JPH11262387A - Nucleic acid-binding magnetic carrier and isolation of nucleic acid using the carrier - Google Patents
Nucleic acid-binding magnetic carrier and isolation of nucleic acid using the carrierInfo
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Landscapes
- Soft Magnetic Materials (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
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Abstract
Description
【0001】[0001]
【発明が属する技術分野】本発明は、核酸を含有すると
考えられる試料から核酸を単離するための核酸結合性磁
性担体および該担体を含む核酸単離用試薬キットならび
に核酸単離方法に関する。TECHNICAL FIELD The present invention relates to a nucleic acid-binding magnetic carrier for isolating a nucleic acid from a sample suspected of containing the nucleic acid, a nucleic acid isolation reagent kit containing the carrier, and a nucleic acid isolation method.
【0002】[0002]
【従来の技術】近年の遺伝子工学および分子生物学など
の分野の進歩により、感染症や遺伝子疾患などについて
DNAまたはRNAレベルで分析することが可能になっ
た。特に、PCR法(Polymerase Chain Reaction, Sci
ence 230:1350-1354, 1985) やNASBA法(Nucleic
Acid Sequence Based Amplification, Nature 350:91-9
2, 1991 )に代表される核酸増幅方法の発明により、従
来であれば、検出が非常に困難であった極微量の核酸の
検出が可能となり、遺伝子解析が飛躍的に容易なものと
なった。2. Description of the Related Art Recent advances in fields such as genetic engineering and molecular biology have made it possible to analyze infectious diseases and genetic diseases at the DNA or RNA level. In particular, PCR (Polymerase Chain Reaction, Sci.
ence 230: 1350-1354, 1985) and the NASBA method (Nucleic
Acid Sequence Based Amplification, Nature 350: 91-9
The invention of the nucleic acid amplification method represented by 2, 1991) has made it possible to detect a very small amount of nucleic acid, which has been extremely difficult to detect in the past, and has greatly facilitated gene analysis. .
【0003】しかし、生物試料中の核酸を必要により増
幅し、検出するためには、試料中の核酸を選択的に取り
出す必要がある。これは、通常の生物試料中には核酸以
外の夾雑物質、例えばタンパク質、脂質、糖類などが大
量に含まれており、これらが増幅や検出に悪影響を及ぼ
す可能性が少なくない。従ってあらかじめ試料中の夾雑
物質を除き、核酸を単離する操作が必要となる。However, in order to amplify and detect nucleic acids in a biological sample as necessary, it is necessary to selectively remove the nucleic acids from the sample. This is because ordinary biological samples contain a large amount of contaminants other than nucleic acids, for example, proteins, lipids, saccharides, and the like, and these have many possibilities of adversely affecting amplification and detection. Therefore, it is necessary to remove nucleic acids in the sample and to isolate the nucleic acid in advance.
【0004】この核酸の単離法は、古くから様々な手法
で行われてきた。代表的なものとしてはフェノール法
(Biochimica et Biophysica Acta, 72:619-629, 196
3)、アルカリ法(Nucleic Acid Research, 7:1513-152
3, 1979)などの液相で行う方法がある。これらは実験
室スケールで汎用されるが、有害で廃棄の困難なフェノ
ールやクロロホルムのような有機溶媒などのほか、危険
物である水酸化ナトリウムなどを使用するため、技術的
には熟練を要し、再現性よく実施することは容易でない
方法である。[0004] This nucleic acid isolation method has been performed by various methods since ancient times. A representative example is the phenol method (Biochimica et Biophysica Acta, 72: 619-629, 196
3), alkali method (Nucleic Acid Research, 7: 1513-152
3, 1979). These are widely used on a laboratory scale, but require technical skills because they use dangerous organic solvents such as phenol and chloroform, which are difficult to dispose of, and sodium hydroxide, which is a dangerous substance. It is not easy to carry out with good reproducibility.
【0005】また、核酸の単離に核酸結合用担体を用い
る系としては、ガラス粒子とヨウ化ナトリウムを用いる
方法(Proc. Natl. Acad. Sci.USA., 76-2:615-619, 197
9)、ハイドロキシアパタイトを用いる方法(特開昭63-2
63093 号公報)などがある。これらの方法は有害な有機
溶媒などはそれほど使用しないが、そのかわり工程中に
遠心分離操作を多く含むため多数の試料を一度に処理す
ることが困難で、核酸を単離するのに長時間かかるとい
う問題を含んでいる。As a system using a nucleic acid-binding carrier for isolating a nucleic acid, a method using glass particles and sodium iodide (Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 76-2: 615-619, 197)
9), a method using hydroxyapatite (Japanese Unexamined Patent Publication No.
No. 63093). These methods do not use harmful organic solvents, etc., but instead involve many centrifugation operations during the process, so it is difficult to process many samples at once, and it takes a long time to isolate nucleic acids Includes the problem.
【0006】従って、上記の核酸単離方法は有機溶媒や
アルカリなどの危険な試薬を使用すること、遠心分離操
作を必要とし、多数検体の処理が難しいことなどの難点
があるが、さらに大きな問題点が存在する。それは、抽
出工程の機械化において生じるものである。多数の検体
を再現性よく処理し、さらに人的コストを低減させるた
めには核酸単離の自動機械化は今後不可欠になりつつあ
る。Accordingly, the above-mentioned nucleic acid isolation method has drawbacks such as the use of dangerous reagents such as organic solvents and alkalis, the necessity of centrifugation, and the difficulty in treating a large number of samples. There is a point. It occurs in the mechanization of the extraction process. Automated mechanization of nucleic acid isolation is becoming indispensable in the future in order to process a large number of samples with good reproducibility and to further reduce human costs.
【0007】この自動機械化を目指したものとして、シ
リカ粒子とカオトロピックイオンを用いた方法(J. Cli
nical Microbiology, 28-3:495-503, 1990および特開平
2-289596号公報)がある。これは、核酸結合性のシリカ
粒子と試料中の核酸を遊離する能力を持つカオトロピッ
クイオンとを試料と混合し、核酸をシリカ粒子に結合さ
せ、夾雑物質を洗浄により除去した後、シリカ粒子に結
合した核酸を回収するというものである。該方法はDN
Aに加えて、より不安定であるRNAの抽出にも好適で
あり、また純度の高い核酸が得られるという点で非常に
優れている。しかし、この核酸が結合した粒子の洗浄に
ついては遠心分離またはフィルターなどを使用した濾過
などを行う必要があり、機械化の際に工程が複雑となる
恐れが高い。[0007] To achieve this automatic mechanization, a method using silica particles and chaotropic ions (J. Cli
nical Microbiology, 28-3: 495-503, 1990 and JP
2-289596). This involves mixing nucleic acid-binding silica particles and chaotropic ions capable of releasing nucleic acids in a sample with the sample, binding the nucleic acids to the silica particles, removing contaminants by washing, and then binding to the silica particles. The recovered nucleic acid is recovered. The method is DN
In addition to A, it is also suitable for extracting a more unstable RNA, and is very excellent in that a nucleic acid with high purity can be obtained. However, it is necessary to carry out centrifugation or filtration using a filter or the like for washing the particles to which the nucleic acid is bound, and there is a high possibility that the process becomes complicated during the mechanization.
