを発現する細胞株が同定され得、そしてこの細胞の表面のヨ ウ素化は、レセプターを標識するために使用され得る。次いで、細胞はオクチル グルコシドで抽出され得、そして抽出物はマトリックス(例えば、SepharoseTM )に結合された脳帰巣ペプチド(表1を参照のこと)を使用してアフィニティー クロマトグラフィーによって分画され得る。HUVEC細胞(ヒト臍静脈内皮細胞) から調製される抽出物は、脳由来内皮細胞のコントロールとして使用され得る。 精製されたレセプターは微小配列決定され得、そして抗体が調製され得る。所望 であれば、オリゴヌクレオチドプローブが調製され得、そしてレセプターをコー ドするcDNAクローンを単離するために使用され得る。あるいは、抗レセプター抗 体は、発現ライブラリーからcDNAクローンを単離するために使用し得る(Argrav esら、J.Cell Biol. 105:1183-1190(1987)を参照のこと、これは、本明細書中に 参考として援用される)。 レセプターを単離する代わりのものとして、レセプターをコードする核酸は、 哺乳動物細胞発現クローニング系(例えば、COS細胞系)を使用して単離され得 る。適切なライブラリーは、例えば、初代脳内皮細胞由来のmRNAを使用して調製 され得る(Latheyら、Virology 176:266-273(1990)、これは、本明細書中に参考 として援用される)。核酸は、例えば、pcDNAIベクター(Invitrogen)内にクロ ーン化され得る。レセプターのcDNAを発現する細胞は、脳帰巣ペプチドに結合す ることによって選択され得る。精製されたファージは、ペプチドのキャリアとし て使用され得、そして例えば抗M13抗体(Pharmacia)でコートされた磁気ビーズ に付着され得る。ペプチドコーティングに結合する細胞は、磁石を使用して回収 され得、そしてプラスミドが単離され得る。次いで、回収されたプラスミド調製 物は、プールに分けられ得、そしてCOS細胞トランスフェクションにおいて調べ られ得る。この手順は、脳帰巣ペプチドに結合する能力をCOS細胞に与え得る単 一のプラスミドが得られるまで繰返され得る。 以下の実施例は、本発明を例示することを意図するが、本発明を制限しない。 実施例I インビボパンニング 本実施例は、ファージライブラリーを調製する方法、およびインビボパンニン グを使用してライブラリーをスクリーニングすることにより選択された器官また は組織に帰巣するペプチドを発現するファージを同定する方法を示す。A.ファージライブラリーの調製 ファージディスプレーライブラリーを、Koivunenら(前出、1995;Koivunenら 、前出、1994bもまた参照のこと)によって記載されたようにfuse5ベクターを 使用して構築した。CX5C(配列番号36)、CX6C(配列番号37)、CX7C(配列番号 38)、CX9(配列番号39)、X2CX14CX2(配列番号40)およびX2CX18(配列番号41 )と称するペプチドをコードする6つのライブラリーを調製した。ここで、「C 」はシステインを示し、そして「XN」は、独立して選択されたアミノ酸の所定 の数を示す。これらのライブラリーは、少なくとも2つのシステイン残基がペプ チド内に存在する場合、環状ペプチドを呈示し得る。 オリゴヌクレオチドを、「C」がコドンTGTによってコードされ、そして「XN 」がNNKによってコードされるように構築した。ここで、「N」はA、C、G、 およびTの等モル混合物であり、そしてここで、「K」はGおよびTの等モル混 合物である。従って、CX5C(配列番号36)によって示されるペプチドは、配列TG T(NNK)5TGT(配列番号42)を有するオリゴヌクレオチドによって表され得る。オ リゴヌクレオチドを3サイクルのPCR増幅によって二本鎖にし、精製し、そしてf use5ベクター内の遺伝子IIIタンパク質をコードする核酸と連結し、発現の際に 、ペプチドが遺伝子IIIタンパク質のN末端に融合タンパク質として存在するよ うにした。 ベクターをエレクトロポレーションによってMC1061細胞内にトランスフェクト した。細菌を20μg/mlテトラサイクリンの存在下で24時間培養し、次いで、ファ ージをポリエチレングリコールを使用して2回の沈降によって上清から採集した 。各ライブラリーは、約5×109〜5×1014形質導入単位を含んだ(TU;個々の組 換えファージ)。B.ファージのインビボパンニング 1×1014TUを含むファージライブラリーの混合物を200μl DMEM中に希釈し、 そして麻酔をかけたBALB\cマウス(2月齢メス;Jackson Laboratories;Bar Harbor ME)の尾静脈に注入した;AvertinTM(0.015ml/g)を麻酔薬として使用 した(PasqualiniおよびRuoslahti、前出、1996を参照のこと)。1〜4分後、 マウスを液体窒素中で急速凍結した。ファージを回収するために、室温にて1時 間、死体を部分的に解凍し、器官を採集し、そして計量し、次いで1ml DMEM-PI (プロテアーゼインヒビター(PI);フェニルメチルスルホニルフルオリド(PMS F;1mM)、アプロチニン(20μg/ml)、ロイペプチン(1μg/ml)を含有するDMEM )内ですりつぶした。 器官サンプルを、1%ウシ血清アルブミン(BSA)を含有する氷冷DMEM-PIで3回 洗浄し、次いで、1ml K91-kan細菌と1時間、直接インキュベートした。0.2μg/ mlテトラサイクリンを含有する10ml NZY培地(NZY/tet)を細菌培養物に加え、そ の混合物を37℃のシェーカー中で1時間インキュベートし、次いで、200μlのア リコートを40μg/mlテトラサイクリンを含有する寒天プレート(tet/agar)中にプ レートした。 