JPH10506016A - アポリポ蛋白質(a)[APO(a)]を阻害することによる血漿リポ蛋白質(a)[Lp(a)]のレベルに関連する疾患または状態のリボザイム治療 - Google Patents

アポリポ蛋白質(a)[APO(a)]を阻害することによる血漿リポ蛋白質(a)[Lp(a)]のレベルに関連する疾患または状態のリボザイム治療

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JPH10506016A JP8511069A JP51106996A JPH10506016A JP H10506016 A JPH10506016 A JP H10506016A JP 8511069 A JP8511069 A JP 8511069A JP 51106996 A JP51106996 A JP 51106996A JP H10506016 A JPH10506016 A JP H10506016A
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Abstract

(57)【要約】 apo(a)mRNAを切断する酵素的RNA分子。リポ蛋白質Aのレベルに関連する状態、例えばアテローム性動脈硬化症、心筋梗塞、脳溢血、再狭窄および心臓疾患の処置における、これらの触媒的RNA分子の使用。

Description

【発明の詳細な説明】 アポリポ蛋白質(a)[APO(a)]を阻害することによる血漿リポ蛋白質 (a)[Lp(a)]のレベルに関連する疾患または状態のリボザイム治療発明の属する技術分野 本発明はアテローム性動脈硬化症、心筋梗塞、脳溢血および再狭窄等の、Lp (a)レベルに関連する疾患または状態の治療または診断のための、治療用組成 物および方法に関する。発明の背景 以下はLp(a)の生理学的役割の簡潔な説明である。本論議は完璧なもので はなく、以下の発明を理解するためにのみ提供されるものである。この要約は、 下記の研究のいずれも特許請求される発明に対する従来技術であることを認める ものではない。 低比重リポ蛋白質(LDL)は主としてコレステロール、リン脂質および単一 の疎水性蛋白質であるアポリポ蛋白質B(apoB)からなる。それらはヒト血 漿中、主なコレステロールのキャリアーであると考えられている(総説としてU terman,G.(1989) Science 246,904−910を 参照されたい)。Apo(B)はLDLの唯一の蛋白質サブユニットであり、細 胞表面上のLDL受容体を認識し、これに結合する。このLDL−LDL受容体 の相互作用は、LDLの内在化を生じ、そして結果としてコレステロールが細胞 内に放出される。 LDLの修飾された型は、リポ蛋白質(a)[Lp(a)]と称され、196 3年に発見された(Berg,K.(1963) Acta Pathol.M icrobiol.Scand. 59,369)。追加の糖蛋白質であるapo (a)のLDLへの共有結合は、Lp(a)をLDLから区別する。最近いくつ かの研究は、ヒト血漿中のLp(a)の高レベルが心臓疾患につながることを示 唆してきた(Gurakarら,(1985) Atherosclerosi 57,293−301; Lerenら,(1988) Atherosc lerosis 73,135−141;Utermann,前掲)。1000 倍以上のLp(a)レベル域および血漿Lp(a)レベルが上位4分の1である 個人は進行性アテローム性動脈硬化症を発症する2〜5倍高い可能性を有する。 アロテーム性動脈硬化症は、血管壁の硬化と弾力性の喪失を伴う疾患である。 ヒト血漿中のLp(a)の形態の高濃度のコレステロールは、アロテーム性動脈 硬化症の原因の最も重要な要因の1つである。動脈壁に関連するマクロファージ および平滑筋細胞内でのコレステロールの付着は、隣接する平滑筋細胞の増殖を 引き起こす斑点(じゅく状病変)を生じさせる。時が経つにつれて、それらの斑 点はサイズが大きくなり、動脈壁の硬化および弾力性の喪失を引き起こし、次に 動脈壁の決裂、血液凝固および血管内の血流の閉塞を引き起こす(詳しくはTe xtbook of medical physiology Guyton, A.C.,(Saunders Company,Philadelphia, 1991)pp.761−764を参照されたい)。 Lp(a)および/またはapo(a)レベルは、アテローム性動脈硬化症、 および心筋梗塞、脳溢血および再狭窄等のそれに続く徴候の危険性の増加とよく 相関している。apo(a)蛋白質はヒト、旧世界の霊長類およびハリネズミに 特有である;慣用的な実験動物にそれが欠損しているため、apo(a)レベル の生理学的な役割を探求することは困難であった。近年、apo(a)をコード するヒト遺伝子を発現するトランスジェニックマウスが構築された(Lawnら ,(1992) Nature 360,670−672)。トランスジェニッ クマウスは大動脈中の脂質に富む領域の発達に対して対照同腹仔よりも感受性が 高い。さらに、ヒトapo(a)発現は脂肪付着領域に局在する。すなわち、a po(a)の過剰発現は、実験動物に動脈硬化様病変を直接引き起こす。この所 見はヒトにおけるapo(a)の高レベルがアテローム性動脈硬化症の一因であ ることの仮説の信憑性を高くする。 アポリポ蛋白質(a)は300〜800 KDaの種々の大きさの巨大糖蛋白 質である。ヒト血漿中から34の異性体が確認されている。