【0008】シリカ粒子を容易に混合あるいは洗浄する
方法として、磁性シリカ粒子を使用することは既に知ら
れており、本発明者らは特定の比表面積を有する磁性シ
リカ粒子を使用することにより、非特異的に多くの核酸
を吸着させることが可能な磁性粒子担体およびこの担体
を使用した、簡単な操作で有効に生物材料から核酸を単
離する方法(特開平9-19292 号公報)を提案した。しか
し、単に特定の比表面積を有する磁性粒子を使用するだ
けでは、試料中の夾雑物質による吸着阻害への影響など
を受け、核酸の回収効率が低下する現象が多くみられ
る。As a method for easily mixing or washing silica particles, the use of magnetic silica particles is already known, and the present inventors have proposed the use of magnetic silica particles having a specific surface area to improve the non-magnetic properties. A magnetic particle carrier capable of specifically adsorbing many nucleic acids, and a method for effectively isolating nucleic acids from biological materials by a simple operation using this carrier (Japanese Patent Application Laid-Open No. H9-19292) have been proposed. . However, simply using magnetic particles having a specific specific surface area often causes a phenomenon in which the efficiency of nucleic acid recovery is reduced due to the influence of impurities in the sample on adsorption inhibition.
【0009】[0009]
【発明が解決しようとする課題】本発明は、上記の問題
点を解決するためになされたものであり、生物試料、特
に全血検体から核酸を効率よく、単離することが可能で
あり、さらに核酸単離の自動機械化が可能な方法を提供
することを目的とする。DISCLOSURE OF THE INVENTION The present invention has been made to solve the above problems, and it is possible to efficiently isolate a nucleic acid from a biological sample, particularly a whole blood sample, Another object of the present invention is to provide a method capable of automatically mechanizing nucleic acid isolation.
【0010】[0010]
【課題を解決するための手段】本発明者らは、これらの
課題を解決すべく鋭意研究を進めた結果、生物試料から
核酸を効率よく回収するために、該磁性シリカ粒子担体
が少なくとも50m2/gの外部表面積を有することが
有効であることを見い出し、本発明に到達した。Means for Solving the Problems The present inventors have made intensive studies to solve these problems, and as a result, in order to efficiently recover nucleic acids from a biological sample, the magnetic silica particle carrier has at least 50 m 2. / G of external surface area was found to be effective and arrived at the present invention.
【0011】すなわち、超常磁性金属酸化物を含む磁性
シリカ粒子である核酸結合性磁性担体であって、該磁性
シリカ粒子が少なくとも50m2 /gの外部表面積を有
することを特徴とする核酸結合性磁性担体である。That is, a nucleic acid binding magnetic carrier which is magnetic silica particles containing a superparamagnetic metal oxide, wherein the magnetic silica particles have an external surface area of at least 50 m 2 / g. It is a carrier.
【0012】また、本発明は、少なくとも上記核酸結合
性磁性担体、核酸を核酸結合性担体に吸着させるための
核酸吸着用溶液および核酸結合性担体−核酸複合体から
核酸を溶出するための溶液を含むことを特徴とする核酸
単離用試薬キットである。The present invention also provides a nucleic acid-binding magnetic carrier, a nucleic acid-adsorbing solution for adsorbing a nucleic acid to the nucleic acid-binding carrier, and a solution for eluting the nucleic acid from the nucleic acid-binding carrier-nucleic acid complex. It is a nucleic acid isolation reagent kit characterized by including:
【0013】さらに、本発明は下記工程(a)〜(c)
を含むことを特徴とする核酸単離方法である。 (a)上記核酸結合性磁性担体、核酸を含有する試料お
よび核酸を核酸結合性担体に吸着させるための核酸吸着
用溶液を混合して、核酸を核酸結合性担体に結合させる
工程 (b)核酸が結合した核酸結合性担体を液体から分離
し、必要により洗浄する工程、および (c)核酸結合性担体−核酸複合体から核酸を溶出する
工程Further, the present invention provides the following steps (a) to (c):
It is a nucleic acid isolation method characterized by including the following. (A) mixing the nucleic acid with the nucleic acid-binding carrier by mixing the nucleic acid-binding magnetic carrier, the sample containing the nucleic acid, and the nucleic acid adsorption solution for adsorbing the nucleic acid to the nucleic acid-binding carrier; Separating the nucleic acid-binding carrier to which is bound from the liquid, washing if necessary, and (c) elute the nucleic acid from the nucleic acid-binding carrier-nucleic acid complex
【0014】[0014]
【発明の実施の形態】次に本発明において使用する言葉
を定義し、その測定法を説明する。表面積とは、担体の
全表面上の面積を示す。また、微小径粒子においては粒
子1個当たりの表面積でなく、単位重量(例えば1g)
当たりの表面積で示すことが多く、これを比表面積とい
う。また、外部表面積とは、担体の表面に位置する表面
積をいう。DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS Next, words used in the present invention are defined, and a method for measuring the words will be described. The surface area indicates the area on the entire surface of the carrier. Further, in the case of micro-sized particles, not the surface area per particle, but the unit weight (for example, 1 g)
It is often indicated by the surface area per unit, and this is called the specific surface area. The external surface area refers to a surface area located on the surface of the carrier.
【0015】細孔とは、粒子表面に存在する微細な空洞
を示し、細孔容積とは、細孔により構成される空間の容
積を示す。また、表面細孔直径とは、担体上に存在する
微小な細孔の直径であり、微小径の粒子では平均の直径
がよく用いられる。粒子径とは、分散粒子の形を球形と
仮定した場合の直径を示す。これらの表面積細孔直径お
よび細孔容積は、窒素ガス吸着測定法により測定され
る。[0015] The pores indicate fine cavities existing on the particle surface, and the pore volume indicates the volume of a space constituted by the pores. The surface pore diameter is the diameter of the fine pores present on the carrier, and the average diameter of the fine pore particles is often used. The particle diameter indicates a diameter when the shape of the dispersed particles is assumed to be spherical. These surface area pore diameters and pore volumes are measured by nitrogen gas adsorption measurement.
【0016】これらの測定法は、JIS K1150
「シリカゲル試験法」で規格化されている。その他はB
ET法、窒素置換(t−plot)法などにより測定さ
れる。These measuring methods are based on JIS K1150
Standardized by the "Silica gel test method". Others are B
It is measured by an ET method, a nitrogen substitution (t-plot) method, or the like.
【0017】一般に、磁性シリカ粒子担体の表面積につ
いては、この粒子が多孔質であるため、その細孔部分に
由来する内部表面積と、実質的に表面として現れる外部
表面積に分かれる。そして、本発明においては、後者の
外部表面積が試料中の核酸の回収効率に影響することを
見い出したのである。In general, the surface area of the magnetic silica particle carrier is divided into an internal surface area originating from the pores and an external surface area substantially appearing as a surface because the particles are porous. Then, in the present invention, they have found that the latter external surface area affects the efficiency of recovering nucleic acid in a sample.
【0018】すなわち、本発明においては、磁性シリカ
粒子担体が少なくとも50m2 /g、好ましくは70〜
100m2 /gの外部表面積を有することが必要であ
る。外部表面積がより大きい粒子を使用することによ
り、核酸の回収量を高めることができるのである。50
m2 /g未満であると、試料中の夾雑物質が粒子表面に
結合し、核酸が吸着できないという欠点を生じる。That is, in the present invention, the magnetic silica particle carrier is at least 50 m 2 / g, preferably 70 m 2 / g.
It is necessary to have an external surface area of 100 m 2 / g. By using particles having a larger external surface area, the amount of nucleic acid recovered can be increased. 50
If it is less than m 2 / g, there is a disadvantage that contaminants in the sample bind to the particle surface and nucleic acids cannot be adsorbed.