脳または腎臓から回収したファージを含む個々のコロニーを、5ml NZY/tetに おいて16時間増殖させた。個々のコロニーから得られた細菌培養物をプールし、 そしてファージを精製し、そして2回目のインビボパンニングのために上記のよ うにマウスに再度注入した。3回目のインビボパンニングもまた行った。ファー ジDNAを2回目および3回目のインビボパンニングから得られた個々の細菌コロ ニーから精製し、そして選択されたファージによって発現されたペプチドをコー ドするDNA配列を決定した(Koivunenら、前出、1994bを参照のこと)。 実施例II 選択された器官に帰巣するペプチドの特徴付け 本実施例は、本発明の器官帰巣ペプチドが、選択された器官へ選択的に帰巣す ること、およびインビボパンニングにより同定された器官帰巣ペプチドが、部分 を選択された器官に指向させるために用いられ得ることを実証する。 A.脳は、選択された器官である 3回のインビボパンニングを、マウスで行った。腎臓をコントロール器官とし て使用した。マウスには、異なる2つのファージライブラリー混合物を注入した 。第一の混合物は、CX9(配列番号39)、CX5C(配列番号36)、CX6C(配列番号3 7)、およびCX7C(配列番号38)ペプチドをコードするライブラリーを含む(CX5 -7 /CX9混合物;配列番号36-39)。第2の混合物は、X2CX14CX2(配列番号40)お よびX2CX18(配列番号41)ペプチドをコードするライブラリーを含む(X2CX18/X2 CX14CX2混合物;配列番号40および41)。 ファージライブラリー混合物を、マウスに尾静脈注射により投与した。ファー ジ投入は、CX5-7/CX9(配列番号36-39)混合物1×1016TU、またはX2CX18/X2CX1 4 CX2(配列番号40および41)混合物1×1014TUであった。ファージを、注入され たマウスの脳から回収し、この回収されたファージを、インビトロで増幅させ、 次いで2回目および3回目のインビボパンニングを行った。2回目および3回目 のパンニングでは、ファージを脳および腎臓から回収し、次いでそれぞれの器官 からのTUの数を比較した。この比較により、CX5-7/CX9(配列番号36-39)混合物 のファージは、2回目のパンニングでは、腎臓よりも脳に6倍多くのファージが 結合すること、そしてCX5-7/CX9(配列番号36-39)のファージは、3回目のパン ニングにおいては、腎臓よりも脳に13倍多くのファージが結合することが、明ら かと なった。X2CX18/X2CX14CX2(配列番号40および41)混合物の投与後、2回目およ び3回目のパンニングにおいて、脳に帰巣するファージが、腎臓に比べて、それ ぞれ11倍および8倍高かった。このように、脳に結合するファージのかなりの富 化が、2回目および3回目のインビボパンニング後に観察された。 2回目および3回目のインビボパンニングの間に脳から回収された、73個のク ローン化されたファージに存在する挿入片のアミノ酸配列を決定した。SRLモチ ーフを含むペプチドが優勢であり(配列決定されたクローンの36%;配列番号1 、3および5を参照のこと)、次いでVLRモチーフを含むペプチド(クローンの2 0.5%;配列番号4および16)、およびペプチドCENWWGDVC(配列番号2;クロー ンの19%;表1を参照のこと)が見られた。他のペプチドは、生じた頻度がさら に低かったが、一度より多く存在した。これらは、CGVRLGC(配列番号6)、CKD WGRIC(配列番号7)、CLDWGRIC(配列番号8)、およびCTRITESC(配列番号9 )を包含する。8つの別の配列は、それぞれ1度だけ現れたのみで、さらに特徴 付けは行われなかった。SRLトリペプチドモチーフは、いくつかの異なる配列背 景において存在した。これは、ペプチドをコードする核酸が、多数の独立のファ ージに由来することを示す。これらの結果は、SRLモチーフを含むペプチドの選 択が、いくつかの独立したファージ呈示ペプチドのSRL配列との特異的な結合を 表し、そして、例えばファージの増幅による人工物ではないことを示している。 さらにいくつかの場合では、異なるファージが、同じアミノ酸配列を有するペプ チドを発現したが、しかし、これらは、異なる配列を有するオリゴヌクレオチド によりコードされた。従って、特定のファージの器官への帰巣は、ファージ上で 発現される特異的ペプチドに起因することが確認された。 同定された個々のモチーフの脳への帰巣の特異性を決定するために、優勢なモ チーフを示したファージを個々に増幅し、同じ投入力価に希釈し、そしてマウス に投与した。投与後、脳および腎臓を摘出し、次いでそれぞれの器官におけるフ ァージのTU数を決定した。コントロール器官である腎臓と比較した選択された器 官である脳から回収されたファージの富化の比は、最もよく回収された4つのペ プチド(CNSRLHLRC(配列番号1)、CENWWGDVC(配列番号2)、WRCVLREGPAGGCAWFNR HRL(配列番号16)、CLSSRLDAC(配列番号3))の中の1つを示すファージが、それ ぞれ選択的に、腎臓と比較して脳を標的化することを明らかにした。詳細には、 選択的な帰巣の比(脳:腎臓)は、CNSRLHLRC(配列番号1)およびCLSSRLDAC(配 列番号3)については約8であり、CENWWGDVC(配列番号2)については約4であり 、そしてWRCVLREGPAGGCAWFNRHRL(配列番号16)については約9であった。 2つのコントロールファージは、脳および腎臓のどちらに対しても低い結合を 示した。