現在入手可能な唯一 のヒトcDNAクローンは、apo(a)をコードする14kbのメッセージを 包含する(McLeanら,(1987) Nature 330,132−1 37)。apo(a)のmRNAの3’末端部分に相当するベンガルザルのcD NAもまた、クローン化され配列決定された(Tomlinsonら,1989J.Biol.Chem. 264,5957−5965)。クローン化したcD NAの配列解析は、apo(a)の構造の2つのユニークな面を明らかに示した 。第1に、apo(a)cDNAは著しい反復構造である。再構築したapo( a)cDNAは、4529アミノ酸の蛋白質をコードする;残基の4210は、 それぞれが114アミノ酸の37回反復中に存在する。反復単位はそれ自身非常 に相同性である;24はヌクレオチド配列が同一であり、4つは3つのヌクレオ チドにおいてのみ異なる配列を共有しており、残りの反復は11〜71塩基のみ 異なる。 第2に、アポリポ蛋白質(a)はセリンプロテアーゼであるプラスミノーゲン と高い相同性を有する。プラスミノーゲンはクリングルと称される5つの反復相 同領域(それらはアミノ酸配列で約50%の相同性を有する)および続くトリプ シン様プロテアーゼ領域からなる。プラスミノーゲンのクリングルIVはapo( a)の37の反復と高い相同性を有する(蛋白質レベルで75−85%)。さら に、プラスミノーゲンの5’非翻訳領域、シグナルペプチド領域、クリングルV 、プロテアーゼ領域、および3’非翻訳領域は、apo(a)の配列とそれぞれ 98%、100%、91%、94%および87%の相同性を有する。プラスミノ ーゲンと比較して、apo(a)はクリングルI、IIおよびIIIを欠失しており 、上記に述べたように広範囲に重複したクリングルIVを有する。高い相同性にも かかわらず、apo(a)は組織型プラスミノーゲン活性化因子(tpA)によ ってプロテアーゼに転換されることができない。これは、apo(a)中では、 tPAによるプラスミノーゲン活性部位上で1つのアミノ酸が置換されているた めである(Utterman(前掲))。インビトロ実験は、apo(a)およ びLp(a)がプラスミノーゲン受容体およびフィブリンへの結合についてプラ スミノーゲンと競合することを示し、このことは、高いLp(a)レベルと心筋 梗塞との間の相関関係を支持する(Gonzalez−Gronowら,(19 89) Biochemistry 28,2374−2378;Hajjar ら,(1989) Narure 339,303−305;Milesら,( 1989) Nature 339,301−303)。最近のヒト(Moli te rnoら,1993 Circulation 88,935−940)および サル(Williamsら,1993 Atheroscler.Thromb 13,548−554)におけるインビボ実験は、凝固溶解の予防におけるL p(a)の役割を支持する。 apo(a)とプラスミノーゲンとの間の驚くべき相同性は、薬物開発にいく つかの障壁を与える。apo(a)の小分子阻害剤は、プラスミノーゲン機能に 負の影響を与えることなくapo(a)に選択的に結合しなければならないだろ う。同様に、アンチセンス方法は、2つの遺伝子間の総ヌクレオチド配列相同性 により制限されるであろう。現在の食餌および薬物療法(Gurakarら、前 掲;Lerenら、前掲)は、ニコチン酸を除いて、apo(a)レベルに対し てほとんどあるいは全く影響を及ぼさない。 出願人は、それらの同じ制限がリボザイム療法の好機であることをここに示す 。リボザイムの切断部位特異性は、プラスミノーゲンのmRNAには全く存在し ないが、apo(a)のmRNA上に存在するリボザイム標的部位を同定するこ とを可能にする。例えば、高度に保存されたapo(a)のクリングル上にプラ スミノーゲンのクリングルIVには存在しない13のハンマーヘッド切断部位が存 在する。同様に、apo(a)の最後のクリングル反復、プロテアーゼ領域およ び3’非翻訳領域は、プラスミノーゲン上には存在しないがapo(a)上に存 在する21のハンマーヘッドリボザイム切断部位を含む。すなわち、apo(a )mRNAを標的とするリボザイムは、アロテーム性動脈硬化症の高い危険性を 持つ者の治療および診断のための、独特な治療および診断道具である。発明の概要 本発明は、apo(a)をコードするmRNA種の切断を指示するリボザイム 、もしくは酵素的RNA分子に関する。特に、出願人は、このRNAを切断しう るリボザイムの選択および機能、およびここに議論される疾患を治療するために 、種々の組織中でapo(a)レベルを減少するためのそれらの使用を記述する 。 apo(a)mRNAを切断するリボザイムは、アロテーム性動脈硬化症の新 規な治療法を提示する。リボザイムは、それらの触媒特性およびその固有の二次 または三次構造のために、アンチセンス分子よりもすぐれた耐久性またはより低 い有効投与量を示すことができる。このようなリボザイムは、触媒活性および高 い部位特異性を有し(下に記述するように)、アンチセンスオリゴヌクレオチド よりも強力かつ安全な治療的分子である。 出願人は、それらのリボザイムがapo(a)の発現を阻害しうること、およ びリボザイムの触媒活性がその阻害効果のために必要であることを示す。当業者 は、記載された例からapo(a)をコードする標的mRNAを切断する他のリ ボザイムを容易に設計することができ、これらも本発明の範囲に含まれることが 明らかであることを理解するであろう。 