【0019】本発明において、粒子の表面積についての
解析は、t法により行う。この方法では、解析される試
料と表面特性の類似した標準試料との窒素吸着等温線が
比較される。まず、非多孔性材料の吸着等温線より標準
のt曲線が作成される。ここでは、窒素分子の単分子層
の厚みを0.354nmとして、標準試料の窒素ガスを
用いた吸着量の厚みtnmを算出する。そして、解析試
料の窒素吸着量を、基準試料の吸着量の厚みに対してプ
ロットする。このtプロットは、本発明で示しているマ
イクロポアをもつ吸着剤においては、図1のような形を
とる。In the present invention, the surface area of the particles is analyzed by the t method. In this method, the nitrogen adsorption isotherm of a sample to be analyzed is compared with that of a standard sample having similar surface characteristics. First, a standard t-curve is created from the adsorption isotherm of the non-porous material. Here, assuming that the thickness of the monolayer of nitrogen molecules is 0.354 nm, the thickness tnm of the adsorption amount of the standard sample using nitrogen gas is calculated. Then, the nitrogen adsorption amount of the analysis sample is plotted against the thickness of the reference sample adsorption amount. This t-plot takes the form as shown in FIG. 1 for the adsorbent having micropores shown in the present invention.
【0020】本発明の磁性シリカ粒子は、好ましくは比
表面積が10〜800m2 /g、粒径が0.5〜15μ
m、特に好ましくは1.0〜10.0μmである。本発
明の磁性シリカ粒子は、表面細孔直径が、好ましくは
0.01〜60nm、特に好ましくは0.5〜10nm
であり、そして、細孔容積が、好ましくは0.01〜
1.5ml/g、特に好ましくは0.01〜0.5ml
/gである。The magnetic silica particles of the present invention preferably have a specific surface area of 10 to 800 m 2 / g and a particle size of 0.5 to 15 μm.
m, particularly preferably 1.0 to 10.0 μm. The magnetic silica particles of the present invention have a surface pore diameter of preferably 0.01 to 60 nm, particularly preferably 0.5 to 10 nm.
And the pore volume is preferably from 0.01 to
1.5 ml / g, particularly preferably 0.01 to 0.5 ml
/ G.
【0021】好ましい実施態様では、本発明の磁性シリ
カ粒子は、以下のような構造を有している。すなわち、
下記超常磁性金属酸化物の表面がシリカで被覆されてお
り、そして、さらに微小なシリカ粒子で構成される無機
多孔性壁物質で複合されている。この磁性シリカ粒子
は、ほぼ完全な球状である。核酸とシリカ粒子とは、シ
リカ表面の水酸基と核酸の塩基との間で生じる水素結合
により結合される。In a preferred embodiment, the magnetic silica particles of the present invention have the following structure. That is,
The surface of the following superparamagnetic metal oxide is coated with silica, and is further composited with an inorganic porous wall material composed of fine silica particles. The magnetic silica particles are almost perfectly spherical. The nucleic acid and the silica particles are bonded by a hydrogen bond generated between the hydroxyl group on the silica surface and the base of the nucleic acid.
【0022】本発明で用いられる超常磁性金属酸化物と
は、磁場変化度に応答するが、永久磁化はされず、残留
磁化が小さい金属酸化物をいう。好ましい超常磁性金属
酸化物としては、酸化鉄が挙げられる。この酸化鉄とし
ては、四三酸化鉄(Fe3 O4 )および四三酸化鉄を徐
々に酸化して得られるr型三二酸化鉄(rFe2 O3 )
などが用いられる。この四三酸化鉄は残留磁気が小さ
く、さらに好ましい表面構造 (ほぼ球形) を有するた
め、磁気分離および再分散のサイクルを反復することが
可能である。四三酸化鉄を含有する磁性シリカ粒子は、
弱酸性の水溶液中で安定であり、2年以上も貯蔵可能で
ある。The superparamagnetic metal oxide used in the present invention refers to a metal oxide which responds to the degree of change in the magnetic field but has no permanent magnetization and a small residual magnetization. Preferred superparamagnetic metal oxides include iron oxide. As the iron oxide, r-type iron sesquioxide (rFe 2 O 3 ) obtained by gradually oxidizing iron sesquioxide (Fe 3 O 4 ) and iron sesquioxide
Are used. This triiron tetroxide has a low remanence and a more favorable surface structure (substantially spherical), so that the cycle of magnetic separation and redispersion can be repeated. Magnetic silica particles containing ferric oxide,
It is stable in weakly acidic aqueous solutions and can be stored for more than 2 years.
【0023】本発明の磁性シリカ粒子中に含まれる超常
磁性金属酸化物の重量は、磁極の強さにもよるが、10
〜60wt%が好ましく、さらに好ましくは20〜40
wt%である。この好ましい範囲内では、磁性担体は市
販の磁石を使用して迅速に分離できる。The weight of the superparamagnetic metal oxide contained in the magnetic silica particles of the present invention depends on the strength of the magnetic pole.
6060 wt%, more preferably 20-40.
wt%. Within this preferred range, the magnetic support can be rapidly separated using commercially available magnets.
【0024】本発明において、シリカとは、SiO2 結
晶および他の形態の酸化ケイ素、SiO2 から構成され
るケイソウ植物の骨格ならびに無定形酸化ケイ素を含
む。In the present invention, silica includes SiO 2 crystals and other forms of silicon oxide, a skeleton of a diatom plant composed of SiO 2, and amorphous silicon oxide.
【0025】本発明の磁性シリカ粒子は下記性質を有す
るものが最も好ましい。 (1) 担体は、超常磁性酸化鉄を含む磁性シリカ粒子であ
る。 (2) 磁性シリカ粒子の外部表面積は、少なくとも50m
2 /gである。 (3) 磁性シリカ粒子は、その表面がシリカで被覆されて
いる超常磁性金属酸化物を、微小なシリカ粒子で構成さ
れる無機多孔性壁物質で複合してなる。 (4) 超常磁性酸化鉄の重量は、10〜60wt%であ
る。 (5) 磁性シリカ粒子の比表面積は、10〜800m2 /
gである。 (6) 磁性シリカ粒子の表面細孔直径は、0.1〜60n
mである。 (7) 磁性シリカ粒子の細孔容積は、0.01〜1.5m
l/gである。 (8) 磁性シリカ粒子の粒子径は、0.5〜15μmであ
る。The magnetic silica particles of the present invention most preferably have the following properties. (1) The carrier is magnetic silica particles containing superparamagnetic iron oxide. (2) The external surface area of the magnetic silica particles is at least 50 m
2 / g. (3) The magnetic silica particles are composed of a superparamagnetic metal oxide whose surface is coated with silica and an inorganic porous wall material composed of fine silica particles. (4) The weight of the superparamagnetic iron oxide is 10 to 60 wt%. (5) The specific surface area of the magnetic silica particles is 10 to 800 m 2 /
g. (6) The surface pore diameter of the magnetic silica particles is 0.1 to 60 n.
m. (7) The pore volume of the magnetic silica particles is 0.01 to 1.5 m.
1 / g. (8) The particle diameter of the magnetic silica particles is 0.5 to 15 μm.