これらの結果は、インビボパンニングが、選択された器官に帰巣するフ ァージ発現ペプチドを同定するために、ファージディスプレイライブラリーのス クリーンに用いられ得ることを実証する。 B.選択された器官としての腎臓 腎臓に帰巣するファージ発現ペプチドを単離するために、ファージ発現脳帰巣 ペプチドの単離に用いた方法と同じ方法を用いた。これらの実験では、脳をコン トロール器官として用いた。CX5C(配列番号36)およびCX6C(配列番号37)ライ ブラリーの混合物を、上記のように投与した。腎臓へのファージの帰巣が得られ 、そしてインビボでの2度目のパンニング後、腎臓に帰巣するファージは、約3 倍から7倍富化されたことが観察された。 腎臓に帰巣する48個のクローン化されたファージにおける挿入断片のアミノ酸 配列を、決定した。これらのファージにより発現されるペプチドは、2つの優勢 な配列(CLPVASC(配列番号21;配列決定されたクローンの46%)およびCGAREMC( 配列番号22;クローンの17%)、表2を参照のこと)により表された。さらに、 ペプチドCKGRSSAC(配列番号23)が3回現れ、そして別の3つのペプチドがそれぞ れ2回現れた。CLPVASC(配列番号21)、CGAREMC(配列番号22)、またはCKGRSSAC( 配列番号23)ペプチドをそれぞれ発現するファージは、それぞれ腎臓への選択的 な帰巣を示した;腎臓:脳への帰巣の選択性の比は、CLPVASC(配列番号21)につ いては7であり、CGAREMC(配列番号22)については3であり、そしてCKGRSSAC(配 列番号23)については2であった。 これらの結果は、インビボパンニング方法が、選択された器官に帰巣するファ ージ発現ペプチドを同定するための、ファージライブラリーのスクリーニングに 一般的に適用し得る方法であることを実証する。データベース検索では、脳に帰 巣するまたは腎臓に帰巣するペプチドと、内皮細胞レセプターに対する公知のリ ガンドとにおいて、いかなる有意な相同性も明らかにはされなかった。 C.ペプチドの帰巣は特異的である 選択された器官への帰巣を指向させるペプチドの特異性を確かめるために、ペ プチド競合実験を行った。環状ペプチドCLSSRLDAC(配列番号3)(脳帰巣ペプチ ドの1つ(表1を参照のこと))を合成し(Immunodynamics; La Jolla CA)、 次いでHPLCにより精製した。CLSSRLDAC(配列番号3)、CENWWGDVC(配列番号2)、 またはWRCVLREGPAGGCAWFNRHRL(配列番号16)を発現するファージの脳への帰巣に おける影響を、合成ペプチドの同時投与がファージの帰巣に影響するかどうかを 決定するために調べた。 CLSSRLDAC(配列番号3)、CENWWGDVC(配列番号2)、またはWRCVLREGPAGGCAWFNR HRL(配列番号16)を発現するファージを同じ濃度に滴定し、次いで1×108TUを単 独で、または100μgの精製した合成環状CLSSRLDAC(配列番号3)ペプチドと共に 、マウスに注入した。合成環状CLSSRLDAC(配列番号3)ペプチドは、CLSSRLDAC( 配列番号3)を発現するファージの帰巣を約60%阻害した。この結果は、脳への ファージの帰巣が、CLSSRLDAC(配列番号3)ペプチドのファージにおける発現に 特異的に起因することを実証する。 合成CLSSRLDAC(配列番号3)ペプチドはまた、WRCVLREGPAGGCAWFNRHRL(配列番 号16)ペプチドを発現するファージの帰巣を約60%阻害したが、しかしCENWWGDVC (配列番号2)ファージの帰巣には影響しなかった。この結果は、CLSSRLDAC(配列 番号3)およびRCVLREGPAGGCAWFNRHRL(配列番号16)ペプチドは、脳の中の同じ標 的分子を認識し得るが、CENWWGDVC(配列番号2)ペプチドは、異なる標的を認識 することを示す。 D.脳帰巣ペプチドCLSSRLDAC(配列番号3)は、赤血球を脳に指向させる 合成環状CLSSRLDAC(配列番号3)ペプチド(1mg)を、BoltonおよびHunter試 薬(Amersham; Arlington Helghts IL)を用いて、ヨウ素-125によって標識した 。標識されたペプチドを、Sep-PakTMカートリッジ(Waters,Millipore Corp.; Milford PA)上で逆相HPLCにより精製し、次いで125I-ペプチド(200μg)を製 造者の指示書に従って、グルタルアルデヒドで安定化したヒツジ赤血球(RBC) (Sigma Chemical Co.;St.Louis MO)1mlに結合させた。 50μlの125I-ペプチド/RBC(200,000cpm)を、単独で、あるいは10mMの未標 識CLSSRLDAC(配列番号3)(このペプチドは脳帰巣ペプチドである)と共に、ま たはCVRLNSLAC(配列番号43)(このペプチドは脳帰巣活性を有さない)と共に 、尾静脈に注入した。2分後、各マウスを50mlのDMEMで心臓灌流し、次いで脳お よび腎臓を摘出し、放射活性についてアッセイした。 CLSSRLDAC/RBC複合体(配列番号3)のほぼ2倍量が、腎臓よりも脳に帰巣し た。未標識CLSSRLDAC(配列番号3)と複合体との同時投与は、本質的に完全に複 合体の脳帰巣を阻害したが、しかし、腎臓に局在する複合体には影響しなかった 。これは、腎臓への複合体の局在が非特異的であることを示す。未標識CVRLNSLA C(配列番号43)の同時投与は、複合体の脳への選択的な帰巣に影響はなく、そ して腎臓における複合体の非特異的な局在にも影響を与えなかった。