現在天然に生ずる酵素的RNAの6つの基本的な変種が知られている。それぞ れは、生理学的条件下でRNAのホスホジエステル結合の加水分解をトランスに 触媒することができる(従って他のRNA分子を切断することができる)。表I はそれらのリボザイムの特徴のいくつかを要約したものである。一般的に、酵素 的核酸は、まず標的RNAに結合することにより作用する。この結合は、標的R NAを切断するよう作用する分子の酵素的部分に近接して保持された、酵素的核 酸の標的結合部分により行なわれる。すなわち、酵素的核酸はまず標的RNAを 認識し、次に相補的塩基対合により標的RNAに結合し、適正な部位にいったん 結合すると、酵素的に作用して標的RNAを切断する。このような標的RNAの 戦略的切断は、それがコードする蛋白質の合成を指令する能力を破壊するであろ う。酵素的核酸は、そのRNA標的に結合して切断させたのち、そのRNAから 離脱して他の標的を探し、新たな標的に反復的に結合して切断することができる 。 リボザイムの酵素的性質は他の手法、例えばアンチセンス法(この場合は核酸 分子が単に核酸標的に結合して、そのプロセシングおよび翻訳を阻止するだけで ある)より有利である。療法処置を行なうのに必要なリボザイムの濃度がアンチ センスオリゴヌクレオチドのものより低いからである。この利点は、リボザイム が酵素的に作用する能力を反映している。すなわち1個のリボザイム分子が多数 の標的RNA分子を切断することができる。さらにリボザイムは特異性の高い阻 害剤であり、その阻害の特異性は、標的RNAへの結合の塩基対合メカニズムの みならず、標的RNAの切断のメカニズムにも依存する。切断部位の近くにおけ る一つのミスマッチまたは塩基置換は、リボザイムの触媒活性を完全に除去する ことができる。アンチセンス分子中の同様のミスマッチはそれらの作用を妨害し ない(Woolf,T.M.ら,1992,Proc.Natl.Acad.S ci.USA 89,7305−7309)。従って、リボザイムの作用の特異 性は、同一のRNA部位に結合するアンチセンスオリゴヌクレオチドのものより 高い。 本発明の好ましい態様においては、酵素的核酸分子はハンマーヘッドまたはヘ アピンのモチーフで形成されるが、デルタ肝炎ウイルス、グループIイントロン 、またはRNaseP RNA(RNAガイド配列に関するもの)またはNeu rospora VS RNAのモチーフで形成されてもよい。このようなハン マーヘッドモチーフの例は、Rossiら,1992,Aids Resear ch and Human Retroviruses, 8,183により記載 され;ヘアピンモチーフの例はHampelら,“RNA Catalyst for Cleaving Specific RNA Sequences” 、1989年9月20日出願、1988年9月20日出願の米国特許出願第07 /247,100の一部継続出願、Hampel and Tritz,198 9Biochemistry,28,4929,およびHampelら、1990 Nucleic Acids Res. ,18,299により記載され;デルタ 肝炎ウイルスモチーフの例は、Perrotta and Been,1992 Biochemistry ,31,16により記載され、RNasePモチーフ の例は、Guerrier−Takedaら,1983 Cell,35,84 9により記載され;Neurospora VS RNAリボザイムのモチーフ の例は、Collins(Saville and Collins,1990 Cell ,61,685−696;Saville and Collins( 1991),Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88,8826 −8830;Collins and Olive,1993 Biochem istry ,32,2795−2799)により記載され;グループIイントロ ンの例はCechら、米国特許第4,987,071号に記載されている。これ らの具体的なモチーフは本発明を限定するものではなく、本発明の酵素的核酸分 子において重要なすべては、それが1または2以上の標的遺伝子RNA領域に対 し て相補的な特異的基質結合部位を有し、かつその基質結合部位内またはその周囲 にその分子にRNA切断活性を付与するヌクレオチド配列を有することであるこ とは、当業者には認識されるであろう。 本発明は、所望の標的のRNAに高い特異性を示す、一群の酵素的切断剤を製 造する手法を提供する。酵素的核酸分子は、好ましくは、1つまたはいくつかの 酵素的核酸を用いて疾患および状態の特異的な処置を提供しうるように、apo (a)をコードする標的mRNAの高度に保存された配列領域を標的とする。こ のような酵素的核酸分子は、要求されるように特定の細胞に対して外的に送達す ることができる。あるいは、リボザイムは特定の細胞に送達されるDNAベクタ ーから発現させることができる。 100ヌクレオチドを越える長さの核酸の合成は、自動化された方法を用いて は困難であり、そのような分子の療法経費は著しい。本発明においては、小型の 酵素的核酸モチーフ(例えばハンマーヘッドまたはヘアピン構造のもの)を外的 送達に用いる。これらの分子の構造が簡単であることは、酵素的核酸がmRNA 構造の標的領域内へ侵入する能力を高める。