【0026】本発明の磁性シリカ粒子は、例えば特開平
6-47273 号公報に記載の方法により製造され得る。例え
ば四三酸化鉄を、テトラエトキシシランのアルコール溶
液に添加し、超音波分散機により分散湿潤させる。これ
にテトラエトキシシランの加水分解触媒を加え、超音波
分散させながら、四三酸化鉄の表面にシリカを沈着させ
る。このようにして得られた分散液に、ケイ酸ナトリウ
ムを加え、有機溶媒おび界面活性剤 (ソルビタンモノス
テアレートのトルエン溶液) を加えて乳化し、W/O型
エマルジョンを形成させる。この乳濁液を硫酸アンモニ
ウム水溶液に添加し、十分攪拌させる。その後、濾過分
離、水洗、アルコール沈殿を行い、乾燥させることによ
り、所望の球状シリカ粒子が得られる。The magnetic silica particles of the present invention are, for example,
It can be produced by the method described in JP-A-6-47273. For example, ferric oxide is added to an alcohol solution of tetraethoxysilane and dispersed and wetted by an ultrasonic disperser. A hydrolysis catalyst for tetraethoxysilane is added thereto, and silica is deposited on the surface of iron sesquioxide while being ultrasonically dispersed. Sodium silicate is added to the dispersion thus obtained, and an organic solvent and a surfactant (a solution of sorbitan monostearate in toluene) are added to emulsify to form a W / O emulsion. This emulsion is added to an aqueous solution of ammonium sulfate and thoroughly stirred. Thereafter, filtration separation, washing with water, alcohol precipitation and drying are performed to obtain desired spherical silica particles.
【0027】本発明の核酸単離用試薬キットは、少なく
とも上記核酸結合性磁性担体、核酸を核酸結合性担体に
吸着させるための核酸吸着用溶液および核酸結合性担体
−核酸複合体から核酸を溶出するための溶液を含む。The reagent kit for nucleic acid isolation of the present invention comprises a nucleic acid-binding magnetic carrier, a nucleic acid-adsorbing solution for allowing nucleic acid to be adsorbed to the nucleic acid-binding carrier, and a nucleic acid-binding carrier-nucleic acid complex. Solution.
【0028】本発明における核酸吸着用溶液とは、生物
試料中の核酸を含む細胞などを破壊し、核酸を露出さ
せ、そして、この核酸を磁性シリカ粒子に結合させる働
きを持つ溶液である。このような溶液としては、好まし
くは、カオトロピック物質のようなシリカ粒子表面の疎
水性を高める物質が選択され、さらに、好ましくは、グ
アニジン(イソ)チオシアン酸塩および/またはグアニ
ジン塩酸塩のような核酸分解酵素の阻害活性を有する化
合物の溶液が使用できる。The nucleic acid adsorbing solution in the present invention is a solution having a function of destroying cells containing nucleic acids in a biological sample, exposing the nucleic acids, and binding the nucleic acids to magnetic silica particles. As such a solution, a substance that enhances the hydrophobicity of the silica particle surface, such as a chaotropic substance, is preferably selected. Further, a nucleic acid, such as guanidine (iso) thiocyanate and / or guanidine hydrochloride, is preferably used. A solution of a compound having a degrading enzyme inhibitory activity can be used.
【0029】カオトロピック物質としては、具体的には
グアニジンチオシアン酸塩、グアニジン塩酸塩、ヨウ化
ナトリウム、ヨウ化カリウム、過塩素酸ナトリウム、尿
素等が挙げられるが、これらのうち、RNAを分解する
リボヌクレアーゼに対する阻害効果の大きなグアニジン
チオシアン酸塩あるいはグアニジン塩酸塩の使用が好ま
しい。これらのカオトロピック物質の使用濃度は、用い
られるカオトロピック物質により異なり、通常、1〜8
M、好ましくは4〜7Mであり、例えばグアニジン塩酸
塩を使用する場合は、4〜7.5Mである。また、グア
ニジンチオシアン酸塩を使用する場合には、3〜5.5
Mの範囲である。Specific examples of the chaotropic substance include guanidine thiocyanate, guanidine hydrochloride, sodium iodide, potassium iodide, sodium perchlorate, and urea. Of these, ribonuclease that degrades RNA It is preferable to use guanidine thiocyanate or guanidine hydrochloride, which has a large inhibitory effect on guanidine. The concentration used of these chaotropic substances differs depending on the chaotropic substance used, and is usually 1 to 8
M, preferably 4-7M, for example when using guanidine hydrochloride it is 4-7.5M. When guanidine thiocyanate is used, it is 3-5.5.
M range.
【0030】本発明の吸着剤を含む核酸吸着用溶液に
は、緩衝剤を含有させることが好ましい。これは予め吸
着用溶液に含まれていても、また、細胞を溶解した後に
緩衝液として添加してもよい。この緩衝剤としては、一
般に使用されるものであれば、特に限定されないが、中
性付近、すなわち、pH5〜9において緩衝能を有する
ものが好ましい。例えば、トリス−塩酸塩、四ホウ酸ナ
トリウム−塩酸、リン酸二水素カリウム−四ホウ酸ナト
リウム緩衝液等が挙げられ、その使用濃度としては1〜
500mM、pHは7〜9の範囲が好適である。The nucleic acid-adsorbing solution containing the adsorbent of the present invention preferably contains a buffer. This may be contained in the solution for adsorption in advance, or may be added as a buffer after lysing the cells. The buffer is not particularly limited as long as it is generally used, but a buffer having a buffer capacity at around neutral, that is, at a pH of 5 to 9 is preferable. For example, tris-hydrochloride, sodium tetraborate-hydrochloric acid, potassium dihydrogen phosphate-sodium tetraborate buffer, and the like are used.
500 mM, pH is preferably in the range of 7-9.
【0031】また、核酸吸着用溶液には、細胞膜の破壊
あるいは細胞中に含まれるタンパク質を変性させる目的
で界面活性剤を含有させてもよい。この界面活性剤とし
ては、一般に細胞等からの核酸抽出に使用されるもので
あれば、特に限定されないが、具体的には、トリトン系
界面活性剤およびツイーン系界面活性剤等の非イオン界
面活性剤、N−ラウロイルサルコシンナトリウム等の陰
イオン界面活性剤が挙げられる。本発明においては、特
に非イオン界面活性剤を0.1〜2%の範囲で使用する
のが好ましい。Further, the nucleic acid adsorbing solution may contain a surfactant for the purpose of disrupting cell membranes or denaturing proteins contained in cells. The surfactant is not particularly limited as long as it is generally used for nucleic acid extraction from cells or the like. Specifically, nonionic surfactants such as triton-based surfactants and tween-based surfactants are used. And an anionic surfactant such as sodium N-lauroyl sarcosine. In the present invention, it is particularly preferable to use a nonionic surfactant in the range of 0.1 to 2%.
【0032】さらに、核酸吸着用溶液には試料中に含ま
れるタンパク質、特にリボヌクレアーゼを変性、失活さ
せる目的で、2−メルカプトエタノールあるいはジチオ
スレイトール等の還元剤を含有させることが好ましい。Further, the nucleic acid adsorbing solution preferably contains a reducing agent such as 2-mercaptoethanol or dithiothreitol for the purpose of denaturing and inactivating proteins contained in the sample, particularly ribonuclease.