これらの結 果は、インビボパンニングにより同定された器官帰巣ペプチドが、血液細胞のよ うな部分と結合し得、そして結合された部分の帰巣を、選択された器官へ選択的 に指向させ得ることを実証する。 E.細網内皮組織系の構成要素を含む器官へ選択的に帰巣する分子についての インビボパンニング 本実施例は、肝臓および脾においてペプチドを呈示するファージの取り込みが RESにより上昇することは、非感染性のファージの同時投与によってブロックさ れ得、これにより、RESを含む器官へ選択的に帰巣する分子の同定が可能である ことを実証する。 CX9(配列番号39)ライブラリーを発現する約1×108TUの増幅されたファージを 、単独でまたは1000倍過剰量の増幅できない非感染性ファージと共に、マウスに 静脈注射した。2分後、マウスを屠殺し、肝臓、肺、腎臓、脳、および脾よりフ ァージを回収し、次いで回収された組織の1グラムあたりのファージ数(TU)(TU /g)を決定した。 非感染性ファージとライブラリーファージとの同時投与は、回収されるファー ジ量を、肝臓では約1300TU/gから約200TU/gに、脾では約300TU/gから約200TU/g に、実質的に減少させた。これと比較して、脳、腎臓、または肺から回収された ファージの数は、ファージライブラリーを単独で、または非感染性ファージと組 み合わせて投与した場合において、わずかな相違が観察されたか、もしくは相違 が全く観察されなかった。この結果は、RES構成要素を含む器官(例えば、肝臓 および脾臓)における非特異的なファージの取り込みは、ファージライブラリー と非感染性ファージとの同時投与によりブロックされ得ることを実証する。 これらの結果はまた、肺におけるファージの取り込みが選択的であることを実 証した。詳細には、肺からのファージの回収は、ファージライブラリーを単独で 注入したか、または非感染性ファージと同時投与したかに関わらず、本質的に同 一である。従って、肺において以前観察された(PasqualiniおよびRuoslahti, 前出,1996)ようなファージの高い取り込みは、おそらく、肺に存在する大量の 血管系に起因しており、肺のRES構成要素を構成する肺胞食細胞によるファージ の取り込みに起因するわけではないと考えられる。 非感染性ファージと同時投与した場合に肝臓に帰巣したファージが、実際に肝 臓に選択的に帰巣したことを実証するために、ファージライブラリーを、非感染 性ライブラリーと同時投与し、次いで、1回目のインビボパンニングの後に肝臓 から回収したファージを、インビトロで増幅し、そして2回目のインビボパンニ ングに用いた。ファージを、肝臓および脳(コントロール器官)から回収し、各 回のインビボパンニング後に定量した。 2回目のインビボパンニング後では、脳(200TU/g)と比較して、より多くの ファージが肝臓(350TU/g)に帰巣した。さらに、1回目のパンニング後では、 約150TUファージ/g肝臓が回収されたのに対し、2回目のパンニング後では、約3 50TUファージ/g肝臓が回収された。これは、1回目のインビボパンニング後に肝 臓から回収されるファージの集団は、肝臓に選択的に帰巣するファージで富化さ れていることを示す。これらの結果は、肝臓のような器官のRES構成要素がブロ ックされ得ること、従って、インビボパンニング方法を用いることにより、この ような器官に選択的に帰巣する分子を同定し得ることを実証する。 実施例III 選択された腫瘍組織に帰巣するペプチドの特徴付け 本実施例は、インビボパンニングが、乳腫瘍または黒色腫に帰巣するペプチド の同定に用いられ得ることを実証する。 A.ヌードマウスに移植されたヒト乳ガン腫瘍へ帰巣するペプチド ヒト435乳ガン細胞(Priceら、Cancer Res.50:717-721(1990))を、ヌードマ ウスの乳房脂肪パッドに接種した。腫瘍が直径約1cmに達した時に、ファージ標 的化実験(ここでは、特定のペプチドを発現するファージを、腫瘍を有するマウ スに投与した)、またはインビボパンニングのいずれかを行った。 乳腫瘍を有するマウスに、CX3CX3CX3C(配列番号47)ペプチドのライブラリーを 発現するファージを1×109個注入した。ここでX3は、独立に選択されたランダ ムなアミノ酸の3つの基を示す。ファージを4分間循環させ、次いで、マウスを 麻酔し、麻酔下で液体窒素中で急速凍結し、そして腫瘍を取り出した。ファージ を、腫瘍から単離し、さらに2回のインビボパンニングに供した。 3回目のパンニングの後、ファージを定量し、そして14個のクローン化された 異なるファージにより発現されるペプチドの配列を決定した。14個のクローン化 されたファージは、4つの異なるペプチドを発現した(表3)。これらの結果は 、インビボパンニング方法が、乳腫瘍組織に選択的に帰巣する分子を同定し得る ことを実証する。 B.マウスに移植されたB16マウス黒色腫細胞に帰巣するペプチド 腫瘍に選択的に帰巣するペプチドを同定するインビボパンニング方法の一般的 な適用性を、移植されたマウス黒色腫を有するマウスにおいてインビボパンニン グを行うことにより調べた。 黒色腫を有するマウスを、B16B15bマウス黒色腫細胞を移植することにより作 製した。これは、高度に血管化された腫瘍を生じる。B16B15bマウス黒色腫細胞 をヌードマウス(2カ月齢)の乳房脂肪パッド中に皮下注射し、腫瘍を直径が約 1cmになるまで成長させた。インビボパンニングを上記で開示したように行った 。CX5C(配列番号36)、CX6C(配列番号37)、またはCX5C(配列番号38)ライブラリー を発現する約1×1012形質導入ユニットのファージを静脈注射し、そして4分間 循環させた。