しかし、それらの触媒的RNA分子 は真核生物のプロモーターから細胞中で発現させることもできる(例えば、Sc anlon,K.J.ら,1991 Proc.Natl.Acad.Sci. USA ,88,10591−5;Kashani−Sabet,M.ら,199 2 Antisense Res.Dev.,2,3−15;Dropulic ,B.ら,1992 J.Virol.,66,1432−41;Weeras inghe,M.ら,1991 J.Virol.,65,5531−4;Oj wang,J.O.ら,1992 Proc.Natl.Acad.Sci.U SA ,89,10802−6;Chen,C.J.,ら,1992 Nucle ic Acids Res. ,20,4581−9;Sarver,H.,ら, 1990,Science,247,1222−1225)。当業者は適当なD NAベクターから任意のリボザイムを真核細胞中で発現しうることを理解する。 二次リボザイムによって一次転写産物からリボザイムを放出させることにより、 このようなリボザイムの活性を増大させることができる(Draperら、PC TWO93/23569,およびSullivanら、PCT WO94/02 5 95(これらの内容のすべてを本明細書の一部としてここに引用する);Ohk awa,J.ら、1992,Nucleic Acids Sym .Ser. ,27,15−6;Taira,K.ら,1991,Nucleic Acids Res. ,19,5125−30;Ventura,M.ら,1993,Nuc leic Acids Res. ,21,3249−55)。 すなわち、本発明の第1の観点においては、本発明は、apo(a)の産生を 阻害するリボザイムを特徴とする。これらの化学的または酵素的に合成したRN A分子は、それらの標的mRNAのアクセス可能な領域に結合する基質結合領域 を含む。RNA分子はまたRNAの切断を触媒する領域を含む。RNA分子は好 ましくはハンマーヘッドまたはヘアピンモチーフのリボザイムである。結合した 後、リボザイムはapo(a)をコードする標的mRNAを切断し、翻訳および 蛋白質の蓄積を妨げる。標的遺伝子が発現しないため、治療的効果を観察するこ とができる。 “阻害”とは、apo(a)をコードするmRNAの活性またはレベルが、リ ボザイムの不在下で観察されるものより、および好ましくはmRNA上の同一の 部位に結合しうるがそのRNAを切断できない不活性RNA分子の存在下で観察 されるレベルより減少することである。 このようなリボザイムは、上に述べたような疾患および状態、および細胞また は組織中のapo(a)活性のレベルに関連する他の疾患または状態の予防に有 用である。“関連する”とは、apo(a)mRNA転写の阻害、すなわちap o(a)のレベルの減少が、疾患または状態の症状をある程度軽減することを意 味する。 リボザイムは、直接加えるか、または陽イオン性の脂質と複合体を作るか、リ ポソーム内にパッケージングするか、または他の方法により標的細胞に送達する 。RNAまたはRNA複合体は、カテーテル、注入ポンプまたはステントを使用 することにより、バイオポリマー中に取り込むかまた取り込ませることなく、適 切な組織に局所的に投与することができる。好ましい態様においては、リボザイ ムは表II、IV、VI、およびVIIの配列に相補的な結合アームを有する。このよう なリボザイムの例は、表III、V、VIおよびVIIに示される。このようなリボザイ ムの例 は、本質的にこれらの表に定義される配列からなる。“本質的に・・・からなる ”とは、活性リボザイムがこの例のものと均等の酵素中心、および標的部位での 切断が生ずるようにmRNAに結合しうる結合アームを含むことを意味する。そ のような切断を妨害しない他の配列が存在していてもよい。 本発明の他の観点においては、標的分子を切断しapo(a)活性を阻害する リボザイムは、DNA、RNA、またはウイルスベクター中に挿入された転写ユ ニットから発現される。好ましくは、リボザイムを発現しうる組み換えベクター は、上記のように局所的に送達され、標的細胞中に一時的に存在する。いったん 発現されると、リボザイムは標的mRNAを切断する。組み換えベクターは、好 ましくはDNAプラスミドまたはアデノウイルスベクターである。しかし、RN A発現を指示する他の哺乳動物細胞ベクターをこの目的のために使用してもよい 。 本発明の他の特徴および利点は、以下の好ましい態様の記載および特許請求の 範囲から明らかであろう。好ましい態様の記載 まず、図面を簡単に説明する。図面 図1は、本技術分野において知られるハンマーヘッドリボザイム領域を図示し たものである。ステムIIは2塩基対以上の長さであるか、または塩基対のないル ープ領域でありうる。 図2aは、本技術分野において知られるハンマーヘッドリボザイム領域を図示 したものである;図2bはUhlenbeck(1987 Nature,32 7,596−600)によって基質および酵素部分に分割されたハンマーヘッド リボザイムを図示したものである;図2cはHaseloff and Ger lach(1988 Nature,334,585−591)によって2つの 部分に分割されたハンマーヘッドを示す同様な図である;そして、図2dはJe ffries and Symons(1989 Nucl.Acids.Re s. ,]7,1371−1371)によって2つの部分に分割されたハンマーヘ ッドを示す同様な図である。 