【0033】本発明において必要により使用する洗浄液
とは、核酸結合性担体から核酸の溶離を促進するもので
なく、かつ、タンパク質、糖類、脂質の固相への結合を
妨げるものであれば、特に限定されない。具体的には、
4〜7.5Mグアニジン塩酸塩溶液あるいは40〜80
%エタノールで洗浄することが好ましい。また、初めに
溶解・吸着工程にて使用した吸着用溶液を洗浄液として
使用すると、ゲノムDNAとタンパク質の除去に有効で
ある。このとき、続いて40〜80%エタノールで洗浄
することが好ましい。The washing solution optionally used in the present invention is not particularly limited as long as it does not promote elution of the nucleic acid from the nucleic acid binding carrier and prevents binding of proteins, saccharides and lipids to the solid phase. Not limited. In particular,
4-7.5M guanidine hydrochloride solution or 40-80
It is preferred to wash with% ethanol. Also, if the adsorption solution used in the dissolution / adsorption step is used as a washing solution, it is effective for removing genomic DNA and proteins. At this time, it is preferable to subsequently wash with 40 to 80% ethanol.
【0034】本発明における核酸の結合した核酸結合性
担体から核酸を溶出する核酸抽出液とは、核酸結合性担
体から核酸の溶離を促進するものであれば、特に限定さ
れない。具体的には、水あるいはTEバッファー(10
mMトリス−塩酸緩衝液、1mM EDTA:pH8.
0)が好ましい。この核酸−磁性シリカ粒子複合体を形
成する際、夾雑物を多量に含む生物試料、例えば血液の
ような検体を処理する場合、該試料由来の物質が磁性シ
リカ粒子の周囲に付着し、核酸の結合を妨げる傾向にあ
る。実際、夾雑物が多い試料ほど核酸の回収能力が低下
する。この問題を解決するため、本発明においては、外
部表面積がより大きい粒子を使用することにより、上記
試料由来の夾雑物質が粒子に付着しても、核酸の結合に
影響が出にくく、従って、高い回収効率を維持すること
が可能となる。The nucleic acid extract for eluting a nucleic acid from a nucleic acid-binding carrier to which the nucleic acid is bound in the present invention is not particularly limited as long as it promotes elution of the nucleic acid from the nucleic acid-binding carrier. Specifically, water or TE buffer (10
mM Tris-HCl buffer, 1 mM EDTA: pH8.
0) is preferred. When forming a nucleic acid-magnetic silica particle complex, when processing a biological sample containing a large amount of contaminants, for example, a sample such as blood, a substance derived from the sample adheres around the magnetic silica particles, They tend to prevent binding. In fact, the sample with more contaminants has lower nucleic acid recovery ability. In order to solve this problem, in the present invention, by using particles having a large external surface area, even if the contaminant derived from the sample adheres to the particles, it is unlikely to affect the binding of the nucleic acid, and therefore, high Recovery efficiency can be maintained.
【0035】本発明の核酸単離用試薬キットは、(1)
超常磁性金属酸化物を含む磁性シリカ粒子である核酸結
合性磁性担体であって、該該磁性シリカ粒子が少なくと
も50m2 /gの外部表面積を有する核酸結合性磁性担
体、(2)核酸を該粒子に吸着させるための溶液および
(3)核酸を溶出するための溶液とを少なくとも含む。
その組成比は、使用目的に応じて種々に選択されるが、
その一例としては、(1)約20〜200μl、(2)
約100〜10,000μlおよび(3)約20〜20
0μlがある。The nucleic acid isolation reagent kit of the present invention comprises (1)
A nucleic acid-binding magnetic carrier, which is a magnetic silica particle containing a superparamagnetic metal oxide, wherein the magnetic silica particle has an external surface area of at least 50 m 2 / g. And (3) a solution for eluting nucleic acids.
The composition ratio is variously selected depending on the purpose of use,
For example, (1) about 20 to 200 μl, (2)
About 100 to 10,000 μl and (3) about 20 to 20
There is 0 μl.
【0036】本発明では、このような磁性シリカ粒子
を、核酸を含有する試料とともに核酸吸着用溶液中に添
加し、磁性シリカ粒子−核酸複合体を形成する。本発明
の核酸単離方法は、具体的には下記工程を含む。 (a)核酸結合性担体、核酸を含有する試料および核酸
を核酸結合性担体に吸着させるための核酸吸着用溶液を
混合して、核酸を核酸結合性担体に結合させる工程(吸
着工程) (b)核酸が結合した核酸結合性担体を液体から分離
し、必要により洗浄する工程(分離工程) および (c)核酸結合性担体−核酸複合体から核酸を溶出する
工程(溶出工程)In the present invention, such magnetic silica particles are added to a solution for nucleic acid adsorption together with a nucleic acid-containing sample to form a magnetic silica particle-nucleic acid complex. The nucleic acid isolation method of the present invention specifically includes the following steps. (A) mixing a nucleic acid-binding carrier, a sample containing the nucleic acid, and a nucleic acid adsorbing solution for adsorbing the nucleic acid to the nucleic acid-binding carrier, and binding the nucleic acid to the nucleic acid-binding carrier (adsorption step); ) A step of separating the nucleic acid-binding carrier to which the nucleic acid is bound from the liquid and washing if necessary (separation step); and (c) a step of eluting the nucleic acid from the nucleic acid-binding carrier-nucleic acid complex (elution step)
【0037】ここで、核酸を含有する試料とは、全血、
血清、血漿、尿、唾液、体液などの動物由来の生物材
料、その他、植物、微生物などの動物以外の生物材料を
包含する。また、これらの生物から分離した細胞および
培養細胞を含む。さらに、部分精製された核酸も包含す
る。核酸とは、DNAまたはRNAを意味し、DNAと
しては、2本鎖DNA、1本鎖DNA、プラスミドDN
A、ゲノムDNA、cDNAなどを含む。また、RNA
としては、ウイルス、細菌あるいは真菌等の外来性寄生
生物由来のRNAに加えて、これらの生物材料を産する
生物に由来する内在性のRNAを含み、t−RNA、m
−RNA、r−RNAなどを含む。Here, the sample containing nucleic acid includes whole blood,
It includes biological materials derived from animals such as serum, plasma, urine, saliva, body fluids, and other non-animal biological materials such as plants and microorganisms. It also includes cells and cultured cells isolated from these organisms. Furthermore, a partially purified nucleic acid is also included. Nucleic acid means DNA or RNA, and DNA is double-stranded DNA, single-stranded DNA, plasmid DN.
A, genomic DNA, cDNA, etc. Also, RNA
As well as endogenous RNAs derived from organisms producing these biological materials, in addition to RNAs derived from foreign parasites such as viruses, bacteria, and fungi.
-RNA, r-RNA and the like.
【0038】本発明の(a)吸着工程では、核酸結合性
担体、核酸を含有する試料および核酸吸着用溶液を混合
し、核酸を核酸結合性担体に吸着させる。混合方法は、
ボルテックスによる攪拌、転倒混和、磁気攪拌などがあ
り、混合時間は約5〜60分間である。これらの物質を
混合することにより、試料中の核酸、タンパク質、糖類
などが核酸結合性担体に物理的に吸着する。In the (a) adsorption step of the present invention, the nucleic acid-binding carrier, the nucleic acid-containing sample and the nucleic acid adsorbing solution are mixed, and the nucleic acid is adsorbed on the nucleic acid-binding carrier. The mixing method is
There are vortex stirring, inversion mixing, magnetic stirring and the like, and the mixing time is about 5 to 60 minutes. By mixing these substances, nucleic acids, proteins, saccharides and the like in the sample are physically adsorbed to the nucleic acid binding carrier.