次いで、マウスを麻酔下で液体窒素中で急速凍結し、腫瘍組織およ び脳(コントロール器官)を摘出し、そしてファージを上記のように単離した。 インビボパンニングを3回行った。 B16B15b腫瘍から回収された89個のクローン化されたファージの挿入断片のア ミノ酸配列を決定した。これらのファージにより発現されたペプチドは、2つの 優勢な配列(CLSGSLSC(配列番号55;配列決定されたクローンの52%)およびWGTG LC(配列番号52;クローンの25%);表4を参照のこと)により表された。選択さ れたペプチドの1つを発現するファージを再感染させた結果、脳と比較して腫瘍 に帰巣するファージは約3倍富化されていた。 マウスの器官における腫瘍帰巣ペプチドを発現するファージの局在を、腫瘍お よび他の様々な組織の免疫組織化学染色により調べた。1×109pfuの、コントロ ール(挿入断片なし)ファージ、または腫瘍帰巣ペプチドCLSGSLSC(配列番号50) を発現するファージを、腫瘍を有するマウスに静脈注射し、そして4分間循環さ せた。次いで、マウスをDMEMで灌流し、そして様々な組織(腫瘍を包含する)を 摘出し、Bouin's溶液中に固定した。組織切片を調製し、次いで抗M13(ファージ )抗体により染色した(PasqualiniおよびRuoslahti,前出,1996を参照のこと )。 CLSGSLSC(配列番号50)腫瘍帰巣ペプチドを発現するファージを注入したマウス から得られた黒色腫において、強い免疫染色が明らかであった。腫瘍実質におい てもいくらかの染色が存在したが、黒色腫の染色は、一般に、腫瘍内の血管系に 局在した。挿入断片を有さないコントロールファージを注入したマウスから得ら れた腫瘍、または皮膚、またはいずれかのファージを注入したマウスから得られ た腎臓サンプルにおいては、本質的には全く染色が観察されなかった。しかし、 肝臓の洞様毛細血管および脾臓において免疫染色が検出された。これは、RESを 含む器官において、ファージが非特異的に捕捉され得ることを示す。 これらの結果は、インビボパンニング方法が、選択された器官または組織(腫 瘍を包含する)に帰巣するファージ発現ペプチドを同定するために、ファージラ イブラリーをスクリーニングするための一般に適用可能な方法であることを実証 する。 実施例IV RGD ペプチドを発現するファージの腫瘍へのインビボ標的化 ヒト435乳ガン細胞を、ヌードマウスの乳房脂肪パッドに接種した。腫瘍の直 径が約1cmに達した時に、特異的RGD含有ペプチドを発現するファージを腫瘍を 有するマウスに投与した。以下に記載する結果は、ヒト黒色腫C8161細胞の移植 、またはマウスB16黒色腫細胞の移植により形成された腫瘍を有するヌードマウ スから得られた結果と、類似の結果であった。 RGD含有ペプチドCDCRGDCFC(配列番号57;Koivunenら、前出,1995を参照のこ と)を発現するファージ、またはコントロール(挿入断片なし)ファージを1×1 09個マウスに静脈注射し、4分間循環させた。次いで、このマウスを麻酔下で急 速凍結し、そして様々な器官(腫瘍、脳、および腎臓を包含する)を摘出し、そ の器官に存在するファージを定量した(PasqualiniおよびRuoslahti,前出,199 6を参照のこと)。 CDCRGDCFC(配列番号57)を発現する約2〜3倍多くのファージが、脳および腎 臓と比較して、乳腫瘍において検出された。これは、CDCRGDFC(配列番号57RGDフ ァージ)ペプチドが、ファージの乳ガン腫瘍への選択的な帰巣を生じたことを示 す。これと平行した研究において、様々な異なったペプチドを発現する選択され ていないファージを、腫瘍を有するマウスに注射し、次いで様々な器官を、ファ ージの存在について調べた。腫瘍と比較して、腎臓にははるかに大量のファージ が存在し、脳においては、腎臓よりは少ない程度でファージが存在した。従って 、選択されないファージより80倍多くのRGD発現ファージが、腫瘍において集中 した。これらの結果は、RGD含有ペプチドを発現するファージは、おそらく、腫 瘍において形成する血管におけるαvβ3インテグリンの発現に起因して、腫瘍に 帰巣することを示す。 乳腫瘍帰巣ペプチドの特異性が、競合実験により実証された。500μgの遊離ペ プチドACDCRGDCFCG(配列番号58)は、不活性なコントロールペプチドGRGESP(配列 番号59)との同時注入では本質的に影響を与えないのに対して、腫瘍帰巣ペプチ ドを発現するファージとの同時注入では腫瘍中のファージの量が約10倍減少した 。乳腫瘍に帰巣するファージの免疫組織学染色は、脳または腎臓(コントロール 器官)においては染色が観察されなかったが、腫瘍内の血管においてはRGDファ ージの蓄積を示した。これらの結果は、脈管形成血管系において発現されるイン テグリンと結合し得るペプチドを示すファージが、このような血管系を包含する 腫瘍のような器官または組織に、インビボで選択的に帰巣し得ることを実証する 。 本発明は開示された実施例に関して記載されているが、様々な改変が、本発明 の意図から逸脱することなくなされ得ることが理解されるべきである。したがっ て、本発明は、添付の請求の範囲によってのみ制限される。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI G01N 33/566 0276−2J G01N 33/566 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),AU,CA,JP (72)発明者 パスカリーニ, レナタ アメリカ合衆国 カリフォルニア 92075, ソロナ ビーチ,サウス シエラ アベ ニュー ナンバー29 707