図3は、本技術分野において知られるヘアピンリボザイム領域の一般的構造を 示したものである。HはA、UまたはCである。YはUまたはCである。NはA 、U、GまたはCである。N’はNの相補的配列である。ヘリックス4は2塩基 対以上の長さでありうる。 図4は、本技術分野において知られるデルタ肝炎ウイルスリボザイム領域の一 般的構造を図示したものである。 図5は、Neurospora VS RNA酵素モチーフの一般的構造を図 示したものである 図6は、RNase Hのアクセス可能性試験を図示したものである。特に、 図6の左側は、標的RNA上のアクセス可能な部位に結合した相補的DNAオリ ゴヌクレオチドの図である。相補的DNAオリゴヌクレオチドはA、B、および Cで標識した広い線で示す。標的RNAは細いねじれた線で示す。図5の右側は 切断されていない標的RNAを切断された標的RNAからゲル分離する模式図で ある。標的RNAの検出はボディラベルしたT7転写産物のオートラジオグラフ ィーによる。それぞれのレーンに共通のバンドは非切断標的RNAを表す;それ ぞれのレーンに特徴的なバンドは切断された生産物を表す。リボザイム 本発明のリボザイムは、apo(a)の発現をある程度妨害し、疾患の治療ま たはそのような疾患の診断に使用することができる。リボザイムは培養中の細胞 あるいはLp(a)の動物モデルの組織中に送達されるであろう。これらの系に おけるapo(a)mRNAのリボザイム切断は、疾患の症状または状態を予防 または軽減することができる。標的部位 有用なリボザイムの標的は、Draperら(前掲)、Sullivanら(前 掲)、ならびにDrapar,“Method and reagent fo r treatment of arthritic conditions” と題する米国特許出願(1993年11月12日出願、米国特許出願08/15 2,487号(この内容のすべてを本明細書の一部としてここに引用する)に開 示されるようにして決定することができる。これらの文書に記載された手引きを ここに繰り返さずに、このような方法の特定の例を下記に提供するが、これらは 当業者を制限するものではない。このような標的に対するリボザイムは、それら の出願に記載されたように設計し、また記載されるようにインビトロおよびイン ビボで試験すべく合成する。このようなリボザイムは記載されたように最適化し て送達することもできる。サルおよびヒトのRNAに対する特定の例が提供され るが、当業者は、記載されたヒトRNA標的の均等物を下記のとおり使用しうる ことを認識するであろう。すなわち、同一の標的を使用することができるが、ヒ トRNA配列を標的化するために適切な結合アームがリボザイム中に存在する。 そのような標的もまた下記のとおり選択することができる。 ヒトおよびサルのapo(a)mRNAの配列は、コンピューター折り畳みア ルゴリズムを用いてアクセス可能な部位についてスクリーニングすることができ る。二次折りたたみ構造を形成せず、潜在的ハンマーヘッドまたはヘアピンリボ ザイム切断部位を含むmRNAの領域を同定することができる。それらの部位は 、表II、IVおよびVI-VIIに示されている(すべての配列は表の5’から3’方向 である)。サルおよびヒトの配列をスクリーニングして、次にリボザイムを設計 することができるが、ヒトを標的とする配列は最も有用である。しかし、sti nchcombら、“Methods and Composition fo r Treatment of Restenosis and Cancer Using Ribozymes”と題する米国特許出願(1993年5月1 8日出願、米国特許出願第08/245,466号;本明細書の一部としてここ に引用する)において議論されるように、サルを標的とするリボザイムはヒトの 試験に先立ってリボザイムの作用の有効性を試験するのに有用である。表中、ヌ クレオチド塩基位置は、表示されるタイプのリボザイムによって切断されるべき 位置として示されている。 リボザイム標的部位を、切断部位がapo(a)のmRNA上に存在するがプ ラスミノーゲンのmRNAには全く存在しないように選択した(表II、IV、VIお よびVII)。これはapo(a)とプラスミノーゲンとの間に驚くべき相同性が 存在するからである(上記参照)。 コンピューターに基づくRNA折り畳みアルゴリズムによって予想された位置 が潜在的な切断部位に相当することを確立しなければならない。ハンマーヘッド およびヘアピンリボザイムは、リボザイム配列が結合しうるように設計し、コン ピューター折り畳みにより個々に分析して、適当な二次構造に折り畳まれるかど うか評価する(Jaegerら、1989 Proc.Natl.Acad.S ci.USA ,86,7706−7710)。結合アームと触媒中心との間に好 ましくない分子内相互作用を有するリボザイムは考慮から除外される。活性を最 適化するために種々の結合アーム長さを選択することができる。一般的には、各 アーム上の少なくとも5塩基が標的RNAと結合することができるか、さもなけ れば標的RNAと相互作用することができる。 図6に示されるように、McSwiggen(“Assay for rib ozyme target site”と題する米国特許出願(1992年5月 1日出願、米国特許出願第07/883,849号;本明細書の一部としてここ に引用する)に一般的に記載される方法により、アクセス可能な切断部位につい てmRNAをスクリーニングする。