【0039】(b)分離工程における液相と核酸結合性
担体との分離手段としては、粒子内の超常磁性金属酸化
物を使用するから、磁石等を用いた簡便な磁気分離法が
可能である。(b)分離工程では、必要により洗浄を行
い、不要なタンパク質、糖類、脂質などを溶離する。洗
浄は1回または2回以上行う。(B) As a means for separating the liquid phase and the nucleic acid binding carrier in the separation step, a superparamagnetic metal oxide in the particles is used, so that a simple magnetic separation method using a magnet or the like is possible. . (B) In the separation step, washing is performed as necessary to elute unnecessary proteins, saccharides, lipids, and the like. Washing is performed once or twice or more.
【0040】(c)溶出工程は、上記(b)工程におけ
る核酸が吸着した核酸結合性担体から該核酸を溶出する
工程である。このとき回収した核酸は、透析やエタノー
ル沈殿法等の脱塩、濃縮操作を施すことなく、制限酵素
やDNAポリメラーゼ等を使用する酵素反応に直接使用
することができる。また、必要により増幅した後、核酸
プローブ試薬を使用して目的核酸を検出することもでき
る。The (c) elution step is a step of eluting the nucleic acid from the nucleic acid binding carrier to which the nucleic acid has been adsorbed in the above (b) step. The nucleic acid recovered at this time can be directly used for an enzymatic reaction using a restriction enzyme, a DNA polymerase, or the like without performing a desalting or concentration operation such as dialysis or ethanol precipitation. After amplification as required, the target nucleic acid can be detected using a nucleic acid probe reagent.
【0041】[0041]
【実施例】次に、実施例を挙げることにより、本発明の
効果をより一層、明瞭なものとする。ただし、これらの
実施例によって本発明の範囲は限定されるものではな
い。 実施例1 磁性シリカ粒子は、平均粒子径の範囲が1〜10μm、
四三酸化鉄粒子の含有量がグラム重量あたり、30%、
比表面積が50〜500m2 /gであるもの(鈴木油脂
工業社製)を使用した(表1参照)。Next, the present invention will be described by way of examples.
The effect is made clearer. However, these
The scope of the present invention is not limited by the examples.
No. Example 1 The magnetic silica particles have an average particle diameter in the range of 1 to 10 μm,
The content of ferric oxide particles is 30% per gram weight,
Specific surface area is 50-500mTwo / G (Suzuki Yushi
Was used (see Table 1).
【0042】まず、0.5g/ml濃度になるように滅
菌水中に懸濁した上記磁性シリカ粒子を準備した。ま
た、これらの条件で、外部表面積が10〜70m2 /g
程度まで、異なる磁性シリカ粒子を数種類用意した。各
Lot中の磁性シリカ粒子のそれぞれの性質を、表1に
示す。First, the above magnetic silica particles suspended in sterilized water so as to have a concentration of 0.5 g / ml were prepared. Under these conditions, the external surface area is 10 to 70 m 2 / g.
To some extent, several kinds of different magnetic silica particles were prepared. Table 1 shows the properties of the magnetic silica particles in each Lot.
【0043】生物試料としては、メチシリン耐性の黄色
ブドウ球菌(以下、MRSAと示す)陽性の全血検体を
用いた。また、核酸抽出用溶液としては、5mol/l
グアニジンチオシアン酸塩、1.0%トリトンX−10
0および20mmol/lエチレンジアミン四酢酸(E
DTA)を含むトリス/塩酸緩衝液を使用した。そし
て、洗浄液としては、5mol/lグアニジンチオシア
ン酸塩を含むトリス/塩酸緩衝液を使用した。また、こ
れらに含まれる高濃度の塩を除去するために、70%エ
タノール水溶液およびアセトンを使用し、粒子担体に結
合した核酸を回収するための溶離液としては、滅菌水を
使用した。As a biological sample, a methicillin-resistant Staphylococcus aureus (hereinafter referred to as MRSA) -positive whole blood sample was used. In addition, as a solution for nucleic acid extraction, 5 mol / l
Guanidine thiocyanate, 1.0% Triton X-10
0 and 20 mmol / l ethylenediaminetetraacetic acid (E
DTA) was used. As a washing solution, a Tris / HCl buffer containing 5 mol / l guanidine thiocyanate was used. A 70% aqueous ethanol solution and acetone were used to remove high-concentration salts contained therein, and sterile water was used as an eluent for recovering nucleic acids bound to the particle carrier.
【0044】具体的な操作としては、下記(1)〜(1
3)の工程を実施した。 (1)1.5ml容のエッペンドルフチューブに、核酸
抽出用溶液0.9mlを入れ、次に全血サンプル0.1
mlを添加し、よく混合した。 (2)次に、滅菌水に懸濁した磁性シリカ粒子0.1m
lを加えた。 (3)よく混合し、室温で10分間放置した。 (4)1.5ml容エッペンドルフチューブ専用の磁極
スタンドに、上記のチューブを設置することにより、粒
子を磁極側のチューブ壁面に移動させた。 (5)フィルターチップまたはディスポーザブルスポイ
トを用いて、溶液相を吸引排出した。 (6)チューブを磁極スタンドから取り出し、洗浄液と
して、5mol/lのグアニジンチオシアン酸塩を含む
トリス/塩酸緩衝液1.0mlを加えた。 (7)十分混合した後、専用の磁極スタンドに設置し、
上記と同様にして溶液を排出した。 (8)洗浄液による洗浄操作をもう一度繰り返した。 (9)1.0mlの70%エタノール溶液により、上記
と同様に核酸の吸着した磁性シリカ粒子を洗浄し、高濃
度の塩を除去した。 (10)再度、1.0mlの70%エタノール溶液で洗
浄した後、1.0mlのアセトンで同様に洗浄した。 (11)約56℃のヒートブロック上に上記のチューブ
を設置し、約10分間放置することにより、チューブ内
および磁性シリカ粒子中のアセトンを完全に蒸発させて
除去した。 (12)0.1mlの滅菌水を加え、約56℃のヒート
ブロック上に上記チューブを設置し、10分間放置し
た。 (13)磁極スタンドに設置し、溶液相をフィルターチ
ップで吸引し、別の新しいチューブに回収した。回収量
は通常、60〜70μl程度である。As specific operations, the following (1) to (1)
Step 3) was performed. (1) 0.9 ml of the nucleic acid extraction solution was placed in a 1.5 ml Eppendorf tube.
ml was added and mixed well. (2) Next, magnetic silica particles suspended in sterilized water 0.1 m
1 was added. (3) Mix well and leave at room temperature for 10 minutes. (4) The above-mentioned tube was set on a magnetic pole stand dedicated to a 1.5 ml Eppendorf tube to move particles to the tube wall surface on the magnetic pole side. (5) The solution phase was suctioned and discharged using a filter tip or a disposable dropper. (6) The tube was taken out of the magnetic pole stand, and 1.0 ml of a Tris / hydrochloric acid buffer containing 5 mol / l guanidine thiocyanate was added as a washing solution. (7) After sufficient mixing, set on a dedicated magnetic pole stand,
The solution was drained as above. (8) The washing operation with the washing solution was repeated once. (9) The nucleic acid-adsorbed magnetic silica particles were washed with 1.0 ml of a 70% ethanol solution in the same manner as described above to remove high-concentration salts. (10) After washing again with 1.0 ml of a 70% ethanol solution, washing was similarly performed with 1.0 ml of acetone. (11) The above tube was placed on a heat block at about 56 ° C., and left for about 10 minutes to completely evaporate and remove acetone in the tube and in the magnetic silica particles. (12) 0.1 ml of sterilized water was added, the tube was placed on a heat block at about 56 ° C., and left for 10 minutes. (13) The solution phase was set on a magnetic pole stand, the solution phase was sucked with a filter tip, and collected in another new tube. The recovery amount is usually about 60 to 70 μl.