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.選択された器官または組織に帰巣する分子を得るための方法であって、以下 の工程を包含する、方法: a.被験体に多様な分子のライブラリーを投与する工程; b.該選択された器官または組織のサンプルを採集する工程;および c.該選択された器官または組織に帰巣する分子を同定する工程。 2.前記多様な分子のそれぞれがタグに結合されている、請求項1に記載の方法 。 3.前記タグが支持体である、請求項2に記載の方法。 4.前記ライブラリーがファージディスプレイライブラリーである、請求項1に 記載の方法。 5.前記分子がペプチドである、請求項4に記載の方法。 6.前記ライブラリーが、核酸ライブラリーおよび化学的ライブラリーからなる 群より選択される、請求項1に記載の方法。 7.前記選択された器官または組織が、脳および腎臓からなる群より選択される 、請求項1に記載の方法。 8.前記選択された器官または組織が腫瘍である、請求項1に記載の方法。 9.脳に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドが以下のアミノ酸配列 を有する、ペプチド: X1SRX2(配列番号45)、 ここでX1およびX2はそれぞれ約1個から約10個の独立に選択されたアミノ酸 である。 10.前記ペプチドがアミノ酸配列CLSSRLDAC(配列番号3)を有する、請求項 9に記載のペプチド。 11.前記ペプチドが、CNSRLHLRC(配列番号1)およびCNSRLQLRC(配列番号5 )からなる群より選択されたアミノ酸配列を有する、請求項9に記載のペプチド 。 12.脳に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドが以下のアミノ酸配 列を有する、ペプチド: X3VLRX4(配列番号46)、 ここでX3は、存在しないかまたは約1から10個の独立に選択されたアミノ酸で あり、そしてX4は、約1個から約20個の独立に選択されたアミノ酸である。 13.前記ペプチドが、CVLRGGRC(配列番号4)およびWRCVLREGPAGGCAWFNRHRL (配列番号16)からなる群より選択されたアミノ酸配列を有する、請求項12に 記載のペプチド。 14.脳に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがCENWWGDVC(配列 番号2)およびCGVRLGC(配列番号6)からなる群より選択されたアミノ酸配列 を有する、ペプチド。 15.脳に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがCKDWGRIC(配列番 号7);CLDWGRIC(配列番号8);およびCTRITESC(配列番号9)からなる群より 選択されたアミノ酸配列を有する、ペプチド。 16.腎臓に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがCLPVASC(配列 番号21);CGAREMC(配列番号22);およびCKGRSSAC(配列番号23)からなる群よ り選択されたアミノ酸配列を有する、ペプチド。 17.腎臓に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがCWARAQGC(配列 番号24);CLGRSSVC(配列番号25);およびCTSPGGSC(配列番号26)からなる群よ り選択されたアミノ酸配列を有する、ペプチド。 18.乳ガンに選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがCGRECPRLCQSS C(配列番号48)、CGEACGGQCALPC(配列番号49)、およびCNGRCVSGCAGRC(配列番 号50)からなる群より選択されたアミノ酸配列を有する、ペプチド。 19.黒色腫に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがWGTGLC(配列 番号52)およびCLSGSLSC(配列番号55)からなる群より選択されたアミノ酸配列 を有する、ペプチド。 20.黒色腫に選択的に帰巣するペプチドであって、該ペプチドがCSVANSC(配列 番号53)、CSSTMRC(配列番号54)、およびCIEGVLGGC(配列番号56)からなる群よ り選択されたアミノ酸配列を有する、ペプチド。 21.選択された器官または組織に帰巣する分子であって、該分子が以下の工程 を包含するインビボパンニングによって同定される、分子: a.被験体に多様な分子のライブラリーを投与する工程; b.該選択された器官または組織のサンプルを採集する工程;および c.該選択された器官または組織に帰巣する分子を同定する工程。 22.前記選択された器官または組織が、脳、腎臓、腫瘍、および脈管形成の血 管系からなる群より選択される、請求項21に記載の分子。 23.前記腫瘍が、乳ガンおよび黒色腫からなる群から選択される、請求項22 に記載の分子。 24.部分を選択された器官または組織に指向させる方法であって、以下の工程 を包含する、方法: a.該部分を請求項21に記載の分子に結合させて、該部分および該分子を含 む複合体を形成させる工程;および b.該複合体と該選択された器官または組織とを接触させる工程であって、こ こで請求項21に記載の該分子が該選択された器官または組織に選択的に結合し 、これにより該部分を該選択された器官または組織に指向させる、工程。 25.前記接触工程がインビトロで行われる、請求項24に記載の方法。 26.前記接触工程がインビボで行われる、請求項24に記載の方法。 27.前記部分が検出可能な標識を含む、請求項24に記載の方法。 28.前記部分が細胞毒性因子を含む、請求項24に記載の方法。 29.前記部分が室のあるマイクロデバイスを含む、請求項24に記載の方法。 30.標的分子の存在を同定する方法であって、該標的分子は選択された器官ま たは組織に選択的に帰巣する分子に特異的に結合し、該方法は以下の工程を包含 する、方法: a.該標的分子を発現すると疑いのある器官または組織のサンプルを得る工程 ; b.該サンプルと請求項21に記載の分子とを、請求項21に記載の該分子と 該標的分子との特異的結合を可能にする条件下で接触させる工程;および c.請求項21に記載の該分子の特異的結合を検出する工程であって、該特異 的結合が該サンプル中の該標的分子の存在を同定する、工程。 31.標的分子を実質的に単離する方法であって、該標的分子は選択された器官 または組織に選択的に帰巣する分子に特異的に結合し、該方法は以下の工程を包 含する、方法: a.該選択された器官または組織のサンプルを得る工程であって、該器官また は組織が該標的分子を発現している、工程; b.該サンプルと請求項21に記載の分子とを、請求項21に記載の該分子と 該標的分子との特異的結合を可能にする条件下で接触させ、複合体を形成させる 工程;および c.該複合体から該標的分子を実質的に単離する工程。 32.請求項31に記載の方法により得られる、実質的に単離された標的分子。 33.脈管形成血管系を含有する器官または組織をインビボで標的化する方法で あって、該器官または組織とαV含有インテグリンに特異的に結合する分子とを 接触させる工程を包含する、方法。 34.前記器官または組織が腫瘍である、請求項33に記載の方法。 35.前記分子が、RGD含有ペプチド、およびαV含有インテグリンに特異的に結 合する抗体からなる群より選択される、請求項33に記載の方法。 36.前記αV含有インテグリンがαVβ3インテグリンである、請求項33に記 載の方法。 37.前記分子がCDCRGDCFC(配列番号57)である、請求項33に記載の方法。
JP51208797A 1995-09-11 1996-09-10 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法 Expired - Fee Related JP3900305B2 (ja)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US52670895A 1995-09-11 1995-09-11
US08/526,710 US5622699A (en) 1995-09-11 1995-09-11 Method of identifying molecules that home to a selected organ in vivo
US08/526,710 1995-09-11
US08/526,708 1995-09-11
PCT/US1996/014600 WO1997010507A1 (en) 1995-09-11 1996-09-10 Molecules that home to a selected organ or tissue in vivo and methods of identifying same