簡単には、潜在的ハンマーヘッドまたはヘア ピンリボザイム切断部位を表すDNAオリゴヌクレオチドを合成する。ポリメラ ーゼ連鎖反応を用いて、ヒトまたはサルのapo(a)のcDNAクーロンから 、T7RNAポリメラーゼ転写の基質を生じさせる。ラベルしたRNA転写産物 をインビトロで2つの鋳型から合成する。オリゴヌクレオチドおよびラベルした 転写産物をアニーリングし、RNase Hを加え、混合物を37℃で設定した 時間インキュベートする。反応を止め、RNAを配列決定用ポリアクリルアミド ゲルで分離する。切断された基質の百分率はホスファーイメージングシステムを 用いてオートラジオグラフィー定量により決定する。これらのデータから、ハン マーヘッドまたはヘアピンリボザイム部位を、最もアクセス可能な部位として選 択する。 ハンマーヘッドまたはヘアピンモチーフのリボザイムをmRNAメッセンジャ ーの種々の部位にアニーリングするように設計する。結合アームは、上記の標的 部位の配列に相補的である。リボザイムを化学的に合成する。用いた合成方法は 、Usmanら、1987 J.Am.Chem.Soc.,109,7845 −7854およびScaringeら、1990 Nucleic Acid Res. ,18,5433−5441に記載されているような、通常のRNA合 成 の手順に従い、5’末端にジメトキシトリチルおよび3’末端にホスホルアミデ ートのような一般的な核酸の保護およびカップリング基を使用する。平均的な段 階カップリング収率は>98%であった。不活性なリボザイムは、G5をUに、 A14をUに置換することによって合成する(番号はHertelら、1992Nucleic Acids Res. ,20,3252に従う)。ヘアピンリ ボザイムは2つの部分で合成し、アニーリングして活性リボザイムを再構築する (Chowrira and Burke,1992 Nucleic Aci ds Res. ,20,2835−2840)。すべてのリボザイムは、5’お よび3’末端の両方で2’−O−メチル基で5つのリボヌクレオチドを修飾する ことによって、安定性を高めるために修飾する。リボザイムは、一般的方法を使 用してゲル電気泳動により精製するか、または高速液体クロマトグラフィー(H PLC;Usmanら、Synthesis,deprotection,an alysis and purification of RNA and r ibozymes(1994年5月18日出願、米国特許出願第08/245, 736号)に記載されており、この内容のすべてを本明細書の一部としてここに 引用する)によって精製し、水に再懸濁した。 本研究に有用な化学的に合成したリボザイムの配列を、表III、V、VIおよびV IIに示す。当業者は、これらの配列が、リボザイムの酵素的部分(結合アームを 除くすべて)が活性に影響するように変更されているはるかに多くのこのような 配列の代表例にすぎないことを認識するであろう。例えば表IIIおよびVに記載 されたハンマーヘッドリボザイムのステムループII配列(5’−GGCCGAA AGGCC−3’)は、最小で2つの塩基対合したステム構造が形成しうるかぎ り任意の配列を含むように変更(置換、欠失、および/または挿入)することが できる。同様に、。表VIおよびVIIに記載されたヘアピンリボザイムのステムル ープIV配列(5’−CACGUUGUG−3’)は、最小で2つの塩基対合した ステム構造が形成しうるかぎり任意の配列を含むように変更(置換、欠失、およ び/または挿入)することができる。表III、V−VIIに記載される配列は、リボ ヌクレオチドまたは他のヌクレオチドまたは非ヌクレオチドから形成することが できる、そのようなリボザイムは表に特に記載されるリボザイムと均等である。リボザイム活性の最適化 リボザイム活性は、Stinchcombら(前掲)に記載されたように最適 化することができる。詳細はここに繰り返さないが、リボザイムの結合アームの 長さを変更すること(ステムIおよびIII、図2cを参照されたい)、または血 清リボヌクレアーゼによるそれらの分解を妨げるよう修飾したリボザイムを化学 的に合成すること(例えば、Ecksteinら、国際公開WO92/07065 ;Perraultら、1990 Nature,344,565;Pieke nら、1991 Science,253,314;Usman and Ce dergren,1992 Trends in Biochem.Sci.1 7,334;Usmanら、国際公開WO 93/15187;およびRoss iら、国際公開WO91/03162、ならびにUsmans,Nら、米国特許 出願第07/829,729およびSproat、ヨーロッパ特許出願第921 10298.4および米国特許5,334,711およびJenningsら、 WO94/13688(これらは酵素的RNA分子の糖部分に行いうる種々の化 学修飾を記載しており、これらのすべての刊行物を本明細書の一部としてここに 引用する)を参照されたい)、細胞内におけるこれらの効力を増強するよう修飾 すること、およびRNA合成時間を短縮し化学物質の必要性を減少するためにス テムII塩基を除去することを含む。 Sullivanら(前掲)は、酵素的RNA分子の送達の一般的方法を記載 する。リボザイムは当業者に知られる種々の方法によって細胞に投与することが できる。