【0045】次に、この回収した核酸溶液をNASBA
法(Nature 350: 91-92 、1991、特許第2648802 号公報
および特許第2650159号公報)により増幅した。すなわ
ち、増幅はmecA遺伝子の配列中より最適な配列を有
するプライマー2種(配列番号1および2)を使用し、
T7RNAポリメラーゼ、逆転写酵素およびRNase
H(一重鎖または二重鎖RNAまたはDNAを加水分解
することなく、RNA−DNAハイブリッドのRNAを
加水分解するリボヌクレアーゼ)を用いて、41℃で9
0分間、増幅反応を行った。Next, the recovered nucleic acid solution was added to NASBA.
Amplification was carried out by the method (Nature 350: 91-92, 1991, Japanese Patent No. 2648802 and Japanese Patent No. 2650159). That is, amplification uses two types of primers (SEQ ID NOs: 1 and 2) having an optimal sequence from the sequence of the mecA gene,
T7 RNA polymerase, reverse transcriptase and RNase
H (ribonuclease that hydrolyzes RNA of RNA-DNA hybrids without hydrolyzing single- or double-stranded RNA or DNA) at 41 ° C.
The amplification reaction was performed for 0 minutes.
【0046】そして、核酸の検出は、固相としてナイロ
ン膜を使用したドットブロットハイブリダイゼーション
により行った。上記の増幅反応によって得られた核酸溶
液を滅菌水で10倍濃度に希釈し、あらかじめ5×SS
C(0.075mol/l Na-Citrate、pH 7.0、0.75mol/l NaCl
混合液)で洗浄したナイロン膜上に、1.0μlをブロ
ットした。乾燥後、この膜をハイブリバッグ(BRL社
製)に入れ、アルカリホスファターゼ標識した検出プロ
ーブ(配列番号3)を含むハイブリダイゼーション緩衝
液1.0mlを加え、振とうさせながら、50℃で30
分間ハイブリダイゼーションを行った。その後、膜をハ
イブリバッグから取り出し、洗浄液1(5×SSC、
1.0%ラウリル硫酸ナトリウム)を入れたバットに移
し、50℃で10分間洗浄した。次に洗浄液2(5×S
SC、0.5 %トリトンX−100)のバットに移し振と
うさせながら、室温で10分間洗浄した。洗浄が終了し
た膜を新しいハイブリバッグに入れ、ニトロブルーテト
ラゾリウムおよび5−ブロモ−4−クロロ−3−インド
リルリン酸を含むアルカリホスファターゼの基質溶液を
加えてシールし、37℃で60分間静置することで発色
反応させた。発色後、膜を蒸留水で洗浄して乾燥させ、
発色を色彩色差計CR−221(ミノルタカメラ社製)
により測定した。測定には△Eモードを用いた。The nucleic acid was detected by dot blot hybridization using a nylon membrane as a solid phase. The nucleic acid solution obtained by the above amplification reaction was diluted to 10-fold concentration with sterile water, and 5 × SS
C (0.075 mol / l Na-Citrate, pH 7.0, 0.75 mol / l NaCl
1.0 μl was blotted on a nylon membrane washed with (mixture). After drying, the membrane was placed in a hybrid bag (manufactured by BRL), and 1.0 ml of a hybridization buffer containing a detection probe (SEQ ID NO: 3) labeled with alkaline phosphatase was added thereto.
Hybridization was performed for minutes. Thereafter, the membrane was removed from the hybrid bag, and the washing solution 1 (5 × SSC,
(1.0% sodium lauryl sulfate) and transferred to a vat and washed at 50 ° C. for 10 minutes. Next, cleaning solution 2 (5 × S
(SC, 0.5% Triton X-100) and washed at room temperature for 10 minutes while shaking. The washed membrane is placed in a new hybrid bag, sealed with a substrate solution of alkaline phosphatase containing nitroblue tetrazolium and 5-bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate, and left standing at 37 ° C. for 60 minutes. A color development reaction was performed. After color development, the membrane is washed with distilled water and dried,
Color development is color difference meter CR-221 (Minolta Camera)
Was measured by The ΔE mode was used for the measurement.
【0047】下記表1から明らかなように、本発明の5
0m2 /g以上の外部表面積をもつ磁性シリカ粒子(表
1中のLotA)を核酸の抽出、単離に使用する場合は、外
部表面積の小さい磁性粒子(表1のLotD,G,H)を使用し
た場合よりも、明らかに高い検出値を示した。これは核
酸抽出効率が上昇したことを示している。As is clear from Table 1 below, 5
When magnetic silica particles having an external surface area of 0 m 2 / g or more (LotA in Table 1) are used for nucleic acid extraction and isolation, magnetic particles having a small external surface area (LotD, G, H in Table 1) should be used. The detection value was clearly higher than when used. This indicates that the nucleic acid extraction efficiency has increased.
【0048】[0048]
【表1】 [Table 1]
【0049】[0049]
【発明の効果】少なくとも50m2 /gの外部表面積を
有する磁性シリカ粒子を担体として核酸の抽出、単離に
使用する本発明は、核酸の回収量に優れている。特に、
夾雑物質を多量に含む試料、例えば血液検体の処理にお
いて、その回収量に優れている。The present invention, which uses magnetic silica particles having an external surface area of at least 50 m 2 / g as a carrier for extracting and isolating nucleic acids, is excellent in recovering nucleic acids. Especially,
In the processing of a sample containing a large amount of contaminants, for example, a blood sample, it is excellent in the recovery amount.
【0050】[0050]
【配列表】配列番号:1 配列の長さ:21 配列の形:核酸 トポロジー:一本鎖 配列の種類:合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..21 特徴を決定した方法:S 他の特徴:黄色ブドウ球菌のmecA遺伝子の1332番目
から1352番目のヌクレオチド配列と相同的な配列を有す
る。 配列 CGTTACAAGA TATGAAGTGG T 21[Sequence List] SEQ ID NO: 1 Sequence length: 21 Sequence form: Nucleic acid Topology: Single-stranded Sequence type: Synthetic DNA Sequence characteristics Location: 1..21 Method for determining characteristics: S Other characteristics : Having a sequence homologous to the nucleotide sequence of positions 1332 to 1352 of the mecA gene of S. aureus. Sequence CGTTACAAGA TATGAAGTGG T 21
【0051】配列番号:2 配列の長さ:47 配列の形:核酸 トポロジー:一本鎖 配列の種類:合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..47 特徴を決定した方法:S 他の特徴:黄色ブドウ球菌のmecA遺伝子の1552番目
から1571番目のヌクレオチド配列と相補的な配列を有す
る。またT7RNAポリメラーゼのプロモーター配列を
持つ。 配列 AATTCTAATA CGACTCACTA TAGGGAGCCT TGTCCGTAAC CTGAATC 47SEQ ID NO: 2 Sequence length: 47 Sequence form: Nucleic acid Topology: Single-stranded Sequence type: Synthetic DNA Sequence characteristics Location: 1..47 Method for determining characteristics: S Other characteristics: It has a sequence complementary to the nucleotide sequence at positions 1552 to 1571 of the mecA gene of S. aureus. It also has a promoter sequence for T7 RNA polymerase. Sequence AATTCTAATA CGACTCACTA TAGGGAGCCT TGTCCGTAAC CTGAATC 47
【0052】配列番号:3 配列の長さ:25 配列の形:核酸 トポロジー:一本鎖 配列の種類:合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..25 特徴を決定した方法:S 他の特徴:黄色ブドウ球菌のmecA遺伝子の1410番目
から1434番目のヌクレオチド配列と相同的な配列を有す
る。 配列 TAGAGTAGCA CTCGAATTAG GCAGT 25SEQ ID NO: 3 Sequence length: 25 Sequence form: Nucleic acid Topology: Single-stranded Sequence type: Synthetic DNA Sequence characteristics Location: 1..25 Method for determining characteristics: S Other characteristics: It has a sequence homologous to the nucleotide sequence at positions 1410 to 1434 of the mecA gene of S. aureus. Sequence TAGAGTAGCA CTCGAATTAG GCAGT 25
【図1】 t−plotを示す図である。FIG. 1 is a diagram showing t-plot.