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2002245801A Division JP2003155296A (ja) 1995-09-11 2002-08-26 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JPH10502674A true JPH10502674A (ja) 1998-03-10
JP3900305B2 JP3900305B2 (ja) 2007-04-04

Family

ID=27062186

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP51208797A Expired - Fee Related JP3900305B2 (ja) 1995-09-11 1996-09-10 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法
JP2002245801A Pending JP2003155296A (ja) 1995-09-11 2002-08-26 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法
JP2007056453A Pending JP2007204483A (ja) 1995-09-11 2007-03-06 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法

Family Applications After (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2002245801A Pending JP2003155296A (ja) 1995-09-11 2002-08-26 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法
JP2007056453A Pending JP2007204483A (ja) 1995-09-11 2007-03-06 インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法

Country Status (8)

Country Link
EP (3) EP0876611A1 (ja)
JP (3) JP3900305B2 (ja)
AT (2) ATE382630T1 (ja)
AU (1) AU693723B2 (ja)
CA (1) CA2204535C (ja)
DE (3) DE69609585T2 (ja)
ES (1) ES2299232T3 (ja)
WO (1) WO1997010507A1 (ja)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002506079A (ja) * 1998-03-13 2002-02-26 ザ バーナム インスティチュート 種々の選択された器官または組織にホーミングする分子
JP2005530771A (ja) * 2002-05-08 2005-10-13 ユニバーシティ カレッジ ロンドン 生物学的活性物質の細胞への運搬に適した複合体
JP2019522966A (ja) * 2016-06-03 2019-08-22 サムソン ライフ パブリック ウェルフェア ファウンデーション 患者由来腫瘍スフェロイドを用いた抗体スクリーニング方法

Families Citing this family (42)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2265484C (en) * 1996-09-10 2008-12-02 The Burnham Institute Tumor homing molecules, conjugates derived therefrom, and methods of using same
US6576239B1 (en) 1996-09-10 2003-06-10 The Burnham Institute Angiogenic homing molecules and conjugates derived therefrom
US6361938B1 (en) * 1996-11-08 2002-03-26 Elan Corporation, Plc Peptides which enhance transport across tissues and methods of identifying and using the same
SE9700291D0 (sv) * 1997-01-31 1997-01-31 Pharmacia & Upjohn Ab Selection method and prodcts resulting therefrom
AU6682598A (en) * 1997-03-04 1998-09-22 Bio-Technology General Corporation Isolation of tissue specific peptide ligands and their use for targeting pharmaceuticals to organs
JP2001516055A (ja) * 1997-09-10 2001-09-25 ザ バーナム インスティチュート 腫瘍中の血管形成血管系にホーミングする分子を同定する方法
US6180084B1 (en) 1998-08-25 2001-01-30 The Burnham Institute NGR receptor and methods of identifying tumor homing molecules that home to angiogenic vasculature using same
US6174687B1 (en) 1999-02-26 2001-01-16 The Burnham Institute Methods of identifying lung homing molecules using membrane dipeptidase
JP2002510709A (ja) * 1998-04-08 2002-04-09 ジー・ディー・サール・アンド・カンパニー 二重Avb3及び転移関連受容体リガンド
US6852318B1 (en) 1998-05-08 2005-02-08 The Regents Of The University Of California Methods for detecting and inhibiting angiogenesis
DE19845251A1 (de) * 1998-09-07 2000-03-09 Univ Eberhard Karls Peptide für Pharmatargeting
EP1109897A1 (de) * 1998-09-07 2001-06-27 Eberhard-Karls-Universität Tübingen Universitätsklinikum Verfahren zur selektion von peptiden für zielgerichteten pharma- und markertransport und peptide damit entdeckt
US6528481B1 (en) 1999-02-16 2003-03-04 The Burnam Institute NG2/HM proteoglycan-binding peptides that home to angiogenic vasculature and related methods
US6303573B1 (en) 1999-06-07 2001-10-16 The Burnham Institute Heart homing peptides and methods of using same
US7413536B1 (en) 1999-09-14 2008-08-19 Xenoport, Inc. Substrates and screening methods for transport proteins
WO2001023619A1 (en) 1999-09-29 2001-04-05 Xenoport, Inc. Compounds displayed on replicable genetic packages and methods of using same
US7037706B1 (en) 1999-09-29 2006-05-02 Xenoport, Inc. Compounds displayed on replicable genetic packages and methods of using same
WO2001044300A2 (en) * 1999-12-13 2001-06-21 Cambridge Antibody Technology Limited Brain specific binding members
CA2405469C (en) 2000-04-12 2012-03-20 Amersham Health As Integrin binding peptide derivatives
US7420030B2 (en) 2000-09-08 2008-09-02 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Aminopeptidase A (APA) targeting peptides for the treatment of cancer
US7452964B2 (en) 2001-09-07 2008-11-18 Board Of Regents, The University Of Texas System Compositions and methods of use of targeting peptides against placenta and adipose tissues
US20040170955A1 (en) 2000-09-08 2004-09-02 Wadih Arap Human and mouse targeting peptides identified by phage display
EP2028187A1 (en) * 2000-09-08 2009-02-25 Board Of Regents, The University Of Texas System Human and mouse targeting peptides identified by phage display
NO20004795D0 (no) 2000-09-26 2000-09-26 Nycomed Imaging As Peptidbaserte forbindelser
EP1385984A4 (en) 2001-03-21 2007-06-13 Xenoport Inc COMPOUND PRESENTED ON AN ICOSAEDRIC PHAGE AND METHOD OF USE THEREOF
BRPI0210886B8 (pt) 2001-07-10 2021-05-25 Amersham Health As composto, composição farmacêutica, uso de um composto, e, métodos de geração de imagens, de monitoração do efeito do tratamento de um corpo humano ou animal com uma droga para combater uma condição associada com câncer e de tratamento de câncer ou de uma doença relacionada em um corpo humano ou animal
US20040241688A1 (en) * 2001-07-19 2004-12-02 Cuneyt Bukusoglu Human tissue specific drug screening procedure
EP1581790B1 (en) * 2001-11-08 2009-01-07 The Burnham Institute Peptides that home to tumor lymphatic vasculature and methods of using same
US7192921B2 (en) 2001-11-08 2007-03-20 The Burnham Institute Peptides that home to tumor lymphatic vasculature and methods of using same
US7544767B2 (en) 2002-04-05 2009-06-09 Burnham Institute For Medical Research HMGN2 peptides and related molecules that selectively home to tumor blood vessels and tumor cells
US7598341B2 (en) 2003-10-31 2009-10-06 Burnham Institue For Medical Research Molecules that selectively home to vasculature of premalignant or malignant lesions of the pancreas and other organs
CA2461223C (en) * 2004-03-16 2013-05-28 Stanley Phillips Apparatus for generating ozone and/or o1 using a high energy plasma discharge
ES2388068T3 (es) 2004-12-23 2012-10-08 Molmed Spa Producto de conjugación
NZ569818A (en) 2005-12-16 2012-07-27 Catherine M Shachaf Diagnostic system for the detection and diagnosis of skin cancer
FI121959B (fi) * 2008-05-09 2011-06-30 Pirjo Laakkonen Aivokasvaimiin hakeutuva peptidi
JP5522717B2 (ja) * 2008-09-19 2014-06-18 国立大学法人佐賀大学 アトピー性皮膚炎の検出方法および予防・治療剤のスクリーニング方法
US20110256055A1 (en) 2008-12-23 2011-10-20 Ge Healthcare Limited Application of 99mtc peptide-based compound as a bone marrow imaging agent
US11564991B2 (en) 2014-11-12 2023-01-31 University Of Mississippi Medical Center Molecular-size of elastin-like polypeptide delivery system for therapeutics modulates intrarenal deposition and bioavailability
EP3217947B1 (en) 2014-11-12 2022-03-09 University of Mississippi Medical Center Kidney-targeted drug delivery systems
EP3405209B1 (en) * 2016-01-19 2021-05-26 The University Of Western Australia Novel biomolecule conjugates and uses therefor
IT201800009362A1 (it) * 2018-10-11 2020-04-11 Gimac Di Maccagnan Giorgio Vite per estrusore e dispositivo estrusore
US11248038B2 (en) 2019-03-29 2022-02-15 University Of Mississippi Medical Center Molecular-size of elastin-like polypeptide delivery system for therapeutics modulates intrarenal deposition and bioavailability