この方法には、リポソーム中へのカプセル化、イオントホレシスによる もの、あるいはヒドロゲル、シクロデキストリン、生分解性ナノカプセル、およ び生物吸着性マイクロスフェアのような他のベヒクル中に取り込ませることによ るものを含むが、これらに限定されない。RNA/ベヒクル組み合わせ物を直接 注入により、またはカテーテル、注入ポンプまたはステントの使用により局所的 に送達する。別の送達経路には、静脈内注射、筋肉内注射、皮下注射、エアゾー ル吸入、経口(錠剤または丸薬の形で)、局所、全身、眼、腹空内、および/ま たは鞘内投与が含まれるが、これらに限定されない。リボザイムの送達および投 与のより詳細な記載は、本明細書の一部としてここに引用したSullivan ら(前掲)、およびDraperら(前掲)によって提供されている。 細胞内に高濃度のリボザイムを蓄積させる他の手段は、DNA発現ベクターに リボザイムをコードする配列を取り込ませることである。リボザイム配列の転写 は真核生物RNAポリメラーゼI(pol I)、RNAポリメラーゼII(po l II)、またはRNAポリメラーゼIII(pol III)のプロモーターから進 められる。pol IIまたはpol IIIプロモーターからの転写産物は、すべ ての細胞内で高レベルで発現されるであろう;一定の細胞タイプ中における一定 のpol IIプロモーターのレベルは、近くに存在する遺伝子調節配列(エンハ ンサー、サイレンサーなど)の性質に依存するであろう。原核生物RNAポリメ ラーゼ酵素が適切な細胞内で発現される限り、原核生物のRNAポリメラーゼプ ロモーターもまた使用される(Elroy−Stein and Moss,1 990 Proc,Natl.Acad.Sci.USA,87,6743−7 ;Gao and Huang 1993 Nucleic Acids Re s. ,21,2867−72;Lieber ら、1993 Methods Enzymol. ,217,47−66;Zhouら1990 Mol.Cel l.Biol. ,10,4529−37)。幾人かの研究者は、このようなプロ モーターから発現されたリボザイムが哺乳動物細胞中で機能しうることを実証し てきた(例えば、Kashani−Sabetら、1992 Antisens e Res.Dev. ,2,3−15;Ojwangら、1992 Proc. Natl.Acad.Sci.USA ,89,10802−6;Chenら、199 2 Nucleic Acids Res.,20,4581−9;Yuら、199 3 Proc,Natl.Acad.Sci.USA,90,6340−4;L ’Huillierら、1992 EMBO J.11,4411−8;Lis ziewiczら、1993 Proc.Natl.Acad.Sci.U.S .A. ,90,8000−4)。上記のリボザイム転写ユニットは哺乳類細胞に 導入するための種々のベクター中に取り込ませることができる。ベクターには、 プラスミドDNAベクター、ウイルスDNAベクター(アデノウイルスまたはア デノ関連性ウイルスのベクター等)、またはウイルスRNAベクター(レトロウ イルス,シンビスウイルス、セムリキフォレストウイルスのベクター等)が含ま れるが、 これらに限定されない。 本発明の好ましい態様においては、apo(a)RNAを切断するリボザイム を発現する転写ユニットをプラスミドDNAベクター、レトロウイルスDNAウ イルスベクター、アデノウイルスDNAウイルスベクターまたはアデノ関連性ウ イルスベクター中に挿入する。これらのおよび他のベクターは、生存動物に遺伝 子を伝達し(総説については、Friedman,1989 Science 2 44,1275−1281;Roemer and Friedman,199 2 Eur.J.Biochem. 208,211−225を参照されたい) 、および一時的または安定な遺伝子発現を導くために使用されてきた。ベクター は、組み換えウイルス粒子として送達される。DNAは単独でまたはベヒクルと の複合体(RNAについて上述したような)で送達することができる。DNA、 DNA/ベヒクル複合体、または組み換えウイルス粒子は、処置部位に、例えば カテーテル、ステントまたは注入ポンプを使用して局所的に投与される。例1:apo(a)ハンマーヘッドリボザイム リボザイムモチーフを工作することによって、我々はapo(a)mRNA配 列に対するいくつかのリボザイムを設計してきた。これらはそのヌクレアーゼ耐 性を改善するような修飾を有するように合成された。これらのリボザイムはイン ビトロでapo(a)標的配列を切断する。 apo(a)を発現する細胞にリボザイムを外的送達することにより、インビ ボでの機能について試験する。リボザイムはリポソームに取り込ませることによ って、陽イオン性脂質と複合体を作ることによって、マイクロインジェクション によって、またはDNAベクターから発現させることによって送達する。apo (a)の発現は、ELISA、間接免疫蛍光法、および/またはFACS分析に よってモニターする。apo(a)mRNAのレベルは、Northern分析 、RNase保護、プライマー延長分析、または定量的RT−PCR技法により 評価する。apo(a)蛋白質およびmRNAの誘導を90%以上妨害するリボ ザイムが同定される。診断使用 本発明のリボザイムは、羅患細胞内での遺伝的浮動および突然変異を試験する 診断道具として使用することができる。リボザイム活性と標的RNAの構造との 間の密接な関係は、標的RNAの塩基対合および三次元構造を変更する分子の任 意の領域において突然変異を検出することを可能とする。本発明に記載される多 数のリボザイムを用いることによって、インビトロでのならびに細胞中および組 織中でのRNAの構造および機能に重要なヌクレオチド変化を位置決定すること ができる。リボザイムによる標的RNAの切断を用いて、遺伝子発現を阻害し、 疾患の進行中における特定の遺伝子産物の役割(本質的な)を特定することがで きる。このようにして、他の遺伝子標的を疾患の重要な媒体として特定すること ができる。これらの実験は、組合せ治療を可能とすることにより、疾患の進行の よりよい治療につながるであろう(例えば、異なる遺伝子を標的とする多数のリ ボザイム、既知の小分子阻害剤に結合させたリボザイム、またはリボザイムおよ び/または他の化学的または生物学的分子の組み合わせを用いる断続的な治療) 。本発明のリボザイムの他のインビトロ使用は当該技術分野でよく知られており 、これにはapo(a)関連状態と関連するmRNAの存在を検出することが含 まれる。このようなRNAは標準方法を用いてリボザイムで処理した後、切断産 物の存在を判定することによって検出される。 特定の例においては、標的RNAの野性型または変異型のみを切断しうるリボ ザイムをアッセイに使用する。第1のリボザイムを用いて試料中に存在する野性 型RNAを同定し、第2のリボザイムを用いて試料中の突然変異RNAを同定す る。反応対照として、野性型および突然変異型の両方のRNAの合成基質を両方 のリボザイムにより切断することにより、反応中のリボザイムの相対的な効力お よび“非標的”RNA種の切断の欠失が実証される。合成基質からの切断産物は 試料集団中の野性型および突然変異型RNAの分析用のサイズマーカーを生ずる のにも役立つであろう。すなわち、それぞれの分析に2つのリボザイム、2つの 基質および1つの未知試料が必要であり、これらを組み合わせて6つの反応とす る。切断生産物の存在は、それぞれのRNAの全長および切断フラグメントがポ リアクリルアミドゲルの1つのレーンで分析できるように、RNAse保護アッ セイを用いて判定される。突然変異RNAの発現および標的細胞内における所望 の表現型変化の推測される危険性を見抜くためには、結果を定量化することが絶 対的に必要というわけではない。その蛋白質生成物が表現型(すなわちapo( a))の発生に関係しているようなmRNAの発現は、危険性を立証するのに適 当である。類似した比活性のプローブを両方の転写産物について使用する場合に は、RNAレベルの定性的比較が適当であり、初期の診断の経費を削減するであ ろう。RNAレベルが定性的または定量的に比較されるかにかかわらず、突然変 異型対野性型の比が高ければ高いほど、より高い危険性と関連があるであろう。 他の具体例は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ニュートン,ロジャー・エス アメリカ合衆国ミシガン州48105,アン・ アーバー,バーズタウン・トレイル 1425 (72)発明者 ラムハラック,ランディ アメリカ合衆国ミシガン州48105,アン・ アーバー,アンティータム・ドライブ 2465

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.apo(a)mRNAを切断する酵素的RNA分子。 2.その結合アームが表II中のいずれかの配列により定義されるいずれか1つの 配列に相補的な配列を含む、請求項1記載の酵素的RNA分子。 3.その結合アームが表IV、VIおよびVIIのいずれか1つにおいて定義される配 列に相補的な配列を含む、請求項1記載の酵素的RNA分子。 4.前記RNA分子がハンマーヘッドモチーフのものである、請求項1、2また は3に記載の酵素的RNA分子。 5.前記RNA分子が、ヘアピン、デルタ肝炎ウイルス、グループIイントロン 、Neurospora VS RNAまたはRNaseP RNAモチーフの ものである、請求項1、2または3に記載の酵素的RNA分子。 6.前記リボザイムが前記mRNAに相補的な12から100塩基を含む、請求 項5記載の酵素的RNA分子。 7.前記リボザイムが前記mRNAに相補的な14から24塩基を含む、請求項 6記載の酵素的RNA分子。 8.本質的に表III、V、VIおよびVIIに示される配列からなる群より選択される いずれかの配列からなる酵素的RNA分子。 9.請求項1、2または3に記載の酵素的RNA分子を含む哺乳動物細胞。 10.前記細胞がヒト細胞である、請求項8記載の細胞。 11.請求項1、2または3に記載の1つの酵素的RNA分子または多数の酵素 的分子をコードする核酸を、その酵素的RNA分子が哺乳動物細胞中で発現する 様式で含む発現ベクター。 12.請求項11記載の発現ベクターを含む哺乳動物細胞。 13.前記細胞がヒト細胞である請求項13記載の細胞。 14.患者に請求項1、2または3に記載の酵素的核酸分子を投与することによ り上昇した血漿Lp(a)レベルに関連する状態を処置する方法。 15.患者に請求項11記載の発現ベクターを投与することにより上昇した血漿 Lp(a)レベルに関連する状態を処置する方法。 16.前記患者がヒトである、請求項14または15に記載の方法。 17.前記状態が、および心臓疾患からなる群より選択される、請求項15記載 の方法。 18.前記状態が再狭窄である、請求項17記載の方法。
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