Claims (9)
子である核酸結合性磁性担体であって、該磁性シリカ粒
子が少なくとも50m2 /gの外部表面積を有すること
を特徴とする核酸結合性磁性担体。1. A nucleic acid binding magnetic carrier comprising magnetic silica particles containing a superparamagnetic metal oxide, wherein the magnetic silica particles have an external surface area of at least 50 m 2 / g. Carrier.
2 /gの外部表面積を有する請求項1記載の核酸結合性
磁性担体。2. The magnetic silica particle carrier has a particle diameter of 70 to 100 m.
The nucleic acid binding magnetic carrier according to claim 1, which has an external surface area of 2 / g.
被覆されている超常磁性金属酸化物を、微小なシリカ粒
子で構成される無機多孔性壁物質で複合してなる請求項
1記載の核酸結合性担体。3. The nucleic acid according to claim 1, wherein the magnetic silica particles are a composite of a superparamagnetic metal oxide whose surface is coated with silica and an inorganic porous wall material composed of fine silica particles. Binding carrier.
gの比表面積を有する請求項1記載の核酸結合性磁性担
体。4. The method according to claim 1, wherein the magnetic silica particles have a particle diameter of 10 to 800 m 2 /
The nucleic acid binding magnetic carrier according to claim 1, which has a specific surface area of g.
粒子径を有する請求項1記載の核酸結合性磁性担体。5. The nucleic acid-binding magnetic carrier according to claim 1, wherein the magnetic silica particles have a particle size of 0.5 to 15 μm.
mの粒子径を有する請求項1記載の核酸結合性磁性担
体。6. The magnetic silica particles have a particle size of 1.0 to 10.0 μm.
The nucleic acid-binding magnetic carrier according to claim 1, which has a particle diameter of m.
磁性担体。 (1) 担体は、超常磁性酸化鉄を含む磁性シリカ粒子であ
る。 (2) 磁性シリカ粒子の外部表面積は、少なくとも50m
2 /gである。 (3) 磁性シリカ粒子は、その表面がシリカで被覆されて
いる超常磁性金属酸化物を、微小なシリカ粒子で構成さ
れる無機多孔性壁物質で複合してなる。 (4) 超常磁性酸化鉄の重量は、10〜60wt%であ
る。 (5) 磁性シリカ粒子の比表面積は、10〜800m2 /
gである。 (6) 磁性シリカ粒子の表面細孔直径は、0.1〜60n
mである。 (7) 磁性シリカ粒子の細孔容積は、0.01〜1.5m
l/gである。 (8) 磁性シリカ粒子の粒子径は、0.5〜15μmであ
る。7. A nucleic acid-binding magnetic carrier having the following properties (1) to (7). (1) The carrier is magnetic silica particles containing superparamagnetic iron oxide. (2) The external surface area of the magnetic silica particles is at least 50 m
2 / g. (3) The magnetic silica particles are composed of a superparamagnetic metal oxide whose surface is coated with silica and an inorganic porous wall material composed of fine silica particles. (4) The weight of the superparamagnetic iron oxide is 10 to 60 wt%. (5) The specific surface area of the magnetic silica particles is 10 to 800 m 2 /
g. (6) The surface pore diameter of the magnetic silica particles is 0.1 to 60 n.
m. (7) The pore volume of the magnetic silica particles is 0.01 to 1.5 m.
1 / g. (8) The particle diameter of the magnetic silica particles is 0.5 to 15 μm.
に記載される核酸結合性磁性担体、核酸を核酸結合性担
体に吸着させるための核酸吸着用溶液および核酸結合性
担体−核酸複合体から核酸を溶出するための溶液を含む
ことを特徴とする核酸単離用試薬キット。8. A nucleic acid-binding magnetic carrier according to claim 1, a nucleic acid-adsorbing solution for adsorbing a nucleic acid to the nucleic acid-binding carrier, and a nucleic acid-binding carrier-nucleic acid complex. A reagent kit for nucleic acid isolation, comprising a solution for eluting a nucleic acid from a nucleic acid.
徴とする核酸単離方法。 (a)請求項1〜7のいずれか1項記載の核酸結合性磁
性担体、核酸を含有する試料および核酸を核酸結合性担
体に吸着させるための核酸吸着用溶液を混合して、核酸
を核酸結合性担体に結合させる工程 (b)核酸が結合した核酸結合性担体を液体から分離
し、必要により洗浄する工程、および (c)核酸結合性担体−核酸複合体から核酸を溶出する
工程9. A method for isolating a nucleic acid, comprising the following steps (a) to (c). (A) mixing the nucleic acid-binding magnetic carrier according to any one of claims 1 to 7, a nucleic acid-containing sample, and a nucleic acid-adsorbing solution for allowing the nucleic acid to be adsorbed to the nucleic acid-binding carrier; (B) separating the nucleic acid-binding carrier to which the nucleic acid has been bound from the liquid, washing if necessary, and (c) elute the nucleic acid from the nucleic acid-binding carrier-nucleic acid complex
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP6566298A JPH11262387A (en) | 1998-03-16 | 1998-03-16 | Nucleic acid-binding magnetic carrier and isolation of nucleic acid using the carrier |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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| JP6566298A JPH11262387A (en) | 1998-03-16 | 1998-03-16 | Nucleic acid-binding magnetic carrier and isolation of nucleic acid using the carrier |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH11262387A true JPH11262387A (en) | 1999-09-28 |
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ID=13293439
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP6566298A Pending JPH11262387A (en) | 1998-03-16 | 1998-03-16 | Nucleic acid-binding magnetic carrier and isolation of nucleic acid using the carrier |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH11262387A (en) |
Cited By (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2003528455A (en) * | 2000-03-24 | 2003-09-24 | キアゲン ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング | Porous ferromagnetic or ferrimagnetic glass particles for molecular isolation |
| JP2004500067A (en) * | 1999-12-22 | 2004-01-08 | アボット・ラボラトリーズ | Nucleic acid isolation method and kit |
| JP2007224323A (en) * | 2006-02-21 | 2007-09-06 | Hitachi Metals Ltd | Magnetic silica particle and method for producing the same |
| WO2015054768A1 (en) * | 2013-10-15 | 2015-04-23 | Fundação Universidade Federal De São Carlos | Magnetic porous silica microparticles and synthesis method |
| EP4254441A1 (en) | 2022-03-29 | 2023-10-04 | Seiko Epson Corporation | Magnetic bead and magnetic bead dispersion liquid |
-
1998
- 1998-03-16 JP JP6566298A patent/JPH11262387A/en active Pending
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| US12260976B2 (en) | 2022-03-29 | 2025-03-25 | Seiko Epson Corporation | Magnetic bead and magnetic bead dispersion |
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