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0135277B1 (en) * 1983-07-21 1986-10-29 Scripps Clinic And Research Foundation Synthetic polypeptides corresponding to portions of proteinoids translated from brain-specific mrnas, receptors, methods and diagnostics using the same
US5223409A (en) * 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
US5650489A (en) * 1990-07-02 1997-07-22 The Arizona Board Of Regents Random bio-oligomer library, a method of synthesis thereof, and a method of use thereof
JP3306063B2 (ja) * 1990-08-24 2002-07-24 イグジス, インコーポレイテッド ランダムコドンを有するオリゴヌクレオチドを合成する方法
US5264563A (en) * 1990-08-24 1993-11-23 Ixsys Inc. Process for synthesizing oligonucleotides with random codons
WO1992006191A1 (en) * 1990-09-28 1992-04-16 Protein Engineering Corporation Proteinaceous anti-dental plaque agents
IL106106A0 (en) * 1993-06-22 1993-10-20 Interpharm Lab Ltd Library of polymeric molecules and its preparation
US5981478A (en) * 1993-11-24 1999-11-09 La Jolla Cancer Research Foundation Integrin-binding peptides

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002506079A (ja) * 1998-03-13 2002-02-26 ザ バーナム インスティチュート 種々の選択された器官または組織にホーミングする分子
JP2005530771A (ja) * 2002-05-08 2005-10-13 ユニバーシティ カレッジ ロンドン 生物学的活性物質の細胞への運搬に適した複合体
JP2019522966A (ja) * 2016-06-03 2019-08-22 サムソン ライフ パブリック ウェルフェア ファウンデーション 患者由来腫瘍スフェロイドを用いた抗体スクリーニング方法
US11199536B2 (en) 2016-06-03 2021-12-14 Aimed Bio Inc. Method for screening antibody using patient-derived tumor spheroids

Also Published As

Publication number Publication date
CA2204535C (en) 2002-11-12
DE69637395T2 (de) 2008-12-18
CA2204535A1 (en) 1997-03-20
EP0773441B1 (en) 2000-08-02
DE69609585D1 (de) 2000-09-07
JP2007204483A (ja) 2007-08-16
DE69637395D1 (de) 2008-02-14
EP0987275A3 (en) 2006-06-21
DE773441T1 (de) 1999-03-04
JP3900305B2 (ja) 2007-04-04
DE69609585T2 (de) 2001-04-05
EP0987275B1 (en) 2008-01-02
AU6973996A (en) 1997-04-01
WO1997010507A1 (en) 1997-03-20
HK1027820A1 (en) 2001-01-23
JP2003155296A (ja) 2003-05-27
EP0773441A1 (en) 1997-05-14
ATE382630T1 (de) 2008-01-15
ATE195181T1 (de) 2000-08-15
ES2299232T3 (es) 2008-05-16
AU693723B2 (en) 1998-07-02
EP0876611A1 (en) 1998-11-11
EP0987275A2 (en) 2000-03-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JPH10502674A (ja) インビボにおいて選択された器官または組織に帰巣する分子および同分子を同定する方法
US6068829A (en) Method of identifying molecules that home to a selected organ in vivo
US5622699A (en) Method of identifying molecules that home to a selected organ in vivo
US6610651B1 (en) Molecules that home to various selected organs or tissues
US6576239B1 (en) Angiogenic homing molecules and conjugates derived therefrom
EP0927045B1 (en) Tumor homing molecules, conjugates derived therefrom, and methods of using same
US20030113320A1 (en) NGR receptor and methods of identifying tumor homing molecules that home to angiogenic vasculature using same
JP2001516055A (ja) 腫瘍中の血管形成血管系にホーミングする分子を同定する方法
US6743892B1 (en) Molecules that home to a selected organ in vivo
AU728668B2 (en) Molecules that home to a selected organ or tissue in vivo and methods of identifying same
HK1027820B (en) Molecules that home to a selected organ or tissue in vivo
HK1033466A1 (en) Molecules that home to various selected organs or tissues
HK1033466B (en) Molecules that home to various selected organs or tissues

Legal Events

Date Code Title Description
A912 Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912

Effective date: 20040219

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20061109

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20061220

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20100112

Year of fee payment: 3

RD02 Notification of acceptance of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R3D02

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110112

Year of fee payment: 4

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120112

Year of fee payment: 5

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120112

Year of fee payment: 5

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120112

Year of fee payment: 5

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees